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consensus : TAAT---T---T---TTCA----CT---TA-A-ACT-C--T-ATTT--CT----GA--AA-AT----T----A-TG---AT---A--T----AT-----------CT--ACA----TG----A-T---GCA-A--A-T---AT----GA-A-AT-T-A----------A-A-A--T-A--CC-C------N-AG------T---N-T-------G-T------G----T-----G---CA-----G------A----C----C----C------TT--A------AT---TT--C--G--T--T--C--T--TTA-------------T-T-------G--G-A-AA--G--G-G----G-C-A-----T-A-AC---T-------C----TTGTAAATG-GTTGA-AAGG-C-AT---------C-----ATA--TTTC-G------C---N----TG--T--N--C--G-----C-G----G-T---C--A--T-----NT--N--T-----GA-C-A---A------A--AA-GTG-T-A---A------C---T------TT----C--AA-ATA--T----TT---T---T------TTCAT--C-N----G---T----T-T---T--TAT-----CGG----T--A----T-G-A-T--A-G-------A---A--A------A---T-----C----C---A-AGG------A-A------A-T--A------TC----NAT----T-------N----GTA--T-T--G--T------TT-----A--A----GA----A--T-G---TT-T-AC---T----N------ATA--TTTT--CAAA--NC----NAGCGTGAC---GCCA---C-----T----------A--------CA-A-ATA---TT-A-GAA---TG--A-TTTTCTT-----AAATACGTTA-TATATGAAAATT
Reference ( gi|15 ) : TAAT---T---T---TTCA----CT---TA-A-ACT-C--T-ATTT--CT----TA--AA-AT----T----A-TG---AT---A--T----AT-----------CT--ACA----CG----A-T---GCA-A--A-T---AT----GA-A-AG-T-A----------A-A-A--T-A--TT-C------G-AG------T---T-T-------G-T------G----T-----G---CA-----T------A----T----T----C------TT--A------AT---TT--C--G-AT--T--C--T--TTA---A---------T-T-------G--G-A-AA--G--G-G----G-C-T-----T-A-AC---T-------C----TGGTAAATG-GTTGA-AAGG-C-AT---------C-----ATA--GTTC-G------C---C----TG--T--A--C--G-----C-G----A-T---C--A--T-----GT--T--C-----GA-C-A---A------A--AG-GTG-T-A---A------C---T--G---TTG---C--AA-ATA-ATC-CCTT---T---T------TTCAT--C-C----G---T----T-T---C--TAT-----CAACT--T--A----T-G-A-T--A-G-------A---A--A------G---T-----T----C---A-AGA------A-A------A-T--A------TC----CAT----T-------A----GTA--C-T--G--T------TT-----A--A----GA----A--T-G---TT-T-AC---T----A------ATA--TTTT--GAAA--TC----AAGCGTGAC---GCGA---C-----T----------A--------CA-A-ATA---TT-A-GAA---TG--AGTTTTCTTCGGGCAA--ACGTTAGTATACAGAAATTCGATCTATT
gi|14 : TAAT---TAAAT---TTAA----CC---TA-A--TT-C--T-GTAT--CT----GA--AA-AC----T----A-T---------A--T----AT-----------TT--ATA----TG----T-C---GCA-A--A-T---AT----GA-A-AT-T-A----------G-A-A--T-A--CC-C------C-AT------A---T-A-------G-T------T----T-----G---CA-----GGA----A----T----T----T------TT--T------AT------------AT--T------------------------T-T-------G--G-A-AA--G--G-G----G-C-A-----T-T-AC---T-------C----TTGTAAATG-GTTAA-AAGG-C-AT---------T-----ATA----TT-A------C---T----TA--A--A--TG-G-----T-G----A-TAA-C--A--T-----GT--T---------A-C-A---G------A--A--ATG-T-T---A------T---T--T---TTG---T--AA-GT
gi|98 : aagtgacacatggcaattTAAA---T---T---TTCA----CT---TA-A--CA-C--T-ATTT--CT----GA--AA-AT----T----A-CA---AA---A--TTA--AT-----------CT--ACA----AG----A-T---GCA-A--G-T---CT----GG-A-AT-T-A----------G-A-A--T-A--TC-C------A-AG------T---T-----------------------T-----G---CA-----A------A----T----T----C------TT--A------AT---TT--T--G--T--T--C--TCATT--------------T-T-------G--G-A-AA--G--tttataatgagcctaacatcacttgttttataaaaaatgttaataatttctgaaatatgaaatttcatatagtaatacttagatattattatctgcatttggttgtatgttcataaatgtaaagattgatttgatgcccaaaacttgagaaaaataagatttccacattgccatttgtc
gi|56 : gacacaggcacttttcaTAAA---T---T---TTTA----CT---TT-C-ACC-C----ATTT--CT----TA--AC-AT----T----A-TT---AT---A--T----AT-----------AT---CAAAT-TG----A-G---GCA-A--AAT---AT----GA-A-AA-T-A----------T-A-T--T-A--CT-C------C-AG----------------------------------------------------------A----C----C----T------TT--A------AA---TT--T--G-TT--TTCC--T--TT--------------T-C-------A--G-A-AAA-G--G-G----G-C-A-----T-G------T-------T----TTGTAAATG-GTTGA-AAGG-C-AT---------A-----ATA--GGTC-G------C---A-----G--TC-A--CG-G-----C-A----A-T------A--T-----GC--T---------A-C-A---A------A--AA-GTt
gi|19 : ttttaaagggacaaatggcaattttgaTAATATAT---T---TTCA----TT---TA-A--CT-C--T-TTTTTTCT----GA--AA-AT----T----A-T---------A--T----AT-----------CT--GCA----TA----AAT---AGA-A--A-T---AT----GA-A-AT-T-T----------A-A-C--T----TT-C------ACAG------A---A-T-------G-T------G----T-----G---CA-----G------A----C----C----C------TT--ACTGGTAAT---CT--T--G-TT--T--C--TG-TT--------------T-T-------T--T-A-AA--G--G-T----T-C-A-----T-A-AC---C-------C----TGGTAAATATGATAA-ACTG-T-AT---------C-----GTA--TTCT-G------C---A----TATTT--A--C--A-----T-A----A-T---C--A----------------------A-C-A---A------A--AA-GTG-T-A-----------------------G---C--AG-ATA-TT----TTA--T---T------TTCAT--C-A----G---T----G-T---T--TAT-------GGT--T--A------G-A-T--A-GAGGAAAAA---A--A------A---T-----C----C---ATAGAAAAAT-A-A------A-T--A------CA----CAA----T-------A----TTA----T--GT-T------TT-----A--C----GA----A--C-T---TT-A-AC---G----C------ATA--CTTT--CAAA--AC---------TGAC---GCGT---C-----T----------T--------CA-a
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gi|30 : gcaagaTAAA---T---T---ATCA-----T---CA-A-ACTAT--T-ATTT--TT----GA--AA-AT----TGT--A-TT---AA---A--T----AT-----------CT--GAT----TG----A-T---GCA-A--A-T---AT----GA-G-AT-T-T----------T-G-A--T-A--CC-C------A-AA------T---A-T-------G-T------T----T-----A---AA-----A------A----A----C----C------TT--A------AT---TT--A--G-TT--T--CGAT--TTT---G---------T-C-------A--A-G-AA--G--A-A----G-----------A-AC---T-------C----TTGTAAGTG-ATTGA-AAGG----T---------C-----AT---GTAT-A------T---T----TG--T----------------G----G-T---T--A--T-----A------C-----AA-C-AC--A------A--AA-ATG-T-A---A------C--------------------A-ATT-AT---TTT---G---T------TTCAT--C-A----G---T----T-C---T--TAT-----TG--C--T--A----C-GAA-T--A-G-----------A--A------T---T-----C----C---A-AAG------A-A------A-T--A------TC------T----T------------GTA--T-T--T--T------TT-----A--A----GATCATA--T-G---TA-T-AT---T----
gi|43 : acagcatttttgaTGAT---T---TGTGTTTA----CT---TA-----T-CAAT-ATTT--CT-----A--AA-AT---------A-TGC--AT---A--T----AT-----------CT--ACA----TG----A-T---GCG-A--A-T---AT----GA-A------A----------A-A-A--T-AGCCC-C------G-AA------------T-------G-T------G----T-----G---AA-----G------A----C----A----C------TT--G------G----TT--CAAA-ATG-T--C--T--T---------------T-T-------G--G-A-AA-----A-A----G-T-T-----T-A-------------------TGGTACATG-GTAAT-AAAG-C-AT---------A-----AT----TT------------------TA--T-----C--G-----CAG----G-C---C--A--T-----TT--T--T-----GA-C-A---A------A--AA-ACG---A---G------C---T---------------AA-ATG-------TT---TAG-T------TTTAT--T-A----G---T----T-T---A--CAT-------ACG--T--A----C-G-A-T--G-G-------A---A--t
gi|66 : taaaggcacaggtggcatttttgaTAAA---T---T---TCCA----CT---TA-A-CAT-T--T-TTTT--CTGT--TA--AT-TC----T----A-TA---AT---A--T----CT-----------TT--ATC----TG----A-T---GTA-G--A-T---AT----TA-G-TT-T-A----------A-G-A--T-A--T--C------G-AA------T---TAT-------G-T------T----G-----G---TA-----G------A----T----C----T------TT--A------AT---TT--C--A-----------T--TTA---T---------T-T-------T--A-A-AA--G--A-G----G-A-A-----T-T-AC---C-------T----TGGTAAATACATTGA-AATG-A-GT---------C-----ATA--
gi|17 : taaagcgacctactgcaattttaaTAAG---T---T---TTCA----CT---TG-A--CA-T--T-ATTT--CT----GA--AT-AT----C------TG---A----A--T----ATTCTCA------CTCAGCA----TG----G-T---TCA-G--A-T---AT----AG-A-A--T-AG---------A-A-A--T-A--CA-C------C-TG------T---A-T-------G-T------A----T-----G---CA-----G------A----C----A---------------A------ATACATT--C--G-TT--T--C--T--TTG-------------T-T-------G--T-T-AA--T--G-GC---G-C-T-------A-AC---T-------C----TGTCAAATG-ATTGA-AAAG-C-AT---------C-----TT----TTT-GTA----T---C----CG--T--------G-----T-G----A-T---C--A--T-----TT--A--T-----GA-C-C---A------A--A---------------------------------------AA-ATA------TTT---TAA-T------TTTAT--G-T----G---T----T-T----------------ACTGGT--A----T-T-A-T--A-GAAA----A---A--A------A---T-----C----C---A-ATG------A-A------A-C--G------TC----AAT----T-------T----GTA--T-TAAA--T------TTTATA-A--A----AA----A--T-GGT-TT-C-AT---T----T------ATA--TTTTC-CAAA--TT-----AGCATG
gi|27 : atgattcaaacaaggaacaaacgaaacttctgaTAAT---T---T---TTCA----CT---TA-----C-C--T-GT--------------AA-AT----C------------T---G--T----TT-----------TT--ACA----AG----A-T---GCA-A--A-T---AT----GA-T-AG-T-A----------A-A-A--T-A--TC-A------C-AA------T--------------------------------------A-----T------A----T----------------TT--A------AT---TT--T--G--T--T--T--T--TGT---A---------T-T-------A--G-A-AA--G--G-G----G-C-A-----T-A-AT---T-------C----TTGCTAATG-GATAA------T-AT---------CT----ATA--ATT---------T---T----TG-----------G------------------C--A--T-----AT--T--C---------------------A--AG-GTA-A-A---A------T---T--A---ATGTATC--AA-AT--GTT-GGTT---T---C------TTCA----------A---T----T-T---T--TG-------------T--A----T-GTA-T----C-------A---A--A------G------------------A-AG-------A-A------A-T--A------TC----AAT----C-------AG---GTA--T-T-----T------TT--------A----CA----A--T-T---TT-T-AC---T----ccagcattagttttaa
gi|112 : ttaaagggacacttgacaatttttaTAATCAAT---T---TTCA----CT---TA-A-CCA-C----ATTT--CT----GA--AA-AC----T----A------ATT--A--TC---AT-----------CT--GCA----TG----A-T---GCA-A--A-T---AT----GA-A-A--T-A----------A-A-A--cctttcttcagaactaatttgacttcactagttttgataa
gi|99 : aaatacagcaatttTAAT---G---T---TTTA----CT---GA-ACACT-T--T--TGT--CT----GA--AATGT----T----A-TG----T---A-------AT------------T--GCA----TG----A-T---GCA-A--A-----AT----AC-A-AG-T-T----------A-G-A--C-A--AC-C------T-AA------T---A-T-------G-T------G----T-----G---CA-----G------A----C----T----C------TT--A------AC---TT--T--G-TT--T--C--T--TTctgttattatatttacagactcattact
gi|5 : taaagggaccctagacaattttaggAAT---T---G---TACA----CT---TG-A--CA-C--T-ATTT--CTGAACTG--AA-A----------G-TG---AT---G--T-----------------CT--TCA----TG----A-T---GTT-A--A-C---AT----GA-A-AT-T-A----------A-A-A--C-A--CA-C--------------------T-T-------G-T------A----T-----G---TA-----T------G----T----CAAACC------TT--A------AT---TT--C--TTAT--T--C--T----A---A---------T-T-------T--G-A-AAAAG--G-G----A-C-G-----T-A-AC---T-------C----TGGTGAATA-GTTGA-AAAG-C-AT---------C-----CTG--TTTC-A------C---A----CA--T--T--T--G-----T-G----A-T---C--A--T-----CT--A--C-----AA-C-A---A------A--AA-TTG-TGA---A------A---T--G---Ttc
gi|62 : ttgaAAT---T---T---GTAA----CTAAGTG-A-GCT----T-CTTT--TT----TAGAAA-AT----T------------T---A--T----AT-----------TT--ACA----TG----A-T---CCA-ATTA-T---ATTATTGG-A-A--T-A----------A-A----------T-C--------AG------T---A-T-------G-T------G----TTGAGAA---CA-----T------A----T----C----T------TT--C------AT---TT--A--T-AT--T--A--C--GTAC--A---------T----------------AA--G--G-G----G-C-A-----T-A-AC---T-------C----TTGTAAATG-TTTGA-AATG-C-AT---------C-----ATA--TTTC-A------C---T----TA--T--T--C--T-----T-C----G-T---C--A--T-----AT--G--T-----GA-C-A---A------A--Aattaattatcaaactacaattttgtcatagattgctgcaaaaaccagtttaaaatcaacatgataaaaaaaaaatccaaagcaataacaaatttgtgttttataatattttctttatacatattttatataatagtatgacaccaccaattctattaaaactgtcaatactttcataaatatggagtccaagatattaaatatctatttacatttccgtggttatatgtctataaatttaaaaattgatttaatgtgtgatca
gi|44 : AAT---T---T---TTAA-----T---TG-A-ACT-T--TTATTT--G------A--AA-GTAA--T----A-TA---AT---T--T----GTTT---------CT--CTA----TG----A-T---GCA-A--A-T---AT----GA-A-AA-T-G----------A-A-T--T-A--CC----------------------T-C-------A-T----------------------A-----T------A----T---------------------------GT---TT--C--C-AT--C------------------------T-T-------G--A-A-AA--G--C-G----A-C-A-----T-A-AC---T-------C----TGATAATTA-ATTAA-AATG-C-AT---------C-----TTA--TTTC-G------C---A----AT--T--T--C--------T-G----A-T---C--AGCT-----GT--T--T--------C-T---A------A--AA-GTG--------------C---T------TTG-------A-ATA------TTT---T---T------TTCAT--C-CAGCAG---T----T-T---T--TAT-----TGGTT--T-------T-G-A-C--T-G-------A---A--G-------------------------A-AAA------A-A------A-T--A------TC----AAT----T-------T----GTA--T-T--a
gi|72 : gcAAT---T---T---TCCATTGCCT---T-----CT-T--T-GTTC--CT----GA--AA-AT----T----A-T---------A--T----AT------------T--A-A----CG----A-A---ATG-A--A-----AT----GA-A-AT-TTG----------A-A-A--T-A--CC-A------C-AG------T---A-C-------G-T------G----T-----A---CA-----G------A----T----G----T------TT--A------AT---TG--T--G-TT--T--C--TA-TT--------------T-T-------G--G-A-AA--G--G-G----G-C-A-----T-T-AT---T-------A----TTGTAAATG-GACGA-AAGG-A-AT---------A-----TTA--TTTC-G------A---C----T
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gi|74 : tgtgttgctgggcaagtaatgcattaaaggtacacgcgacAAT---A---T---TCGA----TT---TA-A---T-A--T-ATTT--CT-----G--AA-AT----C----AATA---A----A--T----AT-----------CT--GCT----CG----A-T---GCA-A--A-TG--AT----GA-G-GT-T-A----------G-A-A--T----TC-CCCCAATA-AG------T---T-C-------G-T------A----------GACCCA-----T------AG---T----T----G------TT--A-------T---TT--------T--T--T--T--TTAT--ACTT------T-T-------G--G-A-AA--G--G-G----A-CAT-----T-A-CT---T-------C----T-GTAAACG-GTTGG-AAaaagattatatttgaacttcactagttttgacatgacagac
gi|49 : ttcatcAAA---T---T---TTCA----CT---TA-ACATT-------TTT--CT----GA--AA-AT----T----G-T---------A--T----AT-----------CA--ACA----TA----A-T---GCA-A--A-T---AT----GA-G-AT-T-A----------A-A-A--T-C--T-------------------T---T-T-------A-TA-----A----T-----G---CA-----G------A----C----C----C------CT--T------AT---TT--C--atatatt
gi|88 : aagtttttaaaggattaacactgcagttttcAAT---G---T---TCCG----TT------A-ACA-C--T-AGTT--AT-----A--AA-AT----T-------G---AT---T--T----AT-----------TT--ACA----TA----A-G---GCG-A--A-T---TT----AA-A-AT-T-A----------A-A-A--T-A------------A-AA------T---A-T-------G-C------A----A-----C---CA-----G------A----C----A----C------TT--G------AT---TT--T--G-CT--T--C--TGGT---------------T-T-------G--A-A-AA--G--G-G----G-C-G-----T-T-AC---T-------C----Tatgtacacctgataaggttatctgtatttttaccagggttagatattatgatctcatcctgggttcaagataaaattatcacattgtgacattgaccccatctatataggcata
gi|23 : tcgacactcgacaattgtgataAGT---T---T---TTC------C---TG-A-ACT-C--T-ATTT--C-----TA--GA-A-----T----G-T----AT---C--T----GT-----------CC--ATG----TG----A-T---GCA-A--A-T---A-----GA-ATAT-T-T----------A-A-A--T-A--CC-C--------------------C-T-------G-T------A----TAAA--A---CA-----G------A----C----C----C------TT--T------AT---TT--C--G-TT--T--C--TAGTT--------------T-T-------G--A-T-AA--G--G-A----------------A-AC---A-------T----TTATAAATG-GCCGA-GCGG-A-AT---------C-----CT-------------------C----TT--T--A--C--A-----C-T----T-T---T--G--T-----GG--T--C--------------A------A--TG-ATG-A-A---A------C---A--A---TCG---T--AA---A-ATA-TATT---TCGAT------TTTA----------G---T----T-T---T--TATTAGACCAAC-----------T-G-G-A--A-A-------A---C--A------A---T-----C----CT--A-ATA------A-A------A----A------------CAT----C-------A----AAA--A-T--G--T------T---------A----AA----A--TAG---TT-T-TT---C----G------ATA--TTTC---AAA--GC----TGGCGTGAC---ACCA---C-----tctaa
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gi|8 : acgatT---T---T---TATA----CT---TA----TTAC--T-ATTT--TT----GA--AA-AGCAAAT----A-TACAAAT---G--T----GC-----------CT--ACA----TT----A-T---GTA-A--A-T---AA----TA-A-AT-A-A----------A-A-A--T-A--CA-C------C-AG------A-------------G-T------A----T-----A---CA-----A------A----C----C----T------TT--A------AT---TC--T--G-TT--T--C--TA-TTT---G---------T-T-------T--A-A-AA--G--G-A----A-----------A-ACC--T-------C----TTATAGATA-GTTGA-AAGGCC-AT---------T------TG--TTTT-GTACTATT---T----TG--T--A--C--AATTT-T-G----A-T---C--A--T-----CT--A--T-----GA-C-A---A------A--AA-GAG-T-A------------------------------AA-ATG--------T---T---C------ATTAT--CTC----G---T----T-T---G--TAC-----CGA----T--A----C-G-G-T--A-GT------A---A--AATT---G---T-----C----T---A-AGT------A-A------C-T---------TT----CATTTTGT-------A----GTT--T-T--G--T------TT-----A--tttg
gi|29 : tgggg---T---T---TTCG----TA---TA-A---T-C--T-GTTG--TTG---TA--AA-------T----A-TGT--AT---A--T----AT-----------CT--ACA----CG----A-T---TCA-A--A-T---AT----GA-A-A--T-A----------A-G-A--T-A--AT-C----------------C---T-A-------G-T------A----T-----G---CAAG---C------A----T----C----C------TT---------AT---T-------------------------------------T-T-------G--T-A-AA--A--G-T----G-C-A-----C-G-CC---G-------C----TTGTAAATG-ATTGA-ACGA-C-AT---------A-----ACA---TT------------------TG--T-----C--A-----A-G----G-T---C--G--T-----AT--A--G-----GA-C-A---C------A-----------A---A------C---T--G---TCA---C--AA-ATC-AT----TTA--T---T------TTTAT--C-T----G---TTTTGT-T---C--TGT-----CAAA------G----T-G-A-T--A-GT------A---A--AT-----A---T-----T----C---G-ATA------ATA------A-T--A------Ttttcatatttacaaaactgacattggttatataaaagtctgataatactttcctaaacatgaagtgtcaaatataaatatttggagatttttcatatttgaatataatttatgtcaaaacgtttaaaaagataagtgtaaacat
gi|12 : ttacagtggcgcacggcaatgtttgttata---T---T---TTCG----C-----AGA-ATT-C--T-ATTT--CC----GA--AA-AC------------G---AT---A--T----AT-----------CC--ACA----TG----A-T---GCT-A--T-T---AT----GA-A-AT-TTG----------A-A-A--G-G--CC-C------A-AG------T---A-T-------G-T------T----T-----G---CA-----G------A----C----C----T------TT--A------AT---TG--T--G-----T--T--T--ATA---G---------T-T-------T--G-T-AAT-A--G-A----G-C-A-----T-C-AT---C-------C----TTGTAAACT-GATAA-ACAT-T-AT---------T-----ATA--TTTC-G------C---C----TG--TTAA--C--G--------------T---T--A--T-----AT--T--T-----GA--------------------GCG-G-C---A------T---T--A---TTG---T--AA-ATA-gtaattattcagttccacataataatacttgataat
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gi|84 : ggacgcactcaaaatttgataca---T---T---TTCT----CT---GA-A-A-T-C--C-ATTT--AA----GA--AA-AC----T------T-----C---A--T----AT-----------CA--ACA----CG----A-T---GCA-A--A-T---GT----GA-A-AATT-A----------G-A-A--C-A--CC-C------C-TG------T---A-T-------G-T------G----T-----G---CA-----G------C----T----C----C------AT--A------AT---TT--C--a
gi|22 : gaaggaacatgtggaaatgttgaaaga---T---TTCA----AT---TA-G--CT-T--T-ATTT---T----TA--AA-A-------------G---AT---A--A----ATAAA--------TT--ACA----TG----A-T---ACA-A--A-T---ATG---GA-A-AA-A-A----------G-A-A--T-T--TT-C------C-AG------G---A-T-------A-T------A----T-----T---TA-----G------A----C----C----T------TT--A------AT---TT--T--G-TT--T--C-----TTA---A---------T-T-------G--G-T-AA--A--G-G----G-C-G-----T-ACAT---T-------T----TCA-AAATG-GATTA-AAAT-C-AT---------C-----ATA--TTTC-G------C---A-----G--T-----C--A-----T-G----G-T---C--G--T-----ATA-T--CATCG-GA-C-A---A------A--AA-------A---A------G---T--G---TTA---C--AC-ATA-TTT-TATT---T---T------AT--T--C-T----GT--T----T-T---T--TAT-----CGG----T--A----T-G-A-A--A-G-------A---A--AAAC---A---T-----A----C---A-AGA------A-A------A-G--G------TC----AAT----T-------------------------T------TT-----A--A----AA----T--T-G---TT-T-GT---T----G------ATAATTTCT--AAAA--ttatctacatgtattttagaaaaggtcataa
gi|51 : acggtaattttgataca---T---TTCA----AT---CA-A-AA--C--A-GTGT--CT----AA--AA-AG----T----A-C---------A--T----AT-----------TT--ACA----CA----A-C---GCA-A--AAT---AT----GA-A-AC-T-A----------T-A-A--T-A--CC-C--------AG------T---T-T-------G-T------G----T-----G---CA-----G------A----T----A----C------TT--A------AT---TT-----G-ATA-T--C--TA-TT--------------T-T-------G--T-A-AC--G--G-G----C-C-A-----T-A-AC---T-------C----TTTTAAATG-ACTGA-AGAC-C-AT---------C-----ACAT-TTTC-T------C---A----TA--T--T--A--A-----C-G----G-T---C--A--C-----AC--G--T-----GA-C-A---A------A--AT-ATG-T-A--------------T--A------------AA-ATA-TTT-CC-----A---T------TTCAT--C-A----G---T----T-T---ctagactattttggttttatgaagtttt
gi|9 : agaacatggtaattctgataaaa---T---TTCA----CC---TG-A--TT-C--T-ATTT--CT----GA--AA-GT----T----G-TC-----------T----AT-----------TT--ACA----TG----G-TCGTACA-A--A-T---AT----GA-A-AC-T-A----------A-A-A--C-A--TC-C------C-AG------T----------------------A----T-----G---CA-----G------A----C----A----A------TT--A------AT---TC--C--G-TT--T--C--T----A---A---------T-TTTCCAAGG--G-A-AA----------------T-----T-C--C---T-------C----ATATAAATC-AATGA-AAAG-C-AT---------C-----AAA--ATTC-G---------------TG-----------G-----T-G----AAT---C--A--T-----A------------GA-T-A---A------A--AG-GTG-T-A---A------------------TA---A--AG-AAA-A----------------------TCAT--C-A----G---T----T-T---T------------AGG--T--A----T-G-T-T--A-G-------ATATA--C------T---T-----C----C---A-AAG------A-A------A-T--A------TC----AAT----G-------T----TTA--T-T--T--T------TT-----A--C----GA----A--C-T---TC-T-AC---T----T------GTAT-TTTT--CAAA--TT----AA
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gi|39 : tagagggacacgacatgcccattttgacaaata---TTCA---------TA-A-ATT----T-ATTT--TC----TG--AA-A----------A-TG---AT---A--T----AC-----------CT--AAA----CG----A-T---G-A-A--A-T---AT----GA-A-A--C-A----------A-A-AT-T-A--CC-T------G-AG------T---A-T-------G-T------A----T-----G---CA------------G----T----C----CG-----GT--A------A--------C--G--T--T--C--T--AT----G---------T-T-------C--G-A-AA--G--G-G----C-A-A-----T-A-AC---T-------CT---TGATAAATT-ACTGA-AAAA-C-AA---------C-----TTA--ATT------------------TG--T--T--C--G-----T-GTT--G-T---C--A--T-----AT--A--C-----AA-C-A---A------AG-AT-GTG-TCA---G------C---TTGG---TGG---C--AG-----------TT---T---T------ATCAT--T-C----T---T----A-T---C--T-T-----AAA-------A----T-A-A-A--A-A-------A---A--A------A---T-----G----A---ATAGA------A-A------C-T--AT-----TT----TGT----T-------A----TTA----T--A--T------TT-----A--A----actgatcataaagtcttggagggtaatacttggaaatcatcttcatattgttatattttacagtgtaaaagagacgatgtgcgaacatgaggaaaaccaatttcaatatcacagcgtgtccctttaaatacaggtaagttatattattgcagtatttagtcattctctaaat
gi|78 : ---TTAA----CT---TA-A--TT-C--T-ATTT--CT----GT--AA-AT----T----A-T---------A--T----GT-----------CT--GCA----TG----A-T---ACA------T---GT----GA-A-A--T-A----------A-G-A--T----------------------------T-T-------G--------A----T-----A---AA-----A------A----T----T----G------TT--T------TT---TT--------T--T--C--TG-TT--------------T-T-------G--G-A-AA--G--G-G----G-T-C-----T-A-AC---T-------T----T-GTAAA
gi|128 : aaatattaaagtgatatgccacaattttgataaaac---TTTA----CT---TA-A--------C-ATTT--CT----GA--AA-AC----T----A-T-----T------C----AT-----------TT--ATA----AG----G-T---TCA-A--A-T---AT----CA-A-AT-T-G----------A-A-A--T-A--TT-C------C-AG------T---A-T-------G-T------A----T-----G---gtgcgtaaaa
gi|113 : ---TTCA----CA---TA-A--CA-C--T-ACTT--CT----GA--AA-AT------------G---AT---A--TTTGTAT-----------CT--ACA----TG----A-T---GCATT--T-T---TT----AA-A-AT-T-A----------A-A-A--T-A--CC-C------T-A-------T---A-T-------G-T------G----T-----G---CT-----A------A----C----C----C------TC----------T---TT--C-----------C--T--CTG---G---------T-T-------G--G-A-AA--G--aaaacccattattcgttt
gi|109 : aaatgTCA----AT---TA-ACACT-T--T-ACAT--CT----GA--AA-AT----A----A-TG-----------T----AT-----------TT--ACA----TG----A-T---GCA-A--A-T---TT----GA-A-AT-C-A----------A-T-A--T-A--
gi|1 : aggacacatggcgtttttgataaaatgT---TA-A-CCT-T--T-ATTT--CT----GA--AA-------T----A-TG---GT---A--T----ATACAGTAGAGATCT--TCA----TG----A-G---GCA-A--A-T---AT----GA-A-A--T-A----------A-A-AC-T-A--AC-C------C-AG------T---A-T-------G-T------G----T-----G---CA-----G------A----T----T----C------AT--A------AT---TT--C----AT--T--T--T--TGT---T---------T-T-------G--C-A-AA--T--G-G----G-C-A-----T-A-AC---C-------C----TTGTGAATA-GTTCA-AAGG-C-AT---------C-----ATA--GTTT-G------TATAT----TG--T--------------T-G----G-T---C--A--T-----TT--A--T-----GA-C-A---ACAATAGA--AG-A-G-T-A---A-----------------------C--AA-ATA-------TT---T---T------TT--T--T-T----G---T----T-T---CA-GAT--------TT--T--T----T-G-G-T--A-T-------A---ATGA------A---T-----TTC--C---T-AGA------A-A------A-TCAG------TT----TAT----G-------C----ATA--T-T--G--T------TT----------------------------TT-T-TT---T----T------ATA--TTC----AAA--AC----AA--ATTAC----TGA---C-----TTC--------A--------CA-ATGTG---TT----AA---TA--ATTTTT--------AAATACGTTA-TATATGAAAATTccctataaggttttcaagactttctcaat
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gi|32 : accttT-C--T-ATTC--TT----GA--AA-ATCG--T----A-TT---AT------T----AT-----------CA--ACAATATCGTACTA-T---GAC-A--T-T---AG----GA-G-AT-T-A----------A-A-C--T-A--TCAC------C-A-------T---G-T-------G-T------A----T-----G---CA-----G------A----C----T----A------TT--G------AA---TT--C--G-TT--T--C--T--ATT---T---------T-T-------G------AA--G--G-G----T-C-A-----T-A-AT---T-------C----TGGTAAATG-ATTCG-AAGA-C-AT---------C-----ATatttt
gi|3 : acatgacacttttaataactt-C--T-ATTT--C------A--GA-AG----T------TA---AC---A--T----TT-----------CT--ACA----AG----A-T---GCA-A--A-T---AT----GACA-AA-T-AGAGAAGAAAAA-A-A--C-A--AC-T------GCAG------T---A-T-------G-T------G----C-----A---TG-----T------A----T----T----CAGACAATT--A------AT---TT--C-----------C--T--TTAT--A---------C-C-------G--GTA-CA--T--G-T----A-T-T-----TTA-AC---T-------C----GTGTAAGTA-ACTGA-AAGG-C-AA---------C-----ATA--TTTT-G------C---A----CA--T--T--T--G-----T------A-T---C--A--T-----AT--T--T-----GA-C-A---A------A--AA-CTG-T-A---A-------------------A---A--AA-ATA-TTC-AA---------T------TTAAT--C-A----G---A----T-T---T--TAC-----TGA----T--A----C-C-A-T--A-T-------A---A--A------A---T-----TAC--C---A-AGG------A-A------A-T--A------Ttttgacacaaaatgaaaaacaaagcttttatttcacatatcggtatgacagaaaaacaatcaaaataattatgtatttttattaaaaaaattgttttaccctattttcca
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gi|54 : ttttatgaattgtcatataa--T-ATTT--GT----TA--AA--C----T----A-TT---TC---T--T----GT-----------CC--TTA----CG----A-T---GCA-A--G-T---AT----G--------------------A-A-A--T-A--CT--------G---------------T-------G-T------G----C-----G---CA-----CG-----A----A----C----C------AT--A------CT---TT--C--G-TT--T--C--TA-TT--------------T-T-------C--G-A-AA--T--A-G----G-C-A-----T-A-AC---T-------A----TGATA---------A-AGGG-C-AC---------T-----ATA--TTTC-G------T---A----TA--T--C--C--A-----T-A----A-C---C--A--T-----AA--A--T-----AACC-A---A------A--AA-ATG-T-A---A------C----------------------ATA-GTC-CA-----T---T------GTCA---C-C----A---T----C-T---G--TAT-----CGA----T--A----T-G-A-T--A-GA------A---A--A------A---T-----C----C---A-TGG------A-G------G-T--A------TC----
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gi|10 : TT--TT----GA--AA-AT----T----A-T---------A--C----AT-----------CT--GCA----TA----A-A---GCA-A--A-----ATA---GA-ACAT-T-G----------A-A-A--T-A--TC-C--------AG------T---T-T-------C-T------G----T-----G---CC-----G------A----T----T----C------TT--A------AA---TT--T--G-TT--T--C--T--AT----A---------T-T-------A--T-A-AA--T--G-G----G-C-------T-A-AT---T-------C----TTGTAAA----TTG---------AT---------C-----GTG--TTTC-G------T---A----TA--T--C--A--G-----T-G----A-TCG-C--A--T-----GT-----------GA-C-A---A------A--AA-GTGTT-A---A------CATAT--A---TT-----------TA-ATTGCCT-------------------T--C-T----G---T----T-T---A--TAT-----CGG----T--A----T-G-A-T--A-G-------A---A--A------AATTT-----C----C---A-AGG------A-A------A-T--T------TC------T----T-----------------C-T-----T------TT-----A----------------------TT-T-AT---T----C------ATA--TTTT--CAAA--ctgtgaacaaaaagtatacacttttaaaatatgttattggaacatgggtatgacagaacatgtcaaagaaaacataaatttgtaatgccagataaattagtactcaaacactagcatgtgaccactagttgtataatattttattactgccaagtagtaatatttagacatacatgtaagtagctcaatacgagtaaacgttcatatgcgtcaatatagatttgacgcatgcaacataagtaaaaatcgactaaaatattgctttgcgt
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gi|21 : T--CT----GA--AA-AT----T----G-T---------A--T----GC-----------CT--ACA----TT----G-T---ACA-A--A-T---AC----AA-A-GT-T-G----------G-A-A--T-A--CG-C------C-AA------T---A---------G-T------G----A-----G---CA-----G------A----T---------C------TT--A------A-------------AT--TA-C--C--TTATAGA---------C-T-------G--A-A-CA--G--T-G----G-C-A-----T-A-AC---C-------A----TTGTAAATG-GCTGA-AAGG-C-AT---------A-----CTA--TTT-------------T----TA--T--ATTC--G-----T-A----G-T---C--A--C-----GTG-T--T-----GA-T-T---A------T--AA-GTG-A-A---A------C---A--A---AT----C--AA-GT--ATT-TTTT---T---T------TTCATTAT-C--------T----T-T---T--TGT-----TGGTT--T-------T-A-A-A--A-A-------A---A--AT-----G---T-----T----TTA-A-AGA------T-A------A-T--A------TC----AATA---T-------A------A--C-T------------------------------------T-A---TT-A-ACT--T----A------ATA--TCTT--CAAA--tttg
gi|91 : aagggacacatgacaatttaaataaaatttcatttaatgcgaaaT----TA--AT-ATC---T----A-CA---ATTTAA--T----AT-----------CT--ACA----TG----A-T---GCA-A--A-T---AC----AA-A-AT-T-G----------A-A-A--T-A--CC-C------A-GG------T---A-T-------A-T------T----T-----G---CA-----G------A----T----C----A------TT--A------AT---TT--T--G-aattatcattattttaatagactttca
gi|4 : gctacacacaacttctttgatattatttttgtctaagctccaaatctgaaaaaaatat----TG--AA-AT----T------TG----T---A--T----AT-----------CT--ACA----C-----A-T---ATC-A--A-T---AT----GA-A-AT-T-G----------G-A-A--T-A--CC-C--------AG------T---TGT-------G-T------G----T-----G---CA-----G------A----T----CAAC-C------TTTAA------AT---TTGTT--G-AT--T--T--T--T-------------------------G--G-A-AA--A--G-G----G-C-A-----T-A-TT---T-------G----TTGTAAATG-GTTGA-AAGG-CTAT---------C-----ATG--TTTT-G------C---A----TA--T--T--T--G-----T-G----G-T----------------T--T--TAAAAAGA---A---A------A--AA-GTA---A---A------C----------------C--AA-ATA-TT----TTA--T---T------TTCAT--T-T----G---T----T-T---T--TAT-----CAG----T--G----T-G-G-T--A-C-------A---A--AAAT---G---T-----T----C---T-CAT------T-G------A-T--A------CT----CAT----T-------C----ATA--T-T--T--T------TA-----A--A----GA----A--T-----TT-T-AT---T----C------ATA--TTTT--CAAA--AC----TAGGATGTC---ACCA---C-----T----------A--------tata
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gi|76 : gtaaactgagctttaacatattattataggttaacA--AC-AT----T----A-TG----T------T----AT-----------CT--ACC----TG----A-T---GCA-A--A-T---AT----GA-T-AT-T-A----------A-G-A--T----------------------------------------------------------G---CA-----T-----------------------------T--AGT----AT---TT--C--G-----T--T--T--TTA---A---------T-T-------A--A-A-AA--G--G----------------T-A-AGATGT-------A----TGGTGAATC-TTTGA-AATG-C-GT---------C-----ATA--GTTT-G------C---A----CA--T--A--A--G-----C-G----T-T---T--G--T-----GT--T--tattatgaatagactagtgttattatttttcacatgtctaacaataaaaagttgacagtaaaaactgttaataactttgtaaaatgtaaggtttcacacggtaatacttggaaattaacatcttcatgcggttatatgtttataggtgtcagaattgacttaatgcattaacacaagga
gi|47 : taagtaataatttattatcaattatgaaA--AA-AT----T----A-T---------A--T----AT-----------TG--ATA----TG----A-T---GCA-A--A-T---AT----GA-A-AT-T-------------------T-A--AT-T------G--G------TA--T-T-------G--------G----T-----G---CA-----G------G----C----C----C------TT--AC-----AT---TT-----G-----------T--TTA---AAAT------T-T-------G--G-A-AA--A--G-A----G-C-A-----T-T-GT---T-------C----TAATAAATT-AATGA-AATA-C-AT---------------ATA--GTTT-A------A---A----AA--T--T--C--G-----C-G----G-T---C--A--TAC---GTA-TA-T-----GA-C-A---A------A--AT-TTG-T-ATCCA------G---T--A---TT----C--GA-ATA------------------------TCTT--C-G----G---T----T-T------TAT-----CGGC------A----T-G-A-A--A-GAAA----A---A--A------G---T-----C----A---A-AGG------G-A------A-A--A------T-----CAG----T-------AT---GTA--T-T--G--T------CT-----A--A----taca
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gi|100 : agagacattaagtaactttgatagagtttcaataaaaatag--AA-AT----C----A-T-----T---A-------AT-----------CT--ATA----TT----A-TTCTGTT-A--A-T---AT----GA-A-AT-T-T----------A-A----------T----------AG------T---A-T-------G-T------T----T-----G---CA-----C------A----C----C----C------AT--A------AT---TT--C--GTATAAT--A--T--TT----------------T-------G--G-A-AA--A-----------C-TAAA--T-A-AC---T-------C----TGGTAAATG-ATTGA-AAGA-C-Aaatactatttctgatattcttggctacatactaccaacaagtaaaacacatgttttattttcatatttttttattgattgtaaaaaaat
gi|37 : gatactttcactgg----T----A-TG---A----A--T----AT-----------CTGAACA----TT----A-T----------A-T---AT----CT-A-AA-T-A----------T-ATA--T-A--TA-T------G-AG------T---------------------------------G---CA-----G------A----T----C----T------TT--A------TT---TT--C--G-----------T--TTAT--A---------T-T-------GTTG-A-AA--G--G-G----G-C-A-----C-A-AC---T-------C----TGGTAAACG-GTTGA-ATAG-T-AT---------C-----ATA--TTTC-G------C---G----TA--T--A--C--A-----T-G----G-T---C--A--T-----AT--C--T-----GA-C-A---A------A--A--ATG-T-A--------------T------TTA---CATAA-ATA-A----------T---T------TGCAT--C-A----G---T----G-T---T--TAT-----GGG----T--A----A-G-AGT--G-A-------A---A--A------GAA-T-----C----C---A-AGG------A-A------A-ac
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gi|104 : gtaaaagagatatgcggcatgtttttttctctctaaattttcatctac---AT---A--T----AT-----------CT--AC--------------------------C---AT----GG-C-AT-T-A----------G-A-A--A-A--CC-C------A-A-----------T-T-------G-T------G----T-----G---CG-----G------A----T----C----C------CT--G------AT---TT--T--G-AT--A--C--TA-CT--------------T-T-------A--G-A-AA--G--G-G------C-TA----T-A-AC---T-------C----GTGTAAATG-GTCGA-AACG-C-AT---------C-----CTA--GTTT-G------T---A----TA--T--T--C--G-----C-gttctacataaacaataaaataaaaatcttaaatat
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gi|31 : -----------CT--GCA----TG----A-T---GTA-T--A-A---AT----GA-T-AT-T-G----------A-A-G--C-A-----C------G-AAAC----C---T-A-------G-T------G----T-----G---CA-----G------A----C----C----T------TT--A------AT---TT--C--A-----T--C--T--ATA---T---------T-T-------A--G-G-AA--G--G-G----G-T-A-----T-A-AC---T-------T----TTGTAGCTA-GTTGG-ACGG-C-AT---------C-----AAA--CTAC-G------C---A----GG--T--G--C--A-----C-G----G-C---C--A--A-----AT--A--T-----AA-C-A---AT-----T--AT-GTG-T-A---T------T---T--T---TTT---C------TA--------T---T---T------TCCTT--T-A----G---T----T-T---T--TAT-----TGATG--TCAA----T-G-A-A--A-A-------AC--A--A------A---T-----C----C---A-TTG------A-A------A-T--ACATGATTG----TAT----T-------AATTTGTAT-T-T--T--T------TT-----A--A----GA----A--T-T---TT-T-AC---T----C------ATA--TTTT--ttttctcaaattcgcggtctcatagggaaaaa
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gi|85 : --A-T---AC----GA-A-AC-T-A----------C-A-A--C-A--CC-C------A-------------T-T-------G-T---------------------C------T------A----T----G----C------TT--G------CT---TT--C--T-A------C--T--TTA--------------------------G-A-AA--G--G-G----G-C-A-----C-A-AC---T-------C----TTGTAAATG-a
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gi|34 : taga-T-------G-T------T----T-----G---CA-----G------A----C----C----T------TT--A------AT---TT--T--G--T--T--C--C--A-A---A---------TCT-------G--A-A-AA--G--G-G----G-C-A-----T-A-CT---T-------C----TTGCAAATG-TTTGA-AAGG-G-AT---------C-----ATA--GTTT-G------C---A----TA--T--T--T--G-----T-G----A-T---T--A--T-----ATG-T--C------A-C-A---A------A--AA-TTT-T-A---A------C------------A---C--AT-TTT-ATT-CC------------------CGT--C-A----G---T----T-T---T--TAT-----AGA----T--A----T-G-A-T--A-C-------A---A--T------A---T-----TATTGA---A-AGT------A-A------A-C--A------TT----GAT----T-------T----GAA--T-T--T--T------TT-----A--A----GAT---A--T-----TT-T-AT---T----C------ATA--ATTT--AAAA--Taacatcagtttttattggaa
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gi|117 : TA---A---------T-T-------G--T-A-AA--G--G-G----G-C-G-----T-A-AC---T-------C----TAATAAATG-GTTAG-TAAG-C-AT---------C-----GTA--TTTC-A------C---A----TA--T--C--C--A-----T-C----G-T---CTTA--T-----GT--C---------A-C-A---A------A--Acatcacattttatcaagttaagctgacttcaatattgtcatgtacttttttaacatcaccagcattgataaataaataatc
gi|107 : ccccagtatgtattcagaacagTA---A---------T-T-------G--T-A-AA--G--G-G----G-C-G-----T-A-AC---T-------C----TAATAAATG-GTTAG-TAAG-C-AT---------C-----GTA--TTTC-A------C---A----TA--T--C--C--A-----T-C----G-T---CTTA--T-----GT--C---------A-C-A---A------A--Aat
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gi|18 : -AT---T-------T----TGGAAAATG-GCTGA-AAGG-T-GT---------C-----ATA---TTC-T------A---C----T---T--A--C--C-----C-ATGGAA-T---C--AA-T-----AT-----------GA-C-A---A------A--AA-GTG-T-C---A------------------TA---T--AA-ATA-TTT-CCTT---T---TCATGTTTTTAT--T-C----A---T----T-T---TGGTAT-----TAATT--------------A-C--A-G-------A---A--A------A---TAATATC----C---A-AGG------A-A------A-C--A------TC----AAT----T-------T----GTA----T--A--TAATTTATT-----A--A----GC----A--T-T---TT-T-AC---T----A------ATA--TTTT--CAAA--AC----AAGCATGAG---GTCA---CTTGTTT----------A--------CACA-ATATGTTT-A-GGA----------TTTCTT
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gi|40 : gTGA-AAGG-G-GT---------C-----ATA--TTTA-G------C---G----TA--T--T--C--C-----G-G----G-T---C--A--T-----GT--G--T-----GA-C-A---G------A--AG----------------------T--G---TTA---CA-AA-ATA-TTC-AATT---T---TA-----TT--T--C-C--------T----T-T---T--TAT-----TG--T--A--A----T-G-A-T--A-G-------A---A--A------AAATT-----T----C---C-ACA------GCA------A-T--A------T-----CGT----T-------T----GTA--T-T--T--T------TT-----A--A----G-----A--T-----TT-T-AC---A----A------ATA--CTgtttcctaagcactgcatacttatttaaatatgaatttccaaatcttgatgcttgaagattaatatttccacatggtgtaagaattaagcagatttcaatattgccacatgtcgcgttaa
gi|52 : gacaatttaattttgtttgtacttaaaaattaga----T-T---G--TAT-----CAATT--TC-A----T-T-A-A--A-C-------A---A-------------------T----C---A-AGG------A-A------A-T--A------TC----AAT----T-------------------T--G--T------TTTTGTGA--A----GA----AA-T-G---TT-TTAC---T----A------GTG--TTTT--CAAA--AC----TAGCGTGAT---GCgaactaaattttcaaaactagcacacttcaacagttttataaaaattttttaaataatttctcaaata
gi|33 : atgtatttaa----T-T---T--TAT-----CAACT--C--AATAAT-G-A-C--ATA-------A---A--A------A---T-----C----T---A-AGA------A-A------A-T--A------TC----AAT----TTGTAGCAG----GTA--C-T-----T------TT-----ATTA----GA----T--TTG---TTAC-AC---T------------TA--TTTT--CAAAACTT----AGGCCTGAT---GCCA---C-----T----------AGTTTTATACA-A-------TT-A-GAA---TA--Acgccttcttcaaacagtcatcctttagagattaattcttcaaagtgtgtatacgttcatttcatagctgcggaaattgatttgagatgtaaagattagtgaaatatcaaaatatt
gi|86 : agtagaactaaaaagcacaaaaaatattttac----T-G-A-TTGA-G-------A---A--A------AA--T-----C----C---C-AGT------A-A------A-T--A------CC----AAT----T-------T----GTA--C-T--T--T------TT-----T--A-----A----C--C-G---TT-T-AT---TTTACAT-----ATA--TTTT--CAAA--AC----TATCGTGAC---GCAA---C-----TTGTTTTATCAA--------TA-A-ATA---TTCA-GGA---TT--AATTaatctgaagttccagttgtgcgtataagttcaaagatgtaaaaatttatacatgtgtgaacatgagtaatattcattttaaaaaatcgatttttatgttcctttactttgaa
gi|38 : tttgtatctgttA------A-A------A-T--A-------------AT----T------------GTA--T-T-----T------TT-----A--A----GA----A--A-G---TT-T-AC---T----GTTACTCATG--TTTT--CAAA--AC----AAGCATGAT---GTCA---C-----C----------A--------aaacaatattgagtttcaat
65 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|110 ): TTCTTAAATATAAACATTTAGATAGCAATTGGGTTATAGAATGACAGATGTAAACATTGATTTGATGCATGAAACATAAGAAAAACAAATTTCAACATTGTCATGAGTCCCTTTAA
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Unaligned ( gi|118 ): TCGTTTCTATTTTGGAAAAGGGCGTGACAGAAGTAACTTGTTGAAATAAGTATTCATACTATTTCGTACATTTGACGTAATCCATGACAAATAATGTAAATA
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Unaligned ( gi|120 ): GACAAACGACAATTAATGGACAATTTAACTAACACTATTTCTGTGAGTTATATATCTATGTGGTACCAATATAAATAACCTTGTATGTATGCAGA
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Unaligned ( gi|125 ): TGTTAGATTTAAAGTGACACGCAGAGAATTTGATTCAATCTAGCTTCATTATATTTGTGGAAATCAAACACCTGCATGATGCATCAAACAAG
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Unaligned ( gi|127 ): TTTCATAAGGATAATTGATTCATAGACTTGAGAAAGATTGGCTTTGTGCAAGAACATGGGTAGACTATAATTCCAACATTGCTGTGTATC
Unaligned ( gi|129 ): AAAATATTAATAATTTCTTAACATGGGAGTTTCAGATTATAATACTTGGGAATAAATATCTCCTTATGATAATTATCAAAGATTGATTC
Unaligned ( gi|130 ): TTCGTTCATATTTTTAAAAGATTGATTTGGTGCGCAAACATTAAAATAACTCGATTTCAACATCGCATGGTGTCCCTTTAAAATAGTAA
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Unaligned ( gi|132 ): CACGGTGGTTTTGATAAATTTAAACTCTCTTAACTATATTTCTGATATGATTAATATCTGATTATGCAAATGTGAAATTTGAAAACCC
Unaligned ( gi|133 ): TAAAAAGGACACTTGGCAATTTTGATTCATTTTCTCATAACTCTGTGTCTGAAAATTATATATTTGATGCAAATAAATGTATGAAAT
Unaligned ( gi|135 ): ATATATTCATGGTTACAAGTCCATGGGTGTAAATATCGAGTTGATGCACGGGCATGAACACGCCCGAGTTCAACATTGCCGTGTGT
Unaligned ( gi|136 ): TTTCAGATTCTTCACTTTGCTGCTAATTAAAAGGGACACACTTCTTGCAAATGTGATTAAAATACATCTATTTTGCATATCTG
Unaligned ( gi|137 ): AATTATCTTACATCATTGAAAAATTTCATATTTCGCTTGTTCAGGGTTATAAATGACAAATGCAAAACATGTGTTTTCCACAA
Unaligned ( gi|139 ): CGCCATGTGGTTACATGTTCAGAGGTGTAAAGATATATGTGATGCGAGAACATGAGTAATATTGTGTTGAACATTACC
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gi|11 : atat---T----T---T------C-A-TT-A----T---AT--------------T-T----T---AT---C---------------A----T-G-C--TT----A-G-------A---A----AT-----A------T-----T---------AA-G--A-A-AG----------T--GTC---AA-T---T-TA------TA----------T-------A---T--T-T----A-AT---G--A--------------T-T-----T-A---C-T-----G------A--T--A-T-TTTC-AAT-AC----T--A---AC--G-Tccaccatatttcattatattttatcatgcttagaaatattaagaaagtgtcaatttatatatttaatgatttactgatattttcaatactaacgtatcaaaattagtttttatactaataaaataaactataacagttaagaaattctgaagtttcaaatagtatacaatacttaaagattgatatctccccatagttatacactcataaatgtgaagattggttgagtaaaatcgatttcccattgccgcgtgtccctttaagaac
gi|111 : atataaattatatatctacatgaatatgaaattaaaaaatattctagtgagtttacagaccctttgttaatttcgttatctattttcgaaagtggggtacaactcaggtaaatgtttgaacggcatcctgtttcccaccataTAAT---T---T---TGCT----CT---TA-ACACT-T--C-AAAAGTCTAAAGTTG-AA----A-A-------------C-----T--AT----A-T-----A--A----AT-----------C------G------AC-A---TG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-AT-A-ACT-T---------A--A---G-A--T----AA----C-CC-A--atcaaaattagtttttatactaataaaataaactataacagttaagaaattctgaagtttcaaatagtatacaatacttaaagattgatatctccccatagttatacactcataaatgtgaagattggttgagtaaaatcgatttcccattgccgcgtgtccctttaagaac
gi|112 : taaagtgacacatgccaatttttaTAATCAAT---T---TTCA----CT---TA-A-CCA-C----A----TTT----CTG-AA----A-A-------------C-----TA-ATT---A-T--------C----AT-----------C------T------GC-A---TG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-A--A-A-T-A---------A--A---A-C--T----G-------TT-A--TTA-T-------AT----T----TA-------CA-G--A----CTCA--T---------T----A------tc
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gi|118 : ----T----C----G----T----TT--C---T--A-T-T-----------T-----T-----G--G-A---AA-A--G---G---G--CG-------T-------GAC------AGA--AG-T-AACT-T----G-TTGAAAT-AA-G-T-AT---T-C-----ATACTA-TT--T---C--G------T---------AC-A-TTT--G----A-C--G--T---AA----T-----CC-A--T------GA-C--A-----A---A-T--A---A------T-G--------T-A-A------t
gi|12 : ---T---T---TTCG----C-----AGA-ATT-C--T-A----TTT----CCG-AA----A-A-------------C----------G---A-T-----A--T----AT-----------C------C------AC-A---TG---------A-T---GCT-AT------T--AT---G-A--A-A-T-TT--------G--A---A-A--G----GC----C-CA-A--GTA-T-------GT----T----TG-------CA-G--A----CCT---T---------T----A------AT---T----G----T----G----T----T-------T--A-T-AGT---------T-----T-----G--T-A---AT-A--G---A---G--CA-------T-------CAT------CCT--TG-T-AAAC-T----G-ATAAA---CA-T-T-A----T-T-----A---TA-TT--T---C--G------C---------CT-G-TTA--A----C----G--T---TA----T-----AT-T--T------GA-ata
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gi|122 : gacaaacgacaattaatggacaa--T---C---T---T----T---T------C-G-CT-G----G---TC--------------T-T----T---AT---C------GG--T----A----T-G-A--T-----T-A-------A---A----A------T------T-----C----CA---AA-A--G-A-GG----------T--ATG---AA-T---T-CG------CA----------T----T--T---T--TGT----A-A----G--A----A---T-A---TAT-----T-A---C-T-----C------A--T--A-T-TTGC-AAA-AC----
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gi|124 : gcatccaatgtcaacaatgtttggatC------CCT--TG-T-AAAT-G----A-TAGGA---AG-G-A-A----T-C-----A---TA-TA--T---C--T------C---------AT-A-TTC--G----T-G--G--T---AA----T-----AT-C--T------GA-TA-A-----A---A-A--A---A------T-G--------T-A-A------TGTAT----TTA--T-A--A--A-T-A----T--T---aaat
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gi|134 : taaaaaggacacttggcaattttgattcat-----------T-----T-----A--G-T---AA-G--G---G---G--CA-------T-------AAC------ACT--TG-T-AAAT-G----G-TTAAA---AT-G-T-A----C-C-----A---TG-TT--T---T--A------C---------AT-A-TTC--T----T-G--C--T---CA----T------------------------------------A--A---A------T-G--------T-A-A--------------------T-A--A--A-T-A----T--T---T---
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gi|138 : aattatcttacatca-----------T-----T-----G--G-A---AA-A--G---A---A--AA-------A-------TAT------TCC--TG-T-AAAT-G----G-TTAAA---AT-G-C-A----T-C-----A---TA-CA--G---T--G------T---------AA-A-TGT--G----T-G--G--C---CA----T-----CT-A--T------GA-A--A-----A---A-A--tgcaaaacatgtgttttccacaa
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gi|144 : aatagatc---C-A--A--A-T-A----T--C---TTA-T---T----T---T------C-A-CC-A----G---GT--------------T-T----A---TT---T------GG--C----A----T-G-A--C-----A-G-------AT--A----A------AGAT---T-----C----C----AA-A--G-A-AA----------T--ACC---
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gi|154 : tggT----TTG-AA----A-A-------------T-----T--AT------------A--T----AT-----------C------T------AC-A---TG---------A-T---GCA-AT------T--AT---GAA--A-A-T-T---------A--A---A-A--C----A
gi|156 : -----G--G-A---AA-G--G---T---G--CC-------T-------AAC------TCTGATG-T-A--T-G----G-TTGAA---AG-G-C-T----T-C-----A---TA-TT--T---a
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gi|17 : gtaaaagagatatgcggcatgtttttttctctctaaattttcatctacatctgtttacacccgTAAG---T---T---TTCA----CT---TG-A--CA-T--T-A----TTT----CTG-AA----T-A-------------T-----C---TG---AAT-----A--T-----T-----------C------TCACTCAGC-A---TG---------G-T---TCA-GA------T--AT---A-G--A-A-T-A---------G--A---A-A--T----AC----A-CC-T--GTA-T-------GT----A----TG-------CA-G--A----CA-------------------A------ATACAT----T----C----G----T----TT--C---T--T-T-G-----------T-----T-----G--T-T---AA-T--G---GC--G--C--------T-------AAC------TC---TG-TCAAAT-G----A-TTGAA---AA-G-C-A----T-C---------T--TT--T---T--G------T---------AT-C-CGT--G----T-G--A--T---CA----T-----TT-A--T------GA-C--C-----A---A-A---------------------------------------------------A--A--A-T-A----T--T---T---TAA-T----T---T------T-A-T-------G---TG--------------T-T----T---AC---T------GG--T----A----T-T-A--T-----A-GAAA----A---A----A------A------T-----C----C----AA-T--G-A-AA----------C--GTC---AA-T---T-TG------TA----------T----TAAA---T--T-TTATAA-A----A--A----A---T-GGT-T-T-----C-A---T-T-----T------A--T--A-T-TTTC-CAA-AT----T--A---GC--A-TG--CC---AGCA----T-----T----------A--------t
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gi|20 : tagagggacacgacatgcccattttgacaaataAGT---T---T---TTC------C---TG-A-ACT-C--T-A----TTT----CTA-GA----A---------------------T--GT----A-T-----C--T----GT-----------C------C------AT-G---TG---------A-T---GCA-AA------T--A----G-A--ATA-T-T---------T--A---A-A--T----AC----C-CC-T--GTA-T-------A-----A----AA-------CA-G--A----CCC---T---------T----T------AT---T----T----C----G----T----T-------T--C-T-AGTT--------T-----T-----G--A-T---AA-G--G---A-----------------------AAC------ATT--TA-T-AAAT-G----G-CCGAG---CG-G-A-A----T-C-----C---TC-TT--TA--C--A------C---------TT-T-T----G----T-G--G--T---CA----A-----TG-A--T------GA----A-----A---C-A--A---T------C-G--------T-A-A----------------------A--AT-A-T-A----T--T---TCGAT---T----T---T-------------A----G---TT--------------T-T----T---AT---T------AG-------A----C-C-AACT-----G-G-------A---AAAC-A------A------T-----C----C----TA-A--T-A-AA----------A--ATC----A-T---C-AA------AA----------A----T--G------T-T----A-A----A--A----C---A-G---T-T-----T-T---T-C-----G------A--T--A---TTTC-AAA-GC----T--G---GC--G-TG--AC---ACCA----C-----tcaaaactaggatgacattactaattttatgcaaactgatcataaagtcttggagggtaatacttggaaatcatcttcatattgttatattttacagtgtaaaagagacgatgtgcgaacatgaggaaaaccaatttcaatatcacagcgtgtccctttaaatacaggtaagttatattattgcagtatttagtcattctctaaat
gi|21 : taatttaaaaggccaaaagacaattttggtaT----CTG-AA----A-A-------------T-----T--GT------------A--T----GC-----------C------T------AC-A---TT---------G-T---ACA-AA------T--AC---A-A--A-G-T-T---------G--G---A-A--T----AC----G-CC-A--ATA---------GT----G----AG-------CA-G--A----TCT---T---------A----A------AT---T----A----C----C----T----T---A---T--A-G-A-----------C-----T-----G--A-A---CA-G--T---G---G--CA-------T-------AAC------CAT--TG-T-AAAT-G----G-CTGAA---AG-G-C-A----T-A-----C---TA-TT--T---T---------T---------AT-A-TTC--G----T-A--G--T---CA----C-----GTGT--T------GA-T--T-----A---T-A--A---G------T-G--------A-A-A------CA--A----AT---C-A--A--G-T-ATTT-T--T---T---T---T----T---T------C-A-TTAT----C---TT--------------T-T----T---GT---T------GG--T----T----T-T-A--A-----A-A-------A---A----A------ATGT---T-----T----T----AA-A--G-ATAA----------T--ATC---AA---------------TA----------T----A--A---C--T-T----A------------------------T-T-----A-A---CTT-----A------A--T--A-T-CTTC-AAA-cggttttatacttaaatta
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gi|43 : taaattttcatgtaattctaaaaaaatgtatacccacgtgatataaatatagaaattagtatactccagtatgtacatataacatgtggaaagtatgtattacatatggaaagtatgtattacataaaTGAT---T---TGTGTTTA----CT---TA-----T-CAAT-A----TTT----CTA-AA----A---------------------T--ATGC--A-T-----A--T----AT-----------C------T------AC-A---TG---------A-T---GCG-AA------T--AT---G-A--A---------------A--A---A-A--T----AG----C-CC-C--GAA-T-------GT----G----TG-------AA-G--A----CAC---T---------T----G------GT---T----CAAAAT----G---------T---C---T--T---------------T-----T-----G--G-A---AA-A--A---G---------------T---------T------TAT--GG-T-ACAT-G----G-TAATA---AA-G-C-A----T-A-----A---TT-TTA-T---C--G------C---------A----------------G--G--C---CA----T-----TT-T--T------GA-C--A-----A---A-A--A---A------C-G----------A-G------C---T-----------A--A--A-T-G----T--T---TA--G---T----T---T------T-A-TT-A----G---TT--------------T-A----C---AT---A------CG--T----A----C-G-A--T-----G-G-------A---A----
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gi|51 : aatagtccaggaattattcc---T---TTCA----AT---CA-A-AA--C--A-G----TGT----CTA-AA----A-A-------------G-----T--AC------------A--T----AT-----------T------T------AC-A---CA---------A-C---GCA-AAA-----T--AT---G-A--A-A-C-T---------A--T---A-A--T----AC----C-C--A--GTT-T-------GT----G----TG-------CA-G--A----TAC---T---------T----A------AT---T----T----G----A----TA---T---C---T--A-T-T-----------T-----T-----G--T-A---AC-G--G---G---C--CA-------T-------AAC------TCT--TT-T-AAAT-G----A-CTGAA---GA-C-C-A----T-C-----A---CATTT--T---C--T------C---------AT-A-TTA--A----C-G--G--T---CA----C-----AC-G--T------GA-C--A-----A---A-A--T---A------T-G--------T-A------------------T---A-A--A--A-T-A----T--T---T---CCA-T----T---T------C-A-TC-A----G---TT--------------T-
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gi|57 : ttttaaagggacaaatggcaattttga--ATG---A-A-----A--TT---AA-----------C------T------TT-A---TT---------A-T---GTT-AG------T--AT---G-A--A-A-T-A---------A--G---A-T--T----AA----C-------GTT-T-------ATA---G----TC-------TA----A----CCC---T---------G----A------AT---T----T----T----A----T----T--------------------------T-----G-----G--G-A---AA-G--G---C---G--CA-------T-------AGC------TCG--GA-T-AAAT-G----G-TTG-----AT-G-A-A----T-T-----G---CT-TT--T---C--A------C---------AC-A-GTT--G----T-G--G--T---CA----C-----AT-A--T------GG-C--A-----A---A-A--T---G------T-G--------T-A------------T----TT---T-A--A--------------------------T----G---G------C-A-TC-A----G---TT--------------T-G----T---AT---a
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gi|60 : gtaaactgagctttaacatattattataggttaacA-AA------T--AT---G-A--A-A-T-C---------A--G---A-A--T----AT----C-CC-T--GCA-T-------GC----A----TG-------AA-G--A----CGA---T---------T----A------AT---T----T----C----G----T----T---T---T--T-T-T-----------T-----T----------------------------G--CATT-----T-------GAT------TCT--TG-T-AAAT-A----C-TCAAA---GG-A-C-A----C-C-----A---T--TT--T---C--G------T---------ACAG-TC--------T-G--G--TA--CA----T-----GT-T----------A-CGGA-----A---A-A--G---G------T-G-----------------------------T---T-A--A--------------------------T----T---C------C-A-CT-A----G---CT--------------T-T----T---AT---C------TG--T----A----T-G-A--TTGAAAA-C-------A---A----A------A------T-----C----C----AA-tattatgaatagactagtgttattatttttcacatgtctaacaataaaaagttgacagtaaaaactgttaataactttgtaaaatgtaaggtttcacacggtaatacttggaaattaacatcttcatgcggttatatgtttataggtgtcagaattgacttaatgcattaacacaagga
gi|61 : T---G-A--A-A-C-T---------C--A---A-A--T----AT----T-CT-A--TCA-T-------GT----A----TT-------CA-G--A----TCC---T---------T----C------AT---T----T----T----G----T----T---T---C--T-T-AAACTTTCTATTT-----T-----G--G-A---AA-A--G---G---G---A-------TTT-----ATC------TCT--GG-T-AAAT-G----G-CTGAACTTAGTG-T-A----C-A-----A---AG-TT--T---C--A------C---------AC-A-ACT--A----T-G--G--T---GA----T-----AT-A--T------GA-C--A-----A---C-A--A---T------T-G--------C-A------------------T---A-A--G--A-T-G----C--T---T---T---T----A---A------CTG-TC-A----A---TT--------------G-T----C---AT---C------GA--T----A----tataattttgtagttctta
gi|62 : AAT---T---T---GTAA----CTAAGTG-A-GCTTC--T-T----TTT----TAG-AA----A-A-------------T-----T----------T-----A--T----AT-----------T------T------AC-A---TG---------A-T---CCA-AT------T--AT---A-T--T-A-T-T---------G--G---A-A--T----AA----A-TC-A--GTA-T-------GT----G----TT-------GA-G--A----ACA---T---------A----T------CT---T----T----C----A----T----T-------T--A-T-A-----------T-----TAC---G--T-ACATAA-G--G---G---G--CA-------T-------AAC------TCT--TG-T-AAAT-G----T-TTGAA---AT-G-C-A----T-C-----A---TA-TT--T---C--A------C---------TT-A-TTC--T----T-C--G--T---CA----T-----AT-G--T------GA-C--A-----A---A-A--A---gggccaaaa
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gi|72 : ctAAT---T---T---TCCATTGCCT---T-----CT-T--T-G----TTC----CTG-AA----A-A-------------T-----T--AT------------A--T----AT-----------T------A------AC-G---AA---------A-T---G---AA---------AT---G-A--A-A-T-TT--------G--A---A-A--T----AC----C-AC-A--GTA-C-------GT----G----TA-------CA-G--A----TGT---T---------T----A------AT---T----G----T----G----T----TT--C---T--A-T-T-----------T-----T-----G--G-A---AA-G--G---G---G--CA-------T-------TAT------TAT--TG-T-AAAT-G----G-ACGAA---AG-G-A-A----T-A-----T---TA-TT--T---C--G------
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gi|82 : ttaaagggacacatggcaattttgttgttG-------CA-G--A----CCC---T---------T----A------AT---T----T----T----GT---T----T---C---T--T-T-T-----------T-----T-----C--G-A---GC-G--C---T---A--CA-------T-------AAG------TCG--T--T-AAAA-G----G-TTAAA---GG-A-C-A--------------------T--T---C--G------T---------GC-A-TGT--G----T-T--A--T---CA----T-----CT-G--T------GA-C--A-----A---C-A--A---A------T-G--------C---A------T---T----TT-----------G-T-A----T--T---A---TGA-T----T---T------C-A-TC-A----G----T--------------T-T----A---AT---C------GG--T----A----T-T-A--A-----A-G-------A---AAC--A------A------C-----C----C----AA-tatcta
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gi|86 : ---TT--------------T-G----T---AT---C------TG--T----T----T-G-A--TTG---A-G-------A---A----A------AA-----T-----C----C----CA-G--T-A-AA----------T--ACC---AA-T---T-TG------TAC---------T----T--T---T--T-T----A-ACC--GTTT----A---T-----T-T-----T-A---C-A-----T------A--T--A-T-TTTC-AAA-AC----T--A---TC--G-TG--AC---GCAA----C-----TTGTTTTATCAA--------T--A--A--AT----A--------TTCAGGA-------Tacat
gi|88 : AAT---G---T---TCCG----TT------A-ACA-C--T-A----GTT----AT--AA----A-A-------------T-----T----G---A-T-----T--T----AT-----------T------T------AC-A---TA---------A-G---GCG-AA------T--TT---A-A--A-A-T-T---------A--A---A-A--T----A--------A-A--ATA-T-------GC----A----AC-------CA-G--A----CAC---T---------T----G------AT---T----T----T----GC---T----T---C---T--G-G-T-----------T-----T-----G--A-A---AA-G--G---G---G--CG-------T-------TAC------TCT--TC-T-AAtaattaaacaatattgagtttcaat
gi|89 : tcgacactcgacaattgtgata-----A--C----AT-----------C------T------AC-A---TG-----------T---GTA-A-----------T---A-A--A-A-T-T---------A--G---A-A--T----GC----A-CA-A--ATA-C-------GT----G----TA-------CA-G--G----CCC---T---------T----A------AT---T----T----C----G----TATA-T---G---T--T-T-A-----------------------G--G-A---AA-G--G-----------ATTTTTTTT-------AGC------TTC--TG-T-AAAT-A----T-ATGAA---AC-G-C-A----T-C-----A---TT-TT--T---C--T------C---------AA-A-TTC--G----C-G--G--T---C
gi|9 : ---T---TTCA----CC---TG-A--TT-C--T-A----TTT----CTG-AA----A-G-------------T-----T--------G-T-----C--T----AT-----------T------T------AC-A---TGGTC------G-T---ACA-AA------T--AT---G-A--A-A-C-T---------A--A---A-A--C----AT----C-CC-A--GTA--------------------TG-------CA-G--A----CAA---T---------T----A------AT---T----C----C----G----T----T-------T--C-T-AAT---------T-----T-----T--C-C---AA-G--G---G---A--AA-------T-------TCC------TCA--TA-T-AAAT-C----A-ATGAA---AA-G-C-A----T-C-----A---AA-AT--T---C--G------T---------G--G-TG----------A--A--T---CA----T-----A------------GA-T--A-----A---A-A--G---G------T-G--------T-A-A----------------T---A-AAGA--A-A-A----------------------------T------C-A-TC-A----G----T--------------T-T----T---A-----------GG--T----A----T-G-T--T-----A-G-------AT--A----T------ACT----T-----C----C----AA-A--G-A-AA----------T--ATC---AA-T---G-TT------TA----------T----T--T---T--T-T----A-C----G--A----A---C-T---T-C-----T-A---C-T-----T------G--T--ATT-TTTC-AAA-TT----A--A---tcatagggaaaaa
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gi|95 : tagaAAA---T---T---TTCA----CT---TG-A--CA-T--T-A----TTT----TCA-AA----A-A-------------C-----T--AT----A-T-----A--T----ATAAAATTA----CATTGTAT------AC-A---TGTAATATATTA-T---GCA-TA------T--GT---G-A--A-A-T-T---------G--G---A-A--T----AC----C-CT-G--ATA-T-------CT----A----TG-------CA-G--A----CCaa
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gi|99 : gacacaggcacttttcaTAAT---G---T---TTTA----CT---GA-ACACT-T--T------TGT----CTG-AA----ATG-------------T-----T--ATG-----T-----A-------AT------------------T------GC-A---TG---------A-T---GCA-AAA-----T--AC-----A--A-G-T-T---------A--G---A----C----AA----C-CT-A--ATA-T-------GT----G----TG-------CA-G--A----CTC---T---------T----A------AC---T----T----T----GT---T----T---C---T--T-T-t
42 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|93 ): TTATTTCTTAAATATGAAGTGTAAGATACAGACAGTAATTATTGGTGATTAATATTTCCACATGGTTATCTTTTCATATCTGTAAAGATCGGCTTGGTGTATGAACATACGAAAAATCAATGTTAACATTGCCATGCG
Unaligned ( gi|96 ): ATGAAAAATTAACATATTAACATGTCATATAGCAATTCTTGGGGACAAATATCGTCATATGGTTACATGTTTATAGGTGTAAATATTTATTTGATGCATGGACATGAGCAACATGTGATTACAACAATGCCGTGT
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Unaligned ( gi|121 ): AATATTAATGCAGGAACACACAGCAATTTTGATAGATTTCTACTTGACACTTTTTTTTTAAAAATTACATATCTACCAATTAAAAAATAACAT
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gi|111 : atataaattatatatctacatgaatatgaaattaaaaaatattctagtgagtttacagaccctttgttaatttcgttatctattttcgaaagtggggtacaactcaggtaaatgtttgaacggcatcctgtttcccaccataTAAT---T---T---TGCT----CT---TA-ACACT-T--C-AAAAGTCTAAAGTTG-AA----A-A-------------C-----T--AT----A-T-----A--A----AT-----------C------G------AC-A---TG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-AT-A-ACT-T---------A--A-GA--T----AA----C-C-CA----atcaaaattagtttttatactaataaaataaactataacagttaagaaattctgaagtttcaaatagtatacaatacttaaagattgatatctccccatagttatacactcataaatgtgaagattggttgagtaaaatcgatttcccattgccgcgtgtccctttaagaac
gi|112 : taaagtgacacatgccaatttttaTAATCAAT---T---TTCA----CT---TA-A-CCA-C----A----TTT----CTG-AA----A-A-------------C-----TA-ATT---A-T--------C----AT-----------C------T------GC-A---TG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-A--A-A-T-A---------A--A-AC--T----G-------T-TA----TT-A------T-------AT----T----T-A-------CA-GA----CTCA--T---------T----A------tc
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gi|12 : ---T---T---TTCG----C-----AGA-ATT-C--T-A----TTT----CCG-AA----A-A-------------C----------G---A-T-----A--T----AT-----------C------C------AC-A---TG---------A-T---GCT-AT------T--AT---G-A--A-A-T-TT--------G--A-AA--G----GC----C-C-AA----GT-A------T-------GT----T----T-G-------CA-GA----CCT---T---------T----A------AT---T-G-T----G--T-T------------------T--A-T--AGT----T-T-----G--T---A---AT--A--G---A---G--CA-------T-------CAT----C------CT--TG-T-AA-------AC-T----G-ATAAA---C--A-T-T-A-T--------T-----A-TA---TT-T---C---G-C--C----T-----G--TT--tgaactagttt
gi|120 : gggacacactgcattttcgataca---T---TTAA----CT------A-ACA-C--T-A----TTT----CTG-TG----A-G-------------T-----T--AT------------A--T----AT-----------C------T------AT-G---TG---------G-T---ACC-AA------T--AT---------------------------A-AA--T----AA----C-C-TT----GT-A------T-------GT----A----T-G-------CA-GA----aacgttatatttgagcggcattattgtaaatatcaagtggaatgtgtgtattttaaagatttattatacatatttacaaacctggggttatttcttcggtagaatataaatgtaaacaacttcttaaatattgagattccgagaatagtacttgaataaatatttaatatgatacgttgtcaataattggtataaaacttgatttgatatgtaaa
gi|122 : gacaaacgacaattaatggacaa--T-C---T--------T-T---T---C-G-------C----------------TG-G---TC-T--T----TAT---C------GG--T----A----T-G-A--T----T-A-------A---A----A---T------T-----C----CA---A-A-AG--A-G--G----------TAT-------G----AA--------TT-C----G------CA--------T----T--TT-TGT----A-A----GA----A---T--ATA---T-----T-A-CT----C-ATAT-TTGC-AAAAC----
gi|123 : aTG--G---A-TA--------T----CT--------G-----C------GA-C--A-----AT--A-------A--A---G-T-A---A------AC-------------A----A-T-A----T--T-T---CAA------T-T---T---C-A-------T----------------CA-T---TT-C--T----TAT---T------GG--T----T----T-G-A--TA---A-G-------A---A----A---A------
gi|124 : gcatccaatgtcaacaatgttC----C------CT--TG-T-AA-------AT-G----A-TAGGA---A--G-G-A-A-T--------C-----A-TA---TA-T---C---T-C--A----T-----A--TT--C--GTG--G---T-AA--------T----AT--------C-----T------GA-TA-A-----A---A-------A--A---A-T-G-T-A------Aaaat
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gi|134 : taaaaaggacacttggcaattttgattcat------T-T-----A--G---T---AA--G--G---G---G--CA-------T-------AAC----A------CT--TG-T-AA-------AT-G----G-TTAAA---A--T-G-T-A-C--------C-----A-TG---TT-T---T---A-C--A----T-----A--TT--C--TTG--C---T-CA--------T---------------------------------------------------A--A---A-T-G-T-A------A------T----A--A----A-T-A----T--T-T---
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gi|142 : aagtgacacatggcaatt-CA----GT-G------T-------TT----A----T-T-------CC-GA----CCC---T---------T----G-------T---G-T---------T-T-----------C------T--A-T--A------T-T-----G--AT--A---AA--G--G---G---A--CA-------T-------TAC----T------CT--TG-T----------AT-G----GCTTGAA---ataatgagcctaacatcacttgttttataaaaaatgttaataatttctgaaatatgaaatttcatatagtaatacttagatattattatctgcatttggttgtatgttcataaatgtaaagattgatttgatgcccaaaacttgagaaaaataagatttccacattgccatttgtc
gi|144 : aatagat-----C----A--A----A-T-A----T--C-TTA-T--------T-T---T---C-A-------C----------------CA-G---GT-T--T----ATT---T------GG--C----A----T-G-A--C----A-G-------AT--A----A---AGAT---T-----C----C----A-A-AG--A-A--A----------TAC-------C----A
gi|149 : gtttga-GG--A-A--A----------TGT-------A----AA--------TT-A----A------TC--------T----T--TC-T-A----A-A----GA----G---T--TT----T-----T-A-CT----T-GTTT-TTTC-AAAAC----T----AGC--G-T-G--AC---G--g
gi|15 : TAAT---T---T---TTCA----CT---TA-A-ACT-C--T-A----TTT----CTT-AA----A-A-------------T-----T--ATG---A-T-----A--T----AT-----------C------T------AC-A---CG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-A--A-A-G-T---------A--A-AA--T----AT----T-C-GA----GT-T------T-------GT----G----T-G-------CA-TA----TTC---T---------T----A------AT---T-T-C----GA-T-T-----------C------T--T-TA-A------T-T-----G--G---A---AA--G--G---G---G--CT-------T-------AAC----T------CT--GG-T-AA-------AT-G----G-TTGAA---A--G-G-C-A-T--------C-----A-TA---GT-T---C---G-C--C----T-----G--TA--C--GCG--A---T-CA--------T----GT--------T-----C------GA-C--A-----A---A-------A--G---G-T-G-T-A------ACTGTTGC----A--A----A-T-AATCCC--T-T---T--------T-T---T---C-A-------T----------------CC-G---TT-T--C----TAT---C------AACTT----A----T-G-A--T----A-G-------A---A----A---G------T-----T----C----A-A-GA--A-A--A----------TAT-------C----CA--------TT-A----G------TA--------C----T--GT-T-T----A-A----GA----A---T--GT----T-----T-A-CT----A-ATAT-TTTG-AAATC----A----AGC--G-T-G--AC---G--CG---A----C-----T----------A--------C--A--A--AT----A--------T-----T-AGAA-------TG-----AGT--T--T---TCTTCGGGC-AA-----A-----C---GT-TAGT---ATACAGAAATT
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gi|154 : tggT----TTG-AA----A-A-------------T-----T--AT------------A--T----AT-----------C------T------AC-A---TG---------A-T---GCA-AT------T--AT---GAA--A-A-T-T---------A--A-AA--C----A
gi|156 : -----G--G---A---AA--G--G---T---G--CC-------T-------AAC----T------CTGATG-T-A---------T-G----G-TTGAA---A--G-G-C-T-T--------C-----A-TA---TT-T---a
gi|158 : TT----CTG-AA----A-A-------------T-----T--AC------------A--T----AT-----------C------T------GC-A---CG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-A--A-A-T-T---------
gi|16 : ---GCA-AA------T--AT---G-A--A-A-T-A---------A--G-AA--T----CC----C-C-AA----GT-A------T-------GT----A----T-A-------T--GA----CCC---T---------TT---A------AT---TATGT----G--T-T-----------C------T--A-T--T------T-T-----G--T---A---AA--G--G---G---G--TA-------C-------AAC----T------CT--TG-T-AA-------AT-G----G-TTGAA---A--G-G-T-AAT--------A-----A-TG---TT-T---C-----C-------T-----A--TT--C--GTG--G---T-CA--------T----TTGC------A-----T------GA-C--A-----A---A-------A--A---A-T-G-T-G-------------C----A--A------T-A----T--T-T---T--------T-T---T---C-A-------T----------------CA-G---TT-T--T----TAT---C------GG--T----A----T-G-A--T----A-G-------ATGTA----T---T------T-----C----C----A-C-AA--A-A--G----------TAT-------C----GT--------TT-T----GTTGT--TG--------T----T--GT-T-T------T----TACTTTA---T--TTA---T-----T-A-TT----C-ATAT-TTTC-AAACT----T----ACC--G-T-G--ACTTTA--CT---AGTT-C-----T----------A--------CATA--A--AC----A--------A-----T-AAAA-------TA-----A-A--A--A---TCTT------AAAT---A-----T---tg
gi|17 : gtaaaagagatatgcggcatgtttttttctctctaaattttcatctacatctgtttacacccgTAAG---T---T---TTCA----CT---TG-A--CA-T--T-A----TTT----CTG-AA----T-A-------------T-----C---TG---AAT-----A--T-----T-----------C------TCACTCAGC-A---TG---------G-T---TCA-GA------T--AT---A-G--A-A-T-A---------G--A-AA--T----AC----A-C-CT----GT-A------T-------GT----A----T-G-------CA-GA----CA-------------------A------ATACAT-T-C----GT-T-T-----------C------T--T-T--G------T-T-----GT-T---A---AT--G--G---C---G--C--------T-------AAC----T------C---TG-TCAA-------AT-G----A-TTGAA---A--A-G-C-A-T--------C-------T----TT-T---T---G---------T-----A--TC--CGTGTG--A---T-CA--------T----TT--------A-----T------GA-C--C-----A---A-------A---------------------------------A--A----A-T-A----T--T-T---TAA------T-T---T---T-A-------T-------------------G---TG-T--T----TAC---T------GG--T----A----T-T-A--T----A-GAAA----A---A----A---A------T-----C----C----A-A-TG--A-A--A----------CGT-------C----AA--------TT-T----G------TA--------T----TAAAT-T-TTATAA-A----AA----A---TGGTT----T-----C-A-TT----T-ATAT-TTTC-CAAAT----T----AGC--A-T-G--CC---A--GC---A----T-----T----------A--------
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gi|2 : ttaaaaggacacatggcaattt---TTCA----CT---CA-A-AAA------A----TTT----CTA-AA----A-A-------------A-----T---TT---A-T-----A--T----AT-----------C------T------AT-A---TG---------T-T---GTA-AA------T--AT---G-A--A-A-T-T---------A--G-AA--C----TT----C-C-AA----GC-A------T-------GA----A----T-G-------CA-GA----CCC---T---------T----A-----------------------T-T-----------C------T--A----ACT----T-T-----G--T---C---AA--G--G---G---G--CA-------T-------AAC----T------CT--TG-T-TA-------TT-G----C-TTCAA---A--G-G-C-A-T--------C-----A-TA---CA-T---T---A-C--A----T-----A--TT--C--ACA--G---T-AA--------TATAATT--------A-----T------GA-C--A-----A---A-------A--T---G-T-A-T-A------A------C----A--A----A-T-A----T--T-TA--C--------T-T---C---C-A-------T----------------CT-G---TT-T--C----TAG---T------GG--T----A----T-C-A--T----A-GCAGAA--A---A----A---A------A-----CAAAAC----A-A-AGC-A-A--A----------TAT-------C----AA--------TT-T----
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gi|21 : taatttaaaaggccaaaagacaattttggtaT----CTG-AA----A-A-------------T-----T--GT------------A--T----GC-----------C------T------AC-A---TT---------G-T---ACA-AA------T--AC---A-A--A-G-T-T---------G--G-AA--T----AC----G-C-CA----AT-A--------------GT----G----A-G-------CA-GA----TCT---T---------A----A------AT---T-A-C----C--T-T-----------A------T--A-G--A------C-T-----G--A---A---CA--G--T---G---G--CA-------T-------AAC----C------AT--TG-T-AA-------AT-G----G-CTGAA---A--G-G-C-A-T--------A-----C-TA---TT-T---T-----T--A----T-----A--TT--C--GTA--G---T-CA--------C----GT--------GT----T------GA-T--T-----A---T-------A--A---G-T-G-A-A------ACAAAT-C----A--A----G-T-ATTT-T--T-T---T--------T-T---T---C-A-------T----------------TATC---TT-T--T----TGT---T------GG--T----T----T-T-A--A----A-A-------A---A----A---ATGT---T-----T----T----A-A-AG--ATA--A----------TAT-------C----AA--------TA-T----A-------A--------C----T--TA-T-T----A-A------------------C----T-----T-A---------ATAT-CTTC-AAAAcggttttatacttaaatta
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gi|43 : taaattttcatgtaattctaaaaaaatgtatacccacgtgatataaatatagaaattagtatactccagtatgtacatataacatgtggaaagtatgtattacatatggaaagtatgtattacataaattaTGAT---T---TGTGTTTA----CT---TA-----T-CAAT-A----TTT----CTA-AA----A---------------------T--ATGC--A-T-----A--T----AT-----------C------T------AC-A---TG---------A-T---GCG-AA------T--AT---G-A--A---------------A--A-AA--T----AG----C-C-CC----GA-A------T-------GT----G----T-G-------AA-GA----CAC---T---------T----G--------------------G--T-T-----------CAAAATGT--C-T--T------T-T-----G--G---A---AA--A--A---G---------------T---------T----T------AT--GG-T-AC-------AT-G----G-TAATA---A--A-G-C-A-T--------A-----A-TT---TTAT---C---G-C--A----------------------G--G---C-CA--------T----TT--------T-----T------GA-C--A-----A---A-------A--A---A-C-G---A------GC-----T----A--A----A-T-G----T--T-TA--G--------T-T---T---T-A-------T----------------TA-G---TT-T--A----CAT---A------CG--T----A----C-G-A--T----G-G-------A---A----
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gi|47 : agagacattaagtaactttgatagagtttcaataaaaatagaaatTA-AA----A-A-------------T-----T--AT------------A--T----AT-----------T------G------AT-A---TG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-A--A-A-T-T---------T--A-AT--T---------------G----GT-A------T-------TG----G----T-G-------CA-GG----CCC---T---------T----AC-----AT---T-T------G--T-T------------------T--A-A--AAT----T-T-----G--G---A---AA--A--G---A---G--CA-------T-------TGT----T------CT--AA-T-AA-------AT-T----A-ATGAA---A--T-A-C-A-T--------------A-TA---GT-T---T---A-A--A----A-----A--TT--C--GCG--G---T-CATACG----T----AT--------A-----T------GA-C--A-----A---A-------A--T---T-T-G-T-A------TC-----C-------A----G-T-A----T--T-C---GAA------T-A---T---C-T-------T----------------CG-G----T-T--T----TAT---C------GG--C----A----T-G-A--A----A-G-------A---A----A---AAAG---T-----C----A----A-A-GG--G-A--A----------AAT-------C----AG--------TA-T----G------TA--------T----T--GT-C-T----A-A----at
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gi|52 : agaacatggtaattctgataaaa--T----A-A-------A---C----A---A------T-----C---------A-A-GG--A-A--A----------TAT-------C----AA--------TT-T----G------TT--------T----T--TG-T-G----A-A----GA----AA--T--GT----T-----TTA-CT----A-GTGT-TTTC-AAAAC----T----AGC--G-T-G--AT---G--CC---GCCTTC-----T----------T--------C--A--A--AC----AGTCATCCTT-----T-AGA---------G-----A-T--TAAT---TCTT------CAAA---G-----T---GTGTA-T---A
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gi|55 : tatttgttaaactatttcttgtccttT---T-T-C----G--T-T------------------T--C-T--A------T-TTTCTAA--T---A---AA--G--G---G---G--CA-------C-------AAC----T------CT--AG-A-AA-------AT-G----T-TTAAA---A--C-G-C-A-C--------C-----C-TA---TT-T---C---G-T--ACGTTT-----A--TT--A--ATT--A---C-CA--------T----CT--------A-----T------GA-C--A-----A---A-------T--A---G-T-G-T-A------A-------------------A-T-A----T--T-T---TTTTATA--T-T---T---C-A-------T----------------AA-GGGTTT-T--T----TTT---C------GG--T----A----A-A-A--T----A-G-------G---A----A---AATT---T-----C----C----A-A-GG--A-A--A----------CAT-------T----AA--------TT-T----G------TG--------TGTG-C--TT-T-T----ATA----AA----ATACT--TT----T-----C-A-CT----C-ATAT-ATT
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gi|57 : ttttaaagggacaaatggcaattttga--ATG---A-A-----A--TT---AA-----------C------T------TT-A---TT---------A-T---GTT-AG------T--AT---G-A--A-A-T-A---------A--G-AT--T----AA----C---------GT-T------T-------ATA---G----T-C-------TA--A----CCC---T---------G----A------AT---T-T-T----A--T-T---------------------------------T-G-----G--G---A---AA--G--G---C---G--CA-------T-------AGC----T------CG--GA-T-AA-------AT-G----G-TTGA-------T-G-A-A-T--------T-----G-CT---TT-T---C---A-C--A----C-----A--GT--T--GTG--G---T-CA--------C----AT--------A-----T------GG-C--A-----A---A-------A--T---G-T-G--------------------------------T-A----T--T-T---TAA------T-G---G---C-A-------T----------------CA-G---TT-T--G----TAT---a
gi|58 : ttcagggaaaatacagattaagatcatctg---T---T---TTTG----CT---TA-A--CT-T--T-A----TTT----CTG-AA----A-G----------------------AT----A-T-----A--T----AT-----------C------C------AC-A---CG---------A-T---GCA-AA------T--AT----------A-T-T---------ACTA-GA--TG---AC----T-C-CAATGCGT-A------T-------AT----G----G-A-------GA-AA----CTT---T---------T----A-----------T-T-T----A--T-T-----------C------T--A-T--T------T-T-----TT-G---A---AA--G--A---G---G--CC-------T-------AGC----A------CG--TG-A-AG-------AT-G----G-ATAAA---A--A-A--------------------G-TA---TT-----C---G-C--A----C-----A--TT--T--GTG--G---T-TA--------T----GT--------A-----T------GA-C--A-----A---A-------A--A---t
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gi|60 : gtaaactgagctttaacatattattataggttaacA-AA------T--AT---G-A--A-A-T-C---------A--G-AA--T----AT----C-C-CT----GC-A------T-------GC----A----T-G-------AA-GA----CGA---T---------T----A------AT---T-T-C----G--T-T-----------T------T--T-T--T------T-T-----G----------------------------CA-------TTT-----GAT----T------CT--TG-T-AA-------AT-A----C-TCAAA---G--G-A-C-A-C--------C-----A-T----TT-T---C---G-T--A----C-----A--GT--C---TG--G---TACA--------T----GTT-------A-----C------GG----A-----A---A-------A--G---G-T-G-T---------------T----A--A-------------------------------T-T---C---C-A-------C----------------TA-G---CT-T--T----TAT---C------TG--T----A----T-G-A--T----T-G-------A---A----A---A-----------------C----A-A-AATCC-A--A----------TAT-------A----AT--------TT-T----G------TA--------G----T--TC-T-T----A-tgaatagactagtgttattatttttcacatgtctaacaataaaaagttgacagtaaaaactgttaataactttgtaaaatgtaaggtttcacacggtaatacttggaaattaacatcttcatgcggttatatgtttataggtgtcagaattgacttaatgcattaacacaagga
gi|61 : T---G-A--A-A-C-T---------C--A-AA--T----AT----T-C-TA----TC-A------T-------GT----A----T-T-------CA-GA----TCC---T---------T----C------AT---T-T-T----G--T-TTCTTAAACTTTC------T--A-T--T------T-T-----G--G---A---AA--A--G---G---G---A-------TTT-----ATC----T------CT--GG-T-AA-------AT-G----G-CTGAACTTA--GTG-T-A-C--------A-----A-AG---TT-T---C---A-C--A----C-----A--AC--T--ATG--G---T-GA--------T----AT--------A-----T------GA-C--A-----A---C-------A--A---T-T-G-----------------C----AT-A----A-G-A----T--G-C---T--------T-T---T---A-ACTG----T----------------CA-A---TT-G--T----CAT---C------GA--T----A----
gi|62 : AAT---T---T---GTAA----CTAAGTG-A-GCTTC--T-T----TTT----TAG-AA----A-A-------------T-----T----------T-----A--T----AT-----------T------T------AC-A---TG---------A-T---CCA-AT------T--AT---A-T--T-A-T-T---------G--G-AA--T----AA----A-T-CA----GT-A------T-------GT----G----T-T-------GA-GA----ACA---T---------A----T------CT---T-T-C----A--T-T------------------T--A-T--A------T-TAC---G--T---ACATAA--G--G---G---G--CA-------T-------AAC----T------CT--TG-T-AA-------AT-G----T-TTGAA---A--T-G-C-A-T--------C-----A-TA---TT-T---C---A-C--T----T-----A--TT--C--TTC--G---T-CA--------T----AT--------G-----T------GA-C--A-----A---A-------A--A---gggccaaaa
gi|63 : A------C--AT---G-A--A-A-A-T---------C--A-AA--T----AC----C-C-CA----GT-A------TCATGGCAGT----A----T-GTAATATTCA-GA----CCC---T---------A----A------AT---T-T-C----G--T-T------------------TGAG-T--T------C-T-----G--G---A---AA--G--G---ATCTGATCA-------T-------AACTCAAT------CT--GG-T-AA-------GG-A----G-TTAAA---A-------------------C-----A-TA---CT-TTTAC---A-C--A----CAGTAAA--TT--T--GTT--GTAAT-CA--------T----CT--------T-----T------GA-C--A-----A---A-------A--AT--G-T-A-T-A------------------A--A----A-TAA----T--T-T---TAA------T-T---T---C-A-------T----------------CA-
gi|64 : ---A-T-----A--T----AT-----------C------A------AC-A---TG---------A-T---GAA-AA------T--AT---A-A--T-A-T-T---------A--A-TA--T----AC----T-C-GA----G--A------A-------AT----A---------------A-GA----TCC---T---------T----A------AT---T-T-C----G--T-T------------------T--T-T--ATT----T-T-----G--G---A---AA--G--G---G---GA-AA-------T-------AAC----C------CT--GG-T-AA-------AT---------------------G-T-A-T--------C-----A-------------C---A-C--A----T--------CT--C--TCG--G-----CA--------T----TT--------A-----A------GA-C--A-----A---A-------C--A-----T-A-TAA------AC-----C----AT-A----A-T------T--T-T---G--------T-T---T---C-G-------T----------------CA-A---CT-T--T----TAC---C------GG--T----T----T-A-A-------A-G-------A---A----
gi|65 : attctgact-T-----A--T----AT-----------C------T------TC-G---TA---------A-T---GCA-CA------C--ATAATG-A--A-A-T-T---------A--C-GA--T------------T-TA----GT-ACTTTTTT-------GT----A----T-G-------TA-AA----CCG---A---------T----A------AT---T-T-T----T--T-T-----------T------T--C-T--AA-----T-T-----AT-G---A---AA--A--G---A---T--CT-------G-------AAT----T------CT--GG-C-AA-------AT-G----A-TTGGA---A--G-G-G-A-T--------T-----T-TA---TT-T---C---T-C--A----T-----AGTTT--C--A----G---T-CA--------T----TT--------A-----T------GA-C--------A---A-------A--C---G-C-G-T---------------C----A--A----A-T-A----
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gi|72 : ctAAT---T---T---TCCATTGCCT---T-----CT-T--T-G----TTC----CTG-AA----A-A-------------T-----T--AT------------A--T----AT-----------T------A------AC-G---AA---------A-T---G---AA---------AT---G-A--A-A-T-TT--------G--A-AA--T----AC----C-A-CA----GT-A------C-------GT----G----T-A-------CA-GA----TGT---T---------T----A------AT---T-G-T----G--T-TT----------C------T--A-T--T------T-T-----G--G---A---AA--G--G---G---G--CA-------T-------TAT----T------AT--TG-T-AA-------AT-G----G-ACGAA---A--G-G-A-A-T--------A-----T-TA---TT-T---C---G-
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gi|82 : ttaaagggacacatggcaattttgttgtt-G-------CA-GA----CCC---T---------T----A------AT---T-T-T----GT-T-T-----------C------T--T-T--T------T-T-----C--G---A---GC--G--C---T---A--CA-------T-------AAG----T------CG--T--T-AA-------AA-G----G-TTAAA---G--G-A-C-A------------------------T-T---C---G-T--G----C-----A--TG--T--GTT--A---T-CA--------T----CT--------G-----T------GA-C--A-----A---C-------A--A---A-T-G-C--------AT-----T----T--T----G-T-A----T--T-A---TGA------T-T---T---C-A-------T----------------CA-G----T-T--T----AAT---C------GG--T----A----T-T-A--A----A-G-------A---AAC--A---A------C-----C----C----A-A-tatcta
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gi|86 : ---TT-T--G----TAT---C------TG--T----T----T-G-A--TTG--A-G-------A---A----A---AA-----T-----C----C----C-A-GT--A-A--A----------TAC-------C----AA--------TT-T----G------TAC-------T----T--TT-T-T----A-A----CC----G---T--TTATT-T-----T-A-CA----T-ATAT-TTTC-AAAAC----T----ATC--G-T-G--AC---G--CA---A----C-----TTGTTTTATCAA--------T--A--A--AT----A--------T-----TCAGGA-------Tacat
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gi|89 : tcgacactcgacaattgtgata-----A--C----AT-----------C------T------AC-A---TG-----------T---GTA-A-----------T---A-A--A-A-T-T---------A--G-AA--T----GC----A-C-AA----AT-A------C-------GT----G----T-A-------CA-GG----CCC---T---------T----A------AT---T-T-C----G--TAT-----------A------T--G-T--T------T-A-----G--G---A---AA--G--G-----------ATTTTTTTT-------AGC----T------TC--TG-T-AA-------AT-A----T-ATGAA---A--C-G-C-A-T--------C-----A-TT---TT-T---C---T-C--A----A-----A--TT--C--GCG--G---T-CT--------C----AT--------A-----G------GG-A--A-----A---A-------A--
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41 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|108 ): AAGTTTTAGACAGTAGTATTTAATTACTTTGAGACTGATATATCCCTATTGTTATAACTTATAAGATCATTCATAAACATAAACAACATTCATTTCAACATTGCGGTGTGTCCCTTTA
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gi|119 : T-T--T----TAT---C------GG--T----T----A-G-A--T----A-G-------A---A----A---A------------A----C----AA-T--C--A-A--ATCAT------TAT-------C-AA--------TG-T----G------TAC-------T-----T------TT--T-T---A----A-A---T--T---T----TATA--TA-TA----C-ATAT-TTTTAAAAAC----T----ATC--G-T-G--GC---ata
gi|12 : ---T---T---TTCG----C-----AGA-ATT-C--T-A----TTT----CCG-AA----A-A-------------C----------G---A-T-----A--T----AT-----------C------C------AC-A---TG---------A-T---GCT-AT------T--AT---G-A--A-A-T-TT--------G--A-AA--G----GC----C-C-AA----GT-A------T-------GT----T----T-G-------CA-GA----CCT---T---------T----A------AT---T-G-T----G--T-T-----------TA-----T--A-G-T---T-T---G--T-A---AT-A--G---A---G--CA-------T-------CAT----C------CT--TG-T-AA-------AC-T----G-ATAAA---C--A-T-T-A-T--------T-----A-TA---TT-T---C---G-C--C----T-----G--TT--tgaactagttt
gi|120 : gggacacactgcattttcgataca---T---TTAA----CT------A-ACA-C--T-A----TTT----CTG-TG----A-G-------------T-----T--AT------------A--T----AT-----------C------T------AT-G---TG---------G-T---ACC-AA------T--AT---------------------------A-AA--T----AA----C-C-TT----GT-A------T-------GT----A----T-G-------CA-GA----aacgttatatttgagcggcattattgtaaatatcaagtggaatgtgtgtattttaaagatttattatacatatttacaaacctggggttatttcttcggtagaatataaatgtaaacaacttcttaaatattgagattccgagaatagtacttgaataaatatttaatatgatacgttgtcaataattggtataaaacttgatttgatatgtaaa
gi|122 : gacaaacgacaattaatggacaa--T-C--------T------T-T---T---C-G-------C----------------TG-G---TC-T--T----TAT---C------GG--T----A----T-G-A--T----T-A-------A---A----A---T------T-----C----CA---AA-A--G--A-G--G----------TAT-------G-AA--------TT-C----G------CA--------T-----T------TT--TGT---A-A-GA-A---TA-T---A----T-----TA-CT----C-ATAT-TTGC-AAAAC----
gi|123 : aTG--G---A-TA--------T----CT--------G-----C------GA-C--A-----AT--A-------A--A---G-T-A---A------AC-------------A----A-T-A----T--T-T--------CAA----T-T---T---C-A-------T----------------CA-T---TT-C--T----TAT---T------GG--T----T----T-G-A--TA---A-G-------A---A----A---A------
gi|124 : gcatccaatgtcaacaatgttC----C------CT--TG-T-AA-------AT-G----A-TAGGA---A--G-G-A-A-T--------C-----A-TA---TA-T---C---T-C--A----T-----A--TT--C--GTG--G---T-AA--------T----AT--------C-----T------GA-TA-A-----A---A-------A--A---A-T-G-T-A------Aaaat
gi|128 : ---TTTA----CT---TA-A--------C-A----TTT----CTG-AA----A-A-------------C-----T--AT------T--------C----AT-----------T------T------AT-A---AG---------G-T---TCA-AA------T--AT---C-A--A-A-T-T---------G--A-AA--T----AT----T-C-CA----GT-A------T-------GT----A----T-G-------AA-AA----CCCA--T---------T----A-----------T-T-C----G--T-T-----------tgtatttataaatattggtatcagtg
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gi|132 : AAT---T---TAAACTCT----CT---TA-A--CT-A--T-A----TTT----CTG-A---------------------------T--ATG---A-TTA---A--T----AT-----------C------T------G--A---TT---------A-T---GCA-AA------T--GT---G-A--A-A-T-T---------T--G-AA--A----AC----C-C-acatgtaagtagctcaatacgagtaaacgttcatatgcgtcaatatagatttgacgcatgcaacataagtaaaaatcgactaaaatattgctttgcgt
gi|133 : cacggtggttttgataT---T---T---CTCA----T-------A-ACT-C--T-G----TGT----CTG-AA----A-A-------------T-----T--------A-T-----A--T----AT-----------T--------------------TG---------A-T---GCA-AATAAATGT--AT---G-A--A-A-T-
gi|134 : taaaaaggacacttggcaattttgattcat---T-T---A--G-T---AA-G--G---G---G--CA-------T-------AAC----A------CT--TG-T-AA-------AT-G----G-TTAAA---A--T-G-T-A-C--------C-----A-TG---TT-T---T---A-C--A----T-----A--TT--C--TTG--C---T-CA--------T---------------------------------------------------A--A---A-T-G-T-A------A------T----A--A----A-T-A----T--T-T--------
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gi|142 : aagtgacacatggcaatt-CA----GT-G------T-------TT----A----T-T-------CC-GA----CCC---T---------T----G-------T---G-T---------T-T-----------C------T--A-T-A---T-T---G--ATA---AA-G--G---G---A--CA-------T-------TAC----T------CT--TG-T----------AT-G----GCTTGAA---ataatgagcctaacatcacttgttttataaaaaatgttaataatttctgaaatatgaaatttcatatagtaatacttagatattattatctgcatttggttgtatgttcataaatgtaaagattgatttgatgcccaaaacttgagaaaaataagatttccacattgccatttgtc
gi|144 : aatagat-----C----A--A----A-T-A----T--C-TTA------T------T-T---T---C-A-------C----------------CA-G---GT-T--T----ATT---T------GG--C----A----T-G-A--C----A-G-------AT--A----A---AGAT---T-----C----C----AA-A--G--A-A--A----------TAC-------C-A
gi|149 : gtttga-G--G--A-A--A----------TGT-------A-AA--------TT-A----A------TC--------T-----T------TC--T-A---A-A-GA-G---T--T---T----T-----TA-CT----T-GTTT-TTTC-AAAAC----T----AGC--G-T-G--AC---G--g
gi|15 : TAAT---T---T---TTCA----CT---TA-A-ACT-C--T-A----TTT----CTT-AA----A-A-------------T-----T--ATG---A-T-----A--T----AT-----------C------T------AC-A---CG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-A--A-A-G-T---------A--A-AA--T----AT----T-C-GA----GT-T------T-------GT----G----T-G-------CA-TA----TTC---T---------T----A------AT---T-T-C----GA-T-T-----------C------T--T-TAA---T-T---G--G-A---AA-G--G---G---G--CT-------T-------AAC----T------CT--GG-T-AA-------AT-G----G-TTGAA---A--G-G-C-A-T--------C-----A-TA---GT-T---C---G-C--C----T-----G--TA--C--GCG--A---T-CA--------T----GT--------T-----C------GA-C--A-----A---A-------A--G---G-T-G-T-A------ACTGTTGC----A--A----A-T-AATCCC--T-T--------T------T-T---T---C-A-------T----------------CC-G---TT-T--C----TAT---C------AACTT----A----T-G-A--T----A-G-------A---A----A---G------T-----T----C----AA-G--A--A-A--A----------TAT-------C-CA--------TT-A----G------TA--------C-----T------GT--T-T---A-A-GA-A---T--G---T----T-----TA-CT----A-ATAT-TTTG-AAATC----A----AGC--G-T-G--AC---G--CG---A----C-----T----------A--------C--A--A--AT----A--------T-----T-AGAA-------TG-----AGT--T--T---TCTTCGGGC-AA-----A-----C---GT-TAGT---ATACAGAAATT
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gi|154 : tggT----TTG-AA----A-A-------------T-----T--AT------------A--T----AT-----------C------T------AC-A---TG---------A-T---GCA-AT------T--AT---GAA--A-A-T-T---------A--A-AA--C----A
gi|156 : ---G--G-A---AA-G--G---T---G--CC-------T-------AAC----T------CTGATG-T-A---------T-G----G-TTGAA---A--G-G-C-T-T--------C-----A-TA---TT-T---a
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gi|16 : ---GCA-AA------T--AT---G-A--A-A-T-A---------A--G-AA--T----CC----C-C-AA----GT-A------T-------GT----A----T-A-------T--GA----CCC---T---------TT---A------AT---TATGT----G--T-T-----------C------T--A-T-T---T-T---G--T-A---AA-G--G---G---G--TA-------C-------AAC----T------CT--TG-T-AA-------AT-G----G-TTGAA---A--G-G-T-AAT--------A-----A-TG---TT-T---C-----C-------T-----A--TT--C--GTG--G---T-CA--------T----TTGC------A-----T------GA-C--A-----A---A-------A--A---A-T-G-T-G-------------C----A--A------T-A----T--T-T--------T------T-T---T---C-A-------T----------------CA-G---TT-T--T----TAT---C------GG--T----A----T-G-A--T----A-G-------ATGTA----T---T------T-----C----C----AC-A--A--A-A--G----------TAT-------C-GT--------TT-T----GT-----TG--------TTGTTGT------TT--T-T---A-CTTT-A---T--T---TA---T-----TA-TT----C-ATAT-TTTC-AAACT----T----ACC--G-T-G--ACTTTA--CT---AGTT-C-----T----------A--------CATA--A--AC----A--------A-----T-AAAA-------TA-----A-A--A--A---TCTT------AAAT---A-----T---tg
gi|17 : gtaaaagagatatgcggcatgtttttttctctctaaattttcatctacatctgtttacacccgTAAG---T---T---TTCA----CT---TG-A--CA-T--T-A----TTT----CTG-AA----T-A-------------T-----C---TG---AAT-----A--T-----T-----------C------TCACTCAGC-A---TG---------G-T---TCA-GA------T--AT---A-G--A-A-T-A---------G--A-AA--T----AC----A-C-CT----GT-A------T-------GT----A----T-G-------CA-GA----CA-------------------A------ATACAT-T-C----GT-T-T-----------C------T--T-T-G---T-T---GT-T-A---AT-G--G---C---G--C--------T-------AAC----T------C---TG-TCAA-------AT-G----A-TTGAA---A--A-G-C-A-T--------C-------T----TT-T---T---G---------T-----A--TC--CGTGTG--A---T-CA--------T----TT--------A-----T------GA-C--C-----A---A-------A---------------------------------A--A----A-T-A----T--T-T--------TAA----T-T---T---T-A-------T-------------------G---TG-T--T----TAC---T------GG--T----A----T-T-A--T----A-GAAA----A---A----A---A------T-----C----C----AA-T--G--A-A--A----------CGT-------C-AA--------TT-T----G------TA--------T-----TAAA---TT--T-TATAA-A-AA-A---TGGT---T----T-----CA-TT----T-ATAT-TTTC-CAAAT----T----AGC--A-T-G--CC---A--GC---A----T-----T----------A--------
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gi|20 : tagagggacacgacatgcccattttgacaaataAGT---T---T---TTC------C---TG-A-ACT-C--T-A----TTT----CTA-GA----A---------------------T--GT----A-T-----C--T----GT-----------C------C------AT-G---TG---------A-T---GCA-AA------T--A----G-A--ATA-T-T---------T--A-AA--T----AC----C-C-CT----GT-A------T-------A-----A----A-A-------CA-GA----CCC---T---------T----T------AT---T-T-C----GT-T-T-----------C------TA-G-T-T---T-T---G--A-T---AA-G--G---A-----------------------AAC----A------TT--TA-T-AA-------AT-G----G-CCGAG---C--G-G-A-A-T--------C-----C-TC---TT-T-------A-C--A----C-----T--TT--T--GTG--G---T-CA--------A----TG--------A-----T------GA----A-----A---C-------A--A---T-C-G-T-A------A-----------A--AT---A-T-A----T--T-TCGA-----T------T-T---T-------------------------------A-G---TT-T--T----TAT---T------AG-------A----C-C-AACT----G-G-------A---AAAC-A---A------T-----C----C----TA-A--T--A-A--A----------AAT-------C-A----------T-C----A------AA--------A-----A------TG--T-T---A-A-AACA---G--T---T----T-----T---T----CGATA--TTTC-AAAGC----T----GGC--G-T-G--AC---A--CC---A----C-----caaaactaggatgacattactaattttatgcaaactgatcataaagtcttggagggtaatacttggaaatcatcttcatattgttatattttacagtgtaaaagagacgatgtgcgaacatgaggaaaaccaatttcaatatcacagcgtgtccctttaaatacaggtaagttatattattgcagtatttagtcattctctaaat
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gi|43 : taaattttcatgtaattctaaaaaaatgtatacccacgtgatataaatatagaaattagtatactccagtatgtacatataacatgtggaaagtatgtattacatatggaaagtatgtattacataaattaTGAT---T---TGTGTTTA----CT---TA-----T-CAAT-A----TTT----CTA-AA----A---------------------T--ATGC--A-T-----A--T----AT-----------C------T------AC-A---TG---------A-T---GCG-AA------T--AT---G-A--A---------------A--A-AA--T----AG----C-C-CC----GA-A------T-------GT----G----T-G-------AA-GA----CAC---T---------T----G--------------------G--T-T-----------CAAAATGT--C-T-T---T-T---G--G-A---AA-A--A---G---------------T---------T----T------AT--GG-T-AC-------AT-G----G-TAATA---A--A-G-C-A-T--------A-----A-TT---TTAT---C---G-C--A----------------------G--G---C-CA--------T----TT--------T-----T------GA-C--A-----A---A-------A--A---A-C-G---A------GC-----T----A--A----A-T-G----T--T-TA-------G------T-T---T---T-A-------T----------------TA-G---TT-T--A----CAT---A------CG--T----A----C-G-A--T----G-G-------A---A----
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gi|55 : tatttgttaaactatttcttgtccttT---T-T-C----G--T-TT----------C------T--A-T-T---T-TCTAA--T-A---AA-G--G---G---G--CA-------C-------AAC----T------CT--AG-A-AA-------AT-G----T-TTAAA---A--C-G-C-A-C--------C-----C-TA---TT-T---C---G-T--ACGTTT-----A--TT--A--ATT--A---C-CA--------T----CT--------A-----T------GA-C--A-----A---A-------T--A---G-T-G-T-A------A-------------------A-T-A----T--T-T--------TTTTATAT-T---T---C-A-------T----------------AA-GGGTTT-T--T----TTT---C------GG--T----A----A-A-A--T----A-G-------G---A----A---AATT---T-----C----C----AA-G--G--A-A--A----------CAT-------T-AA--------TT-T----G------TG--------TGTG--C------TT--T-T---ATA-AA-ATACT--T---T----T-----CA-CT----C-ATAT-ATT
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gi|57 : ttttaaagggacaaatggcaattttga--ATG---A-A-----A--TT---AA-----------C------T------TT-A---TT---------A-T---GTT-AG------T--AT---G-A--A-A-T-A---------A--G-AT--T----AA----C---------GT-T------T-------ATA---G----T-C-------TA--A----CCC---T---------G----A------AT---T-T------------------------------T--A-T-T---T-G---G--G-A---AA-G--G---C---G--CA-------T-------AGC----T------CG--GA-T-AA-------AT-G----G-TTGA-------T-G-A-A-T--------T-----G-CT---TT-T---C---A-C--A----C-----A--GT--T--GTG--G---T-CA--------C----AT--------A-----T------GG-C--A-----A---A-------A--T---G-T-G--------------------------------T-A----T--T-T--------TAA----T-G---G---C-A-------T----------------CA-G---TT-T--G----TAT---a
gi|58 : ttcagggaaaatacagattaagatcatctg---T---T---TTTG----CT---TA-A--CT-T--T-A----TTT----CTG-AA----A-G----------------------AT----A-T-----A--T----AT-----------C------C------AC-A---CG---------A-T---GCA-AA------T--AT----------A-T-T---------ACTA-GA--TG---AC----T-C-CAATGCGT-A------T-------AT----G----G-A-------GA-AA----CTT---T---------T----A-----------T-T-T----A--T-T-----------C------T--A-T-T---T-T---TT-G-A---AA-G--A---G---G--CC-------T-------AGC----A------CG--TG-A-AG-------AT-G----G-ATAAA---A--A-A--------------------G-TA---TT-----C---G-C--A----C-----A--TT--T--GTG--G---T-TA--------T----GT--------A-----T------GA-C--A-----A---A-------A--A---t
gi|59 : ggacgcactcaaaatttgatacaT---T-T-C----T--T-T-----------G------T--C-C-T---T-T---G--G-T---AA-G--G---G---G--CT-------T-------AAC----T------CT--GG-T-AA-------TT-G----C-TTGAA---G--T-G-C-A-T--------CCTACAA-TA---TT-T---C---A-C--A----T-----G---------------------A--------C----AC--------A-----T------GA-A--A-----A---AG------A--A---G-T---T-A-------------C----A--AT---G-T-A----T--T-TTATATATAT------T-T---T---C-A-------T----------------TA-----------------AT---T------GG--T----A----T-G-A--T------T-------A---A----A---A------T-----T----TTCAAAA-A--A--A-A--A----------TGT-------C-AA--------TT-
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gi|60 : gtaaactgagctttaacatattattataggttaacA-AA------T--AT---G-A--A-A-T-C---------A--G-AA--T----AT----C-C-CT----GC-A------T-------GC----A----T-G-------AA-GA----CGA---T---------T----A------AT---T-T-C----G--T-T-----------T------T--T-T-T---T-T--------------------------G--CATT-----T-------GAT----T------CT--TG-T-AA-------AT-A----C-TCAAA---G--G-A-C-A-C--------C-----A-T----TT-T---C---G-T--A----C-----A--GT--C---TG--G---TACA--------TG---TT--------A-----C------GG----A-----A---A-------A--G---G-T-G-T---------------T----A--A----------------------------------T-T---C---C-A-------C----------------TA-G---CT-T--T----TAT---C------TG--T----A----T-G-A--T----T-G-------A---A----A---A-----------------C----AA-A--ATCC-A--A----------TAT-------A-AT--------TT-T----G------TA--------G-----T------TC--T-T---A-tgaatagactagtgttattatttttcacatgtctaacaataaaaagttgacagtaaaaactgttaataactttgtaaaatgtaaggtttcacacggtaatacttggaaattaacatcttcatgcggttatatgtttataggtgtcagaattgacttaatgcattaacacaagga
gi|61 : T---G-A--A-A-C-T---------C--A-AA--T----AT----T-C-TA----TC-A------T-------GT----A----T-T-------CA-GA----TCC---T---------T----C------AT---T-T-T----G--T-TTCTTAAACTTTC------T--A-T-T---T-T---G--G-A---AA-A--G---G---G---A-------TTT-----ATC----T------CT--GG-T-AA-------AT-G----G-CTGAACTTA--GTG-T-A-C--------A-----A-AG---TT-T---C---A-C--A----C-----A--AC--T--ATG--G---T-GA--------T----AT--------A-----T------GA-C--A-----A---C-------A--A---T-T-G-----------------C----AT-A----A-G-A----T--G-C--------T------T-T---T---A-ACTG----T----------------CA-A---TT-G--T----CAT---C------GA--T----A----
gi|62 : AAT---T---T---GTAA----CTAAGTG-A-GCTTC--T-T----TTT----TAG-AA----A-A-------------T-----T----------T-----A--T----AT-----------T------T------AC-A---TG---------A-T---CCA-AT------T--AT---A-T--T-A-T-T---------G--G-AA--T----AA----A-T-CA----GT-A------T-------GT----G----T-T-------GA-GA----ACA---T---------A----T------CT---T-T-C----A--T-T------------------T--A-T-A---T-TAC-G--T-ACATAA-G--G---G---G--CA-------T-------AAC----T------CT--TG-T-AA-------AT-G----T-TTGAA---A--T-G-C-A-T--------C-----A-TA---TT-T---C---A-C--T----T-----A--TT--C--TTC--G---T-CA--------T----AT--------G-----T------GA-C--A-----A---A-------A--A---gggccaaaa
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gi|64 : ---A-T-----A--T----AT-----------C------A------AC-A---TG---------A-T---GAA-AA------T--AT---A-A--T-A-T-T---------A--A-TA--T----AC----T-C-GA----G--A------A-------AT----A---------------A-GA----TCC---T---------T----A------AT---T-T-C----GT-T-T-----------T------T--A-T-T---T-T---G--G-A---AA-G--G---G---GA-AA-------T-------AAC----C------CT--GG-T-AA-------AT---------------------G-T-A-T--------C-----A-------------C---A-C--A----T--------CT--C--TCG--G-----CA--------T----TT--------A-----A------GA-C--A-----A---A-------C--A-----T-A-TAA------AC-----C----AT-A----A-T------T--T-T--------G------T-T---T---C-G-------T----------------CA-A---CT-T--T----TAC---C------GG--T----T----T-A-A-------A-G-------A---A----
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gi|71 : T--TG-T-AA-------AT-A----G-TTAAA---T--A-G-A-A-T--------C-----G-TT---CT-T---T---G-T--A----T-----G--TT--G--GCT--G---T-AA--------T----AT--------G-----T------GG-C--G-----A---G-------A--A---GGT-A-T-A------AC----------A--A----A-T-A----T--TATA-------T------T-T---T---C-A-------C----------------CA-G---TA-T--G----AAT---T------GG--T----A----T-A-A--T----A-G-------G---A----A---AAAGT--T-----C----C----AA-G--A--A-A--A----------TAT-------C-AA--------TT-C----G------TA--------T-----C------TTAGC-G---A-T-GA-A---T--C---T----T-----TA-CT----C-ATAT-TTTC-AAAAC----aagttaagctgacttcaatattgtcatgtacttttttaacatcaccagcattgataaataaataatc
gi|72 : ctAAT---T---T---TCCATTGCCT---T-----CT-T--T-G----TTC----CTG-AA----A-A-------------T-----T--AT------------A--T----AT-----------T------A------AC-G---AA---------A-T---G---AA---------AT---G-A--A-A-T-TT--------G--A-AA--T----AC----C-A-CA----GT-A------C-------GT----G----T-A-------CA-GA----TGT---T---------T----A------AT---T-G-T----G--T-TT----------C------T--A-T-T---T-T---G--G-A---AA-G--G---G---G--CA-------T-------TAT----T------AT--TG-T-AA-------AT-G----G-ACGAA---A--G-G-A-A-T--------A-----T-TA---TT-T---C---G-
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gi|82 : ttaaagggacacatggcaattttgttgtt-G-------CA-GA----CCC---T---------T----A------AT---T-T-T----GT-T-T-----------C------T--T-T-T---T-T---C--G-A---GC-G--C---T---A--CA-------T-------AAG----T------CG--T--T-AA-------AA-G----G-TTAAA---G--G-A-C-A------------------------T-T---C---G-T--G----C-----A--TG--T--GTT--A---T-CA--------T----CT--------G-----T------GA-C--A-----A---C-------A--A---A-T-G-C--------AT-----T----T--T----G-T-A----T--T-A--------TGA----T-T---T---C-A-------T----------------CA-G----T-T--T----AAT---C------GG--T----A----T-T-A--A----A-G-------A---AAC--A---A------C-----C----C----AA-tatcta
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gi|86 : ---TT-T--G----TAT---C------TG--T----T----T-G-A--TTG--A-G-------A---A----A---AA-----T-----C----C----CA-G--T--A-A--A----------TAC-------C-AA--------TT-T----G------TAC-------T-----T------TT--T-T---A-A-CC-G---T--T---TATT-T-----TA-CA----T-ATAT-TTTC-AAAAC----T----ATC--G-T-G--AC---G--CA---A----C-----TTGTTTTATCAA--------T--A--A--AT----A--------T-----TCAGGA-------Tacat
gi|88 : AAT---G---T---TCCG----TT------A-ACA-C--T-A----GTT----AT--AA----A-A-------------T-----T----G---A-T-----T--T----AT-----------T------T------AC-A---TA---------A-G---GCG-AA------T--TT---A-A--A-A-T-T---------A--A-AA--T----A---------AA----AT-A------T-------GC----A----A-C-------CA-GA----CAC---T---------T----G------AT---T-T-T----GC-T-T-----------C------T--G-G-T---T-T---G--A-A---AA-G--G---G---G--CG-------T-------TAC----T------CT--TC-T-AA-------taattaaacaatattgagtttcaat
gi|89 : tcgacactcgacaattgtgata-----A--C----AT-----------C------T------AC-A---TG-----------T---GTA-A-----------T---A-A--A-A-T-T---------A--G-AA--T----GC----A-C-AA----AT-A------C-------GT----G----T-A-------CA-GG----CCC---T---------T----A------AT---T-T-C----G--TAT-----------A------T--G-T-T---T-A---G--G-A---AA-G--G-----------ATTTTTTTT-------AGC----T------TC--TG-T-AA-------AT-A----T-ATGAA---A--C-G-C-A-T--------C-----A-TT---TT-T---C---T-C--A----A-----A--TT--C--GCG--G---T-CT--------C----AT--------A-----G------GG-A--A-----A---A-------A--
gi|9 : ---T---TTCA----CC---TG-A--TT-C--T-A----TTT----CTG-AA----A-G-------------T-----T--------G-T-----C--T----AT-----------T------T------AC-A---TGGTC------G-T---ACA-AA------T--AT---G-A--A-A-C-T---------A--A-AA--C----AT----C-C-CA----GT-A-------------------------T-G-------CA-GA----CAA---T---------T----A------AT---T-C-C----GT-T-T-----------C------T--A-A-T---T-T---T--C-C---AA-G--G---G---A--AA-------T-------TCC----T------CA--TA-T-AA-------AT-C----A-ATGAA---A--A-G-C-A-T--------C-----A----------------------A----A-----A--TT--C--GTG--G---T-GA--------A----TC--------A-----TA-----GA-T--A-----A---A-------A--G---G-T-G-T-A------AT-----A----AAGA----A-A-A-------------------------------T---C-A-------T----------------CA-G----T-T--T----TA-----------GG--T----A----T-G-T--T----A-G-------AT--A----T---ACT----T-----C----C----AA-A--G--A-A--A----------TAT-------C-AA--------TG-T----T------TA--------T-----T------TT--T-T---A-C-GA-A---C--T---T----C-----TA-CT----T-GTAT-TTTT-CAAAT----T----A----A-T-G--AT---T--CCTTAA----A-----T----------A--------T--A--A--GT----T--------TGCAGGT-AGAA-------AT-----A-C--T--TGGATA-T------AAAT---A-----T---GTATG-T---ATATAG
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gi|99 : gacacaggcacttttcaTAAT---G---T---TTTA----CT---GA-ACACT-T--T------TGT----CTG-AA----ATG-------------T-----T--ATG-----T-----A-------AT------------------T------GC-A---TG---------A-T---GCA-AAA-----T--AC-----A--A-G-T-T---------A--G-A---C----AA----C-C-TA----AT-A------T-------GT----G----T-G-------CA-GA----CTC---T---------T----A------AC---T-T-T----G--T-T------------------T--C-T-T---T-T---t
41 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|111 : atataaattatatatctacatgaatatgaaattaaaaaatattctagtgagtttacagaccctttgttaatttcgttatctattttcgaaagtggggtacaactcaggtaaatgtttgaacggcatcctgtttcccaccataTAAT---T---T---TGCT----CT---TA-ACACT-T--C-AAAAGTCTAAAGTTG-AA----A-A-------------C-----T--AT----A-T-----A--A----AT-----------C------G------AC-A---TG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-AT-A-ACT-T---------A--A-GA--T----AA----C-C-CA----atcaaaattagtttttatactaataaaataaactataacagttaagaaattctgaagtttcaaatagtatacaatacttaaagattgatatctccccatagttatacactcataaatgtgaagattggttgagtaaaatcgatttcccattgccgcgtgtccctttaagaac
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gi|119 : T-T--T----TAT---C------GG--T----T----A-G-A--T----A-G-------A---A----A---A------------A----C----AA-T--C--A-A--ATCAT------TAT-------C-AA--------TG-T----G------TAC-------T-----T------TT--T-T---A----A-A---T--T---T----TATA--TA-TA----C-ATAT-TTTTAAAAAC----T----ATC--G-T-G--GC---ata
gi|12 : ---T---T---TTCG----C-----AGA-ATT-C--T-A----TTT----CCG-AA----A-A-------------C----------G---A-T-----A--T----AT-----------C------C------AC-A---TG---------A-T---GCT-AT------T--AT---G-A--A-A-T-TT--------G--A-AA--G----GC----C-C-AA----GT-A------T-------GT----T----T-G-------CA-GA----CCT---T---------T----A------AT---T-G----T----G--T--T-----------TA-----T---A-G---T--TT---G------T-A---ATA--GA---G--CA-------T-------CAT----C------CT--TG-T-AA-------AC-T----G-ATAAA---CA-T-T-A-T--------T-----A---TA-TT-T---C---G-C--C----T-----G--TT--tgaactagttt
gi|120 : gggacacactgcattttcgataca---T---TTAA----CT------A-ACA-C--T-A----TTT----CTG-TG----A-G-------------T-----T--AT------------A--T----AT-----------C------T------AT-G---TG---------G-T---ACC-AA------T--AT---------------------------A-AA--T----AA----C-C-TT----GT-A------T-------GT----A----T-G-------CA-GA----aacgttatatttgagcggcattattgtaaatatcaagtggaatgtgtgtattttaaagatttattatacatatttacaaacctggggttatttcttcggtagaatataaatgtaaacaacttcttaaatattgagattccgagaatagtacttgaataaatatttaatatgatacgttgtcaataattggtataaaacttgatttgatatgtaaa
gi|122 : gacaaacgacaattaatggacaa--T-C---T--------T-T---T---C-G-------C----------------TG-G---TC-T--T----TAT---C------GG--T----A----T-G-A--T----T-A-------A---A----A---T------T-----C----CA---AA-A--G--A-G--G----------TAT-------G-AA--------TT-C----G------CA--------T-----T------TT--TGT---A-A-GA-A---TA-T---A----T-----TA-CT----C-ATAT-TTGC-AAAAC----
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gi|124 : gcatccaatgtcaacaatgttC----C------CT--TG-T-AA-------AT-G----A-TAGGA---AG-G-A-A-T--------C-----A---TA-TA-T---C---T-C--A----T-----A--TT--C--GTG--G---T-AA--------T----AT--------C-----T------GA-TA-A-----A-A-------A--A---A-T-G-T-A------Aaaat
gi|128 : ---TTTA----CT---TA-A--------C-A----TTT----CTG-AA----A-A-------------C-----T--AT------T--------C----AT-----------T------T------AT-A---AG---------G-T---TCA-AA------T--AT---C-A--A-A-T-T---------G--A-AA--T----AT----T-C-CA----GT-A------T-------GT----A----T-G-------AA-AA----CCCA--T---------T----A-----------T-T----C----G--T--T-----------tgtatttataaatattggtatcagtg
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gi|134 : taaaaaggacacttggcaattttgattcat--TT---A------G-T---AAG--GG---G--CA-------T-------AAC----A------CT--TG-T-AA-------AT-G----G-TTAAA---AT-G-T-A-C--------C-----A---TG-TT-T---T---A-C--A----T-----A--TT--C--TTG--C---T-CA--------T-------------------------------------------------A--A---A-T-G-T-A------A------T----A--A----A-T-A----T--T-T---
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gi|142 : aagtgacacatggcaatt-CA----GT-G------T-------TT----A----T-T-------CC-GA----CCC---T---------T----G-------T---G-T------------T--T-----------C------T---A-T---A--TT---G------ATA---AAG--GG---A--CA-------T-------TAC----T------CT--TG-T----------AT-G----GCTTGAA---ataatgagcctaacatcacttgttttataaaaaatgttaataatttctgaaatatgaaatttcatatagtaatacttagatattattatctgcatttggttgtatgttcataaatgtaaagattgatttgatgcccaaaacttgagaaaaataagatttccacattgccatttgtc
gi|144 : aatagat-----C----A--A----A-T-A----T--C-TTA-T--------T-T---T---C-A-------C----------------CA-G---GT-T--T----ATT---T------GG--C----A----T-G-A--C----A-G-------AT--A----A---AGAT---T-----C----C----AA-A--G--A-A--A----------TAC-------C-A
gi|149 : gtttga-G--G--A-A--A----------TGT-------A-AA--------TT-A----A------TC--------T-----T------TC--T-A---A-A-GA-G---T--T---T----T-----TA-CT----T-GTTT-TTTC-AAAAC----T----AGC--G-T-G--AC---G--g
gi|15 : TAAT---T---T---TTCA----CT---TA-A-ACT-C--T-A----TTT----CTT-AA----A-A-------------T-----T--ATG---A-T-----A--T----AT-----------C------T------AC-A---CG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-A--A-A-G-T---------A--A-AA--T----AT----T-C-GA----GT-T------T-------GT----G----T-G-------CA-TA----TTC---T---------T----A------AT---T-T----C----GA-T--T-----------C------T-----T---TAATT---G------G-A---AAG--GG---G--CT-------T-------AAC----T------CT--GG-T-AA-------AT-G----G-TTGAA---AG-G-C-A-T--------C-----A---TA-GT-T---C---G-C--C----T-----G--TA--C--GCG--A---T-CA--------T----GT--------T-----C------GA-C--A-----A-A-------A--G---G-T-G-T-A------ACTGTTGC----A--A----A-T-AATCCC--T-T---T--------T-T---T---C-A-------T----------------CC-G---TT-T--C----TAT---C------AACTT----A----T-G-A--T----A-G-------A---A----A---G------T-----T----C----AA-G--A--A-A--A----------TAT-------C-CA--------TT-A----G------TA--------C-----T------GT--T-T---A-A-GA-A---T--G---T----T-----TA-CT----A-ATAT-TTTG-AAATC----A----AGC--G-T-G--AC---G--CG---A----C-----T----------A--------C--A--A--AT----A--------T-----T-AGAA-------TG-----AGT--T--T---TCTTCGGGC-AA-----A-----C---GT-TAGT---ATACAGAAATT
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gi|154 : tggT----TTG-AA----A-A-------------T-----T--AT------------A--T----AT-----------C------T------AC-A---TG---------A-T---GCA-AT------T--AT---GAA--A-A-T-T---------A--A-AA--C----A
gi|156 : ---G------G-A---AAG--GT---G--CC-------T-------AAC----T------CTGATG-T-A---------T-G----G-TTGAA---AG-G-C-T-T--------C-----A---TA-TT-T---a
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gi|17 : gtaaaagagatatgcggcatgtttttttctctctaaattttcatctacatctgtttacacccgTAAG---T---T---TTCA----CT---TG-A--CA-T--T-A----TTT----CTG-AA----T-A-------------T-----C---TG---AAT-----A--T-----T-----------C------TCACTCAGC-A---TG---------G-T---TCA-GA------T--AT---A-G--A-A-T-A---------G--A-AA--T----AC----A-C-CT----GT-A------T-------GT----A----T-G-------CA-GA----CA-------------------A------ATACAT-T----C----GT-T--T-----------C------T---T-T---G--TT---GT-----T-A---ATG--GC---G--C--------T-------AAC----T------C---TG-TCAA-------AT-G----A-TTGAA---AA-G-C-A-T--------C---------T--TT-T---T---G---------T-----A--TC--CGTGTG--A---T-CA--------T----TT--------A-----T------GA-C--C-----A-A-------A---------------------------------A--A----A-T-A----T--T-T---TAA------T-T---T---T-A-------T-------------------G---TG-T--T----TAC---T------GG--T----A----T-T-A--T----A-GAAA----A---A----A---A------T-----C----C----AA-T--G--A-A--A----------CGT-------C-AA--------TT-T----G------TA--------T-----TAAA---TT--T-TATAA-A-AA-A---TGGT---T----T-----CA-TT----T-ATAT-TTTC-CAAAT----T----AGC--A-T-G--CC---A--GC---A----T-----T----------A--------
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gi|2 : ttaaaaggacacatggcaattt---TTCA----CT---CA-A-AAA------A----TTT----CTA-AA----A-A-------------A-----T---TT---A-T-----A--T----AT-----------C------T------AT-A---TG---------T-T---GTA-AA------T--AT---G-A--A-A-T-T---------A--G-AA--C----TT----C-C-AA----GC-A------T-------GA----A----T-G-------CA-GA----CCC---T---------T----A--------------------------T--T-----------C------TA--A-C---T--TT---G------T-C---AAG--GG---G--CA-------T-------AAC----T------CT--TG-T-TA-------TT-G----C-TTCAA---AG-G-C-A-T--------C-----A---TA-CA-T---T---A-C--A----T-----A--TT--C--ACA--G---T-AA--------TATAATT--------A-----T------GA-C--A-----A-A-------A--T---G-T-A-T-A------A------C----A--A----A-T-A----T--T-TA--C--------T-T---C---C-A-------T----------------CT-G---TT-T--C----TAG---T------GG--T----A----T-C-A--T----A-GCAGAA--A---A----A---A------A-----CAAAAC----AA-A--GC-A-A--A----------TAT-------C-AA--------TT-T----
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gi|21 : taatttaaaaggccaaaagacaattttggtaT----CTG-AA----A-A-------------T-----T--GT------------A--T----GC-----------C------T------AC-A---TT---------G-T---ACA-AA------T--AC---A-A--A-G-T-T---------G--G-AA--T----AC----G-C-CA----AT-A--------------GT----G----A-G-------CA-GA----TCT---T---------A----A------AT---T-A----C----C--T--T-----------A------T---A-G---A--CT---G------A-A---CAG--TG---G--CA-------T-------AAC----C------AT--TG-T-AA-------AT-G----G-CTGAA---AG-G-C-A-T--------A-----C---TA-TT-T---T-----T--A----T-----A--TT--C--GTA--G---T-CA--------C----GT--------GT----T------GA-T--T-----A-T-------A--A---G-T-G-A-A------ACAAAT-C----A--A----G-T-ATTT-T--T-T---T--------T-T---T---C-A-------T----------------TATC---TT-T--T----TGT---T------GG--T----T----T-T-A--A----A-A-------A---A----A---ATGT---T-----T----T----AA-A--G--ATA--A----------TAT-------C-AA--------TA-T----A-------A--------C-----T------TA--T-T---A-A---------------C----T-----TA---------ATAT-CTTC-AAAAcggttttatacttaaatta
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gi|55 : tatttgttaaactatttcttgtccttT---T-T----C----G--T--TT----------C------T---A-T---T--TTCTAA------T-A---AAG--GG---G--CA-------C-------AAC----T------CT--AG-A-AA-------AT-G----T-TTAAA---AC-G-C-A-C--------C-----C---TA-TT-T---C---G-T--ACGTTT-----A--TT--A--ATT--A---C-CA--------T----CT--------A-----T------GA-C--A-----A-A-------T--A---G-T-G-T-A------A-------------------A-T-A----T--T-T---TTTTATA--T-T---T---C-A-------T----------------AA-GGGTTT-T--T----TTT---C------GG--T----A----A-A-A--T----A-G-------G---A----A---AATT---T-----C----C----AA-G--G--A-A--A----------CAT-------T-AA--------TT-T----G------TG--------TGTG--C------TT--T-T---ATA-AA-ATACT--T---T----T-----CA-CT----C-ATAT-ATT
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gi|57 : ttttaaagggacaaatggcaattttga--ATG---A-A-----A--TT---AA-----------C------T------TT-A---TT---------A-T---GTT-AG------T--AT---G-A--A-A-T-A---------A--G-AT--T----AA----C---------GT-T------T-------ATA---G----T-C-------TA--A----CCC---T---------G----A------AT---T-T----------------------------------T---A-T---T--TG---G------G-A---AAG--GC---G--CA-------T-------AGC----T------CG--GA-T-AA-------AT-G----G-TTG-----AT-G-A-A-T--------T-----G---CT-TT-T---C---A-C--A----C-----A--GT--T--GTG--G---T-CA--------C----AT--------A-----T------GG-C--A-----A-A-------A--T---G-T-G--------------------------------T-A----T--T-T---TAA------T-G---G---C-A-------T----------------CA-G---TT-T--G----TAT---a
gi|58 : ttcagggaaaatacagattaagatcatctg---T---T---TTTG----CT---TA-A--CT-T--T-A----TTT----CTG-AA----A-G----------------------AT----A-T-----A--T----AT-----------C------C------AC-A---CG---------A-T---GCA-AA------T--AT----------A-T-T---------ACTA-GA--TG---AC----T-C-CAATGCGT-A------T-------AT----G----G-A-------GA-AA----CTT---T---------T----A-----------T-T----T----A--T--T-----------C------T---A-T---T--TT---TT-----G-A---AAG--AG---G--CC-------T-------AGC----A------CG--TG-A-AG-------AT-G----G-ATAAA---AA-A--------------------G---TA-TT-----C---G-C--A----C-----A--TT--T--GTG--G---T-TA--------T----GT--------A-----T------GA-C--A-----A-A-------A--A---t
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gi|72 : ctAAT---T---T---TCCATTGCCT---T-----CT-T--T-G----TTC----CTG-AA----A-A-------------T-----T--AT------------A--T----AT-----------T------A------AC-G---AA---------A-T---G---AA---------AT---G-A--A-A-T-TT--------G--A-AA--T----AC----C-A-CA----GT-A------C-------GT----G----T-A-------CA-GA----TGT---T---------T----A------AT---T-G----T----G--T--TT----------C------T---A-T---T--TT---G------G-A---AAG--GG---G--CA-------T-------TAT----T------AT--TG-T-AA-------AT-G----G-ACGAA---AG-G-A-A-T--------A-----T---TA-TT-T---C---G-
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gi|81 : agggacaaataatcagcaacttagaataattatctT---T---T---TGTA----AT---CA-A-AGT----T-A----TTA----TTG-AA----A-AA------------T-----T----------T-----A--T----TT-----------C------T------AC-A---TG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-A--A-T-T-T---------A--A-A-------------------A----GT-A------C--------T----G----TAG-------TA-GA----CCA---T---------T----A------AT---T-T----A----GT-T--T-----------C------T---G-T---T--TC---T------G-A---GAC--GG---G--CA-------T-------CAG----T------CT--TA-T-
gi|82 : ttaaagggacacatggcaattttgttgtt-G-------CA-GA----CCC---T---------T----A------AT---T-T----T----GT-T--T-----------C------T---T-T---T--TT---C------G-A---GCG--CT---A--CA-------T-------AAG----T------CG--T--T-AA-------AA-G----G-TTAAA---GG-A-C-A------------------------T-T---C---G-T--G----C-----A--TG--T--GTT--A---T-CA--------T----CT--------G-----T------GA-C--A-----A-C-------A--A---A-T-G-C--------AT-----T----T--T----G-T-A----T--T-A---TGA------T-T---T---C-A-------T----------------CA-G----T-T--T----AAT---C------GG--T----A----T-T-A--A----A-G-------A---AAC--A---A------C-----C----C----AA-tatcta
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gi|84 : acatatcgcaatattgataca---T---T---TTCT----CT---GA-A-A-T-C--C-A----TTT----AAG-AA----A-A-------------C-----T---T------C-----A--T----AT-----------C------A------AC-A---CG---------A-T---GCA-AA------T--GT---G-A--A-AAT-T---------A--G-AA--C----AC----C-C-CT----GT-A------T-------GT----G----T-G-------CA-GC----TCC---A---------T----A------AT---T-T----C----T--TA-T-----------CTACATGT---A-T---T--TT---A------G-A---AAA--GG---T--CA-------T-------AAatctaaa
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gi|86 : ---TT-T--G----TAT---C------TG--T----T----T-G-A--TTG--A-G-------A---A----A---AA-----T-----C----C----CA-G--T--A-A--A----------TAC-------C-AA--------TT-T----G------TAC-------T-----T------TT--T-T---A-A-CC-G---T--T---TATT-T-----TA-CA----T-ATAT-TTTC-AAAAC----T----ATC--G-T-G--AC---G--CA---A----C-----TTGTTTTATCAA--------T--A--A--AT----A--------T-----TCAGGA-------Tacat
gi|88 : AAT---G---T---TCCG----TT------A-ACA-C--T-A----GTT----AT--AA----A-A-------------T-----T----G---A-T-----T--T----AT-----------T------T------AC-A---TA---------A-G---GCG-AA------T--TT---A-A--A-A-T-T---------A--A-AA--T----A---------AA----AT-A------T-------GC----A----A-C-------CA-GA----CAC---T---------T----G------AT---T-T----T----GC-T--T-----------C------T---G-G---T--TT---G------A-A---AAG--GG---G--CG-------T-------TAC----T------CT--TC-T-AA-------taattaaacaatattgagtttcaat
gi|89 : tcgacactcgacaattgtgata-----A--C----AT-----------C------T------AC-A---TG-----------T---GTA-A-----------T---A-A--A-A-T-T---------A--G-AA--T----GC----A-C-AA----AT-A------C-------GT----G----T-A-------CA-GG----CCC---T---------T----A------AT---T-T----C----G--TA-T-----------A------T---G-T---T--TA---G------G-A---AAG--G--------ATTTTTTTT-------AGC----T------TC--TG-T-AA-------AT-A----T-ATGAA---AC-G-C-A-T--------C-----A---TT-TT-T---C---T-C--A----A-----A--TT--C--GCG--G---T-CT--------C----AT--------A-----G------GG-A--A-----A-A-------A--
gi|9 : ---T---TTCA----CC---TG-A--TT-C--T-A----TTT----CTG-AA----A-G-------------T-----T--------G-T-----C--T----AT-----------T------T------AC-A---TGGTC------G-T---ACA-AA------T--AT---G-A--A-A-C-T---------A--A-AA--C----AT----C-C-CA----GT-A-------------------------T-G-------CA-GA----CAA---T---------T----A------AT---T-C----C----GT-T--T-----------C------T---A-A---T--TT---T------C-C---AAG--GG---A--AA-------T-------TCC----T------CA--TA-T-AA-------AT-C----A-ATGAA---AA-G-C-A-T--------C-----A----------------------A----A-----A--TT--C--GTG--G---T-GA--------A----TC--------A-----TA-----GA-T--A-----A-A-------A--G---G-T-G-T-A------AT-----A----AAGA----A-A-A----------------------------T---C-A-------T----------------CA-G----T-T--T----TA-----------GG--T----A----T-G-T--T----A-G-------AT--A----T---ACT----T-----C----C----AA-A--G--A-A--A----------TAT-------C-AA--------TG-T----T------TA--------T-----T------TT--T-T---A-C-GA-A---C--T---T----C-----TA-CT----T-GTAT-TTTT-CAAAT----T----A----A-T-G--AT---T--CCTTAA----A-----T----------A--------T--A--A--GT----T--------TGCAGGT-AGAA-------AT-----A-C--T--TGGATA-T------AAAT---A-----T---GTATG-T---ATATAG
gi|91 : gaaacagcattttctatgctg---T---T---TTTG----TC---TA-A-GCT-C--C-A----AAT----CTG-AA----A-AAAATATTTAATATC-----T--ACA---A-TTTA--A--T----AT-----------C------T------AC-A---TG---------A-T---GCA-AA------T--AC---A-A--A-A-T-T---------G--A-AA--T----AC----C-C-AG----GT-A------T-------AT----T----T-G-------CA-GA----TCA---T---------T----A------AT---T-T----T----G--T--tattacgtccgtggctgtactgatcaatctgatgtgtagaaatgagtaaaaatatttatagtgtcact
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gi|95 : tagaAAA---T---T---TTCA----CT---TG-A--CA-T--T-A----TTT----TCA-AA----A-A-------------C-----T--AT----A-T-----A--T----ATAAAATTA----CATTGTAT------AC-A---TGTAATATATTA-T---GCA-TA------T--GT---G-A--A-A-T-T---------G--G-AA--T----AC----C-C-TG----AT-A------T-------CT----A----T-G-------CA-GA----CCaa
gi|98 : taaaggtacattcagcaattttgataTAAA---T---T---TTCA----CT---TA-A--CA-C--T-A----TTT----CTG-AA----A-A-------------T-----T--ACA---A-A-----A--TTA--AT-----------C------T------AC-A---AG---------A-T---GCA-AG------T--CT---G-G--A-A-T-T---------A--G-AA--T----AT----C-C-AA----GT--------T------------------T-G-------CA-AA----TTC---T---------T----A------AT---T-T----T----G--T--T-----------C------TC--A-T---T--TT---G------G-A---AAG--
gi|99 : gacacaggcacttttcaTAAT---G---T---TTTA----CT---GA-ACACT-T--T------TGT----CTG-AA----ATG-------------T-----T--ATG-----T-----A-------AT------------------T------GC-A---TG---------A-T---GCA-AAA-----T--AC-----A--A-G-T-T---------A--G-A---C----AA----C-C-TA----AT-A------T-------GT----G----T-G-------CA-GA----CTC---T---------T----A------AC---T-T----T----G--T--T------------------T---C-T---T--TT---t
41 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|111 : atataaattatatatctacatgaatatgaaattaaaaaatattctagtgagtttacagaccctttgttaatttcgttatctattttcgaaagtggggtacaactcaggtaaatgtttgaacggcatcctgtttcccaccataTAAT---T---T---TGCT----CT---TA-ACACT-T--C-AAAAGTCTAAAGTTG-AA----A-A-------------C-----T--AT----A-T-----A--A----AT-----------C------G------AC-A---TG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-AT-A-ACT-T---------A--A-GA--T----AA----C-C-CA----atcaaaattagtttttatactaataaaataaactataacagttaagaaattctgaagtttcaaatagtatacaatacttaaagattgatatctccccatagttatacactcataaatgtgaagattggttgagtaaaatcgatttcccattgccgcgtgtccctttaagaac
gi|112 : taaagtgacacatgccaatttttaTAATCAAT---T---TTCA----CT---TA-A-CCA-C----A----TTT----CTG-AA----A-A-------------C-----TA-ATT---A-T--------C----AT-----------C------T------GC-A---TG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-A--A-A-T-A---------A--A-AC--T----G-------T-TA----TT-A------T-------AT----T----T-A-------CA-GA----CTCA--T---------T----A------tc
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gi|122 : gacaaacgacaattaatggacaa--T-C---T--------T-T---T---C-G-------C----------------TG-G---TC-T--T----TAT---C------GG--T----A----T-G-A--T----T-A-------A---A----A---T------T-----C----CA---AA-A--G--A-G--G----------TAT-------G-AA--------TT-C----G------CA--------T-----T------TT--TGT---A-A-GA-A---TA-T---A----T-----TA-CT----C-ATAT-TTGC-AAAAC----
gi|123 : aTG--G---A-TA--------T----CT--------G-----C------GA-C--A-----ATA-------A--A---G-T-A---A------AC-------------A----A-T-A----T--T-T---CAA------T-T---T---C-A-------T----------------CA-T---TT-C--T----TAT---T------GG--T----T----T-G-A--TA---A-G-------A---A----A---A------
gi|124 : gcatccaatgtcaacaatgttC----C------CT--TG-T-AA-------AT-G----A-TAGGA---AG-G-A-A-T--------C-----A---TA-TA-T---C---T-C--A----T-----A--TT--C--GTG--G---T-AA--------T----AT--------C-----T------GA-TA-A-----A-A-------A--A---A-T-G-T-A------Aaaat
gi|128 : ---TTTA----CT---TA-A--------C-A----TTT----CTG-AA----A-A-------------C-----T--AT------T--------C----AT-----------T------T------AT-A---AG---------G-T---TCA-AA------T--AT---C-A--A-A-T-T---------G--A-AA--T----AT----T-C-CA----GT-A------T-------GT----A----T-G-------AA-AA----CCCA--T---------T----A-----------T-T----C----G--T--T-----------tgtatttataaatattggtatcagtg
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gi|142 : aagtgacacatggcaatt-CA----GT-G------T-------TT----A----T-T-------CC-GA----CCC---T---------T----G-------T---G-T------------T--T-----------C------T---A-T---A--TT---G------ATA---AAG--GG---A--CA-------T-------TAC----T------CT--TG-T----------AT-G----GCTTGAA---ataatgagcctaacatcacttgttttataaaaaatgttaataatttctgaaatatgaaatttcatatagtaatacttagatattattatctgcatttggttgtatgttcataaatgtaaagattgatttgatgcccaaaacttgagaaaaataagatttccacattgccatttgtc
gi|144 : aatagat-----C----A--A----A-T-A----T--C-TTA-T--------T-T---T---C-A-------C----------------CA-G---GT-T--T----ATT---T------GG--C----A----T-G-A--C----A-G-------AT--A----A---AGAT---T-----C----C----AA-A--G--A-A--A----------TAC-------C-A
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gi|15 : TAAT---T---T---TTCA----CT---TA-A-ACT-C--T-A----TTT----CTT-AA----A-A-------------T-----T--ATG---A-T-----A--T----AT-----------C------T------AC-A---CG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-A--A-A-G-T---------A--A-AA--T----AT----T-C-GA----GT-T------T-------GT----G----T-G-------CA-TA----TTC---T---------T----A------AT---T-T----C----GA-T--T-----------C------T-----T---TAATT---G------G-A---AAG--GG---G--CT-------T-------AAC----T------CT--GG-T-AA-------AT-G----G-TTGAA---AG-G-C-A-T--------C-----A---TA-GT-T---C---G-C--C----T-----G--TA--C--GCG--A---T-CA--------T----GT--------T-----C------GA-C--A-----A-A-------A--G---G-T-G-T-A------ACTGTTGC----A--A----A-T-AATCCC--T-T---T--------T-T---T---C-A-------T----------------CC-G---TT-T--C----TAT---C------AACTT----A----T-G-A--T----A-G-------A---A----A---G------T-----T----C----AA-G--A--A-A--A----------TAT-------C-CA--------TT-A----G------TA--------C-----T------GT--T-T---A-A-GA-A---T--G---T----T-----TA-CT----A-ATAT-TTTG-AAATC----A----AGC--G-T-G--AC---G--CG---A----C-----T----------A--------C--A--A--AT----A--------T-----T-AGAA-------TG-----AGT--T--T---TCTTCGGGC-AA-----A-----C---GT-TAGT---ATACAGAAATT
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gi|154 : tggT----TTG-AA----A-A-------------T-----T--AT------------A--T----AT-----------C------T------AC-A---TG---------A-T---GCA-AT------T--AT---GAA--A-A-T-T---------A--A-AA--C----A
gi|156 : ---G------G-A---AAG--GT---G--CC-------T-------AAC----T------CTGATG-T-A---------T-G----G-TTGAA---AG-G-C-T-T--------C-----A---TA-TT-T---a
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gi|17 : gtaaaagagatatgcggcatgtttttttctctctaaattttcatctacatctgtttacacccgTAAG---T---T---TTCA----CT---TG-A--CA-T--T-A----TTT----CTG-AA----T-A-------------T-----C---TG---AAT-----A--T-----T-----------C------TCACTCAGC-A---TG---------G-T---TCA-GA------T--AT---A-G--A-A-T-A---------G--A-AA--T----AC----A-C-CT----GT-A------T-------GT----A----T-G-------CA-GA----CA-------------------A------ATACAT-T----C----GT-T--T-----------C------T---T-T---G--TT---GT-----T-A---ATG--GC---G--C--------T-------AAC----T------C---TG-TCAA-------AT-G----A-TTGAA---AA-G-C-A-T--------C---------T--TT-T---T---G---------T-----A--TC--CGTGTG--A---T-CA--------T----TT--------A-----T------GA-C--C-----A-A-------A---------------------------------A--A----A-T-A----T--T-T---TAA------T-T---T---T-A-------T-------------------G---TG-T--T----TAC---T------GG--T----A----T-T-A--T----A-GAAA----A---A----A---A------T-----C----C----AA-T--G--A-A--A----------CGT-------C-AA--------TT-T----G------TA--------T-----TAAA---TT--T-TATAA-A-AA-A---TGGT---T----T-----CA-TT----T-ATAT-TTTC-CAAAT----T----AGC--A-T-G--CC---A--GC---A----T-----T----------A--------
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gi|21 : taatttaaaaggccaaaagacaattttggtaT----CTG-AA----A-A-------------T-----T--GT------------A--T----GC-----------C------T------AC-A---TT---------G-T---ACA-AA------T--AC---A-A--A-G-T-T---------G--G-AA--T----AC----G-C-CA----AT-A--------------GT----G----A-G-------CA-GA----TCT---T---------A----A------AT---T-A----C----C--T--T-----------A------T---A-G---A--CT---G------A-A---CAG--TG---G--CA-------T-------AAC----C------AT--TG-T-AA-------AT-G----G-CTGAA---AG-G-C-A-T--------A-----C---TA-TT-T---T-----T--A----T-----A--TT--C--GTA--G---T-CA--------C----GT--------GT----T------GA-T--T-----A-T-------A--A---G-T-G-A-A------ACAAAT-C----A--A----G-T-ATTT-T--T-T---T--------T-T---T---C-A-------T----------------TATC---TT-T--T----TGT---T------GG--T----T----T-T-A--A----A-A-------A---A----A---ATGT---T-----T----T----AA-A--G--ATA--A----------TAT-------C-AA--------TA-T----A-------A--------C-----T------TA--T-T---A-A---------------C----T-----TA---------ATAT-CTTC-AAAAcggttttatacttaaatta
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gi|3 : ttacagtggcgcacggcaatgtttgttata-C--T-A----TTT----CAG-AA----G---------------T-----T--A-----A-C-----A--T----TT-----------C------T------AC-A---AG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-ACAA-A-T-AGAGAAGAAAA--A-AA--C----AA----C-TGCA----GT-A------T-------GT----GCA--T-GTATT---CA-GA----CAA---T---------T----A------AT---T-T----C----C--T--T------------------T---A-T---A--CC---G------G-T---A------------CA-------TGTATTTTAAC----T------CG--TG-T-AA-------GT-A----A-CTGAA---AG-G-C-A-A--------C-----A---TA-TT-T---T---G-C--A----C-----A--TT--T--GT---A---T-CA--------T----AT--------T-----T------GA-C--A-----A-A-------A--A---C-T-G-T-A------AA-----A----A--A----A-T-A----T--T-CA--A--------T-T---T---A-A-------T----------------CA-G---AT-T--T----TAC---T------GA--T----A----C-C-A--T----A-T-------A---A----A---A------TTA---C----C----AA-G--G--A-A--A----------TA-----------------------------------TA--------T-----T------TT-------------------T--T---T----T-----CA-TT----G-ATAT-TTTC-ACAGA----T----GGC--A-A-G--AT---T--CT---A----C-----T-------------------------A--ATTTGCA--------T-----A-AAAA-------TGTTA--A-T--T--T---TTTT---------T--------------T-TA-T---A---AGAAATTattcgataataatatgtaattattcagttccacataataatacttgataat
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gi|31 : acagcatttttgaT----CTA-AA----A-C-------------C-----T--ATA---C-T-----G--------------------C------T------GC-A---TG---------A-T---GTA-TA------A--AT---G-A--T-A-T-T---------G--A-AG--C----ACGAAAC-C-TA----GT----------------------G----T-G-------CA-GA----CCT---T---------T----A------AT---T-T----C----A-----T-----------C------T---A-TA--T--TT---A------G-G---AAG--GG---G--TA-------T-------AAC----T------TT--TG-T-AG-------CT-A----G-TTGGA---CG-G-C-A-T--------C-----A---AA-CT-A---C---G-C--A----G-----G--TG--C--ACG--G---C-CA--------A----AT--------A-----T------AA-C--A-----A-T-------T--A-----T-G-T----------------------------G-T-A----T--T-T---T--------T-T---T---CTATTTTCCTT----------------TA-G---TT-T--T----TAT---T------GA--TGTCAA----T-G-A--A----A-A-------AC--A----A---A------T-----C----C----AT-T--G--A-A--ATACATGATTGTAT-------T-AA--------TT-T----G------TAT-------T-----T------TT--T-T---A-A-GA-A---T--T---T----T-----TA-CT----C-ATAT-TTT
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gi|4 : T----CTG-AA----A---------------T-----T---TG-----T-----A--T----AT-----------C------T------AC-A---C----------A-T---ATC-AA------T--AT---G-A--A-A-T-T---------G--G-AA--T----AC----C-C--A----GTTG------T-------GT----G----T-G-------CA-GATCAACCT---T---------T----A------AA---T-T----T----G--T--T-----------G------A---T-T---T--TT---G------G-A---AAA--GG---G--CA-------T-------ATT----T------GT--TG-T-AA-------AT-G----G-TTGAA---AG-G-CTA-T--------C-----A---TG-TT-T---T---G-C--A----T-----A--TT--T--GTG--G---T-----------T----TT--------A-----AAAA---GA----A-----A-A-------A--A---G-T-A---A------AC-----C----A--A----A-T-A----T--T-T---TAT------T-T---T---C-A-------T----------------TT-G---TT-T--T----TAT---C------AG--T----G----T-G-G--T----A-C-------A---A----A---AATGT--T-----CT---C----AT-T--G--A---------------TAC-------T-CA--------TT-C----A------TA--------T-----T------TT--T-A---A-A-GA-A---T--T---T----T------A-TT----C-ATAT-TTTC-AAAAC----T----AGG--A-T-G--TC---A--CC---A----C-----T----------AGTT-----C-----A--AT----A------------------AA-------TG-----T-T--TA-T---TCTTTCCTG-ACAT---T-----T---GT-AC-T---A-ATAGAGATTaaatgaatagaaactattttgttattatatttaa
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gi|55 : tatttgttaaactatttcttgtccttT---T-T----C----G--T--TT----------C------T---A-T---T--TTCTAA------T-A---AAG--GG---G--CA-------C-------AAC----T------CT--AG-A-AA-------AT-G----T-TTAAA---AC-G-C-A-C--------C-----C---TA-TT-T---C---G-T--ACGTTT-----A--TT--A--ATT--A---C-CA--------T----CT--------A-----T------GA-C--A-----A-A-------T--A---G-T-G-T-A------A-------------------A-T-A----T--T-T---TTTTATA--T-T---T---C-A-------T----------------AA-GGGTTT-T--T----TTT---C------GG--T----A----A-A-A--T----A-G-------G---A----A---AATT---T-----C----C----AA-G--G--A-A--A----------CAT-------T-AA--------TT-T----G------TG--------TGTG--C------TT--T-T---ATA-AA-ATACT--T---T----T-----CA-CT----C-ATAT-ATT
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gi|58 : ttcagggaaaatacagattaagatcatctg---T---T---TTTG----CT---TA-A--CT-T--T-A----TTT----CTG-AA----A-G----------------------AT----A-T-----A--T----AT-----------C------C------AC-A---CG---------A-T---GCA-AA------T--AT----------A-T-T---------ACTA-GA--TG---AC----T-C-CAATGCGT-A------T-------AT----G----G-A-------GA-AA----CTT---T---------T----A-----------T-T----T----A--T--T-----------C------T---A-T---T--TT---TT-----G-A---AAG--AG---G--CC-------T-------AGC----A------CG--TG-A-AG-------AT-G----G-ATAAA---AA-A--------------------G---TA-TT-----C---G-C--A----C-----A--TT--T--GTG--G---T-TA--------T----GT--------A-----T------GA-C--A-----A-A-------A--A---t
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gi|70 : tatttatattgttttaacagcttgtttaatttaaaaagacacatggcagtttttttc-T---T--TT---G------A-A---AAG--GG---G--TA-------T-------AAC----T------TT--AT-T-AA-------AT-G----G-TTGAA---AG-G-T-T-T--------C-----C---TC-TT-T---T---G-C--A----C-----A--TT--G--TTG--G---T-CA--------T----CT--------T-----T------GATC--A-----A-A-------C--A---T-T-A-T-A------A----------------------------------------------T-T---G---C-A-------T----------------CA-C---AT-T--T----TAT---C------gtagatacacagtatttgacatgattaaaacattctaaggcaatataattataaacaaattttatattagagtatttgtttgtttattcaaaacaagccgatattacactggaatttcatataaataatgtttttgttagatatacatacagagtttcagattgtaatatttggagatgactctttggttgttcatatatgtaaaaattactttgatgcacaagtggaattaaatttcgatgttgccatgtgtcc
gi|71 : tcT--TG-T-AA-------AT-A----G-TTAAA---TA-G-A-A-T--------C-----G---TT-CT-T---T---G-T--A----T-----G--TT--G--GCT--G---T-AA--------T----AT--------G-----T------GG-C--G-----A-G-------A--A---GGT-A-T-A------AC----------A--A----A-T-A----T--TATA--T--------T-T---T---C-A-------C----------------CA-G---TA-T--G----AAT---T------GG--T----A----T-A-A--T----A-G-------G---A----A---AAAGT--T-----C----C----AA-G--A--A-A--A----------TAT-------C-AA--------TT-C----G------TA--------T-----C------TTAGC-G---A-T-GA-A---T--C---T----T-----TA-CT----C-ATAT-TTTC-AAAAC----aagttaagctgacttcaatattgtcatgtacttttttaacatcaccagcattgataaataaataatc
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gi|75 : ttcatc------CT--TA-C-AA-------AA-G----G-TTGAA---CG-G-G-A-A--------C-----G---TA-GT-C---T---G-C--A----T-----T--TT--C--ATG--G---C-TA--------T----TT--------G-----T------GA-C--A-----A-T-------A--A---T-T-T-T-A------AT-----C------------A-T-A--------------------------------C-A-------T----------------CA-G---TT-T--T----GTT---C------GA--T----A----T-G-A--T----A-AT------A---ACC--A---A------T-----C----C----AA-G--A--A-AATA----------TAT-------T-AATAATAGATTT-T----G------TA--------T-----T------CT--T-T---T-A-AA-C---C--T---T----G-----TC-TT----C-ATCC-TTTC-AAA
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gi|8 : acgatT---T---T---TATA----CT---TA----TTAC--T-A----TTT----TTG-AA----A-A-------------GCAAA-T--ATACAAA-T-----G--T----GC-----------C------T------AC-A---TT---------A-T---GTA-AA------T--AA---T-A--A-A-T-A---------A--A-AA--T----AC----A-C-CA----G--A--------------GT----A----T-A-------CA-AA----CCT---T---------T----A------AT---T-C----T----GT-T--T-----------C------T---A-T---TTGTT---T------A-A---AAG--GA-------A-------A-------ACC----T------CT--TA-T-AG-------AT-A----G-TTGAA---AG-GCC-A-TTTGTTTTGT-----AC--TA-TT-T---T---G-T--A----C-----A--AT--T--TTG--A---T-CA--------T----CT--------A-----T------GA-C--A-----A-A-------A--A---G-A-G-T-A------------------A--A----A-T-G----T--T-CA--T--------T-A---T---C---------T----------------C--G---TT-T--G----TAC---C------GA--T----A----C-G-G--T----A-GT------A---A----A---ATTG---T-----C----T----AA-G--T--A-A--C----------TTT-------C-AT--------TT-T----G------TA--------G-----T------TT--T---------G-------------T----T-----TATTT----C-ATAT-TTAC-AAAAC----T----GAC--ATT-G-------G--TT---A----TA----T----------A--------A--A--A--GT----C--------T-----G-ATAA-------T------A-C--T--T---TCCT------AAAC---ATGAAGT---GT-CA-A---ATATAAATATTatttg
gi|80 : tgggg-A-ACC-T--T-A----TTT----CTG-AA----A-A-------------T-----T--AT------------A--T----AT-----------C------T------AC-A---TG---------A-T---ACA-AA------T--AG---G-A--A-A-T-T---------A--T-AA--T----AT----C-C-CA----GT-G------T-------GT----G----T-G-------TA-GA----GTG---TATGACAGCAT----A------AT---T-T----T-----------------------------T---A-T---T--TT---T------A-A---AAA--AG---A--CA-------T-------TAC----T------CT--TG-T-tggagatttttcatatttgaatataatttatgtcaaaacgtttaaaaagataagtgtaaacat
gi|81 : agggacaaataatcagcaacttagaataattatctT---T---T---TGTA----AT---CA-A-AGT----T-A----TTA----TTG-AA----A-AA------------T-----T----------T-----A--T----TT-----------C------T------AC-A---TG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-A--A-T-T-T---------A--A-A-------------------A----GT-A------C--------T----G----TAG-------TA-GA----CCA---T---------T----A------AT---T-T----A----GT-T--T-----------C------T---G-T---T--TC---T------G-A---GAC--GG---G--CA-------T-------CAG----T------CT--TA-T-
gi|82 : ttaaagggacacatggcaattttgttgtt-G-------CA-GA----CCC---T---------T----A------AT---T-T----T----GT-T--T-----------C------T---T-T---T--TT---C------G-A---GCG--CT---A--CA-------T-------AAG----T------CG--T--T-AA-------AA-G----G-TTAAA---GG-A-C-A------------------------T-T---C---G-T--G----C-----A--TG--T--GTT--A---T-CA--------T----CT--------G-----T------GA-C--A-----A-C-------A--A---A-T-G-C--------AT-----T----T--T----G-T-A----T--T-A---TGA------T-T---T---C-A-------T----------------CA-G----T-T--T----AAT---C------GG--T----A----T-T-A--A----A-G-------A---AAC--A---A------C-----C----C----AA-tatcta
gi|83 : ---T---T---TTCA-----T---CA-A-ACA-T--T-A----TT-----CTA-AA----A-A----------------------GTG-----T-----A--T----TT-----------C------T------AC-A---T----------A-G---GCA-AA------T--AT---G-G--C-A-T-T---------G--A-CT--T----AC----C-C-TA----AT-A------------------------------------A-AAT---CCC---C---------C----AGGATGCAT---T-A----C----GT-T--T-----------C------T---A-T---T--TT---G------A-A---ATG--GG---G---A-------T-------ACA----T------CT--TG-T-AG-------Actga
gi|84 : acatatcgcaatattgataca---T---T---TTCT----CT---GA-A-A-T-C--C-A----TTT----AAG-AA----A-A-------------C-----T---T------C-----A--T----AT-----------C------A------AC-A---CG---------A-T---GCA-AA------T--GT---G-A--A-AAT-T---------A--G-AA--C----AC----C-C-CT----GT-A------T-------GT----G----T-G-------CA-GC----TCC---A---------T----A------AT---T-T----C----T--TA-T-----------CTACATGT---A-T---T--TT---A------G-A---AAA--GG---T--CA-------T-------AAatctaaa
gi|85 : gaaggaacatgtggaaatgttgaaagaA------T--AC---G-A--A-A-C-T---------A--C-AA--C----AC----C-C--A----TT-G------T-------CT----A----T-G-------C-------------------------------------T---T-G----C----T--T--T-----------C------T---A-C---T--TT---A------G-A---AAG--GG---G--CA-------C-------AAC----T------CT--TG-T-AA-------AT-GCTCTC-TTTAC---AT-A-C-T-T--------C-----T---TA-TT-T---C---T-T--A----C-----A--TT--T--GAA--C---A-CA--------C----CT--------A-----T------GA-C--A-----A-A-------A--A---T-T-G-T-A------A-----------A--A----A-G-T----T--T-T---TAA------T-T---T---C-A-------T----------------
gi|86 : ---TT-T--G----TAT---C------TG--T----T----T-G-A--TTG--A-G-------A---A----A---AA-----T-----C----C----CA-G--T--A-A--A----------TAC-------C-AA--------TT-T----G------TAC-------T-----T------TT--T-T---A-A-CC-G---T--T---TATT-T-----TA-CA----T-ATAT-TTTC-AAAAC----T----ATC--G-T-G--AC---G--CA---A----C-----TTGTTTTATCAA--------T--A--A--AT----A--------T-----TCAGGA-------Tacat
gi|88 : AAT---G---T---TCCG----TT------A-ACA-C--T-A----GTT----AT--AA----A-A-------------T-----T----G---A-T-----T--T----AT-----------T------T------AC-A---TA---------A-G---GCG-AA------T--TT---A-A--A-A-T-T---------A--A-AA--T----A---------AA----AT-A------T-------GC----A----A-C-------CA-GA----CAC---T---------T----G------AT---T-T----T----GC-T--T-----------C------T---G-G---T--TT---G------A-A---AAG--GG---G--CG-------T-------TAC----T------CT--TC-T-AA-------taattaaacaatattgagtttcaat
gi|89 : tcgacactcgacaattgtgata-----A--C----AT-----------C------T------AC-A---TG-----------T---GTA-A-----------T---A-A--A-A-T-T---------A--G-AA--T----GC----A-C-AA----AT-A------C-------GT----G----T-A-------CA-GG----CCC---T---------T----A------AT---T-T----C----G--TA-T-----------A------T---G-T---T--TA---G------G-A---AAG--G--------ATTTTTTTT-------AGC----T------TC--TG-T-AA-------AT-A----T-ATGAA---AC-G-C-A-T--------C-----A---TT-TT-T---C---T-C--A----A-----A--TT--C--GCG--G---T-CT--------C----AT--------A-----G------GG-A--A-----A-A-------A--
gi|9 : ---T---TTCA----CC---TG-A--TT-C--T-A----TTT----CTG-AA----A-G-------------T-----T--------G-T-----C--T----AT-----------T------T------AC-A---TGGTC------G-T---ACA-AA------T--AT---G-A--A-A-C-T---------A--A-AA--C----AT----C-C-CA----GT-A-------------------------T-G-------CA-GA----CAA---T---------T----A------AT---T-C----C----GT-T--T-----------C------T---A-A---T--TT---T------C-C---AAG--GG---A--AA-------T-------TCC----T------CA--TA-T-AA-------AT-C----A-ATGAA---AA-G-C-A-T--------C-----A----------------------A----A-----A--TT--C--GTG--G---T-GA--------A----TC--------A-----TA-----GA-T--A-----A-A-------A--G---G-T-G-T-A------AT-----A----AAGA----A-A-A----------------------------T---C-A-------T----------------CA-G----T-T--T----TA-----------GG--T----A----T-G-T--T----A-G-------AT--A----T---ACT----T-----C----C----AA-A--G--A-A--A----------TAT-------C-AA--------TG-T----T------TA--------T-----T------TT--T-T---A-C-GA-A---C--T---T----C-----TA-CT----T-GTAT-TTTT-CAAAT----T----A----A-T-G--AT---T--CCTTAA----A-----T----------A--------T--A--A--GT----T--------TGCAGGT-AGAA-------AT-----A-C--T--TGGATA-T------AAAT---A-----T---GTATG-T---ATATAG
gi|91 : gaaacagcattttctatgctg---T---T---TTTG----TC---TA-A-GCT-C--C-A----AAT----CTG-AA----A-AAAATATTTAATATC-----T--ACA---A-TTTA--A--T----AT-----------C------T------AC-A---TG---------A-T---GCA-AA------T--AC---A-A--A-A-T-T---------G--A-AA--T----AC----C-C-AG----GT-A------T-------AT----T----T-G-------CA-GA----TCA---T---------T----A------AT---T-T----T----G--T--tattacgtccgtggctgtactgatcaatctgatgtgtagaaatgagtaaaaatatttatagtgtcact
gi|92 : gctacacacaacttctttgatatta-A------T-------GA----G----T-G-------CA-GA----TTCGTAT---------T----A------AT---T-G----T----G--T--T-----------C----------A-T---T--TT---GTTTCAAG-A---AAG--GA---A--CA-------T-------TAC----T------CC--TG-T-AA-------AT-G----G-TTAAA---GA-G-T-A-A--------C-----A---TA-TT-T---T---G-T--A----ata
gi|94 : atttgcattatgatgaaccagtatgtgtgcaatctaaaA----GT-A------T-------GA----G----T-G-------CA-GA----CCC---T---------T----A------TT---T-T----CAATTG--T--T-----------T------T-----T---T--TTCA-A------A-A---AAG--GG---G--CA-------T-------AAC----T------CT--TG-T-AA-------AT-A-------TATA---A-----------------T-----A---TA-TT-T---C---A-C--A----T-----G--TT--C--AAG--G---T-CA--------T----TT--------A-----T------GT-C--T-----A-A-------A--T---G-T-G-T-A------A-----------A--A-----------------------------------------C-A-------T----------------CA-G---TT-T--T----TAT---T------GG--gtttcattcaaatct
gi|95 : tagaAAA---T---T---TTCA----CT---TG-A--CA-T--T-A----TTT----TCA-AA----A-A-------------C-----T--AT----A-T-----A--T----ATAAAATTA----CATTGTAT------AC-A---TGTAATATATTA-T---GCA-TA------T--GT---G-A--A-A-T-T---------G--G-AA--T----AC----C-C-TG----AT-A------T-------CT----A----T-G-------CA-GA----CCaa
gi|98 : taaaggtacattcagcaattttgataTAAA---T---T---TTCA----CT---TA-A--CA-C--T-A----TTT----CTG-AA----A-A-------------T-----T--ACA---A-A-----A--TTA--AT-----------C------T------AC-A---AG---------A-T---GCA-AG------T--CT---G-G--A-A-T-T---------A--G-AA--T----AT----C-C-AA----GT--------T------------------T-G-------CA-AA----TTC---T---------T----A------AT---T-T----T----G--T--T-----------C------TC--A-T---T--TT---G------G-A---AAG--
gi|99 : gacacaggcacttttcaTAAT---G---T---TTTA----CT---GA-ACACT-T--T------TGT----CTG-AA----ATG-------------T-----T--ATG-----T-----A-------AT------------------T------GC-A---TG---------A-T---GCA-AAA-----T--AC-----A--A-G-T-T---------A--G-A---C----AA----C-C-TA----AT-A------T-------GT----G----T-G-------CA-GA----CTC---T---------T----A------AC---T-T----T----G--T--T------------------T---C-T---T--TT---t
blockSeqs : CAA AAA AAA TTGCC AAG CACTT AAAG AAAG CTGA AAATATTTAATATCTACAATTTA TTGT AAAATTA ATTGTA CACTCA TAATATATT TAAATG TC AAT C CA C GAGAAGAAA TACAAC GC ATGC ACTTTTT CATGGCA CCTAG TAATATT TCAA CGTA ATGACAGCA TGTT GTTGTT ACA TGTTTCTTAAACTTTC CTA G ACT AA GTTTCAAG CAT AT TTTTTTT GTATTTT TCAA GTTAGT CACAACT CTCT CTT GT TA TTGTTTTG CTACAA CCCAC CAGTAA CGTG TAA TAATTATGTATA AGATAC C AA . AATTGTG TT AAAG A AACTGTTGCAAATAATCCCTTT AAC CC TTTTCCT AGATTGCTGCAAAAAC GGT CA GTTC TCATTTT CT GTCA AGAG TAAAA AGGAAAA TGT CAAA AAC ACAACGTCA GCC TC AT TACATGATTG AAATACA TAATAGAT A GAAGTTT GCAGGTACT TTTTAC AG ATTAA AAATACT CTA ACTG ACAAA TT GAAC G A . AGTG ATG C TA TTTA TTA CTAGTTGAATATATTAAAAGCAATGTTGATAC AA GGA ACTGCC ATGAAGT TATCCC T
blockSeqs : ATA . GTG C . CACTT . TT . TCGTATTATTATCAACA TA TT CGG GA GTC A G A A T T T ACGAAA T . TG A GGCTG TATT T CA TACTGG T GGATGC A CTTATCTACATG AA G A AA CTAAT T A TT CTG G . . T AT G CT G ATAC TTACA TACTC TACA AA TTTGAAACAAAA CATCG T A . G T TA C ATTAATTATCAAACTACAATTT . . CTG CCAG T A . TACC T . A TTAC CAGAA T GAAA T AAAATATCC TA C . TCAT . . A GT TTGTTG AAA A TATA AAATGG TC ATT ATA TC . G T . TA AT . . TTTG . CCTTCTTCAAACAGTCATCCTTTAGAGAT A . CGGGC GGAAT TAGT T
blockSeqs : . . GC C . ACTAT . T . GCAAATATACAAAT T . G . . A . . T . T T AAT C . AA . GCA T . CA A . TCT . CAATTGTTT TA G A TG TCAGA . A . TT . . . C . G CC A AC TGG CGTTT AG . TCTAAAGTT AAA . . . . . TG . AACAAATCAAGTATTTTTTT . . T TT . A . C . . . ACT AAA C AAC . TAATATCC G . . . . . A C TATAA . . GT AAATTG G A . TT . . . . . G . . GTA . CCAATTCTATTAAAACTGTCAATAC . . TCCTG ATCAA GTAT T
blockSeqs : . . . C . GCTTC . . . GTATGTACAT . . . . . A . . . . . . GAC C . T . AG . . C . . TT . AAAATGTC A . A . CAAA . . . . . . . . . C C . G CGC CT CG . TATAATTA A . . . . . TG . ACAATGTATTTTATATATAT . . . . . . . C . . . ACT AT T AAC . ATGTTCTC G . . . . . . A TGTG . . T GAAAGT . . . T . . . . . G . . T . GTTCTACATAAACAATAAAATAAA . . . AT ATGT T
blockSeqs : . . . C . TCCTT . . . TTGTATTAA . . . . . A . . . . . . TCC T . A . G . . C . . C . CGTATAA T . . . GAT . . . . . . . . . A T . A CG T CG . TACGTATA . . . . . . GG . ACACTTTTAAAATATGTTA . . . . . . . C . . . TTG A . CC . ACAAAAC T . . . . . . G CT . . A GAAATG . . . C . . . . . G . . G . CTTGTTTACACAATATGTTTAGGA . . . AC AAT G
blockSeqs : . . . C . CACTT . . . TAATATAAT . . . . . . . . . . . . AT T . A . T . . C . . . . CGTTATC C . . . GTT . . . . . . . . . G C . C CA T CA . TGCTTGA . . . . . . G . AACAAAGATTATATTTGAA . . . . . . . C . . . TT T . AC . TTATTGA A . . . . . . G TT . . T GAATA . . . T . . . . . G . . G . GTTTTATAAAATGAATGTAAATTA . . . AT TAT T
blockSeqs : . . . C . CCAC . . . TTCTATAAT . . . . . . . . . . . . AA C . G . G . . A . . . . TGATTTC . . . . TTG . . . . . . . . . C C . G TG T CT . TTTGCA . . . . . . G . CTCAATATTATTTCATA . . . . . . . C . . . TA T . . . AATTTCC G . . . . . . G CT . . A TAAAT . . . C . . . . . G . . A . ATATAAGTTTGCAGGTAGAAATAC . . . AT ACT T
blockSeqs : . . . C . ACTC . . . CTAATTAT . . . . . . . . . . . . TC T . A . A . . C . . . . CTTATTC . . . . AT . . . . . . . . . G C . C CA T CA . CGTGT . . . . . . G . CATATAAATATTTCCT . . . . . . . T . . . GC . . . . TTTTCAA A . . . . . . A T . . A TTTAT . . . C . . . . . A . . G . CTAGTTTCCTAAGCACTGCATAC . . . AT TCC .
blockSeqs : . . . T . ATTC . . . TATGATTA . . . . . . . . . . . . AC T . A . T . . C . . . . GTGTTTT . . . . GG . . . . . . . . . A C . A TA T TG . CATAC . . . . . . A . TAACATATATTTAAT . . . . . . . G . . . TA . . . . AAGTTCC G . . . . . . G T . . T AACAG . . . C . . . . . A . . T . CTAATTTGCATAAAAATGTTAAT . . . AT TTC .
blockSeqs : . . . C . ACAC . . . CATTATGT . . . . . . . . . . . . AT C . A . T . . C . . . . TGTTTC . . . . AG . . . . . . . . . A A . T CA T CG . TGTTA . . . . . . G . AAAATATATTTCGAT . . . . . . . T . . . T . . . . ATTTCC G . . . . . . G T . . T AATAG . . . C . . . . . G . . A . GTTTTATAAAAACTTAAAATGAT . . . TT CAA
blockSeqs : . . . C . ACTC . . . TTATGAT . . . . . . . . . . . . AA C . C . G . . C . . . . TGATAC . . . . CG . . . . . . . . . A C . G CG T TG . CATG . . . . . . A . AAAATATATTTCGAT . . . . . . . C . . . T . . . . GATTCC A . . . . . . G A . . T GAGT . . . T . . . . . G . . A . CTTCAACAGTTTTATAAAAAT . . . AT
blockSeqs : . . . C . ACTC . . . TCTGAAT . . . . . . . . . . . . AC C . A . T . . A . . . . CATTTC . . . . GG . . . . . . . . . G T . A CG C CT . TATA . . . . . . G . ATTTACATAAATAAT . . . . . . . C . . . T . . . . TGTTTT T . . . . . . A T . . T GAAT . . . T . . . . . G . . T . CTACAAATATTAGAATGAGT . . . GT
blockSeqs : . . . T . ACTC . . . TAATGTT . . . . . . . . . . . . GC A . A . A . . T . . . . CATTTC . . . . GG . . . . . . . . . T T . A CT T CA . TATG . . . . . . A . AACCAAATATTTTAT . . . . . . . T . . . T . . . . GATTTT G . . . . . . A C . . T GCAT . . . C . . . . . G . . G . TTATCATAAGAATGTTAAT . . . AT
blockSeqs : . . . C . ACTC . . . TATGTAT . . . . . . . . . . . . AA T . A . T . . T . . . . CGTTTC . . . . GT . . . . . . . . . T A . A TA T TG . TATG . . . . . . G . TACAAAATATTCAAT . . . . . . . G . . . C . . . . AATTCC A . . . . . . G T . . T GAAC . . . C . . . . . A . . T . TATAAAAGTCTGATAATAC . . . A
blockSeqs : . . . A . ACTC . . . CTATACT . . . . . . . . . . . . AT C . A . A . . C . . . . TGTTTA . . . . GG . . . . . . . . . A C . A CG T GG . TCCA . . . . . . A . AAACACATGTTTTAT . . . . . . . T . . . C . . . . AAGTCA A . . . . . . G T . . T GAAT . . . T . . . . . T . . G . CTAGTTCAATAAATGTT . . . .
blockSeqs : . . . C . TCAA . . . TATGCAT . . . . . . . . . . . . AC C . A . A . . C . . . . TGTATT . . . . GT . . . . . . . . . T T . A TG T CG . TCTG . . . . . . G . AAATATTTTTTTATA . . . . . . . T . . . T . . . . ATTTCC A . . . . . . G A . . T CAAT . . . T . . . . . G . . T . CTAGTTGTATAATAT . . .
blockSeqs : . . . T . ACTT . . . TTATTAT . . . . . . . . . . . . AC C . A . A . . C . . . . CGATTC . . . . AG . . . . . . . . . G T . A CT A TG . TATC . . . . . . G . AGCAGATATTTTAT . . . . . . . T . . . T . . . . TTGTCT A . . . . . . G C . . T GAAA . . . C . . . . . A . . G . AAAATTAA . .
blockSeqs : . . . C . CATT . . . TTAACAT . . . . . . . . . . . . AC C . G . T . . C . . . . GTGTTC . . . . GG . . . . . . . . . G C . A CG T CG . TAAA . . . . . . G . AACAAGAAAACTGT . . . . . . . C . . . T . . . . TGTCA G . . . . . . G A . . T GAAT . . . C . . . . . C . . G .
blockSeqs : . . . C . ACCC . . . TTACAAA . . . . . . . . . . . . AT G . T . A . . C . . . . CGTTTC . . . . GG . . . . . . . . . T C . C CA T CA . TCTA . . . . . . T . CACAAATCATTTAT . . . . . . . T . . . T . . . . TTCCC G . . . . . . G T . . T GATT . . . G . . . . . A . . A .
blockSeqs : . . . T . CATT . . . CTATAT . . . . . . . . . . . . CC A . A . G . . C . . . . TGTTTC . . . . GG . . . . . . . . . G C . A TG T CA . CATG . . . . . . G . AAAAAAATATTCAA . . . . . . . G . . . T . . . . TTACC A . . . . . . G T . . T GATA . . . T . . . . . A . . A .
blockSeqs : . . . C . TCTC . . . GTACGA . . . . . . . . . . . . AC C . A . A . . T . . . . CGTTTC . . . . GG . . . . . . . . . G T . A TA T TG . TGTT . . . . . . G . AAACAAAGCTTTTA . . . . . . . T . . . A . . . . TTTCC A . . . . . . G T . . T GAAT . . . T . . . . . A . . G .
blockSeqs : . . . C . TTAC . . . ATTTAT . . . . . . . . . . . . TT C . A . A . . T . . . . CGTTTC . . . . GT . . . . . . . . . A C . A TG T CG . TGTA . . . . . . T . AAAAAATATTTTAC . . . . . . . T . . . A . . . . CTTCC A . . . . . . G T . . T CAAT . . . C . . . . . G . . G .
blockSeqs : . . . C . ACCT . . . ATAAAT . . . . . . . . . . . . TT A . A . G . . C . . . . CGTTTC . . . . TT . . . . . . . . . G C . G TA T CA . TTTA . . . . . . G . CAGCTTGGTGGCAG . . . . . . . A . . . C . . . . TCCA G . . . . . . G T . . T AAGT . . . C . . . . . A . . G .
blockSeqs : . . . A . ACAT . . . TTGCAT . . . . . . . . . . . . AC C . A . A . . C . . . . AGTTTC . . . . GT . . . . . . . . . T T . A CG T TG . ATGA . . . . . . G . AAACACATATCTTA . . . . . . . C . . . A . . . . TCCT A . . . . . . A T . . A TATT . . . C . . . . . A . . G .
blockSeqs : . . . C . ACAC . . . CTATGA . . . . . . . . . . . . AC C . A . A . . T . . . . CGTTTC . . . . GA . . . . . . . . . G T . C AA C CC . TATA . . . . . . G . AGCTAAATGTTTAG . . . . . . . C . . . T . . . . ATCC T . . . . . . G T . . T GGAT . . . T . . . . . G . . T .
blockSeqs : . . . C . GCTC . . . CAATAA . . . . . . . . . . . . TT C . A . G . . C . . . . AGTTTC . . . . GA . . . . . . . . . G C . C TG T CG . ATGA . . . . . . A . ATCCAGTATTCGAA . . . . . . . T . . . T . . . . TCC T . . . . . . A T . . C GAAT . . . C . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . C . CAC . . . CTATAT . . . . . . . . . . . . AC C . A . A . . C . . . . CGTTTA . . . . GG . . . . . . . . . G A . A GG C TT . TAAA . . . . . . G . ATAAAATATTTCCA . . . . . . . T . . . T . . . . TTC G . . . . . . G T . . T GTAT . . . T . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . C . CTA . . . TTATGT . . . . . . . . . . . . AC T . A . A . . A . . . . CGTTTC . . . . GA . . . . . . . . . A C . C CA T CA . TCTG . . . . . . C . AAACCATAATTTTG . . . . . . . T . . . T . . . . TCC G . . . . . . G T . . T GAAT . . . C . . . . . A . .
blockSeqs : . . . T . TTC . . . TCATT . . . . . . . . . . . . GA C . A . G . . C . . . . AGTCTC . . . . GG . . . . . . . . . G C . G TG T TG . TCTA . . . . . . C . AACAAATATTATAT . . . . . . . C . . . A . . . . TCC G . . . . . . G T . . T AACC . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . CAT . . . TAATG . . . . . . . . . . . . AT T . A . A . . T . . . . TGTGTC . . . . AC . . . . . . . . . G A . A CG G CA . TATA . . . . . . A . ATTTTGTATTATGA . . . . . . . C . . . C . . . . TCC G . . . . . . A T . . G CCGT . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . T . CTC . . . CTATT . . . . . . . . . . . . AA A . A . A . . A . . . . GATATC . . . . GA . . . . . . . . . G C . C TG T TG . TATT . . . . . . G . AACAATATTTCAA . . . . . . . A . . . C . . . . TCC T . . . . . . G T . . T GAAC . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . C . AAA . . . TGTAT . . . . . . . . . . . . AC T . A . T . . T . . . . CGTTTC . . . . AG . . . . . . . . . A C . A AT T TG . TACA . . . . . . T . AACAAATATTTAC . . . . . . . C . . . T . . . . TAC A . . . . . . G T . . T AAT . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . A . CTT . . . TGTAT . . . . . . . . . . . . AT C . G . G . . T . . . . CGTTTC . . . . GT . . . . . . . . . T C . C CA C CA . AATA . . . . . . G . TACACATATTTTA . . . . . . . G . . . T . . . . TCC A . . . . . . G T . . A AAT . . . C . . . .
blockSeqs : . . . C . ATT . . . TTAAC . . . . . . . . . . . . AC T . A . A . . C . . . . TGTGTC . . . . GG . . . . . . . . . A T . A CG T TG . TATG . . . . . . G . AACAATTATTTTG . . . . . . . C . . . C . . . . TCC A . . . . . . A T . . T GAA . . . A . . . .
blockSeqs : . . . T . CAC . . . TTAAT . . . . . . . . . . . . AC C . A . T . . T . . . . CATTTA . . . . GT . . . . . . . . . G C . A TG G CA . TCTA . . . . . . G . AAGAAATACTTCA . . . . . . . C . . . T . . . . TCT G . . . . . . G T . . T GAT . . . T . . . .
blockSeqs : . . . C . AAC . . . TTTGT . . . . . . . . . . . . GA C . A . G . . G . . . . CGTTTT . . . . AG . . . . . . . . . G C . A TG T CG . TATC . . . . . . G . AAAATAATTTTAA . . . . . . . T . . . T . . . . TCC G . . . . . . G T . . G GA . . . C . . .
blockSeqs : . . . T . CTT . . . AATGT . . . . . . . . . . . . AT G . A . G . . T . . . . TGTTTC . . . . TG . . . . . . . . . G C . A AG T TG . TATA . . . . . . T . AAAAAGTTTTTAA . . . . . . . C . . . T . . . . TCC A . . . . . . G T . . T GA . . . T . . .
blockSeqs : . . C . CTT . . . GTGAT . . . . . . . . . . . . AC C . A . A . . T . . . . CTAATG . . . . GA . . . . . . . . . G C . A CG T CC . TTTA . . . . . . A . ACATACATTTTG . . . . . . . T . . . T . . . . TCC G . . . . . . G T . . T GA . . . C . . .
blockSeqs : . . C . TTC . . . TTGAT . . . . . . . . . . . . AC C . A . G . . C . . . . TGTTTC . . . . GG . . . . . . . . . G C . A CG T CC . TGTG . . . . . . G . AAAACATGTGTT . . . . . . . A . . . T . . . . TCC G . . . . . . T T . . T A . . . C . . .
blockSeqs : . . C . AGT . . . TTAT . . . . . . . . . . . . AC C . A . G . . C . . . . AGTTTC . . . . GG . . . . . . . . . G G . C CG T CT . TACA . . . . . . G . ATCAAATGTTGG . . . . . . . T . . . C . . . . AAA A . . . . . . . G . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . ATC . . . TTAT . . . . . . . . . . . . AG T . A . G . . C . . . . TGTTTC . . . . TG . . . . . . . . . G C . C AG T TC . GATA . . . . . . G . AACATATTCTAG . . . . . . . T . . . T . . . . CCG G . . . . . . . G . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . TTC . . . TGAT . . . . . . . . . . . . AC T . A . A . . C . . . . CGTTTC . . . . CG . . . . . . . . . C C . A CT T CG . TTTT . . . . . . T . AAACTGTATTTT . . . . . . . T . . . T . . . . TCC G . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . CAT . . . TAAT . . . . . . . . . . . . GA C . A . G . . C . . . . TGCTTC . . . . GG . . . . . . . . . A T . T TA T CT . GCTG . . . . . . A . ACTAAATTTTAA . . . . . . . C . . . A . . . . CCC A . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . CAC . . . CGAT . . . . . . . . . . . . AC C . T . A . . C . . . . CGTATA . . . . GG . . . . . . . . . A C . A CA T CG . TGTA . . . . . . G . AACATAGTCCAT . . . . . . . C . . . T . . . . TT A . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . TC . . . TTAT . . . . . . . . . . . . AG C . G . A . . T . . . . CGTTTC . . . . GG . . . . . . . . . G G . A CT A TG . TCTA . . . . . . A . AAATATTTTAA . . . . . . . C . . . T . . . . AC A . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . TG . . . TTAT . . . . . . . . . . . . AC C . T . A . . C . . . . CCTTA . . . . GA . . . . . . . . . G C . G CG C TG . CACG . . . . . . A . TTGAATATTTT . . . . . . . C . . . T . . . . AC G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . TA . . . CTAT . . . . . . . . . . . . AC C . A . G . . T . . . . TGTTT . . . . GA . . . . . . . . . G T . A CG G AA . TAAA . . . . . . G . CATAAGATGCT . . . . . . . C . . . T . . . . TC G . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . TTAT . . . . . . . . . . . . AA C . A . G . . C . . . . TGTTC . . . . GG . . . . . . . . . T C . T CG T CA . TCTA . . . . . . G . AACAATATATA . . . . . . . C . . . T . . . . T G . . . . . .
blockSeqs : . . . . TTAC . . . . . . . . . . . . AA T . A . G . . A . . . . CGTTC . . . . GG . . . . . . . . . A C . A CA T AA . TATG . . . . . . G . AAAATGTTCAT . . . . . . . C . . . T . . . . C G . . . . . .
blockSeqs : . . . . TTAT . . . . . . . . . . . . AT C . A . A . . C . . . . TGTTG . . . . GA . . . . . . . . . T A . C CG C CA . CATA . . . . . . G . AATAAAGAAAA . . . . . . . C . . . T . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . TTGT . . . . . . . . . . . . AT C . A . A . . A . . . . TGTTT . . . . GT . . . . . . . . . G A . A CA C TG . TGTA . . . . . . G . GCAATATTTT . . . . . . . C . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . TTAT . . . . . . . . . . . . AA G . A . G . . C . . . . TATTC . . . . GT . . . . . . . . . A C . C CG T TG . CACA . . . . . . T . AACACATTTT . . . . . . . C . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . TGAT . . . . . . . . . . . . AC T . A . A . . C . . . . CTTTG . . . . CG . . . . . . . . . T C . A CA A TA . CATC . . . . . . G . AACATATA . . . . . . . C . . . T . . . .
blockSeqs : . . . TTAT . . . . . . . . . . . . AC A . A . A . . G . . . . CGTTT . . . . GG . . . . . . . . . A T . A CA C CT . TATA . . . . . . T . TATTTTAA . . . . . . . T . . . T . . . .
blockSeqs : . . . TTAT . . . . . . . . . . . . AT T . A . A . . T . . . . CGTTT . . . . GG . . . . . . . . . A C . A CA C TG . TATG . . . . . . G . GTATTTT . . . . . . . C . . . A . . . .
blockSeqs : . . TTGT . . . . . . . . . . . . AC C . A . T . . T . . . . TTTTT . . . . GG . . . . . . . . . A C . C CT T CT . TCTT . . . . . . T . AATCATA . . . . . . . C . . . T . . . .
blockSeqs : . . GTAC . . . . . . . . . . . . AC C . A . G . . T . . . . TTTTT . . . . GG . . . . . . . . . G C . A CA T CA . TTTA . . . . . . G . TATTTT . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . ATAT . . . . . . . . . . . . GC T . A . G . . C . . . . CGTTT . . . . GT . . . . . . . . . C C . G CA T CT . TTTA . . . . . . A . TATTTT . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . TTAT . . . . . . . . . . . . AC C . G . G . . C . . . . TTTTC . . . . GG . . . . . . . . . G A . G TG T GT . TTTA . . . . . . T . TTAT . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . TTAT . . . . . . . . . . . . AT C . A . T . . G . . . . CATTT . . . . GG . . . . . . . . . T C . C TG T GG . TCTT . . . . . . G . AAAA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . TTAT . . . . . . . . . . . . AC C . A . A . . T . . . . CTTTC . . . . GA . . . . . . . . . A C . A CG C TA . TATG . . . . . . G . TAA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . ATTT . . . . . . . . . . . . AC T . A . G . . T . . . . TGTTC . . . . AA . . . . . . . . . T C . A TG T CA . TTTG . . . . . . . . AA . . . . . . . .
blockSeqs : . . GTGT . . . . . . . . . . . . AC C . G . A . . G . . . . TGTTC . . . . GA . . . . . . . . . T T . A TG C TT . TCTA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . CTTC . . . . . . . . . . . . GC A . A . G . . A . . . . CCTC . . . . GG . . . . . . . . . G C . A TG T TG . TCTG . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TTGT . . . . . . . . . . . . AT A . A . G . . C . . . . CCTT . . . . GG . . . . . . . . . T T . A TG C TG . CCTA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TCT . . . . . . . . . . . . AC C . A . G . . C . . . . TTTA . . . . GG . . . . . . . . . G G . T CG T CG . CATA . . . . . . . .
blockSeqs : . TTT . . . . . . . . . . . . AC A . A . A . . C . . . . TGTT . . . . GG . . . . . . . . . T A . A CT C CG . ATCA . . . . . . . .
blockSeqs : . TAT . . . . . . . . . . . . AT T . A . A . . C . . . . CCTT . . . . TT . . . . . . . . . A T . A CT C CA . TTTA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . AA A . A . G . . C . . . . CATC . . . . TA . . . . . . . . . G T . G TG C G . ATA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . G T . A . T . . A . . . . CATT . . . . TA . . . . . . . . . A A . C CA A A . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . A . G . . A . . . . TGTT . . . . TG . . . . . . . . . G A . G G A C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . G . . C . . . . TTC . . . . CG . . . . . . . . . G C . T C T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . TTC . . . . GA . . . . . . . . . G G . C A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . . . TTA . . . . AG . . . . . . . . . T C . A T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTC . . . . AG . . . . . . . . . A C . G A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTT . . . . GA . . . . . . . . . G C . A C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . GG . . . . . . . . . G C . T G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . TC . . . . . . . . . T C . T G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . GG . . . . . . . . . C C . A C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A T . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : TTAT******************************** *********** CGTTTC**************************** *** ***** *** G********** GAAT******* C* **** G***
originalCons : TAAT---T---T---TTCA----CT---TA-A-ACT-C--T-A----TTT----CTG-AA----A-A-------------T-----T--ATG---A-T-----A--T----AT-----------C------T------AC-A---TG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-A--A-A-T-T---------A--A-AA--T----AC----C-C-CA----GT-A------T-------GT----G----T-G-------CA-GA----CCC---T---------T----A------AT---T-T----C----G--T--T-----------C------T---A-T---T--TT---G------G-A---AAG--GG---G--CA-------T-------AAC----T------CT--TG-T-AA-------AT-G----G-TTGAA---AG-G-C-A-T--------C-----A---TA-TT-T---C---G-C--A----T-----A--TT--C--GTG--G---T-CA--------T----NT--------A-----T------GA-C--A-----A-A-------A--A---G-T-G-T-A------AC-----C----A--A----A-T-A----T--T-T---T--------T-T---T---C-A-------T----------------CA-G---TT-T--T----TAT---C------GG--T----A----T-G-A--T----A-G-------A---A----A---A------T-----C----C----AA-G--G--A-A--A----------TAT-------C-AA--------TT-T----G------TA--------T-----T------TT--T-T---A-A-GA-A---T--T---T----T-----TA-CT----C-ATAT-TTTC-AAAAC----T----AGC--G-T-G--AC---G--CC---A----C-----T----------A--------C--A--A--AT----A--------T-----T-AGAA-------TG-----A-T--T--T---TCTT------AAAT---A-----T---GT-TA-T---ATATAGAAATT
finalCons : TAAT---T---T---TTCA----CT---TA-A-ACT-C--T-A----TTT----CTG-AA----A-ATTAT--------------------------------A--T----AT-----------C------T------AC-A---TG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-A--A-A-T-T---------A--A-AA--T----AC----C-C-CA----GT-A------T-------GT----G----T-G-------CA-GA----CCC---T---------T----A------AT---T-TCGTTTC----------------------------T---A-T---T--TT---G------G-A---AAG--GG---G--CA-------T-------AAC----T------CT--TG-T-AA-------AT-G----G-TTGAA---AG-G-C-A-T--------C-----A---TA-TT-T---C---G-C--A----T-----A--TT--C--GTG--G---T-CA--------T----NT--------A-----T------GA-C--A-----A-A-------A--A---G-T-G-T-A------AC-----C----A--A----A-T-A----T--T-T---T--------T-T---T---C-A-------T----------------CA-G---TT-T--T----TAT---C------GG--T----A----T-G-A--T----A-G-------A---A----A---A------T-----C----C----AA-G--G--A-A--A----------TAT-------C-AA--------TT-TG----------TA--------T-----T------TT--T-T---A-AGAAT-------T---T----T-----TAC-T----C-ATAT-TTTC-AAAAC----T----AGCG---T-G--AC---G--CC---A----C-----T----------A--------C--A--A--AT----A--------T-----T-AGAA-------TG-----A-T--T--T---TCTT------AAAT---A-----T---GT-TA-T---ATATAGAAATT
41 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|101 : gatactttca---G--CA-------T-------ACC----T------CT--TA-T-AA-------AC-T----G-TCGAA---AG-G-T-T-G--------C-----A---TG-TT-T---C---A-T--A----T-----A--AT--C--GTG--G---T-CA--------T----AT--------A-----TAGATACGG-C--A-----A-A-------G--A---G-TGG-T-A-------------C----A--T----A-C-A----T--T-T---TG-------TAT---T---C-A-------T----------------CA-G---TT-T--T----TGT---C------GG--T----A----T-A-T--T----A-GAT-----A---A----A---A------T-----C----C----ac
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gi|107 : aA--T----TC----C-C-CA----GT-A------T-------GT----A----T-T-------CA-GA----ACA-------G------T----A------AT---T-------GT---------------------------------------------------A---AAG--GG---G--CG-------T-------AAC----T------CT--AA-T-AA-------AT-G----G-TTAGT---AA-G-C-A-T--------C-----G---TA-TT-T---C---A-C--A----T-----A--TC--C--ATC--G---T-CT--------T----AT--------G-----T------CA-C--A-----A-A-------A--A---ctgtacc
gi|109 : atgagtatcagatgttgtTCA----AT---TA-ACACT-T--T-A----C---A-T----CTGA--A----A--A--T--------A---A---T------G----T-----A---------T----------T------T------A-C-A---TG---------A-T---GCA-AA------T--TT---G-A--A-A-T-C---------A--A-TA--T----AC----C-C-TA----tg
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gi|128 : tgttagatttaaagtgacacgcagagaatttgattcaatctagcttcatta---TTTA----CT---TA-A--------C-A----T---T-T----CTGA--A----A--A--C--------T---A---T------T----C-----A---------T----------T------T------A-T-A---AG---------G-T---TCA-AA------T--AT---C-A--A-A-T-T---------G--A-AA--T----AT----T-C-CA----GT-A------T-------GT----A----T-G-------AA-AA----CCCA------T------T----A-----------TT-C----GT-T-T---tcaaacaag
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gi|133 : cacggtggttttgataT---T---T---CTCA----T-------A-ACT-C--T-G----T---G-T----CTGA--A----A--A--T--------T---A---T------A----T-----A---------T----------T---------------------TG---------A-T---GCA-AATAAATGT--AT---G-A--A-A-T-
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gi|144 : aatagat-----C----A--A----A-T-A----T--C-TTA-T--------T-T---T---C-A-------C----------------CA-G---GT-T--T----ATT---T------GG--C----A----T-G-A--C----A-G-------AT--A----A---AGAT---T-----C----C----AA-A--G--A-A--A----------TAC-------C-A
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gi|2 : ttaaaaggacacatggcaattt---TTCA----CT---CA-A-AAA------A----T---T-T----CTAA--A----A--AATT--------T---A---T------A----T-----A---------T----------C------T------A-T-A---TG---------T-T---GTA-AA------T--AT---G-A--A-A-T-T---------A--G-AA--C----TT----C-C-AA----GC-A------T-------GA----A----T-G-------CA-GA----CCC-------T------T----A----------------------T-T---C------TA---------A-C----T--T--T---G------T-C---AAG--GG---G--CA-------T-------AAC----T------CT--TG-T-TA-------TT-G----C-TTCAA---AG-G-C-A-T--------C-----A---TA-CA-T---T---A-C--A----T-----A--TT--C--ACA--G---T-AA--------TATAATT--------A-----T------GA-C--A-----A-A-------A--T---G-T-A-T-A------A------C----A--A----A-T-A----T--T-TA--C--------T-T---C---C-A-------T----------------CT-G---TT-T--C----TAG---T------GG--T----A----T-C-A--T----A-GCAGAA--A---A----A---A------A-----CAAAAC----AA-A--GC-A-A--A----------TAT-------C-AA--------TT-T----
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gi|21 : taatttaaaaggccaaaagacaattttggta-T----CTGA--A----A--A--T--------T---G---T------A----T-----G---------C----------C------T------A-C-A---TT---------G-T---ACA-AA------T--AC---A-A--A-G-T-T---------G--G-AA--T----AC----G-C-CA----AT-A--------------GT----G----A-G-------CA-GA----TCT-------T------A----A------AT---TA-C-----C-T-T---A------T----------A-G----A--C--T---G------A-A---CAG--TG---G--CA-------T-------AAC----C------AT--TG-T-AA-------AT-G----G-CTGAA---AG-G-C-A-T--------A-----C---TA-TT-T---T-----T--A----T-----A--TT--C--GTA--G---T-CA--------C----GT--------GT----T------GA-T--T-----A-T-------A--A---G-T-G-A-A------ACAAAT-C----A--A----G-T-ATTT-T--T-T---T--------T-T---T---C-A-------T----------------TATC---TT-T--T----TGT---T------GG--T----T----T-T-A--A----A-A-------A---A----A---ATGT---T-----T----T----AA-A--G--ATA--A----------TAT-------C-AA--------TA-T----A-------A--------C-----T------TA--T-T---A-A---------------C----T-----TA---------ATAT-CTTC-AAAAcggttttatacttaaatta
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gi|3 : ttacagtggcgcacggcaatgtttgttata-C--T-A----T---T-T----CAGA--A----G--T--T--------A---A---C------A----T-----T---------T----------C------T------A-C-A---AG---------A-T---GCA-AA------T--AT---G-ACAA-A-T-AGAGAAGAAAA--A-AA--C----AA----C-TGCA----GT-A------T-------GT----GCA--T-GTATT---CA-GA----CAA-------T------T----A------AT---TT-C----CT-T-T---A------T----------A-C----C------------------------G--GT---A--CA-------TGTATTTTAAC----T------CG--TG-T-AA-------GT-A----A-CTGAA---AG-G-C-A-A--------C-----A---TA-TT-T---T---G-C--A----C-----A--TT--T--GTA------T-CA--------T----AT--------T-----T------GA-C--A-----A-A-------A--A---C-T-G-T-A------AA-----A----A--A----A-T-A----T--T-CA--A--------T-T---T---A-A-------T----------------CA-G---AT-T--T----TAC---T------GA--T----A----C-C-A--T----A-T-------A---A----A---A------TTA---C----C----AA-G--G--A-A--A----------TA-----------------------------------TA--------T-----T------TT-------------------T--T---T----T-----CA-TT----G-ATAT-TTTC-ACAGA----T----GGC--A-A-G--AT---T--CT---A----C-----T-------------------------A--ATTTGCA--------T-----A-AAAA-------TGTTA--A-T--T--T---TTTT---------T--------------T-TA-T---A---AGAAATTattcgataataatatgtaattattcagttccacataataatacttgataat
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gi|31 : acagcatttttga-T----CTAA--A----A--C--C--------T---A---T------A----C-----T---------G----------C------T------G-C-A---TG---------A-T---GTA-TA------A--AT---G-A--T-A-T-T---------G--A-AG--C----ACGAAAC-C-TA----GT----------------------G----T-G-------CA-GA----CCT-------T------T----A------AT---TT-C----AT-C-T---A------T----------A-T----T--T--A---G------G-----AAG--GG---G--TA-------T-------AAC----T------TT--TG-T-AG-------CT-A----G-TTGGA---CG-G-C-A-T--------C-----A---AA-CT-A---C---G-C--A----G-----G--TG--C--ACG--G---C-CA--------A----AT--------A-----T------AA-C--A-----A-T-------T--A-----T-G-T----------------------------G-T-A----T--T-T---T--------T-T---T---CTATTTTCCTT----------------TA-G---TT-T--T----TAT---T------GA--TGTCAA----T-G-A--A----A-A-------AC--A----A---A------T-----C----C----AT-T--G--A-A--ATACATGATTGTAT-------T-AA--------TT-T----G------TAT-------T-----T------TT--T-T---A-A-GA-A---T--T---T----T-----TA-CT----C-ATAT-TTT
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gi|82 : ttaaagggacacatggcaattttgttgtt-G-------CA-GA----CCC-------T------T----A------AT---TT-T----GT-T-T---C------T----------T-T----T--T--T---C------G-A---GCG--CT---A--CA-------T-------AAG----T------CG--T--T-AA-------AA-G----G-TTAAA---GG-A-C-A------------------------T-T---C---G-T--G----C-----A--TG--T--GTT--A---T-CA--------T----CT--------G-----T------GA-C--A-----A-C-------A--A---A-T-G-C--------AT-----T----T--T----G-T-A----T--T-A---TGA------T-T---T---C-A-------T----------------CA-G----T-T--T----AAT---C------GG--T----A----T-T-A--A----A-G-------A---AAC--A---A------C-----C----C----AA-tatcta
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gi|92 : gctacacacaacttctttgatattatttttgtctaagctccaaatctgaaaaaaatattta-A------T-------GA----G----T-G-------CA-GA----TTCGTA----T------T----A------AT---TG-T----GT-T-C---------------------A-T----T--T--T---GTTTCAAG-A---AAG--GA---A--CA-------T-------TAC----T------CC--TG-T-AA-------AT-G----G-TTAAA---GA-G-T-A-A--------C-----A---TA-TT-T---T---G-T--A----ata
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gi|95 : tagaAAA---T---T---TTCA----CT---TG-A--CA-T--T-A----T---T-T----TCAA--A----A--A--C--------T---A---T------A----T-----A---------TATAAAATTA-CATTGTAT------A-C-A---TGTAATATATTA-T---GCA-TA------T--GT---G-A--A-A-T-T---------G--G-AA--T----AC----C-C-TG----AT-A------T-------CT----A----T-G-------CA-GA----CCaa
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