lowQualScore : 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 1 111 2 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111111111111 222222222 444444444 666666666666666666666666666666666666 1111111 1 1 1 11111 555555555555555555555555555 1 111111 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 2222222222 1 1 33 4
lowQualScore : 5 4 7 0 111 6 0 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3 66666666666666666 2 33 000000000 000000000 333 22 55 33 4 1 222222222222222222222222222222222222 44 5555 66 33 2 1111111 6666 33 7777 77777 8 6 4 3 7 00000 11 222222222222222222222222222 5 8888 1 777 2 0 222222 0 2 0 33 1 6 1 1 11 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0 2 5555555555 0 6 1 5 2 0 1 7 77 00 0
lowQualScore : . . . . ... . . .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. . ................. . .. ......... ......... ... .. .. .. . . .................................... .. .... .. .. . ....... .... .. .... ..... . . . . . ..... .. ........................... . .... . ... . . ...... . . . .. . . . . .. ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . . .......... . . . . . . . . .. .. .
lowQualScore : 0 0 0 2 555 0 0 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 55555555555555555 4 22 333333333 666666666 999 77 55 11 0 6 555555555555555555555555555555555555 99 0000 77 22 1 3333333 7777 99 1111 44444 0 6 0 0 5 00000 99 888888888888888888888888888 7 9999 0 000 7 5 777777 5 7 7 99 6 0 8 4 99 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 4 0 6666666666 1 7 7 4 1 7 7 9 99 77 0
consensus : NNNNNTTTGTTNTTATCCCCCGCTTTTCGACAGANA--TTTGG-GGATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCTGTCCGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTC--------CAAT--CTACA------ACTC-ATTCAAATGAAACT---TGTACATGT-CCT----G-GCGC-TA----AA-A----AATTAACGATTTT--ATNGAGTT--ATGGCCCTTTGT-CTN------TTT-AA-CTTAGA-TTTT------TAC-----AT-----------------TTT------AC--------------GTT--A-GATCN-ACTCTCCTCC-CA-AT---TTTAACCC-GAT-TCAAAC-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AG------CAGGTACATG-G-TC--T---GAA-CATGA-GCCTGTGG--TNTTGGCGTTCCG-ATTNAA------TNA---T-TTCTTNA-AG--AG-TTATGGCCCT----TTGA-TC--TTTTTAA-------T---GAAA--TTACA----TTC-G-TT-GCAACTTTGC-ATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CACCA---TTG-NATTTTCT---TATGAGGACAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTGT-AAGGGCCAGTTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CAT-CCCCG--CCCC-----T-CTT----------T------A--T-TT-----TC--GTC---CTTTT-AC----TATATTNTTTTCT--T---N---A-TTCT-T--TTC--C-TA-TTGCAT-TTCTNATGT--TN--CA--CCAT-----A-----CC--A---N-----ATT--------------CCC--------------A----GT---T--CAT-----CCT-GTTTCTTCACTTATTGT-TT-------AACCTTCGCCT-TGN-TTTATT--------TG--TTTC-CACCCAC-A----TA----TA-A-------TTT-----TTTAC-CATTACAATAA--TT-----TTT--A---CATCTCNT--GC--AT--TATAA-TGCAG--------TG----T-------------T-------------C-----CA-------------CAGGCAATGTCTA-NTTTTG--CTCAGTCCATGGCCCTTNTGAGCGGGGGATAT--GAATTCACTGAATTTTCTTGT-TTC
Reference ( gi|1 ) : AAATTTTGGTTATTATCCCGCGCTTCTCGA-AGACA--CTTGGGGGATATTATTTAAATGAT---GTCCGCCC-TCCGTCA-GTCCGTCCATCCGACCCAATT-TGGATCAACAACTTTGCGGCGGCAATTCCTACA------ACCCGATTCAAATGAAACT---TGTACATGT-TCTGA--A-GTGT-TA----AA-A----AATCAACGATTTT--ATCGAGTT--ATGACCCTCC---CTAA-----TTT-AA-TTTA-A-TTTT------TAC-----AT-----------------TTT------AC--------------GTT--A-GATTT-ACTCTTCTCT-CA-AT---TTTAAGCC-GAT-TCAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AG------TATGTACA---G-TA--T---GAA-CATGA-GCCTGTGG--TCTTGGTGTTCCT-ATTAAA------TAA---T-TTCTTAA-AT--AA-TTATGGCCCT----TTGA-TC--TTTTTAA-------T---GAAA--TTACA----TCC-A-TT-GCAATTGTGC-ATGTCAGCGTATA-----ACTATTGAGTAACAGCATCTAC---TACCA-AATTG-CATTATCT---GATGATGACAAGCCTTCAGAAA--GTGATGACCTTTATTTGTTAAGGGTCAGTTACCTCAAAAGTCATGGTCACTTGGGTTA-----CAT-CCCCA--CCCC-----T-CTT----------T------A--T-TT-----TTGAGTC---CGTTT-AC----TATATTGTTTTCT--T---T---A-TTCT-T--TTT--C-TA-TTGCAT-TTCTGATGT--TG--CA--CCAT-----A-----CT--A---T-----ATT--------------TCC--------------A----AT---T--CAT-----CCT-TTTTCTTCACTTATTGT-TT-------AACCTTCGCCT-TGCTTTTATT--------TG--TTTC-CATCCAC-A----T----------------TTT-----TTTAC-CATAACAATAA--GA-----TTT--A---CGTCTCTT--GC--AT--TATAA-TGCAA--------TG----T-------------T-------------C-----CA-------------CAGGCAATTTTT--TTTTCA--CTCAGACCATGGCCCATTTGAGCGGCGGATAT--GAATTCACTGAATTACCTTGTATTCA
gi|13 : TTTGTTATT-TCCCGC--TTTTCAA-AGATA---TTGATGGATATTG---AAATGGC---GTTCGTCC---------GTCCGTCCGTC
gi|15 : aacattgactgcTTTTTGTCCCCTGCTTTTCAACAAAAA--TTTGG----TTTTATTAAAATGGCACCGTCCGTCTGTCTGTAT-GTCTGTCCATC--ACGT--TT-TGGTTCATCAACTC-----------TTTCTACAGTTGTCACTTGATTCAAATGAAACT---TGatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgaacatgagcctaaagtcttggcattctgatttgatgatattacggagttatgctctttacttttttaacttaaattttacatcacacttttgaccaacactgttacagatgcaactcctccaataactttgagcctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|22 : tatatttcttgttTTATTCTTCGCTTTTCGA-AGAAAAGTTTG----ATATT-TTGAAATGGC---ATCTGCCT-TTC--CATGTCT-TTCA--------AGTTATGGACCAACAA-----------CAAT-----CA------A----ATTCAAACGAAACTTGCTGTACActgaaaagtttgctgtctaaactggtgcctgtggtgatattattttgattaattttttttgatggagtagtggccctttgttcttttaacttagatgatacttcatac
gi|6 : atattgaccttcactATACCCCTCTTTTCGATAAATA---TTGGGGGATATTG---AAATGGC---ATCTG----TCTG-CA-GTCTGTCccaggtacatgacctaaacatgaacctgtaatctttgtccaatttaattactgagttgt
gi|2 : ataaatttacgttgtatttcttac-TAGACAAACAACTTC----CAACAAT--CTA--------ACTCTATTCAAAT--AATT---TGAATATGTGCCTGC----GCGC-TATTGGAATA----AATTAT---TTTT--ATAGAGCA--ATGACACTTTG--CTA------TTC-AA-ACTA-AGTTTT------TAC-----AT-----------------TAA------AC--------------GNN--N-NNNNN-NNNNNNNNNN-NN-NN---NNNNNNNN-NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAC-ATGCTGTAC--AA-------AGGTACATG-A-TC--T---GAA-TATTA-GCCTATAG--CATTGGTGCTTCA-ATTCCA------TAA---T-CTGTTAC-AG--AA-GTATGGCTTT----TTGA-TC--TTATAAG-------T---GAAA--TTACA----TTT-A-TT-ACATTTTTGC-ATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAACAACAGCAT---C---TACCA-TATTG--ATTTTTT---TATGAGGACAGACCTTCTGGAA--GTGGTG-----TATT-------GGCCAGTTACCTAAGAGATCAATGTCACATAGGTCAACTCCCCC-CCCCC--CCCC-----T-CTT----------C------AATT-TC-----TTTTGTT---ATTTT-ACGAAACAAACACTTTTC-----------A-TTCT-T--CTT--C-TA-TTGCAT-TTCTAATGT--TC--CA--CCacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|5 : TGAAACT----GTGCCTGT--------G-GTCT-TA----AC-ATTCTAGTTAATGACTTTTGATGGAGTT--ATAGCCCTTTGTTCT-------TTT-AA-CTTAGA-TTTTATGTGATACTNNNNNN-----------------NNN------NN--------------NNN--N-NNNNN-NNNNNNNNNN-NN-NN---NNNNNNNN-NNN-NNNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAT--AG------CAAGTACATG-G-TT--G---GAA-TATGT-GCCTGTAG--TATTAGAGTT-----TTGCC------TAA---C-TTTTTCG-ATGGAG-TTATGACCCT----TTGT-TC--TTTTAAC-------T---TAGA--TTttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|7 : gtcGTACATGT-TCTTATCACGTGCATG----TA-A----AATTAACTATTTT---TTTATTTTAATG-CCCTTT---GTAA-----TTTTAACTTTA-A-TT--------TGCG----A---------------------------AC--------------GCA--A-------ACCCTCCTAC-AG-AT---A--AAATC--ATGTCAAAT-----------------GTCAC-TTGTTTTGC--AG------CA-GTACATG-G-TC--T---AAA-CATAA-GAATGTAG--TATTTGTGTTCCA-GCTCAA------TG--------CGTAA-TG--AG-TTATGGTCCT----TTGA-TC--TCTTGAA-------T---GGAA--CTACA----TTC-T-TT-GCAATT-TGC-ATttaagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtatagcatatgtatatggtcagaatacgtgcctgtgatattagagttttgactaactttttgatgaagatatggccctttgttcttttaatttagattttagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|14 : GT-TA----AA-T----AAT-----ATTTT--ATTGAGTA--ATTGCTCTTTGT-TTTT-----TTT-AA-CTTAGA-TTTT------GGC-----ATAA---------------TTTGGACCAACA-------------GTC--ATGAC---ACTACCCTCC-CA-CTGTATTTA--CCAGAT-TCAANN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NN------NNNNNNNN---N-NN--N---NNN-NNNNN-NNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNN-NNNNNN------NNN---N-NNNNNNN-NN--NN-NNNNNNNNNN----NNNN-NNNNTTTTTAA-------T---AAAA--TTACA----TTT-G-TT-GCATTTTTGC-ATTTCAGCCTATA-----AATATTGAGTAtttcttatcaggacatactttcaggaagtaattacattgtttgttaaggaccagtaatataaaaggccaaggccaattgggccacatgcaccattttgttttgtacttcagtgtttgttttaattatttccctattgtattgtgttctgccaacccatctctaactccaaatttccatccggctcatctgtttcttaactcattgcttattgataaacctttgccttggtttcatttcatcccg
gi|13 : tgctgtatgtacatggtcgaagtatgtgcctgtggtattggcattccaATGATATT--ACGGAGTT--ATGCTCTTTA---CTTT-----TTT-AA-CTTA-A-ATTT------TAC-----ATCACAC------------TTTTG----ACCAACACT-------GTTACA-GATGCAACTCCTCCAA-TA-AC---TTTGAGCC-TAT-TCATAT-----------------GAAATGTTGTTGGTC--AG------CAATTACA---tcttgatttttt
gi|8 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgaacatgagcctaaagtcttggcattctgatttgTTTC--ATTGAGTA--ATGGCCAT------TAAGTTATTTT-AA-CTTA-A-TTTT------TAC-----ATCATAATNNNNNNNNNNNNNN------NN--------------NNN--N-NNNNN-NNNNNNNNNN-NN-NN---NNNNNNNN-NNN-NNNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGCACTAAG------TAGGTACA-----TA--TTCTGAA-CATGA-GTCTGTGG--TCTTGGCATTC----------------AA---T-T-----A-AT--GA-TT-TAGACAT----TTGA-CC--TCTTTTA-------T---AAAA--TTATA----TTC-T-TT-GAAACTATGC-ATTTCATCTTATAGATTAAGTATTGAGTAACAGCACTTTC---TACT----TTG-AATTTGCT---TATGAGAACAGGCTTTCAGGAA--GAACTGACCTTTATTTGTAAAGGGCAACTTAACTCAAAGGTCAAGGTCACT
gi|3 : tttcattttacatcacactttctgtagatttaggattccatttaaattattTTT--ATTGAGTT--ATGGCTCTTTGTTCT-------TTT-AA-CTTAGA-TTT--------A------AT-----------------TTC------A-----------------T--A----CT-NNNNNNNNNN-NN-NN---NNNNNNNN-NNN-NNNNNN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NN------NNNNNNNN---N-TC--T---GAC-TATTT-GCATG-GG--TATTGGAGTTTTG-ATTAAA------TTA---TGTTC--------------ATGTCTCT----TTG---C--TATTTAT-------T---AA------ACA----TTA-A-CT-GCAATTTTAC-ATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAATAGCAGCACTTAC---CATC----TTGAGATT-TCT---TATGAAGACAGGCTTTGAGGAA--ATGATGAATTTTA----------GCCAGTTAT-----AGGTCATGGTC---------A-----CAT-CCCCC--TCCG-----C-CTT----------TAAATTAA--T-TT-----TCTAACC---TTTTT-AC----AATAATGTTTTCT--T---A---A-TTCT-T--TTT--CTTA-TTGCAT-TTCTTATGT--TC--CA--ACAT-----ATCACCCC--A---G-----ACT--------------CCCCCCACACCCTGCCAA----GT---T--CCTGCTCATCT-GTTTCTTCACTTATTGT-TT-------AATCTTGGCCA-TTATTTTATTCCGACCAATGCATATC-CCCCAAG-AAGATT----------------TTT-----TTTAA-CATTACAATAT--TT-----TTTTCA---CATCCCAG--GC--A---TAAAA-TGCAG--------TA----T-------------TTCAGTACTCACACC-----CA-------------CAGGCAATGTTT--ATTGTA--CCCAGTCCATGGTCCTTATGAGTGGGGGATAT--GAAccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa
gi|20 : ctttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagattttta--ATGGAGTT--GTGGCCCTTT---GTCA-----TTT-AA-ACTT-A-TTTT------TAA-----AT-----------------TAC------ACTNNNNNNNNNNNNNNNN--N-NNNNN-NNNNNNNNNN-NN-NN---NNNNNNNN-NNN-NNNNNN-----------------GAAAC-TTGTTGTAC--AG------CAGGTAGATG-A-TC--T---GTA-CATGA-GCCTGTGG--TCTTGGTGTa
gi|15 : actcaatgtatggagtcatggcttcttgaatatgtgcctgttgtattggggttccaattatgttattgccT------CAC-----GT-----------------TTT------G---------------GTT--C--ATCA-ACTCTT-TCTACA-GT---TGTCACTT-GAT-TCAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGAAA--AG------TTTG--CT---G-TC--T---AAA-C-TGGTGCCTGTGG-----TGATATTATT--TTGAT------TAAT--T-TTTTTTG-ATGGAG-TAGTGGCCCT----TTGT-TC--TTTT
gi|27 : tatatttcttgtttttttgtcccctgcttttcaacaaaaatttggttttattaaaatggcaccgtccgtctgtctgtatgtctgtccaCTCCTCC-CACAT---TTTAACCC-AAT-TCAAAT-----------------TTAGC-CAACTGTAC--AG------CA-GTACATGGG-TC--T---GAA-TATGA-GGCCGTGG--TCTTGGTATTCCA-ATTaacttagatgatacttcatac
gi|12 : aAACCC-AGT-TCATAT-----------------TAAAC-TTCCTATAT--AG------CAAGGAAATG-G-TC--T---GAA-TGTGA-GCCT-TGGCATTTTAATG------ATT---------TTA---T-TTTTTTA-TT--AAGTTATGGCCCT----TTGG-TA--TTTATAT-------T---GCAA--TTATAATTATTC-A-TTTACAACTTTGC-ATTTTGACTTATA-----ACTATTGAGTATGAGAATTCAC---CATCA-ca
gi|22 : AT-TCAAAC-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AC------CAGGTACA---T-GACCT---AAA-CATGA-ACCTGTAA--TCTT--TG-TCCA-ATT---------TAA---T-TACTggaacctttaaaggccaattacctcagaggtcaaggtcattggggccacatacctccctctcagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcccattacaaaattgttttacatctactgcattataactgctgttccagtactcacatcca
gi|18 : atattgaccttcactttattcttcgcttttcgaagaaaagtttgatattttgaaatggcatctgcctttccatgtctttcaagttatggaccaacaacaatcaaAAC-----------------GAAAC-TTGCCGTAC--AGCAAGTCTAAGTGTG---G-TC--T---AAA-CATGT-GTCTGTGA--TCTTACCATTTCG-ATTAAA------ATA---T-GTTTTGATAG--AG-TTATTGCCC-----TTGT-TC---TTTTAA-------TTTCGAAT--TTAgagttgt
gi|4 : ccgaaggttgc-----------------GAAAA-TTGCTGAAC--AA------CGGGTACAT--GCTC--T---GAA-TATGA-ACCTGAAA--TATTGACATTAATGATTTAA------TTA---T-TTCTTAC-TG--AG-TTATGACCCTAAGATTGA-CT--TTTTAAA-------T---AAAG--TTACA----TTCTA-TT--TAACTTTAT-AAATCAGC------------TATTGAGTGACAACACCTAA---CATC----TTG-AATTTGCT---TATGAGGACAGTCCTTCAGAAA--GTAATGTGCTTTACTTGTAAAGGGTCACCTATCTCAAAGGTCAAAGTCACTTCGGT--------AA-CCGTA--CC---------TTT----------T------A--C-TT-----TT---------------C----TAGATT-TTTTCT--TAAAT---ACTTGTAT--TTC--C-TT-TTGCGA-TTATTATGT--TC--CA--CCAT-----A-----CC--A---TCCCCAACTCCGCCTACACCTTGCCC--------------A----GT---TTCCAT-----CCTGCTTTCTTCACTTATTAT-TT-------AACGTTCGCCaaacatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcgaaacttgctagtggtctgaatttgtgcctcaggtatt
gi|6 : ttactgtacatcaggtgcattctctgaacatgtacctgtggtattggccttcagattaaatcattttccaaagcgttctggttctttgttgttttacataattatacatcaaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AA------CAAGTACATG-G-TC--T---GAA-CATGT-GCCAGTGG--TATTGGCATTATG-ATTAAATTGTTGTTG---T-TTTTTAA-GG--AG-TTATGGCCCT----TTTATTC--TTTTT
gi|13 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-----------------GACAC-TTTATGTGC--AG------CAGGTACATG-A-TT--T---GAA-CATGA-GCCTAAAG--TCTTGGCATTCTG-ATTTGA------TGA------TATTAC-GG--AG-TTAT-GCTCT----TT-A-CT--TTTTTAAC------T---TAAATTTTACA----TCtcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|19 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-----------------GAAAC-TTTATGTGC--AG------CA-----G---G-TC--T---GAA--GTGAAGCCTGGGG--TCTTGGCATTC-------AA------T-G---T-TACT-----G--AG-TTACTGCCCT----TTAA-TA--CTTTTCA-------T---TAAA--TTACacacttttgaccaacactgttacagatgcaactcctccaataactttgagcctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|14 : tttaattgatccttactgagttatgacgtttttgttattgtaacttaatgtttataacacagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG------TATGTACATG-G-T---C---GAAGTATGT-GCCTGTGG--TATTGGCATTCCA-GTTAAA------TAATATT-TTATTGA-GT--AA-TT---GCTCT----TTGT-TT--TTTTTAA-------tttcttctgaga
gi|20 : tgct--T---GAA-TATGT-GCCTGTTG--TATTGGGGTTCCA-ATTATG------TTA---T-TGCC----ATGGAG-TTGTGGCCCT----TTG--TC--ATTTAAACTTATTTT---TAAA--TTACA----cttagattttggcataatttggaccaacagtcatgacactaccctcccactgtatttaccagattcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttaataaaattacatttgttgcatttttgcatttcagcctataaatattgagtatcttgatttttt
gi|28 : actcaatgtatggagtcatggcttct--AG-TTAAGGCCCT----TAAA-TC--TTTT-AA-------T---GAAA--TTACT----TTC-G-TTTGAAACTTTCC-ATTTCAGCCTATA-----ATTATTGAGTAACAGCATCctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgttgtacagcaggtagatgatctgtacatgagcctgtggtcttggtgt
gi|9 : actg-TTATGGCGCT----TTGA-TC--TTTTTAA-------T---GAAA--TAACA----TTC-ATTT-GTAACTTTGCAATA-CGGACTCTA-----TCTATTGAATAAAAGCACCTACATGTACAA-ACGTG-CATCTTCTTCATATGGGGACATG------GACA---T-ATGACATTCATTCGTTAAGGGCCAGTTAACCCAAAGTTGAAAGTCATT---GTTG-----------CCA--GCCC-----T-TGTCCAATAAAAAT------A--TATT-----TTG-TTCTCTCTTTT-TC----T-TAATACTCCCC--C---C---A-ACCT-TTATTT--CTTA-TT-CATCTTCAGCT-T--T---CA--TCAT-----A-----CT--C---TGCTAAATT--------------TCA--------------A----CTTGCT--CAT------CT-GTTTCTTTACTTCTTGT-TG-------AATC-TCACTT-TGA----ATT--------CC--TTTC-AACCCAC-A----TGATACTAAAATATTTATTT-----TTTCC-CACTACAAT-----G-----TTT--ATTTCATATCCTAAGC--ATAATAGAA-CACCA--------GGACACTCA-----------T-------------C-----TA-------------CAGGCAATTTCTA-TTTTTT--CTCAGctcc
gi|10 : gCA----TTC-A-TT-GTGATTTCGC-ATTTCAG--TCTA-----ACTAGTGAGTAACAGCACCTAC---------------CATT--TT---GA-------AATTTCTTGTAAA--GTAATGCCCTTTATTTGTTAGGGACCAATTACCTTAAAGGTCATGGTCACTTGGGTCA-----CAT-CCACA-----------T-TTTCAA-------T------A--T-GT-----TT--GTC---CTTTTAAC----TGTA-TATTTTTTAAT---T---A-TT-T-T--TTT--C-TA-TGGCAT-TTCTCATGT--TT--CA--CC-C-----A-----C------------------------------TCC--------------C----AC---A--CAC-----CC----TGCCAAACTTCCTG---------------CTCGTCTCTGC--TCGTC--------TG--TTTCTTAACTTT-AT---T----------------TTT-----TTTAA-CATTACAAT-A--TATTTTTTTT--A---CATCTCGT--GC--AT--TAAAA-TGCAGTTGCACACTG----C-------------C-------------CACATTCA-------------CAGACAATGTTT--ATTTTG--CTGCGTCCATGGCACTTATTAGCGCGGGATATTCAAATGTACTCAATTTTCTTGT-TTCt
gi|25 : TCATCCCATT-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CATCACGGTT----TTA-CT---TATGAAGACATGCCTTCAGGAAATATGAGGATCTTCAAAGGTAAATGGTCAg
gi|7 : gtggttCA-ATTTG-CATTTTCT---TATCAGGACATACTTTCAGGAA--GTAATTACATT-GTTTGTTAAGGACCAGTAATATAAAAGGCCAAGGCCAATTGGGCCA-----CATGCACCA-------------TTT----------T------G--T-TT-----T---GTA---C-TTC-AG----TGT-TTGTTTTA-----------A-TTAT-T--TCC--C-TA-TTGTAT-T----GTGTTCTGC-CAACCCATCTCTAA-----CTCCA---A-----ATT--------------TCC--------------ATCCGGC---T--CAT------CT-GTTTCTTAACTCATTGC-TTATTGATAAACCTTTGCCT-TGGTTTCATT--------T--------CATCCccaccctcatatatttaattttgtcactgtata
gi|16 : gtacatgttcttatcacgtgcatgtaaaattaactatttttttattttaatgccctttgtaattttaactttaatttgcgaacgcaaaccctcctacagataaaatcatgtcaaatgtcacttgttttgcagcagtacatggtctaaacataagaatgtagtatttgtgttccagctcaatgcgtaatgagttatggtcctttgatctcttgaatggaactacattctttgATGGAGACAGGTGTTTAGGAA--AGGATGACCTTTATATGTTAAGGGTCAGTTATGTAAAAGGTCAAGGTTGTCTGGGTCA-----C-T-CACTGGTCCCC-----C-CTT----------A------A--A-ATAAACAACAAATC-----TTT-GC----CTTATTTTTATCG--T---A---A-TTCT-T--TTC--C-TACTTGCA--TTCTTATAG--AA--CA--CCAT-----A-----C-------C-----ATT--------------CCC--------------G----AT---C--CAA-----CC-----------CCTACCATGTC-------AAATTTC-CAT-TGTGCCTATA--------TG--TTTC---TTCAC-A----TA---------------TTG-----TTTAcg
gi|11 : catATTACATTCATTTG--------CATTTGCGTCAAAGATCAATGTCATTTGGGTCA-----C-C-CTTCG--CCCTAAAAATACTT----------T-----------TT-----CTA---C---CTTTT-TT----TATATT----TCT--T---TATAA-TTCT-T--TTGAAC-CA--TGCAT-TCCT--TAT--TGTCTA--CCTT-----A-----CC--AACCT-----CTT--------------TCCCAACATT-------A----AA---T--CAT-----C-------CGTCACATA-TGT-TTC------AACC--CGCA--------TATT------------ACCC-CACCCACAA----TATATATATA-------TTTATAAATTTACAAATAGCAATA----T-----TTT--A---CATCTCGG--AC--AT--TATAG-AGC-G--------TGA---T-------------T-------------C-----CAGTATTTATATCACCGGGCAATGTTTA-TTTT----TTCAGTCCATGACCATTTTGAGTGGCGAATAT---AATTCata
gi|12 : ttaaggaaACCTTTA-------AAGGCCAATTACCTCAGAGGTCAAGGTCATTGGGGCCA-----CAT-ACCTC--CCTC-----T-Cccctcgctgaagttcttg
gi|12 : aacccagttcatattaaacttcctatatagcaaggaaatggtctgaatgtgagccttggcattttaatgattttatttttttattaagttatggccctttggtatttatattgcaattataattattcatttacaactttgcattttgacttataactattgagtatgagaattcaccatcaggaC-CATTACAA-AATTGT-----TTT--A---CATCTACT--GC--AT--TATAACTGC----------TG----T-------------T-------------C-----CA-------------agtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcccattacaaaattgttttacatctactgcattataactgctgttccagtactcacatcca
gi|2 : aacccagttcatattaaacttcctatatagcaaggaaatggtctgaatgtgagccttggcattttaatgattttatttttttattaagttatggccctttggtatttatattgcaattataattattcatttacaactttgcattttgacttataactattgagtatgagaattcaccatcaggaacctttaaaggccaattacctcagaggtcaaggtcattggggccacatacctccctctcagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatc---CGTCCCCT--CCCAAA--TATAA-TGCAG--------TG----T-------------T-------------C-----CAGTACCCACATCCGCAGGCTATGGTTAGTTGTGATCCTC---CCATTGTCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAATCCACTGGACTTTCTTGTgtactcacatcca
gi|24 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttcttttgttattttacgaaacaaacacttttcattcttcttctattgcatttctaatgttccaccttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccc--GC--AT--TATAA-TGCAC--------TG----TTCTAGTACCCACAT-------------C-----TA-------------CAGGC-ATGTCT--GTTCTA--CTCAGTCCATCGCCCTTTTCAGCATGGGTTAC--GAATTTACTGAATT-TCTTGTt
gi|30 : gcccggctgtaattatttttcagtactttgttttttcatctgg-------------T-------------C-----CA-------------AAGGCAATGTCT--ATTTTG--CTCAATCCATGG-CCGTATCAGCAGGAAATAT--GAATTCACTTAATTtt
gi|17 : ttacagtacccata-------------C-----TA-------------CAGGCAATGTCT--GTTTTG--CTCAGTCAGTGGCACTTTTGAGT-GCAGATAT--GAATTCACTGCATTtctt
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): TCTTTTATTCATATTGCATTTATTATGTTCCACCATACCATACCCAATTCGCCCACACCCTGCGAGATTTCCATCCTGATAATCTGTTTCATCCCTTATTGATTAATCTTTGTCTTGATTTCCATGCACATATTTCCCCTCCCACAAACTATGTTTAAACATTGCACTATTTTTTTCAAATTTTACGTCTCAGACATTATACTACACTATTCCTACACCCAC
Unaligned ( gi|23 ): CTTTGTTTTTTTTAATTAGATTTCACGTTGTATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAAAGAAACTTGCTGTGCAGTAAGTACCTGGTCTGATCCGATTAAAATGTTTTCGATAGATTTATGGTTCTTAGTTTTTTTTAAACTTAATATTTACGTCATAC
Unaligned ( gi|26 ): ATTCAGTTATGGCCCTTGGTTATTTAAACTTAATTTTTGCATTGCACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTTGCTGTACAGCAGGTGGGTCCTCTGT
Unaligned ( gi|29 ): TATGAAACCTGCTAAGTTTTGGCATTCTGAGTTAATGCTATTTATTGAGTTATGGCCTTTGTTCTAACTTATTTTACTTCACTCTCT
Unaligned ( gi|31 ): TTTTTTAAAACCCTCTTTTTTTAAAAAAAATTGGGGGGATATTGAAATGGCATCTGTCTGTTTGCACATCCGACTGTCACAT
Unaligned ( gi|32 ): TGGAGTTATGGCCCTTTGTTCTTATAACTTAGATTTGATCTCATATT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 2 1111 1111 111 4444444444 22222222 1 11111111111111111111111111111111111 222222222222222 8888888888888888888888888888888888888888888 1111 111 1111 1 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 111111111111111111 22222222222 22222222 222222 111111111111111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111 22222222 1111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 33333333333333333 1111 1111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22 11111 1 1
lowQualScore : 5 1 11 1 1 99 3 6666 9999 111 3333333333 6 00000000 0 2 00000000000000000000000000000000000 555555555555555 2 1 6666666666666666666666666666666666666666666 9999 3 3 222 1 2 55 2 4444 2 2 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 00 11111111 33 1 3 2 2 555555555555555555 1 22 333 3333 1 44 1 1 55 2 44 77777 4 555555 55 1 88888888888 3333 88 1 1 8888888 8888 33 5555 99 7 1 9999999 777 55555555 4 555 0 44 66 0 88888 0 0 0 222222 33 3 1 1 222222222222222 99999 3 11111111111111111111111111111111111111111111111111111 4 333 8888 55 4 777 99 2 666666666 4 1 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 444444 00000000 1 8888888 5 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 44444 1 5 66 33333333333333333 777 4444 4444444 4 4 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 3 1 0 66 44444 4 0
lowQualScore : . . .. . . .. . .... .... ... .......... . ........ . . ................................... ............... . . ........................................... .... . . ... . . .. . .... . . . ............................................................................................ .. ........ .. . . . . .................. . .. ... .... . .. . . .. . .. ..... . ...... .. . ........... .... .. . . ....... .... .. .... .. . . ....... ... ........ . ... . .. .. . ..... . . . ...... .. . . . ............... ..... . ..................................................... . ... .... .. . ... .. . ......... . . .......................................................................................... ...... ........ . ....... . . ...................................................................... ..... . . .. ................. ... .... ....... . . ............................................................... .. . . . .. ..... . .
lowQualScore : 0 0 00 8 0 22 0 7777 3333 777 3333333333 7 99999999 0 5 55555555555555555555555555555555555 888888888888888 3 4 9999999999999999999999999999999999999999999 5555 1 1 000 0 5 66 4 4444 4 4 5 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 88 44444444 66 9 9 5 5 666666666666666666 7 33 888 5555 7 11 7 4 55 2 44 00000 5 555555 66 9 44444444444 9999 99 4 9 1111111 4444 11 7777 22 3 8 6666666 000 44444444 5 888 2 66 99 2 00000 5 4 3 666666 66 3 8 0 888888888888888 11111 6 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 777 5555 66 0 000 55 4 000000000 0 0 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 000000 66666666 0 9999999 1 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333 4 0 99 00000000000000000 222 0000 4444444 4 4 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 33 7 0 2 99 33333 1 0
consensus : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA--TTNGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGAAACT---TG----------TACATGT-T----CTG-----GCG--C------TG----AA-A-------AATTAAC-GAT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CCTTT--G-TTTT-TT-T-AACTTAGATTT----T------T-----AC-----A------------T-----------------TNC--AC-----------------GTT--A-GAT-CNACTCTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG--TCT-GAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-C---GATTAAA------TTAT-TTNT-TAA--A--GAGTTATGGCCCT----TTGN-TCTTTTTA-A-------T---NAAA--TTACA----TTCG-TT-GCAACTTTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTTCT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AA-GGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATAT-TNTTT-TCTTAA----TTC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCAN-----A----TTC--------C--------------C--------------A----G---C------T--CAT-----CCTG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--A--CCCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CA--AT-------A-N---TT--TTT--ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTTTGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
Reference ( family-1759 ) : NNNNNTTTGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGACAGANA--TTTGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCTGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTC--------C----AAT--CTACA------ACTC-ATTCAAATGAAACT---TG----------TACATGT-C----CTG-----GCG--C------TA----AA-A-------AATTAAC-GAT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CCTTT--G-TCTN-TT-T-AACTTAGATTT----T------T-----AC-----A------------T-----------------TTT--AC-----------------GTT--A-GAT-CNACTCTCCTCC--CA----ATTTTAACCCGAT-T-CAAAC-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG--TCT-GAACATGA-GCCTGTGGTNTTGGCGTTC-C---GATTNAA------TNAT-TTCT-TNA--A--GAGTTATGGCCCT----TTGA-TCTTTTTA-A-------T---GAAA--TTACA----TTCG-TT-GCAACTTTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGNATTTTCT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AA-GGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATAT-TNTTT-TCTTNA----TTC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTNAT---------G-TTNCACCA---------TA-----CCAN-----A----TTC--------C--------------C--------------A----G---T------T--CAT-----CCTG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--A--CCCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CA--AT-------A-A---TT--TTT--ACATCTCNT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTANTTTTGCTCAGTCCATGGCCCTTNTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
gi|1 : TTGGTTATTA--TCCCGCGCTTCTCGA-AGACA--CTTGGGGGATATTATTTAAATGAT---GTCCGCCC-TCCGTCA-GTCCGTC-CATCCGACCCAATT-TGGATCAACAACTTTGCGGCGGC----AATTCCTACA------ACCCGATTCAAATGAAACT---TG----------TACATGT-T----CTGAA---GTG--T------TA----AA-A-------AATCAAC-GAT-T-TT---ATCGAGTTATGAC-CCTCC-----CTAATT-T-AATTTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------T-----------------TTT--AC-----------------GTT--A-GAT-TTACTCTTCTCT--CA----ATTTTAAGCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGTAT--GTACA-------G--TAT-GAACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGTTC-C---TATTAAA------TAAT-TTCT-TAA--A--TAATTATGGCCCT----TTGA-TCTTTTTA-A-------T---GAAA--TTACA----TCCA-TT-GCAATTGTGCATGTCAGCGTATA-----ACTATTGAGTAACAGCATCTAC---TA-CCAAA--TTGCATTATCT---GATGATGA--CAAGCCTTCAGAAA--GTGATGACCTTTATTTGTT-AA-GGG-TCAG-TTACCTCAAAAGTCATGGTCACTTGGGTTA-----CATCCCCA--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTTGA--GTCCGTTT-AC----TATAT-TGTTT-TCTTTA----TTC-T-TTT---TCTA--TTGCATTTCTGAT---------G-TTGCACCA---------TA-----CTAT-----A----TTT--------C--------------C--------------A----A---T------T--CAT-----CCTT--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTGCTT-TT------ATTTGTTTCC--A--TCCA---CA-----T----------------------------TTT-----TTTACCATAA-CA--AT-------A-A---GA--TTT--ACGTCTCTT--GCATTATA-------A-TG-CAA--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATTTTT-TTTTCACTCAGACCATGGCCCATTTGAGCGGCGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTACCTTGTATTC
gi|10 : aaattCA----TTCA-TT-GTGATTTCGCATTTCAGTCTA-------ACTAGTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TT-----TTGAAATTTCT---TGTAA------------------A--GTAATGCCCTTTATTTG-T-TA-GGGACCAA-TTACCTTAAAGGTCATGGTCACTTGGGTCA-----CATCCACA-----------T-TTTCAA------T---------AT-GTTT----GTCCTTTTAAC----TGTATATTTTT-TAATTA----TT--T-TTT---TCTA--TGGCATTTCTCAT---------G-TTTCACC--------------------C-----A----CTC--------C--------------C--------------A--------C------A--CAC-----CCTG-----------CCAAACTTCCTG--------------CTCGTC-TCT-GC-TC------GTCTGTTTCTTAA--CTT-----------T-AT-----------------T-------TTT-----TTTAACATTA-CA--AT-------ATATTTTT--TTT--ACATCTCGT--GCATTAAA-------A-TG-CAGTTGCACACTG-C-------------C-------------CACATTC-A-------------CAGACAATGTTTA-TTTTGCTGCGTCCATGGCACTTATTAGCGCGGGATATTCAAAT-----GTACTCAATTTTCTTGT-TTCa
gi|11 : TTAAGGAA-----ATTACATTCATTTG-----------CAT-TTGCGTCAAAGATCAATGTCATTTGGGTCA-----C-CCTTCG--CCCTAAAAATACTT---------T-------------TTC----TACCTTTT-TT----TATAT-TTCTT-TAT-AA----TTC-T-TTTGAACC-A--T-GCATTCCTTAT---------T-GTCTACCT---------TA-----CCAA-----CCTCTTTC--------C--------------C--------------A----A---CATTAAAT--CAT-----CC-G--------T-----CACATAT-GTTTC------AACC--CGC------ATATT------ACC-----CC--A--CCCA---CAATATAT-AT-----AT----------A-------TTTATAAATTTACAAATAGCA--AT-------A------T--TTT--ACATCTCGG--ACATTATA-------G-AG-C-G--------TGAT-------------T-------------C-----C-AGTATTTATATCACCGGGCAATGTTTATTTTT--TCAGTCCATGACCATTTTGAGTGGCGAATAT---AATTCCCCTCGCTGAA-GTTCTTGg
gi|12 : AACCCAGT-T-CATAT-----------------TAAAC-TTCCTATAT--AGCAA--GGAAA----T-GG--TCT-GAATGTGA-GCCT-------TGGCATTT-TAATGATT---------TTAT-TTTT-TTATTA---AGTTATGGCCCT----TTGG-TATTTATA-T-------T---GCAA--TTATAATTATTCA-TTTACAACTTTGCATTTTGACTTATA-------------------------------A-CT--A--TTGAGT---------ATGAGAATTCA--CCATCAGGAA---------CCTTTA--------A-AGG-CCAA-TTACCTCAGAGGTCAAGGTCATTGGGGCCA-----CATACC----TCCC-----T-CT
gi|12 : CCATTA-CA--A--------A-A---TTGTTTT--ACATCTACT--GCATTATA-------ACTG-C----------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------cagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcccattacaaaattgttttacatctactgcattataactgctgttccagtactcacatcca
gi|13 : aacccagttcatattaaacttcctatatagcaaggaaatggtctgaatgtgagccttggcattttaatgattttatttttttattaagttatggccctttggtatttatattgcaattataattattcatttacaactttgcattttgacttataactattgagtatgagaattcaccatcaggaacctttaaaggccaattacctcagaggtcaaggtcattggggccacatacctccctctcagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcTTGTTA--TTTCCCGCTTTTCAA-AGATA--TTGATGG-ATATTG---AAATGGC---GTTCGTCC---------GTCCGTC-CGTC--Agtactcacatcca
gi|13 : aacattgactgct-----------------GACAC-TTTATGTGC--AGCAG--GTACA----T-GA--TTT-GAACATGA-GCCTAAAGTCTTGGCATTC-T---GATTTGA------TGA---TAT-TAC--G--GAGTTAT-GCTCT----TT-A-CTTTTTTA-AC------T---TAAATTTTACA----Ttttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgaacatgagcctaaagtcttggcattctgatttgatgatattacggagttatgctctttacttttttaacttaaattttacatcacacttttgaccaacactgttacagatgcaactcctccaataactttgagcctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|13 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGAT-GAT-A-TT---ACGGAGTTATG-C-TCTTT--A-CTTT-TT-T-AACTTAAATTTTACAT------C-----AC-----A------------C-----------------TTTTGACCAACACT----------GTTACA-GATGCAA--CTCCTCCAATA----ACTTTGAGCCTAT-T-CATAT-----------------GAAATGTTGTTGGTC--AGCAA--TTACA----cacacttttgaccaacactgttacagatgcaactcctccaataactttgagcctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|14 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgaacatgagcctaaagtcttggcattctgatTGCTGTAT---------GTACA----T-GG--TCG-AAGTATGT-GCCTGTGGTATTGGCATTC-C---AGTTAAA------TAAT-ATTT-TAT--T--GAGTAATTGCTCT----TTGT-TTTTTTTA-A-------
gi|14 : G--T------TA----AA-T-------AAT------AT-T-TT---ATTGAGTAATTGC-TCTTT--GTTTTT-TT-T-AACTTAGATTT----T------G-----GC-----A------------TAA---------------TTTGGACCAACA------------GTC--ATGA---CACTACCCTCC--CACTGTATTT--ACCAGAT-T-CAANN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NN--NNN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N---NNNNNNN------NNNN-NNNN-NNN--N--NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNTTTTTA-A-------T---AAAA--TTACA----TTTG-TT-GCATTTTTGCATTTCAGCCTATA-----AATATTGAGTActtagattttggcataatttggaccaacagtcatgacactaccctcccactgtatttaccagattcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttaataaaattacatttgttgcatttttgcatttcagcctataaatattgagtatcttgatttttt
gi|15 : tgctgtatgtacatggtcgaagtatgtgcctgtggtattggcattccaTTTTTG--TCCCCTGCTTTTCAACAAAAA--TTTGG----TTTTATTAAAATGGCACCGTCCGTCTGTCTG-TATGTCTGTC-CATC--ACGT--TT-TGGTTCATCAACTC--------T-----TT--CTACAGTTGTCACTTGATTCAAATGAAACT---TGCTGAAAAGTTTGC-TGT-CTAAACTG-----GTG--CCTGTGGTG----AT-ATTATTTTGATTAAT-TTT-T-TTTG-ATGGAGTAGTGGC-CCTTT--G-TTCT-TT-T-AACTTAGATtcttgatttttt
gi|16 : tatatttcttgtt---TATGGAGA--CAGGTGTTTAGGAA--AGGATGACCTTTATATG-TTAA-GGG-TCAG-TTATGTAAAAGGTCAAGGTTGTCTGGGTCA-----C-TCACTGGTCCCC-----C-CTTAAAA-----TAAACAACAAAT-CTTT----G-CCT------------TAT-TTTTA-TCGTAA----TTC-T-TTT---CCTAC-TTGCA-TTCTTAT---------A-GAACACCA---------TA-----CC-------A----TTC--------C--------------C--------------G----A---T------C--CAA-----CCgatacttcatac
gi|16 : caTG--------TTTCTTCACATATTGTTT-------AAcctaccatgtcaaatttccattgtgcctatatgtttcttcacatattgtttaata
gi|17 : catatggagacaggtgtttaggaaaggatgacctttatatgttaagggtcagttatgtaaaaggtcaaggttgtctgggtcactcactggtccccccttaaaataaacaacaaatctttgccttatttttatcgtaattcttttcctacttgcattcttatagaacaccataccattcccgatccaacccctaccatgtcaaatttccattgtgcctata-------------C-----T-A-------------CAGGCAATGTCT-GTTTTGCTCAGTCAGTGGCACTTTTGAGT-GCAGATAT--GAAT-----TCACTGCATTTta
gi|18 : tgtagcatattctcattctggacctttcttccaccccccccccccccccatctcatgtgaaattgccattctgcttatctgtttcttcaccatttgatgacaataccattttccattttttatgtcctatgtcccagcaagtatgctgtttcagtacccacacAAC-----------------GAAAC-TTGCCGTAC--AGCAA--GTCTAAGTGT-GG--TCT-AAACATGT-GTCTGTGATCTTACCATTT-C---GATTAAA------ATAT-GTTT-TGAT-A--GAGTTATTGCCC-----TTGT-TC-TTTTA-A-------TTTCGAAT--TTAcatgt
gi|19 : ccgaaggttgcTTAATTGAT-CCTT---ACTGAGTTATGACGTTTTT--G-T-TA-TTGT-AACTTA-ATGT----T------TATAACAC-----AGTNNNNNNNNNNN-----------------NNN--NN-----------------NNN--N-NNN-NNNNNNNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTTATGTGC--AGCAG--GT--------------CT-GAA-GTGAAGCCTGGGGTCTTGGC----------ATTCAA------TG-T-TACT---------GAGTTACTGCCCT----TTAA-TACTTTTC-A-------T---TAAA--TTACT----TTCaaacatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcgaaacttgctagtggtctgaatttgtgcctcaggtatt
gi|2 : t-TAGACAAACAACTT--------CCAACAAT--CTA--------ACTCTATTCAAAT--AATT---TG----------AATATGTGC----CTGC----GCG--C------TATTGGAATA-------AATTAT----T-T-TT---ATAGAGCAATGAC-ACTTT--G--CTA-TT-C-AAACTAAGTTT----T------T-----AC-----A------------T-----------------TAA--AC-----------------GNN--N-NNN-NNNNNNNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAC-ATGCTGTAC--AA-AG--GTACA----T-GA--TCT-GAATATTA-GCCTATAGCATTGGTGCTT-C---AATTCCA------TAAT-CTGT-TAC--A--GAAGTATGGCTTT----TTGA-TCTTATAA-G-------T---GAAA--TTACA----TTTA-TT-ACATTTTTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAACAACAGCATCTAC---CA--T--A--TTG-ATTTTTT---TATGAGGA--CAGACCTTCTGGAA--GTGGTG-----TATT---------GG-CCAG-TTACCTAAGAGATCAATGTCACATAGGTCAACTCCCCCCCCCC--CCCC-----T-CTT---------C---------AA-TTTCTTTTGTTATTTT-ACGAAACAAAC-ACTTT-TC---A----TTC-T-TCT---TCTA--TTGCATTTCTAAT---------G-TTCCACCttctgaga
gi|2 : CACCTTC---CATCC--A--C--AATGTTTT---TCCGAGGA--CAGGCCTCCAGGAT--GTGATGACCTTGATTTGTT-AA-GGG--CAGCTTACTTT--AGATCAACGTCACTTAAGTCA-----CATCCCCGT-CCCC-----T-Cttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|2 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttcttttgttattttacgaaacaaacacttttcattcttcttctattgcatttctaatgttcTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-AGTACCCACATCCGCAGGCTATGGTTAGTTGTGATCCTCCCATTGTCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----CCACTGGACTTTCTTGT-ccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|20 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttcttttgttattttacgaaacaaacacttttcattcttcttctattgcatttctaatgttccaccttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaaCA----T-GGCTTCTTGAATATGT-GCCTGTTGTATTGGGGTTC-C---AATTATG------TTAT-TGCCATG------GAGTTGTGGCCCT----TTG--TCATTTAA-ACTTATTTT---TAAA--TTACA----CT
gi|20 : actcaatgtatggagt---ATGGAGTTGTGGC-CCTTT--G-TCAT-TT-A-AACTTA--TTT----T------T-----AA-----A------------T-----------------TAC--ACTNNNNNNNNNNNNN---NNN--N-NNN-NNNNNNNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGTTGTAC--AGCAG--GTAGA----T-GA--TCT-GTACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgttgtacagcaggtagatgatctgtacatgagcctgtggtcttggtgt
gi|21 : actcaatgtatggagtcatggcttcttgaatatgtgcctgttgtattggggttccaattatgttattgcc----TTT-T-ATT---CATA--TTGCATTTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATACCCAA----TTCGCCCACACC--------------CTGCG----------A----GATTT------C--CAT-----CCTGATAATCTGTTTCATCCCTTATTGATT-------AATCTTTGTC-TTG-AT-TTCCATGCACATATTTCC--CCTCCCA---CA-----A-AC-----T-----------A-------TGT-----TTAAACATTG-CACTATTTTTTTCA-A---AT--TTT--ACGTCTCAG--ACATTATA-------C-TA-CAC--------TA-T-------------T-------------C-----CTA-------------CA
gi|22 : tcTTA--TTCTTCGCTTTTCGA-AGAAAAGTTTG----ATATT-TTGAAATGGC---ATCTGCCT-TTC--CA----TGTC-TTTC--A---AGTTATGGACCAACAA-----------C----AAT-----CA------A----ATTCAAACGAAACTTGCTG----------TACAcccac
gi|22 : atattgaccttcactAATCAAAT-T-CAAAC-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--ACCAG--GTACA----T-GA--CCT-AAACATGA-ACCTGTAATCTTTG---TC-C---AATTTAA------TTAC-Tccaggtacatgacctaaacatgaacctgtaatctttgtccaatttaattactgagttgt
gi|23 : atattgaccttcactttattcttcgcttttcgaagaaaagtttgatattttgaaatggcatctgcctttccatgtctttcaagttatggaccaacaacCTTT--G-TTTT-TT-T-TAATTAGATTTCACGT------T-----GT-----A------------T-----------------TNN--NN-----------------NNN--N-NNN-NNNNNNNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-NNCAAAA-----------------GAAAC-TTGCTGTGC--AGTAA--GTACC----T-GG--TCT-GA------------------------TC-C---GATTAAA------ATGT-TT-T-CGAT-A--GATTTATGGTTCT----TAGT-TTTTTTTA-A-------gagttgt
gi|24 : -----T-GT-----A-----------A-------TTA-----TTTTTCAGTA-CT--TT-------G-T---TT--TTT---CATCTGG---GCATTATA-------A-TG-CAC--------TG-TTCTAGTACCCACAT-------------C-----T-A-------------CAGGC-ATGTCT-GTTCTACTCAGTCCATCGCCCTTTTCAGCATGGGTTAC--GAAT-----TTACTGAA-TTTCTTGT-TTacttaatatttacgtcatac
gi|25 : gcccggcTTTCATCCCATT-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TC--A--CGGT-TTTACT---TATGAAGA--CATGCCTTCAGGAAATATGAGGATCTTCA
gi|26 : gtgg---ATTCAGTTATGGC-CCTTG--G-T-TA-TT-TAAACTTA-ATTT----T------T-----GC-----A------------T-----------------TGC--ACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--N-NNN-NNNNNNNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTaaggtaaatggtcaccaccctcatatatttaattttgtcactgtata
gi|27 : CTCCTCC--CAC---ATTTTAACCCAAT-T-CAAAT-----------------TTAGC-CAACTGTAC--AGCA---GTACA----TGGG--TCT-GAATATGA-GGCCGTGGTCTTGGTATTC-C---AATTCAgggtcctctgt
gi|28 : a--GAGTTAAGGCCCT----TAAA-TCTTTT-A-A-------T---GAAA--TTACT----TTCG-TTTGAAACTTTCCATTTCAGCCTATA-----ATTATTGAGTAACAGCATC
gi|29 : actATGAAACC---TG----------C-TAAGT-T----TTG-----GCATTC------TG----AG-----------TTAAT-GCTAT-TT---ATTGAGTTATGG--CCTTT--G-T----TC-T-AACTTA---TT----T------T-----AC------------------------------------TTC--AC-----------------ctcc
gi|3 : tC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG--TCT-GAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-T---GA-TAGA------TT-T-TTAT-TTAT-T--GAGTTATGGCTCT----TTGT-TCTTTTAA-C-------T---TAGA--TTtctct
gi|3 : -T-TT---ATTGAGTTATGGC-TCTTT--G-TTCT-TT-T-AACTTAGATTT-----------------A------A------------T-----------------TTC--A------------------------------TACTNNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NNN-TCT-GACTATTT-GCATG-GGTATTGGAGTTT-T---GATTAAA------TTATGTTC---------------ATGTCTCT----TTG---CTATTTA-T-------T---AAA------CA----TTAA-CT-GCAATTTTACATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAATAGCAGCACTTAC---CA-TC-----TTGAGATTTCT---TATGAAGA--CAGGCTTTGAGGAA--ATGATGAATTTTA------------G-CCAG-TTAT-----------AGGTCAT---GGTCA-----CATCCCCC--TCCG-----C-CTT---------TAAATTA---AT-TTTCTA--ACCTTTTT-AC----AATAA-TGTTT-TCTTAA----TTCTT-TTT---CTTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCAACA---------TATCACCCCAG-----A----CTC--------C--------------CCCCACACCCTGCCAA----G---T------T--CCTGCTCATCTG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AATCTTGGCCATTA-TT-TT------A-----TTCC--G--ACCAATGCA-----T-ATCCCCCA-----------AGAAGATTTTT-----TTTAACATTA-CA--AT-------A-T---TT--TTTTCACATCCCAG--GCA-TAAA-------A-TG-CAG--------TA-T-------------TTCAGTACTCACACC-----C-A-------------CAGGCAATGTTTA-TTGTACCCAGTCCATGGTCCTTATGAGTGGGGGATAT--GAAtaatttcatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctgactatttgcatgggtattggagttttgattaaattatgttcatgtctctttgctatttattaaacattaactgcaattttacatttcagcctataactattgaatagcagcacttaccatcttgagatttcttatgaagacaggctttgaggaaatgatgaattttagccagttataggtcatggtcacatccccctccgcctttaaattaattttctaacctttttacaataatgttttcttaattctttttcttattgcatttcttatgttccaacatatcaccccagactccccccacaccctgccaagttcctgctcatctgtttcttcacttattgtttaatcttggccattattttattccgaccaatgcatatcccccaagaagattttttttaacattacaatatttttttcacatcccaggcataaaatgcagtatttcagtactcacacccacaggcaatgtttattgtacccagtccatggtccttatgagtgggggatatgaaa
gi|30 : ctttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagattttta-------------T-------------C-----C-A-------------AAGGCAATGTCTA-TTTTGCTCAATCCATGGCCGT-ATCAGCAGGAAATAT--GAAT-----TCACTTAA-TTTCTTa
gi|31 : ttacagtacccataCCCTCTTTTTTTAAAAAAAA--TTGGGGGGATATTG---AAATGGC---ATCTGTCTGTTTG-CACATCCGAC-TGTC--ACAT
gi|32 : ttttttaaaaTGGAGTTATGGC-CCTTT--G-TTCT-TA-T-AACTTAGATTT----
gi|4 : -TTACTGTAC--ATCAG--GTGCA----T-TC--TCT-GAACATGT-ACCTGTGGTATTGGCCTTC-A---GATTAAA------TCAT-TTTC-CAA--A--GCGTTCTGGTTCT----TTG--TTGTTTTACA-------T-----AA--TTATA----gatctcatatt
gi|4 : -----------------GAAAA-TTGCTGAAC--AACGG--GTACA----T-GC--TCT-GAATATGA-ACCTGAAATATTGACATTAAT---GATTTAA------TTAT-TTCT-TAC--T--GAGTTATGACCCTAAGATTGA-CTTTTTAA-A-------T---AAAG--TTACA----TTCT-AT-TTAACTTTATAAATCAGC------------TATTGAGTGACAACACCTAA---CA-TC-----TTGAATTTGCT---TATGAGGA--CAGTCCTTCAGAAA--GTAATGTGCTTTACTTG-T-AAAGGG-TCAC-CTATCTCAAAGGTCAAAGTCACTTCGGTAA-----C-----CG--TACC-----T--TT---------T---------A-------------CTTTT--C----TAGAT-T-TTT-TCTTAAATACTTG-TATTT---CCTT--TTGCGATTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATCCCCAA----CTC--------CGCCTACACCTTGCCC--------------A----G---T------TTCCAT-----CCTGC-------TTTCTTCACTTATTATTT-------AACGTTCGCC-catcaaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaattgctgaacaacgggtacatgctctgaatatgaacctgaaatattgacattaatgatttaattatttcttactgagttatgaccctaagattgactttttaaataaagttacattctatttaactttataaatcagctattgagtgacaacacctaacatcttgaatttgcttatgaggacagtccttcagaaagtaatgtgctttacttgtaaagggtcacctatctcaaaggtcaaagtcacttcggtaaccgtaccttttacttttctagattttttcttaaatacttgtatttccttttgcgattattatgttccaccataccatccccaactccgcctacaccttgcccagtttccatcctgctttcttcacttattatttaacgttcgcc
gi|5 : ttactgtacatcaggtgcattctctgaacatgtacctgtggtattggccttcagattaaatcattttccaaagcgttctggttctttgttgttttacataattatacatcaaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGAAACT----G----------TGCCTGT--------G-----GTC--T------TA----AC-ATTCT---AGTTAAT-GAC-T-TTTG-ATGGAGTTATAGC-CCTTT--G-TTCT-TT-T-AACTTAGATTT----TATGTGAT-----ACTNNNNN------------N-----------------NNN--NN-----------------NNN--N-NNN-NNNNNNNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAT--AGCAA--GTACA----T-GG--TTG-GAATATGT-GCCTGTAGTATTAGAGTT--------TTGCC------TAAC-TTTT-TCG--ATGGAGTTATGACCCT----TTGT-TCTTTTAA-C-------T---TAGA--TT
gi|5 : gtcTAAC---T-T-TTTCGATGGAGTTATGAC-CCTTT--G-TTCT-TT-T-AACTTAGATTT----TAAGTGAT-----ACTNNN-N------------N-----------------NNN--NN-----------------NNN--N-NNN-NNNNNNNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-ATGCTGTAT--AGCATATGTATA----T-GG--TCA-GAATACGT-GCCTGTGATATTAGAGTTT-T---GACTAAC------TT-T-TTGA-TGA--A--GA--TATGGCCCT----TTGT-TC-TTTTA-A-------T---ttaagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtatagcatatgtatatggtcagaatacgtgcctgtgatattagagttttgactaactttttgatgaagatatggccctttgttcttttaatttagattttagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : gtctgaaactgtgcctgtggtcttaacattctagttaatgacttttgatggagttatagccctttgttcttttaacttagattttatgtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtatagcaagtacatggttggaatatgtgcctgtagtattagagttttgccTTCTTACATACCCCTCTTTTCGATAAATA--TTGGGGG-ATA---TTGAAATGGC---ATCTGTCT----G-CA-GTCTGTCACGTT--Attagattttagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : ataaatttacgttgtat-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AACAA--GTACA----T-GG--TCT-GAACATGT-GCCAGTGGTATTGGCATTA-T---GATTAAATTGTTGTTGT-TTTT-TAA--G--GAGTTATGGCCCT----TTTATTCTTTTTttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|6 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-T-TT---AAGGAGTTATGGC-CCTTTTAT-TCTT-TT-T--TCCTAGA-TT----T------T-----AC-----T------------T-----------------CAT--AC-----------------ATT--A-tcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|6 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttAAT-----------------GTAAC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG--TCT-GAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-T---GA-TAGA------TT-T-TTAT-TTAT-T--GAGTTATGGCTCT----TTGT-TCTTTTAA-C-------T---TAGA--TTctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|7 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcG----------TACATGT-T----CTTATCACGTG--CA-----TG----TA-A-------AATTAAC-TAT-T-TT---TTTATTTTAATGC-CCTTT--G-TAAT-TT-T-AACTTTAATTT-----------------GCG----A-----------------------------------AC-----------------GCA--A-------ACCCTCCTAC--AG----ATA--AAATC-ATGT-CAAAT-----------------GTCAC-TTGTTTTGC--AGCAG---TACA----T-GG--TCT-AAACATAA-GAATGTAGTATTTGTGTTC-C---AGCTCAA------TG-----CG-TAA--T--GAGTTATGGTCCT----TTGA-TCTCTTGA-A-------T---GGAA--CTACA----TTCT-TT-GCAA-TTTGCATTTtaat
gi|7 : --TTGCATTTTCT---TATCAGGA--CATACTTTCAGGAA--GTAATTACA-TTGTTTGTT-AA-GGA-CCAG-TAATATAAAAGGCCAAGGCCAATTGGGCCA-----CAT----G--CACC-----A-TTT---------T---------GT-TTT-----GTACTT-----------CAG-TGTTTGTTTTAA----TTA-T-TTC---CCTA--TTGTATT----GT---------G-TTCTGCCAACCCATCTCTAACT--CCAA-----A----TTT--------C--------------C--------------ATCCGG---C------T--CAT------CTG--------TTTCTTAACTCATTGCTTATTGATAAACCTTTGCC-TTG-GT-TTC-----ATTTtcttatcaggacatactttcaggaagtaattacattgtttgttaaggaccagtaatataaaaggccaaggccaattgggccacatgcaccattttgttttgtacttcagtgtttgttttaattatttccctattgtattgtgttctgccaacccatctctaactccaaatttccatccggctcatctgtttcttaactcattgcttattgataaacctttgccttggtttcatttcatcccg
gi|8 : gtacatgttcttatcacgtgcatgtaaaattaactatttttttattttaatgccctttgtaattttaactttaatttgcgaacgcaaaccctcctacagataaaatcatgtcaaatgtcacttgttttgcagcagtacatggtctaaacataagaatgtagtatttgtgttccagctcaatgcgtaatgagttatggtcctttgatctcttgaatggaactacattctttgcaat-A-------AATTATT---T-T-TC---ATTGAGTAATGGC-CATTAA-G-TTAT-TT-T-AACTTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------TCATAATNNNNNNNNNNNNNN--NN-----------------NNN--N-NNN-NNNNNNNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGCACTAAGTAG--GTACA----T-AT--TCT-GAACATGA-GTCTGTGGTCTTGGCATTC-----AATT-AA------TGAT-TT--------A--GA--------CAT----TTGA-CCTCTTTT-A-------T---AAAA--TTATA----TTCT-TT-GAAACTATGCATTTCATCTTATAGATTAAGTATTGAGTAACAGCACTTTC---TA-CT-----TTGAATTTGCT---TATGAGAA--CAGGCTTTCAGGAA--GAACTGACCTTTATTTG-TAAA-GGG-CAAC-TTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTcatcccg
gi|9 : tttcattttacatcacactttctgtagatttaggattccatttGTTATGGCGCT----TTGA-TCTTTTTA-A-------T---GAAA--TAACA----TTCATTT-GTAACTTTGCAATACGGACTCTA-----TCTATTGAATAAAAGCACCTACATGTA-CA--AACGTGCATCTTCTTCATATGGGGA--CA----T---GGAC--AT-ATGACATTCATTCGTT-AA-GGG-CCAG-TTAACCCAAAGTTGAAAGTCATT---GT---------TGCCAG--CCCT-----T-GTCCAATAAAAAT---------ATATTTT----GTTCTCT---C----T-------TTT-TCTTAA----TAC-T-CCC---CCCAACCTTTATTTCTTATTCATCTTCAGCTTTCATCA---------TACTCTGCTAA-----A----TTT--------C--------------A--------------ACTT-G---C------T--CAT------CTG--------TTTCTTTACTTCTTGTTG-------AATC-TCACT-TTG-A----------ATTCCTTTCA--A--CCCA---CA-----TGAT-----ACTAAAATATTTA-------TTT-----TTTCCCACTA-CA--AT-------G-T---TT--ATT--TCATATCCTAAGCATAATAGAACACCA-GGACAC--------TC-A-------------T-------------C-----T-A-------------CAGGCAATTTCTATTTTTTCTCAGTccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 11 1111 111 4444444444 22222222 1 888888888888888888888888888888 111 99999999999999999999999999999999999999999999999999 1111 111 11 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 11111111111111111 22222222222222222222 22222222 2222 111111111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222222 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 333333333333333 1111 1111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111 1 1
lowQualScore : 1 11 1 3 1 55 2222 6 9999 111 3333333333 6 00000000 0 2 111111111111111111111111111111 6666 444 999 1 77777777777777777777777777777777777777777777777777 8888 3 3 222 1 2 2 2 00 9 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111111 33 1 3 2 2 33333333333333333 1 22 333 3333 1 44 1 2 33 1 44 66 0 00000000000000000000 1 1 3333 2 9999999999999 1 22 5555 99 7 1 99999 777 88888888 6 3 555 0 44 66 0 88888 0 0 0 0 5555 33 3 1 1 222222222222222 99999 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 0 8888 55 4 4 777 99 666666666 4 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 00000000 9999 777 2 4 5 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 44444 1 5 888888888888888 777 6666 4444444 4 4 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 4 3 2 0 66 44444 4 0
lowQualScore : . .. . . . .. .... . .... ... .......... . ........ . . .............................. .... ... ... . .................................................. .... . . ... . . . . .. . ........................................................................................................... ........ .. . . . . ................. . .. ... .... . .. . . .. . .. .. . .................... . . .... . ............. . .. .... .. . . ..... ... ........ . . ... . .. .. . ..... . . . . .... .. . . . ............... ..... . .................................................... . . .... .. . . ... .. ......... . ....................................................................................... . ........ .... ... . . . . ...................................................................... ..... . . ............... ... .... ....... . . ............................................................... . . . . . .. ..... . .
lowQualScore : 0 00 4 3 0 88 8888 7 3333 777 3333333333 7 99999999 0 5 222222222222222222222222222222 0000 000 555 4 22222222222222222222222222222222222222222222222222 2222 1 1 000 0 5 4 4 88 5 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 44444444 66 0 9 5 5 33333333333333333 7 33 888 5555 7 00 7 0 22 4 11 33 5 66666666666666666666 7 7 7777 7 6666666666666 0 88 7777 22 3 8 11111 000 88888888 5 6 888 2 66 99 2 00000 5 1 4 3 6666 66 3 8 0 888888888888888 11111 6 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 1 5555 55 0 0 000 55 000000000 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 66666666 4444 888 2 4 1 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333 4 0 555555555555555 222 4444 4444444 4 4 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 4 7 5 2 99 33333 1 0
consensus : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA--TTGGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGAAACT---TGT--ACATGT-T-----------CTGA----GCG--C------T----GAA-A-------AATTAAC-GAT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CC-TTT-GTT-NTTTTAACTTAGATTT----T------T-----AC-----A------------TTNC--A-----------------C-----------------GTNA-GACC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG--TCT-GAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------TTATTTNTTAN--NGAGTT-ATGGCCC-T----TTGNTCTTTT---NAA-------TNAAA--TTACA----TTCG-TT-GCAACTTTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA-----N-----A----TT---C--------------CCAC-C--------------GC-------T--CATCCTG--------TTTCTT----CA---CTTATTGTTT-AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--A--CCCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT---------TTTT--ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
Reference ( family-1759 ) : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA--TTNGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGAAACT---TGT--ACATGT-T-----------CTG-----GCG--C------T----GAA-A-------AATTAAC-GAT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CC-TTT-GTT-TTTTTAACTTAGATTT----T------T-----AC-----A------------TTNC--A-----------------C-----------------GTTA-GATC--NACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG--TCT-GAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------TTATTTNTTAA--AGAGTT-ATGGCCC-T----TTGNTCTTTT---TAA-------TNAAA--TTACA----TTCG-TT-GCAACTTTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA-----N-----A----TT---C--------------CCA-----------------GC-------T--CATCCTG--------TTTCTT----CA---CTTATTGTTT-AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--A--CCCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----NT---------TTTT--ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
gi|1 : TTGGTTATTA--TCCCGCGCTTCTCGA-AGACAC-TTGGGGG-ATATTATTTAAATGAT---GTCCGCCC-TCCGTCA-GTCCGTC-CATCCGACCCAATT-TGGATCAACAACTTTGCGGCGGC----AATTCCTACA------ACCCGATTCAAATGAAACT---TGT--ACATGT-T-----------CTGAA---GTG--T------T----AAA-A-------AATCAAC-GAT-T-TT---ATCGAGTTATGAC-CC-TCC--CT-AATTTAATTTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------TTTT--A-----------------C-----------------GTTA-GATT--TACT-------------CTTCTCT--CA----ATTTTAAGCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGTAT--GTACA-------G--TAT-GAACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGTTC-CTATTAAA------TAATTTCTTAA--ATAATT-ATGGCCC-T----TTGATCTTTT---TAA-------TGAAA--TTACA----TCCA-TT-GCAATTGTGCATGTCAGCGTATA-----ACTATTGAGTAACAGCATCTAC---TA-CCAAA--TTGCATTAT-CT---GATGATGA--CAAGCCTTCAGAAA--GTGATGACCTTTATTTGTT-AAGGG-TCAG-TTACCTCAAAAGTCATGGTCACTTGGGTTA-----CATCCCCA--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTTGA--GTCCGTTT-AC----TATATTGTTT-TCTTTA----T--TC-T-TTT---TCTA--TTGCATTTCTGAT---------G-TTGCACCA---------TA-----CTA-----T-----A----TT---T--------------CCA-----------------AT-------T--CATCCTT--------TTTCTT----CA---CTTATTGTTT-AACCTTCGCC-TTGCTT-TT------ATTTGTTTCC--A--TCCA---CA-----T----------------------------TTT-----TTTACCATAA-CAATA----AG---------ATTT--ACGTCTCTT--GCATTATA-------A-TG-CAA--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATTTTTT-TTT-CACTCAGACCATGGCCCATTTGAGCGGCGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTACCTTGTATTC
gi|10 : aaattCA----TTCA-TT-GTGATTTCGCATTTCAGTCTA-------ACTAGTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TT-----TTGAAATTT-CT---TGTAA------------------A--GTAATGCCCTTTATTTG-T-TAGGGACCAA-TTACCTTAAAGGTCATGGTCACTTGGGTCA-----CATCCACA-----------T-TTTCAA------T---------AT-GTTT----GTCCTTTTAAC----TGTA-TATTT-T-TTAA----TTATT-T-TTT---TCTA--TGGCATTTCTCAT---------G-TTTCACC-------------------------C-----A----CT---C--------------CCA------------------C-------A--CACCCTG-----------CCA----AA---CTTCCTG--------CTCGTC-TCT-GC-TC------GTCTGTTTCTTAA--CTT-----------T-AT-----------------T-------TTT-----TTTAACATTA-CAATATATTTT---------TTTT--ACATCTCGT--GCATTAAA-------A-TG-CAGTTGCACACTG-C-------------C-------------CACATTC-A-------------CAGACAATGTTTA-TTT-TGCTGCGTCCATGGCACTTATTAGCGCGGGATATTCAAAT-----GTACTCAATTTTCTTGT-TTCa
gi|11 : TTAAGGAA-----ATTACATTCATTTG----------CAT-TTGCGTCAAAGATCAATGTCATTTGGGTCA-----C-CCTTCG--CCCTAAAAATACTT---------T-------------TTC----TACCTTTT-TT----TATATTTCTT-TAT-AA----T--TC-T-TTTGAACC-A--T-GCATTCCTTAT---------T-GTCTACCT---------TA-----CCA-----A-----CCTCTTT---C--------------CCA-----------------ACATTAAA-T--CATCC-G--------T---------CA---CATAT-GTTTCAACC--CGC------ATATT------ACC-----CC--A--CCCA---CAATATAT-AT-----AT----------A-------TTTATAAATTTACAAATAGCAATA---------------TTTT--ACATCTCGG--ACATTATA-------G-AG-C-G--------TGAT-------------T-------------C-----C-AGTATTTATATCACCGGGCAATGTTTA-TTT-T-TTCAGTCCATGACCATTTTGAGTGGCGAATAT---AATTCCCCTCGCTGAA-GTTCTTGg
gi|12 : AACCCAGT-T-CATAT-----------------TAAAC-TTCCTATAT--AGCAA--GGAAA----T-GG--TCT-GAATGTGA-GCCT-TGGCATT----TTAATGATT---------TTATTTTTTTATTA-AGTT-ATGGCCC-T----TTGGTATTTA---TAT-------TGCAA--TTATAATTATTCA-TTTACAACTTTGCATTTTGACTTATA-----ACT-----------------------------A--TTGAGT----------ATGAGAATTCA--CCATCAGGAA---------CCTTTA--------AAGG-CCAA-TTACCTCAGAGGTCAAGGTCATTGGGGCCA-----CATACC----TCCC-----T-CT
gi|12 : CCATTA-CAAAA----TTG--------TTTT--ACATCTACT--GCATTATA-------ACTG-C----------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------cagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcccattacaaaattgttttacatctactgcattataactgctgttccagtactcacatcca
gi|13 : aacccagttcatattaaacttcctatatagcaaggaaatggtctgaatgtgagccttggcattttaatgattttatttttttattaagttatggccctttggtatttatattgcaattataattattcatttacaactttgcattttgacttataactattgagtatgagaattcaccatcaggaacctttaaaggccaattacctcagaggtcaaggtcattggggccacatacctccctctcagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcTTGTTA--TTTCCCGCTTTTCAA-AGATA--TTGATGG-ATA---TTGAAATGGC---GTTCGTCC---------GTCCGTC-CGTC--Agtactcacatcca
gi|13 : aacattgactgct-----------------GACAC-TTTATGTGC--AGCAG--GTACA----T-GA--TTT-GAACATGA-GCCTAAAGTCTTGGCATTC-TGATTTGA------TGA--TATTAC--GGAGTT-AT-GCTC-T----TTACT-TTTT---TAAC------TTAAATTTTACA----Ttttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgaacatgagcctaaagtcttggcattctgatttgatgatattacggagttatgctctttacttttttaacttaaattttacatcacacttttgaccaacactgttacagatgcaactcctccaataactttgagcctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|13 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGAT-GAT-A-TT---ACGGAGTTATG-C-TC-TTT-ACT-TTTTTAACTTAAA-TT----T------T-----AC-----A------------TCAC--A-----------------C-----------------TTTT-GACCAACACTGTTACAGATGCAACTCCTCCAATA----ACTTTGAGCCTAT-T-CATAT-----------------GAAATGTTGTTGGTC--AGCAA--TTACA----cacacttttgaccaacactgttacagatgcaactcctccaataactttgagcctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|14 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgaacatgagcctaaagtcttggcattctgatTGCTGTAT---------GTACA----T-GG--TCG-AAGTATGT-GCCTGTGGTATTGGCATTC-CAGTTAAA------TAATATTTTAT--TGAGTA-ATTGCTC-T----TTGTTTTTTT---TAAC------TTAGA--TT
gi|14 : AT-T-TT---ATTGAGTAATTGC-TC-TTT-GTTTTTTTTAACTTAGATTT----T------G-----GC-----ATAAT--------TTGG--A-----------------CCAACA------------GTCATGA----CACT-------------ACCCTCC--CACTGTATTT--ACCAGAT-T-CAANN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NN--NNN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN------NNNNNNNNNNN--NNNNNN-NNNNNNN-N----NNNNNNTTTT---TAA-------TAAAA--TTACA----TTTG-TT-GCATTTTTGCATTTCAGCCTATA-----AATATTGAGTAttggcataatttggaccaacagtcatgacactaccctcccactgtatttaccagattcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttaataaaattacatttgttgcatttttgcatttcagcctataaatattgagtatcttgatttttt
gi|15 : tgctgtatgtacatggtcgaagtatgtgcctgtggtattggcattccagttaaataatTTTTTG--TCCCCTGCTTTTCAACAAAAA--TTTGG----TTTTATTAAAATGGCACCGTCCGTCTGTCTG-TATGTCTGTC-CATC--ACGT--TT-TGGTTCATCAACT---------C----TTT--CTACAGTTGTCACTTGATTCAAATGAAACT---TGCTGAAAAGT-TTGCTGTCTAAACTG-----GTG--CCTGTGGT----GAT-ATTATTTTGATTAAT-TTT-T-TTTG-ATGGAGTAGTGGC-CC-TTT-GTT-CTTTTAACTTAGATtcttgatttttt
gi|16 : tatatttcttgtt---TATGGAGA--CAGGTGTTTAGGAA--AGGATGACCTTTATATG-TTAAGGG-TCAG-TTATGTAAAAGGTCAAGGTTGTCTGGGTCA-----C-TCACTGGTCCCC-----C-CTTAAAA-----TAAACAACAAAT-CTTT----G-CCT------------TATTTTTA-TCGTAA----T--TC-T-TTT---CCTAC-TTGCA-TTCTTAT---------A-GAACACCA---------TA-----CC------------A----TT---C--------------CCgatacttcatac
gi|16 : caTG--------TTTCTT----CA---CATATTGTTT-AAgatccaacccctaccatgtcaaatttccattgtgcctatatgtttcttcacatattgtttaata
gi|17 : catatggagacaggtgtttaggaaaggatgacctttatatgttaagggtcagttatgtaaaaggtcaaggttgtctgggtcactcactggtccccccttaaaataaacaacaaatctttgccttatttttatcgtaattcttttcctacttgcattcttatagaacaccataccattcccgatccaacccctaccatgtcaaatttccattgtgcctata-------------C-----T-A-------------CAGGCAATGTCTG-TTT-TGCTCAGTCAGTGGCACTTTTGAGT-GCAGATAT--GAAT-----TCACTGCATTTta
gi|18 : tgtagcatattctcattctggacctttcttccaccccccccccccccccatctcatgtgaaattgccattctgcttatctgtttcttcaccatttgatgacaataccattttccattttttatgtcctatgtcccagcaagtatgctgtttcagtacccacacAAC-----------------GAAAC-TTGCCGTAC--AGCAA--GTCTAAGTGT-GG--TCT-AAACATGT-GTCTGTGATCTTACCATTT-CGATTAAA------ATATGTTTTGAT-AGAGTT-ATTGCCC------TTGTTC-TTT---TAA-------Tcatgt
gi|19 : ccgaaggttgcTTAATTGAT-CCTT---ACTGAGTTATGACGTT-TTT-GTT-ATTGTAACTTA-ATGT----T------TATAACAC-----AGTNNNNNNNNNNNNNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTTATGTGC--AGCAG--GT--------------CT-GAA-GTGAAGCCTGGGGTCTTGGCATTC-------AA------T-----GTTAC--TGAGTT-ACTGCCC-T----TTAATACTTT---TCA-------TTAAA--TTACT----TTCttcgaatttaaaacatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcgaaacttgctagtggtctgaatttgtgcctcaggtatt
gi|2 : t-TAGACAAACAACTT--------CCAACAAT--CTA--------ACTCTATTCAAAT--AATT---TGA--ATATGTGC-----------CTGC----GCG--C------TATTGGAATA-------AATTAT----T-T-TT---ATAGAGCAATGAC-AC-TTT-GCT-ATTCAAACTAAG-TTT----T------T-----AC-----A------------TTAA--A-----------------C-----------------GNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAC-ATGCTGTAC--AA-AG--GTACA----T-GA--TCT-GAATATTA-GCCTATAGCATTGGTGCTT-CAATTCCA------TAATCTGTTAC--AGAAGT-ATGGCTT-T----TTGATCTTAT---AAG-------TGAAA--TTACA----TTTA-TT-ACATTTTTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAACAACAGCATCTAC---CA--T--A--TTG-ATTTT-TT---TATGAGGA--CAGACCTTCTGGAA--GTGGTG-----TATT--------GG-CCAG-TTACCTAAGAGATCAATGTCACATAGGTCAACTCCCCCCCCCC--CCCC-----T-CTT---------C---------AA-TTTCTTTTGTTATTTT-ACGAAACAAACACTTT-TC---A----T--TC-T-TCT---TCTA--TTGCATTTCTAAT---------G-TTCCACCttctgaga
gi|2 : CACCTTC---CATCC--A--C--AATGTT-TT---TCCGAGGA--CAGGCCTCCAGGAT--GTGATGACCTTGATTTGTT-AAGGG--CAGCTTACTTT--AGATCAACGTCACTTAAGTCA-----CATCCCCGT-CCCC-----T-Cttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|2 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttcttttgttattttacgaaacaaacacttttcattcttcttctattgcatttctaatgttcTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-AGTACCCACATCCGCAGGCTATGGTTA-GTTGTGATCCTCCCATTGTCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----CCACTGGACTTTCTTGT-ccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|20 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttcttttgttattttacgaaacaaacacttttcattcttcttctattgcatttctaatgttccaccttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaaCA----T-GGCTTCTTGAATATGT-GCCTGTTGTATTGGGGTTC-CAATTATG------TTA-TTGCCAT--GGAGTT-GTGGCCC-T----TTG-TCATTT---AAACTTATTTTTAAA--TTACA----CT
gi|20 : actcaatgtatggagt---ATGGAGTTGTGGC-CC-TTT-GTC-ATTTAAACTTA--TTT----T------T-----AA-----A------------TTAC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNN---NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGTTGTAC--AGCAG--GTAGA----T-GA--TCT-GTACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgttgtacagcaggtagatgatctgtacatgagcctgtggtcttggtgt
gi|21 : actcaatgtatggagtcatggcttcttgaatatgtgcctgttgtattggggttccaattatgttattgcc----T--TT-T-ATT---CATA--TTGCATTTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA-----TACCCAA----TT---CGC------------CCACACCCT-----------GCGAGATTTC--CATCCTGATAATCTGTTTCAT----CC---CTTATTGATT-AATCTTTGTC-TTG-AT-TTCCATGCACATATTTCC--CCTCCCA---CA-----A-AC-----T-----------A-------TGT-----TTAAACATTG-CACTA----TTTTTTTCAAATTTT--ACGTCTCAG--ACATTATA-------C-TA-CAC--------TA-T-------------T-------------C-----CTA-------------CA
gi|22 : tcTTA--TTCTTCGCTTTTCGA-AGAAAAGTTT---G-ATATT-TTGAAATGGC---ATCTGCCT-TTC--CA----TGTC-TTTC--A---AGTTATGGACCAACAA-----------C----AAT-----CA------A----ATTCAAACGAAACTTGCTGT--ACAcccac
gi|22 : atattgaccttcactAATCAAAT-T-CAAAC-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--ACCAG--GTACA----T-GA--CCT-AAACATGA-ACCTGTAATCTTTG---TC-CAATTTAA------TTACTccaggtacatgacctaaacatgaacctgtaatctttgtccaatttaattactgagttgt
gi|23 : atattgaccttcactttattcttcgcttttcgaagaaaagtttgatattttgaaatggcatctgcctttccatgtctttcaagttatggaccaacaacC-TTT-GTT-TTTTTTAATTAGATTTCACGT------T-----GT-----A------------TTNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-NNCAAAA-----------------GAAAC-TTGCTGTGC--AGTAA--GTACC----T-GG--TCT-GA------------------------TC-CGATTAAA------ATGTTTTCGAT--AGATTT-ATGGTTC-T----TAGTTTTTTT---TAA-------gagttgt
gi|24 : -----T-GT-----A-----------A-------TTA-----TTTTTCAGTA-CTTTG----TT---------TTTT---CATCTGG---GCATTATA-------A-TG-CAC--------TG-TTCTAGTACCCACAT-------------C-----T-A-------------CAGGC-ATGTCTG-TTC-TACTCAGTCCATCGCCCTTTTCAGCATGGGTTAC--GAAT-----TTACTGAA-TTTCTTGT-TTacttaatatttacgtcatac
gi|25 : gcccggcTTTCATCCCATT-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TC--A--CGG--TTTTACT---TATGAAGA--CATGCCTTCAGGAAATATGAGGATCTTCA
gi|26 : gtgg---ATTCAGTTATGGC-CC-TTG-GTT-ATTTAAACTTA-ATTT----T------T-----GC-----A------------TTGC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTaaggtaaatggtcaccaccctcatatatttaattttgtcactgtata
gi|27 : -------------CTCCTCC--CAC---ATTTTAACCCAAT-T-CAAAT-----------------TTAGC-CAACTGTAC--AGCA---GTACA----TGGG--TCT-GAATATGA-GGCCGTGGTCTTGGTATTC-CAATTgggtcctctgt
gi|28 : aGAGTT-AAGGCCC-T----TAAATCTTTT----AA-------TGAAA--TTACT----TTCG-TTTGAAACTTTCCATTTCAGCCTATA-----ATTATTGAGTAACAGCATCca
gi|29 : actATGAAACC---TGC---TAAGT-T-----------TTG-----GCATTC------T----GAG-----------TTAAT-GCTAT-TT---ATTGAGTTATGG--CC-TTT-G----TTCTAACTTA---TT----T------T-----AC-------------------TTC--A-----------------C-----------------ctcc
gi|3 : tC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG--TCT-GAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGATTT---TTATTTATT-----GAGTT-ATGGCTC-T----TTGTTCTTTT---AAC-------TTAGA--TTtctct
gi|3 : -T-TT---ATTGAGTTATGGC-TC-TTT-GTT-CTTTTAACTTAGATTT-----------------A------A------------TTTC--A----------------------------------------------TACT-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NNN-TCT-GACTATTT-GCATG-GGTATTGGAGTTT-TGATTAAA------TTAT------------GTTCATGTCTC-T----TTGCTATTT------A-------TTAAA-----CA----TTAA-CT-GCAATTTTACATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAATAGCAGCACTTAC---CA-TC-----TTGAGATTT-CT---TATGAAGA--CAGGCTTTGAGGAA--ATGATGAATTTTA-----------G-CCAG-TTAT-----------AGGTCAT---GGTCA-----CATCCCCC--TCCG-----C-CTT---------TAAATTA---AT-TTTCTA--ACCTTTTT-AC----AATAATGTTT-TCTTAA----T--TCTT-TTT---CTTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCAACA---------TATCACCCCA-----G-----A----CTCCCC--------------CCACACCCTGCCAAGTTCCTGC-------T--CAT-CTG--------TTTCTT----CA---CTTATTGTTT-AATCTTGGCCATTA-TT-TT------A-----TTCC--G--ACCAATGCA-----T-ATCCCCCA-----------AGAAGATTTTT-----TTTAACATTA-CAATA----TT---------TTTTTCACATCCCAG--GCA-TAAA-------A-TG-CAG--------TA-T-------------TTCAGTACTCACACC-----C-A-------------CAGGCAATGTTTA-TTG-TACCCAGTCCATGGTCCTTATGAGTGGGGGATAT--GAAtaatttcatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctgactatttgcatgggtattggagttttgattaaattatgttcatgtctctttgctatttattaaacattaactgcaattttacatttcagcctataactattgaatagcagcacttaccatcttgagatttcttatgaagacaggctttgaggaaatgatgaattttagccagttataggtcatggtcacatccccctccgcctttaaattaattttctaacctttttacaataatgttttcttaattctttttcttattgcatttcttatgttccaacatatcaccccagactccccccacaccctgccaagttcctgctcatctgtttcttcacttattgtttaatcttggccattattttattccgaccaatgcatatcccccaagaagattttttttaacattacaatatttttttcacatcccaggcataaaatgcagtatttcagtactcacacccacaggcaatgtttattgtacccagtccatggtccttatgagtgggggatatgaaa
gi|30 : ctttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagattttta-------------T-------------C-----C-A-------------AAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAATCCATGGCCGTATC-AGCAGGAAATAT--GAAT-----TCACTTAA-TTTCTTa
gi|31 : ttacagtacccataTTTTAAA-AAAAA--TTGGGGGGATATTG---AAATGGC---ATCTGTCTGTTTG-CACATCCGAC-TGTC--ACAT
gi|32 : ttttttaaaaccctctttTGGAGTTATGGC-CC-TTT-GTT-CTTATAACTTAGATTT----
gi|4 : -TTACTGTAC--ATCAG--GTGCA----T-TC--TCT-GAACATGT-ACCTGTGGTATTGGCCTTC-AGATTAAA------TCATTTTCCAA--AGCGTT-CTGGTTC-T----TTGTTGTTTTACATAA-------TTA-----TACA----Tgatctcatatt
gi|4 : -----------------GAAAA-TTGCTGAAC--AACGG--GTACA----T-GC--TCT-GAATATGA-ACCTGAAATATTGACATTAATGATTTAA------TTATTTCTTAC--TGAGTT-ATGACCC-TAAGATTGACTTTTT---AAA-------TAAAG--TTACA----TTCT-AT-TTAACTTTATAAATCAGC------------TATTGAGTGACAACACCTAA---CA-TC-----TTGAATTTG-CT---TATGAGGA--CAGTCCTTCAGAAA--GTAATGTGCTTTACTTG-TAAAGGG-TCAC-CTATCTCAAAGGTCAAAGTCACTTCGGTAA----------CCG--TACC-----T--TT---------T---------A-------------CTTTT--C----TAGATT-TTT-TCTTAAATACT--TG-TATTT---CCTT--TTGCGATTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATCCCCA-----A----CT---CCGCCTACACCTTGCCCA-----------------GT-------TTCCATCCTGC-------TTTCTT----CA---CTTATTATTT-AACGTTCGCC-caaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaattgctgaacaacgggtacatgctctgaatatgaacctgaaatattgacattaatgatttaattatttcttactgagttatgaccctaagattgactttttaaataaagttacattctatttaactttataaatcagctattgagtgacaacacctaacatcttgaatttgcttatgaggacagtccttcagaaagtaatgtgctttacttgtaaagggtcacctatctcaaaggtcaaagtcacttcggtaaccgtaccttttacttttctagattttttcttaaatacttgtatttccttttgcgattattatgttccaccataccatccccaactccgcctacaccttgcccagtttccatcctgctttcttcacttattatttaacgttcgcc
gi|5 : ttactgtacatcaggtgcattctctgaacatgtacctgtggtattggccttcagattaaatcattttccaaagcgttctggttctttgttgttttacataattatacatcaaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG--TCT-GAAACTGT-GCCTGTGGTCTTAACATTC-TAGTTAA-------TGACTTTTGAT--GGAGTT-ATAGCCC-T----TTGTTCTTTT---AAC-------TTAGA--TT
gi|5 : -------AGTTAAT-GAC-T-TTTG-ATGGAGTTATAGC-CC-TTT-GTT-CTTTTAACTTAGATTT----TATGTGAT-----ACTNNNNN------------NNNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAT--AGCAA--GTACA----T-GG--TTG-GAATATGT-GCCTGTAGTATTAGAGTTT-TGCCTAAC------T--TTTTCGAT--GGAGTT-ATGACCC-T----TTGTTCTTTT---AAC-------TTAGA--TTttatgtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtatagcaagtacatggttggaatatgtgcctgtagtattagagttttgcctaactttttcgatggagttatgaccctttgttcttttaacttagattttaagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtatagcatatgtatatggtcagaatacgtgcctgtgatattagagttttgactaactttttgatgaagatatggccctttgttcttttaatttagattttagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|5 : gtctgaaactgtgcctgtggtcttaacattctTAAC---T-T-TTTCGATGGAGTTATGAC-CC-TTT-GTT-CTTTTAACTTAGATTT----TAAGTGAT-----ACTNNN-N------------NNNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-ATGCTGTAT--AGCATATGTATA----T-GG--TCA-GAATACGT-GCCTGTGATATTAGAGTTT-TGACTAAC------TT-TTTGATGA--AGA--T-ATGGCCC-T----TTGTTCTTTT---AAT-------TTAGA--TTttaagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtatagcatatgtatatggtcagaatacgtgcctgtgatattagagttttgactaactttttgatgaagatatggccctttgttcttttaatttagattttagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : gtctgaaactgtgcctgtggtcttaacattctagttaatgacttttgatggagttatagccctttgttcttttaacttagattttatgtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtatagcaagtacatggttggaatatgtgcctgtagtattagagttttgccTTCTTACATACCCCTCTTTTCGATAAATA--TTGGGGG-ATATTG---AAATGGC---ATCTGTCT----G-CA-GTCTGTCACGTT--Attagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : ataaatttacgttgtat-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AACAA--GTACA----T-GG--TCT-GAACATGT-GCCAGTGGTATTGGCATTA-TGATTAAATTGTTGTTGTTTTTTAA--GGAGTT-ATGGCCCTT----TTATTCTTTT---Tttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|6 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-T-TT---AAGGAGTTATGGC-CCTTTT-ATT-CTTTTTTCCTAGATTT----TACTTCAT-----AC-----A------------TTAC--tcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|6 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttAAT-----------------GTAAC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG--TCT-GAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGATTT---TTATTTATT-----GAGTT-ATGGCTC-T----TTGTTCTTTT---AAC-------TTAGA--TTtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|7 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcGT--ACATGT-T-----------CTTATCACGTG--CA-----T----GTA-A-------AATTAAC-TAT-T-TT---TTTATTTTAATGC-CC-TTT-GTA-ATTTTAACTTTAATTT---------------------------------------GCGAA-----------------C-----------------GCAA--------ACC-------------CTCCTAC--AG----ATA--AAATC-ATGT-CAAAT-----------------GTCAC-TTGTTTTGC--AGCAG---TACA----T-GG--TCT-AAACATAA-GAATGTAGTATTTGTGTTC-CAGCTCAA------TG----CGTAA--TGAGTT-ATGGTCC-T----TTGATCTCTT---GAA-------TGGAA--CTACA----TTCT-TT-GCAA-TTTGCATTTtaat
gi|7 : --TTGCATTTT-CT---TATCAGGA--CATACTTTCAGGAA--GTAATTACATT-GTTTG-TTAAGGA-CCAG-TAATATAAAAGGCCAAGGCCAATTGGGCCA-----CAT----G--CACC-----A-TTT---------T---------GT-TTT-----GTACTTC-----------AGTGTTTGTTTTAA----T--TA-T-TTC---CCTA--TTGTATT----GT---------G-TTCTGCCAACCCATCTCTAACT--CCA-----A-----A----TT---T--------------CCATCCG-------------GC-------T--CATC-TG--------TTTCTTAACTCATTGCTTATTGATA-AACCTTTGCC-TTG-GT-TTC-----ATTTtcttatcaggacatactttcaggaagtaattacattgtttgttaaggaccagtaatataaaaggccaaggccaattgggccacatgcaccattttgttttgtacttcagtgtttgttttaattatttccctattgtattgtgttctgccaacccatctctaactccaaatttccatccggctcatctgtttcttaactcattgcttattgataaacctttgccttggtttcatttcatcccg
gi|8 : gtacatgttcttatcacgtgcatgtaaaattaactatttttttattttaatgccctttgtaattttaactttaatttgcgaacgcaaaccctcctacagataaaatcatgtcaaatgtcacttgttttgcagcagtacatggtctaaacataagaatgtagtatttgtgttccagctcaatgcgtaatgagttatggtcctttgatctcttgaatggaactacattctttgcaat-A-------AATTATT---T-T-TC---ATTGAGTAATGGC-CA-TTAAGTT-ATTTTAACTTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------TCAT--AATNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGCACTAAGTAG--GTACA----T-AT--TCT-GAACATGA-GTCTGTGGTCTTGGCATTC--AATTAA-------TGATTT-------AGA---------CA-T----TTGACCTCTT---TTA-------TAAAA--TTATA----TTCT-TT-GAAACTATGCATTTCATCTTATAGATTAAGTATTGAGTAACAGCACTTTC---TA-CT-----TTGAATTTG-CT---TATGAGAA--CAGGCTTTCAGGAA--GAACTGACCTTTATTTG-TAAAGGG-CAAC-TTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTcatcccg
gi|9 : tttcattttacatcacactttctgtagatttaggattccatttGTT-ATGGCGC-T----TTGATCTTTT---TAA-------TGAAA--TAACA----TTCATTT-GTAACTTTGCAATACGGACTCTA-----TCTATTGAATAAAAGCACCTACATGTA-CA--AACGTGCATCTT-CTTCATATGGGGA--CA----T---GGAC--AT-ATGACATTCATTCGTT-AAGGG-CCAG-TTAACCCAAAGTTGAAAGTCATT---GT---------TGCCAG--CCCT-----T-GTCCAATAAAAAT---------ATATTTT----GTTCTCT---C----T------TTT-TCTTAA----T--AC-T-CCC---CCCAACCTTTATTTCTTATTCATCTTCAGCTTTCATCA---------TACTCTGCTA-----A-----A----TT---T--------------CAACTT--------------GC-------T--CAT-CTG--------TTTCTT----TA---CTTCTTGTTG-AATC-TCACT-TTG-A----------ATTCCTTTCA--A--CCCA---CA-----TGAT-----ACTAAAATATTTA-------TTT-----TTTCCCACTA-CAATG----TT---------TATT--TCATATCCTAAGCATAATAGAACACCA-GGACAC--------TC-A-------------T-------------C-----T-A-------------CAGGCAATTTCTATTTT-TTCTCAGTccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 111 1111 111 4444444444 22222222 1 888888888888888888888888888888 111 11 5555555555555555555555 1111 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111111111111 1 22222222 2222 111111111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 1111 2222222222 1111 1111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111 1 1
lowQualScore : 1 11 1 3 1 888 2 2 6 9999 111 3333333333 6 00000000 0 2 111111111111111111111111111111 6666 111 1 99 5555555555555555555555 4444 3 3 888 1 5 2 2 2 1 2 1 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 99999999 33 1 3 2 2 22222222222222222 1 22 333 3333 1 44 1 0 33 1 55 55 3 555555 7777777777 33 1 1 3333 1 2 1 3 88888888 2 22 22 22 5555 5 0 1 99999 777 88888888 6 3 555 0 44 66 0 88888 0 0 0 0 5555 33 3 1 1 222222222222222 99999 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 0 8888 55 4 4 777 99 666666666 4 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 9999 777 2 4 5 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 44444 1 5 0000 5 7777777777 6666 4444444 4 4 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 4 3 2 0 66 44444 4 0
lowQualScore : . .. . . . ... . . . .... ... .......... . ........ . . .............................. .... ... . .. ...................... .... . . ... . . . . . . . . ................................................................................................................ ........ .. . . . . ................. . .. ... .... . .. . . .. . .. .. . ...... .......... .. . . .... . . . . ........ . .. .. .. .... . . . ..... ... ........ . . ... . .. .. . ..... . . . . .... .. . . . ............... ..... . .................................................... . . .... .. . . ... .. ......... . .............................................................................................................................. .... ... . . . . ...................................................................... ..... . . .... . .......... .... ....... . . ............................................................... . . . . . .. ..... . .
lowQualScore : 0 00 4 3 0 333 5 5 7 3333 777 3333333333 7 99999999 0 5 222222222222222222222222222222 0000 777 7 00 0000000000000000000000 7777 1 1 333 0 0 4 4 4 0 4 0 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 33333333 77 0 1 4 4 77777777777777777 7 22 888 4444 7 00 7 9 22 7 44 77 3 000000 0000000000 22 7 7 5555 7 6 7 3 33333333 9 66 66 66 0000 6 9 8 11111 000 88888888 5 6 888 2 66 99 2 00000 5 1 4 3 6666 66 3 8 0 888888888888888 11111 6 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 1 5555 55 0 0 000 55 000000000 0 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4444 888 2 4 1 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333 4 0 6666 0 2222222222 4444 4444444 4 4 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 4 7 5 2 99 33333 1 0
consensus : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGAAACT---TGTACATGTG-TCTGA----GCGTTC-T----GAA-AAATTAAC-GAT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CC-TTT-G-TTNTTTTAACT-TAGATTT----T------T-----AC-----A------------TTNC--A-----------------C-----------------GTT--A-G---ATC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG--TCT-GAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------TTAT-TTTTT-ANNGAGTT-ATGGCCC-T----T-TGNT-CTTTTAAA-------TNAA--A--T--TACA----TTCATT-GCAACTTTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA-----N-----A----TTC--C-----C------AC-C-------------GC-------T----------CA---------TCC------------TG--------TTTCTT----CA---CTTATTGTTT-AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--AC--CCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
Reference ( family-1759 ) : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGAAACT---TGTACATGT--TCTGA----GCG--C-T----GAA-AAATTAAC-GAT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CC-TTT-G-TTNTTTTAACT-TAGATTT----T------T-----AC-----A------------TTNC--A-----------------C-----------------GTN--A-G---ACC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG--TCT-GAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------TTAT-TTNTT-ANNGAGTT-ATGGCCC-T----T-TGNT-CTTTTNAA-------TNAA--A--T--TACA----TTCGTT-GCAACTTTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA-----N-----A----TTC--C-----C------AC-C-------------GC-------T----------CA---------TCC------------TG--------TTTCTT----CA---CTTATTGTTT-AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--AC--CCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
gi|1 : TTGGTTATTA--TCCCGCGCTTCTCGA-AGACAC--TTGGGGG-ATATTATTTAAATGAT---GTCCGCCC-TCCGTCA-GTCCGTC-CATCCGACCCAATT-TGGATCAACAACTTTGCGGCGGC----AATTCCTACA------ACCCGATTCAAATGAAACT---TGTACATGT--TCTGAA---GTG--T-T----AAA-AAATCAAC-GAT-T-TT---ATCGAGTTATGAC-CC-TCC---CTAATTTAATT-TA-ATTT----T------T-----AC-----A------------TTTT--A-----------------C-----------------GTT--A-G---ATT--TACT-------------CTTCTCT--CA----ATTTTAAGCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGTAT--GTACA-------G--TAT-GAACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGTTC-CTATTAAA------TAAT-TTCTT-AAATAATT-ATGGCCC-T----T-TGAT-CTTTTTAA-------TGAA--A--T--TACA----TCCATT-GCAATTGTGCATGTCAGCGTATA-----ACTATTGAGTAACAGCATCTAC---TA-CCAAA--TTGCATTAT-CT---GATGATGA--CAAGCCTTCAGAAA--GTGATGACCTTTATTTGTT-AAGGG-TCAG-TTACCTCAAAAGTCATGGTCACTTGGGTTA-----CATCCCCA--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTTGA--GTCCGTTT-AC----TATATTGTTT-TCTTTA----T--TC-T-TTT---TCTA--TTGCATTTCTGAT---------G-TTGCACCA---------TA-----CTA-----T-----A----TTT--C-----C------A----------------AT-------T----------CA---------TCC------------TT--------TTTCTT----CA---CTTATTGTTT-AACCTTCGCC-TTGCTT-TT------ATTTGTTTCC--AT--CCA---CA-----T----------------------------TTT-----TTTACCATAA-CAATA----AG-ATTT---------ACGTCTCTT--GCATTATA-------A-TG-CAA--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATTTTTT-TTT-CACTCAGACCATGGCCCATTTGAGCGGCGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTACCTTGTATTC
gi|10 : aaattCA----TTCATT-GTGATTTCGCATTTCAGTCTA-------ACTAGTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TT-----TTGAAATTT-CT---TGTAA------------------A--GTAATGCCCTTTATTTG-T-TAGGGACCAA-TTACCTTAAAGGTCATGGTCACTTGGGTCA-----CATCCACA-----------T-TTTCAA------T---------AT-GTTT----GTCCTTTTAAC----TGTA-TATTT-T-TTAA----TTATT-T-TTT---TCTA--TGGCATTTCTCAT---------G-TTTCACC-------------------------C-----A----CTC--C-----C------AC-A---------------------------------CA---------CCC------------TG-----------CCA----AA---CTTCCTG--------CTCGTC-TCT-GC-TC------GTCTGTTTCTTAAC--TT-----------T-AT-----------------T-------TTT-----TTTAACATTA-CAATATATTTT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTAAA-------A-TG-CAGTTGCACACTG-C-------------C-------------CACATTC-A-------------CAGACAATGTTTA-TTT-TGCTGCGTCCATGGCACTTATTAGCGCGGGATATTCAAAT-----GTACTCAATTTTCTTGT-TTCa
gi|11 : TTAAGGAA-----ATTACATTCATTTG----------CAT-TTGCGTCAAAGATCAATGTCATTTGGGTCA-----C-CCTTCG--CCCTAAAAATACTT---------T-------------TTC----TACCTTTT-TT----TATATTTCTT-TAT-AA----T--TC-T-TTTGAACC-A--T-GCATTCCTTAT---------T-GTCTACCT---------TA-----CCA-----A-----CCTCTTTC--C-----C------AA-C-------------AT-------TAAAT------CA---------TCC-------------G--------T---------CA---CATAT-GTTTCAACC--CGC------ATATT------ACC-----CC--AC--CCA---CAATATAT-AT-----AT----------A-------TTTATAAATTTACAAATAGCAATA----TT-TT-----------ACATCTCGG--ACATTATA-------G-AG-C-G--------TGAT-------------T-------------C-----C-AGTATTTATATCACCGGGCAATGTTTA-TTT-T-TTCAGTCCATGACCATTTTGAGTGGCGAATAT---AATTCCCCTCGCTGAA-GTTCTTGg
gi|12 : AACCCAGT-T-CATAT-----------------TAAAC-TTCCTATAT--AGCAA--GGAAA----T-GG--TCT-GAATGTGA-GCCT-TGGCATT----TTAATGATT---------TTAT-TTTTTTATTAAGTT-ATGGCCC-T----T-TGGT-ATTTATAT-------TGCA--A--T--TATAATTATTCATTTACAACTTTGCATTTTGACTTATA-----ACT-----------------------------A--TTGAGT----------ATGAGAATTCA--CCATCAGGAA---------CCTTTA--------AAGG-CCAA-TTACCTCAGAGGTCAAGGTCATTGGGGCCA-----CATACC----TCCC-----T-CT
gi|12 : CCATTA-CAAAA----TTGTTTT---------ACATCTACT--GCATTATA-------ACTG-C----------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------cagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcccattacaaaattgttttacatctactgcattataactgctgttccagtactcacatcca
gi|13 : aacccagttcatattaaacttcctatatagcaaggaaatggtctgaatgtgagccttggcattttaatgattttatttttttattaagttatggccctttggtatttatattgcaattataattattcatttacaactttgcattttgacttataactattgagtatgagaattcaccatcaggaacctttaaaggccaattacctcagaggtcaaggtcattggggccacatacctccctctcagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcTTGTTA--TTTCCCGCTTTTCAA-AGATA---TTGATGG-ATA---TTGAAATGGC---GTTCGTCC---------GTCCGTC-CGTC--Agtactcacatcca
gi|13 : aacattgactgct-----------------GACAC-TTTATGTGC--AGCAG--GTACA----T-GA--TTT-GAACATGA-GCCTAAAGTCTTGGCATTC-TGATTTGA------TGA---TATT-ACGGAGTT-AT-GCTC-T----T-TACT-TTTTTAAC-------TTAA--ATTT--TACA----Ttttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgaacatgagcctaaagtcttggcattctgatttgatgatattacggagttatgctctttacttttttaacttaaattttacatcacacttttgaccaacactgttacagatgcaactcctccaataactttgagcctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|13 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGAT-GAT-A-TT---ACGGAGTTATG-C-TC-TTT-A-CTTTTTTAACT-TAAA-TT----T------T-----AC-----A------------TCAC--A-----------------C-----------------TTT--T-G---ACCAACACTGTTACAGATGCAACTCCTCCAATA----ACTTTGAGCCTAT-T-CATAT-----------------GAAATGTTGTTGGTC--AGCAA--TTACA----cacacttttgaccaacactgttacagatgcaactcctccaataactttgagcctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|14 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgaacatgagcctaaagtcttggcattctgatTGCTGTAT---------GTACA----T-GG--TCG-AAGTATGT-GCCTGTGGTATTGGCATTC-CAGTTAAA------TAAT-ATTTT-ATTGAGTA-ATTGCTC-T----T-TGTT-TTTTTTAAC------TTAG--A--T--T
gi|14 : AT-T-TT---ATTGAGTAATTGC-TC-TTT-GTTTTTTTTAACT-TAGATTT----T------G-----GC-----ATAAT--------TTGG--A-----------------CCAACA------------GTC--ATG---A----CACT-------------ACCCTCC--CACTGTATTT--ACCAGAT-T-CAANN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NN--NNN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN------NNNN-NNNNN-NNNNNNNN-NNNNNNN-N----N-NNNN-NTTTTTAA-------TAAA--A--T--TACA----TTTGTT-GCATTTTTGCATTTCAGCCTATA-----AATATTGAGTAttggcataatttggaccaacagtcatgacactaccctcccactgtatttaccagattcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttaataaaattacatttgttgcatttttgcatttcagcctataaatattgagtatcttgatttttt
gi|15 : tgctgtatgtacatggtcgaagtatgtgcctgtggtattggcattccagttaaataatTTTTTG--TCCCCTGCTTTTCAACAAAAA---TTTGG----TTTTATTAAAATGGCACCGTCCGTCTGTCTG-TATGTCTGTC-CATC--ACGT--TT-TGGTTCATCAACT---------C----TTT--CTACAGTTGTCACTTGATTCAAATGAAACT---TGtcttgatttttt
gi|15 : tatatttcttgttAA-AAATT--T-GGT-T-TT---ATTAAA--ATGGCACC-----G-TCCGTCTGTCTGTATGTCT----G------T-----CC-----A------------T--C--A-----------------C-----------------GTTTTG-GTTCATC--AACT-------------CTTTCTA--CA----GTTGTCACTTGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGAA------AA--GTTTG----C-TG--TCT-AAACTGGT-GCCTGTGGTGATATTATTT-TGATT-AA------TTTT-TTTTG-ATGGAGTA-GTGGCCC-T----T-TGTT-CTTTTAAC-------TTAG--A--TGATAC-----TTCATctgaaaagtttgctgtctaaactggtgcctgtggtgatattattttgattaattttttttgatggagtagtggccctttgttcttttaacttagatgatacttcatac
gi|16 : tatatttcttgtttttttgtcccctgcttttcaac---TATGGAGA--CAGGTGTTTAGGAA--AGGATGACCTTTATATG-TTAAGGG-TCAG-TTATGTAAAAGGTCAAGGTTGTCTGGGTCA-----C-TCACTGGTCCCC-----C-CTTAAAA-----TAAACAACAAAT-CTTT----G-CCT------------TATTTTTA-TCGTAA----T--TC-T-TTT---CCTAC-TTGCA-TTCTTAT---------A-GAACACCA---------TA-----CC------------A----TTC--C-----CGATCCAAC-C-------------CC-------TAC--------CATGTCAAATTTCCATTGTGCCTATATG--------TTTCTT----CA---CATATTGTTT-AAac
gi|17 : ca-------------C-----T-A-------------CAGGCAATGTCTG-TTT-TGCTCAGTCAGTGGCACTTTTGAGT-GCAGATAT--GAAT-----TCACTGCATTTta
gi|18 : tgtagcatattctcattctggacctttcttccaccccccccccccccccatctcatgtgaaattgccattctgcttatctgtttcttcaccatttgatgacaataccattttccattttttatgtcctatgtcccagcaagtatgctgtttcagtacccacacAAC-----------------GAAAC-TTGCCGTAC--AGCAA--GTCTAAGTGT-GG--TCT-AAACATGT-GTCTGTGATCTTACCATTT-CGATTAAA------ATATGTTTTG-ATAGAGTT-ATTGCCC------T-TGTT-CTTTTAAcatgt
gi|19 : ccgaaggttgcTTAATTGAT-CCTT---ACTGAGTTATGACGTT-TTT-G-TTATTGTAACT-TA-ATGT----T------TATAACAC-----AGTNNNNNNNNNNNNNN--N-----------------N-----------------NNN--N-N---NNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTTATGTGC--AGCAG--GT--------------CT-GAA-GTGAAGCCTGGGGTCTTGGCATTC-------AA------T------GTT-ACTGAGTT-ACTGCCC-T----T-TAATACTTTTC-A-------TTAA--A--T--TACT----TTCtttcgaatttaaaacatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcgaaacttgctagtggtctgaatttgtgcctcaggtatt
gi|2 : t-TAGACAAACAACTT--------CCAACAAT--CTA--------ACTCTATTCAAAT--AATT---TGAATATGTG-CCTGC----GCG--C-TATTGGAATAAATTAT----T-T-TT---ATAGAGCAATGAC-AC-TTT-G-CTATTCAAACT-AAG-TTT----T------T-----AC-----A------------TTAA--A-----------------C-----------------GNN--N-N---NNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAC-ATGCTGTAC--AA-AG--GTACA----T-GA--TCT-GAATATTA-GCCTATAGCATTGGTGCTT-CAATTCCA------TAAT-CTGTT-ACAGAAGT-ATGGCTT-T----T-TGAT-CTTATAAG-------TGAA--A--T--TACA----TTTATT-ACATTTTTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAACAACAGCATCTAC---CA--T--A--TTG-ATTTT-TT---TATGAGGA--CAGACCTTCTGGAA--GTGGTG-----TATT--------GG-CCAG-TTACCTAAGAGATCAATGTCACATAGGTCAACTCCCCCCCCCC--CCCC-----T-CTT---------C---------AA-TTTCTTTTGTTATTTT-ACGAAACAAACACTTT-TC---A----T--TC-T-TCT---TCTA--TTGCATTTCTAAT---------G-TTCCACCttctgaga
gi|2 : CACCTTC---CATCC--A--C--AATGTT-TT---TCCGAGGA--CAGGCCTCCAGGAT--GTGATGACCTTGATTTGTT-AAGGG--CAGCTTACTTT--AGATCAACGTCACTTAAGTCA-----CATCCCCGT-CCCC-----T-Cttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|2 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttcttttgttattttacgaaacaaacacttttcattcttcttctattgcatttctaatgttcTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-AGTACCCACATCCGCAGGCTATGGTTA-GTTGTGATCCTCCCATTGTCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----CCACTGGACTTTCTTGT-ccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|20 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttcttttgttattttacgaaacaaacacttttcattcttcttctattgcatttctaatgttccaccttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaaCA----T-GGCTTCTTGAATATGT-GCCTGTTGTATTGGGGTTC-CAATTATG------TTA--TTGCC-ATGGAGTT-GTGGCCC-T----T-TG-T-CATTTAAACTTATTTTTAA--A--T--TACA----CT
gi|20 : actcaatgtatggagt---ATGGAGTTGTGGC-CC-TTT-G-TCATTTAAACT-TA--TTT----T------T-----AA-----A------------TTAC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNN---NNN--N-N---NNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGTTGTAC--AGCAG--GTAGA----T-GA--TCT-GTACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgttgtacagcaggtagatgatctgtacatgagcctgtggtcttggtgt
gi|21 : actcaatgtatggagtcatggcttcttgaatatgtgcctgttgtattggggttccaattatgttattgcc----T--TT-T-ATT---CATA--TTGCATTTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA-----TACCCAA----TTCGCC-----C------ACAC-------------CC-------TGCGAGATTTCCA---------TCC------------TGATAATCTGTTTCAT----CC---CTTATTGATT-AATCTTTGTC-TTG-AT-TTCCATGCACATATTTCC--CCTCCCA---CA-----A-AC-----T-----------A-------TGT-----TTAAACATTG-CACTA----TT-TTTTTCAAATTTTACGTCTCAG--ACATTATA-------C-TA-CAC--------TA-T-------------T-------------C-----CTA-------------CA
gi|22 : tcTTA--TTCTTCGCTTTTCGA-AGAAAAGTTT----G-ATATT-TTGAAATGGC---ATCTGCCT-TTC--CA----TGTC-TTTC--A---AGTTATGGACCAACAA-----------C----AAT-----CA------A----ATTCAAACGAAACTTGCTGTACAcccac
gi|22 : atattgaccttcactAATCAAAT-T-CAAAC-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--ACCAG--GTACA----T-GA--CCT-AAACATGA-ACCTGTAATCTTTG---TC-CAATTTAA------TTAC-Tccaggtacatgacctaaacatgaacctgtaatctttgtccaatttaattactgagttgt
gi|23 : atattgaccttcactttattcttcgcttttcgaagaaaagtttgatattttgaaatggcatctgcctttccatgtctttcaagttatggaccaacaacC-TTT-G-TTTTTTTTAAT-TAGATTTCACGT------T-----GT-----A------------TTNN--N-----------------N-----------------NNN--N-N---NNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-NNCAAAA-----------------GAAAC-TTGCTGTGC--AGTAA--GTACC----T-GG--TCT-GA------------------------TC-CGATTAAA------ATGT-TTTCG-ATAGATTT-ATGGTTC-T----T-AGTT-TTTTTTAA-------gagttgt
gi|24 : -----T-GT-----A-----------A-------TTA-----TTTTTCAGTA-CTTTG----TT-TTTT----------CATCTGG---GCATTATA-------A-TG-CAC--------TG-TTCTAGTACCCACAT-------------C-----T-A-------------CAGGC-ATGTCTG-TTC-TACTCAGTCCATCGCCCTTTTCAGCATGGGTTAC--GAAT-----TTACTGAA-TTTCTTGT-TTacttaatatttacgtcatac
gi|25 : gcccggcTTTCATCCCATT-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TC--A--CGG--TTTTACT---TATGAAGA--CATGCCTTCAGGAAATATGAGGATCTTCA
gi|26 : gtgg---ATTCAGTTATGGC-CC-TTG-G-TTATTTAAACT-TA-ATTT----T------T-----GC-----A------------TTGC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--N-N---NNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTaaggtaaatggtcaccaccctcatatatttaattttgtcactgtata
gi|27 : -------------CTCCTCC--CAC---ATTTTAACCCAAT-T-CAAAT-----------------TTAGC-CAACTGTAC--AGCA---GTACA----TGGG--TCT-GAATATGA-GGCCGTGGTCTTGGTATTC-CAATTgggtcctctgt
gi|28 : a-ACTGAGTT-AAGGCCC-T----T-AAAT-CTTTT-AA-------TGAA--A--T--TACT----TTCGTTTGAAACTTTCCATTTCAGCCTATA-----ATTATTGAGTAACAGCATCca
gi|29 : ATGAAACC---TGC-TAAGT--TTTG-----GCATTC-T----GAG----TTAAT-GCTAT-TT---ATTGAGTTATGG--CC-TTT-G-TTC---TAACT-TA---TT----T------T-----AC-------------------TTC--A-----------------C-----------------ctcc
gi|3 : tC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG--TCT-GAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGA------TTTT-TATTT-ATTGAGTT-ATGGCTC-T----T-TGTT-CTTTTAAC-------TTAG--A--T--Ttctct
gi|3 : -T-TT---ATTGAGTTATGGC-TC-TTT-G-TTCTTTTAACT-TAGATTT-----------------A------A------------TTTC--A-----------------T----------------------------------ACT-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NNN-TCT-GACTATTT-GCATG-GGTATTGGAGTTT-TGATTAAA------TTAT------------GTTCATGTCTC-T----T-TGCT-ATTT---A-------TTAA--A-------CA----TTAACT-GCAATTTTACATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAATAGCAGCACTTAC---CA-TC-----TTGAGATTT-CT---TATGAAGA--CAGGCTTTGAGGAA--ATGATGAATTTTA-----------G-CCAG-TTAT-----------AGGTCAT---GGTCA-----CATCCCCC--TCCG-----C-CTT---------TAAATTA---AT-TTTCTA--ACCTTTTT-AC----AATAATGTTT-TCTTAA----T--TCTT-TTT---CTTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCAACA---------TATCACCCCA-----G-----A----CTC--CCCCCAC------AC-CCTGCCAAGTTCCTGC-------T----------CA---------T-C------------TG--------TTTCTT----CA---CTTATTGTTT-AATCTTGGCCATTA-TT-TT------A-----TTCC--GA--CCAATGCA-----T-ATCCCCCA-----------AGAAGATTTTT-----TTTAACATTA-CAATA----TT-TTTTTC-------ACATCCCAG--GCA-TAAA-------A-TG-CAG--------TA-T-------------TTCAGTACTCACACC-----C-A-------------CAGGCAATGTTTA-TTG-TACCCAGTCCATGGTCCTTATGAGTGGGGGATAT--GAAtaatttcatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctgactatttgcatgggtattggagttttgattaaattatgttcatgtctctttgctatttattaaacattaactgcaattttacatttcagcctataactattgaatagcagcacttaccatcttgagatttcttatgaagacaggctttgaggaaatgatgaattttagccagttataggtcatggtcacatccccctccgcctttaaattaattttctaacctttttacaataatgttttcttaattctttttcttattgcatttcttatgttccaacatatcaccccagactccccccacaccctgccaagttcctgctcatctgtttcttcacttattgtttaatcttggccattattttattccgaccaatgcatatcccccaagaagattttttttaacattacaatatttttttcacatcccaggcataaaatgcagtatttcagtactcacacccacaggcaatgtttattgtacccagtccatggtccttatgagtgggggatatgaaa
gi|30 : ctttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagattttta-------------T-------------C-----C-A-------------AAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAATCCATGGCCGTATC-AGCAGGAAATAT--GAAT-----TCACTTAA-TTTCTTa
gi|31 : ttacagtacccataTTTTAAA-AAAAA---TTGGGGGGATATTG---AAATGGC---ATCTGTCTGTTTG-CACATCCGAC-TGTC--ACAT
gi|32 : ttttttaaaaccctctttTGGAGTTATGGC-CC-TTT-G-TTCTTATAACT-TAGATTT----
gi|4 : -TTACTGTAC--ATCAG--GTGCA----T-TC--TCT-GAACATGT-ACCTGTGGTATTGGCCTTC-AGATTAAA------TCAT-TTTCC-AAAGCGTT-CTGGTTC-T----T-TGTT-GTTTTACA-------T--A--A--T--TATA----gatctcatatt
gi|4 : -----------------GAAAA-TTGCTGAAC--AACGG--GTACA----T-GC--TCT-GAATATGA-ACCTGAAATATTGACATTAATGATTTAA------TTAT-TTCTT-ACTGAGTT-ATGACCC-TAAGAT-TGAC-TTTTTAAA-------TAAA--G--T--TACA----TTCTAT-TTAACTTTATAAATCAGC------------TATTGAGTGACAACACCTAA---CA-TC-----TTGAATTTG-CT---TATGAGGA--CAGTCCTTCAGAAA--GTAATGTGCTTTACTTG-TAAAGGG-TCAC-CTATCTCAAAGGTCAAAGTCACTTCGGTAA----------CCG--TACC-----T--TT---------T---------A-------------CTTTT--C----TAGATT-TTT-TCTTAAATACT--TG-TATTT---CCTT--TTGCGATTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATCCCCA-----A----CTC--CGCCTAC------AC-CTT-----------GCCCAGTTTC----------CA---------TCC------------TGC-------TTTCTT----CA---CTTATTATTT-AACGTTCGCC-catcaaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaattgctgaacaacgggtacatgctctgaatatgaacctgaaatattgacattaatgatttaattatttcttactgagttatgaccctaagattgactttttaaataaagttacattctatttaactttataaatcagctattgagtgacaacacctaacatcttgaatttgcttatgaggacagtccttcagaaagtaatgtgctttacttgtaaagggtcacctatctcaaaggtcaaagtcacttcggtaaccgtaccttttacttttctagattttttcttaaatacttgtatttccttttgcgattattatgttccaccataccatccccaactccgcctacaccttgcccagtttccatcctgctttcttcacttattatttaacgttcgcc
gi|5 : ttactgtacatcaggtgcattctctgaacatgtacctgtggtattggccttcagattaaatcattttccaaagcgttctggttctttgttgttttacataattatacatcaaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGAAACT----GTGCCTGTGGTCTTA----ACATTC-T---------AGTTAAT-GAC-T-TTTG-ATGGAGTTATAGC-CC-TTT-G-TTCTTTTAACT-TAGATTT----TATGTGAT-----ACTNNNNN------------NNNN--N-----------------N-----------------NNN--N-N---NNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAT--AGCAA--GTACA----T-GG--TTG-GAATATGT-GCCTGTAGTATTAGAGTTT-TGCCTAAC------T--T-TTTCG-ATGGAGTT-ATGACCC-T----T-TGTT-CTTTTAAC-------TTAG--A--T--T
gi|5 : gtcTAAC---T-T-TTTCGATGGAGTTATGAC-CC-TTT-G-TTCTTTTAACT-TAGATTT----TAAGTGAT-----ACTNNN-N------------NNNN--N-----------------N-----------------NNN--N-N---NNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-ATGCTGTAT--AGCATATGTATA----T-GG--TCA-GAATACGT-GCCTGTGATATTAGAGTTT-TGACTAAC------TT-T-TTGAT-GAAGA--T-ATGGCCC-T----T-TGTT-CTTTTAAT-------TTAG--A--T--Tttaagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtatagcatatgtatatggtcagaatacgtgcctgtgatattagagttttgactaactttttgatgaagatatggccctttgttcttttaatttagattttagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : gtctgaaactgtgcctgtggtcttaacattctagttaatgacttttgatggagttatagccctttgttcttttaacttagattttatgtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtatagcaagtacatggttggaatatgtgcctgtagtattagagttttgccTTCTTACATACCCCTCTTTTCGATAAATA---TTGGGGG-ATATTG---AAATGGC---ATCTGTCT----G-CA-GTCTGTCACGTT--Attagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : ataaatttacgttgtat-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AACAA--GTACA----T-GG--TCT-GAACATGT-GCCAGTGGTATTGGCATTA-TGATTAAATTGTTGTTGT-TTTTT-AAGGAGTT-ATGGCCCTT----T-TATT-CTTTTttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|6 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-T-TT---AAGGAGTTATGGC-CCTTTT-A-TTCTTTTTTCC-TAGATTT----TACTTCAT-----AC-----A------------TTAC--ttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|6 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttAAT-----------------GTAAC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG--TCT-GAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGA------TTTT-TATTT-ATTGAGTT-ATGGCTC-T----T-TGTT-CTTTTAAC-------TTAG--A--T--Ttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|7 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcGTACATGT--TCTTATCACGTG--CAT----GTA-AAATTAAC-TAT-T-TT---TTTATTTTAATGC-CC-TTT-G-TAATTTTAACT-TTAATTT---------------------------------------GCGAA-----------------C-----------------GCA--A-----------ACC-------------CTCCTAC--AG----ATA--AAATC-ATGT-CAAAT-----------------GTCAC-TTGTTTTGC--AGCAG---TACA----T-GG--TCT-AAACATAA-GAATGTAGTATTTGTGTTC-CAGCTCAA------TG-----CGT-AATGAGTT-ATGGTCC-T----T-TGAT-CTCTTGAA-------TGGA--A--C--TACA----TTCTTT-GCAA-TTTGCATTTtaat
gi|7 : --TTGCATTTT-CT---TATCAGGA--CATACTTTCAGGAA--GTAATTACATT-GTTTG-TTAAGGA-CCAG-TAATATAAAAGGCCAAGGCCAATTGGGCCA-----CAT----G--CACC-----A-TTT---------T---------GT-TTT-----GTACTTC-----------AGTGTTTGTTTTAA----T--TA-T-TTC---CCTA--TTGTATT----GT---------G-TTCTGCCAACCCATCTCTAACT--CCA-----A-----A----TTT--C-----C------AT-CCG-----------GC-------T----------CA---------TC-------------TG--------TTTCTTAACTCATTGCTTATTGATA-AACCTTTGCC-TTG-GT-TTC-----ATTTtcttatcaggacatactttcaggaagtaattacattgtttgttaaggaccagtaatataaaaggccaaggccaattgggccacatgcaccattttgttttgtacttcagtgtttgttttaattatttccctattgtattgtgttctgccaacccatctctaactccaaatttccatccggctcatctgtttcttaactcattgcttattgataaacctttgccttggtttcatttcatcccg
gi|8 : gtacatgttcttatcacgtgcatgtaaaattaactatttttttattttaatgccctttgtaattttaactttaatttgcgaacgcaaaccctcctacagataaaatcatgtcaaatgtcacttgttttgcagcagtacatggtctaaacataagaatgtagtatttgtgttccagctcaatgcgtaatgagttatggtcctttgatctcttgaatggaactacattctttgcaatCTGTAGATTTAGGATTC-CATTTAAA------TTAT-TTTTC-ATTGAGTA-ATGGCCA-T----TAAGTT-ATTTTAAC-------TTAATTT--T--TACA----Tcatcccg
gi|8 : tttcattttacatcacacttt-AAATTATT---T-T-TC---ATTGAGTAATGGC-CA-TTAAG-TTATTTTAACT-TA-ATTT----T------T-----AC-----A------------TCAT--AATNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------NNN--N-N---NNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGCACTAAGTAG--GTACA----T-AT--TCT-GAACATGA-GTCTGTGGTCTTGGCATTC-------AA------TTA---------ATGATTT-A--GACA-T----T-TGAC-CTCTTTTA-------TAAA--A--T--TATA----TTCTTT-GAAACTATGCATTTCATCTTATAGATTAAGTATTGAGTAACAGCACTTTC---TA-CT-----TTGAATTTG-CT---TATGAGAA--CAGGCTTTCAGGAA--GAACTGACCTTTATTTG-TAAAGGG-CAAC-TTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTcataatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgcactaagtaggtacatattctgaacatgagtctgtggtcttggcattcaattaatgatttagacatttgacctcttttataaaattatattctttgaaactatgcatttcatcttatagattaagtattgagtaacagcactttctactttgaatttgcttatgagaacaggctttcaggaagaactgacctttatttgtaaagggcaacttaactcaaaggtcaaggtcactccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa
gi|9 : tttcattttacatcacactttctgtagatttaggattccatttGTT-ATGGCGC-T----T-TGAT-CTTTTTAA-------TGAA--A--T--AACA----TTCATTTGTAACTTTGCAATACGGACTCTA-----TCTATTGAATAAAAGCACCTACATGTA-CA--AACGTGCATCTT-CTTCATATGGGGA--CA----T---GGAC--AT-ATGACATTCATTCGTT-AAGGG-CCAG-TTAACCCAAAGTTGAAAGTCATT---GT---------TGCCAG--CCCT-----T-GTCCAATAAAAAT---------ATATTTT----GTTCTCT---C----T------TTT-TCTTAA----T--AC-T-CCC---CCCAACCTTTATTTCTTATTCATCTTCAGCTTTCATCA---------TACTCTGCTA-----A-----A----TTT--C-----A------ACTT-------------GC-------T----------CA---------T-C------------TG--------TTTCTT----TA---CTTCTTGTTG-AATC-TCACT-TTG-A----------ATTCCTTTCA--AC--CCA---CA-----TGAT-----ACTAAAATATTTA-------TTT-----TTTCCCACTA-CAATG----TT-TATT---------TCATATCCTAAGCATAATAGAACACCA-GGACAC--------TC-A-------------T-------------C-----T-A-------------CAGGCAATTTCTATTTT-TTCTCAGTccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 111 1111 111 4444444444 22222222 1 888888888888888888888888888888 111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111 11111111111111111 11111 1111 22222222 2222 111111111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 1111 222222222 1111 1111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111 1 1
lowQualScore : 1 11 1 3 1 888 2 2 6 9999 111 3333333333 6 00000000 0 2 111111111111111111111111111111 6666 666 9999999999 3 111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 5 444 1 2 2 2 2 1 888888888 2 9 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00000000 33 1 3 2 2 77777777777777777 1 22 333 3333 1 1 1 33 2 55 66 1 555555 66666 1 22 44 1 1 1 3333 1 55 1 1 6666 3 2 1 22 6666 2 00000 0000 6666 3 77777 0 77777 0 777 88888888 6 3 555 0 44 66 0 88888 0 0 0 5555 33 3 1 1 222222222222222 99999 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 0 8888 55 4 4 777 99 3 666666666 4 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 1 8888888 5 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 44444 1 5 0000 555555555 777 6666 4444444 4 4 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 4 3 2 0 66 44444 4 0
lowQualScore : . .. . . . ... . . . .... ... .......... . ........ . . .............................. .... ... .......... . ... ................................................................ . . ... . . . . . . ......... . . ........................................................................................................... ........ .. . . . . ................. . .. ... .... . . . .. . .. .. . ...... ..... . .. .. . . . .... . .. . . .... . . . .. .... . ..... .... .... . ..... . ..... . ... ........ . . ... . .. .. . ..... . . . .... .. . . . ............... ..... . .................................................... . . .... .. . . ... .. . ......... . ....................................................................................................................... . . ....... . . ...................................................................... ..... . . .... ......... ... .... ....... . . ............................................................... . . . . . .. ..... . .
lowQualScore : 0 00 4 3 0 333 5 5 7 3333 777 3333333333 7 99999999 0 5 222222222222222222222222222222 0000 444 7777777777 6 777 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 3 777 0 4 2 2 2 0 999999999 2 3 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77777777 55 0 7 4 4 44444444444444444 7 33 888 7777 8 8 2 55 0 11 44 0 555555 55555 1 11 00 8 8 7 7777 7 11 7 7 4444 3 9 9 66 7777 7 99999 5555 5555 1 77777 2 77777 8 000 88888888 5 6 888 2 66 99 2 00000 5 4 3 6666 66 3 8 0 888888888888888 11111 6 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 1 5555 55 0 0 000 55 4 000000000 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 0 9999999 1 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333 4 0 6666 000000000 222 4444 4444444 4 4 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 4 7 5 2 99 33333 1 0
consensus : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGAAACT---TG-TACA-----TG-T-G-TCTT-------G--G-------C--GTTC------T--GA--A-------AATT---AA--C-G--AT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CC-TTT-G-TTNTTTTA---------AC-TTAGATTT----T------T-----AC-----A------------TTNC--A-----------------C-----------------GTNA-GACC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG-TCTGAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------TTAT-TTTTT-ATNGA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-NT-CTTT-TA----AATTA-A--A----TTACATT-C-A---TT-G--CAAC----T-T-----TGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA-----AA----TT--CC-----C------AC-C-------------GC-------T----------CA---------TC--------C------------TG-TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--A--CCCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT---------TTTT--ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
Reference ( family-1759 ) : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGAAACT---TG-TACA-----TG-T-G-TCTG-------A--G-------C--GTTC------T--GAA-A-------AATT---AA--C-G--AT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CC-TTT-G-TTNTTTTA---------AC-TTAGATTT----T------T-----AC-----A------------TTNC--A-----------------C-----------------GTTA-GATC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG-TCTGAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------TTAT-TTTTT-ANNGA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-NT-CTTT-TA----AATNA-A--A----TTACATT-C-A---TT-G--CAAC----T-T-----TGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA-----NA----TT--CC-----C------AC-C-------------GC-------T----------CA---------TC--------C------------TG-TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--A--CCCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT---------TTTT--ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
gi|1 : TTGGTTATTA--TCCCGCGCTTCTCGA-AGACAC--TTGGGGG-ATATTATTTAAATGAT---GTCCGCCC-TCCGTCA-GTCCGTC-CATCCGACCCAATT-TGGATCAACAACTTTGCGGCGGC----AATTCCTACA------ACCCGATTCAAATGAAACT---TG-TACA-----TG-T---TCTG-------AA-G-------T--GTT----------AAA-A-------AATC---AA--C-G--AT-T-TT---ATCGAGTTATGAC-CC-TCC---CTAATTTA---------AT-TTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------TTTT--A-----------------C-----------------GTTA-GATT--TACT-------------CTTCTCT--CA----ATTTTAAGCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGTAT--GTACA-------G-TATGAACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGTTC-CTATTAAA------TAAT-TTCTT-AAATA-ATT-ATGGCCC-T----T-TG-AT-CTTT-TT----AATGA-A--A----TTACATC-C-A---TT-G--CAAT----T-G-----TGCATGTCAGCGTATA-----ACTATTGAGTAACAGCATCTAC---TA-CCAAA--TTGCATTAT-CT---GATGATGA--CAAGCCTTCAGAAA--GTGATGACCTTTATTTGTT-AAGGG-TCAG-TTACCTCAAAAGTCATGGTCACTTGGGTTA-----CATCCCCA--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTTGA--GTCCGTTT-AC----TATATTGTTT-TCTTTA----T--TC-T-TTT---TCTA--TTGCATTTCTGAT---------G-TTGCACCA---------TA-----CTA-----TA----TT--TC-----C------A----------------AT-------T----------CA---------TC--------C------------TT-TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTGCTT-TT------ATTTGTTTCC--A--TCCA---CA-----T----------------------------TTT-----TTTACCATAA-CAATA----AG---------ATTT--ACGTCTCTT--GCATTATA-------A-TG-CAA--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATTTTTT-TTT-CACTCAGACCATGGCCCATTTGAGCGGCGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTACCTTGTATTC
gi|10 : aaattCATT-C-A---TT-G--TGAT----T-T-----CGCATTTCAGTCTA-------ACTAGTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TT-----TTGAAATTT-CT---TGTAA------------------A--GTAATGCCCTTTATTTG-T-TAGGGACCAA-TTACCTTAAAGGTCATGGTCACTTGGGTCA-----CATCCACA-----------T-TTTCAA------T---------AT-GTTT----GTCCTTTTAAC----TGTA-TATTT-T-TTAA----TTATT-T-TTT---TCTA--TGGCATTTCTCAT---------G-TTTCACC-------------------------CA----CT--CC-----C------AC-A---------------------------------CA---------CC--------C------------TG----CCAAACTTCCTG--------------CTCGTC-TCT-GC-TC------GTCTGTTTCTTAA--CTT-----------T-AT-----------------T-------TTT-----TTTAACATTA-CAATATATTTT---------TTTT--ACATCTCGT--GCATTAAA-------A-TG-CAGTTGCACACTG-C-------------C-------------CACATTC-A-------------CAGACAATGTTTA-TTT-TGCTGCGTCCATGGCACTTATTAGCGCGGGATATTCAAAT-----GTACTCAATTTTCTTGT-TTCa
gi|11 : TTAAGGAA-----ATTACATTCATTTG----------CAT-TTGCGTCAAAGATCAATGTCATTTGGGTCA-----C-CCTTCG--CCCTAAAAATACTT---------T-------------TTC----TACCTTTT-TT----TATATTTCTT-TAT-AA----T--TC-T-TTTGAACC-A--T-GCATTCCTTAT---------T-GTCTACCT---------TA-----CCA-----ACCTCTTT--CC-----C------AA-C-------------AT-------TAAAT------CA---------TC--------C-------------G-T-----CACATAT-GTTTC------AACC--CGC------ATATT------ACC-----CC--A--CCCA---CAATATAT-AT-----AT----------A-------TTTATAAATTTACAAATAGCAATA----TT---------TT----ACATCTCGG--ACATTATA-------G-AG-C-G--------TGAT-------------T-------------C-----C-AGTATTTATATCACCGGGCAATGTTTA-TTT-T-TTCAGTCCATGACCATTTTGAGTGGCGAATAT---AATTCCCCTCGCTGAA-GTTCTTGg
gi|12 : AACCCAGT-T-CATAT-----------------TAAAC-TTCCTATAT--AGCAA--GGAAA----T-GG-TCTGAATGTGA-GCCT-TGGCATT----TTAATGATT---------TTAT-TTTTTTATTAA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-GT-ATTTATATTGCAATTATA--A----TTA--TT-C-A---TTTA--CAAC----T-T-----TGCATTTTGACTTATA-----ACT-----------------------------A--TTGAGT----------ATGAGAATTCA--CCATCAGGAA---------CCTTTA--------AAGG-CCAA-TTACCTCAGAGGTCAAGGTCATTGGGGCCA-----CATACC----TCCC-----T-CT
gi|12 : CCATTA-CAAAA----TTG--------TTTT--ACATCTACT--GCATTATA-------ACTG-C----------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------cagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcccattacaaaattgttttacatctactgcattataactgctgttccagtactcacatcca
gi|13 : aacccagttcatattaaacttcctatatagcaaggaaatggtctgaatgtgagccttggcattttaatgattttatttttttattaagttatggccctttggtatttatattgcaattataattattcatttacaactttgcattttgacttataactattgagtatgagaattcaccatcaggaacctttaaaggccaattacctcagaggtcaaggtcattggggccacatacctccctctcagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcTTGTTA--TTTCCCGCTTTTCAA-AGATA---TTGATGG-ATA---TTGAAATGGC---GTTCGTCC---------GTCCGTC-CGTC--Agtactcacatcca
gi|13 : aacattgactgct-----------------GACAC-TTTATGTGC--AGCAG--GTACA----T-GA-TTTGAACATGA-GCCTAAAGTCTTGGCATTC-TGATTTGA------TGA---TATT-ACGGA-GTT-AT-GCTC-T----T-TA-CT-TTTT-TA----ACTTA-A--ATT--TTACATCAC-ACTTTT-GACCAACACTGT-TACAGATGCAACTCCTCCAATA-----ACT-TTGAGtttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgaacatgagcctaaagtcttggcattctgatttgatgatattacggagttatgctctttacttttttaacttaaattttacatcacacttttgaccaacactgttacagatgcaactcctccaataactttgagcctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|13 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-G-TCTT-------G--G-------C--ATTC------T--GAT-----------TT---GA--T-G--AT-A-TT---ACGGAGTTATG-C-TC-TTT-A-CTTTTTTA---------AC-TTAAA-TT----T------T-----AC-----A------------TCAC--A-----------------C-----------------TTTT-GACCAACACTGTTACAGATGCAACTCCTCCAATA----ACTTTGAGCCTAT-T-CATAT-----------------GAAATGTTGTTGGTC--AGCAA--TTACA----cctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|14 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgaacatgagcctaaaTGCTGTAT---------GTACA----T-GG-TCGAAGTATGT-GCCTGTGGTATTGGCATTC-CAGTTAAA------TAAT-ATTTT-ATTGA-GTA-ATTGCTC-T----T-TGTTT-TTTT-TA----ACTTA-G--A----TT
gi|14 : ---TG-TGCC-----TG-T-GGTATT-------G--G-------C--ATTCCAG---T--TAA-A----------T---AA--T----AT-T-TT---ATTGAGTAATTGC-TC-TTT-GTTTTTTTTA---------AC-TTAGATTT----T------G-----GC-----ATAAT--------TTGG--A-----------------CCAACA------------GTCATGA----CACT-------------ACCCTCC--CACTGTATTT--ACCAGAT-T-CAANN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN------NNNN-NNNNN-NNNNN-NNN-NNNNNNN-N----N-NN-NN-NTTT-TT----AATAA-A--A----TTACATT-T-G---TT-G--CATT----T-T-----TGCATTTCAGCCTATA-----AATATTGAGTAttggcataatttggaccaacagtcatgacactaccctcccactgtatttaccagattcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttaataaaattacatttgttgcatttttgcatttcagcctataaatattgagtatcttgatttttt
gi|15 : tgctgtatgtacatggtcgaagtaTTTTTG--TCCCCTGCTTTTCAACAAAAA---TTTGG----TTTTATTAAAATGGCACCGTCCGTCTGTCTG-TATGTCTGTC-CATC--ACGT--TT-TGGTTCATCAACT---------C----TTT--CTACAGTTGTCACTTGATTCAAATGAAACT---TGCTGAAAAGTTTGCT-G-TCTA-------A--A-------CTGGTGCCTGTGGT--GAT-ATTATTTTGATT---AA--T-T--TT-T-TTTG-ATGGAGTAGTGGC-CC-TTT-G-TTCTTTTA---------AC-TTAGATtcttgatttttt
gi|16 : tatatttcttgtt---TATGGAGA--CAGGTGTTTAGGAA--AGGATGACCTTTATATG-TTAAGGG-TCAG-TTATGTAAAAGGTCAAGGTTGTCTGGGTCA-----C-TCACTGGTCCCC-----C-CTTAAAA-----TAAACAACAAAT-CTTT----G-CCT------------TATTTTTA-TCGTAA----T--TC-T-TTT---CCTAC-TTGCA-TTCTTAT---------A-GAACACCA---------TA-----CC-------A----TT--CC-----CGATCCAAC-C-------------CC-------TAC--------CATGTCAAATTTC--------CATTGTGCCTATATG-TTTCTTCACATATTGTTT-------AAgatacttcatac
gi|17 : ca-------------C-----T-A-------------CAGGCAATGTCTG-TTT-TGCTCAGTCAGTGGCACTTTTGAGT-GCAGATAT--GAAT-----TCACTGCATTTta
gi|18 : tgtagcatattctcattctggacctttcttccaccccccccccccccccatctcatgtgaaattgccattctgcttatctgtttcttcaccatttgatgacaataccattttccattttttatgtcctatgtcccagcaagtatgctgtttcagtacccacacAAC-----------------GAAAC-TTGCCGTAC--AGCAA--GTCTAAGTGT-GG-TCTAAACATGT-GTCTGTGATCTTACCATTT-CGATTAAA------ATATGTTTTG-ATAGA-GTT-ATTGCCC------T-TG-TT-CTTT-TA----Acatgt
gi|19 : ccgaaggttgcTT---AA--TTG--AT-CCTT---ACTGAGTTATGACGTT-TTT-G-TTATTGTA---------AC-TTA-ATGT----T------TATAACAC-----AGTNNNNNNNNNNNNNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTTATGTGC--AGCAG--GT-------------CTGAA-GTGAAGCCTGGGGTCTTGGCATTC-------AA------TG------TT-ACTGA-GTT-ACTGCCC-T----T-TA-ATACTTT-T-----CATTA-A--A----TTACTTT-C-tttcgaatttaaaacatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcgaaacttgctagtggtctgaatttgtgcctcaggtatt
gi|2 : t-TAGACAAACAACTT--------CCAACAAT--CTA--------ACTCTATTCAAAT--AATT---TG-AATA-----TG-T-G-CCTG-------C--G-------C--GCTA------TTGGAATA-------AATT---AT--------T-T-TT---ATAGAGCAATGAC-AC-TTT-G-CTATTCAA---------AC-TAAG-TTT----T------T-----AC-----A------------TTAA--A-----------------C-----------------GNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAC-ATGCTGTAC--AA-AG--GTACA----T-GA-TCTGAATATTA-GCCTATAGCATTGGTGCTT-CAATTCCA------TAAT-CTGTT-ACAGA-AGT-ATGGCTT-T----T-TG-AT-CTTA-TA----AGTGA-A--A----TTACATT-T-A---TT-A--CATT----T-T-----TGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAACAACAGCATCTAC---CA--T--A--TTG-ATTTT-TT---TATGAGGA--CAGACCTTCTGGAA--GTGGTG-----TATT--------GG-CCAG-TTACCTAAGAGATCAATGTCACATAGGTCAACTCCCCCCCCCC--CCCC-----T-CTT---------C---------AA-TTTCTTTTGTTATTTT-ACGAAACAAACACTTT-TC---A----T--TC-T-TCT---TCTA--TTGCATTTCTAAT---------G-TTCCACCttctgaga
gi|2 : CT-T----T-TG-TT-ATTT-TACG--AAACA-A--ACACTTTTCATT-C-----TT----CTTC----TAT-----TGCATTTC------TA-----A-TGTT------C--CACCTTC---CATCC--A--C--AATGTT-TT---TCCGAGGA--CAGGCCTCCAGGAT--GTGATGACCTTGATTTGTT-AAGGG--CAGCTTACTTT--AGATCAACGTCACTTAAGTCA-----CATCCCCGT-CCCC-----T-Cttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|2 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-AGTACCCACATCCGCAGGCTATGGTTA-GTTGTGATCCTCCCATTGTCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----CCACTGGACTTTCTTGT-ccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|20 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttcttttgttattttacgaaacaaacacttttcattcttcttctattgcatttctaatgttccaccttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaaCT---TG-AATA-----TG-T-G-CCTGTTGTATTG--G-------G--GTTC------C--------------AATT---A---T-GTTAT-TGCC---ATGGAGTTGTGGC-CC-TTT-G-TCATTTAA---------AC-TTA--TTT----T------T-----AA-----A------------TTAC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNN---NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGTTGTAC--AGCAG--GTAGA----T-GA-TCTGTACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGT
gi|21 : actcaatgtatggagtcatggctt----T--TT-T-ATT---CATA--TTGCATTTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATACCCAA----TTCGCC-----C------ACAC-------------CC-------TGCGAGATTTCCA---------TCCTGATAATC------------TG-TTTCATCCCTTATTGATT-------AATCTTTGTC-TTG-AT-TTCCATGCACATATTTCC--CCTCCCA---CA-----A-AC-----T-----------A-------TGT-----TTAAACATTG-CACTA----TTTTTTTCAAATTTT--ACGTCTCAG--ACATTATA-------C-TA-CAC--------TA-T-------------T-------------C-----CTA-------------CA
gi|22 : tcTTA--TTCTTCGCTTTTCGA-AGAAAAGTTT----G-ATATT-TTGAAATGGC---ATCTGCCT-TTC--CA----TGTC-TTTC--A---AGTTATGGACCAACAA-----------C----AAT-----CA------A----ATTCAAACGAAACTTGCTG-TACA-----cccac
gi|22 : atattgaccttcactAATCAAAT-T-CAAAC-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--ACCAG--GTACA----T-GA-CCTAAACATGA-ACCTGTAATCTTTG---TC-CAATTTAA------TTAC-Tccaggtacatgacctaaacatgaacctgtaatctttgtccaatttaattactgagttgt
gi|23 : atattgaccttcactttattcttcgcttttcgaagaaaagtttgatattttgaaatggcatctgcctttccatgtctttcaagttatggaccaacaacC-TTT-G-TTTTTTTT---------AA-TTAGATTTCACGT------T-----GT-----A------------TTNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-NNCAAAA-----------------GAAAC-TTGCTGTGC--AGTAA--GTACC----T-GG-TCTGA------------------------TC-CGATTAAA------ATGT-TTTCG-ATAGA-TTT-ATGGTTC-T----T-AGTTT-TTTT-TA----AACTT-A--A----Tgagttgt
gi|24 : -----T-GT-----A-----------A-------TTA-----TTTTTCAGTA-CTTTG----TT---------TTTT---CATCTGG---GCATTATA-------A-TG-CAC--------TG-TTCTAGTACCCACAT-------------C-----T-A-------------CAGGC-ATGTCTG-TTC-TACTCAGTCCATCGCCCTTTTCAGCATGGGTTAC--GAAT-----TTACTGAA-TTTCTTGT-TTatttacgtcatac
gi|25 : gcccggcTTTCATCCCATT-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TC--A--CGG--TTTTACT---TATGAAGA--CATGCCTTCAGGAAATATGAGGATCTTCA
gi|26 : gtgg---ATTCAGTTATGGC-CC-TTG-G-TTATTTAA---------AC-TTA-ATTT----T------T-----GC-----A------------TTGC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTaaggtaaatggtcaccaccctcatatatttaattttgtcactgtata
gi|27 : -------------CTCCTCC--CAC---ATTTTAACCCAAT-T-CAAAT-----------------TTAGC-CAACTGTAC--AGCA---GTACA----TGGG-TCTGAATATGA-GGCCGTGGTCTTGGTATTC-CAATTgggtcctctgt
gi|28 : a-ACTGA-GTT-AAGGCCC-T----T-AA-AT-CTTT-TA----A-TGA-A--A----TTACTTT-C-G---TTTG--AAAC----T-T-----TCCATTTCAGCCTATA-----ATTATTGAGTAACAGCATCca
gi|29 : ATGAAACC---TG-C--------TA-A-G-TTTT-------G--G-------C--ATTC------T--GAG-----------TT---AA--T-G--CTAT-TT---ATTGAGTTATGG--CC-TTT-G-TTC---TA---------AC-TTA---TT----T------T-----AC-------------------TTC--A-----------------C-----------------ctcc
gi|3 : tC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG-TCTGAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGA------TTTT-TATTT-ATTGA-GTT-ATGGCTC-T----T-TG-TT-CTTT-TA----ACTTA-G--A----TTtctct
gi|3 : ---TG-AATA-----TG-T-G-CCTG-------T--GGTATCGAC--ATTC------T--GAT-A-------GATTTTTA-----------T-TT---ATTGAGTTATGGC-TC-TTT-G-TTCTTTTA---------AC-TTAGATTT-----------------A------A------------TTTC--A-----------------T-----------------------------ACT-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NNNTCTGACTATTT-GCATG-GGTATTGGAGTTT-TGATTAAA------TTAT-------------GTTCATGTCTC-T----T-TG-CT-ATTT--------ATTA-A--A-------CATT-A-A---CT-G--CAAT----T-T-----TACATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAATAGCAGCACTTAC---CA-TC-----TTGAGATTT-CT---TATGAAGA--CAGGCTTTGAGGAA--ATGATGAATTTTA-----------G-CCAG-TTAT-----------AGGTCAT---GGTCA-----CATCCCCC--TCCG-----C-CTT---------TAAATTA---AT-TTTCTA--ACCTTTTT-AC----AATAATGTTT-TCTTAA----T--TCTT-TTT---CTTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCAACA---------TATCACCCCA-----GA----CT--CCCCCCAC------AC-CCTGCCAAGTTCCTGC-------T----------CA---------T---------C------------TG-TTTCTTCACTTATTGTTT-------AATCTTGGCCATTA-TT-TT------A-----TTCC--G--ACCAATGCA-----T-ATCCCCCA-----------AGAAGATTTTT-----TTTAACATTA-CAATA----TT---------TTTTTCACATCCCAG--GCA-TAAA-------A-TG-CAG--------TA-T-------------TTCAGTACTCACACC-----C-A-------------CAGGCAATGTTTA-TTG-TACCCAGTCCATGGTCCTTATGAGTGGGGGATAT--GAAtaatttcatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctgactatttgcatgggtattggagttttgattaaattatgttcatgtctctttgctatttattaaacattaactgcaattttacatttcagcctataactattgaatagcagcacttaccatcttgagatttcttatgaagacaggctttgaggaaatgatgaattttagccagttataggtcatggtcacatccccctccgcctttaaattaattttctaacctttttacaataatgttttcttaattctttttcttattgcatttcttatgttccaacatatcaccccagactccccccacaccctgccaagttcctgctcatctgtttcttcacttattgtttaatcttggccattattttattccgaccaatgcatatcccccaagaagattttttttaacattacaatatttttttcacatcccaggcataaaatgcagtatttcagtactcacacccacaggcaatgtttattgtacccagtccatggtccttatgagtgggggatatgaaa
gi|30 : ctttctgtatatcaagtacatggtc-------------T-------------C-----C-A-------------AAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAATCCATGGCCGTATC-AGCAGGAAATAT--GAAT-----TCACTTAA-TTTCTTa
gi|31 : ttacagtacccataTTTTAAA-AAAAA---TTGGGGGGATATTG---AAATGGC---ATCTGTCTGTTTG-CACATCCGAC-TGTC--ACAT
gi|32 : ttttttaaaaccctctttTGGAGTTATGGC-CC-TTT-G-TTCTTATA---------AC-TTAGATTT----
gi|4 : -TTACTGTAC--ATCAG--GTGCA----T-TC-TCTGAACATGT-ACCTGTGGTATTGGCCTTC-AGATTAAA------TCAT-TTTCC-AAAGC-GTT-CTGGTTC-T----T-TG-TT-GTTT-TA----CAT---A--A----TTATAgatctcatatt
gi|4 : AACA---TG-TACC-----TG-T-GGTATT-------G--G-------C--CTTC-------------A-------GATT---AAATC----AT-T-TTCC-AAAGCGTTCTGGT-TC-TTT-G-TTGTTTTACATAATTATACATCAAACTN----N------N-----NN-----N------------NNNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-------------GAAAA-TTGCTGAAC--AACGG--GTACA----T-GC-TCTGAATATGA-ACCTGAAATATTGACATTAATGATTTAA------TTAT-TTCTT-ACTGA-GTT-ATGACCC-TAAGAT-TG-AC-TTTT-TA----AATAA-A--G----TTACATT-CTA---TT----TAAC----T-T-----TATAAATCAGC------------TATTGAGTGACAACACCTAA---CA-TC-----TTGAATTTG-CT---TATGAGGA--CAGTCCTTCAGAAA--GTAATGTGCTTTACTTG-TAAAGGG-TCAC-CTATCTCAAAGGTCAAAGTCACTTCGGTAA----------CCG--TACC-----T--TT---------T---------A-------------CTTTT--C----TAGATT-TTT-TCTTAAATACT--TG-TATTT---CCTT--TTGCGATTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATCCCCAA----CT--CCGCCTAC------AC-CTT-----------GCCCAGTTTC----------CA---------TC--------C------------TGCTTTCTTCACTTATTATTT-------AACGTTCGCC-catcaaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaattgctgaacaacgggtacatgctctgaatatgaacctgaaatattgacattaatgatttaattatttcttactgagttatgaccctaagattgactttttaaataaagttacattctatttaactttataaatcagctattgagtgacaacacctaacatcttgaatttgcttatgaggacagtccttcagaaagtaatgtgctttacttgtaaagggtcacctatctcaaaggtcaaagtcacttcggtaaccgtaccttttacttttctagattttttcttaaatacttgtatttccttttgcgattattatgttccaccataccatccccaactccgcctacaccttgcccagtttccatcctgctttcttcacttattatttaacgttcgcc
gi|5 : ttactgtacatcaggtgcattctctgTGAAACT----G-TGCC-----TG-T-GGTCTT-------A--A-------C--ATTC------T--------------AGTT---AA--T-G--AC-T-TTTG-ATGGAGTTATAGC-CC-TTT-G-TTCTTTTA---------AC-TTAGATTT----TATGTGAT-----ACTNNNNN------------NNNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAT--AGCAA--GTACA----T-GG-TTGGAATATGT-GCCTGTAGTATTAGAGTTT-TGCCTAAC------T--T-TTTCG-ATGGA-GTT-ATGACCC-T----T-TG-TT-CTTT-TA----ACTTA-G--A----TT
gi|5 : gtcTGGAATA---TG-TGCC-----TG-TAG-TATT-------A--G-------A--GTTT------T--GC------------CT---AA--C-----T-T-TTTCGATGGAGTTATGAC-CC-TTT-G-TTCTTTTA---------AC-TTAGATTT----TAAGTGAT-----ACTNNN-N------------NNNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-ATGCTGTAT--AGCATATGTATA----T-GG-TCAGAATACGT-GCCTGTGATATTAGAGTTT-TGACTAAC------TT----TTTG-ATGAA-GAT-ATGGCCC-T----T-TG-TT-CTTT-TA----ATTTA-G--A----TTttaagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtatagcatatgtatatggtcagaatacgtgcctgtgatattagagttttgactaactttttgatgaagatatggccctttgttcttttaatttagattttagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : gtctgaaactgtgcctgtggtcttaacattctagttaatgacttttgatggagttatagccctttgttcttttaacttagattttatgtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtatagcaagtacatggtTTCTTACATACCCCTCTTTTCGATAAATA---TTGGGGG-ATATTG---AAATGGC---ATCTGTCT----G-CA-GTCTGTCACGTT--Attagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : ataaatttacgttgtat-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AACAA--GTACA----T-GG-TCTGAACATGT-GCCAGTGGTATTGGCATTA-TGATTAAATTGTTGTTGT-TTTTT-AAGGA-GTT-ATGGCCCTT----T-TA-TT-CTTT-Tttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|6 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-T-TT---AAGGAGTTATGGC-CCTTTT-A-TTCTTTTT---------TC-CTAGATTT----TACTTCAT-----AC-----A------------TTAC--ttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|6 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttAAT-----------------GTAAC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG-TCTGAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGA------TTTT-TATTT-ATTGA-GTT-ATGGCTC-T----T-TG-TT-CTTT-TA----ACTTA-G--A----TTtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|7 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcG-TACA-----TG-T---TCTT-------ATCA-------C--GTGCA-----T--GTA-A-------AATT---AA--C-T--AT-T-TT---TTTATTTTAATGC-CC-TTT-G-TAATTTTA---------AC-TTTAATTT---------------------------------------GCGAA-----------------C-----------------GCAA--------ACC-------------CTCCTAC--AG----ATA--AAATC-ATGT-CAAAT-----------------GTCAC-TTGTTTTGC--AGCAG---TACA----T-GG-TCTAAACATAA-GAATGTAGTATTTGTGTTC-CAGCTCAA------TG-----CGT-AATGA-GTT-ATGGTCC-T----T-TG-AT-CTCT-TG----AATGG-A--A----CTACATT-C-T---TT-G--CAA-----T-T-----TGCATTTtaat
gi|7 : --TTGCATTTT-CT---TATCAGGA--CATACTTTCAGGAA--GTAATTACA-TTGTTTGTT-AAGGA-CCAG-TAATATAAAAGGCCAAGGCCAATTGGGCCA-----CAT----G--CACC-----A-TTT---------T---------GT-TTT-----GTACTT-----------CAGTGTTTGTTTTAA----T--TA-T-TTC---CCTA--TTGTA----TTGT---------G-TTCTGCCAACCCATCTCTAACT--CCA-----AA----TT--TC-----C------AT-CCG-----------GC-------T----------CA---------T---------C------------TG-TTTCTTAACTCATTGCTTATTGATAAACCTTTGCC-TTG-GT-TTC-----ATTTtcttatcaggacatactttcaggaagtaattacattgtttgttaaggaccagtaatataaaaggccaaggccaattgggccacatgcaccattttgttttgtacttcagtgtttgttttaattatttccctattgtattgtgttctgccaacccatctctaactccaaatttccatccggctcatctgtttcttaactcattgcttattgataaacctttgccttggtttcatttcatcccg
gi|8 : gtacatgttcttatcacgtgcatgtaaaattaactatttttttattttaatgccctttgtaattttaactttaatttgcgaacgcaaaccctcctacagataaaatcatgtcaaatgtcacttgttttgcagcagtacatggtctaaacataagaatgtagtatttgtgttccagctcaatgcgtaatgagttatggtcctttgatctcttgaatggaactacattctttgcaatCTGTAGATTTAGGATTC-CATTTAAA------TTAT-TTTTC-ATTGA-GTA-ATGGCCA-T----TAAG-TT-ATTT-TA----ACTTA-ATTT----TTACA-T-C-A---Tcatcccg
gi|8 : tttcattttacatcacacttt-A-------AATT---AT--T-----T-T-TC---ATTGAGTAATGGC-CA-TTAAG-TTATTTTA---------AC-TTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------TCAT--AATNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGCACTAAGTAG--GTACA----T-AT-TCTGAACATGA-GTCTGTGGTCTTGGCATTC--AATTAA-------TGAT-TT------AGACATT--TGACC-------------T-CTTT-TA------TAA-A--A----TTATATT-C-T---TT-G--AAAC----T-A-----TGCATTTCATCTTATAGATTAAGTATTGAGTAACAGCACTTTC---TA-CT-----TTGAATTTG-CT---TATGAGAA--CAGGCTTTCAGGAA--GAACTGACCTTTATTTG-TAAAGGG-CAAC-TTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgcactaagtaggtacatattctgaacatgagtctgtggtcttggcattcaattaatgatttagacatttgacctcttttataaaattatattctttgaaactatgcatttcatcttatagattaagtattgagtaacagcactttctactttgaatttgcttatgagaacaggctttcaggaagaactgacctttatttgtaaagggcaacttaactcaaaggtcaaggtcactccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa
gi|9 : tttcattttacatcacactttctgtagatttaggattccattt-GTT-ATGGCGC-T----T-TG-AT-CTTT-TT----AATGA-A--A----TAACATT-C-AT--TT-G--TAAC----T-T-----TGCAATACGGACTCTA-----TCTATTGAATAAAAGCACCTACATGTA-CA--AACGTGCATCTT-CTTCATATGGGGA--CA----T---GGAC--AT-ATGACATTCATTCGTT-AAGGG-CCAG-TTAACCCAAAGTTGAAAGTCATT---GT---------TGCCAG--CCCT-----T-GTCCAATAAAAAT---------ATATTTT----GTTCTCT---C----T------TTT-TCTTAA----T--AC-T-CCC---CCCAACCTTTATTTCTTATTCATCTTCAGCTTTCATCA---------TACTCTGCTA-----AA----TT--TC-----A------ACTT-------------GC-------T----------CA---------T---------C------------TG-TTTCTTTACTTCTTGTTG-------AATC-TCACT-TTG-A----------ATTCCTTTCA--A--CCCA---CA-----TGAT-----ACTAAAATATTTA-------TTT-----TTTCCCACTA-CAATG----TT---------TATT--TCATATCCTAAGCATAATAGAACACCA-GGACAC--------TC-A-------------T-------------C-----T-A-------------CAGGCAATTTCTATTTT-TTCTCAGTccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 111 1111 111 4444444444 22222222 1 888888888888888888888888888888 22222222222222222 111 4444444444444444444444444 111 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111 11111111111111111 1111 22222222 2222 111111111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 1111 2222222222 1111 1111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111 1 1
lowQualScore : 1 11 1 3 1 888 2 2 6 9999 111 3333333333 6 00000000 0 2 111111111111111111111111111111 6666 666 33333333333333333 1 5 55 888 1 3 99 999999 5555555555555555555555555 2 5 888 1 2 2 1 2 999999999 2 0 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00000000 33 1 3 2 2 77777777777777777 1 22 333 3333 1 1 1 33 2 55 66 1 555555 77777777 1 33 44 1 1 1 3333 1 55 1 66666 6666 4 44 1 22 6666 2 99999 0000 6666 3 77777 0 77777 0 777 88888888 6 3 555 0 44 66 0 88888 0 0 0 5555 33 3 1 1 222222222222222 99999 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 0 8888 55 4 4 777 99 3 666666666 4 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 8888888 5 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 44444 1 5 0000 5 7777777777 6666 4444444 4 4 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 4 3 2 0 66 44444 4 0
lowQualScore : . .. . . . ... . . . .... ... .......... . ........ . . .............................. .... ... ................. . . .. ... . . .. ...... ......................... . . ... . . . . . ......... . . ............................................................................................................... ........ .. . . . . ................. . .. ... .... . . . .. . .. .. . ...... ........ . .. .. . . . .... . .. . ..... .... . .. . .. .... . ..... .... .... . ..... . ..... . ... ........ . . ... . .. .. . ..... . . . .... .. . . . ............... ..... . .................................................... . . .... .. . . ... .. . ......... . ................................................................................................................... . ....... . . ...................................................................... ..... . . .... . .......... .... ....... . . ............................................................... . . . . . .. ..... . .
lowQualScore : 0 00 4 3 0 333 5 5 7 3333 777 3333333333 7 99999999 0 5 222222222222222222222222222222 0000 444 33333333333333333 3 0 00 333 8 3 22 666666 7777777777777777777777777 9 7 333 0 5 4 0 4 444444444 4 5 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77777777 55 0 7 4 4 44444444444444444 7 33 888 7777 8 8 2 55 0 11 44 0 555555 66666666 5 33 66 8 8 7 7777 7 11 7 11111 1111 4 00 7 44 1111 5 66666 5555 5555 1 77777 2 77777 8 000 88888888 5 6 888 2 66 99 2 00000 5 4 3 6666 66 3 8 0 888888888888888 11111 6 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 1 5555 55 0 0 000 55 4 000000000 0 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 9999999 1 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333 4 0 6666 0 2222222222 4444 4444444 4 4 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 4 7 5 2 99 33333 1 0
consensus : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGAAACT---TG-----------------TGCCT--GT-G-TCT-TG--GCG------TTC---TG-A-AAATT---AA--T-G--AT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CCTTT-GTTNTTTT-A---------AC-TTAGATTT----T------T-----AC-----A------------T----TNC--A-----------------C-----------------GTNA-GACC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG-TCTGAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------T---TAT-TTTTT-ATNGA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-NT-CTTT-----TA----AATT-A-A--A----TTACATT-C-A---TT-G--CAAC----T-T-----TGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA----------AA----CTC--C-----CAC-C-------------GC-------T----------CA----TCC------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--AC--CCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
Reference ( family-1759 ) : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGAAACT---TG-----------------TACAT--GT-G-TCT-TG--GCG------TTC---TG-A-AAATT---AA--C-G--AT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CCTTT-GTTNTTTT-A---------AC-TTAGATTT----T------T-----AC-----A------------T----TNC--A-----------------C-----------------GTNA-GACC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG-TCTGAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------T---TAT-TTTTT-ATNGA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-NT-CTTT-----TA----AATT-A-A--A----TTACATT-C-A---TT-G--CAAC----T-T-----TGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA----------AA----TTC--C-----CAC-C-------------GC-------T----------CA----TCC------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--AC--CCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
gi|1 : TTGGTTATTA--TCCCGCGCTTCTCGA-AGACAC--TTGGGGG-ATATTATTTAAATGAT---GTCCGCCC-TCCGTCA-GTCCGTC-CATCCGACCCAATT-TGGATCAACAACTTTGCGGCGGC----AATTCCTACA------ACCCGATTCAAATGAAACT---TG-----------------TACAT--GT---TCT--GAAGTG------TTA----A-A-AAATC---AA--C-G--AT-T-TT---ATCGAGTTATGAC-CCTCC--CTAATTT-A---------AT-TTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------T----TTT--A-----------------C-----------------GTTA-GATT--TACT-------------CTTCTCT--CA----ATTTTAAGCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGTAT--GTACA-------G-TATGAACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGTTC-CTATTAAA------T---AAT-TTCTT-AAATA-ATT-ATGGCCC-T----T-TG-AT-CTTT-----TT----AATG-A-A--A----TTACATC-C-A---TT-G--CAAT----T-G-----TGCATGTCAGCGTATA-----ACTATTGAGTAACAGCATCTAC---TA-CCAAA--TTGCATTAT-CT---GATGATGA--CAAGCCTTCAGAAA--GTGATGACCTTTATTTGTT-AAGGG-TCAG-TTACCTCAAAAGTCATGGTCACTTGGGTTA-----CATCCCCA--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTTGA--GTCCGTTT-AC----TATATTGTTT-TCTTTA----T--TC-T-TTT---TCTA--TTGCATTTCTGAT---------G-TTGCACCA---------TA-----CTA----------TA----TTT--C-----CA----------------AT-------T----------CA----TCC------------TT--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTGCTT-TT------ATTTGTTTCC--AT--CCA---CA-----T----------------------------TTT-----TTTACCATAA-CAATA----AG-ATTT---------ACGTCTCTT--GCATTATA-------A-TG-CAA--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATTTTTT-TTT-CACTCAGACCATGGCCCATTTGAGCGGCGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTACCTTGTATTC
gi|10 : aaattCATT-C-A---TT-G--TGAT----T-T-----CGCATTTCAGTCTA-------ACTAGTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TT-----TTGAAATTT-CT---TGTAA------------------A--GTAATGCCCTTTATTTG-T-TAGGGACCAA-TTACCTTAAAGGTCATGGTCACTTGGGTCA-----CATCCACA-----------T-TTTCAA------T---------AT-GTTT----GTCCTTTTAAC----TGTA-TATTT-T-TTAA----TTATT-T-TTT---TCTA--TGGCATTTCTCAT---------G-TTTCACC-----------------C-------------A----CTC--C-----CAC-A---------------------------------CA----CCC------------TG-----------CCAAACTTCCTG--------------CTCGTC-TCT-GC-TC------GTCTGTTTCTTAAC--TT-----------T-AT-----------------T-------TTT-----TTTAACATTA-CAATATATTTT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTAAA-------A-TG-CAGTTGCACACTG-C-------------C-------------CACATTC-A-------------CAGACAATGTTTA-TTT-TGCTGCGTCCATGGCACTTATTAGCGCGGGATATTCAAAT-----GTACTCAATTTTCTTGT-TTCa
gi|11 : TTAAGGAA-----ATTACATTCATTTG----------CAT-TTGCGTCAAAGATCAATGTCATTTGGGTCA-----C-CCTTCG--CCCTAAAAATACTT---------T-------------TTC----TACCTTTT-TT----TATATTTCTT-TAT-AA----T--TC-T-TTTGAACC-A--T-GCATTCCTTAT---------T-GTCTACCT---------TA-----CCA----------ACCTCTTTC--C-----CAA-C-------------AT-------TAAAT------CA----TCC-------------G--------T-----CACATAT-GTTTC------AACC--CGC------ATATT------ACC-----CC--AC--CCA---CAATATAT-AT-----AT----------A-------TTTATAAATTTACAAATAGCAATA----TT-TT-----------ACATCTCGG--ACATTATA-------G-AG-C-G--------TGAT-------------T-------------C-----C-AGTATTTATATCACCGGGCAATGTTTA-TTT-T-TTCAGTCCATGACCATTTTGAGTGGCGAATAT---AATTCCCCTCGCTGAA-GTTCTTGg
gi|12 : AACCCAGT-T-CATAT-----------------TAAAC-TTCCTATAT--AGCAA--GGAAA----T-GG-TCTGAATGTGA-GCCT-TGGCATT----TTAATGATT---------T---TAT-TTTTTTATTAA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-GT-ATTTA----TATTGCAATT-ATA--A----TTA--TT-C-A---TTTA--CAAC----T-T-----TGCATTTTGACTTATA-----ACT-----------------------------A--TTGAGT----------ATGAGAATTCA--CCATCAGGAA---------CCTTTA--------AAGG-CCAA-TTACCTCAGAGGTCAAGGTCATTGGGGCCA-----CATACC----TCCC-----T-CT
gi|12 : CCATTA-CAAAA----TTGTTTT---------ACATCTACT--GCATTATA-------ACTG-C----------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------cagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcccattacaaaattgttttacatctactgcattataactgctgttccagtactcacatcca
gi|13 : aacccagttcatattaaacttcctatatagcaaggaaatggtctgaatgtgagccttggcattttaatgattttatttttttattaagttatggccctttggtatttatattgcaattataattattcatttacaactttgcattttgacttataactattgagtatgagaattcaccatcaggaacctttaaaggccaattacctcagaggtcaaggtcattggggccacatacctccctctcagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcTTGTTA--TTTCCCGCTTTTCAA-AGATA---TTGATGG-ATA---TTGAAATGGC---GTTCGTCC---------GTCCGTC-CGTC--Agtactcacatcca
gi|13 : aacattgactgct-----------------GACAC-TTTATGTGC--AGCAG--GTACA----T-GA-TTTGAACATGA-GCCTAAAGTCTTGGCATTC-TGATTTGA------T---GA---TATT-ACGGA-GTT-AT-GCTC-T----T-TA-CT-TTTT-----TA----ACTT-A-A--ATT--TTACATCAC-ACTTTT-GACCAACACTGT-TACAGATGCAACTCCTCCAATA-----ACT-TTGAGtttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgaacatgagcctaaagtcttggcattctgatttgatgatattacggagttatgctctttacttttttaacttaaattttacatcacacttttgaccaacactgttacagatgcaactcctccaataactttgagcctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|13 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-G-TCT-TG--GCA------TTC---TG-A-T--TT---GA--T-G--AT-A-TT---ACGGAGTTATG-C-TCTTT-ACTTTTTT-A---------AC-TTAAA-TT----T------T-----AC-----A------------T----CAC--A-----------------C-----------------TTTT-GACCAACACTGTTACAGATGCAACTCCTCCAATA----ACTTTGAGCCTAT-T-CATAT-----------------GAAATGTTGTTGGTC--AGCAA--TTACA----cctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|14 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgaacatgagcctaaaTGCTGTAT---------GTACA----T-GG-TCGAAGTATGT-GCCTGTGGTATTGGCATTC-CAGTTAAA------T---AAT-ATTTT-ATTGA-GTA-ATTGCTC-T----T-TGTTT-TTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TT
gi|14 : ---TG-----------------TGCCT--GT-GGTAT-TG--GCA------TTCCAGTT-A-AA--T---AA--T----AT-T-TT---ATTGAGTAATTGC-TCTTT-GTTTTTTTTA---------AC-TTAGATTT----T------G-----GC-----A------------TAATTTGG--A-----------------CCAACA------------GTCATGAC----ACT-------------ACCCTCC--CACTGTATTT--ACCAGAT-T-CAANN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN------N---NNN-NNNNN-NNNNN-NNN-NNNNNNN-N----N-NN-NN-NTTT-----TT----AATA-A-A--A----TTACATT-T-G---TT-G--CATT----T-T-----TGCATTTCAGCCTATA-----AATATTGAGTAttggcataatttggaccaacagtcatgacactaccctcccactgtatttaccagattcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttaataaaattacatttgttgcatttttgcatttcagcctataaatattgagtatcttgatttttt
gi|15 : tgctgtatgtacatggtcgaagtaTTTTTG--TCCCCTGCTTTTCAACAAAAA---TTTGG----TTTTATTAAAATGGCACCGTCCGTCTGTCTG-TATGTCTGTC-CATC--ACGT--TT-TGGTTCATCAACT---------C----TTT--CTACAGTTGTCACTTGATTCAAATGAAACT---TGCTGAAAAGTTTGCTGTCTAAACTGGT-G-CCTGTG--GTGATATTATTT---TG-----ATT---AA--T-T--TT-T-TTTG-ATGGAGTAGTGGC-CCTTT-GTTCTTTT-A---------AC-TTAGATtcttgatttttt
gi|16 : tatatttcttgtt---TATGGAGA--CAGGTGTTTAGGAA--AGGATGACCTTTATATG-TTAAGGG-TCAG-TTATGTAAAAGGTCAAGGTTGTCTGGGTCA-----C-TCACTGGTCCCC-----C-CTTAAAA-----TAAACAACAAAT-CTTT----G-CCT------------TATTTTTA-TCGTAA----T--TC-T-TTT---CCTAC-TTGCA-TTCTTAT---------A-GAACACCA---------TA-----CCATTCCCGATCCAA----CCC--C-----TAC-C-------------ATG------T----------CAAATTTCCATTGTGCCTATATG--------TTTCTTCACATATTGTTT-------AAgatacttcatac
gi|17 : ca-------------C-----T-A-------------CAGGCAATGTCTG-TTT-TGCTCAGTCAGTGGCACTTTTGAGT-GCAGATAT--GAAT-----TCACTGCATTTta
gi|18 : tgtagcatattctcattctggacctttcttccaccccccccccccccccatctcatgtgaaattgccattctgcttatctgtttcttcaccatttgatgacaataccattttccattttttatgtcctatgtcccagcaagtatgctgtttcagtacccacacAAC-----------------GAAAC-TTGCCGTAC--AGCAA--GTCTAAGTGT-GG-TCTAAACATGT-GTCTGTGATCTTACCATTT-CGATTAAA------A---TATGTTTTG-ATAGA-GTT-ATTGCCC------T-TG-TT-CTTT-----TA----ATTTCG-A--A----TTcatgt
gi|19 : ccgaaggttgcTT---AA--TTG--AT-CCTT---ACTGAGTTATGACGTTTTT-GTTATTGT-A---------AC-TTA-ATGT----T------TATAACAC-----AGTNNNNNNNNNNN----NNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTTATGTGC--AGCAG--GT-------------CTGAA-GTGAAGCCTGGGGTCTTGGCATTC-------AA------T---G------TT-ACTGA-GTT-ACTGCCC-T----T-TA-ATACTTT-----TC----A-TT-A-A--A----TTACTTT-C-taaaacatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcgaaacttgctagtggtctgaatttgtgcctcaggtatt
gi|2 : t-TAGACAAACAACTT--------CCAACAAT--CTA--------ACTCTATTCAAAT--AATT---TG-----------------AATAT--GT-G-CCT-GC--GCG------CTA---TT-G-GAATA---AA--T-T--AT-T-TTT--ATAGAGCAATGAC-ACTTT-GCTATTCA-A---------AC-TAAG-TTT----T------T-----AC-----A------------T----TAA--A-----------------C-----------------GNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAC-ATGCTGTAC--AA-AG--GTACA----T-GA-TCTGAATATTA-GCCTATAGCATTGGTGCTT-CAATTCCA------T---AAT-CTGTT-ACAGA-AGT-ATGGCTT-T----T-TG-AT-CTTA-----TA----AGTG-A-A--A----TTACATT-T-A---TT-A--CATT----T-T-----TGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAACAACAGCATCTAC---CA--T--A--TTG-ATTTT-TT---TATGAGGA--CAGACCTTCTGGAA--GTGGTG-----TATT--------GG-CCAG-TTACCTAAGAGATCAATGTCACATAGGTCAACTCCCCCCCCCC--CCCC-----T-CTT---------C---------AA-TTTCTTTTGTTATTTT-ACGAAACAAACACTTT-TC---A----T--TC-T-TCT---TCTA--TTGCATTTCTAAT---------G-TTCCACCttctgaga
gi|2 : CT-T----T-TG-TT-ATTT-----TACG--AAAC-A-A--ACACTTTTCATT-C-----TT----CTTC----TAT-----TGCATTTC------TA-----A-TGTT------C--CACCTTC---CATCC--A--C--AATGTT-TT---TCCGAGGA--CAGGCCTCCAGGAT--GTGATGACCTTGATTTGTT-AAGGG--CAGCTTACTTT--AGATCAACGTCACTTAAGTCA-----CATCCCCGT-CCCC-----T-Cttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|2 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-AGTACCCACATCCGCAGGCTATGGTTA-GTTGTGATCCTCCCATTGTCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----CCACTGGACTTTCTTGT-ccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|20 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttcttttgttattttacgaaacaaacacttttcattcttcttctattgcatttctaatgttccaccttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaa---TG-----------------TGCCT--GTTG-TAT-TG--GGG------TTC---C-----AATT---A---T-GTTAT-TGCC---ATGGAGTTGTGGC-CCTTT-GTCATTTA-A---------AC-TTA--TTT----T------T-----AA-----A------------T----TAC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNN---NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGTTGTAC--AGCAG--GTAGA----T-GA-TCTGTACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGT
gi|21 : actcaatgtatggagtcatggcttcttgaata----T--TT-T-ATT---CATA--TTGCATTTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATACCC-----AA----TTCGCC-----CACAC-------------CC-------TGCGAGATTTCCA----TCC------------TGATAATCTGTTTCATCCCTTATTGATT-------AATCTTTGTC-TTG-AT-TTCCATGCACATATTTCC--CCTCCCA---CA-----A-AC-----T-----------A-------TGT-----TTAAACATTG-CACTA----TT-TTTTTCAAATTTTACGTCTCAG--ACATTATA-------C-TA-CAC--------TA-T-------------T-------------C-----CTA-------------CA
gi|22 : tcTTA--TTCTTCGCTTTTCGA-AGAAAAGTTT----G-ATATT-TTGAAATGGC---ATCTGCCT-TTC--CA----TGTC-TTTC--A---AGTTATGGACCAACAA-----------C----AAT-----CA------A----ATTCAAACGAAACTTGCTG-----------------TACAcccac
gi|22 : atattgaccttcactAATCAAAT-T-CAAAC-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--ACCAG--GTACA----T-GA-CCTAAACATGA-ACCTGTAATCTTTG---TC-CAATTTAA------T---TAC-Tccaggtacatgacctaaacatgaacctgtaatctttgtccaatttaattactgagttgt
gi|23 : atattgaccttcactttattcttcgcttttcgaagaaaagtttgatattttgaaatggcatctgcctttccatgtctttcaagttatggaccaacaacCTTT-GTTTTTTT-T---------AA-TTAGATTTCACGT------T-----GT-----A------------T----TNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-NNCAAAA-----------------GAAAC-TTGCTGTGC--AGTAA--GTACC----T-GG-TCTGA------------------------TC-CGATTAAA------A---TGT-TTTCG-ATAGA-TTT-ATGGTTC-T----T-AGTTT-TTTT-----TA----AACT-T-A--A----Tgagttgt
gi|24 : -----T-GT-----A-----------A-------TTA-----TTTTTCAGTA-CTTTG----TT-TTTT----------CATCTGG---GCATTATA-------A-TG-CAC--------TG-TTCTAGTACCCACAT-------------C-----T-A-------------CAGGC-ATGTCTG-TTC-TACTCAGTCCATCGCCCTTTTCAGCATGGGTTAC--GAAT-----TTACTGAA-TTTCTTGT-TTatttacgtcatac
gi|25 : gcccggcTTTCATCCCATT-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TC--A--CGG--TTTTACT---TATGAAGA--CATGCCTTCAGGAAATATGAGGATCTTCA
gi|26 : gtgg---ATTCAGTTATGGC-CCTTG-GTTATTTA-A---------AC-TTA-ATTT----T------T-----GC-----A------------T----TGC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTaaggtaaatggtcaccaccctcatatatttaattttgtcactgtata
gi|27 : -------------CTCCTCC--CAC---ATTTTAACCCAAT-T-CAAAT-----------------TTAGC-CAACTGTAC--AGCA---GTACA----TGGG-TCTGAATATGA-GGCCGTGGTCTTGGTATTC-CAATTgggtcctctgt
gi|28 : a-ACTGA-GTT-AAGGCCC-T----T-AA-AT-CTTT-----TA----A-TG-A-A--A----TTACTTT-C-G---TTTG--AAAC----T-T-----TCCATTTCAGCCTATA-----ATTATTGAGTAACAGCATCca
gi|29 : ATGAAACC---TG-----------------C---T--AA-G-TTT-TG--GCA------TTC---TG-A-G--TT---AA--T-G--CTAT-TT---ATTGAGTTATGG--CCTTT-GTTC---T-A---------AC-TTA---TT----T------T-----AC-----------------------TTC--A-----------------C-----------------ctcc
gi|3 : tC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG-TCTGAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGA------T---TTT-TATTT-ATTGA-GTT-ATGGCTC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TTtctct
gi|3 : ---TG-----------------TGCCT--GT-GGTAT-CG--ACA------TTC---TG-ATAGATTTTTA-----------T-TT---ATTGAGTTATGGC-TCTTT-GTTCTTTT-A---------AC-TTAGATTT-----------------A------A------------T----TTC--A-----------------T-----------------------------ACT-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NNNTCTGACTATTT-GCATG-GGTATTGGAGTTT-TGATTAAA------T---TAT-------------GTTCATGTCTC-T----T-TG-CT-ATTT------------ATT-A-A--A-------CATT-A-A---CT-G--CAAT----T-T-----TACATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAATAGCAGCACTTAC---CA-TC-----TTGAGATTT-CT---TATGAAGA--CAGGCTTTGAGGAA--ATGATGAATTTTA-----------G-CCAG-TTAT-----------AGGTCAT---GGTCA-----CATCCCCC--TCCG-----C-CTT---------TAAATTA---AT-TTTCTA--ACCTTTTT-AC----AATAATGTTT-TCTTAA----T--TCTT-TTT---CTTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCAACA---------TATCACCCCA----------GA----CTC--CCCCCACAC-CCTGCCAAGTTCCTGC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AATCTTGGCCATTA-TT-TT------A-----TTCC--GA--CCAATGCA-----T-ATCCCCCA-----------AGAAGATTTTT-----TTTAACATTA-CAATA----TT-TTTTTC-------ACATCCCAG--GCA-TAAA-------A-TG-CAG--------TA-T-------------TTCAGTACTCACACC-----C-A-------------CAGGCAATGTTTA-TTG-TACCCAGTCCATGGTCCTTATGAGTGGGGGATAT--GAAtaatttcatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctgactatttgcatgggtattggagttttgattaaattatgttcatgtctctttgctatttattaaacattaactgcaattttacatttcagcctataactattgaatagcagcacttaccatcttgagatttcttatgaagacaggctttgaggaaatgatgaattttagccagttataggtcatggtcacatccccctccgcctttaaattaattttctaacctttttacaataatgttttcttaattctttttcttattgcatttcttatgttccaacatatcaccccagactccccccacaccctgccaagttcctgctcatctgtttcttcacttattgtttaatcttggccattattttattccgaccaatgcatatcccccaagaagattttttttaacattacaatatttttttcacatcccaggcataaaatgcagtatttcagtactcacacccacaggcaatgtttattgtacccagtccatggtccttatgagtgggggatatgaaa
gi|30 : ctttctgtatatcaagtacatggtctgaata-------------T-------------C-----C-A-------------AAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAATCCATGGCCGTATC-AGCAGGAAATAT--GAAT-----TCACTTAA-TTTCTTa
gi|31 : ttacagtacccataTTTTAAA-AAAAA---TTGGGGGGATATTG---AAATGGC---ATCTGTCTGTTTG-CACATCCGAC-TGTC--ACAT
gi|32 : ttttttaaaaccctctttTGGAGTTATGGC-CCTTT-GTTCTTAT-A---------AC-TTAGATTT----
gi|4 : -TTACTGTAC--ATCAG--GTGCA----T-TC-TCTGAACATGT-ACCTGTGGTATTGGCCTTC-AGATTAAA------T---CAT-TTTCC-AAAGC-GTT-CTGGTTC-T----T-TG-TT-GTTT-----TA----CAT----A--A----TTATAgatctcatatt
gi|4 : AACA---TG-----------------TACCT--GT-GGTAT-TG--GCC------TTC--------AGATT---AAATC----AT-T-TTCC-AAAGCGTTCTGGT-TCTTT-GTTGTTTT-ACATAATTATACATCAAACTN----N------N-----NN-----N------------N----NNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-------------GAAAA-TTGCTGAAC--AACGG--GTACA----T-GC-TCTGAATATGA-ACCTGAAATATTGACATTAATGATTTAA------T---TAT-TTCTT-ACTGA-GTT-ATGACCC-TAAGAT-TG-AC-TTTT-----TA----AATA-A-A--G----TTACATT-CTA---TT----TAAC----T-T-----TATAAATCAGC------------TATTGAGTGACAACACCTAA---CA-TC-----TTGAATTTG-CT---TATGAGGA--CAGTCCTTCAGAAA--GTAATGTGCTTTACTTG-TAAAGGG-TCAC-CTATCTCAAAGGTCAAAGTCACTTCGGTAA----------CCG--TACC-----T--TT---------T---------A-------------CTTTT--C----TAGATT-TTT-TCTTAAATACT--TG-TATTT---CCTT--TTGCGATTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATCCCC-----AA----CTC--CGCCTACAC-CTT-----------GCCCAGTTTC----------CA----TCC------------TGC-------TTTCTTCACTTATTATTT-------AACGTTCGCC-catcaaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaattgctgaacaacgggtacatgctctgaatatgaacctgaaatattgacattaatgatttaattatttcttactgagttatgaccctaagattgactttttaaataaagttacattctatttaactttataaatcagctattgagtgacaacacctaacatcttgaatttgcttatgaggacagtccttcagaaagtaatgtgctttacttgtaaagggtcacctatctcaaaggtcaaagtcacttcggtaaccgtaccttttacttttctagattttttcttaaatacttgtatttccttttgcgattattatgttccaccataccatccccaactccgcctacaccttgcccagtttccatcctgctttcttcacttattatttaacgttcgcc
gi|5 : ttactgtacatcaggtgcattctctgTGAAACT----G-----------------TGCCT--GT-GGTCT-TA--ACA------TTC---T-----AGTT---AA--T-G--AC-T-TTTG-ATGGAGTTATAGC-CCTTT-GTTCTTTT-A---------AC-TTAGATTT----TATGTGAT-----ACTNNNNN------------N----NNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAT--AGCAA--GTACA----T-GG-TTGGAATATGT-GCCTGTAGTATTAGAGTTT-TGCCTAAC------T-----T-TTTCG-ATGGA-GTT-ATGACCC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TT
gi|5 : gtcTGGAATA---TG-----------------TGCCT--GTAG-TAT-TA--GAG------TTT---TG-C----CT---AA--C-----T-T-TTTCGATGGAGTTATGAC-CCTTT-GTTCTTTT-A---------AC-TTAGATTT----TAAGTGAT-----ACTNNN-N------------N----NNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-ATGCTGTAT--AGCATATGTATA----T-GG-TCAGAATACGT-GCCTGTGATATTAGAGTTT-TGACTAAC------T---T----TTTG-ATGAA-GAT-ATGGCCC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ATTT-A-G--A----TTttaagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtatagcatatgtatatggtcagaatacgtgcctgtgatattagagttttgactaactttttgatgaagatatggccctttgttcttttaatttagattttagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : gtctgaaactgtgcctgtggtcttaacattctagttaatgacttttgatggagttatagccctttgttcttttaacttagattttatgtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtatagcaagtacatggtTTCTTACATACCCCTCTTTTCGATAAATA---TTGGGGG-ATATTG---AAATGGC---ATCTGTCT----G-CA-GTCTGTCACGTT--Attagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : ataaatttacgttgtat-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AACAA--GTACA----T-GG-TCTGAACATGT-GCCAGTGGTATTGGCATTA-TGATTAAATTGTTGT---TGT-TTTTT-AAGGA-GTT-ATGGCCCTT----T-TA-TT-CTTTTTTCCTA----GATT-----------TTAC-TT-C-A---Tttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|6 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAT-----------------GTAAC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG-TCTGAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGA------T---TTT-TATTT-ATTGA-GTT-ATGGCTC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TTacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|7 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcG-----------------TACAT--GT---TCT-TATCACG------TGCA--TGTA-AAATT---AA--C-T--AT-T-TT---TTTATTTTAATGC-CCTTT-GTAATTTT-A---------AC-TTTAATTT-------------------------------------------GCGAA-----------------C-----------------GCAA--------ACC-------------CTCCTAC--AG----ATA--AAATC-ATGT-CAAAT-----------------GTCAC-TTGTTTTGC--AGCAG---TACA----T-GG-TCTAAACATAA-GAATGTAGTATTTGTGTTC-CAGCTCAA------TGCGTA--------AT-GA-GTT-ATGGTCC-T----T-TG-AT-CTCT-----TG----AATG-G-A--A----CTACATT-C-T---TT-G--CAA-----T-T-----TGCATTTtaat
gi|7 : --TTGCATTTT-CT---TATCAGGA--CATACTTTCAGGAA--GTAATTACA-TTGTTTGTT-AAGGA-CCAG-TAATATAAAAGGCCAAGGCCAATTGGGCCA-----CAT----G--CACC-----A-TTT---------T---------GT-TTT-----GTACTT-----------CAGTGTTTGTTTTAA----T--TA-T-TTC---CCTA--TTGTA----TTGT---------G-TTCTGCCAACCCATCTCTAACT--CCA----------AA----TTT--C-----CAT-CCG-----------GC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTAACTCATTGCTTATTGATAAACCTTTGCC-TTG-GT-TTC-----ATTTtcttatcaggacatactttcaggaagtaattacattgtttgttaaggaccagtaatataaaaggccaaggccaattgggccacatgcaccattttgttttgtacttcagtgtttgttttaattatttccctattgtattgtgttctgccaacccatctctaactccaaatttccatccggctcatctgtttcttaactcattgcttattgataaacctttgccttggtttcatttcatcccg
gi|8 : gtacatgttcttatcacgtgcatgtaaaattaactatttttttattttaatgccctttgtaattttaactttaatttgcgaacgcaaaccctcctacagataaaatcatgtcaaatgtcacttgttttgcagcagtacatggtctaaacataagaatgtagtatttgtgttccagctcaatgcgtaatgagttatggtcctttgatctcttgaatggaactacattctttgcaatCTGTAGATTTAGGATTC-CATTTAAA------T---TAT-TTTTC-ATTGA-GTA-ATGGCCA-T----TAAG-TT-ATTT-----TA----ACTT-A-ATTT----TTACA-T-C-A---Tcatcccg
gi|8 : tttcattttacatcacacttt-AAATT---AT--T-----T-T-TC---ATTGAGTAATGGC-CATTAAGTTATTTT-A---------AC-TTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------T----CAT--AATNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGCACTAAGTAG--GTACA----T-AT-TCTGAACATGA-GTCTGTGGTCTTGGCATTC--AATTAA-------T---GAT-TT------AGACATT--TGACC-------------T-CTTT-----TA----TA---A-A--A----TTATATT-C-T---TT-G--AAAC----T-A-----TGCATTTCATCTTATAGATTAAGTATTGAGTAACAGCACTTTC---TA-CT-----TTGAATTTG-CT---TATGAGAA--CAGGCTTTCAGGAA--GAACTGACCTTTATTTG-TAAAGGG-CAAC-TTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgcactaagtaggtacatattctgaacatgagtctgtggtcttggcattcaattaatgatttagacatttgacctcttttataaaattatattctttgaaactatgcatttcatcttatagattaagtattgagtaacagcactttctactttgaatttgcttatgagaacaggctttcaggaagaactgacctttatttgtaaagggcaacttaactcaaaggtcaaggtcactccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa
gi|9 : tttcattttacatcacactttctgtagatttaggattccattt-GTT-ATGGCGC-T----T-TG-AT-CTTT-----TT----AATG-A-A--A----TAACATT-C-AT--TT-G--TAAC----T-T-----TGCAATACGGACTCTA-----TCTATTGAATAAAAGCACCTACATGTA-CA--AACGTGCATCTT-CTTCATATGGGGA--CA----T---GGAC--AT-ATGACATTCATTCGTT-AAGGG-CCAG-TTAACCCAAAGTTGAAAGTCATT---GT---------TGCCAG--CCCT-----T-GTCCAATAAAAAT---------ATATTTT----GTTCTCT---C----T------TTT-TCTTAA----T--AC-T-CCC---CCCAACCTTTATTTCTTATTCATCTTCAGCTTTCATCA---------TACTCTGCTA----------AA----TTT--C-----AACTT-------------GC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTTACTTCTTGTTG-------AATC-TCACT-TTG-A----------ATTCCTTTCA--AC--CCA---CA-----TGAT-----ACTAAAATATTTA-------TTT-----TTTCCCACTA-CAATG----TT-TATT---------TCATATCCTAAGCATAATAGAACACCA-GGACAC--------TC-A-------------T-------------C-----T-A-------------CAGGCAATTTCTATTTT-TTCTCAGTccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 111 1111 111 4444444444 22222222 1 888888888888888888888888888888 22222222222222 111 111111 3333333333 11111 111 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111 11111111111111111 1111 22222222 2222 111111111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 1111 2222222222 1111 1111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111 1 1
lowQualScore : 1 11 1 3 1 888 2 2 6 9999 111 3333333333 6 00000000 0 2 111111111111111111111111111111 6666 1 11111111111111 999999 999 2 3 55 000000 3333333333 2 77777 2 5 888 1 2 2 1 2 999999999 2 0 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00000000 33 1 3 2 2 77777777777777777 1 22 333 3333 1 1 1 33 2 55 66 1 555555 77777777 1 33 44 1 1 1 3333 1 55 1 66666 6666 4 44 1 22 6666 2 99999 0000 6666 3 77777 0 77777 0 777 88888888 6 3 555 0 44 66 0 88888 0 0 0 5555 33 3 1 1 222222222222222 99999 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 0 8888 55 4 4 777 99 3 666666666 4 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 8888888 5 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 44444 1 5 0000 5 7777777777 6666 4444444 4 4 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 4 3 2 0 66 44444 4 0
lowQualScore : . .. . . . ... . . . .... ... .......... . ........ . . .............................. .... . .............. ...... ... . . .. ...... .......... . ..... . . ... . . . . . ......... . . ............................................................................................................... ........ .. . . . . ................. . .. ... .... . . . .. . .. .. . ...... ........ . .. .. . . . .... . .. . ..... .... . .. . .. .... . ..... .... .... . ..... . ..... . ... ........ . . ... . .. .. . ..... . . . .... .. . . . ............... ..... . .................................................... . . .... .. . . ... .. . ......... . ................................................................................................................. . ....... . . ...................................................................... ..... . . .... . .......... .... ....... . . ............................................................... . . . . . .. ..... . .
lowQualScore : 0 00 4 3 0 333 5 5 7 3333 777 3333333333 7 99999999 0 5 222222222222222222222222222222 0000 3 88888888888888 666666 111 8 6 00 555555 0000000000 9 33333 9 7 333 0 5 4 0 4 444444444 4 5 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77777777 55 0 7 4 4 44444444444444444 7 33 888 7777 8 8 2 55 0 11 44 0 555555 66666666 5 33 66 8 8 7 7777 7 11 7 11111 1111 4 00 7 44 1111 5 66666 5555 5555 1 77777 2 77777 8 000 88888888 5 6 888 2 66 99 2 00000 5 4 3 6666 66 3 8 0 888888888888888 11111 6 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 1 5555 55 0 0 000 55 4 000000000 0 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 9999999 1 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333 4 0 6666 0 2222222222 4444 4444444 4 4 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 4 7 5 2 99 33333 1 0
consensus : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGAAACTTG-------------TGCCT------GT-GGTNT-TG--GCG------TTC---TGA-AAATTAA-T-G--AT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CCTTT-GTTNTTTT-A---------AC-TTAGATTT----T------T-----AC-----A------------T----TNC--A-----------------C-----------------GTNA-GACC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG-TCTGAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------T---TAT-TTTTT-ATNGA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-NT-CTTT-----TA----AATT-A-A--A----TTACATT-C-A---TT-G--CAAC----T-T-----TGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA----------AACTC----C-----CAC-C-------------GC-------T----------CA----TCC------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--AC--CCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
Reference ( family-1759 ) : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGAAACTTG-------------TGCCT------GT-G-TCT-TG--GCG------TTC---TGA-AAATTAA-T-G--AT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CCTTT-GTTNTTTT-A---------AC-TTAGATTT----T------T-----AC-----A------------T----TNC--A-----------------C-----------------GTNA-GACC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG-TCTGAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------T---TAT-TTTTT-ATNGA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-NT-CTTT-----TA----AATT-A-A--A----TTACATT-C-A---TT-G--CAAC----T-T-----TGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA----------AACTC----C-----CAC-C-------------GC-------T----------CA----TCC------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--AC--CCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
gi|1 : TTGGTTATTA--TCCCGCGCTTCTCGA-AGACAC--TTGGGGG-ATATTATTTAAATGAT---GTCCGCCC-TCCGTCA-GTCCGTC-CATCCGACCCAATT-TGGATCAACAACTTTGCGGCGGC----AATTCCTACA------ACCCGATTCAAATGAAACTTG-------------TACAT------GT---TCT--GAAGTG------TTA----AA-AAATCAA-C-G--AT-T-TT---ATCGAGTTATGAC-CCTCC--CTAATTT-A---------AT-TTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------T----TTT--A-----------------C-----------------GTTA-GATT--TACT-------------CTTCTCT--CA----ATTTTAAGCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGTAT--GTACA-------G-TATGAACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGTTC-CTATTAAA------T---AAT-TTCTT-AAATA-ATT-ATGGCCC-T----T-TG-AT-CTTT-----TT----AATG-A-A--A----TTACATC-C-A---TT-G--CAAT----T-G-----TGCATGTCAGCGTATA-----ACTATTGAGTAACAGCATCTAC---TA-CCAAA--TTGCATTAT-CT---GATGATGA--CAAGCCTTCAGAAA--GTGATGACCTTTATTTGTT-AAGGG-TCAG-TTACCTCAAAAGTCATGGTCACTTGGGTTA-----CATCCCCA--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTTGA--GTCCGTTT-AC----TATATTGTTT-TCTTTA----T--TC-T-TTT---TCTA--TTGCATTTCTGAT---------G-TTGCACCA---------TA-----CTA----------TATTT----C-----CA----------------AT-------T----------CA----TCC------------TT--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTGCTT-TT------ATTTGTTTCC--AT--CCA---CA-----T----------------------------TTT-----TTTACCATAA-CAATA----AG-ATTT---------ACGTCTCTT--GCATTATA-------A-TG-CAA--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATTTTTT-TTT-CACTCAGACCATGGCCCATTTGAGCGGCGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTACCTTGTATTC
gi|10 : aaattCATT-C-A---TT-G--TGAT----T-T-----CGCATTTCAGTCTA-------ACTAGTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TT-----TTGAAATTT-CT---TGTAA------------------A--GTAATGCCCTTTATTTG-T-TAGGGACCAA-TTACCTTAAAGGTCATGGTCACTTGGGTCA-----CATCCACA-----------T-TTTCAA------T---------AT-GTTT----GTCCTTTTAAC----TGTA-TATTT-T-TTAA----TTATT-T-TTT---TCTA--TGGCATTTCTCAT---------G-TTTCACC-----------------C-------------ACTC----C-----CAC-A---------------------------------CA----CCC------------TG-----------CCAAACTTCCTG--------------CTCGTC-TCT-GC-TC------GTCTGTTTCTTAAC--TT-----------T-AT-----------------T-------TTT-----TTTAACATTA-CAATATATTTT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTAAA-------A-TG-CAGTTGCACACTG-C-------------C-------------CACATTC-A-------------CAGACAATGTTTA-TTT-TGCTGCGTCCATGGCACTTATTAGCGCGGGATATTCAAAT-----GTACTCAATTTTCTTGT-TTCa
gi|11 : TTAAGGAA-----ATTACATTCATTTG----------CAT-TTGCGTCAAAGATCAATGTCATTTGGGTCA-----C-CCTTCG--CCCTAAAAATACTT---------T-------------TTC----TACCTTTT-TT----TATATTTCTT-TAT-AA----T--TC-T-TTTGAACC-A--T-GCATTCCTTAT---------T-GTCTACCT---------TA-----CCA----------ACCTCTTTCC-----CAA-C-------------AT-------TAAAT------CA----TCC-------------G--------T-----CACATAT-GTTTC------AACC--CGC------ATATT------ACC-----CC--AC--CCA---CAATATAT-AT-----AT----------A-------TTTATAAATTTACAAATAGCAATA----TT-TT-----------ACATCTCGG--ACATTATA-------G-AG-C-G--------TGAT-------------T-------------C-----C-AGTATTTATATCACCGGGCAATGTTTA-TTT-T-TTCAGTCCATGACCATTTTGAGTGGCGAATAT---AATTCCCCTCGCTGAA-GTTCTTGg
gi|12 : AACCCAGT-T-CATAT-----------------TAAAC-TTCCTATAT--AGCAA--GGAAA----T-GG-TCTGAATGTGA-GCCT-TGGCATT----TTAATGATT---------T---TAT-TTTTTTATTAA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-GT-ATTTA----TATTGCAATT-ATA--A----TTA--TT-C-A---TTTA--CAAC----T-T-----TGCATTTTGACTTATA-----ACT-----------------------------A--TTGAGT----------ATGAGAATTCA--CCATCAGGAA---------CCTTTA--------AAGG-CCAA-TTACCTCAGAGGTCAAGGTCATTGGGGCCA-----CATACC----TCCC-----T-CT
gi|12 : CCATTA-CAAAA----TTGTTTT---------ACATCTACT--GCATTATA-------ACTG-C----------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------cagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcccattacaaaattgttttacatctactgcattataactgctgttccagtactcacatcca
gi|13 : aacccagttcatattaaacttcctatatagcaaggaaatggtctgaatgtgagccttggcattttaatgattttatttttttattaagttatggccctttggtatttatattgcaattataattattcatttacaactttgcattttgacttataactattgagtatgagaattcaccatcaggaacctttaaaggccaattacctcagaggtcaaggtcattggggccacatacctccctctcagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcTTGTTA--TTTCCCGCTTTTCAA-AGATA---TTGATGG-ATA---TTGAAATGGC---GTTCGTCC---------GTCCGTC-CGTC--Agtactcacatcca
gi|13 : aacattgactgct-----------------GACAC-TTTATGTGC--AGCAG--GTACA----T-GA-TTTGAACATGA-GCCTAAAGTCTTGGCATTC-TGATTTGA------T---GA---TATT-ACGGA-GTT-AT-GCTC-T----T-TA-CT-TTTT-----TA----ACTT-A-A--ATT--TTACATCAC-ACTTTT-GACCAACACTGT-TACAGATGCAACTCCTCCAATA-----ACT-TTGAGtttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgaacatgagcctaaagtcttggcattctgatttgatgatattacggagttatgctctttacttttttaacttaaattttacatcacacttttgaccaacactgttacagatgcaactcctccaataactttgagcctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|13 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACATG-------------AGCCT------AAAG-TCT-TG--GCA------TTC---TGA-T--TTGA-T-G--AT-A-TT---ACGGAGTTATG-C-TCTTT-ACTTTTTT-A---------AC-TTAAA-TT----T------T-----AC-----A------------T----CAC--A-----------------C-----------------TTTT-GACCAACACTGTTACAGATGCAACTCCTCCAATA----ACTTTGAGCCTAT-T-CATAT-----------------GAAATGTTGTTGGTC--AGCAA--TTACA----cctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|14 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgTGCTGTAT---------GTACA----T-GG-TCGAAGTATGT-GCCTGTGGTATTGGCATTC-CAGTTAAA------T---AAT-ATTTT-ATTGA-GTA-ATTGCTC-T----T-TGTTT-TTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TT
gi|14 : TG-------------TGCCT------GT-GGTAT-TG--GCA------TTCCAGTTA-AA--TAA-T----AT-T-TT---ATTGAGTAATTGC-TCTTT-GTTTTTTTTA---------AC-TTAGATTT----T------G-----GC-----A------------TAATTTGG--A-----------------CCAACA------------GTCATGAC----ACT-------------ACCCTCC--CACTGTATTT--ACCAGAT-T-CAANN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN------N---NNN-NNNNN-NNNNN-NNN-NNNNNNN-N----N-NN-NN-NTTT-----TT----AATA-A-A--A----TTACATT-T-G---TT-G--CATT----T-T-----TGCATTTCAGCCTATA-----AATATTGAGTAttggcataatttggaccaacagtcatgacactaccctcccactgtatttaccagattcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttaataaaattacatttgttgcatttttgcatttcagcctataaatattgagtatcttgatttttt
gi|15 : tgctgtatgtacatggtcgaagtaTTTTTG--TCCCCTGCTTTTCAACAAAAA---TTTGG----TTTTATTAAAATGGCACCGTCCGTCTGTCTG-TATGTCTGTC-CATC--ACGT--TT-TGGTTCATCAACT---------C----TTT--CTACAGTTGTCACTTGATTCAAATGAAACTTGCTGAAAAGTTTGCTGTCTAAACTGGT-G-CCTGTG--GTGATATTATTT---TG----ATTAA-T-T--TT-T-TTTG-ATGGAGTAGTGGC-CCTTT-GTTCTTTT-A---------AC-TTAGATtcttgatttttt
gi|16 : tatatttcttgtt---TATGGAGA--CAGGTGTTTAGGAA--AGGATGACCTTTATATG-TTAAGGG-TCAG-TTATGTAAAAGGTCAAGGTTGTCTGGGTCA-----C-TCACTGGTCCCC-----C-CTTAAAA-----TAAACAACAAAT-CTTT----G-CCT------------TATTTTTA-TCGTAA----T--TC-T-TTT---CCTAC-TTGCA-TTCTTAT---------A-GAACACCA---------TA-----CCATTCCCGATCCAACCC----C-----TAC-C-------------ATG------T----------CAAATTTCCATTGTGCCTATATG--------TTTCTTCACATATTGTTT-------AAgatacttcatac
gi|17 : ca-------------C-----T-A-------------CAGGCAATGTCTG-TTT-TGCTCAGTCAGTGGCACTTTTGAGT-GCAGATAT--GAAT-----TCACTGCATTTta
gi|18 : tgtagcatattctcattctggacctttcttccaccccccccccccccccatctcatgtgaaattgccattctgcttatctgtttcttcaccatttgatgacaataccattttccattttttatgtcctatgtcccagcaagtatgctgtttcagtacccacacAAC-----------------GAAAC-TTGCCGTAC--AGCAA--GTCTAAGTGT-GG-TCTAAACATGT-GTCTGTGATCTTACCATTT-CGATTAAA------A---TATGTTTTG-ATAGA-GTT-ATTGCCC------T-TG-TT-CTTT-----TA----ATTTCG-A--A----TTcatgt
gi|19 : ccgaaggttgcTTAA-TTG--AT-CCTT---ACTGAGTTATGACGTTTTT-GTTATTGT-A---------AC-TTA-ATGT----T------TATAACAC-----AGTNNNNNNNNNNN----NNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTTATGTGC--AGCAG--GT-------------CTGAA-GTGAAGCCTGGGGTCTTGGCATTC-------AA------T---G------TT-ACTGA-GTT-ACTGCCC-T----T-TA-ATACTTT-----TC----A-TT-A-A--A----TTACTTT-C-taaaacatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcgaaacttgctagtggtctgaatttgtgcctcaggtatt
gi|2 : t-TAGACAAACAACTT--------CCAACAAT--CTA--------ACTCTATTCAAAT--AATTTG-------------AATAT------GT-G-CCT-GC--GCG------CTA---TTG-GAATAAA-T-T--AT-T-TTT--ATAGAGCAATGAC-ACTTT-GCTATTCA-A---------AC-TAAG-TTT----T------T-----AC-----A------------T----TAA--A-----------------C-----------------GNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAC-ATGCTGTAC--AA-AG--GTACA----T-GA-TCTGAATATTA-GCCTATAGCATTGGTGCTT-CAATTCCA------T---AAT-CTGTT-ACAGA-AGT-ATGGCTT-T----T-TG-AT-CTTA-----TA----AGTG-A-A--A----TTACATT-T-A---TT-A--CATT----T-T-----TGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAACAACAGCATCTAC---CA--T--A--TTG-ATTTT-TT---TATGAGGA--CAGACCTTCTGGAA--GTGGTG-----TATT--------GG-CCAG-TTACCTAAGAGATCAATGTCACATAGGTCAACTCCCCCCCCCC--CCCC-----T-CTT---------C---------AA-TTTCTTTTGTTATTTT-ACGAAACAAACACTTT-TC---A----T--TC-T-TCT---TCTA--TTGCATTTCTAAT---------G-TTCCACCttctgaga
gi|2 : CT-T----T-TG-TT-ATTT-----TACG--AAAC-A-A--ACACTTTTCATT-C-----TT----CTTC----TAT-----TGCATTTC------TA-----A-TGTT------C--CACCTTC---CATCC--A--C--AATGTT-TT---TCCGAGGA--CAGGCCTCCAGGAT--GTGATGACCTTGATTTGTT-AAGGG--CAGCTTACTTT--AGATCAACGTCACTTAAGTCA-----CATCCCCGT-CCCC-----T-Cttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|2 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-AGTACCCACATCCGCAGGCTATGGTTA-GTTGTGATCCTCCCATTGTCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----CCACTGGACTTTCTTGT-ccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|20 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttcttttgttattttacgaaacaaacacttttcattcttcttctattgcatttctaatgttccaccttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaaTG-------------TGCCT------GTTG-TAT-TG--GGG------TTC---C----AATTA--T-GTTAT-TGCC---ATGGAGTTGTGGC-CCTTT-GTCATTTA-A---------AC-TTA--TTT----T------T-----AA-----A------------T----TAC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNN---NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGTTGTAC--AGCAG--GTAGA----T-GA-TCTGTACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGT
gi|21 : actcaatgtatggagtcatggcttcttgaata----T--TT-T-ATT---CATA--TTGCATTTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATACCC-----AATTCGC--C-----CACAC-------------CC-------TGCGAGATTTCCA----TCC------------TGATAATCTGTTTCATCCCTTATTGATT-------AATCTTTGTC-TTG-AT-TTCCATGCACATATTTCC--CCTCCCA---CA-----A-AC-----T-----------A-------TGT-----TTAAACATTG-CACTA----TT-TTTTTCAAATTTTACGTCTCAG--ACATTATA-------C-TA-CAC--------TA-T-------------T-------------C-----CTA-------------CA
gi|22 : tcTTA--TTCTTCGCTTTTCGA-AGAAAAGTTT----G-ATATT-TTGAAATGGC---ATCTGCCT-TTC--CA----TGTC-TTTC--A---AGTTATGGACCAACAA-----------C----AAT-----CA------A----ATTCAAACGAAACTTG----------------CT------GT-cccac
gi|22 : atattgaccttcactAATCAAAT-T-CAAAC-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--ACCAG--GTACA----T-GA-CCTAAACATGA-ACCTGTAATCTTTG---TC-CAATTTAA------T---TAC-Tacaccaggtacatgacctaaacatgaacctgtaatctttgtccaatttaattactgagttgt
gi|23 : atattgaccttcactttattcttcgcttttcgaagaaaagtttgatattttgaaatggcatctgcctttccatgtctttcaagttatggaccaacaacCTTT-GTTTTTTT-T---------AA-TTAGATTTCACGT------T-----GT-----A------------T----TNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-NNCAAAA-----------------GAAAC-TTGCTGTGC--AGTAA--GTACC----T-GG-TCTGA------------------------TC-CGATTAAA------A---TGT-TTTCG-ATAGA-TTT-ATGGTTC-T----T-AGTTT-TTTT-----TA----AACT-T-A--A----Tgagttgt
gi|24 : -----T-GT-----A-----------A-------TTA-----TTTTTCAGTA-CTTTG----TT-TTTT----------CATCTGG---GCATTATA-------A-TG-CAC--------TG-TTCTAGTACCCACAT-------------C-----T-A-------------CAGGC-ATGTCTG-TTC-TACTCAGTCCATCGCCCTTTTCAGCATGGGTTAC--GAAT-----TTACTGAA-TTTCTTGT-TTatttacgtcatac
gi|25 : gcccggcTTTCATCCCATT-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TC--A--CGG--TTTTACT---TATGAAGA--CATGCCTTCAGGAAATATGAGGATCTTCA
gi|26 : gtgg---ATTCAGTTATGGC-CCTTG-GTTATTTA-A---------AC-TTA-ATTT----T------T-----GC-----A------------T----TGC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTaaggtaaatggtcaccaccctcatatatttaattttgtcactgtata
gi|27 : -------------CTCCTCC--CAC---ATTTTAACCCAAT-T-CAAAT-----------------TTAGC-CAACTGTAC--AGCA---GTACA----TGGG-TCTGAATATGA-GGCCGTGGTCTTGGTATTC-CAATTgggtcctctgt
gi|28 : a-ACTGA-GTT-AAGGCCC-T----T-AA-AT-CTTT-----TA----A-TG-A-A--A----TTACTTT-C-G---TTTG--AAAC----T-T-----TCCATTTCAGCCTATA-----ATTATTGAGTAACAGCATCca
gi|29 : ATGAAACCTG----------------CT------AA-G-TTT-TG--GCA------TTC---TGA-G--TTAA-T-G--CTAT-TT---ATTGAGTTATGG--CCTTT-GTTC---T-A---------AC-TTA---TT----T------T-----AC-----------------------TTC--A-----------------C-----------------ctcc
gi|3 : tC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG-TCTGAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGA------T---TTT-TATTT-ATTGA-GTT-ATGGCTC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TTtctct
gi|3 : TG-------------TGCCT------GT-GGTAT-CG--ACA------TTC---TGATAGATTTT-T-A-----T-TT---ATTGAGTTATGGC-TCTTT-GTTCTTTT-A---------AC-TTAGATTT-----------------A------A------------T----TTC--A-----------------T-----------------------------ACT-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NNNTCTGACTATTT-GCATG-GGTATTGGAGTTT-TGATTAAA------T---TAT-------------GTTCATGTCTC-T----T-TG-CT-ATTT------------ATT-A-A--A-------CATT-A-A---CT-G--CAAT----T-T-----TACATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAATAGCAGCACTTAC---CA-TC-----TTGAGATTT-CT---TATGAAGA--CAGGCTTTGAGGAA--ATGATGAATTTTA-----------G-CCAG-TTAT-----------AGGTCAT---GGTCA-----CATCCCCC--TCCG-----C-CTT---------TAAATTA---AT-TTTCTA--ACCTTTTT-AC----AATAATGTTT-TCTTAA----T--TCTT-TTT---CTTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCAACA---------TATCACCCCA----------GACTC----CCCCCACAC-CCTGCCAAGTTCCTGC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AATCTTGGCCATTA-TT-TT------A-----TTCC--GA--CCAATGCA-----T-ATCCCCCA-----------AGAAGATTTTT-----TTTAACATTA-CAATA----TT-TTTTTC-------ACATCCCAG--GCA-TAAA-------A-TG-CAG--------TA-T-------------TTCAGTACTCACACC-----C-A-------------CAGGCAATGTTTA-TTG-TACCCAGTCCATGGTCCTTATGAGTGGGGGATAT--GAAtaatttcatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctgactatttgcatgggtattggagttttgattaaattatgttcatgtctctttgctatttattaaacattaactgcaattttacatttcagcctataactattgaatagcagcacttaccatcttgagatttcttatgaagacaggctttgaggaaatgatgaattttagccagttataggtcatggtcacatccccctccgcctttaaattaattttctaacctttttacaataatgttttcttaattctttttcttattgcatttcttatgttccaacatatcaccccagactccccccacaccctgccaagttcctgctcatctgtttcttcacttattgtttaatcttggccattattttattccgaccaatgcatatcccccaagaagattttttttaacattacaatatttttttcacatcccaggcataaaatgcagtatttcagtactcacacccacaggcaatgtttattgtacccagtccatggtccttatgagtgggggatatgaaa
gi|30 : ctttctgtatatcaagtacatggtctgaata-------------T-------------C-----C-A-------------AAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAATCCATGGCCGTATC-AGCAGGAAATAT--GAAT-----TCACTTAA-TTTCTTa
gi|31 : ttacagtacccataTTTTAAA-AAAAA---TTGGGGGGATATTG---AAATGGC---ATCTGTCTGTTTG-CACATCCGAC-TGTC--ACAT
gi|32 : ttttttaaaaccctctttTGGAGTTATGGC-CCTTT-GTTCTTAT-A---------AC-TTAGATTT----
gi|4 : -TTACTGTAC--ATCAG--GTGCA----T-TC-TCTGAACATGT-ACCTGTGGTATTGGCCTTC-AGATTAAA------T---CAT-TTTCC-AAAGC-GTT-CTGGTTC-T----T-TG-TT-GTTT-----TA----CAT----A--A----TTATAgatctcatatt
gi|4 : AACATG-------------TACCT------GT-GGTAT-TG--GCC------TTC-------AGATTAAAT-C--AT-T-TTCC-AAAGCGTTCTGGT-TCTTT-GTTGTTTT-ACATAATTATACATCAAACTN----N------N-----NN-----N------------N----NNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-------------GAAAA-TTGCTGAAC--AACGG--GTACA----T-GC-TCTGAATATGA-ACCTGAAATATTGACATTAATGATTTAA------T---TAT-TTCTT-ACTGA-GTT-ATGACCC-TAAGAT-TG-AC-TTTT-----TA----AATA-A-A--G----TTACATT-CTA---TT----TAAC----T-T-----TATAAATCAGC------------TATTGAGTGACAACACCTAA---CA-TC-----TTGAATTTG-CT---TATGAGGA--CAGTCCTTCAGAAA--GTAATGTGCTTTACTTG-TAAAGGG-TCAC-CTATCTCAAAGGTCAAAGTCACTTCGGTAA----------CCG--TACC-----T--TT---------T---------A-------------CTTTT--C----TAGATT-TTT-TCTTAAATACT--TG-TATTT---CCTT--TTGCGATTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATCCCC-----AACTC----CGCCTACAC-CTT-----------GCCCAGTTTC----------CA----TCC------------TGC-------TTTCTTCACTTATTATTT-------AACGTTCGCC-catcaaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaattgctgaacaacgggtacatgctctgaatatgaacctgaaatattgacattaatgatttaattatttcttactgagttatgaccctaagattgactttttaaataaagttacattctatttaactttataaatcagctattgagtgacaacacctaacatcttgaatttgcttatgaggacagtccttcagaaagtaatgtgctttacttgtaaagggtcacctatctcaaaggtcaaagtcacttcggtaaccgtaccttttacttttctagattttttcttaaatacttgtatttccttttgcgattattatgttccaccataccatccccaactccgcctacaccttgcccagtttccatcctgctttcttcacttattatttaacgttcgcc
gi|5 : ttactgtacatcaggtgcattctctgTGAAACT-G-------------TGCCT------GT-GGTCT-TA--ACA------TTC---T----AGTTAA-T-G--AC-T-TTTG-ATGGAGTTATAGC-CCTTT-GTTCTTTT-A---------AC-TTAGATTT----TATGTGAT-----ACTNNNNN------------N----NNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAT--AGCAA--GTACA----T-GG-TTGGAATATGT-GCCTGTAGTATTAGAGTTT-TGCCTAAC------T-----T-TTTCG-ATGGA-GTT-ATGACCC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TT
gi|5 : gtcTGGAATATG-------------TGCCT------GTAG-TAT-TA--GAG------TTT---TGC----CTAA-C-----T-T-TTTCGATGGAGTTATGAC-CCTTT-GTTCTTTT-A---------AC-TTAGATTT----TAAGTGAT-----ACTNNN-N------------N----NNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-ATGCTGTAT--AGCATATGTATA----T-GG-TCAGAATACGT-GCCTGTGATATTAGAGTTT-TGACTAAC------T---T----TTTG-ATGAA-GAT-ATGGCCC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ATTT-A-G--A----TTttaagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtatagcatatgtatatggtcagaatacgtgcctgtgatattagagttttgactaactttttgatgaagatatggccctttgttcttttaatttagattttagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : gtctgaaactgtgcctgtggtcttaacattctagttaatgacttttgatggagttatagccctttgttcttttaacttagattttatgtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtatagcaagtacatggtTTCTTACATACCCCTCTTTTCGATAAATA---TTGGGGG-ATATTG---AAATGGC---ATCTGTCT----G-CA-GTCTGTCACGTT--Attagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : ataaatttacgttgtat-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AACAA--GTACA----T-GG-TCTGAACATGT-GCCAGTGGTATTGGCATTA-TGATTAAATTGTTGT---TGT-TTTTT-AAGGA-GTT-ATGGCCCTT----T-TA-TT-CTTTTTTCCTA----GATT-----------TTAC-TT-C-A---Tttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|6 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAT-----------------GTAAC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG-TCTGAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGA------T---TTT-TATTT-ATTGA-GTT-ATGGCTC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TTacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|7 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcA-AAATTAA-C-T--AT-T-TT---TTTATTTTAATGC-CCTTT-GTAATTTT-A---------AC-TTTAATTT-------------------------------------------GCGAA-----------------C-----------------GCAA--------ACC-------------CTCCTAC--AG----ATA--AAATC-ATGT-CAAAT-----------------GTCAC-TTGTTTTGC--AGCAG---TACA----T-GG-TCTAAACATAA-GAATGTAGTATTTGTGTTC-CAGCTCAA------TGCGTA--------AT-GA-GTT-ATGGTCC-T----T-TG-AT-CTCT-----TG----AATG-G-A--A----CTACATT-C-T---TT-G--CAA-----T-T-----TGCATTTtaat
gi|7 : gtacatgttcttatcacgtgcatgt--TTGCATTTT-CT---TATCAGGA--CATACTTTCAGGAA--GTAATTACA-TTGTTTGTT-AAGGA-CCAG-TAATATAAAAGGCCAAGGCCAATTGGGCCA-----CAT----G--CACC-----A-TTT---------T---------GT-TTT-----GTACTT-----------CAGTGTTTGTTTTAA----T--TA-T-TTC---CCTA--TTGTA----TTGT---------G-TTCTGCCAACCCATCTCTAACT--CCA----------AATTT----C-----CAT-CCG-----------GC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTAACTCATTGCTTATTGATAAACCTTTGCC-TTG-GT-TTC-----ATTTtcttatcaggacatactttcaggaagtaattacattgtttgttaaggaccagtaatataaaaggccaaggccaattgggccacatgcaccattttgttttgtacttcagtgtttgttttaattatttccctattgtattgtgttctgccaacccatctctaactccaaatttccatccggctcatctgtttcttaactcattgcttattgataaacctttgccttggtttcatttcatcccg
gi|8 : gtacatgttcttatcacgtgcatgtaaaattaactatttttttattttaatgccctttgtaattttaactttaatttgcgaacgcaaaccctcctacagataaaatcatgtcaaatgtcacttgttttgcagcagtacatggtctaaacataagaatgtagtatttgtgttccagctcaatgcgtaatgagttatggtcctttgatctcttgaatggaactacattctttgcaatCTGTAGATTTAGGATTC-CATTTAAA------T---TAT-TTTTC-ATTGA-GTA-ATGGCCA-T----TAAG-TT-ATTT-----TA----ACTT-A-ATTT----TTACA-T-C-A---Tcatcccg
gi|8 : tttcattttacatcacacttt-AAATTAT-T-----T-T-TC---ATTGAGTAATGGC-CATTAAGTTATTTT-A---------AC-TTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------T----CAT--AATNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGCACTAAGTAG--GTACA----T-AT-TCTGAACATGA-GTCTGTGGTCTTGGCATTC--AATTAA-------T---GAT-TT------AGACATT--TGACC-------------T-CTTT-----TA----TA---A-A--A----TTATATT-C-T---TT-G--AAAC----T-A-----TGCATTTCATCTTATAGATTAAGTATTGAGTAACAGCACTTTC---TA-CT-----TTGAATTTG-CT---TATGAGAA--CAGGCTTTCAGGAA--GAACTGACCTTTATTTG-TAAAGGG-CAAC-TTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgcactaagtaggtacatattctgaacatgagtctgtggtcttggcattcaattaatgatttagacatttgacctcttttataaaattatattctttgaaactatgcatttcatcttatagattaagtattgagtaacagcactttctactttgaatttgcttatgagaacaggctttcaggaagaactgacctttatttgtaaagggcaacttaactcaaaggtcaaggtcactccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa
gi|9 : tttcattttacatcacactttctgtagatttaggattccattt-GTT-ATGGCGC-T----T-TG-AT-CTTT-----TT----AATG-A-A--A----TAACATT-C-AT--TT-G--TAAC----T-T-----TGCAATACGGACTCTA-----TCTATTGAATAAAAGCACCTACATGTA-CA--AACGTGCATCTT-CTTCATATGGGGA--CA----T---GGAC--AT-ATGACATTCATTCGTT-AAGGG-CCAG-TTAACCCAAAGTTGAAAGTCATT---GT---------TGCCAG--CCCT-----T-GTCCAATAAAAAT---------ATATTTT----GTTCTCT---C----T------TTT-TCTTAA----T--AC-T-CCC---CCCAACCTTTATTTCTTATTCATCTTCAGCTTTCATCA---------TACTCTGCTA----------AATTT----C-----AACTT-------------GC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTTACTTCTTGTTG-------AATC-TCACT-TTG-A----------ATTCCTTTCA--AC--CCA---CA-----TGAT-----ACTAAAATATTTA-------TTT-----TTTCCCACTA-CAATG----TT-TATT---------TCATATCCTAAGCATAATAGAACACCA-GGACAC--------TC-A-------------T-------------C-----T-A-------------CAGGCAATTTCTATTTT-TTCTCAGTccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 111 1111 111 4444444444 22222222 1 888888888888888888888888888888 33333333333333333333333333 3333333333 22222 111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111 11111111111111111 22222222 2222 111111111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 1111 2222222222 1111 1111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111 1 1
lowQualScore : 1 11 1 3 1 888 2 2 6 9999 111 3333333333 6 00000000 0 2 111111111111111111111111111111 6666 9999 4 44444444444444444444444444 44 3 1 55 2 4444444444 44 00000 2 5 555 1 2 2 1 2 999999999 2 9 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00000000 33 1 3 2 2 88888888888888888 1 22 444 3333 1 1 1 33 1 55 66 0 555555 66666 2 0 33 44 1 1 1 3333 1 55 1 66666 6666 4 44 1 22 3333 555 77 0 3 1 88888 1 777 88888888 6 3 555 0 44 66 0 88888 0 0 0 5555 33 3 1 1 222222222222222 99999 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 0 8888 55 4 4 777 99 3 666666666 4 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 8888888 5 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 44444 1 5 0000 5 7777777777 6666 4444444 4 4 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 4 3 2 0 66 44444 4 0
lowQualScore : . .. . . . ... . . . .... ... .......... . ........ . . .............................. .... .... . .......................... .. . . .. . .......... .. ..... . . ... . . . . . ......... . . ............................................................................................................... ........ .. . . . . ................. . .. ... .... . . . .. . .. .. . ...... ..... . . .. .. . . . .... . .. . ..... .... . .. . .. .... ... .. . . . ..... . ... ........ . . ... . .. .. . ..... . . . .... .. . . . ............... ..... . .................................................... . . .... .. . . ... .. . ......... . ................................................................................................................. . ....... . . ...................................................................... ..... . . .... . .......... .... ....... . . ............................................................... . . . . . .. ..... . .
lowQualScore : 0 00 4 3 0 333 5 5 7 3333 777 3333333333 7 99999999 0 5 222222222222222222222222222222 0000 4444 2 77777777777777777777777777 88 6 0 00 5 8888888888 66 88888 9 7 777 0 5 4 0 4 444444444 4 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77777777 55 0 7 4 4 22222222222222222 8 44 333 9999 9 9 7 66 4 55 44 1 888888 22222 0 7 99 44 9 9 8 9999 8 33 8 44444 4444 0 66 8 55 9999 999 77 8 3 0 33333 8 000 88888888 5 6 888 2 66 99 2 00000 5 4 3 6666 66 3 8 0 888888888888888 11111 6 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 1 5555 55 0 0 000 55 4 000000000 0 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 9999999 1 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333 4 0 6666 0 2222222222 4444 4444444 4 4 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 4 7 5 2 99 33333 1 0
consensus : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGA----AACNTG-------------------------TGCCTGTG-G-TATTG--GCGTTC---TGA-AAATTAA-T-G--AT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CCTTT-GTTNTTTT-A---------AC-TTAGATTT----T------T-----AC-----A------------T----TNC--A-----------------C-----------------GTNA-GACC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG-TCTGAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------T---TAT-TTTTT-ATNGA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-NT-CTTT-----TA----AATT-A-A--A----TTACATTC-A-TT-GCAACT-TTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA----------AACTC----C-----CAC-C-------------GC-------T----------CA----TCC------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--AC--CCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
Reference ( family-1759 ) : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGA----AACTTG-------------------------TGCCTGTG-G-TNTTG--GCGTTC---TGA-AAATTAA-T-G--AT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CCTTT-GTTNTTTT-A---------AC-TTAGATTT----T------T-----AC-----A------------T----TNC--A-----------------C-----------------GTNA-GACC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG-TCTGAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------T---TAT-TTTTT-ATNGA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-NT-CTTT-----TA----AATT-A-A--A----TTACATTC-A-TT-GCAACT-TTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA----------AACTC----C-----CAC-C-------------GC-------T----------CA----TCC------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--AC--CCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
gi|1 : TTGGTTATTA--TCCCGCGCTTCTCGA-AGACAC--TTGGGGG-ATATTATTTAAATGAT---GTCCGCCC-TCCGTCA-GTCCGTC-CATCCGACCCAATT-TGGATCAACAACTTTGCGGCGGC----AATTCCTACA------ACCCGATTCAAATGA----AACTTG-------------------------TACATGT-----TCTGAAGTGTTA----AA-AAATCAA-C-G--AT-T-TT---ATCGAGTTATGAC-CCTCC--CTAATTT-A---------AT-TTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------T----TTT--A-----------------C-----------------GTTA-GATT--TACT-------------CTTCTCT--CA----ATTTTAAGCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGTAT--GTACA-------G-TATGAACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGTTC-CTATTAAA------T---AAT-TTCTT-AAATA-ATT-ATGGCCC-T----T-TG-AT-CTTT-----TT----AATG-A-A--A----TTACATCC-A-TT-GCAATT-GTGCATGTCAGCGTATA-----ACTATTGAGTAACAGCATCTAC---TA-CCAAA--TTGCATTAT-CT---GATGATGA--CAAGCCTTCAGAAA--GTGATGACCTTTATTTGTT-AAGGG-TCAG-TTACCTCAAAAGTCATGGTCACTTGGGTTA-----CATCCCCA--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTTGA--GTCCGTTT-AC----TATATTGTTT-TCTTTA----T--TC-T-TTT---TCTA--TTGCATTTCTGAT---------G-TTGCACCA---------TA-----CTA----------TATTT----C-----CA----------------AT-------T----------CA----TCC------------TT--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTGCTT-TT------ATTTGTTTCC--AT--CCA---CA-----T----------------------------TTT-----TTTACCATAA-CAATA----AG-ATTT---------ACGTCTCTT--GCATTATA-------A-TG-CAA--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATTTTTT-TTT-CACTCAGACCATGGCCCATTTGAGCGGCGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTACCTTGTATTC
gi|10 : aaattCATTC-A-TT-GTGATT-TCGCATTTCAGTCTA-------ACTAGTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TT-----TTGAAATTT-CT---TGTAA------------------A--GTAATGCCCTTTATTTG-T-TAGGGACCAA-TTACCTTAAAGGTCATGGTCACTTGGGTCA-----CATCCACA-----------T-TTTCAA------T---------AT-GTTT----GTCCTTTTAAC----TGTA-TATTT-T-TTAA----TTATT-T-TTT---TCTA--TGGCATTTCTCAT---------G-TTTCACC-----------------C-------------ACTC----C-----CAC-A---------------------------------CA----CCC------------TG-----------CCAAACTTCCTG--------------CTCGTC-TCT-GC-TC------GTCTGTTTCTTAAC--TT-----------T-AT-----------------T-------TTT-----TTTAACATTA-CAATATATTTT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTAAA-------A-TG-CAGTTGCACACTG-C-------------C-------------CACATTC-A-------------CAGACAATGTTTA-TTT-TGCTGCGTCCATGGCACTTATTAGCGCGGGATATTCAAAT-----GTACTCAATTTTCTTGT-TTCa
gi|11 : TTAAGGAA-----ATTACATTCATTTG----------CAT-TTGCGTCAAAGATCAATGTCATTTGGGTCA-----C-CCTTCG--CCCTAAAAATACTT---------T-------------TTC----TACCTTTT-TT----TATATTTCTT-TAT-AA----T--TC-T-TTTGAACC-A--T-GCATTCCTTAT---------T-GTCTACCT---------TA-----CCA----------ACCTCTTTCC-----CAA-C-------------AT-------TAAAT------CA----TCC-------------G--------T-----CACATAT-GTTTC------AACC--CGC------ATATT------ACC-----CC--AC--CCA---CAATATAT-AT-----AT----------A-------TTTATAAATTTACAAATAGCAATA----TT-TT-----------ACATCTCGG--ACATTATA-------G-AG-C-G--------TGAT-------------T-------------C-----C-AGTATTTATATCACCGGGCAATGTTTA-TTT-T-TTCAGTCCATGACCATTTTGAGTGGCGAATAT---AATTCCCCTCGCTGAA-GTTCTTGg
gi|12 : AACCCAGT-T-CATAT-----------------TAAAC-TTCCTATAT--AGCAA--GGAAA----T-GG-TCTGAATGTGA-GCCT-TGGCATT----TTAATGATT---------T---TAT-TTTTTTATTAA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-GT-ATTTA----TATTGCAATT-ATA--A----TTA--TTC-A-TTTACAACT-TTGCATTTTGACTTATA-----ACT-----------------------------A--TTGAGT----------ATGAGAATTCA--CCATCAGGAA---------CCTTTA--------AAGG-CCAA-TTACCTCAGAGGTCAAGGTCATTGGGGCCA-----CATACC----TCCC-----T-CT
gi|12 : CCATTA-CAAAA----TTGTTTT---------ACATCTACT--GCATTATA-------ACTG-C----------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------cagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcccattacaaaattgttttacatctactgcattataactgctgttccagtactcacatcca
gi|13 : aacccagttcatattaaacttcctatatagcaaggaaatggtctgaatgtgagccttggcattttaatgattttatttttttattaagttatggccctttggtatttatattgcaattataattattcatttacaactttgcattttgacttataactattgagtatgagaattcaccatcaggaacctttaaaggccaattacctcagaggtcaaggtcattggggccacatacctccctctcagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcTTGTTA--TTTCCCGCTTTTCAA-AGATA---TTGATGG-ATA---TTGAAATGGC---GTTCGTCC---------GTCCGTC-CGTC--Agtactcacatcca
gi|13 : aacattgactgct----AACATG-------------------------AGCCTAAA-G-TCTTG--GCATTC---TGA-T--TTGA-T-G--AT-A-TT---ACGGAGTTATG-C-TCTTT-ACTTTTTT-A---------AC-TTAAA-TT----T------T-----AC-----A------------T----CAC--A-----------------C-----------------TTTT-GACCAACACTGTTACAGATGCAACTCCTCCAATA----ACTTTGAGCCTAT-T-CATAT-----------------GAAATGTTGTTGGTC--AGCAA--TTACA----tttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgaacatgagcctaaagtcttggcattctgatttgatgatattacggagttatgctctttacttttttaacttaaattttacatcacacttttgaccaacactgttacagatgcaactcctccaataactttgagcctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|14 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgTGCTGTAT---------GTACA----T-GG-TCGAAGTATGT-GCCTGTGGTATTGGCATTC-CAGTTAAA------T---AAT-ATTTT-ATTGA-GTA-ATTGCTC-T----T-TGTTT-TTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TT
gi|14 : TG-------------------------TGCCTGTG-G-TATTG--GCATTCCAGTTA-AA--TAA-T----AT-T-TT---ATTGAGTAATTGC-TCTTT-GTTTTTTTTA---------AC-TTAGATTT----T------G-----GC-----A------------TAATTTGG--A-----------------CCAACA------------GTCATGAC----ACT-------------ACCCTCC--CACTGTATTT--ACCAGAT-T-CAANN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN------N---NNN-NNNNN-NNNNN-NNN-NNNNNNN-N----N-NN-NN-NTTT-----TT----AATA-A-A--A----TTACATTT-G-TT-GCATTT-TTGCATTTCAGCCTATA-----AATATTGAGTAttggcataatttggaccaacagtcatgacactaccctcccactgtatttaccagattcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttaataaaattacatttgttgcatttttgcatttcagcctataaatattgagtatcttgatttttt
gi|15 : tgctgtatgtacatggtcgaagtaTTTTTG--TCCCCTGCTTTTCAACAAAAA---TTTGG----TTTTATTAAAATGGCACCGTCCGTCTGTCTG-TATGTCTGTC-CATC--ACGT--TT-TGGTTCATCAACT---------C----TTT--CTACAGTTGTCACTTGATTCAAATGA----AACTTGCTGAAAAGTTTGCTGTCTAAACTGGTGCCTGTG-G-TGATA--TTATTT---TG----ATTAA-T-T--TT-T-TTTG-ATGGAGTAGTGGC-CCTTT-GTTCTTTT-A---------AC-TTAGATtcttgatttttt
gi|16 : tatatttcttgtt---TATGGAGA--CAGGTGTTTAGGAA--AGGATGACCTTTATATG-TTAAGGG-TCAG-TTATGTAAAAGGTCAAGGTTGTCTGGGTCA-----C-TCACTGGTCCCC-----C-CTTAAAA-----TAAACAACAAAT-CTTT----G-CCT------------TATTTTTA-TCGTAA----T--TC-T-TTT---CCTAC-TTGCA-TTCTTAT---------A-GAACACCA---------TA-----CCATTCCCGATCCAACCC----C-----TAC-C-------------ATG------T----------CAAATTTCCATTGTGCCTATATG--------TTTCTTCACATATTGTTT-------AAgatacttcatac
gi|17 : ca-------------C-----T-A-------------CAGGCAATGTCTG-TTT-TGCTCAGTCAGTGGCACTTTTGAGT-GCAGATAT--GAAT-----TCACTGCATTTta
gi|18 : tgtagcatattctcattctggacctttcttccaccccccccccccccccatctcatgtgaaattgccattctgcttatctgtttcttcaccatttgatgacaataccattttccattttttatgtcctatgtcccagcaagtatgctgtttcagtacccacacAAC-----------------GAAAC-TTGCCGTAC--AGCAA--GTCTAAGTGT-GG-TCTAAACATGT-GTCTGTGATCTTACCATTT-CGATTAAA------A---TATGTTTTG-ATAGA-GTT-ATTGCCC------T-TG-TT-CTTT-----TA----ATTTCG-A--A----TTcatgt
gi|19 : ccgaaggttgcTTAA-TTG--AT-CCTT---ACTGAGTTATGACGTTTTT-GTTATTGT-A---------AC-TTA-ATGT----T------TATAACAC-----AGTNNNNNNNNNNN----NNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTTATGTGC--AGCAG--GT-------------CTGAA-GTGAAGCCTGGGGTCTTGGCATTC-------AA------T---G------TT-ACTGA-GTT-ACTGCCC-T----T-TA-ATACTTT-----TC----A-TT-A-A--A----TTACTTTC-taaaacatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcgaaacttgctagtggtctgaatttgtgcctcaggtatt
gi|2 : t-TAGACAAACAACTT--------CCAACAAT--CTA--------ACTCTATTCAAATAATTTGAATATG-------------------------TGCCTGCGCGCTATTG--GAAT---------AAATTA--T-----T-T-TT---ATAGAGCAATGAC-ACTTT-GCTATTCA-A---------AC-TAAG-TTT----T------T-----AC-----A------------T----TAA--A-----------------C-----------------GNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAC-ATGCTGTAC--AA-AG--GTACA----T-GA-TCTGAATATTA-GCCTATAGCATTGGTGCTT-CAATTCCA------T---AAT-CTGTT-ACAGA-AGT-ATGGCTT-T----T-TG-AT-CTTA-----TA----AGTG-A-A--A----TTACATTT-A-TT-ACATTT-TTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAACAACAGCATCTAC---CA--T--A--TTG-ATTTT-TT---TATGAGGA--CAGACCTTCTGGAA--GTGGTG-----TATT--------GG-CCAG-TTACCTAAGAGATCAATGTCACATAGGTCAACTCCCCCCCCCC--CCCC-----T-CTT---------C---------AA-TTTCTTTTGTTATTTT-ACGAAACAAACACTTT-TC---A----T--TC-T-TCT---TCTA--TTGCATTTCTAAT---------G-TTCCACCttctgaga
gi|2 : CT-T----T-TG-TT-ATTT-----TACG--AAAC-A-A--ACACTTTTCATTC---TT--CTTCTATTGCATTTC------TA-----A-TGTT------C--CACCTTC---CATCC--A--C--AATGTT-TT---TCCGAGGA--CAGGCCTCCAGGAT--GTGATGACCTTGATTTGTT-AAGGG--CAGCTTACTTT--AGATCAACGTCACTTAAGTCA-----CATCCCCGT-CCCC-----T-Cttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|2 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-AGTACCCACATCCGCAGGCTATGGTTA-GTTGTGATCCTCCCATTGTCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----CCACTGGACTTTCTTGT-ccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|20 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttcttttgttattttacgaaacaaacacttttcattcttcttctattgcatttctaatgttccaccttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaaTG-------------------------TGCCTGTT-G-TATTG--GGGTTC---C----AATTA--T-GTTAT-TGCC---ATGGAGTTGTGGC-CCTTT-GTCATTTA-A---------AC-TT--ATTT----T------T-----AA-----A------------T----TAC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNN---NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGTTGTAC--AGCAG--GTAGA----T-GA-TCTGTACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGT
gi|21 : actcaatgtatggagtcatggcttcttgaata----T--TT-T-ATT---CATA--TTGCATTTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATACCC-----AATTCGC--C-----CACAC-------------CC-------TGCGAGATTTCCA----TCC------------TGATAATCTGTTTCATCCCTTATTGATT-------AATCTTTGTC-TTG-AT-TTCCATGCACATATTTCC--CCTCCCA---CA-----A-AC-----T-----------A-------TGT-----TTAAACATTG-CACTA----TT-TTTTTCAAATTTTACGTCTCAG--ACATTATA-------C-TA-CAC--------TA-T-------------T-------------C-----CTA-------------CA
gi|22 : tcTTA--TTCTTCGCTTTTCGA-AGAAAAGTTT----G-ATATT-TTGAAATGGC---ATCTGCCT-TTC--CA----TGTC-TTTC--A---AGTTATGGACCAACAA-----------C----AAT-----CA------A----ATTCAAACGA----AACTTG----------------------------CTGTcccac
gi|22 : atattgaccttcactAATCAAAT-T-CAAAC-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--ACCAG--GTACA----T-GA-CCTAAACATGA-ACCTGTAATCTTTG---TC-CAATTTAA------T---TAC-Tacaccaggtacatgacctaaacatgaacctgtaatctttgtccaatttaattactgagttgt
gi|23 : atattgaccttcactttattcttcgcttttcgaagaaaagtttgatattttgaaatggcatctgcctttccatgtctttcaagttatggaccaacaacCTTT-GTTTTTTT-T---------AA-TTAGATTTCACGT------T-----GT-----A------------T----TNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-NNCAAAA-----------------GAAAC-TTGCTGTGC--AGTAA--GTACC----T-GG-TCTGA------------------------TC-CGATTAAA------A---TGT-TTTCG-ATAGA-TTT-ATGGTTC-T----T-AGTTT-TTTT-----TA----AACT-T-A--A----Tgagttgt
gi|24 : -----T-GT-----A-----------A-------TTA-----TTTTTCAGTA-CTTTG----TT-TTTT----------CATCTGG---GCATTATA-------A-TG-CAC--------TG-TTCTAGTACCCACAT-------------C-----T-A-------------CAGGC-ATGTCTG-TTC-TACTCAGTCCATCGCCCTTTTCAGCATGGGTTAC--GAAT-----TTACTGAA-TTTCTTGT-TTatttacgtcatac
gi|25 : gcccggcTTTCATCCCATT-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TC--A--CGG--TTTTACT---TATGAAGA--CATGCCTTCAGGAAATATGAGGATCTTCA
gi|26 : gtgg---ATTCAGTTATGGC-CCTTG-GTTATTTA-A---------AC-TTA-ATTT----T------T-----GC-----A------------T----TGC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTaaggtaaatggtcaccaccctcatatatttaattttgtcactgtata
gi|27 : -------------CTCCTCC--CAC---ATTTTAACCCAAT-T-CAAAT-----------------TTAGC-CAACTGTAC--AGCA---GTACA----TGGG-TCTGAATATGA-GGCCGTGGTCTTGGTATTC-CAATTgggtcctctgt
gi|28 : a-ACTGA-GTT-AAGGCCC-T----T-AA-AT-CTTT-----TA----A-TG-A-A--A----TTACTTTC-G-TTTGAAACT-TTCCATTTCAGCCTATA-----ATTATTGAGTAACAGCATCca
gi|29 : ATGA----AACCTG----------------------------CTA-A-G-TTTTG--GCATTC---TGA-G--TTAA-T-G--CTAT-TT---ATTGAGTTATGG--CCTTT-GTTC---T-A---------AC-TTA---TT----T------T-----AC-----------------------TTC--A-----------------C-----------------ctcc
gi|3 : tC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG-TCTGAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGA------T---TTT-TATTT-ATTGA-GTT-ATGGCTC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TTtctct
gi|3 : TG-------------------------TGCCTGTG-G-TATCG--ACATTC---TGATAGATTTT-T-A-----T-TT---ATTGAGTTATGGC-TCTTT-GTTCTTTT-A---------AC-TTAGATTT-----------------A------A------------T----TTC--A-----------------T-----------------------------ACT-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NNNTCTGACTATTT-GCATG-GGTATTGGAGTTT-TGATTAAA------T---TAT-------------GTTCATGTCTC-T----T-TG-CT-ATTT------------ATT-A-A--A-------CATTA-A-CT-GCAATT-TTACATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAATAGCAGCACTTAC---CA-TC-----TTGAGATTT-CT---TATGAAGA--CAGGCTTTGAGGAA--ATGATGAATTTTA-----------G-CCAG-TTAT-----------AGGTCAT---GGTCA-----CATCCCCC--TCCG-----C-CTT---------TAAATTA---AT-TTTCTA--ACCTTTTT-AC----AATAATGTTT-TCTTAA----T--TCTT-TTT---CTTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCAACA---------TATCACCCCA----------GACTC----CCCCCACAC-CCTGCCAAGTTCCTGC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AATCTTGGCCATTA-TT-TT------A-----TTCC--GA--CCAATGCA-----T-ATCCCCCA-----------AGAAGATTTTT-----TTTAACATTA-CAATA----TT-TTTTTC-------ACATCCCAG--GCA-TAAA-------A-TG-CAG--------TA-T-------------TTCAGTACTCACACC-----C-A-------------CAGGCAATGTTTA-TTG-TACCCAGTCCATGGTCCTTATGAGTGGGGGATAT--GAAtaatttcatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctgactatttgcatgggtattggagttttgattaaattatgttcatgtctctttgctatttattaaacattaactgcaattttacatttcagcctataactattgaatagcagcacttaccatcttgagatttcttatgaagacaggctttgaggaaatgatgaattttagccagttataggtcatggtcacatccccctccgcctttaaattaattttctaacctttttacaataatgttttcttaattctttttcttattgcatttcttatgttccaacatatcaccccagactccccccacaccctgccaagttcctgctcatctgtttcttcacttattgtttaatcttggccattattttattccgaccaatgcatatcccccaagaagattttttttaacattacaatatttttttcacatcccaggcataaaatgcagtatttcagtactcacacccacaggcaatgtttattgtacccagtccatggtccttatgagtgggggatatgaaa
gi|30 : ctttctgtatatcaagtacatggtctgaata-------------T-------------C-----C-A-------------AAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAATCCATGGCCGTATC-AGCAGGAAATAT--GAAT-----TCACTTAA-TTTCTTa
gi|31 : ttacagtacccataTTTTAAA-AAAAA---TTGGGGGGATATTG---AAATGGC---ATCTGTCTGTTTG-CACATCCGAC-TGTC--ACAT
gi|32 : ttttttaaaaccctctttTGGAGTTATGGC-CCTTT-GTTCTTAT-A---------AC-TTAGATTT----
gi|4 : -TTACTGTAC--ATCAG--GTGCA----T-TC-TCTGAACATGT-ACCTGTGGTATTGGCCTTC-AGATTAAA------T---CAT-TTTCC-AAAGC-GTT-CTGGTTC-T----T-TG-TT-GTTT-----TA----CAT----A--A----TTATAgatctcatatt
gi|4 : ----AACATG-------------------------TACCTGTG-G-TATTG--GCCTTC-------AGATTAAAT-C--AT-T-TTCC-AAAGCGTTCTGGT-TCTTT-GTTGTTTT-ACATAATTATACATCAAACTN----N------N-----NN-----N------------N----NNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-------------GAAAA-TTGCTGAAC--AACGG--GTACA----T-GC-TCTGAATATGA-ACCTGAAATATTGACATTAATGATTTAA------T---TAT-TTCTT-ACTGA-GTT-ATGACCC-TAAGAT-TG-AC-TTTT-----TA----AATA-A-A--G----TTACATTCTA-TT--TAACT-TTATAAATCAGC------------TATTGAGTGACAACACCTAA---CA-TC-----TTGAATTTG-CT---TATGAGGA--CAGTCCTTCAGAAA--GTAATGTGCTTTACTTG-TAAAGGG-TCAC-CTATCTCAAAGGTCAAAGTCACTTCGGTAA----------CCG--TACC-----T--TT---------T---------A-------------CTTTT--C----TAGATT-TTT-TCTTAAATACT--TG-TATTT---CCTT--TTGCGATTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATCCCC-----AACTC----CGCCTACAC-CTT-----------GCCCAGTTTC----------CA----TCC------------TGC-------TTTCTTCACTTATTATTT-------AACGTTCGCC-catcaaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaattgctgaacaacgggtacatgctctgaatatgaacctgaaatattgacattaatgatttaattatttcttactgagttatgaccctaagattgactttttaaataaagttacattctatttaactttataaatcagctattgagtgacaacacctaacatcttgaatttgcttatgaggacagtccttcagaaagtaatgtgctttacttgtaaagggtcacctatctcaaaggtcaaagtcacttcggtaaccgtaccttttacttttctagattttttcttaaatacttgtatttccttttgcgattattatgttccaccataccatccccaactccgcctacaccttgcccagtttccatcctgctttcttcacttattatttaacgttcgcc
gi|5 : ttactgtacatcaggtgcattctctgTGA----AACT-G-------------------------TGCCTGTG-G-TCTTA--ACATTC---T----AGTTAA-T-G--AC-T-TTTG-ATGGAGTTATAGC-CCTTT-GTTCTTTT-A---------AC-TTAGATTT----TATGTGAT-----ACTNNNNN------------N----NNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAT--AGCAA--GTACA----T-GG-TTGGAATATGT-GCCTGTAGTATTAGAGTTT-TGCCTAAC------T-----T-TTTCG-ATGGA-GTT-ATGACCC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TT
gi|5 : gtcTGG----AATATG-------------------------TGCCTGTA-G-TATTA--GAGTTT---TGC----CTAA-C-----T-T-TTTCGATGGAGTTATGAC-CCTTT-GTTCTTTT-A---------AC-TTAGATTT----TAAGTGAT-----ACTNNN-N------------N----NNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-ATGCTGTAT--AGCATATGTATA----T-GG-TCAGAATACGT-GCCTGTGATATTAGAGTTT-TGACTAAC------T---T----TTTG-ATGAA-GAT-ATGGCCC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ATTT-A-G--A----TTttaagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtatagcatatgtatatggtcagaatacgtgcctgtgatattagagttttgactaactttttgatgaagatatggccctttgttcttttaatttagattttagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : gtctgaaactgtgcctgtggtcttaacattctagttaatgacttttgatggagttatagccctttgttcttttaacttagattttatgtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtatagcaagtacatggtTTCTTACATACCCCTCTTTTCGATAAATA---TTGGGGG-ATATTG---AAATGGC---ATCTGTCT----G-CA-GTCTGTCACGTT--Attagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : ataaatttacgttgtat-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AACAA--GTACA----T-GG-TCTGAACATGT-GCCAGTGGTATTGGCATTA-TGATTAAATTGTTGT---TGT-TTTTT-AAGGA-GTT-ATGGCCCTT----T-TA-TT-CTTTTTTCCTA----GATT-----------TTAC-TTC-A-Tttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|6 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAT-----------------GTAAC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG-TCTGAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGA------T---TTT-TATTT-ATTGA-GTT-ATGGCTC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TTacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|7 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcA-AAATTAA-C-T--AT-T-TT---TTTATTTTAATGC-CCTTT-GTAATTTT-A---------AC-TTTAATTT-------------------------------------------GCGAA-----------------C-----------------GCAA--------ACC-------------CTCCTAC--AG----ATA--AAATC-ATGT-CAAAT-----------------GTCAC-TTGTTTTGC--AGCAG---TACA----T-GG-TCTAAACATAA-GAATGTAGTATTTGTGTTC-CAGCTCAA------TGCGTA--------AT-GA-GTT-ATGGTCC-T----T-TG-AT-CTCT-----TG----AATG-G-A--A----CTACATTC-T-TT-GCAA-T-TTGCATTTtaat
gi|7 : gtacatgttcttatcacgtgcatgt--TTGCATTTT-CT---TATCAGGA--CATACTTTCAGGAA--GTAATTACA-TTGTTTGTT-AAGGA-CCAG-TAATATAAAAGGCCAAGGCCAATTGGGCCA-----CAT----G--CACC-----A-TTT---------T---------GT-TTT-----GTACTT-----------CAGTGTTTGTTTTAA----T--TA-T-TTC---CCTA--TTGTA----TTGT---------G-TTCTGCCAACCCATCTCTAACT--CCA----------AATTT----C-----CAT-CCG-----------GC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTAACTCATTGCTTATTGATAAACCTTTGCC-TTG-GT-TTC-----ATTTtcttatcaggacatactttcaggaagtaattacattgtttgttaaggaccagtaatataaaaggccaaggccaattgggccacatgcaccattttgttttgtacttcagtgtttgttttaattatttccctattgtattgtgttctgccaacccatctctaactccaaatttccatccggctcatctgtttcttaactcattgcttattgataaacctttgccttggtttcatttcatcccg
gi|8 : gtacatgttcttatcacgtgcatgtaaaattaactatttttttattttaatgccctttgtaattttaactttaatttgcgaacgcaaaccctcctacagataaaatcatgtcaaatgtcacttgttttgcagcagtacatggtctaaacataagaatgtagtatttgtgttccagctcaatgcgtaatgagttatggtcctttgatctcttgaatggaactacattctttgcaatCTGTAGATTTAGGATTC-CATTTAAA------T---TAT-TTTTC-ATTGA-GTA-ATGGCCA-T----TAAG-TT-ATTT-----TA----ACTT-A-ATTT----TTACA-TC-A-Tcatcccg
gi|8 : tttcattttacatcacacttt-AAATTAT-T-----T-T-TC---ATTGAGTAATGGC-CATTAAGTTATTTT-A---------AC-TTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------T----CAT--AATNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGCACTAAGTAG--GTACA----T-AT-TCTGAACATGA-GTCTGTGGTCTTGGCATTC--AATTAA-------T---GAT-TT------AGACATT--TGACC-------------T-CTTT-----TA----TA---A-A--A----TTATATTC-T-TT-GAAACT-ATGCATTTCATCTTATAGATTAAGTATTGAGTAACAGCACTTTC---TA-CT-----TTGAATTTG-CT---TATGAGAA--CAGGCTTTCAGGAA--GAACTGACCTTTATTTG-TAAAGGG-CAAC-TTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgcactaagtaggtacatattctgaacatgagtctgtggtcttggcattcaattaatgatttagacatttgacctcttttataaaattatattctttgaaactatgcatttcatcttatagattaagtattgagtaacagcactttctactttgaatttgcttatgagaacaggctttcaggaagaactgacctttatttgtaaagggcaacttaactcaaaggtcaaggtcactccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa
gi|9 : tttcattttacatcacactttctgtagatttaggattccattt-GTT-ATGGCGC-T----T-TG-AT-CTTT-----TT----AATG-A-A--A----TAACATTC-ATTT-GTAACT-TTGCAATACGGACTCTA-----TCTATTGAATAAAAGCACCTACATGTA-CA--AACGTGCATCTT-CTTCATATGGGGA--CA----T---GGAC--AT-ATGACATTCATTCGTT-AAGGG-CCAG-TTAACCCAAAGTTGAAAGTCATT---GT---------TGCCAG--CCCT-----T-GTCCAATAAAAAT---------ATATTTT----GTTCTCT---C----T------TTT-TCTTAA----T--AC-T-CCC---CCCAACCTTTATTTCTTATTCATCTTCAGCTTTCATCA---------TACTCTGCTA----------AATTT----C-----AACTT-------------GC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTTACTTCTTGTTG-------AATC-TCACT-TTG-A----------ATTCCTTTCA--AC--CCA---CA-----TGAT-----ACTAAAATATTTA-------TTT-----TTTCCCACTA-CAATG----TT-TATT---------TCATATCCTAAGCATAATAGAACACCA-GGACAC--------TC-A-------------T-------------C-----T-A-------------CAGGCAATTTCTATTTT-TTCTCAGTccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 111 1111 111 4444444444 22222222 1 888888888888888888888888888888 33333333333333333333333333 3333333333 22222 111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111 11111111111111111 22222222 2222 111111111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 1111 2222222222 1111 1111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111 1 1
lowQualScore : 1 11 1 3 1 888 2 2 6 9999 111 3333333333 6 00000000 0 2 111111111111111111111111111111 6666 7777 4 44444444444444444444444444 44 3 3 55 2 4444444444 44 00000 2 5 555 1 2 2 1 2 999999999 2 9 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00000000 33 1 3 2 2 88888888888888888 1 22 333 4444 2 2 1 33 1 66 77 0 77777777777777777777 55 2 2 1 4444 1 33 1 66666 6666 3 55 1 22 4444 555 77 0 3 1 88888 1 777 88888888 6 3 555 0 44 66 0 88888 0 0 0 5555 33 3 1 1 222222222222222 99999 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 0 8888 55 4 4 777 99 3 666666666 4 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 8888888 5 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 44444 1 5 0000 5 7777777777 6666 4444444 4 4 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 4 3 2 0 66 44444 4 0
lowQualScore : . .. . . . ... . . . .... ... .......... . ........ . . .............................. .... .... . .......................... .. . . .. . .......... .. ..... . . ... . . . . . ......... . . ............................................................................................................... ........ .. . . . . ................. . .. ... .... . . . .. . .. .. . .................... .. . . . .... . .. . ..... .... . .. . .. .... ... .. . . . ..... . ... ........ . . ... . .. .. . ..... . . . .... .. . . . ............... ..... . .................................................... . . .... .. . . ... .. . ......... . ................................................................................................................. . ....... . . ...................................................................... ..... . . .... . .......... .... ....... . . ............................................................... . . . . . .. ..... . .
lowQualScore : 0 00 4 3 0 333 5 5 7 3333 777 3333333333 7 99999999 0 5 222222222222222222222222222222 0000 1111 2 77777777777777777777777777 88 6 5 00 5 8888888888 66 88888 9 7 777 0 5 4 0 4 444444444 4 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77777777 55 0 7 4 4 22222222222222222 8 55 999 0000 0 0 5 77 9 00 22 6 11111111111111111111 11 0 0 9 0000 9 66 9 77777 7777 4 33 9 66 0000 999 77 8 3 0 33333 8 000 88888888 5 6 888 2 66 99 2 00000 5 4 3 6666 66 3 8 0 888888888888888 11111 6 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 1 5555 55 0 0 000 55 4 000000000 0 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 9999999 1 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333 4 0 6666 0 2222222222 4444 4444444 4 4 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 4 7 5 2 99 33333 1 0
consensus : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGA----AACATG-------------------------TGCCTGTG-G-TATTG--GCGTTC---TGA-AAATTAA-T-G--AT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CCTTT-GTTNTTTT-A---------AC-TTAGATTT----T------T-----AC-----A------------T----TNC--A-----------------C-----------------GTNA-GACC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG-TCTGAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------T---TAT-TTTTT-ATNGA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-NT-CTTT-----TA----AATT-A-A--A----TTACATTC-A-TT-GCAACT-TTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA----------AACTC----C-----CAC-C-------------GC-------T----------CA----TCC------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--AC--CCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
Reference ( family-1759 ) : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGA----AACNTG-------------------------TGCCTGTG-G-TATTG--GCGTTC---TGA-AAATTAA-T-G--AT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CCTTT-GTTNTTTT-A---------AC-TTAGATTT----T------T-----AC-----A------------T----TNC--A-----------------C-----------------GTNA-GACC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG-TCTGAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------T---TAT-TTTTT-ATNGA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-NT-CTTT-----TA----AATT-A-A--A----TTACATTC-A-TT-GCAACT-TTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA----------AACTC----C-----CAC-C-------------GC-------T----------CA----TCC------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--AC--CCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
gi|1 : TTGGTTATTA--TCCCGCGCTTCTCGA-AGACAC--TTGGGGG-ATATTATTTAAATGAT---GTCCGCCC-TCCGTCA-GTCCGTC-CATCCGACCCAATT-TGGATCAACAACTTTGCGGCGGC----AATTCCTACA------ACCCGATTCAAATGA----AACTTG-------------------------TACATGT----T-CTGAAGTGTTA----AA-AAATCAA-C-G--AT-T-TT---ATCGAGTTATGAC-CCTCC--CTAATTT-A---------AT-TTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------T----TTT--A-----------------C-----------------GTTA-GATT--TACT-------------CTTCTCT--CA----ATTTTAAGCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGTAT--GTACA-------G-TATGAACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGTTC-CTATTAAA------T---AAT-TTCTT-AAATA-ATT-ATGGCCC-T----T-TG-AT-CTTT-----TT----AATG-A-A--A----TTACATCC-A-TT-GCAATT-GTGCATGTCAGCGTATA-----ACTATTGAGTAACAGCATCTAC---TA-CCAAA--TTGCATTAT-CT---GATGATGA--CAAGCCTTCAGAAA--GTGATGACCTTTATTTGTT-AAGGG-TCAG-TTACCTCAAAAGTCATGGTCACTTGGGTTA-----CATCCCCA--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTTGA--GTCCGTTT-AC----TATATTGTTT-TCTTTA----T--TC-T-TTT---TCTA--TTGCATTTCTGAT---------G-TTGCACCA---------TA-----CTA----------TATTT----C-----CA----------------AT-------T----------CA----TCC------------TT--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTGCTT-TT------ATTTGTTTCC--AT--CCA---CA-----T----------------------------TTT-----TTTACCATAA-CAATA----AG-ATTT---------ACGTCTCTT--GCATTATA-------A-TG-CAA--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATTTTTT-TTT-CACTCAGACCATGGCCCATTTGAGCGGCGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTACCTTGTATTC
gi|10 : aaattCATTC-A-TT-GTGATT-TCGCATTTCAGTCTA-------ACTAGTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TT-----TTGAAATTT-CT---TGTAA------------------A--GTAATGCCCTTTATTTG-T-TAGGGACCAA-TTACCTTAAAGGTCATGGTCACTTGGGTCA-----CATCCACA-----------T-TTTCAA------T---------AT-GTTT----GTCCTTTTAAC----TGTA-TATTT-T-TTAA----TTATT-T-TTT---TCTA--TGGCATTTCTCAT---------G-TTTCACC-----------------C-------------ACTC----C-----CAC-A---------------------------------CA----CCC------------TG-----------CCAAACTTCCTG--------------CTCGTC-TCT-GC-TC------GTCTGTTTCTTAAC--TT-----------T-AT-----------------T-------TTT-----TTTAACATTA-CAATATATTTT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTAAA-------A-TG-CAGTTGCACACTG-C-------------C-------------CACATTC-A-------------CAGACAATGTTTA-TTT-TGCTGCGTCCATGGCACTTATTAGCGCGGGATATTCAAAT-----GTACTCAATTTTCTTGT-TTCa
gi|11 : TTAAGGAA-----ATTACATTCATTTG----------CAT-TTGCGTCAAAGATCAATGTCATTTGGGTCA-----C-CCTTCG--CCCTAAAAATACTT---------T-------------TTC----TACCTTTT-TT----TATATTTCTT-TAT-AA----T--TC-T-TTTGAACC-A--T-GCATTCCTTAT---------T-GTCTACCT---------TA-----CCA----------ACCTCTTTCC-----CAA-C-------------AT-------TAAAT------CA----TCC-------------G--------T-----CACATAT-GTTTC------AACC--CGC------ATATT------ACC-----CC--AC--CCA---CAATATAT-AT-----AT----------A-------TTTATAAATTTACAAATAGCAATA----TT-TT-----------ACATCTCGG--ACATTATA-------G-AG-C-G--------TGAT-------------T-------------C-----C-AGTATTTATATCACCGGGCAATGTTTA-TTT-T-TTCAGTCCATGACCATTTTGAGTGGCGAATAT---AATTCCCCTCGCTGAA-GTTCTTGg
gi|12 : AACCCAGT-T-CATAT-----------------TAAAC-TTCCTATAT--AGCAA--GGAAA----T-GG-TCTGAATGTGA-GCCT-TGGCATT----TTAATGATT---------T---TAT-TTTTTTATTAA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-GT-ATTTA----TATTGCAATT-ATA--A----TTA--TTC-A-TTTACAACT-TTGCATTTTGACTTATA-----ACT-----------------------------A--TTGAGT----------ATGAGAATTCA--CCATCAGGAA---------CCTTTA--------AAGG-CCAA-TTACCTCAGAGGTCAAGGTCATTGGGGCCA-----CATACC----TCCC-----T-CT
gi|12 : CCATTA-CAAAA----TTGTTTT---------ACATCTACT--GCATTATA-------ACTG-C----------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------cagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcccattacaaaattgttttacatctactgcattataactgctgttccagtactcacatcca
gi|13 : aacccagttcatattaaacttcctatatagcaaggaaatggtctgaatgtgagccttggcattttaatgattttatttttttattaagttatggccctttggtatttatattgcaattataattattcatttacaactttgcattttgacttataactattgagtatgagaattcaccatcaggaacctttaaaggccaattacctcagaggtcaaggtcattggggccacatacctccctctcagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcTTGTTA--TTTCCCGCTTTTCAA-AGATA---TTGATGG-ATA---TTGAAATGGC---GTTCGTCC---------GTCCGTC-CGTC--Agtactcacatcca
gi|13 : aacattgactgct----AACATG-------------------------AGCCTAAA-G-TCTTG--GCATTC---TGA-T--TTGA-T-G--AT-A-TT---ACGGAGTTATG-C-TCTTT-ACTTTTTT-A---------AC-TTAAA-TT----T------T-----AC-----A------------T----CAC--A-----------------C-----------------TTTT-GACCAACACTGTTACAGATGCAACTCCTCCAATA----ACTTTGAGCCTAT-T-CATAT-----------------GAAATGTTGTTGGTC--AGCAA--TTACA----tttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgaacatgagcctaaagtcttggcattctgatttgatgatattacggagttatgctctttacttttttaacttaaattttacatcacacttttgaccaacactgttacagatgcaactcctccaataactttgagcctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|14 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgGA----AGTATG-------------------------TGCCTGTG-G-TATTG--GCATTCCAGTTA-AA--TAA-T----AT-T-TT---ATTGAGTAATTGC-TCTTT-GTTTTTTTTA---------AC-TTAGATTT----T------G-----GC-----A------------TAATTTGG--A-----------------CCAACA------------GTCATGAC----ACT-------------ACCCTCC--CACTGTATTT--ACCAGAT-T-CAANN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN------N---NNN-NNNNN-NNNNN-NNN-NNNNNNN-N----N-NN-NN-NTTT-----TT----AATA-A-A--A----TTACATTT-G-TT-GCATTT-TTGCATTTCAGCCTATA-----AATATTGAGTA
gi|15 : tgctgtatgtacatggtcTTTTTG--TCCCCTGCTTTTCAACAAAAA---TTTGG----TTTTATTAAAATGGCACCGTCCGTCTGTCTG-TATGTCTGTC-CATC--ACGT--TT-TGGTTCATCAACT---------C----TTT--CTACAGTTGTCACTTGATTCAAATGA----AACTTGCTGAAAAGTTTGCTGTCTAAACTGGTGCCTGTG-G-TGATA--TTATTT---TG----ATTAA-T-T--TT-T-TTTG-ATGGAGTAGTGGC-CCTTT-GTTCTTTT-A---------AC-TTAGATtcttgatttttt
gi|16 : tatatttcttgtt---TATGGAGA--CAGGTGTTTAGGAA--AGGATGACCTTTATATG-TTAAGGG-TCAG-TTATGTAAAAGGTCAAGGTTGTCTGGGTCA-----C-TCACTGGTCCCC-----C-CTTAAAA-----TAAACAACAAAT-CTTT----G-CCT------------TATTTTTA-TCGTAA----T--TC-T-TTT---CCTAC-TTGCA-TTCTTAT---------A-GAACACCA---------TA-----CCATTCCCGATCCAACCC----C-----TAC-C-------------ATG------T----------CAAATTTCCATTGTGCCTATATG--------TTTCTTCACATATTGTTT-------AAgatacttcatac
gi|17 : ca-------------C-----T-A-------------CAGGCAATGTCTG-TTT-TGCTCAGTCAGTGGCACTTTTGAGT-GCAGATAT--GAAT-----TCACTGCATTTta
gi|18 : tgtagcatattctcattctggacctttcttccaccccccccccccccccatctcatgtgaaattgccattctgcttatctgtttcttcaccatttgatgacaataccattttccattttttatgtcctatgtcccagcaagtatgctgtttcagtacccacacAAC-----------------GAAAC-TTGCCGTAC--AGCAA--GTCTAAGTGT-GG-TCTAAACATGT-GTCTGTGATCTTACCATTT-CGATTAAA------A---TATGTTTTG-ATAGA-GTT-ATTGCCC------T-TG-TT-CTTT-----TA----ATTTCG-A--A----TTcatgt
gi|19 : ccgaaggttgcTTAA-TTG--AT-CCTT---ACTGAGTTATGACGTTTTT-GTTATTGT-A---------AC-TTA-ATGT----T------TATAACAC-----AGTNNNNNNNNNNN----NNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTTATGTGC--AGCAG--GT-------------CTGAA-GTGAAGCCTGGGGTCTTGGCATTC-------AA------T---G------TT-ACTGA-GTT-ACTGCCC-T----T-TA-ATACTTT-----TC----A-TT-A-A--A----TTACTTTC-taaaacatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcgaaacttgctagtggtctgaatttgtgcctcaggtatt
gi|2 : t-TAGACAAACAACTT--------CCAACAAT--CTA--------ACTCTATTCAAATAATTTGAATATG-------------------------TGCCTGCGCGCTATTG--GAAT---------AAATTA--T-----T-T-TT---ATAGAGCAATGAC-ACTTT-GCTATTCA-A---------AC-TAAG-TTT----T------T-----AC-----A------------T----TAA--A-----------------C-----------------GNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAC-ATGCTGTAC--AA-AG--GTACA----T-GA-TCTGAATATTA-GCCTATAGCATTGGTGCTT-CAATTCCA------T---AAT-CTGTT-ACAGA-AGT-ATGGCTT-T----T-TG-AT-CTTA-----TA----AGTG-A-A--A----TTACATTT-A-TT-ACATTT-TTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAACAACAGCATCTAC---CA--T--A--TTG-ATTTT-TT---TATGAGGA--CAGACCTTCTGGAA--GTGGTG-----TATT--------GG-CCAG-TTACCTAAGAGATCAATGTCACATAGGTCAACTCCCCCCCCCC--CCCC-----T-CTT---------C---------AA-TTTCTTTTGTTATTTT-ACGAAACAAACACTTT-TC---A----T--TC-T-TCT---TCTA--TTGCATTTCTAAT---------G-TTCCACCttctgaga
gi|2 : CT-T----T-TG-TT-ATTT-----TACG--AAAC-A-A--ACACTTTTCATTC---TT--CTTCTATTGCATTTC------TA-----A-TGTT------C--CACCTTC---CATCC--A--C--AATGTT-TT---TCCGAGGA--CAGGCCTCCAGGAT--GTGATGACCTTGATTTGTT-AAGGG--CAGCTTACTTT--AGATCAACGTCACTTAAGTCA-----CATCCCCGT-CCCC-----T-Cttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|2 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-AGTACCCACATCCGCAGGCTATGGTTA-GTTGTGATCCTCCCATTGTCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----CCACTGGACTTTCTTGT-ccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|20 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttcttttgttattttacgaaacaaacacttttcattcttcttctattgcatttctaatgttccaccttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaa----AATATG-------------------------TGCCTGTT-G-TATTG--GGGTTC---C----AATTA--T-GTTAT-TGCC---ATGGAGTTGTGGC-CCTTT-GTCATTTA-A---------AC-TT--ATTT----T------T-----AA-----A------------T----TAC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNN---NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGTTGTAC--AGCAG--GTAGA----T-GA-TCTGTACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGT
gi|21 : actcaatgtatggagtcatggcttcttg----T--TT-T-ATT---CATA--TTGCATTTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATACCC-----AATTCGC--C-----CACAC-------------CC-------TGCGAGATTTCCA----TCC------------TGATAATCTGTTTCATCCCTTATTGATT-------AATCTTTGTC-TTG-AT-TTCCATGCACATATTTCC--CCTCCCA---CA-----A-AC-----T-----------A-------TGT-----TTAAACATTG-CACTA----TT-TTTTTCAAATTTTACGTCTCAG--ACATTATA-------C-TA-CAC--------TA-T-------------T-------------C-----CTA-------------CA
gi|22 : tcTTA--TTCTTCGCTTTTCGA-AGAAAAGTTT----G-ATATT-TTGAAATGGC---ATCTGCCT-TTC--CA----TGTC-TTTC--A---AGTTATGGACCAACAA-----------C----AAT-----CA------A----ATTCAAACGA----AACTTG----------------------------CTGTcccac
gi|22 : atattgaccttcactAATCAAAT-T-CAAAC-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--ACCAG--GTACA----T-GA-CCTAAACATGA-ACCTGTAATCTTTG---TC-CAATTTAA------T---TAC-Tacaccaggtacatgacctaaacatgaacctgtaatctttgtccaatttaattactgagttgt
gi|23 : atattgaccttcactttattcttcgcttttcgaagaaaagtttgatattttgaaatggcatctgcctttccatgtctttcaagttatggaccaacaacCTTT-GTTTTTTT-T---------AA-TTAGATTTCACGT------T-----GT-----A------------T----TNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-NNCAAAA-----------------GAAAC-TTGCTGTGC--AGTAA--GTACC----T-GG-TCTGA------------------------TC-CGATTAAA------A---TGT-TTTCG-ATAGA-TTT-ATGGTTC-T----T-AGTTT-TTTT-----TA----AACT-T-A--A----Tgagttgt
gi|24 : -----T-GT-----A-----------A-------TTA-----TTTTTCAGTA-CTTTG----TT-TTTT----------CATCTGG---GCATTATA-------A-TG-CAC--------TG-TTCTAGTACCCACAT-------------C-----T-A-------------CAGGC-ATGTCTG-TTC-TACTCAGTCCATCGCCCTTTTCAGCATGGGTTAC--GAAT-----TTACTGAA-TTTCTTGT-TTatttacgtcatac
gi|25 : gcccggcTTTCATCCCATT-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TC--A--CGG--TTTTACT---TATGAAGA--CATGCCTTCAGGAAATATGAGGATCTTCA
gi|26 : gtgg---ATTCAGTTATGGC-CCTTG-GTTATTTA-A---------AC-TTA-ATTT----T------T-----GC-----A------------T----TGC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTaaggtaaatggtcaccaccctcatatatttaattttgtcactgtata
gi|27 : -------------CTCCTCC--CAC---ATTTTAACCCAAT-T-CAAAT-----------------TTAGC-CAACTGTAC--AGCA---GTACA----TGGG-TCTGAATATGA-GGCCGTGGTCTTGGTATTC-CAATTgggtcctctgt
gi|28 : a-ACTGA-GTT-AAGGCCC-T----T-AA-AT-CTTT-----TA----A-TG-A-A--A----TTACTTTC-G-TTTGAAACT-TTCCATTTCAGCCTATA-----ATTATTGAGTAACAGCATCca
gi|29 : ATGA----AACCTG----------------------------CTA-A-G-TTTTG--GCATTC---TGA-G--TTAA-T-G--CTAT-TT---ATTGAGTTATGG--CCTTT-GTTC---T-A---------AC-TTA---TT----T------T-----AC-----------------------TTC--A-----------------C-----------------ctcc
gi|3 : tC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG-TCTGAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGA------T---TTT-TATTT-ATTGA-GTT-ATGGCTC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TTtctct
gi|3 : ----AATATG-------------------------TGCCTGTG-G-TATCG--ACATTC---TGATAGATTTT-T-A-----T-TT---ATTGAGTTATGGC-TCTTT-GTTCTTTT-A---------AC-TTAGATTT-----------------A------A------------T----TTC--A-----------------T-----------------------------ACT-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NNNTCTGACTATTT-GCATG-GGTATTGGAGTTT-TGATTAAA------T---TAT-------------GTTCATGTCTC-T----T-TG-CT-ATTT------------ATT-A-A--A-------CATTA-A-CT-GCAATT-TTACATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAATAGCAGCACTTAC---CA-TC-----TTGAGATTT-CT---TATGAAGA--CAGGCTTTGAGGAA--ATGATGAATTTTA-----------G-CCAG-TTAT-----------AGGTCAT---GGTCA-----CATCCCCC--TCCG-----C-CTT---------TAAATTA---AT-TTTCTA--ACCTTTTT-AC----AATAATGTTT-TCTTAA----T--TCTT-TTT---CTTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCAACA---------TATCACCCCA----------GACTC----CCCCCACAC-CCTGCCAAGTTCCTGC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AATCTTGGCCATTA-TT-TT------A-----TTCC--GA--CCAATGCA-----T-ATCCCCCA-----------AGAAGATTTTT-----TTTAACATTA-CAATA----TT-TTTTTC-------ACATCCCAG--GCA-TAAA-------A-TG-CAG--------TA-T-------------TTCAGTACTCACACC-----C-A-------------CAGGCAATGTTTA-TTG-TACCCAGTCCATGGTCCTTATGAGTGGGGGATAT--GAAtaatttcatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctgactatttgcatgggtattggagttttgattaaattatgttcatgtctctttgctatttattaaacattaactgcaattttacatttcagcctataactattgaatagcagcacttaccatcttgagatttcttatgaagacaggctttgaggaaatgatgaattttagccagttataggtcatggtcacatccccctccgcctttaaattaattttctaacctttttacaataatgttttcttaattctttttcttattgcatttcttatgttccaacatatcaccccagactccccccacaccctgccaagttcctgctcatctgtttcttcacttattgtttaatcttggccattattttattccgaccaatgcatatcccccaagaagattttttttaacattacaatatttttttcacatcccaggcataaaatgcagtatttcagtactcacacccacaggcaatgtttattgtacccagtccatggtccttatgagtgggggatatgaaa
gi|30 : ctttctgtatatcaagtacatggtctg-------------T-------------C-----C-A-------------AAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAATCCATGGCCGTATC-AGCAGGAAATAT--GAAT-----TCACTTAA-TTTCTTa
gi|31 : ttacagtacccataTTTTAAA-AAAAA---TTGGGGGGATATTG---AAATGGC---ATCTGTCTGTTTG-CACATCCGAC-TGTC--ACAT
gi|32 : ttttttaaaaccctctttTGGAGTTATGGC-CCTTT-GTTCTTAT-A---------AC-TTAGATTT----
gi|4 : -TTACTGTAC--ATCAG--GTGCA----T-TC-TCTGAACATGT-ACCTGTGGTATTGGCCTTC-AGATTAAA------T---CAT-TTTCC-AAAGC-GTT-CTGGTTC-T----T-TG-TT-GTTT-----TA----CAT----A--A----TTATAgatctcatatt
gi|4 : ----AACATG-------------------------TACCTGTG-G-TATTG--GCCTTC-------AGATTAAAT-C--AT-T-TTCC-AAAGCGTTCTGGT-TCTTT-GTTGTTTT-ACATAATTATACATCAAACTN----N------N-----NN-----N------------N----NNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-------------GAAAA-TTGCTGAAC--AACGG--GTACA----T-GC-TCTGAATATGA-ACCTGAAATATTGACATTAATGATTTAA------T---TAT-TTCTT-ACTGA-GTT-ATGACCC-TAAGAT-TG-AC-TTTT-----TA----AATA-A-A--G----TTACATTCTA-TT--TAACT-TTATAAATCAGC------------TATTGAGTGACAACACCTAA---CA-TC-----TTGAATTTG-CT---TATGAGGA--CAGTCCTTCAGAAA--GTAATGTGCTTTACTTG-TAAAGGG-TCAC-CTATCTCAAAGGTCAAAGTCACTTCGGTAA----------CCG--TACC-----T--TT---------T---------A-------------CTTTT--C----TAGATT-TTT-TCTTAAATACT--TG-TATTT---CCTT--TTGCGATTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATCCCC-----AACTC----CGCCTACAC-CTT-----------GCCCAGTTTC----------CA----TCC------------TGC-------TTTCTTCACTTATTATTT-------AACGTTCGCC-catcaaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaattgctgaacaacgggtacatgctctgaatatgaacctgaaatattgacattaatgatttaattatttcttactgagttatgaccctaagattgactttttaaataaagttacattctatttaactttataaatcagctattgagtgacaacacctaacatcttgaatttgcttatgaggacagtccttcagaaagtaatgtgctttacttgtaaagggtcacctatctcaaaggtcaaagtcacttcggtaaccgtaccttttacttttctagattttttcttaaatacttgtatttccttttgcgattattatgttccaccataccatccccaactccgcctacaccttgcccagtttccatcctgctttcttcacttattatttaacgttcgcc
gi|5 : ttactgtacatcaggtgcattctctgTGA----AAC-TG-------------------------TGCCTGTG-G-TCTTA--ACATTC---T----AGTTAA-T-G--AC-T-TTTG-ATGGAGTTATAGC-CCTTT-GTTCTTTT-A---------AC-TTAGATTT----TATGTGAT-----ACTNNNNN------------N----NNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAT--AGCAA--GTACA----T-GG-TTGGAATATGT-GCCTGTAGTATTAGAGTTT-TGCCTAAC------T-----T-TTTCG-ATGGA-GTT-ATGACCC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TT
gi|5 : gtcTGG----AATATG-------------------------TGCCTGTA-G-TATTA--GAGTTT---TGC----CTAA-C-----T-T-TTTCGATGGAGTTATGAC-CCTTT-GTTCTTTT-A---------AC-TTAGATTT----TAAGTGAT-----ACTNNN-N------------N----NNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-ATGCTGTAT--AGCATATGTATA----T-GG-TCAGAATACGT-GCCTGTGATATTAGAGTTT-TGACTAAC------T---T----TTTG-ATGAA-GAT-ATGGCCC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ATTT-A-G--A----TTttaagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtatagcatatgtatatggtcagaatacgtgcctgtgatattagagttttgactaactttttgatgaagatatggccctttgttcttttaatttagattttagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : gtctgaaactgtgcctgtggtcttaacattctagttaatgacttttgatggagttatagccctttgttcttttaacttagattttatgtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtatagcaagtacatggtTTCTTACATACCCCTCTTTTCGATAAATA---TTGGGGG-ATATTG---AAATGGC---ATCTGTCT----G-CA-GTCTGTCACGTT--Attagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : ataaatttacgttgtat-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AACAA--GTACA----T-GG-TCTGAACATGT-GCCAGTGGTATTGGCATTA-TGATTAAATTGTTGT---TGT-TTTTT-AAGGA-GTT-ATGGCCCTT----T-TA-TT-CTTTTTTCCTA----GATT-----------TTAC-TTC-A-Tttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|6 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAT-----------------GTAAC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG-TCTGAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGA------T---TTT-TATTT-ATTGA-GTT-ATGGCTC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TTacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|7 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcA-AAATTAA-C-T--AT-T-TT---TTTATTTTAATGC-CCTTT-GTAATTTT-A---------AC-TTTAATTT-------------------------------------------GCGAA-----------------C-----------------GCAA--------ACC-------------CTCCTAC--AG----ATA--AAATC-ATGT-CAAAT-----------------GTCAC-TTGTTTTGC--AGCAG---TACA----T-GG-TCTAAACATAA-GAATGTAGTATTTGTGTTC-CAGCTCAA------TGCGTA--------AT-GA-GTT-ATGGTCC-T----T-TG-AT-CTCT-----TG----AATG-G-A--A----CTACATTC-T-TT-GCAA-T-TTGCATTTtaat
gi|7 : gtacatgttcttatcacgtgcatgt--TTGCATTTT-CT---TATCAGGA--CATACTTTCAGGAA--GTAATTACA-TTGTTTGTT-AAGGA-CCAG-TAATATAAAAGGCCAAGGCCAATTGGGCCA-----CAT----G--CACC-----A-TTT---------T---------GT-TTT-----GTACTT-----------CAGTGTTTGTTTTAA----T--TA-T-TTC---CCTA--TTGTA----TTGT---------G-TTCTGCCAACCCATCTCTAACT--CCA----------AATTT----C-----CAT-CCG-----------GC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTAACTCATTGCTTATTGATAAACCTTTGCC-TTG-GT-TTC-----ATTTtcttatcaggacatactttcaggaagtaattacattgtttgttaaggaccagtaatataaaaggccaaggccaattgggccacatgcaccattttgttttgtacttcagtgtttgttttaattatttccctattgtattgtgttctgccaacccatctctaactccaaatttccatccggctcatctgtttcttaactcattgcttattgataaacctttgccttggtttcatttcatcccg
gi|8 : gtacatgttcttatcacgtgcatgtaaaattaactatttttttattttaatgccctttgtaattttaactttaatttgcgaacgcaaaccctcctacagataaaatcatgtcaaatgtcacttgttttgcagcagtacatggtctaaacataagaatgtagtatttgtgttccagctcaatgcgtaatgagttatggtcctttgatctcttgaatggaactacattctttgcaatCTGTAGATTTAGGATTC-CATTTAAA------T---TAT-TTTTC-ATTGA-GTA-ATGGCCA-T----TAAG-TT-ATTT-----TA----ACTT-A-ATTT----TTACA-TC-A-Tcatcccg
gi|8 : tttcattttacatcacacttt-AAATTAT-T-----T-T-TC---ATTGAGTAATGGC-CATTAAGTTATTTT-A---------AC-TTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------T----CAT--AATNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGCACTAAGTAG--GTACA----T-AT-TCTGAACATGA-GTCTGTGGTCTTGGCATTC--AATTAA-------T---GAT-TT------AGACATT--TGACC-------------T-CTTT-----TA----TA---A-A--A----TTATATTC-T-TT-GAAACT-ATGCATTTCATCTTATAGATTAAGTATTGAGTAACAGCACTTTC---TA-CT-----TTGAATTTG-CT---TATGAGAA--CAGGCTTTCAGGAA--GAACTGACCTTTATTTG-TAAAGGG-CAAC-TTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgcactaagtaggtacatattctgaacatgagtctgtggtcttggcattcaattaatgatttagacatttgacctcttttataaaattatattctttgaaactatgcatttcatcttatagattaagtattgagtaacagcactttctactttgaatttgcttatgagaacaggctttcaggaagaactgacctttatttgtaaagggcaacttaactcaaaggtcaaggtcactccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa
gi|9 : tttcattttacatcacactttctgtagatttaggattccattt-GTT-ATGGCGC-T----T-TG-AT-CTTT-----TT----AATG-A-A--A----TAACATTC-ATTT-GTAACT-TTGCAATACGGACTCTA-----TCTATTGAATAAAAGCACCTACATGTA-CA--AACGTGCATCTT-CTTCATATGGGGA--CA----T---GGAC--AT-ATGACATTCATTCGTT-AAGGG-CCAG-TTAACCCAAAGTTGAAAGTCATT---GT---------TGCCAG--CCCT-----T-GTCCAATAAAAAT---------ATATTTT----GTTCTCT---C----T------TTT-TCTTAA----T--AC-T-CCC---CCCAACCTTTATTTCTTATTCATCTTCAGCTTTCATCA---------TACTCTGCTA----------AATTT----C-----AACTT-------------GC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTTACTTCTTGTTG-------AATC-TCACT-TTG-A----------ATTCCTTTCA--AC--CCA---CA-----TGAT-----ACTAAAATATTTA-------TTT-----TTTCCCACTA-CAATG----TT-TATT---------TCATATCCTAAGCATAATAGAACACCA-GGACAC--------TC-A-------------T-------------C-----T-A-------------CAGGCAATTTCTATTTT-TTCTCAGTccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 111 1111 111 4444444444 22222222 1 888888888888888888888888888888 33333333333333333333333333 3333333333 22222 111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111 11111111111111111 22222222 2222 111111111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 1111 2222222222 1111 1111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111 1 1
lowQualScore : 1 11 1 3 1 888 2 2 6 9999 111 3333333333 6 00000000 0 2 111111111111111111111111111111 6666 7777 3 44444444444444444444444444 44 3 3 55 2 4444444444 44 00000 2 5 555 1 2 2 2 1 999999999 2 9 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00000000 33 1 3 2 2 88888888888888888 1 22 333 4444 2 2 1 33 1 66 77 0 77777777777777777777 55 2 2 1 4444 1 33 1 66666 6666 3 55 1 22 4444 555 77 0 3 1 88888 1 777 88888888 6 3 555 0 44 66 0 88888 0 0 0 5555 33 3 1 1 222222222222222 99999 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 0 8888 55 4 4 777 99 3 666666666 4 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 8888888 5 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 44444 1 5 0000 5 7777777777 6666 4444444 4 4 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 4 3 2 0 66 44444 4 0
lowQualScore : . .. . . . ... . . . .... ... .......... . ........ . . .............................. .... .... . .......................... .. . . .. . .......... .. ..... . . ... . . . . . ......... . . ........................................................................................................... ........ .. . . . . ................. . .. ... .... . . . .. . .. .. . .................... .. . . . .... . .. . ..... .... . .. . .. .... ... .. . . . ..... . ... ........ . . ... . .. .. . ..... . . . .... .. . . . ............... ..... . .................................................... . . .... .. . . ... .. . ......... . ................................................................................................................. . ....... . . ...................................................................... ..... . . .... . .......... .... ....... . . ............................................................... . . . . . .. ..... . .
lowQualScore : 0 00 4 3 0 333 5 5 7 3333 777 3333333333 7 99999999 0 5 222222222222222222222222222222 0000 1111 6 77777777777777777777777777 88 6 5 00 5 8888888888 66 88888 9 7 777 0 5 4 4 0 444444444 4 0 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77777777 55 0 7 4 4 22222222222222222 8 55 999 0000 0 0 5 77 9 00 22 6 11111111111111111111 11 0 0 9 0000 9 66 9 77777 7777 4 33 9 66 0000 999 77 8 3 0 33333 8 000 88888888 5 6 888 2 66 99 2 00000 5 4 3 6666 66 3 8 0 888888888888888 11111 6 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 1 5555 55 0 0 000 55 4 000000000 0 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 9999999 1 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333 4 0 6666 0 2222222222 4444 4444444 4 4 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 4 7 5 2 99 33333 1 0
consensus : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGA----AACATG-------------------------TGCCTGTG-G-TATTG--GCGTTC---TGA-AAATTAA-T-G--AT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CCTTT-G-TTNTTTTA---------AC-TTAGATTT----T------T-----AC-----A------------TTNC--A-----------------C-----------------GTNA-GACC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG-TCTGAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------T---TAT-TTTTT-ATNGA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-NT-CTTT-----TA----AATT-A-A--A----TTACATTC-A-TT-GCAACT-TTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA----------AACTC----C-----CAC-C-------------GC-------T----------CA----TCC------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--AC--CCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
Reference ( family-1759 ) : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGA----AACATG-------------------------TGCCTGTG-G-TATTG--GCGTTC---TGA-AAATTAA-T-G--AT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CCTTT-G-TTNTTTTA---------AC-TTAGATTT----T------T-----AC-----A------------TTNC--A-----------------C-----------------GTNA-GACC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG-TCTGAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------T---TAT-TTTTT-ATNGA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-NT-CTTT-----TA----AATT-A-A--A----TTACATTC-A-TT-GCAACT-TTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA----------AACTC----C-----CAC-C-------------GC-------T----------CA----TCC------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--AC--CCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
gi|1 : TTGGTTATTA--TCCCGCGCTTCTCGA-AGACAC--TTGGGGG-ATATTATTTAAATGAT---GTCCGCCC-TCCGTCA-GTCCGTC-CATCCGACCCAATT-TGGATCAACAACTTTGCGGCGGC----AATTCCTACA------ACCCGATTCAAATGA----AACTTG-------------------------TACATGT----T-CTGAAGTGTTA----AA-AAATCAA-C-G--AT-T-TT---ATCGAGTTATGAC-CCTCC---CTAATTTA---------AT-TTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------TTTT--A-----------------C-----------------GTTA-GATT--TACT-------------CTTCTCT--CA----ATTTTAAGCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGTAT--GTACA-------G-TATGAACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGTTC-CTATTAAA------T---AAT-TTCTT-AAATA-ATT-ATGGCCC-T----T-TG-AT-CTTT-----TT----AATG-A-A--A----TTACATCC-A-TT-GCAATT-GTGCATGTCAGCGTATA-----ACTATTGAGTAACAGCATCTAC---TA-CCAAA--TTGCATTAT-CT---GATGATGA--CAAGCCTTCAGAAA--GTGATGACCTTTATTTGTT-AAGGG-TCAG-TTACCTCAAAAGTCATGGTCACTTGGGTTA-----CATCCCCA--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTTGA--GTCCGTTT-AC----TATATTGTTT-TCTTTA----T--TC-T-TTT---TCTA--TTGCATTTCTGAT---------G-TTGCACCA---------TA-----CTA----------TATTT----C-----CA----------------AT-------T----------CA----TCC------------TT--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTGCTT-TT------ATTTGTTTCC--AT--CCA---CA-----T----------------------------TTT-----TTTACCATAA-CAATA----AG-ATTT---------ACGTCTCTT--GCATTATA-------A-TG-CAA--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATTTTTT-TTT-CACTCAGACCATGGCCCATTTGAGCGGCGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTACCTTGTATTC
gi|10 : aaattCATTC-A-TT-GTGATT-TCGCATTTCAGTCTA-------ACTAGTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TT-----TTGAAATTT-CT---TGTAA------------------A--GTAATGCCCTTTATTTG-T-TAGGGACCAA-TTACCTTAAAGGTCATGGTCACTTGGGTCA-----CATCCACA-----------T-TTTCAA------T---------AT-GTTT----GTCCTTTTAAC----TGTA-TATTT-T-TTAA----TTATT-T-TTT---TCTA--TGGCATTTCTCAT---------G-TTTCACC-----------------C-------------ACTC----C-----CAC-A---------------------------------CA----CCC------------TG-----------CCAAACTTCCTG--------------CTCGTC-TCT-GC-TC------GTCTGTTTCTTAAC--TT-----------T-AT-----------------T-------TTT-----TTTAACATTA-CAATATATTTT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTAAA-------A-TG-CAGTTGCACACTG-C-------------C-------------CACATTC-A-------------CAGACAATGTTTA-TTT-TGCTGCGTCCATGGCACTTATTAGCGCGGGATATTCAAAT-----GTACTCAATTTTCTTGT-TTCa
gi|11 : TTAAGGAA-----ATTACATTCATTTG----------CAT-TTGCGTCAAAGATCAATGTCATTTGGGTCA-----C-CCTTCG--CCCTAAAAATACTT---------T-------------TTC----TACCTTTT-TT----TATATTTCTT-TAT-AA----T--TC-T-TTTGAACC-A--T-GCATTCCTTAT---------T-GTCTACCT---------TA-----CCA----------ACCTCTTTCC-----CAA-C-------------AT-------TAAAT------CA----TCC-------------G--------T-----CACATAT-GTTTC------AACC--CGC------ATATT------ACC-----CC--AC--CCA---CAATATAT-AT-----AT----------A-------TTTATAAATTTACAAATAGCAATA----TT-TT-----------ACATCTCGG--ACATTATA-------G-AG-C-G--------TGAT-------------T-------------C-----C-AGTATTTATATCACCGGGCAATGTTTA-TTT-T-TTCAGTCCATGACCATTTTGAGTGGCGAATAT---AATTCCCCTCGCTGAA-GTTCTTGg
gi|12 : AACCCAGT-T-CATAT-----------------TAAAC-TTCCTATAT--AGCAA--GGAAA----T-GG-TCTGAATGTGA-GCCT-TGGCATT----TTAATGATT---------T---TAT-TTTTTTATTAA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-GT-ATTTA----TATTGCAATT-ATA--A----TTA--TTC-A-TTTACAACT-TTGCATTTTGACTTATA-----ACT-----------------------------A--TTGAGT----------ATGAGAATTCA--CCATCAGGAA---------CCTTTA--------AAGG-CCAA-TTACCTCAGAGGTCAAGGTCATTGGGGCCA-----CATACC----TCCC-----T-CT
gi|12 : CCATTA-CAAAA----TTGTTTT---------ACATCTACT--GCATTATA-------ACTG-C----------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------cagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcccattacaaaattgttttacatctactgcattataactgctgttccagtactcacatcca
gi|13 : aacccagttcatattaaacttcctatatagcaaggaaatggtctgaatgtgagccttggcattttaatgattttatttttttattaagttatggccctttggtatttatattgcaattataattattcatttacaactttgcattttgacttataactattgagtatgagaattcaccatcaggaacctttaaaggccaattacctcagaggtcaaggtcattggggccacatacctccctctcagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcTTGTTA--TTTCCCGCTTTTCAA-AGATA---TTGATGG-ATA---TTGAAATGGC---GTTCGTCC---------GTCCGTC-CGTC--Agtactcacatcca
gi|13 : aacattgactgct----AACATG-------------------------AGCCTAAA-G-TCTTG--GCATTC---TGA-T--TTGA-T-G--AT-A-TT---ACGGAGTTATG-C-TCTTT-A-CTTTTTTA---------AC-TTAAA-TT----T------T-----AC-----A------------TCAC--A-----------------C-----------------TTTT-GACCAACACTGTTACAGATGCAACTCCTCCAATA----ACTTTGAGCCTAT-T-CATAT-----------------GAAATGTTGTTGGTC--AGCAA--TTACA----tttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgaacatgagcctaaagtcttggcattctgatttgatgatattacggagttatgctctttacttttttaacttaaattttacatcacacttttgaccaacactgttacagatgcaactcctccaataactttgagcctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|14 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgGA----AGTATG-------------------------TGCCTGTG-G-TATTG--GCATTCCAGTTA-AA--TAA-T----AT-T-TT---ATTGAGTAATTGC-TCTTT-GTTTTTTTTA---------AC-TTAGATTT----T------G-----GC-----ATAAT--------TTGG--A-----------------CCAACA------------GTCATGA----CACT-------------ACCCTCC--CACTGTATTT--ACCAGAT-T-CAANN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN------N---NNN-NNNNN-NNNNN-NNN-NNNNNNN-N----N-NN-NN-NTTT-----TT----AATA-A-A--A----TTACATTT-G-TT-GCATTT-TTGCATTTCAGCCTATA-----AATATTGAGTA
gi|15 : tgctgtatgtacatggtcTTTTTG--TCCCCTGCTTTTCAACAAAAA---TTTGG----TTTTATTAAAATGGCACCGTCCGTCTGTCTG-TATGTCTGTC-CATC--ACGT--TT-TGGTTCATCAACT---------C----TTT--CTACAGTTGTCACTTGATTCAAATGA----AACTTGCTGAAAAGTTTGCTGTCTAAACTGGTGCCTGTG-G-TGATA--TTATTT---TG----ATTAA-T-T--TT-T-TTTG-ATGGAGTAGTGGC-CCTTT-G-TTCTTTTA---------AC-TTAGATtcttgatttttt
gi|16 : tatatttcttgtt---TATGGAGA--CAGGTGTTTAGGAA--AGGATGACCTTTATATG-TTAAGGG-TCAG-TTATGTAAAAGGTCAAGGTTGTCTGGGTCA-----C-TCACTGGTCCCC-----C-CTTAAAA-----TAAACAACAAAT-CTTT----G-CCT------------TATTTTTA-TCGTAA----T--TC-T-TTT---CCTAC-TTGCA-TTCTTAT---------A-GAACACCA---------TA-----CCATTCCCGATCCAACCC----C-----TAC-C-------------ATG------T----------CAAATTTCCATTGTGCCTATATG--------TTTCTTCACATATTGTTT-------AAgatacttcatac
gi|17 : ca-------------C-----T-A-------------CAGGCAATGTCTG-TTT-TGCTCAGTCAGTGGCACTTTTGAGT-GCAGATAT--GAAT-----TCACTGCATTTta
gi|18 : tgtagcatattctcattctggacctttcttccaccccccccccccccccatctcatgtgaaattgccattctgcttatctgtttcttcaccatttgatgacaataccattttccattttttatgtcctatgtcccagcaagtatgctgtttcagtacccacacAAC-----------------GAAAC-TTGCCGTAC--AGCAA--GTCTAAGTGT-GG-TCTAAACATGT-GTCTGTGATCTTACCATTT-CGATTAAA------A---TATGTTTTG-ATAGA-GTT-ATTGCCC------T-TG-TT-CTTT-----TA----ATTTCG-A--A----TTcatgt
gi|19 : ccgaaggttgcTTAA-TTG--AT-CCTT---ACTGAGTTATGACGTTTTT-G-TTATTGTA---------AC-TTA-ATGT----T------TATAACAC-----AGTNNNNNNNNNNNNNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTTATGTGC--AGCAG--GT-------------CTGAA-GTGAAGCCTGGGGTCTTGGCATTC-------AA------T---G------TT-ACTGA-GTT-ACTGCCC-T----T-TA-ATACTTT-----TC----A-TT-A-A--A----TTACTTTC-taaaacatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcgaaacttgctagtggtctgaatttgtgcctcaggtatt
gi|2 : t-TAGACAAACAACTT--------CCAACAAT--CTA--------ACTCTATTCAAATAATTTGAATATG-------------------------TGCCTGCGCGCTATTG--GAAT---------AAATTA--T-----T-T-TT---ATAGAGCAATGAC-ACTTT-G-CTATTCAA---------AC-TAAG-TTT----T------T-----AC-----A------------TTAA--A-----------------C-----------------GNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAC-ATGCTGTAC--AA-AG--GTACA----T-GA-TCTGAATATTA-GCCTATAGCATTGGTGCTT-CAATTCCA------T---AAT-CTGTT-ACAGA-AGT-ATGGCTT-T----T-TG-AT-CTTA-----TA----AGTG-A-A--A----TTACATTT-A-TT-ACATTT-TTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAACAACAGCATCTAC---CA--T--A--TTG-ATTTT-TT---TATGAGGA--CAGACCTTCTGGAA--GTGGTG-----TATT--------GG-CCAG-TTACCTAAGAGATCAATGTCACATAGGTCAACTCCCCCCCCCC--CCCC-----T-CTT---------C---------AA-TTTCTTTTGTTATTTT-ACGAAACAAACACTTT-TC---A----T--TC-T-TCT---TCTA--TTGCATTTCTAAT---------G-TTCCACCttctgaga
gi|2 : CT-T----T-TG-TT-ATTT-----TACG--AAAC-A-A--ACACTTTTCATTC---TT--CTTCTATTGCATTTC------TA-----A-TGTT------C--CACCTTC---CATCC--A--C--AATGTT-TT---TCCGAGGA--CAGGCCTCCAGGAT--GTGATGACCTTGATTTGTT-AAGGG--CAGCTTACTTT--AGATCAACGTCACTTAAGTCA-----CATCCCCGT-CCCC-----T-Cttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|2 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-AGTACCCACATCCGCAGGCTATGGTTA-GTTGTGATCCTCCCATTGTCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----CCACTGGACTTTCTTGT-ccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|20 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttcttttgttattttacgaaacaaacacttttcattcttcttctattgcatttctaatgttccaccttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaa----AATATG-------------------------TGCCTGTT-G-TATTG--GGGTTC---C----AATTA--T-GTTAT-TGCC---ATGGAGTTGTGGC-CCTTT-G-TCATTTAA---------AC-TT--ATTT----T------T-----AA-----A------------TTAC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNN---NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGTTGTAC--AGCAG--GTAGA----T-GA-TCTGTACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGT
gi|21 : actcaatgtatggagtcatggcttcttg----T--TT-T-ATT---CATA--TTGCATTTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATACCC-----AATTCGC--C-----CACAC-------------CC-------TGCGAGATTTCCA----TCC------------TGATAATCTGTTTCATCCCTTATTGATT-------AATCTTTGTC-TTG-AT-TTCCATGCACATATTTCC--CCTCCCA---CA-----A-AC-----T-----------A-------TGT-----TTAAACATTG-CACTA----TT-TTTTTCAAATTTTACGTCTCAG--ACATTATA-------C-TA-CAC--------TA-T-------------T-------------C-----CTA-------------CA
gi|22 : tcTTA--TTCTTCGCTTTTCGA-AGAAAAGTTT----G-ATATT-TTGAAATGGC---ATCTGCCT-TTC--CA----TGTC-TTTC--A---AGTTATGGACCAACAA-----------C----AAT-----CA------A----ATTCAAACGA----AACTTG----------------------------CTGTcccac
gi|22 : atattgaccttcactAATCAAAT-T-CAAAC-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--ACCAG--GTACA----T-GA-CCTAAACATGA-ACCTGTAATCTTTG---TC-CAATTTAA------T---TAC-Tacaccaggtacatgacctaaacatgaacctgtaatctttgtccaatttaattactgagttgt
gi|23 : atattgaccttcactttattcttcgcttttcgaagaaaagtttgatattttgaaatggcatctgcctttccatgtctttcaagttatggaccaacaacCTTT-G-TTTTTTTT---------AA-TTAGATTTCACGT------T-----GT-----A------------TTNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-NNCAAAA-----------------GAAAC-TTGCTGTGC--AGTAA--GTACC----T-GG-TCTGA------------------------TC-CGATTAAA------A---TGT-TTTCG-ATAGA-TTT-ATGGTTC-T----T-AGTTT-TTTT-----TA----AACT-T-A--A----Tgagttgt
gi|24 : -----T-GT-----A-----------A-------TTA-----TTTTTCAGTA-CTTTG----TT-TTTT----------CATCTGG---GCATTATA-------A-TG-CAC--------TG-TTCTAGTACCCACAT-------------C-----T-A-------------CAGGC-ATGTCTG-TTC-TACTCAGTCCATCGCCCTTTTCAGCATGGGTTAC--GAAT-----TTACTGAA-TTTCTTGT-TTatttacgtcatac
gi|25 : gcccggcTTTCATCCCATT-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-TC--A--CGG--TTTTACT---TATGAAGA--CATGCCTTCAGGAAATATGAGGATCTTCA
gi|26 : gtgg---ATTCAGTTATGGC-CCTTG-G-TTATTTAA---------AC-TTA-ATTT----T------T-----GC-----A------------TTGC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTaaggtaaatggtcaccaccctcatatatttaattttgtcactgtata
gi|27 : -------------CTCCTCC--CAC---ATTTTAACCCAAT-T-CAAAT-----------------TTAGC-CAACTGTAC--AGCA---GTACA----TGGG-TCTGAATATGA-GGCCGTGGTCTTGGTATTC-CAATTgggtcctctgt
gi|28 : a-ACTGA-GTT-AAGGCCC-T----T-AA-AT-CTTT-----TA----A-TG-A-A--A----TTACTTTC-G-TTTGAAACT-TTCCATTTCAGCCTATA-----ATTATTGAGTAACAGCATCca
gi|29 : ATGA----AACCTG----------------------------CTA-A-G-TTTTG--GCATTC---TGA-G--TTAA-T-G--CTAT-TT---ATTGAGTTATGG--CCTTT-G-TTC---TA---------AC-TTA---TT----T------T-----AC-------------------TTC--A-----------------C-----------------ctcc
gi|3 : tC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG-TCTGAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGA------T---TTT-TATTT-ATTGA-GTT-ATGGCTC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TTtctct
gi|3 : ----AATATG-------------------------TGCCTGTG-G-TATCG--ACATTC---TGATAGATTTT-T-A-----T-TT---ATTGAGTTATGGC-TCTTT-G-TTCTTTTA---------AC-TTAGATTT-----------------A------A------------TTTC--A-----------------T-----------------------------ACT-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NNNTCTGACTATTT-GCATG-GGTATTGGAGTTT-TGATTAAA------T---TAT-------------GTTCATGTCTC-T----T-TG-CT-ATTT------------ATT-A-A--A-------CATTA-A-CT-GCAATT-TTACATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAATAGCAGCACTTAC---CA-TC-----TTGAGATTT-CT---TATGAAGA--CAGGCTTTGAGGAA--ATGATGAATTTTA-----------G-CCAG-TTAT-----------AGGTCAT---GGTCA-----CATCCCCC--TCCG-----C-CTT---------TAAATTA---AT-TTTCTA--ACCTTTTT-AC----AATAATGTTT-TCTTAA----T--TCTT-TTT---CTTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCAACA---------TATCACCCCA----------GACTC----CCCCCACAC-CCTGCCAAGTTCCTGC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AATCTTGGCCATTA-TT-TT------A-----TTCC--GA--CCAATGCA-----T-ATCCCCCA-----------AGAAGATTTTT-----TTTAACATTA-CAATA----TT-TTTTTC-------ACATCCCAG--GCA-TAAA-------A-TG-CAG--------TA-T-------------TTCAGTACTCACACC-----C-A-------------CAGGCAATGTTTA-TTG-TACCCAGTCCATGGTCCTTATGAGTGGGGGATAT--GAAtaatttcatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctgactatttgcatgggtattggagttttgattaaattatgttcatgtctctttgctatttattaaacattaactgcaattttacatttcagcctataactattgaatagcagcacttaccatcttgagatttcttatgaagacaggctttgaggaaatgatgaattttagccagttataggtcatggtcacatccccctccgcctttaaattaattttctaacctttttacaataatgttttcttaattctttttcttattgcatttcttatgttccaacatatcaccccagactccccccacaccctgccaagttcctgctcatctgtttcttcacttattgtttaatcttggccattattttattccgaccaatgcatatcccccaagaagattttttttaacattacaatatttttttcacatcccaggcataaaatgcagtatttcagtactcacacccacaggcaatgtttattgtacccagtccatggtccttatgagtgggggatatgaaa
gi|30 : ctttctgtatatcaagtacatggtctg-------------T-------------C-----C-A-------------AAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAATCCATGGCCGTATC-AGCAGGAAATAT--GAAT-----TCACTTAA-TTTCTTa
gi|31 : ttacagtacccataTTTTAAA-AAAAA---TTGGGGGGATATTG---AAATGGC---ATCTGTCTGTTTG-CACATCCGAC-TGTC--ACAT
gi|32 : ttttttaaaaccctctttTGGAGTTATGGC-CCTTT-G-TTCTTATA---------AC-TTAGATTT----
gi|4 : -TTACTGTAC--ATCAG--GTGCA----T-TC-TCTGAACATGT-ACCTGTGGTATTGGCCTTC-AGATTAAA------T---CAT-TTTCC-AAAGC-GTT-CTGGTTC-T----T-TG-TT-GTTT-----TA----CAT----A--A----TTATAgatctcatatt
gi|4 : ----AACATG-------------------------TACCTGTG-G-TATTG--GCCTTC-------AGATTAAAT-C--AT-T-TTCC-AAAGCGTTCTGGT-TCTTT-G-TTGTTTTACATAATTATACATCAAACTN----N------N-----NN-----N------------NNNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-------------GAAAA-TTGCTGAAC--AACGG--GTACA----T-GC-TCTGAATATGA-ACCTGAAATATTGACATTAATGATTTAA------T---TAT-TTCTT-ACTGA-GTT-ATGACCC-TAAGAT-TG-AC-TTTT-----TA----AATA-A-A--G----TTACATTCTA-TT--TAACT-TTATAAATCAGC------------TATTGAGTGACAACACCTAA---CA-TC-----TTGAATTTG-CT---TATGAGGA--CAGTCCTTCAGAAA--GTAATGTGCTTTACTTG-TAAAGGG-TCAC-CTATCTCAAAGGTCAAAGTCACTTCGGTAA----------CCG--TACC-----T--TT---------T---------A-------------CTTTT--C----TAGATT-TTT-TCTTAAATACT--TG-TATTT---CCTT--TTGCGATTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATCCCC-----AACTC----CGCCTACAC-CTT-----------GCCCAGTTTC----------CA----TCC------------TGC-------TTTCTTCACTTATTATTT-------AACGTTCGCC-catcaaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaattgctgaacaacgggtacatgctctgaatatgaacctgaaatattgacattaatgatttaattatttcttactgagttatgaccctaagattgactttttaaataaagttacattctatttaactttataaatcagctattgagtgacaacacctaacatcttgaatttgcttatgaggacagtccttcagaaagtaatgtgctttacttgtaaagggtcacctatctcaaaggtcaaagtcacttcggtaaccgtaccttttacttttctagattttttcttaaatacttgtatttccttttgcgattattatgttccaccataccatccccaactccgcctacaccttgcccagtttccatcctgctttcttcacttattatttaacgttcgcc
gi|5 : ttactgtacatcaggtgcattctctgTGA----AAC-TG-------------------------TGCCTGTG-G-TCTTA--ACATTC---T----AGTTAA-T-G--AC-T-TTTG-ATGGAGTTATAGC-CCTTT-G-TTCTTTTA---------AC-TTAGATTT----TATGTGAT-----ACTNNNNN------------NNNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAT--AGCAA--GTACA----T-GG-TTGGAATATGT-GCCTGTAGTATTAGAGTTT-TGCCTAAC------T-----T-TTTCG-ATGGA-GTT-ATGACCC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TT
gi|5 : gtcTGG----AATATG-------------------------TGCCTGTA-G-TATTA--GAGTTT---TGC----CTAA-C-----T-T-TTTCGATGGAGTTATGAC-CCTTT-G-TTCTTTTA---------AC-TTAGATTT----TAAGTGAT-----ACTNNN-N------------NNNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-ATGCTGTAT--AGCATATGTATA----T-GG-TCAGAATACGT-GCCTGTGATATTAGAGTTT-TGACTAAC------T---T----TTTG-ATGAA-GAT-ATGGCCC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ATTT-A-G--A----TTttaagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtatagcatatgtatatggtcagaatacgtgcctgtgatattagagttttgactaactttttgatgaagatatggccctttgttcttttaatttagattttagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : gtctgaaactgtgcctgtggtcttaacattctagttaatgacttttgatggagttatagccctttgttcttttaacttagattttatgtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtatagcaagtacatggtTTCTTACATACCCCTCTTTTCGATAAATA---TTGGGGG-ATATTG---AAATGGC---ATCTGTCT----G-CA-GTCTGTCACGTT--Attagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : ataaatttacgttgtat-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AACAA--GTACA----T-GG-TCTGAACATGT-GCCAGTGGTATTGGCATTA-TGATTAAATTGTTGT---TGT-TTTTT-AAGGA-GTT-ATGGCCCTT----T-TA-TT-CTTTTTTCCTA----GATT-----------TTAC-TTC-A-Tttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|6 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAT-----------------GTAAC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG-TCTGAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGA------T---TTT-TATTT-ATTGA-GTT-ATGGCTC-T----T-TG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-G--A----TTacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|7 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcA-AAATTAA-C-T--AT-T-TT---TTTATTTTAATGC-CCTTT-G-TAATTTTA---------AC-TTTAATTT---------------------------------------GCGAA-----------------C-----------------GCAA--------ACC-------------CTCCTAC--AG----ATA--AAATC-ATGT-CAAAT-----------------GTCAC-TTGTTTTGC--AGCAG---TACA----T-GG-TCTAAACATAA-GAATGTAGTATTTGTGTTC-CAGCTCAA------TGCGTA--------AT-GA-GTT-ATGGTCC-T----T-TG-AT-CTCT-----TG----AATG-G-A--A----CTACATTC-T-TT-GCAA-T-TTGCATTTtaat
gi|7 : gtacatgttcttatcacgtgcatgt--TTGCATTTT-CT---TATCAGGA--CATACTTTCAGGAA--GTAATTACA-TTGTTTGTT-AAGGA-CCAG-TAATATAAAAGGCCAAGGCCAATTGGGCCA-----CAT----G--CACC-----A-TTT---------T---------GT-TTT-----GTACTT-----------CAGTGTTTGTTTTAA----T--TA-T-TTC---CCTA--TTGTA----TTGT---------G-TTCTGCCAACCCATCTCTAACT--CCA----------AATTT----C-----CAT-CCG-----------GC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTAACTCATTGCTTATTGATAAACCTTTGCC-TTG-GT-TTC-----ATTTtcttatcaggacatactttcaggaagtaattacattgtttgttaaggaccagtaatataaaaggccaaggccaattgggccacatgcaccattttgttttgtacttcagtgtttgttttaattatttccctattgtattgtgttctgccaacccatctctaactccaaatttccatccggctcatctgtttcttaactcattgcttattgataaacctttgccttggtttcatttcatcccg
gi|8 : gtacatgttcttatcacgtgcatgtaaaattaactatttttttattttaatgccctttgtaattttaactttaatttgcgaacgcaaaccctcctacagataaaatcatgtcaaatgtcacttgttttgcagcagtacatggtctaaacataagaatgtagtatttgtgttccagctcaatgcgtaatgagttatggtcctttgatctcttgaatggaactacattctttgcaatCTGTAGATTTAGGATTC-CATTTAAA------T---TAT-TTTTC-ATTGA-GTA-ATGGCCA-T----TAAG-TT-ATTT-----TA----ACTT-A-ATTT----TTACA-TC-A-Tcatcccg
gi|8 : tttcattttacatcacacttt-AAATTAT-T-----T-T-TC---ATTGAGTAATGGC-CATTAAG-TTATTTTA---------AC-TTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------TCAT--AATNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGCACTAAGTAG--GTACA----T-AT-TCTGAACATGA-GTCTGTGGTCTTGGCATTC--AATTAA-------T---GAT-TT------AGACATT--TGACC-------------T-CTTT-----TA----TA---A-A--A----TTATATTC-T-TT-GAAACT-ATGCATTTCATCTTATAGATTAAGTATTGAGTAACAGCACTTTC---TA-CT-----TTGAATTTG-CT---TATGAGAA--CAGGCTTTCAGGAA--GAACTGACCTTTATTTG-TAAAGGG-CAAC-TTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgcactaagtaggtacatattctgaacatgagtctgtggtcttggcattcaattaatgatttagacatttgacctcttttataaaattatattctttgaaactatgcatttcatcttatagattaagtattgagtaacagcactttctactttgaatttgcttatgagaacaggctttcaggaagaactgacctttatttgtaaagggcaacttaactcaaaggtcaaggtcactccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa
gi|9 : tttcattttacatcacactttctgtagatttaggattccattt-GTT-ATGGCGC-T----T-TG-AT-CTTT-----TT----AATG-A-A--A----TAACATTC-ATTT-GTAACT-TTGCAATACGGACTCTA-----TCTATTGAATAAAAGCACCTACATGTA-CA--AACGTGCATCTT-CTTCATATGGGGA--CA----T---GGAC--AT-ATGACATTCATTCGTT-AAGGG-CCAG-TTAACCCAAAGTTGAAAGTCATT---GT---------TGCCAG--CCCT-----T-GTCCAATAAAAAT---------ATATTTT----GTTCTCT---C----T------TTT-TCTTAA----T--AC-T-CCC---CCCAACCTTTATTTCTTATTCATCTTCAGCTTTCATCA---------TACTCTGCTA----------AATTT----C-----AACTT-------------GC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTTACTTCTTGTTG-------AATC-TCACT-TTG-A----------ATTCCTTTCA--AC--CCA---CA-----TGAT-----ACTAAAATATTTA-------TTT-----TTTCCCACTA-CAATG----TT-TATT---------TCATATCCTAAGCATAATAGAACACCA-GGACAC--------TC-A-------------T-------------C-----T-A-------------CAGGCAATTTCTATTTT-TTCTCAGTccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa
blockSeqs : G CA T C T AGT G G G ATTA ACC GTCTGTATG A ACGT A C CTTTCTACAGTTGTC CTTG TTTG A CTGAAAAGTTTGCTGTCTAAACTGGT GC C C . A CAGTTAAA AA GTTA A C TCG G G A T T CATAATTAT A A TTATAACACAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN CACTGT TT C A G N NNNNNNNNNNNNNNNNN G TA TAT AGTG G N T AA A NN AT TTGTTGTTGTTTTTT TT C C T AAGA A TT A TTTCC TTGC A TC T TT CACT TA TA A C GATTA C ATG CAAAC A A TCA TT GG ATATG TTA AC C C T ACTCCCCCCCCCC AAAAA A CAATTTCTTTTGTTATTTTACGAAACAAACAC G ATAC TA T A GAA AC T TCATCTTCA C TACCATTCCCGATCCAACCCCTACCATGTCAAATTTCCATTGTGCCTATATG T ATTGATA C A TTTTATTCCGACCAATGCATATCCCCCAAGAAGATT ATAAA A G TATT G TCAAATTTTA CTAA GAACACC C A AGTTGCACACTGCCCACATTCA T G G T TC TCCCC T .
blockSeqs : T . C T A . T G . TTG . GTTTGCACA . AAG . C TCCAACAATCTA CTCT . A A A . A . A TGATAGA A TGA . G TG T . . . T . . G TTGCATTGCACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN AATA NN G T . . NNNN . . A . . . N A N CA AT TTATTTTTTT NN . . . . . G . A CG A T . . . AT TG . T . C . TCCA A . . . GA GTA TTA C . G C CTCACTGGT . . TAAATTAATTTTCTAACCTTTTTACAATAATG . . . . . . C T . . TACCATACCCAATTCGCCCACACCCTGCGAGATTTCCATCCTGATAATCTG T C T . AATTCCTTTCAACCCACATGATACTAAAATATTTA . C . . . TCA GT . . . GTGATTCCAGTATTTATATCAC . . G G . . T .
blockSeqs : C . T . A . G G . TTG . TTCCA . . . CAATCA . . T T G . G . A TGAT A GA . . CC G . . . C . . G TTACATCATAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN CAC NN C G . . . . . A . . . C N C CA N ATATGTTTTG TA . . . . . N . . . T A . . . A G . C . A . TCA A . . . GG AGG TAA T . C C CATCCCCGT . . AAAATAAACAACAAATCTTTGCCTTATTT . . . . . . . T . . TATCACCCCAGACTCCCCCCACACCCTGCCAAGTTCCTGCTCATCTG A . T . ATTTCCATGCACATATTTCCCCTCCCACAAACTA . C . . . A GG . . . AGTGTTCCAGTACCCACATCCG . . G G . . C .
blockSeqs : . A . A . G . . G . GCAG . . A T G . A . A TGAG A TT . . TG T . . . A . . G TTACATCACACTTTTGACCAACACTGTTACAGATGCAA NN NN N N . . . . . N . . . T T C TG C NNNNNNNNN CT . . . . . T . . . G T . . . A G . C . C . TT A . . . TG GTG TTA C . G A CATCCACA . . CAATATGTTTGTCCTTTTAACTGTATA . . . . . . . T . . TACCATCCCCAACTCCGCCTACACCTTGCCCAGTTTCCATCCTGC T . T . ATATTACCCCACCCACAATATATATATA . A . . . A CT . . . ACTGTTCTAGTACCCACATCTA . . A G . . .
blockSeqs : . T . . . . G . G . . A T T . A . G TGA A GC . . . A . . . A . . G TTAAATTACACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NN NN N N . . . . . A . . . C A A TG C TAATCTGTT CA . . . . . A . . . A G . . . G A . C . C . TA A . . . GG GTG TAA C . C A CATCCCCC . . CAATAAAAATATATTTTGTTCTCTCT . . . . . . . T . . ACCCATCTCTAACTCCAAATTTCCATCCGGCTCATCTG T . T . GCTCGTCTGTTTCTTAACTTTATT . T . . . A AG . . . AGTATTTCAGTACTCACACCCA . . A C . . .
blockSeqs : . T T A . T . A AAA A CA . . . G . . . A . . G TATGTGATACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NN NN N N . . . . . G . . . C A C TA C ATGTTTTCG TA . . . . . A . . . A C . . . A G . C . T . TC C . . . GT ATG TTA T . T T CCCTTCG . . TTTCTACCTTTTTTTATATTT . . . . . . . A . . TACCAACCTCTTTCCCAACATTAAATCATCCG C . . . . A . . . T AG . . . ACTATTCCTA . . G G . . .
blockSeqs : . C T G . A . A CAA T GA . . . T . . . T . . G TAAGTGATACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NN TT T A . . . . . G . . . T A C CA C TTTTTATTT CT . . . . . T . . . C T . . . G G . C . C . TC A . . . TA GTA TT C . C C CATACC . . TGTTTTGTACTTCAGTG . . . . . . . T . . TACTCTGCTAAATTTCAACTTGCTCATCTG T . . . C . . . . G . . . ACTCATCTA . . T . .
blockSeqs : . A T G . A . C AGA A TA . . . T . . . A . . A TGGCATAATTTGGACCAACAGTCATGACACT NN NN N N . . . . . G . . . T A C AG C TCATTTTCC TT . . . . . A . . . A G . . . A G . T . G . CT C . . . GG GTA . C . A A TGCCAG . . TACTTTTCTAGATT . . . . . . . . . . CACTCCCACACACCCTG . . . . . TGTTCCA . . .
blockSeqs : . A T G . C . A TAG A A . . . T . . . C . . G CACGTTGTATTNNNNNNNNNNNNNNNN NN NN N N . . . . . G . . . T T A CC T TTATTTCTT AA . . . . . T . . . A T . . . A G . C . C . A . . . . . GAA . C . C C CATG . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . A . A . G TGC A A . . . G . . . C . . G TTACATTAAACGNNNNNNNNNNN NN NN C A . . . . . A . . . C T A CA T TTTTTATTT CT . . . . . C . . . A T . . . T . . . . . . . . . . AT . . . C C CCG . .
blockSeqs : . . . T . . . . A . . . C . . A NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NN NN N N . . . . . G . . . T T A AG A TTATTTTTC TG . . . . . T . . . C A . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . G . . . GCGAACGCAAACC NN NN N N . . . . . A . . . T A A AG T TTTTTCG TG . . . . . A . . . T T . . . T .
blockSeqs : . . . . . G . . . C . . . AATTTCATACT AG T N N . . . . . N . . . T T A CA T TTTTTG AG . . . . . T . . . A T . . . .
blockSeqs : . T . . . C . . . NN . N N . . . . . G . . . C T A CA T TGCGTA TT . . . . . T . . . C T . . .
blockSeqs : T . . . A . . . A N . . . . . G . . . T T A TG T TGATTT TT . . . . . T . . . A T . . .
blockSeqs : . . A . . . N . . . . . . A . . . C T A GA C TGTT T . . . . . T . . . C G . . .
blockSeqs : . . . A . . . C A A CA C TTAT A . . . . . A . . . A T . . .
blockSeqs : . . . A . . . . A T . . . . . . . . T . . . A G . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : *** TTG* GTCCCACG** G* ** CGA******* TC******
originalCons : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATTGTTGAAATGGC---GTCCGTCT-TCCG-CA-GTCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGA----AACATG-------------------------TGCCTGTG-G-TATTG--GCGTTC---TGA-AAATTAA-T-G--AT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CCTTT-G-TTNTTTTA---------AC-TTAGATTT----T------T-----AC-----A------------TTNC--A-----------------C-----------------GTNA-GACC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG-TCTGAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------T---TAT-TTTTT-ATNGA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-NT-CTTT-----TA----AATT-A-A--A----TTACATTC-A-TT-GCAACT-TTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CA-CC--A--TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA----------AACTC----C-----CAC-C-------------GC-------T----------CA----TCC------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--AC--CCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
finalCons : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATTTTG-AAATGGC---GTCCGTCTGTCCCACG--TCCGTC-CGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGA----AACATG-------------------------TGCCTGTG-G-TATTG--GCGTTCCGA-------TTAA-T-G--AT-T-TT---ATNGAGTTATGGC-CCTTT-G-TTNTTTTA---------AC-TTAGATTT----T------T-----AC-----A------------TTNC--A-----------------C-----------------GTNA-GACC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG-TCTGAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------T---TAT-TTTTT-ATNGA-GTT-ATGGCCC-T----T-TG-NT-CTTT-----TA----AATT-A-A--A----TTACATTC-A-TT-GCAACT-TTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTAC---CATC------TTGAATTTT-CT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA----------AACTC----C-----CAC-C-------------GC-------T----------CA----TCC------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--AC--CCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 111 333 111 4444444444 11111111 888888888888888888888888888888 33333333333333333333333333 1111 222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111 11111111111111111 11111111111 2222 111111111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 1111 2222222222 1111 1111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111 1 1
lowQualScore : 1 11 1 3 1 888 1 777 111 111 9999999999 66666666 8 2 111111111111111111111111111111 6666 7777 3 44444444444444444444444444 44 3 4 44 66 77777 99 2 6666 2 99 222 1 2 2 2 1 999999999 2 9 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00000000 33 1 3 2 2 88888888888888888 1 22 333 4444 2 2 1 33 1 55 88 0 1 99999999999999999999999 2 2 2 4444 33 2 77777 7777 2 66 2 4444 777 77 0 3 1 88888 1 77777777777 3 555 0 44 66 0 88888 0 0 0 5555 33 3 1 1 222222222222222 99999 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 0 8888 55 4 4 777 99 3 666666666 4 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 8888888 5 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 44444 1 5 0000 5 7777777777 6666 4444444 4 4 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 4 3 2 0 66 44444 4 0
lowQualScore : . .. . . . ... . ... ... ... .......... ........ . . .............................. .... .... . .......................... .. . . .. .. ..... .. . .... . .. ... . . . . . ......... . . ........................................................................................................... ........ .. . . . . ................. . .. ... .... . . . .. . .. .. . . ....................... . . . .... .. . ..... .... . .. . .... ... .. . . . ..... . ........... . ... . .. .. . ..... . . . .... .. . . . ............... ..... . .................................................... . . .... .. . . ... .. . ......... . ................................................................................................................. . ....... . . ...................................................................... ..... . . .... . .......... .... ....... . . ............................................................... . . . . . .. ..... . .
lowQualScore : 0 00 4 3 0 333 0 555 888 777 3333333333 22222222 0 5 222222222222222222222222222222 0000 1111 6 77777777777777777777777777 99 3 7 66 66 00000 66 9 1111 9 66 000 0 5 4 4 0 444444444 4 0 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77777777 55 0 7 4 4 22222222222222222 8 55 999 0000 0 0 5 77 1 22 11 3 2 99999999999999999999999 1 1 0 2222 77 0 00000 0000 9 00 0 2222 000 77 8 3 0 33333 8 66666666666 4 888 2 66 99 2 00000 5 4 3 6666 66 3 8 0 888888888888888 11111 6 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 1 5555 55 0 0 000 55 4 000000000 0 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 9999999 1 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333 4 0 6666 0 2222222222 4444 4444444 4 4 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 4 7 5 2 99 33333 1 0
consensus : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATT-TTGAAATGGC---GTCCGTCTGTCCG-CACGTCCGTCCGTC--ACGTAATT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGA----AACATG-------------------------TGCCTGTG-G-TATTG--GCGTTCCGA--TT--AA-T-N--AT-T--TT---ATNGAGTTATGGC-CCTTT-G-TTNTTTTA---------AC-TTAGATTT----T------T-----AC-----A------------TTNC--A-----------------C-----------------GTNA-GACC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG-TCTGAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------T---TAT-TTTTT-ATNGA-GTT-ATGGCCC-T----TTG-NT-CTTT-----TA----AATT-A-AA----TTACATTC-A-TT-GCAACT-TTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTACCAT-------C---TTGAATTTTCT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA----------AACTC----C-----CAC-C-------------GC-------T----------CA----TCC------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--AC--CCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
Reference ( family-1759 ) : NNNNNTTGGTTNTTA--TCCCCCGCTTTTCGA-AGANA---TTGGGGG-ATATT-TTGAAATGGC---GTCCGTCTGTCC--CACGTCCGTCCGTC--ACGTAGTT-TGGACCAACAACTT--------C----AAT--CTACA------ACTCGATTCAAATGA----AACATG-------------------------TGCCTGTG-G-TATTG--GCGTTCCGA--TT--AA-T-G--AT-T--TT---ATNGAGTTATGGC-CCTTT-G-TTNTTTTA---------AC-TTAGATTT----T------T-----AC-----A------------TTNC--A-----------------C-----------------GTNA-GACC--CACT-------------CTCCTCC--CA----ATTTTAANCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTACA----T-GG-TCTGAACATGN-GCCTGTGGTATTGGCGTTC-CGATTAAA------T---TAT-TTTTT-ATNGA-GTT-ATGGCCC-T----TTG-NT-CTTT-----TA----AATT-A-AA----TTACATTC-A-TT-GCAACT-TTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAGTAACAGCACCTACCAT-------C---TTGAATTTTCT---TATGAGGA--CAGGCCTTCAGGAA--GTGATGACCTTTATTTG-T-AAGGG-CCAG-TTACCTCAAAGGTCAAGGTCACTTGGGTCA-----CATCCCCG--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTC----GTCCTTTT-AC----TATATTNTTT-TCTTAA----T--TC-T-TTT---CCTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCA----------AACTC----C-----CAC-C-------------GC-------T----------CA----TCC------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTG-NT-TT------ATTTGTTTCC--AC--CCA---CA-----T-AT-----A-----------A-------TTT-----TTTACCATTA-CAATA----TT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAGTCCATGGCCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTTTCTTGT-TTC
gi|1 : TTGGTTATTA--TCCCGCGCTTCTCGA-AGACAC--TTGGGGG-ATATTATTTAAATGAT---GTCCGCCC-TCCGTCA-GTCCGTCCATCCGACCCAATT-TGGATCAACAACTTTGCGGCGGC----AATTCCTACA------ACCCGATTCAAATGA----AACTTG-------------------------TACATGT----T-CTGAAGTGTTAAAAAATC--AA-C-G--AT-T--TT---ATCGAGTTATGAC-CCTCC---CTAATTTA---------AT-TTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------TTTT--A-----------------C-----------------GTTA-GATT--TACT-------------CTTCTCT--CA----ATTTTAAGCCGAT-T-CAAAT-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGTAT--GTACA-------G-TATGAACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGTTC-CTATTAAA------T---AAT-TTCTT-AAATA-ATT-ATGGCCC-T----TTG-AT-CTTT-----TT----AATG-A-AA----TTACATCC-A-TT-GCAATT-GTGCATGTCAGCGTATA-----ACTATTGAGTAACAGCATCTACTAC-------CAAATTGCATTATCT---GATGATGA--CAAGCCTTCAGAAA--GTGATGACCTTTATTTGTT-AAGGG-TCAG-TTACCTCAAAAGTCATGGTCACTTGGGTTA-----CATCCCCA--CCCC-----T-CTT---------T---------AT-TTTTGA--GTCCGTTT-AC----TATATTGTTT-TCTTTA----T--TC-T-TTT---TCTA--TTGCATTTCTGAT---------G-TTGCACCA---------TA-----CTA----------TATTT----C-----CA----------------AT-------T----------CA----TCC------------TT--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AACCTTCGCC-TTGCTT-TT------ATTTGTTTCC--AT--CCA---CA-----T----------------------------TTT-----TTTACCATAA-CAATA----AG-ATTT---------ACGTCTCTT--GCATTATA-------A-TG-CAA--------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------CAGGCAATTTTTT-TTT-CACTCAGACCATGGCCCATTTGAGCGGCGGATAT--GAAT-----TCACTGAATTACCTTGTATTC
gi|10 : aaattCATTC-A-TT-GTGATT-TCGCATTTCAGTCTA-------ACTAGTGAGTAACAGCACCTACCAT-------T---TTGAAATTTCT---TGTAA------------------A--GTAATGCCCTTTATTTG-T-TAGGGACCAA-TTACCTTAAAGGTCATGGTCACTTGGGTCA-----CATCCACA-----------T-TTTCAA------T---------AT-GTTT----GTCCTTTTAAC----TGTA-TATTT-T-TTAA----TTATT-T-TTT---TCTA--TGGCATTTCTCAT---------G-TTTCACC-----------------C-------------ACTC----C-----CAC-A---------------------------------CA----CCC------------TG-----------CCAAACTTCCTG--------------CTCGTC-TCT-GC-TC------GTCTGTTTCTTAAC--TT-----------T-AT-----------------T-------TTT-----TTTAACATTA-CAATATATTTT-TTTT---------ACATCTCGT--GCATTAAA-------A-TG-CAGTTGCACACTG-C-------------C-------------CACATTC-A-------------CAGACAATGTTTA-TTT-TGCTGCGTCCATGGCACTTATTAGCGCGGGATATTCAAAT-----GTACTCAATTTTCTTGT-TTCa
gi|11 : TTAAGGAA-----ATTACATTCATTTG----------CAT-TTGCGTCAAAGATCAATGTCATTTGGGTCA-----C-CCTTCG--CCCTAAAAATACTT---------T-------------TTC----TACCTTTT-TT----TATATTTCTT-TAT-AA----T--TC-T-TTTGAACC-A--T-GCATTCCTTAT---------T-GTCTACCT---------TA-----CCA----------ACCTCTTTCC-----CAA-C-------------AT-------TAAAT------CA----TCC-------------G--------T-----CACATAT-GTTTC------AACC--CGC------ATATT------ACC-----CC--AC--CCA---CAATATAT-AT-----AT----------A-------TTTATAAATTTACAAATAGCAATA----TT-TT-----------ACATCTCGG--ACATTATA-------G-AG-C-G--------TGAT-------------T-------------C-----C-AGTATTTATATCACCGGGCAATGTTTA-TTT-T-TTCAGTCCATGACCATTTTGAGTGGCGAATAT---AATTCCCCTCGCTGAA-GTTCTTGg
gi|12 : AACCCAGT-T-CATAT-----------------TAAAC-TTCCTATAT--AGCAA--GGAAA----T-GG-TCTGAATGTGA-GCCT-TGGCATT----TTAATGATT---------T---TAT-TTTTTTATTAA-GTT-ATGGCCC-T----TTG-GT-ATTTA----TATTGCAATT-ATAA----TTA--TTC-A-TTTACAACT-TTGCATTTTGACTTATA-----ACTA--------------------------------TTGAGT---------ATGAGAATTCA--CCATCAGGAA---------CCTTTA--------AAGG-CCAA-TTACCTCAGAGGTCAAGGTCATTGGGGCCA-----CATACC----TCCC-----T-CT
gi|12 : CCATTA-CAAAA----TTGTTTT---------ACATCTACT--GCATTATA-------ACTG-C----------TG-T-------------T-------------C-----C-A-------------cagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcccattacaaaattgttttacatctactgcattataactgctgttccagtactcacatcca
gi|13 : aacccagttcatattaaacttcctatatagcaaggaaatggtctgaatgtgagccttggcattttaatgattttatttttttattaagttatggccctttggtatttatattgcaattataattattcatttacaactttgcattttgacttataactattgagtatgagaattcaccatcaggaacctttaaaggccaattacctcagaggtcaaggtcattggggccacatacctccctctcagtctacacatatccccatctacaaaagaaaaagatattttagaagaaatcTTGTTA--TTTCCCGCTTTTCAA-AGATA---TTGATGG-ATATT---GAAATGGC---GTTCGTC---------CGTCCGTCCGTC--Agtactcacatcca
gi|13 : aacattgactgct----AACATG-------------------------AGCCTAAA-G-TCTTG--GCATTCTGA--TTT-GA-T-G--AT-A--TT---ACGGAGTTATG-C-TCTTT-A-CTTTTTTA---------AC-TTAAA-TT----T------T-----AC-----A------------TCAC--A-----------------C-----------------TTTT-GACCAACACTGTTACAGATGCAACTCCTCCAATA----ACTTTGAGCCTAT-T-CATAT-----------------GAAATGTTGTTGGTC--AGCAA--TTACA----tttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgaacatgagcctaaagtcttggcattctgatttgatgatattacggagttatgctctttacttttttaacttaaattttacatcacacttttgaccaacactgttacagatgcaactcctccaataactttgagcctattcatatgaaatgttgttggtcagcaattaca
gi|14 : aacattgactgctttgttatttcccgcttttcaaagatattgatggatattgaaatggcgttcgtccgtccgtccgtcatttacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacactttatgtgcagcaggtacatgatttgGA----AGTATG-------------------------TGCCTGTG-G-TATTG--GCATTCCAG--TTA-AA-T-AATAT-T--TT---ATTGAGTAATTGC-TCTTT-GTTTTTTTTA---------AC-TTAGATTT----T------G-----GC-----ATAAT--------TTGG--A-----------------CCAACA------------GTCATGA----CACT-------------ACCCTCC--CACTGTATTT--ACCAGAT-T-CAANN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN------N---NNN-NNNNN-NNNNN-NNN-NNNNNNN-N----NNN-NN-NTTT-----TT----AATA-A-AA----TTACATTT-G-TT-GCATTT-TTGCATTTCAGCCTATA-----AATATTGAGTA
gi|15 : tgctgtatgtacatggtcTTTTTG--TCCCCTGCTTTTCAACAAAAA---TTTGG----TTTTATTAAAATGGCACCGTCCGTCTGTCTG-TATGTCTGTCCATC--ACGT--TT-TGGTTCATCAACT---------C----TTT--CTACAGTTGTCACTTGATTCAAATGA----AACTTGCTGAAAAGTTTGCTGTCTAAACTGGTGCCTGTG-G-TGATA--TTATTTTGA--TT--AA-T-T--TT-T--TTTG-ATGGAGTAGTGGC-CCTTT-G-TTCTTTTA---------AC-TTAGATtcttgatttttt
gi|16 : tatatttcttgtt---TATGGAGA--CAGGTGTTTAGGAA--AGGATGACCTTTATATG-TTAAGGG-TCAG-TTATGTAAAAGGTCAAGGTTGTCTGGGTCA-----C-TCACTGGTCCCC-----C-CTTAAAA-----TAAACAACAAAT-CTTT----G-CCT------------TATTTTTA-TCGTAA----T--TC-T-TTT---CCTAC-TTGCA-TTCTTAT---------A-GAACACCA---------TA-----CCATTCCCGATCCAACCC----C-----TAC-C-------------ATG------T----------CAAATTTCCATTGTGCCTATATG--------TTTCTTCACATATTGTTT-------AAgatacttcatac
gi|17 : ca-------------C-----T-A-------------CAGGCAATGTCTG-TTT-TGCTCAGTCAGTGGCACTTTTGAGT-GCAGATAT--GAAT-----TCACTGCATTTta
gi|18 : tgtagcatattctcattctggacctttcttccaccccccccccccccccatctcatgtgaaattgccattctgcttatctgtttcttcaccatttgatgacaataccattttccattttttatgtcctatgtcccagcaagtatgctgtttcagtacccacacAAC-----------------GAAAC-TTGCCGTAC--AGCAA--GTCTAAGTGT-GG-TCTAAACATGT-GTCTGTGATCTTACCATTT-CGATTAAA------A---TATGTTTTG-ATAGA-GTT-ATTGCCC------TTG-TT-CTTT-----TA----ATTTCG-AA----TTcatgt
gi|19 : ccgaaggttgc--TT--AA-TTG--AT-CC-TT---ACTGAGTTATGACGTTTTT-G-TTATTGTA---------AC-TTA-ATGT----T------TATAACAC-----AGTNNNNNNNNNNNNNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTTATGTGC--AGCAG--GT-------------CTGAA-GTGAAGCCTGGGGTCTTGGCATTC-------AA------T---G------TT-ACTGA-GTT-ACTGCCC-T----TTA-ATACTTT-----TC----A-TT-A-AA----TTACTTTC-taaaacatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtcgaaacttgctagtggtctgaatttgtgcctcaggtatt
gi|2 : t-TAGACAAACAACTT--------CCAACAAT--CTA--------ACTCTATTCAAATAATTTGAATATG-------------------------TGCCTGCGCGCTATTG--G------AA--TA--AA-T-T--AT-T--TTT--ATAGAGCAATGAC-ACTTT-G-CTATTCAA---------AC-TAAG-TTT----T------T-----AC-----A------------TTAA--A-----------------C-----------------GNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAC-ATGCTGTAC--AA-AG--GTACA----T-GA-TCTGAATATTA-GCCTATAGCATTGGTGCTT-CAATTCCA------T---AAT-CTGTT-ACAGA-AGT-ATGGCTT-T----TTG-AT-CTTA-----TA----AGTG-A-AA----TTACATTT-A-TT-ACATTT-TTGCATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAACAACAGCATCTACCAT-------A---TTG-ATTTTTT---TATGAGGA--CAGACCTTCTGGAA--GTGGTG-----TATT--------GG-CCAG-TTACCTAAGAGATCAATGTCACATAGGTCAACTCCCCCCCCCC--CCCC-----T-CTT---------C---------AA-TTTCTTTTGTTATTTT-ACGAAACAAACACTTT-TC---A----T--TC-T-TCT---TCTA--TTGCATTTCTAAT---------G-TTCCACCttctgaga
gi|2 : CT-T----TTG-TT-ATTT-----TACG--AAAC-A-AACACTTTTCATTC---TT--CTTCTATTGCATTTC------TA-----A-TGTT------C--CACCTTCCAT-------C---CACAATGTTTT---TCCGAGGA--CAGGCCTCCAGGAT--GTGATGACCTTGATTTGTT-AAGGG--CAGCTTACTTT--AGATCAACGTCACTTAAGTCA-----CATCCCCGT-CCCC-----T-Cttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|2 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttTATA-------A-TG-CAG--------TG-T-------------T-------------C-----C-AGTACCCACATCCGCAGGCTATGGTTA-GTTGTGATCCTCCCATTGTCCTTTTGAGCGGGGGATAT--GAAT-----CCACTGGACTTTCTTGT-ccaaatataatgcagtgttccagtacccacatccgcaggctatggttagttgtgatcctcccattgtccttttgagcgggggatatgaatccactggactttcttgtt
gi|20 : tagacaaacaacttccaacaatctaactctattcaaataatttgaatatgtgcctgcgcgctattggaataaattatttttatagagcaatgacactttgctattcaaactaagtttttacattaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtacaaaggtacatgatctgaatattagcctatagcattggtgcttcaattccataatctgttacagaagtatggctttttgatcttataagtgaaattacatttattacatttttgcatttcagcctataactattgaacaacagcatctaccatattgatttttttatgaggacagaccttctggaagtggtgtattggccagttacctaagagatcaatgtcacataggtcaactcccccccccccccctcttcaatttcttttgttattttacgaaacaaacacttttcattcttcttctattgcatttctaatgttccaccttccatccacaatgtttttccgaggacaggcctccaggatgtgatgaccttgatttgttaagggcagcttactttagatcaacgtcacttaagtcacatccccgtcccctcccaaa----AATATG-------------------------TGCCTGTT-G-TATTG--GGGTTCCAA--TT---A-T-GTTAT-TG-CC---ATGGAGTTGTGGC-CCTTT-G-TCATTTAA---------AC-TT--ATTT----T------T-----AA-----A------------TTAC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNN---NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGTTGTAC--AGCAG--GTAGA----T-GA-TCTGTACATGA-GCCTGTGGTCTTGGTGT
gi|21 : actcaatgtatggagtcatggcttcttg----T--TT-T-ATT---CATA--TTGCATTTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATACCC-----AATTCGC--C-----CACAC-------------CC-------TGCGAGATTTCCA----TCC------------TGATAATCTGTTTCATCCCTTATTGATT-------AATCTTTGTC-TTG-AT-TTCCATGCACATATTTCC--CCTCCCA---CA-----A-AC-----T-----------A-------TGT-----TTAAACATTG-CACTA----TT-TTTTTCAAATTTTACGTCTCAG--ACATTATA-------C-TA-CAC--------TA-T-------------T-------------C-----CTA-------------CA
gi|22 : tcTTA--TTCTTCGCTTTTCGA-AGAAAAGTTTG-----ATATT-TTGAAATGGC---ATCTGCCT-TTC--CATGTCT-T---TC--A---AGTTATGGACCAACAA-----------C----AAT-----CA------A----ATTCAAACGA----AACTTG----------------------------CTGTcccac
gi|22 : atattgaccttcactAATCAAAT-T-CAAAC-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--ACCAG--GTACA----T-GA-CCTAAACATGA-ACCTGTAATCTTTG---TC-CAATTTAA------T---TAC-Tacaccaggtacatgacctaaacatgaacctgtaatctttgtccaatttaattactgagttgt
gi|23 : atattgaccttcactttattcttcgcttttcgaagaaaagtttgatattttgaaatggcatctgcctttccatgtctttcaagttatggaccaacaacCTTT-G-TTTTTTTT---------AA-TTAGATTTCACGT------T-----GT-----A------------TTNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-NNCAAAA-----------------GAAAC-TTGCTGTGC--AGTAA--GTACC----T-GG-TCTGA------------------------TC-CGATTAAA------A---TGT-TTTCG-ATAGA-TTT-ATGGTTC-T----TAGTTT-TTTT-----TA----AACT-T-AA----Tgagttgt
gi|24 : -----T-GT-----A-----------A-------TTA-----TTTTTCAGTA-CTTTG----TT-TTTT----------CATCTGG---GCATTATA-------A-TG-CAC--------TG-TTCTAGTACCCACAT-------------C-----T-A-------------CAGGC-ATGTCTG-TTC-TACTCAGTCCATCGCCCTTTTCAGCATGGGTTAC--GAAT-----TTACTGAA-TTTCTTGT-TTatttacgtcatac
gi|25 : gcccggcTTTCATCCCATT-----ACTATTGAGTAACAGCACCTACCAT-------C---ACGGTTTTACT---TATGAAGA--CATGCCTTCAGGAAATATGAGGATCTTCA
gi|26 : gtgg---ATTCAGTTATGGC-CCTTG-G-TTATTTAA---------AC-TTA-ATTT----T------T-----GC-----A------------TTGC--A-----------------CTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AGCAG--GTaaggtaaatggtcaccaccctcatatatttaattttgtcactgtata
gi|27 : -------------CTCCTCC--CAC---ATTTTAACCCAAT-T-CAAAT-----------------TTAGC-CAACTGTAC--AGCA---GTACA----TGGG-TCTGAATATGA-GGCCGTGGTCTTGGTATTC-CAATTgggtcctctgt
gi|28 : a-ACTGA-GTT-AAGGCCC-T----TAA-AT-CTTT-----TA----A-TG-A-AA----TTACTTTC-G-TTTGAAACT-TTCCATTTCAGCCTATA-----ATTATTGAGTAACAGCATCca
gi|29 : ATGA----AACCTG----------------------------CTA-A-G-TTTTG--GCATTCTGAG-TT--AA-T-G--CTAT--TT---ATTGAGTTATGG--CCTTT-G-TTC---TA---------AC-TTA---TT----T------T-----AC-------------------TTC--A-----------------C-----------------ctcc
gi|3 : tC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG-TCTGAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGA------T---TTT-TATTT-ATTGA-GTT-ATGGCTC-T----TTG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-GA----TTtctct
gi|3 : ----AATATG-------------------------TGCCTGTG-G-TATCG--ACATTCTGA--TA--GA-T-T--TT-TATTT---ATTGAGTTATGGC-TCTTT-G-TTCTTTTA---------AC-TTAGATTT-----------------A------A------------TTTC--A-----------------T-----------------------------ACT-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------NNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN--NNNNN----N-NNNTCTGACTATTT-GCATG-GGTATTGGAGTTT-TGATTAAA------T---TAT-------------GTTCATGTCTC-T----TTG-CT-ATTT------------ATT-A-AA-------CATTA-A-CT-GCAATT-TTACATTTCAGCCTATA-----ACTATTGAATAGCAGCACTTACCAT-------C---TTGAGATTTCT---TATGAAGA--CAGGCTTTGAGGAA--ATGATGAATTTTA-----------G-CCAG-TTAT-----------AGGTCAT---GGTCA-----CATCCCCC--TCCG-----C-CTT---------TAAATTA---AT-TTTCTA--ACCTTTTT-AC----AATAATGTTT-TCTTAA----T--TCTT-TTT---CTTA--TTGCATTTCTTAT---------G-TTCCAACA---------TATCACCCCA----------GACTC----CCCCCACAC-CCTGCCAAGTTCCTGC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTCACTTATTGTTT-------AATCTTGGCCATTA-TT-TT------A-----TTCC--GA--CCAATGCA-----T-ATCCCCCA-----------AGAAGATTTTT-----TTTAACATTA-CAATA----TT-TTTTTC-------ACATCCCAG--GCA-TAAA-------A-TG-CAG--------TA-T-------------TTCAGTACTCACACC-----C-A-------------CAGGCAATGTTTA-TTG-TACCCAGTCCATGGTCCTTATGAGTGGGGGATAT--GAAtaatttcatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctgactatttgcatgggtattggagttttgattaaattatgttcatgtctctttgctatttattaaacattaactgcaattttacatttcagcctataactattgaatagcagcacttaccatcttgagatttcttatgaagacaggctttgaggaaatgatgaattttagccagttataggtcatggtcacatccccctccgcctttaaattaattttctaacctttttacaataatgttttcttaattctttttcttattgcatttcttatgttccaacatatcaccccagactccccccacaccctgccaagttcctgctcatctgtttcttcacttattgtttaatcttggccattattttattccgaccaatgcatatcccccaagaagattttttttaacattacaatatttttttcacatcccaggcataaaatgcagtatttcagtactcacacccacaggcaatgtttattgtacccagtccatggtccttatgagtgggggatatgaaa
gi|30 : ctttctgtatatcaagtacatggtctg-------------T-------------C-----C-A-------------AAGGCAATGTCTA-TTT-TGCTCAATCCATGGCCGTATC-AGCAGGAAATAT--GAAT-----TCACTTAA-TTTCTTa
gi|31 : ttacagtacccataTTTTAAA-AAAAA---TTGGGGGGATATT---GAAATGGC---ATCTGTCTGTTTG-CACATCCGACTGTC--ACAT
gi|32 : ttttttaaaaccctctttTGGAGTTATGGC-CCTTT-G-TTCTTATA---------AC-TTAGATTT----
gi|4 : -TTACTGTAC--ATCAG--GTGCA----T-TC-TCTGAACATGT-ACCTGTGGTATTGGCCTTC-AGATTAAA------T---CAT-TTTCC-AAAGC-GTT-CTGGTTC-T----TTG-TT-GTTT-----TA----CAT----AA----TTATAgatctcatatt
gi|4 : ----AACATG-------------------------TACCTGTG-G-TATTG--GCCTTCAGA--TT--AAAT-C--AT-T--TTCC-AAAGCGTTCTGGT-TCTTT-G-TTGTTTTACATAATTATACATCAAACTN----N------N-----NN-----N------------NNNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-------------GAAAA-TTGCTGAAC--AACGG--GTACA----T-GC-TCTGAATATGA-ACCTGAAATATTGACATTAATGATTTAA------T---TAT-TTCTT-ACTGA-GTT-ATGACCC-TAAGATTG-AC-TTTT-----TA----AATA-A-AG----TTACATTCTA-TT--TAACT-TTATAAATCAGC------------TATTGAGTGACAACACCTAACAT-------C---TTGAATTTGCT---TATGAGGA--CAGTCCTTCAGAAA--GTAATGTGCTTTACTTG-TAAAGGG-TCAC-CTATCTCAAAGGTCAAAGTCACTTCGGTAA----------CCG--TACC-----T--TT---------T---------A-------------CTTTT--C----TAGATT-TTT-TCTTAAATACT--TG-TATTT---CCTT--TTGCGATTATTAT---------G-TTCCACCA---------TA-----CCATCCCC-----AACTC----CGCCTACAC-CTT-----------GCCCAGTTTC----------CA----TCC------------TGC-------TTTCTTCACTTATTATTT-------AACGTTCGCC-catcaaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaattgctgaacaacgggtacatgctctgaatatgaacctgaaatattgacattaatgatttaattatttcttactgagttatgaccctaagattgactttttaaataaagttacattctatttaactttataaatcagctattgagtgacaacacctaacatcttgaatttgcttatgaggacagtccttcagaaagtaatgtgctttacttgtaaagggtcacctatctcaaaggtcaaagtcacttcggtaaccgtaccttttacttttctagattttttcttaaatacttgtatttccttttgcgattattatgttccaccataccatccccaactccgcctacaccttgcccagtttccatcctgctttcttcacttattatttaacgttcgcc
gi|5 : ttactgtacatcaggtgcattctctgTGA----AAC-TG-------------------------TGCCTGTG-G-TCTTA--ACATTCTAG--TT--AA-T-G--AC-T--TTTG-ATGGAGTTATAGC-CCTTT-G-TTCTTTTA---------AC-TTAGATTT----TATGTGAT-----ACTNNNNN------------NNNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGTAT--AGCAA--GTACA----T-GG-TTGGAATATGT-GCCTGTAGTATTAGAGTTT-TGCCTAAC------T-----T-TTTCG-ATGGA-GTT-ATGACCC-T----TTG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-GA----TT
gi|5 : gtcTGG----AATATG-------------------------TGCCTGTA-G-TATTA--GAGTTTTGC--CT--AA-C-----T-T--TTTCGATGGAGTTATGAC-CCTTT-G-TTCTTTTA---------AC-TTAGATTT----TAAGTGAT-----ACTNNN-N------------NNNN--N-----------------N-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-ATGCTGTAT--AGCATATGTATA----T-GG-TCAGAATACGT-GCCTGTGATATTAGAGTTT-TGACTAA------------CT-TTTTG-ATGAA-GAT-ATGGCCC-T----TTG-TT-CTTT-----TA----ATTT-A-GA----TTttaagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacatgctgtatagcatatgtatatggtcagaatacgtgcctgtgatattagagttttgactaactttttgatgaagatatggccctttgttcttttaatttagattttagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : gtctgaaactgtgcctgtggtcttaacattctagttaatgacttttgatggagttatagccctttgttcttttaacttagattttatgtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtatagcaagtacatggtTTCTTACATACCCCTCTTTTCGATAAATA---TTGGGGG-ATATT---GAAATGGC---ATCTGTCTG-----CA-----GTCTGTC--ACGTTATT-Tttagtgatactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttg
gi|6 : ataaatttacgttgtat-----------------GAAAC-TTGCTGTAC--AACAA--GTACA----T-GG-TCTGAACATGT-GCCAGTGGTATTGGCATTA-TGATTAAATTGTTGT---TGT-TTTTT-AAGGA-GTT-ATGGCCCTT----TTA-TT-CTTTTTTCCTA----GATT---------TTAC-TTC-A-Ttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|6 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAT-----------------GTAAC-TTTCTGTAT--ATCAA--GTACA----T-GG-TCTGAATATGT-GCCTGTGGTATCGACATTC-TGA-TAGA------T---TTT-TATTT-ATTGA-GTT-ATGGCTC-T----TTG-TT-CTTT-----TA----ACTT-A-GA----TTacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcaatgtaactttctgtatatcaagtacatggtctgaatatgtgcctgtggtatcgacattctgatagatttttatttattgagttatggctctttgttcttttaacttagatttaat
gi|7 : ataaatttacgttgtatttcttacatacccctcttttcgataaatattgggggatattgaaatggcatctgtctgcagtctgtcacgttattttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacttgctgtacaacaagtacatggtctgaacatgtgccagtggtattggcattatgattaaattgttgttgttttttaaggagttatggcccttttattcttttttcctagattttacttcatacattactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccttgctgtatatcattgtaacttgctgtatatcA--TT--AA-C-T--AT-T--TT---TTTATTTTAATGC-CCTTT-G-TAATTTTA---------AC-TTTAATTT---------------------------------------GCGAA-----------------C-----------------GCAA--------ACC-------------CTCCTAC--AG----ATA--AAATC-ATGT-CAAAT-----------------GTCAC-TTGTTTTGC--AGCAG---TACA----T-GG-TCTAAACATAA-GAATGTAGTATTTGTGTTC-CAGCTCAA------TGCGTA--------AT-GA-GTT-ATGGTCC-T----TTG-AT-CTCT-----TG----AATG-G-AA----CTACATTC-T-TT-GCAA-T-TTGCATTTtaat
gi|7 : gtacatgttcttatcacgtgcatgtaaa---TTGCATTTTCT---TATCAGGA--CATACTTTCAGGAA--GTAATTACA-TTGTTTGTT-AAGGA-CCAG-TAATATAAAAGGCCAAGGCCAATTGGGCCA-----CAT----G--CACC-----A-TTT---------T---------GT-TTT-----GTACTT-----------CAGTGTTTGTTTTAA----T--TA-T-TTC---CCTA--TTGTA----TTGT---------G-TTCTGCCAACCCATCTCTAACT--CCA----------AATTT----C-----CAT-CCG-----------GC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTAACTCATTGCTTATTGATAAACCTTTGCC-TTG-GT-TTC-----ATTTtcttatcaggacatactttcaggaagtaattacattgtttgttaaggaccagtaatataaaaggccaaggccaattgggccacatgcaccattttgttttgtacttcagtgtttgttttaattatttccctattgtattgtgttctgccaacccatctctaactccaaatttccatccggctcatctgtttcttaactcattgcttattgataaacctttgccttggtttcatttcatcccg
gi|8 : gtacatgttcttatcacgtgcatgtaaaattaactatttttttattttaatgccctttgtaattttaactttaatttgcgaacgcaaaccctcctacagataaaatcatgtcaaatgtcacttgttttgcagcagtacatggtctaaacataagaatgtagtatttgtgttccagctcaatgcgtaatgagttatggtcctttgatctcttgaatggaactacattctttgcaatCTGTA-G-ATTTA--GGATTCC-A--TTTAAA-T-T--AT-T--TTTC-ATTGAGTAATGGC-CATTAAG-TTATTTTA---------AC-TTA-ATTT----T------T-----AC-----A------------TCAT--AATNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------NNNN-NNNN--NNNN-------------NNNNNNN--NN----NNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-----------------GAAAC-TTGCTGCACTAAGTAG--GTACA----T-AT-TCTGAACATGA-GTCTGTGGTCTTGGCATTC--AATTAA-------T---GAT-TT------AGACATT--TGACC------------T-CTTT-----TA----TA---A-AA----TTATATTC-T-TT-GAAACT-ATGCATTTCATCTTATAGATTAAGTATTGAGTAACAGCACTTTCTAC-------T---TTGAATTTGCT---TATGAGAA--CAGGCTTTCAGGAA--GAACTGACCTTTATTTG-TAAAGGG-CAAC-TTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTcatcccg
gi|9 : tttcattttacatcacacttt-GTT-ATGGCGC-T----TTG-AT-CTTT-----TT----AATG-A-AA----TAACATTC-ATTT-GTAACT-TTGCAATACGGACTCTA-----TCTATTGAATAAAAGCACCTA-CATGTACAAAC---GTGCATCTTCTTCATATGGGGA--CA----T---GGAC--AT-ATGACATTCATTCGTT-AAGGG-CCAG-TTAACCCAAAGTTGAAAGTCATT---GT---------TGCCAG--CCCT-----T-GTCCAATAAAAAT---------ATATTTT----GTTCTCT---C----T------TTT-TCTTAA----T--AC-T-CCC---CCCAACCTTTATTTCTTATTCATCTTCAGCTTTCATCA---------TACTCTGCTA----------AATTT----C-----AACTT-------------GC-------T----------CA----T-C------------TG--------TTTCTTTACTTCTTGTTG-------AATC-TCACT-TTG-A----------ATTCCTTTCA--AC--CCA---CA-----TGAT-----ACTAAAATATTTA-------TTT-----TTTCCCACTA-CAATG----TT-TATT---------TCATATCCTAAGCATAATAGAACACCA-GGACAC--------TC-A-------------T-------------C-----T-A-------------CAGGCAATTTCTATTTT-TTCTCAGTccaatcattttctttcctcctttccaaaaccagaattttttgtttactaaa