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Reference ( gi|5 )            :                                                     TAATTATTCACTTCATTTT-T--AAGTTTCTT--AAATATATCAGAAACAATATTGCTAAAAGTATGTTAA-A-CG-T-TTTT--ATTATATATATATTGAAC-TATGTTATATTC--GTAATGCTAAGACCATA-----A------A---T-C--AGATT-GT-TAATAA--TCTGCCAAATTT-GTTCA--CA---ATTGA--TA----TA-TGTC-ATGGAAAAGAACTT-TATAA--G-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----AT--------ATT-T--ATAC--CTAA--ACTTATG----T----GTAT-ATA-TGTAC--AT-TTGA--A--TGAAT-AAA-ATATGTTTAAAC
gi|4                          :                                                     TAAGTACTCACTTCGTTTTCT--AAGTTTCTT--AAATATATCAGAAACAATATTCCTAAAAGTATGTTAA-A-CA-T-TTTT--ATTAAATATATTTTGAAC-TATGGTATATTC--GTAATGGTAAGAGCATA-----A------A---T-C--AAATT-GT-TGATAA--TCTGCCAAATTT-GTTCA--CA---ATTGA--TA----TA-TGTC-ATGGAAAAGAACTT-TATAA--G-ATT---TTAT-CTT-C-CAT-TCTAATCC-----AT--------ATT-T--ATAC--CTAA--ACTTATG----T----GTAT-ATA-TATAC--AT-TTGA--A--TGAAT--AA-ATATGTTTA
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gi|18                         :                                                      AATTACCCGCTTCACTTC-T--ATTTTTCTT--AAACATATTAGAAATATTATT-CTAACAATATGTAAAGA-TA-T-TTTT--ACTAAGTATATTTTGAAC-TAGGTTATATTC--ATAAAGTTAAGAGCATA-----C------A---TAC--A-ATT-GT-TAATGA--TCTGCCAAATCT-GTTTA--CA---TTTAA--TA----TA-TGTC-A
gi|6                          :                                                           tcCGCTTCACTTC-T--ATTTTTCTT--AAACATATTAGAAATATTATT-CTAACAATATGTAAAGA-TA-T-TTTT--ATTAAGTATATTTTTAAC-TAGGTAA-ATTC--ATAAAGTTAAGAGCATA-----C------A---T-A--AAATT-GT-TAATGA--TCTGCCAAATCT-GTTAA--CA---TTTAA--TA----TA-GGTC-ATGGAGAAGAACTT-TATAA--G-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----AT--------ATT-T--ATACTTTTTT--ACTGATC----T----GTAT-GTA-TGTAA--AT-TTGA--A--TGAAT--AA-ATATGTTTAA
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gi|2                          : ctcttctcagcttgtatttattatacataggcctactagtattaatactacgaaaatatataattgatcattgttcattaatttttcattatatttttttttctttgtttctaaaacatattatatctaataactttaattaaaaaagagtatatttatccagccatgagctctttaaataaagttgatacctaatttagcgcattttaaATT-GT-CAATAA--TCTGCCAAATCT-GTACA--CA---TTTTA--CA----CA-TTTT-ATGGAGAAGAACTT---TAA--G-ATTAAACTAT-CTT-C-CATGTATAAT------------------TT-C--ATAT--C--G--ATTTATA----T----G-----TA-TGTAA--AA-TTCA--A--T---T-GAA-AGATGTTTAAACcaa
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                           aaggttaaaatgaaataacagtaaaattgcattcattttttgttattttaacaatgctttctaatgaa-ATGGAAACTAACTT-TATAA--G-ATT---TTAT-ATT-C-CGT-TCTAATAC-----AT--------GTT-T--GTTC--CTAA--ACTTATG----T----GTAT-ATA-TGTAC--AT-TTGA--A--TGAAT--AA-ATATGTTTAAACtcaaattcctatgcaaaacgaca
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                     tcatatgataattcttaagatcacatacctcatgacgccaat-ATAGAAAAGACCTT--------G-ATT---TTAT-CTT-C-AGT-TCTAATCC-----AT--------ATT-T--ATAC--TTAA-----TATGTTT-T----GTAT-TTA-TAAGA--AT-TTGACTA--CAAAT-AA----CTGTTTAAAC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     tAGGAACTT-TATAA--G-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----AT--------AAT-T--ATAC--CTAA--ACTTATG----C----GTAT-ATA-TGTAC--AT-TTGA--A--TGAAC--CA-TTATGTTTAt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGAACAT-CATAA--GCATT-----ATGCTT-C-CGT-TCTAATCC-----TTTTTCTGTTATTGT--ATAC--------ACTTGTA----TTACTGTAT-AAAATGTACTTATATTGA--G---AAAT-ACA-ATATGTTTAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                         AACTC-TACAG--G-ATG---TTAT-CTTAC-CA---CCAATCC-----AT--------ATT-T--ATAT--TTAA--ACTGATT----G----GTAT-GTA-TGTAA--AT-TTGA--A--TAAAT-AAA-ATGAGTTAAAAC
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gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACGT-TATAA--G-AAT---TTAT-ATT-C-CGT-TCTAATCG-----AT--------ATT-C--ATAC--TTAA--ACTGATT----T----GAAT-GTA-TGTAA--AT-TTGT--A--TAAAT-AAATATAT
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): TAAAATGTACTTATATTGAGAAATAAAATATGTTTAAACC






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Reference ( family-174 )      :                                                                                                                                                                                    TAATTACTCGCTTCATTT--CTAAG--TTTCTTAAATATATCAGAAACAATATTCCTAACAGTATGTNA-A-A-CAT-TTT-T--ATTAAGTATATTTTGA-ACTANGTTATATTC--GTAATGCTAAGAGCA-TAAATCAA-------ATTGTTAATAA--TCTGCCAAATCT-GTTCA--CAATTGA--TA----TA-TGTC-ATGGAGAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----------ATATT---TATAC--TTAAACTNATNTGT---ATGTATGTAAATTTGA--A--TGAAT-A---AA-ATA-TG-----TTTAAAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -------ATTGTCAATAA--TTTGCAAAATTTTGTACA--CA-TT---------------TC-ATGGAGAAGAAC----T----TTAAAAA-ATT---AAAT-CTT-C-CGT-TCTAATAT-----------ATATG---TGTAT--TTATGTTGATTTCT---ATGTATGTATAACTGA--GT-TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAAAC
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                             aaaccagaATAT--CTAATAGTACGTAA-G-A-TATATTT-T--ATTAAGTATATTATGA-CTTAGGTTATATTTTTGTCATGTTAAGCGC--TGA-TGAA-------ACTGTTAATGACATCT--CGAACCT-CTTCG--CAATTAA--TA----CA-TGTC-A-------AAAC----C----TTTTACG-ATT---TAAT-CTT-C-CAT-TCTAAACC-----------ATATT---TATAC--TTAAACTGATTTGT---ATGTATGTAAATTTG---A--TCAAT-A---AA-ATA-TG-----TTTAAAtcc
gi|12                         :                                                                                                                                                                               ccattTAATTACTCGCTTCATTTT-CTAAGTTTTTTTTAAATATATCAGAATAAATATTCATAAAAGTATG--A-A-A-CAT-TTT-A--ATTAAATATATTTTGA-ACTATGTTAAATTC--ATTATACTAAGAGCA-TAAATCAA-------ATTATTGATAA--TCTGCCAAATCT-GTTCA--CAAT--A--TA----TA-TGTC-ATGGAGAAGAAC----T----TTATAGG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----------
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                tttcTGTTA-A-A-CAT-TTT-T--ATTAGATATAATTTGA-ACTGTTTTATATTC--GTAATGCTAAGAGCA-TCAATCAA-------ACTGTTGATAA--TCTGCCAAATTT-GTTCA--CAATTGA--TA----TA-TTTC-ATGGAAAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTATTCC-----------ATATG---TACAC--CTTAACTTATGTGT---ATATATGCACATTTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TT-----TTTAAAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAT-CTT-C-AAT-TCTAATCC-----------ATATT---TATAC--TTAAATTGATTTGT---ATATATGTAAATTTGG--A--TAAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAAAc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaggttaaaatgaaataacagtaaaattgcattcattttttgttattttaacaatgctttctaatgaacatggaattaaattcatataatggagacGTC-ATGGAGAAGAAC----T----TTATCAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----------ATATT---TATACTTTTGTACTGATTTGT---ATGTATGTAAATTTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAAAtcaaattcctatgcaaaacgaca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gcaaaaacatgtaagtaggtataacaattgactgtgccggatataaatagatattgtcttatgatttcctcaacatataacatgaaAAC----T----CTACAGG-ATG---TTAT-CTTAC-CA---CCAATCC-----------ATATT---TATAT--TTAAACTGATTGGT---ATGTATGTAAATTTGA--A--TAAAT-A---AA-ATG-AG-----TTAAAAC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                tgttaatgtttgtcttcatatttcattttttatttataataattttatcA-------ATAGTTAGCTA--TTTGCTACAT---GT-------ATTGA--TA----CAATACCCGTGGAGAAGAAC----T----CTATAAG-AGT---T-AT-CTT-C--G-----------------------ATT---TACAC--T------GATTTGT---ATGTATGTAAATTTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAAACcaattattttccactttattagaaagttttatagttagttatttta
gi|18                         :                                                                                                                           tttattaaatgcattttttgtctgtataaaaccatacaacgtgttattggatttgtgcAATTACCCGCTTCACTT--CTATT--TTTCTTAAACATATTAGAAATATTATTC-TAACAATATGTAA-AGA-TAT-TTT-T--ACTAAGTATATTTTGA-ACTAGGTTATATTC--ATAAAGTTAAGAGCA-TACATACA-------ATTGTTAATGA--TCTGCCAAATCT-GTTTA--CATTTAA--TA----TA-TGTC-Ac
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   tc-T--ATTAAATATGTTTTGA-ACTATGTTATATTC--GTAAC---------------TTAA-------ATTGTTAATAA--TCTGCCAAATCT-GTTCA--CAATTTA--TA----TA-TGTC-ATGGAGAA-AAC----A----TTATAAG-ATT---TTGT-CTT-C-TGT-TCTTATCC-----------ATATG---TATAC--CTAAACTTATGCG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                 taagaatataaacaagagcacacTTCCTA-CGGT-TCTAA-A-A-CAT-ATT-A--AT--AATCTAATCTGACAC-ATGTTTCAG-C--ATAATTCCATTATCAATAAA--AACTGGAGTATTGTCAATAA--TCTGCCAAATCT-GTACA--CATTTTA--CA----CA-TTTT-ATGGAGAAGAAC----T----T--TAAG-ATTAAACTAT-CTT-C-CATGTATAAT----------------TT---CAT--------ATCGATTTAT---ATGTATGTAAAATTCA--A--T---T-G---AA-AGA-TG-----TTTAAAC
gi|20                         :                                                                                                                                                               ttttctcatctggtattaaacataccagtattctaatagtatgaaaatatatatataatcggttgatcgtttcTTTCTAACAGTTTGTAA-AGA-CGT-TTTTT--ATTAAGTATATTTTGA-ACTAAGTTATATTC--ATAATGCTTAGAGCA-TACATACA-------ATCAGTAATGA--TCTGCCAAATCT-GTTTA--CATTTAA--TA----TA-TACC-ATGGAGAAAAAC----T----TTACAAG-ATT---TTGT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----------ATAcaaat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                    TAATTACTCGTTTCATTTT-CTACG--TTTCTTAAGTATATCTGAACCAATATTACTAAAAGTATGTTA-A-AACAT-TTC-T--GTTAAATATATATTGA-ACTATGTTATATTC--GTAATACTAAGAGCA-TAAATTAA-------ATTGTTAATAA--TCTGCCAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TC-ACGGAGAAGAAC----T----TTATACA-ATT---T-AT-CTT-C-CGT-TCTGATCC-----------AGGTT---TATAA--TTTAACTGATTTGT---AT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGT---ATGTATGTAAACTTGA--A--TATAT-AAATAA-ATACTGCACCTTTTAAACcaaggaattataccagtccttgtttgtttgtatgtatgtaaacttgaatatataaataaatactgcaccttttaaacac
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcacggagaagaactttatacaatttatcttccgttctgatccaggtttataatttaactgatttgtatcaaggaattataccagtccttgtttgtt-ATGGAAACTAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-ATT-C-CGT-TCTAATAC-----------ATGTT---TGTTC--CTAAACTTATGTGT---ATATATGTACATTTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAAACac
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tcatatgataattcttaagatcacatacctcatgacgccaatCAAATAT-GTACGTGCAGTTTA--CA----CG-TGTA-ATTGAGATGAAC----T----CTGTCAG-ACA---ATAT-CTT-CTCAG-TCTGATTC-----------ATGTT---TGAAT--TTGTATTTATATCT---ATGAATGTTAAACTGA--ATTTGAA--A---AA-ATA-TC-----TTTAAA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAC----A----TCATAAGCATT-----ATGCTT-C-CGT-TCTAATCCTTTTTCTG---TTATTGTATACAC--TTGTATTACTGTATAAAATGTACTTATA-TTGA--G---AAAT-A---CA-ATA-TG-----TTTAAA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAC----A----TCATAAGCATT-----ATGCTT-C-CGT-TCTAATCCTTTTTCTATTAGTGTT---TACAC--TTGTATTACTGTATAAAATGTACTTATA-TTGA--G---AAAT-A---AA-ATA-TG-----TTGAAA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGGAGAATAACATAATCACGTTATAAG-AAT---TTAT-ATT-C-CGT-TCTAATCG-----------ATATT---CATAC--TTAAACTGATTTGA---ATGTATGTAAATTTGT--A--TAAAT-A---AATATA-T
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Reference ( family-174 )      :                                                                                                                                                                                    TAATTACTCGCTTCATTTT-CTAAG--TTTCTTAAATATATCAGAAACAATATTCCTAACAGTATGTNA-A-A-CAT-TTT-T--ATTAAGTATATTTTGA-ACTATGTTATATTC--GTAATGCTAAGAGCA-TAAA---TNAA--ATTGT-TAATAA--TCTGC-CAAATCT-GTTCA--CAATTGA--TA----T-A-TGTC-ATGGAGAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATATTTATAC--T----TAAAC-TG-ATT--TGT-----A----TGTATGTAAAT---------TTGA--A--TGAAT-A---AA-ATA-TG-----TTTAAAC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                        aaggttaaaatgaaataacagtaaaattgcattcattttttgttattttaacaatgctttctaatgaacatggaattaaattcatataatggagacA-TAAA---TAGAT-ATTGTCTTATGA--TTTCCTCAA--------CA--TA--TAA--CA----TGA-AGTC-ATGGAGAAGAAC----T----TTATCAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATATTTATACTTT----TGTAC-TG-ATT--TGT-----A----TGTATGTAAAT---------TTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAAAtcaaattcctatgcaaaacgaca
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                 taagaatataaacaagagcacacTTCCTA-CGGT-TCTAA-A-A-CAT-ATT-A--AT--AATCTAATCTGACAC-ATGTTTCAG-C--ATAATTCCATTATCAATAAAAACTGGAGTATTGT-CAATAA--TCTGC-CAAATCT-GTACA--CATTTTA--CA----C-A-TTTT-ATGGAGAAGAAC----T----T--TAAG-ATTAAACTAT-CTT-C-CATGTATAAT----------TTCAT------------AT-CG-ATT--TAT-----A----TGTATGTAAAA---------TTCA--A--T---T-G---AA-AGA-TG-----TTTAAACgcg
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TT--TGT-----A----TGTATGTAAAC---------TTGA--A--TATAT-AAATAA-ATACTGCACCTTTTAAACcaaggaattataccagtccttgtttgtttgtatgtatgtaaacttgaatatataaataaatactgcaccttttaaacac
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcacggagaagaactttatacaatttatcttccgttctgatccaggtttataatttaactgatttgtatcaaggaattataccagtccttgtttg-ATGGAAACTAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-ATT-C-CGT-TCTAATAC-----ATGTTTGTTC--C----TAAAC-TT-ATG--TGT-----A----TATATGTACAT---------TTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAAACac
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcatatgataattcttaagatcacatacctcatgacgccaat-CAAATAT-GTACGTGCAGTTTA--CA----C-G-TGTA-ATTGAGATGAAC----T----CTGTCAG-ACA---ATAT-CTT-CTCAG-TCTGATTC-----ATGTTTGAAT--T----TGTAT-TT-ATA--TCT-----A----TGAATGTTAAA---------CTGA--ATTTGAA--A---AA-ATA-TC-----TTTAAA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGAAC----A----TCATAAGCATT-----ATGCTT-C-CGT-TCTAATCC------TTTTTCTGT--TATTGTATAC----ACT--TGT-----ATTACTGTATA-AAATGTACTTATATTGA--G---AAAT-A---CA-ATA-TG-----TTTAAA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAC----A----TCATAAGCATT-----ATGCTT-C-CGT-TCTAATCCTTTTTCTATTAGTGT--T----TACACTTGTATTACTGTATAAAA----TGTACTTATA----------TTGA--G---AAAT-A---AA-ATA-TG-----TTGAAA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGGAGAATAACATAATCACGTTATAAG-AAT---TTAT-ATT-C-CGT-TCTAATCG-----ATATTCATAC--T----TAAAC-TG-ATT--TGA-----A----TGTATGTAAAT---------TTGT--A--TAAAT-A---AATATA-T
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -ATAGAAAAGACC----T----T-----G-ATT---TTAT-CTT-C-AGT-TCTAATCC-----ATATTTATAC--T----TAATA-TG-TTT--TGT-----A----TTTATAAGAAT---------TTGACTA--CAAAT-A---A----C-TG-----TTTAAAC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tAGGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATAATTATAC--C----TAAAC-TT-ATG--CGT-----A----TATATGTACAT---------TTGA--A--TGAAC-----CA-TTA-TG-----TTTAt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                    TAATTACTCGCTTCCTTTTTCTAAG--TTTCTTAAATATATCAGAAACAATATTCCTTAAAGTACGTTA-A-T-CAT-TTT-T--GATAAATATATTTTGA-ACTATGTTATATTC--GTAAAGCTAAGAACA-AAAA---TCAA--ATTGT-TAATAA--TCTGC-CAAATTT-CTTCA--CAATTGA--TA----T-A-TGTT-ACGGAAAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCCAATCC-----ATATTTAAAC--C----TAAAC-TC-ATG--TGT-----A----AATATGTACAT---------TTGA--A--TGAA--A---AA-ATA-T
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tctcTATTT------T----TAAAC-TG-ATT--TGT-----A----TGTATAAAAAT---------TGGA--A--TGAAT-----AG-ATA-TG-----TTTAAACtctt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-C-CGT-TCTATTAA-----GTATTTGAAT--T----TATAA-TG-ACT--TAT-----G----TGTATGTACAA---------TTGA--AT-TGAAT-----AA-CTC-TG-----TTTAAAtaaacctggaaatcatcactgtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                    TAAGTACTCACTTCGTTTT-CTAAG--TTTCTTAAATATATCAGAAACAATATTCCTAAAAGTATGTTA-A-A-CAT-TTT-T--ATTAAATATATTTTGA-ACTATGGTATATTC--GTAATGGTAAGAGCA-TAAA---TCAA--ATTGT-TGATAA--TCTGC-CAAATTT-GTTCA--CAATTGA--TA----T-A-TGTC-ATGGAAAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CAT-TCTAATCC-----ATATTTATAC--C----TAAAC-TT-ATG--TGT-----A----TATATATACAT---------TTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAacaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                tttcTAATTATTCACTTCATTTT--TAAG--TTTCTTAAATATATCAGAAACAATATTGCTAAAAGTATGTTA-A-A-CGT-TTT-T--ATTATATATATATTGA-ACTATGTTATATTC--GTAATGCTAAGACCA-TAAA---TCAG--ATTGT-TAATAA--TCTGC-CAAATTT-GTTCA--CAATTGA--TA----T-A-TGTC-ATGGAAAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATATTTATAC--C----TAAAC-TT-ATG--TGT-----A----TATATGTACAT---------TTGA--A--TGAAT-A---AA-ATA-TG-----TTTAAAC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                         ACCCGCTTCACTT--CTATT--TTTCTTAAACATATTAGAAATATTATTC-TAACAATATGTAA-AGA-TAT-TTT-T--ATTAAGTATATTTTTA-ACTAGGTAA-ATTC--ATAAAGTTAAGAGCA-TACA---TAAA--ATTGT-TAATGA--TCTGC-CAAATCT-GTTAA--CATTTAA--TA----T-A-GGTC-ATGGAGAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATATTTATACTTT----TTTAC-TG-ATC--TGT-----A----TGTATGTAAAT---------TTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                     TT-CTAAG--TTTCTTAAATATATCAGAAACAATATTCTTAAAAGTATGTTA-A-A-CAT-TTT-TTTATTAAATATATTTTGA-ACTATGTTATATTC--GTAATGCTAAGAGCA-TAAA---TCAA--ATTGG-TAATAA--TCTGC-CAAATTTTGTTCA--CAATTGA--TA----T-A-AGTC-ATGGAAAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTTATCC-----ATATTTATAC--A----TAAAC-TT-ATG--TAT-----A----TATATGTACAT---------TTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                     AATTACTCGCTTCATTT--CTAA---TTTC------ATATTAGAACTATTATTC-TAACAATAAGTAA-AGA-TAT-TTT-T--ACTAAGTATATTTTGA-ACTAGGTTATATTC--ATAAAGTTAGGAGCA-TACA---TAAA--ATTGT-TAATGA--TCTGC-CAAATCT-GTTTA--CATTTAA--TA----T-A-TGTC-ATGGAGAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATATTTATACTTT----TATAC-TG-ATT--TGT-----A----TGTATGTAAAT---------TTGA--A--TGA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                     TT-CTAAG--TTTTT---ATATAGTAGAACCAATATTCCTAACAGTATG-CA-A-A-GATATTT-C--ATAAAGAATAGGTT-A-ACTA--------------GAT--TAAGTACA-TAAG---T-AA--ATTGT-TAATGA--TCTCC-CAAATCT-GTTTT--CATTTAGTTTAATCTT-A-TATC-ATGGAGAAGAAT----T----ATGTAAC-ATT---TTAT-TTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATGTTTATAG--T----TAAAC-TG-ATT--TGA-----A----TGTATGTAAAT---------TTGA--A--GGAAT-----AA-ATA-TG-----
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): TAAAATGTACTTATATTGAGAAATAAAATATGTTTAAACC






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Reference ( family-174 )      :                                                                                                                                                                                    TAATTACTCGCTTCATTTT-CTAAG--TTTCTTAAATATATCAGAAACAATATTCCTAACAGTATGTNA-A-A-CAT-TTT-T--ATTAAGTATATTTTGA-ACTATGTTATATTC--GTAATGCTAAGAGCA-TAAA---TNAA--ATTGT-TAATAA--TCTGC-CAAATCT-GTTCA--CAATTGA--TA----T-A-TGTC-ATGGAGAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATATTTATAC--T----TAAAC-TG-ATT--TGT-----A----TGTATGTAAAT---------TTGA--A--TGAAT-A---AA-ATA-TG-----TTTAAAC
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gi|20                         :                                                                                                                                                               ttttctcatctggtattaaacataccagtattctaatagtatgaaaatatatatataatcggttgatcgtttcTTTCTAACAGTTTGTAA-AGA-CGT-TTTTT--ATTAAGTATATTTTGA-ACTAAGTTATATTC--ATAATGCTTAGAGCA-TACA---TACA--ATCAG-TAATGA--TCTGC-CAAATCT-GTTTA--CATTTAA--TA----T-A-TACC-ATGGAGAAAAAC----T----TTACAAG-ATT---TTGT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATAcaaat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                    TAATTACTCGTTTCATTTT-CTACG--TTTCTTAAGTATATCTGAACCAATATTACTAAAAGTATGTTA-A-AACAT-TTC-T--GTTAAATATATATTGA-ACTATGTTATATTC--GTAATACTAAGAGCA-TAAA---TTAA--ATTGT-TAATAA--TCTGC-CAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TC-ACGGAGAAGAAC----T----TTATACA-ATT---T-AT-CTT-C-CGT-TCTGATCC-----AGGTTTATAA--T----TTAAC-TG-ATT--TGT-----A----T
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TT--TGT-----A----TGTATGTAAAC---------TTGA--A--TATAT-AAATAA-ATACTGCACCTTTTAAACcaaggaattataccagtccttgtttgtttgtatgtatgtaaacttgaatatataaataaatactgcaccttttaaacac
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcacggagaagaactttatacaatttatcttccgttctgatccaggtttataatttaactgatttgtatcaaggaattataccagtccttgtttg-ATGGAAACTAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-ATT-C-CGT-TCTAATAC-----ATGTTTGTTC--C----TAAAC-TT-ATG--TGT-----A----TATATGTACAT---------TTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAAACac
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcatatgataattcttaagatcacatacctcatgacgccaat-CAAATAT-GTACGTGCAGTTTA--CA----C-G-TGTA-ATTGAGATGAAC----T----CTGTCAG-ACA---ATAT-CTT-CTCAG-TCTGATTC-----ATGTTTGAAT--T----TGTAT-TT-ATA--TCT-----A----TGAATGTTAAA---------CTGA--ATTTGAA--A---AA-ATA-TC-----TTTAAA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGAAC----A----TCATAAGCATT-----ATGCTT-C-CGT-TCTAATCC------TTTTTCTGT--TATTGTATAC----ACT--TGT-----ATTACTGTATA-AAATGTACTTATATTGA--G---AAAT-A---CA-ATA-TG-----TTTAAA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAC----A----TCATAAGCATT-----ATGCTT-C-CGT-TCTAATCCTTTTTCTATTAGTGT--T----TACACTTGTATTACTGTATAAAA----TGTACTTATA----------TTGA--G---AAAT-A---AA-ATA-TG-----TTGAAA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGGAGAATAACATAATCACGTTATAAG-AAT---TTAT-ATT-C-CGT-TCTAATCG-----ATATTCATAC--T----TAAAC-TG-ATT--TGA-----A----TGTATGTAAAT---------TTGT--A--TAAAT-A---AATATA-T
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -ATAGAAAAGACC----T----T-----G-ATT---TTAT-CTT-C-AGT-TCTAATCC-----ATATTTATAC--T----TAATA-TG-TTT--TGT-----A----TTTATAAGAAT---------TTGACTA--CAAAT-A---A----C-TG-----TTTAAAC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tAGGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATAATTATAC--C----TAAAC-TT-ATG--CGT-----A----TATATGTACAT---------TTGA--A--TGAAC-----CA-TTA-TG-----TTTAt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                    TAATTACTCGCTTCCTTTTTCTAAG--TTTCTTAAATATATCAGAAACAATATTCCTTAAAGTACGTTA-A-T-CAT-TTT-T--GATAAATATATTTTGA-ACTATGTTATATTC--GTAAAGCTAAGAACA-AAAA---TCAA--ATTGT-TAATAA--TCTGC-CAAATTT-CTTCA--CAATTGA--TA----T-A-TGTT-ACGGAAAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCCAATCC-----ATATTTAAAC--C----TAAAC-TC-ATG--TGT-----A----AATATGTACAT---------TTGA--A--TGAA--A---AA-ATA-T
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tctcTATTT------T----TAAAC-TG-ATT--TGT-----A----TGTATAAAAAT---------TGGA--A--TGAAT-----AG-ATA-TG-----TTTAAACtctt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-C-CGT-TCTATTAA-----GTATTTGAAT--T----TATAA-TG-ACT--TAT-----G----TGTATGTACAA---------TTGA--AT-TGAAT-----AA-CTC-TG-----TTTAAAtaaacctggaaatcatcactgtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                    TAAGTACTCACTTCGTTTT-CTAAG--TTTCTTAAATATATCAGAAACAATATTCCTAAAAGTATGTTA-A-A-CAT-TTT-T--ATTAAATATATTTTGA-ACTATGGTATATTC--GTAATGGTAAGAGCA-TAAA---TCAA--ATTGT-TGATAA--TCTGC-CAAATTT-GTTCA--CAATTGA--TA----T-A-TGTC-ATGGAAAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CAT-TCTAATCC-----ATATTTATAC--C----TAAAC-TT-ATG--TGT-----A----TATATATACAT---------TTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAacaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                tttcTAATTATTCACTTCATTTT--TAAG--TTTCTTAAATATATCAGAAACAATATTGCTAAAAGTATGTTA-A-A-CGT-TTT-T--ATTATATATATATTGA-ACTATGTTATATTC--GTAATGCTAAGACCA-TAAA---TCAG--ATTGT-TAATAA--TCTGC-CAAATTT-GTTCA--CAATTGA--TA----T-A-TGTC-ATGGAAAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATATTTATAC--C----TAAAC-TT-ATG--TGT-----A----TATATGTACAT---------TTGA--A--TGAAT-A---AA-ATA-TG-----TTTAAAC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                         ACCCGCTTCACTT--CTATT--TTTCTTAAACATATTAGAAATATTATTC-TAACAATATGTAA-AGA-TAT-TTT-T--ATTAAGTATATTTTTA-ACTAGGTAA-ATTC--ATAAAGTTAAGAGCA-TACA---TAAA--ATTGT-TAATGA--TCTGC-CAAATCT-GTTAA--CATTTAA--TA----T-A-GGTC-ATGGAGAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATATTTATACTTT----TTTAC-TG-ATC--TGT-----A----TGTATGTAAAT---------TTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                     TT-CTAAG--TTTCTTAAATATATCAGAAACAATATTCTTAAAAGTATGTTA-A-A-CAT-TTT-TTTATTAAATATATTTTGA-ACTATGTTATATTC--GTAATGCTAAGAGCA-TAAA---TCAA--ATTGG-TAATAA--TCTGC-CAAATTTTGTTCA--CAATTGA--TA----T-A-AGTC-ATGGAAAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTTATCC-----ATATTTATAC--A----TAAAC-TT-ATG--TAT-----A----TATATGTACAT---------TTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                     AATTACTCGCTTCATTT--CTAA---TTTC------ATATTAGAACTATTATTC-TAACAATAAGTAA-AGA-TAT-TTT-T--ACTAAGTATATTTTGA-ACTAGGTTATATTC--ATAAAGTTAGGAGCA-TACA---TAAA--ATTGT-TAATGA--TCTGC-CAAATCT-GTTTA--CATTTAA--TA----T-A-TGTC-ATGGAGAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATATTTATACTTT----TATAC-TG-ATT--TGT-----A----TGTATGTAAAT---------TTGA--A--TGA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                     TT-CTAAG--TTTTT---ATATAGTAGAACCAATATTCCTAACAGTATG-CA-A-A-GATATTT-C--ATAAAGAATAGGTT-A-ACTA--------------GAT--TAAGTACA-TAAG---T-AA--ATTGT-TAATGA--TCTCC-CAAATCT-GTTTT--CATTTAGTTTAATCTT-A-TATC-ATGGAGAAGAAT----T----ATGTAAC-ATT---TTAT-TTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATGTTTATAG--T----TAAAC-TG-ATT--TGA-----A----TGTATGTAAAT---------TTGA--A--GGAAT-----AA-ATA-TG-----


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      TT     .                             C   T       A . G A   A   TTT                 C    G         TT               A    AAC G  GT     C      CA     T       T     TG  A  G TT  ATCT G A    C            ATAA CACG       A   AAA    G   A T   G        TTTTT          TT ATTG     T  T   AC   ATAAA TTAC           GTACTTATA    CT TT     AAAT   T   C  CACCT
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      T      .                             A   A       T . G .   A   TT                  .    T         .                .    .   C  T      .      .      .       .     .   A  A .   .    . .    .            .    .          C   .      G   . .   .        .              TT .        .  .   .    .     .              .            .  T      AA     .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      T      .                             C   C       A . G .   .   T                   .    T         .                .    .   C  .      .      .      .       .     .   A  G .   .    . .    .            .    .          C   .      .   . .   .        .              TT .        .  .   .    .     .              .            .  .      A      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      T      .                             C   C       A . G .   .   A                   .    G         .                .    .   A  .      .      .      .       .     .   A  A .   .    . .    .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      A      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      T      .                             C   C       A . . .   .   T                   .    T         .                .    .   A  .      .      .      .       .     .   A  G .   .    . .    .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      G      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      T      .                             C   A       T . . .   .   T                   .    T         .                .    .   T  .      .      .      .       .     .   T  A .   .    . .    .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      A      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      .      .                             C   A       T . . .   .   T                   .    A         .                .    .   G  .      .      .      .       .     .   A  T .   .    . .    .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      A      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      .      .                             C   A       T . . .   .   A                   .    T         .                .    .   A  .      .      .      .       .     .   T  T .   .    . .    .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      A      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      .      .                             T   A       T . . .   .   T                   .    T         .                .    .   T  .      .      .      .       .     .   T  A .   .    . .    .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      A      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                           C   C       A . . .   .   T                   .    T         .                .    .   C  .      .      .      .       .     .   G  T .   .    . .    .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      A      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                           .   A       T . . .   .   T                   .    T         .                .    .   C  .      .      .      .       .     .   A  G .   .    . .    .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      A      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                           .   C       A . . .   .   T                   .    G         .                .    .   C  .      .      .      .       .     .   A  G .   .    . .    .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      A      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                           .   C       C . . .   .   T                   .    T         .                .    .   A  .      .      .      .       .     .   A  G .   .    . .    .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      .      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                       . . . .   .   T                   .    G         .                .    .   C  .      .      .      .       .     .   T  A .   .    . .    .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      .      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                     C                   .    .         .                .    .   A  .      .      .      .       .     .   A  G .   .    . .    .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      .      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .    .   .  .      .      .      .       .     .   T  A .   .    . .    .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      .      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .      .      .      .       .     .   T  A .   .    . .    .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      .      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .      .      .      .       .     .   .  . .   .    . .    .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      .      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .                                      .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      .      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      .      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .            .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      .      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      .      .   .  .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .    .          .   .      .   . .   .        .              .  .        .  .   .    .     .              .            .  .      .      .   .       
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Reference ( family-174 )      :                                                                                                                                                                                    TAATTACTCGCTTCATTTT-CTAAG--TTTCTTAAATATATCAGAAACAATATTCCTAACAGTATGTNA-A-A-CAT-TTT-T--ATTAAGTATATTTTGA-ACTATGTTATATTC--GTAATGCTAAGAGCA-TAAA---TNAA--ATTGT-TAATAA--TCTGC-CAAATCT-GTTCA--CAATTGA--TA----T-A-TGTC-ATGGAGAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATATTTATAC--T----TAAAC-TG-ATT--TGT-----A----TGTATGTAAAT---------TTGA--A--TGAAT-A---AA-ATA-TG-----TTTAAAC
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                tttcTGTTA-A-A-CAT-TTT-T--ATTAGATATAATTTGA-ACTGTTTTATATTC--GTAATGCTAAGAGCA-TCAA---TCAA--ACTGT-TGATAA--TCTGC-CAAATTT-GTTCA--CAATTGA--TA----T-A-TTTC-ATGGAAAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTATTCC-----ATATGTACAC--C----TTAAC-TT-ATG--TGT-----A----TATATGCACAT---------TTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TT-----TTTAAAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAT-CTT-C-AAT-TCTAATCC-----ATATTTATAC--T----TAAAT-TG-ATT--TGT-----A----TATATGTAAAT---------TTGG--A--TAAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAAAc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                        aaggttaaaatgaaataacagtaaaattgcattcattttttgttattttaacaatgctttctaatgaacatggaattaaattcatataatggagacA-TAAA---TAGAT-ATTGTCTTATGA--TTTCCTCAA--------CA--TA--TAA--CA----TGA-AGTC-ATGGAGAAGAAC----T----TTATCAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATATTTATACTTT----TGTAC-TG-ATT--TGT-----A----TGTATGTAAAT---------TTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAAAtcaaattcctatgcaaaacgaca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gcaaaaacatgtaagtaggtataacaattgactgtgccggatAAC----T----CTACAGG-ATG---TTAT-CTTAC-CA---CCAATCC-----ATATTTATAT--T----TAAAC-TG-ATT--GGT-----A----TGTATGTAAAT---------TTGA--A--TAAAT-A---AA-ATG-AG-----TTAAAAC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgttaatgtttgtcttcatatttcattttttatttataataattttatcA--ATAGT-TAGCTA--TTTGC-TACAT---GT-------ATTGA--TA----C-AATACCCGTGGAGAAGAAC----T----CTATAAG-AGT---T-AT-CTT-C--G-----------------ATTTACAC--T-----------G-ATT--TGT-----A----TGTATGTAAAT---------TTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAAACcaattattttccactttattagaaagttttatagttagttatttta
gi|18                         :                                                                                                                           tttattaaatgcattttttgtctgtataaaaccatacaacgtgttattggatttgtgcAATTACCCGCTTCACTT--CTATT--TTTCTTAAACATATTAGAAATATTATTC-TAACAATATGTAA-AGA-TAT-TTT-T--ACTAAGTATATTTTGA-ACTAGGTTATATTC--ATAAAGTTAAGAGCA-TACA---TACA--ATTGT-TAATGA--TCTGC-CAAATCT-GTTTA--CATTTAA--TA----T-A-TGTC-Ac
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   tc-T--ATTAAATATGTTTTGA-ACTATGTTATATTC--GTAAC------------------TTAA--ATTGT-TAATAA--TCTGC-CAAATCT-GTTCA--CAATTTA--TA----T-A-TGTC-ATGGAGAA-AAC----A----TTATAAG-ATT---TTGT-CTT-C-TGT-TCTTATCC-----ATATGTATAC--C----TAAAC-TT-AT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                 taagaatataaacaagagcacacTTCCTA-CGGT-TCTAA-A-A-CAT-ATT-A--AT--AATCTAATCTGACAC-ATGTTTCAG-C--ATAATTCCATTATCAATAAAAACTGGAGTATTGT-CAATAA--TCTGC-CAAATCT-GTACA--CATTTTA--CA----C-A-TTTT-ATGGAGAAGAAC----T----T--TAAG-ATTAAACTAT-CTT-C-CATGTATAAT----------TTCAT------------AT-CG-ATT--TAT-----A----TGTATGTAAAA---------TTCA--A--T---T-G---AA-AGA-TG-----TTTAAACgcg
gi|20                         :                                                                                                                                                               ttttctcatctggtattaaacataccagtattctaatagtatgaaaatatatatataatcggttgatcgtttcTTTCTAACAGTTTGTAA-AGA-CGT-TTTTT--ATTAAGTATATTTTGA-ACTAAGTTATATTC--ATAATGCTTAGAGCA-TACA---TACA--ATCAG-TAATGA--TCTGC-CAAATCT-GTTTA--CATTTAA--TA----T-A-TACC-ATGGAGAAAAAC----T----TTACAAG-ATT---TTGT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATAcaaat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                    TAATTACTCGTTTCATTTT-CTACG--TTTCTTAAGTATATCTGAACCAATATTACTAAAAGTATGTTA-A-AACAT-TTC-T--GTTAAATATATATTGA-ACTATGTTATATTC--GTAATACTAAGAGCA-TAAA---TTAA--ATTGT-TAATAA--TCTGC-CAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TC-ACGGAGAAGAAC----T----TTATACA-ATT---T-AT-CTT-C-CGT-TCTGATCC-----AGGTTTATAA--T----TTAAC-TG-ATT--TGT-----A----T
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TT--TGT-----A----TGTATGTAAAC---------TTGA--A--TATAT-AAATAA-ATACTGCACCTTTTAAACcaaggaattataccagtccttgtttgtttgtatgtatgtaaacttgaatatataaataaatactgcaccttttaaacac
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcacggagaagaactttatacaatttatcttccgttctgatccaggtttataatttaactgatttgtatcaaggaattataccagtccttgtttg-ATGGAAACTAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-ATT-C-CGT-TCTAATAC-----ATGTTTGTTC--C----TAAAC-TT-ATG--TGT-----A----TATATGTACAT---------TTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAAACac
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcatatgataattcttaagatcacatacctcatgacgccaat-CAAATAT-GTACGTGCAGTTTA--CA----C-G-TGTA-ATTGAGATGAAC----T----CTGTCAG-ACA---ATAT-CTT-CTCAG-TCTGATTC-----ATGTTTGAAT--T----TGTAT-TT-ATA--TCT-----A----TGAATGTTAAA---------CTGA--ATTTGAA--A---AA-ATA-TC-----TTTAAA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGAAC----A----TCATAAGCATT-----ATGCTT-C-CGT-TCTAATCC------TTTTTCTGT--TATTGTATAC----ACT--TGT-----ATTACTGTATA-AAATGTACTTATATTGA--G---AAAT-A---CA-ATA-TG-----TTTAAA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAC----A----TCATAAGCATT-----ATGCTT-C-CGT-TCTAATCCTTTTTCTATTAGTGT--T----TACACTTGTATTACTGTATAAAA----TGTACTTATA----------TTGA--G---AAAT-A---AA-ATA-TG-----TTGAAA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGGAGAATAACATAATCACGTTATAAG-AAT---TTAT-ATT-C-CGT-TCTAATCG-----ATATTCATAC--T----TAAAC-TG-ATT--TGA-----A----TGTATGTAAAT---------TTGT--A--TAAAT-A---AATATA-T
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -ATAGAAAAGACC----T----T-----G-ATT---TTAT-CTT-C-AGT-TCTAATCC-----ATATTTATAC--T----TAATA-TG-TTT--TGT-----A----TTTATAAGAAT---------TTGACTA--CAAAT-A---A----C-TG-----TTTAAAC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tAGGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATAATTATAC--C----TAAAC-TT-ATG--CGT-----A----TATATGTACAT---------TTGA--A--TGAAC-----CA-TTA-TG-----TTTAt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                    TAATTACTCGCTTCCTTTTTCTAAG--TTTCTTAAATATATCAGAAACAATATTCCTTAAAGTACGTTA-A-T-CAT-TTT-T--GATAAATATATTTTGA-ACTATGTTATATTC--GTAAAGCTAAGAACA-AAAA---TCAA--ATTGT-TAATAA--TCTGC-CAAATTT-CTTCA--CAATTGA--TA----T-A-TGTT-ACGGAAAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCCAATCC-----ATATTTAAAC--C----TAAAC-TC-ATG--TGT-----A----AATATGTACAT---------TTGA--A--TGAA--A---AA-ATA-T
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tctcTATTT------T----TAAAC-TG-ATT--TGT-----A----TGTATAAAAAT---------TGGA--A--TGAAT-----AG-ATA-TG-----TTTAAACtctt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-C-CGT-TCTATTAA-----GTATTTGAAT--T----TATAA-TG-ACT--TAT-----G----TGTATGTACAA---------TTGA--AT-TGAAT-----AA-CTC-TG-----TTTAAAtaaacctggaaatcatcactgtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                    TAAGTACTCACTTCGTTTT-CTAAG--TTTCTTAAATATATCAGAAACAATATTCCTAAAAGTATGTTA-A-A-CAT-TTT-T--ATTAAATATATTTTGA-ACTATGGTATATTC--GTAATGGTAAGAGCA-TAAA---TCAA--ATTGT-TGATAA--TCTGC-CAAATTT-GTTCA--CAATTGA--TA----T-A-TGTC-ATGGAAAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CAT-TCTAATCC-----ATATTTATAC--C----TAAAC-TT-ATG--TGT-----A----TATATATACAT---------TTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAacaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                tttcTAATTATTCACTTCATTTT--TAAG--TTTCTTAAATATATCAGAAACAATATTGCTAAAAGTATGTTA-A-A-CGT-TTT-T--ATTATATATATATTGA-ACTATGTTATATTC--GTAATGCTAAGACCA-TAAA---TCAG--ATTGT-TAATAA--TCTGC-CAAATTT-GTTCA--CAATTGA--TA----T-A-TGTC-ATGGAAAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATATTTATAC--C----TAAAC-TT-ATG--TGT-----A----TATATGTACAT---------TTGA--A--TGAAT-A---AA-ATA-TG-----TTTAAAC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                         ACCCGCTTCACTT--CTATT--TTTCTTAAACATATTAGAAATATTATTC-TAACAATATGTAA-AGA-TAT-TTT-T--ATTAAGTATATTTTTA-ACTAGGTAA-ATTC--ATAAAGTTAAGAGCA-TACA---TAAA--ATTGT-TAATGA--TCTGC-CAAATCT-GTTAA--CATTTAA--TA----T-A-GGTC-ATGGAGAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATATTTATACTTT----TTTAC-TG-ATC--TGT-----A----TGTATGTAAAT---------TTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                     TT-CTAAG--TTTCTTAAATATATCAGAAACAATATTCTTAAAAGTATGTTA-A-A-CAT-TTT-TTTATTAAATATATTTTGA-ACTATGTTATATTC--GTAATGCTAAGAGCA-TAAA---TCAA--ATTGG-TAATAA--TCTGC-CAAATTTTGTTCA--CAATTGA--TA----T-A-AGTC-ATGGAAAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTTATCC-----ATATTTATAC--A----TAAAC-TT-ATG--TAT-----A----TATATGTACAT---------TTGA--A--TGAAT-----AA-ATA-TG-----TTTAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                     AATTACTCGCTTCATTT--CTAA---TTTC------ATATTAGAACTATTATTC-TAACAATAAGTAA-AGA-TAT-TTT-T--ACTAAGTATATTTTGA-ACTAGGTTATATTC--ATAAAGTTAGGAGCA-TACA---TAAA--ATTGT-TAATGA--TCTGC-CAAATCT-GTTTA--CATTTAA--TA----T-A-TGTC-ATGGAGAAGAAC----T----TTATAAG-ATT---TTAT-CTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATATTTATACTTT----TATAC-TG-ATT--TGT-----A----TGTATGTAAAT---------TTGA--A--TGA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                     TT-CTAAG--TTTTT---ATATAGTAGAACCAATATTCCTAACAGTATG-CA-A-A-GATATTT-C--ATAAAGAATAGGTT-A-ACTA--------------GAT--TAAGTACA-TAAG---T-AA--ATTGT-TAATGA--TCTCC-CAAATCT-GTTTT--CATTTAGTTTAATCTT-A-TATC-ATGGAGAAGAAT----T----ATGTAAC-ATT---TTAT-TTT-C-CGT-TCTAATCC-----ATGTTTATAG--T----TAAAC-TG-ATT--TGA-----A----TGTATGTAAAT---------TTGA--A--GGAAT-----AA-ATA-TG-----
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): TAAAATGTACTTATATTGAGAAATAAAATATGTTTAAACC