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Reference ( family-2095 ) : CAAGGAATTATATAGAGAAGGAA-AGGCAA-CT-GATTG-A-GA--TT--T-GTGAACGCTCGCGTATTCACGCAAAATCTCG-CAATATCTCGTTTTCAATTATCTTAACTTCCATTCATCTCA----------------GGAACACAAA--T-CAAAAT-TCTTA----CATTGCAGAATG-AA----ATTCTCATCAAAACAATACCATTCCCAGNAATTT---GTGTTTAAAATTGTT--GAAGTACTTNTGATTACAA---AATTTGTATACTGCAGCT-A--AAA--TAA-CGA-C--A----A--ATTACGA---NAAATTTTCCTTCAA---ACCTCAATATCTT-T-AATTCAAGATCATTTTGCG-----TGAT--CG---AAACATG-TTTAAA-CATCTAAGATTA-CAT-ACAACTTACAGT-----TTTATGTAC-AAGAA-ATCAGTTGCCTGTGAATTATGAATGATTAATTTG--C-AAATAATTA--ATCCTTCGTGTGCTATTTCATCAACATT-----T--AGTCA----GGA-GATGCAAGTTTCCTATCCT--TCTATA---TAAGTCC
gi|1 : GAAATTATATAGAGAAGGAA-ATTCAA-CT-TAATG-A-GAG-TT--T-GGGAATGCTCACGTATTCACGTAAATGCTCG-CAATATCTCGTTTTCATTTATCTTAACTTCAATTTACATCA----------------GGAACACAAA--T-CAAAGT-TCTTA----TATTGCAAAATA-AA----ATTCTTATCAAAACAATACCATTTCCAACAATTT---GTGTTTAAAATTGTT--GAAGTGAATCTGATTACAA---AATTTGTATACTACAGCT-A--AAA--TAA-CGA-C--A----A--ATTACAA---GAAATTTTCTTTCTA---TCCTCAATATCTT-T-AATTCAAGATCATTTTGCA-----TGAT--CG---AAACATG-TTTAAC-CCTTTA
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gi|10 : gaaattatatagagaaggaaattcaacttaatgagagtttgggaatgctcacgtattcacgtaaatgctcgcaatatctcgttttcatttatcttaacttcaatttacatcaggaacacaaatcaaagttcttatattgcaaaataaaattcttatcaaaacaataccatttccaacaatttgtgtttaaaattgttgaagtgaatctgattacaaaatttgtatactacagctaaaataacgacaaattacaagaaattttctttctatcctcaatatctttaattcaagatcattttgcatgatcgaaacatgtttaaccctttactccatagatactccaagcttttgaaaatagtgcaggaagagttcacattgctcgtaacgagcaagctgaacacttcctgcactgttttccactctgtcagttaatataaacataattcacccattgctaatacgtggtgaattaatgctttcaatttgggagagtccaagaaaatgcttatggagcaaagggAGGAATTATATAGAGGAGGAA-AGGCAA-CT-GTTTG-A-GA--TTG-T-GTAAACGCTCGCATATTCACGCAAAATCTTG-CAATATCTCGTTTTTACTTATCTTAACTTCCATTCATCTCA----------------GGAATCCAAA--T-CAAAAT-TCTTC----AACTGCAGAATG-AA----ATTGTCATCAAAACAATACCATTCCCAGAAATTT---GTGTTTAAAACCGTT--GAAGTACTTGTGATTACAA---AATTTGTATACTGCAGCT-A--AAA--TAA-ATA-C--A----A--ATTACGA---TACATTTTCCCTCAA---ACCTCAATATCTT-T-AATTCAAGAGCATTTTGCA-----AGAT--CA---AAACATG-TTTAAG-CATTTAAGATTA-CAT-ACAACCTACAAT-----TT-ATATAC-AAGAA-ATCAGTTGCCTATGAATTATGA------------------ATGATTA--AT------------------TTGACATT-----T--AGTCA----GGA-GATGCAAGTTTCCAATCCT--TCTATA---CAAGTCC
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gi|17 : CAAAGAGTTATACTGAGATGGAA-AAACAA-CT-AATTT-G-GG--TT--T-GTAAAAGCTTGCGTATTCACACACTATCTtt
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gi|17 : caaagagttatactgagatggaaaaacaactaatttgggtttgtaaaagcttgcgtattcacacactatcttatgagtt-----TGATTACA---AAATATG-TATA------CTGCAATTA-AAG-A-AACGAACA-------TTTATGCAC-AAGAA-AGCAGAAGCCTATGAAGTCTAAATGATTATTTTG--CCAAATAAT-------CT--GCTTGCTATTGTATCAACATT-----T--AGTCA----GCA-GACGCCAGTTTCCTATTCT--TCTATA---TAacatttatgcacaagaaagcagaagcctatgaagtctaaatgattattttgccaaataatctgcttgctattgtatcaacatttagtcagcagacgccagtttcctattcttctatatacatcatt
gi|18 : caaagagttatactgagatggaaaaacaactaatttgggtttgtaaaagcttgcgtattcacacactatcttatgagttattaatgtcctgacgttgcagaagaaaatttgaaacaaaacaagaccattcacaacaatttgtgtttaaaattagtgatgtatttcCAAGGACTTATATAGAGAAAGAA-AAACAA-CT-GATcatcatt
gi|18 : acttaactccattaatagcATCTCGTTTTCAAATATCCTAACTTCCATTCATCTTA----------------GAAAAACAAA--T-CAAAAT-TCTTT----CTTTGCACAATG-GA----ATTCTCTACAAAACGAGACTA---------------------TACAATTGTT--AAAGTACGTATGATAACAA---AATATGCATAGTGCAACG-A--AAA--CAATCAAGG--A----A--AATACTT---GAAATTTAACTTCAA---AGTGAAATATC-T-T-ATTTTAAGAT-ATTTTctcgttttcaaatatcctaacttccattcatcttagaaaaacaaatcaaaattctttctttgcacaatggaattctctacaaaacgagactatacaattgttaaagtacgtatgataacaaaatatgcatagtgcaacgaaaacaatcaaggaaaatacttgaaatttaacttcaaagtgaaatatcttattttaagatattttcactttaaacctttacttcatacagacgcctttggaaccctctaatattgaaagcattaattcacc
gi|19 : acttaactccattaatagccaaggacttatatagagaaagaaaaacaactgTCACAA---AGTTTGTATATTGCTACT-A--AA---TAA-TGA-ATAA----A--ATCATTT---GAAATTTTACTTCAATCTACTTCAATGGTTT-T-AATTCAAGGTCATTTTGTG-----Tcactttaaacctttacttcatacagacgcctttggaaccctctaatattgaaagcattaattcacc
gi|19 : tgtttgtattgagttatatcactttttcatgT-----TTTGTGTAC-AAAAA-ATCAGTTATCTGTGAAACATGAATGATAAATTTGC-C-AAATTACTA--ATTCTTTGTGTGCAATTTTATCAACATTTACGGT--AGTGG----AGA-GGTGCAAGTTTCCGATCCacaaaaaatcagttatctgtgaaacatgaatgataaatttgccaaattactaattctttgtgtgcaattttatcaacatttacggtagtggagaggtgcaagtttccgatcc
gi|2 : tgtttgtattgagttatatcactttttcatgtcacaaagtttgtatattgctactaaataatgaataaaatcatttgaaattttacttcaatctacttcaatggttttaattcaaggtcaCAAGGAATTGTATAGAGAAGGAA-AGGCAA-CTTGATTA-A-AAAATT--T--TGAATGCTCGCATATTCACCCAAAATCTCG-CAGTATGTCGTTTTCAATTATCTTAACTTCCATTCATCTCA----------------TGAACACAAA--T-CAAAAT-TTTTA----CATTGCAGAATG-AA----ATTGTCATCAAAACAATACCATTCCCAGAAGTTT---ATGTTTAAAATTGTT--GAAGTGCTTTTGATTACAA---AATTTGTATACAGCAGCT-A--AAA--TAT-CGA-C--A----A--ATCATGA---TAAATTTTCCTTCAA---ACCTCAATATCTT-T-AATTCAAGATCATTTTGCG-----TGAT--CC---AAACATG-TTTAAA-CATCTAAGATTA-CAT-ATAACTTACAGTAACTGTTAAAATAC-AAGAA-ATCAGTTACCTGTGAAATATGAATGATTCATTTG--C-AAATTATGA--ATCCTTCATGTGCTATTTCATTAACATT-----T--AGTCA----GGA-GATGCAAGTTTCCTATCCT--TTTATA---TAAATCC
gi|20 : --TT--T-GTGAAAGCTCGCGTATTCAGGAAAAATCTAG-CAATATCTCGTTTTCAATTATCTTA----CCATTC
gi|20 : TACCATTCCCAAAACTAT---GTGTTTGTAATTGTTTTGAAGTGAATATGATTACAC---AATTTGTTTAATGCAGCT-A--AA---T-------------------TTACGA---GAAAGTATCCTTCAA---ACCTCAATATCTC-T-AATTCAAAATCGTTTTGGA-----TGAT--CC---AA--ATGATCTAA---ATCT----TT--CA--ATAATTTATAAT-----Tccaaaactatgtgtttgtaattgttttgaagtgaatatgattacacaatttgtttaatgcagctaaatttacgagaaagtatccttcaaacctcaatatctctaattcaaaatcgttttggatgatccaaatgatctaaatctttcaataatttataatt
gi|21 : tttgtgaaagctcgcgtattcaggaaaaatctagcaatatctcgttttcaattatct-AATTCAAGATCATTTTTCG-----TGAT--TG---AAACAT--TTTAAATCATTTGAGAT
gi|21 : aaaatatttatttatggtaatataccatatatatctatgactaatttatgtaaatgaacagtgaacaacttaataaatgaatgaatgaagtaaaAACATT-----TTAAATCATTTGAGATGATGCAAGTTTCCTATCCT--TCTATA---TAAGTCCgatgcaagtttcctatccttctatataagtccttgc
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gi|24 : TGTGCTATTTTCTCAAGATT-----T--AGTCA----AGA-GATGCAAGTCTCCTATCGT--TCTATA---CAAGTTCg
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gi|27 : CAAGGACTTATATAGAGAA-GAA-AAACAA-CT-GATt
gi|28 : cttaatgcattaacaGA-GATACAAATTTCCTATCCT--TCTATA---TAAGTTC
gi|29 : aAAGTTTCCTATCCT--TCTATA---TAAGTCttg
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gi|4 : aagaaattatatagagaaggaaaggcaactgattgagttttagtgaacgtttgtgtatttacacacaatctcgcaataattcgttttcaattatctagcatccattcaaaattcaaattcaaaattcttgcattgcagagagatattctcatcaaaacaataccattcccagaaatttgtgtttaaaattgctgaaatacttttgatttcaaaatatctatactgcatctaacataacaacaagttaactatgatacattttccttcaagcttcaatatctagcAAGGAATTGTATAGAGGAGGAA-AGGTAA-CT-GATTG-A-GA--TT--TTGTGAACGCTCGCGTATTCACTCAAAATATCG-CAATATCTCGTTTTTAATTAGCTCAACTTCCATTCATCTCA----------------TGAATACGAA--T-CAAAAT-TCTTA----CATTGCAGAATG-AA----ATTGATATCAAAACAATACCATTCCCAGAAATTT---GTGTTAAAAATTGTT--GAAATACTTGTGATTATAA---AATTTGTATACTGCAGCT-A--GAA--TAA-TGA-C--A----A--ATTACAA---TAAATTTTCCTTCAA---ACCTCAATATC-T-T-AATTCAGGAGCATTTAGCC-----TGAT--CGCAAAAATATT-TTTAAA-CATCCAAGGCTA-CAT-ACAACTTACAG------TTTATGTAC-AATAA-ATAAGTTGCCTATGAATTATGAATGATTAATTTG--C-AAATCATGA--ATGCTTCATGTGCTGTTTCATCAACATT-----T--AGTCA----GAA-AATGCAAGTTTCCTGTCCT--TCTATA---CAAGTCCttcctatcctattctatacaagtcattgatgactagtcatatttgaaagttacaatttatatgttttaatgtttgattcgatatacactgtagaagcaaaatatatttttcatatagtatttgtg
gi|5 : AAGGAATTATATAGAGACGTAA-AGGCAA-TT-AATTG-A-TA--TAA-T-GTGAACGCTCGCGTATTCACGCAAAATCTCAACAAAATCTCGTTTTTAATTATCTTAACTTCCATTTATCCCA----------------TGAATAAAAA--AACAAAAT-TCTCA----CATTGCAGAATG-AATGAAATTCTCA-CAAAACAATACCATAACCAGCAA--------GTTTATAATTGTT--GAAGTACTTCTGATTACAT---GAGTTGTATACTGTAGCT-A--AAA--TAA-CAA-C--A----A--ATTAAGA---GAAAATTTACATAAA---ACCGCAATATCTT-T-AATTCAAGATCATTTTTCG-----TTAT--TG---AAACAT--TAAAAA-CATCTATGATTA-CATGAAAACTTACA-T-----GTTATGTAC-AAGAA-ACCAGTTGATTGTTTATTGTAAATGATTTAC-----C-AAATAATTA--ACCCT---TGTGTTATTTTATTATCATT-----T--AGACA----G---GATGCAAGTTTCCTATCAT--TCTATA---CAAGTC
gi|6 : ATTATATAGAGAAAGAA-AGGCAA-CT-GATTG-A-GA--TT--TTGTGAATGCTTGCGTATTCACACAAAATCTTG-CAATATCTCGTTTTCAGTTATCTTAACTTCCATTCACCCCC----------------GGAACACAAA--T-CAAAAT-TATTG----CATTGCAGAATG-AA----ATCGTCATCAAAACAAGACTATTCCCAGAATTTT---TTATTTAAATTTGTT--GAAGTACTCATGAATACAA---AATTTGAATACT------------A--TAA-CGG-C--A----A--GTTACAA---TAAATTTTCCTTCAA---ACCTCAATATCTT-T-AATTCAAGATCATTTTTCA-----TGAT--CG---AAACATG-TTTAAA-CGTTTAAGATTG-CAT-ACAACTTACAG------TTTATGTAC-AAGAA-ATCAGTTGCCTGTGAATTATGAATGATTAATTTG--C-AAATTATGA--ATCCTTCGTGTGCTGTTTCATCGACATA-----T--AGTCA----GGA-AATGTAAGTTTCCTAACCT--C---TA---CAAATCC
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blockSeqs : . . . . TGT GT G . . . A . . . . G T C . . G . . . . . GG . . T G . . . A . A G T . . AT . . T C . C . C TTG T T . . . . TC .
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blockSeqs : . . . . GT TT A . . . . . . . . C A C . . A . . . . . T . . G A . . . G . A G . . . G . . A C . C . C TTG T C . . . . . .
blockSeqs : . . . . GA TT T . . . . . . . . G A A . . T . . . . . C . . G C . . . G . C G . . . G . . A T . T . T TCA C C . . . . . .
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blockSeqs : . . . . GA T A . . . . . . . . G T C . . C . . . . . C . . G C . . . G . G G . . . T . . G . . T . G GCG T C . . . . . .
blockSeqs : . . . . TA T G . . . . . . . . C T A . . T . . . . . C . . T C . . . C . G A . . . G . . A . . G . C TCA C C . . . . . .
blockSeqs : . . . . GT T G . . . . . . . . G T A . . G . . . . . C . . T A . . . G . G . . . . T . . A . . C . C G C C . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C T A . . A . . . . . C . . T A . . . G . G . . . . T . . . . . T . G . C G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . C . . C . . . . . C . . A A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . .
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Unaligned ( gi|14 ): AGTTCTGGTGTTTAAATAATATTCCATTTAAACTTTATTTTATGATTTAACATTATAATTTCACATAGAAATTATCAAAATTAATTTACTGAGAAATGTCAATAACTGATCAATAAAATTTAGAGCCTTTCAACTTTCATTACGAAATCTGTGTAACAAAAATTAACCCTTTACTCCATAGATACATCGCATTTTCCCGCACCAATCACAGAAGGCCTTTGAAAACAGTGCAGGAAGAGTTCAGATTGCTCATAACGAGCAATTTTAACACTTCCTGCACTGTTTTCCACTCTGTCAGTTAATATTAACATAATTCACCCATTGCTGATACATGGTGAATTAATGCTTTCAATTGGAAGAATCCAAGAAAATGCTTATGGAGCAAAGGTTTAAGGCCTAAAATGTACACAATGTTAAATCAG
Unaligned ( gi|22 ): AAACTGTGGACGTTCTATTGTCGCACTACAAAGTTTGTACACTGCCACACATTAACCCCCCCCCATAAAACAACCTGAAGCTTTTCTTCAAAATCAATTAGTTTTCATTGAACTTGTTGCAAAGTCAACCCATATATACATGTAATTATATAACTTACATTATTGATGT