lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 1111111111 222222 33 1
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 3 11 444 2 1111111111 555555 2 2 4444 4 2 1 99999 1 44 333 2 4 22 44 777 777 1 8888 888888888 2 444 2 4 2 9999 2 00 5
lowQualScore : .................................................... . . .. ... . .......... ...... . . .... . . . ..... . .. ... . . .. .. ... ... . .... ......... . ... . . . .... . .. .
lowQualScore : 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 2 22 777 7 7777777777 000000 4 2 0000 0 0 9 66666 9 88 555 0 1 88 88 888 444 3 2222 444444444 4 111 4 7 5 3333 9 00 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNGATAT-----AATT---ATATATATATATATATC--TATATAATTTCTTG-------GTATATAC-GTATATATATATATATATGGGAGAGATAATA---AA-TT----------AATTA-----TTAAAAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AA-TATNAATGATGATA--ATGT--T-ANGATGTCAAA---CGA----TTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATT-GTGAAAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
Reference ( gi|2 ) : AATAATTATTATTAGATATGTGCAAATTTAAATATATGTGTGTATACCGGTGTATAGGTTTGTGTATGTATGTATATAT-GTGTATATATATATATATGGGAGAGATAATA---AA-TT----------AATTT-----TTAAAAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AA-TATGAATGATGATA--ATGT--T-ATGATGTCAAA---CAA----TTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATT-GTGAAAACGTTCACAAATTATGCGGTGCGCCTTAAGGGGC
gi|3 : GATAT-----AATT---ATATATATATATATATC--TATATAATTTCTTG-------GTA-A-AT-GCAAAGACACATATATATGGGAGAGATAATA---AA-TT----------AATTA-----TTACAAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGTGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATG---A---AA-TATGAGTGATGATA--ATGT--T-ATGATGTCGAA---CGA----TTATAA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGG-CAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATT-GTGAAAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAAGTGC
gi|20 : tgtataattcctcggtaaatgtaaagacttTATATAA-AGGGAGATA-ATATTTATGGGAGAGATAATA---AA-TT----------AATTA-----TTAAAAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAAATCTTT----AAAAGTCTTTA-AAA-A-AA--C--TCGAGCACTTTCGAAAAAATATATTATT
gi|1 : attagacagaATATAT-ATATATATATATATATATGGGAGAGATAATA---AA-TT----------AATTA-----TTAAAAA-TTAATTAAT-ACACACAAACAATACTGAATTCTTT----AAATCTATTTT-AAA-A-AA--AAACCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAA-TGA--A---AA-TATGAATGATGATA--ATGT--T-ATGATGTCAAA---CGA----TTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATT-GTGAAAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGG
gi|26 : aaaacagacctattaggcatttgttttcaaataaagaaaattttcaaattcaatttaaataatatttgttacacaaaaacagaacaaataaaacaataATATACAGTGTATAAATATCTATATGGGACAGATAATA---AA-TT----------AATC-----------AA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTG--TTCCTT----AAAATTAc
gi|21 : TATATATATATATATATGGGAGAGATAATAATTAA-TTATTTATTAAAAATTTAATTATTAAAAA-TTTATTAAT-ACACCTAAACAATACTGAATTCTTT----CAAATTATTTA-AAC-A-AA--C--CCGAGTGCTTTCG-GA
gi|5 : TATATATATATATATGGGAGAGATAATA---AAATT----------AATTA-----TTAAAAAATTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTA-AAATA-AA--C----AAGTGCTTTTG-GAATA-ATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAAT------------ATAAATGATGACA--ATGT--T-AAGATATCAAA---CGA----TTACGA---------TGATAAAAACATGGATGTGTGG-AACAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AA
gi|6 : acacagcaatttatgactgatgcaagtgaaagaaATATATATATATGG--GAGATAATA---AA-TT----------AATTA-----TTAAAAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTTAAAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATG-AAATGA--A---AA-TATGAATGATGATA--ATGT--T-ATGATGTCAAA---CGA----TTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATT-GTGAAAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCCTAAGGatatatataaaata
gi|9 : ATATATATATAGCAGAAATAATA---AA-TT----------AATTA-----TTAAAAA-TTAATTAAT-AAACCTAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTA-TTT-AAA-A-AA--TA-AAAAGCGCTTTCG-AAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGAATAAAAATTA--A---AA-TATTAGTGATGATA--ATGT--T-AAGATGTCAAA---CGA----TTACGA---------TGAAAAAAACATGGAAGTATGG-AAAAATCACAA---T-AAAA-AATAA-TA-------------AAAACGTTCACAAATTATGcg
gi|7 : aaTATAAATATGG-AGAGATAATA---AC-TT----------AATTA-----TTAAAAA-TTAATTTAT-ACATCCAAACAATACTGAATT-TTT----AAAATTATTAA-AAA-A-AA--A--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGG--A---AA-TATAAATGATGATA--ATGT--T-AAGATATCAAA---CGA----TTATGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGG-AAATATCAGAG---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATT-GTGAAAATGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGatgtg
gi|24 : gGGAGAGATAATA---AA-TT----------AATTA-----TTAAAAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--c
gi|8 : GAGAGATAATA---AA-TT----------AATTA-----TTAAAAA-TTAATTAAT-ACACTCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-AAAA--C--CCGAGCGCTTTCA-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AA-TATGAATGATGATA--ATGT--T-ATAATGTCAAA---CGA----TTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTTG-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAAAT--AATTAAT--AAACGTTCACAGATTATGATGTGCGCCTTAAGGaagtatattttaatttg
gi|14 : GAGAGATAATA---AA-TT----------AATTA-----TTAAAAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATTTATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATAA--A---AA-TATGAATGATGATA--ACGT--T-ATGATGTCAAA---CGA----TTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-Acg
gi|19 : GAGAGATAATA---AG-TT----------AATTA-----TTATAAA-TGAGTTAAT-ACACGCAAACAATACCGATGTCTTT----AAAATTGTTAA-AAA-A-AAAAC--TTGATCACTTTCG-ACATATATATCATTCCTTCTTCAGGAGATGAACATGA--A---AA-TATCAATGATGATA--ATGT--T-AAGAT
gi|10 : AGAGATAATA---AA-TT----------AATTA-----TTAAAAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTT-AAA-A-AAC-C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAAGGGATG-AAATGA--A---AA-TATGAATGATGATA--ATGT--T-ATGATGTCAAA---CGA----TTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATT-GTGAAAACGTTCACAAATTATGATGTGCG
gi|18 : A---GA-TT----------AATC-----------AA-TTCATTAAT-ACACCAAAACTATACTGAACTCTTT----GAAATTA-TTT-AAA-A-AA--C--CCGAGAGCTTTCG-GACTATA---TATTCCTTCTTCA-TTAATGGTAATAA--C---GATTACG-ATGATAATAACACGC--T--TAACACCATA---CAA----CCACAA---------CAACAACAAC
gi|12 : cAA-TAAATTAAT-ACACTCAAATAATACTGAATTCTTA----AAAAAGAATTT-AAA-A-AA--C--CTGAGCACTTACG-GAGTTTATATT---CCTTTTTCTGGGGTTGAAAATGGG-A---AA-GATCAATAGTGAAA--ATGT--TTAAAATGTCAAATAACGA----TTATGA---------TGATAAAAATATGGAAGTATGA-TAAGATCACAA---T-AAAA-ATCAA-TAA----AATT-GAGAAAACGTTCACAAATTATGATGGGTGCCTT
gi|4 : A-TTAATTTATTACACCGAAACAATACTGAATTCTTT----AAAAAGAAATT-AAA-A-AC--C--CCAAACGCTTTCG-GA--AGATACTATTCCTTATACAAGGGATGAAAATGA--G---A------------GGTA--ATGT--TCACAATGTAAAA---CAAAGG-TAACGACATTGTTGGTGATACAAACA
gi|11 : agacaaatttatgtatttattctaccaaacaatagatagctaacaaatgtatgttgtttcacagactgtttgaacaaatattaacaacaaaataaatagtgacttgagttatatttcacagaggtagagagcgattTAACTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTTTAAA-A-AA--A--ACGAGCGCTTTCG-GAATAT--ATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AA-TATGAATGACGATA--ATGT--T-ATGATGCCAAA---CGA----TTACGA---------TGAT-AAAACATTGAAGTGTGG-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATT-GTGAAAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
gi|30 : CACCAAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-GAA-A-Ag
gi|15 : ACAATACTGATTCCTTT----AAAATTATTTA-AAA-A-AAA-CA-CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTGTTCCTTCTTCAGTGGATGATAATGA--A---AA-TATCAATGATGATA--ATGT--T-AAGGTGTAAAA---CGA----TTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTATGA-AAAAATAACAA---TAAAAA-ATTAA-TAG----AATT-ATAAAAATGTTCACAA
gi|13 : ACAATACTGAGTTCTTTTTTAAAAAATATTTT-AAA-A-A------CCGAGTGCTTTTG-GAATACAT--TATTCATTCTTCATGGAATGAAGGTAA--A---AC-AATCAATAATGATA--ATGTC-T-AAAATGTCAAA---TAAAGAGTT-TGG---------TAATGCAAACATGGAAGTGTGA-TAAAATCACAA---T-AAAA-A-AAA-TCAGGTGAATG-GCGAAAATGTTCACAAATTATGta
gi|16 : -AA--C--CCGAGTGCTTTCG-AAATATAT--TAT------------GTATGAAAATGACCACTTGA-GATCAATCAAGATA--ATGTGTT-A-AATGTCAAA---TAA----T---GA---------TGATAAAAACATGGGAG-ATGA-TAAAATCACAA---T-GAAATATCAA-GTG----AATT-GTGAAAACGTTCACAAAATATGATTTGCACCTTCAGatgtacacaatcaggcgc
gi|17 : --CCAAGAACTTTTG-GAATATATATT-TT--TTCTTCAAGGGATGAAAATGA--A---AA-TATCAATAATGA---------------A-GTTAAA----AA----TCTCAA---------AGATAAAAACATGGAAGTATGA-AAAAATCACAA---C-AAAAAATTAA-TAG----AATT-GTAAAAACATTCACAAATTATGATGTGCACCTTac
gi|27 : -GAATATTTTTTATTCCTTCCTCAGGGGATGAAAATAT--A---AA-TATCAATGATGATA--TTGT--T-AAGATtacg
gi|25 : a--A---AA-GATCAATAATGATA--ATGT--TCAAAATGTCAAATAACGA----TTAGGA---------TGATAAAA-CATGAAAGTATGA-TAAAATCACAA---T-TAAA-ATCAA-Ttacg
gi|23 : AA---CAA----TTACGG---------TGATATAAACATTGAAATATGGTAACAAT-ACAAGGTT---AA-ATCAACTGG----AATT-GTGTAAACGTTCACAAAATATGtgaa
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): TATATAGTTAGTACATGTATAATATATACACATATACACATATTATATGTTTGCACGTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGG
Unaligned ( gi|28 ): TAACCAATATTAGATTATTCATTATGTTGTATTGAATAAGTGTATGCTTCCCTTTAGTTTATATAGC
Unaligned ( gi|29 ): ATGATTAAAAATAAGAAATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Alignments
lowQualScore : 33333 222 1111 11 6666666 111 11111111111111111
lowQualScore : 33333 333 6666 88 3 3 5555555 777 88888888888888888 2 2 2 2 2 3333 3 1 1 88888 1 0 44 333 1 44 5 1 1 8888888 888888888 2 333 2 4 2 8888 2
lowQualScore : ..... ... .... .. . . ....... ... ................. . . . . . .... . . . ..... . . .. ... . .. . . . ....... ......... . ... . . . .... .
lowQualScore : 33333 333 3333 33 0 0 0000000 555 77777777777777777 7 7 5 2 1 9999 8 9 8 77777 8 4 55 333 7 55 5 6 8 1111111 000000000 2 999 2 4 4 8888 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNGATAT-----AATT---ATATA--TATATATATATC--TATATAGNTTCGTGTATGTATGTATATAC-GTATATATATATATATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATNAATGATGATAATGT--T-ANGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
Reference ( family-1633 ) : NNNNNNNNNNNNNNGATAT-----AATT---ATATA--TATATATATATC--TATATAATTTCTTG-------GTATATAC-GTATATATATATATATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATNAATGATGATAATGT--T-ANGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
gi|1 : AC-----AATA---ATATA--TATATATATATA--TATATA
gi|1 : aaaacagacctattaggcatttgttttcaaataaagaaaattttcaaattcaatttaaataatatttgttacacaaaaacagaacaaataaaATATAT-ATATATATATATATATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACACAAACAATACTGAATTCTTT----AAATCTATTTT-AAA-A-AA--AAACCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAA-TGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCtgggagagataataaattaattattaaaaattaattaatacacacaaacaatactgaattctttaaatctattttaaaaaaaaaccgagcgctttcggaatatatattattccttcttcaggggatgaaatgaaaatatgaatgatgataatgttatgatgtcaaacgattacgatgataaaaacatggaagtgtgaaaaaatcacaataaaaattaataaaattgtgaaaacgttcacaaattatgatgtgcgccttaaggc
gi|10 : aaaacagacctattaggcatttgttttcaaataaagaaaattttcaaattcaatttaaataatatttgttacacaaaaacagaacaaataaaacaataAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTT-AAA-A-AAC-C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAAGGGATG-AAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCG
gi|11 : TAACTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTTTAAA-A-AA--A--ACGAGCGCTTTCG-GAATATAT--TATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATGAATGACGATAATGT--T-ATGA-TGCCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAA-CATTGAAGTGTGG-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
gi|12 : AA-TAAATTAAT-ACACTCAAATAATACTGAATTCTTA----AAAAAGAATTT-AAA-A-AA--C--CTGAGCACTTACG-GAGTTTATATT---CCTTTTTCTGGGGTTGAAAATGGG-A---AAGATCAATAGTGAAAATGT--TTAAAA-TGTCAAATAAC---GATTATGA---------TGATAAAAATATGGAAGTATGA-TAAGATCACAA---T-AAAA-ATCAA-TAA----AATTGAGA-AAACGTTCACAAATTATGATGGGTGCCTTg
gi|13 : ACAATACTGAGTTCTTTTTTAAAAAATATTTT-AAA-A-A------CCGAGTGCTTTTG-GAATACAT--TATTCATTCTTCATGGAATGAAGGTAA--A---ACAATCAATAATGATAATGTC-T-AAAA-TGTCAAA---TAAAGAGTTTGG---------TAATGCAAACATGGAAGTGTGA-TAAAATCACAA---T-AAAA-A-AAA-TCAGGTGAATGGCGA-AAATGTTCACAAATTATGATGTACACAATCAGGCGC
gi|14 : GAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATTTATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATAA--A---AATATGAATGATGATAACGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-A
gi|15 : ACAATACTGATTCCTTT----AAAATTATTTA-AAA-A-AAA-CA-CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTGTTCCTTCTTCAGTGGATGATAATGA--A---AATATCAATGATGATAATGT--T-AAGG-TGTAAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTATGA-AAAAATAACAA---TAAAAA-ATTAA-TAG----AATTATAA-AAATGTTCACAA
gi|16 : -AA--C--CCGAGTGCTTTCG-AAATATAT--TAT------------GTATGAAAATGACCACTTGAGATCAATCAAGATAATGTGTT-AA-A-TGTCAAA---T---AAT---GA---------TGATAAAAACATGGGAG-ATGA-TAAAATCACAA---T-GAAATATCAA-GTG----AATTGTGA-AAACGTTCACAAAATATGATTTGCACCTTCAGACta
gi|17 : --CCAAGAACTTTTG-GAATATATATT-TT--TTCTTCAAGGGATGAAAATGA--A---AATATCAATAATGA--A-GT--T-AAAAATCTCAAA-------------------------GATAAAAACATGGAAGTATGA-AAAAATCACAA---C-AAAAAATTAA-TAG----AATTGTAA-AAACATTCACAAATTATGATGTGCACCTT
gi|18 : ATTAATCAA-TTCATTAAT-ACACCAAAACTATACTGAACTCTTT----GAAATTA-TTT-AAA-A-AA--C--CCGAGAGCTTTCG-GACTATA---TATTCCTTCTTC------------------------ATTAATGGTAAT-------------------AA---C---GATTACGA---------TGATAATAACACGtacg
gi|19 : cagGAGAGATAATAA-----------------G-TT-AATTATTAT-AAA-TGAGTTAAT-ACACGCAAACAATACCGATGTCTTT----AAAATTGTTAA-AAA-A-AAAAC--TTGATCACTTTCG-ACATATATATCATTCCTTCTTCAGGAGATGAACATGA--A---AATATCAATGATGATAATGT--T-AAGA-Tcttaacaccatacaaccacaacaacaacaac
gi|2 : GATATGTGCAAATTTAAATATA--TGTGTGTATACCGGTGTATAGGTTTGTGTATGTATGTATATAT-GTGTATATATATATATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTTTTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---AATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGCGGTGCGCCTTAAGGGGC
gi|20 : aataattattattaATA-ATATTTATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAAATCTTT----AAAAGTCTTTA-AAA-A-AA--C--TCGAGCACTTTCGAAAAAATATATTATT
gi|21 : attagacagatatataaagggagTATATATATATATATATGGGAGAGATAATAATTAATTATTTATTAAAAA-TTTAATTATTAA-AAA-TTTATTAAT-ACACCTAAACAATACTGAATTCTTT----CAAATTATTTA-AAC-A-AA--C--CCGAGTGCTTTCG-GA
gi|23 : -AAGA-TATATAA---C---AATTACGG---------TGATATAAACATTGAAATATGGTAACAAT-ACAAGGTT-AAA---TCAACTGG----AATTGTGT-AAACGTTCACAAAATATGACGCG
gi|24 : cGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--
gi|25 : --A---AAGATCAATAATGATAATGT--TCAAAA-TGTCAAATAAC---GATTAGGA---------TGATAAAA-CATGAAAGTATGA-TAAAATCACAA---T-TAAA-ATCAA-Taagtatattttaatttg
gi|26 : ATATACAGTGTATAAATATCTATATGGGACAGATAATAA-----------------A-TT-AATC-------AA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTG--TTCCTT----AAAATTAtgaa
gi|27 : -GAATATTTTTTATTCCTTCCTCAGGGGATGAAAATAT--A---AATATCAATGATGATATTGT--T-AAGA-T
gi|3 : aGATAT-----AATT---ATA--TATATATATATATC--TATATAATTTCTTG-------GTAAAT---GCAAAGACACATATATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAC-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGTGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATG---A---AATATGAGTGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCGAA---C---GATTATAA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGG-CAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAAGTGCtacg
gi|30 : tgtataattcctcggtaaatgtaaagacttCACCAAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-GAA-A-A
gi|4 : A-TTAATTTATTACACCGAAACAATACTGAATTCTTT----AAAAAGAAATT-AAA-A-AC--C--CCAAACGCTTTCG-GA--AGATACTATTCCTTATACAAGGGATGAAAATGA--G---A-----------GGTAATGT--TCACAA-TGTAAAA---CAAAGGTAACGACATTGTTGGTGATACAAACA
gi|5 : agacaaatttatgtatttattctaccaaacaatagatagctaacaaatgtatgttgtttcacagactgtttgaacaaatattaacaacaaaataaatagtgacttgagttatatttcacagaggtagagagcgattATATATATATATATATGGGAGAGATAATAA-----------------AATT-AATTATTAA-AAAATTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTA-AAATA-AA--C----AAGTGCTTTTG-GAATA-ATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAAT-----------ATAAATGATGACAATGT--T-AAGA-TATCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGATGTGTGG-AACAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AA
gi|6 : acacagcaatttatgactgatgcaagtgaaagaATATATATATATGG--GAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTTAAAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATG-AAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCCTAAGGCGatatatataaaata
gi|7 : TATAAATATGG-AGAGATAATAA-----------------C-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTTAT-ACATCCAAACAATACTGAATT-TTT----AAAATTATTAA-AAA-A-AA--A--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGG--A---AATATAAATGATGATAATGT--T-AAGA-TATCAAA---C---GATTATGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGG-AAATATCAGAG---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAATGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGC
gi|8 : gGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACTCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-AAAA--C--CCGAGCGCTTTCA-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATAA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTTG-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAAAT--AAT--TAATAAACGTTCACAGATTATGATGTGCGCCTTAAGGCG
gi|9 : ATATATATATAGCAGAAATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-AAACCTAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTA-TTT-AAA-A-AA--TA-AAAAGCGCTTTCG-AAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGAATAAAAATTA--A---AATATTAGTGATGATAATGT--T-AAGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGAAAAAAACATGGAAGTATGG-AAAAATCACAA---T-AAAA-AATAA-TA------------A-AAACGTTCACAAATTATGATGTG
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): TATATAGTTAGTACATGTATAATATATACACATATACACATATTATATGTTTGCACGTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGG
Unaligned ( gi|28 ): TAACCAATATTAGATTATTCATTATGTTGTATTGAATAAGTGTATGCTTCCCTTTAGTTTATATAGC
Unaligned ( gi|29 ): ATGATTAAAAATAAGAAATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Alignments
lowQualScore : 55555 333 11 1 1 1 11 11111111111111111
lowQualScore : 00000 555 88 4 3 2 0 00 2 3 88888888888888888 2 2 2 2 2 3333 3 1 1 88888 1 0 44 333 1 44 5 1 1 8888888 888888888 2 333 2 4 2 8888 2
lowQualScore : ..... ... .. . . . . .. . . ................. . . . . . .... . . . ..... . . .. ... . .. . . . ....... ......... . ... . . . .... .
lowQualScore : 00000 000 33 0 7 3 0 33 7 6 77777777777777777 7 7 5 2 1 9999 8 9 8 77777 8 4 55 333 7 55 5 6 8 1111111 000000000 2 999 2 4 4 8888 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNGATATGTGCAAATTTAAATATATGTGTGTATACC--TATATAG-TTCGTGCATGTAT-GTATATAC-GTATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATNAATGATGATAATGT--T-ANGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
Reference ( family-1633 ) : NNNNNNNNNNNNNNGATAT-----AATT---ATATATATATATATATC--TATATAGNTTCGTGTATGTAT-GTATATAC-GTATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATNAATGATGATAATGT--T-ANGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
gi|1 : ATATAT-ATATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACACAAACAATACTGAATTCTTT----AAATCTATTTT-AAA-A-AA--AAACCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAA-TGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGC
gi|10 : aaaacagacctattaggcatttgttttcaaataaagaaaattttcaaattcaatttaaataatatttgttacacaaaaacagaacaaataaaacaataAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTT-AAA-A-AAC-C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAAGGGATG-AAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCG
gi|11 : TAACTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTTTAAA-A-AA--A--ACGAGCGCTTTCG-GAATATAT--TATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATGAATGACGATAATGT--T-ATGA-TGCCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAA-CATTGAAGTGTGG-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
gi|12 : AA-TAAATTAAT-ACACTCAAATAATACTGAATTCTTA----AAAAAGAATTT-AAA-A-AA--C--CTGAGCACTTACG-GAGTTTATATT---CCTTTTTCTGGGGTTGAAAATGGG-A---AAGATCAATAGTGAAAATGT--TTAAAA-TGTCAAATAAC---GATTATGA---------TGATAAAAATATGGAAGTATGA-TAAGATCACAA---T-AAAA-ATCAA-TAA----AATTGAGA-AAACGTTCACAAATTATGATGGGTGCCTTg
gi|13 : ACAATACTGAGTTCTTTTTTAAAAAATATTTT-AAA-A-A------CCGAGTGCTTTTG-GAATACAT--TATTCATTCTTCATGGAATGAAGGTAA--A---ACAATCAATAATGATAATGTC-T-AAAA-TGTCAAA---TAAAGAGTTTGG---------TAATGCAAACATGGAAGTGTGA-TAAAATCACAA---T-AAAA-A-AAA-TCAGGTGAATGGCGA-AAATGTTCACAAATTATGATGTACACAATCAGGCGC
gi|14 : GAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATTTATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATAA--A---AATATGAATGATGATAACGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-A
gi|15 : ACAATACTGATTCCTTT----AAAATTATTTA-AAA-A-AAA-CA-CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTGTTCCTTCTTCAGTGGATGATAATGA--A---AATATCAATGATGATAATGT--T-AAGG-TGTAAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTATGA-AAAAATAACAA---TAAAAA-ATTAA-TAG----AATTATAA-AAATGTTCACAA
gi|16 : -AA--C--CCGAGTGCTTTCG-AAATATAT--TAT------------GTATGAAAATGACCACTTGAGATCAATCAAGATAATGTGTT-AA-A-TGTCAAA---T---AAT---GA---------TGATAAAAACATGGGAG-ATGA-TAAAATCACAA---T-GAAATATCAA-GTG----AATTGTGA-AAACGTTCACAAAATATGATTTGCACCTTCAGACta
gi|17 : --CCAAGAACTTTTG-GAATATATATT-TT--TTCTTCAAGGGATGAAAATGA--A---AATATCAATAATGA--A-GT--T-AAAAATCTCAAA-------------------------GATAAAAACATGGAAGTATGA-AAAAATCACAA---C-AAAAAATTAA-TAG----AATTGTAA-AAACATTCACAAATTATGATGTGCACCTT
gi|18 : ATTAATCAA-TTCATTAAT-ACACCAAAACTATACTGAACTCTTT----GAAATTA-TTT-AAA-A-AA--C--CCGAGAGCTTTCG-GACTATA---TATTCCTTCTTC------------------------ATTAATGGTAAT-------------------AA---C---GATTACGA---------TGATAATAACACGtacg
gi|19 : cagGAGAGATAATAA-----------------G-TT-AATTATTAT-AAA-TGAGTTAAT-ACACGCAAACAATACCGATGTCTTT----AAAATTGTTAA-AAA-A-AAAAC--TTGATCACTTTCG-ACATATATATCATTCCTTCTTCAGGAGATGAACATGA--A---AATATCAATGATGATAATGT--T-AAGA-Tcttaacaccatacaaccacaacaacaacaac
gi|2 : GATATGTGCAAATTTAAATATATGTGTGTATACCGGTGTATAGGTTTGTGTATGTAT-GTATATAT-GTGTATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTTTTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---AATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGCGGTGCGCCTTAAGGGGC
gi|20 : aataattattattaAT-ATATAAAG-GGAGATA---ATA-TTTATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAAATCTTT----AAAAGTCTTTA-AAA-A-AA--C--TCGAGCACTTTCGAAAAAATATATTATT
gi|21 : attagacagTATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAATTAATTATTTATTAAAAA-TTTAATTATTAA-AAA-TTTATTAAT-ACACCTAAACAATACTGAATTCTTT----CAAATTATTTA-AAC-A-AA--C--CCGAGTGCTTTCG-GA
gi|22 : --TATATAG-TTAGTACATGTATAATATATAC-ACATATACACATATTATATG
gi|23 : -AAGA-TATATAA---C---AATTACGG---------TGATATAAACATTGAAATATGGTAACAAT-ACAAGGTT-AAA---TCAACTGG----AATTGTGT-AAACGTTCACAAAATATGACGCGtttgcacgtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngg
gi|24 : cGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--
gi|25 : --A---AAGATCAATAATGATAATGT--TCAAAA-TGTCAAATAAC---GATTAGGA---------TGATAAAA-CATGAAAGTATGA-TAAAATCACAA---T-TAAA-ATCAA-Taagtatattttaatttg
gi|26 : ATATACAGTGTATAAATATC-TATATGGGACAGATAATAA-----------------A-TT-AATC-------AA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTG--TTCCTT----AAAATTAtgaa
gi|27 : -GAATATTTTTTATTCCTTCCTCAGGGGATGAAAATAT--A---AATATCAATGATGATATTGT--T-AAGA-T
gi|3 : aGATAT-----AATT---ATATATATATATATATC--TATATAATTTCTTG--------GTAAATGC---AAAGACACATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAC-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGTGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATG---A---AATATGAGTGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCGAA---C---GATTATAA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGG-CAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAAGTGCtacg
gi|30 : tgtataattcctcggtaaatgtaaagacttCACCAAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-GAA-A-A
gi|4 : A-TTAATTTATTACACCGAAACAATACTGAATTCTTT----AAAAAGAAATT-AAA-A-AC--C--CCAAACGCTTTCG-GA--AGATACTATTCCTTATACAAGGGATGAAAATGA--G---A-----------GGTAATGT--TCACAA-TGTAAAA---CAAAGGTAACGACATTGTTGGTGATACAAACA
gi|5 : agacaaatttatgtatttattctaccaaacaatagatagctaacaaatgtatgttgtttcacagactgtttgaacaaatattaacaacaaaataaatagtgacttgagttatatttcacagaggtagagagcgattATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------AATT-AATTATTAA-AAAATTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTA-AAATA-AA--C----AAGTGCTTTTG-GAATA-ATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAAT-----------ATAAATGATGACAATGT--T-AAGA-TATCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGATGTGTGG-AACAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AA
gi|6 : acacagcaatttatgactgatgcaagtgaaagaATATATA-TATATGG--GAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTTAAAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATG-AAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCCTAAGGCGatatatataaaata
gi|7 : TATA-AATATGG-AGAGATAATAA-----------------C-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTTAT-ACATCCAAACAATACTGAATT-TTT----AAAATTATTAA-AAA-A-AA--A--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGG--A---AATATAAATGATGATAATGT--T-AAGA-TATCAAA---C---GATTATGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGG-AAATATCAGAG---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAATGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGC
gi|8 : gGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACTCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-AAAA--C--CCGAGCGCTTTCA-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATAA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTTG-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAAAT--AAT--TAATAAACGTTCACAGATTATGATGTGCGCCTTAAGGCG
gi|9 : ATATA-TATATAGCAGAAATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-AAACCTAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTA-TTT-AAA-A-AA--TA-AAAAGCGCTTTCG-AAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGAATAAAAATTA--A---AATATTAGTGATGATAATGT--T-AAGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGAAAAAAACATGGAAGTATGG-AAAAATCACAA---T-AAAA-AATAA-TA------------A-AAACGTTCACAAATTATGATGTG
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): TAACCAATATTAGATTATTCATTATGTTGTATTGAATAAGTGTATGCTTCCCTTTAGTTTATATAGC
Unaligned ( gi|29 ): ATGATTAAAAATAAGAAATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Alignments
lowQualScore : 22222 222 11 1 11 1111 11 11111111111111111
lowQualScore : 66666 111 88 3 9 55 1111 00 2 3 88888888888888888 2 2 2 2 2 3333 3 1 1 88888 1 44 333 1 44 5 1 1 8888888 888888888 2 333 2 4 2 8888 2
lowQualScore : ..... ... .. . . .. .... .. . . ................. . . . . . .... . . . ..... . .. ... . .. . . . ....... ......... . ... . . . .... .
lowQualScore : 00000 555 33 3 0 77 3333 33 7 6 77777777777777777 7 7 5 2 1 9999 8 9 8 77777 8 55 333 7 55 5 6 8 1111111 000000000 2 999 2 4 4 8888 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNGATATGTGCAAATTTAAATATATGTGTGTATACC--TATATAG-TTTGTGCATGTAT-GTATATAC-GTATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATNAATGATGATAATGT--T-ANGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
Reference ( family-1633 ) : NNNNNNNNNNNNNNGATATGTGCAAATTTAAATATATGTGTGTATACC--TATATAG-TTCGTGCATGTAT-GTATATAC-GTATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATNAATGATGATAATGT--T-ANGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
gi|1 : ATATAT-ATATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACACAAACAATACTGAATTCTTT----AAATCTATTTT-AAA-A-AA--AAACCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAA-TGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGC
gi|10 : aaaacagacctattaggcatttgttttcaaataaagaaaattttcaaattcaatttaaataatatttgttacacaaaaacagaacaaataaaacaataAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTT-AAA-A-AAC-C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAAGGGATG-AAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCG
gi|11 : TAACTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTTTAAA-A-AA--A--ACGAGCGCTTTCG-GAATATAT--TATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATGAATGACGATAATGT--T-ATGA-TGCCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAA-CATTGAAGTGTGG-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
gi|12 : AA-TAAATTAAT-ACACTCAAATAATACTGAATTCTTA----AAAAAGAATTT-AAA-A-AA--C--CTGAGCACTTACG-GAGTTTATATT---CCTTTTTCTGGGGTTGAAAATGGG-A---AAGATCAATAGTGAAAATGT--TTAAAA-TGTCAAATAAC---GATTATGA---------TGATAAAAATATGGAAGTATGA-TAAGATCACAA---T-AAAA-ATCAA-TAA----AATTGAGA-AAACGTTCACAAATTATGATGGGTGCCTTg
gi|13 : ACAATACTGAGTTCTTTTTTAAAAAATATTTT-AAA-A-A------CCGAGTGCTTTTG-GA--ATACATTATTCATTCTTCATGGAATGAAGGTAA--A---ACAATCAATAATGATAATGTC-T-AAAA-TGTCAAA---TAAAGAGTTTGG---------TAATGCAAACATGGAAGTGTGA-TAAAATCACAA---T-AAAA-A-AAA-TCAGGTGAATGGCGA-AAATGTTCACAAATTATGATGTACACAATCAGGCGC
gi|14 : GAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATTTATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATAA--A---AATATGAATGATGATAACGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-A
gi|15 : ACAATACTGATTCCTTT----AAAATTATTTA-AAA-A-AAA-CA-CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTGTTCCTTCTTCAGTGGATGATAATGA--A---AATATCAATGATGATAATGT--T-AAGG-TGTAAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTATGA-AAAAATAACAA---TAAAAA-ATTAA-TAG----AATTATAA-AAATGTTCACAA
gi|16 : -AA--C--CCGAGTGCTTTCG-AAATATAT--TAT------------GTATGAAAATGACCACTTGAGATCAATCAAGATAATGTGTT-AA-A-TGTCAAA---T---AAT---GA---------TGATAAAAACATGGGAG-ATGA-TAAAATCACAA---T-GAAATATCAA-GTG----AATTGTGA-AAACGTTCACAAAATATGATTTGCACCTTCAGACta
gi|17 : --CCAAGAACTTTTG-GAATATATATT-TT--TTCTTCAAGGGATGAAAATGA--A---AATATCAATAATGA--A-GT--T-AAAAATCTCAAA-------------------------GATAAAAACATGGAAGTATGA-AAAAATCACAA---C-AAAAAATTAA-TAG----AATTGTAA-AAACATTCACAAATTATGATGTGCACCTT
gi|18 : ATTAATCAA-TTCATTAAT-ACACCAAAACTATACTGAACTCTTT----GAAATTA-TTT-AAA-A-AA--C--CCGAGAGCTTTCG-GACTATA---TATTCCTTCTTC------------------------ATTAATGGTAAT-------------------AA---C---GATTACGA---------TGATAATAACACGtacg
gi|19 : cagGAGAGATAATAA-----------------G-TT-AATTATTAT-AAA-TGAGTTAAT-ACACGCAAACAATACCGATGTCTTT----AAAATTGTTAA-AAA-A-AAAAC--TTGATCACTTTCG-ACATATATATCATTCCTTCTTCAGGAGATGAACATGA--A---AATATCAATGATGATAATGT--T-AAGA-Tcttaacaccatacaaccacaacaacaacaac
gi|2 : GATATGTGCAAATTTAAATATATGTGTGTATACCGGTGTATAGGTTTGTGTATGTAT-GTATATAT-GTGTATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTTTTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---AATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGCGGTGCGCCTTAAGGGGC
gi|20 : aataattattattaAT-ATATAAAG-GGAGATA---ATA-TTTATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAAATCTTT----AAAAGTCTTTA-AAA-A-AA--C--TCGAGCACTTTCGAAAAAATATATTATT
gi|21 : attagacagTATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAATTAATTATTTATTAAAAA-TTTAATTATTAA-AAA-TTTATTAAT-ACACCTAAACAATACTGAATTCTTT----CAAATTATTTA-AAC-A-AA--C--CCGAGTGCTTTCG-GA
gi|22 : --TATATAG-TTAGTACATGTATAATATATAC-ACATATACACATATTATATG
gi|23 : -AAGA-TATATAA---C---AATTACGG---------TGATATAAACATTGAAATATGGTAACAAT-ACAAGGTT-AAA---TCAACTGG----AATTGTGT-AAACGTTCACAAAATATGACGCGtttgcacgtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngg
gi|24 : cGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--
gi|25 : --A---AAGATCAATAATGATAATGT--TCAAAA-TGTCAAATAAC---GATTAGGA---------TGATAAAA-CATGAAAGTATGA-TAAAATCACAA---T-TAAA-ATCAA-Taagtatattttaatttg
gi|26 : ATATACAGTGTATAAATATC-TATATGGGACAGATAATAA-----------------A-TT-AATC-------AA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTG--TTCCTT----AAAATTAtgaa
gi|27 : -GAATATTTTTTATTCCTTCCTCAGGGGATGAAAATAT--A---AATATCAATGATGATATTGT--T-AAGA-T
gi|3 : aGATAT-----AATT---ATATATATATATATATC--TATATAA-TTTCT---TG----GTAAATGC---AAAGACACATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAC-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGTGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATG---A---AATATGAGTGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCGAA---C---GATTATAA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGG-CAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAAGTGCtacg
gi|30 : tgtataattcctcggtaaatgtaaagacttCACCAAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-GAA-A-A
gi|4 : A-TTAATTTATTACACCGAAACAATACTGAATTCTTT----AAAAAGAAATT-AAA-A-AC--C--CCAAACGCTTTCG-GA--AGATACTATTCCTTATACAAGGGATGAAAATGA--G---A-----------GGTAATGT--TCACAA-TGTAAAA---CAAAGGTAACGACATTGTTGGTGATACAAACA
gi|5 : agacaaatttatgtatttattctaccaaacaatagatagctaacaaatgtatgttgtttcacagactgtttgaacaaatattaacaacaaaataaatagtgacttgagttatatttcacagaggtagagagcgattATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------AATT-AATTATTAA-AAAATTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTA-AAATA-AA--C----AAGTGCTTTTG-GAATA-ATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAAT-----------ATAAATGATGACAATGT--T-AAGA-TATCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGATGTGTGG-AACAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AA
gi|6 : acacagcaatttatgactgatgcaagtgaaagaATATATA-TATATGG--GAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTTAAAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATG-AAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCCTAAGGCGatatatataaaata
gi|7 : TATA-AATATGG-AGAGATAATAA-----------------C-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTTAT-ACATCCAAACAATACTGAATT-TTT----AAAATTATTAA-AAA-A-AA--A--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGG--A---AATATAAATGATGATAATGT--T-AAGA-TATCAAA---C---GATTATGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGG-AAATATCAGAG---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAATGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGC
gi|8 : gGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACTCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-AAAA--C--CCGAGCGCTTTCA-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATAA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTTG-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAAAT--AAT--TAATAAACGTTCACAGATTATGATGTGCGCCTTAAGGCG
gi|9 : ATATA-TATATAGCAGAAATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-AAACCTAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTA-TTT-AAA-A-AA--TA-AAAAGCGCTTTCG-AAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGAATAAAAATTA--A---AATATTAGTGATGATAATGT--T-AAGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGAAAAAAACATGGAAGTATGG-AAAAATCACAA---T-AAAA-AATAA-TA------------A-AAACGTTCACAAATTATGATGTG
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): TAACCAATATTAGATTATTCATTATGTTGTATTGAATAAGTGTATGCTTCCCTTTAGTTTATATAGC
Unaligned ( gi|29 ): ATGATTAAAAATAAGAAATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Alignments
lowQualScore : 22222 222 11 1 11 1111 11 11111111111111111
lowQualScore : 66666 111 88 3 55 1111 00 2 3 88888888888888888 2 2 2 2 2 3333 3 1 1 88888 1 44 333 1 44 5 1 1 8888888 888888888 2 333 2 4 2 8888 2
lowQualScore : ..... ... .. . .. .... .. . . ................. . . . . . .... . . . ..... . .. ... . .. . . . ....... ......... . ... . . . .... .
lowQualScore : 00000 555 33 3 77 3333 33 7 6 77777777777777777 7 7 5 2 1 9999 8 9 8 77777 8 55 333 7 55 5 6 8 1111111 000000000 2 999 2 4 4 8888 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNGATATGTGCAAATTTAAATATATGTGTGTATACC--TATATAG-TTTGTGCATGTAT-GTATATAC-GTATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATNAATGATGATAATGT--T-ANGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
Reference ( family-1633 ) : NNNNNNNNNNNNNNGATATGTGCAAATTTAAATATATGTGTGTATACC--TATATAG-TTTGTGCATGTAT-GTATATAC-GTATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATNAATGATGATAATGT--T-ANGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
gi|1 : ATATAT-ATATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACACAAACAATACTGAATTCTTT----AAATCTATTTT-AAA-A-AA--AAACCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAA-TGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGC
gi|10 : aaaacagacctattaggcatttgttttcaaataaagaaaattttcaaattcaatttaaataatatttgttacacaaaaacagaacaaataaaacaataAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTT-AAA-A-AAC-C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAAGGGATG-AAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCG
gi|11 : TAACTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTTTAAA-A-AA--A--ACGAGCGCTTTCG-GAATATAT--TATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATGAATGACGATAATGT--T-ATGA-TGCCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAA-CATTGAAGTGTGG-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
gi|12 : AA-TAAATTAAT-ACACTCAAATAATACTGAATTCTTA----AAAAAGAATTT-AAA-A-AA--C--CTGAGCACTTACG-GAGTTTATATT---CCTTTTTCTGGGGTTGAAAATGGG-A---AAGATCAATAGTGAAAATGT--TTAAAA-TGTCAAATAAC---GATTATGA---------TGATAAAAATATGGAAGTATGA-TAAGATCACAA---T-AAAA-ATCAA-TAA----AATTGAGA-AAACGTTCACAAATTATGATGGGTGCCTTg
gi|13 : ACAATACTGAGTTCTTTTTTAAAAAATATTTT-AAA-A-A------CCGAGTGCTTTTG-GA--ATACATTATTCATTCTTCATGGAATGAAGGTAA--A---ACAATCAATAATGATAATGTC-T-AAAA-TGTCAAA---TAAAGAGTTTGG---------TAATGCAAACATGGAAGTGTGA-TAAAATCACAA---T-AAAA-A-AAA-TCAGGTGAATGGCGA-AAATGTTCACAAATTATGATGTACACAATCAGGCGC
gi|14 : GAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATTTATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATAA--A---AATATGAATGATGATAACGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-A
gi|15 : ACAATACTGATTCCTTT----AAAATTATTTA-AAA-A-AAA-CA-CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTGTTCCTTCTTCAGTGGATGATAATGA--A---AATATCAATGATGATAATGT--T-AAGG-TGTAAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTATGA-AAAAATAACAA---TAAAAA-ATTAA-TAG----AATTATAA-AAATGTTCACAA
gi|16 : -AA--C--CCGAGTGCTTTCG-AAATATAT--TAT------------GTATGAAAATGACCACTTGAGATCAATCAAGATAATGTGTT-AA-A-TGTCAAA---T---AAT---GA---------TGATAAAAACATGGGAG-ATGA-TAAAATCACAA---T-GAAATATCAA-GTG----AATTGTGA-AAACGTTCACAAAATATGATTTGCACCTTCAGACta
gi|17 : --CCAAGAACTTTTG-GAATATATATT-TT--TTCTTCAAGGGATGAAAATGA--A---AATATCAATAATGA--A-GT--T-AAAAATCTCAAA-------------------------GATAAAAACATGGAAGTATGA-AAAAATCACAA---C-AAAAAATTAA-TAG----AATTGTAA-AAACATTCACAAATTATGATGTGCACCTT
gi|18 : ATTAATCAA-TTCATTAAT-ACACCAAAACTATACTGAACTCTTT----GAAATTA-TTT-AAA-A-AA--C--CCGAGAGCTTTCG-GACTATA---TATTCCTTCTTC------------------------ATTAATGGTAAT-------------------AA---C---GATTACGA---------TGATAATAACACGtacg
gi|19 : cagGAGAGATAATAA-----------------G-TT-AATTATTAT-AAA-TGAGTTAAT-ACACGCAAACAATACCGATGTCTTT----AAAATTGTTAA-AAA-A-AAAAC--TTGATCACTTTCG-ACATATATATCATTCCTTCTTCAGGAGATGAACATGA--A---AATATCAATGATGATAATGT--T-AAGA-Tcttaacaccatacaaccacaacaacaacaac
gi|2 : GATATGTGCAAATTTAAATATATGTGTGTATACCGGTGTATAGGTTTGTGTATGTAT-GTATATAT-GTGTATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTTTTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---AATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGCGGTGCGCCTTAAGGGGC
gi|20 : aataattattattaAT-ATATAAAG-GGAGATA---ATA-TTTATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAAATCTTT----AAAAGTCTTTA-AAA-A-AA--C--TCGAGCACTTTCGAAAAAATATATTATT
gi|21 : attagacagTATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAATTAATTATTTATTAAAAA-TTTAATTATTAA-AAA-TTTATTAAT-ACACCTAAACAATACTGAATTCTTT----CAAATTATTTA-AAC-A-AA--C--CCGAGTGCTTTCG-GA
gi|22 : --TATATAG-TTAGTACATGTATAATATATAC-ACATATACACATATTATATG
gi|23 : -AAGA-TATATAA---C---AATTACGG---------TGATATAAACATTGAAATATGGTAACAAT-ACAAGGTT-AAA---TCAACTGG----AATTGTGT-AAACGTTCACAAAATATGACGCGtttgcacgtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngg
gi|24 : cGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--
gi|25 : --A---AAGATCAATAATGATAATGT--TCAAAA-TGTCAAATAAC---GATTAGGA---------TGATAAAA-CATGAAAGTATGA-TAAAATCACAA---T-TAAA-ATCAA-Taagtatattttaatttg
gi|26 : ATATACAGTGTATAAATATC-TATATGGGACAGATAATAA-----------------A-TT-AATC-------AA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTG--TTCCTT----AAAATTAtgaa
gi|27 : -GAATATTTTTTATTCCTTCCTCAGGGGATGAAAATAT--A---AATATCAATGATGATATTGT--T-AAGA-T
gi|3 : aGATAT-----AATT---ATATATATATATATATC--TATATAA-TTTCT---TG----GTAAATGC---AAAGACACATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAC-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGTGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATG---A---AATATGAGTGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCGAA---C---GATTATAA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGG-CAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAAGTGCtacg
gi|30 : tgtataattcctcggtaaatgtaaagacttCACCAAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-GAA-A-A
gi|4 : A-TTAATTTATTACACCGAAACAATACTGAATTCTTT----AAAAAGAAATT-AAA-A-AC--C--CCAAACGCTTTCG-GA--AGATACTATTCCTTATACAAGGGATGAAAATGA--G---A-----------GGTAATGT--TCACAA-TGTAAAA---CAAAGGTAACGACATTGTTGGTGATACAAACA
gi|5 : agacaaatttatgtatttattctaccaaacaatagatagctaacaaatgtatgttgtttcacagactgtttgaacaaatattaacaacaaaataaatagtgacttgagttatatttcacagaggtagagagcgattATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------AATT-AATTATTAA-AAAATTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTA-AAATA-AA--C----AAGTGCTTTTG-GAATA-ATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAAT-----------ATAAATGATGACAATGT--T-AAGA-TATCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGATGTGTGG-AACAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AA
gi|6 : acacagcaatttatgactgatgcaagtgaaagaATATATA-TATATGG--GAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTTAAAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATG-AAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCCTAAGGCGatatatataaaata
gi|7 : TATA-AATATGG-AGAGATAATAA-----------------C-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTTAT-ACATCCAAACAATACTGAATT-TTT----AAAATTATTAA-AAA-A-AA--A--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGG--A---AATATAAATGATGATAATGT--T-AAGA-TATCAAA---C---GATTATGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGG-AAATATCAGAG---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAATGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGC
gi|8 : gGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACTCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-AAAA--C--CCGAGCGCTTTCA-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATAA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTTG-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAAAT--AAT--TAATAAACGTTCACAGATTATGATGTGCGCCTTAAGGCG
gi|9 : ATATA-TATATAGCAGAAATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-AAACCTAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTA-TTT-AAA-A-AA--TA-AAAAGCGCTTTCG-AAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGAATAAAAATTA--A---AATATTAGTGATGATAATGT--T-AAGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGAAAAAAACATGGAAGTATGG-AAAAATCACAA---T-AAAA-AATAA-TA------------A-AAACGTTCACAAATTATGATGTG
blockSeqs : . . . . AC TATA AG T T TTAATTATTTATTAAAA A T T A T TTTA T T A ACA A CC CTT G GT T T A TAAC CATTGTTGG T GGT A T C GGTG T
blockSeqs : . . . . G T . . . . . . . . A . . AAC . G . G C C T . TAAA . . . . A . AT .
blockSeqs : G C . . . . . . . . . . . CC . . . C . C A . TAAC . . . . . . . .
blockSeqs : A A . . . . . . . . . . . TA . . . C . . A . CAAA . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . . . . . . A . . . G . . T . C . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . C . . . C . . A . C . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . C . . . C . . A . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . C . . A . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . T . . A . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . C . . T . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . G . . A . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . C . . A . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . C . . A . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . G . . T . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . A . . C . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . G . . A . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . A . . T . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . G . . A . C .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : C****
originalCons : NNNNNNNNNNNNNNGATATGTGCAAATTTAAATATATGTGTGTATACC--TATATAG-TTTGTGCATGTAT-GTATATAC-GTATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATNAATGATGATAATGT--T-ANGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
finalCons : NNNNNNNNNNNNNNGATATGTGCAAATTTAAATATATGTGTGTATACC--TATATAG-TTTGTGCATGTAT-GTATATAC-GTATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AAC----CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATNAATGATGATAATGT--T-ANGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): TAACCAATATTAGATTATTCATTATGTTGTATTGAATAAGTGTATGCTTCCCTTTAGTTTATATAGC
Unaligned ( gi|29 ): ATGATTAAAAATAAGAAATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Alignments
lowQualScore : 22222 222 11 1 11 1111 11 11111111111111111
lowQualScore : 66666 111 88 3 55 1111 00 2 3 88888888888888888 2 2 2 2 2 3333 3 1 1 88888 1 44 333 1 44 5 1 1 8888888 888888888 2 333 2 4 2 8888 2
lowQualScore : ..... ... .. . .. .... .. . . ................. . . . . . .... . . . ..... . .. ... . .. . . . ....... ......... . ... . . . .... .
lowQualScore : 00000 555 33 3 77 3333 33 7 6 77777777777777777 7 7 5 2 1 9999 8 9 8 77777 8 55 333 7 55 5 6 8 1111111 000000000 2 999 2 4 4 8888 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNGATATGTGCAAATTTAAATATATGTGTGTATACC--TATATAG-TTTGTGCATGTAT-GTATATAC-GTATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATNAATGATGATAATGT--T-ANGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
Reference ( family-1633 ) : NNNNNNNNNNNNNNGATATGTGCAAATTTAAATATATGTGTGTATACC--TATATAG-TTTGTGCATGTAT-GTATATAC-GTATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATNAATGATGATAATGT--T-ANGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
gi|1 : ATATAT-ATATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACACAAACAATACTGAATTCTTT----AAATCTATTTT-AAA-A-AA--AAACCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAA-TGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGC
gi|10 : aaaacagacctattaggcatttgttttcaaataaagaaaattttcaaattcaatttaaataatatttgttacacaaaaacagaacaaataaaacaataAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTT-AAA-A-AAC-C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAAGGGATG-AAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCG
gi|11 : TAACTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTTTAAA-A-AA--A--ACGAGCGCTTTCG-GAATATAT--TATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATGAATGACGATAATGT--T-ATGA-TGCCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAA-CATTGAAGTGTGG-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGCGC
gi|12 : AA-TAAATTAAT-ACACTCAAATAATACTGAATTCTTA----AAAAAGAATTT-AAA-A-AA--C--CTGAGCACTTACG-GAGTTTATATT---CCTTTTTCTGGGGTTGAAAATGGG-A---AAGATCAATAGTGAAAATGT--TTAAAA-TGTCAAATAAC---GATTATGA---------TGATAAAAATATGGAAGTATGA-TAAGATCACAA---T-AAAA-ATCAA-TAA----AATTGAGA-AAACGTTCACAAATTATGATGGGTGCCTTg
gi|13 : ACAATACTGAGTTCTTTTTTAAAAAATATTTT-AAA-A-A------CCGAGTGCTTTTG-GA--ATACATTATTCATTCTTCATGGAATGAAGGTAA--A---ACAATCAATAATGATAATGTC-T-AAAA-TGTCAAA---TAAAGAGTTTGG---------TAATGCAAACATGGAAGTGTGA-TAAAATCACAA---T-AAAA-A-AAA-TCAGGTGAATGGCGA-AAATGTTCACAAATTATGATGTACACAATCAGGCGC
gi|14 : GAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATTTATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATAA--A---AATATGAATGATGATAACGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-A
gi|15 : ACAATACTGATTCCTTT----AAAATTATTTA-AAA-A-AAA-CA-CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTGTTCCTTCTTCAGTGGATGATAATGA--A---AATATCAATGATGATAATGT--T-AAGG-TGTAAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTATGA-AAAAATAACAA---TAAAAA-ATTAA-TAG----AATTATAA-AAATGTTCACAA
gi|16 : -AA--C--CCGAGTGCTTTCG-AAATATAT--TAT------------GTATGAAAATGACCACTTGAGATCAATCAAGATAATGTGTT-AA-A-TGTCAAA---T---AAT---GA---------TGATAAAAACATGGGAG-ATGA-TAAAATCACAA---T-GAAATATCAA-GTG----AATTGTGA-AAACGTTCACAAAATATGATTTGCACCTTCAGACta
gi|17 : --CCAAGAACTTTTG-GAATATATATT-TT--TTCTTCAAGGGATGAAAATGA--A---AATATCAATAATGA--A-GT--T-AAAAATCTCAAA-------------------------GATAAAAACATGGAAGTATGA-AAAAATCACAA---C-AAAAAATTAA-TAG----AATTGTAA-AAACATTCACAAATTATGATGTGCACCTT
gi|18 : ATTAATCAA-TTCATTAAT-ACACCAAAACTATACTGAACTCTTT----GAAATTA-TTT-AAA-A-AA--C--CCGAGAGCTTTCG-GACTATA---TATTCCTTCTTC------------------------ATTAATGGTAAT-------------------AA---C---GATTACGA---------TGATAATAACACGtacg
gi|19 : cagGAGAGATAATAA-----------------G-TT-AATTATTAT-AAA-TGAGTTAAT-ACACGCAAACAATACCGATGTCTTT----AAAATTGTTAA-AAA-A-AAAAC--TTGATCACTTTCG-ACATATATATCATTCCTTCTTCAGGAGATGAACATGA--A---AATATCAATGATGATAATGT--T-AAGA-Tcttaacaccatacaaccacaacaacaacaac
gi|2 : GATATGTGCAAATTTAAATATATGTGTGTATACCGGTGTATAGGTTTGTGTATGTAT-GTATATAT-GTGTATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTTTTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---AATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGCGGTGCGCCTTAAGGGGC
gi|20 : aataattattattaAT-ATATAAAG-GGAGATA---ATA-TTTATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAAATCTTT----AAAAGTCTTTA-AAA-A-AA--C--TCGAGCACTTTCGAAAAAATATATTATT
gi|21 : attagacagTATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAATTAATTATTTATTAAAAA-TTTAATTATTAA-AAA-TTTATTAAT-ACACCTAAACAATACTGAATTCTTT----CAAATTATTTA-AAC-A-AA--C--CCGAGTGCTTTCG-GA
gi|22 : --TATATAG-TTAGTACATGTATAATATATAC-ACATATACACATATTATATG
gi|23 : -AAGA-TATATAA---C---AATTACGG---------TGATATAAACATTGAAATATGGTAACAAT-ACAAGGTT-AAA---TCAACTGG----AATTGTGT-AAACGTTCACAAAATATGACGCGtttgcacgtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngg
gi|24 : cGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--
gi|25 : --A---AAGATCAATAATGATAATGT--TCAAAA-TGTCAAATAAC---GATTAGGA---------TGATAAAA-CATGAAAGTATGA-TAAAATCACAA---T-TAAA-ATCAA-Taagtatattttaatttg
gi|26 : ATATACAGTGTATAAATATC-TATATGGGACAGATAATAA-----------------A-TT-AATC-------AA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTG--TTCCTT----AAAATTAtgaa
gi|27 : -GAATATTTTTTATTCCTTCCTCAGGGGATGAAAATAT--A---AATATCAATGATGATATTGT--T-AAGA-T
gi|3 : aGATAT-----AATT---ATATATATATATATATC--TATATAA-TTTCT---TG----GTAAATGC---AAAGACACATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAC-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-A-AA--C--CCGAGTGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATG---A---AATATGAGTGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCGAA---C---GATTATAA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGG-CAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAAGTGCtacg
gi|30 : tgtataattcctcggtaaatgtaaagacttCACCAAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-GAA-A-A
gi|4 : A-TTAATTTATTACACCGAAACAATACTGAATTCTTT----AAAAAGAAATT-AAA-A-AC--C--CCAAACGCTTTCG-GA--AGATACTATTCCTTATACAAGGGATGAAAATGA--G---A-----------GGTAATGT--TCACAA-TGTAAAA---CAAAGGTAACGACATTGTTGGTGATACAAACA
gi|5 : agacaaatttatgtatttattctaccaaacaatagatagctaacaaatgtatgttgtttcacagactgtttgaacaaatattaacaacaaaataaatagtgacttgagttatatttcacagaggtagagagcgattATATATATATA-TATATGGGAGAGATAATAA-----------------AATT-AATTATTAA-AAAATTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTA-AAATA-AA--C----AAGTGCTTTTG-GAATA-ATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAAT-----------ATAAATGATGACAATGT--T-AAGA-TATCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGATGTGTGG-AACAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AA
gi|6 : acacagcaatttatgactgatgcaagtgaaagaATATATA-TATATGG--GAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACCCAAACAATACTGAATTCTTT----AAATTTATTTTAAAA-A-AA--C--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATG-AAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGA-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAACGTTCACAAATTATGATGTGCGCCCTAAGGCGatatatataaaata
gi|7 : TATA-AATATGG-AGAGATAATAA-----------------C-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTTAT-ACATCCAAACAATACTGAATT-TTT----AAAATTATTAA-AAA-A-AA--A--CCGAGCGCTTTCG-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGG--A---AATATAAATGATGATAATGT--T-AAGA-TATCAAA---C---GATTATGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTGG-AAATATCAGAG---T-AAAA-ATTAA-TAA----AATTGTGA-AAATGTTCACAAATTATGATGTGCGCCTTAAGGC
gi|8 : gGAGAGATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-ACACTCAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTATTTT-AAA-AAAA--C--CCGAGCGCTTTCA-GAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGGATGAAAATGA--A---AATATGAATGATGATAATGT--T-ATAA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGATAAAAACATGGAAGTGTTG-AAAAATCACAA---T-AAAA-ATTAA-TAAAT--AAT--TAATAAACGTTCACAGATTATGATGTGCGCCTTAAGGCG
gi|9 : ATATA-TATATAGCAGAAATAATAA-----------------A-TT-AATTATTAA-AAA-TTAATTAAT-AAACCTAAACAATACTGAATTCTTT----AAAATTA-TTT-AAA-A-AA--TA-AAAAGCGCTTTCG-AAATATATATTATTCCTTCTTCAGGGAATAAAAATTA--A---AATATTAGTGATGATAATGT--T-AAGA-TGTCAAA---C---GATTACGA---------TGAAAAAAACATGGAAGTATGG-AAAAATCACAA---T-AAAA-AATAA-TA------------A-AAACGTTCACAAATTATGATGTG
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): TAACCAATATTAGATTATTCATTATGTTGTATTGAATAAGTGTATGCTTCCCTTTAGTTTATATAGC
Unaligned ( gi|29 ): ATGATTAAAAATAAGAAATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG