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Reference ( gi|1 )            :                                                                                  CTTCTACT----TCTGCTACCAGTACAA-CAACAAC-AGCAATA--AACATCAACAAC-AACACCA--AC-A--A---CGAATGTAATA--ACTACTT--CT--GCT---GCT-A---T---T---ACTAA-T--ACTTC-T-CT--TACTGCTACT--T-----C------TACT---GC--TACTGTTG-TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AC-TTT-TGTTGCTACA-A----CT---GCTA---CG---T-CTAT------TAC--TGC---TGT---TG---C------TACA------A----CT---ACT-TT-TTCTGC--T-G------C---T---A---C-----T--------------A---CTAC--TG-C--------A-----TAC--T-----------C----T-GCTGCTGCTA---T--T---A-C------T--AC------A---ATT----A-CT---T---------TTGT--TGCTA---C-T---ACTACTACT--TT---------------T--G-----G--C-TGCA----G--CTACTTC---TACT-ATT-TTTACT--CTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTCATCTT---CTTCTTCTACTTCTACTT-CTAC--AATAACAACAAACA--------ACA--ACAACAACGATAAAA--A-CTGTTA---CT---GT-TAC------TGCTCTTG---CTGCTAC--------------T-----A-C---TACTT---CTTC---TT-----CTG---C---------T---GCTG---CT---A-A---T---ACTAC---------TGCT---T--C-----TGC-CG---CT----G---T------T--A-C--TAC---TACT---A-CTTCTAC---T---GC---TGT-TT-A----TACTCCTA---A-AT-CTGG---TGCT-------TTTA---T--TT------G----------TG---CTA------C---T---A-CT---T-------C-T-AC---T---A---ATT----C---T---A---CT---ACT--T---C------T----GTTG-----CT------G-----C-----T---G------CT---AC---T-----A---CTA-CTTCTGCTGCTG-----GT--G--G-TA---------TTAT---TA------T---TACTACTA----TTTC-AG--T------TGCTG---------CTA----CTAC-----A---A---CT----A-------T-C-T---C-T----T-------CTGCT---G---C---TA------C---T--A--A---T--A---C---TAC---T---T---CTGCT---G-C---TA---C------TAC---TA---GT------A------C--T---TAT----GCTG---C-T------GT--------T---ACT---A---C------------TACTGCT-TCA-ACTAAAG---ATAAT----AATA----TT--A--T--T-TACTGCTG---CTACAACTACGACTTTT-----GCTG------TT--GTTG---T-------TATTG------------TTGTTGT-TTT-ACTTTTTATAATGTATTCCAAATTTGCAAAATTGCGTTTAAAATATTTGATCTATTAATAGAAGCATTCGATTGGACTTTTGATACCCAATTGAAAACCTG
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gi|23                         :                                                                                                                            accattaagaatactatttcttctactaatactacttttATGTACTATTACTACTA--CT--ACT---TC--A---T---T-----TAA-T--ACTTA-T-AA--TAGTTCTACT--T-----C------TACT---TC--TGCTacaactac
gi|5                          :                                                                                                                                       gctacttttacaattattattattactacTGTACTACTATTATTG--CT--ACC---ACT-AAAAC---T---ACTAA-T--ATTCC-T-TT--TACTACTACT--T-----C------TACT---ACAGTACTacaacta
gi|20                         :                                                        gtactaagattactaaaactactaatatttcttcagctactactgctattactactactaaatctactaatatttcttcagcttctactactattcctaaaactaatacttctTA--A-TACTG--TT--GCT---GCT-A---T---T---AT----T--ACTTC-------TACTACTACA--T-----T------AACT---GC--TAGTGCTactattactaaatttactaatatttctacta
gi|8                          :                                                                                                                                                     tactagtattaatactgctgcA--ACTACTA--CT--ATT---GCT-A---C---C---ACTAA-C----------CC--TACCGCTAAC--G-----C------CACC---AC--TACTGCCA-CCGCTACCACAACCAACTACCACTACAACTACCACTACTGCTACTGTTACTGCCATTGTC----AC-T----GCCACCACCCA----CT---ACCA---TG---A-TAAC------TAC--CAC---TAC---CA---C------TACA------A----CT---G--------CTAC--T-G------C---T---A---C-----T--------------G---TTAC--TG-C----------------C--A-----------C----T-GCTACCACTA---C--C---A-C------C--AC------tctgctgctgattctgatactacttctacaaccact
gi|8                          :                                                                                                                                                                          c--ACTACTG--CC--ACC---GCT-A---C---C---AC-AA-CCAACTAC-C-AC--TACAACTACC--A-----C------TACT---GC--TACTGTTcc
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gi|21                         :                                                                                                                                             gctgctgcagctgctattacatctactact--ACTACTT--CT--ACT---ACT-A---T---T---ACTAA-A--ACTctnnnnnnnnnnt
gi|29                         :                                                                                                      ctacaaatatttcttcttctactacagtactttttttttactaagattactaatatttcttcttatact--ACTACTA--CA--CCT---ACT-T---T---T---A-TAACT--ACTTC-T-AC--TACTGCTGCTA-TAGATGC------TGCT---GC--CACTGCTG-Tacaaataa
gi|15                         :                                                                                                                                                                              CTACTT--TT--ACT---GCT-G------------CAGA-T--ACTT-----T--TACTGCTGCT--G-----C------TGCT---GC--TGCTGCTt
gi|14                         :                                                                                                                                              cattgttattgctactgcctctgctacagatcCTGCTG--CT--GCT---GCT-G---T---TAAAAGTAC-T--ACTTC-TGCTAATACTACTACT--G-----C------TGTT---GC--TGCTGCTG-Tacatttattgttactagtgctggtgttactgttgttgcatctactgctgatacta
gi|17                         :                                                                                                     actgctgctgctgcttttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctgCTGCCT--CT--GCT---ACTTG---T---T----CTAC-T--ACATC-T-AC--CACAACTACT--T-----C------TACT---AC--TACTtaatact
gi|10                         :                                                                                                                                                                              gTACTT--CT--GCC---ACT-A---C---T---ACTAC-C--ACTTC-TACT--T-CCGCTAATTAT-----C------TACTCCAAC--TACTGactatttattatgataatacttttactttagctgacgatgctgctcctactttataactaatactgctactaat
gi|24                         :                                             taccattgttactacatgtatatatattctgatattgcttcagtaagtgttgctgagttactgcaactgttgcttctgtcgctacaatcactactactatcactactattgttgctgctgctgcttctgtTACTT--TT--ACT---G-------T---T---GCTGA-T--ACTT-----T--TACTGCTACA----------------ACT---TT--CACTGTTG-g
gi|6                          :                                                                                                                                                                       tgttgttgtACTT--CT--ACA---ACT-A---C---T---ACTA------CTTC-T-CA--TACTCCTTCC--C-----A------CACT---AC--TACTACTA-CTCATCATAATCCTCCTCCTACTTCTACAATTACGTCTACTACTACTCCTCATCTTCCTC-----C-TCC-TCCTACTACT-A----CT---ATTA---CGGC-G-CTAT------TACATTG----TAC---TA---C------TAT-------A----CT---GCTGTTATTTTAC--T-A------C---T---A---C-----T--------------A---CTAC--T----------------------T-----------C----T-ACTATTGATA---A--T---A-T------T--Actatttctaaaactaccaccactataactactacta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                 CTT--CT--GCT---G-------T---T---GCTGC-T--ACTGC-T-AC--TACTACTACT--G-----C------TGCT---GC--TGCTGCTG-gta
gi|5                          :                                        cgctaccgttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattactgccgttaccgcttccgctactgctacttcttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnng-A---C---T---ACTAA-T--ATTTC-T-TC--AGCTACTACT--G-----C------TATT---AC--TACTACT----AAATCTACTAATATTTCTTCAGCTTCTACTACTATTCCTAAAACTAATACTTCTTGTACT--AC-TAT-TATTGCTACC-A----CTAAAACTA----------CTAA------TAT--TCC---TTT---TA---C------T---------A----CT---ACT-TC-TACTACAGT-A------C---T---A---C-----T--------------A---TTAC--Tc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                  gtactaagattactaaa-A---C---T---ACTAC-T--ACTTC-T-GC--TGCTGCTACT--T-----C------TGCT---GC--TAC--------AAACATGTATATGGTCAACGACTACTATTTCTTCTGCTGCTGCTGTTTCTGTTGGTACAA--ACATGTATATTGTCAAG-A----CT---ACTA---C---------T------T-C--TGC---TGT---TG---C------TAC------------------------TTCTAC--T-G------C---T---A---C-----T--------------A---aaatttactaatatttctacta
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                aca-A---T---T---ACTAA-T--ATTTCTT-CTTATACTACTACT--T-----C------TACT---AC--TATTaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                        ctacaaatatttcttcttctactacagtactttttttttactaag-T--ACTGC-C-GT--TACCGCTTCC--G-----C------TACT---GC--TACTTCT--TCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTT----C-TGC-TGTTGCTGCT-A----CT---GCTA---CT---A-CTAC------TAC--TGC---TGC---TG---C------TGCactaaaactacaaataa
gi|9                          :                                                                                                                                                                   cgctaccgttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatT--TGCTGCCGCT--T-----T------TACT---GC--TTCTGTAGCTTCCATCTCTACTCTTGCTTCGACTACTGCCATGTTTATCGTCATTACTGCGGCTACCATCGCCAC-TTT-TACTGCTAGA-T----TT---GCTG---CT---T----T------TAC--TGC---TTT---TG---C------TAGATTTGCTG----CTTTGACT-TT-TTATAC--T-A------C---TTTTA---C-----T--------------A---CTTT--TG-C--------------TAC--TG----------C----T-ACTTCTGCtgctgc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taA--AC-TAT-TGTTGCTGC--------T---GCCA---CT---G-CTGC------TAC--TAC---TAC---TG---C------TGCG------T----CT---ACT-AT-TACTGA--T-G------C---T---A---C-----T--------------ACTTCTAT--TG----------A-----TAT--TA----------C----C-ACTACCATTG---T--C---A-C------T--GT------C---ACT----A-CT---A---------CTGC--TGCTA---C-T---ATAACTACT--AT---------------TACA-----A--C-TGCT----G--CTGCTGC---TGCT-ATA-GTTACT--
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                  actatttaaagtatgttcctgaaggcaactacacctaatagtactaccactactaccgccaccgctaccatcaccaacactaatactactactactaatactacaacaac--AC-TCT-TGCTTCGACT-A----CT---GCCA---TG---T-TTATCGTCATTAC--TGC---GGC---TA---C------CATC------G----CC---ACT-TT-TACTGC--TAG--------------A---T-----T-------------------TGC--TG-C--------T-----TTT--A-----------C----T-GCTTTTGCTAGATT--T---G-C------T--GC------T---TTG----A-CT---T---------TTTA--TACTA---C-T---TTTACTACT--TT---------------T--------G--C-TACT----G--CTACTTC---TGCactattacaactgcggttgctactacgactaaaattactatttactacctac
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tattgctgccgcttttactgcttctgtagcttccatctct--AC-TTT-TACTGCTACA-A----CT---------------T-TCAC------TGT--TGC---TAT---TT---C------TAAA------A----CT---ACC-AC-CACTAT--A-A------C---T---A---C-----T--------------A---CTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgttgttgttacttttactgttgctgat-TATTTCTTCA-G----CT---ACTA---CT---G-CTAT------TAC--TAC---TAC---TAAATC------TACT------A----AT---ATT-TC-TTCAGC--T-T------C---T---A---C-----T--------------A---CTAT--TC-CTAAAACTAA-----TAC--T-----------TCTTGT-ACTACTATTA---T--T---G-C------T--ACCACTAAA---ACT----A-CT---A---------ATAT--TCCTT---T-T---ACTACTACT--TC---------------T--------A--C-TACA----GTACTACTAT---TACT-AAA-TTTACT--
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtactaagattactaaaactactaa-TGTTGCTG-A-G----TT---ACTG---CA---A-CTGT------TGC--TTC---TGT---CG---C------TACA------A----TC---AC-----TACTAC--T-A------T---C---A---C-----T--------------A---CTAT--TG---------------------------------T----T-GCTGCTGCTG---C--T---T-C------T--------------GTT----A-CT---T---------CTGC--CACTA---C-T---ACTACCACT--T-----------------------------------------CTACTTC---CGCTAATTATCTACT--Caatatttctacta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taccattgttactacatgtatatatattctgatattgcttcagtaag-TGCTGCTGCT-G----CT---GTTA---AA---A-GTAC------TAC--TTC---TGC---TA---A------TACT------A----CT---ACT-GC-TGTTGC--T-G------C---T---G---C-----T--------------G---TTA---------------A-----TAC--T-----------caactactgg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                actgctgctgctgcttttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctgcGCTGCTGCA-G----CT---GCTATTACA---T-CTAC------TAC--TAC---TA---------C------TACT------A----CT---GCT-GT-TGCTGC--T-GTTCATAC---T---A---C-----T--------------A---CTAC--TG-C--------------TGC--TA----------C----T-GCTGCT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GCTACT-G----CT---ACTT---CT---T-CTNN------NNN--NNN---NNN---NN---N------NNNN------N----NN---NNN-NN-NNNNNN--N-N------N---N---N---N-----N--------------N---NNNN--NN-N--------N-----NNN--N-----------N----N-GCTTCTGCTG---T--T---G-C------T--GC------------T----A-CT--------------------GCTA---C-T---ACTACTACT----------------------------G--C-TGCT----G--CTGCTGC---TGCnnnnnnnnnnt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                           cgctaccgttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattactgccgttaccgcttccGCTGCC-T----CT---GCTA---CT---T-GTTC------TAC--TAC---ATC---TA---C------CACA------A----CT---AC-----TTCTAC--T-A------C---T---A---C-----T--------------A---CTAT--T-----------------TAT--T-----------A----T-GATAATACTT---T--T---A-C------T---------------TT----AGCT---G---------ACGA--TGCTG---C-T---CCTACT--T--TA---------------T--A-----A--C-TA-A--------TACTGC---TACT-A
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTACA-A----TT------A---CG---T-CTAC------TAC--TAC---TCC---T-------------CA------T----CT-----T-CC-TCCTCC--T-C------C---T---A---C-----T--------------A---CTAC--TA-T--------------TAC--G-----------G----C-GCTATTAC-A---TTGT---A-C------T--AC------T---A-T----A-CT---G---------CTGT--TATT----T-T---ACTACTACT-----------------------------------------A--CTACTTC---TACT-ATT-at
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                  acttctacaactactactacttctcatactccttcccacactactactactactcatcataatcctcctcctacttCTACA-A----CT---ACCA---C----------------TAC--TGC---TAC---TG---T------TACT------G----CC---ATT-GT-CACTGC--C-A------C---C---A---C-----CC-------------A---CTACCATG----------A-----TA----------------------ACTACCACTA---C--C---A-C------T--AC------A---ACT----G-CT---A---------CTGC--TACTG---T-T---ACTGCCACT----------------------------G--C-TACC----A--CTACgataatattagta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  caactactactattgctaccactaaccctaccgctaacgccaccactactgccaccgctaccacaaccaactaccaCCACA-AAATTCT---ACTT---CT---T-CTAC------TAC--TTT---TAC---TA---C------TACA------A----CT---AC-----TACTGC--T-T------C---T---A---C-----T--------------A---TTAC--TA-C--------AAAAACTAC--TAATGTNNNNNNN----N-NNTTCTACTA---T--T---A-C------T--AC------A---Acaccaccc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tcatcaccaccaccaccaACA-A----CG---ACGA---CGACTT-CTAT------TAC--TAC---TAT---TA---C------TTCT------T----CT---ACT-TC-TACTCC--T-C------C---T---C---A-----T--------------A---CTAC--------------------TAC--T-----------C----T-GCTGCTGCTG---A--T---G-C------T--GCTGG---T---ACT----A-CT---T---------CTAC--TTCTA---C-T---ACTGCTGCT--GC---------------T--G-----G--aaac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                acaacaactccttctcctcatactaccactactactacgacgacgatgACA-A----CT---ACTA---C-------TAC------TTC--TGC---TGC---TG---C------TAC------------------------TTCTGC--T-G------C---T---A---CAAACATGTATATGGTCAACGA---CTAC--TA-T--------T-----TCT--T-----------C----T-GCTGCTGCTG---T--T---T-CTGTTGGT--AC------A---AAC----A-TG---T---------ATAT--TGTCA---A-G---ACTACTACT--TC---------------T--------G--C-TGTT----G--CTACTTC---TACT-tggtgctatcacgaccatcacctactaacgatacttattctactgctggcactgcaacatctattaactctttcagatactaatacccatgccgc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACA-A----CT---ACTA---CT---A-CAAC------TAT--AAC---TGA---TA---C------TACA------A----CT---A--------------T-A------G---T---A---C-----T--------------A---CTAT--TA-C--------A------GT--T-----------C----T-GCT--TG---------T---A-T------T--AA------A---ATC----A-CTAAAT---------TTGC--TACgctactaaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aca-A----CT---ACTA---C----T-CTGC------TGC--TGC---TGA---TG---C------TGCT------G----GT---ACT-AC-TTCTAC--T-T------C---T---A---C-----T--------------A---CTGC--TG-C--------------TG---------------C----T-GGTGGTGCTA---T--C---A-C------G--AC------C---ATC----A-CC---TA--------CTAA--CGATA---CTT---ATT-CTACT--GC---------------T--G-----GCAC-TGCA---------ACATC---TATT-A------ACT--CTT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                          acaacaactccttctcctcatactaccactactactacgacgacgatgacaacgacgacgacttctattactactattacttcttctacttctactcctcctcat-A----CT---ACTA---CA---TGC----------AC--TGC---TGC---TG---C------TAC---------------------------TGC--T-A------C---T---A---C-----T--------------A---CTAC--Ttcagatactaatacccatgccgc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          t-CTGC------TGC--TGC---TGC---TG---T------TAAA------A----GT---ACT-AC-TTCTGC--T-A------A---T---A---C-----T--------------A---CTAC--TG-C--------------TGT--TG----------C----T-GCTGCTGTTA---A--T---A-C------T--tttaatatcaataataatat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  actgctgctgctgcttttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctg-CTAA------TAC--TAC---TTT---TA---CAAATACTATA------A----CT---ACT-TT-TT------T-G------C---T--------------------------------------TA-T--------A-----TAA--------------C----T-ACTGCTACTA---C--T---T-C------T--AC------C---ATA----A-CT---T---------CTAC--CACTA---C-T---ACAACTAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    accattaagaatactatttcttctaTAT------TGC--TAC---TGCCTCTG---C------TACA------GATC-CT---ACT-TT-TACTGC--T-G------CAGAT---A---C-----T--------------T---TTAC--TG-C--------------TGC--T------------------GCTGCTGCTG---C--T---G-C------T--AC------A---TTT----A----------------TTGT--TACTAGTGC-T---GGTGTTACT--GT---------------T--------G--T-TGCA----T--CTACTGCTGATACT-A
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cattgtTAT------TAA--TAC---TGC---TG---C------TA--------A-----T---ACT-GT-T---GC--T-G------C---T---A---T-----T--------------A---TTAC--T----------------------T-----------C----T-ACTACTAC-A---T--T---AAC------T--GC------T---AGT----G-CT---T---------CTGC--TGCTGATTC-T---GATACTACT--T----------------------------C-TACA----A--CCACT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tactagAT------AAC--TGCAAACGT---TG---C------TAAA------G----CT---GCT-AC-CGCTGC--T-G------C---T---G---C-----T--------------A---TTAC--GGTC--------T-----TAT--TT----------C----T-ATTACTAATA---T--TCATA-C------TTTAT------A---ATTTAGAA-TA---T---------ATGTACTACGA---C-T---ACTACTACTA-TT---------------T--GT----G--C-T
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          actgca------TAC--TAC---TAT---TA---C------AACA------A----CT---ACT-AT-TATTAC----A------C---T---A---C-----T--------------A---CTACAATA-C--------A------AC--TA----------T----T-ACTACTACAA---C--A---A-C------T--AC------T---ATT----A-CT---TGTACTATCATTAT--TACTT---C-T---ACTGCTACTACTA---------------T--A-----A--C-TGCT----G--CTGCTAC---TACT-ACT-TCTACT--Ctctcatactaaaattactactgttac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atatcactggtgccaatgcatgtttatgaaattttaaacattagatacaatggccatctgcttttatttcatctttttcttcttctattattaccC--TGC---TGT---TG---C------T---------G----CT---A--------CTGC--T-A------C---T---A---C-----T--------------A---CTAC--TG-C--------------TGC--TG----------C----T-GCTGCTGCcaacttttactaccaatactaatatgcctttgtaatacagtgtatattttgctactacttcttctattactatggctactaatatgcctttgtaatagtgtatattttgctactactacctcttctattactatggctactaatatgcctttgtaatagtgtgtattttgctactactacttgtattactaccttttcttttactatggctactaatatgcctttgtaatacagtgtatattttgctactactacttctattactacttctactaatatc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                           cgctaccgttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattactgccgttaccgcttccgctactgctacttcttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctt--TGT---TGT---TG---T------TACT------T----TT---ACT-GT-TGCTGA--T-A------C---T---T---T-----T--------------A---CTGC--TA-C--------A------AC--T-----------T----TCACTGTTGCTA---T--T---T-C------T--AA------A---ACT----A-CC---A---------CCAC--TATAA---C-T---ACTACTA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GC---TG---C------TGCA------G----CT---GCT-AT-TACATC--T-A------C---T---A---C-----T--------------A---CTAC--TA-C--------------TAC--TG----------C----T-GTTGCTGCTG---T--T---C-A------T--AC------T---ACT----A-CT---A---------CTGC--TGCTA---C-T---GCTGCT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---TA---C------TACA------C----CT---ACT-TT-TATAAC--T-A------C---T---T---C-----T--------------A---CTAC--TG-C--------------TGC--TATAG-------A----T-GCTGCTGCCA---C--T---G-C------T--nnnnnnnnnnt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ac---C------CACA------AAATTCT---ACT-TC-TTCTAC--T-A------C---T---T---T-----T--------------A---CTAC--TA-C--------AAC---TAC--TA----------C----T-GCTTCTACTA---T--T---A-C------T--AC------A---A------A--------------------------A---------ACTACTAA--------------------T--G-----T--N-NNNN----N--NNNNTTC---TACT-ATT-ACTACgtt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcatcaccaccaccacca----CT---ACT-TT-TACAAT--T-A------T---T---A---T-----T--------------A---TTAC--TA-C--------A-----TGT--A-----------C----T-ATTACTACTA---C--T---A-C------T--TC------ATTTAAT----A-CT---T---------ATAA--TAGTT---C-T---ACTTCTACT--TC---------------T--------G--C-TACA----A--CTAaaaaac
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gCTGC--T-G------C---A---G---C-----T--------------G---CTAT--TA-C--------A-----T-C--TA----------C----T-ACTACTACTA---C--T---A-C------T--GC------T---GTT----G-CT---G---------CTGT--TCATA---C-T---ACTACTACT----------------------------G--C-T-------G--CTACTGC---TGCT-
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gCTGC--T-G------C---T---G---C-----T--------------G---CTGC--TG-TTA------A-----AAG--TA----------C----T-ACTTCTGCTA---A--T---A-C------T--AC------T---ACT----G-CT---G---------TTGC--TGCTG---C-T---GTTAATACT--nnnnnnnnnnt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           actgctgctgctgcttttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTGC--T-G------C---T---A---C-----T--------------G---CTAC--TA-C--------------TAC--TA----------C----T-GCTGCTGCTG---C--T---G-C------T--GC------
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             cgctaccgttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattactgccgttaccgcttccgctactgctacttcttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcttctgctgtGT--T-G------C---T---AAAGC-----T--------------G---CTAC--CG-C------------------------------------T-GCTGCTGCTA---T--T---A-CGG----T---C-----------TT----A-TT---T---------CTAT--TACTA---A-T---ATTCATACT--TTATAATTTAGAATATAT--GT----A--C-TACG----A--CTACTAC---TACT-ATT-TGTGCT--
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       actgcaataactgcaaac------C---T---A---C-----T--------------A---CTAT--TA-C--------G-----TATGATA----------C----T-ACTGCTGCTG---C--T---G-C------T--GC------A---ATT----A-CC---G---------CCGC--CGCCA---T-CAAAACCACTACtctcatactaaaattactactgttac
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tacga-----T--------------A---CTAC--TA-C--------A-----TGC--A-----------C----T-GCTGCTGCTACTGC--T---A-C------T--AC------T---ACT----A-CT---T---------TTcaacta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -----------C----T-GCTGCTGCTG---T--T---A-A------A--AG------T---ACT----A-CT---T---------CTGC--TAATA---C-T---ACTACTGCT--GT---------------T--------G--C-TGCT----G--CTGTTAA---TACT-aatatcaataataatat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      actgctgctgctgcttttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctgctg-----------C----T-GTTGCTGCTA---C--T---G-C------T--AC------T---ACT----A-CT---A---------CTGC--TGCTG---C-T---GCTGCTGC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cgctaccgttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattactgccgttaccgcttccgctactgctacttcttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcttctgA---C--T---A-C------T--AC------A---CCT----A-CT---T---------TTAT--AACTA---C-T---TCTACTACT--GC---------------T--------G--C-TATA----G--ATGCTGC---TGCC-ACT-
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             A---C--T---A-C------T--AC------T---ATT----A-C----------------GTA-TGATA---C-T---ACTGCTGCT--GC---------------T--------G--C-TGCA----A--TTACgctgtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacgTTCATCTTTTTCTTCTTCTATTATTACCTACTAC--TATTACAACAACTACTATTATTACACTACTACTACAATACAA----CTATTA---CT---AC-TACAACAACTACTATTA---CTTGTAC--------------T-----A-T---CATTA---TTAC---TT-----CTA---C---------T---GCTA---CT---A-C---T---ATAAC---------TGCT---G--C-----TGC-TA---CT----A---C------T--A-C--TTC---TACTCCAA-CTTTTAC---T---ACCAATAC-TA-A----TATGCCTTTGTA-AT-ACAG---TG---------TATA---T--TT-----------------TG---CTA------C---T---A-CT---T-------C-T----------------T----C---T---A---TT---ACT------A------T----G----------------G-----C-----T---A------CT---AA---T-----A----TG-CCTTTG-TAATA-----GT--GT-A-TA---------TT-T---TG------C---TACTACTA----CCTC-----T------T-CTA---------TTA----CTAT-----G---G---CT----A---------C-T---A-A----T-------ATGCC---T---T---TG----------T--A--A---T--A---G---TGTGTAT---T---TTGCT---A-C---TA---C------TAC---TT---GT------A-------------------------------------T--------T---ACT---A---C------------CTTTTCT-TTT-ACTATGG---CTACT----AATA----Tcgccgccgccatcaaaaccactaccaacta
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atatcactggtgccaatgcatgtttatgaaattttaaacattagatacaatggccatctgcttttatCTT---CTCCTCATACTACCACTA-CTAC--TACGACGACGA-TG--------ACA--ACGACGACGA----------------------------C------TTCTATTA---CTACTAT--------------T-----A-C---TTCTT---CTAC---TT-----CTA---C---------T---CCTC---CT---C-A---T---ACTAC---------TACT---CTGC-----TGC-TG---CT----G---A------T--G-C--TGCTGGTACT---A-CTTCTAC---T---TC---TAC-TA-C----TGCTGCTG--------CTGG---TGGT-------GCTA---T---------------------CA---CGA------C---C---ATCA---C-------C-T-AC---T---A---A------C---G---A----T---ACT--T---A------T----TCTA-----CT------G-----C-----T---G------GC---AC---T-----G---CAA-CATCTgcctttgtaatacagtgtatattttgctactactacttctattactacttctactaatatc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acaacaactcCTA---CTTCTGCTGCTGCTACTT-CTGC----TG-CTACAAACATGT-----ATA--TGGTCAACGAC------------TA---CT---AT-T-----------TCTT----CTGCTGC--------------T-----G-C---TGTTT---CTGT---TG-----GTA---CAAACATGTAT---ATTG---TC---A-A---G---ACTAC---------TACT---T--C-----T----G---CT----G---T------T--G-C--TAC---TTCT---A-CTGCTAC---T---attaactctttcagatactaatacccatgccgc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acaactactaCTT---CTTCTACTACTTTTACTA-CTAC--AACTACTAC-TGCT--------TCT--ACTATTACTACAAAA--A-CTACTA---AT---GTNNNN------NNNNNNTT---CTACTAT--------------T-----A-C---TACaaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcatcaccaccaccaccaccacaaaattcta---CTTCCGCTACTGCTACTT-CTTCTNNNNNNNNNNNNNNN--------NNN--NNNNNNNNNNNNNNN--N-NNNNNN---NN---NN-NNN------NNNNNNNG---CTTCTGC--------------T-----G-T---TGCTG---CT--------------A---C---------T---GCTA---CT---A-C---T---ACTAC---------TGCT---G--C-----TGC-TG---CT----G---C------T--G-C--aaaaac
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cgctaccgttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattactgccgttaccgCTACTGCCACCG-CTAC--CA---CAACCAACT--------ACC--ACTACAACTACCACT--A-CTGCTA---CT---GT-TAC------TGCCATTGTCACTGCCAC--------------C-----ACC---CACTA---C--C---ATGATAACTA---C---------C---ACTA---CC---A-C---T---ACAAC---------TGCT---A--C-----TGC-TA---CT----G---T------T--A-C--TGC---CACT---G-CTACCAC---T---AC---
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             actgATTAAT--A-CTGCTG---CT---AA-TAC------TG---TTG---CTGCTAT--------------T-----A-T---TACTT---CTAC---TA-----CTA---C----------------A---TT---A-AC--T---GCTAG---------TGCT---T--C-----TGC-TG---CT----G---A------T--T-C--TGA---TACT---A-CTTCTAC---catactaaaattactactgttac
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tactagtA--A-CTGTTG---CTTCTGT-CGC------TACAATCA---CTACTAC--------------T-----A-T---CACTA---CTAT---TG-----TTG---C---------T---GCTG---CT---G-C---T---TCTGT---------TACT---T--C-----TGC-CA---C----------------T--A-C--TAC---TACC---A-CTTCTAC---TTCCGC---TAA-TT-ATC--TACTCC-A---A-CTACTGG---aaccact
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taccattgttactacatgtatatatattctgatattgcttcagtaagtgttgctgagttactgcA--A-TTATTA---TT---AT-TAC------TACATGTA---CTATTAC--------------T-----A-C---TACTA---CTTC---AT-----TTA---A---------T---ACTT---AT---A-A---T---AGTTC---------TACT---T--C-----TAC-TT---CT----G---C------T--A-C--AAC---TA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gctacttttac--A-CTTCTG---CT---GC-TGC------TACTTCTG---CTGCTACAAACATGTATATGGTCAACGA-C---TACTA---TTTC---TT-----CTG---C---------T---GCTG---CT---G-T---T---TCTGT---------TGGT---A--CAAACATGTATA---TT----G---T------C--A-A--GAC---TACT---A-CTTCTGC---T---GT---TGC---------TACTTCTA--------CTGC---TACT-------
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tgttgtTA---TT---GC-TGC------CGCTTTTA---CTGCTTC--------------T-----G-T---AGCTT---CCAT---CT-----CTA---C---------T---CTTG---CT---T-C---G---ACTAC---------TGCCATGT--T-----TAT-CG---TC----A---T------T--A-C--TGC---GGCT---A----CCAT---C---GC---CAC-TT-T----TACTGCTA---G-AT-TTGC---TGCT-------TTTACTGC--TT------T----------TG---CTAGATTTGC---T---G-CT---T-------T-G-AC---T---T---TTT----A---T---A---CT---ACT--T---T------T----ACTA-----CT------T-----T-----T---G------CT---AC---T-----G---CTA-CTTCTGC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TG---CT---GT-TGC------TGCTACTG---CTACTAC--------------T-----A-C---TACTG---CTGC---TG-----CTG---C---------T---GCTG---C
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cgctaccgttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattactgccgttaccgcttccgctactgctacttcttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcttcTA---CT---AA-TAC------TACTTTTA---CAAATAC--------------T-----A-T---AACTA---CTTT---TT------TG---C---------T---TATATAACT---A-C---T---GCTAC---------TACT---T--C-----TAC-CATAACT----T---C------T--A-C--CAC---TACT---A-CAACTAC---
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         accattaagaatactatttcttcA---TT---GT-TAT------TGCTACTG---CCTCTGC--------------T-----A-C---AGATC---CTAC---TT-----TTA---C---------T---GCTG---CA---G-A---T---ACTTT---------TACT---G--C-----TGC-TG---CT----G---C------T--G-C--TGC---TGCT---A-CATTTAT---T---G--------TT-A---------CTA---G-TG-CTGG---TGTT-------ACTG---T--TG------T----------TGCATCTA------C---T---G-CT---G-------A-T-AC---T---A---
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cA---CT---GC-TGC------TGCTACTG---CTACTAC--------------T-----A-C---TACTT---TT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tactactacatgc---GC-TGC------TGCTGCTG---CTGCTGT--------------T-----A-A---AAGTA---CTAC---TT-----CTG---C---------T---AATA---CT---A-C---T---ACTGC---------TGTT---G--C-----TGC-TG---CT----G---T------T--A-A--TAC---Taatatcaataataatat
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      actgctgctgctgcttttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TAC------TACACCTA---CTTTTAT--------------A-----A-C---TACTT---CTAC---TA-----CTG---C---------T---GCTA---TA---G-A---T---GCTGC---------TGCC---A--C-----TGC-TG---TT----
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acTCTT----CTTCTAC--------------T-----A-CAG-TACTT---TTTT---TT---------------------------TA---CT---A-AGATT---ACTAA---------TATT---T--C-----TTC----------------T------T--A----TAC---TACT---A-CTTCTAC---T---AC---TAT-T
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctacaaatattCTT----CTACAAC--------------T-----A-C---TACTA---CTTC---TC-----ATA---C---------T---CCTT---CC---C-A---C---ACTAC---------TACT---A--C-----TACTCA---TC----A---TAA----T--C-C--TCC---TCCT---A-CTTCTACAATT---AC----GT-CT-ACTACTACTCCT----C-AT-CT-----TCCT-------CCTC---C--TC------C----------TA---CTA------C---T---A-CTA--TTACGGCGC-T-AT---T---AC--ATT----G---T---A---CT---ACTA-TA--C------T----GCTGTTATTTT------A-----C-----T---A------CT---AC---T-----A---CTA-CTTCTACTATTG-----AT--A--A-TA---------TTAG---TA------actaaaactacaaataa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aG---CTGCTGC--------------A-----G-C---TGCTA---TTAC---AT-----CTA---C---------T---ACTA---CT---A-C---T---ACTAC---------TGCT---G--T-----TGC-TG---CT----G---TTCATACT--A-C--TAC---TACT---G-CTGCTAC---T---GC---TGC-T
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTAC--------------T-----A-C---TATTG---CTAC---CA-----CTAACCC---------T---ACCG---CT---A-A---C---GCCAC---------CACT---A--C-----TGC-CA---CC----G---C------T--A-C--CAC---AACC---AACTACCAC---T---AC---AAC-T--------ACCACTA--------CTGC---TACT-------GTTA---C--T-------------------G---CCA------T---TGTCA-CT---G-------C-C-AC---C---A-----C----C---C---A---CT---ACC--A---T------G----ATAA-----CT------A-----C-----C---A------CT---AC---C-----A---CTA-CAACTGCTACTG-------------------------CTAC---TG------T---TACTGCCA----------------------CTG---------CTA----CCAC-----T---A---CC----A-------C-C-nnnnnnnnnnt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 caaTAC--------------T-----A-C---TACATGCACTGC---TG-----CTG---C---------T---ACTG---CT---A-C---T---ACTAC---------TACT---T--T-----Taccc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AC--------------T-----A-CTAATATTT---CTTC---AG-----CTA---C---------T---ACTG---CT---A-T---T---ACTAC---------TACTAAAT--C-----T----A---CT----A---A------T--A-T--TTC---TTCA---G-CTTCTAC---T---AC---------------TATTCCTA---A-AA-CTAA---TACT-------T------C--TT------G----------TA---CTA------C---T---A-TT---A-------T-T-GC---T---A----------C---C---A---CTAAAACT--A---C------T----AATA-----TT------C-----C-----T---T------TT---AC---T-----A---CTA-CTTCTACTAC-A-----GT--A--C-TA---------CTAT---TACTAAATT---TACTAATA----TTTC-aatatcaataataatat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gtactaagattactaaaAC--------------A-----A-C---AACTC---CTTC---TC-----CTC---A---------T---ACTA---CC---A-C---T---ACTAC---------TACG---A--C------GA-CG---AT----G---A------C--AAC--GAC---GACG---A-CTTCTAT---T---AC---TAC-TA-T----TACTTCT-------T-CTA------CT-------TCTA---C--TCCTCCTCA----------TA---CTA------C---T---A-C----T-------C-T-GC---T---G---CTG----C---T---G---AT---GCT--G---C------T----GGTA-----CT------A-----C-----T---T------CT---AC---T-----T---CTA-CTACTGCTGCTG-----CT--G--G-TG---------GTGC---TA------T---CACGACCA------TC-AC--C------TACTA-----------A----CGAT-----A---C---TT----A-------T---T---C-T----A-------CTGCT---G---G---CA------C---TGCA--A---C--AT--C---TAT---TAACT---CT--T---T-C---AG---A------TAC---TA---AT------A------C--C---CAT----GCCG---C-tacta
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AC--------------A-----A-C---TACTA---CTAC---TT-----CTG---C---------T---GCTG---CT---A-C---T---TCTGC---------TGCT---A--CAAACATGT-AT---AT----G---G------TCAA-C--GAC---TACT---A-TTTCTTC---T---GC---TG--------------------------CTGC---TGTT-------TCTG---T--TG------G----------TA---CAA------A---C---A-TG---T-------A-T-AT---TGTCA---AGA----C---T---A---CT---ACT--T---C------T----GCTG-----TT------G-----C-----T---A------CT---TC---T-----A---CTG-CTACT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTG---CTGC---TG-----CTG---C---------T---GCTG---TT---A-A---A---AGTAC---------TACT---T--C-----TGC-TA---AT----A---C------T--A-C--TAC---TGCT---G-TTGCTGC---T---GC---TGT-TA-A----TACTaaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      actgctgctgctgcttttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngC---TG-----CTG---C---------T---GCTG---CTTTTA-A---N---NNNNN---------NNNN---N--N-----NNN-NN---NN----N---N------N--N-N--NNN---NNNN---N-NNNNNNN---N---NN---NNN-NN-N----NGCTGCTG--------CTGC---TGCT-------GCTG---T--TA------A----------AA---GTA------C---T---A-CT---T-------C-T-GC---T---A---ATA----C---T---A---CT---ACT--G---C------T----GTTG-----CT------G-----C-----T---G------CT---GT---T-----A---ATA-CT
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         a---C---------T---GCTA---CT---T-G---T---TCTAC---------TACA---T--C-----TAC-CA---CA----A---C------T--A-C--TTC---TACT---A----CTAC---T---AC---TAT-TT-A----TTATGATA---A-----------TACT-------TTTA---C--TTTA----GCTGACGATGCTG---CTC------C---T---A-CT---T-------TATAAC---T---A---ATA----C---T---G---CT---ACT--gta
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gctgcct---------T---ACTA---CT---ACA---T---GC-AC---------TGCT---G--C-----TGC-TA---CT----G---C------T--A-C--TAC---TACT---A-CTTTTAaat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ---GCTG---CC---T-C---T---GCTAC---------TTGT---T--C-----TAC-TA---CA----T---C------T--A-C--CAC---AACT---A-CTTCTAC---T---AC---------------TACTACTA--------------------------TTTA------TT------A----------TG---ATA------A---T---A-CT---T-------T-T-AC---T--------TTAG--C---T---G--------AC-------------------GATG-----CT------G-----C-----T---C------CT---AC---TTTATAA---CTA-ATACTGCTACTatatcaataataatat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TA---CT---A-AAACT---ACTAA---------TATT---T--C-----TTC-AG---CT------------------A-C--TAC---TGCT---A-TTACTAC---T---AC---TA---A-A----T-CTACTA---ATAT-TT-------CT-------TCAG---C--TT------C----------TA---CTA------C---T---A--T---T-------C----C---T---A---AAA----C---T---A---AT---ACT--T---C------T----TGTA-----CT------A-----C-----T---A------TT---AT---T-----G---CTA-CCACTAAAACTA-----CT--A--A-TA---------TTCC---TT------T---TACTACTA----CTT---------------------------CTA----CTAC-----A---G----T----A------------------------------CTACT---A---T---TA------C---T--A--AATTT--A---CTAATAT---T---T---CTACT---aat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtactaagatT---A-A---T---ACTGC---------TGCT---A--A-----TAC-TG---TT----G---C------T--G-C--TAT---TATT---A-CTTCTAC---T---AC---TACATT-A-----ACTGCTA---G-TG-CTTC---TGCT-------GCTG---A--TT------C----------TG---ATA------C---T---A-CT---T-------C-T-AC---a
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tactagtatT---G-A---T---ACTAC---------TGCT---G--C-----TGC-TG---CT----G---C------A--A-T--TAC---aaccact
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tacgactactactattacgta---A-A---T---TCTAC---------TTCT---T--C-----TAC-TA---CT----T---T------T--A-C--TAC---TACA---A-CTACTAC---T---GC---T-T-CT-ACTATTACTACAA---A-AA-CTAC---TA------------A---T--GT------N----------NN---NNN------N---N---N-NT---T-------C-T-AC---T---A----------T---T---A---CT---ACcgccgccgccatcaaaaccactaccaacta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tcatcaccaccaccaccaccacaaT----G---T------T--A-T--TGC---TACT---G-CCTCTGC---T---AC----------A----GA-TCCTA-----------------CT-------TTTA---C--T-------------------G---CTG------CAGAT---A-CT---T-------T-T-AC---T---G------------------------------------C------T----GCTG-----CT------G-----C-----T---G------CT---GC---T-----G---CTA-CATTTATTGTTA-----CT--A--G-TG---------CTGG---TG------T---TACTGTTG----TTGC-AT--C------TACTG---------CTG----ATAC-----aaaaac
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cat------T--A-C--TAT---TACT---A-CTACTAC---T---TC----AT-TTAA----TACTTATA---A-----TAGTTCTACT-------TCTA---C--TT------C----------TG---CTA------C---A---A-CT---ta
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gctacttttacaattattattattactacatg--A-C--TAC---TACT---A-CTTCTGC---T---GC---TGC-T--------ACT----------T-CTGC---TGCTACAAACATGTA---T--AT------G-----------G---------------------------T-------C-A-AC---G---A----------C---T---A---CT---ATT--T---C------T----TCTG-----CT------G-----C-----T---G--------------------------CTG-TTTCTGTTGGTACAAACAT--GT-A-TA---------TTGT---CA------A---GACTACTA----CTTC------------TGCTG---------TTG----CTA------------------------------------C-T----T-------CTACT---G---C---TA------C---T--A--A---a
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aca--TAC---TAGT---A-TTAATAC---T---GC---TGC-TA-A----TACT---------GT--TGC---TGCT-------ATTA---T--TA------C----------TT---CTA------C---T---A-CT---A-------C---AT---T---A---ACTG---C---T---A---GT---GCT--T---C------T----GCTG-----CT------G-----A-----T---T------CT---GA---T-----A---CTA-CTTCTACa
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gctacttttacaattattattattactaca----------TG---CTA------T---T---A-CT---A-------C-T-AC---T---A---AAT----C---T---A---CT---AATA-T---T------T----CTT------CA------G-----C-----T---T------CT---AC---T-----A---CTA-TTCCTAAAACTA-----AT--A-----C---------TTCT---TG----------TACTACTA----TT----A--T------TGCTA---------CCA----CTAA-----A---A---CT----A---------------C-T----A-------ATATT---C---C---TT------T---T--A--C---T--A---C---TAC---T---T---CTACT---A-CAG-TA---C------TAC---TA---TT------A------C--TAAATTT----ACTA---A-T------AT--------T---TCT---A---C------------TAaacta
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gctgctgcagc----------TA---CTA------A---T---A-TT---T-------C-T-TC---T---T---ATA----C---T---A---CT---ACT--T---C------T----ACTA-----CT------A-----T-----T---A------CT---AA---A-----A---CTA-Cctnnnnnnnnnnt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ctacaaatatttcttcttctactacagtactttttttttactaagat----------TA---CTA------T---T---T-CT---T-------C-T-AC---T---A---AT-------------A---CT---ACT--T----------------TTA-----CA------A-----A-----T---A------CT---AT---A-----A---CTA-CTTTT-TTGCT-------T-----A-TA---------TAAC---TA------C---TGCTACTA----CTT---------------------------CTA----CCAT-----A---A-------------------------C-T----T-------CTACC---A---C---TA------C---T--A--C---A--A---C---TAC---aaataa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    accattaagaaG---CTG------C---C---T-CT---G-------C-T-AC---T---T---GTT----C---T---A---CT---ACA--T---C------T----ACCA-----CA------A-----C-----T---A------CT---TC---T-----A---CTA-CTACTACTATT---------------TA---------TTAT---GA------TAA-TACTTTTA----CTTT-AG--CTGACGATGCTG---------CTC----CTACTTTATA---A---CT----A------------------------------ATACT---G---C---TA------C---T--A--A---T--
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ---CTA------C---T---A-CA---C-------C-T-AC---T---T----TT----A---T---AA--CT---ACT--T---C------T----ACTA-----CT------G-----C-----T---G------CT---ATAGAT-----G---CTG-CTGCCACTGCTG-----
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aTA------C---T---A-CT---T-------T-T-AC---A---A---ATA----C---T---ATAACT---ACT--T---T------T-----TTG-----CTTATATAA-----C-----T---A------CT---GC---T-----A---CTA-CTTCTACtt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        accattaagaatactatttcttctactaaA------C---T---C-CT---T-------C-T-CC---T---C---ATA----C---T---A---CC---ACT--A---C------T----ACTA-----CG------A-----CGACGAT---GACAA--CG---AC---G-----A---CGA-CTTCTATTACT----------------A---------CTAT---TA------C---TTCTTCTA----CTTC-TA--C------TCCTC---------CTC----ATAC-----T---A---CT----A---------C-T---C-T----G-------CTGCT---G---C---TGATGCTGC---T--G--G---T--A---C---TAC---T---T---CTACT---T-C---TA---C------TAC---TG---CT------G------C--------T----GCTG---G-T------GG--------T---GCT---A---T------------CACGACCATCA-CCTA------CTAAC----GATAC---TT--A--T--TCTACTGCTGGCACTGCAACcataacttctaccactactacaactac
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acaacaA------C---T---A-CT---A-------C-T-AT---T---A---CGT----A---T---G---AT---ACT--A---C------T----GCTG-----CT------G-----C-----T---G------CT---GC---A-----A---TTA-CCGCCGCCGCatctattaactctttcagatactaatacccatgccgc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tacg------C---T---A-CT---T-------T-T-AC-------A---ATTATTAT---T---A---TT---ACT--A---CA-----T----GT-A-----CT------A-----T-----T---A------CT---AC---T-----A---CTA-CTTC-ATT----------T--A--A-TAC--------TTA----TA------A---TAGTTCTA----CTTC------------TACTT---------CTG----CTAC-----A---A---CT----A-------catcaaaaccactaccaacta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                g---A-CT---T-------C-T-AC-------A---ACTA---C---T---A---CT---ACT--T---C------T----CATA-----CT------C-----CT----T---C------CC---AC---------A---CTA-CTACTACTACTC-----AT--C--A-TA---------ATCC---TC------C---TCCTACTT----CTAC-AA--T------TACGT---------CTA----CTAC-----T---A---CTCCTCA-------T-C-TTC-C-T----C-------CTCCT---C---C---TA------C---T--A--C---T--A---C---TAT---T---A---CGGC----G-C---TA---T------TACA--TT---GT------A------C--TAC-TAT----ACTG---C-T------GTTATTTTACT---ACT---A---C------------TACTACT-TCT-ACTATTG---ATAAT----ATTA----GT--A--
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -------C-T-AC---T---AC--ATG----C-------A---CT---GCT--G---C------T----GCTA-----CT------G-----C-----T---A------CT---AC---T-----A---CTA-CTTTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ta-AC---T---A----------C---T---A---CT---ACT--T---C------T----GCTG-----CT------G-----C-----T--------------------------------A-CTTCTGCTGCTACAAACAT--GT-A-TA---------TGGT---CAA-----C---GACTACTA----TTTC-----T------T-CTG---------CTG----CTGC--------------T----G-------T---------T----T-------CTGTT---G---G---TA------C---A--A--A---C--A---TG--TA-------------TATT---G-T---CA---A------GAC---TA---CT------A------C--T---TCT----GCTG---T-T------GC--------T---ACT---T---C------------TACTGCT-----ACTAAAaatatcaataataatat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aca---A---ATT----C---T---A---CT---TCT--T---C------T----ACTA-----CT------T-----T-----T---A------CT---AC---T-----A---CAA-CTACTACTGCTT-----CT--A--C-TA---------TTAC---TA------CAAAAACTACTAATGTNNNN-NN--N------NNNTT---------CTA----CTAT-----T---A---CT----A-------
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcatcaccaccaccaccaccacaa----C---T---A---CT---ATT--T---C------T----GTTG-----CT------G-----C-----T---G-------T---CC---T-----G---CCA-CTTTCGCTGTCA-----TT--GCCA-TA---------CTA----TA------T---CACCGC------CTCC-AC--C------TTCT----------CTA----CCAC-----AAGCA---CT----A-------T-C-A---C-TACAAT-------CCACC---A---C---TA------T---C--A--T---T--A---G---TGC---T---A---CTGCT---G-C---TA----------------TC---G----------------------AT----GCTT---C-T------GG--------A---ACT---A---C------------Tcaaaaac
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ----C---T---A---CT---ACA--T---G------C----ACTG-----CT------G-----C-----T---G------CT---AC---T-----G---CTA-CTACTACTACTT-----TT--A--A-TA---------TCAA---TA------A---TAATA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ta---A---TT---ACT--G---C------C----GTTA-----CC------G-----C-----TTCCG------CT---AC---T-----G---CTA-CTTCTTCTNNNN-----NN--N--N-NN---------NNNN---NN------N---NNNNNNNN----NNNN-NN--N------NNNNN---------NNN----NNNN-----N---N---NN----N-------N-N-NNNGC-T----T-------CTGCT---G---T---TG------C---T--G-------------------------------CTACT---G-C---TA---C------TAC---TA---CT------A------C--T---GCT----GCTG---C-T------GC--------T---GCT---G---C------------t
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cgctaccgttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT---ATT--G---C------T----ACTG-----CC------T-----C-----T---G------CT---ACAGAT-----C---CTA-CTTTTACTGCTG-----CA--G--A-TA---------CTTT---TA------C---TGCTGCTG----CT----G--C------TGCTG---------CTG----CTAC-----A---T---TT----A-------T---T---G-T----TACTAGTGCTGGT---G---T---TA------C---T--G--T---T--G---T---TGC---A---T---CTACT---G-C---TG---A------TAC---TA---
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---C------T----ACTA-----CT------A-----T-----T---G------CT---AC---C-----A---CTA-ACCCTACCGCTA-----AC--G------------------------------C---CACCACTA----CT----G--C------CACCG---------CTA----CCAC-----A---A---CC----A--------------------------------ACT---A---C---CA------C---T--A--C---A--A---C---TAC---C---A---CTACT---G-C---TA---C------TGT---TA------------------C--T----------GCCA---T-T------GT--------C---ACT---G---C------------CACCAC---CC-ACTACC----ATGAT----AAC------T--A--C--C--ACTACCA---CTACAACTGCTACTGCT-----ACTG------TT--ACTG---C-------CACTG------------CT
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  actgcaataactgcaaacG-----CT------G-----C-----TGCAG------CT---GC---T-----A---TTA-CATCTACTAC----------------TA---------CTAC---TA------C---TACTGCTG----TT----G--C------TGCTG---------TTC----ATAC-----T---A---CT----A---------------C-T----A-------CTGCT---G---C---TA------C---T--G--C---T--G---C---T
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gctgctgcagctgctattacatT------G-----T-----T---A------TT---GC---T-----A---CTG-CCTCTGCTACAG-----AT--C---------------CTAC---TT------T---TACTGCTG-------C-AG--A------TACTT---------TTA----CTGC-------------------------------------T----G-------CTGCT---G---C---TG------C---T--G--C---T--G---C---TAC---A---T---TTATT---G----------T------TAC---TA---GT------G------C--T---GGT----GTTA---C-T------GT--------T---GTT---GCATC------------TACTGCT-nnnnnnnnnnt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cat------CT---AC---T-----A---CTA-CAACTATAACTG-----AT--A--C-TA---------CAAC---TA------TAG-TACTACTA----TTAC-AG--T------T-CTG---------CTgatacta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acaacaaC---T-----A---CTT-CTTCTACTACTT-----TT--A--C-TA---------CTAC---AA------C---TACTACTG----CTTC------------TACTA---------TTA----CTACAAA--A---A---CT----ACTAATGTN-N-N---N-N----N-------NNNNT---T---C---TA------C---T--A--T---T--A---C---TAC---tgtattaaaatcactaaatttgctac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tcatcaccaccaccaccaccacaaaatt---CTG-CCTCTGCTACTT-----GT--T--C-TA---------CTAC----A------T-----CTACCA-------C-AA--C------TACTT---------CTA----CTAC-----T---A---CT----A---------C-T---A-T----T-----------T---A---T---TA------TGA-T--A--A---T--A---CTTTTAC---T---T---TAGCT---GACGA-TG---C------TGC---TC---CT------A------C--T---T---------------T------AT--------A---ACT---A---A------------TACTGCT-----ACTAAaaaaac
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         g-TG---------TTGT---TG------T---TACTTTTA----CT----G--T------TGCTGATACTTTTACTG----CTAC-----A---A---CT----T-------T-C-A---C-T----G-------TTGCT---A---T---TT------C---T--A--A---A--A---C---TAC---C---A---CCACTATAA-C---TA---C------TAC---TA---t
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A---------TTAC---TAAAA---C---TACTAATA----TTTC-----T------T-CAG---------CTA----CTAC-----T---G---CT----A-------T-T-A---C-T----A-------CTACT---AAATC---TA------C---T--A--A---T--A---T---TTC---T---T---CAGCT---T-C---TA---C------TAC---TA---TTCCTAAAA------C--T---AAT----ACTT---CTT------GTAC------T---ACT---A---T------------TATTGCT-ACC-ACTAAAA---CTACT----AATA----TT--CCTT--T-TACTACTA---CTTCTACTAC
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cA---------TTAT---TA------T---TATTACTA-------C-AT--G------TACTA---------TTA----CTAC-----T---A---CT----A-------C-T-T---C-A----T-------TTAAT---A---C---TT------A---T--A--A---T--AGTTC---TAC---T---T---CTACT---T-C---TG---C------TAC---ta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gctacttttacaTAC---TA------A---TACTACTT----TTAC-A--------------A---------ATA----CTAT-----A---A---CT----A---------C-T---T-T----T-------TTGCT---T---A---TA----------T--A---------A---C---TAC---T---G---CTACT---A-C---TT---C------TAC---CA---TA------A------C--T---TCT----ACCA---C-T------AC--------T---ACA---A---C------------TACaacta
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       accattaagaatactatttcttcA------C---TACTACTA----CTTC-TG--C------TGCTG---------CTA-------------------------------------------C-T----T-------CTGCT---G---C---TA------C---A--A--A---C--A---TG--TA--------T---ATGGTCA-A-C---GA---C------TAC---TA---TT------T------C--T---TCT----GCTG---C-T------GC--------T---GTT---T---C------------TGTTGGT-----AC-AAAC---AT-GT-----ATA----T-----------------TG---TCAAGACTACTACTTCT-----GCTG------TT--GCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aca---TACTAGTA----TT---AA--TAC----TGCTG---------CTA----ATAC---------------------------------------------------TGTT---G---C---TG------C---T--A--T---T--A---T---TAC---T---T---CTACT---A-C---TA---CATTAACTGC---TA---GT------G------C--T---TCT----GCTG---C-T------GA--------T---TCT---G---A------------TACTACT-TCT-ACacttctactgctactaaa
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cCTACTA----CTTT---------------TA---------CTA----CTAC-----A---A---CT----A---------------C-T----A-------CTGCT---T---C---TA------C---T--A--T---T--A---C---TAC---A---------------A-A---AA---C------TAC---TA---AT------G---------T---NNN----NNNN---N-N------NT--------T----CT---A---C------------TATTACT-ACA-Aaaataa
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gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             actgctgctgctgcttttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctgctgctG--T------TGTTG---------TTA----CTTT-----T---A---CT----G-------T-T-G---C-T----G-------ATACT---T---T---TA------C---T--G--C---T--A---C---AAC---T---TTCACTGTT---G-C---TA---T------TTC---TA---AA------A------C--T---ACC----ACCA---C-T------AT--------A---ACT---A---C------------TACT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tGCTG---------CTA----TTAC-----A------------------------------------T-------CTACT---A---C---TA------C---T--A--C---T--A---C---TAC---T---G---CTGTT---G-C---TG---C------TGT---TC---AT------A------C--T---ACT----ACTA---C-T------GC--------T---GCT---A---C------------TGCTGCT-a
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gctgctgcaGCTA---------CTT----TTAC-----A---A---TT----A-------T---T---A-T----T-------AT--T---A---C---TA------C---A--T--G---T--A---C---TAT---T---A---CTACT---A-C---TA---C------TTCATTTA---AT------A------C--T---TATAATAGTT----C-T------AC--------T---TCT---A---C------------TTCTGCT-ACA-ACTAnnnnnnnnnnt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GCTG---------CCT----CTGC-----T---A---CT----------------T---G-T----T-------CTACT---A---CATCTA------C---C--A--C---A--A---C---TAC---T---T---CTACT---A-C---TA---C------TAC---------T------A------T--T---TAT------TA-----T------GA--------T---AAT---A---C------------TTTTACT-TTA-GCTGACG---AT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---------CTT----CTAC-----A---A---CT----A------------------------------CTACT---A---C---TT------C---T--C--A---T--A---C---TCC---T---T---CCCAC---A-C---TA---C------TAC---TA---CT------A------C--T---CAT----CATA---A-T------CC--------T---CCT---C---C------------TACTTCT-ACA-ATTACGT---CTACT----ACTACTCCTC--A--TC-T-TCCTCCTC---CTCCTACTACTACTATTACGGCGCTA------TTACATTG---TACTACTATACTG------------CTGTTAT-TTT-ACTgctgctcctactttataactaatactgctactaat
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gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aTA----CTAC-----T---A---C-----A-------TGC-A---C-T----G-------CTGCT---G---C---TA------C---T--G--C---T--A---C---TAC---T---A---CTACT---T-T---TA---A------TAT---CA---AT------A------gtt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ----CTAC-----A---A---AT----A-------T-T-T---C-T----T-------CTTCT---A---C---TA------C------A--G---T--A---C---T-T---T---T---TTTTT---A-C---TAAGAT------TAC---TA---AT------ATTTCTTC--T---TAT----ACTA---C-T------AC--------TTCTACT---A---C------------TATTACT-AAA-ACTACAA---ATAAataatat
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gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -C---TA---C------TAC---TA---TT------A------C--G---TAT----GATA---C-T------AC--------T---GCT---G---C------------TGCTGCT-GCA-ATTAttcactgttgctatttctaaaactaccaccactataactactacta
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ----GCTG---C-T------GC--------T---GCT---G---C------------TGCTGTT--------AAA-------------AGTA----CT--A--C--T-T-CTGCTA---ATACTACTAC------T-----GCTG------TT--GCTG---C-------TGCTG------------TT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             actgctgctgctgcttttaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTG---C-T------GT--------T---GCT---G---C------------TACTGCT-ACT-ACTAaatact
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): TATTTCCCGGAGAGTTGACAAATCGCCTACGCAGTATTCTACTACTACTACCACTACCACAACCGAAACCACAACCACCACCACCACCACTATTACTAACACAACTACTACTACCATTGCCGCTA
Unaligned ( gi|27 ): TTATTATGATAATACTTCTAGTTTAGCTGATGATGCAGCTACTACTTTATAACTAATACTGTTACTAACAG






Alignments
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Reference ( family-319 )      :                                              CTTCTACT----CCTACTACCGCTACNACAA-CGAC-ANCAATAAACNACNACNACAACACCAAC-A--ACGAATATAATAACTACTNC---TGCT---G------CTATTACTANTA-CTTCTN---CTACTGCTACTN---CTACTGCTACTGCTGCTNCNNCTACNNCTNNTCCTNCNNCTACNNCTNNTNCTNCNNCGNCTNNTCNNCNTNNTNTAACTNTTGCTGCTACNACTACTAC-T-------------CTACTACTGCTGCT---GCTACAACTACTNTTNCTGCTGCT---ACTACTACTGCATACT-CT-GCTGCTGCTACTACTACNACTACTNCTGCTGCTACTACTACTACTTCT-------GC-------TGCN----GCTACTNCTACT---ATTTCTACTCTTTTCTTTTACTATGGCTACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTATATTTTGCTA-----TTCATCTTCTTCTNCTACTGCTACTTCTACNACGACNACGAACNACAACNACNACNACAAAAACTGCTA---CTGCTACTGCTNTTGCTGCTACTA---C--TACTNCTNCTNCTGCTGCTGCTANTACT-----AC---------T---GCTNC-----TGCCGCT---GCT--ACTACTAC---TACTNCTAC---TGC------T-GCTNA--TACT---NCTA---C------------TGCTGCTTCTAC-T---TNT----G-CTACT---ACTTCTAC-T---A-A-TNCT---ACTACTTCTGC---TGCTG---C-TG--CTACT------ACTACTNCTGCTG---CTGNT-GT----ACTACTACTACTACTACTTCAGCT---G-CT--GCTACTACA---ACT----A---T-T-CTT-C--TGCTGCTACTANTACTACTTCTG---CTGCTACTAC----T-AN---TAC--T---TNTGCTGCTGT--------TACTACTA-CTGCTNC---N---ACTANNGATAAT----AATATTATTT--ACTG---CTGCTACNACTACTACTTCTGCTGTTGCTGTTACTGTTGTTGCTTTACTTTTTATA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CAATAACTGCAAACGTTGCTAAAGCTGCTACCGCTGCTGCTGCTATTA---CGGTCTTATTTCTATTACTAATATTCATACTTTATAAT---------TTAGAATATA----TG----T---ACT--ACGACTAC---TACTACTATTTGTGC------T-TCTCA--TACTAAAATTA---C------------TACTGTTaaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                actgGTTGCTAAAGCTGCTACCG---CTGCTGCTGC----T-AT---TACGGT---CTTATTTCTAT--------TACTAATA-----TTC---AT--ACT--TTATAATTTAGAATAT-ATGT--ACTA---CGACTACTACTACTATTTGTGCTac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   actgcaataactgcaaacCT---ACTATTTCTGT---TGCTG---C-TG---TCCT------GCCACTTTCGCTGTCATTGCC-AT----ACTA-TATCACCGC--CTCCACCT---T-CT---CTACCACAAGCACT----A---T-CACTA-CAAT-CCACCACTATCATTAGTGCTA---CTGCTGCTAT----C-GA---TGC--T---TCTGtctcatactaaaattactactgttac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTGCTGCTGCTGCTTTTAAN-----NN---------N---NNNNN-----NNNNNNN---NNN--NNNNNNNN---NNNNNNNNN---NNN------N-NNNNN--NNNN---GCTG---C------------TGCTGCTGCTGC-T---GTTAAAAG--TACT---ACTTCTGC-T---A-A-TACT---ACTACTGCTGT---TGCTG---C-TG--CTGTT------AATACTgaactact
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aATTGTTA---TTGCTACTGCCT---CTGCTACAG---A--TCCTACTTTTACTGCTGCAGATACTTTT-----AC---------T---GCTGC-----TGCTGCT---GCT--GCTGCTACATTTATTGTTAC---TAG------T-GCTGG--TGTT---ACTG---T------------TGTTGCATCTAC-T---GCT----G-ATACT---A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cTTCTAC-T---TCT----T-CTACT---ACTTTTAC-T---A-C-TACA---ACTACTACTGC---TTCTA---C-TA--TTACTACAAAAACTACTAATG-TN---NNNNN-NN----NNTTCTACTATTACTAC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tcatcaccaccaccaccaccacaaaaCTGCCTCTGCTACTTGTTCT-----AC---------T---ACATC-----TACCACA---ACT--ACTTCTAC---TACTACTAC---TATTTATTAT-GATAA--TACT---TTTA---CTTTAGCTGACGATGCTGCTCCTACTT---TATA---A-CTAAT---ACTGCTAC-T---A-A-Taaaaac
gi|18                         :                                              gTTCTACT----ACTACTACCACTACCACAACCGAA-ACCA--CAACCACCACCAC--CACCACT-ATTACTAACACAACTACTACTACCATTGCC---G------CTA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatttcccggagagttgacaaatcgcctacgcagtaCTTCTACTAATACTACTT---TT---A-CA--AATACTATA---ACT----A---C-T-TTT-T--TGCT--TA-TATAACTACTGCTA---CTACTTCTAC----C-AT---AAC--T---TCTACCACTAC--------TACAACTA-C
gi|2                          :                           accattaagaatactatttCTTCTATTATTACCTACTACTATTACAACAA-CTACTATTATTACACTACTACTACAATAC-AACTATTACTACTACAACAACTACTAT---TACTTGTA------CTATCATTATTA-CTTCT------ACTGCTACTA---CTATAACTGCTGCTGCTACTACTACTTCTACTCCAACTTTTACTACCAATACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTA--TATT-TTGCTACTACTTCT---T-------------CTATTACTATGGCT---------ACTAATATGCCT-TTG-------TAATAGTGTATATT-TT-GCTACTACTACCTCTTCTATTACTA-TG--GCTACTAATA-TGCCTTT-------GTAATAGTGTGTATTTTGCTACTACTACTTGTATTACTAC-CTTTTCTTTTACTATGGCTACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTATATTTTGCTA----------CTACTACTTCTATTACTACTTCTACTA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atatcactggtgccaatgcatgtttatgaaattttaaacattagatacaatggccatctgcttttatttcatctttttcttTACTAG---TATTAATAC---TGC------T-GCTAA--TACT---GTTG---C------------TGCTATTATTAC-T---TCT----A-CTACT---AC----AT-T---A-ACTGCT---AGTGCTTCTGC---TGCTG---A-TT--CTGAT------ACTACTTCTACatatc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCT---GCTGCAGCTGCTATTACATCTACT---ACTACTACTAC-TACTGCT-GTTGCTGCTGTTCATACTACTACTACTGCTGCTACTGCTGCTaaccact
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTACTTTTA---CAATTATTAT----T-AT---TAC--TA--CATG-TACTAT--------TACTACTA-CTACTTC---ATTTAATACTTATAAT----AGTTCTACTTCTACTT---CTGCTACAACTAnnnnnnnnnnt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gTGTTGTT---GTTACTTTTACTGTTGCTGATACT---TTTACTGCTACA-ACT-TTCACTGTTGCTATTTCTAAAACTACCACCACTATAACTACTACTA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----ACAACAACTACTACTA---CAACTATAA-CT--GATACTACA---ACT----A--------------TAGTACTACTATTAC-AGTTCTG---CTTGTATTAA----A-AT---CAC--TAAATTTGCTAC
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     TACGACTACTAC-TATTACGTATGATACTACTGCTGCTGCT---GCTGCAATTACCGCCGCCGCCATCAAAACCACTAC
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -CTACT---ACTATTAC-G---T-A-TGAT---ACTACTGCTGC---TGCTG---C-TG--CAATT------ACCGCCGCCGCcaacta
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tacga-CTACT---ACACCTAC-T---T-T-TATA---ACTACTTCTAC---TACTG---C-TG--CTATA------GATGCTGCTGCCA---CTGCT-GT----catcaaaaccactaccaacta
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aCAACTACACCTAATAGTACTACCA---CTACTACCGCCACCGCTACCATCA---C--CAACACTAATACTACTACTACTAATACT-----ACAACAACAACT---ATTGT-----TGCTGCT---GCC--ACTGCTGC---TACTACTAC---TGC------T-GCGTC--TACT---ATTA---C------------TG----------------AT----G-CTACT---ACTTCTAT-T---G-A-TATT---ACCACTACCAT---TGTCA---C-TG--TCACT------ACTACTGCTGCTA---CT-AT-A-----ACTACTATTACAACTGCT---GCT---G-CT--GCTGCTATA--------------------------GTTACTACTATTACAACTGCGG---TTGCTACTAC----G-AC---TAt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     actatttaaagtatgttcctgaaggTACTACTACATGCA-CT-GCTGCTGCTACTGCTACTACTACTACTaaattactatttactacctac
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TACTAC----T-ACATGCAC--T---GCTGCTGCTAC--------TGCTACTA-CTACTACTTTT---AATATCAATAAT----AATATtttaatatcaataataatat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTTCTCCTCATACTACCACTACTACTACGACGACGA-TGACAACGACGACGAC------TTCTA---TTACTACTATTACTTCTTCTACTT---C--TACTCCTCCTCATACTACTACT-CTGCT-----GC---------T---GCTGA-----TGCTGCT---GGT--ACTACTTC---TACTTCTAC---TAC------T-G--------CT---GCTG---C------------TGGTGGTGCTA--T---CAC----GACCATC---AC--CTAC-T---A-A-CGAT---ACTTATTCTAC---TGCTGGCAC-TG--CAAC
gi|4                          :                                                                                                                     acaacaactcACTGCTGC---TGCT---GGTGGTGCTATCACGACCATCACCTA---CTAACGATACTTATTCTACTGCTGGCACTGCAACATCTATTA--ACTCTTTCAGATACatctattaactctttcagatactaatacccatgccgc
gi|5                          : acaacaactccttctcctcatactaccactactactacgacgacgatgacaacgacgacgacttctattactactattacttcttctacttctactcctcctcatactactactctgctgctgctgatgctgctggtactacttctacttctactTACTAAGA-TTACTAAAACTACTAATATTT---CTTCAGCTACTACTGCTATTACTACTACTAA------ATCTACTAATATTTCTTCAGCTTCTACTACTATTCCTAAAACTAATACTTCTTGTACTACTAT-T------------------ATTGCTACC---ACTAAAACTACTAATATTCCTTTT---ACTACTACT------T-CT-ACTACAG-TACTACTATTACTAAATTTACTAATATTTCTACTAtaatacccatgccgc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                  gTTCTTCAGCTACTACTGCTATTACTACTAC-TAAAT---------CTACTAATATTTCTTCAGCTTCTACTACTATTCCTAAAACT---AATACTTCT-TGTACTACT-ATTATTGCTACCACTAAAACTACTAATATTCCTTTTACTACTACTTCT-------AC-------TACA----G----TACTACT---ATTACTA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gtactaagattactaaaactactaatat---ACTTCTAC-A---A-C-TACT---ACTACTTCTCA---TACTC---CTTC--CCAC-------ACTACTACTACTA---CTCATCAT----AATCCTCCTCCTACTTCTACAATT---A-CG--TCTACTACT---ACTCCTCATCTT-C-CTC-C--TCCTCCTACTACTACTATTACGG---C-GCTATTACATTGT-AC---TAC------TATACTGCTGTTATTTTACTACTACTA-CTACTTC---T---ACTATTGATAAT----ATTAGTAaatttactaatatttctacta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATT-----AC---------T---GCCGT-----TACCGCTTCCGCT--ACTGCTAC---TTCTTCTNN---NNN------N-NNNNN--NNNN---NNNN---N------------NNNNNNNNNNNN-N---NNN----N-NNNNN---NNNNNNNN-N---N-N-NGCT---TCTGCTGTTGC---TGCTA---C-TG--CTACT------ACTACTACTGCTG---CTGCT-G------CTGCTGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cgctaccgttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTAC---TACTA---T-TG--CTACC------ACTAACCCTACCG---CTAAC-GCCACCACTACTGCCACCGCTACCACAACC---AACT--ACCACTACA---ACT----A-------CCA-C--TACTGCTACTGTTACTGCCATTGTCACTGCCACCAC----CCAC---TAC--C----ATGATA-------------ACTACCA-CTACCAC---T---ACAACTGCTACT----GCTACTGTT---ACTGCCACTGCTACCACTACCAC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         caaCTGCCG---CTTTTACTGCTTCTGTAGCTTCCATCTC--TACTCTTGCTTCGACTACTGCCATGTTT-----AT---------C---GTCAT-----TACTGCG---GCT--ACCATCGC---CACTTTTAC---TGC------TAGATT---TGCT---GCTT---T------------TACTGCTTTTGC-TAGATTT----G-CTGCTTTGACTTTT---T---A------T---ACTACTTTTAC---TACTT---T-TG--CTACT------GCTACTTCTGCcaccc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): CTACAAATATTTCTTCTTCTACTACAGTACTTTTTTTTTACTAAGATTACTAATATTTCTTCTTATACTACTACTTCTACTACTATTACTAAAACTACAAATAA
Unaligned ( gi|27 ): TTATTATGATAATACTTCTAGTTTAGCTGATGATGCAGCTACTACTTTATAACTAATACTGTTACTAACAG
Unaligned ( gi|28 ): ACAACAACAACAGCAGTAGCAACAGCAACAACAACAACAACAAAACCGAGTCTGCTATTTTCTTTTGTT






Alignments
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --ACTGCAAT---AACTGCAAACGTTGCTAA--AGCTGCTA---C---CGCT-GCTGCTG------CT---ATTACGGTCTT---ATTTCTATTACT---A-A-TATT-----CATACTTTATAATTTAGAATATATGTACTACGA-----CT------A--CTAC---------T------ACTATTTGT-GCT---TCT--C-A-T-ACTAAAATTACTAC--TGT---TA-C-aaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                 ATAACTGCAAACGTTGCTAA------AG---CTGCTACCGCTGCT---GCTGCTATTACGGTCTTATTTCTATTACTAATATT-CATACT-TT-A-------TAATT-TAGAATATATGTACTACGACTACTACTACTATTTGTG-C-------T
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  actgcaCT-----ACTATTTC-----------------TGTTGCTG-----CT------GTCCTGC---------C------ACTTTCGCT-GTC---ATTGCC-A-T-ACT---A-TATCAC--CGC------C-TCCACCTT---CT---CTACCACAAGCACTAT-CACTACAAT-CCACCACTATCATTAGTGCTAC---TGCTGCT---AT----CGATGCTTCTGtctcatactaaaattactactgttac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACTGCTGCTGCTGCTTTTAANNNNN-N---------NNNNNN-----NNNNNNNNNN--NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNN--NGCTGCTG---C---TGCT-GCTGCTG------TT---AAAAG--TACT---ACTTCTG---CT---A-A-TACT-----ACTACTGC-----------------TGTTGCTG-----CT------G--CTGT---------T------AATACTgaactact
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTGTTATTGCTACTGC-----CT-CTGCTACAG---ATCCTACTTTTACTGCTGCAGATACTTTTA-C---------TGCTGC-----TGCTGCTGCT--GCTGCTACATTTATTGTTACTAGTGCTGG--TGTTACTG---T---TGTT-GCATCTA------CT---GCTGA--TACT---A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cTTCTA------CT---TCTTC--TACT---ACTTTTA---CT---A-C-TACA-----ACTACTAC-----------------TGCTTCTA-----CT------A--TTAC---------TACAAAAACTACTAAT-GTN---NNNNNN-N-N-NTT----CTACTAT--TAC---TA-C-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcatcaccaccaccaccaccacaaaaG---C---TGCC-TCTGCTA------CT---TGTTC--TACT---ACATCTA---C--------CACA-----ACTACTTC-----------------TACTACTA-----CT------A--CTATTTATTATGAT------AATACTTTT-ACTTTAGCTGAC-GAT-GCT---GCTCCTACTTTAT---AA-C-T-AA--TA---CT--GCTACTAaaaaac
gi|18                         :                     TTCTACTA----CTACTACCACTACCACAACCGAA-ACCA-C-AA-CCACCACCAC--CACCACT-ATTACTAACACAACTACTACTACCATTGCC---G------CTAat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tatttcccggagagttgacaaatcgcctacgcagtaCT---TCTACTAA--TAC---TA-C-T-T--TTA---CA--AATACTATA---ACTAC-T-TTTT--TGCT--TA-TATAACTACTGCTAC---TACTTCT---AC----CATAACTTCTACCACTA--------CTACAACTA-C
gi|2                          : accattaagaatactatttCTTCTATTATTACCTACTACTATTACAACAAC-TACTATTA-TTACACTACTACTACAATAC-AACTATTACTACTACAACAACTACTAT---TACTTGTA------CTATCATTATTA-CTTCTACT---GCTACTA---CTATAACTGCTGCTGCTACTACTACTTCTACTCCAACTTTTACTACCAATACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTA--TATT-TTGCTACTACTTCTTC------TA---TTACTATGGCT------------ACTAA--TATGCCT-----TTGTAATAGTGTATATT-TT-GCTACTACTACCTCTTCTAT-TAC-TA-TG--GCTACTAATA-TGCCTTTG-TAATAGTGTGTATTTTG--CTACTACTACTTGTA---TTACTAC-CTTTTCTTTTACTATGGCTACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTATATTTTGCTA----------CTACTACTTCTATTACTACTTCTACTA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atatcactggtgccaatgcatgtttatgaaattttaaacattagatacaatggccatctgcttttatttcatctttttcttTACTAG---TATTAATACTGCTGCTAA--TACTGTTG---C---TGCT-ATTATTA------CT---TCTAC--TACT---AC----A---TT---A-ACTGCT-----AGTGCTTC-----------------TGCTGCTGATT--CT------G--ATAC---------T------ACTTCTACA-ACC---ACTatatc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCT---GCTGCAGCTGC--TATTACATCTACTACTACTACTAC-TACTGCT-GTTGCTGCTGTTCATACTAC-TAC-TACTGCTGCTACTGCTGCT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTACTTTTACAATTATTATT---AT----TACTACATGTACTATTA--------CTACTACTA-CTTCATTTAATACTTATAATAGTTCTACTTCTACTTCTGCTACAACTAnnnnnnnnnnt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      gTGTTGTT---GTTACTTTTAC--TGTTGCTGATACTTTTACTGCTACA-ACT-TTCACTGTTGCTATTTCTAAAAC-TAC-CACCACTATAACTACTACTA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -ACA---ACAACTAC--TAC---TA-C----AACTATAACT--GATACTACA---ACTA----------TAGTACTACTATTAC-AGTTCTGC---TTGTATTAAAAT----CACTAAATTTGCTAC
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                          ACAACTACTAC------TA---CAACTATAACTGAT---ACTACAACTA------------TAGTACTACTATTACA-GTT-CT-GCT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                acaTACGACTACTACTATTACGTATGATA---CTACTGCTGCTGCT---GCTGCAATTAC--CGCCGCCGCCATCAAAACCACTACtgtattaaaatcactaaatttgctac
gi|29                         :                                                                                                      ACTACTAC---ACCT---A------CTTTTATAACTA-CTTCTACTACTG---CTG---CTATAGATGCTGCTGCCACTGCTcaacta
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GAA-GGCAACTACACCTAATAGTACTACCACTACTACCGCCA---CCGCTACCATCA---CCAACACTAATACTACTACTACTAATACTA-CAACAACAACTATTGT-----TGCTGCTGCC--ACTGCTGC---TACTACTACTGCTGCGTC--TACTATT-------------------A------CT---GATGC--TACT---ACTTCTA---TT---G-A-TATT-----ACCACTAC-----------------CATTGTCA-----CT------G--TCAC---------T------ACTACTGCT-GCT---ACTATA-----ACT---ACTATTAC--AAC---TG-C-T---GCTG---CT--GCTGCTATA------------------GTTACTACTATTACAACTGCGGT---TGCTACT---AC----GACTAAAATTACTATT----------TACTAC---CTACgtt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         actatttaaagtatgttcctTACTACTACATGCA-CT-GCTGCTGCTACTGCTACTAC-TAC-TACT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ---TACTACT---ACATG-CACTGCTGCTGCTACTG--------CTACTACTA-CTACTTTTAATATCAATAATAATATtttaatatcaataataatat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTTCTCCTCATACTACCACTACTACTACGACGACGA-TGACAACGACGACGAC------TTCTATTACTACTATTA---CTTCTTCTACTT---CTACTCCTCCTCATACTACTACT----CTG-C---------TGCTGCTGA--TGCTGCTGGT--ACTACTTC---TACTTCTACTACTG--------CTGCTG---C---TGGT-GGTGCTA------TC---ACGAC--CATC---AC--CTA---CT---A-A-CGAT-----ACTTATTC-----------------TACTGCTGGCA--CT------G--CAAC---------
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|27 ): TTATTATGATAATACTTCTAGTTTAGCTGATGATGCAGCTACTACTTTATAACTAATACTGTTACTAACAG
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                              acaaACTGCAATAACTGCAAACGTTGC------TAAAGCTGCTACCGCTGCT---GCTGCTATTACGGTCTTATTTCTATTACTAATATT-CATACT-TT-A-------TAATT-TAGAATATATGTACTACGACTACTACTACTATTTGTG-C-------T-------T--CTCATACTAAA---A---TTACTACTGTTaaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CT-----A---CTATTTC------TGTTGC----T------G-----CTGTCCTGCC------ACTTTCGCTGTCA---TT-GCCAT-ACTA-TATCACCGC---CTCCA--CCTT---CT---CTACCACAAGCACTAT-CACTACAAT-CCACCACTATCAT--TAGTGCTAC---TGCTGCT---AT---CGATGCTTCTGGAACTA--CTac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACTGCTGCTGCTGCTTTTAANNNN-NNNNNNNN-----NNN---NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNN--N--GCTGCTG---CTGCTGCTG-----CTGTTA---A--AAGTACT---ACTT-CT---GC--T---A------A-TACT-----A---CTACTGC------TGTTGC----T------G-----CTG--CTGTT------AATACT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AT---TGTTATTGCTACTGC-----CT----CTGCTACAGATCCTACTTTTACTGCTGCAGATACTTTT-ACTGCTGC-----TGC---TGCTGCTGCTGCTACATTTATTGTTACTAGTGCTGG--T--GTTACTG---TTGTTGCAT-----CTACTG---C--TGATACT---A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cTT-----CTACTT---C--TTCTACT---ACTT-TT---AC--T---A------C-TACA-----A---CTACTAC------TGCTTC----T------A-----CTA--TTACTACAAAAACTACTAATGTNN---NN-NNNNN-NTT-CTACTATTACTA-C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcatcaccaccaccaccaccacaaaaGCTGCCTCTGCTAC---TTGTTCTACTAC-----A--T---CTACCA---CAACTACTT-----CTACTA---C--TACTACT---ATTTATT---ATGAT---A------A-TACT-----T---TTACTTT------AGCTGA----C------G-----ATG--CTGCT------CCTACTT----------------T-ATAACTAATACTGCTA-CT-aaaaac
gi|18                         :             TTCTACTA----CTACTACCACTACCACAACCGAA-ACCA-C--AACCACCACCAC--CACCACT-ATTACTAACACAACTACTACTACCATTGCC---GCTAaat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tatttcccggagagttgacaaatcgcctacgcagtaTACTATTT-----CTTCTA---C--TAATACT---ACTT-TT---AC--A---A------A-TACT-----ATAACTACTTT------T-TTGC----TTATATAA-----CTA--CTGCT------ACTACTTCTACCATAACT-TC--T-ACCACTACTACAACTA-C
gi|2                          : accattaagaaCTTCTATTATTACCTACTACTATTACAACAA-CTACTATTA-TTACACTACTACTACAATAC-AACTATTACTACTACAACAACTACTAT---TACTTGTACTATCATTATTACTTCTACT---GCTACTACTATAACTGCTGCTGCTACTACTACTTCTACTCCAACTTTTACTACCAATACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTA--TATT-TTGCTACTACTTC------TTC------TA---TTACTA-------T---G--GCTACTAA--TATGCCT-----TTGTAATAGTGTATATT-TT-GCTACTACTACCTCTTCTAT-TAC-TA-TG--GCTACTAATA-TGCCTTTG-TAATAGTGTGTATTTTG--CTACTACTACTTGTA---TTACTAC-CTTTTCTTTTACTATGGCTACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTATATTTTGCTA----------CTACTACTTCTATTACTACTTCTACTA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atatcactggtgccaatgcatgtttatgaaattttaaacattagatacaatggccatctgcttttatttcatctttttcttTACTAG---TATTAATACTGCTGCTAA--T--ACTGTTG---CTGCTATTA-----TTACTT---C--TACTACT---AC--------AT--T---A------ACTGCT-----A---GTGCTTC------TGCTGC----T------GATT--CTG--ATACT------ACTTCTACAACCA---CT-atatc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTT---CT--TCTACTACA---G-TAC-T-TTTT--TTTTACTAAGATTAC--TAATATTTC---TTCTTAT---AC---TACTACTTCTA---CTA--CTATTACTAAAACTAC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   ctacaaatatttGCT---GCTGCAGCTGC--TATTACATCTACTACTACTACTAC-TACTGCT-GTTGCTGCTGTTCATACTAC-TAC-TACTGCTGCTACTGCTGCTaaataa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               C--TACTTTTACAATTATTATT---AT---TACTACATGTA---CTA--TTACTACTACTACTTCA-TTTAATACTTATAATAGTTCTACTTCTACTTCTGCTACAACTAnnnnnnnnnnt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                          gTGTTGTT---GTTACTTTTAC--TGTTGCTGATACTTTTACTGCTACA-ACT-TTCACTGTTGCTATTTCTAAAAC-TAC-CACCACTATAACTACTACTA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -ACAACAACTACTACTA-C---A--ACTATAACT--GATACTACA---ACTA----------TAGTACTACTATTAC---AGTTCTGC---TTGTATTAAAAT---CACTAAATTTG---CTA--C
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                 TACGACTACTACTAT------TACGTATGATA---CTACTGCTGCTGCT---GCTGCAATTAC--CGCCGCCGCCATCAAAACCACTAC
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAA---TACTTCTAGTTTAGCTGA--T--GATGCAG---CTACTACTTTATAACTAATA---C--TGTTACT---Acaacta
gi|29                         :                                                                                     ttattatgaACTACTAC---ACCT---ACTTTTATAACTACTTCTACTACTG---CTGCTATAGATGCTGCTGCCACTGCTacag
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAAGGCAACTACACCTAATAGTACTACCACTA---CTA---CCGCCACCGCTACCATCACCAACACTAATACTACTACT-A--------------------CTAATACTACAAC---AACAACTATTGTTGCTGC--T--GCCACTG---CTGCTACTA-----CTACTG---C--TGCGTCT---ACTA-TT---AC--T---G------A-TGCT-----A---CTACTT---------CTAT----T------G-----ATA--TTACC------ACTACCATTGTCA---CT-GTC---ACTACTACTGCTGCTA-CTATA-----A---CT--ACTATTACA---ACTG----CTGC--TGCTGCTGCTATAGT--TACTA---------CTATT---AC---AACTGCGGTTG---CTA--CTACGACTAAAATTACTATTTACTACCgtt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       actatttaaagtatgttcct---TACTACT---ACATGCACTGCTGCTG---CTA--CTGCTACTACTACTACT-TTTAATATCAATAATAATATtac
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gi|5                          :                                                                                                                                                                             acaacaactcTACTAAGATTACTAAAAC---TACTAATATTTCTTCAGCTACTACTGCTATTACTAC------TAC------TAAATCTACTAATATTTCTTCAGCTTCTACTAC--TATTCCTAAAACTAATACTTCT-TGTACTACT-ATTATTGCTACCACTAAAAC-TAC-TAATATTCCTTTTACTACTACTTCTA-C-------TACA----GTACTACTATTACT---AAATTTACTAATATTTatctattaactctttcagatactaatacccatgccgc
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                             acaaGCAATAACTGCAAACGTTGCTA-----AA-G-CTGCTACCGCTGCT---GCTGCTATTACGGTCTTATTTCTATTACTAATATT-CATACT-TT-A-TA-----ATT--TAGAATATATGTACTACGACTACTACTACTATTTGTG-C-------T-------T--CTCATACTAA---AA---TTACTACTGTTaaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   actCT-----ACTATTTC------TGTTGC----TG-----CTG-TCCT------GC----CACT--TTCGCTGTCATT-GCCA-T-ACTA-TATCACCGC---CT-CCA--CCTT---CT---CTACCACAAGCACTAT-CAC--TACAAT-CCA-CCACTATCAT--TAGTGCT--AC---TGCTGCT---AT---CGATGCTTCTGGA---A--CTACTac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACTGCTGCTGCTGCTTTTAANNNNNNNNNNNN-----NNN---NNNNNNNNNNNNN---------NN---NNNNNNNNNNNNNNNNNN--N--GCTGCTG---CTGCTGCTG-----CTGTTA---A-AAGTACT---ACT---TCT---GC---TA------A-TACT-----ACTACTGC------TGTTGC----TG-----CTGCTGTT------AA----TACT--
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATTGTTATTGCT---ACTGCCTCT---GCT---ACAGATCCTACTTTTACTGCTGCAGATACTTTTACTGCTGC-----TGC---TGCTGCTGCTGCT---------ACATTTATTGTTACTAGTGCTGG--T--GTTACTG---TTGTTGCAT-----CTACTG---C-TGATACT---A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cTT-----CTACTT---C-TTCTACT---ACT---TTT---AC---TA------C-TACA-----ACTACTAC------TGCTTC----TA-----CTATTACTACAAAAAC----TACTAAT---GTNNNNNN-NNNN-T-TCTACTATTACTAC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcatcaccaccaccaccaccacaaaa------GCT---GCCTCTGCTACTTGTTCTACTACATCTACCACAACTACTTC-----TAC---TACTACTACTATTTATTATGATAA---TACTTTTACTTTAGCTGA--C--GATGCTG---CTCCTACTTTATAACTAATA---C-TGCTACT---Aaaaaac
gi|18                         :                     TTCTACTA----CTACTACCACTACCACAACCGAA-ACCA-C--AACCACCACCAC--CACCACT-ATTACTAACACAACTACTACTACCATTGCC---GCTAat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tatttcccggagagttgacaaatcgcctacgcagtaCTTCTACTAATACTA-CT-T-----TTA---CA--AATACTATAA---CTAC-T-T--TTT--TGCT---TA-TATAAC--TACTGCT--AC---TACTTCT---AC---CATAACTTCTACC---A--CTACTACAACTAC
gi|2                          : accattaagaatactatttCTTCTATTATTACCTACTACTATTACAACAA-CTACTATTA-TTACACTACTACTACAATAC-AACTATTACTACTACAACAACTACTAT---TACTTGTACTATCATTATTACT-------------TCTACT---GCTACTACTATAACTGCTGCTGCTACTACTACTTCTACTCCAACTTTTACTACCAATACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTA--TATT-TTGCTACTACTTCTTC---T---A-TTACTA-TG-----------GCTACTAA--TATGCCT-----TTGTAATAGTGTATATT-TT-GCTACTACTACCTCT---TC-TAT-TACTATGGCTACTAATA-TGCCTTTG-TAATAGTGTGTATTTTG--CTACTACTACTTGTA---TTACTAC-CTTTTCTTTTACTATGGCTACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTATATTTTGCTA----------CTACTACTTCTATTACTACTTCTACTA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atatcactggtgccaatgcatgtttatgaaattttaaacattagatacaatggccatctgcttttatttcatctttttcttTACT---------AG---TATTAATACTGCTGCTAA--T--ACTGTTG---CTGCTATTA-----TTACTT---C-TACTACT---AC----------AT---TA------ACTGCT-----AGTGCTTC------TGCTGC----TG-----ATTCTGAT------AC----TACT--T---CTACatatc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTACAA---ATAT-TTC--TTC--TTCTA-CTAC-AGTAC--TTTTTTTTTAC---TAAGATT---AC---TAATATTTCTTCTTATA--CTACTACTTCTACTACT-ATTACTAaaccact
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTGCTGCA---GCTGCTATTAC---AT-----CTACTACTACTACTAC-TACTGCT-GTTGCTGCTGTTCATACTAC-TAC-TACTGCTGCTACTGCTGCTaaactacaaataa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gC--TACTTTT--ACAATTATTATT---AT---TACTACATGTACT---A--TTACTACTACTACTTCA-TTTAATACTTATAATAGTTCTACTTCTACTTCTGCTACAACTAnnnnnnnnnnt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       gTGTTGTT---GTTACTTTTAC--TGTTGCTGATACTTTTACTGCTACA-ACT-TTCACTGTTGCTATTTCTAAAAC-TAC-CACCACTATAACTACTACTA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -ACAACAACTACTACTA-C----A--ACTATAACT--GATACTACAA---CTA------------TAGTA-CTACTATTAC---AGTTCT--GC---TTGTATTAAAAT---CACTAAATTTGCT---A--C
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                      TACGACTACTACTATTACGTATGATA-CTACTGCTGCTGCT---GCTGCAATTAC--CGCCGCCGCCATCAAAACCACTAC
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T---------AA---TACTTCTAGTTTAGCTGA--T--GATGCAG---CTACTACTTTATAACTAATA---C-TGTTACT---Acaacta
gi|29                         :                                                                                             ttattatgaACTACTAC---ACCT---ACTTTTATAACTACT-------------TCTACTACTGCT---GCTATAGATGCTGCTGCCACTGCTacag
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAAGGCAACTACACCTAATAGTACTACCACT---ACTACC------GCC---ACCGCTACCATCACCAACACTAATACTACTACTA--------------------CTAATACTACA---------AC---AACAACTATTGTTGCTGC--T--GCCACTG---CTGCTACTA-----CTACTG---C-TGCGTCT---ACT---ATT---AC---TG------A-TGCT-----ACTACTTC------TATTGA----TA-----TTACCACT------AC----CA--------TTGTCACT-GTC----ACTACTACTGCTGCTA-CTAT-A-----A---CT--ACTATTACAA---CTG----C--TGC--TGCTG-CTGCTA-TAG--T-----T--AC---TACTATT---AC---AACTGCGGTTGCT---A--CTACGACTAAAATTACTATTTACTACCgtt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   actatttaaagtatgttcct---TACTACT---ACATGCACTGCTGCTGCT---A--CTGCTACTACTACTACT-TTTAATATCAATAATAATATtac
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTTCTCCTCATACTACCACTACTACTACGACGACGA-TGACAACGACGACGAC---------TTCTATTACTACTATT---ACTTCT------TCT---ACTTCTACTCCTCCTCATACTACTACT-CTGCTGCTGCTGA-----TGC---TGCTGGTACTACT---------TC---TACTTCTACTACTGC-----T--GCTGCTG---GTGGTG--------CTATCA---C-GACCATC---AC-----CT---AC---TA------A-CGAT-----ACTTATTC------TACTGC----TG-------GC-ACT------GC----AACA--T---CT
gi|4                          :                                                                               acaacaactcTACTACTTCTACTTCTACTAC---TGCT---GCTGCTGGTGGTGCTATCACGACCATCACCTACTAACGATACT--TAT-TCTACTGCTGGCACTGCAACATCTATT--AACTCTTTC---AGATACTAATACattaactctttcagatactaatacccatgccgc
gi|5                          :                                                                   acaacaactccttctcctcatactaccactactactacgacgacgatgacaacgacgacgacttctattactactattacttcttctacttctactcctcctcatactactactctgctgctgctgatgctgctggTTACTAAAACTACTAATA---TTTC---------TTCAGCTACTACTGCTATTACTACTAC---TAA-ATCTACTAATATTTCTTCAGCTTCTACTAC--TATTCCTAAAACTAATACTTCT-TGTACTACT-ATTATTGCTACCACTAAAAC-TAC-TAATATTCCTTTTACTACTACTTCTA-C-------TACA----GTACTACTATTAC---TAAATTTACTAATATTTccatgccgc
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACTGCTGCTGCTGCTTTTAANNNNNNNNNNNN-----NNN---NNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNN--NNN-NNN------NNNNNN--N--GCTGCTG---CTGCTGCTG-----CTGTTA---A-AAGTACT---ACT---TCTGC---TAA-TACTACTACTGCTGTTGCTGCTGCT------GTTAA----TACT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTGTTATTGCT---ACTGCCTCT---GCT---ACAGATCCTACTTTTACTGCTGCAGATACTTTTACTGCT--------GC---TGCTGCTGCTGCT---------GCTACATT--TAT-TGTTACTAGTGCTGG--T--GTTACTG---TTGTTGCAT-----CTACTG---C-TGATACT---A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cCCACCACCACCACCACA--AAATT-CT-ACTTCT---TCTACTACTTTTACTACTACAACTA-------------CTACTGCTTCTACTATTA-C-------TACA----A--AAACTACTAA---TG---TNNNNNNNNNNTTC---TACTATTACTACAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcatcaC---TAC--TTCTTCTACTACTTTTACTACTACAACTA-CTACT-GCTTCT---ACTATTACTACAAAAACTACTAATGTNNNNNNNNNNTTCTACTATTACTACaac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcatcaccaccaccaccaccacaaaatt------GCT---GCCTCTGCTACTTGTTCTACTACATCTACCACAACTACTTC-----TAC---TACTACTACTATTTATTATGATAATACTTT--TAC-TTT------AGCTGA--C--GATGCTG---CTCCTACTTTATAACTAATA---C-TGCTACT---Aaaaaac
gi|18                         :                     TTCTACTA----CTACTACCACTACCACAACCGAA-ACCA-C--AACCACCACCAC--CACCACT-ATTACTAACACAACTACTACTACCATTGCC---GCTAat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatttcccggagagttgacaaatcgcctacgcagtaCTTCTACTAATACTACT-T---TTA---CA--AATACTATAA---CT----A---------C-T-T--TTT--TGCT---TA-TATAAC--TACTGCT--AC---TACTTCT---AC---CATAACTTCT------A--CCACTACTACAACTAC
gi|2                          : accattaagaatactatttCTTCTATTATTACCTACTACTATTACAACAA-CTACTATTA-TTACACTACTACTACAATAC-AACTATTACTACTACAACAACTACTAT---TACTTGTACTATCATTATTACT-------------TCTACT---GCTACTACTATAACTGCTGCTGCTACTACTACTTCTACTCCAACTTTTACTACCAATACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTA--TATT-TTGCTACTACTTCT---T----CTATTACTA-TG--------GCTAC---TAA--TATGCCT-----TTGTAATAGTGTA--TA-TT-TT-GCTACT---ACTACCTCT---TCTATTACTATGG-------------CTACTAATA-TGCCTTTG-TAATAGTGTGTATTTTG--CTACTACTACTTGTA---TTACTAC-CTTTTCTTTTACTATGGCTACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTATATTTTGCTA----------CTACTACTTCTATTACTACTTCTACTA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atatcactggtgccaatgcatgtttatgaaattttaaacattagatacaatggccatctgcttttatttcatctttttcttTACT---------AGTATTAA--TAC-TGC------TGCTAA--T--ACTGTTG---CTGCTATTA-----TTACTT---C-TACTACT---AC-------AT---TAACTGCTAGTGCTTCTGCTGCTGATTCT------GATAC----TACTT---CTACatatc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTACAA---AT----A---------T-TTC--TTC--TTCTA-CTAC-AGTAC--TTTTTTTTTAC---TAAGATT---AC---TAATATTTCTTCTTATA--CTACTACTTCTACTACT-ATTACTAaaccact
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GCT------GCT---GCAGCTGCTATTACATCTACTACTACTACTACTACTGCTGT-----TGC---TGCTGTTCATACT---------ACTA---C--TAC-TGC------TGCTAC--T--GCTGCTaaactacaaataa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C--TACTTTT--ACAATTATTATT---AT---TACTACATGTACT---A--TTACTACTACTACTTCA-TTTAATACTTATAATAGTTCTACTTCTACTTCTGCTACAACTAnnnnnnnnnnt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    gTGTTGTT---GTTACTTT---TAC--TGTTGCTGATACTTTTACTGCTACA---A-CT-TTCACTGTT---GCTATTTCTAAAACTACCACCACTA-------------TAACTACTACTA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACAACAACTACTACTAC----AACTATAACT--GATACTACAA---CT----A---------------------TAGTA-CTACTATTAC---AGTTCT--GC---TTGTATTAAAAT---CACTAAATTTGCT---A--C
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                      TACGACTACTACTATTACGTATG-ATACTACTGCTGCT---GCTGCTGCAATTAC--CGCCGCCGCCATCAAAACCACTAC
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T---------AATACTTC--TAG-TTT------AGCTGA--T--GATGCAG---CTACTACTTTATAACTAATA---C-TGTTACT---Acaacta
gi|29                         :                                                                                             ttattatgaACTACTAC---ACCT---ACTTTTATAACTACT-------------TCTACTACTGCT---GCTATAGATGCTGCTGCCACTGCTacag
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --CTAATAGTACTACCACT---ACTACC------GCC---ACCGCTACCATCAC-----------CAAC-ACTAATACTAC-----TAC---TACTAATACTACA---------ACAACAAC--TAT-TGT------TGCTGC--T--GCCACTG---CTGCTACTA-----CTACTG---C-TGCGTCT---ACT---ATTAC---TGA-TGCTACTACTTCTATTGATATTACC------ACTAC----CA------TTGTCACTGTC---ACTACTACTGCTGCTACTAT-A---A---CT--ACTATTACAA---CT----G-------------C--TGC--TGCTG-CTGCTA-TAG--T-----T--AC---TACTATT---AC---AACTGCGGTTGCT---A--CTACGACTAAAATTACTATTTACTACCgtt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  actatttaaagtatgttcctgaaggcaactacac---TACTACT---ACATGCACTGCTGCTGCT---A--CTGCTACTACTACTACT-TTTAATATCAATAATAATATtac
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTTCTCCTCATACTACCACTACTACTACGACGACGA-TGACAACGACGACGAC------TTCTATTACTACTATT---ACTTCT------TCT---ACTTCTACTCCTCCTCATACTACTACT-CTGCTGCTGCTGA-----TGC---TGCTGGTACTACT---------TCTACTTC--TAC-TAC------TGC-----T--GCTGCTG---GTGGTG--------CTATCA---C-GACCATC---AC-----CTAC---TAA-CGATACTTATTCTACTGCTG--GC-------ACTGC----AACAT---CT
gi|4                          :                                                                               acaacaactcTACTACTTCTACTTCTACTAC---TGCT---GCTGCTGGTGGTGCTATCACGACCATCACCTACTAACGATACT--TAT-TCTACTGCTGGCACTGCAACATCTATT--AACTCTTTC---AGATACTAATACattaactctttcagatactaatacccatgccgc
gi|5                          :                                                                   acaacaactccttctcctcatactaccactactactacgacgacgatgacaacgacgacgacttctattactactattacttcttctacttctactcctcctcatactactactctgctgctgctgatgctgctggTTACTAAAACTACTAATAT---TTC---------TTCAGCTACTACTGCTATTACTACTAC-TAAATCTACTAATATTTCTTCAGCTTCTAC---TAC--TATTCCTAAAACTAATACTTCT-TG--TA-CTACT-ATTATT---GCTACCACTAAAACTACTAATATTC-------------CTTTTACTACTACTTCTA-C-------TACA----GTACTACTATTAC---TAAATTTACTAATATTTccatgccgc
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACTGCTGCTGCTGCTTTTAANNNNNNNNNNNN-----NNN---NNNNNNNNNNNNN---------NN---NNNNNN--NNN-NNNNNNNNN--N--GCTGCTG---CTGCTGC-----------TG-------CTGTTA---AA------AGTACT---ACT---TCTGC---TAAT-ACTACTACTGCTGTTGCTGCTGCT------GTTAATACT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTGTTATTGCT---ACTGCCTCT---GCT---ACAGATCCTACTTTTACTGCTGCAGATACTTTTACTGCTGC-----TGC---TGCTGCTGCTGCT---------ACATTTATTGT--TAC-TAGTGCTGG--T--GTTACTG---TTGTTGC-----------AT-------CTACTG---CT------GATACT---A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       cC---TAC--TTCTTCTACTACTTTTACTACTACAACTACTACT-GCTTCT---ACTATTACTACAAAAACTACTAATGTNNNNNNNNNNTTCTACTATTA-CTACA-----------
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcatcaccaccaccaccaccacaaaatt------GCT---GCCTCTGCTACTTGTTCTACTACATCTACCACAACTACTTC-----TAC---TACTACTACTATTTATTATGATAA---TACTTT--TAC-TTTAGCTGA--C--GATGCTG---CTCCTAC-----------TTTATAA--CTAATA---CT------GCTACT---Aaaaac
gi|18                         :                     TTCTACTA----CTACTACCACTACCACAACCGAA-ACCA-C--AACCACCACCAC--CACCACT-ATTACTAACACAACTACTACTACCATTGCC---GCTAat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tatttcccggagagttgacaaatcgcctacgcagtaCTTCTACTAATACTACT-T---TTA---CA--AATACTATAA---CTAC-------------T-TTTT--TGCT--TA-TATAAC--TACTGCTAC---TACTTCT---AC---CATAACTTCTACCA--CTACTACAACTAC
gi|2                          : accattaagaatactatttCTTCTATTATTACCTACTACTATTACAACAA-CTACTATTA-TTACACTACTACTACAATAC-AACTATTACTACTACAACAACTACTAT---TACTTGTACTATCATTATTACTTCTACT---GCTACTACTATAACTGCTGCTGCTACTACTACTTCTACTCCAACTTTTACTACCAATACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTA--TATT-TTGCTACTACTTCT---T---CTATTACTA-TG--------GCTAC---TAA--TATGCCT-----TTGTAATAGTGTA--TATT-TT-GCTACT---ACTACCTCT---TCTATTACTATGGCTACTAATA-----TGCCTTTG-TAATAGTGTGTATTTTG--CTACTACTACTTGTA---TTACTAC-CTTTTCTTTTACTATGGCTACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTATATTTTGCTA----------CTACTACTTCTATTACTACTTCTACTA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atatcactggtgccaatgcatgtttatgaaattttaaacattagatacaatggccatctgcttttatttcatctttttcttTACT---------AG---TATTAA--TAC-TGCTGCTAA--T--ACTGTTG---CTGCTAT-----------TA-------TTACTT---CT------ACTACT---AC-------AT---TAACTGCTAGTGCTTCTGCTGCTGATTCT------GATACTACTT---CTACatatc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTT---CT--TCTACTACAG----TAC-------------T-TTTT--TTTTACTAAGATTAC--TAATATTTC---TTCTTAT---AC---TACTACTTCTACTA--CTATTACTAAAACTACaaccact
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctacaaatatttGCT------GCT---GCAGCTGCTATTACATCTACTACTACTACTACTACTGCTGT-----TGC---TGCTGTTCATACT---------AC---TA---C--TAC-TGCTGCTAC--T--GCTGCTaaataa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     C--TACTTTTACAATTATTATT---AT---TACTACATGTACTA--TTACTACTACTACTTCA-TTTAATACTTATAATAGTTCTACTTCTACTTCTGCTACAACTAnnnnnnnnnnt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                      gTGTTGTT---GTTACTTT---TAC--TGTTGCTGATACTTTTACTGCTACA---ACT-TTCACTGTT---GCTATTTCTAAAACTACCACCACTATAACTACTA----CTA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACAACAACTACTACTAC----AACTATAACT--GATACTACAA---CTA----------------------TAGTACTACTATTAC---AGTTCTGC---TTGTATTAAAAT---CACTAAATTTGCTA--C
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                         TACGACTACTACTATTACGTATGATACTACTGCTGCT---GCTGCTGCAATTAC--CGCCGCCGCCATCAAAACCACTAC
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T---------AA---TACTTC--TAG-TTTAGCTGA--T--GATGCAG---CTACTAC-----------TTTATAA--CTAATA---CT------GTTACT---Acaacta
gi|29                         :                                                                                             ttattatgaACTACTAC---ACCT---ACTTTTATAACTACTTCTACTACTGCT---GCTATAGATGCTGCTGCCACTGCTacag
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --CTAATAGTACTACCACT---ACTACC------GCC---ACCGCTACCATCAC-----------CAAC-ACTAATACTAC-----TAC---TACTAATACTACA---------AC---AACAAC--TAT-TGTTGCTGC--T--GCCACTG---CTGCTAC-----------TA-------CTACTG---CT------GCGTCT---ACT---ATTAC---TGAT-GCTACTACTTCTATTGATATTACC------ACTACCA------TTGTCACTGTC---ACTACTACTGCTGCTACTAT-A---A---CT--ACTATTACAA---CTG----------------CTGC--TGCTGCTGCTA-TAG--T-----TAC---TACTATT---AC---AACTGCGGTTGCTA--CTACGACTAAAATTACTATTTACTACCgtt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               actatttaaagtatgttcctgaaggcaactacac---TACTACT---ACATGCACTGCTGCTGCTA--CTGCTACTACTACTACT-TTTAATATCAATAATAATATtac
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTTCTCCTCATACTACCACTACTACTACGACGACGA-TGACAACGACGACGAC------TTCTATTACTACTATT---ACTTCT------TCT---ACTTCTACTCCTCCTCATACTACTACT-CTGCTGCTGCTGA-----TGC---TGCTGGTACTACT---------TC---TACTTC--TAC-TACTGC-----T--GCTGCTG---GTGGTG---------------------CTATCA---CG------ACCATC---AC-----CTAC---TAAC-GATACTTATTCTACTGCTG--GC-------ACTGCAACAT---CT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                    acaacaactcTTACTAAAACTACTAATAT---TTC---------TTCAGCTACTACTGCTATTACTACTACTAAATCTACTAATATTTCTTCAGCTTCTAC---TAC--TATTCCTAAAACTAATACTTCT-TG--TACTACT-ATTATT---GCTACCACTAAAACTACTAATATTCCTTTTACTA----CTACTTCTA-CTACA-----------GTACTACTATTAC---TAAATTTACTAATATTTattaactctttcagatactaatacccatgccgc
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               C------GCT---ACCGTTACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNN---NNNNNNNNNNNNN---------AT---TACTGC--CGT-TACCGCTTC--C--GCTACTG---CTACTTC-----------TT-------CTNNNN---NN------NNNNNN---NNN---NNNNN---NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNNGCTT---CTGCTGTTGCTGCTACTGCTACTACTACTACT----GCTG---CT--GCTGCTGC
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Reference ( family-319 )      :                    CTTCTACTA----CTACTACCANTACAACAA-CGAC-ANCA-T-AAACNACNACNACAACACCAAC-ATTACTAATACAACAACTACTAC---TGCT---GCTA------TTATTANTACT----TCTACTACTGCTACTNCTATAGCTGCTGCTGCCACTGCTACTTCTACTCCAACTTTTACTANNANTACTAATATGCCTTCGTAATACAGTNCAGCTATTACTGCTACTACTGCTACGTAAGCTACTACTGCTGCT---GCTGCTAC---TAC--TNTTNCTGCTACTNNTACTACTACA--TACT-CT-GCTACT---GCTATTNCTACAACTACTACTATTGCTACTACTA----CTACTTTTA-CTACA-----------G--CTACTACTAC---TA---TTACTACTCTTTTCTTTTACTATGGCTACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTATATTTTGCTA---TCTTCATCTTCTNCTTCTACTACTACTTCTACTACGACGACGAACGACAACGACGACGACAAA--CTNNTATTGCTACCGCT---ACTGCC------GCT---ACCGCTA----CTACTNCTTCTGCTGCTGCTAC-TNCTACTGCTGC-----TGC---TGCTGCTACTACT---------ACTACTTC--TAC-TGC------TGCTGA--T--GCTGCTG---CTGCTGCTT-----CTACTA---CTGCTACT---ACT---TCTAC---T---AAC-GCTACTACTNCTGCTGCTGCTGCTACTACTACTT---CTGCCGCTGCCG-TACTACTACTACTACTACT-CAGCTA---CT--GCTACTACA---ACTACC-CTNC--TGCTACTACTATTAC--TACTNCTAC---TAC----TACTAC---CACTACTTCTGCTA--CTACTACTACTAC---TACT-TCTACTACCGATAATAATATTA--TCTACTNCTGCTACAACTACGACTTTTGCTGTTGTTGTTATTGTTGTTGTTTTACTTTTTATA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATTGTTATTGCT---ACTGCCTCT---GCT---ACAGATC----CTACTTTTACTGCTGCAGATAC-TTTTACTGCTGC-----T------GCTGCTGCTGCT---------GCTACATT--TAT-TGTTACTAGTGCTGG--T--GTTACTG---TTGTTGCAT-----CTACTG---CTGATACT---A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cATCACC---ACCACC------ACC---ACCACAAAATTCTACTTCTTCTACTACTTTTAC-TACTACAACTAC-----TAC---TGCTTCTACTATT---------ACTA---C--AAA-AAC------TACTAA--T--GT--NNN---NNNNNNNTT-----CTACTA---TTACTAC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcC---TAC--TTCTTCTACTACTTTTACTACTACAACTACTACT-GCTTCT---ACTATTACTACAAAAACTACTAATGTNNNNNNNNNNTTCTACTATTA-CTACA-----------aaaaac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tcatcaccaccaccaccaccacaaaatt------GCT---GCCTCTG----CTACTTGTTCTACTACATCTAC-CACAACTACTTC-----TAC---TACTACTACTATTTATTATGATAATACTTT--TAC-TTT------AGCTGA--C--GATGCTG---CTCCTACTTTATAACTAATA---CTGCTACT---Aaaaac
gi|18                         :                     TTCTACTA----CTACTACCACTACCACAACCGAA-ACCA-C--AACCACCACCAC--CACCACT-ATTACTAACACAACTACTACTACCATTGCC---GCTA------at
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tatttcccggagagttgacaaatcgcctacgcagtaCTTCTACTAATACTACT-T--TTA---CA--AATACTATA---ACTACT-TTTT--TGCT--TA-TATAAC--TACTGCTAC---TAC----TTCTAC---CATAACTTCTACCA--CTACTACAACTAC---
gi|2                          : accattaagaatactatttCTTCTATTATTACCTACTACTATTACAACAA-CTACTATTA-TTACACTACTACTACAATAC-AACTATTACTACTACAACAACTACTAT---TACTTGTACTA------TCATTATTACT----TCTACT---GCTACTACTATAACTGCTGCTGCTACTACTACTTCTACTCCAACTTTTACTACCAATACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTA--TATT-TTGCTACTACTTCT---T---CTATTACTA-TG--------GCTAC---TAA--TATGCCT-----TTGTAATAGTGTA--TATT-TT-GCTACT---ACTACCTCT---TCTATTACTATGGCTACTAATA-----TGCCTTTG-TAATAGTGTGTATTTTG--CTACTACTACTTGTA---TTACTAC-CTTTTCTTTTACTATGGCTACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTATATTTTGCTA----------CTACTACTTCTATTACTACTTCTACTA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atatcactggtgccaatgcatgtttatgaaattttaaacattagatacaatggccatctgcttttatttcatctttttcttTACT---------AGTATTAA--TAC-TGC------TGCTAA--T--ACTGTTG---CTGCTATTA-----TTACTT---CTACTACT---AC-------AT---T---AACTGCTAGTGCTTCTGCTGCTGATTCTGATACTACTT---CTACatatc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTT---CT--TCTACTACA---G-TACT-TTTT--TTTTACTAAGATTAC--TAATATTTC---TTC----TTATAC---TACTACTTCTACTA--CTATTACTAAAAC---TACaaccact
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctacaaatatttGCT------GCT---GCAGCTG----CTATTACATCTACTACTACTAC-TACTACTGCTGT-----TGC---TGCTGTTCATACT---------ACTA---C--TAC-TGC------TGCTAC--T--GCTGCTaaataa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   C--TACTTTTACAATTAT----TATTAT---TACTACATGTACTA--TTACTACTACTAC---TTCA-TTTAATACTTATAATAGTTCTACTTCTACTTCTGCTACAACTAnnnnnnnnnnt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                gTGTTGTT---GTTACTTT---TAC--TGTTGCTGATACTTTTACTGCTACA---ACT-TTCACTGTT---GCTATTTCTAAAACTACCACCACTATAACTACTA----CTA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACAACAACTACTACTAC---AACTATAACT--GATACTACA---ACTA---------TAGTACTACTATTACAGTTCTGCTTG---TAT----TAAAAT---CACTAAATTTGCTA--C
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                   TACGACTACTACTATTACGTATGATACTACTGCTGCT---GCTGCTGCAATTAC--CGCCGCCGCCATCAAAACCACTAC
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T---------AATACTTC--TAG-TTT------AGCTGA--T--GATGCAG---CTACTACTTTATAACTAATA---CTGTTACT---Acaacta
gi|29                         :                                                                                             ttattatgaACTACTAC---ACCT---ACTT------TTATAACTACT----TCTACTACTGCT---GCTATAGATGCTGCTGCCACTGCTacag
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --CTAATAGTACTACCACT---ACTACC------GCC---ACCGCTA----CCATCAC-----------CAAC--ACTAATACTAC-----TAC---TACTAATACTACA---------ACAACAAC--TAT-TGT------TGCTGC--T--GCCACTG---CTGCTACTA-----CTACTG---CTGCGTCT---ACT---ATTAC---T---GAT-GCTACTACTTCTATTGATATTACCACTACCA------TTGTCACTGTC---ACTACTACTGCTGCTACTATA---A---CT--ACTATTACA---ACTG---CTGC--TGCTGCTGCTA-TAG--T-----TAC---TAC----TATTAC---AACTGCGGTTGCTA--CTACGACTAAAAT---TACTATTTACTACCgtt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            actatttaaagtatgttcctgaaggcaactacacTACTACTACATGC-ACTGCTGC-----TGC---TACTGCTACTACT---------ACTACTTT--TAtac
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ---TAC----TACTACATGCACTGCT---GCTG--CTACTGCTACTACTACTACT-TTTAATATCAATAATAATATatatcaataataatat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTTCTCCTCATACTACCACTACTACTACGACGACGA-TGACAACGACGACGAC------TTCTATTACTACTATT---ACTTCT------TCT---ACTTCTA----CTCCTCCTCATACTACTACT-C-TGCTGCTGCTGA-----TGC---TGCTGGTACTACT---------TCTACTTC--TAC-TAC------TGC-----T--GCTGCTG---GTGGTG--------CTATCA---CGACCATC---AC-----CTAC---T---AAC-GATACTTATTCTACTGCTG--GC-ACTGCAACAT---CT
gi|4                          :                                                                                            acaacaactcACTACTGC---TGCT---GCTGGTGGTGCTATCACGACCATCACCTACTAACGATACT--TAT-TCTACTGCTGGCACTGCAACATCTATT--AACTCTTTC---AGATACTAATAattaactctttcagatactaatacccatgccgc
gi|5                          :                                                acaacaactccttctcctcatactaccactactactacgacgacgatgacaacgacgacgacttctattactactattacttcttctacttctactcctcctcatactactactctgctgctgctgatgctgctggtactacttctacttctTTACTAAAACTACTAATAT---TTC---------TTCAGCTACTACTGCTATTACTACTACTAAATCTACTAATATTTCTTCAGCTTCTAC---TAC--TATTCCTAAAACTAATACTTCT-TG--TACTACT-ATTATT---GCTACCACTAAAACTACTAATATTCCTTTTACTA----CTACTTCTA-CTACA-----------GTACTACTATTAC---TAAATTTACTAATATTTcccatgccgc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtactaagaACTTC--TAC-AAC------TACTAC--T--ACTTCTC---ATACTCCTT-----C--CCA---C-ACTACT---ACT---ACTAC---T-----C-ATCA-TAATCCTCCTCCTACTTCTACAATTA----------------CG-T----CTACTACTACTCCT-CATCT-----T--CCTCCT-----------C-CTCC--TACTACTACTATTAC--GGC-GCTAT---TACATTGTACTAC---TA-TACTGCTGTTATTTTACTACTACTAC---TACT-TCTACTATTGATAATATTAGTA--ctacta
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                T---ACTGCC------GTT---ACCGCT-------------TCCGCTACTGCTAC-TTCTTCTNNNNN-----NNN---NNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNN--NNN-NNN------NNNNNN--N--NNNNNNN---NNNNNGCTT-----CTGCTG---TTGCTGCT---ACT---GCTAC---T---ACT-ACTACTGCTGCTGCTGCTGCTGCtgc
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Reference ( family-319 )      :                    CTTCTACTA----CTACTACCANTACAACAA-CGAC-ANCA-T-AAACNACNACNACAACACCAAC-ATTACTAATACAACAACTACTAC---TGCT---GCTA------TTATTACTACT----TCTACTACCGCTACTNCTATAGCTGCTGCTGCCACTGCTACNTCTACTCCAACTCTTACTANAAATACTAATATGCCTTCGTAATACAGTNCAGCTATTACTGCTACTACTGCTACGTAAGCTACTACTGCTGCT---GCTGCTAC---TAC--TNTTNCTGCTACTNNTACTACTACA--TACT-CT-GCTACT---GCTAT---TNCTACAACTACTACTATTGCTACTACTA----CTACTTTTA-CTACA-----------G--CTACTACTAC---TA---TTACTACTCTTTTCTTTTACTATGGCTACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTATATTTTGCTA---TCTTCATCTTCTNCTTCTACTACTACTTCTACTACGACGACGAACGACAACGACGACGACAAA--CTNNTATTGCTACCGCT---ACTGCC------GCT---ACCGCTA----CTACTNCTTCTGCTACTGCTAC-TNCTACTGCTGC-----TGC---TGCTGCTACTACT---------AC---TACTTC--TAC-TGCTGCTGA--T--GCTGCTG---CTGCTGC-----------TT-------CTACTA---CT------GCTACT---ACTN---CTAC---TAAC-GCTACTACTTCTGCTGC----TGCTGCTACTACTACTT---CTGCCGCTGCCG-TACTACTACTACTACTACT-C-AGCTA---CT--GCTACTACAA---CTACC-CTNC--TGCTACTACTATTAC--TACTGCTAC---TAC----TACTAC---CACTACTTCTGCTA--CTACTACTACTAC---TACT-TCTACTACCGATAATAATATTA--TCTACTNCTGCTACAACTACGACTTTTGCTGTTGTTGTTATTGTTGTTGTTTTACTTTTTATA
gi|1                          :                    CTTCTACTT----CTGCTACCAGTACAACAA-CAAC-AGCAAT-AAACATCAACAACAACACCAAC-A--ACGAATGTAATAACTACTTC---TGCT---GCTA------TTACTAATACT----TCTCTTACTGCTACTTCTACTGCTACTGTTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTTTTGTTGCTACAACTGCTACGT---CTATTACTGCTGTT---GCTACAAC---TAC--TTTTTCTGCTGCTACTACTACTGCA--TACT-CT-GCTGCT---GCTAT---TACTACAATTACTTTTGTTGCTACTACTA----CTACTTTTGGCTGCA-----------G--CTACTTCTAC---TA---TTTTTACTCTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTCATCTTCTTCTTCTACTTCTACTTCTACAATAACAACAAACAACAACAACAACGATAAAAACTGTTACTGTTACTGCT---CTTGCT------GCT---ACTACTA----CTTCTTCTTCTGCTGCTGCTAA-TACTACTGCTTC-----TGC---CGCTGTTACTACT---------AC---TACTTC--TAC-TGCTGTTTA--T--ACTCCTAAATCTGGTGC-----------TT-------TTATTT---GT------GCTACT---ACTT---CTAC---TAAT-TCTACTACTTCTGTTGC----TGCTGCTACTACTACTT---CTGCTGCTGGTGGTATTATTATTACTACTATTTC-AGTTG---CT--GCTACTACAA---CTATCTCTTC--TGCTGCTACTAATAC--TACTTCTGC---TGC----TACTAC---TAGTACTTATGCTG--CTGTTACTACTAC---TGCT-TCAACTAAAGATAATAATATTA--TTTACTGCTGCTACAACTACGACTTTTGCTGTTGTTGTTATTGTTGTTGTTTTACTTTTTATA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T---------AT---TGCTTCAGTAAGTGTTGCTGAGTT--ACTGCAA---CTGTTGC-----------TT-------CTGTCG---CT------ACAATC---ACTA---CTAC---TATC-ACTACTATTGTTGCTGC----TGCTGCTTCTGTTACTT---CTGCCACTAC---TACTACCACTTCTACT--T-C-CGCTA---ATTATCTACTCCAA---CTACatgtattccaaatttgcaaaattgcgtttaaaatatttgatctattaatagaagcattcgattggacttttgatacccaattgaaaacctg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taccattgttactacatgtatatatattctgaCTA----CTACTACTTCTGCTGCTGCTAC-TTCTGCTGCTACAAACATGTATATGGT-CAACGACT---------AC---TATTTC--TTC-TGCTGCTGC--T--GTTTCTG---TTGGTACAAACATGTATATTGTCAAGACTACTA---CTTCTGCTGTTGCT---ACTT---CTAC---T----GCTACTAtgg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                          acaaGCAATAACTGCAAACGTTGCTA---AAGCTGCTACCGCTGCT---GCTGCTAT---TACGGTCTTATTTCTATTACTAATATT-CA--TACT-TT-ATAATTTAGAATATATGTACTACGACTACTACTA---CTATTTGTG----CTTCTCATA-CTAAA----------------ATTACTAC---TG---TTACaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       actCTACTATTTCTGTTGC----TGCTG-TCCTGCCACTTTCGCTGTCATTGCCA-TACTA-TATCACCGC--CT-CCACCTT---CT---CTACCACAAGCACTATCACTACAAT-CCACCACTATCAT--TAGTGCTAC---TGC----TGCTAT---CGATGCTTCTGGAA--CTACT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACTGCTGCTGCTGCTTTTAA-NNNNNNNNNNNN-----NNN---NNNNNNNNNNNNN---------NN---NNNNNN--NNN-NNNNNNNNN--N--GCTGCTG---CTGCTGC-----------TG-------CTGTTA---AA------AGTACT---ACTT---CTGC---TAAT-ACTACTACTGCTGTTGC----TGCTGCTGTTAATACT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTGTTATTGCT---ACTGCCTCT---GCT---ACAGATC----CTACTTTTACTGCTGCAGATAC-TTTTACTGCTGC-----TGC---TGCTGCTGCTGCT---------ACATTTATTGT--TAC-TAGTGCTGG--T--GTTACTG---TTGTTGC-----------AT-------CTACTG---CT------GATACT---A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cATCACC---ACCACC------ACC---ACCACAAAATTCTACTTCTTCTACTACTTTTAC-TACTACAACTAC-----TAC---TGCT--T-CTACT---------AT---TACTAC--AAA-AACTACTAA--T--GT--NNN---NNNNNNN-----------TT-------CTACTA---TT------ACTAC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcC---TAC--TTCTTCTACTACTTTTACTACTACAACTACTACT-GCTTCT---ACTAT---TACTACAAAAACTACTAATGTNNNNNNNNNNTTCTACTATTA-CTACA-----------aaaaac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tcatcaccaccaccaccaccacaaaatt------GCT---GCCTCTG----CTACTTGTTCTACTACATCTAC-CACAACTACTTC-----TAC---TACTACTACTATTTATTATGATAA---TACTTT--TAC-TTTAGCTGA--C--GATGCTG---CTCCTAC-----------TTTATAA--CTAATA---CT------GCTACT---Aaaaac
gi|18                         :                     TTCTACTA----CTACTACCACTACCACAACCGAA-ACCA-C--AACCACCACCAC--CACCACT-ATTACTAACACAACTACTACTACCATTGCC---GCTA------at
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tatttcccggagagttgacaaatcgcctacgcagtaCTTCTACTAATACTACT-T---TTA---CA--AATACTATAA---CTACT-TTTT--TGCT--TA-TATAAC--TACTGCTAC---TAC----TTCTAC---CATAACTTCTACCA--CTACTACAACTAC---
gi|2                          : accattaagaatactatttCTTCTATTATTACCTACTACTATTACAACAA-CTACTATTA-TTACACTACTACTACAATAC-AACTATTACTACTACAACAACTACTAT---TACTTGTACTA------TCATTATTACT----TCTACT---GCTACTACTATAACTGCTGCTGCTACTACTACTTCTACTCCAACTTTTACTACCAATACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTA--TATT-TTGCTACTACTTCT---T---CTATTACTA-TG--------GCTAC---TAA--TATGCCT-----TTGTAATAGTGTA--TATT-TT-GCTACT---ACTAC---CTCT---TCTATTACTATGGCTACTAATA-----TGCCTTTG-TAATAGTGTGTATTTTG--CTACTACTACTTGTA---TTACTAC-CTTTTCTTTTACTATGGCTACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTATATTTTGCTA----------CTACTACTTCTATTACTACTTCTACTA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atatcactggtgccaatgcatgtttatgaaattttaaacattagatacaatggccatctgcttttatttcatctttttcttTACT---------AG---TATTAA--TAC-TGCTGCTAA--T--ACTGTTG---CTGCTA---------------------TTATTA---CT------TCTACT---ACTA---C-AT---TAACTGCTAGTGCTTCTGCTGC----TGATTCTGATACTACTT---CTACatatc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTT---CT--TCTACTACAG----TACT-TTTT--TTTTACTAAGATTAC--TAATATTTC---TTC----TTATAC---TACTACTTCTACTA--CTATTACTAAAAC---TACaaccact
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctacaaatatttGCT------GCT---GCAGCTG----CTATTACATCTACTACTACTAC-TACTACTGCTGT-----TGC---TGCTGTTCATACT---------AC---TA---C--TAC-TGCTGCTAC--T--GCTGCTaaataa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C--TACTTTTACAATTAT----TATTAT---TACTACATGTACTA--TTACTACTACTAC---TTCA-TTTAATACTTATAATAGTTCTACTTCTACTTCTGCTACAACTAnnnnnnnnnnt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                gTGTTGTT---GTTACTTT---TAC--TGTTGCTGATACTTTTACTGCTACA---ACT-TTCACTGTT---GCTAT---TTCTAAAACTACCACCACTATAACTACTA----CTA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACAACAACTACTACTAC----AACTATAACT--GATACTACAA---CTA---------TAGTACTACTATTACAGTTCTGCTTG---TAT----TAAAAT---CACTAAATTTGCTA--C
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                   TACGACTACTACTATTACGTATGATACTACTGCTGCT---GCTGCTGCAATTAC--CGCCGCCGCCATCAAAACCACTAC
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T---------AA---TACTTC--TAG-TTTAGCTGA--T--GATGCAG---CTACTAC-----------TT--------TA-TA-----------ACTAAT---ACTG---TTAC---TAAC-caacta
gi|29                         :                                                                                             ttattatgaACTACTAC---ACCT---ACTT------TTATAACTACT----TCTACTACTGCT---GCTATAGATGCTGCTGCCACTGCTag
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --CTAATAGTACTACCACT---ACTACC------GCC---ACCGCTA----CCATCAC-----CAAC----AC-TAATACTACTAC-----TAC---TAATACTACAACA---------AC---AA---C--TAT-TGTTGCTGC--T--GCCACTG---CTGCTAC-----------TA-------CTACTG---CT------GCGTCT---ACTA---TTAC---TGAT-GCTACTACTTCTATTGA----TATTACCACTACCA------TTGTCACTGTC---ACTACTACTGCTGCTACTAT-A---A---CT--ACTATTACAA---CTG---CTGC--TGCTGCTGCTA-TA-------GTTAC---TAC----TATTAC---AACTGCGGTTGCTA--CTACGACTAAAAT---TACTATTTACTACCgtt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               actatttaaagtatgttcctgaaggcaactacacTACTACTACATGC-ACTGCTGC-----TGC---TACTGCTACTACT---------AC---TACTTT--TAtac
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---TAC----TACTACATGCACTGCT---GCTG--CTACTGCTACTACTACTACT-TTTAATATCAATAATAATATatatcaataataatat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTTCTCCTCATACTACCACTACTACTACGACGACGA-TGACAACGACGACGAC------TTCTATTACTACTATT---ACTTCT------TCT---ACTTCTA----CTCCTCCTCATACTACTACT-C-TGCTGCTGCTGA-----TGC---TGCTGGTACTACT---------TC---TACTTC--TAC-TACTGC-----T--GCTGCTG---GTGGTG---------------------CTATCA---CG------ACCATC---AC-----CTAC---TAAC-GATACTTATTCTACTGC----TG--GC-ACTGCAACAT---CT
gi|4                          :                                                                                            acaacaactcACTACTGC---TGCT---GCTGGTGGTGCTATCACGACCATCACCTACTAACGATACT--TAT-TCTACTGCTGGCACTGCAACATCTATT--AACTCTTTC---AGATACTAATAattaactctttcagatactaatacccatgccgc
gi|5                          :                                                acaacaactccttctcctcatactaccactactactacgacgacgatgacaacgacgacgacttctattactactattacttcttctacttctactcctcctcatactactactctgctgctgctgatgctgctggtactacttctacttctTTACTAAAACTACTAATAT---TTC---------TTCAGCTACTACTGCTATTACTACTACTAAATCTACTAATATTTCTTCAGCTTCTAC---TAC--TATTCCTAAAACTAATACTTCT-TG--TACTACT-ATTATT---GCTAC---CACTAAAACTACTAATATTCCTTTTACTA----CTACTTCTA-CTACA-----------GTACTACTATTAC---TAAATTTACTAATATTTcccatgccgc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtactaagaCTT---CTACAAC-----------TA-------CTACTA---CT------TCTCAT---ACTC---CTTC---CCAC-ACTACTACTACTACT-CATCATAATCCTCCTCCTACTT---CTACAATTA-CG-T----CTACTACTACTCCT-C-ATCT-----T--CCTCCT-----------C-CTCC--TACTACTACTATTAC--GGC-GCTAT---TACATTGTACTAC---TA-TACTGCTGTTATTTTACTACTACTAC---TACT-TCTACTATTGATAATATTAGTA--ctacta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aC------GCT---ACCGTTA----CCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-----NNN---NNNNNNNNNNNNN---------AT---TACTGC--CGT-TACCGCTTC--C--GCTACTG---CTACTTC-----------TT-------CTNNNN---NN------NNNNNN---NNNN---NNNN---NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNGCTT---CTGCTGTTGCTGCTACTGCTACTACTACTACT----GCTG---CT--GCTGCTGC
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Reference ( family-319 )      :                    CTTCTACTA----CTACTACCANTACAACAA-CGAC-ANCA-T-AAACNACNACNACAACACCAAC-ATTACTAATACAACAACTACTAC---TGCT---GCTA------TTATTACTACT----TCTACTACCGCTACTNCTATAGCTGCTGCTGCCACTGCTACNTCTACTCCAACTCTTACTANAAATACTAATATGCCTTCGTAATACAGTNCAGCTATTACTGCTACTACTGCTACGTAAGCTACTACTGCTGCT---GCTGCTAC---TAC--TNTTNCTGCTACTNNTACTACTACA--TACT-CT-GCTACT---GCTAT---TACTACAACTACTACTATTGCTACTACTA----CTACTTTTA-CTACA-----------G--CTACTACTAC---TA---TTACTACTCTTTTCTTTTACTATGGCTACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTATATTTTGCTA---TCTTCATCTTCTNCTTCTACTACTACTTCTACTACGACGACGAACGACAACGACGACGACAAA--CTNNTATTGCTACCGCT---ACTGCC------GCT---ACCGCTA----CTACTNCTTCTGCTACTGCTAC-TNCTACTGCTGC-----TGC---TGCTGCTACTACT---------ACTACTTC--TAC-TGC------TGCTGA--T--GCTGCTG---CTGCTGCTT-----CTACTA---C-TGCTACT---ACTN---CT---AC---TA------AC-GCTACTACTNCTGCTGC----TGCTGCTNCTGCTACTT---CTGCCGCTGCCG-TACTACTACTACTACTACT-C-AGCTA---CT--GCTACTACAA---CTACC-CTNC--TGCTACTACTATTAC--TACTGCTAC---TAC----TACTAC---CACTACTTCTGCTACT--ACTACTACTAC---TACT-TCTACTACCGATAATAATATTA--TCTACTNCTGCTACAACTACGACTTTTGCTGTTGTTGTTATTGTTGTTGTTTTACTTTTTATA
gi|1                          :                    CTTCTACTT----CTGCTACCAGTACAACAA-CAAC-AGCAAT-AAACATCAACAACAACACCAAC-A--ACGAATGTAATAACTACTTC---TGCT---GCTA------TTACTAATACT----TCTCTTACTGCTACTTCTACTGCTACTGTTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTTTTGTTGCTACAACTGCTACGT---CTATTACTGCTGTT---GCTACAAC---TAC--TTTTTCTGCTGCTACTACTACTGCA--TACT-CT-GCTGCT---GCTAT---TACTACAATTACTTTTGTTGCTACTACTA----CTACTTTTGGCTGCA-----------G--CTACTTCTAC---TA---TTTTTACTCTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTCATCTTCTTCTTCTACTTCTACTTCTACAATAACAACAAACAACAACAACAACGATAAAAACTGTTACTGTTACTGCT---CTTGCT------GCT---ACTACTA----CTTCTTCTTCTGCTGCTGCTAA-TACTACTGCTTC-----TGC---CGCTGTTACTACT---------ACTACTTC--TAC-TGC------TGTTTA--T--ACTCCTAAATCTGGTGCTT-----TTATTT---G-TGCTACT---ACTT---CT---AC---TA------AT-TCTACTACTTCTGTTGC----TGCTGCTACTACTACTT---CTGCTGCTGGTGGTATTATTATTACTACTATTTC-AGTTG---CT--GCTACTACAA---CTATCTCTTC--TGCTGCTACTAATAC--TACTTCTGC---TGC----TACTAC---TAGTACTTATGCTGCT--GTTACTACTAC---TGCT-TCAACTAAAGATAATAATATTA--TTTACTGCTGCTACAACTACGACTTTTGCTGTTGTTGTTATTGTTGTTGTTTTACTTTTTATA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T---------ATTGCTTCAGTAAGTGT------TGCTGAGTT--ACTGCAA---CTGTTGCTT-----CTGTCG---C-TACAATC---ACTA---CT---AC---TA------TC-ACTACTATTGTTGCTGC----TGCTGCTTCTGTTACTT---CTGCCACTAC---TACTACCACTTCTACT--T-C-CGCTA---ATTATCTACTCCAA---CTACatgtattccaaatttgcaaaattgcgtttaaaatatttgatctattaatagaagcattcgattggacttttgatacccaattgaaaacctg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taccattgttactacatgtatatatattctgaCTA----CTACTACTTCTGCTGCTGCTAC-TTCTGCTGCTACAAACATGTATATGGT-CAACGACT---------ACTATTTC--TTC-TGC------TGC-----T--GCTGTTT---CTGTTGGTA-----CAA--A---CATG-TA-------TA---TT---GT---CA------AG-ACTACTACTTCTGCTGT----TGCTACTTCTACTGCTA---CTtgg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                          acaaGCAATAACTGCAAACGTTGCTA---AAGCTGCTACCGCTGCT---GCTGCTAT---TACGGTCTTATTTCTATTACTAATATT-CA--TACT-TT-ATAATTTAGAATATATGTACTACGACTAC---TACTACTATTTGTG----CTTCTCATA-CTAAA----------------ATTACTAC---TG---TTACaaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 actCTACTATTTCTGTTGC----TGCTG-TCCTGCCACTTTCGCTGTCATTGCCA-TACTA-TATCACCGC--CT-CCACCTT---CT---CTACCACAAGCACTATCACTACAAT-CCACCACTATCAT--TAGTGCTAC---TGC----TGCTAT---CGATGCTTCTGGAACT--ACT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACTGCTGCTGCTGCTTTTAA-NNNNNNNNNNNN-----NNN---NNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNN--NNN-NNN------NNNNNN--N--GCTGCTG---CTGCTGCTG-----CTGTTA---A-AAGTACT---ACTT---CT---GC---TA------AT-ACTACTACTGCTGTTGC----TGCTGCTGTTAATACT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTGTTATTGCT---ACTGCCTCT---GCT---ACAGATC----CTACTTTTACTGCTGCAGATAC-TTTTACTGCTGC-----T------GCTGCTGCTGCT---------GCTACATT--TAT-TGTTACTAGTGCTGG--T--GTTACTG---TTGTTGCAT-----CTACTG---C-TGATACT---A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cATCACC---ACCACC------ACC---ACCACAAAATTCTACTTCTTCTACTACTTTTAC-TACTACAACTAC-----TAC---TGCTTCTACTATT---------ACTA---C--AAA-AAC------TACTAA--T--GT--NNN---NNNNNNNTT-----CTACTA---T-TACTAC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcC---TAC--TTCTTCTACTACTTTTACTACTACAACTACTACT-GCTTCT---ACTAT---TACTACAAAAACTACTAATGTNNNNNNNNNNTTCTACTATTA-CTACA-----------aaaaac
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tatttcccggagagttgacaaatcgcctacgcagtaCTTCTACTAATACTACT-T---TTA---CA--AATACTATAA---CTACT-TTTT--TGCT--TA-TATAAC--TACTGCTAC---TAC----TTCTAC---CATAACTTCTACCACT--ACTACAACTAC---
gi|2                          : accattaagaatactatttCTTCTATTATTACCTACTACTATTACAACAA-CTACTATTA-TTACACTACTACTACAATAC-AACTATTACTACTACAACAACTACTAT---TACTTGTACTA------TCATTATTACT----TCTACT---GCTACTACTATAACTGCTGCTGCTACTACTACTTCTACTCCAACTTTTACTACCAATACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTA--TATT-TTGCTACTACTTCT---T---CTATTACTA-TG--------GCTAC---TAA--TATGCCT-----TTGTAATAGTGTA--TATT-TT-GCTACT---ACTAC---CTCT---TCTATTACTATGGCTACTAATA-----TGCCTTTG-TAATAGTGTGTATTTTG--CTACTACTACTTGTA---TTACTAC-CTTTTCTTTTACTATGGCTACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTATATTTTGCTA----------CTACTACTTCTATTACTACTTCTACTA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atatcactggtgccaatgcatgtttatgaaattttaaacattagatacaatggccatctgcttttatttcatctttttcttTACT---------AGTATTAA--TAC-TGC------TGCTAA--T--ACTGTTG---CTGCTA--------TTATTA---C-TTCTACT---ACTA---C----AT---TA------ACTGCTAGTGCTTCTGCTGC----TGATTCTGATACTACTT---CTACatatc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTT---CT--TCTACTACAG----TACT-TTTT--TTTTACTAAGATTAC--TAATATTTC---TTC----TTATAC---TACTACTTCTACTACT--ATTACTAAAAC---TACaaccact
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctacaaatatttGCT------GCT---GCAGCTG----CTATTACATCTACTACTACTAC-TACTACTGCTGT-----TGC---TGCTGTTCATACT---------ACTA---C--TAC-TGC------TGCTAC--T--GCTGCTaaataa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  C--TACTTTTACAATTAT----TATTAT---TACTACATGTACTATT--ACTACTACTAC---TTCA-TTTAATACTTATAATAGTTCTACTTCTACTTCTGCTACAACTAnnnnnnnnnnt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                gTGTTGTT---GTTACTTT---TAC--TGTTGCTGATACTTTTACTGCTACA---ACT-TTCACTGTT---GCTAT---TTCTAAAACTACCACCACTATAACTACTA----CTA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACAACAACTACTACTAC----AACTATAACT--GATACTACAA---CTA---------TAGTACTACTATTACAGTTCTGCTTG---TAT----TAAAAT---CACTAAATTTGCTAC
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                   TACGACTACTACTATTACGTATGATACTACTGCTGCT---GCTGCTGCAATTAC--CGCCGCCGCCATCAAAACCACTAC
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T---------AATACTTC--TAG-TTT------AGCTGA--T--GATGCAG---CTACTACTT------TA-TA------ACTAAT---ACTG---TT---AC---TA------AC-caacta
gi|29                         :                                                                                             ttattatgaACTACTAC---ACCT---ACTT------TTATAACTACT----TCTACTACTGCT---GCTATAGATGCTGCTGCCACTGCTag
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --CTAATAGTACTACCACT---ACTACC------GCC---ACCGCTA----CCATCAC-----CAAC----AC-TAATACTACTAC-----TAC---TAATACTACAACA---------ACAA---C--TAT-TGT------TGCTGC--T--GCCACTG---CTGCTACTA-----CTACTG---C-TGCGTCT---ACTA---TT---AC---TG------AT-GCTACTACTTCTATTGA----TATTACCACTACCA------TTGTCACTGTC---ACTACTACTGCTGCTACTAT-A---A---CT--ACTATTACAA---CTG---CTGC--TGCTGCTGCTA-TA-------GTTAC---TAC----TATTAC---AACTGCGGTTGCTACT--ACGACTAAAAT---TACTATTTACTACCgtt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               actatttaaagtatgttcctgaaggcaactacacTACTACTACATGC-ACTGCTGC-----TGC---TACTGCTACTACT---------ACTACTTT--TAtac
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---TAC----TACTACATGCACTGCT---GCTGCT--ACTGCTACTACTACTACT-TTTAATATCAATAATAATATatatcaataataatat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTTCTCCTCATACTACCACTACTACTACGACGACGA-TGACAACGACGACGAC------TTCTATTACTACTATT---ACTTCT------TCT---ACTTCTA----CTCCTCCTCATACTACTACT-C-TGCTGCTGCTGA-----TGC---TGCTGGTACTACT---------TCTACTTC--TAC-TAC------TGC-----T--GCTGCTG---GTGGTG--------CTATCA---C-GACCATC---AC-----CT---AC---TA------AC-GATACTTATTCTACTGC----TG--GC-ACTGCAACAT---CT
gi|4                          :                                                                                            acaacaactcACTACTGC---TGCT---GCTGGTGGTGCTATCACGACCATCACCTACTAACGATACT--TAT-TCTACTGCTGGCACTGCAACATCTATT--AACTCTTTC---AGATACTAATAattaactctttcagatactaatacccatgccgc
gi|5                          :                                                acaacaactccttctcctcatactaccactactactacgacgacgatgacaacgacgacgacttctattactactattacttcttctacttctactcctcctcatactactactctgctgctgctgatgctgctggtactacttctacttctTTACTAAAACTACTAATAT---TTC---------TTCAGCTACTACTGCTATTACTACTACTAAATCTACTAATATTTCTTCAGCTTCTAC---TAC--TATTCCTAAAACTAATACTTCT-TG--TACTACT-ATTATT---GCTAC---CACTAAAACTACTAATATTCCTTTTACTA----CTACTTCTA-CTACA-----------GTACTACTATTAC---TAAATTTACTAATATTTcccatgccgc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtactaagaCTT-----CTACAA---C-TACTACT---ACTT---CTCATAC---TCCTTCCCAC-ACTACTACTACTACT-CATCATAATCCTCCTCCTACTT---CTACAATTAC-G-T----CTACTACTACTCCT-C-ATCT-----T--CCTCCT-----------C-CTCC--TACTACTACTATTAC--GGC-GCTAT---TACATTGTACTAC---TA-TACTGCTGTTATTTTACTACTACTAC---TACT-TCTACTATTGATAATATTAGTA--ctacta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aC------GCT---ACCGTTA----CCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-----NNN---NNNNNNNNNNNNN---------ATTACTGC--CGT-TAC------CGCTTC--C--GCTACTG---CTACTTCTT-----CTNNNN---N-NNNNNNN---NNNN---NN---NN---NN------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNGCTT---CTGCTGTTGCTGCTACTGCTACTACTACTACT----GCTG---CT--GCTGCTGC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T---ACTGCC------GTT---ACCGCT-------------TCCGCTACTGCTAC-TTCTTCTNNNNN-----NNN---NNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNN--NNN-NNN------NNNNNN--N--NNNNNNN---NNNNNGCTT-----CTGCTG---T-TGCTGCT---ACTG---CT---AC---TA----------CTACTACTGCTGCTGC----TGCTGCTGCtgc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cgctaccgttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatCTA-----CTACTA---T-TGCTACC---ACTAACCCT---ACCGCTA------AC-GCCACCACTACTGCCAC----CGCTACCACAACCAA-----CTACCACTACA---ACTACCACTACTGCTACT----GTTA---CT--GCCATTGTCA---CTGCCACCAC----CCACTACCATGAT--AACTACCAC---TAC----CACTAC---AACTGCTACTGCTACT--GTTACTGCCAC---TGCT-ACCACTACC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caaTATTGCTGCCGCTTTTACTGCTTCTGTAGCTTCCATCTCTA----CTCTTGCTTCGACTACTGCCAT-GTTTATCGTCAT-----TAC---TGCGGCTACCATC---------GCCACTTT--TAC-TGC------TA--GA--TTTGCTGCTT---TTACTGCTT-----TTGCTAGATT-TGCTGCTTTGACTT---TT--------TA-----------TACTACTTTTACTAC----TTTTGCTACTGCTACTT---CTGCaccaccc


blockSeqs                     :                             TTAC         C        C G  T C  TTA    C  C  C  A    C   T T                     CAT    TGT    GTGGTG    T      ATCA      ACT   A  A    AA                   T      CC         TAC            GCCTTTGTAATACAG G  G     A           G  ACGTATG         C  C TCA        AAT   GG C  A  TCT   AC       A  AC    A  C      TAG     ATG     C      TAC              NNTT         .     GTGTGTATTTTG            TTGTA          T                                                        .              A                              .                .      AA             TTT      TCTGTA   TCC      AAATT     A           G    A T        A AAACA G ATA             TATTATGAT    C   AG   G   TACTAG   TGAGT TT       .          TTATAA   T  GATT        TTG   AACC  CAT  CGC  CTTCCCACA         G       ATCA  C    T  G      TCG     A    TGC                A  AACTATAA     TAT     C   GCA   TCACTACAAT              AG         AAT   ATTG      ATGC A    TC       TT           TAC    A                G     CT      T
blockSeqs                     :                             .            T        . T  . T  C      T  T  T  .    .   . T                     .      .      .         A      .         AAC   A  G    AG                   A      .          TAA            TTC             T  G     A           T  ACTAAAT         T  T .          .     .  T  T  ACT   TT       G  .     A  .      .       .       C      TAC              .            .     GTA                     TAAAT          .                                                                       C                                                      TC             .        TCT      .        A         G           T    . N        N .     N .               .            T   .    .   .        NNN   .        .          T        T  CA          .     A     .    .    ACTG              T       .     C    T  A      .       A    CA                 A  CCACCTT      A       A   .     CTTTTTTG                .          .     .         C    T    TC       .            .      .                A     .        
blockSeqs                     :                                                                                                              .      .      .         C      .         .     .  .    T                                      .                                 .     A           A  AAAG            C  C .          .     .  A  C  GAT   TG       A  .     .  .      .       .       A      CAC              .            .     .                       TG                                                                                                                                                           .        .        .        C         T           G    . T        G .     A .               .            N   .    .   .        TGG   .        .          A        C  C           .     A     .    .    TCA               T       .     C    C  G      .       A    C                  A  CCGCTA       T       A   .     CTTTTTTT                .          .     .         C    C    TC       .            .      .                T              
blockSeqs                     :                                                                                                              .      .      .                                                                                                                       .           A  T               T  C .          .     .  G  G  GCC   TT       A  .     .  .      .       .       A      TAA              .            .                                                                                                                                                                                          .        .        .        G         T           T    . A        A .     A .               .            C   .    .   .        TAA   .        .          G        C  A           .     T     .    .    AGA               G       .     C    G  A      .       A    G                  C  CATCT        G       A   .     CCTCCTA                 .          .     .         T    C    TG       .            .      .                               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                   .  . .          .     .  G  G  AAA   AA       .  .     .  .      .       .       .      .                .                                                                                                                                                                                                       .        .        .        G         T           T    . A        T .     G .               .            C   .    .   .        TGA   .        .          T        A  C           .     A     .    .    ATA               T       .     A    G  A      .       G    A                  A  TTTA         A       A   .     CCACCAC                 .          .     .         T    C    TT       .            .      .                               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .     .  A  C  .     AA       .                                                                                                                                                                                                                                                                  .        .        .        A         A           A    . A        G .     A .               .            T   .    .   .        TAA   .        .          T        T  T           .     G     .    .    ATG               T       .     T    A  A      .       A    .                  A  ATAA         C       A   .     CTGCTG                  .          .     .         C    C    GT       .            .                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .        .        A         A           A    . A        A .     G .               .            C   .    .   .        TAC   .        .          T        C  C           .     A     .    .    ACG               T       .     A    A  G      .                               .  GCTG         G       G   .     TA                      .          .     .         A    C    GC       .            .                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .        .        A         C           A    . G        G .     G .               .            C   .    .   .        TGA   .        .          A        T  C           .     T     .    .    NNN               A       .     N    C  C      .                               .  GTTA         G       G   .                             .          .     .         T    C    AC       .                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .        .        A         N           N    . G        G .     N .               .            C   .    .   .        TGC   .        .          T        C  C           .     N     .    .    ACG               N       .     C    N  N      .                                               .       .                                            .     .         A    .    .                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .         G           G    . N        N .     N .               .            C   .    .   .        TTC   .        .          T        N  C           .     G     .    .    .                 G       .     C    G  A      .                                                                                                                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .           G    . T        N .     A .               .            N   .    .   .        NNN   .        .          T        C  C           .     T     .    .    .                 A       .     T    A  G                                                                                                                                                                                                  
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                          acaaGCAATAACTGCAAACGTTGCTAA---AGCTGCTACCGCTGCT---GCTGCTATTACGGTCTTATTTCTATTACTAATATT-CATACT-TT-ATAATTTAGAATATATGTACTACGACTAC---TACTACTATTTGTGCTTCTCAT-ACTAAA----------------ATTACTAC---TG---TTACaaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             actCTACTATTTCTGTTGC----TG---CTG-TCCTGCCACTTTCGCTGTCATTG--CCA-T----ACTA-TATCACCGCCTCCACC---TTCT------CTACCACA---A----G-CACTATCA-CTACAATCC-ACCACTATCAT--TA----GTGCTA--C---TGC----TGCTAT---CGATGCTTCTGGAA--CTACT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ACTGCTGCTGCTGCTTTTAA-NNNNNNNNNNNN-----NNN---NNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNN--NNN-NNN------NNNNNN--N--GCTGCTG---CTGCTGCTG-----CTGTTA---AAAGTACT---AC---TT---CTGC---TAAT-ACTACTACTGCTGTTGC----TG---CTGCTGTTAATACT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTGTTATTGCT---ACTGCCTCT---GCT---ACAGATCCTACTTTTACTGCTGCAGATAC-TTTTACTGCTGC-----T------GCTGCTGCTGCT---------GCTACATT--TAT-TGTTACTAGTGCTGG--T--GTTACTG---TTGTTGCAT-----CTACTG---CTGATACT---A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cACCAC---CACCA-----CCACCACA---AAATTC-TACT-TC---TTC----T-ACTACT-TT----------------------TAC----TACTAC---AACTACTACTGCTT--CTACTATTACTAC---AAAA-ACTACTAATGTNNNNNNNNNNT--TCTACTATTACTACAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcatc---CTACTTCTT-----CTACTA---CTTTTACT---AC---TA---CAAC---TA----CTACTGCTTCTACTAT----TA---CTACAAAAACTACTA---ATGTNNNNN--NN--N----NNTTCTACTATTAC-TACaaac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcatcaccaccaccaccaccacaaaatt------GCT---GCCTCTGCTACTTGTTCTACTACATCTAC-CACAACTACTTC-----TAC---TACTACTACTATTTATTATGATAATACTTT--TAC-TTT------AGCTGA--C--GATGCTG---CTCCTACTTTATAACTAATA---CTGCTACT---Aaaaaac
gi|18                         :                     TTCTACTA----CTACTACCACTACCACAACCGAA-ACCA-C--AACCACCACCAC--CACCACT-ATTACTAACACAACTACTACTACCATTGCC---GCTA------at
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tatttcccggagagttgacaaatcgcctacgcagtaCTTCTACTAATAC-TACTTT---TACAA-----ATACTATA---A----C-TACT-T----TTT----T-GCTTATATAAC--TA----CTGCTA--C---TAC----TTCTAC---CATAACTTCTACCA--CTACTACAACTAC---
gi|2                          : accattaagaatactatttCTTCTATTATTACCTACTACTATTACAACAA-CTACTATTA-TTACACTACTACTACAATAC-AACTATTACTACTACAACAACTACTAT---TACTTGTACTA------TCATTATTACT----TCTACT---GCTACTACTATAACTGCTGCTGCTACTACTACTTCTACTCCAACTTTTACTACCAATACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTA--TATT-TTGCTACTACTTCT------TCTATTACTA-TG--------GCTACTAA--TATGCCT-----TTGTAATAGTGTATATT-TT-GCTACT---ACTAC---CTCT---TCTATTACTATGGCTACTAATA-TGCCTTT-GTAATAGTGTGTATTTTG--CTACTACTACTTGTA---TTACTAC-CTT---TTCTTTTACTATGGCTACTAATATGCCTTTGTAATACAGTGTATATTTTGCTA-------CTACTACTTCTATTACTACTTCTACTA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atatcactggtgccaatgcatgtttatgaaattttaaacattagatacaatggccatctgcttttatttcatctttttcttTACT---------AGTATTAA--TAC-TGC------TGCTAA--T--ACTGTTG---CTGCTA--------TTATTA---CTTCTACT---AC---TA---C-AT---TAACTGCTAGTGCTTCTGCTGC----TG---ATTCTGATACTACTT---CTACatatc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTACAAA-TATTTC---TTCTT-----CTACTACA---G------TACT-TT--TTTT----TTACTAAGATTAC--TA----ATATTT--C---TTC----TTATAC---TACTACTTCTACTA--CTATTACTAAAAC---TACaaccact
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GCT------GCT---GCAGCTGCTATTACATCTACTACTACTAC-TACTACTGCTGT-----TGC---TGCTGTTCATACT---------ACTA---C--TAC-TGC------TGCTAC--T--GCTGCTaaataa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                C--TA----CTTTTA--CAATTAT----TATTAT---TACTACATGTACTA--TTACTACTACTAC---TTCA-TTTAATACTTATAATAGTTCTACTTCTACTTCTGCTACAACTAnnnnnnnnnnt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                gTGTTGTT---GTTACTTTTAC--TGTTGCTGATACTTTTACTGCTACA-ACT-TTCACTGTT---GCTAT---TTCTAAAACTACCACCACTATAACTACTACTA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ----ACAACTACTACTAC-AACTAT---AACTG-----ATACTACA---A----C-TA--------TAG----T-ACTACTATTACAGTT----CTGCTT--G---TAT----TAAAAT---CACTAAATTTGCTA--C
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acaTA---CGACTACT---AC---TA---TTAC---GTAT-GATACTACTGCTGCTGC----TG---CTG---CAATTACCG---CCGCCGC----CA--TCAAAACCACTACCA--AC-TA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T---------AATACTTC--TAG-TTT------AGCTGA--T--GATGCAG---CTACTACTT------TA-TA-----ACTAAT---AC---TG---TTAC---TAAC-
gi|29                         :                                                                                             ttattatgaACTACTAC---ACCT---ACTT------TTATAACTACT----TCTACTACTGCT---GCTATAGATGCTGCTGCCACTGCTag
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTAATAGTACTACCACT---ACTACC------GCC---ACCGCTACCATCAC-----CAAC----AC-TAATACTACTAC-----TAC---TAATACTACAACA---------ACAA---C--TAT-TGT------TGCTGC--T--GCCACTG---CTGCTACTA-----CTACTG---CTGCGTCT---AC---TA---TTAC---TGAT-GCTACTACTTCTATTGA----TA---TTACCACTACCA------TTGTCACTG---T--C----ACTACTACTGCTGC-TACTAT---AACTA-----CTATTACA---A----C-TGC--TG--CTGC----T-GCTGCTA-TA-----------GTTA--C---TAC----TATTAC---AACTGCGGTTGCTA--CTACGACTAAAAT---TACTATTTACTACCgtt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  actatttaaagtatgttcctgaaggcaactacacTACTACTACATGC-ACTGCTGC-----TGC---TACTGCTACTACT---------ACTACTTT--TAtac
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---TAC----TACTACATGCACTGCT---GCTG--CTACTGCTACTACTACTACT-TTTAATATCAATAATAATATatatcaataataatat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTTCTCCTCATACTACCACTACTACTACGACGACGA-TGACAACGACGACGAC------TTCTATTACTACTATT---ACTTCT------TCT---ACTTCTACTCCTCCTCATACTACTACT-C-TGCTGCTGCTGA-----TGC---TGCTGGTACTACT---------TCTACTTC--TAC-TAC------TGC-----T--GCTGCTG---GTGGTG--------CTATCA---CGACCATC---AC--------CTAC---TAAC-GATACTTATTCTACTGC----TGGCACTGC
gi|4                          :                                                                                            acaacaactcACTACTGC---TGCT---GCTGGTGGTGCTATCACGACCATCACCTACTAACGATACT--TAT-TCTACTGCTGGCACTGCAACATCTATT--AACTCTTTC---AGATACTAATAaacatctattaactctttcagatactaatacccatgccgc
gi|5                          :                                                acaacaactccttctcctcatactaccactactactacgacgacgatgacaacgacgacgacttctattactactattacttcttctacttctactcctcctcatactactactctgctgctgctgatgctgctggtactacttctacttctTTACTAAAACTACTAATAT---TTC---------TTCAGCTACTACTGCTATTACTACTACTAAATCTACTAATATTTCTTCAGCTTCTACTAC--TATTCCTAAAACTAATACTTCT-TGTACTACT-ATTATT---GCTAC---CACTAAAACTACTAATATTCCTTTTACTACTACTTCT-ACTACA-----------GTACTACTATTAC---TAAATTTACTAATATT---Tcccatgccgc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gtactaagaCTT---CTACAACTA-----CTACTA---CTTCTCAT---AC---TC---CTTC---CCAC-ACTACTACTACTACT-CATCATA---ATCCTCCTCCTACTT---CTACAATTA--CG--T-----CTACTACTACTCC-TCATCT---TCCTC-----CT------------------CC-TC--CTAC----T-ACTACTATTAC--GG----C-GCTA--T---TACATTGTACTAC---TA-TACTGCTGTTATTTTACTACTACTAC---TACT-TCTACTATTGATAATATTAGTA--ctacta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aC------GCT---ACCGTTACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-----NNN---NNNNNNNNNNNNN---------ATTACTGC--CGT-TAC------CGCTTC--C--GCTACTG---CTACTTCTT-----CTNNNN---NNNNNNNN---NN---NN---NNNN---NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN----NN---NNNNNNNNNNNGCTT---CTGCTGTTG--CTGCT----ACTGCTACTACTAC-TACTGC---TGCTG-----CTGCTGC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          T---ACTGCC------GTT---ACCGCT---------TCCGCTACTGCTAC-TTCTTCTNNNNN-----NNN---NNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNN--NNN-NNN------NNNNNN--N--NNNNNNN---NNNNNGCTT-----CTGCTG---TTGCTGCT---AC---TG---CTAC---TA----CTACTACTGCTGCTGC----TG---CTGCTGCtgc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cgctaccgttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatCTA-----CTACTA---TTGCTACC---AC---TAACCCTACCGCTAAC-GCCACCACTACTGCCAC----CG---CTACCACAACCAA-----CTACCACTA--CA-------ACTACCACTACTGC-TACTGT---TACTG-----CCATTGTC---A----C-TGCC-AC--CACC----C-ACTACCATGAT--AA----CTACCA--C---TAC----CACTAC---AACTGCTACTGCTA--CTGTTACTGCCAC---TGCT-ACCACTACC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           caaTATTGCTGCCGCTTTTACTGCTTCTGTAGCTTCCATCTCTACTCTTGCTTCGACTACTGCCAT-GTTTATCGTCAT-----TAC---TGCGGCTACCATC---------GCCACTTT--TAC-TGC------TA--GA--TTTGCTGCTT---TTACTGCTT-----TTGCTAGATTTGCTGCTTTGAC---TT---TT-----TA-----TACTACTTTTACTAC----TT---TTGCTACTGCTACTT---CTGCaccaccc
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): ACAACAACAACAGCAGTAGCAACAGCAACAACAACAACAACAAAACCGAGTCTGCTATTTTCTTTTGTT