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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                tcttaagactaagaaaataaaaagcgcGCAA------------T------------------------TGTTGCG------------------------TTTTC-TAAGCC-TCACCTAAT-AAAC--TTTG-TACGGAAAGGCACTA-AC-CTTGTCTTTTCTTTATac
gi|7                          :                                                                                                                          tgcttaaataattcaaattctaacaaaaacctatgtaactatttacctctttcattttgcatatgacttttagcagatgaaacatggacatctatttctgcaacataaccaaagtatcaacattacacaaaacctagaagcaagtt------------------------TGTTACA------------------------TTGATGT--GCC-AAATCTAAT-GAAC--T-TG-TAGCAATAGTT-TTT-TCTCTAGTATTTTGTTTATCCTGCTgaggctctcccgagccattcatgcattttcgtgctgaaccttataaactttgtagaaaaagacattttatttatactgtaatataagcaagtaacgttttgaaagaatagaggattgagctagcagaactaagcttctaattattaactaaaaataaaaattaagtatgtttatttgttatgtattttaataaattaacaaaaaaaaaaatatgtaatggttttcttaccatatctatcgtaattaactagtaaaaattaaaataaattaaaacaaacaagttgttgcataaaatcagtcgaaagtgccagcttcagtcgcaaaatctcggacaataaaatttacacgaagaaatccaagtaatatgaaattgatgtttatttggttaccccattattatatctaataatgacttgtgataggatga
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaaatcataaaggcaaggccctctctgctgaggcagCCTCAGTAAAC--TCTG-TAGGGACAGGCACTT-AC-ATTGTATTCT-------CTAT---A-TAA-CACATCACTAAATGATAAAAGTAAAATGACTAAATCAGCAGAAgctgaggtttcaataacaatatcttggacaactgttttaaaggaagaaatccaagcagtctgaatgaaggtcaaccagccaaataaacttacagtagtaggtttaataggtcaactctttatta
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttaccATGGTCGATC-ATTATAACTCAGCTTCTA-TTATT-A-TAAAAA---A---T---ACCACAAAATCC-GTTTA-------------TTT---GTTTTG--------TAATTTAACAAATGATTAAACAAAAGAAAGAA--AA-------CATAACATATTTATCGTACATGA------CAATT--AAAAAAATATATTGATATCATTATCTAAGTCG----ATGATAATT--CAGGCGATGC--G--T------CCGTTTTTGTCGCA------AAATCTCGGACACTAAAATGT---ACACG-ACGAAA----TCTAAGTAA--TCGG-AAATTG-TA-GTTTATTTGGTTACCTACTAAccattgtttggttgtcgtgcttatcctaatacacattgtgcagaaaagtattgaccttgtattttatttgttgtgttgaataagcaagaaacagaggattgagatagcagtact
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acaaggttattaggtgagatttaggaaatgcaattgtttcgtttttgtgccgaacctaagaatctgtgtagggaaaggcactaacattgtattatattatcCTTCTAATTA-TTA-TAAAAA---AATATCAAAC----TAGTC-CGTTTATTTGTTTTGTAATTTA---AC---A------AATGATTAAACAAA---------AGAAA----AA--AAA------CATAACATATTTATCGTACTTGA------CAATC--AAAAAAATATATTGATATCATTATCTAAGTCG----ATGATAATT--CAGGCAATGC--G--T------CCGTTTCTGTCGCA------AAATCTCGGACACTAAAATGT---ACACG-ACGAAA----TCCAAGTAA--TCGG-AAATTG-TA-GTCTATTTGGTTACCTGCTAAATATACC--TAAA--AACATTCGGACAC---------------CCCACAATGACTGATGAAAGGATAcattcggacaccccacaatgactgatgaaaagataa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gAACATATTTATCTTACTTGA------TAAGTTAAAAA---TGTGTTGCTGTCATAATCTAAGTCG----ATAATAGGT--CCGCCAATGT--G--TTAATTTCAGTC------GAA------CCATCTCGGACACTACACTTT---ACACG-AAGAAA----GCAAAGCAA--GCTA-AAATTG-GA-GTTTATTTGGTTACCTGCCATATAAACC--TACG--TCT---------CCC--CTTTATTATGTCTGATAATGACTGGTGATAGGATAaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATATTTATAGTACTTGA------TAAGTTAAAAAA--TTTCTTGATGTCATAATCTAAGTCG----ATAATAGTT--TGCGCAATCT--G--T------CAGTT------TCAGTTGCTACATCTTGGATACTAACATTT---TCATG-AATAAA----TCAAAAGTAATTTTGAAAATTG-AA-GTTTATTTGATTACCTGCCAA-AAAAAC--TGAA--TTTATTGGGCCACAC--CTTTATTATGTCTAGTAATGACTGGTGGTAGGACAa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aatgtatttaaataaatgattaaacttaacaatataatatttgtttgtttATGTCATAATCTAGAACG----AAATTAGTT--CCGGAAATAT--G--TTATTATCAATT------GCA------ATATCACGGACACCACAATTT---AAACG-AAGAAA----TCCAAA-TA--TT------CTG-CA-GTTTATTTTGTaa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GC--T--T------CAATC------ACA------ACATCTTGGTCACT--AATTT---A-AGGCAAGAAA----ACCAAGTaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   g--T------CAATC------ATA------ACATCTTGGACATTAA--TTT---GCAGG-TA-AAA----TCCAAGTAG--TCTG-AA--TGAAA-ACCTATTTTGCTACTTACTAAATAAATT--TA-GAATTTATTCAAT--CGTTCCCTTATTATGTCTAGTAAGGCCCGGTGATAGGATAa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                attaatattcaagcaattgtaaaagatacagagaatactgggttagtggttctccccacacaaggtttattaggtgaggttaagaaaatgcaacaagcagaggctctccaggagtctgtgttgggttttcatgtcaaaccttataaactttgataggaaaggcactacggttgtattctgtttatcctatggaccaaaattacaattgtgtt--T------CAATA------ACA------ATATCTTGGACA----ACTGTTTTAAAGG-AAGAAA----TCCAAGCAG--TCTG-AA--TG-AA-GGTCA-------ACCAGCCAAATAAACT--TAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaaatcataaaggcaaggccctctctgctgaggcagtgttacattgatgtgccaaatctaatgaacttgtagcaatagttttttctctagtattttgtttatcctgctgctgaggttG-AAGAAAAAAGTCCAAGTAT--TCT--AAATTA-AATGTTTACTGTGCTAA-TGCTTAATAAACT--TAAA--GTTAT--GGCTACAT--CTTTATTATGTCAAATAATGagtagtaggtttaataggtcaactctttatta
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-179 )      :       GCTTAAATAAT-----TCAAATTCTAACAAAAACCTATGTAACTATTTACCTCTTTCATTTTGCATATGACTTTTAGCAGA--TGAAACA-TGGACA-TC-TATTT--CTGCAACATAACCAAAGTATCAACATTATCATCNAGTGACGTGNNAGCAAG--ATATAGAGAATACAAGGTTA-GTGC-CTTTCCCTACA--AAG-TTTATTAGGTGAGGCTN-AGA--------AAA------------T---GCAA------------C------------------------TGTTGCG------------------------TTTTCGTGCCGAACCTAATAAACTNTG-TAGGGAAAGGCACTNACCT-T-GTATTCTATTTATCCTGTTNGA-TAAGCAAGTAACG---TGA-AA-AANAGANGATTGAGCTAGCAGAACTNAGCTTCTAATTATT-A--TAAA---AAAA-AT---AC----AAGTCC-GTTTAT---TTAC---G------AATAATTTAACAAA----------AAAAA-AAAAA---AA-------CATAACATATTTATCGTACTTGACAANTTAAAA--AAAATATATTGA-----------TGT--CATAATCTAAGTCGATAATAGT-TCNGGC--AATGCGT------CAGT------CGCA------ACATCTCGGACA-CTAAAATTTACACG-AAGAAATCCAA-GTAATC----T--GAAATTG-AA-GTTTATTTGGTTACCTGCCAA-ATAAACCTAC--------G--TTTATTCGGTCACNCCTTTATTATGTCTAATAATGACTGGTGATAGGATA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tAATGA-AA-ATTTATTTCACTATCTGCCAACACCA--CTTC--------A--TTTATTCGGTCATCCCTGTATTGTGTCAAATAAga
gi|11                         :                                            tttgcaaggaaagccactactttagatttctttttttttttcttttttttttactaaatttacaagtgtgtagttttcaatcacaatatcttttatctttatttgaggggttaattcttaaagtccATAAAAGTTACAAAAT---GTGTACTTTTCCTACA--ACA-TGTATTACTTGAGGCTA-AGACAAAGCAAAAAGGCGAGACTCTGTCGGGCAA------------T------------------------TGTTACA------------------------TTTTTGTACTGAGCCTAATAAACTT---TAGGGGAAGGCACT--CCTATAATACTCTATTGATCAT-TTTGACTAA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TACCTACTAA-ATAAACTTAG--------A--AATATTCGAATACCCCTTTACAATATC----AAAGAATGGCGATAGGATAaatataattcggaattcatcattat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gcattactcatgtattgtatttatccctttgattaaaattaaatatatgaagtttcaatatcatggccacttatatgaagaagaaagatcaatgtagaccACAACAGTATTTGACTAAAGGTAT------CAAT------CGTA------AAACCATGGACG-CTAA--CTTAAAGG-TAAAAGTCCAA-GTACTCGGATT--AAAAAAA-AA-GTTTATTTG-----------A-ATA----TAC--------A--TTTATTCGACAGTTCCTTCATCAAGTCaac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgtaatctgattatcctttagacaaaaataaaa------CACT------CACA------ACATCTT--ACAGC----ATTTGAAGA-AAAAAGTCCAA-GTATTC----T---AAATTA-AATGTTTACTGTGCTAA-TGCTTA-ATAAACTTAA--------A--GTTAT--GGCTACATCTTTATTATGTCAAATAATGCCAAATAATAAGATA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    ------------------------TGGTGCA------------------------CTTTTATGTCAAACCAAATAT-TTTTG-CTGGGAAAGGCACTAATCT-A-ATATTCCAGTTATCCTGTTTGACTAAaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgaggctaacaaatgtagacaacatgagacgctgctaaactagA-----------TGT--CATAATCTAGAACGAAATTAGT-TCCGGA--AATATGTTATTATCAAT------TGCA------ATATCACGGACA-CCACAATTTAAACG-AAGAAATCCAA-ATATTC------------TG-CA-GTTTATTTTGTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                           TAGAGAATACTAGGTTG-GTGC-CATTCCTTACA--AAG-GTTTTCAGTTGAGGCTT-AGA--------AAA------------G---GCAA------------C------------------------aa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                     aagcatcatTAC-CGTTCCCTGCA--AAGTTTTATT-GGTGAGACTA-AGA--------ATA------------T---GTAACACGTTGAGACTC------------------------TGTTACG------------------------GTTTCGTGCTGGATCCAGAAAACATTG-CAGaaagttgggctgtgttgagttaatgctgagtttttgtgc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                  aagagtgtTA-GTGC-TTTTCACTTCA--GAG-TTTATTAGGTGAGGTTA-AGA--------AAA------------T---GTAA------------C------------------------aa
gi|2                          : ggttgaGCCTAAATGATAAACTTTAAGTTTTA-CAGATATGTATGTATTTAATTAGTTTTCTAATTTAGT---TAGCTAT--ACAGAATTGGAACAACGAACAATCGTATTTACCT-CAAAATGTTTA--GTA-CACCATTATCATCTACTAATATATCAGTAAG--ATATAAAGACGACTACGTTG-GTGC-CTTTCCTAACA--GAG-TTTATTAGATGAGACTT-TGA--------TAA------------T---GTAA------------C------------------------TGTTTCG------------------------TTTTCGTGCCGATCCTAAGAAACTGTG-TAGGGAAAGGC-CTTACCT-T-GTATTCTATTTATCCTGTTAGA-TAATCAGTTAACGAATTGATCA-AACAGATGATCGAGCTAGCAGAACTAAACTTCTAATTATTTA--TAAA---AAAA-AT---AC----AAGTCAAGTTTAT---TAAT---G------AATGATTTAACAAA----------AAAAACAAGAA---AAT------CATAACATATTTATCGTACTTGAAAATTTAAAA--AAAATGT-TTGA-----------TAT--AATAATCTAAGTCGATAACAAT-TCCGGC--AATGCGT------CAGT------TGCA------ACATCTCGGACA-CTAAAATGTACACG-AAGAAATCCAA-GTTATC----T--GAAATTG-TA-GTTTATTTGGTTACCTGCTAA-TTAAACCTAC--------G--TTTATTCAGCTACGTCTGTATTATGTCTGACAATGACTTGTGAAAGGATAaagttgagactgcttaaccatttttgtttttataaactt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                           GCGAGGCTCTACA--------AA-----------------GCCA------------C------------------------TGTCATG------------------------TTTTCATGTGGAACCTAATAAACTGTA-TAGTGAAAGACAC
gi|21                         :                                                                                                                                           tcttaagactaagaaaataaaaagcAG--ATACAGAGAACTTAAGGTTAAGTGC-ATGTGCATGTA--CTG-TTAATTAGGTGAGATTA-AGA--------AAA------------T---GCAA------------C------------------------
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                         gACA--AGG-TT-ATTAGGTGAGATTT-AGG--------AAA------------T---GCAA------------T------------------------TGTTTCG------------------------TTTTTGTGCCGAACCTAAGAATCTGTG-TAGGGAAAGGCACTAACAT-T-GTATTATA-TTATCATGGTCGA-T
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AACTCAGCTTCTA-TTATT-A--TAAA---AAA---T---ACCACAAAATCC-GTTTAT---TTGTTTTG--------TAATTTAACAAATGATTAAACAAAAGA-AAGAA---AA-------CATAACATATTTATCGTACATGACAATT--AAA--AAAATATATTGA-----------TAT--CATTATCTAAGTCGATGATAAT-TCAGGC--GATGCGT------CCGTTTTTGTCGCA------AAATCTCGGACA-CTAAAATGTACACG-ACGAAATCTAA-GTAATC----G--GAAATTG-TA-GTTTATTTGGTTACCTACTAA------------------------CATTCGGACACCCC-------------ACAATGACTGATGAAAAGATAcattataactcagcttctattattataaaaaataccacaaaatccgtttatttgttttgtaatttaacaaatgattaaacaaaagaaagaaaacataacatatttatcgtacatgacaattaaaaaaatatattgatatcattatctaagtcgatgataattcaggcgatgcgtccgtttttgtcgcaaaatctcggacactaaaatgtacacgacgaaatctaagtaatcggaaattgtagtttatttggttacctactaacattcggacaccccacaatgactgatgaaaagataa
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                  attaatattcaagcaattgtaaaagatacagagaatactgggttagtggttctccccacacaaggtttattaggtgaggttaagaaaatgcaacaagcagaggctctccaggagtctgtgttgggttttcatgtcaaaccttataaactttgataggaaaggcactacggttgtattctgtttatcctatggaccaaaattacaattgtgttGCTTCTAATTATT-A--TAAA---AAAATATCAAAC----TAGTCC-GTTTAT---TTGTTTTG--------TAATTTAACAAATGATTAAACAAAAGA-AAAAA---AA-------CATAACATATTTATCGTACTTGACAA--TCAAA--AAAATATATTGA-----------TAT--CATTATCTAAGTCGATGATAAT-TCAGGC--AATGCGT------CCGTTTCTGTCGCA------AAATCTCGGACA-CTAAAATGTACACG-ACGAAATCCAA-GTAATC----G--GAAATTG-TA-GTCTATTTGGTTACCTGCTAA-ATATACCTAA--------A--AACATTCGGACACCCC-------------ACAATGACTGATGAAAGGATA
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgaggctaacaaatgtagacaacatgagacgctgctaaactagA-----------TGT--CATAATCTAGAACGAAATTAGTTCCGGAAATATGTTATTATCAAT------TGCA------ATATCACGGACA-CCACAATTTAAACG-AAGAAATCCAA-ATATTC------------TG-CA-GTTTATTTTGTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                  TAGAGAA--TACTAGGTTG-GTGC-CATTCCTTA-CA--AAG-GTTTTCAGTTGAGGCTT-AGA--------AAA------------G---GCAA------------C------------------------aa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                              aagcatcatTAC-CGTTCCCTG-CA--AAGTTTTATT-GGTGAGACTA-AGA--------ATA------------T---GTAACACGTTGAGACTC------------------------TGTTACG------------------------GTTTCGT-GCTGGATCCAGAAAACAT--TG-CAGaaagttgggctgtgttgagttaatgctgagtttttgtgc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                           aagagtgtTA-GTGC-TTTTCACTT-CA--GAG-TTTATTAGGTGAGGTTA-AGA--------AAA------------T---GTAA------------C------------------------aa
gi|2                          : ggttgaGCCTAAATGATAAACTTTAAGTTTTA-CAGATATGTATGTATTTAATTAGTTTTCTAATTTAGT---TAGCTAT--ACAGAATTGGAACAACGAACAATCGTATTTACCT-CAAA---ATGTTTA--GTA-CACCATT---AT-CATCTACTAATAT--ATCAGTAAGATATAAAGAC--GACTACGTTG-GTGC-CTTTCCTAA-CA--GAG-TTTATTAGATGAGACTT-TGA--------TAA------------T---GTAA------------C------------------------TGTTTCG------------------------TTTTCGT-GCCGATCCTAAGAAACTG--TG-TAGGGAAAGGC-CTTACCT-T-GTATTCTATTTATCCTGTTAGA-TAATCAGTTAACGAATTGATCA--AACAGATGATCGAGCTAGCAGAACTAAACTTCTAATTATTTA--TAAA---AAAA-AT---AC----AAGTCAAGTTTATTAA---TGAATGATTTAA-CAAA---------AAAAACA-AGAA-----AA------TC-----ATAACATATTTATCGTACTTGAAAATTTAAAA--AAAATGT-TTGA-----------TAT--AATAATCTAAGTCGATAACAATTCCGGCAATGCGT------CAGT------TGCA------ACATCTCGGACA-CTAAAATGTACACG-AAGAAATCCAA-GTTATC----T--GAAATTG-TA-GTTTATTTGGTTACCTGCTAA-TTAAACCTAC--------G--TTTATTCAGCTACGTCTGTATTATGTCTGACAATGACTTGTGAAAGGATAaagttgagactgcttaaccatttttgtttttataaactt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                     GCGAGGCTCTACA--------AA-----------------GCCA------------C------------------------TGTCATG------------------------TTTTCAT-GTGGAACCTAATAAACTG--TA-TAGTGAAAGACAC
gi|21                         :                                                                                                                                                    tcttaagactaagaaaataaaaagcAGATACAGAGAA--CTTAAGGTTAAGTGC-ATGTGCATG-TA--CTG-TTAATTAGGTGAGATTA-AGA--------AAA------------T---GCAA------------C------------------------
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GCTT------CAAT------CACA------ACATCTTGGTCA-CT--AATTTA-AGGCAAGAAAACCAA-GTAaag
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                  gA-CA--AGG-TT-ATTAGGTGAGATTT-AGG--------AAA------------T---GCAA------------T------------------------TGTTTCG------------------------TTTTTGT-GCCGAACCTAAGAATCTG--TG-TAGGGAAAGGCACTAACAT-T-GTATTATA-TTATCATGGTCGA-T
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACTCAGCTTCTA-TTA-TTA--TAAA---AAA---T---ACCACAAAATC-CGTTTATTTGTTTTG--TAATTTAA-CAAATGATTAAACAAAAGAA-AGAA-----AA-------C-----ATAACATATTTATCGTACATGACAA-TTAAAA--AAA-TATATTGA-----------TAT--CATTATCTAAGTCGATGATAATTCAGGCGATGCGT------CCGTTTTTGTCGCA------AAATCTCGGACA-CTAAAATGTACACG-ACGAAATCTAA-GTAATC----G--GAAATTG-TA-GTTTATTTGGTTACCTACTAA------------------------CATTCGGACACCCC-------------ACAATGACTGATGAAAAGATAcattataactcagcttctattattataaaaaataccacaaaatccgtttatttgttttgtaatttaacaaatgattaaacaaaagaaagaaaacataacatatttatcgtacatgacaattaaaaaaatatattgatatcattatctaagtcgatgataattcaggcgatgcgtccgtttttgtcgcaaaatctcggacactaaaatgtacacgacgaaatctaagtaatcggaaattgtagtttatttggttacctactaacattcggacaccccacaatgactgatgaaaagataa
gi|4                          :                                                        acaaggttattaggtgagatttaggaaatgcaattgtttcgtttttgtgccgaacctaagaatctgtgtagggaaaggcactaacattgtattatattatcatggtcgatcattatAAGATACAGAGAA--TACTGGGTTA-GTGG-TTCTCCCCA-CACAAGG-TTTATTAGGTGAGGTTA-AGA--------AAA------------T---GCAA------------CAAGCAGAGGCTCTCCAGGAGTCTGTGTTGGG------------------------TTTTCAT-GTCAAACCTTATAAACTT--TGATA-GGAAAGGCACTACGGT-T-GTATTCTGTTTATCCTATa
gi|4                          :                                                                                        attaatattcaagcaattgtaaTTTACCTGCAAATTAATGTCCAAGATGTTATGATTGAAACACAATTG-TAATTTTGGTCCATAGGATAAACAGAA--TACAACCGTA-GTGC-CTTT-CCTATCA--AAG-TTTATAAGGTTTGAC-A-TGA--------AAA------------C---CCAA------------CACAGACTCCTGGAGAGCCTCTGCTTGTTGCA------------------------TTTTCTTAACCTCACCTAATAAACCTTGTG-TGGGGAGAACCACTAACCC-A-GTATTCTCTGTATCTTggaccaaaattacaattgtgtttcaatcataacatcttggacattaatttgcaggtaaaatccaagtagtctgaatgaaaacctattttgctacttactaaataaatttagaatttattcaatcgttcccttattatgtctagtaaggcccggtgataggata
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   attaatattcaagcaattgtaaT------CAAT------CATA------ACATCTTGGACA-TTAA--TTTGCAGG-TA-AAATCCAA-GTAGTC----T--GAA--TGAAA-ACCTATTTTGCTACTTACTAA-ATAAATTTA---------GAATTTATTCAATCGTTCCCTTATTATGTCTAGTAAGGCCCGGTGATAGGATAatccaagtagtctgaatgaaaacctattttgctacttactaaataaatttagaatttattcaatcgttcccttattatgtctagtaaggcccggtgataggata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                attaatattcaagcaattgtaaaagatacagagaatactgggttagtggttctccccacacaaggtttattaggtgaggttaagaaaatgcaacaagcagaggctctccaggagtctgtgttgggttttcatgtcaaaccttataaactttgataggaaaggcactacggttgtattctgtttatcctatggaccaaaattacaattgtgttGCTTCTAATTA-TTA--TAAA---AAAATATCAAAC----TAGTC-CGTTTATTTGTTTTG--TAATTTAA-CAAATGATTAAACAAAAGAA-AAAA-----AA-------C-----ATAACATATTTATCGTACTTGACAA--TCAAA--AAAATATATTGA-----------TAT--CATTATCTAAGTCGATGATAATTCAGGCAATGCGT------CCGTTTCTGTCGCA------AAATCTCGGACA-CTAAAATGTACACG-ACGAAATCCAA-GTAATC----G--GAAATTG-TA-GTCTATTTGGTTACCTGCTAA-ATATACCTAA--------A--AACATTCGGACACCCC-------------ACAATGACTGATGAAAGGATA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATTTAAATAAATGATTAAACTTAACAATATAA-----TA------TTTGTTTGTT-TATATTTATAGTACTTGATAAGTTAAAA--AA--TTTCTTGA-----------TGT--CATAATCTAAGTCGATAATAGTTTGCGCAATCTGT------CAGT------TTCAGTTGCTACATCTTGGATA-CTAACATTTTCATG-AATAAATCAAAAGTAATT----TTGAAAATTG-AA-GTTTATTTGATTACCTGCCAA-A-AAAACTGA--------A--TTTATTGGGCCACACCTTTATTATGTCTAGTAATGACTGGTGGTAGGACAaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aatgtT------CAAT------AACA------ATATCTTGGACAACTGT--TTTAAAGG-AAGAAATCCAA-GCAGTC----T--GAA--TG-AA-GGTCA-------ACCAGCCAA-ATAAACTTACAGTAGTAGG--TTTAATAGGTCAACTCTTTATTAaa
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Reference ( family-179 )      :       GCCTAAATGATAAACTTCAAGTTCTAACAGANACGTATGTANCTANTTANCTCTCTNATTTNGCATATGGCTNTTAGCAGAATTGGAACAACGGACAATCGTATTTACCTGCAAA---ATGTCCAAGGTATCANCATT---AT-CATTTA--TAATNT--GTCAGTAAGATATAGAGAA--TACAAGGTTA-GTGC-CTTTCCCTA-CA--AAG-TTTATTAGGTGAGGCTN-AGA--------AAA------------T---GCAA------------C------------------------TGTTGCG------------------------TTTTCGT-GCCGAACCTAATAAACTT--TG-TAGGGAAAGGCACTAACCT-T-GTATTCTATTTATCCTGTTNGA-TAAGCAAGTAACG--TTGA--A--AACAGAGGATCGAGCTAGCAGAACTAAGCTTCTAATTA-TTA--TAAA---AAAA-AT---AC----AAGTC-CGTTTATTTGTTTTGTAATTTAACAAATGATTAAACAAAAGA---A-AGAAAATC-----GTAA------------CATATTTATCGTACTTGACAAGTTAAAA--AAAATATATTGA-----------TGT--CATAATCTAAGTCGATAATAGTTCCGGCAATGCGT------CAGT------CGCA------ACATCTCGGACA-CTAAAATTTACACG-AAGAAATCCAA-GTAATC----T--GAAATTG-AA-GTTTATTTGGTTACCTGCCAA-ATAAACCTAC--------G--TTTATTCGGCCACCCCTTTATTATGTCTAATAATGACTGGTGATAGGATA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tAATGA-AA-ATTTATTTCACTATCTGCCAACACCA--CTTC--------A--TTTATTCGGTCATCCCTGTATTGTGTCAAATAAga
gi|11                         :                                                    tttgcaaggaaagccactactttagatttctttttttttttcttttttttttactaaatttacaagtgtgtagttttcaatcacaatatcttttatctttatttgaggggttaattcttaaagtccATAAAAGT--TACAAAAT---GTGTACTTTTCCTA-CA--ACA-TGTATTACTTGAGGCTA-AGACAAAGCAAAAAGGCGAGACTCTGTCGGGCAA------------T------------------------TGTTACA------------------------TTTTTGT-ACTGAGCCTAATAAACTT-----TAGGGGAAGGCACT--CCTATAATACTCTATTGATCAT-TTTGACTAA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TACCTACTAA-ATAAACTTAG--------A--AATATTCGAATACCCCTTTACAATATC----AAAGAATGGCGATAGGATAaatataattcggaattcatcattat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gcattactcatgtattgtatttatccctttgattaaaattaaatatatgaagtttcaatatcatggccacttatatgaagaagaaagatcaatgtagaccAAGGTAT------CAAT------CGTA------AAACCATGGACG-CTAA--CTTAAAGG-TAAAAGTCCAA-GTACTCGGATT--AAAAAAA-AA-GTTTATTTG-----------A-ATA----TAC--------A--TTTATTCGACAGTTCCTTCATCAAGTCaac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgtaatctgattatcctttagacaaaaataaaaacaacagtatttgacta------CACT------CACA------ACATCTT--ACAGC----ATTTGAAGA-AAAAAGTCCAA-GTATTC----T---AAATTA-AATGTTTACTGTGCTAA-TGCTTA-ATAAACTTAA--------A--GTTAT--GGCTACATCTTTATTATGTCAAATAATGCCAAATAATAAGATA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               ------------------------TGGTGCA------------------------CTTTTAT-GTCAAACCAAATAT-TTT--TG-CTGGGAAAGGCACTAATCT-A-ATATTCCAGTTATCCTGTTTGACTAAaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgaggctaacaaatgtagacaacatgagacgctgctaaactagA-----------TGT--CATAATCTAGAACGAAATTAGTTCCGGAAATATGTTATTATCAAT------TGCA------ATATCACGGACA-CCACAATTTAAACG-AAGAAATCCAA-ATATTC------------TG-CA-GTTTATTTTGTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                   TAGAGAA--TACTAGGTTG-GTGC-CATTCCTTA-CA--AAG-GTTTTCAGTTGAGGCTT-AGA--------AAA------------G---GCAA------------C------------------------aa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                               aagcatcatTAC-CGTTCCCTG-CA--AAGTTTTATT-GGTGAGACTA-AGA--------ATA------------T---GTAACACGTTGAGACTC------------------------TGTTACG------------------------GTTTCGT-GCTGGATCCAGAAAACAT--TG-CAGaaagttgggctgtgttgagttaatgctgagtttttgtgc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                            aagagtgtTA-GTGC-TTTTCACTT-CA--GAG-TTTATTAGGTGAGGTTA-AGA--------AAA------------T---GTAA------------C------------------------aa
gi|2                          : ggttgaGCCTAAATGATAAACTTTAAGTTTTA-CAGATATGTATGTATTTAATTAGTTTTCTAATTTAGT---TAGCTAT--ACAGAATTGGAACAACGAACAATCGTATTTACCT-CAAA---ATGTTTA--GTA-CACCATT---AT-CATCTAC-TAATAT--ATCAGTAAGATATAAAGAC--GACTACGTTG-GTGC-CTTTCCTAA-CA--GAG-TTTATTAGATGAGACTT-TGA--------TAA------------T---GTAA------------C------------------------TGTTTCG------------------------TTTTCGT-GCCGATCCTAAGAAACTG--TG-TAGGGAAAGGC-CTTACCT-T-GTATTCTATTTATCCTGTTAGA-TAATCAGTTAACGAATTGATCA--AACAGATGATCGAGCTAGCAGAACTAAACTTCTAATTATTTA--TAAA---AAAA-AT---AC----AAGTCAAGTTTA-------------TTAATGAATGATTTAACAAAAAAAACA-AGAAAATC-----ATAA------------CATATTTATCGTACTTGAAAATTTAAAA--AAAATGT-TTGA-----------TAT--AATAATCTAAGTCGATAACAATTCCGGCAATGCGT------CAGT------TGCA------ACATCTCGGACA-CTAAAATGTACACG-AAGAAATCCAA-GTTATC----T--GAAATTG-TA-GTTTATTTGGTTACCTGCTAA-TTAAACCTAC--------G--TTTATTCAGCTACGTCTGTATTATGTCTGACAATGACTTGTGAAAGGATAaagttgagactgcttaaccatttttgtttttataaactt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                      GCGAGGCTCTACA--------AA-----------------GCCA------------C------------------------TGTCATG------------------------TTTTCAT-GTGGAACCTAATAAACTG--TA-TAGTGAAAGACAC
gi|21                         :                                                                                                                                                     tcttaagactaagaaaataaaaagcAGATACAGAGAA--CTTAAGGTTAAGTGC-ATGTGCATG-TA--CTG-TTAATTAGGTGAGATTA-AGA--------AAA------------T---GCAA------------C------------------------
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCTT------CAAT------CACA------ACATCTTGGTCA-CT--AATTTA-AGGCAAGAAAACCAA-GTAaag
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                   gA-CA--AGG-TT-ATTAGGTGAGATTT-AGG--------AAA------------T---GCAA------------T------------------------TGTTTCG------------------------TTTTTGT-GCCGAACCTAAGAATCTG--TG-TAGGGAAAGGCACTAACAT-T-GTATTATA-TTATCATGGTCGA-T
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AACTCAGCTTCTA-TTA-TTA--TAAA---AAA---T---ACCACAAAATC-CGTTTATTTGTTTTGTAATTTAACAAATGATTAAACAAAAGA---A-AGAAAA-C-----ATAA------------CATATTTATCGTACATGACAA-TTAAAA--AAA-TATATTGA-----------TAT--CATTATCTAAGTCGATGATAATTCAGGCGATGCGT------CCGTTTTTGTCGCA------AAATCTCGGACA-CTAAAATGTACACG-ACGAAATCTAA-GTAATC----G--GAAATTG-TA-GTTTATTTGGTTACCTACTAA------------------------CATTCGGACACCCC-------------ACAATGACTGATGAAAAGATAcattataactcagcttctattattataaaaaataccacaaaatccgtttatttgttttgtaatttaacaaatgattaaacaaaagaaagaaaacataacatatttatcgtacatgacaattaaaaaaatatattgatatcattatctaagtcgatgataattcaggcgatgcgtccgtttttgtcgcaaaatctcggacactaaaatgtacacgacgaaatctaagtaatcggaaattgtagtttatttggttacctactaacattcggacaccccacaatgactgatgaaaagataa
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgaggctaacaaatgtagacaacatgagacgctgctaaactagA-----------TGT--CATAATCTAGAACGAAATTAGTTCCGGAAATATGTTATTATCAAT------TGCA------ATATCACGGACA-CCACAATTTAAACG-AAGAAATCCAA-ATATTC------------TG-CA-GTTTATTTTGTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                   TAGAGAA--TACTAGGTTG-GTGC-CATTCCTTA-CA--AAG-GTTTTCAGTTGAGGCTT-AGA--------AAA------------G---GCAA------------C------------------------aa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                               aagcatcatTAC-CGTTCCCTG-CA--AAGTTTTATT-GGTGAGACTA-AGA--------ATA------------T---GTAACACGTTGAGACTC------------------------TGTTACG------------------------GTTTCGT-GCTGGATCCAGAAAACAT--TG-CAGaaagttgggctgtgttgagttaatgctgagtttttgtgc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                            aagagtgtTA-GTGC-TTTTCACTT-CA--GAG-TTTATTAGGTGAGGTTA-AGA--------AAA------------T---GTAA------------C------------------------aa
gi|2                          : ggttgaGCCTAAATGATAAACTTTAAGTTTTA-CAGATATGTATGTATTTAATTAGTTTTCTAATTTAGT---TAGCTAT--ACAGAATTGGAACAACGAACAATCGTATTTACCT-CAAA---ATGTTTA--GTA-CACCATT---AT-CATCTAC-TAATAT--ATCAGTAAGATATAAAGAC--GACTACGTTG-GTGC-CTTTCCTAA-CA--GAG-TTTATTAGATGAGACTT-TGA--------TAA------------T---GTAA------------C------------------------TGTTTCG------------------------TTTTCGT-GCCGATCCTAAGAAACTG--TG-TAGGGAAAGGC-CTTACCT-T-GTATTCTATTTATCCTGTTAGA-TAATCAGTTAACGAATTGATCA--AACAGATGATCGAGCTAGCAGAACTAAACTTCTAATTATTTA--TAAA---AAAA-AT---AC----AAGTCAAGTTTA-------------TTAATGAATGATTTAACAAAAAAAACA-AGAAAATC-----ATAA------------CATATTTATCGTACTTGAAAATTTAAAA--AAAATGT-TTGA-----------TAT--AATAATCTAAGTCGATAACAATTCCGGCAATGCGT------CAGT------TGCA------ACATCTCGGACA-CTAAAATGTACACG-AAGAAATCCAA-GTTATC----T--GAAATTG-TA-GTTTATTTGGTTACCTGCTAA-TTAAACCTAC--------G--TTTATTCAGCTACGTCTGTATTATGTCTGACAATGACTTGTGAAAGGATAaagttgagactgcttaaccatttttgtttttataaactt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                      GCGAGGCTCTACA--------AA-----------------GCCA------------C------------------------TGTCATG------------------------TTTTCAT-GTGGAACCTAATAAACTG--TA-TAGTGAAAGACAC
gi|21                         :                                                                                                                                                     tcttaagactaagaaaataaaaagcAGATACAGAGAA--CTTAAGGTTAAGTGC-ATGTGCATG-TA--CTG-TTAATTAGGTGAGATTA-AGA--------AAA------------T---GCAA------------C------------------------
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCTT------CAAT------CACA------ACATCTTGGTCA-CT--AATTTA-AGGCAAGAAAACCAA-GTAaag
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                   gA-CA--AGG-TT-ATTAGGTGAGATTT-AGG--------AAA------------T---GCAA------------T------------------------TGTTTCG------------------------TTTTTGT-GCCGAACCTAAGAATCTG--TG-TAGGGAAAGGCACTAACAT-T-GTATTATA-TTATCATGGTCGA-T
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AACTCAGCTTCTA-TTA-TTA--TAAA---AAA---T---ACCACAAAATC-CGTTTATTTGTTTTGTAATTTAACAAATGATTAAACAAAAGA---A-AGAAAA-C-----ATAA------------CATATTTATCGTACATGACAA-TTAAAA--AAA-TATATTGA-----------TAT--CATTATCTAAGTCGATGATAATTCAGGCGATGCGT------CCGTTTTTGTCGCA------AAATCTCGGACA-CTAAAATGTACACG-ACGAAATCTAA-GTAATC----G--GAAATTG-TA-GTTTATTTGGTTACCTACTAA------------------------CATTCGGACACCCC-------------ACAATGACTGATGAAAAGATAcattataactcagcttctattattataaaaaataccacaaaatccgtttatttgttttgtaatttaacaaatgattaaacaaaagaaagaaaacataacatatttatcgtacatgacaattaaaaaaatatattgatatcattatctaagtcgatgataattcaggcgatgcgtccgtttttgtcgcaaaatctcggacactaaaatgtacacgacgaaatctaagtaatcggaaattgtagtttatttggttacctactaacattcggacaccccacaatgactgatgaaaagataa
gi|4                          :                          acaaggttattaggtgagatttaggaaatgcaattgtttcgtttttgtgccgaacctaagaatctgtgtagggaaaggcactaacattgtattatattatcatggtcgatcattatATT---AA-TATTCAAGCAAT-T--GTAA--AAGATACAGAGAA--TACTGGGTTA-GTGG-TTCTCCCCA-CACAAGG-TTTATTAGGTGAGGTTA-AGA--------AAA------------T---GCAA------------CAAGCAGAGGCTCTCCAGGAGTCTGTGTTGGG------------------------TTTTCAT-GTCAAACCTTATAAACTT--TGATA-GGAAAGGCACTACGGT-T-GTATTCTGTTTATCCTATa
gi|4                          :                                                                                                              TTTACCTGCAAATTAATGTCCAAGATGTTATGATTGAAACACAATTG--TAATTTTGGTCCATAGGATAAACAGAA--TACAACCGTA-GTGC-CTTT-CCTATCA--AAG-TTTATAAGGTTTGAC-A-TGA--------AAA------------C---CCAA------------CACAGACTCCTGGAGAGCCTCTGCTTGTTGCA------------------------TTTTCTTAACCTCACCTAATAAACCTTGTG-TGGGGAGAACCACTAACCC-A-GTATTCTCTGTATCTTggaccaaaattacaattgtgtttcaatcataacatcttggacattaatttgcaggtaaaatccaagtagtctgaatgaaaacctattttgctacttactaaataaatttagaatttattcaatcgttcccttattatgtctagtaaggcccggtgataggata
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     attaatattcaagcaattgtaaT------CAAT------CATA------ACATCTTGGACA-TTAA--TTTGCAGG-TA-AAATCCAA-GTAGTC----T--GAA--TGAAA-ACCTATTTTGCTACTTACTAA-ATAAATTTA---------GAATTTATTCAATCGTTCCCTTATTATGTCTAGTAAGGCCCGGTGATAGGATAatccaagtagtctgaatgaaaacctattttgctacttactaaataaatttagaatttattcaatcgttcccttattatgtctagtaaggcccggtgataggata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                 attaatattcaagcaattgtaaaagatacagagaatactgggttagtggttctccccacacaaggtttattaggtgaggttaagaaaatgcaacaagcagaggctctccaggagtctgtgttgggttttcatgtcaaaccttataaactttgataggaaaggcactacggttgtattctgtttatcctatggaccaaaattacaattgtgttGCTTCTAATTA-TTA--TAAA---AAAATATCAAAC----TAGTC-CGTTTATTTGTTTTGTAATTTAACAAATGATTAAACAAAAGA---A-AAAAAA-C-----ATAA------------CATATTTATCGTACTTGACAA--TCAAA--AAAATATATTGA-----------TAT--CATTATCTAAGTCGATGATAATTCAGGCAATGCGT------CCGTTTCTGTCGCA------AAATCTCGGACA-CTAAAATGTACACG-ACGAAATCCAA-GTAATC----G--GAAATTG-TA-GTCTATTTGGTTACCTGCTAA-ATATACCTAA--------A--AACATTCGGACACCCC-------------ACAATGACTGATGAAAGGATA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTATTTAAATAAATGATTAAACTTAACA---ATATAATATTTGTTTGTT-------------TATATTTATAGTACTTGATAAGTTAAAA--AA--TTTCTTGA-----------TGT--CATAATCTAAGTCGATAATAGTTTGCGCAATCTGT------CAGT------TTCAGTTGCTACATCTTGGATA-CTAACATTTTCATG-AATAAATCAAAAGTAATT----TTGAAAATTG-AA-GTTTATTTGATTACCTGCCAA-A-AAAACTGA--------A--TTTATTGGGCCACACCTTTATTATGTCTAGTAATGACTGGTGGTAGGACAaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaT------CAAT------AACA------ATATCTTGGACAACTGT--TTTAAAGG-AAGAAATCCAA-GCAGTC----T--GAA--TG-AA-GGTCA-------ACCAGCCAA-ATAAACTTACAGTAGTAGG--TTTAATAGGTCAACTCTTTATTAaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaaatcataaaggcaaggccctctctgctgaggcagtgttacattgatgtgccaaatctaatgaacttgtagcaatagttttttctctagtattttgtttatcctgctgctgaggttAA------------CATATTTATCTTACTTGATAAGTTAAAA--A---TGTGTTGC-----------TGT--CATAATCTAAGTCGATAATAGGTCCGCCAATGTGTTAATTTCAGT------CGAA------CCATCTCGGACA-CTACACTTTACACG-AAGAAAGCAAA-GCAAGC----T--AAAATTG-GA-GTTTATTTGGTTACCTGCCAT-ATAAACCTAC--------G--TCT---------CCCCTTTATTATGTCTGATAATGACTGGTGATAGGATA
gi|9                          :                                                                                                                                               TT---AT-CATTTAG-TGATGT--GTTA------TATAGAGAA--TACAATGTAA-GTGC-CTGTCCCTA-CA--GAG-TTTACT----GAGGCC-----------------------------------A------------T------------------------TGTTTGG------------------------TTGTCGT-GCTTATCCTAATACACAT--TG-TGCAGAAAAGTATTGACCT-T-GTATTTTATTTGTTGTGTTGAA-TAAGCAAG-------------A--AACAGAGGATTGAGATAGCAGTACTa


blockSeqs                     :                  AAACT          .    T  G      T   A   G      A    A  .       A .      AT       A      A  G     A   G    TTA       AG   T  C    GAAACACAATTG      A TG  C GT             .      A    A    A         T  CA   T                CT   CAAAGCAA   GGCGAGACTCTGTCGG    CAAGCAGAGGCTCTCCAGGAGTCTGTGTTGGG                                           A                  TG  A           A  A    ATA              A    T  C        TAACGAATTGATCA                                    A   T   .     .     ATATCAAAC         AA     T     T    A             TT       A AAC T G  A TTTGTTTGTT                                  T      .   AA   A    .             .                A T                 TATTAT    TTTTGT    GTTGCT A          G   CA     A G C           A      GGATTA    A   AA T                     C   AACT  CAGTAGTAGGT      TC  TC  C  TG         AA
blockSeqs                     :                                                                                                                 A   .    .         .    .  T    AATATTCAAG        T .   A AT             .      G    .    .         .  .    .                A    .          G                   CACAGACTCCTGGAGAGCCTCTGCTTGTTGCA                                           .                  .   .           A  T    A                C    T  C        A                                                 A   .   .     .     TACCACA           C      T     T    A             TA       G .   . G  A TCATAA                                      G      .   AA   A    .             .                T A                 TAATTT    TTCTGT    .      C          A   AA     A G .           .      TTGA      A   A  .                     .   AACT  GAAT             TC  AT  C  TT         AA
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 ATCATCTAC         G .   C .              .      C    .    .         .  .    .                T    .          T                   CACGTTGAGACTCTGTTACG                                                       .                  .   .           A  A    T                C    A  .                                                          .   .   .     .     AATAC             C      .     .    T             TA       G .   . A  A CATAA                                       G      .   A    C    .             .                T A                 .         .         .      T          .   AA     A C .           .      TG        A   A  .                     .   AACC  CAT              TC  CA  T  TT         TG
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 ATCATTTAG         . .   T .              .      G    .    .         .  .    .                A    .          T                   TTGTTACA                                                                   .                  .   .           A  A    T                A    C  .                                                                                                                  .             TA       C .   . T  T CATAA                                       .      .   .    G    .             .                T A                 .         .         .      C          .   AA     C C .           .      GG        A   A  .                     .   AATT  GAA              TC  CT  A  TT         TA
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                          .      G    .    .         .  .    .                A    .          T                   CTGTTTCG                                                                   .                  .   .           A  A    T                C    G  .                                                                                                                                                                                                  .      .   .    .    .             .                T A                 .         .         .      C          .   AC     C G .           .      TG        A   C  .                     .   TACC  CAT              TC  CT  G  TG         TA
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lowQualScore                  :                  .....          .    .  .      .   .   .      .    .  ...     . ..     ..       .      .  .     .   .    ...       ..   .  .     .....  .....   . ..  . ..             ..   . .    .    .         .  ..   .                ..   ........   ................    ....................................................................       .                  ..  .           .  .    ...        .     .    .  .        ................          .                       .   .   ..    ...   .............     ..     .     .    .             ..       . ... ..  . .     ...........................                  .  .   ..  .  . .    ...........   ..               . .      .      .   ......  ......  ......    ...... .          .   ..     . . .           .   .  ........  .   .. .        .         .  . . ....  ............    ..  ..  .  ..         ..                     
lowQualScore                  :                  00000          5    0  5      0   0   0      0    0  555     0 55     55       5      5  0     3   7    333       00   3  0     66666  00000   8 00  0 88             99   8 4    4    0         6  00   6                66   11111111   4444444444444444    66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666       0                  55  0           9  2    555        1     4    0  3        7777777777777777          7                       2   0   88    555   2222222222222     22     2     5    8             88       4 000 22  0 0     000000000000000000000000000                  8  2   22  2  3 7    11111111111   99               7 7      7      1   222222  666666  666666    666666 0          7   44     5 8 3           3   6  77777777  2   11 3        4         1  3 3 7777  666666666666    66  77  0  44         11                     
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Reference ( family-179 )      :       GCCTAAATGATAAACTTCAAGTTCTAACAGANACGTATGTANCTANTTANCTCTCTNATTTNGCATATGGCTNTTAGCAGAATTGGAACAACGGACAATCGTATTTACCTGCAAA---ATGTCCAAGGTATCANCATTANNATTCA---GTAATNT--GTNAGTAAGATATAGAGAA--TACAAGGTTA-GTGC-CTTTCCCTA-CA--AAG-TTTATTAGGTGAGGCTN-AGA--------AAA------------T---GCAA------------C------------------------TGTTGCG------------------------TTTTCGT-GCCGAACCTAATAAACTT--TG-TAGGGAAAGGCACTAACCT-T-GTATTCTATTTATCCTGTTNGA-TAAGCAAGTAACG--TTGA--A--AACAGAGGATCGAGCTAGCAGAACTAAGCTTCTAATTA-TTA--TAAA---AAAA-AT---AC----AAGTC-CGTTTATTTGTTTTGTANTTTAATAAATGATTAAACAAAAGA---AAGAAAA-CATAA------------CAT------------ATTTATCGTACTTGACAAGTTAAAA--AAAATATATTGA-----------TGT--CATAATCTAAGTCGATAATAGTTCCGGCAATGCGT------CA------GT------CGCA------ACATCTCGGACA-CTAAAATTTACACG-AAGAAATCCAA-GTAATC----T--GAAATTG-AA-GTTTATTTGGTTACCTGCCAA-ATAAACCTA-NA--------TTTATTCGGCCACCCCTTTATTATGTCTAATAATGACTGGTGATAGGATA
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgtaatctgattatcctttagacaaaaataaaaacaacagtatttgacta------CA------CT------CACA------ACATCTT--ACAGC----ATTTGAAGA-AAAAAGTCCAA-GTATTC----T---AAATTA-AATGTTTACTGTGCTAA-TGCTTA-ATAAACTTA-AA--------GTTAT--GGCTACATCTTTATTATGTCAAATAATGCCAAATAATAAGATA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             ------------------------TGGTGCA------------------------CTTTTAT-GTCAAACCAAATAT-TTT--TG-CTGGGAAAGGCACTAATCT-A-ATATTCCAGTTATCCTGTTTGACTAAaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgaggctaacaaatgtagacaacatgagacgctgctaaactagA-----------TGT--CATAATCTAGAACGAAATTAGTTCCGGAAATATGTTATTATCA------AT------TGCA------ATATCACGGACA-CCACAATTTAAACG-AAGAAATCCAA-ATATTC------------TG-CA-GTTTATTTTGTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                 TAGAGAA--TACTAGGTTG-GTGC-CATTCCTTA-CA--AAG-GTTTTCAGTTGAGGCTT-AGA--------AAA------------G---GCAA------------C------------------------aa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                             aagcatcatTAC-CGTTCCCTG-CA--AAGTTTTATT-GGTGAGACTA-AGA--------ATA------------T---GTAACACGTTGAGACTC------------------------TGTTACG------------------------GTTTCGT-GCTGGATCCAGAAAACAT--TG-CAGaaagttgggctgtgttgagttaatgctgagtttttgtgc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                          aagagtgtTA-GTGC-TTTTCACTT-CA--GAG-TTTATTAGGTGAGGTTA-AGA--------AAA------------T---GTAA------------C------------------------aa
gi|2                          : ggttgaGCCTAAATGATAAACTTTAAGTTTTA-CAGATATGTATGTATTTAATTAGTTTTCTAATTTAGT---TAGCTAT--ACAGAATTGGAACAACGAACAATCGTATTTACCT-CAAA---ATGTTTA--GTA-CACCATTATCATCTA---CTAATAT--ATCAGTAAGATATAAAGAC--GACTACGTTG-GTGC-CTTTCCTAA-CA--GAG-TTTATTAGATGAGACTT-TGA--------TAA------------T---GTAA------------C------------------------TGTTTCG------------------------TTTTCGT-GCCGATCCTAAGAAACTG--TG-TAGGGAAAGGC-CTTACCT-T-GTATTCTATTTATCCTGTTAGA-TAATCAGTTAACGAATTGATCA--AACAGATGATCGAGCTAGCAGAACTAAACTTCTAATTATTTA--TAAA---AAAA-AT---AC----AAGTCAAGTTTA-------------TTAATGAATGATTTAACAAAAAAAACAAGAAAATCATAA------------CAT------------ATTTATCGTACTTGAAAATTTAAAA--AAAATGT-TTGA-----------TAT--AATAATCTAAGTCGATAACAATTCCGGCAATGCGT------CA------GT------TGCA------ACATCTCGGACA-CTAAAATGTACACG-AAGAAATCCAA-GTTATC----T--GAAATTG-TA-GTTTATTTGGTTACCTGCTAA-TTAAACCTA-CG--------TTTATTCAGCTACGTCTGTATTATGTCTGACAATGACTTGTGAAAGGATAaagttgagactgcttaaccatttttgtttttataaactt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                    GCGAGGCTCTACA--------AA-----------------GCCA------------C------------------------TGTCATG------------------------TTTTCAT-GTGGAACCTAATAAACTG--TA-TAGTGAAAGACAC
gi|21                         :                                                                                                                                                   tcttaagactaagaaaataaaaagcAGATACAGAGAA--CTTAAGGTTAAGTGC-ATGTGCATG-TA--CTG-TTAATTAGGTGAGATTA-AGA--------AAA------------T---GCAA------------C------------------------
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GCTT------CA------AT------CACA------ACATCTTGGTCA-CT--AATTTA-AGGCAAGAAAACCAA-GTAaag
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                 gA-CA--AGG-TT-ATTAGGTGAGATTT-AGG--------AAA------------T---GCAA------------T------------------------TGTTTCG------------------------TTTTTGT-GCCGAACCTAAGAATCTG--TG-TAGGGAAAGGCACTAACAT-T-GTATTATA-TTATCATGGTCGA-T
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AACTCAGCTTCTA-TTA-TTA--TAAA---AAA---T---ACCACAAAATC-CGTTTATTTGTTTTGTAATTTAACAAATGATTAAACAAAAGA---AAGAAAA-CATAA------------CAT------------ATTTATCGTACATGACAA-TT-AAA--AAAATATATTGA-----------TAT--CATTATCTAAGTCGATGATAATTCAGGCGATGCGT------CCGTTTTTGT------CGCA------AAATCTCGGACA-CTAAAATGTACACG-ACGAAATCTAA-GTAATC----G--GAAATTG-TA-GTTTATTTGGTTACCTACTAA-----------------------CATTCGGACACCCC-------------ACAATGACTGATGAAAAGATAcattataactcagcttctattattataaaaaataccacaaaatccgtttatttgttttgtaatttaacaaatgattaaacaaaagaaagaaaacataacatatttatcgtacatgacaattaaaaaaatatattgatatcattatctaagtcgatgataattcaggcgatgcgtccgtttttgtcgcaaaatctcggacactaaaatgtacacgacgaaatctaagtaatcggaaattgtagtttatttggttacctactaacattcggacaccccacaatgactgatgaaaagataa
gi|4                          :                          acaaggttattaggtgagatttaggaaatgcaattgtttcgtttttgtgccgaacctaagaatctgtgtagggaaaggcactaacattgtattatattatcatggtcgatcattatATTAATATTCAA--GCAAT-T--GTAA--AAGATACAGAGAA--TACTGGGTTA-GTGG-TTCTCCCCA-CACAAGG-TTTATTAGGTGAGGTTA-AGA--------AAA------------T---GCAA------------CAAGCAGAGGCTCTCCAGGAGTCTGTGTTGGG------------------------TTTTCAT-GTCAAACCTTATAAACTT--TGATA-GGAAAGGCACTACGGT-T-GTATTCTGTTTATCCTATa
gi|4                          :                                                                                                              TTTACCTGCAAATTAATGTCCAAGATGTTATGATTGAAACACAATTGTAATTTTGGTCCATAGGATAAACAGAA--TACAACCGTA-GTGC-CTTT-CCTATCA--AAG-TTTATAAGGTTTGAC-A-TGA--------AAA------------C---CCAA------------CACAGACTCCTGGAGAGCCTCTGCTTGTTGCA------------------------TTTTCTTAACCTCACCTAATAAACCTTGTG-TGGGGAGAACCACTAACCC-A-GTATTCTCTGTATCTTggaccaaaattacaattgtgtttcaatcataacatcttggacattaatttgcaggtaaaatccaagtagtctgaatgaaaacctattttgctacttactaaataaatttagaatttattcaatcgttcccttattatgtctagtaaggcccggtgataggata
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         attaatattcaagcaattgtaaT------CA------AT------CATA------ACATCTTGGACA-TTAA--TTTGCAGG-TA-AAATCCAA-GTAGTC----T--GAA--TGAAA-ACCTATTTTGCTACTTACTAA-ATAAATTTAGAA--------TTTATTCAATCGTTCCCTTATTATGTCTAGTAAGGCCCGGTGATAGGATAatccaagtagtctgaatgaaaacctattttgctacttactaaataaatttagaatttattcaatcgttcccttattatgtctagtaaggcccggtgataggata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                               attaatattcaagcaattgtaaaagatacagagaatactgggttagtggttctccccacacaaggtttattaggtgaggttaagaaaatgcaacaagcagaggctctccaggagtctgtgttgggttttcatgtcaaaccttataaactttgataggaaaggcactacggttgtattctgtttatcctatggaccaaaattacaattgtgttGCTTCTAATTA-TTA--TAAA---AAAATATCAAAC----TAGTC-CGTTTATTTGTTTTGTAATTTAACAAATGATTAAACAAAAGA---AAAAAAA-CATAA------------CAT------------ATTTATCGTACTTGACAA--TCAAA--AAAATATATTGA-----------TAT--CATTATCTAAGTCGATGATAATTCAGGCAATGCGT------CC------GTTTCTGTCGCA------AAATCTCGGACA-CTAAAATGTACACG-ACGAAATCCAA-GTAATC----G--GAAATTG-TA-GTCTATTTGGTTACCTGCTAA-ATATACCTA-AA--------AACATTCGGACACCCC-------------ACAATGACTGATGAAAGGATA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGTATTTAAATAAATGATTAAACTTAACA---A-------TATAA------------TATTTGTTTGTTTATATTTATAGTACTTGATAAGTTAAAA--AA--TTTCTTGA-----------TGT--CATAATCTAAGTCGATAATAGTTTGCGCAATCTGT------CA------GT------TTCAGTTGCTACATCTTGGATA-CTAACATTTTCATG-AATAAATCAAAAGTAATT----TTGAAAATTG-AA-GTTTATTTGATTACCTGCCAA-A-AAAACTG-AA--------TTTATTGGGCCACACCTTTATTATGTCTAGTAATGACTGGTGGTAGGACAaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaT------CA------AT------AACA------ATATCTTGGACAACTGT--TTTAAAGG-AAGAAATCCAA-GCAGTC----T--GAA--TG-AA-GGTCA-------ACCAGCCAA-ATAAACTTA-CAGTAGTAGGTTTAATAGGTCAACTCTTTATTAaa
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