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lowQualScore                  :           .   .       .....   .                .            ....     ..        .                    
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consensus                     :       NAACGGACGGACAGACC----GACAGACCGACAGACCGACCNCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
Reference ( gi|5 )            :       CAACGGACAGACAGACC----GACAGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|6                          :        AACGGACAGACCAACC----GACAGACCAACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTTGGGGGT
gi|4                          :        AACGGACAGACCGACCAACTGACAGACCAACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----TATAT--ACCCCCTC-AATCTTCGTTTGTCGGGGa
gi|1                          :         ACCGACCGACAGACT----GACAGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGGCTCC----AATAC--ACCCCCTCAAAACTTAGTTTGTGGGGGGTtta
gi|7                          : aacggacagCAGACCGACGGACT----GTCGGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|19                         :             ACGGACAGACC----GAC----CGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCG
gi|12                         :             ACGGACAGATC----GAC----CGACAGACCGACCACAGGGCGACTCC----AATAT--ACCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|14                         :             ACGGACAGACC----GAC----CGACAGACCGACCACAGGGTGACTCG----AATAT--ACCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGAGG
gi|21                         :             ACGGACAGACC----GAC----CGACAGACTGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACC-------AACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|13                         :             ACAGACAGACA----GACAGACAGACAAA-----CTCAAA------CC----AATAT--ACCCCACCAAAACTTCa
gi|16                         :                GACAGACC----GAC----CGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTagggagggcagtggggtta
gi|9                          :               gGACATACC----TACAGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTAAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|23                         :               cGACAGACC----GACCGACCGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AAT-------------AAACTTTGTTTGTCGGGGGT
gi|8                          :               gGACAG--------ACAGACGGACAAGCTGAATCCAGTAT-ACCCCCTCGAACACAAACCCCCCTAACACTTTGTGT-TCGGGGG
gi|10                         :                 ACGGACA----GACAGGCCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTatat
gi|11                         :                 ACGGACA----GACAGACCGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGa
gi|15                         :                     ACG----GACAGACCGACAGACCGACCTCAGGTTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|18                         :                    aACG----GACAGACCGACAGACTGACCTCAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|17                         :                     ACG----GATAGACTGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|26                         :                    aACG----GACAGACCGACAGACCGACCACAGAGTGACTCC---------------------AACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|20                         :                       C----GACGGACCGACAGACCGCCCTCAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|22                         :                               AGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|8                          :                                GACAGACAGACGGAC---AAGCTGAATCC----AGTAT--ACCCCCTCGAAa
gi|25                         :                                 ACGGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--A-CCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGTcacaaacccccctaacactttgtgttcgggggatat
gi|24                         :                                     ACAGACCGACCTCAGGGCGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCCTTTGTCGGGGGT
gi|27                         :                                     aacgaCCGACCTCAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGCCGGGGGT
gi|29                         :                                                 CAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCAGGGGT
gi|3                          :                                                 CAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGCTTGTCGGGGa
gi|2                          :      cggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGtta
gi|32                         :       cggacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTttat
gi|30                         :                                                  AGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
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gi|35                         :                                                       GACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCATTTGTCGGGGGTa
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAC
Unaligned ( gi|31 ): AACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAC
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lowQualScore                  :                                            .....   .                .            ....     ..        .                    
lowQualScore                  :                                            11111   6                5            5555     66        2                    
consensus                     :                            NAACGGACGGACAGACC----GACAGACCGACAGACCGACCNCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
Reference ( family-2476 )     :                            NAACGGACGGACAGACC----GACAGACCGACAGACCGACCNCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|1                          :                              ACCGACCGACAGACT----GACAGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGGCTCC----AATAC--ACCCCCTCAAAACTTAGTTTGTGGGGGGT
gi|10                         :                             aacggacagACGGACA----GACAGGCCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|11                         :                                      ACGGACA----GACAGACCGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGa
gi|12                         :                                  ACGGACAGATC----GAC----CGACAGACCGACCACAGGGCGACTCC----AATAT--ACCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|13                         :                                      ACAGACA----GACAGACAGACAGACAAAC-TCAAA------CC----AATAT--ACCCCACCAAAACTTC
gi|14                         :                                  ACGGACAGACC----GAC----CGACAGACCGACCACAGGGTGACTCG----AATAT--ACCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGAGGagggagggcagtggggtta
gi|15                         :                                          ACG----GACAGACCGACAGACCGACCTCAGGTTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|16                         :                                   aGGACAGACC----GAC----CGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|17                         :                                          ACG----GATAGACTGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|18                         :                                         aACG----GACAGACCGACAGACTGACCTCAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|19                         :                                  ACGGACAGACC----GAC----CGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCG
gi|2                          :                                                                      CAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGG
gi|20                         : cggacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaC----GACGGACCGACAGACCGCCCTCAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTttat
gi|21                         :                                  ACGGACAGACC----GAC----CGACAGACTGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACC-------AACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|22                         :                                                    AGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|23                         :                                    GGACAGACC----GACCGACCGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AAT-------------AAACTTTGTTTGTCGGGGGTa
gi|24                         :                                                          ACAGACCGACCTCAGGGCGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCCTTTGTCGGGGGT
gi|25                         :                                                 aacgaACGGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--A-CCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|26                         :                                          ACG----GACAGACCGACAGACCGACCACAGAGTGACTCC---------------------AACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|27                         :                                                               CCGACCTCAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGCCGGGGGT
gi|29                         :                                                                      CAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCAGGGGT
gi|3                          :                                                                    CACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGCTTGTCGGGGa
gi|30                         :                              cggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTtta
gi|32                         :                                                                       AGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|33                         :                                                                         GGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|34                         :                                                                        GGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|35                         :                                                                            GACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCATTTGTCGGGGGT
gi|4                          :                             AACGGACAGACCGACCAACTGACAGACCAACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----TATAT--ACCCCCTC-AATCTTCGTTTGTCGGGGa
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gi|7                          :                               CAGACCGACGGACT----GTCGGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
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gi|8                          :                                         GACA----GACAGACGGACAAGCTGAATCCAGTAT-ACCCCCTCGAACACAAACCCCCCTAACACTTTGTGT-TCGGGGGcacaaacccccctaacactttgtgttcgggggatat
gi|9                          :                                     GACATACC----TACAGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTAAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTatat
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Alignments
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lowQualScore                  :                                            .....   .                .            ....     ..        .                    
lowQualScore                  :                                            11111   6                5            5555     66        2                    
consensus                     :                            NAACGGACGGACAGACC----GACAGACCGACAGACCGACCNCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
Reference ( family-2476 )     :                            NAACGGACGGACAGACC----GACAGACCGACAGACCGACCNCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|1                          :                              ACCGACCGACAGACT----GACAGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGGCTCC----AATAC--ACCCCCTCAAAACTTAGTTTGTGGGGGGT
gi|10                         :                             aacggacagACGGACA----GACAGGCCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|11                         :                                      ACGGACA----GACAGACCGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGa
gi|12                         :                                  ACGGACAGATC----GAC----CGACAGACCGACCACAGGGCGACTCC----AATAT--ACCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|13                         :                                      ACAGACA----GACAGACAGACAGACAAAC-TCAAA------CC----AATAT--ACCCCACCAAAACTTC
gi|14                         :                                  ACGGACAGACC----GAC----CGACAGACCGACCACAGGGTGACTCG----AATAT--ACCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGAGGagggagggcagtggggtta
gi|15                         :                                          ACG----GACAGACCGACAGACCGACCTCAGGTTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|16                         :                                   aGGACAGACC----GAC----CGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|17                         :                                          ACG----GATAGACTGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|18                         :                                         aACG----GACAGACCGACAGACTGACCTCAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|19                         :                                  ACGGACAGACC----GAC----CGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCG
gi|2                          :                                                                      CAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGG
gi|20                         : cggacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaC----GACGGACCGACAGACCGCCCTCAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTttat
gi|21                         :                                  ACGGACAGACC----GAC----CGACAGACTGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACC-------AACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|22                         :                                                    AGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|23                         :                                    GGACAGACC----GACCGACCGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AAT-------------AAACTTTGTTTGTCGGGGGTa
gi|24                         :                                                          ACAGACCGACCTCAGGGCGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCCTTTGTCGGGGGT
gi|25                         :                                                 aacgaACGGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--A-CCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|26                         :                                          ACG----GACAGACCGACAGACCGACCACAGAGTGACTCC---------------------AACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|27                         :                                                               CCGACCTCAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGCCGGGGGT
gi|29                         :                                                                      CAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCAGGGGT
gi|3                          :                                                                    CACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGCTTGTCGGGGa
gi|30                         :                              cggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTtta
gi|32                         :                                                                       AGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|33                         :                                                                         GGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|34                         :                                                                        GGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|35                         :                                                                            GACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCATTTGTCGGGGGT
gi|4                          :                             AACGGACAGACCGACCAACTGACAGACCAACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----TATAT--ACCCCCTC-AATCTTCGTTTGTCGGGGa
gi|5                          :                             AACGGACAGACAGACC----GACAGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTtta
gi|6                          :                            cAACGGACAGACCAACC----GACAGACCAACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTTGGGGGT
gi|7                          :                               CAGACCGACGGACT----GTCGGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|8                          :                                                     GACAGACAGACGGAC---AAGCTGAATCC----AGTAT--ACCCCCTCGAA
gi|8                          :                                         GACA----GACAGACGGACAAGCTGAATCCAGTAT-ACCCCCTCGAACACAAACCCCCCTAACACTTTGTGT-TCGGGGGcacaaacccccctaacactttgtgttcgggggatat
gi|9                          :                                     GACATACC----TACAGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTAAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTatat


blockSeqs                     :                                            CAACT   A                T            CTCG     AA        A
blockSeqs                     :                                            A       A                A            .        .         A
blockSeqs                     :                                            A       A                A            .        .         A
blockSeqs                     :                                            C       A                T            .        .         A
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blockSeqs                     :                                            C       A                T            .        .         A
blockSeqs                     :                                            G       G                T            .        .         A
blockSeqs                     :                                            C       A                A            .        .         A
blockSeqs                     :                                            G       C                T            .        .         A
blockSeqs                     :                                            G       A                A            .        .         A
blockSeqs                     :                                            C       A                T            .        .         A
blockSeqs                     :                                            C       A                A            .        .         A
blockSeqs                     :                                            C       A                T            .        .         A
blockSeqs                     :                                            C       G                A            .        .         A
blockSeqs                     :                                            G       A                T            .        .         A
blockSeqs                     :                                            C       A                A            .        .         A
blockSeqs                     :                                            C       .                A            .        .         A
blockSeqs                     :                                            T       .                T            .        .         A
blockSeqs                     :                                            A       .                A            .        .         A
blockSeqs                     :                                            C       .                A            .        .         A
blockSeqs                     :                                                    .                T            .        .         A
blockSeqs                     :                                                                     A            .        .         G
blockSeqs                     :                                                                     T            .        .         A
blockSeqs                     :                                                                     C            .        .         A
blockSeqs                     :                                                                     T            .        .         .
blockSeqs                     :                                                                     .            .        .         .
blockSeqs                     :                                                                                  .        .         .
blockSeqs                     :                                                                                  .        .         .
blockSeqs                     :                                                                                  .        .         .
blockSeqs                     :                                                                                  .        .         .
blockSeqs                     :                                                                                  .        .         .
blockSeqs                     :                                                                                  .        .         .
blockSeqs                     :                                                                                  .        .         .


blockSeqCons                  :                            
originalCons                  :                            NAACGGACGGACAGACC----GACAGACCGACAGACCGACCNCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
finalCons                     :                            NAACGGACGGACAGACC----GACAGACCGACAGACCGACCNCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAC
Unaligned ( gi|31 ): AACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAC
Unaligned ( gi|36 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCA






Alignments
lowQualScore                  :                                            55555   4                1            2222     11        2                    
lowQualScore                  :                                            .....   .                .            ....     ..        .                    
lowQualScore                  :                                            11111   6                5            5555     66        2                    
consensus                     :                            NAACGGACGGACAGACC----GACAGACCGACAGACCGACCNCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
Reference ( family-2476 )     :                            NAACGGACGGACAGACC----GACAGACCGACAGACCGACCNCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|1                          :                              ACCGACCGACAGACT----GACAGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGGCTCC----AATAC--ACCCCCTCAAAACTTAGTTTGTGGGGGGT
gi|10                         :                             aacggacagACGGACA----GACAGGCCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|11                         :                                      ACGGACA----GACAGACCGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGa
gi|12                         :                                  ACGGACAGATC----GAC----CGACAGACCGACCACAGGGCGACTCC----AATAT--ACCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|13                         :                                      ACAGACA----GACAGACAGACAGACAAAC-TCAAA------CC----AATAT--ACCCCACCAAAACTTC
gi|14                         :                                  ACGGACAGACC----GAC----CGACAGACCGACCACAGGGTGACTCG----AATAT--ACCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGAGGagggagggcagtggggtta
gi|15                         :                                          ACG----GACAGACCGACAGACCGACCTCAGGTTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|16                         :                                   aGGACAGACC----GAC----CGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|17                         :                                          ACG----GATAGACTGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|18                         :                                         aACG----GACAGACCGACAGACTGACCTCAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|19                         :                                  ACGGACAGACC----GAC----CGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCG
gi|2                          :                                                                      CAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGG
gi|20                         : cggacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaC----GACGGACCGACAGACCGCCCTCAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTttat
gi|21                         :                                  ACGGACAGACC----GAC----CGACAGACTGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACC-------AACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|22                         :                                                    AGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|23                         :                                    GGACAGACC----GACCGACCGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AAT-------------AAACTTTGTTTGTCGGGGGTa
gi|24                         :                                                          ACAGACCGACCTCAGGGCGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCCTTTGTCGGGGGT
gi|25                         :                                                 aacgaACGGACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--A-CCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|26                         :                                          ACG----GACAGACCGACAGACCGACCACAGAGTGACTCC---------------------AACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|27                         :                                                               CCGACCTCAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGCCGGGGGT
gi|29                         :                                                                      CAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCAGGGGT
gi|3                          :                                                                    CACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGCTTGTCGGGGa
gi|30                         :                              cggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGGTGACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTtta
gi|32                         :                                                                       AGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|33                         :                                                                         GGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGT
gi|34                         :                                                                        GGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|35                         :                                                                            GACTCC----AGTAT--ACCCCCTCAAAACTTCATTTGTCGGGGGT
gi|4                          :                             AACGGACAGACCGACCAACTGACAGACCAACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----TATAT--ACCCCCTC-AATCTTCGTTTGTCGGGGa
gi|5                          :                             AACGGACAGACAGACC----GACAGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTtta
gi|6                          :                            cAACGGACAGACCAACC----GACAGACCAACAGACCGACCACAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTTGGGGGT
gi|7                          :                               CAGACCGACGGACT----GTCGGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTa
gi|8                          :                                                     GACAGACAGACGGAC---AAGCTGAATCC----AGTAT--ACCCCCTCGAA
gi|8                          :                                         GACA----GACAGACGGACAAGCTGAATCCAGTAT-ACCCCCTCGAACACAAACCCCCCTAACACTTTGTGT-TCGGGGGcacaaacccccctaacactttgtgttcgggggatat
gi|9                          :                                     GACATACC----TACAGACCGACAGACCGACCTCAGGGTGACTCC----AATAT--ACCCCCTAAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTatat
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAC
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Unaligned ( gi|36 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCA