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lowQualScore                  :   .            ...      .    ..    .      ...  ......................    .    .  .          .           ....    .  ..       .... ....    ..    ......  . ..   ..    .... ..                                     . ..  .   .  .   ..........     . .     .  . .       ... . ..  .       
lowQualScore                  :   0            000      5    00    4      555  8888888888888888888888    8    3  3          7           2222    8  99       0000 3333    66    333333  5 00   00    3333 00                                     5 00  5   6  6   5555555555     6 8     8  3 2       222 7 33  6       
consensus                     :  TGTAGAACGGACCCAGCTCTCCC-GATT--GGGT-CCGTTA---AAT-AGCAA-TG-TGGGA-AAGCCACATTTGAG-CA-CGTTGATTGGTCAGTTGCTTCAAC--GAAA-GT--TTGAATG----AC---GTCA-CAGTT------TA-G--TAA--GCGTTC--A--ATTGCTATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGGG-----GTTAATAGA-CCTGA-TTCGGGAGATAT--CAGG--TTCTGGGATA
Reference ( gi|3 )            :  TATAGAACGAACCCGGTTCTCCC-GATT--GGGT-CCGTTA---AAC-AGATA-TGGTAGAA-AAGCCACATTTGAG-CA-CGTTGATTGGCCAGTTGCTTCAAC-TGAAA-GT--TTGAATG----AT---GTCA-CAGTT------TA-G--TAA--GCGTGC--A--ATTGCTATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGAGG-----GGTAATATA-CCTGA-TTTGCGAGATAT--TAAG--TTTTGGGATA
gi|2                          :  TGTAGAACGGACCCAGCT-TCCC-GATT--GGTT-CCGTTA---AAT-AGCAA-TGTTGGGA-CAGTCACATTTGAA-CA-CGTTGATTGGTCAGTTGCTTCAAC-TGAAA-GT--TTGAATA----ATAACGTTG-CCGTT------TA-G--TAA--GCATGC--A--ATTGCTATGAATTGAGGGCCAGGCAGAGAATCCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGAG-----GTTAATAGC-CCTGA-TTCGGGGAATAT--CAGG--TTC
gi|5                          :  TGTAGAATGAACCCAGCTCTCTT-GATT--GGGT-CTGTTA---AAT-AGCAA-TGTTGGGA-AAGCCACATTTGAG-CA-TGTTGATTGGTCAGTTGCCTCAAC-TGAAA-AT--TTGAATG----AC---GCCAGCA-TT------T------------GTTT--C--ATTGCTATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCATG-C--TT-TTT-CATTTGGAG-----GTTTATAGA-CCTGA-TTTGGAAGGTATAATGAGA-TTCTGGGATAtgtat
gi|1                          :  TGTAGTACGGACTCAGCTCTTCC-TATTTTGGGT-CCGTTT---TAT-AGCAA-TGTTGGGA-AAGCCACATTTTAG-CA-CGTTGATTGGTTAGATGTTTCAAA-TGAAT-GT--TTGA-TG----AC---GTCA-CTGTT------TA-T--TAA--GCGCTT--A--CCTGCTATGAATTGTGGAACAGGCATAGAATTCCCTT-A--TT-TTT-CA-TTGTTG-----GTTAATAGA-CCTGA-TTCGGGAGACAT--CAGG--TTCTGGGATAga
gi|25                         : cTGTAGAATGGTCCCAGATCTCCT-GTGT--TGGT-CCATTA---CAT-AGTTA-TG--------AG----ATTTGAG-CA-TATTGATTTATCAGTTGCTATAGG--GGAA-GT--T-GAATG----AT---TTCA-CAGTT------TA-G--TTA--GCGTTA--G--ATAGCTATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TCT-CA-TTGga
gi|27                         :  cACAGAACAAGC-----TCTCCC-AATA--AGGT-CCGTTA---AA--AGCAA-TGTTGAAA-AAGCCATATTTGAG-CA-CGCTGACTGGTCAATTGTTTCAAA-TGAAT-AA--TTGAATT----AC---GTCA-CATTT------TA-T--TAA--GCGTTA--T--ATTGCTATGAATTGTGGGAAAGGCATAGAA
gi|15                         :  gcTAGAACGAACCCAGCTCTCCC-GATT--TGGT-CCGTTACATAAC-A-AT--CAGTA--------------CGAG-CA-CGCTTATTAGTCAGTTGTTTCAGG--GAAA-GT--TTGAATG----AT---GTCA-TAATT------TA-G--TAA--GCGTTC--A--ATTGCTATGAATTGTGAGACAGGTATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGTG-----GTTAATAAA-CCTGG-TTCGGGAGATAT--CAGG--TT
gi|14                         :    TAGAACGAACTCAACTATCCC-GTTT--GGAT-CCGTTA---AA-----TA-T--CAG-------CACATTTGAG-CA-CGTTGATTGGTCAGTTGCTTCAGG--GAAA-CT--TTGAATG----AC---GACA-TAGTT------TA-G--TAA--GCGTTC--A--ATTGCTATGCATTGTGGTACAGGCATAGGATTACCTG-CT-TT-TTT-TA-TTGGGG-----GTTAATATA-CTTGA-TTAGGGAGATA
gi|13                         :  cgTAGAACGAACCCAGCTCTCCC-GATT--GGGT-CCGTTA---ACT-AGCAA-TTGT---------TAC----GAG-CA-TGCTGATTGGTCAGTTGCTTTAGG--GAAA-GT--TTGAATG----AT---GTCA-------------A-G----A--GC-T-C--A--GTTGCTATGAATTGTTGGACAGGCATGGAATTCCCTG-CT-TT-TTT-CA-TTAACA-----GTTAATAGA-CCTGA-TTCGGAAGATAT--CAGG--TTCTAGGAccggt
gi|12                         :   gTAGAACGGACGCTGCTCGCCC-GACT--GGGT-CCGTTA---AAT-AGCAA-TTGT---------TAC----GAA-CA-CGGTGATTGGTTAGTTGCTTCAG---GAAAAGT--TTGAATG----AC---GCCA------------TA-G--TAA--GCGTTC--A--ATTGCTATGAATTGTGGGGCAGGCCTAGAATTCACTG-CTATT-TTT-CA-TTGGCGTTAATAGAAATATATCTTGA-TTCGGGAGATAT--CAGG--TTaag
gi|18                         :   gTAGAACGGACTCTGCTCTCCC-TATA--AGAT-CCGTTA---AAT-A------------A-CAGC-ACATCTGA--CA-CGTTGATTGGTCAGTTGATTTGG--TGAAA-GT--TTAAATA----AC---GTCA-TAATT------TA-G--TTA--GCGTTT--A--ATTGCTATGAACTGTTGGACAAGCATAGACTTCCCTGAT--TT-TTT-CA-TTAGGG-----GTTAATATA-ATTAA-TTCGACATATAT--TA
gi|21                         :    TAGAGCGGACCCAGCTCTCCC-GATT--GGGT-CCGT-A---AAC----------TAGGA-ATGGGATAT--GAG-CA-CTTTGATTG----------------------------GAATG----AC---GTCA-CAGTT------TG-G--TAA--GCGTTG--A--ATAGCTATGAATTGTGGGACAAGCATGGAATTCCCTG-C--CT-TTT-CA-TTGGGG-----GTTTATAGA-CCTGACTCTG-GAGATAT--CAGG--t
gi|17                         :  tcTAGAATAAATCCAACTCTCTC-GATT--GTGT-CCGTTC---AAT-AGCAA-TTGT-------------TATGAG-CA-CGCTGATTGG-----------AACGGGAAA-GT--TTAAATG----AC---GTCA-TAATT------TA-G--TAA--GCGTTC--A--ATTGCTATGAATTGTGGAACAGGAATAGAATTCCCTT-C--TT-TTTCCA-TTG-GT-----GGT----TG-GCAGA-TTCGGGAGATAT--CAGG--TTCTAGGATAacagggatagac
gi|40                         :  tcTGGAACCAATTCAGCTTTCCCCGATA--GGGT-CCGTTA---
gi|39                         :    TAGAACTGATCCAGCTCTCCC-GCGT--TGAT-CCGTTA---cttagcaacgtatttgaacacatt
gi|4                          : tcagAGTACGGGCCCAGCTCTCCC-GATT--GGGT-CCGTTA---AAT-AGCAA-TGTTGGGA-AAGCAACATTTGAG-CA-CGTTGATTGGTCAGTTATGTCAAC-TTAAA-GT--T-GGATG----AA---GTCA-CTGTT------TT-G--TAA--GCGTTC--A--ATTGCTACGAATTGTGGGACAGGCAAAGAATTCCCTG-C--TT-TGT-CA-TTTGGG-----GTTAATAGA-CCTGA-TTCGGGAGATAT--CAGG--TTCTGGGATAgttacgagcacgtcgtcgtcgtaagttttt
gi|11                         :  ggaAGATCGGACCCAGCTCTTTC-GATT--AGAT-CCGTTA---ACT-AGCAA-TGTT-GAG-AA----TATTTTAG-CA-CGTCCATTGGTCAGTTGCTTCAAC-TTT---GT--TTGAATG----AC---GTCA-CAATT------TC-G--TAA--GCGTTC--A--ATTGCTATGAATTATGGGACAGGAATATAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGGT-----GTTAATAGA-CTTGA-TTCGGGAGATAT--CAGG--TTCTG
gi|23                         :    aAGAACGGTTCCAAATCTCCC-ACTT--TGGT-TCGT-----AAC-A--------TAGACTGAG----ATTTGAG-CA-CTTTGATTGGTCAGTTGCTTCAG---GGAA-CT--TTTATTG----GC---GTCA----------------------------C--A--GTT-----------TGGGACAGGCTTAGAAGTCCCTG-CATTT-TTT-CA-TCGGGA-----TTTAACAGA-TCAGA--TCGGGAGATAT--CAGGGACTTTG
gi|16                         :      GAACGAACCCAGCTCTCCC-GATT--GGGT-CCGTTA---AAT-A------------A-CAGC-ACATTTGAG-CA-CGTTGATTGGTCAGTTGCTTCGAG--GAAA-GT--TTGAATG----AG---GTTA-TAGTT------TA-G--TAA--GCGTTT--A--ATGGTTATGAATTGTGAAACATGCATAGCATTCCCTG-C--TTCTTT-CA-TGGTGG-----ATTAATAGA-CCTGA-TTTGGGAGATGT--CAGG--TTata
gi|7                          :        ATGGACCCAGCTCTCCT-GATT--GGGT-CCCTTA---ATT-AGCAA-TGTTGGGA-AAGCTGCATTTATG-CA-CATTGATTGGTCAATTGCTTCAAC-AGAAA-GT--TTGA-TG----AT---GTCA-CTGTC------TAAG--GAA--GCATTC--A--ACTGCTATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-AA-TTGGTG-----GTTAATAGA-CCTGA-TTTGGGAGAAAT--CAGG--TTCTGGGATAc
gi|20                         :           tACCCAGCTCTCCT-AATT--GGGT-CCGTTA---AAT-AGCAA-TGTTGGGA-AAGCCACATTTGGGGCA-TGTTGAATGGTCAGTAGCTTCAAC-TGAAA-GT--TTAGATG----AC---GTCA-CAGTT------TA-A--TAA--CCTTTA--A--ACTGCAATGAATTGTGGGACAGGCATAAAATTACCTA-C--TT-TTT--A-TTGGTG-----GTTAACGGA-CCTGA-TTCG
gi|8                          :           gACCCAGCTCTTCT-GATT--GGGT-CTGTTT---AAT-AG-------CAG-------CACACTTGAG-CA-TGTTGATTGGTCAGTTGCTTCA----GACA-GTGCTTGAAGA----AC---GTCA-TATTTCACTGATA-T--TAA--GTATAT--A--AT--ATATAAATga
gi|9                          :           acCCTAGCTTTCCC-G-TT--ACGCACCGTTA---GAA-AG-------TAGAA-A-----CGTATGAG-CA-TGATGATTACTTAGTTGCTCCAGC--GGGA-G---TTGAATG----aagcagtcataatttagttaagttttaaagtacaacgtaaaatgctggtgaaacagaagcctgattcaggaggttctatatatagact
gi|29                         :     actgtagacaaggtTCTCCA-AATT--CGCT-CCGTTA---AAT-AG-------CAG-------CACATTTGAG-CA-CGTTGATTGATCAGTTGC-TGAAG-AGAAA-GT--TTGAATtatagttcgatataacgcattaaaaacatatgaatttagggaattgcatgggtttacaatagtttttcacagctcgtcgattggagaagtcaagtacatgtactggaatagact
gi|38                         :             tctcaacCTTCC-GATT--GGGT-CCGTAA---AAT-AGCAA-TGTTGGAA-AAGCCACATTTGAG-CA-CGTTGATTGGTCAATTGTTatcgttttttttttcatgacataacgtcattaaggtggggatgaaattgacaaagcgtcataa
gi|22                         :                     TCCA-GATT--GGGT-CCGTTA---AAT-AGCAA-TTGTA---------AC----GAG-CA-CGCTGATTGGTCAGTTGTTTCAA---GAAAAGT--TTGAATG----AC---GTCA-AAGTT------TA-G--TAA--GCTTTC--A--ATTGCTATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-TA---GAG-----------------CTGA-TTCGGGAGATAT--CAGG--ATCTCGGATA
gi|10                         :                      CCC-AAAT--GGGT-CCGTTA---AAT-AG-TAGTGTTAGGA-CCGCCACATATGAG-CA-CGTTGATTGGTCATATGCTTCAAC-TGAAA-GT--ATGAATG----AC---GTCA-CAATT------TA-GTTTAA--GCGTTC--A--ATTGCTATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCTTA-T--AT--------TTGGTG-----GTTAATAGA-CCTGA-TTCAGGAG-CAT--CAGG--TACAGGGATAgact
gi|42                         :               gcacagaCTC-GCTT--GGGT-CTGGTA---CAC-AGC-------------AGTTAGATATGAG-CA-CGTTGATTGGTCAgacta
gi|24                         :                          tgctcacGGT-CCGT-A---AACTAGGAA-TGG--------G----ATTTGAG-CA-CTTTGATTGGTCA-------------------T--TTGAATG----AC---GTCA-CAGTT------TG-G--TAA--GCGTTG--A--ATAGCTATGAATTGTGGGACAGGCATGGAATTCCCTG-C--CT-TTT-CA-TTGGGG-----GTTCATAGA-CCTGA-TTCGGGAGATAT--CA
gi|26                         :                                  gtagagcggacccagaaaATA-TG--AGGA-AAGCCCCATTTGAG-CA-CTTTCAT---------------------AA-GT--TTGAATG----AC---GTCA-CGGTT------TA-A--TAG--GCGTTC--A--ATTGCTATGTAATGTGGGATAGATATAGAATT-CCTG-C--TT-TTT-CA-TTAGTG-----ATTAATAGA-CCTGA-TTCGGAATATAT--CAGA--TTTTGGGTTAcgactg
gi|30                         :                                                                       tagcaGAG-CAGTGCTGATTGGTCATTTA-TTTAAA-TAAA--------CAATGACGCAT---GTCA-TAATT------TG-G--TAA--ACATg
gi|6                          :                                                     ctcttcccgcctcgagacgtcataAG-CA-CGCTGGTTGGTCAGTTGCTTCAGT-GGAAG-G----GGAACT----AT---GTCA-CAGTT------TG-G--TTA--ACACAT--AAGAGTGCTATGAATTGTGGGACGGGCAGGGAATTCCATA-C--TT-TTG-CA-TTAGAG-----TATAACAGC-CCTGA-ATAGAAAAATAT--CACG--TAATGGGACAaagagagcattgttggtagacagagagtaccatgaacttattg
gi|19                         :                     ctgtagaaactgcttagctgtccctgctggggactgttacatagcagtgatatacaAG-CC-CGCTGATTGGTCAGATGCTTCAGC-CGGAG-----TTGGATT----AT---CCCA-AAGTT------GG-G--TAA--ACGCATTAA--AGTGCTATGAATTGTGGGACATGCAAGGAATTTTGTG-C--TT-TTA-CA-TTgact
gi|28                         :                                             gactgtagaaacgtttttggctgttctctccagggacagttacgtaacaCAGTTGCTTCAAC-AGAAG-----TTGAATG----AT---GTCA-TAGTT------GG-G--TAATTGCATTA--G--AGTGCTATGCATTGTGGGACAGACAGGGAACTCCATG-T--TT-TTttgttattacagacctgaatcggaaaatgtg
gi|32                         :                                                                                                          agactttcgaaatgatcctagcgctcctagctatggactgctacatag--TAA--ACATAC--G--GT-GCTATGAACTGTGGGACGGGCATATAATTCGTTG-C--TT-TTT-CA-TTGGTG-----GTTAATATA-CCTGA-TTCAGGAGGTAT--CAGG--TTTTGGGATAatctgtgtaggt
gi|34                         :                                                                                                                                                                       --A--ATTAGTAGAAATTTTGGGACATACATATAAATCTTTG-C--TT-TAT-CA-TTGGGgtcta
gi|33                         :                                                                                                                                                          ttgaatgcgtcattcatacaTGCTATGAATTGCAGGA-AGGTAAGGAATTCCACG-A--TT-Ttatgagcaggactgtgggaga

Unaligned ( gi|31 ): CTAGAGATCGTTACATAGCTAAGCTGTTTAAGCACGACACGCTGATTGGTCAGTTTTTTTTTCAGCGGGAGGTGAACCACGTGGTAAATTTATTATAGTGCTGCTATGA
Unaligned ( gi|35 ): GGGACATGCATAATTTCCTGCTCGCCAAAATGACAATTTCAAAGCATGGGAGATATCAAGCTCTGGGATAGAATA
Unaligned ( gi|36 ): GCATTAGAGTGCTGTGGACTGCGGGGTAGGAAGGGAATCACATTGTTTTACATAATGGTATAACATAACTGAA
Unaligned ( gi|37 ): ATATGAGCAGGCTGATTAGTTAGTTGTTTCGTGAAGGTGAACCACGTGACAATATGGTTAAGGCATGAGA
Unaligned ( gi|41 ): CACTGTAGAAACGCTAGAACTCACCCAGCTGGGGATCATAACATAGCAATGATATACGA
Unaligned ( gi|43 ): CACTGTAGAAACGCTAGAACTCTCCCAGCTGGGAATCATAACATAGCAATGACATA
Unaligned ( gi|44 ): TATATCCTATTTCGGTTATTATTCTCAGACCGATTCATT
Unaligned ( gi|45 ): GTTATATATTCAACATAATAAGTTAATAGTC

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lowQualScore                  :                                                        7 7               3 7    88    3              7777777777777777     3    2  2              222       3 77777      77        222 7777    222 9    3  88 7 88   88 3 8   88   3                                4 88  4   5  5    0     11    3333 0000000 5     777         888                
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Reference ( family-2332 )     :                                                  TGTAGA-A-CGGACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAATAGCAAT-G-T-G-GGAAAGCCACATT-TGAG-CA-CGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AA-C--GAAAGT--TTGAATGA---C----GTCA-C-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGGGGTTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTGGGATA
gi|1                          :                                                  TGTAGT-A-CGGACTCAGCTCTTC-C-TATTTTGGGT-CCGTTTTATAGCAAT-G-TTG-GGAAAGCCACATT-TTAG-CA-CGTTGATTGGTTAG---ATGTTTCAAA-T--GAATGT--TTG-ATGA---C----GTCA-C-TGTTTA-TT--A-A--GCG--C-TTACC--TGC-TATGAATTGTGGAACAGGCATAGAATTCCCTT-A--TT-TTT-CA-TTGTTGGTTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAC---ATCAGGTTCTGGGATA
gi|10                         :                                                                       cCC-C-AAAT--GGGT-CCGTTAAATAGTAGT-G-TTA-GGACCGCCACATA-TGAG-CA-CGTTGATTGGTCAT---ATGCTTC-AA-CT-GAAAGT--ATGAATGA---C----GTCA-C-AATTTA-GTTTA-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCTTA-T--AT--------TTGGTGGTTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCAGGAG-C---ATCAGGTACAGGGATAga
gi|11                         :                                              gcacagaAGA-T-CGGACCCAGCTCTTT-C-GATT--AGAT-CCGTTAACTAGCAAT-G-TTG-AGAA-----TATT-TTAG-CA-CGTCCATTGGTCAG---TTGCTTC-AA-C--TTT-GT--TTGAATGA---C----GTCA-C-AATTTC-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTATGGGACAGGAATATAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGGTGTTA--ATAG----A-------C-TTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTGgacta
gi|12                         :                                                  aGTAGA-A-CGGACGCTGCTCGCC-C-GACT--GGGT-CCGTTAAATAGCAAT---T-G-------TTAC-----GAA-CA-CGGTGATTGGTTAG---TTGCTTC-AG-G--AAAAGT--TTGAATGA---C----GCCA-------TA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGGCAGGCCTAGAATTCACTG-CTATT-TTT-CA-TT-GGCGTTA--ATAG----AAATATATC-TTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTT
gi|13                         :                                                   GTAGA-A-CGAACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAACTAGCAAT---T-G-------TTAC-----GAG-CA-TGCTGATTGGTCAG---TTGCTTT-AG-G--GAAAGT--TTGAATGA---T----GTCA----------------A--GAG--C-TCAGT--TGC-TATGAATTGTTGGACAGGCATGGAATTCCCTG-CT-TT-TTT-CA-TTAACAGTTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGAAGAT---ATCAGGTTCTAGGA
gi|14                         :                                                   GTAGA-A-CGAACTCAACTATCC-C-GTTT--GGAT-CCGTTAAATATCAG---------------CACATT-TGAG-CA-CGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AG-G--GAAACT--TTGAATGA---C----GACA-T-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGCATTGTGGTACAGGCATAGGATTACCTG-CT-TT-TTT-TA-TTGGGGGTTA--ATAT----A-------C-TTGAT---TAGGGAGAT---ACCGGaag
gi|15                         :                                                   cTAGA-A-CGAACCCAGCTCTCC-C-GATT--TGGT-CCGTTACATAACAAT--------------CA-GTA-CGAG-CA-CGCTTATTAGTCAG---TTGTTTC-AG-G--GAAAGT--TTGAATGA---T----GTCA-T-AATTTA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGAGACAGGTATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGTGGTTA--ATAA----A-------C-CTGGT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTt
gi|16                         :                                                      GA-A-CGAACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAATAACAG---------------CACATT-TGAG-CA-CGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-GA-G--GAAAGT--TTGAATGA---G----GTTA-T-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-TTAAT--GGT-TATGAATTGTGAAACATGCATAGCATTCCCTG-C--TTCTTT-CA-TGGTGGATTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TTGGGAGAT---GTCAGGTTC
gi|17                         :                                                    TAGA-A-TAAATCCAACTCTCT-C-GATT--GTGT-CCGTTCAATAGCAAT---T-G------------TTATGAG-CA-CGCTGATTGG---------------AA-CGGGAAAGT--TTAAATGA---C----GTCA-T-AATTTA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGAACAGGAATAGAATTCCCTT-C--TT-TTTCCA-TTGGTGGTTG--GCA-----------------GAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTAGGATA
gi|18                         :                                                  tcTAGA-A-CGGACTCTGCTCTCC-C-TATA--AGAT-CCGTTAAATAACAG---------------CACATC-TGA--CA-CGTTGATTGGTCAG---TTGATTT-GG-T--GAAAGT--TTAAATAA---C----GTCA-T-AATTTA-GT--T-A--GCG--T-TTAAT--TGC-TATGAACTGTTGGACAAGCATAGACTTCCCTGAT--TT-TTT-CA-TTAGGGGTTA--ATAT----A-------A-TTAAT---TCGACATAT---ATTA
gi|19                         :                                                                                                                              AG-CC-CGCTGATTGGTCAG---ATGCTTC-AG-C--CGGAGT--T-GGATTA---T----CCCA-A-AGTTGG-GT--A-A--ACGCAT-TAAAG--TGC-TATGAATTGTGGGACATGCAAGGAATTTTGTG-C--TT-TTA-CA-TT--TTGTTATTACAG----A-------C-CTGAA---TCGGAAAAT---GTt
gi|2                          : gactgtagaaacgtttttggctgttctctccagggacagttacgtaacaTGTAGA-A-CGGACCCAGCT-TCC-C-GATT--GGTT-CCGTTAAATAGCAAT-G-TTG-GGACAGTCACATT-TGAA-CA-CGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AA-CT-GAAAGT--TTGAATAATAAC----GTTG-C-CGTTTA-GT--A-A--GCA--T-GCAAT--TGC-TATGAATTGAGGGCCAGGCAGAGAATCCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGAGGTTA--ATAG----C-------C-CTGAT---TCGGGGAAT---ATCAGGTTCTg
gi|20                         :                                                             GACCCAGCTCTCC-T-AATT--GGGT-CCGTTAAATAGCAAT-G-TTG-GGAAAGCCACATT-TGGGGCA-TGTTGAATGGTCAG---TAGCTTC-AA-CT-GAAAGT--TTAGATGA---C----GTCA-C-AGTTTA-AT--A-A--CCT--T-TAAAC--TGC-AATGAATTGTGGGACAGGCATAAAATTACCTA-C--TT-TTT--A-TTGGTGGTTA--ACGG----A-------C-CTGAT---TCGGtgtat
gi|21                         :                                                    TAGA-G-CGGACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTAAACTAGGAAT-G-----GGATA---------TGAG-CA-CTTTGATTGG--------------------------------AATGA---C----GTCA-C-AGTTTG-GT--A-A--GCG--T-TGAAT--AGC-TATGAATTGTGGGACAAGCATGGAATTCCCTG-C--CT-TTT-CA-TTGGGGGTTT--ATAG----A-------C-CTGAC---TCTGGAGAT---ATCAGG-ACAGGGATAa
gi|22                         :                                                                     tcTCC-A-GATT--GGGT-CCGTTAAATAGCAATTG-T-A---------AC-----GAG-CA-CGCTGATTGGTCAG---TTGTTTC-AA-G--AAAAGT--TTGAATGA---C----GTCA-A-AGTTTA-GT--A-A--GCT--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-----------------TAG----A-------G-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGATCTCGGATAgac
gi|23                         :                                                     AGA-A-CGGTTCCAAATCTCC-C-ACTT--TGGT-TCGTAACATAG-ACT-G---------AG----ATT-TGAG-CA-CTTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AG----GGAACT--TTTATTGG---C----GTCA-C-A-----------------G--T-T-------------------TGGGACAGGCTTAGAAGTCCCTG-CATTT-TTT-CA-TCGGGATTTA--ACAG----A-------T-CAGA----TCGGGAGAT---ATCAGGgact
gi|24                         :                                                   GTAGA-G-CGGACCCAG---------AA----AGGT-CCGTAAACTAGGAAT-G-----GGA--------TT-TGAG-CA-CTTTGATTGGTCA-----------------------T--TTGAATGA---C----GTCA-C-AGTTTG-GT--A-A--GCG--T-TGAAT--AGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATGGAATTCCCTG-C--CT-TTT-CA-TTGGGGGTTC--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAgactttgata
gi|25                         :                                                  TGTAGA-A-TGGTCCCAGATCTCC-T-GTGT--TGGT-CCATTACATAGTTAT-G---------AG----ATT-TGAG-CA-TATTGATTTATCAG---TTGCTAT-AG-G--GGAAGT--T-GAATGA---T----TTCA-C-AGTTTA-GT--T-A--GCG--T-TAGAT--AGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TCT-CA-TTGcgactg
gi|26                         :                                                                                               cTAGCAAT-A-T-GAGGAAAGCCCCATT-TGAG-CA-CTTTCAT--------------------------AAGT--TTGAATGA---C----GTCA-C-GGTTTA-AT--A-G--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGTAATGTGGGATAGATATAGAATT-CCTG-C--TT-TTT-CA-TTAGTGATTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGAATAT---ATCAGATTTTGGGTTA
gi|27                         :                                                        -A-CAGAACAAGCTCTCC-C-AATA--AGGT-CCGTTAAA-AGCAAT-G-TTG-AAAAAGCCATATT-TGAG-CA-CGCTGACTGGTCAA---TTGTTTC-AAAT--GAATAA--TTGAATTA---C----GTCA-C-ATTTTA-TT--A-A--GCG--T-TATAT--TGC-TATGAATTGTGGGAAAGGCATAGAAg
gi|28                         :                                                                                                                                             gcCAG---TTGCTTC-AA-C--AGAAGT--T-GAATGA---T----GTCA-T-AGTTGG-GT--A-ATTGCA--T-TAGAG--TGC-TATGCATTGTGGGACAGACAGGGAACTCCATG-T--TT-TT
gi|29                         :               agactttcgaaatgatcctagcgctcctagctatggactgctacatagCTCAACTCTCC-A-AATT--CGCT-CCGTTAAATAGCAG---------------CACATT-TGAG-CA-CGTTGATTGATCAG---TTGCTGA-AG-A--GAAAGT--TTGAATAT---C----GTatctgtgtaggt
gi|3                          :                                                 tTATAGA-A-CGAACCCGGTTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAACAGATAT-GGT-A-GAAAAGCCACATT-TGAG-CA-CGTTGATTGGCCAG---TTGCTTC-AA-CT-GAAAGT--TTGAATGA---T----GTCA-C-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-GCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGAGGGGTA--ATAT----A-------C-CTGAT---TTGCGAGAT---ATTAAGTTTTGGGATAtttttttttcatgacataacgtcattaaggtggggatgaaattgacaaagcgtcataa
gi|30                         :                                                                                                                             GAG-CAGTGCTGATTGGTCAT---TTATTTA-AA-T--AAA-------CAATGA---CGCATGTCA-T-AATTTG-GT--A-A--ACA--T-
gi|31                         :                                                                                                        ctcttcccgcctcgagacgtcata-CA-CGCTGATTGGTCAGTTTTTTTTTC-AG-C--GGGAG---GTGAACCA---C----GTGG-TAAATTTA-TT--ATA--GTG--------C--TGC-TATGAaagagagcattgttggtagacagagagtaccatgaacttattg
gi|32                         :                                                                                                                                                                                         ctagagatcgttacatagctaagctgtttaagcacga--TGC-TATGAACTGTGGGACGGGCATATAATTCGTTG-C--TT-TTT-CA-TTGGTGGTTA--ATAT----A-------C-CTGAT---TCAGGAGGT---ATCAGGTTTTGGGATA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                   taaacatacgg--TGC-TATGAATTGCAGGA-AGGTAAGGAATTCCACG-A--TT-TAT--A-TAAAAGTTTA--ACAGTTTAA-------CAGTTATTAATCTGGAGAA---CTCAGGTTATGGGAgtcta
gi|34                         :                                                                                                                                                                        c--TTGAATG----C----GTCA-----TTCA--T--A-----CA------AAT--TAG-TAGAAATTTTGGGACATACATATAAATCTTTG-C--TT-TAT-CA-TTGGGTATGA--GCAG----G-------A-CTG------TGGGAGAgagacta
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GGGAGAT---ATCAAGCTCTGGGATA
gi|38                         :                       gggacatgcataatttcctgctcgccaaaatgacaatttcaaagcatCTTC-C-GATT--GGGT-CCGTAAAATAGCAAT-G-TTG-GAAAAGCCACATT-TGAG-CA-CGTTGATTGGTCAA---TTGTTgaata
gi|39                         :                                                   GTAGA-A-CTGATCCAGCTCTCC-C-GCGT--TGAT-CCGTTA
gi|4                          :                                                  tcaAGT-A-CGGGCCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAATAGCAAT-G-TTG-GGAAAGCAACATT-TGAG-CA-CGTTGATTGGTCAG---TTATGTC-AA-CT-TAAAG---TTGGATGA---A----GTCA-C-TGTTTT-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TACGAATTGTGGGACAGGCAAAGAATTCCCTG-C--TT-TGT-CA-TTTGGGGTTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTGGGATAgttacgagcacgtcgtcgtcgtaagttttt
gi|40                         :                                                 ggaTGGA-A-CCAATTCAGCTTTCC-CCGATA--GGGT-CCGTTACTTAGCAAC-G-T-------------ATT-TGAA-CA-CATT
gi|42                         :                                                                   GCTCACCTC-GCTT--GGGT-CTGGTACACAGCAGT---T-A-G---------ATA-TGAG-CA-CGTTGATTGGTCA
gi|5                          :                                                 tTGTAGA-A-TGAACCCAGCTCTCT-T-GATT--GGGT-CTGTTAAATAGCAAT-G-TTG-GGAAAGCCACATT-TGAG-CA-TGTTGATTGGTCAG---TTGCCTC-AA-CT-GAAAAT--TTGAATGA---C----GCCAGC-A-TTT-------------G--T-TTCAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCATG-C--TT-TTT-CATTTGGAGGTTT--ATAG----A-------C-CTGAT---TTGGAAGGTATAATGAGATTCTGGGATA
gi|6                          :                                                  TGTAGA-AACTG-CTTAGCTGTCC-CTGCTG--GGGA-CTGTTACATAGCAGT-G-------------ATATA-CAAG-CA-CGCTGGTTGGTCAG---TTGCTTC-AG-T--GGAAGG--G-GAACTA---T----GTCA-C-AGTTTG-GT--T-A--ACA--C-ATAAGAGTGC-TATGAATTGTGGGACGGGCAGGGAATTCCATA-C--TT-TTG-CA-TTAGAGTATA--ACAG----C-------C-CTGAA---TAGAAAAAT---ATCACGTAATGGGACAga
gi|7                          :                                                       c-A-TGGACCCAGCTCTCC-T-GATT--GGGT-CCCTTAATTAGCAAT-G-TTG-GGAAAGCTGCATT-TATG-CA-CATTGATTGGTCAA---TTGCTTC-AA-CA-GAAAGT--TTGA-TGA---T----GTCA-C-TGTCTAAGG--A-A--GCA--T-TCAAC--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-AA-TTGGTGGTTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TTGGGAGAA---ATCAGGTTCTGGGATAgact
gi|8                          :                                                             tACCCAGCTCTTC-T-GATT--GGGT-CTGTTTAATAGCAG---------------CACACT-TGAG-CA-TGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-A-----GACAGTGCTTGAAGAA---C----GTCA-T-ATTTCA-
gi|9                          :                                                acTGTAGACA-AGGTCCTAGCTTTCC-C-G-TT--ACGCACCGTTAGAAAGTA----------GAAA----CGTA-TGAG-CA-TGATGATTACTTAG---TTGCTCC-AG-C--GGGAG---TTGAATG-----------TA-T-AGTTCG-AT--ATA--ACG--CATTAAA--AACATATGAATTTAGGGActgatattaagtatataatatataaataagcagtcataatttagttaagttttaaagtacaacgtaaaatgctggtgaaacagaagcctgattcaggaggttctatatatagact

Unaligned ( gi|36 ): GCATTAGAGTGCTGTGGACTGCGGGGTAGGAAGGGAATCACATTGTTTTACATAATGGTATAACATAACTGAA
Unaligned ( gi|37 ): ATATGAGCAGGCTGATTAGTTAGTTGTTTCGTGAAGGTGAACCACGTGACAATATGGTTAAGGCATGAGA
Unaligned ( gi|41 ): CACTGTAGAAACGCTAGAACTCACCCAGCTGGGGATCATAACATAGCAATGATATACGA
Unaligned ( gi|43 ): CACTGTAGAAACGCTAGAACTCTCCCAGCTGGGAATCATAACATAGCAATGACATA
Unaligned ( gi|44 ): TATATCCTATTTCGGTTATTATTCTCAGACCGATTCATT
Unaligned ( gi|45 ): GTTATATATTCAACATAATAAGTTAATAGTC

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Reference ( family-2332 )     :                                                  TGTAGA-A-CGGACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAATAGCAAT-GT--GG----G--A-A--GCCACATT-TGAG-CACG-----TTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AG-C-GAAAGT--TTGAATGA---CGTCA-C-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGNGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTGGGATA
gi|1                          :                                                  TGTAGT-A-CGGACTCAGCTCTTC-C-TATTTTGGGT-CCGTTTTATAGCAAT-GTTGGG----A--A-A--GCCACATT-TTAG-CACG-----TTGATTGGTTAG---ATGTTTCAAA-T-GAATGT--TTG-ATGA---CGTCA-C-TGTTTA-TT--A-A--GCG--C-TTACC--TGC-TATGAATTGTGGAACAGGCATAGAATTCCCTT-A--TT-TTT-CA-TTGTTGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAC---ATCAGGTTCTGGGATA
gi|10                         :                                                                       cCC-C-AAAT--GGGT-CCGTTAAATAGTAGT-GT--TA----G--G-ACCGCCACATA-TGAG-CACG-----TTGATTGGTCAT---ATGCTTC-AA-CTGAAAGT--ATGAATGA---CGTCA-C-AATTTA-GTTTA-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCTTA-T--AT--------TTGGTGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCAGGAG-C---ATCAGGTACAGGGATAga
gi|11                         :                                              gcacagaAGA-T-CGGACCCAGCTCTTT-C-GATT--AGAT-CCGTTAACTAGCAAT-GTT-GA----G--A-A------TATT-TTAG-CACG-----TCCATTGGTCAG---TTGCTTC-AA-C-TTT-GT--TTGAATGA---CGTCA-C-AATTTC-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTATGGGACAGGAATATAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGGTG-TTA--ATAG----A-------C-TTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTGgacta
gi|12                         :                                                  aGTAGA-A-CGGACGCTGCTCGCC-C-GACT--GGGT-CCGTTAAATAGCAAT--T--G--------------TTAC-----GAA-CACG-----GTGATTGGTTAG---TTGCTTC-AG-G-AAAAGT--TTGAATGA---CGCCA-------TA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGGCAGGCCTAGAATTCACTG-CTATT-TTT-CA-TTGGC-G-TTA--ATAG----AAATATATC-TTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTT
gi|13                         :                                                   GTAGA-A-CGAACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAACTAGCAAT--T--G--------------TTAC-----GAG-CATG-----CTGATTGGTCAG---TTGCTTT-AG-G-GAAAGT--TTGAATGA---TGTCA----------------A--GAG--C-TCAGT--TGC-TATGAATTGTTGGACAGGCATGGAATTCCCTG-C--TT-TTTTCA-TTAACAG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGAAGAT---ATCAGGTTCTAGGA
gi|14                         :                                                   GTAGA-A-CGAACTCAACTATCC-C-GTTT--GGAT-CCGTTAAATATCAG----------------------CACATT-TGAG-CACG-----TTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AG-G-GAAACT--TTGAATGA---CGACA-T-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGCATTGTGGTACAGGCATAGGATTACCTG-CT-TT-TTT-TA-TTGGGGG-TTA--ATAT----A-------C-TTGAT---TAGGGAGAT---ACCGGaag
gi|15                         :                                                   cTAGA-A-CGAACCCAGCTCTCC-C-GATT--TGGT-CCGTTACATAACAAT---------------------CA-GTA-CGAG-CACG-----CTTATTAGTCAG---TTGTTTC-AG-G-GAAAGT--TTGAATGA---TGTCA-T-AATTTA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGAGACAGGTATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGTGG-TTA--ATAA----A-------C-CTGGT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTt
gi|16                         :                                                      GA-A-CGAACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAATAACAG----------------------CACATT-TGAG-CACG-----TTGATTGGTCAG---TTGCTTC-GA-G-GAAAGT--TTGAATGA---GGTTA-T-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-TTAAT--GGT-TATGAATTGTGAAACATGCATAGCATTCCCTG-C--TTCTTT-CA--TGGTGGATTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TTGGGAGAT---GTCAGGTTC
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gi|18                         :                                                  tcTAGA-A-CGGACTCTGCTCTCC-C-TATA--AGAT-CCGTTAAATAACAG----------------------CACATC-TGA--CACG-----TTGATTGGTCAG---TTGATTT-GG-T-GAAAGT--TTAAATAA---CGTCA-T-AATTTA-GT--T-A--GCG--T-TTAAT--TGC-TATGAACTGTTGGACAAGCATAGACTTCCCTGAT--TT-TTT-CA-TTAGGGG-TTA--ATAT----A-------A-TTAAT---TCGACATAT---ATTA
gi|19                         :                                                                                                                                     AG-CCCG-----CTGATTGGTCAG---ATGCTTC-AG-C-CGGAGT--T-GGATTA---TCCCA-A-AGTTGG-GT--A-A--ACGCAT-TAAAG--TGC-TATGAATTGTGGGACATGCAAGGAATTTTGTG-C--TT-TTA-CA-TT--TTG-TTATTACAG----A-------C-CTGAA---TCGGAAAAT---GTt
gi|2                          : gactgtagaaacgtttttggctgttctctccagggacagttacgtaacaTGTAGA-A-CGGACCCAGCT-TCC-C-GATT--GGTT-CCGTTAAATAGCAAT-GTT-GG----G--ACA--GTCACATT-TGAA-CACG-----TTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AA-CTGAAAGT--TTGAATAATAACGTTG-C-CGTTTA-GT--A-A--GCA--T-GCAAT--TGC-TATGAATTGAGGGCCAGGCAGAGAATCCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGAGG-TTA--ATAG----C-------C-CTGAT---TCGGGGAAT---ATCAGGTTCTg
gi|20                         :                                                             GACCCAGCTCTCC-T-AATT--GGGT-CCGTTAAATAGCAAT-GTTGGG----A--A-A--GCCACATT-TGGGGCATG-----TTGAATGGTCAG---TAGCTTC-AA-CTGAAAGT--TTAGATGA---CGTCA-C-AGTTTA-AT--A-A--CCT--T-TAAAC--TGC-AATGAATTGTGGGACAGGCATAAAATTACCTA-C--TT-TTT--A-TTGGTGG-TTA--ACGG----A-------C-CTGAT---TCGGtgtat
gi|21                         :                                                    TAGA-G-CGGACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTAAACTAGGAAT-G----G----G--A----------TA-TGAG-CACT-----TTGATTGG-------------------------------AATGA---CGTCA-C-AGTTTG-GT--A-A--GCG--T-TGAAT--AGC-TATGAATTGTGGGACAAGCATGGAATTCCCTG-C--CT-TTT-CA-TTGGGGG-TTT--ATAG----A-------C-CTGAC---TCTGGAGAT---ATCAGG-ACAGGGATAa
gi|22                         :                                                                     tcTCC-A-GATT--GGGT-CCGTTAAATAGCAATTGT--A----------------AC-----GAG-CACG-----CTGATTGGTCAG---TTGTTTC-AA-G-AAAAGT--TTGAATGA---CGTCA-A-AGTTTA-GT--A-A--GCT--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT------------------TAG----A-------G-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGATCTCGGATAgac
gi|23                         :                                                     AGA-A-CGGTTCCAAATCTCC-C-ACTT--TGGT-TCGTAACATAG-ACT-G--------------A--G----ATT-TGAG-CACT-----TTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AG---GGAACT--TTTATTGG---CGTCA-C-A-----------------G--T-T-------------------TGGGACAGGCTTAGAAGTCCCTG-CATTT-TTT-CA-TCGGGAT-TTA--ACAG----A-------T-CAGA----TCGGGAGAT---ATCAGGgact
gi|24                         :                                                   GTAGA-G-CGGACCCAG---------AA----AGGT-CCGTAAACTAGGAAT-G----G----G--A----------TT-TGAG-CACT-----TTGATTGGTCA----------------------T--TTGAATGA---CGTCA-C-AGTTTG-GT--A-A--GCG--T-TGAAT--AGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATGGAATTCCCTG-C--CT-TTT-CA-TTGGGGG-TTC--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAgactttgata
gi|25                         :                                                  TGTAGA-A-TGGTCCCAGATCTCC-T-GTGT--TGGT-CCATTACATAGTTAT-G--------------A--G----ATT-TGAG-CATA-----TTGATTTATCAG---TTGCTAT-AG-G-GGAAGT--T-GAATGA---TTTCA-C-AGTTTA-GT--T-A--GCG--T-TAGAT--AGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TCT-CA-TTGcgactg
gi|26                         :                                                                                               cTAGCAAT-AT--GA----GGAA-A--GCCCCATT-TGAG-CACT-----TTCAT-------------------------AAGT--TTGAATGA---CGTCA-C-GGTTTA-AT--A-G--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGTAATGTGGGATAGATATAGAATT-CCTG-C--TT-TTT-CA-TTAGTGA-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGAATAT---ATCAGATTTTGGGTTA
gi|27                         :                                                        -A-CAGAACAAGCTCTCC-C-AATA--AGGT-CCGTTAAA-AGCAAT-GT--TG----A--A-AAAGCCATATT-TGAG-CACG-----CTGACTGGTCAA---TTGTTTC-AAAT-GAATAA--TTGAATTA---CGTCA-C-ATTTTA-TT--A-A--GCG--T-TATAT--TGC-TATGAATTGTGGGAAAGGCATAGAAg
gi|28                         :                                                                                                                                                        gcCAG---TTGCTTC-AA-C-AGAAGT--T-GAATGA---TGTCA-T-AGTTGG-GT--A-ATTGCA--T-TAGAG--TGC-TATGCATTGTGGGACAGACAGGGAACTCCATG-T--TT-TT
gi|29                         :               agactttcgaaatgatcctagcgctcctagctatggactgctacatagCTCAACTCTCC-A-AATT--CGCT-CCGTTAAATAGCAG----------------------CACATT-TGAG-CACG-----TTGATTGATCAG---TTGCTGA-AG-A-GAAAGT--TTGAATAT---CGTatctgtgtaggt
gi|3                          :                                                 tTATAGA-A-CGAACCCGGTTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAACAG--AT-AT--GGTAGAA--A-A--GCCACATT-TGAG-CACG-----TTGATTGGCCAG---TTGCTTC-AA-CTGAAAGT--TTGAATGA---TGTCA-C-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-GCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGAGGG-GTA--ATAT----A-------C-CTGAT---TTGCGAGAT---ATTAAGTTTTGGGATAtttttttttcatgacataacgtcattaaggtggggatgaaattgacaaagcgtcataa
gi|31                         :                                                                                         CGTTACATAGC-----T-----------A-A--GCTG--TT-TAAG-CACGACACGCTGATTGGTCAGTTTTTTTTTC-AG-C-GGGAG---GTGAACCA---CGTGG-TAAATTTA-TT--ATA--GTG--------C--TGC-TATGA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                            ctagagat--TGC-TATGAACTGTGGGACGGGCATATAATTCGTTG-C--TT-TTT-CA-TTGGTGG-TTA--ATAT----A-------C-CTGAT---TCAGGAGGT---ATCAGGTTTTGGGATA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                         taaacatacgg--TGC-TATGAATTGCAGGA-AGGTAAGGAATTCCACG-A--TT-TAT--A-TAAAAGT-TTA--ACAGTTTAA-------CAGTTATTAATCTGGAGAA---CTCAGGTTATGGGAgtcta
gi|34                         :                                                                                                                                                                                  c--TTGAATG----CGTCA-----TTCA--T--A-----CA------AAT--TAG-TAGAAATTTTGGGACATACATATAAATCTTTG-C--TT-TAT-CA-TTGGGTA-TGA--GCAG----G-------A-CTG------TGGGAGAgagacta
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGGAGAT---ATCAAGCTCTGGGATA
gi|38                         :                       gggacatgcataatttcctgctcgccaaaatgacaatttcaaagcatCTTC-C-GATT--GGGT-CCGTAAAATAGCAAT-GT--TG----G--A-AAAGCCACATT-TGAG-CACG-----TTGATTGGTCAA---TTGTTgaata
gi|39                         :                                                   GTAGA-A-CTGATCCAGCTCTCC-C-GCGT--TGAT-CCGTTA
gi|4                          :                                                  tcaAGT-A-CGGGCCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAATAGCAAT-GTTGGG----A--A-A--GCAACATT-TGAG-CACG-----TTGATTGGTCAG---TTATGTC-AA-CTTAAAG---TTGGATGA---AGTCA-C-TGTTTT-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TACGAATTGTGGGACAGGCAAAGAATTCCCTG-C--TT-TGT-CA-TTTGGGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTGGGATAgttacgagcacgtcgtcgtcgtaagttttt
gi|40                         :                                                 ggaTGGA-A-CCAATTCAGCTTTCC-CCGATA--GGGT-CCGTTACTTAGCAAC-GT---------------------ATT-TGAA-CACA-----TT
gi|42                         :                                                                   GCTCACCTC-GCTT--GGGT-CTGGTACACAGCAGT--T--AG-----------------ATA-TGAG-CACG-----TTGATTGGTCA
gi|5                          :                                                 tTGTAGA-A-TGAACCCAGCTCTCT-T-GATT--GGGT-CTGTTAAATAGCAAT-GTTGGG----A--A-A--GCCACATT-TGAG-CATG-----TTGATTGGTCAG---TTGCCTC-AA-CTGAAAAT--TTGAATGA---CGCCAGC-A-TTT-------------G--T-TTCAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCATG-C--TT-TTT-CATTTGGAGG-TTT--ATAG----A-------C-CTGAT---TTGGAAGGTATAATGAGATTCTGGGATA
gi|6                          :                                                  TGTAGA-AACTG-CTTAGCTGTCC-CTGCTG--GGGA-CTGTTACATAGCAGT-G--------------------ATATA-CAAG-CACG-----CTGGTTGGTCAG---TTGCTTC-AG-T-GGAAGG--G-GAACTA---TGTCA-C-AGTTTG-GT--T-A--ACA--C-ATAAGAGTGC-TATGAATTGTGGGACGGGCAGGGAATTCCATA-C--TT-TTG-CA-TTAGAGT-ATA--ACAG----C-------C-CTGAA---TAGAAAAAT---ATCACGTAATGGGACAga
gi|7                          :                                                       c-A-TGGACCCAGCTCTCC-T-GATT--GGGT-CCCTTAATTAGCAAT-GTTGGG----A--A-A--GCTGCATT-TATG-CACA-----TTGATTGGTCAA---TTGCTTC-AA-CAGAAAGT--TTGA-TGA---TGTCA-C-TGTCTAAGG--A-A--GCA--T-TCAAC--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-AA-TTGGTGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TTGGGAGAA---ATCAGGTTCTGGGATAgact
gi|8                          :                                                             tACCCAGCTCTTC-T-GATT--GGGT-CTGTTTAATAGCAG----------------------CACACT-TGAG-CATG-----TTGATTGGTCAG---TTGCTTC-A----GACAGTGCTTGAAGAA---CGTCA-T-ATTTCA-
gi|9                          :                                                acTGTAGACA-AGGTCCTAGCTTTCC-C-G-TT--ACGCACCGTTAGAAAGTA-------------G--A-A-----ACGTA-TGAG-CATG-----ATGATTACTTAG---TTGCTCC-AG-C-GGGAG---TTGAATG-------TA-T-AGTTCG-AT--ATA--ACG--CATTAAA--AACATATGAATTTAGGGActgatattaagtatataatatataaataagcagtcataatttagttaagttttaaagtacaacgtaaaatgctggtgaaacagaagcctgattcaggaggttctatatatagact

Unaligned ( gi|30 ): CTCTTCCCGCCTCGAGACGTCATAGAGCAGTGCTGATTGGTCATTTATTTAAATAAACAATGACGCATGTCATAATTTGGTAAACATAAGAGAGCATTGTTGGTAGACAGAGAGTACCATGAACTTATTG
Unaligned ( gi|36 ): GCATTAGAGTGCTGTGGACTGCGGGGTAGGAAGGGAATCACATTGTTTTACATAATGGTATAACATAACTGAA
Unaligned ( gi|37 ): ATATGAGCAGGCTGATTAGTTAGTTGTTTCGTGAAGGTGAACCACGTGACAATATGGTTAAGGCATGAGA
Unaligned ( gi|41 ): CACTGTAGAAACGCTAGAACTCACCCAGCTGGGGATCATAACATAGCAATGATATACGA
Unaligned ( gi|43 ): CACTGTAGAAACGCTAGAACTCTCCCAGCTGGGAATCATAACATAGCAATGACATA
Unaligned ( gi|44 ): TATATCCTATTTCGGTTATTATTCTCAGACCGATTCATT
Unaligned ( gi|45 ): GTTATATATTCAACATAATAAGTTAATAGTC

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consensus                     :                                                  TGTAGA-A-CGGACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAATAGC-AA--TGT---GG-----A-A---GCCACATT-TGAG-CACGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AG-C-GAAAGT--TTGAATGA---CGTCA-C-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGNGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTGGGATA
Reference ( family-2332 )     :                                                  TGTAGA-A-CGGACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAATAGC-AA--TGT---GG-----A-A---GCCACATT-TGAG-CACGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AG-C-GAAAGT--TTGAATGA---CGTCA-C-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGNGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTGGGATA
gi|1                          :                                                  TGTAGT-A-CGGACTCAGCTCTTC-C-TATTTTGGGT-CCGTTTTATAGC-AA--TGTTGGGA-----A-A---GCCACATT-TTAG-CACGTTGATTGGTTAG---ATGTTTCAAA-T-GAATGT--TTG-ATGA---CGTCA-C-TGTTTA-TT--A-A--GCG--C-TTACC--TGC-TATGAATTGTGGAACAGGCATAGAATTCCCTT-A--TT-TTT-CA-TTGTTGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAC---ATCAGGTTCTGGGATA
gi|10                         :                                                                       cCC-C-AAAT--GGGT-CCGTTAAATAGT-AG--TGTTA-GG-----A-CC--GCCACATA-TGAG-CACGTTGATTGGTCAT---ATGCTTC-AA-CTGAAAGT--ATGAATGA---CGTCA-C-AATTTA-GTTTA-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCTTA-T--AT--------TTGGTGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCAGGAG-C---ATCAGGTACAGGGATAga
gi|11                         :                                              gcacagaAGA-T-CGGACCCAGCTCTTT-C-GATT--AGAT-CCGTTAACTAGC-AA--TGT---TG-----A-G---A--ATATT-TTAG-CACGTCCATTGGTCAG---TTGCTTC-AA-C-TTT-GT--TTGAATGA---CGTCA-C-AATTTC-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTATGGGACAGGAATATAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGGTG-TTA--ATAG----A-------C-TTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTGgacta
gi|12                         :                                                  aGTAGA-A-CGGACGCTGCTCGCC-C-GACT--GGGT-CCGTTAAATAGC-AA--T-T---G-------------TTAC-----GAA-CACGGTGATTGGTTAG---TTGCTTC-AG-G-AAAAGT--TTGAATGA---CGCCA-------TA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGGCAGGCCTAGAATTCACTG-CTATT-TTT-CA-TTGGC-G-TTA--ATAG----AAATATATC-TTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTT
gi|13                         :                                                   GTAGA-A-CGAACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAACTAGC-AA--T-T---G-------------TTAC-----GAG-CATGCTGATTGGTCAG---TTGCTTT-AG-G-GAAAGT--TTGAATGA---TGTCA----------------A--GAG--C-TCAGT--TGC-TATGAATTGTTGGACAGGCATGGAATTCCCTG-CT-TT-TTT-CA-TTAACAG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGAAGAT---ATCAGGTTCTAGGA
gi|14                         :                                                   GTAGA-A-CGAACTCAACTATCC-C-GTTT--GGAT-CCGTTAAATATC-AG-----------------------CACATT-TGAG-CACGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AG-G-GAAACT--TTGAATGA---CGACA-T-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGCATTGTGGTACAGGCATAGGATTACCTG-CT-TT-TTT-TA-TTGGGGG-TTA--ATAT----A-------C-TTGAT---TAGGGAGAT---ACCGGaag
gi|15                         :                                                   cTAGA-A-CGAACCCAGCTCTCC-C-GATT--TGGT-CCGTTACATAAC-AA--T--------------------CA-GTA-CGAG-CACGCTTATTAGTCAG---TTGTTTC-AG-G-GAAAGT--TTGAATGA---TGTCA-T-AATTTA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGAGACAGGTATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGTGG-TTA--ATAA----A-------C-CTGGT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTt
gi|16                         :                                                      GA-A-CGAACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAATAAC-AG-----------------------CACATT-TGAG-CACGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-GA-G-GAAAGT--TTGAATGA---GGTTA-T-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-TTAAT--GGT-TATGAATTGTGAAACATGCATAGCATTCCCTG-C--TTCTTT-CA--TGGTGGATTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TTGGGAGAT---GTCAGGTTC
gi|17                         :                                                    TAGA-A-TAAATCCAACTCTCT-C-GATT--GTGT-CCGTTCAATAGC-AA--T-T---G------------------TTATGAG-CACGCTGATTGG--AA---------C-GG---GAAAGT--TTAAATGA---CGTCA-T-AATTTA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGAACAGGAATAGAATTCCCTT-C--TT-TTTCCA-TTGGTGG-TTG--GCA-----------------GAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTAGGATA
gi|18                         :                                                  tcTAGA-A-CGGACTCTGCTCTCC-C-TATA--AGAT-CCGTTAAATAAC-AG-----------------------CACATC-TGA--CACGTTGATTGGTCAG---TTGATTT-GG-T-GAAAGT--TTAAATAA---CGTCA-T-AATTTA-GT--T-A--GCG--T-TTAAT--TGC-TATGAACTGTTGGACAAGCATAGACTTCCCTGAT--TT-TTT-CA-TTAGGGG-TTA--ATAT----A-------A-TTAAT---TCGACATAT---ATTA
gi|19                         :                                                                                                                                       AG-CCCGCTGATTGGTCAG---ATGCTTC-AG-C-CGGAGT--T-GGATTA---TCCCA-A-AGTTGG-GT--A-A--ACGCAT-TAAAG--TGC-TATGAATTGTGGGACATGCAAGGAATTTTGTG-C--TT-TTA-CA-TT--TTG-TTATTACAG----A-------C-CTGAA---TCGGAAAAT---GTt
gi|2                          : gactgtagaaacgtttttggctgttctctccagggacagttacgtaacaTGTAGA-A-CGGACCCAGCT-TCC-C-GATT--GGTT-CCGTTAAATAGC-AA--TGTTG-GG-----ACA---GTCACATT-TGAA-CACGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AA-CTGAAAGT--TTGAATAATAACGTTG-C-CGTTTA-GT--A-A--GCA--T-GCAAT--TGC-TATGAATTGAGGGCCAGGCAGAGAATCCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGAGG-TTA--ATAG----C-------C-CTGAT---TCGGGGAAT---ATCAGGTTCTg
gi|20                         :                                                             GACCCAGCTCTCC-T-AATT--GGGT-CCGTTAAATAGC-AA--TGTTGGGA-----A-A---GCCACATT-TGGGGCATGTTGAATGGTCAG---TAGCTTC-AA-CTGAAAGT--TTAGATGA---CGTCA-C-AGTTTA-AT--A-A--CCT--T-TAAAC--TGC-AATGAATTGTGGGACAGGCATAAAATTACCTA-C--TT-TTT--A-TTGGTGG-TTA--ACGG----A-------C-CTGAT---TCGGtgtat
gi|21                         :                                                    TAGA-G-CGGACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTAAACTAGG-AA--TG----GG-----A-----------TA-TGAG-CACTTTGATTGG-------------------------------AATGA---CGTCA-C-AGTTTG-GT--A-A--GCG--T-TGAAT--AGC-TATGAATTGTGGGACAAGCATGGAATTCCCTG-C--CT-TTT-CA-TTGGGGG-TTT--ATAG----A-------C-CTGAC---TCTGGAGAT---ATCAGG-ACAGGGATAa
gi|22                         :                                                                     tcTCC-A-GATT--GGGT-CCGTTAAATAGC-AA--T-T---GT-----A-A------------CGAG-CACGCTGATTGGTCAG---TTGTTTC-AA-G-AAAAGT--TTGAATGA---CGTCA-A-AGTTTA-GT--A-A--GCT--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT------------------TAG----A-------G-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGATCTCGGATAgac
gi|23                         :                                                     AGA-A-CGGTTCCAAATCTCC-C-ACTT--TGGT-TCGTAACATAG--AC--TG-------------A---G----ATT-TGAG-CACTTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AG---GGAACT--TTTATTGG---CGTCA-C-A-----------------G--T-T-------------------TGGGACAGGCTTAGAAGTCCCTG-CATTT-TTT-CA-TCGGGAT-TTA--ACAG----A-------T-CAGA----TCGGGAGAT---ATCAGGgact
gi|24                         :                                                   GTAGA-G-CGGACCCAG---------AA----AGGT-CCGTAAACTAGG-AA--TG----GG-----A-----------TT-TGAG-CACTTTGATTGGTCA----------------------T--TTGAATGA---CGTCA-C-AGTTTG-GT--A-A--GCG--T-TGAAT--AGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATGGAATTCCCTG-C--CT-TTT-CA-TTGGGGG-TTC--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAgactttgata
gi|25                         :                                                  TGTAGA-A-TGGTCCCAGATCTCC-T-GTGT--TGGT-CCATTACATAGT-TA--TG-------------A---G----ATT-TGAG-CATATTGATTTATCAG---TTGCTAT-AG-G-GGAAGT--T-GAATGA---TTTCA-C-AGTTTA-GT--T-A--GCG--T-TAGAT--AGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TCT-CA-TTGcgactg
gi|26                         :                                                                                               cTAGC-AA--TAT---GAGGA--A-A---GCCCCATT-TGAG-CACTTTCAT-------------------------AAGT--TTGAATGA---CGTCA-C-GGTTTA-AT--A-G--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGTAATGTGGGATAGATATAGAATT-CCTG-C--TT-TTT-CA-TTAGTGA-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGAATAT---ATCAGATTTTGGGTTA
gi|27                         :                                                        -A-CAGAACAAGCTCTCC-C-AATA--AGGT-CCGTTAAA-AGC-AA--TGT---TG-----A-AAAAGCCATATT-TGAG-CACGCTGACTGGTCAA---TTGTTTC-AAAT-GAATAA--TTGAATTA---CGTCA-C-ATTTTA-TT--A-A--GCG--T-TATAT--TGC-TATGAATTGTGGGAAAGGCATAGAAg
gi|28                         :                                                                                                                                                     gcCAG---TTGCTTC-AA-C-AGAAGT--T-GAATGA---TGTCA-T-AGTTGG-GT--A-ATTGCA--T-TAGAG--TGC-TATGCATTGTGGGACAGACAGGGAACTCCATG-T--TT-TT
gi|29                         :               agactttcgaaatgatcctagcgctcctagctatggactgctacatagCTCAACTCTCC-A-AATT--CGCT-CCGTTAAATAGC-AG-----------------------CACATT-TGAG-CACGTTGATTGATCAG---TTGCTGA-AG-A-GAAAGT--TTGAATAT---CGTatctgtgtaggt
gi|3                          :                                                 tTATAGA-A-CGAACCCGGTTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAACAG---A--TAT---GGTAGAAA-A---GCCACATT-TGAG-CACGTTGATTGGCCAG---TTGCTTC-AA-CTGAAAGT--TTGAATGA---TGTCA-C-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-GCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGAGGG-GTA--ATAT----A-------C-CTGAT---TTGCGAGAT---ATTAAGTTTTGGGATAtttttttttcatgacataacgtcattaaggtggggatgaaattgacaaagcgtcataa
gi|31                         :                                                                                         CGTTACATAGCTAAGCTGT---TT-----A-A---GC-AC-----GA--CACGCTGATTGGTCAGTTTTTTTTTC-AG-C-GGGAG---GTGAACCA---CGTGG-TAAATTTA-TT--ATA--GTG--------C--TGC-TATGA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                         ctagagat--TGC-TATGAACTGTGGGACGGGCATATAATTCGTTG-C--TT-TTT-CA-TTGGTGG-TTA--ATAT----A-------C-CTGAT---TCAGGAGGT---ATCAGGTTTTGGGATA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                      taaacatacgg--TGC-TATGAATTGCAGGA-AGGTAAGGAATTCCACG-A--TT-TAT--A-TAAAAGT-TTA--ACAGTTTAA-------CAGTTATTAATCTGGAGAA---CTCAGGTTATGGGAgtcta
gi|34                         :                                                                                                                                                                               c--TTGAATG----CGTCA-----TTCA--T--A-----CA------AAT--TAG-TAGAAATTTTGGGACATACATATAAATCTTTG-C--TT-TAT-CA-TTGGGTA-TGA--GCAG----G-------A-CTG------TGGGAGAgagacta
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGGAGAT---ATCAAGCTCTGGGATA
gi|38                         :                       gggacatgcataatttcctgctcgccaaaatgacaatttcaaagcatCTTC-C-GATT--GGGT-CCGTAAAATAGC-AA--TGTT--GG-----A-AAA-GCCACATT-TGAG-CACGTTGATTGGTCAA---TTGTTgaata
gi|39                         :                                                   GTAGA-A-CTGATCCAGCTCTCC-C-GCGT--TGAT-CCGTTA
gi|4                          :                                                  tcaAGT-A-CGGGCCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAATAGC-AA--TGTTGGGA-----A-A---GCAACATT-TGAG-CACGTTGATTGGTCAG---TTATGTC-AA-CTTAAAG---TTGGATGA---AGTCA-C-TGTTTT-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TACGAATTGTGGGACAGGCAAAGAATTCCCTG-C--TT-TGT-CA-TTTGGGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTGGGATAgttacgagcacgtcgtcgtcgtaagttttt
gi|40                         :                                                 ggaTGGA-A-CCAATTCAGCTTTCC-CCGATA--GGGT-CCGTTACTTAGC-AA--CGT---------------------ATT-TGAA-CACATT
gi|42                         :                                                                   GCTCACCTC-GCTT--GGGT-CTGGTACACAGC-AG--T-T---AG-----A-----------TA-TGAG-CACGTTGATTGGTCA
gi|5                          :                                                 tTGTAGA-A-TGAACCCAGCTCTCT-T-GATT--GGGT-CTGTTAAATAGC-AA--TGTTGGGA-----A-A---GCCACATT-TGAG-CATGTTGATTGGTCAG---TTGCCTC-AA-CTGAAAAT--TTGAATGA---CGCCAGC-A-TTT-------------G--T-TTCAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCATG-C--TT-TTT-CATTTGGAGG-TTT--ATAG----A-------C-CTGAT---TTGGAAGGTATAATGAGATTCTGGGATA
gi|6                          :                                                  TGTAGA-AACTG-CTTAGCTGTCC-CTGCTG--GGGA-CTGTTACATAGC-AG--TG--------------------ATATA-CAAG-CACGCTGGTTGGTCAG---TTGCTTC-AG-T-GGAAGG--G-GAACTA---TGTCA-C-AGTTTG-GT--T-A--ACA--C-ATAAGAGTGC-TATGAATTGTGGGACGGGCAGGGAATTCCATA-C--TT-TTG-CA-TTAGAGT-ATA--ACAG----C-------C-CTGAA---TAGAAAAAT---ATCACGTAATGGGACAga
gi|7                          :                                                       c-A-TGGACCCAGCTCTCC-T-GATT--GGGT-CCCTTAATTAGC-AA--TGTTGGGA-----A-A---GCTGCATT-TATG-CACATTGATTGGTCAA---TTGCTTC-AA-CAGAAAGT--TTGA-TGA---TGTCA-C-TGTCTAAGG--A-A--GCA--T-TCAAC--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-AA-TTGGTGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TTGGGAGAA---ATCAGGTTCTGGGATAgact
gi|8                          :                                                             tACCCAGCTCTTC-T-GATT--GGGT-CTGTTTAATAGC-AG-----------------------CACACT-TGAG-CATGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-A----GACAGTGCTTGAAGAA---CGTCA-T-ATTTCA-
gi|9                          :                                                acTGTAGACA-AGGTCCTAGCTTTCC-C-G-TT--ACGCACCGTTAGA-----AA---GT---AG-----A-A------ACGTA-TGAG-CATGATGATTACTTAG---TTGCTCC-AG-C-GGGAG---TTGAATG-------TA-T-AGTTCG-AT--ATA--ACG--CATTAAA--AACATATGAATTTAGGGActgatattaagtatataatatataaataagcagtcataatttagttaagttttaaagtacaacgtaaaatgctggtgaaacagaagcctgattcaggaggttctatatatagact

Unaligned ( gi|30 ): CTCTTCCCGCCTCGAGACGTCATAGAGCAGTGCTGATTGGTCATTTATTTAAATAAACAATGACGCATGTCATAATTTGGTAAACATAAGAGAGCATTGTTGGTAGACAGAGAGTACCATGAACTTATTG
Unaligned ( gi|36 ): GCATTAGAGTGCTGTGGACTGCGGGGTAGGAAGGGAATCACATTGTTTTACATAATGGTATAACATAACTGAA
Unaligned ( gi|37 ): ATATGAGCAGGCTGATTAGTTAGTTGTTTCGTGAAGGTGAACCACGTGACAATATGGTTAAGGCATGAGA
Unaligned ( gi|41 ): CACTGTAGAAACGCTAGAACTCACCCAGCTGGGGATCATAACATAGCAATGATATACGA
Unaligned ( gi|43 ): CACTGTAGAAACGCTAGAACTCTCCCAGCTGGGAATCATAACATAGCAATGACATA
Unaligned ( gi|44 ): TATATCCTATTTCGGTTATTATTCTCAGACCGATTCATT
Unaligned ( gi|45 ): GTTATATATTCAACATAATAAGTTAATAGTC

lowQualScore                  :                                                                                                       777777777777777777777777                                       1111                                                                                                                                                                              
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lowQualScore                  :                                                        7 7               3 7    88    3            3  333333333333333333333333  6  3    2                333       3 2222      88        333     111 7    3  99 8 99   99 4 8   88   3                                4 88  4   5  5    5  5   11    3333 0000000 5     777         888                
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Reference ( family-2332 )     :                                                  TGTAGA-A-CGGACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAATAGC-AA--TGT---GG-----A-A---GCCACATT-TGAG-CACGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AG-C-GAAAGT--TTGAATGA---CGTCA-C-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGNGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTGGGATA
gi|1                          :                                                  TGTAGT-A-CGGACTCAGCTCTTC-C-TATTTTGGGT-CCGTTTTATAGC-AA--TGTTGGGA-----A-A---GCCACATT-TTAG-CACGTTGATTGGTTAG---ATGTTTCAAA-T-GAATGT--TTG-ATGA---CGTCA-C-TGTTTA-TT--A-A--GCG--C-TTACC--TGC-TATGAATTGTGGAACAGGCATAGAATTCCCTT-A--TT-TTT-CA-TTGTTGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAC---ATCAGGTTCTGGGATA
gi|10                         :                                                                       cCC-C-AAAT--GGGT-CCGTTAAATAGT-AG--TGTTA-GG-----A-CC--GCCACATA-TGAG-CACGTTGATTGGTCAT---ATGCTTC-AA-CTGAAAGT--ATGAATGA---CGTCA-C-AATTTA-GTTTA-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCTTA-T--AT--------TTGGTGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCAGGAG-C---ATCAGGTACAGGGATAga
gi|11                         :                                              gcacagaAGA-T-CGGACCCAGCTCTTT-C-GATT--AGAT-CCGTTAACTAGC-AA--TGT---TG-----A-G---A--ATATT-TTAG-CACGTCCATTGGTCAG---TTGCTTC-AA-C-TTT-GT--TTGAATGA---CGTCA-C-AATTTC-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTATGGGACAGGAATATAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGGTG-TTA--ATAG----A-------C-TTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTGgacta
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gi|2                          : gactgtagaaacgtttttggctgttctctccagggacagttacgtaacaTGTAGA-A-CGGACCCAGCT-TCC-C-GATT--GGTT-CCGTTAAATAGC-AA--TGTTG-GG-----ACA---GTCACATT-TGAA-CACGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AA-CTGAAAGT--TTGAATAATAACGTTG-C-CGTTTA-GT--A-A--GCA--T-GCAAT--TGC-TATGAATTGAGGGCCAGGCAGAGAATCCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGAGG-TTA--ATAG----C-------C-CTGAT---TCGGGGAAT---ATCAGGTTCTg
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gi|26                         :                                                                                               cTAGC-AA--TAT---GAGGA--A-A---GCCCCATT-TGAG-CACTTTCAT-------------------------AAGT--TTGAATGA---CGTCA-C-GGTTTA-AT--A-G--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGTAATGTGGGATAGATATAGAATT-CCTG-C--TT-TTT-CA-TTAGTGA-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGAATAT---ATCAGATTTTGGGTTA
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gi|3                          :                                                 tTATAGA-A-CGAACCCGGTTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAACAG---A--TAT---GGTAGAAA-A---GCCACATT-TGAG-CACGTTGATTGGCCAG---TTGCTTC-AA-CTGAAAGT--TTGAATGA---TGTCA-C-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-GCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGAGGG-GTA--ATAT----A-------C-CTGAT---TTGCGAGAT---ATTAAGTTTTGGGATAtttttttttcatgacataacgtcattaaggtggggatgaaattgacaaagcgtcataa
gi|31                         :                                                                                         CGTTACATAGCTAAGCTGT---TT-----A-A---GC-AC-----GA--CACGCTGATTGGTCAGTTTTTTTTTC-AG-C-GGGAG---GTGAACCA---CGTGG-TAAATTTA-TT--ATA--GTG--------C--TGC-TATGA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                         ctagagat--TGC-TATGAACTGTGGGACGGGCATATAATTCGTTG-C--TT-TTT-CA-TTGGTGG-TTA--ATAT----A-------C-CTGAT---TCAGGAGGT---ATCAGGTTTTGGGATA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                      taaacatacgg--TGC-TATGAATTGCAGGA-AGGTAAGGAATTCCACG-A--TT-TAT--A-TAAAAGT-TTA--ACAGTTTAA-------CAGTTATTAATCTGGAGAA---CTCAGGTTATGGGAgtcta
gi|34                         :                                                                                                                                                                               c--TTGAATG----CGTCA-----TTCA--T--A-----CA------AAT--TAG-TAGAAATTTTGGGACATACATATAAATCTTTG-C--TT-TAT-CA-TTGGGTA-TGA--GCAG----G-------A-CTG------TGGGAGAgagacta
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGGAGAT---ATCAAGCTCTGGGATA
gi|38                         :                       gggacatgcataatttcctgctcgccaaaatgacaatttcaaagcatCTTC-C-GATT--GGGT-CCGTAAAATAGC-AA--TGTT--GG-----A-AAA-GCCACATT-TGAG-CACGTTGATTGGTCAA---TTGTTgaata
gi|39                         :                                                   GTAGA-A-CTGATCCAGCTCTCC-C-GCGT--TGAT-CCGTTA
gi|4                          :                                                  tcaAGT-A-CGGGCCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAATAGC-AA--TGTTGGGA-----A-A---GCAACATT-TGAG-CACGTTGATTGGTCAG---TTATGTC-AA-CTTAAAG---TTGGATGA---AGTCA-C-TGTTTT-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TACGAATTGTGGGACAGGCAAAGAATTCCCTG-C--TT-TGT-CA-TTTGGGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTGGGATAgttacgagcacgtcgtcgtcgtaagttttt
gi|40                         :                                                 ggaTGGA-A-CCAATTCAGCTTTCC-CCGATA--GGGT-CCGTTACTTAGC-AA--CGT---------------------ATT-TGAA-CACATT
gi|42                         :                                                                   GCTCACCTC-GCTT--GGGT-CTGGTACACAGC-AG--T-T---AG-----A-----------TA-TGAG-CACGTTGATTGGTCA
gi|5                          :                                                 tTGTAGA-A-TGAACCCAGCTCTCT-T-GATT--GGGT-CTGTTAAATAGC-AA--TGTTGGGA-----A-A---GCCACATT-TGAG-CATGTTGATTGGTCAG---TTGCCTC-AA-CTGAAAAT--TTGAATGA---CGCCAGC-A-TTT-------------G--T-TTCAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCATG-C--TT-TTT-CATTTGGAGG-TTT--ATAG----A-------C-CTGAT---TTGGAAGGTATAATGAGATTCTGGGATA
gi|6                          :                                                  TGTAGA-AACTG-CTTAGCTGTCC-CTGCTG--GGGA-CTGTTACATAGC-AG--TG--------------------ATATA-CAAG-CACGCTGGTTGGTCAG---TTGCTTC-AG-T-GGAAGG--G-GAACTA---TGTCA-C-AGTTTG-GT--T-A--ACA--C-ATAAGAGTGC-TATGAATTGTGGGACGGGCAGGGAATTCCATA-C--TT-TTG-CA-TTAGAGT-ATA--ACAG----C-------C-CTGAA---TAGAAAAAT---ATCACGTAATGGGACAga
gi|7                          :                                                       c-A-TGGACCCAGCTCTCC-T-GATT--GGGT-CCCTTAATTAGC-AA--TGTTGGGA-----A-A---GCTGCATT-TATG-CACATTGATTGGTCAA---TTGCTTC-AA-CAGAAAGT--TTGA-TGA---TGTCA-C-TGTCTAAGG--A-A--GCA--T-TCAAC--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-AA-TTGGTGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TTGGGAGAA---ATCAGGTTCTGGGATAgact
gi|8                          :                                                             tACCCAGCTCTTC-T-GATT--GGGT-CTGTTTAATAGC-AG-----------------------CACACT-TGAG-CATGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-A----GACAGTGCTTGAAGAA---CGTCA-T-ATTTCA-
gi|9                          :                                                acTGTAGACA-AGGTCCTAGCTTTCC-C-G-TT--ACGCACCGTTAGA-----AA---GT---AG-----A-A------ACGTA-TGAG-CATGATGATTACTTAG---TTGCTCC-AG-C-GGGAG---TTGAATG-------TA-T-AGTTCG-AT--ATA--ACG--CATTAAA--AACATATGAATTTAGGGActgatattaagtatataatatataaataagcagtcataatttagttaagttttaaagtacaacgtaaaatgctggtgaaacagaagcctgattcaggaggttctatatatagact


blockSeqs                     :                                                        C A               T C    .     A            T  TATGGTAGAAAAGCC              A    G                TTT       . ACT       GC        TAA     TA       A  TT T TT   CA A C   AG   A                                A TA  C   C  T    T  A   TT    TTTA AATATAT A     TAA         ATA
blockSeqs                     :                                                        . .               . T    .     .            .  TGTTAGGACCGCC                .    .                .         . ACT       .         .       GC       .  .  T .    .  . C   .    .                                . AT  .   .  .    G  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TGTTGGGACAGTC                .    .                .         . ACT       .         .       C        .  .  . .    .  . C   .    .                                . T   .   .  .    C  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TGTTGGGAAAGCC                .    .                .         . AAT       .         .       C        .  .  . .    .  . C   .    .                                . T   .   .  .    C  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TATGAGGAAAGCC                .    .                .         . ACT       .         .       T        .  .  . .    .  . C   .    .                                . .   .   .  .    G  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TGTTGAAAAAGCC                .    .                .         . ACT       .         .       T        .  .  . .    .  . C   .    .                                . .   .   .  .    T  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TGTTGGAAAAGCC                .    .                .         . ACT       .         .       T        .  .  . .    .  . T   .    .                                . .   .   .  .    T  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TGTTGGGAAAGCA                .    .                .         . ACA       .         .       T        .  .  . .    .  . C   .    .                                . .   .   .  .    T  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TGTTGGGAAAGCC                .    .                .         . AC        .         .       T        .  .  . .    .  . T   .    .                                . .   .   .  .    G  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TGTTGGGAAAGCT                .    .                .         . GG        .         .       A        .  .  . .    .  . A   .    .                                . .   .   .  .    T  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  GCTGTTTAAGC                  .    .                .         . GG        .         .       C        .  .  . .    .  . C   .    .                                . .   .   .  .    A  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TGTTGAGA                     .    .                .         . GG        .         .       C        .  .  . .    .  . A   .    .                                . .   .   .  .    T  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TTGTAA                       .    .                .         . GG        .         .       C        .  .  . .    .  . G   .    .                                . .   .   .  .    G  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  GTAGAA                       .    .                .         . AG        .         .       A        .  .  . .    .  . C   .    .                                . .   .   .  .    G  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TTGTT                        .    .                .         . GT        .         .       C        .  .  . .    .  . G   .    .                                . .   .   .  .    G  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TTGTT                        .    .                .         . GC        .         .       C        .  .  . .    .  . A   .    .                                . .   .   .  .    T  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TGGGA                        .    .                .         . AG        .         .       C        .  .  . .    .  . C   .    .                                . .   .   .  .    G  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TGGGA                        .    .                .         . GG        .         .       C        .  .  . .    .  . A   .    .                                . .   .   .  .    T  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TTAGA                        .    .                .         . AC        .         .       C        .  .  . .    .  . A   .    .                                . .   .   .  .    A  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TGAG                         .    .                .         . GA        .         .       T        .  .  . .    .  . C   .    .                                . .   .   .  .    G  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TGAG                         .    .                .         . GC        .         .       C        .  .  . .    .  . C   .    .                                . .   .   .  .    G  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                        . .               . .    .     .            .  TTG                          .    .                .         . GT        .         .       C        .  .  . .    .  . T   .    .                                . .   .   .  .    A  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                                          . .    .     .            .  CGT                          .    .                .         . GC        .         .       C        .  .  . .    .  . T   .    .                                . .   .   .  .    A  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                                          . .    .     .            .  TC                           .    .                .         . G         .         .       C        .  .  . .    .  . C   .    .                                . .   .   .  .    T  .   .     .    .       .     .           .  
blockSeqs                     :                                                                          . .    .     .            .  TG                           .    .                .         . G         .         .       T        .  .  . .    .  . T   .    .                                . .   .   .  .    .  .   .     .    .       .     .              
blockSeqs                     :                                                                          . .    .     .            .  C                            .    .                .         . .         .         .       T        .  .  . .    .  . .   .    .                                . .   .   .  .                                                   
blockSeqs                     :                                                                          . .    .     .            .  C                            .    .                .         . .         .         .       .        .  .  . .    .  . .   .    .                                . .   .                                                          
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Unaligned ( gi|30 ): CTCTTCCCGCCTCGAGACGTCATAGAGCAGTGCTGATTGGTCATTTATTTAAATAAACAATGACGCATGTCATAATTTGGTAAACATAAGAGAGCATTGTTGGTAGACAGAGAGTACCATGAACTTATTG
Unaligned ( gi|36 ): GCATTAGAGTGCTGTGGACTGCGGGGTAGGAAGGGAATCACATTGTTTTACATAATGGTATAACATAACTGAA
Unaligned ( gi|37 ): ATATGAGCAGGCTGATTAGTTAGTTGTTTCGTGAAGGTGAACCACGTGACAATATGGTTAAGGCATGAGA
Unaligned ( gi|41 ): CACTGTAGAAACGCTAGAACTCACCCAGCTGGGGATCATAACATAGCAATGATATACGA
Unaligned ( gi|43 ): CACTGTAGAAACGCTAGAACTCTCCCAGCTGGGAATCATAACATAGCAATGACATA
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Reference ( family-2332 )     :                                                  TGTAGA-A-CGGACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAATAGC-AA--TGT---GG-----A-A---GCCACATT-TGAG-CACGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AG-C-GAAAGT--TTGAATGA---CGTCA-C-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGNGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTGGGATA
gi|1                          :                                                  TGTAGT-A-CGGACTCAGCTCTTC-C-TATTTTGGGT-CCGTTTTATAGC-AA--TGTTGGGA-----A-A---GCCACATT-TTAG-CACGTTGATTGGTTAG---ATGTTTCAAA-T-GAATGT--TTG-ATGA---CGTCA-C-TGTTTA-TT--A-A--GCG--C-TTACC--TGC-TATGAATTGTGGAACAGGCATAGAATTCCCTT-A--TT-TTT-CA-TTGTTGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAC---ATCAGGTTCTGGGATA
gi|10                         :                                                                       cCC-C-AAAT--GGGT-CCGTTAAATAGT-AG--TGTTA-GG-----A-CC--GCCACATA-TGAG-CACGTTGATTGGTCAT---ATGCTTC-AA-CTGAAAGT--ATGAATGA---CGTCA-C-AATTTA-GTTTA-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCTTA-T--AT--------TTGGTGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCAGGAG-C---ATCAGGTACAGGGATAga
gi|11                         :                                              gcacagaAGA-T-CGGACCCAGCTCTTT-C-GATT--AGAT-CCGTTAACTAGC-AA--TGT---TG-----A-G---A--ATATT-TTAG-CACGTCCATTGGTCAG---TTGCTTC-AA-C-TTT-GT--TTGAATGA---CGTCA-C-AATTTC-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTATGGGACAGGAATATAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGGTG-TTA--ATAG----A-------C-TTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTGgacta
gi|12                         :                                                  aGTAGA-A-CGGACGCTGCTCGCC-C-GACT--GGGT-CCGTTAAATAGC-AA--T-T---G-------------TTAC-----GAA-CACGGTGATTGGTTAG---TTGCTTC-AG-G-AAAAGT--TTGAATGA---CGCCA-------TA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGGCAGGCCTAGAATTCACTG-CTATT-TTT-CA-TTGGC-G-TTA--ATAG----AAATATATC-TTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTT
gi|13                         :                                                   GTAGA-A-CGAACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAACTAGC-AA--T-T---G-------------TTAC-----GAG-CATGCTGATTGGTCAG---TTGCTTT-AG-G-GAAAGT--TTGAATGA---TGTCA----------------A--GAG--C-TCAGT--TGC-TATGAATTGTTGGACAGGCATGGAATTCCCTG-CT-TT-TTT-CA-TTAACAG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGAAGAT---ATCAGGTTCTAGGA
gi|14                         :                                                   GTAGA-A-CGAACTCAACTATCC-C-GTTT--GGAT-CCGTTAAATATC-AG-----------------------CACATT-TGAG-CACGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AG-G-GAAACT--TTGAATGA---CGACA-T-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGCATTGTGGTACAGGCATAGGATTACCTG-CT-TT-TTT-TA-TTGGGGG-TTA--ATAT----A-------C-TTGAT---TAGGGAGAT---ACCGGaag
gi|15                         :                                                   cTAGA-A-CGAACCCAGCTCTCC-C-GATT--TGGT-CCGTTACATAAC-AA--T--------------------CA-GTA-CGAG-CACGCTTATTAGTCAG---TTGTTTC-AG-G-GAAAGT--TTGAATGA---TGTCA-T-AATTTA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGAGACAGGTATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGTGG-TTA--ATAA----A-------C-CTGGT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTt
gi|16                         :                                                      GA-A-CGAACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAATAAC-AG-----------------------CACATT-TGAG-CACGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-GA-G-GAAAGT--TTGAATGA---GGTTA-T-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-TTAAT--GGT-TATGAATTGTGAAACATGCATAGCATTCCCTG-C--TTCTTT-CA--TGGTGGATTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TTGGGAGAT---GTCAGGTTC
gi|17                         :                                                    TAGA-A-TAAATCCAACTCTCT-C-GATT--GTGT-CCGTTCAATAGC-AA--T-T---G------------------TTATGAG-CACGCTGATTGG--AA---------C-GG---GAAAGT--TTAAATGA---CGTCA-T-AATTTA-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGAACAGGAATAGAATTCCCTT-C--TT-TTTCCA-TTGGTGG-TTG--GCA-----------------GAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTAGGATA
gi|18                         :                                                  tcTAGA-A-CGGACTCTGCTCTCC-C-TATA--AGAT-CCGTTAAATAAC-AG-----------------------CACATC-TGA--CACGTTGATTGGTCAG---TTGATTT-GG-T-GAAAGT--TTAAATAA---CGTCA-T-AATTTA-GT--T-A--GCG--T-TTAAT--TGC-TATGAACTGTTGGACAAGCATAGACTTCCCTGAT--TT-TTT-CA-TTAGGGG-TTA--ATAT----A-------A-TTAAT---TCGACATAT---ATTA
gi|19                         :                                                                                                                                       AG-CCCGCTGATTGGTCAG---ATGCTTC-AG-C-CGGAGT--T-GGATTA---TCCCA-A-AGTTGG-GT--A-A--ACGCAT-TAAAG--TGC-TATGAATTGTGGGACATGCAAGGAATTTTGTG-C--TT-TTA-CA-TT--TTG-TTATTACAG----A-------C-CTGAA---TCGGAAAAT---GTt
gi|2                          : gactgtagaaacgtttttggctgttctctccagggacagttacgtaacaTGTAGA-A-CGGACCCAGCT-TCC-C-GATT--GGTT-CCGTTAAATAGC-AA--TGTTG-GG-----ACA---GTCACATT-TGAA-CACGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AA-CTGAAAGT--TTGAATAATAACGTTG-C-CGTTTA-GT--A-A--GCA--T-GCAAT--TGC-TATGAATTGAGGGCCAGGCAGAGAATCCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGGAGG-TTA--ATAG----C-------C-CTGAT---TCGGGGAAT---ATCAGGTTCTg
gi|20                         :                                                             GACCCAGCTCTCC-T-AATT--GGGT-CCGTTAAATAGC-AA--TGTTGGGA-----A-A---GCCACATT-TGGGGCATGTTGAATGGTCAG---TAGCTTC-AA-CTGAAAGT--TTAGATGA---CGTCA-C-AGTTTA-AT--A-A--CCT--T-TAAAC--TGC-AATGAATTGTGGGACAGGCATAAAATTACCTA-C--TT-TTT--A-TTGGTGG-TTA--ACGG----A-------C-CTGAT---TCGGtgtat
gi|21                         :                                                    TAGA-G-CGGACCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTAAACTAGG-AA--TG----GG-----A-----------TA-TGAG-CACTTTGATTGG-------------------------------AATGA---CGTCA-C-AGTTTG-GT--A-A--GCG--T-TGAAT--AGC-TATGAATTGTGGGACAAGCATGGAATTCCCTG-C--CT-TTT-CA-TTGGGGG-TTT--ATAG----A-------C-CTGAC---TCTGGAGAT---ATCAGG-ACAGGGATAa
gi|22                         :                                                                     tcTCC-A-GATT--GGGT-CCGTTAAATAGC-AA--T-T---GT-----A-A------------CGAG-CACGCTGATTGGTCAG---TTGTTTC-AA-G-AAAAGT--TTGAATGA---CGTCA-A-AGTTTA-GT--A-A--GCT--T-TCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT------------------TAG----A-------G-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGATCTCGGATAgac
gi|23                         :                                                     AGA-A-CGGTTCCAAATCTCC-C-ACTT--TGGT-TCGTAACATAG--AC--TG-------------A---G----ATT-TGAG-CACTTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-AG---GGAACT--TTTATTGG---CGTCA-C-A-----------------G--T-T-------------------TGGGACAGGCTTAGAAGTCCCTG-CATTT-TTT-CA-TCGGGAT-TTA--ACAG----A-------T-CAGA----TCGGGAGAT---ATCAGGgact
gi|24                         :                                                   GTAGA-G-CGGACCCAG---------AA----AGGT-CCGTAAACTAGG-AA--TG----GG-----A-----------TT-TGAG-CACTTTGATTGGTCA----------------------T--TTGAATGA---CGTCA-C-AGTTTG-GT--A-A--GCG--T-TGAAT--AGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATGGAATTCCCTG-C--CT-TTT-CA-TTGGGGG-TTC--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAgactttgata
gi|25                         :                                                  TGTAGA-A-TGGTCCCAGATCTCC-T-GTGT--TGGT-CCATTACATAGT-TA--TG-------------A---G----ATT-TGAG-CATATTGATTTATCAG---TTGCTAT-AG-G-GGAAGT--T-GAATGA---TTTCA-C-AGTTTA-GT--T-A--GCG--T-TAGAT--AGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TCT-CA-TTGcgactg
gi|26                         :                                                                                               cTAGC-AA--TAT---GAGGA--A-A---GCCCCATT-TGAG-CACTTTCAT-------------------------AAGT--TTGAATGA---CGTCA-C-GGTTTA-AT--A-G--GCG--T-TCAAT--TGC-TATGTAATGTGGGATAGATATAGAATT-CCTG-C--TT-TTT-CA-TTAGTGA-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGAATAT---ATCAGATTTTGGGTTA
gi|27                         :                                                        -A-CAGAACAAGCTCTCC-C-AATA--AGGT-CCGTTAAA-AGC-AA--TGT---TG-----A-AAAAGCCATATT-TGAG-CACGCTGACTGGTCAA---TTGTTTC-AAAT-GAATAA--TTGAATTA---CGTCA-C-ATTTTA-TT--A-A--GCG--T-TATAT--TGC-TATGAATTGTGGGAAAGGCATAGAAg
gi|28                         :                                                                                                                                                     gcCAG---TTGCTTC-AA-C-AGAAGT--T-GAATGA---TGTCA-T-AGTTGG-GT--A-ATTGCA--T-TAGAG--TGC-TATGCATTGTGGGACAGACAGGGAACTCCATG-T--TT-TT
gi|29                         :               agactttcgaaatgatcctagcgctcctagctatggactgctacatagCTCAACTCTCC-A-AATT--CGCT-CCGTTAAATAGC-AG-----------------------CACATT-TGAG-CACGTTGATTGATCAG---TTGCTGA-AG-A-GAAAGT--TTGAATAT---CGTatctgtgtaggt
gi|3                          :                                                 tTATAGA-A-CGAACCCGGTTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAACAG---A--TAT---GGTAGAAA-A---GCCACATT-TGAG-CACGTTGATTGGCCAG---TTGCTTC-AA-CTGAAAGT--TTGAATGA---TGTCA-C-AGTTTA-GT--A-A--GCG--T-GCAAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-CA-TTGAGGG-GTA--ATAT----A-------C-CTGAT---TTGCGAGAT---ATTAAGTTTTGGGATAtttttttttcatgacataacgtcattaaggtggggatgaaattgacaaagcgtcataa
gi|31                         :                                                                                         CGTTACATAGCTAAGCTGT---TT-----A-A---GC-AC-----GA--CACGCTGATTGGTCAGTTTTTTTTTC-AG-C-GGGAG---GTGAACCA---CGTGG-TAAATTTA-TT--ATA--GTG--------C--TGC-TATGA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                         ctagagat--TGC-TATGAACTGTGGGACGGGCATATAATTCGTTG-C--TT-TTT-CA-TTGGTGG-TTA--ATAT----A-------C-CTGAT---TCAGGAGGT---ATCAGGTTTTGGGATA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                      taaacatacgg--TGC-TATGAATTGCAGGA-AGGTAAGGAATTCCACG-A--TT-TAT--A-TAAAAGT-TTA--ACAGTTTAA-------CAGTTATTAATCTGGAGAA---CTCAGGTTATGGGAgtcta
gi|34                         :                                                                                                                                                                               c--TTGAATG----CGTCA-----TTCA--T--A-----CA------AAT--TAG-TAGAAATTTTGGGACATACATATAAATCTTTG-C--TT-TAT-CA-TTGGGTA-TGA--GCAG----G-------A-CTG------TGGGAGAgagacta
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGGAGAT---ATCAAGCTCTGGGATA
gi|38                         :                       gggacatgcataatttcctgctcgccaaaatgacaatttcaaagcatCTTC-C-GATT--GGGT-CCGTAAAATAGC-AA--TGTT--GG-----A-AAA-GCCACATT-TGAG-CACGTTGATTGGTCAA---TTGTTgaata
gi|39                         :                                                   GTAGA-A-CTGATCCAGCTCTCC-C-GCGT--TGAT-CCGTTA
gi|4                          :                                                  tcaAGT-A-CGGGCCCAGCTCTCC-C-GATT--GGGT-CCGTTAAATAGC-AA--TGTTGGGA-----A-A---GCAACATT-TGAG-CACGTTGATTGGTCAG---TTATGTC-AA-CTTAAAG---TTGGATGA---AGTCA-C-TGTTTT-GT--A-A--GCG--T-TCAAT--TGC-TACGAATTGTGGGACAGGCAAAGAATTCCCTG-C--TT-TGT-CA-TTTGGGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TCGGGAGAT---ATCAGGTTCTGGGATAgttacgagcacgtcgtcgtcgtaagttttt
gi|40                         :                                                 ggaTGGA-A-CCAATTCAGCTTTCC-CCGATA--GGGT-CCGTTACTTAGC-AA--CGT---------------------ATT-TGAA-CACATT
gi|42                         :                                                                   GCTCACCTC-GCTT--GGGT-CTGGTACACAGC-AG--T-T---AG-----A-----------TA-TGAG-CACGTTGATTGGTCA
gi|5                          :                                                 tTGTAGA-A-TGAACCCAGCTCTCT-T-GATT--GGGT-CTGTTAAATAGC-AA--TGTTGGGA-----A-A---GCCACATT-TGAG-CATGTTGATTGGTCAG---TTGCCTC-AA-CTGAAAAT--TTGAATGA---CGCCAGC-A-TTT-------------G--T-TTCAT--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCATG-C--TT-TTT-CATTTGGAGG-TTT--ATAG----A-------C-CTGAT---TTGGAAGGTATAATGAGATTCTGGGATA
gi|6                          :                                                  TGTAGA-AACTG-CTTAGCTGTCC-CTGCTG--GGGA-CTGTTACATAGC-AG--TG--------------------ATATA-CAAG-CACGCTGGTTGGTCAG---TTGCTTC-AG-T-GGAAGG--G-GAACTA---TGTCA-C-AGTTTG-GT--T-A--ACA--C-ATAAGAGTGC-TATGAATTGTGGGACGGGCAGGGAATTCCATA-C--TT-TTG-CA-TTAGAGT-ATA--ACAG----C-------C-CTGAA---TAGAAAAAT---ATCACGTAATGGGACAga
gi|7                          :                                                       c-A-TGGACCCAGCTCTCC-T-GATT--GGGT-CCCTTAATTAGC-AA--TGTTGGGA-----A-A---GCTGCATT-TATG-CACATTGATTGGTCAA---TTGCTTC-AA-CAGAAAGT--TTGA-TGA---TGTCA-C-TGTCTAAGG--A-A--GCA--T-TCAAC--TGC-TATGAATTGTGGGACAGGCATAGAATTCCCTG-C--TT-TTT-AA-TTGGTGG-TTA--ATAG----A-------C-CTGAT---TTGGGAGAA---ATCAGGTTCTGGGATAgact
gi|8                          :                                                             tACCCAGCTCTTC-T-GATT--GGGT-CTGTTTAATAGC-AG-----------------------CACACT-TGAG-CATGTTGATTGGTCAG---TTGCTTC-A----GACAGTGCTTGAAGAA---CGTCA-T-ATTTCA-
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