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Reference ( gi|2 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GACAAGCTT---G--AGATGT--------TTATTTCCA---------GAAGGTCTGAGA--CA--CATTAGGAATA-GT---CACAT--AT------ATATGGTAACAAATATGGCGGCAAAATCATTTCTAA-TAA-ACCT-GTA------TAT--CAGA-ATTATATACAATATCATAAAG-AC-CT-T-AAT-------TC-----TATG-AT---ATTATAAAAAGATATGCAGATTGGAGTTTT-----AGGCTTTGTTCAAC------TT---TAGATATATAT-TAT-----TTC------ATA-ACA---GTAATAGAAT-TATGGCAA--A----A------T----ATTA---TA--------CGACTTAACATACAGATCGTGCAA-TATGTGTTTGTAGGTAAAAAATTTAAATCCATTTGATCTTGCCATAGATCGAAACATATATA-ACAGTATCAAACAA-GGA-------ACATA-TACACCAAAATCT-AGATTTCATTAACAAGTTCTTATATTCATGTAGTTGATTGTTTCCCTGGCTGTAATTAGACAAACAATAAGAAACATGTTACATTCTAAG----CATAATATATTTGCTTGGTTAAATTTAACAATCAAGTGGCATTTGTTTTATGATTGCATCAAGATTTCTTT-TGGATCATTGTATCATCTGCAGAGTAAGTTTAAAATACTATAAACTCACAAGTTCTGAGTGTGCACCCTTTATTAAGTGTAATAAATATTCCTTGTATTTTTTA--------CTTGCAGTGTAAACCCCATCTATCT
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatgtttGACAAGTTT---G--ACATGTATTTTTCATTATTTCCA---------GAAGGTCTGAGA--TC--CATGAAGAATA-GT---CAAAT--AT------ATATGATTACAAATATGGCGACAGAA-----TCTAATTAACACCT--TA------TAA--CACA-ATTATATACGATATCATAAAT-AA-TT-T-GA--------TA-----TATA-AT---ATT-TAAACA-ATATGCAGATTGGTGTTTC-----AGGCTTTGTCCGAC------TA---TATACACATATGTAT-----c
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GACAAGTTT---GGCAAATTTAATTCCA-TTATTTTCA---------GTAGGTCCGAGA--CC--CATAAGGAATA-GT---CACAT--AT------ATGTGAATACACATATGGCGACAA---CATT--TAA-TAA-ACATCATA------TAA--CATA-ATTATATACAATACCATAAAG-CA-CT-T-AAT-------at
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GACAAGTTT--------ATTTCAA-----TTATTTCCA---------GAAGGTCTTAGA--CC--CATGAGGAATA-AT---CACGT--ATAATTACACATGATTACAAATATGGCGACAAAgcattatt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  caagtttACAAGTTT--------ATTTCCA-----TTGTTTCTA---------GAGGTTCTTGGA--GC--TATGAGGAATA-GT---CTAAT--AA------AAATGATTACAAATGTGAAGACAAAATC-----TAA-TTA-ACATCATA------CAA--CATA-ATTATATACGATATAATAAAG-CA-TT-T-AA---------CA----TATT-AT---TTTATAAACAAATATGCATATTTGAGTTTC-----AGGATTTGTTCAACGATAACTCCCATAAATATATATATATACAAATTT------ATA-A-AGATGTGACA-AAC-TGTGAAAA--A----AATAAATT----ATTAGATTAACATAGATTAACTTAAAATACACATCGGGCAA-TA----TCTATAG--------------TCT-TTTGATCATGCCCGATATCGAAACGTATATACAAAG-ATCAAACAATGGA-------ACATA-TATATTAAAATTTAAGATTTCATTAATAACTTCATATATCCACGTATTT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aagttttACAAGTTTTTGG--AAAAGT--------TTATTTCCATTCTTTGTAGAAGATTTGAAA--TC--TATACAGAATATGCATACATAT--AT------ATATGAATACAAATATGAC-----AA-CATATCTCA-TAA-ACTT-A-A------TATTACAAA-ATTAAATACAATATCATAAAG-CA-CT-T-AAT-------TT-----GCTG------ATTATGATA--ATATGCAGACTGCATTTTTTTTTCAGGCTTTGTTTGAA------TA---CAAATAACTAT-TTT-----TCT------ATA-AAG---ATAATACATC-AACTGCAT--ACTTTA------T----ATTA---TA--------AGAGATAGCATACAGAAGGAAAAT-TATATTTTCATAAGTAAtttc
gi|7                          : tttgttataacaaaatttataccacatttagatgcagaacttttaccactacgtttgtatataaaataaaggttatgttcaaaacaataatgagtgtacatcatacattgacacagcctcaattctcaatggttcacaatttttttttaatgccattttcaacacatttcaggttatatatggcatatccagttttactggtggagaaagacctcagactgaatcagactgagtagaaccactgtcctaccgcaagtaacatgaaactttctcacattaggtttttggagcgaacaggactcgaacctatggtgagaggcaagtgatcttgagacggcgctttagaccactcggcaatggacgacccgcacctcagaCAAGTTT---G--ACAAGT--------TTATTTCCA---------GAAGGTCCGAGA--CC--CATGATGAATA-GT---CATAT--AT------ATATGATTGCAAATATGACG--AAA---ACTTCT---TAA-ACTT--CA------TAT--AATATATTGTATATGACATCACAAAGCAC-AT-T-AAT-------TC-----TATG-AT---ATTAT--AAACACATGCAGATTGGAGTTTC-----AGGCTCTGTTCTAT------TA---TAGATATATAT-TAT-----TCT------ATA--------T-----AAT-TCT-GCAAACA----A------TTC--TTTG---TA--------AGAATTAA-ATACATGTCGTGTAA-TATGAA--TGTAGGTct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --------TTATTTCCA---------G---GTCTGAGA--CC--CATGAGAAATA-GC---CACAT--AT------ATATGATTAAAAATTTGACAACAAAA--ACTT---A-TAT-ACGTCATA------TAA--CATA-TCTATATGCAATATCATTAAG-TA-CT-T-AATGTATTACTC-----CAT--AT---ATTAT-------CATGCATATTGGAGTTTC-----AGGCATTGTTCGAC-----------TA---ATGTAT-TATA----TTCCAAATTATA-AAA---ATAATAAAAC-TATGACAAT-ATAT-A------T----ATTA---TT--------AGACTGAACAGACAAATCTTGCAA-TGTGAGTTTATTGGT--AAAATCTATATTCACTTGAT-----------------CATATATA-ACAAGATCAAACAATGGA-------TCTTA-AATATCCAAATCT-ATATTTCATTTATAAGTg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acaaatatgacaatgttatttcca--------TTATTTCCA---------GAAGGTCTGAGACCCACCCATGAGGAATA-GT---CACATAAAT------ATATGATTCCAACTATGGCGACAAAA-----TCTAA-TAC-ACATCATA------TAA--CACA-A
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atttgacaaatttatttcca--------TTATTTCCA---------GAAGGACAGAGG--CC--CAT---------------------------------GATTACAAATACGGCGATAAAATC-----TAA-CAA-ACATCATA------TAA--CATA-ATTATATACGATATTATAAA--ACACT-T-AATA------TCTTACTTAGGTATACAATTAT--AAAGTTATCTAGATT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aagtttggcaagtttatttccaTATTTCCA---------GAAGGTTTGAGA--CC--CATGAGAAATA-GT---TACAT--AT------ATATGATTACAAATAAATCGACACAA-----TCTAA-TAA-TCATCATA------TAA--CATA-ATTATATACGATATCATAAA--AC-AT-TGAAT-------TA-----TATG-AT---ATCATAAAA--ATATGCAGATTGGAGTTTC-----AGGATTTGT--------------------------T-TAT-----TT-------ATA-ATA---A-AAAAAAATCCATGACAA--ATTT-G------T----ATCA---TA--------AGACTTATTATACAtgttgtgaatttaaaatgactgataaatat
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttttatttccataTA------TGG--CATA-ATTATATATGATACAATAAAG--C-ATGT-AAT-------TC-----TATG-AT---AT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATATCATAAAG-CA-AT-T-AAT-------TT-----TATT-AT---GTTATAAACACATATGCAGATTGAAATTTC-----GGGCTTTGTTCGGC------TA---TAACTATACATGTAT-----TAT------ATGTATA---TGAAGATAAC-TACAACAA--G----A-----------GTTA---AA--------CTA--TAATACTTAG-------AA-TATGACTTTGTAGGT--AAAATCCATATCAGTTTGATAT----ATACATCGAAATTTATATagta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aaattg------ATA-AAG---ATAATAAAAC-TATGACAA--A----A------TTTATATTA---TT--------AGACTCAACATACAAGTCATGCAA-TATAAGCTTGTAGGTttcattaacaagttcatatatccatatagttgatcttgtctataaatgtaataagaccaactttacgaaacatgttctattttaaacagtcatactatatttgcttgcttaaattttacaaaaaagttgcatttgttttagcagtttataaattattcattaggcacattaatgtacaaaccactggttctaaggtcaggagttttaagtataaacatttctatatgttttaatcgacattttgcattgtctcatttgtct
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tAAC-TTTGACAA--ATTT-A------T----ATCA---TA--------ATACTTAACACATAAGACGTGCAAATATGTGTTC--------------TATATTCATTTGATC-------------AAACATATGCA-ACAAGGTCAGACAAAGGA-------ACATAATACATCAAAAACT-AGATTCCATTAATACGTTCATATATCCAAGTAGTTGGTCTTATCACTGGCTGTAATAAGA
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|14 ): GAGGTACATAATATTCACAATGCACTCATCATAGATTTAGAATTTGTTTTATGGAGTTTCAACCCATTACAAGTTACACATGGCGTCCACTTTTACTGTTGGAGGAAAATCACAATATGAAGCTGA
Unaligned ( gi|15 ): TCGCTTATGTAAAATAAGTAAGTTGTTTAACAAGTTTTGACAAGTTTATTTCCATTATTTCCAACAAAATACTGGTTCTAAGGTCAAAAGCTTTACGTATAAACATTCCTAGATTTTTTA
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Reference ( family-30 )       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACAA-GTTTG---A-----ATTT-------T---T----ATTTCCAGAAGGTCTGAG----ACCCATGAGGAATA-GT---CACAT--AT------ATATGATTACAAATATGGCGACAAA---A-CAT--CTAATAAACNTCATA--------TAACATAATTATATACGATATCATAAAGCAC-TTAAT-------TC-TATGAT-ATTATAAANA-A-TATGCAGATTGGA-----GTTTCAGGCTTTGTTCGAC---------TATAAATATATAT-TAT-----T-----TTATA-ANAATAATA-A--AACTATGA------CAA-A--T-T-AT---AT--TA---TAAG---ACTTAACATACANGTCGTGCAA-TATGAGTTCGTAGGTAAAA--TCTATA-TCNATTTGATCTTG---G-ATA--TCGAAACGTATA------TAACAAGATCAAACAATGGA-------ACATA-TACATCGAAATCT-AGATTTCATTAATAAGTTCATATATCCANGTAGTTGGTCTTGTCNNTGGNTGTAATAAGACCAACTTTACGAAACATGTTCTATTTTAAACAGTCATACTATATTTGCTTGCTTAAATTTTACAAAAAAGTTGCATTT-----GTTTTA-----GC----A-G-----TTTATAAATTAT----TCAT---TAG-GCACATT---AATG-T---ACAAAC-CACTGGTTCTAAG-GT-CAGGAGTT-TTAAGT---ATAAACATTTC-TATATGTTTTAATCGACATTTTGCATTGT----CTCATTTGTCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAAAA-GTTT----------ATTTCCA----T---T----CTTTGTAGAAGATTTGAA----ATCTATACAGAATATGCATACATAT--AT------ATATGAATACAAATATG---ACAAC---A-TAT--CTCATAAACTTAATA--------TTACAAAATTAAATACAATATCATAAAGCAC-TTAAT-------T----TGCTGATTAT-GATA-A-TATGCAGACTGCATTTTTTTTTCAGGCTTTGTTTGAA---------TACAAATAACTAT-TTT-----T-----CTATA-AAGATAATACATCAACTGC-A------TAC-T--T-T-AT---AT--TA---TAAG---AGATAGCATACA
gi|10                         : tttgttataacaaaatttataccacatttagatgcagaacttttaccactacgtttgtatataaaataaaggttatgttcaaaacaataatgagtgtacatcatacattgacacagcctcaattctcaatggttcacaatttttttttaatgccattttcaacacatttcaggttatatatggcatatccagttttactggtggagaaagacctcagactgaatcagactgagtagaaccactgtcctaccgcaagtaacatgaaactttctcacattaggtttttggagcgaacaggactcgaacctatggtgagaggcaagtgatcttgagacggcgctttagaccactcggcaatggacgacccgcacctcagaacaagtttttgGGCAA-GTTT----------ATTTCCA----T---T----ATTTCCAGAAGGACAGAG----GCCCATGA---------------------------------TTACAAATACGGCGATAAA---A---T--CTAACAAACATCATA--------TAACATAATTATATACGATATTATAAAACAC-TTAATA------TC-Tgaaggaaaattatattttcataagtaact
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aagttt-A--AACTTTGA------CAA-A--T-TTAT---AT--CA---TAAT---ACTTAACACATAAGACGTGCAAATATGTGTTC--------------TATA-TTCATTTGATC----------------AAACATATG------CAACAAGGTCAGACAAAGGA-------ACATAATACATCAAAAACT-AGATTCCATTAATACGTTCATATATCCAAGTAGTTGGTCTTATCACTGGCTGTAATAAGAtacttaggtatacaattataaagttatctagatttgttgtgaatttaaaatgactgataaatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACAA-GTTTGGCAA-----ATTTAATTCCAT---T----ATTTTCAGTAGGTCCGAG----ACCCATAAGGAATA-GT---CACAT--AT------ATGTGAATACACATATGGCGAC--A---A-CAT--TTAATAAACATCATA--------TAACATAATTATATACAATACCATAAAGCAC-TTAAT-------
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCGCTTATGTAAA----ATAAGTAAGTTG--TTTAACAAGTTTTG-----AC----AAG-----TTTAT------T----TC------------CATT---A-TT-TCCAACAAAA-TACTGGTTCTAAG-GT-CAAAAGCT-TTACGT---ATAAACATTCC-TAGATTTTTTAgcattatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACAA-ATTT----------ATTTCCA----T---T----ATTTCCAGAAGGTCTGAGACCCACCCATGAGGAATA-GT---CACATAAAT------ATATGATTCCAACTATGGCGACAAA------AT--CTAATACACATCATA--------TAACACAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atttGACAA-GTTT----------ATTTCAA----T---T----ATTTCCAGAAGGTCTTAG----ACCCATGAGGAATA-AT---CACGT--ATAATTACACATGATTACAAATATGGCGACAAA---
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               caagtttATGATA-A--AACTATCA------CAA-A--T-T-TT---ATGATA---TAAG---AATTAACTTTCATATTGTGCAG-TATAAGTTCATAG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            agTATA-AAGATAATA-A--AACTATGA------CAA-AATT-T-AT---AT--TA---TTAG---ACTCAACATACAAGTCATGCAA-TATAAGCTTGTAGGTccaataa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACAA-GCTTG---AG----ATGT-------T---T----ATTTCCAGAAGGTCTGAG----ACACATTAGGAATA-GT---CACAT--AT------ATATGGTAACAAATATGGCGGCAAA---ATCATTTCTAATAAACCT-GTA--------TATCAGAATTATATACAATATCATAAAGACC-TTAAT-------TC-TATGAT-ATTATAAAAAGA-TATGCAGATTGGA-----GTTTTAGGCTTTGTTCAAC---------TTTAGATATATAT-TAT-----T-----TCATA-ACAGTAATA-G--AATTATGG------CAA-A------AT---AT--TA---TACG---ACTTAACATACAGATCGTGCAA-TATGTGTTTGTAGGTAAAAAATTTAAA-TCCATTTGATCTTG---CCATAGATCGAAACATATA------TAACAGTATCAAACAA-GGA-------ACATA-TACACCAAAATCT-AGATTTCATTAACAAGTTCTTATATTCATGTAGTTGATTGTTTCCCTGGCTGTAATTAGACAAACAATAAGAAACATGTTACATTCTAAG----CATAATATATTTGCTTGGTTAAATTTAACAATCAAGTGGCATTT-----GTTTTATGATTGCATCAA-GATTTCTTT-TGGATCATTGTATCATCTGCAGAGTAAGTTTAAAATACT---ATAAACTCACAAGTTCTGAGTGTGCACCCTTTATTAAGTGTAATAAATATTCCTTGTATTTTTTA--------CTTGCAGTGTAAACCCCATCTATCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----ATTTTCAGAAGGTCTGAG----ACCCATGAGGAATA-GA---CACAC--AT------ACA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttttatttccataTA--------TGGCATAATTATATATGATACAATAAAGCAT-GTAAT-------TC-TATGAT-AT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GATATCATAAAGCAA-TTAAT-------TT-TATTAT-GTTATAAACACA-TATGCAGATTGAA-----ATTTCGGGCTTTGTTCGGC---------TATAACTATACATGTAT-----T-----ATATGTATATGAAGA-T--AACTACAA------CAA-GAGT-T-AA---AC--TA---TAAT---ACTTAG--------------AA-TATGACTTTGTAGGTAAAA--TCCATA-TCAGTTTGATA-TA---T-ACA--TCGAAATTTATATTTCATTAACAAGTTCAagta
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaatt-------ATATA-TACATCGAAATTT-ATATTTCATTAACAAGTTCATATATCCATATAGTTGATCTTGTCTATAAATGTAATAAGACCAACTTTACGAAACATGTTCTATTTTAAACAGTCATACTATATTTGCTTGCTTAAATTTTACAAAAAAGTTGCATTT-----GTTTTA-----GC----A-G-----TTTATAAATTAT----TCAT---TAG-GCACATT---AATG-T---ACAAAC-CACTGGTTCTAAG-GT-CAGGAGTT-TTAAGT---ATAAACATTTC-TATATGTTTTAATCGACATTTTGCATTGT----CTCATTTGTCTtatatccatatagttgatcttgtctataaatgtaataagaccaactttacgaaacatgttctattttaaacagtcatactatatttgcttgcttaaattttacaaaaaagttgcatttgttttagcagtttataaattattcattaggcacattaatgtacaaaccactggttctaaggtcaggagttttaagtataaacatttctatatgttttaatcgacattttgcattgtctcatttgtct
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                    aaattgatatcataaagcaattaattttattatgttataaacacatatgcagattgaaatttcgggctttgttcggctataactatacatgtattatatgtatatgaagataactacaacaagagttaaactataatacttagaatatgactttgtaggtaaaatccatatcagtttgACAA-GTTT----------ATTTCCA----T---T----GTTTCTAGAGGTTCTTGG----AGCTATGAGGAATA-GT---CTAAT--AA------AAATGATTACAAATGTGAAGACAAA---A---T--CTAATTAACATCATA--------CAACATAATTATATACGATATAATAAAGCAT-TTAA---------CATATTAT-TTTATAAACA-AATATGCATATTTGA-----GTTTCAGGATTTGTTCAACGATAACTCCCATAAATATATATATATACAAAT-----TTATA-AAGATGTGACA--AACTGTGAAAAAAATAA-A--T-T-ATTAGAT--TAACATAGATTAACTTAAAATACACATCGGGCAA-T-----------------A--TCTATAGTCT-TTTGATCATGCCCG-ATA--TCGAAACGTATA------TACAAAGATCAAACAATGGA-------ACATA-TATATTAAAATTTAAGATTTCATTAATAACTTCATATATCCACGTATTT
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tatgtttGACAATGTT-----------ATTTCCA----T---T----ATTTCCAG---GTCTGAG----ACCCATGAGAAATA-GC---CACAT--AT------ATATGATTAAAAATTTGACAACAAA---A--A---CTTATATACGTCATA--------TAACATATCTATATGCAATATCATTAAGTAC-TTAATGTATTACTC-CAT-AT-ATTAT--------CATGCATATTGGA-----GTTTCAGGCATTGTTCGAC---------T---AATGTATTA-TAT-----TCCAAATTATA-AAAATAATA-A--AACTATGA------CAATA--TAT-AT---AT--TA---TTAG---ACTGAACAGACAAATCTTGCAA-TGTGAGTTTATTGGTAAAA--TCTATA-TTCACTTGAT--------------------CATATA------TAACAAGATCAAACAATGGA-------TCTTA-AATATCCAAATCT-ATATTTCATTTATAAGTc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acaaatatCAA-GTTTG---AC----AAGT-------T---T----ATTTCCAGAAGGTCCGAG----ACCCATGATGAATA-GT---CATAT--AT------ATATGATTGCAAATATGACG--AAA---A-CTT--CT--TAAACTTCATA--------TAATAT-ATTGTATATGACATCACAAAGCACATTAAT-------TC-TATGAT-ATTATAAAC--A-CATGCAGATTGGA-----GTTTCAGGCTCTGTTCTAT---------TATAGATATATAT-TAT-----T-----CTAT--ATAATTCTGCA--AAC-------------A-A--T-T-CT----T--TG---TAAG---AATTAA-ATACATGTCGTGTAA-TATGAAT--GTAGGT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----ATTT-------TCAGT----ATTTCCAGAAGGTTTGAG----ACCCATGAGAAATA-GT---TACAT--AT------ATATGATTACAAATAAATCGACACA------AT--CTAATAATCATCATA--------TAACATAATTATATACGATATCATAAAACAT-TGAAT-------TA-TATGAT-ATCATAAA-A-A-TATGCAGATTGGA-----GTTTCAGGATTTGTT-------------TA--------------------T-----TTATA-ATAAAAAAA-A--ATCCATGA------CAA-AT-T-T-GT---AT--CA---TAAG---ACTTATTATACAg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              taacaatGACAA-GTTTG---ACATGTATTT-------T---TCATTATTTCCAGAAGGTCTGAG----ATCCATGAAGAATA-GT---CAAAT--AT------ATATGATTACAAATATGGCGACAGA------AT--CTAATTAACACCTTA--------TAACACAATTATATACGATATCATAAATAAT-TTGA--------TA-TATAAT-ATT-TAAACA-A-TATGCAGATTGGT-----GTTTCAGGCTTTGTCCGAC---------TATATACACATATGTAT-----
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-30 )       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACAA-GTTTG----A-------TTT----CCA---TTATTTCCAGAAGGTCTGAG----ACCCATGAGGAATA-GT---CACAT--AT------ATATGATTACAAATATGGCGACAAA---A--AT--CTAATAAAC------ATCA--TATAACATAATTATATACGATATCATAAAGCAC-TTAAT-------TC-TATGAT-ATTATAAAC-A-A-TATGCAGATTGGA-----GTTTCAGGCTTTGTTCGAC---------TATAGATATATAT-TAT-----T-----TTATA-ANAATAATA-A--AACTATGAC-AA-A--T-T-ATAT--TATAAGACTTAACATACANGT--CGTGCAA-TATGAGTTCGTAGGTAAAA--TCTATATCCATTTGATC-----T-G--ATA--TCGAAACGTATA------TAACAAGATCAAACAATGGA-------ACATA-TACATCGAAATCT-AGATTTCATTAATAAGTTCATATATCCACGTAGTTGATCTTNTCNCTGGCTGTAATAAGACNAACNNTANGAAACATGTTNCATTCTAAGCAGTCATANTATATTCGCTTGNTTAAATTT-ACAANNAAGTTGCATTT-----GTTTTA-----GC----A-G-----TTTATGGATCAT----TCAT---CAG-GCACGTT---AAT-NT---ACAAAC-CACTGGTTCTAAG-GT-CANNAGTT-TTAAGT---ATAAACATTCC-TATATTTTTTAATCGACATCTTGCANTGTAAACCCCATCTGTCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAAAA-GTTT-----A-------TTT----CCA---TTCTTTGTAGAAGATTTGAA----ATCTATACAGAATATGCATACATAT--AT------ATATGAATACAAATATGACAACATA-------T--CTCATAAAC------TTAA--TATTACAAAATTAAATACAATATCATAAAGCAC-TTAAT-------T----TGCTGATTAT-GAT-A-A-TATGCAGACTGCATTTTTTTTTCAGGCTTTGTTTGAA---------TACAAATAACTAT-TTT-----T-----CTATA-AAGATAATACATCAACTGC-AT-AC-T--T-T-ATAT--TATAAGAGATAGCATACA
gi|10                         : tttgttataacaaaatttataccacatttagatgcagaacttttaccactacgtttgtatataaaataaaggttatgttcaaaacaataatgagtgtacatcatacattgacacagcctcaattctcaatggttcacaatttttttttaatgccattttcaacacatttcaggttatatatggcatatccagttttactggtggagaaagacctcagactgaatcagactgagtagaaccactgtcctaccgcaagtaacatgaaactttctcacattaggtttttggagcgaacaggactcgaacctatggtgagaggcaagtgatcttgagacggcgctttagaccactcggcaatggacgacccgcacctcagaacaagtttttgGGCAA-GTTT-----A-------TTT----CCA---TTATTTCCAGAAGGACAGAG----GCCCATGA---------------------------------TTACAAATACGGCGATAAA---A---T--CTAACAAAC------ATCA--TATAACATAATTATATACGATATTATAAAACAC-TTAATA------TC-Tgaaggaaaattatattttcataagtaact
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aagttt-A--AACTTTGAC-AA-A--T-TTATAT--CATAATACTTAACACATAAGA--CGTGCAAATATGTGTTC--------------TATATTCATTTGATC------------------AAACATATG------CAACAAGGTCAGACAAAGGA-------ACATAATACATCAAAAACT-AGATTCCATTAATACGTTCATATATCCAAGTAGTTGGTCTTATCACTGGCTGTAATAAGAtacttaggtatacaattataaagttatctagatttgttgtgaatttaaaatgactgataaatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACAA-GTTTGGCAAA-------TTTAATTCCA---TTATTTTCAGTAGGTCCGAG----ACCCATAAGGAATA-GT---CACAT--AT------ATGTGAATACACATATGGCGAC-AA---C--AT--TTAATAAAC------ATCA--TATAACATAATTATATACAATACCATAAAGCAC-TTAAT-------
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCGCTTATGTAAA----ATAAGTAAGTTG--TTTAACAAGTTTTG-----AC----AAG-----TTTAT------T----TC------------CATT---A-T-TTCCAACAAAA-TACTGGTTCTAAG-GT-CAAAAGCT-TTACGT---ATAAACATTCC-TAGATTTTTTAgcattatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACAA-ATTT-----A-------TTT----CCA---TTATTTCCAGAAGGTCTGAGACCCACCCATGAGGAATA-GT---CACATAAAT------ATATGATTCCAACTATGGCGAC-AA---A--AT--CTAATACAC------ATCA--TATAACACAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atttGACAA-GTTT-----A-------TTT----CAA---TTATTTCCAGAAGGTCTTAG----ACCCATGAGGAATA-AT---CACGT--ATAATTACACATGATTACAAATATGGCGACAAA---
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              caagtttATGATA-A--AACTATCAC-AA-A--T-T-TTATGATATAAGAATTAACTTTCATAT--TGTGCAG-TATAAGTTCATAG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agTATA-AAGATAATA-A--AACTATGAC-AA-AATT-T-ATAT--TATTAGACTCAACATACAAGT--CATGCAA-TATAAGCTTGTAGGTccaataa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACAA-GCTTG----AGA-----TGT----------TTATTTCCAGAAGGTCTGAG----ACACATTAGGAATA-GT---CACAT--AT------ATATGGTAACAAATATGGCGGCAAA---ATCATTTCTAATAAAC------CT-G--TATATCAGAATTATATACAATATCATAAAGACC-TTAAT-------TC-TATGAT-ATTATAAAA-AGA-TATGCAGATTGGA-----GTTTTAGGCTTTGTTCAAC---------TTTAGATATATAT-TAT-----T-----TCATA-ACAGTAATA-G--AATTATGGC-AA-A------ATAT--TATACGACTTAACATACAGAT--CGTGCAA-TATGTGTTTGTAGGTAAAAAATTTAAATCCATTTGATC-----TTGCCATAGATCGAAACATATA------TAACAGTATCAAACAA-GGA-------ACATA-TACACCAAAATCT-AGATTTCATTAACAAGTTCTTATATTCATGTAGTTGATTGTTTCCCTGGCTGTAATTAGACAAACAATAAGAAACATGTTACATTCTAAG----CATAATATATTTGCTTGGTTAAATTTAACAATCAAGTGGCATTT-----GTTTTATGATTGCATCAA-GATTTCTTT-TGGATCATTGTATCATCTGCAGAGTAAGTTTAAAATACT---ATAAACTCACAAGTTCTGAGTGTGCACCCTTTATTAAGTGTAATAAATATTCCTTGTATTTTTTA--------CTTGCAGTGTAAACCCCATCTATCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTT----A-------TTT----CCA---TAATTTTCAGAAGGTCTGAG----ACCCATGAGGAATA-GA---CACAC--AT------ACA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --TATGGCATAATTATATATGATACAATAAAGCAT-GTAAT-------TC-TATGAT-AT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GATATCATAAAGCAA-TTAAT-------TT-TATTAT-GTTATAAAC-ACA-TATGCAGATTGAA-----ATTTCGGGCTTTGTTCGGC---------TATAACTATACATGTAT-----T-----ATATGTATATGAAGA-T--AACTACAAC-AA-GAGT-T-AAAC--TATAATACTTAG----------------AA-TATGACTTTGTAGGTAAAA--TCCATATCAGTTTGATA-----T-AT-ACA--TCGAAATTTATATTTCATTAACAAGTTCAagta
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaatt-------ATATA-TACATCGAAATTT-ATATTTCATTAACAAGTTCATATATCCATATAGTTGATCTTGTCTATAAATGTAATAAGACCAACTTTACGAAACATGTTCTATTTTAAACAGTCATACTATATTTGCTTGCTTAAATTTTACAAAAAAGTTGCATTT-----GTTTTA-----GC----A-G-----TTTATAAATTAT----TCAT---TAG-GCACATT---AAT-GT---ACAAAC-CACTGGTTCTAAG-GT-CAGGAGTT-TTAAGT---ATAAACATTTC-TATATGTTTTAATCGACATTTTGCATTGT----CTCATTTGTCTtatatccatatagttgatcttgtctataaatgtaataagaccaactttacgaaacatgttctattttaaacagtcatactatatttgcttgcttaaattttacaaaaaagttgcatttgttttagcagtttataaattattcattaggcacattaatgtacaaaccactggttctaaggtcaggagttttaagtataaacatttctatatgttttaatcgacattttgcattgtctcatttgtct
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                    aaattgatatcataaagcaattaattttattatgttataaacacatatgcagattgaaatttcgggctttgttcggctataactatacatgtattatatgtatatgaagataactacaacaagagttaaactataatacttagaatatgactttgtaggtaaaatccatatcagtttgACAA-GTTT-----A-------TTT----CCA---TTGTTTCTAGAGGTTCTTGG----AGCTATGAGGAATA-GT---CTAAT--AA------AAATGATTACAAATGTGAAGACAAA---A---T--CTAATTAAC------ATCA--TACAACATAATTATATACGATATAATAAAGCAT-TTAA---------CATATTAT-TTTATAAAC-A-AATATGCATATTTGA-----GTTTCAGGATTTGTTCAACGATAACTCCCATAAATATATATATATACAAAT-----TTATA-AAGATGTGACA--AACTGTGAA-AA-A--AAT-AAAT--TATTAGA-TTAACATAGAT-TAACTTAAAA-TAC-ACATCG--GGCAATA--TCTATAGTCTTTTGATCATGCCC-G--ATA--TCGAAACGTATA------TACAAAGATCAAACAATGGA-------ACATA-TATATTAAAATTTAAGATTTCATTAATAACTTCATATATCCACGTATTT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ----A-------TTT----TCA---GTATTTCCAGAAGGTTTGAG----ACCCATGAGAAATA-GT---TACAT--AT------ATATGATTACAAATAAATCGAC-AC---A--AT--CTAATAATC------ATCA--TATAACATAATTATATACGATATCATAAAACAT-TGAAT-------TA-TATGAT-ATCATAAA--A-A-TATGCAGATTGGA-----GTTTCAGGATTTGTT-------------TA--------------------T-----TTATA-ATAAAAAAA-A--ATCCATGAC-AA-AT-T-T-GTAT--CATAAGACTTATTATACAg
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-30 )       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACAA-GTTTG----A-------TTT----CCA---TTATTTCCAGAAGGTCTGAG----ACCCATGAGGAATA-GT---CACAT--AT------ATATGATTACAAATATGGCGACAAA---A--AT--CTAATAAAC------ATCA--TATAACATAATTATATACGATATCATAAAGCAC-TTAAT-------TC-TATGAT-ATTATAAAC-A-A-TATGCAGATTGGA-----GTTTCAGGCTTTGTTCGAC---------TATAGATATATAT-TAT-----T-----TTATA-ANAATAATA-A--AACTATGAC-AA-A--T-T-ATAT--TATAAGACTTAACATACANGT--CGTGCAA-TATGAGTTCGTAGGTAAAA--TCTATATCCATTTGATC-----T-G--ATA--TCGAAACGTATA------TAACAAGATCAAACAATGGA-------ACATA-TACATCGAAATCT-AGATTTCATTAATAAGTTCATATATCCACGTAGTTGATCTTNTCNCTGGCTGTAATAAGACNAACNNTANGAAACATGTTNCATTCTAAGCAGTCATANTATATTCGCTTGNTTAAATTT-ACAANNAAGTTGCATTT-----GTTTTA-----GC----A-G-----TTTATGGATCAT----TCAT---CAG-GCACGTT---AAT-NT---ACAAAC-CACTGGTTCTAAG-GT-CANNAGTT-TTAAGT---ATAAACATTCC-TATATTTTTTAATCGACATCTTGCANTGTAAACCCCATCTGTCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAAAA-GTTT-----A-------TTT----CCA---TTCTTTGTAGAAGATTTGAA----ATCTATACAGAATATGCATACATAT--AT------ATATGAATACAAATATGACAACATA-------T--CTCATAAAC------TTAA--TATTACAAAATTAAATACAATATCATAAAGCAC-TTAAT-------T----TGCTGATTAT-GAT-A-A-TATGCAGACTGCATTTTTTTTTCAGGCTTTGTTTGAA---------TACAAATAACTAT-TTT-----T-----CTATA-AAGATAATACATCAACTGC-AT-AC-T--T-T-ATAT--TATAAGAGATAGCATACA
gi|10                         : tttgttataacaaaatttataccacatttagatgcagaacttttaccactacgtttgtatataaaataaaggttatgttcaaaacaataatgagtgtacatcatacattgacacagcctcaattctcaatggttcacaatttttttttaatgccattttcaacacatttcaggttatatatggcatatccagttttactggtggagaaagacctcagactgaatcagactgagtagaaccactgtcctaccgcaagtaacatgaaactttctcacattaggtttttggagcgaacaggactcgaacctatggtgagaggcaagtgatcttgagacggcgctttagaccactcggcaatggacgacccgcacctcagaacaagtttttgGGCAA-GTTT-----A-------TTT----CCA---TTATTTCCAGAAGGACAGAG----GCCCATGA---------------------------------TTACAAATACGGCGATAAA---A---T--CTAACAAAC------ATCA--TATAACATAATTATATACGATATTATAAAACAC-TTAATA------TC-Tgaaggaaaattatattttcataagtaact
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aagttt-A--AACTTTGAC-AA-A--T-TTATAT--CATAATACTTAACACATAAGA--CGTGCAAATATGTGTTC--------------TATATTCATTTGATC------------------AAACATATG------CAACAAGGTCAGACAAAGGA-------ACATAATACATCAAAAACT-AGATTCCATTAATACGTTCATATATCCAAGTAGTTGGTCTTATCACTGGCTGTAATAAGAtacttaggtatacaattataaagttatctagatttgttgtgaatttaaaatgactgataaatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACAA-GTTTGGCAAA-------TTTAATTCCA---TTATTTTCAGTAGGTCCGAG----ACCCATAAGGAATA-GT---CACAT--AT------ATGTGAATACACATATGGCGAC-AA---C--AT--TTAATAAAC------ATCA--TATAACATAATTATATACAATACCATAAAGCAC-TTAAT-------
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCGCTTATGTAAA----ATAAGTAAGTTG--TTTAACAAGTTTTG-----AC----AAG-----TTTAT------T----TC------------CATT---A-T-TTCCAACAAAA-TACTGGTTCTAAG-GT-CAAAAGCT-TTACGT---ATAAACATTCC-TAGATTTTTTAgcattatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACAA-ATTT-----A-------TTT----CCA---TTATTTCCAGAAGGTCTGAGACCCACCCATGAGGAATA-GT---CACATAAAT------ATATGATTCCAACTATGGCGAC-AA---A--AT--CTAATACAC------ATCA--TATAACACAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atttGACAA-GTTT-----A-------TTT----CAA---TTATTTCCAGAAGGTCTTAG----ACCCATGAGGAATA-AT---CACGT--ATAATTACACATGATTACAAATATGGCGACAAA---
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              caagtttATGATA-A--AACTATCAC-AA-A--T-T-TTATGATATAAGAATTAACTTTCATAT--TGTGCAG-TATAAGTTCATAG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agTATA-AAGATAATA-A--AACTATGAC-AA-AATT-T-ATAT--TATTAGACTCAACATACAAGT--CATGCAA-TATAAGCTTGTAGGTccaataa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACAA-GCTTG----AGA-----TGT----------TTATTTCCAGAAGGTCTGAG----ACACATTAGGAATA-GT---CACAT--AT------ATATGGTAACAAATATGGCGGCAAA---ATCATTTCTAATAAAC------CT-G--TATATCAGAATTATATACAATATCATAAAGACC-TTAAT-------TC-TATGAT-ATTATAAAA-AGA-TATGCAGATTGGA-----GTTTTAGGCTTTGTTCAAC---------TTTAGATATATAT-TAT-----T-----TCATA-ACAGTAATA-G--AATTATGGC-AA-A------ATAT--TATACGACTTAACATACAGAT--CGTGCAA-TATGTGTTTGTAGGTAAAAAATTTAAATCCATTTGATC-----TTGCCATAGATCGAAACATATA------TAACAGTATCAAACAA-GGA-------ACATA-TACACCAAAATCT-AGATTTCATTAACAAGTTCTTATATTCATGTAGTTGATTGTTTCCCTGGCTGTAATTAGACAAACAATAAGAAACATGTTACATTCTAAG----CATAATATATTTGCTTGGTTAAATTTAACAATCAAGTGGCATTT-----GTTTTATGATTGCATCAA-GATTTCTTT-TGGATCATTGTATCATCTGCAGAGTAAGTTTAAAATACT---ATAAACTCACAAGTTCTGAGTGTGCACCCTTTATTAAGTGTAATAAATATTCCTTGTATTTTTTA--------CTTGCAGTGTAAACCCCATCTATCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTT----A-------TTT----CCA---TAATTTTCAGAAGGTCTGAG----ACCCATGAGGAATA-GA---CACAC--AT------ACA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --TATGGCATAATTATATATGATACAATAAAGCAT-GTAAT-------TC-TATGAT-AT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GATATCATAAAGCAA-TTAAT-------TT-TATTAT-GTTATAAAC-ACA-TATGCAGATTGAA-----ATTTCGGGCTTTGTTCGGC---------TATAACTATACATGTAT-----T-----ATATGTATATGAAGA-T--AACTACAAC-AA-GAGT-T-AAAC--TATAATACTTAG----------------AA-TATGACTTTGTAGGTAAAA--TCCATATCAGTTTGATA-----T-AT-ACA--TCGAAATTTATATTTCATTAACAAGTTCAagta
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaatt-------ATATA-TACATCGAAATTT-ATATTTCATTAACAAGTTCATATATCCATATAGTTGATCTTGTCTATAAATGTAATAAGACCAACTTTACGAAACATGTTCTATTTTAAACAGTCATACTATATTTGCTTGCTTAAATTTTACAAAAAAGTTGCATTT-----GTTTTA-----GC----A-G-----TTTATAAATTAT----TCAT---TAG-GCACATT---AAT-GT---ACAAAC-CACTGGTTCTAAG-GT-CAGGAGTT-TTAAGT---ATAAACATTTC-TATATGTTTTAATCGACATTTTGCATTGT----CTCATTTGTCTtatatccatatagttgatcttgtctataaatgtaataagaccaactttacgaaacatgttctattttaaacagtcatactatatttgcttgcttaaattttacaaaaaagttgcatttgttttagcagtttataaattattcattaggcacattaatgtacaaaccactggttctaaggtcaggagttttaagtataaacatttctatatgttttaatcgacattttgcattgtctcatttgtct
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                    aaattgatatcataaagcaattaattttattatgttataaacacatatgcagattgaaatttcgggctttgttcggctataactatacatgtattatatgtatatgaagataactacaacaagagttaaactataatacttagaatatgactttgtaggtaaaatccatatcagtttgACAA-GTTT-----A-------TTT----CCA---TTGTTTCTAGAGGTTCTTGG----AGCTATGAGGAATA-GT---CTAAT--AA------AAATGATTACAAATGTGAAGACAAA---A---T--CTAATTAAC------ATCA--TACAACATAATTATATACGATATAATAAAGCAT-TTAA---------CATATTAT-TTTATAAAC-A-AATATGCATATTTGA-----GTTTCAGGATTTGTTCAACGATAACTCCCATAAATATATATATATACAAAT-----TTATA-AAGATGTGACA--AACTGTGAA-AA-A--AAT-AAAT--TATTAGA-TTAACATAGAT-TAACTTAAAA-TAC-ACATCG--GGCAATA--TCTATAGTCTTTTGATCATGCCC-G--ATA--TCGAAACGTATA------TACAAAGATCAAACAATGGA-------ACATA-TATATTAAAATTTAAGATTTCATTAATAACTTCATATATCCACGTATTT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aagttttGACAA-GTTTG------------TTT----CCA---TTATTTTCAGAAGGTCTGAA----TCCCATAAATAATG-GA---CACAT--AT------ATATGAATACACATGTGGCGACAAATTCAT-AC--CTAATAAACTTCGTAATCAATTATAGCATAATTATATACAATATCATAAAGCAC-TTAAT-------TC-TATGAT-ATTATAAACAA-A-TATACAAATTTTA-----GTTTCA------GTTCGAC---------AATAGATATATTT-TAT-----T-----TTATA-AG-ATAATA-A--ACATATCACAAA-A--TGT-ATAT--CATAAGAATTAACATGCATGT--CGTGCAT-TATGAGTTCGTAGATAAAG--TCTATATCAATTTGATCTTGGTT-G--ATA--TCGAAATGTACA------CAGCAAGATTAAACAATGGAAAATATCATATA-TACATCGATATGT-AGATTTCATTAATAAtttc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tatgtttGACAATGTT------A-------TTT----CCA---TTATTTCCAG---GTCTGAG----ACCCATGAGAAATA-GC---CACAT--AT------ATATGATTAAAAATTTGACAACAAA---A--A---CTTATATAC------GTCA--TATAACATATCTATATGCAATATCATTAAGTAC-TTAATGTATTACTC-CAT-AT-ATTAT---------CATGCATATTGGA-----GTTTCAGGCATTGTTCGAC---------TA---ATGTATTA-TAT-----TCCAAATTATA-AAAATAATA-A--AACTATGAC-AATA--TAT-ATAT--TATTAGACTGAACAGACAAAT--CTTGCAA-TGTGAGTTTATTGGTAAAA--TCTATATTCACTTGAT----------------------CATATA------TAACAAGATCAAACAATGGA-------TCTTA-AATATCCAAATCT-ATATTTCATTTATAAGTc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acaaatatCAA-GTTTG----A---------------CAAGTTTATTTCCAGAAGGTCCGAG----ACCCATGATGAATA-GT---CATAT--AT------ATATGATTGCAAATATGACGA-AAA---C--TT--CT--TAAAC------TTCA--TATAATAT-ATTGTATATGACATCACAAAGCACATTAAT-------TC-TATGAT-ATTATAAAC---A-CATGCAGATTGGA-----GTTTCAGGCTCTGTTCTAT---------TATAGATATATAT-TAT-----T-----CTAT--ATAATTCTGCA--AAC--------A-A--T-T-CT-T--TGTAAGAATTAA-ATACATGT--CGTGTAA-TATGAAT--GTAGGT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ----A-------TTT----TCA---GTATTTCCAGAAGGTTTGAG----ACCCATGAGAAATA-GT---TACAT--AT------ATATGATTACAAATAAATCGAC-AC---A--AT--CTAATAATC------ATCA--TATAACATAATTATATACGATATCATAAAACAT-TGAAT-------TA-TATGAT-ATCATAAA--A-A-TATGCAGATTGGA-----GTTTCAGGATTTGTT-------------TA--------------------T-----TTATA-ATAAAAAAA-A--ATCCATGAC-AA-AT-T-T-GTAT--CATAAGACTTATTATACAg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              taacaatGACAA-GTTTG----ACATGTATTTT----TCA---TTATTTCCAGAAGGTCTGAG----ATCCATGAAGAATA-GT---CAAAT--AT------ATATGATTACAAATATGGCGAC-AG---A--AT--CTAATTAAC------ACCT--TATAACACAATTATATACGATATCATAAATAAT-TTGA--------TA-TATAAT-ATT-TAAAC-A-A-TATGCAGATTGGT-----GTTTCAGGCTTTGTCCGAC---------TATATACACATATGTAT-----


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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-30 )       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACAA-GTTTG----A-------TTT----CCA---TTATTTCCAGAAGGTCTGAG----ACCCATGAGGAATA-GT---CACAT--AT------ATATGATTACAAATATGGCGACAAA---A--AT--CTAATAAAC------ATCA--TATAACATAATTATATACGATATCATAAAGCAC-TTAAT-------TC-TATGAT-ATTATAAAC-A-A-TATGCAGATTGGA-----GTTTCAGGCTTTGTTCGA---------CTATAGATATATAT-TAT-----T-----TTATA-ANAATAATA-A--AACTATG-ACAA-A--T-T-ATAT--TATAAGACTTAACATACANGT--CGTGCAA-TATGAGTTCGTAGGTAAAA--TCTATATCCATTTGATCT-TGCCCGATATCGAAACGTATA------TAACAAGATCAAACAATGGA-------ACATA-TACATCGAAATCT-AGATTTCATTAATAAGTTCATATATCCACGTAGTTGATCTTNTCNCTGGCTGTAATAAGACNAACNNTANGAAACATGTTNCATTCTAAGCAGTCATANTATATTCGCTTGNTTAAATTT-ACAANNAAGTTGCATTT-----GTTTTA-----GC----A-G-----TTTATGGATCAT----TCAT---CAG-GCACGTT---AAT-NT---ACAAAC-CACTGGTTCTAAG-GT-CANNAGTT-TTAAGT---ATAAACATTCC-TATATTTTTTAATCGACATCTTGCANTGTAAACCCCATCTGTCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAAAA-GTTT-----A-------TTT----CCA---TTCTTTGTAGAAGATTTGAA----ATCTATACAGAATATGCATACATAT--AT------ATATGAATACAAATATGACAACATA-------T--CTCATAAAC------TTAA--TATTACAAAATTAAATACAATATCATAAAGCAC-TTAAT-------T----TGCTGATTAT-GAT-A-A-TATGCAGACTGCATTTTTTTTTCAGGCTTTGTTTGA---------ATACAAATAACTAT-TTT-----T-----CTATA-AAGATAATACATCAACTGC--ATAC-T--T-T-ATAT--TATAAGAGATAGCATACA
gi|10                         : tttgttataacaaaatttataccacatttagatgcagaacttttaccactacgtttgtatataaaataaaggttatgttcaaaacaataatgagtgtacatcatacattgacacagcctcaattctcaatggttcacaatttttttttaatgccattttcaacacatttcaggttatatatggcatatccagttttactggtggagaaagacctcagactgaatcagactgagtagaaccactgtcctaccgcaagtaacatgaaactttctcacattaggtttttggagcgaacaggactcgaacctatggtgagaggcaagtgatcttgagacggcgctttagaccactcggcaatggacgacccgcacctcagaacaagtttttgGGCAA-GTTT-----A-------TTT----CCA---TTATTTCCAGAAGGACAGAG----GCCCATGA---------------------------------TTACAAATACGGCGATAAA---A---T--CTAACAAAC------ATCA--TATAACATAATTATATACGATATTATAAAACAC-TTAATA------TC-Tgaaggaaaattatattttcataagtaact
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aagttt-A--AACTTTG-ACAA-A--T-TTATAT--CATAATACTTAACACATAAGA--CGTGCAAATATGTGTTC--------------TATATTCATTTGATC--------------AAACATATG------CAACAAGGTCAGACAAAGGA-------ACATAATACATCAAAAACT-AGATTCCATTAATACGTTCATATATCCAAGTAGTTGGTCTTATCACTGGCTGTAATAAGAtacttaggtatacaattataaagttatctagatttgttgtgaatttaaaatgactgataaatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACAA-GTTTGGCAAA-------TTTAATTCCA---TTATTTTCAGTAGGTCCGAG----ACCCATAAGGAATA-GT---CACAT--AT------ATGTGAATACACATATGGCGAC-AA---C--AT--TTAATAAAC------ATCA--TATAACATAATTATATACAATACCATAAAGCAC-TTAAT-------
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCGCTTATGTAAA----ATAAGTAAGTTG--TTTAACAAGTTTTG-----AC----AAG-----TTTAT------T----TC------------CATT---A-T-TTCCAACAAAA-TACTGGTTCTAAG-GT-CAAAAGCT-TTACGT---ATAAACATTCC-TAGATTTTTTAgcattatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACAA-ATTT-----A-------TTT----CCA---TTATTTCCAGAAGGTCTGAGACCCACCCATGAGGAATA-GT---CACATAAAT------ATATGATTCCAACTATGGCGAC-AA---A--AT--CTAATACAC------ATCA--TATAACACAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atttGACAA-GTTT-----A-------TTT----CAA---TTATTTCCAGAAGGTCTTAG----ACCCATGAGGAATA-AT---CACGT--ATAATTACACATGATTACAAATATGGCGACAAA---
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              caagtttATGATA-A--AACTATC-ACAA-A--T-T-TTATGATATAAGAATTAACTTTCATAT--TGTGCAG-TATAAGTTCATAG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agTATA-AAGATAATA-A--AACTATG-ACAA-AATT-T-ATAT--TATTAGACTCAACATACAAGT--CATGCAA-TATAAGCTTGTAGGTccaataa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACAA-GCTTG----AGA-----TGT----------TTATTTCCAGAAGGTCTGAG----ACACATTAGGAATA-GT---CACAT--AT------ATATGGTAACAAATATGGCGGCAAA---ATCATTTCTAATAAAC------CT-G--TATATCAGAATTATATACAATATCATAAAGACC-TTAAT-------TC-TATGAT-ATTATAAAA-AGA-TATGCAGATTGGA-----GTTTTAGGCTTTGTTCAA---------CTTTAGATATATAT-TAT-----T-----TCATA-ACAGTAATA-G--AATTATG-GCAA-A------ATAT--TATACGACTTAACATACAGAT--CGTGCAA-TATGTGTTTGTAGGTAAAAAATTTAAATCCATTTGATCT-TGCCATAGATCGAAACATATA------TAACAGTATCAAACAA-GGA-------ACATA-TACACCAAAATCT-AGATTTCATTAACAAGTTCTTATATTCATGTAGTTGATTGTTTCCCTGGCTGTAATTAGACAAACAATAAGAAACATGTTACATTCTAAG----CATAATATATTTGCTTGGTTAAATTTAACAATCAAGTGGCATTT-----GTTTTATGATTGCATCAA-GATTTCTTT-TGGATCATTGTATCATCTGCAGAGTAAGTTTAAAATACT---ATAAACTCACAAGTTCTGAGTGTGCACCCTTTATTAAGTGTAATAAATATTCCTTGTATTTTTTA--------CTTGCAGTGTAAACCCCATCTATCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTT----A-------TTT----CCA---TAATTTTCAGAAGGTCTGAG----ACCCATGAGGAATA-GA---CACAC--AT------ACA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --TATGGCATAATTATATATGATACAATAAAGCAT-GTAAT-------TC-TATGAT-AT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GATATCATAAAGCAA-TTAAT-------TT-TATTAT-GTTATAAAC-ACA-TATGCAGATTGAA-----ATTTCGGGCTTTGTTCGG---------CTATAACTATACATGTAT-----T-----ATATGTATATGAAGA-T--AACTACA-ACAA-GAGT-T-AAAC--TATAATACTTAG----------------AA-TATGACTTTGTAGGTAAAA--TCCATATCAGTTTGATATATAC-----ATCGAAATTTATATTTCATTAACAAGTTCAagta
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaatt-------ATATA-TACATCGAAATTT-ATATTTCATTAACAAGTTCATATATCCATATAGTTGATCTTGTCTATAAATGTAATAAGACCAACTTTACGAAACATGTTCTATTTTAAACAGTCATACTATATTTGCTTGCTTAAATTTTACAAAAAAGTTGCATTT-----GTTTTA-----GC----A-G-----TTTATAAATTAT----TCAT---TAG-GCACATT---AAT-GT---ACAAAC-CACTGGTTCTAAG-GT-CAGGAGTT-TTAAGT---ATAAACATTTC-TATATGTTTTAATCGACATTTTGCATTGT----CTCATTTGTCTtatatccatatagttgatcttgtctataaatgtaataagaccaactttacgaaacatgttctattttaaacagtcatactatatttgcttgcttaaattttacaaaaaagttgcatttgttttagcagtttataaattattcattaggcacattaatgtacaaaccactggttctaaggtcaggagttttaagtataaacatttctatatgttttaatcgacattttgcattgtctcatttgtct
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                    aaattgatatcataaagcaattaattttattatgttataaacacatatgcagattgaaatttcgggctttgttcggctataactatacatgtattatatgtatatgaagataactacaacaagagttaaactataatacttagaatatgactttgtaggtaaaatccatatcagtttgACAA-GTTT-----A-------TTT----CCA---TTGTTTCTAGAGGTTCTTGG----AGCTATGAGGAATA-GT---CTAAT--AA------AAATGATTACAAATGTGAAGACAAA---A---T--CTAATTAAC------ATCA--TACAACATAATTATATACGATATAATAAAGCAT-TTAA---------CATATTAT-TTTATAAACAA-A-TATGCATATTTGA-----GTTTCAGGATTTGTTCAACGATAACTCCCATAAATATATATATATACAAAT-----TTATA-AAGATGTGACA--AACTGTGAAAAA-A--A-T-AAAT--TATTAGA-TTAACATAGAT-TAACTTAAAA-TAC-ACATCG--GGCAATA--TCTATAGTCTTTTGATCA-TGCCCGATATCGAAACGTATA------TACAAAGATCAAACAATGGA-------ACATA-TATATTAAAATTTAAGATTTCATTAATAACTTCATATATCCACGTATTT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aagttttGACAA-GTTTG------------TTT----CCA---TTATTTTCAGAAGGTCTGAA----TCCCATAAATAATG-GA---CACAT--AT------ATATGAATACACATGTGGCGACAAATTCAT-AC--CTAATAAACTTCGTAATCAATTATAGCATAATTATATACAATATCATAAAGCAC-TTAAT-------TC-TATGAT-ATTATAAAC-A-AATATACAAATTTTA-----GTTTCAG------TTCGA---------CAATAGATATATTT-TAT-----T-----TTATA-AGA-TAATA-A--ACATATC-ACAA-AA-TGT-ATAT--CATAAGAATTAACATGCATGT--CGTGCAT-TATGAGTTCGTAGATAAAG--TCTATATCAATTTGATCT-TGGTTGATATCGAAATGTACA------CAGCAAGATTAAACAATGGAAAATATCATATA-TACATCGATATGT-AGATTTCATTAATAAtttc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tatgtttGACAATGTT------A-------TTT----CCA---TTATTTCCAG---GTCTGAG----ACCCATGAGAAATA-GC---CACAT--AT------ATATGATTAAAAATTTGACAACAAA---A--A---CTTATATAC------GTCA--TATAACATATCTATATGCAATATCATTAAGTAC-TTAATGTATTACTC-CAT-AT-ATTAT---------CATGCATATTGGA-----GTTTCAGGCATTGTTCGA---------CTA---ATGTATTA-TAT-----TCCAAATTATA-AAAATAATA-A--AACTATG-ACAATA--TAT-ATAT--TATTAGACTGAACAGACAAAT--CTTGCAA-TGTGAGTTTATTGGTAAAA--TCTATATTCACTTGAT------------------CATATA------TAACAAGATCAAACAATGGA-------TCTTA-AATATCCAAATCT-ATATTTCATTTATAAGTc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acaaatatCAA-GTTTG----A---------------CAAGTTTATTTCCAGAAGGTCCGAG----ACCCATGATGAATA-GT---CATAT--AT------ATATGATTGCAAATATGACGA-AAA---C--TT--CT--TAAAC------TTCA--TATAATAT-ATTGTATATGACATCACAAAGCACATTAAT-------TC-TATGAT-ATTATAAAC---A-CATGCAGATTGGA-----GTTTCAGGCTCTGTTCTA---------TTATAGATATATAT-TAT-----T-----CTAT--ATAATTCTGCA--AAC--------A-A--T-T-CT-T--TGTAAGAATTAA-ATACATGT--CGTGTAA-TATGAAT--GTAGGT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ----A-------TTT----TCA---GTATTTCCAGAAGGTTTGAG----ACCCATGAGAAATA-GT---TACAT--AT------ATATGATTACAAATAAATCGAC-AC---A--AT--CTAATAATC------ATCA--TATAACATAATTATATACGATATCATAAAACAT-TGAAT-------TA-TATGAT-ATCATAAA--A-A-TATGCAGATTGGA-----GTTTCAGGATTTGTT-------------TA--------------------T-----TTATA-ATAAAAAAA-A--ATCCATG-ACAA-AT-T-T-GTAT--CATAAGACTTATTATACAg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              taacaatGACAA-GTTTG----ACATGTATTTT----TCA---TTATTTCCAGAAGGTCTGAG----ATCCATGAAGAATA-GT---CAAAT--AT------ATATGATTACAAATATGGCGAC-AG---A--AT--CTAATTAAC------ACCT--TATAACACAATTATATACGATATCATAAATAAT-TTGA--------TA-TATAAT-ATT-TAAAC-A-A-TATGCAGATTGGT-----GTTTCAGGCTTTGTCCGA---------CTATATACACATATGTAT-----
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TTGGGGAGAGAGGGTGCCAGCTAATTTAGAAATTTAAGTAGAGGACATTTCATACTCAATTAACTATCAAAGTTTCTCAAATATGATGGACTCTAACCCAAGGTCAAATATGAAGTAAGTGATCTTGAGACAGCAACTTAGACCACTAAACT
Unaligned ( gi|14 ): GAGGTACATAATATTCACAATGCACTCATCATAGATTTAGAATTTGTTTTATGGAGTTTCAACCCATTACAAGTTACACATGGCGTCCACTTTTACTGTTGGAGGAAAATCACAATATGAAGCTGA