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Reference ( family-2135 ) : NATTATTANNGCANACCTTANAG---TTCTTCTTATTATAGGAAGCACTCGGAAACAAATTGCGAGCATGATTATTGACGCCTATGGGTCCT---TTATAAAAATTGTGAACTTCATGCCCCTGGGTCTCACGGTTTGGCCCTGGGGGTG--GGGCCTACTTTACTAAATCTATATAAGAGAAAATGACAAAAAACGTTATTTCTTATGACTG-AATA-GACTTATGTGAATG-NTTTTTGGTGTGATTTGTTGT-TGC-----TG-------ACATGACGGTTAAT---ACCTA----TG-TNAATTTCATGGTCCCC--ACC--CC-CAT----GAGGTCTTGGGGGCGGGGCCA--AAACAGTCAAATTCAAGG--TAAACTTNAAAAA----TCTTCTTCTTATTATTATAGGAAGCACTCGGAAAC-AAA-TT---GCGAGCATGATTATTGACGCCTATGGGTCCTTTATAAAAANTGTGA-AT--TTCAT-GCCCCTGGGTC--------TC---GC------------GGTTT-------------GG------------GCCTACTTTACTAAA---TCTATATAAGAGAAAATGACAAAAAACGTTATTTCTTATGACTG-AATAGACTTATGTGAATGNTTTTTGGTG--TGATTTGTTGTTGCTGACATGACGGTTAATACCTATGT----TT-CAT--G---GTCCCCGACCCC---CACCCCCACCCCCTTACTATAGGAAGCACTCGGAAACAAATTGTGAGCATGAT----TATTGAGGCCTATGGGTCCTTTATAAAAATTGTGAATTNCATG---------CCCCTGGGTCTCACGGTTTGGCCCCGGGGGTGGGTNCCNACTTTACTAAATCTATATAAGAGAAAATGATGTGATTTGTTGTTTCCGACGTGACGGTTAATATCTATGT--GAANTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCCATTG------TTGTTTTC-GGCTCTACTGGCCAAAGGCCAG--AA-GGCCTTATGCGATGGCNCGTCCGTCTTACATCATCTGTCGTCCGTTGGCAGCACTTTTATCTGAAACGACCAGGCCAATTAAACTCNAACTTAACAT-AG----TTCATATGGAT------TTCTATTGAAGATT-TT-TTGTTTCAATCTGAAATTCAAGATGGCTGCCATTACTAAAAATAGTTTAAAACTTAAAAAG-TCTTCTTCTCGTGAACCGC---NAAACGNATTGT---GA----AANTNTTTATGTAGTAATGATAACCAACTATAGTTCTGTTAGATTTGTTAAAATGGTGTCCCTGGGGTTAAAAATGACCCCGCCCCGAGGGTTCAGTTAGGGGACACAT-GTCATAATAAACATAAATTTATTTATTTTTAAAAAAGA--------AACTGATTTTGCCCTTGTTTTCACAGAAGCATTGTTTGGTG--AAGGAGGT---TCAAA-TT-ATAAAAATGACAGGGCTCTAACTNCCTTAAAGGGN-C----AGGA-GGGGC-CC-A-AAAGGGTAAAAATTG-GGAA---TTTTCAAAAATCTTTTT-CT-TAAGAACCGGTCAGTCAAATNCGTTCATATTTNGCATAAATTATCNCTAT-GNGTAGGGGTTTGA--G--AAGAT--AA-GAATTAAGGGGCTNGTATNTATAGGGGCCCTGTAAGG------GGA---------NTTTTACATAGGGATACTATGGGAAAA-C-GGAAA-TTCNNATTTTTTCATCCATTTNTGCAAAATTATTATTCAA--TTTGAGTTCTGAAGCATCGTCTAG----TCATAGCAAATAAGAT-TTGGTT-C---AATAAGGAGGATTGA--ATTTCCATAAGGGGCC-----A----GG--TGGG-T----CCCAA-AAGGGTTAA-ANTTG-GAATTTTTCAAAAA---TCTTC-TCNACA-----ACCGGTCAGTCAAATTTGTTCATATTTGATATAAATTATCCCT--A--T-GAGTAGGGGTTT-AAA----GTTT-------GTACAAAT-CAA--G-G-GCTTG-TATTTATAGGGGCCCTGTNAGGGGACTTTGAGTTTTACATAGG-AATACTAT-GGGAAAACGGAAA--NTTC-A--TTTT--T--------TTT--CATCCATTTNTGCAGAAT-TA--TTATTCAGTTTGAGTTCTGAAGCNTCT-TCTAGTCATAGCAAATAAGATTTGGTTC---AATAAGGAGGAT-TT----NATTTCC-ATAAGGGGCCA--------GG--TGGGGTC-CCAAAAA-G--GT-------TAAA--ATTGAACATTTTCANAAATCTTCTTCTCAACAACCGGTCAGTCAAATTTGTTTATA--TTTGATATAAAATTATCCCT--ATGAGNAGNGGGT--T-CNAAGTTTGTACAAATNAAGGGG--CTTGAATGNATAG-GGGCTTTGTA-G-GGGACT---TT---GAGTTTTACATAGGAATACTAT--GGGA-AAC-G-GAAAATTCTNATTTTTTCANTCATTTTTGCAAAAAT-A-TTTTNAATTTGAGATCTGAANCATTNT----------------NTAGNNNTAGCAGAT--AANNTTTGTTNNAT-AAGGAGNGTTGANNTTCCATAAGGGGCCGG--NGGGGCCCAA--CAAAGAGGTTAACATTGAACATTTTCGT-GAAT-CTTATTCTCAANAACCGATCNGTCGAATTTGTTACAT
gi|1 : ATTATTACGGCATACCTTACAG---TTCTTCTTATTATAGGAAGCAATCAGAAACAAATTGTGAGCATTATTATGGACGCCTATGGGTCCT---TTATAAAAATTGTGAATTTTATGCCTCTGGGTCTCACGGTTTGGCCCTGGGGGTA--GGGCCTACTTTACTATATCTATATAAGAGAAAATGACAAAAAACGTTGTTTCTTATGACCG-TATA-GACTTATGCGAATG--TTTTTGGTGTAATTTGTTGT-TGC-----TG-------ACATGACAGTTAAT---ACCTA----TG-TTAATTTCATGGTCCCC--ATC--CC-CAT----GAGATCTTAGGGGCGGGGCCA--AAACAGTCAAATTCAAGG--TAGACTTAAAAAA----TCTTCTTCTTATTATTATTGGAAGCGCTCAGAAGC-GAA-TT---GTGCGCATGATTATGGACGCCTATGAGTCCTTTATAAAAAATGTGA-AT--TTCAT-GCCCC-GGGTC--------TC---AC------------AGTTC-------------GG------------ACCTACTTTACTAAA---TCTTTATAAGAGAAAATGACAAAAACCGTCATTTCTTATGACTG-AATA--CTCATTTGAATGGTTTTTGGTG--TGATTTGTTTTTGCTAACATGATGGTTAATGCTTATGT----TT-TATTGA---GTCCCTCACCCC---CACCCCTACCCCCTTACCTTAGGAAGCACTAGAAAACAAACTGTAAGCATAATAAATTAATGAGGCCTATGCGTCTGCCATAAAAAATGTGAATTTCATG---------CCCCTGGGTCTCACGGTTTGAACCTTGGGGTGGGTACCC-CTTTACTAAATCTATATAAGAGAAAATGATGTGATTTGTTGATGCAGATATGACATTTAAAATCCATGTTTGAACTTTTGCCGCTTCCCGAAGGACAGCAGTTGGAAAACAGATTCATATTGCTTTATGTCATCAAGGATAATCAGGTGACCGTTAAGGCCCATTGAGCCTCTTGTT----AGCTCTATTGACCAAAGGCCAG--AA-GGCCTTATGCGATGGCGCGTT-GTCT---GTCGTCTGTCATCCGTTAGCAGTACTTTCA-CTGAAATCACTAGGCCAGTTAAACTCAAACTTAACAT-GGATGTTTCTCATGAATAGGAGATTATACAGAAGATTATTATTATTATTATTTAAAATTCAAGATGGCCACCGTTACTAAAA-TAGTATAAAACTTAAAAAAATCTTCTTCTCGTGAACCGC---CAAACAGATTGT---GA----AAATATTTATGTAGTAATGGTCACCAACTATAGTTCCATTAGATTTGTTTAAATGGTGTCCCTAGGGTAAAGAATGACCCCGCCCCGAGGGCTCAATAAGGGGACATGTTATTATAATACACATTAAT------------AAAAAAAAATAAAATGAACGGATATTGCCTATATTTTCACAGAAGCATTGATTGATC--AAGGAGAT---TCAGA-TTAATTAAGATGACTGGATTC-AACTGCCTGAAAGGGT-C----AGGAGGGGGCACC-A-AAAGGGTAAAAATTG-GGAA----TTTCAAAAGCCTTTCT-CT-TAAGAATCAGTCAGTCAAATGTGTTCATATTTGGCAGAAATTATCACTAT-GATTAGGGGTTTGA--ATCAAGAT--TA-GATTCAAGGAGCTTGTGTTTATAGAGGCTCTGTGAGT------GGA---------CTTTTACATAGGGATACAATGGGAAAA-C-GGAAA-TTCTCATTTTTTCACCCATTTGTGCAAAATT-TTATTCAG--TTTGAGTTTTGAAGCATCATCTAG----TCATAGCAAGCAAGAT-TTGATT-C---AATAAGCAGGATTAA--ATTTCCATAAGGGGCC-----A----GG--TGGG-T----CACAA-AAGGCTTAA-ATTTG-AAATTTTTTAACAA---TCTTC-TCTACA-----ACCGGTCAGTCAAATTAGTTCATATTTGATATAAATTATCCCT--A--T-GAATAGGGGTTT-AAA----GTTT-------GTACAAAT-CAA--G-G-GCTAG-TTTTTATAGGGATCCTGTTAGGGTACTTTGAGTTTTACATAGG-AAGTCTAT-CGGAAAACGGAAA--TTTC-ACCTTTT--T--------TTT--CATCCATTTGTGCAGAAT-TA--TTATTCAGTTTGAGTTCTGAAGCTTCT-TCTAGTTAAAGCAAATAATATGTGGTTC---AATAAGCAGGAT-TT----TATTTCC-ATAAGGGATCA--------GG--TGGGGTC-TCAAAAG-G--AT-------TGAA--ATTGAATATTTTCAAAAATCATCTTCTCAGCAACTGGTCAGTCAAATCAGTTTATA--TTTTATATAAAATTATCCCT--ATGGGAAGGGGGT--T-TGAAGTTTGTACACATCAAGGGG--CTGGAATGGATAG-GGGCTTTGTATG-AGGACT---TT---GAGTTTTACATAGGAGTTCTAT--GGGA-GAC-GAGAAAATTCGAATTTCCTCGAGCATTTTCGCAAAACCAA-TTTTGAATTTGAGATTTAAGCCATTGT----------------GTAGAATTAGCAAAT--ATTTTTTGTTACAT-AAAGAGGATTGAAATTCCATAAGGAGCCGG--AGGGA-CCA----AAAGAG-------TTG---ATTTTAAT-GAA-----ATT-TCAAAAACTGATTAGTCGGATTTGTTACAT
gi|10 : tCTTCTTCTCATAAACCAT---TAGCCAGATTGTACAGA----AATTTTGTATGTAGCTTTGATAA
gi|10 : tttta----TG-TGAATTTCATGGTCTCC--ATC--CC-AAT----GGGGCCTTGAGG-TGGGGCCT--AAATAGCTAATTTCATGG--TAAACTTTCAAAA----TCTT---------AATATGTGAAGCACTTGGAAAC-AAA-TT---GCAAACATAATTATTGAGGCCTATGGGTTCTTCATAAAAAATGTGA-AT--TTTAT-GCCCCTGGGTC--------TCTATGCTTGGCCCTGGGAGGGTG-------------GG------------GCCTACTTTACAAAA---TCTATATAAGAGAAAATGACAAAAACTCTTATTagatgaatcaaaattgtgaatttcatggtctccatcccaatggggccttgaggtggggcctaaatagctaatttcatggtaaactttcaaaatcttaatatgtgaagcacttggaaacaaattgcaaacataattattgaggcctatgggttcttcataaaaaatgtgaattttatgcccctgggtctctatgcttggccctgggagggtggggcctactttacaaaatctatataagagaaaatgacaaaaactcttatt
gi|11 : ttttacttcttctcataaaccattagccagattgtacagaaattttgtatgtagctttgataaagatgaatcaaaatGTCCATTG------TTGTTTTCTAGCTCTACTGGCCAAAGGCCAGATAA-TACCT--TGCAATGGCTTGTCCATCTTACATCATCTGTTGTCCATTGGCAGCACTTTTA-CTGAAACAACTAGGCCAATTAAATTCTAACT--ACATAAG----TT
gi|12 : atgattgtagtttgtaaggcatttcaaaggtttttaggttacctctgactttgtgtcagtgatcttttgcaatcgccttt-TTGGTT-C---ATTTAGAA----TAA--ATTTCTATAAAAGGTC-----A----GGAATGG-------CCCAATAACGGTTAATATTTA-GA--TTTTCAAAGA---TCTTC-TCTATA-----GCC-TTTGGTCAAACTTGTTTATACTT------AATCAT-TCT--A--T-AAGTAAGTATTT-CAGTGATGTTTTTTCCCAGTCCAAATGCAA--G-G----------TTA-AAAGGCCCTGTCAG
gi|13 : G----TCATAGAAATTAATATATT--TTAC---ATTACGGAATATCTA--ATTTCCATAAGGATCC-----A------------------CCCAA-AGGGGT-AA-AGCTGTGAATTTT-CTAAAA---TCTTT---AACATATGAATAGGTCAGCCAAGTGCATTCATATTTGGCATATATTGT-CAT--A--TAGAGTA
gi|13 : TCTAATTTCCATAAGGATC-C----A--------C-CC-A-AAGGGGTAAAG-CTG-TGAA---TTTTCTAAAATCTTTAA-CA-TATGAATAGGTCAGCCAAGTGCATTCATATTTGGCATATATTGTCA-TATAGAGTAaatgtacatacc
gi|14 : gtcatagaaattaatatattttacattacggaataGAAAG-C----AA-TTCGCATTTG------CATTTTT-TAGCTTTGCTGATCAAAGTTTAAAATCT----CATCATCTATATATTCATAGCAAATAAGCT-TTGGTT-C---AATAGGGAGTTCTGAATATTTGTTTAAGGGGCC-----A----GGT-TGGG-T----CCCAA-TAAAATTAA-AATaatgtacatacc
gi|14 : AGTTTAAAATCTCA-TCATCTATATATTCATAGCAAATAAGCTTTGGTTC---AATAGGGAG--T-TCTGAATATTTGT-TTAAGGGGCCA--------GG--TTGGGTC-CCAATAA-A--AT-------TAAA--AT
gi|15 : gaaagcaattcgcatttgcattttttagctttgctgatcaaTGAGTTGTGTATAGG-AATACTAA-GGGAAAACGGAAA--ATTC-A--TATT--G--------TTT--CATCCATTTATG-AG-TT-TT--TTATTCAGTTTGAGTTTTGAAGTTTCT-ACTGGTCACAACAAATAAGATT
gi|16 : ACT---TTCAAGAATTTTACATAGAAA-------------AAC-A-TAAAATTCCAACTTTTTCATCCATTTGTGCAAAAAT-A-TTCTG--TTTGAGATCTGgtgtagatcacaatttcatttata
gi|17 : ggtcG------TTGTTTTG-GGCTCTACTGGCCAAAGGTCAT--AAGGGCCTtgaagtatc
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gi|2 : aaattttatttattttTGAGTTTTACAACGG-GGTATTAT-GGGAAAATGGAAA--ATTC-T--CATT--T--------TTT--CTTCCATTTGTGTA-AATATG--TTGTTTAATTTGAGATCTAAAGCATTG-TCT--TAACAATAAATCTGATTTTATTCATTAATAAAGAGGAT-TG----AATTTCC-ATAAGGGGCCATGGGGGTGGG--TGAGG----CATTAA-A--GT-------TAAA--ATTGGGGATTTTCATAAACCTT---------------TCAGTCAAACTAGTTCATA--TTTGATAT-AAATTATCCATACATCAGCA-AGGAT--TGAAAAGTCTG--CATATCAAGGTG--CTGGGATTTATTA-AGGCCCTGAA-ATGTGTTT---TT---TACTTTTATATAGTAATATTATAGGGAA-AAC-T-GATTATTTTCATTTTCGCATCCATGTGTACAAAAAA-ACTTCTT--TTTAAAATCTAAAGCCTTTTTGCTCATAACAAATCCCTAGGAGTGGGTGATTGAAGTTCTGACAAATCAAG--GGGCTGA-GTTGTATAAGGGTTCTGTACAGGGACTAATTCAAA------ATCATTA---ATTTTCGTGGAGTACTAATTTTCAgagttttacaacggggtattatgggaaaatggaaaattctcattttttcttccatttgtgtaaatatgttgtttaatttgagatctaaagcattgtcttaacaataaatctgattttattcattaataaagaggattgaatttccataaggggccatgggggtgggtgaggcattaaagttaaaattggggattttcataaacctttcagtcaaactagttcatatttgatataaattatccatacatcagcaaggattgaaaagtctgcatatcaaggtgctgggatttattaaggccctgaaatgtgttttttacttttatatagtaatattatagggaaaactgattattttcattttcgcatccatgtgtacaaaaaaacttctttttaaaatctaaagcctttttgctcataacaaatccctaggagtgggtgattgaagttctgacaaatcaaggggctgagttgtataagggttctgtacagggactaattcaaaatcattaattttcgtggagtactaattttcattgattttgtggggagcctaga
gi|2 : aaattttatttattttttgttgttttcagctctactggccaaaggccagaagggcttatgtgatggcacattgttgtccgttagcaacacttatctgaaacgaccaggccaattaaactcaattaaagttcatatggatttctattgaagattttttgtttcaatctgaaattcaagatggctgccattactaaaaatagtttaaaacttaaaaaatcttcatctcatgaaccgcacaacgtatttttaaaatgtttatgtagtaatgataaccaactatagttctgttagatttgttaaaatggtgtccctggggttaaaaatgaccccgccccgagggttcagttaggggacacatgtcataataaacataaatttatttatttttaaaaaagaaactgattttgcccttgttttcacagaagcattgtttggtgaaggaggttcaaattataaaaatgacagggctctaacatcttaaggggacagaagtggccctaaaagggtaaaaatttggaattacaaaaatctttttcttaagaaccggtaagtcagatatgttcatatttggcataaattatccctatgtgtaggggtttgattgtagataagaatttaggggcttatatatataggggcactgtaaggcaacacagaattttacatagggaatatgggaaaacagaaaattctaattttttcatctatttaggcaaaattattattcaatatgagttctgaagtatcatctattgataggaaataagatttggttcaacaaggataattgactttccataaggggccagggtgggtaaaaaaagggttaaattagaaaattttcaaaaatcttctcaaccagtcagtcaaatttgttcatatttgatatagattatcccaatgagtctgggtttaaagttcgtacaaatcaaggttcttgtatttatgggggccctgtaagggggttttgagttttatataggattactatgggaaaacagaaaattctcttttttttcatttatttatgacttcttttattcagtttgagttttgaagcttcttttagtcataacaaataagattttgttcgatacaaagggttgacttcctaaaaggggcaggtttggggtcatcaaaaatggttaaattgaacattgttataaagcttattctcaacaaatggccagtcaaatttgttcatatttgatataaattatccctatgattaagagttctaagtttgGA---------GTTTTACAACGGGGTATTATGGGAAAA-T-GGAAAATTCTCATTTTTTCTTCCATTTGTGTAAATATGTTGTTTAA--TTTGAGATCTAAAGCATTGTCT------TAACAATAAATCTGAT-TTTATT-CATTAATAAAGAGGATTGA--ATTTCCATAAGGGGCC-----ATGGGGG--TGGG-TGAGGCATTA-AA--GTTAA-AATTG-GGGATTTTCATAAA---CCTT------------------TCAGTCAAACTAGTTCATATTTGATATAAATTATCCATACA--T-CAGCAAGGATTGAAAA----GTCT-------G--CATAT-CAA--G-GTGCTGG-GATTTATTAAGGCCCTGAAATGTGTTTTTTACTTTTATATAGT-AATATTATAGGGAAAACTGA------TT-A--TTTTCAT--------TTTCGCATCCATGTGTACAAAAA-AAC-TTCTT---TTTAAAATCTAAAGCCT-T-TTTGCTCATAACAAATttgattttgtggggagcctaga
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Reference ( family-2135 ) : NATTATTACNGCATACCTTACAGTTCTTNTTATTATAGGAAGCACTCAGAAACAAATTGTGAGCATAATTATTGACGCCTATGGGTCCT---TTATAAAAATTGTGAATTTCATGCCCCTGGGTCTCACGGTTTGGCCCTGGGGGTG--GGGCC----TACTTTACTAAATCTATATAAGAGAAAATGACAAAAAACGTTATTTCTT---------ATGACTG---AATA-GACTTAT-GTGA--ATG-NTTTTTGGTGTGATTTG--TTGT-TGC-----TG-------ACATGACGGTTAA-T---ACCTA----TG--TGA-ATTT-CATGG--T-CCCC--AC-C--CC-CAT----GG---GGCCTTGGGGGCGGGGCC--A--AAACAGTCAA---ATTCAAGG--TAAAC-TT-TAAAAATCTT--CTTCTTATTAT-A--GG----AAG--CACTCG----GAAA-C-AAATT---GTGAGCATGATTATNGACGCCTATGGGTCCT---TTATAAAAANTGTGAATTGCAT-G---------CCCCT-GGGTC--------TC---GC------------GGT----TT-------------GG------------GCCTACTTTACTAAA---TCTATATAAGAGAAAATGACAAAAACCGTTATTTCTTATGACTG-AATAGACTTATGTGAATGNTTTTTGGTG--TGATTTGTTGTTGCTGACACGACGGTTAATACCTATGT----TTT--AT--A---GCCCCTNACC--CCC-CCCCCACCCCC--NTACCTTAGGAGGCACNATGGGGAAACGAACTGTANGCATGNTAAATTAATGGNGCCTATGNGTCTGCNATCAAAATTGTGAATTGCGTGGTCCCCACCCCCCTGGGTCTCACGGTTTGAGCCTTGGGGTGGGTACCCCTTTACTAAATCTATATAAGAGAAAATGATGTGATTTGTTGATGCAGATATGACATTTAAAATCCATGTTTGAACTTTTGCCGCTTCCCGAAGGACAGCAGTTGGAAAACAGATTCATATTGCTTTATGTCATCAAGGATAATCAGGTGACCGTTAAGGCCCATTG------TTGTTTTC-AGCTCTACTGGCCAAAGGCCAGA--A-GGCCTTATGCGATGGC-C-GTC-GTCT-ACGTCGTCTGTCGTCCGTTAGCAGCACTTTCA-CTGAAACGACTAGGCCAATTAAACTCAAACTTAACAT-AG----TTCNCATGGATAGGAGATTNTACNGAAGATTATTATTGTTNCNATCTGAAATTCAAGATGGCCGCCGTTACTAAAAATAGTNTAAAACTTAAAAAA-TCTTCTTCTCGTGAACCGC---NAAACAGATTGT---GA----AANTATTTATGTAGTAATGATAACCAACTATAGTTCCGTTAGATTTGTTNAAATGGTGTCCCTGGGGTNAAGAATGACCCCGCCCCGAGGGCTCAGTNAGGGGACACGTTGTCATAATANACATNAATTTATTTATTTTTAAAAAAGAATAAAATGAACNGATNTTGCCCNTGTTTTCACAGAAGCATTGTTTGGTNAAGGAGGTTCAAATTA-TNAAGATGACAGGGTTCTAACTNCCTTAAAGGGN-CAGGA--GGGG-C-C--C-A-AAAG-GGTAAAAATTGGGAATTTTCAAAAATCTTTTTCTTAAGAACCGGTCAGTCAAATNTGTTCATATTTGGCATAAATTATCCCTATGANTAGGGGTTTGA--G--AAGATAAGAATTAAGGGGCTTGTATTTATAGGGGCTCTGTAAGG------GGAGTTTTACATAGGGANACTATGGGAAAA-CGGAAAATTCTCATTTTTTCATCCATTTNTGCAAAATTGTTATTCAA--TTTGAGTTC--TGAAGCATCATCTAG----TCATAGNAAATAAGAT-TTGGTT-C---AATAAGGAGGATTGA--ATTTCCATAAGGGGCC-----A----GG--TGGG-T----CNCAA-AAGGGTTAA-ANTT--GGGAATTTTCAAAAA---TCTT-C--TC-----TAC-A---ACCGGTCAGTC-AAA-----T---TTGTT--CAT-ATT-TGA-----TATAAATTATCCCT--AT-G----AGTANGGGTTT-NAA----GTT-T-------GTACAAAT-CAA--G-G-GCTNGTATT-TATAGGGGCCCTGTAAGGGGACTTTGAGTTTTACATAGG-AATACTAT-GGGAAAACGGAAA--NTTC-A--TTTT--TTTT--CATCCATTTGTGCAGA---ATTA--TTATTCAGTTTGAGTTCTGAAGCTTCTTCTGGTCATAACAAATAAGATTTGGTTCAATAAGNAGGGTTTGATTTCC-ATAAGGGGCCAGG--TGGGGTC-TCAAAAA-GGT-------TAAA--ATTGAACATTTTCANAAATCTTCTTCTCAACAACCGGTCAGTCAAATCAGTTCATA--TTTGNT-ATAA-AATTATCCCTATGAGTAGGGGGTTCGAAGTT-TGTACAAATCAAGGGG--CTGGAATGTATAA-GGGCTTTGTACGGGGACT---TTGAGTTTTACATAGGAGTNCTAT-GGGA-AACG-GAAAATTCNAATTTTCTCATNCATTTNCGCAAAAACAATTTTGAATTTGAGATTTAAGCCATTGTGTAGAATTAGCAAATAATTTTTGTTACATAAAGAGGATTGAAATTCCATAAGGAGCCGGAGGGACCCAAAAAGAGTTGATTTTAGTGAAATTTCAAAAACTGATTAGTCGGATTTGTTACAT
gi|1 : ATTATTACGGCATACCTTACAGTTCTTCTTATTATAGGAAGCAATCAGAAACAAATTGTGAGCATTATTATGGACGCCTATGGGTCCT---TTATAAAAATTGTGAATTTTATGCCTCTGGGTCTCACGGTTTGGCCCTGGGGGTA--GGGCC----TACTTTACTATATCTATATAAGAGAAAATGACAAAAAACGTTGTTTCTT---------ATGACCG---TATA-GACTTAT-GCGA--ATG--TTTTTGGTGTAATTTG--TTGT-TGC-----TG-------ACATGACAGTTAA-T---ACCTA----TG--TTA-ATTT-CATGG--T-CCCC--AT-C--CC-CAT----GA---GATCTTAGGGGCGGGGCC--A--AAACAGTCAA---ATTCAAGG--TAGAC-TT-AAAAAATCTT--CTTCTTATTATTATTGG----AAG--CGCTCA----GAAG-C-GAATT---GTGCGCATGATTATGGACGCCTATGAGTCCT---TTATAAAAAATGTGAATTTCAT-G---------CCCC--GGGTC--------TC---AC------------AGT----TC-------------GG------------ACCTACTTTACTAAA---TCTTTATAAGAGAAAATGACAAAAACCGTCATTTCTTATGACTG-AATA--CTCATTTGAATGGTTTTTGGTG--TGATTTGTTTTTGCTAACATGATGGTTAATGCTTATGT----TTT--ATTGA---GTCCCTCACC--CCCACCCCTACCCCC--TTACCTTAGGAAGCACTA---GAAAACAAACTGTAAGCATAATAAATTAATGAGGCCTATGCGTCTGCCATAAAAAATGTGAATTTCATG---------CCCCTGGGTCTCACGGTTTGAACCTTGGGGTGGGTACCCCTTTACTAAATCTATATAAGAGAAAATGATGTGATTTGTTGATGCAGATATGACATTTAAAATCCATGTTTGAACTTTTGCCGCTTCCCGAAGGACAGCAGTTGGAAAACAGATTCATATTGCTTTATGTCATCAAGGATAATCAGGTGACCGTTAAGGCCCATTGAGCCTCTTGTT----AGCTCTATTGACCAAAGGCCAGA--A-GGCCTTATGCGATGGCGC-GTT-GTCT---GTCGTCTGTCATCCGTTAGCAGTACTTTCA-CTGAAATCACTAGGCCAGTTAAACTCAAACTTAACAT-GGATGTTTCTCATGAATAGGAGATTATACAGAAGATTATTATTATTATTATTTAAAATTCAAGATGGCCACCGTTACTAAAA-TAGTATAAAACTTAAAAAAATCTTCTTCTCGTGAACCGC---CAAACAGATTGT---GA----AAATATTTATGTAGTAATGGTCACCAACTATAGTTCCATTAGATTTGTTTAAATGGTGTCCCTAGGGTAAAGAATGACCCCGCCCCGAGGGCTCAATAAGGGGACATGTTATTATAATACACATTAAT------------AAAAAAAAATAAAATGAACGGATATTGCCTATATTTTCACAGAAGCATTGATTGATCAAGGAGATTCAGATTAATTAAGATGACTGGATTC-AACTGCCTGAAAGGGT-CAGGA--GGGGGCAC--C-A-AAAG-GGTAAAAATTGGGAATTT-CAAAAGCCTTTCTCTTAAGAATCAGTCAGTCAAATGTGTTCATATTTGGCAGAAATTATCACTATGATTAGGGGTTTGA--ATCAAGATTAGATTCAAGGAGCTTGTGTTTATAGAGGCTCTGTGAGT------GGACTTTTACATAGGGATACAATGGGAAAA-CGGAAA-TTCTCATTTTTTCACCCATTTGTGCAAAATT-TTATTCAG--TTTGAGTTT--TGAAGCATCATCTAG----TCATAGCAAGCAAGAT-TTGATT-C---AATAAGCAGGATTAA--ATTTCCATAAGGGGCC-----A----GG--TGGG-T----CACAA-AAGGCTTAA-ATTT--GAAATTTTTTAACAA---TCTT-C--TC-----TAC-A---ACCGGTCAGTC-AAA-----T---TAGTT--CAT-ATT-TGA-----TATAAATTATCCCT--AT-G----AATAGGGGTTT-AAA----GTT-T-------GTACAAAT-CAA--G-G-GCTAGTTTT-TATAGGGATCCTGTTAGGGTACTTTGAGTTTTACATAGG-AAGTCTAT-CGGAAAACGGAAA--TTTC-ACCTTTT--TTTT--CATCCATTTGTGCAGA---ATTA--TTATTCAGTTTGAGTTCTGAAGCTTCTTCTAGTTAAAGCAAATAATATGTGGTTCAATAAGCAGGATTTTATTTCC-ATAAGGGATCAGG--TGGGGTC-TCAAAAG-GAT-------TGAA--ATTGAATATTTTCAAAAATCATCTTCTCAGCAACTGGTCAGTCAAATCAGTTTATA--TTTTAT-ATAA-AATTATCCCTATGGGAAGGGGGTTTGAAGTT-TGTACACATCAAGGGG--CTGGAATGGATAG-GGGCTTTGTATGAGGACT---TTGAGTTTTACATAGGAGTTCTAT-GGGA-GACGAGAAAATTCGAATTTCCTCGAGCATTTTCGCAAAACCAATTTTGAATTTGAGATTTAAGCCATTGTGTAGAATTAGCAAATATTTTTTGTTACATAAAGAGGATTGAAATTCCATAAGGAGCCGGAGGGACC--AAAAGAGTTGATTTTAATGAAATTTCAAAAACTGATTAGTCGGATTTGTTACAT
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gi|7 : taagaagaaatctcaactttttattagatcacctgagactttgcctcaagtgaccttttgtgattgcctattgtccgtcttgcgtctgtaaacaactcacatttttttacctcacctcaaaaacaattagcctgattgtgatgaaattttgtatgtagctttgtactaaaaagtgaatcaaaacTCTGATTAATATGGGAAGTGCTCGGAAACAAATTGTAAGCATAATTAATGAGACCTACAGGTCCT---TCATAAATAATGTGAATTGCATTCCCCAGGGTCTGACTTTTT--CGCCCT-ATGGTA--GGGCTT----ACGTTACTAAATCCATATAAT-GAAAATTACAAAAGCTTCTATTTCTCA---------TGACTGA--AATA--ATTTATT-TTA--ATG-ATTTTTGGTGTGTTTTG--TTGT-TGC-----TA-------ATATGACAGTTGAT---ATCTT----TG-------TTT-TATTGAATGCCCC--AC-A--AC-TCT----GT---GGTCTCGGGGATGGGGCC--A--AAATAGCCAA---ATTCAAGGTTTAAACT-T-----ATTTTT--CTTTTTATTAT-A--AG----AAA--AACTTC----GAAG-CAAA-TG---GTAAACATGATTGTTGAGGCCTATGTGTCCT---TTAT-AAAACTGTTAATTGCAT-G---------TCCCT-GGA---------------GT------------G---------------------GA------------GCCAACTCTACTAAT---TCTATATAAGAGAAAATGACAAAAAC--TTATATTTTTTG----------------GTG--TGATT--------------TGTTGTTTCCGACGTGACGGTCAAAATTCAT-T----TTTGAAT--AAGTGCCCCTGA----CCC-CCCACACCCCCAAAGACCT----AGGCACAATGGGGAAACAAAtgaatgccccacaactctgtggtctcggggatggggccaaaatagccaaattcaaggtttaaacttatttttctttttattataagaaaaacttcgaagcaaatggtaaacatgattgttgaggcctatgtgtcctttataaaactgttaattgcatgtccctggagtggagccaactctactaattctatataagagaaaatgacaaaaacttatattttttggtgtgatttgttgtttccgacgtgacggtcaaaattcatttttgaataagtgcccctgaccccccacacccccaaagacctaggcacaatggggaaacaaaaatt
gi|8 : taagaagaaatctcaactttttattagatcacctgagactttgcctcaagtgaccttttgtgattgcctattgtccgtcttgcgtctgtaaacaactcacatttttttacctcacctcaaaaacaattagcctgattgtgatgaaattttgtatgtagctttgtactaaaaagtgaatcaaaactgtgaattttgtccccaccccatgaatctttatggatggggcctaaacagccaatttcatggtaaacttaaaaaaaaaaAGTCAA---ATTCAAGG--TAAACT-T--AAAAAC--T--CTTCTTACTAT-C--GG----AAG--CACTGG----GAAA-GAAA-TG---GTGTACATGATTATGGA----TAAAA----T---ATATAAAAAATATGAATTGCATGG---------CCCCT-GTGCC--------CC-------------------T----TA-------------GG------------GCTTAaatt
gi|8 : gaaccactttcagAAAACTTAAAAAG-TCTTCTTGTAG-GAAGCACTCAGGAATAAATTGT---GAGCATAACTATTGATGaaaaaacttaaaaagtcttcttgtaggaagcactcaggaataaattgtgagcataactattgatgcctatggatcctttataaaaatgaaaactctatgcccctgtgtctcacggttaggcactggagatgggtcctactttactgattctatacaagagaaatttatttcttatgactgaatatacttatgtgaatgactttttgatgtgatttgttgttgacattacggtttacatgttaccaactcccatgaggccttagggtcaaattcgaggtaaatttaaaaatcttcgtattataagaagcactgggaaaatagtacctatctgatg
gi|8 : gaaccactttcagagtcaaattcaaggtaaacttaaaaactcttcttactatcggaagcactgggaaagaaatggtgtacatgattatggataaaatatataaaaaatatgaattgcatggcccctgtgccccttagggcttaaaTCTTCTTGTAGGAAGCACTCAGGAATAAATTGTGAGCATAACTATTGATGCCTATGGATCCT---TTATAAAAAT-GAAAACTCTATGCCCCTGTGTCTCACGGTTA--GGCACTGGAGATG--GGTCCT----ACTTTACTGATTCTATACAAGAGAAA-T-----------TTATTTCTTA---------TGACTG---AATA-TACTTATG-TGA--ATGACTTTTTGATGTGATTTG--TTGT---------TG-------ACATTACGGTT--T---AC--A----TG--T---------------T-ACCA--AC-T--CC-CAT----GA---GGCCTTAGG-------------------GTCAA---ATTCGAGG--TAAA-T-T-TAAAAA---T--CTTCGTATTAT-A--AG----AAG--CACTGG----GAAA-cctatggatcctttataaaaatgaaaactctatgcccctgtgtctcacggttaggcactggagatgggtcctactttactgattctatacaagagaaatttatttcttatgactgaatatacttatgtgaatgactttttgatgtgatttgttgttgacattacggtttacatgttaccaactcccatgaggccttagggtcaaattcgaggtaaatttaaaaatcttcgtattataagaagcactgggaaaatagtacctatctgatg
gi|9 : gaaccactttcagagtcaaattcaaggtaaacttaaaaactcttcttactatcggaagcactgggaaagaaatggtgtacatgattatggataaaatatataaaaaatatgaattgcatggcccctgtgccccttagggcttaaaaaaacttaaaaagTG--TTGTATGCAGCTTTGGT-----ACCTAAGGGTGAAT----CATA----AG--TGTTATTTGCATGG--T-CCCC--AC-C--CC-ACT----GG---GGT-TTGGGGTCTCGTCC--A--AAACAGCCAA---ATTCAAGG--TAAACA-T-TGAAAATCTT--CTTCTTACTAT-A--GG----AAG--TGCTTG----GAAA-CAAA-TG---GTGACCATGATTATGGAGGTATATGGGTCCA---TTATAAAAATTGTGAACTGCAT-G---------TCCCC-GAGTC--------TC---AT------------GGT----TT-------------GG------------CCCTatagtacctatctgatg
gi|9 : acattttctaatccccttttttaggtcacctgagactttttcccaagggacctttcgcgattgccttttgtccatcgctgtgcgtcgtccattcggaaacaattgacattttttacttctcaaatcataagctcaatcataatgaaaG--TGGGGCC-TAAAAAACAGTGCATTCGTAAACAATTGA-CATTTTCAG----CTTCTTCTCAAAAACCgggagtggggcctaaaaaacagtgcattcgtaaacaattgacattttcagcttcttctcaaaaaccataagctga
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blockSeqs : G A AC . T C C C . . . A A G A G . A A . . A G . A . GT G T A TGCA . TGTT T . . . . . . . G T TAA . . . T TC . C . . . . TG . . . G T TA T . A C . . . GCGTGGTTTGGCCTTGGTGGTG . . CG A . GA A T . A T T G . . G G . . G . TTG AG . ACAT AT G . . AG . T TA ACAGA A G CT TT T C A C . . . . A TA C A AT G AAGA G ATTA T ATT T GAAGGGGACTTA . G TTA . A . G AT C . GG . . GT . ATGGG T . CC . G . G . A . TAACATATGAATAGG . TGAA . . T . . T C AC AG T C TG . GT . G . T G G . . A . A A A . T A AC CTTCTT C G C G A . . . G . . C . A . T T C C TTT . C C A C T G C . T . TA . T . G A . . . A C .
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finalCons : NATTATTACNGCATACCTTACAGTTCTTNTTATTATAGGAAGCACTCAGAAACAAATTGTGAGCATAATTATTGACGCCTATGGGTCCT---TTATAAAAATTGTGAATTTCATGCCCCTGGGTCTCACGGTTT--GGCCCTGGGGGTG--GGGCCT----ACTTTACTAAATCTATATAAGAGAAAATGACAAAAAACGTTATTTCTTA---------TGACTG---AATA-GACTTATG-TGA--ATGN-TTTTTGGTGTGATTTG--TTGT-TGC-----TG-------ACATGACGGTTAAT---ACCTA----TG--TGA-ATTT-CATGG--T-CCCC--AC-C--CC-CAT----GG---GGCCTTGGGGGCGGGGCC--A--AAACAGTCAA---ATTCAAGG--TAAACT-T-TAAAAATCTT--CTTCTTATTAT-A--GG----AAG--CACTCG----GAAA-CAAA-TT---GTGAGCATGATTATNGACGCCTATGGGTCCT---TTATAAAAATTGTGAATTGCAT-G---------CCCCT-GGGTC--------TC---GC------------GGT----TT-------------GG------------GCCTACTTTACTAAA---TCTATATAAGAGAAAATGACAAAAACCGTTATTTCTTATGACTG-AATAGACTTATGTGAATGNTTTTTGGTG--TGATTTGTTGTTGCTGACACGACGGTTAATACCTATGT----TTT--AT--A---GCCCCTNACC--CCC-CCCCCACCCCC--NNACCTTAGGAGGCACNATGGGGAAACGAACTGTANGCATGNTAAATTAATGGNGCCTATGNGTCTGCNATNAAAGNTGTGAATTNCGTGGTCCCCACCCCCCTGGGTCTCACGGTTTGAGCCTTGGGGTGGGTACCCCTTTACTAAATCTATATAAGAGAAAATGATGTGATTTGTTGATGCAGATATGACATTTAAAATCCATGTTTGAACTTTTGCCGCTTCCCGAAGGACAGCAGTTGGAAAACAGATTCATATTGCTTTATGTCATCAAGGATAATCAGGTGACCGTTAAGGCCCATTG------TTGTTTTC-AGCTCTACTGGCCAAAGGCCAGA--A-GGCCTTATGCGATGGC-C-GTC-GTCT-ACGTCGTCTGTCGTCCGTTAGCAGCACTTTCA-CTGAAACGACTAGGCCAATTAAACTCAAACTTAACAT-AG----TTCNCATGGATAGGAGATTNTACNGAAGATTATTATTGTTNCNATCTGAAATTCAAGATGGCCGCCGTTACTAAAAATAGTNTAAAACTTAAAAAA-TCTTCTTCTCGTGAACCGC---NAAACAGATTGT---GA----AANTATTTATGTAGTAATGATAACCAACTATAGTTCCGTTAGATTTGTTNAAATGGTGTCCCTGGGGTNAAGAATGACCCCGCCCCGAGGGCTCAGTNAGGGGACACGTTGTCATAATANACATNAATTTATTTATTTTTAAAAAAGAATAAAATGAACNGATNTTGCCCNTGTTTTCACAGAAGCATTGNTTGGTNAAGGAGGTTCAGATTAATNAAGATGACAGGGTTCTAACTNCCTTAAAGGGN-CAGGA--GGGGC--C--C-A-AAAG-GGTAAAAATTGGGAATTTTCAAAAATCTTTTTCTTAAGAACCGGTCAGTCAAATNTGTTCATATTTGGCATAAATTATCCCTATGNTTAGGGGTTTGA--G--AAGATAAGAATTAAGGGGCTTGTATTTATAGGGGCTCTGTAAGG------GGAGTTTTACATAGGG-A--TA---TGGGAAAA-CGGAAAATTCTCATTTTTTCATCCATTTGTGCAAAATTGTTATTCAA--TTTGAGNTC--TGAAGCATCATCTAG----TCATAGNAAATAAGAT-TTGGTT-C---AATAAGGAGGATTGA--ATTTCCATAAGGGGCC-----A----GG--T-GGGT----CNCAA-AAGGGTTAA-ANTT--GGGAATTTTCAAAAA---TCTTCTTAACCGG---------------TCAGTC-AAA-----T---TTGTT--CAT-ATT-TGA-----TATAAATTATCCCT--AT-G----AGTANGGGTTT-NAA----GTT-TGT-------ACAAAT-CAA--G-G-GCTNGTATT-TATAGGGGCCCTGTAAGGGGACTTTGAGTTTTACATAGG-AATACTAT-GGGAAAACGGAAA--NTTCA---TTTT--TTTT--CATCCATTTGTGCAGAAAAACTTTTTTATTCAGTTTGAGTTCTGAAGCTTCTTCTGGTCATAACAAATAAGATTTGGTTCAATAAGNAGGGTTTGATTTCC-ATAAGGGGCCAGG--TGGGGTC-TCAAAAA-GGT-------TAAA--ATTGAACATTTTCANAAATCTTCTTCTCAACAACCGGTCAGTCAAATCAGTTCATA--TTTGNT-ATAA-AATTATCCCTATGAGTAGGGGGTTCGAAGTT-TGTACAAATCAAGGGG--CTGGAATGTATAA-GGGCTTTGTACGGGGACT---TTGAGTTTTACANAGGAGTNCTAT-GGGA-AACG-GAAAATTC-AATTTTCTCGAGCATTTTCGCAAAANCAATTTTNAATTTGAGATTTAAGCCATTGTGTAGAATTAGCAAATAATTTTTGTTACATAAAGAGGATTGAAATTCCATAAGGAGCCGGAGGGACCCAAAAAGAGTTGATTTTAGTGAAATTTCAAAAACTGATTAGTCGGATTTGTTACAT
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