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Reference ( family-2062 ) : NCAGAGTCATTGGCAAAAGTTGCAGGCCTNTGTAACCGTAATAGTAAATTGATGTATACTATATT-GTGCATATGTGTGNATTTA---CTGTT-A---T-ACCAATGA---TA----AT-----AATAAT--AA-----------T----A-AA-ATAA--ATC-----CT-T----C-T-TTCTAAT-TATGGAT--TTGT--T---A--ATGTTTT-----TA-----GGGTATAATTAAAAT--AAATA-T----GT--TGT-------ATGGTTTATCTTTTATTTA---CATACATAANATAATAACAAGTAAAGGCAA-CACA--NNAAATATTTCAACATTATGCNTG-AGT--------AGA---TNTAGTTCTTCTCGTGGGGTCCTTAGTAGGGTCGTTTCCTTTCACTTATGGCATTCTATCCTTATCAATGAACGTATTTGAAC-TTC-ATTTCATCATTGTCAGGACCCTGAAAACAAAAAAGAAAACAGTAAGATGTCACGAAAATATAAAAATTGTAACAACAGTTTCATTCTTAATCATCATTTAAAATTGCTATTATTACCGGTAATAAGAGTATCATTTTCTTTAAGAGTAAGTTCATTGTA-TTTTTGTTTCTCCGTTTTTACAGACGTGTTTTATTTTTAACAGTAAAATTTAGAAATGCGATTCGCCACATCATAAAAGACCATCGATATCACTCAAATAACAATTAAGCAATTAAAAGATGCCAACTTACTGGTTTTCATTCTCCGTAGCCACCTGTT------TTTTGACAGGTTGCATATTCTAACGACCACAAAGTTTGTTTTTACAACACTCTCTCCGGTGTCCTTT----ATGGCTTTGTTTACCCTGAAAACG---TCACACCTTTAACGACAACCACAAATCGGCTCGTTGATTATGTCGTAAATTTTTCCTCGAGGCGTCTTTGATCACACANGTGGTCGTAATTAAGGGTGTGAAAATAGAACAAAGAC-CGTGNTCGGGACAGATTTGGTGGTCGTAATANCGGATTAGCGGGGTGCCCGTATTATCGGAGTT-AACGACCATTG-AATAAAGAAGGAAAAAATCCGTCCCTAAAATAAATGCCCGTAATAGCGGGGTGGTCTTA-ATATCGGGGTGGTCGTNAGGTGGAGTTTTACTG
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Alignments
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Reference ( family-2062 ) : NCAGAGTCATTGGCAAAAGTTGCAGGCCTATGTAACCGTAATAGTAAATTGATGTATACTATATT-GTGCATATGTGTGCATTTA---CTGTT-A---T-ACCAATGATA----ATAATAAT--A-----AT----A-AA---------------ATAA--ATC-----CT-T----N-T-T--TCTAAT-TATGGAT--TTGT--T---A--ATGTTTT-----TA-----GGGTATAATTAAAAT--AAATA-T----GT--TGT-------ATGGTTTATCTTTTATTTA---CATACATAANATAATAACAAGTAAAGGCAA-CACA--NNAAATATTTCAACATTATGCNTG-AGT--------AGA---TNTAGTTCTTCTCGTGGGGTCCTTAGTAGGGTCGTTTCCTTTCACTTATGGCATTCTATCCTTATCAATGAACGTATTTGAACGTTCATTTCATCATTGTCAGGACCCTGAAAACAAAAAAGAAAACAGTAAGATGTCACGAAAATATAAAAATTGTAACAACAGTTTCATTCTTAATCATCATNTAAAATTGCTATTATTACCGGTAATAAGAGTATCATTTTCTTTAAAAGTAAGTTCATTGTA-TTTTTGTTTCTCCGTTTTTACAGACGTGTTTTATTTTTAACAGTAAAATTTAGAAATGCAATTCACCACATCATAAAAGACCATCGATATCACTCAAATAACAATTAAGCAATTAAAAGATGCCAACTTACTGGTTTTCATTCTCCGTAGCCACCTGTT------TTTTGACAGGTTGCATATTCTAACGACCACAAAGTTTGTTTTTACAACACTCTCTCCGGTGTCCTTT----ATGGCTTTGTTTACCCTGAAAACG---TCACACCTTTAACGACAACCACAAATCGGCTCGTTGATTATGTCGTAAATTTTTCCTCGAGGCGTCTTTGATCACACANGTGGTCGTAATTAAGGGTGTGAAAATAGAACAAAGAC-CGTGNTCGGGACAGATTTGGTGGTCGTAATACCGGATTAGCGGGGTGCCCGTATTATCGGAGTT-AACGACCATTG-AATAAAGAAGGAAAAAATCCGTCCCTAAAATAAATGCCCGTAATAGCGGGGTGGTCTTA-ATATCGGGGTGGTCGTNAGGTGGAGTTTTACTG
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Alignments
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consensus : NCAGAGTCATTGGCAAAAGTTGCAGGCCTATGTAACCGTAATAGTAAATTGATGTATACTATATT-GTGCATATGTGTGCATTTA---CTGTT-A---T-ACCAATGATA----ATAATAAT--A-----AT----A-AA---------------ATAA--ATC-----CT-T----N-T-T--TCTAAT-TATGGAT--TTGT--T---A--ATGTTTT-----TA-----GGGTATAATTAAAAT--AAATA-T----GT--TGT-------ATGGTTTATCTTTTATTTA---CATACATAANATAATAACAAGTAAAGGCAA-CACA--NNAAATATTTCAACATTATGCNTG-AGT--------AGA---TNTAGTTCTTCTCGTGGGGTCCTTAGTAGGGTCGTTTCCTTTCACTTATGGCATTCTATCCTTATCAATGAACGTATTTGAACGTTCATTTCATCATTGTCAGGACCCTGAAAACAAAAAAGAAAACAGTAAGATGTCACGAAAATATAAAAATTGTAACAACAGTTTCATTCTTAATCATCATNTAAAATTGCTATTATTACCGGTAATAAGAGTATCATTTTCTTTAAAAGTAAGTTCATTGTA-TTTTTGTTTCTCCGTTTTTACAGACGTGTTTTATTTTTAACAGTAAAATTTAGAAATGCAATTCACCACATCATAAAAGACCATCGATATCACTCAAATAACAATTAAGCAATTAAAAGATGCCAACTTACTGGTTTTCATTCTCCGTAGCCACCTGTT------TTTTGACAGGTTGCATATTCTAACGACCACAAAGTTTGTTTTTACAACACTCTCTCCGGTGTCCTTT----ATGGCTTTGTTTACCCTGAAAACG---TCACACCTTTAACGACAACCACAAATCGGCTCGTTGATTATGTCGTAAATTTTTCCTCGAGGCGTCTTTGATCACACANGTGGTCGTAATTAAGGGTGTGAAAATAGAACAAAGAC-CGTGNTCGGGACAGATTTGGTGGTCGTAATACCGGATTAGCGGGGTGCCCGTATTATCGGAGTT-AACGACCATTG-AATAAAGAAGGAAAAAATCCGTCCCTAAAATAAATGCCCGTAATAGCGGGGTGGTCTTA-ATATCGGGGTGGTCGTNAGGTGGAGTTTTACTG
Reference ( family-2062 ) : NCAGAGTCATTGGCAAAAGTTGCAGGCCTATGTAACCGTAATAGTAAATTGATGTATACTATATT-GTGCATATGTGTGCATTTA---CTGTT-A---T-ACCAATGATA----ATAATAAT--A-----AT----A-AA---------------ATAA--ATC-----CT-T----N-T-T--TCTAAT-TATGGAT--TTGT--T---A--ATGTTTT-----TA-----GGGTATAATTAAAAT--AAATA-T----GT--TGT-------ATGGTTTATCTTTTATTTA---CATACATAANATAATAACAAGTAAAGGCAA-CACA--NNAAATATTTCAACATTATGCNTG-AGT--------AGA---TNTAGTTCTTCTCGTGGGGTCCTTAGTAGGGTCGTTTCCTTTCACTTATGGCATTCTATCCTTATCAATGAACGTATTTGAACGTTCATTTCATCATTGTCAGGACCCTGAAAACAAAAAAGAAAACAGTAAGATGTCACGAAAATATAAAAATTGTAACAACAGTTTCATTCTTAATCATCATNTAAAATTGCTATTATTACCGGTAATAAGAGTATCATTTTCTTTAAAAGTAAGTTCATTGTA-TTTTTGTTTCTCCGTTTTTACAGACGTGTTTTATTTTTAACAGTAAAATTTAGAAATGCAATTCACCACATCATAAAAGACCATCGATATCACTCAAATAACAATTAAGCAATTAAAAGATGCCAACTTACTGGTTTTCATTCTCCGTAGCCACCTGTT------TTTTGACAGGTTGCATATTCTAACGACCACAAAGTTTGTTTTTACAACACTCTCTCCGGTGTCCTTT----ATGGCTTTGTTTACCCTGAAAACG---TCACACCTTTAACGACAACCACAAATCGGCTCGTTGATTATGTCGTAAATTTTTCCTCGAGGCGTCTTTGATCACACANGTGGTCGTAATTAAGGGTGTGAAAATAGAACAAAGAC-CGTGNTCGGGACAGATTTGGTGGTCGTAATACCGGATTAGCGGGGTGCCCGTATTATCGGAGTT-AACGACCATTG-AATAAAGAAGGAAAAAATCCGTCCCTAAAATAAATGCCCGTAATAGCGGGGTGGTCTTA-ATATCGGGGTGGTCGTNAGGTGGAGTTTTACTG
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gi|1 : --ATC-----AT-T----A-T-T--TTAAATGTATGCAC--ATGTAAT---A--ACG----------A-----GGGGATAATTAAAGT--AAATA-T----GT--TGTTTGTTGTATGGTTTATCTTTTATTTA---CATACATAGAATAATAACAAGTAAAGAGAA-CACA--TTAAATATTTCAACATTATGC-----------------------------TTCTCATGGGGTCCTTAGTAGGGTCATTACCCTTC--TTCTGGCATTCTATCCTTATCAATAAACGTATTTGGACTTCCATTTCAACATTGTCATGACCCTGAAAACAAAAAAGAAAACAGAAATATGTCATGAAAATATAAAAATTATAACAACAGTTTCACTCTTTATCATCATTTAAAATTGCTATTATTA------ATAAGAGTATCATTTTCTTTAAGAGTAAGTTCATTGTA-TTTTTGTTTCTCCATTTCTACAGATGTGTTTTATTTT--ACAGTAAAATTTA----TGCGATTCGCCACATCATTAAAGACCATCGATATCACTCAAATAACAATTAAACAATTAAAAGATGCCGACTTACCAGTTTTCATTCTCCATAGCCACCTGTT------TTTTGAAATGGTGCATATTCCAACGGCCACAAAGTTTTTTTTTACAACACTCTC--CGGTGTCCATT----AA----TTGTTTACTC-GAAAACG---TCACACCTTTAATGACAACCATAAATCATCTCGTTGATTATGTTGTTCATTTTTCCTCGAGGCGTGTTTGATCCCACAAGTGGTTGTAATTAAGAATATGAATAAAGAACAAAGAC-CGCAATCGGGACAAATTTGGTGGTCGTAATACCGGATTAGCGGGATGCCCGTATTATCATAGTT-AACGACCATTG-AATAAAGAAGGAAAAATTCCGTTCCTAAAATAAATGCCGATAATAGCGGGGTGGTCTTA-ATATCGGGGTGGTCATAAGGTGGAGTTTTACTcctattattatcattattttaaatgtatgcacatgtaataacgaggggataattaaagtaaatatgttgtttgttgtatggtttatcttttatttacatacatagaataataacaagtaaagagaacacattaaatatttcaacattatgcttctcatggggtccttagtagggtcattacccttcttctggcattctatccttatcaataaacgtatttggacttccatttcaacattgtcatgaccctgaaaacaaaaaagaaaacagaaatatgtcatgaaaatataaaaattataacaacagtttcactctttatcatcatttaaaattgctattattaataagagtatcattttctttaagagtaagttcattgtatttttgtttctccatttctacagatgtgttttattttacagtaaaatttatgcgattcgccacatcattaaagaccatcgatatcactcaaataacaattaaacaattaaaagatgccgacttaccagttttcattctccatagccacctgttttttgaaatggtgcatattccaacggccacaaagtttttttttacaacactctccggtgtccattaattgtttactcgaaaacgtcacacctttaatgacaaccataaatcatctcgttgattatgttgttcatttttcctcgaggcgtgtttgatcccacaagtggttgtaattaagaatatgaataaagaacaaagaccgcaatcgggacaaatttggtggtcgtaataccggattagcgggatgcccgtattatcatagttaacgaccattgaataaagaaggaaaaattccgttcctaaaataaatgccgataatagcggggtggtcttaatatcggggtggtcataaggtggagttttact
gi|10 : agtcgttggcaaaagttgccggcctatgtaactgtaatggtaaattgatgtatactagattgtgcatatgtgtacatatactgttatataatgataattgataataataataaaaaaaaaaaatccttttgctctaattatggattagttgctgtttttacctattatt---TCACACCTTTAACAACAACCACAAATTGGCTTGTTGATTTTGTCATAAAGTTTTCCTGAAGGCGTCTTTGATCACACAAGTAGTCATAATTAATGGTATGAAAATAGAACAAAGAC-TGTGATCATGACAGGCTGGGT-GTCTTAATACCGACTAAGCGAGGTGTCCATATTGTCAAAGTT-ACCAACCAATC-AATAAAGAAGGAAAAAATCCGTCCCTAAAATAAATGCCCATAATAGCAGTGTGCT-TTATATATCGGGGTGGTCGTAAGGTGGAGTTTTA
gi|11 : gttaactgacgtttTAACAATTAAGTTATTGAATGATGCCAACTTACTGGTTTTCATTCTCCATAGCCACCTGCT------TTTTGACAGGTTGCATATTCTAACAACCACAAAGTTTGTTTTTACAACACTCTCTCTGGTGTCCTTT----ATGGTTTTGTTTACC-TGAAAACG---TCACACCTTTAACAACAACCACAAATCGGCTCGTTGATTATGTCATGAATTTTTAATCGAGGCGTCTTTGATTACACATGTGGTCGTAATTAAGGGTGTGAAAATAGAACAAAAAC-TGTGGTCAGGACAAATTTGGTGGTC
gi|12 : ATA-TATATTGATGTATACTATATTCGT-CATGTGTGTGCATATA---CTGTTAA---T-A-GAATGATA----TTAATAATGAA-----AT----ACAA---------------ATAA--A-------AT-A----A-T-T--TCTAAT-TATGTAT--GTGG--T---G--CTGTTAT-----TA-------CTTTAATTATTAT--TATTATT----AT--TGA-------A---TTTA------ATTTA---TGCACAT---GTAATAACA
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gi|13 : atatatattgatgtatactatattcgtcatgtgtgtgcatatactgttaatagaatgatattaataatgaaatacaaataaaataatttctaattatgtatgtggtgctgttattactttaattattattattattattgaatttaatttatgcacatgtaataacacATAAGTGAAAT--AGATA-TACATGTAGTGT-------GTAATTTCTCTATTATTT---------ATAACATAGCAAC-------GGCAA-CACATTTAAAATGTTTAATCATTATACATG-AGT--------AGG---TTTCGCTCTTCAAGTGGGGTCCTTAGCAGGGTCGTTCCCTTTCACTTCTGAAATTCTGTTCTTTTCCATTCAGGTATTCG-GCTTCCATTT
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gi|15 : gacaaccacagaactgttgaagatttagattgtttacatcataattgcattggctgcccgctcatcataaagaagcaaTATGTTACTGCAATAGTAGATTGATGAATACTATATT-CTGCATGTGTGTGCATTTA---CTGTT-A---T-GACAATAATA----TTAATGAT--A-----AT------AA---------------ATA--------------T----G-T-TTATCTAAT-TACAGAT--TTGT----------TGTTAT-----TA-----ta
gi|16 : cttgtataaagctgtaatttgCATACGTGGTTGTAATTAAGGGTGTGAAAATAGAACGAAGAC-CGTGTTTGGAACAGATTTGGTGGTCGTAATACCGGATCAGCGGGTTGTCCGTATTATCGGAGTT-AACGACCGTTG-AATAAAGAAGGAAAAAATCCGTCTCTGAAATAAATGCCTGTAATAGAGGGGTGGTCTTA-ATATTGGGGTGGTCGTTAGGTGGGGTTTTACTGcttcttttattagtgtaatttgttaaacctgtcaacgtatgtacatgcattcagaaggggataagtaagtgaa
gi|17 : CAGAATCATTGACGACAGTTGATGGCCCATGTAACCGTAATTGTAGATTGATGTATATT------------------------------GTT-A---T-ACCAATGATA----ATAAt
gi|17 : CATCATTGTTAAGACCTTGAAAACAAGAAAGAAAAAAGTAAGATGT------AGTATAAAatgcatcattgttaagaccttgaaaacaagaaagaaaaaagtaagatgtagtataaagttcacaac
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gi|20 : cCAGAAGCAATGACAAATGTTGCAGGCCCATGTAACTGTCCGAGTAGATTGATGTA---------------------------TA---CTGTT-A---T-ACCAATGATA----ATGA------------------A-AC---------------TTAA--ATC-----CT-T----T-T-
gi|21 : ttgaatttCTAAAATATATGCCTATAATAGTGGGATGGTCTCA-ATATTGGTGTGTTTTTTTGGTAGAGTTT
gi|3 : TTGGCAAAAGTTG-AAGCCTATGTAACCGTAATAGTAGATTGATAAATACTATATT-CTGCATGTGTGTGCATAAA---CTGTT-A---T-ACCGATGATA----CTAATAAT--A-----AA----T-AA---------------ATAC--ATC-----CT-T----T-G-T--TCTCAT-TATGGAT--TTGT--T---G--CTGTTAT-----TA-------CTGTAATTATTATTGAAAT--T----AT--CAT-------A---TTTA--TTTTATATG---TATGCAT-ATGTTTTAACA--TTGGGGCAATTAAA--ATAAATATaagtgact
gi|3 : TAATAATAAATAAATACATCCT---TT-GTTCTCAT-TATGGATTTGTTGCTGTT-A---TTAC---TG-TA----ATTATTAT---------T----G-AA---------------ATTATCATA-----TT-T----A-T-T--T-TA---TATGTAT--GCAT---------ATGTTTTAACATTG-----GGGCA--ATTAAAAT--AAATA-T----AT--TAT-------ATGGGTT------TATTTA---CATACATAAAATAATATCAAGCAAAGGCAA-TACA--TTAAATGTTTCAACATTATACATG-AGT--------AGA---TTTAGTTTTTCTAGTAGGATCTTTAGTAGGGTCGTTTTCTTTCACTTATGGCATTTTGT--------ATGGAC----TT-----CTCATTTTATCAATGTCAGGGCCTTGAAAACAA----GATAAT-GTAATATGTCAGGAAAGTTTAAAAATTATAATAACAGTTTCATTCTTAATCATCGATTAAAACTGCTAT------CAATAATAAGATTATCATTTTCTTTAAAAGTAAGTT---------------------------ACAGACGTGTTTTACTTTTAG-ATTAAAATTTAG-----------------T--TAAAAGACCATCGATATTACTCTAATAACAATTTAGCAATTAAAAGATGCCAACTTAATGGTTTTTATTCCCCATAGACAACTGTTGTTATTCTTTGACAGGTTGCATATTCGAACGTTCACAA-GTTTGTTTTTACAACACGCTGTCTGGTGTCC---AAAAATGTCTTTGTTTACCC----GACGTTATCACACCTTTAACGACAACCACAAATTGGCTCGTTGAATAAGTCGTAAATTTTTCCTCGATGCGTCTTTGATCACCCAAGTCGTCATAATTAAGGGTATGCAAATAGAAGAAAGAA-ATTAATCGGAACAGATTTGGTGGTCGTTATATCGGATTAGCGGGGTGCCCATATTATCGAAGTT-GCCAACCATTC-AAAAAAGAAAAAACAAATCCGACCCTAAAATAAATGCCCGTAATAGCGGGTTGGTCTTA-ATATCGGTGTGGTCGTAAGGTGGAGTTTTACTGattatatgggtttatttacatacataaaataatatcaagcaaaggcaatacattaaatgtttcaacattatacatgagtagatttagtttttctagtaggatctttagtagggtcgttttctttcacttatggcattttgtatggacttctcattttatcaatgtcagggccttgaaaacaagataatgtaatatgtcaggaaagtttaaaaattataataacagtttcattcttaatcatcgattaaaactgctatcaataataagattatcattttctttaaaagtaagttacagacgtgttttacttttagattaaaatttagttaaaagaccatcgatattactctaataacaatttagcaattaaaagatgccaacttaatggtttttattccccatagacaactgttgttattctttgacaggttgcatattcgaacgttcacaagtttgtttttacaacacgctgtctggtgtccaaaaatgtctttgtttacccgacgttatcacacctttaacgacaaccacaaattggctcgttgaataagtcgtaaatttttcctcgatgcgtctttgatcacccaagtcgtcataattaagggtatgcaaatagaagaaagaaattaatcggaacagatttggtggtcgttatatcggattagcggggtgcccatattatcgaagttgccaaccattcaaaaaagaaaaaacaaatccgaccctaaaataaatgcccgtaatagcgggttggtcttaatatcggtgtggtcgtaaggtggagttttactg
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gi|5 : GAGTCATTGGCAAAAGTTGCAGGCCTTTGTAGCCCTAATAGTAAATGGATGTATACTTTATTTGTGCATATGTGTGAATTTA---CTGTT-A---T-ACCAATGATA----ATAATAAT--A-----AA----A-AT---------------ATAA--ATC-----CT-T----CCT-T--TCTAAT-TATGGAT--TTGT--T-----------TT-----TA-----GGATATAATTAAAAT--AAATA-T----GT--TGT-------ATGGTTTATCTTTTATTTA---TATACATAATATAATAACAA-----------CACA--AAAAATATTTTATTATTTTGCCTG-AGT--------AGA---TATAGTCCTTCTGGTGGGGTCCTTAGTAGGGTCGTTTCCTTTCACTTATGGCATTCTATCTTTATCAACGAACGCAGTTGAACGTTCATTTTATCATTGTCAGGACCCTGAAAACAAAAAAGAGAACAGTAAGATGTCACGAAAATATAAAAATTGTAACAACAGTTTCATTCTTAATCATCATATAAAATTGCTATTATTACTGGTAA-AAGA-------------------TAAATTCATTGTATTTTTTGTTTCTCCGTTTTTACAGACATGTTTTATTTTT-ACTGTAAAATTTAGAAATGCATTTCACCACATCATAAAAGACCATCGATATCACTCGTAAAACAATTAAACAATTAAAAGGTGCAAACTTACTGGTTTTCATTCTTCGTAGCCACCTGTT------TTTTGACAGGTTGTATATTCTTACGACCACAAAGTTTGTTTTTACAACACTCTCTCCAGT-TCCTTT----ATGGCTTTGTTTA-CCTGAAAACG---TAACACCTTTAACAACAACCACAAATCGGCTTGTTGATTATGTAGAAAATTTTTACTCGAGGCGTCTTTGGTCACACACGTGGTCGTAATTAAGGGTGTGAAAATAGAACAAAGAT-CGTGTTTGGGACAGATTTTGTGGTCGTAATAGCAGATTAGCGGATTGTCCGTATTATTGGAGTT-TACGA
gi|6 : TAACAACA----------TAATCATCATTTAAAAT-GCTATTATTA------ATAAGAGTATCATTTTCTTTAAGAGTAAGTTCATTGTA-TTTT-GTTTCTCCATTTTTACAGACGTGTTTTATTTTTA-CAGTAAAATTTAGAA----------TCACATCATTAAAGACCATCGAAATCACTCAAATAACAATGAAGCAATTAAGAGATGCCAACTTACTGGTTTTCATTCTCCATAGCCACCTGTT------TTTTGACAGGTTGCATATTCTAATGACTAAAAAGTTTGTTTTTA--------TCTCTGGTGTCCTTT----TTGGCTTTGTTTA-CCGGAAAACA---TCACACCTTTAATGACAACCACAAATCTGCTGGTTGATTATGTTGTAAGTTTTTCCCCGAGATG-CTTTGATCACACAAGTGGTCGTAATGAAGGGTGTGACAATAGAACAAAGAC-TGTGATTGGGACAGGTTTGGTGGTCGTAATAACGGATAAGTGGGGTGCCTGTATTATCGGAGTT-AATGACCATTGAAAAAAAGAAGGAAAAAATCCGTCACTAAAATAAATGCACATAATAGCGGGGTGGTCTTA-ATATaaaaaaaa
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