lowQualScore : 111 222222 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111 111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111111111111 22222222 111111 222222 22222222222222 111111111111111111 333333333333333333333333333333333333333 11 22222222 11111 222222 2222222222222222 3333333333333 444444444444444444444 1111 22222222222 1 88888888888888888888888888888888888 1
lowQualScore : 5 6 5 555 1 6 3333 22 1 0 22 888 22 1 1 1 1 555 666666 1 22 1 3333 1 7 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 5555 777 1 1 1 222 22 5 1 6 7 555555 9 7 1 3 3 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 99999999999999 666 22 66 4 1 1 3333 22222222 1 555555 44 4444 1 444444 3 7 66 22222222222222 22 555 22 44444 4 6666 444 4444 1 222 1 666666666666666666 1 3 0 444444 4 4444444444 1 000000000000000000000000000000000000000 22 444444 00 1 222 0 1 11111111 1 77777 1 222222 1 1 1 1 1 1 22 555 11 5555555555555555 222 66666 6 44 3 22 3333333333333 44444 1 1 33 22 0 1 000000000000000000000 2 2 3333 33333333333 1 2 0 444 4 00000000000000000000000000000000000 5
lowQualScore : . . . ... . . .... .. . . .. ... .. . . . . ... ...... . .. . .... . . ..................................................................... . .... ... . . . ... .. . . . . ...... . . . . . ........................................................................ . .............. ... .. .. . . . .... ........ . ...... .. .... . ...... . . .. .............. .. ... .. ..... . .... ... .... . ... . .................. . . . ...... . .......... . ....................................... .. ...... .. . ... . . ........ . ..... . ...... . . . . . . .. ... .. ................ ... ..... . .. . .. ............. ..... . . .. .. . . ..................... . . .... ........... . . . ... . ................................... .
lowQualScore : 0 6 1 555 2 5 9999 55 8 9 55 222 44 7 7 7 7 888 333333 7 44 7 5555 7 3 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 7 3333 777 7 7 5 222 33 4 7 7 3 222222 1 3 8 6 6 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 33333333333333 666 99 88 0 9 8 9999 00000000 8 777777 55 2222 3 111111 8 3 88 11111111111111 44 000 00 33333 7 0000 444 1111 5 666 5 999999999999999999 5 1 5 333333 7 9999999999 5 666666666666666666666666666666666666666 22 666666 11 7 888 9 6 44444444 6 33333 7 555555 7 7 7 7 7 7 33 888 88 1111111111111111 999 55555 1 00 3 33 8888888888888 22222 7 7 00 44 9 0 222222222222222222222 0 0 0000 99999999999 1 5 2 444 0 77777777777777777777777777777777777 0
consensus : NAAAGGACCAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TACTTA--TTT-TT-C-AGCAAA-G-C-T--NNG-T-GTATTTGT--A-TTAA----ATA-TAATTTATT-C-TTT--T-A---AA-----T----A----TG--T-----T--T--------T------TN--TT---TTTTA-ATTT--T-ATG--TTT-TT-TCTATTCATAGAAT--GACTCCAAA-GACGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGCTCATT-----T-C-C-CC--G------------AA--TT-TT--GTCCTA----TTTTTT-------N----C----ATTTAAA-TA----T------T--T---T--TT--AT-TA-TGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAGATA--TTTA-TTC-TGATN---ANTGT--CT---GGTACACTCT-GAG-TAAT-AT--GTGTAAATA-T-ATT-GCC-TTGT--GGCAA---GA-GTGCC-----TTCACTGT-T--A---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----A----CNT----A-AA-ATG-GCTTAAAA------TGTAGGAAAA------T-T-GCATA-TTTTCGCTG---T--T-------C-A--TGT--A------CA--CTTT--AA------TG-NT-AT---TGTAT-TA-------AGCG-AAAAAC--GTAAA-AT--TG--A-A-A-A-AC-AA-A--AT-T-TA-CA-T------T-------T---T-----TTAAA--A-G--AAT-A-----A--G--TA-----T-AAT-TA-AAA--TAAAAAA---A-CA--CACC-A-A-C-T-TT-GC--NGAAAAATA-AA-AT---GTTTAATT-TTA---TTGCATTATAC---------AT---------TGGGGC---TTGTAGTGAACCTAGT
Reference ( gi|2 ) : TAAAGGACTAAGTCCACGAAGCACAAATATCGGTCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TGCTTA--TTT-TT-C-AGCAAA-G-T-T--ATG-T-GTATTTGT--A-TTAA----ATA-TACTTTATT-A-TTT--T-A---AA-----T----A----TG--T-----T--T--------T------TT--TT---TTTTA-ATTT--T-ATG--TTT-TT-TCTATTCACAAAAT--GACCCCAAA-GATGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGCTCATT-----T-T-T-CT--G------------AA--TT-GT--GTCCT-----TTTTTT-------T----T----ATTTAAA-TA----T------T--T---T--TT--AT-TA-TGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAGATA--ATTA-ATC-TGATA---AATGT--CT---GGTACATTTT-TAG-TAAT-AT--GTGTAAATA-T-ATT-GCC-TTGT--GGCAA---GA-GTGCC-----TCCACTGT-T--A---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----A----CCT----A-AA-ATG-GCTTAAAA------TGTAGGGAAA------T-T-GCATA-TTTTCGCCG---T--T-------T-A--TGT--A------CT--CTTT--AA------TG-TT-AT---TGTAT-TT-------AGCG-AAAATT--ATAAA-AT--T---A-A-A-A-AC-AA-A--AT-T-TA-CA-G------T-------T---T-----TTGAA--A-G--AAT-------A--G--TA-----T-AAT-TA-AAA--TAAAAAA---AGCA--CATC-A-A-C-T-TT-GC--AAAAAAACA-AA-AT---GTTTAATT-TAA---TTGCATTATGC---------AT---------TGGAGC---TTATAGTGAACGTAGT
gi|17 : AAAGGACTAGGTTCATGAAACCCCAATA-------------------AT--ATT-TATTTT----------------T-TT-C-AGCAAA-G-C-C--TGG-T-GTATTTGT--A-TCA--------------------------T-A----------T----A----TG--A-----T--T--------T------AT--TC---TTTTA-AAAT----ATG--TTGATT-TCT-----------------CCAAA-GACAGTTAAAATT-A------A-A-A-T-AA-TGCTTATT-----T-C-C-CT--C------------A-----------TCTTAAACATATTTT-------TGCGGC----ATTTAAA-TA----T------G--T---T--TT--AAATA-AGAAG-GCATTCTTGCTACAC----AGCTATG--TTTA-CTC-TGATC---ATTGT--CT---AGTTCACCCT-AAG-TAAT-AT--GTGTAAATA-T-TTT-A---TTGT--GGAAA---GA-GTGCCTTCCTTCC-CTTT-T--A---AAAC---CATGGT-AT---A
gi|28 : AAAGGCTCAGGTTCACAAAGTCCCGATATCAGTCCTGTAA----A--ATGCATT-TCATTC--CAA-TATTTA--TTC-AT-C-GGCAAATG-T-T--G-----GTATTTGT--A-CTAA----ATA-TAATTTATT-C-TTT--TAA---AA-----T----A----TG--------------------------------------TAA-ATAT--T-ATC--ATT-T--------------AT--GACTCCAAA-AGCGGTTAAAATT-A------A-G-G-A-AATTGCTCA
gi|30 : AAAGGACAAGATTCATGAAACCCTGATATCAGCCCTGTAA----A--ATGTATT-TCTTTT--AAA-TAGTTA--GTT-TT-T-AGCAAA-GCT-T--A-G-T-GTTTTTCA--A-CTAAATTTATA-TAATTTATT-G-CAT--T-A---AAAAATGT----A----TG--------C--T--------T------TA--TT---TTTTA-ATTT--A-ATG---TT-TT-TCTATTT------T--GACTCCAAA-GATatgttgtcctatgtttcgcattta
gi|6 : AGGGACAAGGTTCAAGAAGGCCCAATATTGGCCCTTTAA----A--ATGCATT-TTCTTT--AAA-TACTTA--TTT-TT-C-AGCAAA-T-C-T--TGG-T-GTGTTTGT--A-ATAA----ATA-TAAATTATT-C-TTT--TAA---AA-----T----A----TA--T-----T--TA-------T------TTTATT---TTTCA-ATTT--T-ATG---TT-TT-TCTATTCATAGAATAAGACTCCAAA-GACAGTTAAAAAA-A------A-GAA-A-AA-TGCTCATT-----T-C-C-C---------------------------ACCCC-----CCTTTT-------T----TAAGCATTTAAATTG----T------T--T---T--TT--AT-TA-TGGAG-GCATTTTAGCCTGAC----AAAGATAGTATT---TC-TGATC---ATTGT--TC---AGTACACTTT-GAG-TATA-ATG-GTGTAAATA-T-TTT---C-TTGT--GACAA---GA-GTGTA-----TACATTGT-T--A---AAA----CATGAT-AT---ATT-C----A----CAT----A-AA-ATG-TCTTCAAA------TGTAGGTAAC------T-T-GCATA-TGTTC-CC--------------------TGT--A----------------AA------TG-T---------------------------AAAATT--G-------------A-A-A-A-AC-AACA--AT-T-TA-TA-T------T-------T---T-----TTAAA--A-G--TATAAAGTTAA--G--TATACCGT-AAT-TA-AAA--TGAAAAA-----CA--TA-A-A-A-T-T-TT-GC--CCCAATATA-AG------GTATAATT-TTG---TTGCATTA
gi|24 : AAGGACCAGGTTCACAAAGCCCCAATA-----CCTGTAA----A--ATGTATT-TCTTTT--AAA-TACTTA--TTT-TT-C-AGCAAA-G-T-T--AT--T----------------A----ATA-TCATTTAAT-A-T-----------------T----A----TG--T-----T--T----------------------------------------G--TTT-TTCTCCATTCATATAGT--AACTCCAAA-GACGGTTAAAATT-A------A-GTA-T-AA-TGCTCATT-----TGT-T-GT--G------------AAATTT-TT--GTCTT-----TTaactgaccattatggggtttcatgaac
gi|4 : AGGACAAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCTCTGTCA----A--ATGCATT-TCTTTC--AAT-AACGTA--TTT-GT-T-AGCAAA-T-A-T--ACG-T-GTAATTGT--A-TTAA----ATA-TACTTTATT-C-TTT--T-A---AAA----T----A----TG--T-----T--T--------------------------------------ACG--TTT-TT--CTATTTAAAGAAT---ACCTCAAAAGACGGTTAAACTT-A------A-GGA-A-AA-TGATAATT-----T-C-C-CCCAA------------AA--TT-GT----CCTA----TTTTTG-------G----C----ACTTAAA-TAGTC-T------T--T---T--TG--AT-TA-TGAAAAGCATTCTTAATACAC----AAATATA--TTTA-TTC-TGATA---AGTGC--CT---GGTACACTTT-AAG-TAAT-AT--GTG-------T-ATT-GTC-TTGG--GCCAA---GA-GTGCC-----GTCACTGC-T--A---AAAC---TATGAT-GT---AAT-T----A----TCT----A-AA-ATG-GC-TAAAA------T--------A------T-T-ACATA-TTTTCGATA---T--T-------C-A--TGT--A------CA--CTTT--AA------TG-AT-AT---TGTTT-TA-------AGCG-AAAAAT--GTAAATAT--G---A-A-A-A-AC-AA-A--GC-T-AA-CA-T------T-------T---T-----TTAAA--A-G--AATAA-----A--G--CA-----T-AAT-TA-AAA--TAAAAA-------A--CTAC-A-A-CTT-TT-GC-----AAAACA-AATACG--GTTTGATT-TTA---TTGAATTATgtcaaattagaaaaaaaacaatctaaatctgaataatttatttatgaaaat
gi|23 : AGGACCAGGTTCACGAAG-ACGAA------------AA----A--ATGCATA-TATTTA--AAA-TTGTTA--TTT-TT-C-AGCGAA-A-T-T---TGAT-GTATTTGT--A--TAA----ATA-TGATTTATT-C-TTT--TGA---AA-----T----G----TG----------------------------T--AT---ATTTA-ATAT--T-ACG---TA-TT-TCTATTCATTGAAT--GACTCCAAA-GACTGTTTAAATTAA------A-G-A-A-AA-AGCTCATTTCCCCT-C-C-CC--A------------AA--TT-TT--GTCCTA----TTTTTC-------A----C----CTTTAAA-TAGTTGT------T--T---T--TT--AT-TG-TGAAG-GCATatagggtaattttaggggttcgtgaacatcgtc
gi|7 : cGGACCAGGTTCACGAAGCCCAAATATCGACCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TATTTA--TTT-TT-C-AACAAA-G-C-T---TG-TTGTATTTGT--A-TTAA----GTA-TAATTGACT-T-TTT--A-A---AA-----T----A----TG--TATA--T--T--------T------TA--TT---TTTTA-ACTT--TCATG--TTT-TT-------------------CTCCAAA-AACTGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AAATGCTCCCC-----C-C-A-CC---------------AA--TT--T--GTCAT-----ATTTTCA------G----C----ATCTAAA-TA----G------TG-T---T--TT--AT-TA-TGAAA-ACATTCTTTCCACAC----AAAGATA--TTTA-TTC-TGATC---ATGGT--CT---GGTATACTCT-GAG-TAAT-AC--GTGTAAATA-T-TTT---C-TTGT--GGCAA---GA-ATGCC-----TTCACTGA-T--A---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----C----CAT----G-AA-ATG-GCTCAAAT------TGTAGGAAAA------T-T-GCATA-TTTTTCCTG---C--A-------C-A--TTT--A------CA--CTTA--CA------TG-AT-AT---TACAT-T---------GAG-AAAAAT--GTACA-AT--TG--A-G-A-A-AC-AA-A--AT-T-TA-TA-T------T-------T---T-----TAAAA--A-T--AAT-------A--AATTA-----T-AAT-TA-TAA--TAAAAAA---A-CA--TA-A-A-A-T-T-TT-GC-----AAAACATTA-AT---GTTAAATG-TCA---TTGCATTA
gi|1 : aatggttctatgGAACTAGGTTCACGACGCCCCAATATTGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TATTTT--AAA-TACTTA--TTT-TT-C-AGCAAA-G-T-T--TTG-T-GTATTTGT--A-TTAA----ATA-TACATTATT-T-TTT--TAA---AA-----T----A----TGGAC-----A--T--------T------TT--GT---CTTTATGTTT--T-ATG---TT-TT-TCTATTCATAGAAT--AACCCCTAA-GACAATTAGAATTAA------A-G-A-A-AA-TGCGCATT-----T-C-C-CC--C------------AA--TT-TT--GTCCTA----TTTTTT-------A----C----ATTTAGA-TA----T------T--T---TTCTT--AC-TA-TGAAG-GCATTCTTGCCACAA----TAAGACA--TTTA-TAC-TGATA---ATTGT--CT---ATAACATTCA-TAG-TAAT-AT--GTATAA--A-T-ATT-GCC-TTGT--GGCA-----------------------------A---AAAC---CCTGAT-AT---ATT-T----A----CCT----A-AA-ATG-GCTTAAAA------TGTAGTAAAG------C-T-TCATA-TTTCTACTG---T--T-------T-A--TAT--A------CA--CTTT--A---------------------------------AGCG-AAAAAG--GTCAA-AT--TAAAA-A-A-A-AT-AA-A--AT-T-TA-CA-T------T-------T---G-----ATAAA--T-G--AAT-------A--GATTA-----T-AAT-TA-A
gi|9 : GGACCAGGTTCGCGAAGCCCTAATTTCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCC-----AAA-AACTTT--TTT-TTTC-AGCAAA-G-C-T--TGG-C-GTACCTGT--A-TTAA----ATA-CAATTTATT-C-TTT--T-A---AAA----T----A----TG--TATATAT--T--------T------TC--AT---TTTAA-ATTT--T-ATG--CTT-TT--CTATTCATATGAT--GATT-----------TTAAAATT-A------G-G-G-GCAA-TGCTCGTA-----T-C-C-CT--C------------AA--TT-TT--GTCCTA----TTTTTC-------G----T----ATTATAA-TA----G------T--T---T--TT--AT-TA-TGAAG-ACATTCTTACTACACTGACAAAACTA--TTTA-TTG-TGATC---ACTGT--CG---AGTACACTCT-GGG-TAAT-AT--GTAT----------------TCAT--GGCAA---GA-TTGCC-----TTCACTAT-T--A---AAAG---CGTGAT-GT---GTT-T----T----CAT----A-AA-ATG-GCTTAACA------TGTAgtgccttcattgttataaaccatgatatatttacctaaattgtcttaattgtagtaaaatagcatatttatattgtttatatttatatattttattaagcgaaattgtcaaattaaaaaataaaatttacatttgataaaataataaaatagaaatattgcaaagaaataatgttttattttatgacattctacagggccttgtttgggtgtttgtgaagcccgtcctt
gi|22 : GGATCAGGTTCACGAAGCCCCGATATCGGCTCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTA--AAA-CATTTA--TTT-TT-T-AGCAAA-G-C-TGGATGAT-GTATTTGT--A-TTAA----ATA-TAATCTATT-A-TTT--T-A---AA-----TA---A----TG--T-----T--G--------A------TA--TC---T------TTT--T-ATGT-TTT-TT-TCGATCCATATAAT--TACTCATAA-AACGATTGAAATG-A------A-G-AGA-GA-TGCTCATT-----T-T-aaacatgtattaagcaaaaaatgtaaaatcgaaaaaacagaatttatcatttttgaatgaataaagtataattcaaataagaaaatcaaactttacgacaaaataa
gi|11 : GGACAAGATTTACGAAGCCCCAATAATGGCCCTGTAA----A--AC-CAAT-TTTTTT--AA------TAAACTT-TT-T-AGCCAA-G-C-T--GGG-T-GTGTTTGT--A-TTAA----ATA-TAATTTATT-C-TGT--A-A---GA-----T----A----TG--TA----TAGT--------T------CA--TG---TTTTA-ATTT--C-ATGTTTTT-TT-TCTATTGATAGAAT--GACGCCAAA-GGCGGTTAAAATA-A------A-GTA-A-AA-TGCCCATcttatgcttattacctttctaacctgatttttttaacatagaaga
gi|5 : tGACTAGGTTCATGAAGCCCCAGTGTGGGCCATGCAA----A--ATGCATT-TCAA----AAA-CACTTA--TTT-TT-C-AGCAAA-G-C-T--TGG-T-GTATTTGT--A-TTAA----ATA-TACTTCATC-C-TTT--TTA---AA-----T----A----TG--T-----G--TACTGGTAAT------TTA-TT---TGTTA-ATTT--T-ATG--TTT-TT-T-TATTCATAGGGT--GACTCCAAA-GATGGCTAAAATT-A------AAG-A-T-TA-TGCTCATT-----T-T-T-CC--A------------AA--TT-GT--GTCCT-----ATTTTT-------TGA--C----ATTTAAA-AAG---T------T--T---T--TT--GGATA-AGAAG-GCATTTTTGCTAC--------------------------ACA---AATAT------------ATTT--------AT--T--CTGTAAAT-----TT-GTC-TAGT--GGTAA---TA-GTGCT-----TTCACTGT-T--G---AACA---CGTGAT-AT----TT-T----A----TCT----A-AA-ATG-GTTCAAAA------TATAAGAAAA------A-T-GCATA-TTGTCACT----T--TAAAATAAT-A--TGT--G------CA--CTTT--CA------TG-GT-AT---TGTTT-TA-------AGCA-CAAAAT--GTAAA-AA--T---ACA-A-A-AC-AA-A--AT-T-GA-CA-T------T-------T---T-----TTAAA--A-G--AGTAA-----A--G--TA-----T-AAT-AA-AAT--TAAGAAA---A--A--CATCAA-A-T-T-TT-GC--AGAAAA--A-AA-ATAGGGATTAATT-TTA---TTGAATatcgcccttaatttgttaaatctatgatatatttacacaaactggcttaaaatgtgggaaaattgcatattatcgctgtgcatgtacactttaatggtatcgtaataagccaaaaaagtaaaattgaaatgcaaaatatatatatttttaaatgagtatagaataattataaaaaaacaaccataaaatgtggccaaaaattaagatttaattttattgcaatagacaagaacattttgggggtgcatgaacatcg
gi|3 : GACCAGGTTCACAAAGTCCCAATATCGGCTTTGTAATACCAGTATGCATTATTTTTT--CAA-TACTAA--TTT-TT-C-ACCAAA-G-C-T---TGAT-ATGTTTGT--A-TCAA----AGA-TAC----------------AAAGAA-----T----A----TG---------------------------------------TA-ATTTTCT-ATG---TT-TT-TCTATTTATAGAAT--GACTTCAAA-G-CGGGTAAAATTAA------A-G-A-A-AA-TGATCATgtacatgtacagggtcattttag
gi|21 : GATCAGGTTCACGGAGCCCAA-TGGTGGCCCTCTAA----A--ATGCATT-TCTATT--AAA-TACTTA--TTTCTT-T-AGCAAA-G-C-T---TGAT-GTAACTGT--A-TT-A----ATA-TAATTTATT-CTTTT--T-A---AA-----G----A----CA----------------------------T--AT---ATTTA-ACTA--A-ATG---TT-TT-TATATTAATTAAAT--GACTCCAAT-AATGGTT-AAATT--------G-G-A-G-GA-T-CCC-------------------------------------------TCCC-----CCGTTT-------T----T----G-TCGAA-TA----T------TTGT---T--TT--AT-TA-TGAAG-GCATCCTTGCCATAC----AGAGATA--TTTA-TTC-TAATaaacctcccccccccccccccacacacccatttttggcatttaaataaaaaaaaaatattatggaggcattcttgatacacaaagcgattttattctgatcattgtaatgtgtaaatattgtctggtagcaaaaagtacctccactgttaaaaacatgacatatttacctaaaatgtaggagaatttcatactttctcagtattttattgtatgtttgatgatatttatttttgattaagcaaacagcacaaaattgaacaacaaaatttacatttcttaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcaaaaatccatctttaatcttattaaattgtaccgggccatttttgggcgtttgtgaa
gi|32 : atgACTACGTTCATGAAGCCCCAATAACGGCCCTGTAA----A--ATGC-TT-TGATTA--AAT-TACTTA--GTC-AT-C-AATAAA-G-C-T--TGG-T-GTCCTTGT--A-TTAA----GTA-TAATTTTTT-C-TTT--TAA---AA-----T----A----T
gi|12 : GTCCACGAAACCTCTATATCGGCCCTGTTA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAAATACTTA--TGT-TT-C-AGCAAA-G-TGT--A-G-T-GTGTTTGT--A-TCAA----ATA-TACTTTATT-C-TTT--A-A---AAATAGGT----A----TA--TAA---T--TA-------T------TA--TTACATATTA-ATTT--T-ATG---TG-TT-TCTATTTATAGAAT--GACTCAAAA-GA-GGTTAATGTT-A------AGG-A-A-AA-TG-TCAAT-----G-T-T--------------------------T--GTTCTA----TTTTTT-------G----T----A-TTAAA-TA----T------T--TTACT--TT--AT-TT-TTAAG-GCATTCTTGCTACAC----AAAGATA--TTTA-TTC-TGA---------T--CT---G-----------AG-TTAT-AT--GTGT------T-ATT-GTC-TGAT--AGCAA---GA-GTACA-----TTCACTGT-T--A---AAAT---CATGAC-AT---ATT-T-------------------------GCTTAAAA------TGGAGGAAAT------T-T-TCATA-TTGTCACTG---TAAT-------TAA--TGT--G------CA--CTTT--GA------TGATA-ATACATGTATATTA------AGCA-AAAAacataattcataatttaa
gi|15 : ggGTTTACAAAGCCCCAATATCTGCCCTGGAA----A--ATGCATT--ATTTT--AAA-TACTTA--TTT-TT-C-AGCAAA-G-T-T--TTG-T-TTGTTTGT--T-TCAA----ATA-TACTCATTT-C-TTT--TAA---AA-----TATAAA----TG--TATA--T--T--------T------CA--TC---TTTTA-AAAG--T-AAG--TTT-GT-TCTGTTCGTAGAAT--GACTCCAGA-GA-GAGTAAGATT-A------AGG-A-A-AA-TGCTCATTA----T-T-T-TT--G------------GA--Tgttta
gi|13 : gCACGACGCCCAAAAAATGGCCCTGTAA----G--ATGCTTT-CCTTTT--AAA-TACTTA--TTT-TT-C-AGCAAA-G-C-T--TGG-T-GTATTTGT--T-TTAA----ATG-TATTTT--------------------------------------T-----T--T--------T------TT--GA---TTTTA-AATT--C-ATA---TT-TT-TCTATTCACAGAAT--GTCTCCAAA-TACGGTTAAAAAT-A------AGG-A-A-AA-TGTTAATT-----T-gatgaaggcattcttgccacacatgatatttattctgatcagtgtctggtacactctgagtaatatgcgtaaatattgtcttgtgatatatttgcctaaaatggcttaacatgtagaaaaaaaaagtttttttagctgtagatgtattcttgaatg
gi|27 : aactAATATCGGCACTGCAA----A--ATGCTTT-TTTTTTTTCAA-GACTAA--TTT-TT-C-AGCAAA-G-C-T--TGG-T-GTATTTGT--A-TTAA----ATA-TAATTTATT-C-TTT--T-A---AA-----A----AGAAGTG--TA----T--T--------T------CA--TT---TTTCA-ATTT--C-ATA---TT-GT-TCTTTTAATATAAT--GACTTCAAA-GACGATTAAAATT-A------AGG-A-A-AA-AGCTCATcgatgttcatgtatgtaaacattttaatggtattttattgagcgaaaaatgtaaaattctaagaactatttgattagaataatcaaatataaccaaaatttaaaaaaaaatcaaattttaccaaaaaattgaggttttattttattggattaaacagggtcattttggggcggtgtggggtgtcataagccactgctttccttt
gi|10 : cAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TAT-----TTT-TT-CAAGCAAA-GAT-T--G-G-T-GTGTTTGG--A-TTCA----ATA-TACGCCATT-C-TTT--A-A---AA-----T----G----TG--TATA--T--T--------TCGCTGATT--TT---ATCTG-ATTT--T-ATG---TT-TT-TCTATTCATAGAAT--GATTC---A-AATAGTTggcccccaaaagttgtccta
gi|8 : TCGACCTTGTAA----A--ATACATT-T----T--AAA-AACTC---TTT-TT-C-AGCAAA-G-C-T--TGG-T-GTATTTGT--A-T-AA----ATA-TA----ATT-A-TTT--T---------------------------------------------------TT--AT---TTTTA-ATTT--C-AT---TTT-TA-TCTATTCATAGAAT--GACTCAAAA-TACGGTTGAAATT-ATATTAAG-G-A-A-AA-TGCTCAAC-----C-C-C-CT--ACCAGCCACACACAA--TT-TT--GTCCTA----TTTTTC-------G----C----ATTTAAA-AAG---T------T--TAA-T--TT--AT-TA-TGAAG-ACATTCTTGCCACAC----AAAGATA--TTTA-TTC-TGACC---ATTGT--TT---AGTACACTCT-GAG-TAAT-AC--GTTCAACCA-TGATC-AC----GT--GG--A---AA-GTGCC-----TTCACTGT-T--A---AA--------GAC-AT--------------------------AA-ATA-GCTTAATA------TGTAGGAAGA------C-T-GGATA-TTTTCGATG---A--A-------C-A--TGT--A------CA--TTTT--AA------TG-GT-GT---TGTGT-TA-------AGTG-AAAAATGGAAAAA-AT--G---G-A-A-A-AC-AA-A--AT-A-TA-TA-T------T-------T---T-----TTAAA--A-GACAAA-------A--G--TT-----T-AATATA-AAA--C---AAA---ATCA--CATT-G-----T-TT-AC--AAAAAATAA-AA-AG---ATTTAATC-TTA---TTGCATTtttttgattataaagacattcttgctacacaaagctatttgttctgatcattgtctggcacactctaagtaatatgtttgaatagtgcctgggagcaaactgcgtatctttgctgtacatgtacactttgatgatattgtattaagtgaaaaacgtaaaattgaaaaacaaaatttacatttttaaaatgaacaaagtattatttaagttaacaaattatacaattttgcagaaaaaatagggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|10 : --TTT-TT-C-TGCAAA-A-T-T--GTA-T-A-ATTTGTTAACTTAA----ATAATACTTTGTTCA-TTT--T-A---AA-----A----A----TG--TAAA--T--T--------T------TG--TT---TTTCA-ATTT--T-ACG--TTT-TT-taacagggccattttgaggcagttcgt
gi|1 : aatatcggccctgtaaaatgcatttcttttaaatattttttcaagcaaagattggtgtgtttggattcaatatacgccattctttaaaatgtgtatatttcgctgattttatctgattttatgtttttctattcatagaatgattcaaatagtttttttgattataaagacattcttgctacacaaagctatttgttctgatcattgtctggcacactctaagtaatatgtttgaatagtgcctgggagcaaactgcgtatctttgctgtacatgtacactttgatgatattgtattaagtg-TTAA----TTA-TAATCTATTCA-TTTATC-A---AA-----T----G----TAAAT-----T--T--------TA-----TT--TT---TTTTA-ATTT--G-AC---CTT-TT-TCGCTT---AAAGT--G--TATATA-AACAGTAGAAAT--A------T-G-A-A-----GCT---------T-T-A-CT--A------------CA--TT-TTAAGCCAT-----TTT--------------------AGGTAAA-TA----T------------------------A-TCAGG-G--TTTTTGCCACA-------AGGCA--AT---ATT-T-ATA---CATATTACT---A-TGAATGTTATAGACAATTATCAGTATAAATG-T-CTT-A---TTGT--GGCAA---GA-ATGCC-----TTCATAGT-A--A---GAA--------AA-AT---ATC-T----A----AATGTAAA-AA-ATA-GGACAAAA------T-TGGGGGAA------A-T-GCGCA-TTTTC-------T--T-------T-AATTCT--AATT---GT--CTTA--GG------GG-TT-AT---TCTAT-GA-------ATAG-AAAAAC--ATAAA-ACA-T---A-A-A-G-AC-AA-A--AT-G-TC-CA-T------A-------T---T-----TTAAA--A-A--AAT-------AATG--TA-----T-ATT-TA-ATA--CAAATA------CA--CA-A-A-A-C-T-TT-GC--TGAAAAAT--AA-GT---ATTTAAAA-TAA---ATGCATTTTACAGGGCCAATAT---------TGGGGC-----GTCGTGAACCTAGTatagggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|29 : ga--------T------TT--AT---TTTAA-ATAT--C-ATG--TGT-TT-CTTAT-CACAGAAT--GATTCCAAA-TACGATTGAAATTAA------A-G-A-A-AA-TGCTCgtgccttcattgttataaaccatgatatatttacctaaattgtcttaattgtagtaaaatagcatatttatattgtttatatttatatattttattaagcgaaattgtcaaattaaaaaataaaatttacatttgataaaataataaaatagaaatattgcaaagaaataatgttttattttatgacattctacagggccttgtttgggtgtttgtgaagcccgtcctt
gi|16 : taaAGAAT--AACTCCAAA-GACGGCTAAAATT-A------A-G-A-ACAA-TGCTCATT-----T-T-CACC--C------------AA--T------GT--------TGTTTT-------A----T----GTTTAGG-CA----C------T--C------------------AA----ATTCTTTCTACAC----A--------------TC-TGATC---AGTGT--CT---GGGGCATTCT-GAG-TAAT-AT--AT-----------TT-G-----GT--AGCAA---AA--TCCC-----TTCACTGT-C--A---AAACAGGTATGAT-AT---ATT-T----A----CAT----A-AA-ATGTGTCTTAAA------TCTACGAAAA------T-T-GCATA-ATTTCACTC---T--T-------C-A--TGT--A------CA--CTTC--AA------TG-AT-AT---TGTAT-TA-------ATCG-GAAACG--TTAAC-TT--T---T-A-A-A-AC-AA-A--GT-T-TA-CA--------T-------T---T-----TTAAG--A-T--AAT--------------------T-TAT-T--AAA--TAATAAA---GGccccaccacattcagcatataaatagttttttattatgaacgcattcctgccacgcaaagatatttattctgatcattgtttagtcgctctgagtaatatgagt
gi|10 : aGCTGATT-----T-TAT-CT--G------------AT--TTTAT--GTTTT-----TCTATTCATAGAAT----G----ATTCAAA-TAGT--T------T--T---T--TTG-AT-TA-TAAAG-ACATTCTTGCTACAC----AAAGCTA--TTTG-TTC-TGATC---ATTGT--CT---GGCACACTCT-AAG-TAAT-AT--GTTTGA--A-T-AGT-GCC-TGGG--AGCAAACTGC-GTATC-----TTTGCTGTAC--ATGTACAC---TTTGATGAT---ATTGT----A------T----T-AA-GTG-A---AAAA------CGTA---AAA------T-T-Ggctattttggggaagggggcgggggggggggg
gi|6 : aatatcggccctgtaaaatgcatttcttttaaatattttttcaagcaaagattggtgtgtttggattcaatatacgccattctttaaaatgtgtatatttcTT-------T----T----ATGTGAA-TA----TATCATGT--T---T--TA--AC-AA-TGTAT-ACACTCTTGTCACAA----GAAAATA--TTTACACCATTATACTCAAAGT--------GTAC----T-GAA-CAATGAT--CAG-AAATACT-AT---CT-TTGTCAGGCTA---AA-ATGCC-----TCCATAAT-A--A---AAAA---CA----------ATT-T----A--------------A-ATG--CTTAAAAAAGGGGGGT-GGGAAA------T-GAGCAT--TTTTC-------T--T-------T-T--TTTTAA------CTGTCTTTGGAG------TC-TT-AT---TCTAT-GA-------ATAG-AAAAAC--ATAAA-AT--TG--A-A-A-A-AT-AA-A--AT-A-AA-TA-T------A-------T---T-----TTAAA--A-G--AAT-------A--ATTTA-----T-ATT-TA-TTA--CAAA--------CA--CACC-A-AGA-T-TT-GC--TGAAAAAT--AA-GT---ATTTAAAG-AAA---ATGCATTaaaaacaaaatttacatttttaaaatgaacaaagtattatttaagttaacaaattatacaattttgcagaaaaaatagggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|14 : agggacaaggttcaagaaggcccaatattggccctttaaTT-------T----TGGC-ATTTAAA-TA----T------T--T---T--TTTTAT-TA-TGAAA-GTATTCTTGCTTCAC----AAAGATA--TTTA-TTC-TGATA---ATTGC--CT---GGTACACTCT-AAG-TAGT-TT--GTGTA--TA-T-ATT-GCC-TTGT--GGCAAC--AA-GTGCC-----TTCACTAT-T--A---AAAC---CATGAT-AT---GTT-TCAATA----CCT----A-AA-ATG-GGTTAAAA------TGTAGGAAAA------T-T-GCATA-TATTCGCTG---T--T-------T-A--TGT--T------CT--CTTT--AA------TG-AT-AT---TGTAT-TA-------AGCA-AAAAAT--GTCAA-AT--TG--A-A-A-A-AC-AA-A--AT-T-TA-TA-T------T-------T---TATATATTAAAT-ATG--AAT-------ATTG--TA-----T-AAC-CA-AAA--TAAAAAA-----TA--AATC-T-T-C-T-T--------AAAAAT---A-AT---GTTTGATTATAATATTTGCATTATAC---------Atgtcttcaaatgtaggtaacttgcatatgttccctgtaaatgtaaaattgaaaaacaacaatttatattttttaaaagtataaagttaagtataccgtaattaaaatgaaaaacataaaattttgccccaatataaggtataattttgttgcattaaactgaccattatggggtttcatgaac
gi|29 : ----ATATAAA-TAG---T------T--T---T--TT--AT-TA-TGAAC-GCATTCCTGCCACGC----AAAGATA--TTTA-TTC-TGATC---ATTGT--TT---AGT-CGCTCT-GAG-TAAT-AT--GAGTgggtcatttttgggaatagtaaa
gi|15 : taatttattttaaatatcatgtgtttcttatcacagaatgattccaaatacgattgaaattaaagaaaatgctcccccaccacattcagc-TA----T------T--T---T--TGG-AT-GA-TGAAG-GCATTCTTGCCACAC-----ATGATA--TTTA-TTC-TGATC---AGTGT--CT---GGTACACTCT-GAG-TAAT-AT--GCGTAA--A-T-ATT-GTC-TTGT--G
gi|9 : ggtttacaaagccccaatatctgccctggaaaatgcattattttaaatacttatttttcagcaaagttttgtttgtttgtttcaaatatactcatttcttttaaaatataaatgtatatttcatcttttaaaagtaagtttgttctgttcgtagaatgactccagagagagtaagattaaggaaaatgctcat--T---T--TT--AA-TAGTGAAG-GCAATCTTGCCATGA----ATACATA---TTA-CCC-AGA------GTGTA-CT---CG-ACA-------G-TGATCAC--A-ATAAATAGT-TTT-GTCAGTGT--AGTAA---GA-ATGTC-----TTCATAAT-A--A---AAAC---TATTAT-A----AT-------A----CGA----A-AA-ATA-GGACAAAA------TTGAGGGATA------C---GAGCA-TT---GCCC---C--T-------A-A--T----------------TTT--AA------AA-TC-AT---CATAT-GA-------ATAG-AAAAGC--ATAAA-AT--T---T-A-A-A-ATGAA-A--ATATATA-CA-T------A-------T---T-----TTAAA--A-G--AAT-------A--AATTG-----T-ATT-TA-ATA--C-----A---GGTA--CGCC-A-AGC-T-TT-GC--TGAAAAAAA-AA-GT---TTTTGG----AA---ATGCATTTTAC---------Aatatatttgcctaaaatggcttaacatgtagaaaaaaaaagtttttttagctgtagatgtattcttgaatg
gi|3 : ggaccaggttcgcgaagccctaatttcggcccT--AT-TA-TGGAG-GCATTCTTGATACAC----AAAG-------CG-ATT-TTAT--------T--CT---GAT-CATT-----G-TAAT-----GTGTAAATA-T---T-GTC-TGGT--AGCAA---AAAGTACC-----TCCACTGT-T--A---AAAA---CATGAC-AT---ATT-T----A----CC-----------------TAAAA------TGTAGGAGAA------T-T-TCATA-CTTTCTCAGTATT--T-------T-AT-TGT--A-------T--GTTT--GA------TG-AT-AT---T-TAT-TTTTGATTAAGCA-AACAGC--ACAAA-AT--T---G-A-ACA-AC-AA-A--AT-T-TA-CA-T------T-------T---C-----TTAAA--A-T---NN-------N--N--NN-----N-NNN-NN-NNN--NNNNNNN---NNNN--NNNN-N-N-N-T-TT-GC--AAAAATCC-----AT---CTTTAATC-TTA---TTAAATTGTAC---------gcgtgatgtgttttcataaaatggcttaacatgtaaaacatgtattaagcaaaaaatgtaaaatcgaaaaaacagaatttatcatttttgaatgaataaagtataattcaaataagaaaatcaaactttacgacaaaataa
gi|18 : gaccaggttcacaaagtcccaatatcggctttgtaataccagtatgcattattttttcaatactaatttttcaccaaagcttgatatgtttgtatcaaagatacaaagaatatgtaattttctatgtttttctatttatagaatgacttcaaagcgggtaaaattaaagaaaatgatcataaacctcccccccccccccccacacacccatttttggcatttaaataaaaaaaaaaA-TAAAA-GCATTCTTGTGACAC----AGAGATA--TTTA-TTT-CGATA---ATTGT--CT---AGTACACTCT-GTG-TAAT-AT--GTGTAACTG-T-ATT---C-ATGT--AAC-A---GA-CTGCG-----TTCACTGT-T--A---AAAC---CATGAT-TT---ATA-T----A----CAT------AA-CTG-GCATAAAA------TGTAGAAAAA------T-T-GCATA-TTcgggccatttttgggcgtttgtgaa
gi|17 : taGAAG-GCACTCTTTCCACAA----TAAAATA--TTTA---C---ACA---TATTA--CTTAGGGTGAACT----AGACAATGATCAGAGTAAACA-T-A---GCT-GTGT--AGCAA---GA-ATGCC-----TTC-TTAT-TT-A---AAAC----------AT---ATT-T----AAATGCCGCA--A-AA-ATATGTTTAAGA------TG-AGGGAAA------TAA-GCA------------------T-------T-A--T----------------TTT--AA------TT-TTAAC---TGTCT-TT-------GGAG--AAATC----------------------A-AC-A----------TA-------------------T---T-----TTAAA--A-G--AAT-------A--------------AAT-CATATA--TGATACA---AATA--CACC-AGG-C-T-TT-GCTGAAAAAAATA-AA-atttttcaaaagaaccaagtataaaagaaaaaacataaaattttgcaaaaatttaatgtttcattttattactttaaacggggtcattttttgaggtggggtggtgggggaggtgtttcacgaacgttgttctt
gi|26 : aaaggactaggttcatgaaaccccaataataTGCCACAC----AAAGATA--TTTA-TTC-TGACA---TAT-----------TAAACGCT-GAG-TAAT-AT--GTGTAAATA-T---T-CTC-TTGT--GACAA---GA-GTGCC-----TTCACT------------AC---CAAGAT-AT---ATT-T----A----CA-----A-AA-ATG-GCTTAAAT------TGTA-----------------TATA-TT------G---T--A-------C-A--TGT--A------CA--CTTT--CA------TG-GT-AT---TGTAT-TA-------AGCcttcccttttaaaaccatggtata
gi|19 : aattgttacattagaatattctataaacacctttactgttacaca-AT--GTGTAAATG-T-TTT---C-TTCT--GAAAA---GA-GTGCC-----CTCACTGT-T--A---AAAC---CAC---------ATT-T----A----TAT----A-AA-ATG-ACTTAAAA------TGTAAGAAAT------T-T-GCATA-TCTTCGCTA---T--A-------C-A--TAT--A------CA--CTTT--AT------TG-GT-AT---CGTAT-TA-------AGCGCAAAATG--A-AAA-ATA-G---A-A-A-A-AC-AA-A--AT-A-TA-TA--------T-------T---T-----TTAAA--A-G--AATTA-----A--G--TA-----C-AAT-TG-AAT--TAAAAAATATAGTA--CA
gi|5 : tatttgtttgcacataaaacaaagatattagTAAATA-T-ATTTG----TGT--AGCAA---AA-ATGCC-----TTC-TTAT-CCAA---AAAA---CTTTTT-AA---ATG-T---------CAA----A-AA-ATA-GGACACAA------TTTGGAAAAA------T-GAGCATAATCTTTAAT----T--T-------T-A---GC--C------AT--CTTT--GG------AG-TC-AC---CCTAT-GA-------ATAA-AAAAAC--ATAAA-AT--T---A-ACA-A-AT-AA-A-----T-TACCA-G------TACACATAT---T-----TAAAA--A-G--GATGA-----A--G--TA-----T-ATT-TA-ATA--CAAA--------TA--CACC-A-AGC-T-TT-GC--TGAAAAAT--AA-GT---GTTT--TT-GAA---ATGCATTTTGC---------ATGGCCCACACTGGGGC---TT-CA-TGAACCTAGTaatacatgacatatcaaataccagaatcaatatgaacatgtcagtgtttttt
gi|15 : gTAAATA-T-CAT-G----TGT--GGCAA---GA-ATGCC-----TTCATCAT-CCAA---AAAT---AATGA--GC---ATT-T----T----CCT----T-AA-ttctgtaaatttgtctagtggtaatagtgctttcactgttgaacacgtgatattttatctaaaatggttcaaaatataagaaaaatgcatattgtcactttaaaataatatgtgcactttcatggtattgttttaagcacaaaatgtaaaaatacaaaacaaaattgacattttttaaaagagtaaagtataataaaattaagaaaaacatcaaattttgcagaaaaaaaatagggattaattttattgaatgtacatgtacagggtcattttag
gi|1 : ggtttacaaagccccaatatctgccctggaaaatgcattattttaaatacttatttttcagcaaagttttgtttgtttgtttcaaatatactcatttcttttaaaatataaatgtatatttcatcttttaaaagtaagtttgttctgttcgtagaatgactccagagagagtaagaA-GTGCC-----TTCATTGT-T--AT--AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----A----CCT----A-AA-TTG-TCTT-AAT------TGTAGTAAAA------T-A-GCATA-TTTATATTG---T--T-------T-A--TAT--------------TT----A------TA--T-AT---TTTAT-TA-------AGCG--AAATT--GTCAA-AT--TA--A-A-A-A-AT-AA-A--AT-T-TA-CA--------------------T-----TTGAT--A-A--AAT-------A--A---------------TA-AAA--TAGAAAT---A------------------TT-GC--AAAGAAAT---A-AT---GTTTTATT-TTA---TGACATTCTAC---------Attctgatcagtgtctggtacactctgagtaatatgcgtaaatattgtcttgtgatatatttgcctaaaatggcttaacatgtagaaaaaaaaagtttttttagctgtagatgtattcttgaatg
gi|11 : gaactaggttcacgacgccccaatattggccctgtaaaatgcatttattttaaatacttatttttcagcaaagttttgtgtatttgtattaaatatacattatttttttaaaatatggacattttgtctttatgttttatgtttttctattcatagaataacccctaagacaattagaattaaagaaaatgcgcatttcccccaattttgtcctattttttacatttagatatttttcttactatgaaggcattcttgccacaataagacatttatactgataattgtctataacattcatagtaatatgtataaatattgccttgtggcaaaaaccctgatatatttacctaaaatggcttaaaatgtagtaaagcttcatatttctactgtttatatacactttaagcgaaaaaggtcaaattaaaaaaaataaaatttacatttgataaatgaatagattataattaTGT-T--A---AATC---TATGAT-AT---ATT-T----A----CAC----A-AA-CTG-GCTTAAAA------TGTGGGAAAA------T-T-GCATA-TTATCGCTG---T--G-------C-A--TGT--A------CA--CTTT--AA------TG-GT-AT---CGTAA-TA-------AGCC-AAAAAA--GTAAA-AT--T---G-A-A-ATGC-AA-A--AT-A-TA-TATA------T-------T---T-----TTAAATGA-G--TAT-------A--G--AA-----T-AAT-T----A--TAAAAAA---A-CAACCATA-A-A-A-TGTG-GC--CAAAAATTA-AG-A-----TTTAATT-TTA---TTGCAATAgggccttgtttgggtgtttgtgaagcccgtcctt
gi|25 : tggacaagatttacgaagccccaataatggccctgtaaaaccaatttttttaataaactttttagccaagctgggtgtgtttgtattaaatataatttattctgtaagatatgtatagttcatgttttaatttcatgttttttttctattgatagaatgacgccaaaggcggttaaaataaagtaaaatgcccatatcgcccttaatt-T--A---AAAC---CTTGAT-AT---ACT-T----A----CAT----A-AA--TA-GCTTAACA------CGTAG----------------CAT--TTTATGC---------------------TGT--A------C---ATTT--AACACGAGTG-GT-CT---TGCAT-AA-------GGCG-GGAAAT--GTAAA-AT--TG--A-A-A-A-AC-AA-A--A-----A-CA-AAAAATAT-------T---T-----CTAAA--A-T--AATCA-----A--A--TA-----T-AAT-TA-AAA--TGAAAAgacaagaacattttgggggtgcatgaacatcg
gi|15 : TGAT-AT---ATT-T----G----CCT----A-AA-ATG-GCTTAACA------TGTAGAAAAAAAAAGTT-T-------TTTTAGCTG---T--A-------G-A--TGT--A------TT--CTTG--AA------TG-tattttttttatcaaatatttaaggctaaatgttaatgcattaaacagggctat
gi|20 : ggtttacaaagccccaatatctgccctggaaaatgcattattttaaatacttatttttcagcaaagttttgtttgtttgtttcaaatatactcatttcttttaaaatataaatgtatatttcatcttttaaaagtaagtttgttctgttcgtagaatgactccagagagagtaagattaaggaaaatgctcattatttttggatgatgaaggcattcttgccacacatgatatttattctgatcagtgtctggtacactctgagtaatatgcgtaaatattgtcttgAT-ATGCAATT-T----T----CCT----ATAA-ATG-GCTTGAAG------TGTAGGAAAA------T-T-GCATA-TTTTCGCTG---C--A-------C-A--TGT--A------CA--CTTT--AA------TG-GT-AT---TGTTT-TA-------AGCG-ATAAAT--GTAAA-CT--TG--A-A-A-A-GC-AA-AACAT-A-TA-TA-T------T-------T---T-----TTAGA--A-G--AATAA-----A--G--TA-----T--AT-T--AAA--T---AAA---TTCA---ATA-A-A-T-T-TT-G---AAAAAAAAA-AT-AC---GTTTGATT-T-A---TTACA--ATAA---------AC---------TGG-GCACTTTATA
gi|13 : aagtatacctgtgcagcgaaaCC----A-AATACG-G-TTAAAA-------ATAAGGAAA------A-T-GT-TA-ATTTCGATG---T--T-------C-A--TGT--ATGTAAACA--TTTT--AA------TG-GT-AT---TTTAT-TG-------AGCG-AAAAAT--GTAAA-ATTCT---A-A-G-A-AC------------TA-----------T-------T---TGA---TTAGA--A-T--AATCA-----A--A--TA-----T-AAC-CA-AAATTTAAAAAA---AA-----ATCAA-A-T-T-TT-AC--CAAAAAATT-GA-G----GTTTTATT-TTA---TTGGATTAtaatatatttttttcggggagcggtgtgggggtcgggaacatcgtc
gi|20 : aactcacgacgcccaaaaaatggccctgtaagatgctttccttttaaatacttatttttcagcaaagcttggtgtatttgttttaaatgtattttttttttgattttaaattcatatttttctattcacagaatgtct------TATAGGAAAA------T-T-GCATA-TTTTCGCTG---aacagggtcattttggggcggtgtggggtgtcataagccactgctttccttt
gi|10 : aagtatacctgtgAAA------C-T-GCGTA-TCTTTGCTG---T--A-------C-A--TGT--A------CA--CTTT--GA------TG-AT-AT---TGTAT-TA-------AGTG-AAAAAC--GTAAA-AT--TG--A-A-A-A-AC-AA-A--AT-T-TA-CA--------T-------T---T-----TTAAA--ATG--AACAA-----A--G--TA-----T-TAT-TT-AAG--TTAACAA---ATTA--TA-C-A-A-T-T-TT-GC--AGAAAAAaatggcttgaagtgtaggaaaattgcatattttcgctgcacatgtacactttaatggtattgttttaagcgataaatgtaaacttgaaaagcaaaacatatatattttttagaagaataaagtatattaaataaattcaataaattttgaaaaaaaaaatacgtttgatttattacaataaactgggcactttatataatatatttttttcggggagcggtgtgggggtcgggaacatcgtc
gi|27 : aatatcggccctgtaaaatgcatttcttttaaatattttttcaagcaaagattggtgtgtttggattcaatatacgccattctttaaaatgtgtatatttcgctgattttatctgattttatgtttttctattcatagaatgattcaaatagtttttttgattataaagacattcttgctacacaaagctatttgttctgatcattgtctggcacactctaagtaatatgtttgaatagtgcctgggagcT--CTTT--GA------AG-TC-AT---TATAT-TA-------AAAG-AACAAT--ATGAA-AT--TG--A-A-A-A-AT-GA-A--AT----A-CA-C------T-------TCTTT-----TTAAA--A-G--AAT-------A--AATTA-----T-ATT-TA-ATA--CAAA--------TA--CACC-A-AGC-T-TT-GC--TGAAAAAatagggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|9 : caatatcggcactgcaaaatgctttttttttttcaagactaa---TGTAT-TA-------AGCA-AAAAAT--GTAAA-AT--CGA-A-A-A-A-AC-AG-A--AT-T-TA-TC-A------T-------T---T-----TTGAA--T-G--AATAA-----A--G--TA-----T-AAT-TC-AAA--TAAGAAA---ATCA-------A-A-C-T-TT-AC--GACAAAATA-Acgattaaaattaaggaaaaagctcatggcccccaaaagttgtccta
gi|31 : ggaccaggttcgcgaagccctaatttcggccctgtaaaatgcatttccaaaaactttttttttcagcaaagcttggcgtacctgtattaaatacaatttattcttttaaaatatgtatatattttcattttaaattttatgcttttctattcatatgatgattttaaaattaggggcaatgctcgtatccctcaattttgtcctatttttcgtattataatagtttttattatgaagacattcttactacactgacaaaactatttattgtgatcactgtcgagtacactctgggtaatatgtattcatggcaagattgccttcactattaaaagcgtgatgtgttttcataaaatggcttaacatgtaaaacaG-AAAAAC--GTAAC-AT--TG--A-A-A-A-AC-AC-A--AT-T-TA-CA-T------T-------T---T-----TT-------T--AAT-------A--G--CA-----TCGAT-TT-AAA--TAAAAAA---A------ATC-A-A-A-T-TTAGC--ACAAAAACA-AG------GTTTAATT-TTA---CTGTATTACAC---------A
8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TTTTTATTTGACTTTATGAAAGACATGACTTATAAATATAATATAAAATATATGACTAAAATTTAAAAAGAAATATCTTCTTTTTTTTTGAATATTTTTATAAACTTGTTT
Unaligned ( gi|34 ): GTTAATGTTATTTTATAACACTAGACTTTAAACCACTGAATAAGAAAAGATTTGATTAATTGATTGGACTTTTAGCATCACTTT
Unaligned ( gi|35 ): ATGTATGTGTTCTTTACAATTCCCTGGTCTATAATTAGTAAATTGTTAGTACTAACTGGTTCATAATGAATTTTTTTT
Unaligned ( gi|36 ): TCTTGTAATCTATACAAACACTACAATTTCGAAACATGTTAAAGATTGAAAACGTATTGCCTAGTTTAGGATAGT
Unaligned ( gi|37 ): TGCTTGTTGCTGTTGTTTTATTTTTTTTGTGGGGGTGTGGGGGTTCATGAACCTAGTCC
Unaligned ( gi|38 ): AGGGGCTAGGTTTACGAGGCCCCAATAATGGCCCTGTCTTTCCAATACTTTTCAGTC
Unaligned ( gi|39 ): CGTCAATTTTAATGAAATAGAAATATTAGATAAAATTTAAACTCCAAA
Unaligned ( gi|40 ): GTTATTGCTAACGATATGTCATAATGGAATAGGATCGAA
Alignments
lowQualScore : 5555555555555555555555555555555555555555 111 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111111111111111111111 222222222 2222222222 11111111111 111 444444444444444 11 22222222 33333333333 11111 3333333
lowQualScore : 1 0 0 3333 22 1 22 1 1 55 1 1 77777 22 1 3333 22 1 1 444 8 5555555555555555555555555555555555555555 1 4 3333 44 333 22 88 0 22 3 555555 2 5 1 3 5 1 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 999999999999999999999999 2 555555555 55 666 33 77 2 2 4444 22 1 8888888 0 0 2 2 333 3333333333 0 555 2 4444 1 1 22 555 333 1 1 333 1 3333 2 1 22 1 1 22 22 444444 333 33333333333 1 666666 3 1 44444 1 44444 33 2 22 6666 22 2 5555555 4 99999 4444444 2 555 777 2 77777 2 2 0 22 33 2 111111111111111 2 22 2 44444444 2 6666 1 77777 99999999999 44444 9999999 2
lowQualScore : . . . .... .. . .. . . .. . . ..... .. . .... .. . . ... . ........................................ . . .... .. ... .. .. . .. . ...... . . . . . . . .................................................... . ........................ . ......... .. ... .. .. . . .... .. . ....... . . . . ... .......... . ... . .... . . .. ... ... . . ... . .... . . .. . . .. .. ...... ... ........... . ...... . . ..... . ..... .. . .. .... .. . ....... . ..... ....... . ... ... . ..... . . . .. .. . ............... . .. . ........ . .... . ..... ........... ..... ....... .
lowQualScore : 2 1 4 4444 22 6 22 6 6 44 6 7 77777 33 7 5555 33 7 7 333 3 2222222222222222222222222222222222222222 2 2 5555 00 000 33 66 3 22 6 222222 7 2 7 5 2 7 7 6666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 888888888888888888888888 2 000000000 33 999 11 55 2 1 5555 99 7 9999999 5 4 2 1 777 7777777777 7 888 0 0000 9 8 55 000 222 7 7 000 7 7777 2 7 44 7 7 33 33 888888 000 11111111111 7 777777 7 9 88888 9 88888 33 0 88 7777 88 0 1111111 0 88888 8888888 1 888 777 1 44444 1 1 1 99 11 0 999999999999999 5 99 5 55555555 9 1111 2 77777 33333333333 33333 3333333 5
consensus : NAAAGGACCAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TACTTATTT-TT--C-AGCAAA-GCT---TGGTGTATTTGT--A-TTAA----A--TA-TAATTTA-TT-C-TTTT-AAA-----T----A----TGTA------T--T---TTATT---TTTTA----ATTTT--ATG--TT--TTT-TCTATTCATAGAAT--GACTCCAAAGACGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGC-T-CAT---------------T-----T--CC-CCG------------A--A--T-TTTGTCCTA-TTTT-----TNG--C-------------ATTTAAAT-A---------TT--T---T--TT--AT-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTGATCAT------TGTCTGGTACACTCTGAGTA-ATATG-T---GTAAATAT-ATTGCCTTGTGGCAA---GA-GTG----CCTTCACT-GT-T--A---AAAC---CATGA-T-AT---ATT-T----ACNTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGGA--AAA------TTGCATATTTTCGCTG---T---N-------CAT-GTA------CACTTTAATGGT-AT-----T-GT-----ATTAAGCGAAAAA-CGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-A---T-A-AG-TA-----T-AAT-TAA--AA--TAAAAAAA-CACA-C----AATTTT-GCNAAA-AAATAAAAT---G-TTTAATTTTA----TTGCATTATA-----CA--------T--TGGGGC-----TTGTA-GT----GAACNTAGT
Reference ( family-164 ) : NAAAGGACCAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TACTTATTT-TT--C-AGCAAA-GCT---NNGTGTATTTGT--A-TTAA----A--TA-TAATTTA-TT-C-TTTT-AAA-----T----A----TGT-------T--T---TTNTT---TTTTA----ATTTT--ATG--TT--TTT-TCTATTCATAGAAT--GACTCCAAAGACGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGC-T-CAT---------------T-----T--CC-CCG------------A--A--T-TTTGTCCTA-TTTT-----TTN--C-------------ATTTAAAT-A---------TT--T---T--TT--AT-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTGATNAN------TGTCTGGTACACTCTGAGTA-ATATG-T---GTAAATAT-ATTGCCTTGTGGCAA---GA-GTG----CCTTCACT-GT-T--A---AAAC---CATGA-T-AT---ATT-T----ACNTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGGA--AAA------TTGCATATTTTCGCTG---T---T-------CAT-GTA------CACTTTAATGNT-AT-----T-GT-----ATTAAGCGAAAAA-CGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-A---T-A-AG-TA-----T-AAT-TAA--AA--TAAAAAAA-CACACC----AACTTT-GCNGAA-AAATAAAAT---G-TTTAATTTTA----TTGCATTATA-----CA--------T--TGGGGC-----TTGTA-GT----GAACCTAGT
gi|1 : GAACTAGGTTCACGACGCCCCAATATTGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TATTTT--AAA-TACTTATTT-TT--C-AGCAAA-GTT---TTGTGTATTTGT--A-TTAA----A--TA-TACATTA-TT-T-TTTTAAAA-----T----A----TGGACA----T--T---TTGTC---TTTAT----GTTTT--ATG---T--TTT-TCTATTCATAGAAT--AACCCCTAAGACAATTAGAATTAA------A-G-A-A-AA-TGC-G-CAT---------------T-----T--CC-CCC------------A--A--T-TTTGTCCTA-TTTT-----TTA--C-------------ATTTAGAT-A---------TT--T---TTCTT--AC-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAA----TAAG--ACATTTATACTGATAAT------TGTCTATAACATTCATAGTA-ATATG-T---ATAA--AT-ATTGCCTTGTGGCA-----------------------------A---AAAC---CCTGA-T-AT---ATT-T----ACCTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGTA--AAG------CTTCATATTTCTACTG---T---T-------TAT-ATA------CACT--------------------------TTAAGCGAAAAA-GGT-CAAA--TTAAA-AAAAATAAA--AT-TTA-C-----AT-TTG-----ATAAA-T-G---A-A---T-AGAT-TA-----T-AAT-TAA--
gi|1 : A-GTG----CCTTCATT-GT-T--AT--AAAC---CATGA-T-AT---ATT-T----ACCTA-AATT--G-TCTTAA-T-TG--TAGTA--AAA------TAGCATATTTATATTG---T---T-------TAT-AT-----------TTA-T-AT-AT-----T-TT-----ATTAAGCGAAAT--TGT-CAAA--TT--A-AAAAATAAA--AT-TTA-C-----AT-TTG-----ATAA--------A-A---T-A-A---------------TAA--AA--TAGAAATA---------------TT-GCAAAG-AAAT--AAT---G-TTTTATTTTA----TGACATTCTA-----CA------------GGGCC-----TTGTgtgccttcattgttataaaccatgatatatttacctaaattgtcttaattgtagtaaaatagcatatttatattgtttatatttatatattttattaagcgaaattgtcaaattaaaaaataaaatttacatttgataaaataataaaatagaaatattgcaaagaaataatgttttattttatgacattctacagggccttgtttgggtgtttgtgaagcccgtcctt
gi|10 : gaactaggttcacgacgccccaatattggccctgtaaaatgcatttattttaaatacttatttttcagcaaagttttgtgtatttgtattaaatatacattatttttttaaaatatggacattttgtctttatgttttatgtttttctattcatagaataacccctaagacaattagaattaaagaaaatgcgcatttcccccaattttgtcctattttttacatttagatatttttcttactatgaaggcattcttgccacaataagacatttatactgataattgtctataacattcatagtaatatgtataaatattgccttgtggcaaaaaccctgatatatttacctaaaatggcttaaaatgtagtaaagcttcatatttctactgtttatatacactttaagcgaaaaaggtcaaattaaaaaaaataaaatttacatttgataaatgaatagattataattaAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TAT---TTT-TT--CAAGCAAA-GAT---TGGTGTGTTTGG--A-TTCA----A--TA-TACGCCA-TT-C-TTTA-AAA-----T----G----TGTATA----T--T---TCGCTGA-TTTTATCTGATTTT--ATG---T--TTT-TCTATTCATAGAAT--GATTCAAAttgggtgtttgtgaagcccgtcctt
gi|10 : -A-A-AA-TGTGTATAT---------------T-----T--CG-CTG------------A-----T-TTTATCTGA-TTTTATGTTTTT--CTATTCATAGAATGATTCAAAT-AGT-------TT--T---T--TTG-AT-TATAAAG-ACATTCTTGCTACAC----AAAG--CTATTTGTTCTGATCAT------TGTCTGGCACACTCTAAGTA-ATATG-T---TTGA--AT-AGTGCCTGGGAGCAAACTGC-GTA----TCTTTGCT-GTAC--ATGTACAC---TTTGA-TGAT---ATTGT----ATT---AAGT--G-A---AA-AACG--T---A--AAA------TTGtagtttttttgattataaagacattcttgctacacaaagctatttgttctgatcattgtctggcacactctaagtaatatgtttgaatagtgcctgggagcaaactgcgtatctttgctgtacatgtacactttgatgatattgtattaagtgaaaaacgtaaaattgaaaaacaaaatttacatttttaaaatgaacaaagtattatttaagttaacaaattatacaattttgcagaaaaaatagggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|10 : aatatcggccctgtaaaatgcatttcttttaaatattttttcaagcaaagattggtgtgtttggattcaatatacgccattctttTC-T----AAGTA-ATAT--G-TTTGAATAGTGCCTGGGAGCAAA------CTGCGTATCTTTGCTG---T---A-------CAT-GTA------CACTTTGATGAT-AT-----T-GT-----ATTAAGTGAAAAA-CGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TAAAA-T-G---A-A---CAA-AG-TAT----T-ATT-TAA--GT--TAACAAAT-TATA-C----AATTTT-GCAGAA-AAAaaaaacaaaatttacatttttaaaatgaacaaagtattatttaagttaacaaattatacaattttgcagaaaaaatagggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|10 : aatatcggccctgtaaaatgcatttcttttaaatattttttcaagcaaagattggtgtgtttggattcaatatacgccattctttaaaatgtgtatatttcgctgattttatctgattttatgtttttctattcatagaatgattcaaatagtttttttgattataaagacattcttgctacacaaagctatttgttctgatcattgtctggcacacGGCCTTG-AA----A--GTTTACT-CCCC------A-TCCCTATTT-TTT-C-TGCAAA-ATT---GTATA-ATTTGTTAACTTAA----A--TAATACTTTG-TT-CATTTT-AAA-----A----A----TGTAAA----T--T---TTGTT---TTTCA----ATTTT--ACG---T--TTT-TCACTTAATACAAT--ATCATCAAAGatagggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|11 : aatatcggccctgtaaaatgcatttcttttaaatattttttcaagcaaagattggtgtgtttggattcaatatacgccattctttaaaatgtgtatatttcgctgattttatctgattttatgtttttctattcatagaatgattcaaatagtttttttgattataaagacattcttgctacacaaagctatttgttctgatcattgtctggcacactctaagtaatatgtttgaatagtgcctgggagcaaactgcgtatctttgctgtacatgtacaGGACAAGATTTACGAAGCCCCAATAATGGCCCTGTAA----A--AC-CAAT-TTTTTT--AA--TAA--ACTT-TT--T-AGCCAA-GCT---GGGTGTGTTTGT--A-TTAA----A--TA-TAATTTA-TT-C-TGTA-AGA-----T----A----TGTA------TAGT---TCATG---TTTTA----ATTTC--ATGTTTT--TTT-TCTATTGATAGAAT--GACGCCAAAGGCGGTTAAAATA-A------A-GTA-A-AA-TGC-C-CAT---------------A-----TCGCC-CTT------------A--A--T-TTatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|11 : t----CCTTAATTTGT-T--A---AATC---TATGA-T-AT---ATT-T----ACACA-AACT--G-GCTTAA-AATG--TGGGA--AAA------TTGCATATTATCGCTG---T---G-------CAT-GTA------CACTTTAATGGT-AT-----C-GT-----AATAAGCCAAAAA-AGT-AAAA--TT--G-AAATGCAAA--AT-ATA-T-----ATATTT-----TTAAA-T-G---A-G---T-ATAG-AA-----T-AAT-T-----A--TAAAAAAA-CA-ACCATAAAATGTG-GCCAAA-AATTAAGA------TTTAATTTTA----TTGCAATAGA-----CAAGAACATTT--TGGGG------GTGCA--T----GAACgttaaatctatgatatatttacacaaactggcttaaaatgtgggaaaattgcatattatcgctgtgcatgtacactttaatggtatcgtaataagccaaaaaagtaaaattgaaatgcaaaatatatatatttttaaatgagtatagaataattataaaaaaacaaccataaaatgtggccaaaaattaagatttaattttattgcaatagacaagaacattttgggggtgcatgaacatcg
gi|12 : tggacaagatttacgaagccccaataatggccctgtaaaaccaatttttttaataaactttttagccaagctgggtgtgtttgtattaaatataatttattctgtaagatatgtatagttcatgttttaatttcatgttttttttctattgatagaatgacgccaaaggcggttaaaataaagtaaaatgcccatatcgcGGTCCACGAAACCTCTATATCGGCCCTGTTA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAAATACTTATGT-TT--C-AGCAAA-GTG---TAGTGTGTTTGT--A-TCAA----A--TA-TACTTTA-TT-C-TTTA-AAAATAGGT----A----TATAA-----T--TA--TTATTACATATTA----ATTTT--ATG---T--GTT-TCTATTTATAGAAT--GACTCAAAAGA-GGTTAATGTT-A------AGG-A-A-AA-TG--T-C--------------------------------------------A--A--TGTTTGTTCTA-TTTT-----TTG--T-------------A-TTAAAT-A---------TT--TTACT--TT--AT-TTTTAAG-GCATTCTTGCTACAC----AAAG--ATATTTATTCTGA----------------------TCTGAGTT-ATATG-T---GT-----T-ATTGTCTGATAGCAA---GA-GTA----CATTCACT-GT-T--A---AAAT---CATGA-C-AT---ATT-T------------------GCTTAA-AATG--GAGGA--AAT------TTTCATATTGTCACTGTAAT---T-------AAT-GTG------CACTTTGATGATAATACATGT-AT-----ATTAAGCAAAAAatcg
gi|13 : gTCACGACGCCCAAAAAATGGCCCTGTAA----G--ATGCTTT-CCTTTT--AAA-TACTTATTT-TT--C-AGCAAA-GCT---TGGTGTATTTGT--T-TTAA----A--TG-T-ATTT--TT-T-TTTT-GA-----------------------------------------TTTTA----AATTC--ATA---T--TTT-TCTATTCACAGAAT--GTCTCCAAATACGGTTAAAAAT-A------AGG-A-A-AA-TGT-T-AAT---------------T-----T--Cgttta
gi|13 : aac-AAATACG-GTTAAA-AATA---AGGA--AAA------T-GT-TAATTTCGATG---T---T-------CAT-GTATGTAAACATTTTAATGGT-AT-----T-TT-----ATTGAGCGAAAAA-TGT-AAAA--TTC-T-AAGAAC---------TA----------TTTGA---TTAGA-A-T---A-A---TCA-AA-TA-----T-AAC-CAA--AATTTAAAAAAA-AAT-CA----AATTTT-ACCAAA-AAATTGAG----G-TTTTATTTTA----TTGGATTAAA-----CAGGGTCATTT--TGGGGC-----gatgttcatgtatgtaaacattttaatggtattttattgagcgaaaaatgtaaaattctaagaactatttgattagaataatcaaatataaccaaaatttaaaaaaaaatcaaattttaccaaaaaattgaggttttattttattggattaaacagggtcattttggggcggtgtggggtgtcataagccactgctttccttt
gi|14 : aactcacgacgcccaaaaaatggccctgtaagatgctttccttttaaatacttatttttcagcaaagcttggtgtatttgttttaaatgtattttttttttgattttaaattcatatttttctattcacagaatgtctccTTT-----TGG--C-------------ATTTAAAT-A---------TT--T---T--TTTTAT-TATGAAA-GTATTCTTGCTTCAC----AAAG--ATATTTATTCTGATAAT------TGCCTGGTACACTCTAAGTA-GTTTG-T---GTA--TAT-ATTGCCTTGTGGCAAC--AA-GTG----CCTTCACT-AT-T--A---AAAC---CATGA-T-AT---GTT-TCAATACCTA-AAAT--G-GGTTAA-AATG--TAGGA--AAA------TTGCATATATTCGCTG---T---T-------TAT-GTT------CTCTTTAATGAT-AT-----T-GT-----ATTAAGCAAAAAA-TGT-CAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-T-----AT-TTTATATATTAAATATG---A-A---T-ATTG-TA-----T-AAC-CAA--AA--TAAAAAA-------T----AAATCT-TCTTAA-AAAT--AAT---G-TTTGATTATAATATTTGCATTATA-----CA--------ggtgtggggtgtcataagccactgctttccttt
gi|15 : GGTTTACAAAGCCCCAATATCTGCCCTGGAA----A--ATGCATT--ATTTT--AAA-TACTTATTT-TT--C-AGCAAA-GTT---TTGTTTGTTTGT--T-TCAA----A--TA-T-ACTCATTT-C-TTTTAAAA-----TATAAA----TGTATA----T--T---TCATC---TTTTA----AAAGT--AAG--TT--TGT-TCTGTTCGTAGAAT--GACTCCAGAGA-GAGTAAGATT-A------AGG-A-A-AA-TGC-T-CAT---------------T-----gggtcatttttgggaatagtaaa
gi|15 : TAAATAT-CATG---TGTGGCAA---GA-ATG----CCTTCATC-AT-CCAA---AAAT---AATGAGC-AT----TT-T----CCTTA-Aatttttggatgatgaaggcattcttgccacacatgatatttattctgatcagtgtctggtacactctgagtaatatgcgtaaatattgtcttgtgatatatttgcctaaaatggcttaacatgtagaaaaaaaaagtttttttagctgtagatgtattcttgaatg
gi|15 : ggtttacaaagccccaatatctgccctggaaaatgcattattttaaatacttatttttcagcaaagttttgtttgtttgtttcaaatatactcatttcttttaaaatataaatgtatatttcatcttttaaaagtaagtttgttctgttcgtagaatgactccagagagagtaagaT-A---------TT--T---T--TGG-AT-GATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AT-G--ATATTTATTCTGATCAG------TGTCTGGTACACTCTGAGTA-ATATG-C---GTAA--AT-AT--------------------TG----TCTT-----------------------GTGA-T-AT---ATT-T----GCCTA-AAAT--G-GCTTAA-CATG--TAGAA--AAAAAAAGTTT-----TTTTAGCTG---T---A-------GAT-GTA------TTCTTGAATGttctgatcagtgtctggtacactctgagtaatatgcgtaaatattgtcttgtgatatatttgcctaaaatggcttaacatgtagaaaaaaaaagtttttttagctgtagatgtattcttgaatg
gi|16 : ggtttacaaagccccaatatctgccctggaaaatgcattattttaaatacttatttttcagcaaagttttgtttgtttgtttcaaatatactcatttcttttaaaatataaatgtatatttcatcttttaaaagtaagtttgttctgttcgtagaatgactccagagagagtaagattaaggaaaatgctcatAGAAT--AACTCCAAAGACGGCTAAAATT-A------A-G-A-ACAA-TGC-T-CAT---------------T-----T--TCACCC------------A--A--T-GTTGT--------T-----TTA--T-------------GTTTAGGC-A---------CT--C-----------------AA----ATTCTTTCTACAC----A-------------TCTGATCAG------TGTCTGGGGCATTCTGAGTA-ATATA-T-------------TTG----GTAGCAA---AA--TC----CCTTCACT-GT-C--A---AAACAGGTATGA-T-AT---ATT-T----ACATA-AAAT--GTGTCTTA-AATC--TACGA--AAA------TTGCATAATTTCACTC---T---T-------CAT-GTA------CACTTCAATGAT-AT-----T-GT-----ATTAATCG-GAAA-CGT-TAAC--TT--T-TAAAACAAA--GT-TTA-C-----AT-TTT-----T---A-A-G-----A---T-A-AT-T------T--AT-TAAATAA--TAAA
gi|17 : aAAAGGACTAGGTTCATGAAAC-----------CCC---------A--AT---------------AA-TATTTATTT-TTTTC-AGCAAA-GCC---TGGTGTATTTGT--A-TCAT----A--TA-TGAT-----------TT-A----------------------------------TTCTT---TTAAA----AT-----ATG--TTGATTT-------------------CTCCAAAGACAGTTAAAATT-A------A-A-A-T-AA-TGC-T-TAT---------------T-----T--CC-CTC------------A--T--C-TTAAACATA-TTTT-----TGCGGC-------------ATTTAAAT-A---------TG--T---T--TT--AAATAAGAAG-GCATTCTTGCTACAC----AGCT--ATGTTTACTCTGATCAT------TGTCTAGTTCACCCTAAGTA-ATATG-T---GTAAATAT-TTTA--TTGTGGAAA---GA-GTGCCTTCCTTCCCT-TT-T--A---AAAC---CATGG-T-AT---Agggctattttggggaagggggcgggggggggggg
gi|18 : ATAAAA-GCATTCTTGTGACAC----AGAG--ATATTTATTTCGATAAT------TGTCTAGTACACTCTGTGTA-ATATG-T---GTAACTGT-ATT--CATGTAAC-A---GA-CTG----CGTTCACT-GT-T--A---AAAC---CATGA-T-TT---ATA-T----ACAT--AACT--G-GCATAA-AATG--TAGAA--AAA------TTGCATATTAT---TT---T---T-------CAA-AAG------AAC--CAA--------------GT-----ATAAAAGAAAAAA-CAT-AAAATTTT--GCAAAAATTTA--ATGTTT-C-----AT-TTTA----TTA
gi|19 : taATG-T---GTAAATGT-TTT--CTTCTGAAAA---GA-GTG----CCCTCACT-GT-T--A---AAAC---CAC----------ATT-T----ATATA-AAAT--G-ACTTAA-AATG--TAAGA--AAT------TTGCATATCTTCGCTA---T---A-------CAT-ATA------CACTTTATTGGT-AT-----C-GT-----ATTAAGCGCAAAA-TGA-AAAA--TA--G-AAAAACAAA--AT-ATA-T-----A--TTT-----TTAAA-A-G---A-AT--T-A-AG-TA-----C-AAT-TGA--AT--TAAAAAActttaaacggggtcattttttgaggtggggtggtgggggaggtgtttcacgaacgttgttctt
gi|2 : tatttgtttgcacataaaacaaagatattagAAAGGACTAAGTCCACGAAGCACAAATATCGGTCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TGCTTATTT-TT--C-AGCAAA-GTT---ATGTGTATTTGT--A-TTAA----A--TA-TACTTTA-TT-A-TTTT-AAA-----T----A----TGT-------T--T---TTTTT---TTTTA----ATTTT--ATG--TT--TTT-TCTATTCACAAAAT--GACCCCAAAGATGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGC-T-CAT---------------T-----T--TT-CTG------------A--A--T-TGTGTCCT--TTTT-----TTT--T-------------ATTTAAAT-A---------TT--T---T--TT--AT-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAG--ATAATTAATCTGATAAA------TGTCTGGTACATTTTTAGTA-ATATG-T---GTAAATAT-ATTGCCTTGTGGCAA---GA-GTG----CCTCCACT-GT-T--A---AAAC---CATGA-T-AT---ATT-T----ACCTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGGG--AAA------TTGCATATTTTCGCCG---T---T-------TAT-GTA------CTCTTTAATGTT-AT-----T-GT-----ATTTAGCGAAAAT-TAT-AAAA--TT----AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AG-TTT-----TTGAA-A-G---A-A---T---AG-TA-----T-AAT-TAA--AA--TAAAAAAAGCACATC----AACTTT-GCAAAA-AAACAAAAT---G-TTTAATTTAA----TTGCATTATG-----CA--------T--TGGAGC-----TTATA-GT----GAACGTAGTtatagtacaaatacatgacatatcaaataccagaatcaatatgaacatgtcagtgtttttt
gi|20 : tTA--TAGGA--AAA------TTGCATATTTTCGCTG---C---A-------CAG-GTA------TACTT
gi|20 : A-T-ATGCAATT-T----TCCTATAAAT--G-GCTTGA-AGTG--TAGGA--AAA------TTGCATATTTTCGCTG---C---A-------CAT-GTA------CACTTTAATGGT-AT-----T-GT-----TTTAAGCGATAAA-TGT-AAAC--TT--G-AAAAGCAAAACAT-ATA-T-----AT-TTT-----TTAGA-A-G---A-A---TAA-AG-TA-----T--AT-T-A--AA--T----AAA-TTCAAT----AAATTT---TGAA-AAAAAAAATAC-G-TTTGA-TTTA----TTACA--ATA-----AA--------C--TGGGaatggcttgaagtgtaggaaaattgcatattttcgctgcacatgtacactttaatggtattgttttaagcgataaatgtaaacttgaaaagcaaaacatatatattttttagaagaataaagtatattaaataaattcaataaattttgaaaaaaaaaatacgtttgatttattacaataaactgggcactttatataatatatttttttcggggagcggtgtgggggtcgggaacatcgtc
gi|21 : aagtatacctgtgcagcgaaaGATCAGGTTCACGGAGCCC-AATGGTGGCCCTCTAA----A--ATGCATT-TCTATT--AAA-TACTTATTTCTT--T-AGCAAA-GCT---TGATGTAACTGT--A-TT-A----A--TA-TAATTTA-TT-CTTTTT-AAA-----G----A----CAT-----------------AT---ATTTA----ACTAA--ATG---T--TTT-TATATTAATTAAAT--GACTCCAATAATGGTTAAATTG-G------A-G-G-A--------T-CCC---------------T-----C--CC-CCG---------------T--T-TTTGTC------------------------------------GAAT-A---------TTTGT---T--TT--AT-TATGAAG-GCATCCTTGCCATAC----AGAG--ATATTTATTCTAATCAcactttatataatatatttttttcggggagcggtgtgggggtcgggaacatcgtc
gi|22 : aGGATCAGGTTCACGAAGCCCCGATATCGGCTCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTA--AAA-CATTTATTT-TT--T-AGCAAA-GCTGGATGATGTATTTGT--A-TTAA----A--TA-TAATCTA-TT-A-TTTT-AAA-----TA---A----TGT-------T--G---ATATC---T---------TTTT--ATGT-TT--TTT-TCGATCCATATAAT--TACTCATAAAACGATTGAAATG-A------A-G-AGA-GA-TGC-T-CAT---------------T-----T--TC-
gi|23 : AGGACCAGGTTCACGAAGACG-AA------------AA----A--ATGCATA-TATTTA--AAA-TTGTTATTT-TT--C-AGCGAA-ATT---TGATGTATTTGT--A-T-AA----A--TA-TGATTTA-TT-C-TTTT-GAA----------A----TGT-------G--T---ATATT---T---A----ATATT--ACG--TA--TTT--CTATTCATTGAAT--GACTCCAAAGACTGTTTAAATTAA------A-G-A-A-AA-AGC-T-CAT---------------TTCCCCT--CC-CCA------------A--A--T-TTTGTCCTA-TTTT-----TCA--C-------------CTTTAAAT-AGTTG-----TT--T---T--TT--AT-TGTGAAG-GCATttatgcttattacctttctaacctgatttttttaacatagaaga
gi|24 : cAAGGACCAGGTTCACAAAGCCCCAATA-----CCTGTAA----A--ATGTATT-TCTTTT--AAA-TACTTATTT-TT--C-AGCAAA-GT---------TATT----------A----A--TA-TCATTTA-AT-A-T------------T----A----TGT-------T-------------------------------TG--TT--TTTCTCCATTCATATAGT--AACTCCAAAGACGGTTAAAATT-A------A-GTA-T-AA-TGC-T-CAT---------------T-----TG-TT-GTG------------A--AATT-TTTGTCTT
gi|25 : -T--A---AAAC---CTTGA-T-AT---ACT-T----ACATA-AA-T--A-GCTTAA-CACG--TAG----------------CAT-TTTATGCTG---T---A-------CAT-TTAA-----CACG--AGTGGT-CT-----T-GC-----ATAAGGCGGGAAA-TGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--A----A-CAAAAAATATTT-----CTAAA-A-T---A-A---TCA-AA-TA-----T-AAT-TAA--AA--TGAAA-----ATATT----TTTTTT-ATC-AA-ATATTTAAG---G-CTAAATGTTA----ATGCATTAAA-----CA-------------GGGC-----Tttgtcaaattagaaaaaaaacaatctaaatctgaataatttatttatgaaaat
gi|26 : TGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTGACA--------TAT----TAAACGCTGAGTA-ATATG-T---GTAAATAT---TCTCTTGTGACAA---GA-GTG----CCTTCACT-------------AC---CAAGA-T-AT---ATT-T----ACA-A-AAAT--G-GCTTAA-ATTG--TA-----------------TATATT------G---T---A-------CAT-GTA------CACTTTCATGGT-AT-----T-GT-----ATTAAGCat
gi|27 : aattgttacattagaatattctataaacacctttactgttacacaCAATATCGGCACTGCAA----A--ATGCTTT-TTTTTTTTCAA-GACTAATTT-TT--C-AGCAAA-GCT---TGGTGTATTTGT--A-TTAA----A--TA-TAATTTA-TT-C-TTTT-AAA-----A----AGAAGTGTA------T--T---TCATT---TTTCA----ATTTC--ATA---T--TGT-TCTTTTAATATAAT--GACTTCAAAGACGATTAAAATT-A------AGG-A-A-AA-AGC-T-CATG--------------G-----C--CC-CCA------------A--A--A-GTTGTCCTA-
gi|28 : AAAGGCTCAGGTTCACAAAGTCCCGATATCAGTCCTGTAA----A--ATGCATT-TCATTC--CAA-TATTTATTC-AT--C-GGCAAATGTT---G---GTATTTGT--A-CTAA----A--TA-TAATTTA-TT-C-TTTTAAAA-----T----A----TG-------------------------TAA----ATATT--ATC--AT--TT--------------AT--GACTCCAAAAGCGGTTAAAATT-A------A-G-G-A-AATTGC-T-C--------------------------------------------A--A--T-GTTGTCCTA-TGTT-----TCG--C-------------ATTTA
gi|29 : --T---TTATT---TTA-A----ATATC--ATG--TG--TTT-CTTAT-CACAGAAT--GATTCCAAATACGATTGAAATT-A------AAG-A-A-AA-TGC-T-C--------------------------CC-CCA--------------------------CCA-CATT-----CAG--C-------------ATATAAAT-AG--------TT--T---T--TT--AT-TATGAAC-GCATTCCTGCCACGC----AAAG--ATATTTATTCTGATCAT------TGTTTAGT-CGCTCTGAGTA-ATATG-A---GT
gi|3 : taaGACCAGGTTCACAAAGTCCCAATATCGGCTTTGTAATACCAGTATGCATTATTTTTT--CAA-TACTAATTT-TT--C-ACCAAA-GCT---TGATATGTTTGT--A-TCAA----AGATA-CAA---A-----------GAA-----T----A----TGT--------------------------A----ATTTTCTATG--TT--TTT--CTATTTATAGAAT--GACTTCAAAG-CGGGTAAAATT-A------AAG-A-A-AA-TGA-T-CATAAACCTCCCCCCCCCC-----C--CC-CCA------------C--A--C-A----CCCA-TTTT-----TGG--C-------------ATTTAAAT-AAAAAAAAAAT--------------AT-TATGGAG-GCATTCTTGATACAC----AAAGCGAT-TTTATTCTGATCAT------TGT------------------A-ATG-T---GTAAATAT---TGTCTGGTAGCAA---AAAGTA----CCTCCACT-GT-T--A---AAAA---CATGA-C-AT---ATT-T----ACCTA-AAAT--G--------------TAGGA--GAA------TTTCATACTTTCTCAG---TATTT-------TATTGTA------TG-TTTGATGAT-AT-----TTATTTTTGATTAAGCAAACAG-CAC-AAAA--TT--G-AACAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTC-----TTAAA-A-T-----N---N-N-NN-NN-----N-NNN-NNN--NN--NNNNNNNN-NNNNNN----NNNTTT-GC--AA-AAAT-CCAT---C-TTTAATCTTA----TTAAATTGTA-----C
gi|30 : AAAGGACAAGATTCATGAAACCCTGATATCAGCCCTGTAA----A--ATGTATT-TCTTTT--AAA-TAGTTAGTT-TT--T-AGCAAA-GCT---TAGTGTTTTTCA--A-CTAAATTTA--TA-TAATTTA-TTGC-ATTA-AAA-----A----A----TGTATG----C--T---TTATT---TTTTA----ATTTA--ATG---T--TTT-TCTATTT------T--GACTCCAAAGAcgggccatttttgggcgtttgtgaa
gi|31 : GAAAAA-CGT-AACA--TT--G-AAAAACACA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TT------T---A-A---T---AG-CA-----TCGAT-TTA--AA--TAAAAAAA----ATC----AAATTTAGCACAA-AAACAAG-----G-TTTAATTTTA----CTGTATTACA-----CA-------------GGGCTATCTTTGTAGGTTCAAGAACCt
gi|32 : tACTACGTTCATGAAGCCCCAATAACGGCCCTGTAA----A--ATGC-TT-TGATTA--AAT-TACTTAGTC-AT--C-AATAAA-GCT---TGGTGTCCTTGT--A-TTAA----G--TA-TAATTTT-TT-C-TTTTAAAA-----T----A----Tcg
gi|37 : GGACTAGGTTCATGAACCCCCAacataattcataatttaa
gi|38 : tgcttgttgctgttgttttattttttttgtgggggtgAGGGGCTAGGTTTACGAGGCCCCAATAATGGCCCTG------------------TCTTTC--CAA-TAC----TT-TT--C-AG
gi|4 : AGGACAAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCTCTGTCA----A--ATGCATT-TCTTTC--AAT-AACGTATTT-GT--T-AGCAAA-TAT---ACGTGTAATTGT--A-TTAA----A--TA-TACTTTA-TT-C-TTTT-AAAA----T----A----TGT-------T--T---------------------------ACG--TT--TTT--CTATTTAAAGAAT--ACCTCAAAAGACGGTTAAACTT-A------A-GGA-A-AA-TGA-T-AAT---------------T-----T--CC-CCC------------A--A--A-ATTGTCCTA-TTTT-----TGG--C-------------ACTTAAAT-AGTC------TT--T---T--TG--AT-TATGAAAAGCATTCTTAATACAC----AAAT--ATATTTATTCTGATAAG------TGCCTGGTACACTTTAAGTA-ATATG-T---GTA-------TTGTCTTGGGCCAA---GA-GTG----CCGTCACT-GC-T--A---AAAC---TATGA-T-GT---AAT-T----ATCTA-AAAT--G-GCT-AA-AAT------------A------TTACATATTTTCGATA---T---T-------CAT-GTA------CACTTTAATGAT-AT-----T-GT-----TTTAAGCGAAAAA-TGT-AAAT--AT--G-AAAAACAAA--GC-TAA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-A---TAA-AG-CA-----T-AAT-TAA--AA--TAAAAAAC-TACAAC------TTTT-GCAAAACAAATACG-----G-TTTGATTTTA----TTGAATTATA-----TA--------tc
gi|5 : GACTAGGTTCATGAAGCCCCAGTGTGGGCCATGCAA----A--ATGCATT-TCAA----AAA-CACTTATTT-TT--C-AGCAAA-GCT---TGGTGTATTTGT--A-TTAA----A--TA-TACTTCA-TC-C-TTTTTAAA-----T----A----TGTGTACTGGTAAT---TTATT---TGTTA----ATTTT--ATG--TT--TTT-T-TATTCATAGGGT--GACTCCAAAGATGGCTAAAATT-A------AAG-A-T-TA-TGC-T-C-----------------------------------------------A--T-TTT-TCCAAATTGT-----GTC--C--------------------T-A---------TT--T---T--TT-----------G-ACATTT-------AA----AAAG-----TTT-TTTGGATAAGAAGGCATTTTTGCTACAC---AAATATATTTA-TTCTGTAAAT----TTGTCTAGTGGTAA---TA-GTG----CTTTCACT-GT-T--G---AACA---CGTGA-T-AT----TT-T----ATCTA-AAAT--G-GTTCAA-AATA--TAAGA--AAA------ATGCATATTGTCACT----T---TAAAATAATAT-GTG------CACTTTCATGGT-AT-----T-GT-----TTTAAGCACAAAA-TGT-AAAA--AT--A-CAAAACAAA--AT-TGA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-G---TAA-AG-TA-----T-AA--TAA--AA--TTAAGAAA-AACATCA---AATTTT-GCAGAA-AA--AAAATAGGG-ATTAATTTTA----TTGAA-TGTA-----CA--------T--gggtaattttaggggttcgtgaacatcgtc
gi|6 : AGGGACAAGGTTCAAGAAGGCCCAATATTGGCCCTTTAA----A--ATGCATT-TTCTTT--AAA-TACTTATTT-TT--C-AGCAAA-TCT---TGGTGTGTTTGT--A-ATAA----A--TA-TAAATTA-TT-C-TTTT-AAAA----T----A----TAT-------T--TATTTTATT---TTTCA----ATTTT--ATG--TT--TTT--CTATTCATAGAATAAGACTCCAAAGACAGTTAAAAAA-A------A-G-A-A-AAATGC-T-CAT---------------T-----T--CC-C-----------------A--C-C----CCCC-TTTT-----TTAAGC-------------ATTTAAATTG---------TT--T---T--TT--AT-TATGGAG-GCATTTTAGCCTGAC----AAAG--ATAGTATTTCTGATCAT------TGTTCAGTACACTTTGAGTA-TAATGGT---GTAAATAT-TTT--CTTGTGACAA---GA-GTG----TATACATT-GT-T--A---AAAC----ATGA-T-AT---ATT-C----ACATA-AAAT--G-TCTTCA-AATG--TAGGT--AAC------TTGCATATGTTCCCTG---T---A-------AAT-GTA------------AA-----AT-----T---------------GAAAAA-C------------------AAC--A--AT-TTA-T-----AT-TTT-----TTAAA-A-GTATA-AAGTT-A-AG-TATACCGT-AAT-TAA--AA--T-GAAAAA-CATA-A----AATTTT-GCCCCA-ATATAAG-----G-TATAATTTTG----TTGCATTAAACTGACCA--------TTATGGGGT-----TTgtacagggtcattttag
gi|7 : GGACCAGGTTCACGAAGCCCAAATATCGACCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TATTTATTT-TT--C-AACAAA-GCT---TGTTGTATTTGT--A-TTAA----G--TA-TAATTGA-CT-T-TTTA-AAA-----T----A----TGTATA----T--T---TTATT---TTTTA----ACTTTC-ATG--TT--TTT-------------------CTCCAAAAACTGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AAATGC-T-C--------------------------CC-CCC------------ACCA--A-TTTGTCATA-TTTT-----CAG--C-------------ATCTAAAT-A---------GTG-T---T--TT--AT-TATGAAA-ACATTCTTTCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTGATCAT------GGTCTGGTATACTCTGAGTA-ATACG-T---GTAAATAT-TTT--CTTGTGGCAA---GA-ATG----CCTTCACT-GA-T--A---AAAC---CATGA-T-AT---ATT-T----CCATG-AAAT--G-GCTCAA-ATTG--TAGGA--AAA------TTGCATATTTTTCCTG---C---A-------CAT-TTA------CACTTACATGAT-AT-----T-AC-----ATTGA--GAAAAA-TGT-ACAA--TT--G-AGAAACAAA--AT-TTA-T-----AT-TTT-----TAAAA-A-T---A-A---T-A-AATTA-----T-AAT-TAT--AA--TAAAAAAA-CATA-A----AATTTT-GCAAAA-CATT--AAT---G-TTAAATGTCA----TTGCATTACA-----TA--------catgaac
gi|8 : aatggttcTCGACCTTGTAA----A--ATACATT-T----T--AAA-AACTC-TTT-TT--C-AGCAAA-GCT---TGGTGTATTTGT--A-T-AA----A--TA-TAATT-A-TT---TTTT-A--------------------------------------T---TTTTA----ATTTC--AT---TT--TTA-TCTATTCATAGAAT--GACTCAAAATACGGTTGAAATT-ATATTAAG-G-A-A-AA-TGC-T-CAA---------------C-----C--CC-CTACCAGCCACACACA--A--T-TTTGTCCTA-TTTT-----TCG--C-------------ATTTAAAA-AG--------TT--TAA-T--TT--AT-TATGAAG-ACATTCTTGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTGACCAT------TGTTTAGTACACTCTGAGTA-ATACG-T---TCAACCATGATCAC---GTGG--A---AA-GTG----CCTTCACT-GT-T--A---AA--------GA-C-AT---A---------------AAT--A-GCTTAA-TATG--TAGGA--AGA------CTGGATATTTTCGATG---A---A-------CAT-GTA------CATTTTAATGGT-GT-----T-GT-----GTTAAGTGAAAAA-TGGAAAAA--AT--G-GAAAACAAA--AT-ATA-T-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---ACA---A-A-AG-TT-----T-AATATAA--AA--C--AAAAT-CACATT----G--TTT-ACA-AA-AAATAAAAA---GATTTAATCTTA----TTGCATT
gi|9 : GGACCAGGTTCGCGAAGCCCTAATTTCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCC-----AAA-AACTTTTTT-TTT-C-AGCAAA-GCT---TGGCGTACCTGT--A-TTAA----A--TA-CAATTTA-TT-C-TTTT-AAAA----T----A----TGTATATA--T--T---TTCAT---TTTAA----ATTTT--ATG--CT--TTT--CTATTCATATGAT--GATT----------TTAAAATT-A------G-G-G-GCAA-TGC-T-CGT---------------A-----T--CC-CTC------------A--A--T-TTTGTCCTA-TTTT-----TCG--T-------------ATTATAAT-A---------GT--T---T--TT--AT-TATGAAG-ACATTCTTACTACACTGACAAAA--CTATTTATTGTGATCAC------TGTCGAGTACACTCTGGGTA-ATATG-T---AT-------------TCATGGCAA---GA-TTG----CCTTCACT-AT-T--A---AAAG---CGTGA-T-GT---GTT-T----TCATA-AAAT--G-GCTTAA-CATG--TA--A--AA--------------------------------------CAT-GTA----------TTAA--------------GC-----AAAAAATGTAAAATCGA-AAAA------------ACAGA--AT-TTATC-----A--TTT-----TTGAA-T-G---A-A---TAA-AG-TA-----T-AAT-TCA--AA--TAAGAAAA-T-CA------AACTTT-ACGACA-AAATAAtaacagggccattttgaggcagttcgt
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TTTTTATTTGACTTTATGAAAGACATGACTTATAAATATAATATAAAATATATGACTAAAATTTAAAAAGAAATATCTTCTTTTTTTTTGAATATTTTTATAAACTTGTTT
Unaligned ( gi|34 ): GTTAATGTTATTTTATAACACTAGACTTTAAACCACTGAATAAGAAAAGATTTGATTAATTGATTGGACTTTTAGCATCACTTT
Unaligned ( gi|35 ): ATGTATGTGTTCTTTACAATTCCCTGGTCTATAATTAGTAAATTGTTAGTACTAACTGGTTCATAATGAATTTTTTTT
Unaligned ( gi|36 ): TCTTGTAATCTATACAAACACTACAATTTCGAAACATGTTAAAGATTGAAAACGTATTGCCTAGTTTAGGATAGT
Unaligned ( gi|39 ): CGTCAATTTTAATGAAATAGAAATATTAGATAAAATTTAAACTCCAAA
Unaligned ( gi|40 ): GTTATTGCTAACGATATGTCATAATGGAATAGGATCGAA
Alignments
lowQualScore : 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222 11111111111 1111111 33333333333 2222222222 44444444444 111111
lowQualScore : 1 0 0 3333 22 1 22 1 1 22 1 1 333 3333 22 222 444 3333 8 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 1 555 55 0 44444 22 222 5 555555 0 5 1 3 5 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 444 4 2 555555555 55 666 22 77 2 2 4444 22 333 0 1 2 99999999999 666 2 4444 2 1 555 333 1 333 1 3333 2 1 22 1 1 22 22 333 88888888888 1 666666 2 1 44444 44 44444 33 2 22 6666 22 2 5555555 4 99999 333 333 2 9999999 2 77777 2 2 0 22 33 2 333 66666666666 2 88 2 4444444444 2 6666 1 77777 99999999999 333333 2 1 3
lowQualScore : . . . .... .. . .. . . .. . . ... .... .. ... ... .... . .................................................... . . ... .. . ..... .. ... . ...... . . . . . . .................................................... ... . . ......... .. ... .. .. . . .... .. ... . . . ........... ... . .... . . ... ... . ... . .... . . .. . . .. .. ... ........... . ...... . . ..... .. ..... .. . .. .... .. . ....... . ..... ... ... . ....... . ..... . . . .. .. . ... ........... . .. . .......... . .... . ..... ........... ...... . . .
lowQualScore : 2 1 4 5555 33 7 33 7 7 33 7 7 000 5555 33 999 666 5555 3 1111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 7 777 11 4 22222 33 999 5 222222 9 5 8 6 5 7 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 666 2 1 888888888 00 666 99 55 2 1 5555 99 777 5 3 2 99999999999 111 1 2222 0 9 222 333 8 222 8 9999 3 7 44 7 7 33 33 000 88888888888 7 777777 5 9 88888 55 88888 33 0 88 7777 88 0 1111111 0 88888 222 777 1 7777777 1 44444 1 1 1 99 11 2 999 77777777777 5 44 5 3333333333 9 1111 2 77777 00000000000 999999 5 0 0
consensus : NAAAGGACCAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--AT--------T-T-T-----ATT---T--TTTAATTTT-ATG--TTTTT-TCTATTCATAGAA-----T--GA---CTCCAAAGACGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGCTCAT---------------T-----T--CC-CCG------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--NG-CATTTAAAT-A---------TT--T---T--TT--AT-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATTGTCTGGTACACTCTGAGTAATAT-GTGTAAATAT-ATTGCCTTGTGGCAA---GA-GTG----CCTTCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACNTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTG---TA------C---AT-GTA------CACTTTAATGGT-AT-----T--GT-----ATTAAGCGAAAAA-CGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-A---T-A-AG-TA-----T-AAT-TAA--AA--TAA-A---AAAA-CA--CA----AAT-TTTGC-NAAA-AAATA--AAAT---G-TTTAATTTTA----TTGCATTATA-----CA--------T--TGGGGC-----TTGTAGTGAACGTNGT
Reference ( family-164 ) : NAAAGGACCAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--AT--------T-T-T-----ATT---T--TTTAATTTT-ATG--TTTTT-TCTATTCATAGAA-----T--GA---CTCCAAAGACGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGCTCAT---------------T-----T--CC-CCG------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--NG-CATTTAAAT-A---------TT--T---T--TT--AT-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATTGTCTGGTACACTCTGAGTAATAT-GTGTAAATAT-ATTGCCTTGTGGCAA---GA-GTG----CCTTCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACNTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTG---TN------C---AT-GTA------CACTTTAATGGT-AT-----T--GT-----ATTAAGCGAAAAA-CGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-A---T-A-AG-TA-----T-AAT-TAA--AA--TAA-A---AAAA-CA--CA-C--AAT-TTTGC-NAAA-AAATA--AAAT---G-TTTAATTTTA----TTGCATTATA-----CA--------T--TGGGGC-----TTGTAGTGAACNTAGT
gi|1 : GAACTAGGTTCACGACGCCCCAATATTGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TATTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGTT---TTGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---CATTATT-T-T----TTTAAAA-----T-A--------TGGAC--AT--------T-T-T-----GTC---T--TTATGTTTT-ATG---TTTT-TCTATTCATAGAA-----T--AA---CCCCTAAGACAATTAGAATTAA------A-G-A-A-AA-TGCGCAT---------------T-----T--CC-CCC------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--TA-CATTTAGAT-A---------TT--T---TTCTT--AC-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAA----TAAG--ACATTTATACTG---ATAATTGTCTATAACATTCATAGTAATAT-GTATAA--AT-ATTGCCTTGTGGCA---------------------------A---AAAC---CCTGAT-AT---ATT-T----ACCTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGTA--AAGCTTCATATTTCTACTG---TT------T---AT-ATA------CACT---------------------------TTAAGCGAAAAA-GGT-CAAA--TTAAA-AAAAATAAA--AT-TTA-C-----AT-TTG-----ATAAA-T-G---A-A---T-AGAT-TA-----T-AAT-TAA--
gi|1 : A-GTG----CCTTCATT-GT-TAT--AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACCTA-AATT--G-TCTTAA-T-TG--TAGTA--AAATAGCATATTTATATTG---TT------T---AT-AT-----------TTA-TA-T-AT-----T--TT-----ATTAAGCGAAAT--TGT-CAAA--TT--A-AAAAATAAA--AT-TTA-C-----AT-TT--------------G---A-------------------------TAA--AA--TAA-T---AAAA-TA--GA----AAT-ATTGC-AAAG-AAAT----AAT---G-TTTTATTTTA----TGACATTCTA-----CA------------GGGCC-----TTGTgtgccttcattgttataaaccatgatatatttacctaaattgtcttaattgtagtaaaatagcatatttatattgtttatatttatatattttattaagcgaaattgtcaaattaaaaaataaaatttacatttgataaaataataaaatagaaatattgcaaagaaataatgttttattttatgacattctacagggccttgtttgggtgtttgtgaagcccgtcctt
gi|10 : gaactaggttcacgacgccccaatattggccctgtaaaatgcatttattttaaatacttatttttcagcaaagttttgtgtatttgtattaaatatacattatttttttaaaatatggacattttgtctttatgttttatgtttttctattcatagaataacccctaagacaattagaattaaagaaaatgcgcatttcccccaattttgtcctattttttacatttagatatttttcttactatgaaggcattcttgccacaataagacatttatactgataattgtctataacattcatagtaatatgtataaatattgccttgtggcaaaaaccctgatatatttacctaaaatggcttaaaatgtagtaaagcttcatatttctactgtttatatacactttaagcgaaaaaggtcaaattaaaaaaaataaaatttacatttgataaatgaatagattataattaAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TAT---TTT-T--T-CAAGCAAAGAT---TGGTGTGTTTGGATTCA----A--TATA---CGCCATT-C-T----TTA-AAA-----T-G--------TG--T--ATA-------T-T-TCGCTGATT---TTATCTGATTTT-ATG---TTTT-TCTATTCATAGAA-----T--GA---TTCAAAttgggtgtttgtgaagcccgtcctt
gi|10 : ATTCAAAT-AGT-------TT--T---T--TTG-AT-TATAAAG-ACATTCTTGCTACAC----AAAG--CTATTTGTTCTG---ATCATTGTCTGGCACACTCTAAGTAATAT-GTTTGA--AT-AGTGCCTGGGAGCAAACTGC-GTA----TCTTTGCT-GTACATGTACAC---TTTGATGAT---ATTGT----ATT---AAGT--G-A---AA-AACG--T---A--AAATTGtagtttttttgattataaagacattcttgctacacaaagctatttgttctgatcattgtctggcacactctaagtaatatgtttgaatagtgcctgggagcaaactgcgtatctttgctgtacatgtacactttgatgatattgtattaagtgaaaaacgtaaaattgaaaaacaaaatttacatttttaaaatgaacaaagtattatttaagttaacaaattatacaattttgcagaaaaaatagggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|10 : aatatcggccctgtaaaatgcatttcttttaaatattttttcaagcaaagattggtgtgtttggattcaatatacgccattctttaaaatgtgtatatttcgctgattttatctgattttatgtttttctattcatagaatgTC-T----AAGTA-ATAT--G-TTTGAATAGTGCCTGGGAGCAAACTGCGTATCTTTGCTG---TA------C---AT-GTA------CACTTTGATGAT-AT-----T--GT-----ATTAAGTGAAAAA-CGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TAAAA-T-G---A-A---CAA-AG-TAT----T-ATT-TAA--GT--TAA-C---AAAT-TA--TA-C--AAT-TTTGCAGAAA-AAATA--aaaaacaaaatttacatttttaaaatgaacaaagtattatttaagttaacaaattatacaattttgcagaaaaaatagggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|11 : aatatcggccctgtaaaatgcatttcttttaaatattttttcaagcaaagattggtgtgtttggattcaatatacgccattctttaaaatgtgtatatttcgctgattttatctgattttatgtttttctattcatagaatgattcaaatagtttttttgattataaagacattcttgctacacaaagctatttgttctgatcattgtctggcacacGGACAAGATTTACGAAGCCCCAATAATGGCCCTGTAA----A--AC-CAAT-TTTTTT--AA--TAA--ACTT-T--T-T-AGCCAAGCT---GGGTGTGTTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----GTA-AGA-----T-A--------TG--T--ATAG------T-T-C-----ATG---T--TTTAATTTC-ATGTTTTTTT-TCTATTGATAGAA-----T--GA---CGCCAAAGGCGGTTAAAATA-A------A-GTA-A-AA-TGCCCAT---------------A-----TCGCC-CTT------------A--A--T-TTgggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|11 : t----CCTTAATTTGT-TA---AATC---TATGAT-AT---ATT-T----ACACA-AACT--G-GCTTAA-AATG--TGGGA--AAATTGCATATTATCGCTG---TG------C---AT-GTA------CACTTTAATGGT-AT-----C--GT-----AATAAGCCAAAAA-AGT-AAAA--TT--G-AAATGCAAA--AT-ATA-T-----ATATTT-----TTAAA-T-G---A-G---T-ATAG-AA-----T-AAT-T-----A--TAA-A---AAAA-CAACCA-TAAAAT-GTGGC-CAAA-AATTA--AGA------TTTAATTTTA----TTGCAATAGA-----CAAGAACATTT--TGGGG------GTGCA-TGAACATgttaaatctatgatatatttacacaaactggcttaaaatgtgggaaaattgcatattatcgctgtgcatgtacactttaatggtatcgtaataagccaaaaaagtaaaattgaaatgcaaaatatatatatttttaaatgagtatagaataattataaaaaaacaaccataaaatgtggccaaaaattaagatttaattttattgcaatagacaagaacattttgggggtgcatgaacatcg
gi|12 : tggacaagatttacgaagccccaataatggccctgtaaaaccaatttttttaataaactttttagccaagctgggtgtgtttgtattaaatataatttattctgtaagatatgtatagttcatgttttaatttcatgttttttttctattgatagaatgacgccaaaggcggttaaaataaagtaaaatgcccatatcgcGGTCCACGAAACCTCTATATCGGCCCTGTTA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAAATACTTATGT-T--T-C-AGCAAAGTG---TAGTGTGTTTGTATCAA----A--TATA---CTTTATT-C-T----TTA-AAAATAGGT-A--------TA--TA-AT--------TAT-T-----ATTACAT--ATTAATTTT-ATG---TGTT-TCTATTTATAGAA-----T--GA---CTCAAAAGA-GGTTAATGTT-A------AGG-A-A-AA-TG-TC--------------------------------------------A--A--TGTTTGTTCTATTTTT--TG-TA-TTAAAT-A---------TT--TTACT--TT--AT-TTTTAAG-GCATTCTTGCTACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---A----------------TCTGAGTTATAT-GTGT-----T-ATTGTCTGATAGCAA---GA-GTA----CATTCACT-GT-TA---AAAT---CATGAC-AT---ATT-T------------------GCTTAA-AATG--GAGGA--AATTTTCATATTGTCACTGTAATT------A---AT-GTG------CACTTTGATGATAATACATGT--AT-----ATTAAGCAAAAAcg
gi|13 : gTCACGACGCCCAAAAAATGGCCCTGTAA----G--ATGCTTT-CCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTTTTAA----A--TGT----ATTT-TT-T-T----TTT-GA--------------------------------------------------T--TTTAAATTC-ATA---TTTT-TCTATTCACAGAA-----T--GT---CTCCAAATACGGTTAAAAAT-A------AGG-A-A-AA-TGTTAAT---------------T-----T------CG------------A---------TGTTC-AT-------G-TATGTAAAC-A---------TT--T---T--gttta
gi|13 : aac-AAATACG-GTTAAA-AATA---AGGA--AAAT-GT-TAATTTCGATG---TT------C---AT-GTATGTAAACATTTTAATGGT-AT-----T--TT-----ATTGAGCGAAAAA-TGT-AAAA--TTC-T-AAGAAC---------TA----------TTTGA---TTAGA-A-T---A-A---TCA-AA-TA-----T-AAC-CAA--AATTTAA-A---AAAA-AAT-CA----AAT-TTTAC-CAAA-AAATT--GAG----G-TTTTATTTTA----TTGGATTAAA-----CAGGGTCATTT--TGGGGC-----aatggtattttattgagcgaaaaatgtaaaattctaagaactatttgattagaataatcaaatataaccaaaatttaaaaaaaaatcaaattttaccaaaaaattgaggttttattttattggattaaacagggtcattttggggcggtgtggggtgtcataagccactgctttccttt
gi|14 : aactcacgacgcccaaaaaatggccctgtaagatgctttccttttaaatacttatttttcagcaaagcttggtgtatttgttttaaatgtattttttttttgattttaaattcatatttttctattcacagaatgtctccTTTT--GG-CATTTAAAT-A---------TT--T---T--TTTTAT-TATGAAA-GTATTCTTGCTTCAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATAATTGCCTGGTACACTCTAAGTAGTTT-GTGTA--TAT-ATTGCCTTGTGGCAAC--AA-GTG----CCTTCACT-AT-TA---AAAC---CATGAT-AT---GTT-TCAATACCTA-AAAT--G-GGTTAA-AATG--TAGGA--AAATTGCATATATTCGCTG---TT------T---AT-GTT------CTCTTTAATGAT-AT-----T--GT-----ATTAAGCAAAAAA-TGT-CAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-T-----AT-TTTATATATTAAATATG---A-A---T-ATTG-TA-----T-AAC-CAA--AA--T-A-A---AAAA-TA--------AAT-CTT-C-TTAA-AAAT----AAT---G-TTTGATTATAATATTTGCATTATA-----CA--------ggtgtggggtgtcataagccactgctttccttt
gi|15 : GGTTTACAAAGCCCCAATATCTGCCCTGGAA----A--ATGCATT--ATTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGTT---TTGTTTGTTTGTTTCAA----A--TATACTCATTTCTT-T-TAAAATAT-AAA-----T-G--------TA--T--AT--------T-T-C-----ATC---T--TTTAAAAGT-AAG--TTTGT-TCTGTTCGTAGAA-----T--GA---CTCCAGAGA-GAGTAAGATT-A------AGG-A-A-AA-TGCTCAT---------------------------------------------------------TATTTTT--GG------------------------------------AT-GATGAAG-GCATTCTTGCCACAC-----ATG--ATATTTATTCTG---ATCAGTGTCTGGTACACTCTGAGTAATAT-GCGTAA--AT-ATTGTCTTGTGATAT---AT-TTG----CC----------TA---AA------ATG-----------------GCTTA-ACAT--G----TAG-AA-----AAAA--AAAGT---TTTTTTAGCTG---TA------G---AT-GTA------TTCTTGAATGgggtcatttttgggaatagtaaa
gi|16 : AGAA-----T--AA---CTCCAAAGACGGCTAAAATT-A------A-G-A-ACAA-TGCTCAT---------------T-----T--TCACCC------------A--A--T-GTTGTTTTATGTTT--AGGCACTCAAAT-----------------------------------------TCTTTCTACAC----A-------------TCTG---ATCAGTGTCTGGGGCATTCTGAGTAATAT-AT----------TTG----GTAGCAA---AA--TC----CCTTCACT-GT-CA---AAACAGGTATGAT-AT---ATT-T----ACATA-AAAT--GTGTCTTA-AATC--TACGA--AAATTGCATAATTTCACTC---TT------C---AT-GTA------CACTTCAATGAT-AT-----T--GT-----ATTAATCG-GAAA-CGT-TAAC--TT--T-TAAAACAAA--GT-TTA-C-----AT-TTT-----T---A-A-G-----A---T-A-AT-T------T--AT-TAAATAA--TAA-A---
gi|17 : aAAAGGACTAGGTTCATGAAAC-----------CCC---------A--AT---------------AA-TATTTATTT-TTTT-C-AGCAAAGCC---TGGTGTATTTGTATCAT----A--TATG---ATTTATT-C-T----TTTAAAA-----T-A--------TG--TTGAT--------T-T-gggctattttggggaagggggcgggggggggggg
gi|17 : A----A--TAAT---ATTTATT-T-T----TTT-CAG-----C-AAAGCCTGGTG--T--AT--------T-TGT-----A---------TCA--TAT-ATGA-TTTAT-TCT-TT--TAAAATATGTT--GATTTCTCCAAAGACAGTTAAAATT-A------A-A-A-T-AA-TGCTTAT---------------T-----T--CC-CTC------------A--T--C-TTAAACATATTTTTGCGG-CATTTAAAT-A---------TG--T---T--TTA-AA-TAAGAAG-GCATTCTTGCTACAC----AGCT--ATGTTTACTCTG---ATCATTGTCTAGTTCACCCTAAGTAATAT-GTGTAAATAT-TTTA--TTGTGGAAA---GA-GTGCCTTCCTTCCCT-TT-TA---AAAC---CATGGT-AT---Actccaaagacagttaaaattaaaataatgcttatttccctcatcttaaacatatttttgcggcatttaaatatgttttaaataagaaggcattcttgctacacagctatgtttactctgatcattgtctagttcaccctaagtaatatgtgtaaatattttattgtggaaagagtgccttccttcccttttaaaaccatggtata
gi|18 : aaaggactaggttcatgaaaccccATAAAA-GCATTCTTGTGACAC----AGAG--ATATTTATTTCG---ATAATTGTCTAGTACACTCTGTGTAATAT-GTGTAACTGT-ATT--CATGTAAC-A---GA-CTG----CGTTCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-TT---ATA-T----ACAT--AACT--G-GCATAA-AATG--TAGAA--AAATTGCATATT----------------------AT-TT----------TTCAAAAGA-AC-----CAAGT-----ATAAAAGAAAAAA-CAT-AAAATTTT--GCAAAAATTTA--ATGTTT-C-----AT-TTTA----TTA
gi|19 : taAT-GTGTAAATGT-TTT--CTTCTGAAAA---GA-GTG----CCCTCACT-GT-TA---AAAC---CAC---------ATT-T----ATATA-AAAT--G-ACTTAA-AATG--TAAGA--AATTTGCATATCTTCGCTA---TA------C---AT-ATA------CACTTTATTGGT-AT-----C--GT-----ATTAAGCGCAAAA-TGA-AAAA--TA--G-AAAAACAAA--AT-ATA-T-----A--TTT-----TTAAA-A-G---A-AT--T-A-AG-TA-----C-AAT-TGA--AT--TAA-A---AAActttaaacggggtcattttttgaggtggggtggtgggggaggtgtttcacgaacgttgttctt
gi|2 : tatttgtttgcacataaaacaaagatattagAAAGGACTAAGTCCACGAAGCACAAATATCGGTCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TGCTTATTT-T--T-C-AGCAAAGTT---ATGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---CTTTATT-A-T----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--TT--------T-T-T------TT---T--TTTAATTTT-ATG--TTTTT-TCTATTCACAAAA-----T--GA---CCCCAAAGATGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGCTCAT---------------T-----T--TT-CTG------------A--A--T-TGTGTCCT-TTTTT--TT-TATTTAAAT-A---------TT--T---T--TT--AT-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAG--ATAATTAATCTG---ATAAATGTCTGGTACATTTTTAGTAATAT-GTGTAAATAT-ATTGCCTTGTGGCAA---GA-GTG----CCTCCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACCTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGGG--AAATTGCATATTTTCGCCG---TT------T---AT-GTA------CTCTTTAATGTT-AT-----T--GT-----ATTTAGCGAAAAT-TAT-AAAA--TT----AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AG-TTT-----TTGAA-A-G---A-A---T---AG-TA-----T-AAT-TAA--AA--TAA-A---AAAAGCA--CATC--AAC-TTTGC-AAAA-AAACA--AAAT---G-TTTAATTTAA----TTGCATTATG-----CA--------T--TGGAGC-----TTATAGTGAACGTAGTtatagtacaaatacatgacatatcaaataccagaatcaatatgaacatgtcagtgtttttt
gi|20 : tTA--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTG---CA------C---AG-GTA------TACTT
gi|20 : AT-ATGCAATT-T----TCCTATAAAT--G-GCTTGA-AGTG--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTG---CA------C---AT-GTA------CACTTTAATGGT-AT-----T--GT-----TTTAAGCGATAAA-TGT-AAAC--TT--G-AAAAGCAAAACAT-ATA-T-----AT-TTT-----TTAGA-A-G---A-A---TAA-AG-TA-----T--AT-T-A--AA--TAA-ATTCAATA-----------AAT-TTTGA-AAAA-AAA-A--ATAC---G-TTTGA-TTTA----TTACA--ATA-----AA--------C--TGGGaatggcttgaagtgtaggaaaattgcatattttcgctgcacatgtacactttaatggtattgttttaagcgataaatgtaaacttgaaaagcaaaacatatatattttttagaagaataaagtatattaaataaattcaataaattttgaaaaaaaaaatacgtttgatttattacaataaactgggcactttatataatatatttttttcggggagcggtgtgggggtcgggaacatcgtc
gi|21 : aagtatacctgtgcagcgaaaGATCAGGTTCACGGAGCCC-AATGGTGGCCCTCTAA----A--ATGCATT-TCTATT--AAA-TACTTATTTCT--T-T-AGCAAAGCT---TGATGTAACTGTATT-A----A--TATA---ATTTATT-CTT----TTT-AAA-----G-A--------CA--T--A-------------T-----A--------TTTAACTAA-ATG---TTTT-TATATTAATTAAA-----T--GA---CTCCAATAATGGTTAAATTG-G------A-G-G-A-------TCCC---------------T-----C--CC-CCG------------------------------TTTT--TG----TCGAAT-A---------TTTGT---T--TT--AT-TATGAAG-GCATCCTTGCCATAC----AGAG--ATATTTATTCTA---ATCATcactttatataatatatttttttcggggagcggtgtgggggtcgggaacatcgtc
gi|22 : GGATCAGGTTCACGAAGCCCCGATATCGGCTCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTA--AAA-CATTTATTT-T--T-T-AGCAAAGCTGGATGATGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATCTATT-A-T----TTT-AAA-----TAA--------TG--T---T--------G-A-T-----ATC---T-------TTTT-ATGT-TTTTT-TCGATCCATATAA-----T--TA---CTCATAAAACGATTGAAATG-A------A-G-AGA-GA-TGCTCAT---------------T-----T--TC-
gi|23 : AGGACCAGGTTCACGAAGACG-AA------------AA----A--ATGCATA-TATTTA--AAA-TTGTTATTT-T--T-C-AGCGAAATT---TGATGTATTTGTA-TAA----A--TATG---ATTTATT-C-T----TTTGAAA-----T-G--------TG--T--A-------------T-----A--------TTTAATATT-ACG---TATT-TCTATTCATTGAA-----T--GA---CTCCAAAGACTGTTTAAATTAA------A-G-A-A-AA-AGCTCAT---------------TTCCCCT--CC-CCA------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--CA-CCTTTAAAT-AGTTG-----TT--T---T--TT--AT-TGTGAAG-GCATttatgcttattacctttctaacctgatttttttaacatagaaga
gi|24 : cAAGGACCAGGTTCACAAAGCCCCAATA-----CCTGTAA----A--ATGTATT-TCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGT---------TATT-------A----A--TATC---ATTT----------------AA-----T-A--------T---T--AT--------G-T-T-------------------------TG--TTTTTCTCCATTCATATAG-----T--AA---CTCCAAAGACGGTTAAAATT-A------A-GTA-T-AA-TGCTCAT---------------T-----TG-TT-GTG------------A--AATT-TTTGTCTT
gi|25 : -TA---AAAC---CTTGAT-AT---ACT-T----ACATA-AA-T--A-GCTTAA-CACG--TAG----------CAT-TTTATGCTG---TA------C---AT-TTAA-----CACG--AGTGGT-CT-----T--GC-----ATAAGGCGGGAAA-TGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--A----A-CAAAAAATATTT-----CTAAA-A-T---A-A---TCA-AA-TA-----T-AAT-TAA--AA--TGA-A---A---------A-T--ATT-TTTTT-TATC-AAATATTTAAG---G-CTAAATGTTA----ATGCATTAAA-----CA-------------GGGC-----Tttgtcaaattagaaaaaaaacaatctaaatctgaataatttatttatgaaaat
gi|26 : TGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---A-CAT-AT----TAAACGCTGAGTAATAT-GTGTAAATAT---TCTCTTGTGACAA---GA-GTG----CCTTCACT-----------AC---CAAGAT-AT---ATT-T----ACA-A-AAAT--G-GCTTAA-ATTG--TA-----------TATATT------G---TA------C---AT-GTA------CACTTTCATGGT-AT-----T--GT-----ATTAAGCat
gi|27 : aattgttacattagaatattctataaacacctttactgttacacaCAATATCGGCACTGCAA----A--ATGCTTT-TTTTTTTTCAA-GACTAATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTT-AAA-----A-AGAAG----TG--T--AT--------T-T-C-----ATT---T--TTCAATTTC-ATA---TTGT-TCTTTTAATATAA-----T--GA---CTTCAAAGACGATTAAAATT-A------AGG-A-A-AA-AGCTCATG--------------G-----C--CC-CCA------------A--A--A-GTTGTCCTA
gi|28 : AAAGGCTCAGGTTCACAAAGTCCCGATATCAGTCCTGTAA----A--ATGCATT-TCATTC--CAA-TATTTATTC-A--T-C-GGCAAATGT---TG--GTATTTGTACTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTTAAAA-----T-A--------TG--T--A-------------------------------AATATT-ATC--ATTT--------------A-----T--GA---CTCCAAAAGCGGTTAAAATT-A------A-G-G-A-AATTGCTC--------------------------------------------A--A--T-GTTGTCCTATGTTT--CG-CATTTA
gi|29 : --T--AA--------T-T-T-----ATT---T--TA-AATATC-ATG--TGTTT-CTTAT-CACAGAA-----T--GA---TTCCAAATACGATTGAAATT-A------AAG-A-A-AA-TGCTC--------------------------CC-CCA--------------------------CCACATTC--AG-CATATAAAT-AG--------TT--T---T--TT--AT-TATGAAC-GCATTCCTGCCACGC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATTGTTTAGT-CGCTCTGAGTAATAT-GAGT
gi|3 : GACCAGGTTCACAAAGTCCCAATATCGGCTTTGTAATACCAGTATGCATTATTTTTT--CAA-TACTAATTT-T--T-C-ACCAAAGCT---TGATATGTTTGTATCAA----AGATACA---A---A--------------GAA-----T-A--------TG--T--A-------------------ATT---T--TCTA-------TG--TTTTT--CTATTTATAGAA-----T--GA---CTTCAAAG-CGGGTAAAATT-A------AAG-A-A-AA-TGATCATAAACCTCCCCCCCCCC-----C--CC-CCA------------C--A--C-A----CCCATTTTT--GG-CATTTAAAT-AAAAAAAAAAT--------------AT-TATGGAG-GCATTCTTGATACAC----AAAGCGAT-TTTATTCTG---ATCATTGT-----------------A-AT-GTGTAAATAT---TGTCTGGTAGCAA---AAAGTA----CCTCCACT-GT-TA---AAAA---CATGAC-AT---ATT-T----ACCTA-AAAT--G--------------TAGGA--GAATTTCATACTTTCTCAG---TA------TTTTATTGTA------TG-TTTGATGAT-AT-----TT-ATTTTTGATTAAGCAAACAG-CAC-AAAA--TT--G-AACAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTC-----TTAAA-A-T---N-N---N-N-NN-NN-----N-NNN-NNN--NN--NNN-N---NNNN-NN--NN-N--NNN-TTTGC---AA-AAAT---CCAT---C-TTTAATCTTA----TTAAATTGTA-----C
gi|30 : AAAGGACAAGATTCATGAAACCCTGATATCAGCCCTGTAA----A--ATGTATT-TCTTTT--AAA-TAGTTAGTT-T--T-T-AGCAAAGCT---TAGTGTTTTTCAACTAAATTTA--TATA---ATTTATTGC-A----TTA-AAA-----A-A--------TG--T--ATGC------T-T-T-----ATT---T--TTTAATTTA-ATG---TTTT-TCTATTT-----------T--GA---CTCCAAAGAcgggccatttttgggcgtttgtgaa
gi|31 : GAAAAA-CGT-AACA--TT--G-AAAAACACA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TT------T---A-A---T---AG-CA-----TCGAT-TTA--AA--TAA-A---AAAA-AT--CA----AAT-TTAGC-ACAA-AAACA--AG-----G-TTTAATTTTA----CTGTATTACA-----CA-------------GGGCTATCTTTGTAGt
gi|32 : tACTACGTTCATGAAGCCCCAATAACGGCCCTGTAA----A--ATGC-TT-TGATTA--AAT-TACTTAGTC-A--T-C-AATAAAGCT---TGGTGTCCTTGTATTAA----G--TATA---ATTTTTT-C-T----TTTAAAA-----T-A--------TA--C--ATAA------T-T-C-----ATA---A--TTTAAgttcaagaacctcg
gi|37 : GGACTAGGTTCATGAACCCCCA
gi|38 : tgcttgttgctgttgttttattttttttgtgggggtgAGGGGCTAGGTTTACGAGGCCCCAATAATGGCCCTG------------------TCTTTC--CAA-TAC----TT-T--T-C-AG
gi|4 : AGGACAAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCTCTGTCA----A--ATGCATT-TCTTTC--AAT-AACGTATTT-G--T-T-AGCAAATAT---ACGTGTAATTGTATTAA----A--TATA---CTTTATT-C-T----TTT-AAAA----T-A--------TG--T--------------------------------------TT-ACG--TTTTT--CTATTTAAAGAA-----T--AC---CTCAAAAGACGGTTAAACTT-A------A-GGA-A-AA-TGATAAT---------------T-----T--CC-CCC------------A--A--A-ATTGTCCTATTTTT--GG-CACTTAAAT-AGTC------TT--T---T--TG--AT-TATGAAAAGCATTCTTAATACAC----AAAT--ATATTTATTCTG---ATAAGTGCCTGGTACACTTTAAGTAATAT-GTGTA-------TTGTCTTGGGCCAA---GA-GTG----CCGTCACT-GC-TA---AAAC---TATGAT-GT---AAT-T----ATCTA-AAAT--G-GCT-AA-AAT------------ATTACATATTTTCGATA---TT------C---AT-GTA------CACTTTAATGAT-AT-----T--GT-----TTTAAGCGAAAAA-TGT-AAAT--AT--G-AAAAACAAA--GC-TAA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-A---TAA-AG-CA-----T-AAT-TAA--AA--TAA-A---AAAC-TA--CA----ACT-TTTGC-AAAACAAATA--CG-----G-TTTGATTTTA----TTGAATTATA-----TAGGGTAATTT--TAGGGG-----T--TCGTGAACATCGTtc
gi|5 : GACTAGGTTCATGAAGCCCCAGTGTGGGCCATGCAA----A--ATGCATT-TCAA----AAA-CACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---CTTCATC-CTT----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--GTACTGGTAAT-T-T-----ATT---T--GTTAATTTT-ATG--TTTTT-T-TATTCATAGGG-----T--GA---CTCCAAAGATGGCTAAAATTAA------A-G-A-T-TA-TGCTCAT---------------T-----T--TT-CCA------------A--A--T-TGTGTCCTATTTTT--TGACATTTAAAA-AG--------TT--T---T--TT--GGATAAGAAG-GCATTTTTGCTACAC----AAAT--ATATTTATTCTGTAAAT--TTGTCTAGTc
gi|5 : TGTAAAT----TTGTCTAGTGGTAA---TA-GTG----CTTTCACT-GT-TG---AACA---CGTGAT-AT----TT-T----ATCTA-AAAT--G-GTTCAA-AATA--TAAGA--AAAATGCATATTGTCACTT---TAAAATAAT---AT-GTG------CACTTTCATGGT-AT-----T--GT-----TTTAAGCACAAAA-TGT-AAAA--AT--A-CAAAACAAA--AT-TGA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-G---TAA-AG-TA-----T-AAT-AAA--AT--TAAGA---AAAA-CAT-CA----AAT-TTTGC-AGAA-AA--A--AAATAGGG-ATTAATTTTA----TTGAA-TGTA-----CA--------T--ggtaatagtgctttcactgttgaacacgtgatattttatctaaaatggttcaaaatataagaaaaatgcatattgtcactttaaaataatatgtgcactttcatggtattgttttaagcacaaaatgtaaaaatacaaaacaaaattgacattttttaaaagagtaaagtataataaaattaagaaaaacatcaaattttgcagaaaaaaaatagggattaattttattgaatgtacatgtacagggtcattttag
gi|6 : gactaggttcatgaagccccagtgtgggccatgcaaaatgcatttcaaaaacacttatttttcagcaaagcttggtgtatttgtattaaatatacttcatcctttttaaatatgtgtactggtaatttatttgttaattttatgtttttttattcatagggtgactccaaagatggctaaaattaaagattatgctcatttttccaaattgtgtcctattttttgacatttaaaaagttttttggataagaaggcatttttgctacacaaatatatttattcAGGGACAAGGTTCAAGAAGGCCCAATATTGGCCCTTTAA----A--ATGCATT-TTCTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAATCT---TGGTGTGTTTGTAATAA----A--TATA---AATTATT-C-T----TTT-AAAATA--T-A--------TT--T--AT--------T-T-T-----ATT---T--TTCAATTTT-ATG--TTTTT--CTATTCATAGAA-----TAAGA---CTCCAAAGACAGTTAAAAAA-A------A-G-A-A-AAATGCTCAT---------------T-----T--CC-C-----------------A--C-CCC--CCTTTTTTA--AG-CATTTAAATTG---------TT--T---T--TT--AT-TATGGAG-GCATTTTAGCCTGAC----AAAG--ATAGTATTTCTG---ATCATTGTTCAGTACACTTTGAGTATAATGGTGTAAATAT-TTT--CTTGTGACAA---GA-GTG----TATACATT-GT-TA---AAA----CATGAT-AT---ATT-C----ACATA-AAAT--G-TCTTCA-AATG--TAGGT--AACTTGCATATGTTCCCTG---TA------A---AT-GTA------------AA-----AT-----T----------------GAAAAA-C------------------AAC--A--AT-TTA-T-----AT-TTT-----TTAAA-A-GTATA-AAGTT-A-AG-TATACCGT-AAT-TAA--AA--T-G-A---AAAA-CA--TA-A--AAT-TTTGC-CCCA-ATATA--AG-----G-TATAATTTTG----TTGCATTAAACTGACCA--------TTATGGGGT-----TTgtacagggtcattttag
gi|7 : GGACCAGGTTCACGAAGCCCAAATATCGACCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TATTTATTT-T--T-C-AACAAAGCT---TGTTGTATTTGTATTAA----G--TATA---ATTGACT-T-T----TTA-AAA-----T-A--------TG--T--ATAT------T-T-T-----ATT---T--TTTAACTTTCATG--TTTTT---------------------------CTCCAAAAACTGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AAATGCTC--------------------------CC-CCC------------ACCA--A-TTTGTCATATTTTC--AG-CATCTAAAT-A---------GTG-T---T--TT--AT-TATGAAA-ACATTCTTTCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATGGTCTGGTATACTCTGAGTAATAC-GTGTAAATAT-TTT--CTTGTGGCAA---GA-ATG----CCTTCACT-GA-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----CCATG-AAAT--G-GCTCAA-ATTG--TAGGA--AAATTGCATATTTTTCCTG---CA------C---AT-TTA------CACTTACATGAT-AT-----T--AC-----ATTGA--GAAAAA-TGT-ACAA--TT--G-AGAAACAAA--AT-TTA-T-----AT-TTT-----TAAAA-A-T---A-A---T-A-AATTA-----T-AAT-TAT--AA--TAA-A---AAAA-CA--TA-A--AAT-TTTGC-AAAA-CATT----AAT---G-TTAAATGTCA----TTGCATTACA-----TA--------catgaac
gi|8 : aatggttcTCGACCTTGTAA----A--ATACATT-T----T--AAA-AACTC-TTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTAT-AA----A--TATA---ATT-ATT---------------------------------------T--------T-T-T-----ATT---T--TT-AATTTC-AT---TTTTA-TCTATTCATAGAA-----T--GA---CTCAAAATACGGTTGAAATT-ATATTAAG-G-A-A-AA-TGCTCAA---------------C-----C--CC-CTACCAGCCACACACA--A--T-TTTGTCCTATTTTT--CG-CATTTAAAA-AG--------TT--TAA-T--TT--AT-TATGAAG-ACATTCTTGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ACCATTGTTTAGTACACTCTGAGTAATAC-GTTCAACCATGATCAC---GTGG--A---AA-GTG----CCTTCACT-GT-TA---AA--------GAC-AT------------------AAAT--A-GCTTAA-TATG--TAGGA--AGACTGGATATTTTCGATG---AA------C---AT-GTA------CATTTTAATGGT-GT-----T--GT-----GTTAAGTGAAAAA-TGGAAAAA--AT--G-GAAAACAAA--AT-ATA-T-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---ACA---A-A-AG-TT-----T-AATATAA--AA--CAA-A---A-----T--CA-C--ATTGTTTAC--AAA-AAATA--AAAA---GATTTAATCTTA----TTGCATT
gi|9 : GGACCAGGTTCGCGAAGCCCTAATTTCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCC-----AAA-AACTTTTTT-T--TTC-AGCAAAGCT---TGGCGTACCTGTATTAA----A--TACA---ATTTATT-C-T----TTT-AAAATATGT-A--------TA--T--AT--------T-T-T-----CAT---T--TTAAATTTT-ATG--CTTTT--CTATTCATATGA-----T--GA---TT----------TTAAAATT-A------G-G-G-GCAA-TGCTCGT---------------A-----T--CC-CTC------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--CG-TATTATAAT-A---------GT--T---T--TT--AT-TATGAAG-ACATTCTTACTACACTGACAAAA--CTATTTATTGTG---ATCACTGTCGAGTACACTCTGGGTAATAT-GTAT-------------TCATGGCAA---GA-TTG----CCTTCACT-AT-TA---AAAG---CGTGAT-GT---GTT-T----TCATA-AAAT--G-GCTTAA-CATG--TA--A--AA----------------------------C---AT-GTA----------TTAA---------------GC-----AAAAAATGTAAAATCGA-AAAA------------ACAGA--AT-TTATC-----A--TTT-----TTGAA-T-G---A-A---TAA-AG-TA-----T-AAT-TCA--AA--TAA-G---AAAA-T---CA----AAC-TTTAC-GACA-AAATA--Ataacagggccattttgaggcagttcgt
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TTTTTATTTGACTTTATGAAAGACATGACTTATAAATATAATATAAAATATATGACTAAAATTTAAAAAGAAATATCTTCTTTTTTTTTGAATATTTTTATAAACTTGTTT
Unaligned ( gi|34 ): GTTAATGTTATTTTATAACACTAGACTTTAAACCACTGAATAAGAAAAGATTTGATTAATTGATTGGACTTTTAGCATCACTTT
Unaligned ( gi|35 ): ATGTATGTGTTCTTTACAATTCCCTGGTCTATAATTAGTAAATTGTTAGTACTAACTGGTTCATAATGAATTTTTTTT
Unaligned ( gi|36 ): TCTTGTAATCTATACAAACACTACAATTTCGAAACATGTTAAAGATTGAAAACGTATTGCCTAGTTTAGGATAGT
Unaligned ( gi|39 ): CGTCAATTTTAATGAAATAGAAATATTAGATAAAATTTAAACTCCAAA
Unaligned ( gi|40 ): GTTATTGCTAACGATATGTCATAATGGAATAGGATCGAA
Alignments
lowQualScore : 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222 11111111111 11111111111 1111111 222222222222222222 2222222222 44444444444 111111
lowQualScore : 1 0 0 3333 22 1 22 1 1 22 1 1 333 3333 22 222 444 3333 8 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 1 555 55 0 44444 22 222 5 555555 0 5 1 3 5 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 444 4 2 555555555 55 666 22 77 2 2 4444 22 333 0 1 2 99999999999 666 2 4444 2 1 555 333 1 333 1 3333 2 1 22 1 1 22 22 11111111111 1 1 555555 0 2 1 44444 44 44444 33 2 22 6666 22 2 5555555 4 99999 555 333 2 9999999 2 77777 2 2 0 22 33 2 111111111111111111 33 88 2 4444444444 2 6666 1 77777 99999999999 333333 2 0 1
lowQualScore : . . . .... .. . .. . . .. . . ... .... .. ... ... .... . .................................................... . . ... .. . ..... .. ... . ...... . . . . . . .................................................... ... . . ......... .. ... .. .. . . .... .. ... . . . ........... ... . .... . . ... ... . ... . .... . . .. . . .. .. ........... . . ...... . . . ..... .. ..... .. . .. .... .. . ....... . ..... ... ... . ....... . ..... . . . .. .. . .................. .. .. . .......... . .... . ..... ........... ...... . . .
lowQualScore : 2 1 4 5555 33 7 33 7 7 33 7 7 000 5555 33 999 666 5555 3 1111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 7 777 11 4 22222 33 999 5 222222 9 5 8 6 5 7 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 666 2 1 888888888 00 666 99 55 2 1 5555 99 777 5 3 2 99999999999 111 1 2222 0 9 222 333 8 222 8 9999 3 7 44 7 7 33 33 66666666666 7 7 000000 1 5 9 88888 55 88888 33 0 88 7777 88 0 1111111 0 88888 333 777 1 7777777 1 44444 1 1 1 99 11 2 555555555555555555 22 44 5 3333333333 9 1111 2 77777 00000000000 999999 5 7 0
consensus : NAAAGGACCAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--AT--------T-T-T-----ATT---T--TTTAATTTT-ATG--TTTTT-TCTATTCATAGAA-----T--GA---CTCCAAAGACGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGCTCAT---------------T-----T--CC-CCG------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--NG-CATTTAAAT-A---------TT--T---T--TT--AT-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATTGTCTGGTACACTCTGAGTAATAT-GTGTAAATAT-ATTGCCTTGTGGCAA---GA-GTG----CCTTCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACNTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTGTA------C---AT-GT-A------CACTTTAATGGT-AT-----T--GT-----ATTAAGCGAAAAA-CGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-A---T-A-AG-TA-----T-AAT-TAA--AA--TAA-AAA----A--A-C-A-C----A--AATTTTGC-NAAA-AAATA--AAAT---G-TTTAATTTTA----TTGCATTATA-----CA--------T--TGGGGC-----TTGTAGTGAACGTCGT
Reference ( family-164 ) : NAAAGGACCAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--AT--------T-T-T-----ATT---T--TTTAATTTT-ATG--TTTTT-TCTATTCATAGAA-----T--GA---CTCCAAAGACGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGCTCAT---------------T-----T--CC-CCG------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--NG-CATTTAAAT-A---------TT--T---T--TT--AT-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATTGTCTGGTACACTCTGAGTAATAT-GTGTAAATAT-ATTGCCTTGTGGCAA---GA-GTG----CCTTCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACNTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTGTA------C---AT-GT-A------CACTTTAATGGT-AT-----T--GT-----ATTAAGCGAAAAA-CGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-A---T-A-AG-TA-----T-AAT-TAA--AA--TAA-AAA----A--A-C-A-C----A--AATTTTGC-NAAA-AAATA--AAAT---G-TTTAATTTTA----TTGCATTATA-----CA--------T--TGGGGC-----TTGTAGTGAACGTNGT
gi|1 : GAACTAGGTTCACGACGCCCCAATATTGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TATTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGTT---TTGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---CATTATT-T-T----TTTAAAA-----T-A--------TGGAC--AT--------T-T-T-----GTC---T--TTATGTTTT-ATG---TTTT-TCTATTCATAGAA-----T--AA---CCCCTAAGACAATTAGAATTAA------A-G-A-A-AA-TGCGCAT---------------T-----T--CC-CCC------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--TA-CATTTAGAT-A---------TT--T---TTCTT--AC-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAA----TAAG--ACATTTATACTG---ATAATTGTCTATAACATTCATAGTAATAT-GTATAA--AT-ATTGCCTTGTGGCA---------------------------A---AAAC---CCTGAT-AT---ATT-T----ACCTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGTA--AAGCTTCATATTTCTACTGTT------T---AT-AT-A------CACT---------------------------TTAAGCGAAAAA-GGT-CAAA--TTAAA-AAAAATAAA--AT-TTA-C-----AT-TTG-----ATAAA-T-G---A-A---T-AGAT-TA-----T-AAT-TAA--
gi|1 : A-GTG----CCTTCATT-GT-TAT--AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACCTA-AATT--G-TCTTAA-T-TG--TAGTA--AAATAGCATATTTATATTGT------------T--T-A------TATTT--ATA-T-AT-----T--TT-----ATTAAGCGAAAT--TGT-CAAA--TT--A-AAAAATAAA--AT-TTA-C-----AT-TT--------------G---A-------------------------TAA--AA--TAA-TAA----A--A-T-A-G----A--AATATTGC-AAAG-AAAT----AAT---G-TTTTATTTTA----TGACATTCTA-----CA------------GGGCC-----TTGTgtgccttcattgttataaaccatgatatatttacctaaattgtcttaattgtagtaaaatagcatatttatattgtttatatttatatattttattaagcgaaattgtcaaattaaaaaataaaatttacatttgataaaataataaaatagaaatattgcaaagaaataatgttttattttatgacattctacagggccttgtttgggtgtttgtgaagcccgtcctt
gi|10 : gaactaggttcacgacgccccaatattggccctgtaaaatgcatttattttaaatacttatttttcagcaaagttttgtgtatttgtattaaatatacattatttttttaaaatatggacattttgtctttatgttttatgtttttctattcatagaataacccctaagacaattagaattaaagaaaatgcgcatttcccccaattttgtcctattttttacatttagatatttttcttactatgaaggcattcttgccacaataagacatttatactgataattgtctataacattcatagtaatatgtataaatattgccttgtggcaaaaaccctgatatatttacctaaaatggcttaaaatgtagtaaagcttcatatttctactgtttatatacactttaagcgaaaaaggtcaaattaaaaaaaataaaatttacatttgataaatgaatagattataattaAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TAT---TTT-T--T-CAAGCAAAGAT---TGGTGTGTTTGGATTCA----A--TATA---CGCCATT-C-T----TTA-AAA-----T-G--------TG--T--ATA-------T-T-TCGCTGATT---TTATCTGATTTT-ATG---TTTT-TCTATTCATAGAA-----T--GA---TTCAAAttgggtgtttgtgaagcccgtcctt
gi|10 : ATTCAAAT-AGT-------TT--T---T--TTG-AT-TATAAAG-ACATTCTTGCTACAC----AAAG--CTATTTGTTCTG---ATCATTGTCTGGCACACTCTAAGTAATAT-GTTTGA--AT-AGTGCCTGGGAGCAAACTGC-GTA----TCTTTGCT-GTACATGTACAC---TTTGATGAT---ATTGT----ATT---AAGT--G-A---AA-AACG--T---A--AAATTGtagtttttttgattataaagacattcttgctacacaaagctatttgttctgatcattgtctggcacactctaagtaatatgtttgaatagtgcctgggagcaaactgcgtatctttgctgtacatgtacactttgatgatattgtattaagtgaaaaacgtaaaattgaaaaacaaaatttacatttttaaaatgaacaaagtattatttaagttaacaaattatacaattttgcagaaaaaatagggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|10 : aatatcggccctgtaaaatgcatttcttttaaatattttttcaagcaaagattggtgtgtttggattcaatatacgccattctttaaaatgtgtatatttcgctgattttatctgattttatgtttttctattcatagaatgTC-T----AAGTA-ATAT--G-TTTGAATAGTGCCTGGGAGCAAACTGCGTATCTTTGCTGTA------C---AT-GT-A------CACTTTGATGAT-AT-----T--GT-----ATTAAGTGAAAAA-CGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TAAAA-T-G---A-A---CAA-AG-TAT----T-ATT-TAA--GT--TAA-CAA----ATTA-T-A-C-------AATTTTGCAGAAA-AAATA--aaaaacaaaatttacatttttaaaatgaacaaagtattatttaagttaacaaattatacaattttgcagaaaaaatagggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|11 : aatatcggccctgtaaaatgcatttcttttaaatattttttcaagcaaagattggtgtgtttggattcaatatacgccattctttaaaatgtgtatatttcgctgattttatctgattttatgtttttctattcatagaatgattcaaatagtttttttgattataaagacattcttgctacacaaagctatttgttctgatcattgtctggcacacGGACAAGATTTACGAAGCCCCAATAATGGCCCTGTAA----A--AC-CAAT-TTTTTT--AA--TAA--ACTT-T--T-T-AGCCAAGCT---GGGTGTGTTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----GTA-AGA-----T-A--------TG--T--ATAG------T-T-C-----ATG---T--TTTAATTTC-ATGTTTTTTT-TCTATTGATAGAA-----T--GA---CGCCAAAGGCGGTTAAAATA-A------A-GTA-A-AA-TGCCCAT---------------A-----TCGCC-CTT------------A--A--T-TTgggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|11 : t----CCTTAATTTGT-TA---AATC---TATGAT-AT---ATT-T----ACACA-AACT--G-GCTTAA-AATG--TGGGA--AAATTGCATATTATCGCTGTG------C---AT-GT-A------CACTTTAATGGT-AT-----C--GT-----AATAAGCCAAAAA-AGT-AAAA--TT--G-AAATGCAAA--AT-ATA-T-----ATATTT-----TTAAA-T-G---A-G---T-ATAG-AA-----T-AAT-T-----A--TAA-AAA----A--A-CAA-CCATAA--AATGTGGC-CAAA-AATTA--AGA------TTTAATTTTA----TTGCAATAGA-----CAAGAACATTT--TGGGG------GTGCA-TGAACATCgttaaatctatgatatatttacacaaactggcttaaaatgtgggaaaattgcatattatcgctgtgcatgtacactttaatggtatcgtaataagccaaaaaagtaaaattgaaatgcaaaatatatatatttttaaatgagtatagaataattataaaaaaacaaccataaaatgtggccaaaaattaagatttaattttattgcaatagacaagaacattttgggggtgcatgaacatcg
gi|12 : tggacaagatttacgaagccccaataatggccctgtaaaaccaatttttttaataaactttttagccaagctgggtgtgtttgtattaaatataatttattctgtaagatatgtatagttcatgttttaatttcatgttttttttctattgatagaatgacgccaaaggcggttaaaataaagtaaaatgcccatatcgcGGTCCACGAAACCTCTATATCGGCCCTGTTA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAAATACTTATGT-T--T-C-AGCAAAGTG---TAGTGTGTTTGTATCAA----A--TATA---CTTTATT-C-T----TTA-AAAATAGGT-A--------TA--TA-AT--------TAT-T-----ATTACAT--ATTAATTTT-ATG---TGTT-TCTATTTATAGAA-----T--GA---CTCAAAAGA-GGTTAATGTT-A------AGG-A-A-AA-TG-TC--------------------------------------------A--A--TGTTTGTTCTATTTTT--TG-TA-TTAAAT-A---------TT--TTACT--TT--AT-TTTTAAG-GCATTCTTGCTACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---A----------------TCTGAGTTATAT-GTGT-----T-ATTGTCTGATAGCAA---GA-GTA----CATTCACT-GT-TA---AAAT---CATGAC-AT---ATT-T------------------GCTTAA-AATG--GAGGA--AATTTTCATATTGTCACTGTAATT---A---AT-GT-G------CACTTTGATGATAATACATGT--AT-----ATTAAGCAAAAA
gi|13 : gTCACGACGCCCAAAAAATGGCCCTGTAA----G--ATGCTTT-CCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTTTTAA----A--TGT----ATTT-TT-T-T----TTT-GA--------------------------------------------------T--TTTAAATTC-ATA---TTTT-TCTATTCACAGAA-----T--GT---CTCCAAATACGGTTAAAAAT-A------AGG-A-A-AA-TGTTAAT---------------T-----T------CG------------A---------TGTTC-AT-------G-TATGTAAAC-A---------TT--T---T--gttta
gi|13 : aac-AAATACG-GTTAAA-AATA---AGGA--AAAT-GT-TAATTTCGATGTT------C---AT-GT-ATGTAAACATTTTAATGGT-AT-----T--TT-----ATTGAGCGAAAAA-TGT-AAAA--TTC-T-AAGAAC---------TA----------TTTGA---TTAGA-A-T---A-A---TCA-AA-TA-----T-AAC-CAA--AATTTAA-AAA----A--A-A-ATC----A--AATTTTAC-CAAA-AAATT--GAG----G-TTTTATTTTA----TTGGATTAAA-----CAGGGTCATTT--TGGGGC-----aatggtattttattgagcgaaaaatgtaaaattctaagaactatttgattagaataatcaaatataaccaaaatttaaaaaaaaatcaaattttaccaaaaaattgaggttttattttattggattaaacagggtcattttggggcggtgtggggtgtcataagccactgctttccttt
gi|14 : aactcacgacgcccaaaaaatggccctgtaagatgctttccttttaaatacttatttttcagcaaagcttggtgtatttgttttaaatgtattttttttttgattttaaattcatatttttctattcacagaatgtctccTTTT--GG-CATTTAAAT-A---------TT--T---T--TTTTAT-TATGAAA-GTATTCTTGCTTCAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATAATTGCCTGGTACACTCTAAGTAGTTT-GTGTA--TAT-ATTGCCTTGTGGCAAC--AA-GTG----CCTTCACT-AT-TA---AAAC---CATGAT-AT---GTT-TCAATACCTA-AAAT--G-GGTTAA-AATG--TAGGA--AAATTGCATATATTCGCTGTT------T---AT-GT-T------CTCTTTAATGAT-AT-----T--GT-----ATTAAGCAAAAAA-TGT-CAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-T-----AT-TTTATATATTAAATATG---A-A---T-ATTG-TA-----T-AAC-CAA--AA--TAA-AAA-----------A-T----A--AATCTT-C-TTAA-AAAT----AAT---G-TTTGATTATAATATTTGCATTATA-----CA--------ggtgtggggtgtcataagccactgctttccttt
gi|15 : GGTTTACAAAGCCCCAATATCTGCCCTGGAA----A--ATGCATT--ATTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGTT---TTGTTTGTTTGTTTCAA----A--TATACTCATTTCTT-T-TAAAATAT-AAA-----T-G--------TA--T--AT--------T-T-C-----ATC---T--TTTAAAAGT-AAG--TTTGT-TCTGTTCGTAGAA-----T--GA---CTCCAGAGA-GAGTAAGATT-A------AGG-A-A-AA-TGCTCAT---------------------------------------------------------TATTTTT--GG------------------------------------AT-GATGAAG-GCATTCTTGCCACAC-----ATG--ATATTTATTCTG---ATCAGTGTCTGGTACACTCTGAGTAATAT-GCGTAA--AT-ATTGTCTTGTGATAT---AT-TTG----CC----------TA---AA------ATG-----------------GCTTA-ACAT--G----TAG-AA-----AAAA--AAAGT---TTTTTTAGCTGTA------G---AT-GT-A------TTCTTGAATGgggtcatttttgggaatagtaaa
gi|16 : AGAA-----T--AA---CTCCAAAGACGGCTAAAATT-A------A-G-A-ACAA-TGCTCAT---------------T-----T--TCACCC------------A--A--T-GTTGTTTTATGTTT--AGGCACTCAAAT-----------------------------------------TCTTTCTACAC----A-------------TCTG---ATCAGTGTCTGGGGCATTCTGAGTAATAT-AT----------TTG----GTAGCAA---AA--TC----CCTTCACT-GT-CA---AAACAGGTATGAT-AT---ATT-T----ACATA-AAAT--GTGTCTTA-AATC--TACGA--AAATTGCATAATTTCACTCTT------C---AT-GT-A------CACTTCAATGAT-AT-----T--GT-----ATTAATCG-GAAA-CGT-TAAC--TT--T-TAAAACAAA--GT-TTA-C-----AT-TTT-----T---A-A-G-----A---T-A-AT-T------T--AT-TAAATAA--TAA-A
gi|17 : aAAAGGACTAGGTTCATGAAAC-----------CCC---------A--AT---------------AA-TATTTATTT-TTTT-C-AGCAAAGCC---TGGTGTATTTGTATCAT----A--TATG---ATTTATT-C-T----TTTAAAA-----T-A--------TG--TTGAT--------T-T-gggctattttggggaagggggcgggggggggggg
gi|17 : A----A--TAAT---ATTTATT-T-T----TTT-CAG-----C-AAAGCCTGGTG--T--AT--------T-TGT-----A---------TCA--TAT-ATGA-TTTAT-TCT-TT--TAAAATATGTT--GATTTCTCCAAAGACAGTTAAAATT-A------A-A-A-T-AA-TGCTTAT---------------T-----T--CC-CTC------------A--T--C-TTAAACATATTTTTGCGG-CATTTAAAT-A---------TG--T---T--TTA-AA-TAAGAAG-GCATTCTTGCTACAC----AGCT--ATGTTTACTCTG---ATCATTGTCTAGTTCACCCTAAGTAATAT-GTGTAAATAT-TTTA--TTGTGGAAA---GA-GTGCCTTCCTTCCCT-TT-TA---AAAC---CATGGT-AT---Actccaaagacagttaaaattaaaataatgcttatttccctcatcttaaacatatttttgcggcatttaaatatgttttaaataagaaggcattcttgctacacagctatgtttactctgatcattgtctagttcaccctaagtaatatgtgtaaatattttattgtggaaagagtgccttccttcccttttaaaaccatggtata
gi|18 : aaaggactaggttcatgaaaccccATAAAA-GCATTCTTGTGACAC----AGAG--ATATTTATTTCG---ATAATTGTCTAGTACACTCTGTGTAATAT-GTGTAACTGT-ATT--CATGTAAC-A---GA-CTG----CGTTCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-TT---ATA-T----ACAT--AACT--G-GCATAA-AATG--TAGAA--AAATTGCATATT-------------------AT-TT-----------TTCAAAAGA-AC-----CAAGT-----ATAAAAGAAAAAA-CAT-AAAATTTT--GCAAAAATTTA--ATGTTT-C-----AT-TTTA----TTA
gi|19 : taAT-GTGTAAATGT-TTT--CTTCTGAAAA---GA-GTG----CCCTCACT-GT-TA---AAAC---CAC---------ATT-T----ATATA-AAAT--G-ACTTAA-AATG--TAAGA--AATTTGCATATCTTCGCTATA------C---AT-AT-A------CACTTTATTGGT-AT-----C--GT-----ATTAAGCGCAAAA-TGA-AAAA--TA--G-AAAAACAAA--AT-ATA-T-----A--TTT-----TTAAA-A-G---A-AT--T-A-AG-TA-----C-AAT-TGA--AT--TAA-AAAATATA--G-T-A-C----A--AATctttaaacggggtcattttttgaggtggggtggtgggggaggtgtttcacgaacgttgttctt
gi|2 : tatttgtttgcacataaaacaaagatattagAAAGGACTAAGTCCACGAAGCACAAATATCGGTCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TGCTTATTT-T--T-C-AGCAAAGTT---ATGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---CTTTATT-A-T----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--TT--------T-T-T------TT---T--TTTAATTTT-ATG--TTTTT-TCTATTCACAAAA-----T--GA---CCCCAAAGATGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGCTCAT---------------T-----T--TT-CTG------------A--A--T-TGTGTCCT-TTTTT--TT-TATTTAAAT-A---------TT--T---T--TT--AT-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAG--ATAATTAATCTG---ATAAATGTCTGGTACATTTTTAGTAATAT-GTGTAAATAT-ATTGCCTTGTGGCAA---GA-GTG----CCTCCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACCTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGGG--AAATTGCATATTTTCGCCGTT------T---AT-GT-A------CTCTTTAATGTT-AT-----T--GT-----ATTTAGCGAAAAT-TAT-AAAA--TT----AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AG-TTT-----TTGAA-A-G---A-A---T---AG-TA-----T-AAT-TAA--AA--TAA-AAA----A--AGC-A-C----ATCAACTTTGC-AAAA-AAACA--AAAT---G-TTTAATTTAA----TTGCATTATG-----CA--------T--TGGAGC-----TTATAGTGAACGTAGTacatgacatatcaaataccagaatcaatatgaacatgtcagtgtttttt
gi|20 : tTA--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTGCA------C---AG-GT-A------TACTT
gi|20 : AT-ATGCAATT-T----TCCTATAAAT--G-GCTTGA-AGTG--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTGCA------C---AT-GT-A------CACTTTAATGGT-AT-----T--GT-----TTTAAGCGATAAA-TGT-AAAC--TT--G-AAAAGCAAAACAT-ATA-T-----AT-TTT-----TTAGA-A-G---A-A---TAA-AG-TA-----T--AT-T-A--AA--TAA-ATT----C--A---A-T----A--AATTTTGA-AAAA-AAA-A--ATAC---G-TTTGA-TTTA----TTACA--ATA-----AA--------C--TGGGaatggcttgaagtgtaggaaaattgcatattttcgctgcacatgtacactttaatggtattgttttaagcgataaatgtaaacttgaaaagcaaaacatatatattttttagaagaataaagtatattaaataaattcaataaattttgaaaaaaaaaatacgtttgatttattacaataaactgggcactttatataatatatttttttcggggagcggtgtgggggtcgggaacatcgtc
gi|21 : aagtatacctgtgcagcgaaaGATCAGGTTCACGGAGCCC-AATGGTGGCCCTCTAA----A--ATGCATT-TCTATT--AAA-TACTTATTTCT--T-T-AGCAAAGCT---TGATGTAACTGTATT-A----A--TATA---ATTTATT-CTT----TTT-AAA-----G-A--------CA--T--A-------------T-----A--------TTTAACTAA-ATG---TTTT-TATATTAATTAAA-----T--GA---CTCCAATAATGGTTAAATTG-G------A-G-G-A-------TCCC---------------T-----C--CC-CCG------------------------------TTTT--TG----TCGAAT-A---------TTTGT---T--TT--AT-TATGAAG-GCATCCTTGCCATAC----AGAG--ATATTTATTCTA---ATCATcactttatataatatatttttttcggggagcggtgtgggggtcgggaacatcgtc
gi|22 : GGATCAGGTTCACGAAGCCCCGATATCGGCTCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTA--AAA-CATTTATTT-T--T-T-AGCAAAGCTGGATGATGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATCTATT-A-T----TTT-AAA-----TAA--------TG--T---T--------G-A-T-----ATC---T-------TTTT-ATGT-TTTTT-TCGATCCATATAA-----T--TA---CTCATAAAACGATTGAAATG-A------A-G-AGA-GA-TGCTCAT---------------T-----T--TC-
gi|23 : AGGACCAGGTTCACGAAGACG-AA------------AA----A--ATGCATA-TATTTA--AAA-TTGTTATTT-T--T-C-AGCGAAATT---TGATGTATTTGTA-TAA----A--TATG---ATTTATT-C-T----TTTGAAA-----T-G--------TG--T--A-------------T-----A--------TTTAATATT-ACG---TATT-TCTATTCATTGAA-----T--GA---CTCCAAAGACTGTTTAAATTAA------A-G-A-A-AA-AGCTCAT---------------TTCCCCT--CC-CCA------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--CA-CCTTTAAAT-AGTTG-----TT--T---T--TT--AT-TGTGAAG-GCATttatgcttattacctttctaacctgatttttttaacatagaaga
gi|24 : cAAGGACCAGGTTCACAAAGCCCCAATA-----CCTGTAA----A--ATGTATT-TCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGT---------TATT-------A----A--TATC---ATTT----------------AA-----T-A--------T---T--AT--------G-T-T-------------------------TG--TTTTTCTCCATTCATATAG-----T--AA---CTCCAAAGACGGTTAAAATT-A------A-GTA-T-AA-TGCTCAT---------------T-----TG-TT-GTG------------A--AATT-TTTGTCTT
gi|25 : -TA---AAAC---CTTGAT-AT---ACT-T----ACATA-AA-T--A-GCTTAA-CACG--TAG----------CAT-TTTATGCTGTA------C---AT-TTAA------CAC--GAGTGGT-CT-----T--GC-----ATAAGGCGGGAAA-TGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--A----A-CAAAAAATATTT-----CTAAA-A-T---A-A---TCA-AA-TA-----T-AAT-TAA--AA--TGA-AAA----T--A-T-------------TTTTTT-TATC-AAATATTTAAG---G-CTAAATGTTA----ATGCATTAAA-----CA-------------GGGC-----Tttgtcaaattagaaaaaaaacaatctaaatctgaataatttatttatgaaaat
gi|26 : TGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---A-CAT-AT----TAAACGCTGAGTAATAT-GTGTAAATAT---TCTCTTGTGACAA---GA-GTG----CCTTCACT-----------AC---CAAGAT-AT---ATT-T----ACA-A-AAAT--G-GCTTAA-ATTG--TA-----------TATATT------GTA------C---AT-GT-A------CACTTTCATGGT-AT-----T--GT-----ATTAAGCat
gi|27 : aattgttacattagaatattctataaacacctttactgttacacaCAATATCGGCACTGCAA----A--ATGCTTT-TTTTTTTTCAA-GACTAATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTT-AAA-----A-AGAAG----TG--T--AT--------T-T-C-----ATT---T--TTCAATTTC-ATA---TTGT-TCTTTTAATATAA-----T--GA---CTTCAAAGACGATTAAAATT-A------AGG-A-A-AA-AGCTCATG--------------G-----C--CC-CCA------------A--A--A-GTTGTCCTA
gi|28 : AAAGGCTCAGGTTCACAAAGTCCCGATATCAGTCCTGTAA----A--ATGCATT-TCATTC--CAA-TATTTATTC-A--T-C-GGCAAATGT---TG--GTATTTGTACTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTTAAAA-----T-A--------TG--T--A-------------------------------AATATT-ATC--ATTT--------------A-----T--GA---CTCCAAAAGCGGTTAAAATT-A------A-G-G-A-AATTGCTC--------------------------------------------A--A--T-GTTGTCCTATGTTT--CG-CATTTA
gi|29 : --T--AA--------T-T-T-----ATT---T--TA-AATATC-ATG--TGTTT-CTTAT-CACAGAA-----T--GA---TTCCAAATACGATTGAAATT-A------AAG-A-A-AA-TGCTC--------------------------CC-CCA--------------------------CCACATTC--AG-CATATAAAT-AG--------TT--T---T--TT--AT-TATGAAC-GCATTCCTGCCACGC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATTGTTTAGT-CGCTCTGAGTAATAT-GAGT
gi|3 : GACCAGGTTCACAAAGTCCCAATATCGGCTTTGTAATACCAGTATGCATTATTTTTT--CAA-TACTAATTT-T--T-C-ACCAAAGCT---TGATATGTTTGTATCAA----AGATACA---A---A--------------GAA-----T-A--------TG--T--A-------------------ATT---T--TCTA-------TG--TTTTT--CTATTTATAGAA-----T--GA---CTTCAAAG-CGGGTAAAATT-A------AAG-A-A-AA-TGATCATAAACCTCCCCCCCCCC-----C--CC-CCA------------C--A--C-A----CCCATTTTT--GG-CATTTAAAT-AAAAAAAAAAT--------------AT-TATGGAG-GCATTCTTGATACAC----AAAGCGAT-TTTATTCTG---ATCATTGT-----------------A-AT-GTGTAAATAT---TGTCTGGTAGCAA---AAAGTA----CCTCCACT-GT-TA---AAAA---CATGAC-AT---ATT-T----ACCTA-AAAT--G--------------TAGGA--GAATTTCATACTTTCTCAGTA------TTTTATTGT-A------TG-TTTGATGAT-AT-----TT-ATTTTTGATTAAGCAAACAG-CAC-AAAA--TT--G-AACAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTC-----TTAAA-ATN---N-N---N-N-NN-NN-----N-NNN-NNN--NN--NNN-NNN----N--N-N-N-N----N--NNNTTTGC---AA-AAAT---CCAT---C-TTTAATCTTA----TTAAATTGTA-----C
gi|30 : AAAGGACAAGATTCATGAAACCCTGATATCAGCCCTGTAA----A--ATGTATT-TCTTTT--AAA-TAGTTAGTT-T--T-T-AGCAAAGCT---TAGTGTTTTTCAACTAAATTTA--TATA---ATTTATTGC-A----TTA-AAA-----A-A--------TG--T--ATGC------T-T-T-----ATT---T--TTTAATTTA-ATG---TTTT-TCTATTT-----------T--GA---CTCCAAAGAcgggccatttttgggcgtttgtgaa
gi|31 : GAAAAA-CGT-AACA--TT--G-AAAAACACA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TT------T---A-A---T---AG-CA-----TCGAT-TTA--AA--TAA-AAA----A--A-A-T-C----A--AATTTAGC-ACAA-AAACA--AG-----G-TTTAATTTTA----CTGTATTACA-----CA-------------GGGCTATCTTTGTAGt
gi|32 : tACTACGTTCATGAAGCCCCAATAACGGCCCTGTAA----A--ATGC-TT-TGATTA--AAT-TACTTAGTC-A--T-C-AATAAAGCT---TGGTGTCCTTGTATTAA----G--TATA---ATTTTTT-C-T----TTTAAAA-----T-A--------TA--C--ATAA------T-T-C-----ATA---A--TTTAAgttcaagaacctcg
gi|37 : GGACTAGGTTCATGAACCCCCA
gi|38 : tgcttgttgctgttgttttattttttttgtgggggtgAGGGGCTAGGTTTACGAGGCCCCAATAATGGCCCTG------------------TCTTTC--CAA-TAC----TT-T--T-C-AG
gi|4 : AGGACAAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCTCTGTCA----A--ATGCATT-TCTTTC--AAT-AACGTATTT-G--T-T-AGCAAATAT---ACGTGTAATTGTATTAA----A--TATA---CTTTATT-C-T----TTT-AAAA----T-A--------TG--T--------------------------------------TT-ACG--TTTTT--CTATTTAAAGAA-----T--AC---CTCAAAAGACGGTTAAACTT-A------A-GGA-A-AA-TGATAAT---------------T-----T--CC-CCC------------A--A--A-ATTGTCCTATTTTT--GG-CACTTAAAT-AGTC------TT--T---T--TG--AT-TATGAAAAGCATTCTTAATACAC----AAAT--ATATTTATTCTG---ATAAGTGCCTGGTACACTTTAAGTAATAT-GTGTA-------TTGTCTTGGGCCAA---GA-GTG----CCGTCACT-GC-TA---AAAC---TATGAT-GT---AAT-T----ATCTA-AAAT--G-GCT-AA-AAT------------ATTACATATTTTCGATATT------C---AT-GT-A------CACTTTAATGAT-AT-----T--GT-----TTTAAGCGAAAAA-TGT-AAAT--AT--G-AAAAACAAA--GC-TAA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-A---TAA-AG-CA-----T-AAT-TAA--AA--TAA-AAA----A--C-T-A-C----A--ACTTTTGC-AAAACAAATA--CG-----G-TTTGATTTTA----TTGAATTATA-----TAGGGTAATTT--TAGGGG-----T--TCGTGAACATCGTtc
gi|5 : GACTAGGTTCATGAAGCCCCAGTGTGGGCCATGCAA----A--ATGCATT-TCAA----AAA-CACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---CTTCATC-CTT----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--GTACTGGTAAT-T-T-----ATT---T--GTTAATTTT-ATG--TTTTT-T-TATTCATAGGG-----T--GA---CTCCAAAGATGGCTAAAATTAA------A-G-A-T-TA-TGCTCAT---------------T-----T--TT-CCA------------A--A--T-TGTGTCCTATTTTT--TGACATTTAAAA-AG--------TT--T---T--TT--GGATAAGAAG-GCATTTTTGCTACAC----AAAT--ATATTTATTCTGTAAAT--TTGTCTAGTc
gi|5 : TGTAAAT----TTGTCTAGTGGTAA---TA-GTG----CTTTCACT-GT-TG---AACA---CGTGAT-AT----TT-T----ATCTA-AAAT--G-GTTCAA-AATA--TAAGA--AAAATGCATATTGTCACTTTAAAATAAT---AT-GT-G------CACTTTCATGGT-AT-----T--GT-----TTTAAGCACAAAA-TGT-AAAA--AT--A-CAAAACAAA--AT-TGA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-G---TAA-AG-TA-----T-AAT-AAA--AT--TAAGAAA----A--A-C-ATC----A--AATTTTGC-AGAA-AA--A--AAATAGGG-ATTAATTTTA----TTGAA-TGTA-----CA--------T--ggtaatagtgctttcactgttgaacacgtgatattttatctaaaatggttcaaaatataagaaaaatgcatattgtcactttaaaataatatgtgcactttcatggtattgttttaagcacaaaatgtaaaaatacaaaacaaaattgacattttttaaaagagtaaagtataataaaattaagaaaaacatcaaattttgcagaaaaaaaatagggattaattttattgaatgtacatgtacagggtcattttag
gi|6 : gactaggttcatgaagccccagtgtgggccatgcaaaatgcatttcaaaaacacttatttttcagcaaagcttggtgtatttgtattaaatatacttcatcctttttaaatatgtgtactggtaatttatttgttaattttatgtttttttattcatagggtgactccaaagatggctaaaattaaagattatgctcatttttccaaattgtgtcctattttttgacatttaaaaagttttttggataagaaggcatttttgctacacaaatatatttattcAGGGACAAGGTTCAAGAAGGCCCAATATTGGCCCTTTAA----A--ATGCATT-TTCTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAATCT---TGGTGTGTTTGTAATAA----A--TATA---AATTATT-C-T----TTT-AAAATA--T-A--------TT--T--AT--------T-T-T-----ATT---T--TTCAATTTT-ATG--TTTTT--CTATTCATAGAA-----TAAGA---CTCCAAAGACAGTTAAAAAA-A------A-G-A-A-AAATGCTCAT---------------T-----T--CC-C-----------------A--C-CCC--CCTTTTTTA--AG-CATTTAAATTG---------TT--T---T--TT--AT-TATGGAG-GCATTTTAGCCTGAC----AAAG--ATAGTATTTCTG---ATCATTGTTCAGTACACTTTGAGTATAATGGTGTAAATAT-TTT--CTTGTGACAA---GA-GTG----TATACATT-GT-TA---AAA----CATGAT-AT---ATT-C----ACATA-AAAT--G-TCTTCA-AATG--TAGGT--AACTTGCATATGTTCCCTGTA------A---AT-GT-A------------AA-----AT-----T----------------GAAAAA-C------------------AAC--A--AT-TTA-T-----AT-TTT-----TTAAA-A-GTATA-AAGTT-A-AG-TATACCGT-AAT-TAA--AA--T-G-AAA----A--A-C-A-TA---A--AATTTTGC-CCCA-ATATA--AG-----G-TATAATTTTG----TTGCATTAAACTGACCA--------TTATGGGGT-----TTgtacagggtcattttag
gi|7 : GGACCAGGTTCACGAAGCCCAAATATCGACCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TATTTATTT-T--T-C-AACAAAGCT---TGTTGTATTTGTATTAA----G--TATA---ATTGACT-T-T----TTA-AAA-----T-A--------TG--T--ATAT------T-T-T-----ATT---T--TTTAACTTTCATG--TTTTT---------------------------CTCCAAAAACTGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AAATGCTC--------------------------CC-CCC------------ACCA--A-TTTGTCATATTTTC--AG-CATCTAAAT-A---------GTG-T---T--TT--AT-TATGAAA-ACATTCTTTCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATGGTCTGGTATACTCTGAGTAATAC-GTGTAAATAT-TTT--CTTGTGGCAA---GA-ATG----CCTTCACT-GA-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----CCATG-AAAT--G-GCTCAA-ATTG--TAGGA--AAATTGCATATTTTTCCTGCA------C---AT-TT-A------CACTTACATGAT-AT-----T--AC-----ATTGA--GAAAAA-TGT-ACAA--TT--G-AGAAACAAA--AT-TTA-T-----AT-TTT-----TAAAA-A-T---A-A---T-A-AATTA-----T-AAT-TAT--AA--TAA-AAA----A--A-C-A-TA---A--AATTTTGC-AAAA-CATT----AAT---G-TTAAATGTCA----TTGCATTACA-----TA--------catgaac
gi|8 : aatggttcTCGACCTTGTAA----A--ATACATT-T----T--AAA-AACTC-TTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTAT-AA----A--TATA---ATT-ATT---------------------------------------T--------T-T-T-----ATT---T--TT-AATTTC-AT---TTTTA-TCTATTCATAGAA-----T--GA---CTCAAAATACGGTTGAAATT-ATATTAAG-G-A-A-AA-TGCTCAA---------------C-----C--CC-CTACCAGCCACACACA--A--T-TTTGTCCTATTTTT--CG-CATTTAAAA-AG--------TT--TAA-T--TT--AT-TATGAAG-ACATTCTTGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ACCATTGTTTAGTACACTCTGAGTAATAC-GTTCAACCATGATCAC---GTGG--A---AA-GTG----CCTTCACT-GT-TA---AA--------GAC-AT------------------AAAT--A-GCTTAA-TATG--TAGGA--AGACTGGATATTTTCGATGAA------C---AT-GT-A------CATTTTAATGGT-GT-----T--GT-----GTTAAGTGAAAAA-TGGAAAAA--AT--G-GAAAACAAA--AT-ATA-T-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---ACA---A-A-AG-TT-----T-AATATAA--AA--C---AAA----A--T-C-A-C----A--TTGTTTAC--AAA-AAATA--AAAA---GATTTAATCTTA----TTGCATT
gi|9 : GGACCAGGTTCGCGAAGCCCTAATTTCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCC-----AAA-AACTTTTTT-T--TTC-AGCAAAGCT---TGGCGTACCTGTATTAA----A--TACA---ATTTATT-C-T----TTT-AAAATATGT-A--------TA--T--AT--------T-T-T-----CAT---T--TTAAATTTT-ATG--CTTTT--CTATTCATATGA-----T--GA---TT----------TTAAAATT-A------G-G-G-GCAA-TGCTCGT---------------A-----T--CC-CTC------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--CG-TATTATAAT-A---------GT--T---T--TT--AT-TATGAAG-ACATTCTTACTACACTGACAAAA--CTATTTATTGTG---ATCACTGTCGAGTACACTCTGGGTAATAT-GTAT-------------TCATGGCAA---GA-TTG----CCTTCACT-AT-TA---AAAG---CGTGAT-GT---GTT-T----TCATA-AAAT--G-GCTTAA-CATG--TA--A--A-------------------A------C---AT-GT-A----------TTAA---------------GC-----AAAAAATGTAAAATCGA-AAAA------------ACAGA--AT-TTATC-----A--TTT-----TTGAA-T-G---A-A---TAA-AG-TA-----T-AAT-TCA--AA--TAA-GAA----A--A-T---C----A--AACTTTAC-GACA-AAATA--Ataacagggccattttgaggcagttcgt
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TTTTTATTTGACTTTATGAAAGACATGACTTATAAATATAATATAAAATATATGACTAAAATTTAAAAAGAAATATCTTCTTTTTTTTTGAATATTTTTATAAACTTGTTT
Unaligned ( gi|34 ): GTTAATGTTATTTTATAACACTAGACTTTAAACCACTGAATAAGAAAAGATTTGATTAATTGATTGGACTTTTAGCATCACTTT
Unaligned ( gi|35 ): ATGTATGTGTTCTTTACAATTCCCTGGTCTATAATTAGTAAATTGTTAGTACTAACTGGTTCATAATGAATTTTTTTT
Unaligned ( gi|36 ): TCTTGTAATCTATACAAACACTACAATTTCGAAACATGTTAAAGATTGAAAACGTATTGCCTAGTTTAGGATAGT
Unaligned ( gi|39 ): CGTCAATTTTAATGAAATAGAAATATTAGATAAAATTTAAACTCCAAA
Unaligned ( gi|40 ): GTTATTGCTAACGATATGTCATAATGGAATAGGATCGAA
Alignments
lowQualScore : 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222 11111111111 11111111111 1111111 222222222222222222 2222222222 44444444444 111111
lowQualScore : 1 0 0 3333 22 1 22 1 1 22 1 1 333 3333 22 222 444 3333 8 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 1 555 55 0 44444 22 222 5 555555 0 5 1 3 5 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 444 4 2 555555555 55 666 22 77 2 2 4444 22 333 0 1 2 99999999999 666 2 4444 2 1 555 333 1 333 1 3333 2 1 22 1 1 22 22 11111111111 1 1 555555 0 2 1 44444 44 44444 33 2 22 6666 22 2 5555555 4 99999 555 333 2 9999999 2 77777 2 2 0 22 33 2 111111111111111111 33 88 2 4444444444 2 6666 1 77777 99999999999 333333 2 0
lowQualScore : . . . .... .. . .. . . .. . . ... .... .. ... ... .... . .................................................... . . ... .. . ..... .. ... . ...... . . . . . . .................................................... ... . . ......... .. ... .. .. . . .... .. ... . . . ........... ... . .... . . ... ... . ... . .... . . .. . . .. .. ........... . . ...... . . . ..... .. ..... .. . .. .... .. . ....... . ..... ... ... . ....... . ..... . . . .. .. . .................. .. .. . .......... . .... . ..... ........... ...... . .
lowQualScore : 2 1 4 5555 33 7 33 7 7 33 7 7 000 5555 33 999 666 5555 3 1111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 7 777 11 4 22222 33 999 5 222222 9 5 8 6 5 7 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 666 2 1 888888888 00 666 99 55 2 1 5555 99 777 5 3 2 99999999999 111 1 2222 0 9 222 333 8 222 8 9999 3 7 44 7 7 33 33 66666666666 7 7 000000 1 5 9 88888 55 88888 33 0 88 7777 88 0 1111111 0 88888 333 777 1 7777777 1 44444 1 1 1 99 11 2 555555555555555555 22 44 5 3333333333 9 1111 2 77777 00000000000 999999 5 7
consensus : NAAAGGACCAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--AT--------T-T-T-----ATT---T--TTTAATTTT-ATG--TTTTT-TCTATTCATAGAA-----T--GA---CTCCAAAGACGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGCTCAT---------------T-----T--CC-CCG------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--NG-CATTTAAAT-A---------TT--T---T--TT--AT-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATTGTCTGGTACACTCTGAGTAATAT-GTGTAAATAT-ATTGCCTTGTGGCAA---GA-GTG----CCTTCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACNTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTGTA------C---AT-GT-A------CACTTTAATGGT-AT-----T--GT-----ATTAAGCGAAAAA-CGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-A---T-A-AG-TA-----T-AAT-TAA--AA--TAA-AAA----A--A-C-A-C----A--AATTTTGC-NAAA-AAATA--AAAT---G-TTTAATTTTA----TTGCATTATA-----CA--------T--TGGGGC-----TTGTAGTGAACGTCGT
Reference ( family-164 ) : NAAAGGACCAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--AT--------T-T-T-----ATT---T--TTTAATTTT-ATG--TTTTT-TCTATTCATAGAA-----T--GA---CTCCAAAGACGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGCTCAT---------------T-----T--CC-CCG------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--NG-CATTTAAAT-A---------TT--T---T--TT--AT-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATTGTCTGGTACACTCTGAGTAATAT-GTGTAAATAT-ATTGCCTTGTGGCAA---GA-GTG----CCTTCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACNTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTGTA------C---AT-GT-A------CACTTTAATGGT-AT-----T--GT-----ATTAAGCGAAAAA-CGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-A---T-A-AG-TA-----T-AAT-TAA--AA--TAA-AAA----A--A-C-A-C----A--AATTTTGC-NAAA-AAATA--AAAT---G-TTTAATTTTA----TTGCATTATA-----CA--------T--TGGGGC-----TTGTAGTGAACGTCGT
gi|1 : GAACTAGGTTCACGACGCCCCAATATTGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TATTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGTT---TTGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---CATTATT-T-T----TTTAAAA-----T-A--------TGGAC--AT--------T-T-T-----GTC---T--TTATGTTTT-ATG---TTTT-TCTATTCATAGAA-----T--AA---CCCCTAAGACAATTAGAATTAA------A-G-A-A-AA-TGCGCAT---------------T-----T--CC-CCC------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--TA-CATTTAGAT-A---------TT--T---TTCTT--AC-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAA----TAAG--ACATTTATACTG---ATAATTGTCTATAACATTCATAGTAATAT-GTATAA--AT-ATTGCCTTGTGGCA---------------------------A---AAAC---CCTGAT-AT---ATT-T----ACCTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGTA--AAGCTTCATATTTCTACTGTT------T---AT-AT-A------CACT---------------------------TTAAGCGAAAAA-GGT-CAAA--TTAAA-AAAAATAAA--AT-TTA-C-----AT-TTG-----ATAAA-T-G---A-A---T-AGAT-TA-----T-AAT-TAA--
gi|1 : A-GTG----CCTTCATT-GT-TAT--AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACCTA-AATT--G-TCTTAA-T-TG--TAGTA--AAATAGCATATTTATATTGT------------T--T-A------TATTT--ATA-T-AT-----T--TT-----ATTAAGCGAAAT--TGT-CAAA--TT--A-AAAAATAAA--AT-TTA-C-----AT-TT--------------G---A-------------------------TAA--AA--TAA-TAA----A--A-T-A-G----A--AATATTGC-AAAG-AAAT----AAT---G-TTTTATTTTA----TGACATTCTA-----CA------------GGGCC-----TTGTgtgccttcattgttataaaccatgatatatttacctaaattgtcttaattgtagtaaaatagcatatttatattgtttatatttatatattttattaagcgaaattgtcaaattaaaaaataaaatttacatttgataaaataataaaatagaaatattgcaaagaaataatgttttattttatgacattctacagggccttgtttgggtgtttgtgaagcccgtcctt
gi|10 : gaactaggttcacgacgccccaatattggccctgtaaaatgcatttattttaaatacttatttttcagcaaagttttgtgtatttgtattaaatatacattatttttttaaaatatggacattttgtctttatgttttatgtttttctattcatagaataacccctaagacaattagaattaaagaaaatgcgcatttcccccaattttgtcctattttttacatttagatatttttcttactatgaaggcattcttgccacaataagacatttatactgataattgtctataacattcatagtaatatgtataaatattgccttgtggcaaaaaccctgatatatttacctaaaatggcttaaaatgtagtaaagcttcatatttctactgtttatatacactttaagcgaaaaaggtcaaattaaaaaaaataaaatttacatttgataaatgaatagattataattaAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TAT---TTT-T--T-CAAGCAAAGAT---TGGTGTGTTTGGATTCA----A--TATA---CGCCATT-C-T----TTA-AAA-----T-G--------TG--T--ATA-------T-T-TCGCTGATT---TTATCTGATTTT-ATG---TTTT-TCTATTCATAGAA-----T--GA---TTCAAAttgggtgtttgtgaagcccgtcctt
gi|10 : ATTCAAAT-AGT-------TT--T---T--TTG-AT-TATAAAG-ACATTCTTGCTACAC----AAAG--CTATTTGTTCTG---ATCATTGTCTGGCACACTCTAAGTAATAT-GTTTGA--AT-AGTGCCTGGGAGCAAACTGC-GTA----TCTTTGCT-GTACATGTACAC---TTTGATGAT---ATTGT----ATT---AAGT--G-A---AA-AACG--T---A--AAATTGtagtttttttgattataaagacattcttgctacacaaagctatttgttctgatcattgtctggcacactctaagtaatatgtttgaatagtgcctgggagcaaactgcgtatctttgctgtacatgtacactttgatgatattgtattaagtgaaaaacgtaaaattgaaaaacaaaatttacatttttaaaatgaacaaagtattatttaagttaacaaattatacaattttgcagaaaaaatagggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|10 : aatatcggccctgtaaaatgcatttcttttaaatattttttcaagcaaagattggtgtgtttggattcaatatacgccattctttaaaatgtgtatatttcgctgattttatctgattttatgtttttctattcatagaatgTC-T----AAGTA-ATAT--G-TTTGAATAGTGCCTGGGAGCAAACTGCGTATCTTTGCTGTA------C---AT-GT-A------CACTTTGATGAT-AT-----T--GT-----ATTAAGTGAAAAA-CGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TAAAA-T-G---A-A---CAA-AG-TAT----T-ATT-TAA--GT--TAA-CAA----ATTA-T-A-C-------AATTTTGCAGAAA-AAATA--aaaaacaaaatttacatttttaaaatgaacaaagtattatttaagttaacaaattatacaattttgcagaaaaaatagggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|11 : aatatcggccctgtaaaatgcatttcttttaaatattttttcaagcaaagattggtgtgtttggattcaatatacgccattctttaaaatgtgtatatttcgctgattttatctgattttatgtttttctattcatagaatgattcaaatagtttttttgattataaagacattcttgctacacaaagctatttgttctgatcattgtctggcacacGGACAAGATTTACGAAGCCCCAATAATGGCCCTGTAA----A--AC-CAAT-TTTTTT--AA--TAA--ACTT-T--T-T-AGCCAAGCT---GGGTGTGTTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----GTA-AGA-----T-A--------TG--T--ATAG------T-T-C-----ATG---T--TTTAATTTC-ATGTTTTTTT-TCTATTGATAGAA-----T--GA---CGCCAAAGGCGGTTAAAATA-A------A-GTA-A-AA-TGCCCAT---------------A-----TCGCC-CTT------------A--A--T-TTgggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|11 : t----CCTTAATTTGT-TA---AATC---TATGAT-AT---ATT-T----ACACA-AACT--G-GCTTAA-AATG--TGGGA--AAATTGCATATTATCGCTGTG------C---AT-GT-A------CACTTTAATGGT-AT-----C--GT-----AATAAGCCAAAAA-AGT-AAAA--TT--G-AAATGCAAA--AT-ATA-T-----ATATTT-----TTAAA-T-G---A-G---T-ATAG-AA-----T-AAT-T-----A--TAA-AAA----A--A-CAA-CCATAA--AATGTGGC-CAAA-AATTA--AGA------TTTAATTTTA----TTGCAATAGA-----CAAGAACATTT--TGGGG------GTGCA-TGAACATCGgttaaatctatgatatatttacacaaactggcttaaaatgtgggaaaattgcatattatcgctgtgcatgtacactttaatggtatcgtaataagccaaaaaagtaaaattgaaatgcaaaatatatatatttttaaatgagtatagaataattataaaaaaacaaccataaaatgtggccaaaaattaagatttaattttattgcaatagacaagaacattttgggggtgcatgaacatcg
gi|12 : tggacaagatttacgaagccccaataatggccctgtaaaaccaatttttttaataaactttttagccaagctgggtgtgtttgtattaaatataatttattctgtaagatatgtatagttcatgttttaatttcatgttttttttctattgatagaatgacgccaaaggcggttaaaataaagtaaaatgcccatatcgcGGTCCACGAAACCTCTATATCGGCCCTGTTA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAAATACTTATGT-T--T-C-AGCAAAGTG---TAGTGTGTTTGTATCAA----A--TATA---CTTTATT-C-T----TTA-AAAATAGGT-A--------TA--TA-AT--------TAT-T-----ATTACAT--ATTAATTTT-ATG---TGTT-TCTATTTATAGAA-----T--GA---CTCAAAAGA-GGTTAATGTT-A------AGG-A-A-AA-TG-TC--------------------------------------------A--A--TGTTTGTTCTATTTTT--TG-TA-TTAAAT-A---------TT--TTACT--TT--AT-TTTTAAG-GCATTCTTGCTACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---A----------------TCTGAGTTATAT-GTGT-----T-ATTGTCTGATAGCAA---GA-GTA----CATTCACT-GT-TA---AAAT---CATGAC-AT---ATT-T------------------GCTTAA-AATG--GAGGA--AATTTTCATATTGTCACTGTAATT---A---AT-GT-G------CACTTTGATGATAATACATGT--AT-----ATTAAGCAAAAA
gi|13 : gTCACGACGCCCAAAAAATGGCCCTGTAA----G--ATGCTTT-CCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTTTTAA----A--TGT----ATTT-TT-T-T----TTT-GA--------------------------------------------------T--TTTAAATTC-ATA---TTTT-TCTATTCACAGAA-----T--GT---CTCCAAATACGGTTAAAAAT-A------AGG-A-A-AA-TGTTAAT---------------T-----T------CG------------A---------TGTTC-AT-------G-TATGTAAAC-A---------TT--T---T--gttta
gi|13 : aac-AAATACG-GTTAAA-AATA---AGGA--AAAT-GT-TAATTTCGATGTT------C---AT-GT-ATGTAAACATTTTAATGGT-AT-----T--TT-----ATTGAGCGAAAAA-TGT-AAAA--TTC-T-AAGAAC---------TA----------TTTGA---TTAGA-A-T---A-A---TCA-AA-TA-----T-AAC-CAA--AATTTAA-AAA----A--A-A-ATC----A--AATTTTAC-CAAA-AAATT--GAG----G-TTTTATTTTA----TTGGATTAAA-----CAGGGTCATTT--TGGGGC-----aatggtattttattgagcgaaaaatgtaaaattctaagaactatttgattagaataatcaaatataaccaaaatttaaaaaaaaatcaaattttaccaaaaaattgaggttttattttattggattaaacagggtcattttggggcggtgtggggtgtcataagccactgctttccttt
gi|14 : aactcacgacgcccaaaaaatggccctgtaagatgctttccttttaaatacttatttttcagcaaagcttggtgtatttgttttaaatgtattttttttttgattttaaattcatatttttctattcacagaatgtctccTTTT--GG-CATTTAAAT-A---------TT--T---T--TTTTAT-TATGAAA-GTATTCTTGCTTCAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATAATTGCCTGGTACACTCTAAGTAGTTT-GTGTA--TAT-ATTGCCTTGTGGCAAC--AA-GTG----CCTTCACT-AT-TA---AAAC---CATGAT-AT---GTT-TCAATACCTA-AAAT--G-GGTTAA-AATG--TAGGA--AAATTGCATATATTCGCTGTT------T---AT-GT-T------CTCTTTAATGAT-AT-----T--GT-----ATTAAGCAAAAAA-TGT-CAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-T-----AT-TTTATATATTAAATATG---A-A---T-ATTG-TA-----T-AAC-CAA--AA--TAA-AAA-----------A-T----A--AATCTT-C-TTAA-AAAT----AAT---G-TTTGATTATAATATTTGCATTATA-----CA--------ggtgtggggtgtcataagccactgctttccttt
gi|15 : GGTTTACAAAGCCCCAATATCTGCCCTGGAA----A--ATGCATT--ATTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGTT---TTGTTTGTTTGTTTCAA----A--TATACTCATTTCTT-T-TAAAATAT-AAA-----T-G--------TA--T--AT--------T-T-C-----ATC---T--TTTAAAAGT-AAG--TTTGT-TCTGTTCGTAGAA-----T--GA---CTCCAGAGA-GAGTAAGATT-A------AGG-A-A-AA-TGCTCAT---------------------------------------------------------TATTTTT--GG------------------------------------AT-GATGAAG-GCATTCTTGCCACAC-----ATG--ATATTTATTCTG---ATCAGTGTCTGGTACACTCTGAGTAATAT-GCGTAA--AT-ATTGTCTTGTGATAT---AT-TTG----CC----------TA---AA------ATG-----------------GCTTA-ACAT--G----TAG-AA-----AAAA--AAAGT---TTTTTTAGCTGTA------G---AT-GT-A------TTCTTGAATGgggtcatttttgggaatagtaaa
gi|16 : AGAA-----T--AA---CTCCAAAGACGGCTAAAATT-A------A-G-A-ACAA-TGCTCAT---------------T-----T--TCACCC------------A--A--T-GTTGTTTTATGTTT--AGGCACTCAAAT-----------------------------------------TCTTTCTACAC----A-------------TCTG---ATCAGTGTCTGGGGCATTCTGAGTAATAT-AT----------TTG----GTAGCAA---AA--TC----CCTTCACT-GT-CA---AAACAGGTATGAT-AT---ATT-T----ACATA-AAAT--GTGTCTTA-AATC--TACGA--AAATTGCATAATTTCACTCTT------C---AT-GT-A------CACTTCAATGAT-AT-----T--GT-----ATTAATCG-GAAA-CGT-TAAC--TT--T-TAAAACAAA--GT-TTA-C-----AT-TTT-----T---A-A-G-----A---T-A-AT-T------T--AT-TAAATAA--TAA-A
gi|17 : aAAAGGACTAGGTTCATGAAAC-----------CCC---------A--AT---------------AA-TATTTATTT-TTTT-C-AGCAAAGCC---TGGTGTATTTGTATCAT----A--TATG---ATTTATT-C-T----TTTAAAA-----T-A--------TG--TTGAT--------T-T-gggctattttggggaagggggcgggggggggggg
gi|17 : A----A--TAAT---ATTTATT-T-T----TTT-CAG-----C-AAAGCCTGGTG--T--AT--------T-TGT-----A---------TCA--TAT-ATGA-TTTAT-TCT-TT--TAAAATATGTT--GATTTCTCCAAAGACAGTTAAAATT-A------A-A-A-T-AA-TGCTTAT---------------T-----T--CC-CTC------------A--T--C-TTAAACATATTTTTGCGG-CATTTAAAT-A---------TG--T---T--TTA-AA-TAAGAAG-GCATTCTTGCTACAC----AGCT--ATGTTTACTCTG---ATCATTGTCTAGTTCACCCTAAGTAATAT-GTGTAAATAT-TTTA--TTGTGGAAA---GA-GTGCCTTCCTTCCCT-TT-TA---AAAC---CATGGT-AT---Actccaaagacagttaaaattaaaataatgcttatttccctcatcttaaacatatttttgcggcatttaaatatgttttaaataagaaggcattcttgctacacagctatgtttactctgatcattgtctagttcaccctaagtaatatgtgtaaatattttattgtggaaagagtgccttccttcccttttaaaaccatggtata
gi|18 : aaaggactaggttcatgaaaccccATAAAA-GCATTCTTGTGACAC----AGAG--ATATTTATTTCG---ATAATTGTCTAGTACACTCTGTGTAATAT-GTGTAACTGT-ATT--CATGTAAC-A---GA-CTG----CGTTCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-TT---ATA-T----ACAT--AACT--G-GCATAA-AATG--TAGAA--AAATTGCATATT-------------------AT-TT-----------TTCAAAAGA-AC-----CAAGT-----ATAAAAGAAAAAA-CAT-AAAATTTT--GCAAAAATTTA--ATGTTT-C-----AT-TTTA----TTA
gi|19 : taAT-GTGTAAATGT-TTT--CTTCTGAAAA---GA-GTG----CCCTCACT-GT-TA---AAAC---CAC---------ATT-T----ATATA-AAAT--G-ACTTAA-AATG--TAAGA--AATTTGCATATCTTCGCTATA------C---AT-AT-A------CACTTTATTGGT-AT-----C--GT-----ATTAAGCGCAAAA-TGA-AAAA--TA--G-AAAAACAAA--AT-ATA-T-----A--TTT-----TTAAA-A-G---A-AT--T-A-AG-TA-----C-AAT-TGA--AT--TAA-AAAATATA--G-T-A-C----A--AATctttaaacggggtcattttttgaggtggggtggtgggggaggtgtttcacgaacgttgttctt
gi|2 : tatttgtttgcacataaaacaaagatattagAAAGGACTAAGTCCACGAAGCACAAATATCGGTCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TGCTTATTT-T--T-C-AGCAAAGTT---ATGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---CTTTATT-A-T----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--TT--------T-T-T------TT---T--TTTAATTTT-ATG--TTTTT-TCTATTCACAAAA-----T--GA---CCCCAAAGATGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGCTCAT---------------T-----T--TT-CTG------------A--A--T-TGTGTCCT-TTTTT--TT-TATTTAAAT-A---------TT--T---T--TT--AT-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAG--ATAATTAATCTG---ATAAATGTCTGGTACATTTTTAGTAATAT-GTGTAAATAT-ATTGCCTTGTGGCAA---GA-GTG----CCTCCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACCTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGGG--AAATTGCATATTTTCGCCGTT------T---AT-GT-A------CTCTTTAATGTT-AT-----T--GT-----ATTTAGCGAAAAT-TAT-AAAA--TT----AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AG-TTT-----TTGAA-A-G---A-A---T---AG-TA-----T-AAT-TAA--AA--TAA-AAA----A--AGC-A-C----ATCAACTTTGC-AAAA-AAACA--AAAT---G-TTTAATTTAA----TTGCATTATG-----CA--------T--TGGAGC-----TTATAGTGAACGTAGTacatgacatatcaaataccagaatcaatatgaacatgtcagtgtttttt
gi|20 : tTA--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTGCA------C---AG-GT-A------TACTT
gi|20 : AT-ATGCAATT-T----TCCTATAAAT--G-GCTTGA-AGTG--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTGCA------C---AT-GT-A------CACTTTAATGGT-AT-----T--GT-----TTTAAGCGATAAA-TGT-AAAC--TT--G-AAAAGCAAAACAT-ATA-T-----AT-TTT-----TTAGA-A-G---A-A---TAA-AG-TA-----T--AT-T-A--AA--TAA-ATT----C--A---A-T----A--AATTTTGA-AAAA-AAA-A--ATAC---G-TTTGA-TTTA----TTACA--ATA-----AA--------C--TGGGaatggcttgaagtgtaggaaaattgcatattttcgctgcacatgtacactttaatggtattgttttaagcgataaatgtaaacttgaaaagcaaaacatatatattttttagaagaataaagtatattaaataaattcaataaattttgaaaaaaaaaatacgtttgatttattacaataaactgggcactttatataatatatttttttcggggagcggtgtgggggtcgggaacatcgtc
gi|21 : aagtatacctgtgcagcgaaaGATCAGGTTCACGGAGCCC-AATGGTGGCCCTCTAA----A--ATGCATT-TCTATT--AAA-TACTTATTTCT--T-T-AGCAAAGCT---TGATGTAACTGTATT-A----A--TATA---ATTTATT-CTT----TTT-AAA-----G-A--------CA--T--A-------------T-----A--------TTTAACTAA-ATG---TTTT-TATATTAATTAAA-----T--GA---CTCCAATAATGGTTAAATTG-G------A-G-G-A-------TCCC---------------T-----C--CC-CCG------------------------------TTTT--TG----TCGAAT-A---------TTTGT---T--TT--AT-TATGAAG-GCATCCTTGCCATAC----AGAG--ATATTTATTCTA---ATCATcactttatataatatatttttttcggggagcggtgtgggggtcgggaacatcgtc
gi|22 : GGATCAGGTTCACGAAGCCCCGATATCGGCTCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTA--AAA-CATTTATTT-T--T-T-AGCAAAGCTGGATGATGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATCTATT-A-T----TTT-AAA-----TAA--------TG--T---T--------G-A-T-----ATC---T-------TTTT-ATGT-TTTTT-TCGATCCATATAA-----T--TA---CTCATAAAACGATTGAAATG-A------A-G-AGA-GA-TGCTCAT---------------T-----T--TC-
gi|23 : AGGACCAGGTTCACGAAGACG-AA------------AA----A--ATGCATA-TATTTA--AAA-TTGTTATTT-T--T-C-AGCGAAATT---TGATGTATTTGTA-TAA----A--TATG---ATTTATT-C-T----TTTGAAA-----T-G--------TG--T--A-------------T-----A--------TTTAATATT-ACG---TATT-TCTATTCATTGAA-----T--GA---CTCCAAAGACTGTTTAAATTAA------A-G-A-A-AA-AGCTCAT---------------TTCCCCT--CC-CCA------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--CA-CCTTTAAAT-AGTTG-----TT--T---T--TT--AT-TGTGAAG-GCATttatgcttattacctttctaacctgatttttttaacatagaaga
gi|24 : cAAGGACCAGGTTCACAAAGCCCCAATA-----CCTGTAA----A--ATGTATT-TCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGT---------TATT-------A----A--TATC---ATTT----------------AA-----T-A--------T---T--AT--------G-T-T-------------------------TG--TTTTTCTCCATTCATATAG-----T--AA---CTCCAAAGACGGTTAAAATT-A------A-GTA-T-AA-TGCTCAT---------------T-----TG-TT-GTG------------A--AATT-TTTGTCTT
gi|25 : -TA---AAAC---CTTGAT-AT---ACT-T----ACATA-AA-T--A-GCTTAA-CACG--TAG----------CAT-TTTATGCTGTA------C---AT-TTAA------CAC--GAGTGGT-CT-----T--GC-----ATAAGGCGGGAAA-TGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--A----A-CAAAAAATATTT-----CTAAA-A-T---A-A---TCA-AA-TA-----T-AAT-TAA--AA--TGA-AAA----T--A-T-------------TTTTTT-TATC-AAATATTTAAG---G-CTAAATGTTA----ATGCATTAAA-----CA-------------GGGC-----Tttgtcaaattagaaaaaaaacaatctaaatctgaataatttatttatgaaaat
gi|26 : TGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---A-CAT-AT----TAAACGCTGAGTAATAT-GTGTAAATAT---TCTCTTGTGACAA---GA-GTG----CCTTCACT-----------AC---CAAGAT-AT---ATT-T----ACA-A-AAAT--G-GCTTAA-ATTG--TA-----------TATATT------GTA------C---AT-GT-A------CACTTTCATGGT-AT-----T--GT-----ATTAAGCat
gi|27 : aattgttacattagaatattctataaacacctttactgttacacaCAATATCGGCACTGCAA----A--ATGCTTT-TTTTTTTTCAA-GACTAATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTT-AAA-----A-AGAAG----TG--T--AT--------T-T-C-----ATT---T--TTCAATTTC-ATA---TTGT-TCTTTTAATATAA-----T--GA---CTTCAAAGACGATTAAAATT-A------AGG-A-A-AA-AGCTCATG--------------G-----C--CC-CCA------------A--A--A-GTTGTCCTA
gi|28 : AAAGGCTCAGGTTCACAAAGTCCCGATATCAGTCCTGTAA----A--ATGCATT-TCATTC--CAA-TATTTATTC-A--T-C-GGCAAATGT---TG--GTATTTGTACTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTTAAAA-----T-A--------TG--T--A-------------------------------AATATT-ATC--ATTT--------------A-----T--GA---CTCCAAAAGCGGTTAAAATT-A------A-G-G-A-AATTGCTC--------------------------------------------A--A--T-GTTGTCCTATGTTT--CG-CATTTA
gi|29 : --T--AA--------T-T-T-----ATT---T--TA-AATATC-ATG--TGTTT-CTTAT-CACAGAA-----T--GA---TTCCAAATACGATTGAAATT-A------AAG-A-A-AA-TGCTC--------------------------CC-CCA--------------------------CCACATTC--AG-CATATAAAT-AG--------TT--T---T--TT--AT-TATGAAC-GCATTCCTGCCACGC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATTGTTTAGT-CGCTCTGAGTAATAT-GAGT
gi|3 : GACCAGGTTCACAAAGTCCCAATATCGGCTTTGTAATACCAGTATGCATTATTTTTT--CAA-TACTAATTT-T--T-C-ACCAAAGCT---TGATATGTTTGTATCAA----AGATACA---A---A--------------GAA-----T-A--------TG--T--A-------------------ATT---T--TCTA-------TG--TTTTT--CTATTTATAGAA-----T--GA---CTTCAAAG-CGGGTAAAATT-A------AAG-A-A-AA-TGATCATAAACCTCCCCCCCCCC-----C--CC-CCA------------C--A--C-A----CCCATTTTT--GG-CATTTAAAT-AAAAAAAAAAT--------------AT-TATGGAG-GCATTCTTGATACAC----AAAGCGAT-TTTATTCTG---ATCATTGT-----------------A-AT-GTGTAAATAT---TGTCTGGTAGCAA---AAAGTA----CCTCCACT-GT-TA---AAAA---CATGAC-AT---ATT-T----ACCTA-AAAT--G--------------TAGGA--GAATTTCATACTTTCTCAGTA------TTTTATTGT-A------TG-TTTGATGAT-AT-----TT-ATTTTTGATTAAGCAAACAG-CAC-AAAA--TT--G-AACAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTC-----TTAAA-ATN---N-N---N-N-NN-NN-----N-NNN-NNN--NN--NNN-NNN----N--N-N-N-N----N--NNNTTTGC---AA-AAAT---CCAT---C-TTTAATCTTA----TTAAATTGTA-----C
gi|30 : AAAGGACAAGATTCATGAAACCCTGATATCAGCCCTGTAA----A--ATGTATT-TCTTTT--AAA-TAGTTAGTT-T--T-T-AGCAAAGCT---TAGTGTTTTTCAACTAAATTTA--TATA---ATTTATTGC-A----TTA-AAA-----A-A--------TG--T--ATGC------T-T-T-----ATT---T--TTTAATTTA-ATG---TTTT-TCTATTT-----------T--GA---CTCCAAAGAcgggccatttttgggcgtttgtgaa
gi|31 : GAAAAA-CGT-AACA--TT--G-AAAAACACA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TT------T---A-A---T---AG-CA-----TCGAT-TTA--AA--TAA-AAA----A--A-A-T-C----A--AATTTAGC-ACAA-AAACA--AG-----G-TTTAATTTTA----CTGTATTACA-----CA-------------GGGCTATCTTTGTAGt
gi|32 : tACTACGTTCATGAAGCCCCAATAACGGCCCTGTAA----A--ATGC-TT-TGATTA--AAT-TACTTAGTC-A--T-C-AATAAAGCT---TGGTGTCCTTGTATTAA----G--TATA---ATTTTTT-C-T----TTTAAAA-----T-A--------TA--C--ATAA------T-T-C-----ATA---A--TTTAAgttcaagaacctcg
gi|37 : GGACTAGGTTCATGAACCCCCA
gi|38 : tgcttgttgctgttgttttattttttttgtgggggtgAGGGGCTAGGTTTACGAGGCCCCAATAATGGCCCTG------------------TCTTTC--CAA-TAC----TT-T--T-C-AG
gi|4 : AGGACAAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCTCTGTCA----A--ATGCATT-TCTTTC--AAT-AACGTATTT-G--T-T-AGCAAATAT---ACGTGTAATTGTATTAA----A--TATA---CTTTATT-C-T----TTT-AAAA----T-A--------TG--T--------------------------------------TT-ACG--TTTTT--CTATTTAAAGAA-----T--AC---CTCAAAAGACGGTTAAACTT-A------A-GGA-A-AA-TGATAAT---------------T-----T--CC-CCC------------A--A--A-ATTGTCCTATTTTT--GG-CACTTAAAT-AGTC------TT--T---T--TG--AT-TATGAAAAGCATTCTTAATACAC----AAAT--ATATTTATTCTG---ATAAGTGCCTGGTACACTTTAAGTAATAT-GTGTA-------TTGTCTTGGGCCAA---GA-GTG----CCGTCACT-GC-TA---AAAC---TATGAT-GT---AAT-T----ATCTA-AAAT--G-GCT-AA-AAT------------ATTACATATTTTCGATATT------C---AT-GT-A------CACTTTAATGAT-AT-----T--GT-----TTTAAGCGAAAAA-TGT-AAAT--AT--G-AAAAACAAA--GC-TAA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-A---TAA-AG-CA-----T-AAT-TAA--AA--TAA-AAA----A--C-T-A-C----A--ACTTTTGC-AAAACAAATA--CG-----G-TTTGATTTTA----TTGAATTATA-----TAGGGTAATTT--TAGGGG-----T--TCGTGAACATCGTtc
gi|5 : GACTAGGTTCATGAAGCCCCAGTGTGGGCCATGCAA----A--ATGCATT-TCAA----AAA-CACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---CTTCATC-CTT----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--GTACTGGTAAT-T-T-----ATT---T--GTTAATTTT-ATG--TTTTT-T-TATTCATAGGG-----T--GA---CTCCAAAGATGGCTAAAATTAA------A-G-A-T-TA-TGCTCAT---------------T-----T--TT-CCA------------A--A--T-TGTGTCCTATTTTT--TGACATTTAAAA-AG--------TT--T---T--TT--GGATAAGAAG-GCATTTTTGCTACAC----AAAT--ATATTTATTCTGTAAAT--TTGTCTAGTc
gi|5 : TGTAAAT----TTGTCTAGTGGTAA---TA-GTG----CTTTCACT-GT-TG---AACA---CGTGAT-AT----TT-T----ATCTA-AAAT--G-GTTCAA-AATA--TAAGA--AAAATGCATATTGTCACTTTAAAATAAT---AT-GT-G------CACTTTCATGGT-AT-----T--GT-----TTTAAGCACAAAA-TGT-AAAA--AT--A-CAAAACAAA--AT-TGA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-G---TAA-AG-TA-----T-AAT-AAA--AT--TAAGAAA----A--A-C-ATC----A--AATTTTGC-AGAA-AA--A--AAATAGGG-ATTAATTTTA----TTGAA-TGTA-----CA--------T--ggtaatagtgctttcactgttgaacacgtgatattttatctaaaatggttcaaaatataagaaaaatgcatattgtcactttaaaataatatgtgcactttcatggtattgttttaagcacaaaatgtaaaaatacaaaacaaaattgacattttttaaaagagtaaagtataataaaattaagaaaaacatcaaattttgcagaaaaaaaatagggattaattttattgaatgtacatgtacagggtcattttag
gi|6 : gactaggttcatgaagccccagtgtgggccatgcaaaatgcatttcaaaaacacttatttttcagcaaagcttggtgtatttgtattaaatatacttcatcctttttaaatatgtgtactggtaatttatttgttaattttatgtttttttattcatagggtgactccaaagatggctaaaattaaagattatgctcatttttccaaattgtgtcctattttttgacatttaaaaagttttttggataagaaggcatttttgctacacaaatatatttattcAGGGACAAGGTTCAAGAAGGCCCAATATTGGCCCTTTAA----A--ATGCATT-TTCTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAATCT---TGGTGTGTTTGTAATAA----A--TATA---AATTATT-C-T----TTT-AAAATA--T-A--------TT--T--AT--------T-T-T-----ATT---T--TTCAATTTT-ATG--TTTTT--CTATTCATAGAA-----TAAGA---CTCCAAAGACAGTTAAAAAA-A------A-G-A-A-AAATGCTCAT---------------T-----T--CC-C-----------------A--C-CCC--CCTTTTTTA--AG-CATTTAAATTG---------TT--T---T--TT--AT-TATGGAG-GCATTTTAGCCTGAC----AAAG--ATAGTATTTCTG---ATCATTGTTCAGTACACTTTGAGTATAATGGTGTAAATAT-TTT--CTTGTGACAA---GA-GTG----TATACATT-GT-TA---AAA----CATGAT-AT---ATT-C----ACATA-AAAT--G-TCTTCA-AATG--TAGGT--AACTTGCATATGTTCCCTGTA------A---AT-GT-A------------AA-----AT-----T----------------GAAAAA-C------------------AAC--A--AT-TTA-T-----AT-TTT-----TTAAA-A-GTATA-AAGTT-A-AG-TATACCGT-AAT-TAA--AA--T-G-AAA----A--A-C-A-TA---A--AATTTTGC-CCCA-ATATA--AG-----G-TATAATTTTG----TTGCATTAAACTGACCA--------TTATGGGGT-----TTgtacagggtcattttag
gi|7 : GGACCAGGTTCACGAAGCCCAAATATCGACCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TATTTATTT-T--T-C-AACAAAGCT---TGTTGTATTTGTATTAA----G--TATA---ATTGACT-T-T----TTA-AAA-----T-A--------TG--T--ATAT------T-T-T-----ATT---T--TTTAACTTTCATG--TTTTT---------------------------CTCCAAAAACTGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AAATGCTC--------------------------CC-CCC------------ACCA--A-TTTGTCATATTTTC--AG-CATCTAAAT-A---------GTG-T---T--TT--AT-TATGAAA-ACATTCTTTCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATGGTCTGGTATACTCTGAGTAATAC-GTGTAAATAT-TTT--CTTGTGGCAA---GA-ATG----CCTTCACT-GA-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----CCATG-AAAT--G-GCTCAA-ATTG--TAGGA--AAATTGCATATTTTTCCTGCA------C---AT-TT-A------CACTTACATGAT-AT-----T--AC-----ATTGA--GAAAAA-TGT-ACAA--TT--G-AGAAACAAA--AT-TTA-T-----AT-TTT-----TAAAA-A-T---A-A---T-A-AATTA-----T-AAT-TAT--AA--TAA-AAA----A--A-C-A-TA---A--AATTTTGC-AAAA-CATT----AAT---G-TTAAATGTCA----TTGCATTACA-----TA--------catgaac
gi|8 : aatggttcTCGACCTTGTAA----A--ATACATT-T----T--AAA-AACTC-TTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTAT-AA----A--TATA---ATT-ATT---------------------------------------T--------T-T-T-----ATT---T--TT-AATTTC-AT---TTTTA-TCTATTCATAGAA-----T--GA---CTCAAAATACGGTTGAAATT-ATATTAAG-G-A-A-AA-TGCTCAA---------------C-----C--CC-CTACCAGCCACACACA--A--T-TTTGTCCTATTTTT--CG-CATTTAAAA-AG--------TT--TAA-T--TT--AT-TATGAAG-ACATTCTTGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ACCATTGTTTAGTACACTCTGAGTAATAC-GTTCAACCATGATCAC---GTGG--A---AA-GTG----CCTTCACT-GT-TA---AA--------GAC-AT------------------AAAT--A-GCTTAA-TATG--TAGGA--AGACTGGATATTTTCGATGAA------C---AT-GT-A------CATTTTAATGGT-GT-----T--GT-----GTTAAGTGAAAAA-TGGAAAAA--AT--G-GAAAACAAA--AT-ATA-T-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---ACA---A-A-AG-TT-----T-AATATAA--AA--C---AAA----A--T-C-A-C----A--TTGTTTAC--AAA-AAATA--AAAA---GATTTAATCTTA----TTGCATT
gi|9 : GGACCAGGTTCGCGAAGCCCTAATTTCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCC-----AAA-AACTTTTTT-T--TTC-AGCAAAGCT---TGGCGTACCTGTATTAA----A--TACA---ATTTATT-C-T----TTT-AAAATATGT-A--------TA--T--AT--------T-T-T-----CAT---T--TTAAATTTT-ATG--CTTTT--CTATTCATATGA-----T--GA---TT----------TTAAAATT-A------G-G-G-GCAA-TGCTCGT---------------A-----T--CC-CTC------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--CG-TATTATAAT-A---------GT--T---T--TT--AT-TATGAAG-ACATTCTTACTACACTGACAAAA--CTATTTATTGTG---ATCACTGTCGAGTACACTCTGGGTAATAT-GTAT-------------TCATGGCAA---GA-TTG----CCTTCACT-AT-TA---AAAG---CGTGAT-GT---GTT-T----TCATA-AAAT--G-GCTTAA-CATG--TA--A--A-------------------A------C---AT-GT-A----------TTAA---------------GC-----AAAAAATGTAAAATCGA-AAAA------------ACAGA--AT-TTATC-----A--TTT-----TTGAA-T-G---A-A---TAA-AG-TA-----T-AAT-TCA--AA--TAA-GAA----A--A-T---C----A--AACTTTAC-GACA-AAATA--Ataacagggccattttgaggcagttcgt
blockSeqs : A TACC GT A TT A C TT T A GGA ATTT GA CTC CT AAAA A ATAGGTATATAATTATTATTACAT T C TTT CT TATGT AA TTT A TATTAA G T G C T A AAACCTCCCCCCCCCCCCCCCACACA GCG G T AAAAAAAAA TG TAC . TT A A TGAC CG TAA G G ACCATGATCAC ACT A CCTT T A TGT AGG G GCA G CAAT C T AC T T CC GC AAAATAAT T A TGTAAA A A ACATG AA TTTTG TC A TT CT AC G CAAAAA A ATATA TAT TAT C AGTTA T TACCG C A AT TT G AACAACCATA TC AG C AAAATAGG A ATAT G CTGAC AGAACATTT CTATCT G
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . GC . G TGTGTATATTTCGCTGATTTTA T . AT T . . . A . G T . C A A CCCCCTACCAGCCACACACAATTT T A . GTTG G AA . G . . . . . G . AATATATTGC C . . . . T . . . . . T . . . . . . AATTA . . . G . . T . T . . GC . . TC A GA AT . . CAA . T . . . . . ATATAGTAC . C . ATTTAAG . . A . GGGTCATTT C G
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . CT . A TATGTGTACTGGTAATTTATTT T . TT T . . . . . G G . . A A TTCCCCTCCCCAAATTT G . . GTC . . . A . . . . . G . AATATTTTA . . . . . . . . . . . G . . . . . . ATTTT . . . A . . . . C . . A . . C . A T . . TAT . . . . . . . ATTATAC . C . AAAAT . . T . GGGTAATTT C G
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . C . A CAAAGCCTGGTGTATTTGTA T . T T . . . . . G . . . . A TTGTTGTGAAATTTT G . . GT . . . . . . . . . G . AATAGTGC . . . . . . . . . . . A . . . . . . AC . . . G . . . . A . . G . . C . . T . . TCA . . . . . . . AAAATC . T . AATAC . . T . TTA C
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . C . . ATATGTATATATTTTCATT T . T T . . . . . A . . . . A ATCGCCCTTAATTT A . . G . . . . . . . . . A . TATATTGC . . . . . . . . . . . C . . . . . . GC . . . A . . . . T . . G . . T . . A . . TAT . . . . . . . AAGCAC . A . AAAAA . . T . T G
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . C . . AAGAAGTGTATTTCATTT C . T T . . . . . A . . . . A TTTCACCCAATGT T . . G . . . . . . . . . A . AATATTGT . . . . . . . . . . . T . . . . . . TC . . . A . . . . T . . G . . T . . A . . TTA . . . . . . . AACATC . A . AAGA . . A . C T
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . T . . ATATATTTATTTTATTT T . A T . . . . . . . . . . C GGCCCCCAAAAGT T . . G . . . . . . . . . G . ACTGTATT . . . . . . . . . . . A . . . . . . TT . . . G . . . . C . . T . . C . . A . . TAA . . . . . . . AACATA . T . TGAG . . T . T .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . T . . TATGTATAGTTCATGT T . T T . . . . . . . . . . A TTCCCTCATCTT C . . . . . . . . . . . . A . AATGTTTT . . . . . . . . . . . A . . . . . . AG . . . G . . . . C . . G . . C . . A . . TCA . . . . . . . AACATA . A . CCAT . . C . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . C . . AATGTATGCTTTATTT T . T T . . . . . . . . . . A TTTTCTGAATTG C . . . . . . . . . . . . G . AATATTCT . . . . . . . . . . . A . . . . . . TC . . . T . . . . T . . G . . T . . A . . TAA . . . . . . . NNNNN . A . AAT . . T . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . T . . TATACATAATTCATAA C . T T . . . . . . . . . . A TTCCCCCAAAAT A . . . . . . . . . . . . A . AATATTGT . . . . . . . . . . . C . . . . . . AC . . . G . . . . T . . G . . C . . A . . TAA . . . . . . . AAATC . A . AAG . . T .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . A . . TATGTATATTTTATTT T . T T . . . . . . . . . . A TTTTCCAAATTG G . . . . . . . . . . . . A . AATATTTT . . . . . . . . . . . C . . . . . . TT . . . G . . . . T . . G . . T . . A . . TAA . . . . . . . ACTAC . C . ACG . . A .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . A . . TGTATATTTCATCT T . T T . . . . . . . . . . A CCCCCACCAATT G . . . . . . . . . . . . G . AATATTTT . . . . . . . . . . . A . . . . . . AC . . . G . . . . T . . G . . C . . A . . TA . . . . . . . ATCAC . A . AAG . . C .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . C . . TAATGTTGATATCT T . T C . . . . . . . . . . A ATCCCTCAATTT T . . . . . . . . . . . . A . AATTTGT . . . . . . . . . . . A . . . . . . AC . . . A . . . . C . . G . . C . . A . . NN . . . . . . . CAAT . G . AAT . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . C . . TATGTTTTTTTTT T . T T . . . . . . . . . . A TTCCCACCC A . . . . . . . . . . . . A . TATTGT . . . . . . . . . . . C . . . . . . AC . . . A . . . . C . . A . . C . . A . . TA . . . . . . . AATC . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . C . . TATGTAATTT C . C T . . . . . . . . . . A TCCCCCG A . . . . . . . . . . . . . . TTGT . . . . . . . . . . . C . . . . . . AC . . . G . . . . T . . G . . C . . A . . AA . . . . . . . TAT . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . C . . TATTATGTT T . . T . . . . . . . . . . A AATGTT C . . . . . . . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . C . . . . . . TC . . . A . . . . T . . G . . T . . T . . T . . . . . . . AT .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . C . . GACATATA A . . . . . . . . . . . . . G TTCGA C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . AA . . . G . . . . C . . . . . T . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . C . . TGTGTATA . . . . . . . . . . . . . . . AATGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . AC . . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . TTTTATTT . . . . . . . . . . . . . . . CCCCA . . . . . . . . . A . . . . . . AC . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . TATGTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . ATATGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : T** ** G*** AACATC************ GATTT******
originalCons : NAAAGGACCAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--AT--------T-T-T-----ATT---T--TTTAATTTT-ATG--TTTTT-TCTATTCATAGAA-----T--GA---CTCCAAAGACGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGCTCAT---------------T-----T--CC-CCG------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--NG-CATTTAAAT-A---------TT--T---T--TT--AT-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATTGTCTGGTACACTCTGAGTAATAT-GTGTAAATAT-ATTGCCTTGTGGCAA---GA-GTG----CCTTCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACNTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTGTA------C---AT-GT-A------CACTTTAATGGT-AT-----T--GT-----ATTAAGCGAAAAA-CGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-A---T-A-AG-TA-----T-AAT-TAA--AA--TAA-AAA----A--A-C-A-C----A--AATTTTGC-NAAA-AAATA--AAAT---G-TTTAATTTTA----TTGCATTATA-----CA--------T--TGGGGC-----TTGTAGTGAACGTCGT
finalCons : NAAAGGACCAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--AT--------T-T-T-----ATT---T--TTTAATTTT-ATGT--TTTT-TCTATTCATAGAA-----T--GA---CTCCAAAGACGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGCTCAT---------------T-----T--CC-CCG------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--NG-CATTTAAAT-A---------TT--T---T--TT--AT-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATTGTCTGGTACACTCTGAGTAATAT-GTGTAAATAT-ATTGCCTTGTGGCAA---GA-GTG----CCTTCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACNTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTGTA------C---AT-GT-A------CACTTTAATGGT-AT-----T--GT-----ATTAAGCGAAAAA-CGT-AAAA--TTG---AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-A---T-A-AG-TA-----T-AAT-TAA--AA--TAA-AAAAACATC------------A--AATTTTGC-NAAA-AAATA--AAAT---G-TTTAATTTTA----TTGCATTATA-----CAGATTT------TGGGGC-----TTGTAGTGAACGTCGT
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TTTTTATTTGACTTTATGAAAGACATGACTTATAAATATAATATAAAATATATGACTAAAATTTAAAAAGAAATATCTTCTTTTTTTTTGAATATTTTTATAAACTTGTTT
Unaligned ( gi|34 ): GTTAATGTTATTTTATAACACTAGACTTTAAACCACTGAATAAGAAAAGATTTGATTAATTGATTGGACTTTTAGCATCACTTT
Unaligned ( gi|35 ): ATGTATGTGTTCTTTACAATTCCCTGGTCTATAATTAGTAAATTGTTAGTACTAACTGGTTCATAATGAATTTTTTTT
Unaligned ( gi|36 ): TCTTGTAATCTATACAAACACTACAATTTCGAAACATGTTAAAGATTGAAAACGTATTGCCTAGTTTAGGATAGT
Unaligned ( gi|39 ): CGTCAATTTTAATGAAATAGAAATATTAGATAAAATTTAAACTCCAAA
Unaligned ( gi|40 ): GTTATTGCTAACGATATGTCATAATGGAATAGGATCGAA
Alignments
lowQualScore : 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222 11111111111 11111111111 1111111 11111 22222222 55555555 11
lowQualScore : 1 0 0 3333 22 1 22 1 1 22 1 1 333 3333 22 222 444 3333 8 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 1 555 55 0 44444 22 222 5 555555 0 5 1 3 5 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 444 4 2 555555555 55 666 22 77 2 2 4444 22 333 0 1 2 99999999999 666 2 4444 2 1 555 333 1 333 1 3333 2 1 22 1 1 22 22 11111111111 1 666666 0 2 1 44444 44 44444 33 2 22 6666 22 2 5555555 4 99999 333 333 2 9999999 2 77777 2 2 22 33 2 22222 22 33 88 2 33333333 2 6666 77777 4 22222222 55 4 4444 11 0
lowQualScore : . . . .... .. . .. . . .. . . ... .... .. ... ... .... . .................................................... . . ... .. . ..... .. ... . ...... . . . . . . .................................................... ... . . ......... .. ... .. .. . . .... .. ... . . . ........... ... . .... . . ... ... . ... . .... . . .. . . .. .. ........... . ...... . . . ..... .. ..... .. . .. .... .. . ....... . ..... ... ... . ....... . ..... . . .. .. . ..... .. .. .. . ........ . .... ..... . ........ .. . .... .. .
lowQualScore : 2 1 4 5555 33 7 33 7 7 33 7 7 000 5555 33 999 666 5555 3 1111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 7 777 11 4 22222 33 999 5 222222 9 5 8 6 5 7 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 666 2 1 888888888 00 666 99 55 2 1 5555 99 777 5 3 2 99999999999 111 1 2222 0 9 222 333 8 222 8 9999 3 7 44 7 7 33 33 66666666666 7 777777 1 5 9 88888 55 88888 33 0 88 7777 88 0 1111111 0 88888 222 777 1 7777777 1 44444 1 1 99 11 2 22222 44 44 44 5 66666666 9 1111 11111 1 11111111 55 4 7777 88 7
consensus : NAAAGGACCAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--AT--------T-T-T-----ATT---T--TTTAATTTT-ATG--TTTTT-TCTATTCATAGAA-----T--GA---CTCCAAAGACGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGCTCAT---------------T-----T--CC-CCG------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--NG-CATTTAAAT-A---------TT--T---T--TT--AT-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATTGTCTGGTACACTCTGAGTAATAT-GTGTAAATAT-ATTGCCTTGTGGCAA---GA-GTG----CCTTCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACNTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTGTA------C---AT-GTA------CACTTTAATGGT-AT-----T--GT-----ATTAAGCGAAAAA-CGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-A---T-A-AG-TA-----T-AATTA-A--AA--TAA-AAAA---ACATCAAAT--TTTGC-NAAA-AAATAAAAT---G-TTTAATTTTA----TTGCAT-----TANACAGGGCCA---T--TTTGGG-GCTTGTAGTGAACGTCGT
Reference ( family-164 ) : NAAAGGACCAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--AT--------T-T-T-----ATT---T--TTTAATTTT-ATG--TTTTT-TCTATTCATAGAA-----T--GA---CTCCAAAGACGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGCTCAT---------------T-----T--CC-CCG------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--NG-CATTTAAAT-A---------TT--T---T--TT--AT-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATTGTCTGGTACACTCTGAGTAATAT-GTGTAAATAT-ATTGCCTTGTGGCAA---GA-GTG----CCTTCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACNTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTGTA------C---AT-GTA------CACTTTAATGGT-AT-----T--GT-----ATTAAGCGAAAAA-CGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-A---T-A-AG-TA-----T-AATTA-A--AA--TAA-AAAA---ACATCAAAT--TTTGC-NAAA-AAATAAAAT---G-TTTAATTTTA----TTGCAT-----TATACAG----A---T--TTTGGG-GCTTGTAGTGAACGTCGT
gi|1 : GAACTAGGTTCACGACGCCCCAATATTGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TATTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGTT---TTGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---CATTATT-T-T----TTTAAAA-----T-A--------TGGAC--AT--------T-T-T-----GTC---T--TTATGTTTT-ATG---TTTT-TCTATTCATAGAA-----T--AA---CCCCTAAGACAATTAGAATTAA------A-G-A-A-AA-TGCGCAT---------------T-----T--CC-CCC------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--TA-CATTTAGAT-A---------TT--T---TTCTT--AC-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAA----TAAG--ACATTTATACTG---ATAATTGTCTATAACATTCATAGTAATAT-GTATAA--AT-ATTGCCTTGTGGCA---------------------------A---AAAC---CCTGAT-AT---ATT-T----ACCTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGTA--AAGCTTCATATTTCTACTGTT------T---AT-ATA------CACT---------------------------TTAAGCGAAAAA-GGT-CAAA--TTAAA-AAAAATAAA--AT-TTA-C-----AT-TTG-----ATAAA-T-G---A-A---T-AGAT-TA-----T-AATTA-A--
gi|1 : A-GTG----CCTTCATT-GT-TAT--AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACCTA-AATT--G-TCTTAA-T-TG--TAGTA--AAATAGCATATTTATATTGT------------T--TA------TATTT--ATA-T-AT-----T--TT-----ATTAAGCGAAAT--TGT-CAAA--TT--A-AAAAATAAA--AT-TTA-C-----AT-TT--------------G---A------------------------TA-A--AA--TAA-TAAA---ATA-GAAAT--ATTGC-AAAG-AAAT--AAT---G-TTTTATTTTA----TGACAT-----TCTACAG----GGCCTTGTTTGGGTGTTTGTgtgccttcattgttataaaccatgatatatttacctaaattgtcttaattgtagtaaaatagcatatttatattgtttatatttatatattttattaagcgaaattgtcaaattaaaaaataaaatttacatttgataaaataataaaatagaaatattgcaaagaaataatgttttattttatgacattctacagggccttgtttgggtgtttgtgaagcccgtcctt
gi|10 : gaactaggttcacgacgccccaatattggccctgtaaaatgcatttattttaaatacttatttttcagcaaagttttgtgtatttgtattaaatatacattatttttttaaaatatggacattttgtctttatgttttatgtttttctattcatagaataacccctaagacaattagaattaaagaaaatgcgcatttcccccaattttgtcctattttttacatttagatatttttcttactatgaaggcattcttgccacaataagacatttatactgataattgtctataacattcatagtaatatgtataaatattgccttgtggcaaaaaccctgatatatttacctaaaatggcttaaaatgtagtaaagcttcatatttctactgtttatatacactttaagcgaaaaaggtcaaattaaaaaaaataaaatttacatttgataaatgaatagattataattaAATATCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TAT---TTT-T--T-CAAGCAAAGAT---TGGTGTGTTTGGATTCA----A--TATA---CGCCATT-C-T----TTA-AAA-----T-G--------TG--T--ATA-------T-T-TCGCTGATT---TTATCTGATTTT-ATG---TTTT-TCTATTCATAGAA-----T--GA---TTCAAAgaagcccgtcctt
gi|10 : ATTCAAAT-AGT-------TT--T---T--TTG-AT-TATAAAG-ACATTCTTGCTACAC----AAAG--CTATTTGTTCTG---ATCATTGTCTGGCACACTCTAAGTAATAT-GTTTGA--AT-AGTGCCTGGGAGCAAACTGC-GTA----TCTTTGCT-GTACATGTACAC---TTTGATGAT---ATTGT----ATT---AAGT--G-A---AA-AACG--T---A--AAATTGtagtttttttgattataaagacattcttgctacacaaagctatttgttctgatcattgtctggcacactctaagtaatatgtttgaatagtgcctgggagcaaactgcgtatctttgctgtacatgtacactttgatgatattgtattaagtgaaaaacgtaaaattgaaaaacaaaatttacatttttaaaatgaacaaagtattatttaagttaacaaattatacaattttgcagaaaaaatagggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|10 : aatatcggccctgtaaaatgcatttcttttaaatattttttcaagcaaagattggtgtgtttggattcaatatacgccattctttaaaatgtgtatatttcgctgattttatctgattttatgtttttctattcatagaatgTC-T----AAGTA-ATAT--G-TTTGAATAGTGCCTGGGAGCAAACTGCGTATCTTTGCTGTA------C---AT-GTA------CACTTTGATGAT-AT-----T--GT-----ATTAAGTGAAAAA-CGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TAAAA-T-G---A-A---CAA-AG-TAT----T-ATTTA-A--GT--TAA-CAAA---TTATACAAT--TTTGCAGAAA-AAATAaaaaacaaaatttacatttttaaaatgaacaaagtattatttaagttaacaaattatacaattttgcagaaaaaatagggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|11 : aatatcggccctgtaaaatgcatttcttttaaatattttttcaagcaaagattggtgtgtttggattcaatatacgccattctttaaaatgtgtatatttcgctgattttatctgattttatgtttttctattcatagaatgattcaaatagtttttttgattataaagacattcttgctacacaaagctatttgttctgatcattgtctggcacacGGACAAGATTTACGAAGCCCCAATAATGGCCCTGTAA----A--AC-CAAT-TTTTTT--AA--TAA--ACTT-T--T-T-AGCCAAGCT---GGGTGTGTTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----GTA-AGA-----T-A--------TG--T--ATAG------T-T-C-----ATG---T--TTTAATTTC-ATGTTTTTTT-TCTATTGATAGAA-----T--GA---CGCCAAAGGCGGTTAAAATA-A------A-GTA-A-AA-TGCCCAT---------------A-----TCGCC-CTT------------A--A--T-TTgggatggggagtaaactttcaaggccatttgaagggggtggggatggggatgtaaaacttactattttatttt
gi|11 : t----CCTTAATTTGT-TA---AATC---TATGAT-AT---ATT-T----ACACA-AACT--G-GCTTAA-AATG--TGGGA--AAATTGCATATTATCGCTGTG------C---AT-GTA------CACTTTAATGGT-AT-----C--GT-----AATAAGCCAAAAA-AGT-AAAA--TT--G-AAATGCAAA--AT-ATA-T-----ATATTT-----TTAAA-T-G---A-G---T-ATAG-AA-----T-AATTATA--AA--AAA-ACAA---CCATAAAAT--GTGGC-CAAA-AATTAAGA------TTTAATTTTA----TTGCAA-----TAGACAAGAACA---T--TTTGGG-G-GTGCA-TGAACATCGgttaaatctatgatatatttacacaaactggcttaaaatgtgggaaaattgcatattatcgctgtgcatgtacactttaatggtatcgtaataagccaaaaaagtaaaattgaaatgcaaaatatatatatttttaaatgagtatagaataattataaaaaaacaaccataaaatgtggccaaaaattaagatttaattttattgcaatagacaagaacattttgggggtgcatgaacatcg
gi|12 : tggacaagatttacgaagccccaataatggccctgtaaaaccaatttttttaataaactttttagccaagctgggtgtgtttgtattaaatataatttattctgtaagatatgtatagttcatgttttaatttcatgttttttttctattgatagaatgacgccaaaggcggttaaaataaagtaaaatgcccatatcgcGGTCCACGAAACCTCTATATCGGCCCTGTTA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAAATACTTATGT-T--T-C-AGCAAAGTG---TAGTGTGTTTGTATCAA----A--TATA---CTTTATT-C-T----TTA-AAAATAGGT-A--------TA--TA-AT--------TAT-T-----ATTACAT--ATTAATTTT-ATG---TGTT-TCTATTTATAGAA-----T--GA---CTCAAAAGA-GGTTAATGTT-A------AGG-A-A-AA-TG-TC--------------------------------------------A--A--TGTTTGTTCTATTTTT--TG-TA-TTAAAT-A---------TT--TTACT--TT--AT-TTTTAAG-GCATTCTTGCTACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---A----------------TCTGAGTTATAT-GTGT-----T-ATTGTCTGATAGCAA---GA-GTA----CATTCACT-GT-TA---AAAT---CATGAC-AT---ATT-T------------------GCTTAA-AATG--GAGGA--AATTTTCATATTGTCACTGTAATT---A---AT-GTG------CACTTTGATGATAATACATGT--AT-----ATTAAGCAAAAA
gi|13 : gTCACGACGCCCAAAAAATGGCCCTGTAA----G--ATGCTTT-CCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTTTTAA----A--TGT----ATTT-TT-T-T----TTT-GA--------------------------------------------------T--TTTAAATTC-ATA---TTTT-TCTATTCACAGAA-----T--GT---CTCCAAATACGGTTAAAAAT-A------AGG-A-A-AA-TGTTAAT---------------T-----T------CG------------A---------TGTTC-AT-------G-TATGTAAAC-A---------TT--T---T--gttta
gi|13 : aac-AAATACG-GTTAAA-AATA---AGGA--AAAT-GT-TAATTTCGATGTT------C---AT-GTATGTAAACATTTTAATGGT-AT-----T--TT-----ATTGAGCGAAAAA-TGT-AAAA--TTC-T-AAGAAC---------TA----------TTTGA---TTAGA-A-T---A-A---TCA-AA-TA-----T-AACCA-A--AATTTAA-AAAA---AAATCAAAT--TTTAC-CAAA-AAATTGAG----G-TTTTATTTTA----TTGGAT-----TAAACAGGGTCA---T--TTTGGG-GCaatggtattttattgagcgaaaaatgtaaaattctaagaactatttgattagaataatcaaatataaccaaaatttaaaaaaaaatcaaattttaccaaaaaattgaggttttattttattggattaaacagggtcattttggggcggtgtggggtgtcataagccactgctttccttt
gi|14 : aactcacgacgcccaaaaaatggccctgtaagatgctttccttttaaatacttatttttcagcaaagcttggtgtatttgttttaaatgtattttttttttgattttaaattcatatttttctattcacagaatgtctccTTTT--GG-CATTTAAAT-A---------TT--T---T--TTTTAT-TATGAAA-GTATTCTTGCTTCAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATAATTGCCTGGTACACTCTAAGTAGTTT-GTGTA--TAT-ATTGCCTTGTGGCAAC--AA-GTG----CCTTCACT-AT-TA---AAAC---CATGAT-AT---GTT-TCAATACCTA-AAAT--G-GGTTAA-AATG--TAGGA--AAATTGCATATATTCGCTGTT------T---AT-GTT------CTCTTTAATGAT-AT-----T--GT-----ATTAAGCAAAAAA-TGT-CAAA--TT--G-AAAAACAAA--AT-TTA-T-----AT-TTTATATATTAAATATG---A-A---T-ATTG-TA-----T-AACCA-A--AA--TAA-AAAA-------TAAAT--CTT-C-TTAA-AAAT--AAT---G-TTTGATTATAATATTTGCAT-----TATACAGGGTCA---T--TTTTGG-Gggtgtggggtgtcataagccactgctttccttt
gi|15 : GGTTTACAAAGCCCCAATATCTGCCCTGGAA----A--ATGCATT--ATTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGTT---TTGTTTGTTTGTTTCAA----A--TATACTCATTTCTT-T-TAAAATAT-AAA-----T-G--------TA--T--AT--------T-T-C-----ATC---T--TTTAAAAGT-AAG--TTTGT-TCTGTTCGTAGAA-----T--GA---CTCCAGAGA-GAGTAAGATT-A------AGG-A-A-AA-TGCTCAT---------------------------------------------------------TATTTTT--GG------------------------------------AT-GATGAAG-GCATTCTTGCCACAC-----ATG--ATATTTATTCTG---ATCAGTGTCTGGTACACTCTGAGTAATAT-GCGTAA--AT-ATTGTCTTGTGATAT---AT-TTG----CC----------TA---AA------ATG-----------------GCTTA-ACAT--G----TAG-AA-----AAAA--AAAGT---TTTTTTAGCTGTA------G---AT-GTA------TTCTTGAATGaatagtaaa
gi|16 : AGAA-----T--AA---CTCCAAAGACGGCTAAAATT-A------A-G-A-ACAA-TGCTCAT---------------T-----T--TCACCC------------A--A--T-GTTGTTTTATGTTT--AGGCACTCAAAT-----------------------------------------TCTTTCTACAC----A-------------TCTG---ATCAGTGTCTGGGGCATTCTGAGTAATAT-AT----------TTG----GTAGCAA---AA--TC----CCTTCACT-GT-CA---AAACAGGTATGAT-AT---ATT-T----ACATA-AAAT--GTGTCTTA-AATC--TACGA--AAATTGCATAATTTCACTCTT------C---AT-GTA------CACTTCAATGAT-AT-----T--GT-----ATTAATCG-GAAA-CGT-TAAC--TT--T-TAAAACAAA--GT-TTA-C-----AT-TTT-----T---A-A-G-----A---T-A-AT-T------T--ATTA-AATAA--TAA-A
gi|17 : aAAAGGACTAGGTTCATGAAAC-----------CCC---------A--AT---------------AA-TATTTATTT-TTTT-C-AGCAAAGCC---TGGTGTATTTGTATCAT----A--TATG---ATTTATT-C-T----TTTAAAA-----T-A--------TG--TTGAT--------T-T-gggctattttggggaagggggcgggggggggggg
gi|17 : A----A--TAAT---ATTTATT-T-T----TTT-CAG-----C-AAAGCCTGGTG--T--AT--------T-TGT-----A---------TCA--TAT-ATGA-TTTAT-TCT-TT--TAAAATATGTT--GATTTCTCCAAAGACAGTTAAAATT-A------A-A-A-T-AA-TGCTTAT---------------T-----T--CC-CTC------------A--T--C-TTAAACATATTTTTGCGG-CATTTAAAT-A---------TG--T---T--TTA-AA-TAAGAAG-GCATTCTTGCTACAC----AGCT--ATGTTTACTCTG---ATCATTGTCTAGTTCACCCTAAGTAATAT-GTGTAAATAT-TTTA--TTGTGGAAA---GA-GTGCCTTCCTTCCCT-TT-TA---AAAC---CATGGT-AT---Actccaaagacagttaaaattaaaataatgcttatttccctcatcttaaacatatttttgcggcatttaaatatgttttaaataagaaggcattcttgctacacagctatgtttactctgatcattgtctagttcaccctaagtaatatgtgtaaatattttattgtggaaagagtgccttccttcccttttaaaaccatggtata
gi|18 : aaaggactaggttcatgaaaccccATAAAA-GCATTCTTGTGACAC----AGAG--ATATTTATTTCG---ATAATTGTCTAGTACACTCTGTGTAATAT-GTGTAACTGT-ATT--CATGTAAC-A---GA-CTG----CGTTCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-TT---ATA-T----ACAT--AACT--G-GCATAA-AATG--TAGAA--AAATTGCATATT-------------------AT-TT----------TTCAAAAGA-AC-----CAAGT-----ATAAAAGAAAAAA-CAT-AAAATTTT--GCAAAAATTTA--ATGTTT-C-----AT-TTTA----TTA
gi|19 : taAT-GTGTAAATGT-TTT--CTTCTGAAAA---GA-GTG----CCCTCACT-GT-TA---AAAC---CAC---------ATT-T----ATATA-AAAT--G-ACTTAA-AATG--TAAGA--AATTTGCATATCTTCGCTATA------C---AT-ATA------CACTTTATTGGT-AT-----C--GT-----ATTAAGCGCAAAA-TGA-AAAA--TA--G-AAAAACAAA--AT-ATA-T-----A--TTT-----TTAAA-A-G---A-AT--T-A-AG-TA-----C-AATTG-A--AT--TAA-AAAA---ctttaaacggggtcattttttgaggtggggtggtgggggaggtgtttcacgaacgttgttctt
gi|2 : tatttgtttgcacataaaacaaagatattagAAAGGACTAAGTCCACGAAGCACAAATATCGGTCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TGCTTATTT-T--T-C-AGCAAAGTT---ATGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---CTTTATT-A-T----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--TT--------T-T-T------TT---T--TTTAATTTT-ATG--TTTTT-TCTATTCACAAAA-----T--GA---CCCCAAAGATGGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AA-TGCTCAT---------------T-----T--TT-CTG------------A--A--T-TGTGTCCT-TTTTT--TT-TATTTAAAT-A---------TT--T---T--TT--AT-TATGAAG-GCATTCTTGCCACAC----AAAG--ATAATTAATCTG---ATAAATGTCTGGTACATTTTTAGTAATAT-GTGTAAATAT-ATTGCCTTGTGGCAA---GA-GTG----CCTCCACT-GT-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----ACCTA-AAAT--G-GCTTAA-AATG--TAGGG--AAATTGCATATTTTCGCCGTT------T---AT-GTA------CTCTTTAATGTT-AT-----T--GT-----ATTTAGCGAAAAT-TAT-AAAA--TT----AAAAACAAA--AT-TTA-C-----AG-TTT-----TTGAA-A-G---A-A---T---AG-TA-----T-AATTA-A--AA--TAA-AAAAAGCACATC-AAC--TTTGC-AAAA-AAACAAAAT---G-TTTAATTTAA----TTGCAT-----TATGCA-------------TTGGA-GCTTATAGTGAACGTAGTtatagtacaaatacatgacatatcaaataccagaatcaatatgaacatgtcagtgtttttt
gi|20 : tTA--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTGCA------C---AG-GTA------TACTT
gi|20 : AT-ATGCAATT-T----TCCTATAAAT--G-GCTTGA-AGTG--TAGGA--AAATTGCATATTTTCGCTGCA------C---AT-GTA------CACTTTAATGGT-AT-----T--GT-----TTTAAGCGATAAA-TGT-AAAC--TT--G-AAAAGCAAAACAT-ATA-T-----AT-TTT-----TTAGA-A-G---A-A---TAA-AG-TA-----T--ATT--A--AA--T---AAAT---TCAATAAAT--TTTGA-AAAA-AAA-AATAC---G-TTTGA-TTTA----TTACAA-----TAAACaatggcttgaagtgtaggaaaattgcatattttcgctgcacatgtacactttaatggtattgttttaagcgataaatgtaaacttgaaaagcaaaacatatatattttttagaagaataaagtatattaaataaattcaataaattttgaaaaaaaaaatacgtttgatttattacaataaactgggcactttatataatatatttttttcggggagcggtgtgggggtcgggaacatcgtc
gi|21 : aagtatacctgtgcagcgaaaGATCAGGTTCACGGAGCCC-AATGGTGGCCCTCTAA----A--ATGCATT-TCTATT--AAA-TACTTATTTCT--T-T-AGCAAAGCT---TGATGTAACTGTATT-A----A--TATA---ATTTATT-CTT----TTT-AAA-----G-A--------CA--T--A-------------T-----A--------TTTAACTAA-ATG---TTTT-TATATTAATTAAA-----T--GA---CTCCAATAATGGTTAAATTG-G------A-G-G-A-------TCCC---------------T-----C--CC-CCG------------------------------TTTT--TG----TCGAAT-A---------TTTGT---T--TT--AT-TATGAAG-GCATCCTTGCCATAC----AGAG--ATATTTATTCTA---ATCATtgggcactttatataatatatttttttcggggagcggtgtgggggtcgggaacatcgtc
gi|22 : GGATCAGGTTCACGAAGCCCCGATATCGGCTCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTA--AAA-CATTTATTT-T--T-T-AGCAAAGCTGGATGATGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATCTATT-A-T----TTT-AAA-----TAA--------TG--T---T--------G-A-T-----ATC---T-------TTTT-ATGT-TTTTT-TCGATCCATATAA-----T--TA---CTCATAAAACGATTGAAATG-A------A-G-AGA-GA-TGCTCAT---------------T-----T--TC-
gi|23 : AGGACCAGGTTCACGAAGACG-AA------------AA----A--ATGCATA-TATTTA--AAA-TTGTTATTT-T--T-C-AGCGAAATT---TGATGTATTTGTA-TAA----A--TATG---ATTTATT-C-T----TTTGAAA-----T-G--------TG--T--A-------------T-----A--------TTTAATATT-ACG---TATT-TCTATTCATTGAA-----T--GA---CTCCAAAGACTGTTTAAATTAA------A-G-A-A-AA-AGCTCAT---------------TTCCCCT--CC-CCA------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--CA-CCTTTAAAT-AGTTG-----TT--T---T--TT--AT-TGTGAAG-GCATttatgcttattacctttctaacctgatttttttaacatagaaga
gi|24 : cAAGGACCAGGTTCACAAAGCCCCAATA-----CCTGTAA----A--ATGTATT-TCTTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGT---------TATT-------A----A--TATC---ATTT----------------AA-----T-A--------T---T--AT--------G-T-T-------------------------TG--TTTTTCTCCATTCATATAG-----T--AA---CTCCAAAGACGGTTAAAATT-A------A-GTA-T-AA-TGCTCAT---------------T-----TG-TT-GTG------------A--AATT-TTTGTCTT
gi|25 : -TA---AAAC---CTTGAT-AT---ACT-T----ACATA-AA-T--A-GCTTAA-CACG--TAG----------CAT-TTTATGCTGTA------C---AT-TTAA-----CACG--AGTGGT-CT-----T--GC-----ATAAGGCGGGAAA-TGT-AAAA--TT--G-AAAAACAAA--A----A-CAAAAAATATTT-----CTAAA-A-T---A-A---TCA-AA-TA-----T-AATTA-A--AA--TGA-AAAT---ATTTT---T--TTTAT-CAAA-TATTTAAG----G-CTAAATGTTA----ATGCAT-----TAAACAG----ttgtcaaattagaaaaaaaacaatctaaatctgaataatttatttatgaaaat
gi|26 : TGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---A-CAT-AT----TAAACGCTGAGTAATAT-GTGTAAATAT---TCTCTTGTGACAA---GA-GTG----CCTTCACT-----------AC---CAAGAT-AT---ATT-T----ACA-A-AAAT--G-GCTTAA-ATTG--TA-----------TATATT------GTA------C---AT-GTA------CACTTTCATGGT-AT-----T--GT-----ATTAAGCggctat
gi|27 : aattgttacattagaatattctataaacacctttactgttacacaCAATATCGGCACTGCAA----A--ATGCTTT-TTTTTTTTCAA-GACTAATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTT-AAA-----A-AGAAG----TG--T--AT--------T-T-C-----ATT---T--TTCAATTTC-ATA---TTGT-TCTTTTAATATAA-----T--GA---CTTCAAAGACGATTAAAATT-A------AGG-A-A-AA-AGCTCATG--------------G-----C--CC-CCA------------A--A--A-GTTGTCCTA
gi|28 : AAAGGCTCAGGTTCACAAAGTCCCGATATCAGTCCTGTAA----A--ATGCATT-TCATTC--CAA-TATTTATTC-A--T-C-GGCAAATGT---TG--GTATTTGTACTAA----A--TATA---ATTTATT-C-T----TTTAAAA-----T-A--------TG--T--A-------------------------------AATATT-ATC--ATTT--------------A-----T--GA---CTCCAAAAGCGGTTAAAATT-A------A-G-G-A-AATTGCTC--------------------------------------------A--A--T-GTTGTCCTATGTTT--CG-CATTTA
gi|29 : --T--AA--------T-T-T-----ATT---T--TA-AATATC-ATG--TGTTT-CTTAT-CACAGAA-----T--GA---TTCCAAATACGATTGAAATT-A------AAG-A-A-AA-TGCTC--------------------------CC-CCA--------------------------CCACATTC--AG-CATATAAAT-AG--------TT--T---T--TT--AT-TATGAAC-GCATTCCTGCCACGC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATTGTTTAGT-CGCTCTGAGTAATAT-GAGT
gi|3 : GACCAGGTTCACAAAGTCCCAATATCGGCTTTGTAATACCAGTATGCATTATTTTTT--CAA-TACTAATTT-T--T-C-ACCAAAGCT---TGATATGTTTGTATCAA----AGATACA---A---A--------------GAA-----T-A--------TG--T--A-------------------ATT---T--TCTA-------TG--TTTTT--CTATTTATAGAA-----T--GA---CTTCAAAG-CGGGTAAAATT-A------AAG-A-A-AA-TGATCATAAACCTCCCCCCCCCC-----C--CC-CCA------------C--A--C-A----CCCATTTTT--GG-CATTTAAAT-AAAAAAAAAAT--------------AT-TATGGAG-GCATTCTTGATACAC----AAAGCGAT-TTTATTCTG---ATCATTGT-----------------A-AT-GTGTAAATAT---TGTCTGGTAGCAA---AAAGTA----CCTCCACT-GT-TA---AAAA---CATGAC-AT---ATT-T----ACCTA-AAAT--G--------------TAGGA--GAATTTCATACTTTCTCAGTA------TTTTATTGTA------TG-TTTGATGAT-AT-----TT-ATTTTTGATTAAGCAAACAG-CAC-AAAA--TT--G-AACAACAAA--AT-TTA-C-----AT-TTC-----TTAAA-A-T---N-N---N-N-NN-NN-----N-NNNNN-N--NN--NNN-NNNN---NNNNNNNNN--TTTGC---AA-AAAT-CCAT---C-TTTAATCTTA----TTAAAT-----TGTACCGGGCCA---T--TTTTGG-GCGTTT-GTGAA
gi|30 : AAAGGACAAGATTCATGAAACCCTGATATCAGCCCTGTAA----A--ATGTATT-TCTTTT--AAA-TAGTTAGTT-T--T-T-AGCAAAGCT---TAGTGTTTTTCAACTAAATTTA--TATA---ATTTATTGC-A----TTA-AAA-----A-A--------TG--T--ATGC------T-T-T-----ATT---T--TTTAATTTA-ATG---TTTT-TCTATTT-----------T--GA---CTCCAAAGA
gi|31 : GAAAAA-CGT-AACA--TT--G-AAAAACACA--AT-TTA-C-----AT-TTT-----TT------T---A-A---T---AG-CA-----TCGATTT-A--AA--TAA-AAAA---A-ATCAAAT--TTAGC-ACAA-AAACAAG-----G-TTTAATTTTA----CTGTAT-----TACACAG----t
gi|32 : tACTACGTTCATGAAGCCCCAATAACGGCCCTGTAA----A--ATGC-TT-TGATTA--AAT-TACTTAGTC-A--T-C-AATAAAGCT---TGGTGTCCTTGTATTAA----G--TATA---ATTTTTT-C-T----TTTAAAA-----T-A--------TA--C--ATAA------T-T-C-----ATA---A--TTTAAggctatctttgtaggttcaagaacctcg
gi|37 : GGACTAGGTTCATGAACCCCCA
gi|38 : tgcttgttgctgttgttttattttttttgtgggggtgAGGGGCTAGGTTTACGAGGCCCCAATAATGGCCCTG------------------TCTTTC--CAA-TAC----TT-T--T-C-AG
gi|4 : AGGACAAGGTTCACGAAGCCCCAATATCGGCTCTGTCA----A--ATGCATT-TCTTTC--AAT-AACGTATTT-G--T-T-AGCAAATAT---ACGTGTAATTGTATTAA----A--TATA---CTTTATT-C-T----TTT-AAAA----T-A--------TG--T--------------------------------------TT-ACG--TTTTT--CTATTTAAAGAA-----T--AC---CTCAAAAGACGGTTAAACTT-A------A-GGA-A-AA-TGATAAT---------------T-----T--CC-CCC------------A--A--A-ATTGTCCTATTTTT--GG-CACTTAAAT-AGTC------TT--T---T--TG--AT-TATGAAAAGCATTCTTAATACAC----AAAT--ATATTTATTCTG---ATAAGTGCCTGGTACACTTTAAGTAATAT-GTGTA-------TTGTCTTGGGCCAA---GA-GTG----CCGTCACT-GC-TA---AAAC---TATGAT-GT---AAT-T----ATCTA-AAAT--G-GCT-AA-AAT------------ATTACATATTTTCGATATT------C---AT-GTA------CACTTTAATGAT-AT-----T--GT-----TTTAAGCGAAAAA-TGT-AAAT--AT--G-AAAAACAAA--GC-TAA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-A---TAA-AG-CA-----T-AATTA-A--AA--TAA-AAAA---CTA-CAACT--TTTGC-AAAACAAATACG-----G-TTTGATTTTA----TTGAAT-----TATATAGGGTAA---T--TTTAGG-GGT--TCGTGAACATCGTtc
gi|5 : GACTAGGTTCATGAAGCCCCAGTGTGGGCCATGCAA----A--ATGCATT-TCAA----AAA-CACTTATTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTATTAA----A--TATA---CTTCATC-CTT----TTT-AAA-----T-A--------TG--T--GTACTGGTAAT-T-T-----ATT---T--GTTAATTTT-ATG--TTTTT-T-TATTCATAGGG-----T--GA---CTCCAAAGATGGCTAAAATTAA------A-G-A-T-TA-TGCTCAT---------------T-----T--TT-CCA------------A--A--T-TGTGTCCTATTTTT--TGACATTTAAAA-AG--------TT--T---T--TT--GGATAAGAAG-GCATTTTTGCTACAC----AAAT--ATATTTATTCTGTAAAT--TTGTCTAGTc
gi|5 : TGTAAAT----TTGTCTAGTGGTAA---TA-GTG----CTTTCACT-GT-TG---AACA---CGTGAT-AT----TT-T----ATCTA-AAAT--G-GTTCAA-AATA--TAAGA--AAAATGCATATTGTCACTTTAAAATAAT---AT-GTG------CACTTTCATGGT-AT-----T--GT-----TTTAAGCACAAAA-TGT-AAAA--AT--A-CAAAACAAA--AT-TGA-C-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---A-G---TAA-AG-TA-----T-AATAA-A--AT--TAAGAAAA---ACATCAAAT--TTTGC-AGAA-AA--AAAATAGGG-ATTAATTTTA----TTGAATGTACATGTACAGGGTCA---T--TTTAGggtaatagtgctttcactgttgaacacgtgatattttatctaaaatggttcaaaatataagaaaaatgcatattgtcactttaaaataatatgtgcactttcatggtattgttttaagcacaaaatgtaaaaatacaaaacaaaattgacattttttaaaagagtaaagtataataaaattaagaaaaacatcaaattttgcagaaaaaaaatagggattaattttattgaatgtacatgtacagggtcattttag
gi|6 : gactaggttcatgaagccccagtgtgggccatgcaaaatgcatttcaaaaacacttatttttcagcaaagcttggtgtatttgtattaaatatacttcatcctttttaaatatgtgtactggtaatttatttgttaattttatgtttttttattcatagggtgactccaaagatggctaaaattaaagattatgctcatttttccaaattgtgtcctattttttgacatttaaaaagttttttggataagaaggcatttttgctacacaaatatatttattcAGGGACAAGGTTCAAGAAGGCCCAATATTGGCCCTTTAA----A--ATGCATT-TTCTTT--AAA-TACTTATTT-T--T-C-AGCAAATCT---TGGTGTGTTTGTAATAA----A--TATA---AATTATT-C-T----TTT-AAAATA--T-A--------TT--T--AT--------T-T-T-----ATT---T--TTCAATTTT-ATG--TTTTT--CTATTCATAGAA-----TAAGA---CTCCAAAGACAGTTAAAAAA-A------A-G-A-A-AAATGCTCAT---------------T-----T--CC-C-----------------A--C-CCC--CCTTTTTTA--AG-CATTTAAATTG---------TT--T---T--TT--AT-TATGGAG-GCATTTTAGCCTGAC----AAAG--ATAGTATTTCTG---ATCATTGTTCAGTACACTTTGAGTATAATGGTGTAAATAT-TTT--CTTGTGACAA---GA-GTG----TATACATT-GT-TA---AAA----CATGAT-AT---ATT-C----ACATA-AAAT--G-TCTTCA-AATG--TAGGT--AACTTGCATATGTTCCCTGTA------A---AT-GTA------------AA-----AT-----T----------------GAAAAA-C------------------AAC--A--AT-TTA-T-----AT-TTT-----TTAAA-A-GTATA-AAGTT-A-AG-TATACCGT-AATTA-A--AA--T-G-AAAA---ACATAAAAT--TTTGC-CCCA-ATATAAG-----G-TATAATTTTG----TTGCAT-----TAAACTGACC-A---T--TATGGG-GTTT
gi|7 : GGACCAGGTTCACGAAGCCCAAATATCGACCCTGTAA----A--ATGCATT-TCTTTT--AAA-TATTTATTT-T--T-C-AACAAAGCT---TGTTGTATTTGTATTAA----G--TATA---ATTGACT-T-T----TTA-AAA-----T-A--------TG--T--ATAT------T-T-T-----ATT---T--TTTAACTTTCATG--TTTTT---------------------------CTCCAAAAACTGTTAAAATT-A------A-G-A-A-AAATGCTC--------------------------CC-CCC------------ACCA--A-TTTGTCATATTTTC--AG-CATCTAAAT-A---------GTG-T---T--TT--AT-TATGAAA-ACATTCTTTCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ATCATGGTCTGGTATACTCTGAGTAATAC-GTGTAAATAT-TTT--CTTGTGGCAA---GA-ATG----CCTTCACT-GA-TA---AAAC---CATGAT-AT---ATT-T----CCATG-AAAT--G-GCTCAA-ATTG--TAGGA--AAATTGCATATTTTTCCTGCA------C---AT-TTA------CACTTACATGAT-AT-----T--AC-----ATTGA--GAAAAA-TGT-ACAA--TT--G-AGAAACAAA--AT-TTA-T-----AT-TTT-----TAAAA-A-T---A-A---T-A-AATTA-----T-AATTA-T--AA--TAA-AAAA---ACATAAAAT--TTTGC-AAAA-CATT--AAT---G-TTAAATGTCA----TTGCAT-----TACATAG----A---catgaac
gi|8 : aatggtTCGACCTTGTAA----A--ATACATT-T----T--AAA-AACTC-TTT-T--T-C-AGCAAAGCT---TGGTGTATTTGTAT-AA----A--TATA---ATT-ATT---------------------------------------T--------T-T-T-----ATT---T--TT-AATTTC-AT---TTTTA-TCTATTCATAGAA-----T--GA---CTCAAAATACGGTTGAAATT-ATATTAAG-G-A-A-AA-TGCTCAA---------------C-----C--CC-CTACCAGCCACACACA--A--T-TTTGTCCTATTTTT--CG-CATTTAAAA-AG--------TT--TAA-T--TT--AT-TATGAAG-ACATTCTTGCCACAC----AAAG--ATATTTATTCTG---ACCATTGTTTAGTACACTCTGAGTAATAC-GTTCAACCATGATCAC---GTGG--A---AA-GTG----CCTTCACT-GT-TA---AA--------GAC-AT------------------AAAT--A-GCTTAA-TATG--TAGGA--AGACTGGATATTTTCGATGAA------C---AT-GTA------CATTTTAATGGT-GT-----T--GT-----GTTAAGTGAAAAA-TGGAAAAA--AT--G-GAAAACAAA--AT-ATA-T-----AT-TTT-----TTAAA-A-G---ACA---A-A-AG-T----------TTA-A--TA--TAA-AACA---AAATCACATTGTTTAC--AAA-AAATAAAAA---GATTTAATCTTA----TTGCAT-----TTAACAGGGCCA---T--TTTGAG-GC
gi|9 : GGACCAGGTTCGCGAAGCCCTAATTTCGGCCCTGTAA----A--ATGCATT-TCC-----AAA-AACTTTTTT-T--TTC-AGCAAAGCT---TGGCGTACCTGTATTAA----A--TACA---ATTTATT-C-T----TTT-AAAATATGT-A--------TA--T--AT--------T-T-T-----CAT---T--TTAAATTTT-ATG--CTTTT--CTATTCATATGA-----T--GA---TT----------TTAAAATT-A------G-G-G-GCAA-TGCTCGT---------------A-----T--CC-CTC------------A--A--T-TTTGTCCTATTTTT--CG-TATTATAAT-A---------GT--T---T--TT--AT-TATGAAG-ACATTCTTACTACACTGACAAAA--CTATTTATTGTG---ATCACTGTCGAGTACACTCTGGGTAATAT-GTAT-------------TCATGGCAA---GA-TTG----CCTTCACT-AT-TA---AAAG---CGTGAT-GT---GTT-T----TCATA-AAAT--G-GCTTAA-CATG--TA--A--A-------------------A------C---AT-GTA----------TTAA---------------GC-----AAAAAATGTAAAATCGA-AAAA------------ACAGA--AT-TTATC-----A--TTT-----TTGAA-T-G---A-A---TAA-AG-TA-----T-AATTC-A--AA--TAA-GAAA-----ATCAAAC--TTTAC-GACA-AAATAAagttcgt
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TTTTTATTTGACTTTATGAAAGACATGACTTATAAATATAATATAAAATATATGACTAAAATTTAAAAAGAAATATCTTCTTTTTTTTTGAATATTTTTATAAACTTGTTT
Unaligned ( gi|34 ): GTTAATGTTATTTTATAACACTAGACTTTAAACCACTGAATAAGAAAAGATTTGATTAATTGATTGGACTTTTAGCATCACTTT
Unaligned ( gi|35 ): ATGTATGTGTTCTTTACAATTCCCTGGTCTATAATTAGTAAATTGTTAGTACTAACTGGTTCATAATGAATTTTTTTT
Unaligned ( gi|36 ): TCTTGTAATCTATACAAACACTACAATTTCGAAACATGTTAAAGATTGAAAACGTATTGCCTAGTTTAGGATAGT
Unaligned ( gi|39 ): CGTCAATTTTAATGAAATAGAAATATTAGATAAAATTTAAACTCCAAA
Unaligned ( gi|40 ): GTTATTGCTAACGATATGTCATAATGGAATAGGATCGAA