lowQualScore : 222222 1111111 1111111111111111 7777777777777777777777777777777777777777777777 3333333333333333 111111 111111111111111111111111 2222 11 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11111111111 22222222 11 11111 222222222222222 11111 22222222 11 1
lowQualScore : 0 666666 1 4 2 1 0000000 22 999999 1 1 6666666666666666 1 1 22 1111111111111111111111111111111111111111111111 444444 2 222 222 5555555555555555 6 22 1 777777 3333 111111111111111111111111 4 444444 1 9 4 777 88 3 5555 00 2 44 9999999999999999 888888 222 1 1 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 8888 22 5 222 22 22222222222 00000000 22 4 3 55 2 1 1 222 22 444444 44444 22 1 1 33333 1 22 8888888 2222 3333 1 000000000000000 3 1 22 55 222 77777 1 55 333 22 99999 1 22 22 888888888888888 44444444 22 22 88 5 4
lowQualScore : . ...... . . . . ....... .. ...... . . ................ . . .. .............................................. ...... . ... ... ................ . .. . ...... .... ........................ . ...... . . . ... .. . .... .. . .. ................ ...... ... . . ............................................................................................................................................. . .... .. . ... .. ........... ........ .. . . .. . . . ... .. ...... ..... .. . . ..... . .. ....... .... .... . ............... . . .. .. ... ..... . .. ... .. ..... . .. .. ............... ........ .. .. .. . .
lowQualScore : 4 444444 1 6 8 0 4444444 44 000000 9 5 2222222222222222 5 5 11 8888888888888888888888888888888888888888888888 666666 7 777 777 2222222222222222 5 00 6 555555 1111 333333333333333333333333 8 333333 4 7 7 888 44 8 5555 88 9 00 5555555555555555 777777 666 5 5 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5 8888 00 5 555 00 11111111111 11111111 00 1 4 00 9 4 4 555 00 111111 66666 00 5 5 77777 4 00 0000000 9999 0000 4 666666666666666 4 6 33 88 999 33333 5 00 222 55 66666 9 66 66 333333333333333 99999999 66 88 22 4 3
consensus : CCCGTAA-C-ATTATCAGGAGTACCGCAATGAAGTCTTTCTCCT-C---C-G--AAA------CAGCATTCAAAC-A----------CC----C-A-ATT--T------G--TT---C-T------G-----C-----T----------GG------TTTGGT---G---AAT------C-C--AA--GAGATAC--TGCCG-----TCTC----TT---------------GT-A----TAANA------CCTG-CCATGGTCAGCAC--TATTTCCG-GTACGAAAAATGGTTC-AG-GGC-GA----------------AGTT--TAT-AT---GTT-TGT-T---N--A-----T--------TC-A------TAAAC---TA--T--A--T-AAT------A---TTT--A-GAA--A--T-----A------T--A---T--AT-C---TTTA--T-------T--TC----AAA--ATATT-TAC---GTG--AAGTT---TA--T-------T---AAC------ATTT--A-TTTCAA-GGAA-A-T-G---T--G------AAATAA---G-AGA--CAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TTAAAA--TA------GT----C----C-ATGCCTTCT-----AA----CCGCCCCGCGC-TATAAT--AA-CTA---ACCAAAAT----CGGTT--A---GTG--AG--G--T-G--T--CTAAGCAC--------A------CAGATCAAT---CGG--AGCT--AGTGACGTCATCTGGGGGAACACAT
Reference ( gi|3 ) : CCTGTAA-A-ATTATCAGGAATACCACAATGAAGTCTTTTTCCT-T---C-G--AAA------CAGCATTCAAAC-A----------TC----C-A-ATT--T------A--CT---T-T------G-----C-----C----------GG------TTTGAT---G---AAT------C-C--GT--TAGGTAC--TGTCC-----TCTC----TT---------------GT-A----TAATA------CCTG-CCATGGTGAACAT--TATTTCCA-GTACGAAAAACAGTTA-AG-GGC-AA----------------AGTT--TGT-AT---GTT-TGT-T---T--G-----T--------TC-A------TAAGT---TA--T--G--T-TAT------A---TTT--A-AAA--A--T-----G------T--A---T--AT-C---TTTA--T--GGAATT--TC----AAA--ATCGT-TAC---CTG--AAATT---TA--T-------C---AAT------TCTT--A-TTTTAA-TGAA-A-T-G---T--G------AAATAA---T-AGA--CAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TTAAAA--TA------AT----C----C-ATGCCTTCT-----TA----CTGCCCCGCAC-TATAAT--AA-TTA---ACCAAAAT----TGGTT--A---GTG--AG--T--T-G--T--CTAAGCAC--------A------CAGATCGTT---CAG--AGCT--AGTGACAACATTTAGGGAAACACAT
gi|20 : CCCGTAA-C-AGTATCAGGAATATCGAAATGAAGTATTTC-CCG-C---C-G--GAA------CAGCATTCAAAC-T----------AA----C-A-ATT--T------A--CT---A-T------T-----C-----TTAAGT-----GG------TATGAT---G---A-T------C-C--AT--TACATAG--TGTCG-----TCTC----TT---------------GC-A-----AA------------------GTGAGCAT--TATTTCAT-GTACGAAAATTGGTAC-AG-GGCGAA----------------AGTT--TAT-AT---GTT-GGT-T---T--G-----T--------TA-AAATTCTTAAAC---TA--T--A--T-AAT------A---TTT--A-GAA--A--T-----A------T--A---T--AT------TTA--T----------TC----AAA---TTATATAC---TTG--AAGTT---TA--T-------C---AATATTAAATTTT--A-TTTTAA-GGAA-A-G-G---T--A------AAATAA---G-AGA--CAAT
gi|8 : ttttCCTGTAACA-A--ATCACGAGTACCACAATGAAGTCTTTCTCTT-C---T-T--AAA------TGTCATTCAAA-------------------T-A-ATT--T------G--TTC--T-T------G-----TTTAAGT----------GG------TTTAGT---G---AAT------C-C--AA--CAGATAG--TG--------------------------------------------------------------GTCAACAA--TATTTCTG-GTAC-AAAAATGATTC-TT-GGC-AA----------------AGTT--TGT-AT---GTT-TGT-T------------------------A------AAATT---CA--A--GAAC-TAT------A-----T--A-GAACTA--T-----A------T--A---T--AT-A---TTTA----------T--TC----AAA--ATATT-TAG---CT---ATGTT---TA--T-------T---GAC------ATTT--A-CTTCAA-GGAA-A-T-G---T--G------AAATAT---G-AGA--CAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TT-GAA--TA------GT----C-------TGACTTCT-----AA----CCATCAGGCGT-TATAAT--TA-CTA---ATTGAAAT----CTGTT--A---GTGGTAG--TGCTAG--T--TTGAGAACAAATAAAAA------CAAAGCGC---------AGCT--AGTGATGTCATCTGAGGAAAgt
gi|28 : ttcCCCGTAA-C-ATTACCAGGAACATCTCAATAAAGTTTTGCTCCT-C---C-G--AAT------CAGCATTCAAAC-A----------TC----T-A-ATT--T------A--CC---C-T------G-----C-----T----------CA------TGTGAT---G---------------------T-GATGA--TGTCG-----TCTC----TT---------------GC-AACGCGAATA------CCTG-ACATAGCGAGCAT--TATTTCCG-GTACGAAAAA---TTG-A--------------------------------T-AG---GTT-TGT-T---T--G-----T------------------TAATT---TA--T--A--T-AAT------A---T
gi|50 : ttttCCCGTAACA-A--GTCAGGAGTACGGCCATGAAGTGTTTATCCT-C---T-A--CGA------CAGCATTCAAAC-A----------
gi|9 : tgttCTGTAACA-A--GTCAGGAGTACCGCAATGAAGTCTTTCTCCT-C---T-G--A-----------CATTCAATTTG----------TC----C-----T--T------A--TT---T-A------A-----G-----T----------GG------TTTAAT---G---AAT------C-G--AA--GAGATAG--TGCCG-----TCTC----TT---------------TC-A----GAAAA------CTTG-TCATGGTCAGCAAAATATTTCCG-GTATGAAAA-TGGTTT--G-GGC-GG----------------AGTT--TAT-AT---GTT-TGT-T---A--AAA---T--------TC-A------CAAAC---TA--T--A--T-ACT------A---TTT--A-GAA--A--T-----A------TCTA---T--AT-T---TTTA--T----------TC----CAA--ATATT-TAG---G-G--AAGTT---TA--T-------T---AAC------ATTT--A-TTTCAA-AGAA-A-T-G---T--G------CAATAA---G-ACA--CAATTTATGAGCATATT----------------------------------------------TTCT-----AA----CCACTCTGCGT-TATAGT--AA-CTA---GCCAAAAT----TGGTT--A---GTG--AT--G--T-G--T--CTAATTAC--------A------CAGATC--------A--AAC---AGTGATGTCATCTGGGGAAATACctc
gi|21 : gcttttCCGTAA-C-AT-GTCAGGTGTACCATATAAAAGCCCTTTTTTT-TGGAT-G--AAA------CAGCATT--AAG-A----------TC----CCA-ATT--T------G--TT---T-T--------------------------------------------------AAT---------------TAAGTGT--TTTTTGTGAATCAC----TT---------------TT-A----GAAAA------TCTG-CCATGGTCAGCAA--TATT------TACGAAAAA-GGTTC-AG-AGT-AA----------------AGTT----T-AT---GTT-TGTGT---T--AAAC--T--------TC-A------TGAAC---TA--T--A--T-ACT------G---TTT--A-GAA--A--T-----A------G--A---T--AT-A---TTTA----------T--TC----AAACCAT--T-TAC---CTG--AAGTG---TA--T-------T---AAC------ATTT--A-TT
gi|30 : tattttCTGTAG-C-AT-GTTAGGTGTACCGTTATAAAGCCCCTTTTCT-A---T-G--AAA------CAGCATTAAAGC-A----------CC----C-A-ATT--T------G--TT---C-TAATTAAG-----T----------------GT------TTTGCT---G---AAT------C-C--AA--TA-------TGTCG-----TCAC----TT---------------TTTA----AAAAA------TCTG-CCATTGTCAGCAA--TATT---A---ACGAAAAA-GGTTA-AG-TTT-GA----------------AGTC--TATGAT----TT-TGT-T---cacaggatcagtctgagctttttaagtcaa
gi|42 : ttCCGTAA-C-ATTATCAGGAATACa
gi|18 : ccttttTAA-C-GTTATCAGGAATATCACAATTAGGTCTTTCTCCT-C---C-CCCAAA------CAGCATTCAAAC-A----------CC----C-A-ATT--T------A--CT---C-T------G-----C-----TTAAAT-----GG------CTTGAA---G---ATT------A-T--AT--TAGATAC--TGTCA-----TCTC----TA---------------GC-A----TGATA------CCTG-CCACGGTGAGCAT--TATTTACG-GTAC-AGAAATGGTTC-AG-GGC-GA----------------AGTA--TAT-AT---ATT-TGT---------------------------------TAAAA---TA--C--A--T-AAT------A---TTT--G-GAA--A--T-----A------T--A---T--A------TTCA--TC-CAAATT--AC----A----------TAC---CTG--AAGTT---TA--T-------A---AGTA-----TCTT--A-----AA-AGAA-A-T-G---T--GAAAAAAAAAAAA---G-AGA--CAATTTATGAGCATagtaatcgaggaattagatagttccttgccgcagtgaagtatgtctcctacgaaacagcattcaaacacctcatttactctgcttt
gi|44 : aacttccccccTAA-ACATTTTCAGGAATACCGCAGTGAGGTGTTTCTCCT-C---C-G--AAA------CAGCATTC-AAC-G----------CC----C-A-ATT--T------A--CT---C-T------G-----C-----
gi|10 : aacctttggc-ATTATCAGGATTACTGCAATGACATCTTTCTCCT-C---T-G--AAA------CAGCAGTCAAAC-T----------CT----C-A-ATT--T------A--CT---T-A------A-----A-----T----------GG------TTTGAT---A---AAT------C-C--AT--CAGTTAC--TGTCG-----TCTC----TT---------------GT-A----TAACA------CCTT-CCACGGTGAGTAT--TAGTTCCA-GTACAA-----AGGTACAG-GGC-AA----------------AGTT--TAT-AT---GTT-TGT-T---T--G-----T--------TA-A-------AATT---CA--TCAA--C-TAT------A----------------------------------A---T--A-------TTA--A--GGAAT--------------AT--T-TCC---CTG----GTT---TA--C-------C---AAC------ATCT--A-TTTTAA-GGAA-A-T-G---A--G------AAAT-A---T----------------GCACATT-T-T-----TA-TTAAAT--CA------GT----C----G-TTGCCTTCT-----AA----C-GCAGCGTGT-TATAAT--AA-CTA---A-CATAAC----TGGTT--G---GTG--AG-----T-G--T--CTATGAAT--------A------CCAATCAAT---CGG--AGCT--AGTGACATCATCT-GGGGAACACATtatatactgttgg
gi|4 : cccTCAGGAGTACTGCAATTAAGTAATTCTGCT-T---T-G--AAA------TAGTATTCAAAC-A----------CT----C-A-ATT--TGTTCTAA--TT---T-A------A-----G-----T----------GG------TTTGTT---G---AAT------A-C--AA--GAGTTGA--CGCCG-----TCTC----TT---------------GT-A----TACAA------CCTG-CCATTGTCAACAC--TATTTTTTTGTAAGAAAA-TGATTC-TT-GTC-AA----------------AGTT--TAT-AT---ACT-TGT-T---A--AAA---T--------TC-A------TTAAC---TA--T--A--T-CAT------A---TTT--A-TAC--A--T-----A------T--A---T--AT-C---TTTA--T--G--------C----AGA--ATATT-TAC---GAG--AAGGT---TATTT-------T---AAC------TTTT--A-TTTCAA-T------T------------------------T-AGA--CAATTTATAAGCATATC-TACCGGTATG-TTAAAA--TA------GC----C----C-ATGCTGTCT-----CA----CCACCCTGCG--TAAATT--AA-CTA---ACCGAAAT----CAGTA--A---GTG--AG--G--T-G--A--CCAAGGAC--------G------AAGA---TT---AAACCAGCT--AGTGATGTTATCTGGGGAAACACAT
gi|7 : ttacagtagcaagTCAGGAGCACCGCCA----GTCTTTTTTCT-C---C-G--AAA------TGACATTCAAGC-A----------CA----C-A-ATT--TGTCCT-A--CT---T-T------AA----T-----C----------AG------TTTTGTTAAA---AAT------A-A--G----AGATAC--TGCCA-----TTTC----CT---------------TT-A----TAATA------CCTG-CCATTGC-AGCTC--TATTTTCT-ATACGAAATA---TTG-AA-GGT-GA----------------AGT------------GTT-TGT-T---A--AAA---T--------TC-A------TGAAC---TA--C--A--T-GAC------A---TTC--A-GAA--A--T-----G------T--G---T----------TTA--T--G-------------------T--T-TAC---GTG--AAGTT---TA--TTAACAAAC---AAT------TTTT--A-----AA-GAAA-A-T-G---T--G------ATATAA---G-AGA--CAATTTAT-AGCATATT-T-C-----TA-TTCAAA--TACTAATTGT----C----C-ATGCCTTCT-----AA----CCGCCTCCCGC-CATAAT--AA-CTA---A---------------T--A---GGG--A------T-GCCT--CTAAGCAT--------A------CCGATTAAT---CGG--ATCT--ATTGCCGTCATAT-GGGAAACAt
gi|2 : tccgttacaagTCAAGAATACTTCCATGAAGTGTTTCTTCT-C---T-G--AAA------CAGCACTGAATC-A-----------C----T-ATGTT--T------G--TC---C-T------G-----C-----TTTA-------AG------TTTTGT---GGAAAATAAAAGACAC--GT--T-----C--TGTCA-----ATTC----CT---------------TT-A----TAATA------CCGG-ACATGGTCAGCAC--TATTTCCT-GT-CAAAAAATATTTG-GG-GGG-GGGGGGGTGGGGGGGTGCAGTT--T---AT---GTT-TGT-T---A--AAC---T--------TA-A------TAAAC---TT--C--A--T-AAC------A---TTT--A-AAA--C--T-----A------T--AGTTT--AC-C---TATA--TTTG----T--TT----AAA--ATAAA-TAC---GTA--AAATG---TA--G-------T---AAT------ATTT--AATTTTAAAGGAA-A-T-A---T--G------ATATAAGACTGAGA--CATTTTATGGGGATATT-T-C-----TA-TTCAAA--TA------AA----A----T-GTGCCTTCT-----AA----CTA-CCTGCGC-TGTAAT--AA-ACT---ACCAAAAT----CGGTG--A-----C--AG-------G--T--CTAG--------------------AGATCG-------G--AGAT--ATTGACGTCATTTATGGGAACGCAT
gi|31 : ttccgttacaggCAGGAGTACCGCAGTGAACTTTTTCCCCT-C---T-G--AAAACTTGGCAGCATTTAAAC-ACTCAGTTTGTTC----T-A-ATT--T---------TT---T-T------G-----T----------------GG------TTTGAT---A---ACT------C-C--AA--GAGATAG--TGCCG-----TCTC----TT---------------GT-----------------------CATGGTCAGCAA--CAT--------------AATGATTC-GG-GAC-GA----------------AGTT--TAA-AT---GTT-Ttg
gi|15 : gtttccccgtaataaggAGGAGTACCGCAACGACGTGTTTCTCCT-C---T-G--AAA------CAACATCCAAAC-A----------CT----C-A-AGT--T------GTTCT---TAT------GTAA--C-----T----------GG------TTTGGT---G---AAT------C-A--A----AGATAA---GTC--------TC----TT---------------TC-A----GAAAA------CACG-TCATTGACAGCAA--TATTTCCA-GTAC--AAAATGGTTC-GGTGGC-GA----------------AGTC--TAT-AT---GTT-GGT-T---A--AAA---T--------TA-A------TGAAC---TA--T--A--T-ACT------A---TTT--ACAAAT-A--T-----A------T--A---T--AT-C---TTTA--T--A--------C----AAA--ATAGT--AA---GTG--AAGTT---TA--T-------T---AAC------ATTT--A-TTTCAT-GGAA-A-T-G---T--G------ACATCT---G-AGA--CAATTTTTGAGCATTTT-T-T-----TA-TTACA----A------AT----C----CTATGTCTTCA-----AA----TCACCCCGTGC-TACAAT--AA-CTA---
gi|42 : caagtaTGCCGCAGTGAAGTATGTCTCCT-A---C-G--AAA------CAGCATTCAAAC-A----------CC----T-C-ATT--T------A--CT---C-T------G-----C-----c
gi|51 : ccttttccgtaacattatcaggaatacagtaatcgaggaattagatagttcctTGCCGCCATGAAGTCTTTTTTCT-C---C-G--AAA------TATCAATTAAGA-A----------CT----C-A-ATT--T------ttt
gi|16 : caattcatatgGGAGT-TTTTTCCT-C---A-G--AAT------CAGCTTTTAAAC-A----------TT----C-A-ATT--T------G--TT---C-G------G-----A-----T----------GGAAGTTGTTTGGT---G---AAT------C-C--AA--GAGATGC--TGCCA-----TTTC----TT---------------GA-G----TTAAA------TCTG-CCATGATAAGCAA--CAGTTCCA-GTAC-AAAAATGATTC-AG-GGC-TA----------------AGTT----T-AT---GTA-TGT-TA--A--A-----T--------TC-A------CGAAC---TA--A--A--A-TTT------A---TTA--A-GAA--A--T-----A------A--A---T--CT-CTTTTTTA--T--AATATT--TCTATTAAA--ATgt
gi|36 : acttttcctgtaacaagttaTCTTTCTTCG-C---C-A--AAA------CATTATTTAAGC-AG---------TT----C-G-TTTGTT------A--TT---T-TTAA---G-----T-----G----------TT------TTTAGT---G---AAT------C-C--AA--AATATAC--TGTCT-----GCAT----TT---------------AA-A----TAATA------CCTA-CCATGgatcagtcttcctaccatcccacactataaccaaccaaaattgaagtgtctaggcacacagatcaataggagcttatgacgtgatctggggaacaca
gi|5 : tgaaattaatcagtcgatggtaatatatctaccatataCTTTTT--T-G---C-G--AAA------CAGAGTTCAA-C-G----------TT---------TT--T------C--CTGCAT-TAA----G-----T-----T----------GT------TTTGTT---T---AAT------A-T--GT--GAGATGC--TGCCT-----TCTC----TT---------------TT-A----TAGTA------CCTGGCCA------GCAC--TATTTTCG-GTACGAAA--TAATTG-AG-GGC-GA----------------CGTT--GGTTAC---A--------------A-----T--------TC-A------TAAAT---TA--A--A--T-AAC------G---TTC--A-GAA--A--T---------------A---T--AC-C---TTCA--T--TTA-TT--TT----AAAT-ATC---TAC---ATG--AAGTT---TA--T-------T---AAC------ATTT--AATTTTAA-AGGA-ACT-G---T--G------ATAAAA---A-AGA--CCAATTATGAGCATATT-T-A-----TA-TTAAAT--TA------ATAGTACAGCAC-ATGCTTTCT-----AC----CCGACCTGTGC-TGTAATAAAA-CTA---ACCAAAAT----CGGGT--T---TTG--AG-----T-G--T--TCAAGCAC--------A------AAACTCAAC---CAG--AACT--GGTGACGTCATCC-GGGGGACACAtt
gi|1 : aattgttccgtaaaaagccatgagcaTTTTTCCTGT---A-T--AAAGTATG-CAACATTCAAGC-A----------CT----C-A-ATT--T------G--TT---C-T------GATAATC-----T----------GG------TTTGGT---G---AAT------T-C--AA--GAGATAC--TGCAG-----TCTC----TT---------------GC-A----GAAAA------CTTG-CCATGGTCAGCAA--TATATCCG-GTATGAAAA-TGATTC-AG-GGT-AT----------------ATTC--TG--AT---AGT-TG-----------------------------------AAAC---CA--T---------------------TT--A-GAA--A--T-----ACAGTA-T--A---T--AT-C---TTTA------G------TC----TAA--ATATT-TAT---GTG--ATGTT---TA--T-------T---AAC------ATTT--A-TTTCAA-TGAT-T-T-G---T--G------AAATAT---G-AGA--CAATTTATGAACATATT-T-C-----TA-TCAAAA--TA------GT----C----C-ATGCCTTCT-----
gi|25 : TCCCT-T---CCG--AAA------CAACAACTAAGT-A----------CT----C-A-ATT--T------G--AT---C-T------G-----A-----TTTAAGT----GG------TTTGGT---C---AAT------C-C--AA--CAGATAC--TGCAG-----TCTC----TT---------------GT-A----TAAAA------CCTG-ACATGGTCAGCAC--TATTTCTG-GTACG-AAAATGGTAC-AG-GTT-GA----------------AGTT--TAT-AT---GTT-TGT-T------------------------A------AAATTAAATA--T--A--T-AAC------A---TTT--G-AAA--A------------------A---T--ATGC---TT--------GA--T--TC----AAA--ATgtcagtgatgtctcaaattgcaatacagacatactgtaatctttcaaaccaacacatatcaaagtttcatatcaatgagaatccaaagaaaaagtaagattgttttctaatgttaagcagcgtatcatatcatgtatcgctctacacgtatcgtggtacatatcatattggaaatctcctggcaatacacagccca
gi|17 : CCT-T---T-G--AAA------CGACATTTAG-C-G----------CC----C-A-TTT--T------G--TT---C-T------G-----C-----T-----------------------T---G---AAT-----------------GGT----TTTTT-----TATCCAGATT---------------GG-A----GCTTG------CCTA-CCATG---AGCAT--TATTTCCG-GTATAAAAGTGAATCA--G-AGC-AA----------------AGTT--TTT-AA---------------T--A-----T--------TC-A------TAACC---TA--T--A--T-AAT------A---TTA--A-GAA--A--T-----A------T--A---T--AT-A---TTTA----------T--TC----AAAT-AT--T-TAT---GTG--ATTTT---TT--T-------TTAAAAT------ATTT--A-TT-----TGA------G---G--G------AAATGA---G-AGA--CAATTTATGAGTGTATTAA-C-----GA---AAGA--TA------GT----T----C-AAGCCTTCT-----AA----CCACTCTGCAC----------------------------------T--G---GTG--AG--G--T-G--T--CTAAGCAC--------A------TAGATCAAT---CGG--AGCT--AGTGATGTAATCTGGGGGAACACAattaac
gi|27 : AA------CAGCACTTAAGC-A----------CT----C-G-GTT--T------G---T---T-T------G-----C-----TTTAGGT----GG------TTGAAT---G---AAT------C-C--AA--GAGATAC--TGCCG-----TCTC----TTAATATAATACTATTAAT-G----TAATA------CCTT-CAATGGTCAACTC--TATTTTTC-ATAC-AGAAATGATTG-AG-GAC-AA----------------AG-T--TGA-A---------GT-T---GAAG-----T--------TT-A------TAAGC---TA--T--G--T-AAC------T---TTT--A-GTT--A--T-----A------T--A---T--A
gi|48 : ttccatagCATTCAAGC-A----------CA----C-A-ATT--T------G--TC---C-T------AAT---CTAAG-C----------GG------TTTGGT---G---AAT------C-C--AA--GAGATAC--TGCCG-----TCaa
gi|39 : aagttttccaTCAAA--A----------TCAGCTC-G-ATT--T------G--TT---T-T------A-----C-----CTTAATTAAATGG------GTTGAT---G---AAT------C-CAAGA--TA--TAC--TACCG-----TCTC----TT---------------GT-G----TAATA------CCTG-CCACGG
gi|32 : gtctgaattacagccataaagctgttcttcTCAACC-AGT--------TC----T-A-ATT--T------A--AG---T-------------------------------GG------TTTGGT---G---AAT------C-A--A----AGATATAATGCAG-----TCAC----TT---------------GT-A----T-ATA------CGTG-CCACAGTCAGCGC--TATCTgcagctcaatttgtt
gi|33 : tttttcttgtaacaaggtagtactgcaacaaagtcaatccc----------GG------TTTGAT---G---AAT------C-C--AA--GAGATAC--TGTTT-----TCTC----TT---------------GT-A----AAATA------CCTG-CCATGGTCAGCAC--TATTTCC--TTAC-AAAAGTGATTG-AGAAGT-CA----------------AGTT--TAT-AT---TAT-TAT-A---T--A-----TTTAAAAAATC-A------TAAAA---TA--T--G--T-AAT------A---TAT--A-TAA--A------------------A---T--AT-T--------------AATT--TT----AAA--ATactacctctgaaagtgttcgtccgtgtaggatatagatagt
gi|13 : t------TTTGGT---A---AAT-----------GTAAGAGATAC--TACCG-----TCTC----TT---------------TT-AA---CAATAAATAAACCTT-AAATAGTCTGCAA--TTTTTCAG-GTACGAAAT-TGGTTC-AG-GGT-GA----------------GGTT--TAT-AT---GTT-TGT-T---A--AA----T--------TC-G------TAAAC---TA--T--A--T-GCT------A---TTT--G-GAA--A--T-----A------T--AAA-T--AT-CA--TTTA--T----------TC----ATA--ATATA-TAT---GTG--GAGTTGATTA--T-------C---ATT------ACTT-----TCTAG--GAA-A-T-G---T--G------AAA--A---T-AGATACAATATATGCGCATATT-T-C-----TA-TTTAAA--TA------GT----C----C-ATGCTTTCT-----TT----C-ACCCCGCGC-TATTAT--AA-TTA---TCCAAAAC----CGGTT--A---GTG--AT--G--T-A--T--CTAAGCAG--------T------CAGATCAAT---CAG--AGCT--AGTGACGTCATCT-GGGGAACACAag
gi|6 : tgcGGT---G---AGC------C-C--AG--GAGATAC--TGGAA-----TATA----TT---------------GT-A----TAATA------CCTG-CCGTGGTTAGCTC--TATTTCCG-GTATGAAAA----TTG-AG-GA--GA----------------AGTT--TAT-AG---TTT-TGC-TAAAA--A-----T--------T--A------TAAAC---TA--TA-A--T-TATAACACAA---TTT--G-AAAT-A--T-----C------T--A---T--AT-A---TTTAT-T--TGAATTAGTT----AAA--ATATC-TAC---GTA--CAGTT---CA--G-------T---AATA-----TTCA--A-TTTCAA---AATA-T-A---T--G------ACACAG---G-AGG--CATTTTATGAGCATGTT-T-C-----TATTTAAAA--TA------GT----T----C-ATGCCATCT-----AAACGTCCGCTCTACTCGTATGAC--AACTTG---CCCAAAGC----CAGCT--AACGGTG--GACCT--T-A-----CTATGCAC--------G------GGGATCAGA---CGG--AGCT--AGTGAC
gi|12 : attgaaagactaaacttctatgttttaaggggtttaaggggtttggtgagcccaaAGATAC--TACCG-----TCTC----TA---------------GT-A----TAAAA------TATG-TCATGTTCATCAC--TATTTCAT-ATACGAAAAATGATAC-AG-ATC-CA----------------AGTT----T-AT---G-------T---A--A-----T--------TC-A------TGAAC---TA--T--T--T-AAT------A---TTT--A-GAA--A--T-----A------C--A---T--GT-----------------ATA--TC----AAT--A-----TAC---TT------TT---T--------------------------------TTTCAA-GGAA-G-T-G------A------AAATAA---G-AGA--CAAACTATGAGACTATT-T-C-----TA-TTAA-----A------AT----C----A-ATGCCCTCT-----AA----CCA-CCCATGC-TATTAT--AA-CCA---AACAAAAT----CGGTT--A---ATC--AG--G--T-G--A--ATTAGTAT--------A------CAGGTCGAT---CGG--ATCT--ATTGACGTAATGTGGGGGAACACATccaatcggga
gi|11 : tttcccgttataagtcaggagaagaaccaaaatgaaatttctttgttttttatttaaatcgataattaag--TGCCT-----TCAT----TC---------------AT-A----TAAAA------TTTG---ATTG-GAGTGT--CATTGACA-GTACGAAAA-TGGTTG-AG-GGC-GA----------------AGTT--TAT-ATAATGTT-TCT-T---A--AAA---T--------TC-A------TAAAC---TA--T--C--T-AAC------A---TTT--A-AAA--A--T-----AATTATAT--A---C--AT-C---TTTA--T----------TT----GAT--ATACT-TACATACTT--ATGTT---TA--T-------C---AAC------TTTT--A-TTTCAA-GGAA-A-T-G---T--A------AAATAA---G-AGA--TAATTTATTACCATATT-T-C-----AA-ATAAAAAGTA------GT----C----C-ATGCCTTCT-----AA----C-AACCCGCGC-TATACT--AT-TTA---GACAAAAT----CGGCTAAA---GTG--AG--G--T-G--T--CTTAGCAC--------A------CAGATCAGT---CGG--AGCT--GGTGATGTTATTCCGGGGAACACAT
gi|19 : ctataattttagtaaaatgagctcagggatatcgTG-CCATGGTAAGCAC--TATTTCCG-GTACGAAAA-TGGTTC-AG-GGC-GA----------------AGTTAATG--AT---GTTGTAT-T---T--AAAAGAT--------TG-A------TGAAC---TA--T--G--T-AAT------A---TTA--A-GAA--A--T-----A------T--A---T--AT-A---TTTA--T----------TC----AAA--ATATT-AAC---GTG--AAGTT---TA--T-------A---AAC------ATCA--A-TTTCAA-GAAA-A-T-A---T--C------AAATAA---G-GTA--CAATTGATGAGCATATT-T-C-----TT-TTAAAA---A------GT----A----C-ATGCCTTCG-----T-----------CGCAC-TAAAGT--AA-CTA---ACCAAAAC----CTGTT--A---GT----G--T--T-G--TGGCTAAGCAC--------A------C-GATTAAT---CAT--AGCT--AGTGGCGTCATCTGGGGGAACGCtg
gi|52 : agcgG-CCATGGTGAGCAT--TATTTCTG-GTATG-AAAATATTTC-AG-GGC-GA----------------AGTT--t
gi|26 : CCA-ATATGTAAATGAGT-G-AG-AAC-AA----------------AGTT--TAT-AT---GTT-TGT-T---A--A-----A--------TCTA------TAAAC---TACAT--G--TATAT------AAAATTTGGA-AAA--A--T-----G------C--A---T--TT-A---TCTA--T--TAAA----------AAG--AT--T-TGC---GTG--AAATT---TA--T-------A---AAT------GTTGGAA-TTTCAA-GGAA-A-T-G---T--G------AAATAA---G-ACA--CAAATTATTAGCATGTT-T-C-----TA-TTCAAA--TA------GT----C----C-AT--CTTCT-----AA----CCGgataa
gi|22 : -AG-GAC-GA----------------AGTT--TAT-AT---GTT-TGT-T---T--G-----T--------TA-A-------AATT---AA--T--GAAC-TAT------A---ATT--ATAAA--A--TTAGAAA------T--A---T--AT-----TTTAATT--AGAA----------AAA--ATA---TAT---CTG--AAGTT---TA--T-------C---AAT------ATCA--A-TTTTAA-GGAA-A-A-A---T--G------AAATAA---G-AGA--CATTTTGTGAGCGTATT-T-C-----TA-TTAAAA--TA------GT----T----T-ATGCCTTCT-----TA----CCGACCAACAC-TGCAAT--AA-CTA---ACCAAAAT----CGGTT--C---ATG--AG--
gi|23 : -----T--------TC-A------AAAAT----A--T--A--T-AAT------A---TTT--A-GAA--G--T-----A------T--A---T--AT-C---TTTA--T----------TC----AAA--ATATT-TAC---CTT--AAGTT---TA--T-------C---AAT------ATTT--A-TTTCAA-GGAA-A-T-G---T--G------AAATAA---G-AGA--CAATTAATGAGCATATT-T-C-----TA-TTAAAA--TA------GT----C----C-ATGCATTCT-----TT----CCATCCCACAC-TATAAC--AA-CTA---ACCAAAA-----TGA----A---GGG--AG--G--T-T--T--CTAAGCAC--------A------CAGAACAAT---CGG--AGCT--AGTGACATCATCTGGGGAAACACATcaattaaagtcctctgaggaaacacattgtc
gi|40 : gtttattaaaaAAT---TA--T--A--T-CAT------A---TTC--A-GAA--A-------------------------------------------AAAT--TC----AAA--ATATT-T-----CTGCAAAGTT---TA--T-------TGA-AAC------TTTA--A-TTTAAA-GGAA-A-T-G---T--G------AAATAA---G-AGA--AAATTTATGAGTATATT-T---------------A--TA------G-----C----T-AAGCTTTCT-----TA----CCATCC
gi|24 : t---TA--T--A--T-AAC------A---TTA--A-GAA--ACAT-----A------T--A---T--AT-C---TTTA--T----------TC----AAA--ATACT-TAC---ATG--AAGTT---TA--T-------G---AAC------TTTT--A-TTTCAA-GGAA-A-T-G---T--G------AAATAA---G-AGA--TAATTTATTACCATATT-T-T-----TA-TTAAAA--TA------GT----C----C-ATGCCTTCT-----AA----CTG-CCCGCGC-TATACT--AA-TTA---ACCAAAAT----CGGTTAAA---GTG--AG--G--T-G--T--CTAAGCAC--------A------CAGATCAGT---CGG--AGC
gi|14 : c--A-AAA--C--T-----G------C--A---TGTAT-C---TTTA--T------TC--TT----AAT--AT--T-AAT---GTG--AAGTT---TA--T-------T---AAC------TTTT--A-TCTCAA--GAA-T-TTG---T--G------AAATAT---G-AGA--CAATTTATCAATATATT-T-C-----TA-TTAAAA--TA------GT----C----C-ATGCCTTCTGTTAGTA----ATGCCTC
gi|45 : atttgcatttaaaaataaaagaaggaaag--A---T--AT-A---TTTA--T--TTACTT--------AAA--ATGTT-TAC---GTA--AATTT---TA--T-------T---AAC------ATTT--AATTTCAA-TGAA-A-T-G---T--G------AAATAA---aaatttcaattgtgatattgtactcttttaaaacaacacaatatctaagtttcatattaaggagaactcaaaagcaaaagtagagtgtttcccaatgttaagcagcgtatcgtatcgccctacctgtatcgcggtacatatcatatctgaagcgacctggcaatacacaactctaataag
gi|38 : atataaaagtaagacagT--TC----AAA--ATCTT-TAG----TG--AAATA---TA--T-------T---AAC------ACTT--A-TTTCAA-GGAA-T-T-G---T--G------ATATCT---G-GGA--CAATTTATGAGTATATT---C-----TG-TTAAAA--TA------CT----C----C-ATGCCTTCT-----AA----TCTCCCCGCGC-TATAAT--AA-CTA---ACCAAA
gi|35 : ctttaT--TC----AAA--ATATT-TAC---CTG--AAGTA---TA--T-------C---AAT------ATCT--A-TTTGAA-GTAA-A-T-A---T--G------AAATAA---G-AGA--CAATTTATGAGCATA---------------TAAAA--TA------GT----c
gi|29 : atataatatttagatttaAC---CTG--ATGTT---TC--T-------T---AAT------ATTC--A-TTTTAA-GGAA-A-T-G---T---------AAACAA---G-AAA--CAAGTTATGAGCATATT-T-C-----TC-TTAAAA--TA------GC----A----C-ATGCCTTCT-----AA----ACCCCTCGCGC-TATAAT--AA-CTA---ACCAAAAT----CGGTT--A---GTG--AT--A--T-A--T--CTAAGCAC--------A------CA-----TTAAACGG--AGCT--AGTGACGTTATCTAGGAAAACAttttgctcgtcaaaggcctctctcaaattatatacatgccagacattccattatc
gi|34 : -TTTTAA-TTAACA-T-GATCTCAG------AGA-AA---T-GTG--CAATTTATGAGCATAAT-T-T-----TA-TTGAAA--TC------GT----C----C-ATGCCCTCT-----CA----C-ACCACGAGC-TGT--T--AA-CAA---ACCAAAAT----CGATT--A---GTG---G--TG-T-G--T--CTTAG------------------------------CGG--AGCT--AGTGACtg
gi|37 : tAATTTATAGGCATTCT-T-T-----TA-TTAAAG--TA------GT----C----C-ATGCCTTCT-----AA----CCTTCTCACGC-TATGGT--AA-CTA---ACCAAAAC----CGGCT--A---GTG---G--TG-T-A--T--CTAAGTAC--------A------CTGACCAAT---CGG--GTCT--ATTGACGTCATCAGGGGAAAggacgtaacccggaggatcacatt
gi|16 : atggTTTATAA---TATT-T-C-----TA-TTAAAA--TG------AT----C------A-GTCTTCC-----TA----CCATCCCACAC-TATAAC------CA---ACCAAAAT----TGA-------------AG--T----G--T--CTAGGCAC--------A------CAGATCAAT---AGG--AGCT--TATGACGTGATCT-GGGGAACACA
gi|54 : acttttcctgtaacaagttaggagttttttcctcagaatcagcttttaaacattcaatttgttcggatggaagttgtttggtgaatccaagagatgctgccatttcttgagttaaatctgccatgataagcaacagttccagtacaaaaatgattcagggctaagtttatgtatgttaaattcacgaactaaaatttattaagaaataaatctctttA-TTAAAA--CA------GT----C----C-ATGCCTTCT-----AA----C--CACCGCGC-TAT
gi|41 : A------GT----C----C-ATGCCGTCT-----TA----CCATTTTGTGC-TATAAT--AA-CAA---ACCAAACT----CAGTT--A---GTG--AA--G--T-G--T--CTAAGCAC--------ACACTGTCAGGTCTAT---TGG--AGCT--AGTGGCAACATCTGGGGACACACGTg
gi|43 : TTTT-----TAA---CTGCCCCATGC-TAT-AT--AT-TTACCTGCCGAAATCTAGTGGCT--A---GAT--AT--T--C-T--T--CCATGCAC--------A------AAGACCAAT---CGG--AGCTTAGGTGACATTGTCTGGAGGAATAGATt
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|46 ): ATAGTATCGTATGTATCAGCCTACCCATATCGCAGTACCTATCGTATCGGAACGGACCTGGCAATACACAGCCCTAATAAT
Unaligned ( gi|47 ): ACAAGTCGGACGTACCGCCAAGAAGTATTTATTGTCTTAAACAATATTGAAGCACGTGATGTGTTTCTGTTGTTGTATG
Unaligned ( gi|49 ): CTATGATTATAGTAAAATGAGCACATGGATCTCGTGCGTTCATTCATAGATATTTTAAATGGAATGCCATTG
Unaligned ( gi|53 ): TTTAACATGCAGTTAGTGACGTCATCTGGGGAACACATTGGTGT
Alignments
lowQualScore : 2222 6666666666666666666666666666666666 11111111111111111111111 3333333333333333333333333333 11111111111 11111111111111
lowQualScore : 5555 2 2 2 1 3333 22 444444 3 4 333 55555555 8888888888888888888888888888888888 444444 0 222 11 333 222 1 00000000000000000000000 7777 444 1 3 66 1 1 2 9999999999999999 1 2 3333 4444 6666666666666666666666666666 33 666666 2222 3333333 1 55555 777777 11111111111 11 33333 6666 66666666666666 0 222 33 444 77777777777 44 33 1 1 333333 2222 1 1 33333 1 1 222 11 333333 2222 1 0 3333 55 1 1 222 22 1 1 44 333 44 3333 3333 6666 3333 555555 0 22 3333 5
lowQualScore : .... . . . . .... .. ...... . . ... ........ .................................. ...... . ... .. ... ... . ....................... .... ... . . .. . . . ................ . . .... .... ............................ .. ...... .... ....... . ..... ...... ........... .. ..... .... .............. . ... .. ... ........... .. .. . . ...... .... . . ..... . . ... .. ...... .... . . .... .. . . ... .. . . .. ... .. .... .... .... .... ...... . .. .... .
lowQualScore : 7777 4 1 0 0 9999 11 111111 3 1 999 44444444 3333333333333333333333333333333333 444444 6 666 33 333 444 4 11111111111111111111111 3333 111 4 1 99 7 3 8 1111111111111111 4 8 0000 3333 9999999999999999999999999999 22 555555 7777 2222222 0 22222 333333 55555555555 88 22222 4444 33333333333333 1 333 11 000 00000000000 44 55 3 3 888888 9999 4 4 66666 4 4 444 99 888888 8888 4 1 0000 00 5 6 888 22 6 3 88 000 77 9999 9999 4444 9999 222222 6 55 9999 4
consensus : CCCGTAACATTA-T-CAGG-A-GTACCGCAATGAAGTCTTTCTCCTC---CG--AAA------CAGCATTCAAACACTCAATTTG---TT--------CT---------G-----C----------T-------GG------TTTGGTG---AATCCAAGAGATAC--TGCCGTC---TC-TT---------------GTA----TAAN---ACCTGCCATGGTCAGCAC--TA-TTTCCGGTACGAAAAATGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTTTAT-AT---GTT----TGTT------A------AA----T--------TC-ATAAACTA------TA----TAA---T---ATTTAGAAA-----TA------TA---TAT--C--T--TT-----AT---T--------T---C-AAAATATTTACGTG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCGCCCCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--AGTG---A-GGT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCAATCGGAGCT--AGT----GACGTCATCTGGGGGAACACAT
Reference ( family-1607 ) : CCCGTAACATTA-T-CAGG-A-GTACCGCAATGAAGTCTTTCTCCTC---CG--AAA------CAGCATTCAAACACCCAATTTG---TT--------CT---------G-----C----------T-------GG------TTTGGTG---AATCCAAGAGATAC--TGCCGTC---TC-TT---------------GTA----TAAN---ACCTGCCATGGTCAGCAC--TA-TTTCCGGTACGAAAAATGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTTTAT-AT---GTT----TGTT------N------A-----T--------TC-ATAAACTA------TA----TAA---T---ATTTAGAAA-----TA------TA---TAT--C--T--TT-----AT---T--------T---C-AAAATATTTACGTG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCGCCCCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--AGTG---A-GGT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCAATCGGAGCT--AGT----GACGTCATCTGGGGGAACACAT
gi|1 : ------CAACATTCAAGCACTCAATTTG---TT--------CT---------GATAATC----------T-------GG------TTTGGTG---AATTCAAGAGATAC--TGCAGTC---TC-TT---------------GCA----GAAA---ACTTGCCATGGTCAGCAA--TA-TATCCGGTATG-AAAATGATTCAG-GG------------------------TAT-AT----TC----TGAT------A------G-----T--------T---GAAAC--------------------C---ATTTAGAAATACAGTA------TA---TAT--C--T--TT-----A----G--------T---C-TAAATATTTATGTG---ATGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-ATGAT-TTGTG------AAATATGA----GACAATTTATGAACATATT-T-C-----TA-TCA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCT
gi|10 : tttttcctgtataaagtatgCATTA-T-CAGG-A-TTACTGCAATGACATCTTTCTCCTC---TG--AAA------CAGCAGTCAAACTCTCAATTTA---CT--------TA---------A-----A----------T-------GG------TTTGATA---AATCCATCAGTTAC--TGTCGTC---TC-TT---------------GTA----TAAC---ACCTTCCACGGTGAGTAT--TA-GTTCCAGTACAAA----GGTACAG-GGCAA----------------A-GTTTAT-AT---GTT----TGTTTGTTAAA------A-----T--------TC-ATCAAC--------TA----TAA---T---ATTAAGGAA------------------------------T-----AT---T--------T---C-----------CCTG-----GTTTA--CC---AAC----A------TCT--A--TTTTA-AGGAA-ATGAG------AAAT------------AT------GCACATT-T-T-----TA-TTA-AA---T--CA------GT----C-GTTGCCTTCTAA-----CGCAGCGTGT-TATAAT-A---A--C-TAA-CATAACTGGTT--GGTG---A--GT----G----T----CTATGAAT----A------CCAATCAATCGGAGCT--AGT----GACATCATCT-GGGGAACACATgtcagtgatgtctcaaattgcaatacagacatactgtaatctttcaaaccaacacatatcaaagtttcatatcaatgagaatccaaagaaaaagtaagattgttttctaatgttaagcagcgtatcatatcatgtatcgctctacacgtatcgtggtacatatcatattggaaatctcctggcaatacacagccca
gi|11 : ccAGGGATATCGTGCCTTC---AT-TC---------------ATA----TAAA---ATTTGAT-TGG--AGTGT--CA-TTGACAGTACGAAAA-TGGTTGAG-GGCGA----------------A-GTTTAT-ATAATGTT----TCTT------A------AAA---T--------TC-ATAAACTA------TC----TAA---C---ATTTAAAAA-----TAATTATATA---CAT--C--T--TT-----AT---T--------T-----GATATACTTACATACTTATGTTTA--TC---AAC----T------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTA------AAATAAGA----GATAATTTATTACCATATT-T-C-----AA-ATA-AA---AAGTA------GT----C-CATGCCTTCTAA-----CAACCCGCGC-TATACT-A---T--T-TAGACAAAATCGGCTAAAGTG---A-GGT----G----T----CTTAGCAC----A------CAGATCAGTCGGAGCT--GGT----GATGTTATTCCGGGGAACACAT
gi|12 : ctataattttagtaaaatgagctcAAGAGATAC--TACCGTC---TC-TA---------------GTA----TAAA---ATATGTCATGTTCATCAC--TA-TTTCATATACGAAAAATGATACAG-ATCCA----------------A-GTTTAT-GT--------------------A------A-----T--------TC-ATGAACTA------TT----TAA---T---ATTTAGAAA-----TA------CA---TGT---------------AT---A--------T---C-AATATACTT------------------------------------TTT-----TTTCA-AGGAA-GTG-A------AAATAAGA----GACAAACTATGAGACTATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--T-------------C-AATGCCCTCTAA----CCACCC-ATGC-TATTAT-A---A--C-CAAACAAAATCGGTT--AATC---A-GGT----G----A----ATTAGTAT----A------CAGGTCGATCGGATCT--ATT----GACGTAATGTGGGGGAACACATtg
gi|13 : tttcccgttataagtcaggagaagaaccaaaatgaaatttctttgttttttatttaaatcgataatt----------T-------GC------TTTGGTA---AATGTAAGAGATAC--TACCGTC---TC-TT---------------TTAACAATAAATAAACCTTAAATAGTCTGCAA--TT-TTTCAGGTACGAAAT-TGGTTCAG-GGTGA----------------G-GTTTAT-AT---GTT----TGTT------A------AA----T--------TC-GTAAACTA------TA----TGC---T---ATTTGGAAA-----TA------TAAA-TAT--CA-T--TT-----AT---T------------C-ATAATATATATGTG---GAGTTGA--TT---ATC----A------TTA--C--TTTCT-AGGAA-ATGTG------AAAATAGA----TACAATATATGCGCATATT-T-C-----TA-TTT-AA---A--TA------GT----C-CATGCTTTCTT-----TCACCCCGCGC-TATTAT-A---A--T-TATCCAAAACCGGTT--AGTG---A-TGT----A----T----CTAAGCAG----T------CAGATCAATCAGAGCT--AGT----GACGTCATCT-GGGGAACACA
gi|14 : A------TG---TAT--C--T--TT-----AT---T------------C-TTAATATTAATGTG---AAGTTTA--TT---AAC----T------TTT--A--TCTCA-AGAAT-TTGTG------AAATATGA----GACAATTTATCAATATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCT
gi|15 : atttgcatttaaaaataaaagaaggaaagaaaactgcAGG-A-GTACCGCAACGACGTGTTTCTCCTC---TG--AAA------CAACATCCAAACACTCAAGTTG---TT--------CTTATGTA---A-----C----------T-------GG------TTTGGTG---AATC--AAAGATAA------GTC---TC-TT---------------TCA----GAAA---ACACGTCATTGACAGCAA--TA-TTTCCAGTAC--AAAATGGTTCGGTGGCGA----------------A-GTCTAT-AT---GTT----GGTT------A------AAA---T--------TA-ATGAACTA------TA----TAC---T---ATTTACAAA-----TA------TA---TATATC--T--TT-----AT---A------------C-AAAATAGT-AAGTG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-TGGAA-ATGTG------ACATCTGA----GACAATTTTTGAGCATTTT-T-T-----TA-TTACAA---A--T--------C----C-TATGTCTTCAAA----TCACCCCGTGC-TACAAT-A---A--C-TAgttagtaatgcctcaaatttcaattgtgatattgtactcttttaaaacaacacaatatctaagtttcatattaaggagaactcaaaagcaaaagtagagtgtttcccaatgttaagcagcgtatcgtatcgccctacctgtatcgcggtacatatcatatctgaagcgacctggcaatacacaactctaataag
gi|16 : caagtaGGAGTTTTT-TCCTC---AG--AAT------CAGCTTTTAAACATTCAATTTG---TT--------CG---------G-----A----------T-------GGAAGTTGTTTGGTG---AATCCAAGAGATGC--TGCCATT---TC-TT---------------GAG----TTAA---ATCTGCCATGATAAGCAA--CA-GTTCCAGTAC-AAAAATGATTCAG-GGCTA----------------A-GTT--T-AT---GTA----TGTTA-----A------A-----T--------TC-ACGAACTA-------------AAATTT---ATTAAGAAA-----TA------AA---TCT--C--T--T-------T---T--------T---T-ATAATATTTc
gi|16 : acttttcctgtaacaagttaTATGTATGTT---AAATTCA--CG---AACTAAAA------TTT--A--TT----AAGAA-AT---------AAAT----------CTCTTTTTTATAATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TG------AT----C--A-GTCTTCCTA----CCATCCCACAC-TATAA---------C-CAACCAAAAT---------TG---A-AGT----G----T----CTAGGCAC----A------CAGATCAATAGGAGCT--TAT----GACGTGATCT-GGGGAACACActattaaaatgatcagtcttcctaccatcccacactataaccaaccaaaattgaagtgtctaggcacacagatcaataggagcttatgacgtgatctggggaacaca
gi|17 : acttttcctgtaacaagttaggagttttttcctcagaatcagcttttaaacattcaatttgttcggatggaagttgtttggtgaatccaagagatgctgccatttcttgagttaaatctgccatgataagcaacagttccagtacaaaaatgattcagggctaagttCCTT---TG--AAA------CGACATTTAG-CGCCCATTTTG---TT--------CT---------G-----C----------TTGAAT--GG------TTTTTTT---A-TCCA---GAT----TGGAG------C-TT---------------G--------------CCTACCATG---AGCAT--TA-TTTCCGGTAT-AAAAGTGAATCAG-AGCAA----------------A-GTTTTT-A------------AT--------------A-----T--------TC-ATAACCTA------TA----TAA---T---ATTAAGAAA-----TA------TA---TAT--A--T--TT-----AT---T--------C------AAATATTTATGTG---ATTTTTT--TTTAAAAT----A------TTT--A--TTTGA-GGGAA-ATG-------------AGA----GACAATTTATGAGTGTATTAA-C-----GA---A-AG---A--TA------GT----T-CAAGCCTTCTAA----CCACTCTGCAC-------------------------------T--GGTG---A-GGT----G----T----CTAAGCAC----A------TAGATCAATCGGAGCT--AGT----GATGTAATCTGGGGGAACACA
gi|18 : CCCCTAACGTTA-T-CAGG-A-ATATCACAATTAGGTCTTTCTCCTC---CCCCAAA------CAGCATTCAAACACCCAATTTA---CT--------CT---------G-----C----------TTAAAT--GG------CTTGAAG---ATTATATTAGATAC--TGTCATC---TC-TA---------------GCA----TGAT---ACCTGCCACGGTGAGCAT--TA-TTTACGGTAC-AGAAATGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTATAT-AT---ATT----TGT---------------------------------TAAAATA------CA----TAA---T---ATTTGGAAA-----TA------TA---TA------T--TC-----A----T--------C---C-AAATTACATACCTG---AAGTTTA--TA---AGT----A------T-------CTTAA-AAGAA-ATGTGAAAAAAAAAAAAGA----GACAATTTATGAGCAT
gi|19 : aacttccTGCCATGGTAAGCAC--TA-TTTCCGGTACGAAAA-TGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTTAATGAT---GTTG---TATT------T------AAAAGAT--------TG-ATGAACTA------TG----TAA---T---ATTAAGAAA-----TA------TA---TAT--A--T--TT-----AT---T------------C-AAAATATTAACGTG---AAGTTTA--TA---AAC----A------TCA--A--TTTCA-AGAAA-ATATC------AAATAAGG----TACAATTGATGAGCATATT-T-C-----TT-TTA-AA---A---A------GT----A-CATGCCTT---------CG--TCGCAC-TAAAGT-A---A--C-TAACCAAAACCTGTT--AGTG---T-TGT----G----G----CTAAGCAC----A------C-GATTAATCATAGCT--AGT----GGCGTCATCTGGGGGAACGC
gi|2 : agcgCCGTTACAG-G-T-CAAG-A-ATACTTCCATGAAGTGTTTCTTCTC---TG--AAA------CAGCACTGAATCACTATGTTTG---TC--------CT---------G-----C----------TTTA----AG------TTTTGTGGAAAAT--AAAAGACACG-TTCTGTCAATTC-CT---------------TTA----TAAT---ACCGGACATGGTCAGCAC--TA-TTTCCTGT-CAAAAAATATTTGGG-GGGGGGGGGGTGGGGGGGTGCA-GTTTAT------GTT----TGTT------A------AAC---T--------TA-ATAAACTT------CA----TAA---C---ATTTAAAAC-----TA------TAGTTTAC--C--T--AT-----AT---T--------TGTTT-AAAATAAATACGTA---AAATGTA--GT---AAT----A------TTT--AATTTTAA-AGGAA-ATATG------ATATAAGACTGAGACATTTTATGGGGATATT-T-C-----TA-TTC-AA---A--TA------AA----A-TGTGCCTTCTAA----CTA-CCTGCGC-TGTAATAA---A--C-T-ACCAAAATCG------GTG---A-CAG----G----T----CT------------------AGA--GATCGGAGAT--ATT----GACGTCATTTATGGGAACGCATt
gi|20 : ttCCCGTAACAGTA-T-CAGG-A-ATATCGAAATGAAGTATTTC-CCGC---CG--GAA------CAGCATTCAAACTAACAATTTACTATT--------CTTAA------G----------------T-------GG------TATGATG---A-TCCATTACATAG--TGTCGTC---TC-TT---------------GCA-----AA--------------GTGAGCAT--TA-TTTCATGTACGAAAATTGGTACAG-GGCGA----------------AAGTTTAT-AT---GTTGGTTTGTT------A------AAA---T--------TC-TTAAACTA------TA----TAA---T---ATTTAGAAA-----TA------TA---TA------T--TT-----A----T--------T---C-AAATTATATACTTG---AAGTTTA--TC---AAT----ATTAAATTTT--A--TTTTA-AGGAA-AGGTA------AAATAAGA----GACAATtg
gi|21 : ttttCCGTAACAT-G-T-CAGG-T-GTACCATATAAAAGCCCTTTTTTTTGGATG--AAA------CAGCATTAAGAT-CCCAATTTG---TT--------TTAATTAAGT-G-----T----------T---------------TTTTGTG---AATC--------AC--T------------TT----------------TA----GAAA---ATCTGCCATGGTCAGCAA--TA-TTT-----ACGAAAAA-GGTTCAG-AGTAA----------------A-GTTTAT-GT---TTG----TGTT------A------AAC---T--------TC-ATGAACTA------TA----TAC---T---GTTTAGAAA-----TA------GA---TAT--A--T--TT-----A----T--------T---C-AAACCATTTACCTG---AAGTGTA--TT---AAC----A------TTT--A---TTCACAGGAgt
gi|22 : tattttAG-GACGA----------------A-GTTTAT-AT---GTT----TGTT------TGTTAAAA-----T--------TA-ATGAACTA------TAATTATAA---A---ATT-AGAAA-----TA------TA---T-------T--TT-----AA---T--------T---AGAAAAAATATATCTG---AAGTTTA--TC---AAT----A------TCA--A--TTTTA-AGGAA-AAATG------AAATAAGA----GACATTTTGTGAGCGTATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----T-TATGCCTTCTTA----CCGACCAACAC-TGCAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--CATG---A-Gtcagtctgagctttttaagtcaa
gi|23 : ---GTT----TATT------A------AAA---T--------TC-A-AAAATA------TA----TAA---T---ATTTAGAAG-----TA------TA---TAT--C--T--TT-----AT---T------------C-AAAATATTTACCTT---AAGTTTA--TC---AAT----A------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GACAATTAATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCATTCTTT----CCATCCCACAC-TATAAC-A---A--C-TAACCAAAAT-GA----AGGG---A-GGT----T----T----CTAAGCAC----A------CAGAACAATCGGAGCT--AGT----GACATCATCTGGGGAAACACATcaattaaagtcctctgaggaaacacattgtc
gi|24 : CTA------TA----TAA---C---ATTAAGAAACA---TA------TA---TAT--C--T--TT-----AT---T------------C-AAAATACTTACATG---AAGTTTA--TG---AAC----T------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GATAATTTATTACCATATT-T-T-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CTG-CCCGCGC-TATACT-A---A--T-TAACCAAAATCGGTTAAAGTG---A-GGT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCAGTCGGAGC
gi|25 : TCCCTTC---CG--AAA------CAACAACTAAGTACTCAATTTG---AT--------CT---------G-----A----------TTTAAGT-GG------TTTGGTC---AATCCAACAGATAC--TGCAGTC---TC-TT---------------GTA----TAAA---ACCTGACATGGTCAGCAC--TA-TTTCTGGTACG-AAAATGGTACAG-GTTGA----------------A-GTTTAT-AT---GTT----TGTT------A------A---------------A-ATTAAATA------TA----TAA---C---ATTT-GAAA-----AA------TA---TG---C--T--TG-----A----T--------T---C-AAAATATTAAC
gi|26 : AAATGAGTGAG-AACAA----------------A-GTTTAT-AT---GTT----TGTT------A------A-----A--------TCTATAAACTACATGTATA----TAA---A---ATTTGGAAA-----AA------TG---CAT--------TT-----ATCTAT--------T---A-AAAAGATTTGCGTG---AAATTTA--TA---AAT----G------TTGGAA--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----CACAAATTATTAGCATGTT-T-C-----TA-TTC-AA---A--TA------GT----C-CAT--CTTCTAA----CCG
gi|27 : ccaatatgtAA------CAGCACTTAAGCACTCGGTTTG---TT---------T---------G-----C----------TTTAGGT-GG------TTGAATG---AATCCAAGAGATAC--TGCCGTC---TC-TTAATATAATACTATTAATG----TAAT---ACCTTCAATGGTCAACTC--TA-TTTTTCATAC-AGAAATGATTGAG-GACAA----------------A-GTTGA--A------------GTT------G------AAG---T--------TT-ATAAGCTA------TG----TAA---C---TTTTAGTTA-----TA------TA---TA
gi|28 : ttccatagCCCGTAACATTA-C-CAGG-A-ACATCTCAATAAAGTTTTGCTCCTC---CG--AAT------CAGCATTCAAACATCTAATTTA---CC--------CT---------G-----C----------T-------CA------TGTGATG-----T------GATGA--TGTCGTC---TC-TT---------------GCAACGCGAAT---ACCTGACATAGCGAGCAT--TA-TTTCCGGTACGAAAAATTGAT--------A----------------G-GTT-----T---GTT----TGTT------A------A-----T--------T--------TA------TA----TAA---T---ATaa
gi|29 : ttttACCTG---ATGTTTC--TT---AAT----A------TTC--A--TTTTA-AGGAA-ATGT-------AAACAAGA----AACAAGTTATGAGCATATT-T-C-----TC-TTA-AA---A--TA------GC----A-CATGCCTTCTAA----ACCCCTCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--AGTG---A-TAT----A----T----CTAAGCAC----A------C--ATTAAACGGAGCT--AGT----GACGTTATCTAGGAAAACA
gi|3 : CCTGTAAAATTA-T-CAGG-A-ATACCACAATGAAGTCTTTTTCCTT---CG--AAA------CAGCATTCAAACATCCAATTTA---CT--------TT---------G-----C----------C-------GG------TTTGATG---AATCCGTTAGGTAC--TGTCCTC---TC-TT---------------GTA----TAAT---ACCTGCCATGGTGAACAT--TA-TTTCCAGTACGAAAAACAGTTAAG-GGCAA----------------A-GTTTGT-AT---GTT----TGTT------T------G-----T--------TC-ATAAGTTA------TG----TTA---T---ATTTAAAAA-----TG------TA---TAT--C--T--TTATGGAAT---T--------T---C-AAAATCGTTACCTG---AAATTTA--TC---AAT----T------CTT--A--TTTTA-ATGAA-ATGTG------AAATAATA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------AT----C-CATGCCTTCTTA----CTGCCCCGCAC-TATAAT-A---A--T-TAACCAAAATTGGTT--AGTG---A-GTT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCGTTCAGAGCT--AGT----GACAACATTTAGGGAAACACATtg
gi|30 : CTGTAGCAT-G-T-TAGG-T-GTACCGTTATAAAGCCCCTTTTCTA---TG--AAA------CAGCATTAAAGCACCCAATTTG---TT--------CTAATTAA---G----------------T-------GT------TTTGCTG---AATCCA----ATA---TGTCGTC---ACTTT---------------TTA----AAAA---ATCTGCCATTGTCAGCAA--TA-TT-----AACGAAAAA-GGTTAAG-TTTGA----------------A-GTCTATGAT----TT----TGTT------
gi|31 : ttCCCGTAATA--A-GGCAGG-A-GTACCGCAGTGAACTTTTTCCCCTC---TG--AAAACTTGGCAGCATTTAAACACTCAGTTTG---TT--------CTAATTTTTTTG----------------T-------GG------TTTGATA---ACTCCAAGAGATAG--TGCCGTC---TC-TT---------------GT------------------CATGGTCAGCAA--CA-T-------------AATGATTCGG-GACGA----------------A-GTTTAA-AT---GTT----Ta
gi|32 : gtttcGTAACA-------AGGTA-GTACTGCAACAAAGTCAATC-CCTC-------AAC------CAG--TTC-------TAATTTA------------------------A-----G----------T-------GG------TTTGGTG---AATCAAAGATATAA--TGCAGTC---AC-TT---------------GTA----T-AT---ACGTGCCACAGTCAGCGC--TA-TCT
gi|33 : tttttctt----------T-------GG------TTTGATG---AATCCAAGAGATAC--TGTTTTC---TC-TT---------------GTA----AAAT---ACCTGCCATGGTCAGCAC--TA-TTTCC-TTAC-AAAAGTGATTGAGAAGTCA----------------A-GTTTAT-AT---TAT----TATA------T------A-----TTTAAAAAATC-ATAAAATA------TG----TAA---T---ATATATAAA------A------TA-----------T--TA-----AT---T--------T---T-AAAATAactacctctgaaagtgttcgtccgtgtaggatatagatagt
gi|34 : TTTAA-TT---AAC----A------TG---A--TCTCA-GAGAA-ATGTG--------------------CAATTTATGAGCATAAT-T-T-----TA-TTG-AA---A--TC------GT----C-CATGCCCTCTCA-----CACCACGAGC-TGT--T-A---A--C-AAACCAAAATCGATT--AGTG---G-TGT----G----T----CTTAG-----------------------CGGAGCT--AGTGACGGACGTAACCCGGAGGATCACATg
gi|35 : ttA------TA----TAA---T---ATTTAGA----------------------------T--TT-----A----T--------T---C-AAAATATTTACCTG---AAGTATA--TC---AAT----A------TCT--A--TTTGA-AGTAA-ATATG------AAATAAGA----GACAATTTATGAGCATA---------------TA-AA---A--TA------GT----t
gi|36 : TCTTTCTTCGC---CA--AAA------CATTATTTAAGCAGTTCGTTTG---TTATTTTTAAGT---------G-----T----------T---------------TTTAGTG---AATCCAAAATATAC--TGTCTGC---AT-TT---------------AAA----TAAT---ACCTACCATGttttgctcgtcaaaggcctctctcaaattatatacatgccagacattccattatc
gi|37 : tgaaattaatcagtcgatggtaatatatctaccatataAATTTATAGGCATTCT-T-T-----TA-TTA-AA---G--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCTTCTCACGC-TATGGT-A---A--C-TAACCAAAACCGGCT--AGTG---G-TGT----A----T----CTAAGTAC----A------CTGACCAATCGGGTCT--ATT----GACGTCATCAGGGGAAAtt
gi|38 : atgg--C--T--TT-----AT---T------------C-AAAATCTTTA-GTG---AAATATA--TT---AAC----A------CTT--A--TTTCA-AGGAA-TTGTG------ATATCTGG----GACAATTTATGAGTATATT---C-----TG-TTA-AA---A--TA------CT----C-CATGCCTTCTAA----TCTCCCCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAA
gi|39 : TACAGCCATAAAGCTGTTCTTCTC---AA--AAT------CAGC----------TCGATTTG---TT--------TT---------A-----CCTTAATTAAAT-------GG------GTTGATG---AATCCAAGATATAC--TACCGTC---TC-TT---------------GTG----TAAT---ACCTGCCACGGGCAGCTC--AA-TTTc
gi|4 : gtctgaat-T-CAGG-A-GTACTGCAATTAAGTAATTCTGCTT---TG--AAA------TAGTATTCAAACACTCAATTTG---TT--------CTAATTTAA--G----------------T-------GG------TTTGTTG---AATACAAGAGTTGA--CGCCGTC---TC-TT---------------GTA----TACA---ACCTGCCATTGTCAACAC--TATTTTTTTGTAAG-AAAATGATTCTT-GTCAA----------------A-GTTTAT-AT---ACT----TGTTAA----A------A-----T--------TC-ATTAACTA------TA----TCA---T---ATTTATACA-----TA------TA---TAT--C--T--TT-----A----T--------G---C-AGAATATTTACGAG---AAGGTTATTTT---AAC----T------TTT--A--TTTC------A-ATTT--------------A----GACAATTTATAAGCATATC-TACCGGTATG-TTA-AA---A--TA------GC----C-CATGCTGTCTCA----CCACCCTGCG--TAAATT-A---A--C-TAACCGAAATCAGTA--AGTG---A-GGT----G----A----CCAAGGAC----G------AAGATTAAAC-CAGCT--AGT----GATGTTATCTGGGGAAACACATgtt
gi|40 : ttacagtagcaagAATTA------TA----TCA---T---ATTCAGAAA-----AA-----------------------------AT---T------------C-AAAATATTTCTGCA---AAGTTTA--TTGA-AAC----T------TTA--A--TTTAA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GAAAATTTATGAGTATATT-T-------------------A--TA------G-----C-TAAGCTTTCTTA----CCATCCt
gi|41 : tA------GT----C-CATGCCGTCTTA----CCATTTTGTGC-TATAAT-A---A--C-AAACCAAACTCAGTT--AGTG---A-AGT----G----T----CTAAGCAC----ACACTGTCAGGTCTATTGGAGCT--AGT----GGCAACATCTGGGGACACACGT
gi|42 : CCGTAACATTA-T-CAGG-A-ATACAGTAATt
gi|42 : ccttttTGCCGCAGTGAAGTATGTCTCCTA---CG--AAA------CAGCATTCAAACACCTCATTTA---CT--------CT---------G-----C----------T-------cgaggaattagatagttccttgccgcagtgaagtatgtctcctacgaaacagcattcaaacacctcatttactctgcttt
gi|43 : ccttttccgtaacattatcaggaatacagtaatcgaggaattagatagttcctTTTTAA----CTGCCCCATGC-TATA-T-ATTTA--C-CTGCCGAAATC---T--AGTGGCTA-GAT----A----TTCTTCCATGCAC----A------AAGACCAATCGGAGCTTAGGT----GACATTGTCTGGAGGAATAGATtt
gi|44 : tAACATTT-T-CAGG-A-ATACCGCAGTGAGGTGTTTCTCCTC---CG--AAA------CAGCATTC-AACGCCCAATTTA---CT--------CT---------G-----C----------T-------tg
gi|45 : aacctttggctaA------TA----TAA---A---AGTAAGACA-----GA------TA---TAT--T--TATTT-----AC---T--------T-----AAAATGTTTACGTA---AATTTTA--TT---AAC----A------TTTA-A--TTTCA-ATGAA-ATGTG------AAATAAatatactgttgg
gi|47 : GG-ACGTACCGCCAAGAAGTATTTATTGTC---TT--AAA------CAATATTGAAGCACGTGATGTGT--TT--------CT---------G-----T----------T-------G
gi|48 : acaagtcCATTCAAGCACACAATTTG---TC--------CT---------AAT---C----------TAAGC---GG------TTTGGTG---AATCCAAGAGATAC--TGCCGTC---ttgtatg
gi|5 : aagttttccaGCCATGAGCACTTTTT--TG---CG--AAA------CAGAGTTCAA-----CG-TTTT---TC--------CT---------G-----CATTAAGT---T-------GT------TTTGTTT---AATATGTGAGATGC--TGCCTTC---TC-TT---------------TTA----TAGT---ACCTG-----GCCAGCAC--TA-TTTTCGGTACGAAA--TAATTGAG-GGCGA--------------------------C---GTT----GGTT------ACA----A-----T--------TC-ATAAATTA------AA----TAA---C---GTTCAGAAA-----TA------TA---CCT--TCAT--TT-----AT---T--------T---T-AAA-TATCTACATG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--AATTTTAA-AGGAA-CTGTG------ATAAAAAA----GACCAATTATGAGCATATT-T-A-----TA-TTA-AATTAA--TA------GTACAGCACATGCTTTCTAC----CCGACCTGTGC-TGTAAT-A---AAAC-TAACCAAAATCGGGT--TTTG---A-G-T----G----T----TCAAGCAC----A------AAACTCAACCAGAACT--GGT----GACGTCATCCGGGGG-ACACA
gi|50 : aattgttccgtaaaaaCCCGTAACA--AGT-CAGG-A-GTACGGCCATGAAGTGTTTATCCTC---TA--CGA------CAGCATTCAAACACTC
gi|51 : tgtt-GTGCCGCCATGAAGTCTTTTTTCTC---CG--AAA------TATCAATTAAGAACTCAATTTG---T
gi|52 : caattcatatGCCATGGTGAGCAT--TA-TTTCTGGTATG-AAAATATTTCAG-GGCGA----------------A-GTTGAT-A
gi|53 : AGTT--AGT----GACGTCATCT-GGGGAACACATa
gi|54 : tttaacatgcA-TTA-AA---A--CA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCA--CCGCGC-TATtggtgt
gi|6 : GGTG---AGCCCAGGAGATAC--TGGAATA---TA-TT---------------GTA----TAAT---ACCTGCCGTGGTTAGCTC--TA-TTTCCGGTATGAAAA----TTGAG-GA-GA----------------A-GTTTAT-AG---TTT----TGCTAAA---A------A-----T--------T--ATAAACTATAAT--TA----TAA---CACAATTT-GAAA-----TATC----TA---TAT--A--T--TT-----AT---TTGAATTAGT---T-AAAATATCTACGTA---CAGTTCA--GT---AAT----A------TTCA-A--TTTCA-A--AATATATG------ACACAGGA----GGCATTTTATGAGCATGTT-T-C-----TATTTA-AA---A--TA------GT----T-CATGCCATCTAAACGTCCGCTCTACTCGTATGAC-A---A--CTTGCCCAAAGCCAGCT--AAC------GGT----GGACCTTA--CTATGCAC----G------GGGATCAGACGGAGCT--AGT----GACg
gi|7 : attgaaagactaaacttctatgttttaaggggtttaaggggtttggtgagcccaaCCGTTACA--AGT-CAGG-A-GCACCGCCA----GTCTTTTTTCTC---CG--AAA------TGACATTCAAGCACACAATTTG---TC--------CT---------A-----C----------TTTAATCAGT------TTTGTTA---AAAATAAGAGATAC--TGCCATT---TC-CT---------------TTA----TAAT---ACCTGCCATTG-CAGCTC--TA-TTTTCTATACGAAATATTG---AA-GGTGA----------------A-GT----------GTT----TGTT------A------AAA---T--------TC-ATGAACTA------CA----TGA---C---ATTCAGAAA-----TG------TG---T----------------------T--------T--------ATGTTTACGTG---AAGTTTA--TT---AAC----AAACAA-TTT------TTAA-AGAAA-ATGTG------ATATAAGA----GACAATTTAT-AGCATATT-T-C-----TA-TTC-AA---A--TACTAATTGT----C-CATGCCTTCTAA----CCGCCTCCCGC-CATAAT-A---A--C-TAA-----------T--AGGG---A-TGC----C----T----CTAAGCAT----A------CCGATTAATCGGATCT--ATT----GCCGTCATAT-GGGAAACAccaatcggga
gi|8 : tCCTGTAACAA-A-T-CACG-A-GTACCACAATGAAGTCTTTCTCTTC---TT--AAA------TGTCATTCAAATA----ATTTG---TT--------CTT--------G-----T----------TTAAGT--GG------TTTAGTG---AATCCAACAG--------------------------------------A----TAG------------TGGTCAACAA--TA-TTTCTGGTAC-AAAAATGATTCTT-GGCAA----------------A-GTTTGT-AT---GTT----TGTT------A------AAA---T--------TC-AAGAACTA------TA----TAG---A---ACT-----A-----TA------TA---TAT--A--T--TT-----AT---T------------C-AAAATATTTA-GCT---ATGTTTA--TT---GAC----A------TTT--A--CTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATATGA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TT--GA---A--TA------GT----C---TGACTTCTAA----CCATCAGGCGT-TATAAT-T---A--C-TAATTGAAATCTGTT--AGTG---GTAGTGCTAG----T----TTGAGAACAAATA------AAAACAAAGCGCAGCT--AGT----GATGTCATCTGAGGAAA
gi|9 : ttcCTGTAACA--AGT-CAGG-A-GTACCGCAATGAAGTCTTTCTCCTC---TG--A-----------CATTCAA--------TTTG---TC--------CTTATTTAA--G----------------T-------GG------TTTAATG---AATCGAAGAGATAG--TGCCGTC---TC-TT---------------TCA----GAAA---ACTTGTCATGGTCAGCAAAATA-TTTCCGGTATG-AAAATGGTTT-G-GGCGG----------------A-GTTTAT-AT---GTT----TGTTAA----A------A-----T--------TC-ACAAACTA------TA----TAC---T---ATTTAGAAA-----TATC----TA---TAT--T--T--TT-----AT---T--------C---C--AAATATTTA-GGG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-AAGAA-ATGTG------CAATAAGA----CACAATTTATGAGCATATT----------------------------------------------TTCTAA----CCACTCTGCGT-TATAGT-A---A--C-TAGCCAAAATTGGTT--AGTG---A-TGT----G----T----CTAATTAC----A------CAGATCAAAC--------AGT----GATGTCATCTGGGGAAATAC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|46 ): ATAGTATCGTATGTATCAGCCTACCCATATCGCAGTACCTATCGTATCGGAACGGACCTGGCAATACACAGCCCTAATAAT
Unaligned ( gi|49 ): CTATGATTATAGTAAAATGAGCACATGGATCTCGTGCGTTCATTCATAGATATTTTAAATGGAATGCCATTG
Alignments
lowQualScore : 2222 6666666666666666666666666666666666 11111111111111111111111 11111 1 11111111111 111111111111111111111
lowQualScore : 5555 2 2 2 1 3333 22 444444 2 1 333 55555555 8888888888888888888888888888888888 444444 0 222 11 333 222 1 00000000000000000000000 7777 444 1 3 55 3 1 2 9999999999999999 1 2 1 2222 6666 77777 1 1 3 3 666666 2222 3333333 1 55555 555555 11 11111111111 11 999999999999999999999 222 33 444 77777777777 44 33 1 1 333333 2222 1 1 33333 1 1 222 11 333333 2222 1 0 3333 55 1 1 222 22 1 1 44 333 44 3333 3333 6666 3333 555555 0 22 3333 5
lowQualScore : .... . . . . .... .. ...... . . ... ........ .................................. ...... . ... .. ... ... . ....................... .... ... . . .. . . . ................ . . . .... .... ..... . . . . ...... .... ....... . ..... ...... .. ........... .. ..................... ... .. ... ........... .. .. . . ...... .... . . ..... . . ... .. ...... .... . . .... .. . . ... .. . . .. ... .. .... .... .... .... ...... . .. .... .
lowQualScore : 7777 4 1 0 0 9999 11 111111 4 1 999 44444444 3333333333333333333333333333333333 444444 6 666 33 333 444 4 11111111111111111111111 3333 111 4 1 11 5 3 8 1111111111111111 4 8 4 7777 7777 55555 4 5 3 2 555555 7777 2222222 0 22222 555555 88 55555555555 88 444444444444444444444 333 11 000 00000000000 44 55 3 3 888888 9999 4 4 66666 4 4 444 99 888888 8888 4 1 0000 00 5 6 888 22 6 3 88 000 77 9999 9999 4444 9999 222222 6 55 9999 4
consensus : CCCGTAACATTA-T-CAGG-A-GTACCGCAATGAAGTCTTTCTCCTC---CG--AAA------CAGCATTCAAACACTCAATTTG---TT--------CT---------G-----C----------T-------GG------TTTGGTG---AATCCAAGAGATAC--TGCCGTC---TC-TT---------------GTA----TAAN---ACCTGCCATGGTCAGCAC--TA-TTTCCGGTACGAAAAATGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-A-TTCATAAACTA------TA----TAA---T---ATTTAGAAA-----TA------T--A---TAT--C--T--TTAT-----T--------T---C-AAAATATTTACGTG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCGCCCCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--AGTG---A-GGT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCAATCGGAGCT--AGT----GACGTCATCTGGGGGAACACAT
Reference ( family-1607 ) : CCCGTAACATTA-T-CAGG-A-GTACCGCAATGAAGTCTTTCTCCTC---CG--AAA------CAGCATTCAAACACTCAATTTG---TT--------CT---------G-----C----------T-------GG------TTTGGTG---AATCCAAGAGATAC--TGCCGTC---TC-TT---------------GTA----TAAN---ACCTGCCATGGTCAGCAC--TA-TTTCCGGTACGAAAAATGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-A-TTCATAAACTA------TA----TAA---T---ATTTAGAAA-----TA------T--A---TAT--C--T--TTAT-----T--------T---C-AAAATATTTACGTG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCGCCCCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--AGTG---A-GGT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCAATCGGAGCT--AGT----GACGTCATCTGGGGGAACACAT
gi|1 : ------CAACATTCAAGCACTCAATTTG---TT--------CT---------GATAATC----------T-------GG------TTTGGTG---AATTCAAGAGATAC--TGCAGTC---TC-TT---------------GCA----GAAA---ACTTGCCATGGTCAGCAA--TA-TATCCGGTATG-AAAATGATTCAG-GG------------------------TAT-A-T----TC----TGAT-------A-G-TT--GAAAC--------------------C---ATTTAGAAATACAGTA------T--A---TAT--C--T--TTA------G--------T---C-TAAATATTTATGTG---ATGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-ATGAT-TTGTG------AAATATGA----GACAATTTATGAACATATT-T-C-----TA-TCA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCT
gi|10 : tttttcctgtataaagtatgCATTA-T-CAGG-A-TTACTGCAATGACATCTTTCTCCTC---TG--AAA------CAGCAGTCAAACTCTCAATTTA---CT--------TA---------A-----A----------T-------GG------TTTGATA---AATCCATCAGTTAC--TGTCGTC---TC-TT---------------GTA----TAAC---ACCTTCCACGGTGAGTAT--TA-GTTCCAGTACAAA----GGTACAG-GGCAA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTTTGTTAA-A-A-TTCATCAAC--------TA----TAA---T---ATTAAGGAA--------------------------------TAT-----T--------T---C-----------CCTG-----GTTTA--CC---AAC----A------TCT--A--TTTTA-AGGAA-ATGAG------AAAT------------AT------GCACATT-T-T-----TA-TTA-AA---T--CA------GT----C-GTTGCCTTCTAA-----CGCAGCGTGT-TATAAT-A---A--C-TAA-CATAACTGGTT--GGTG---A--GT----G----T----CTATGAAT----A------CCAATCAATCGGAGCT--AGT----GACATCATCT-GGGGAACACATgtcagtgatgtctcaaattgcaatacagacatactgtaatctttcaaaccaacacatatcaaagtttcatatcaatgagaatccaaagaaaaagtaagattgttttctaatgttaagcagcgtatcatatcatgtatcgctctacacgtatcgtggtacatatcatattggaaatctcctggcaatacacagccca
gi|11 : ccAGGGATATCGTGCCTTC---AT-TC---------------ATA----TAAA---ATTTGAT-TGG--AGTGT--CA-TTGACAGTACGAAAA-TGGTTGAG-GGCGA----------------A-GTTTAT-A-TAATGTT----TCTT-----A-A-AATTCATAAACTA------TC----TAA---C---ATTTAAAAA-----TAATTATAT--A---CAT--C--T--TTAT-----T--------T-----GATATACTTACATACTTATGTTTA--TC---AAC----T------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTA------AAATAAGA----GATAATTTATTACCATATT-T-C-----AA-ATA-AA---AAGTA------GT----C-CATGCCTTCTAA-----CAACCCGCGC-TATACT-A---T--T-TAGACAAAATCGGCTAAAGTG---A-GGT----G----T----CTTAGCAC----A------CAGATCAGTCGGAGCT--GGT----GATGTTATTCCGGGGAACACAT
gi|12 : ctataattttagtaaaatgagctcAAGAGATAC--TACCGTC---TC-TA---------------GTA----TAAA---ATATGTCATGTTCATCAC--TA-TTTCATATACGAAAAATGATACAG-ATCCA----------------A-GTTTAT-G-T---------------------A-A-TTCATGAACTA------TT----TAA---T---ATTTAGAAA-----TA------C--A---TGT----------AT-----A--------T---C-AATATACTT------------------------------------TTT-----TTTCA-AGGAA-GTG-A------AAATAAGA----GACAAACTATGAGACTATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--T-------------C-AATGCCCTCTAA----CCACCC-ATGC-TATTAT-A---A--C-CAAACAAAATCGGTT--AATC---A-GGT----G----A----ATTAGTAT----A------CAGGTCGATCGGATCT--ATT----GACGTAATGTGGGGGAACACATtg
gi|13 : tttcccgttataagtcaggagaagaaccaaaatgaaatttctttgttttttatttaaatcgataatt----------T-------GC------TTTGGTA---AATGTAAGAGATAC--TACCGTC---TC-TT---------------TTAACAATAAATAAACCTTAAATAGTCTGCAA--TT-TTTCAGGTACGAAAT-TGGTTCAG-GGTGA----------------G-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-A-TTCGTAAACTA------TA----TGC---T---ATTTGGAAA-----TA------T--AAA-TAT--CA-T--TTAT-----T------------C-ATAATATATATGTG---GAGTTGA--TT---ATC----A------TTA--C--TTTCT-AGGAA-ATGTG------AAAATAGA----TACAATATATGCGCATATT-T-C-----TA-TTT-AA---A--TA------GT----C-CATGCTTTCTT-----TCACCCCGCGC-TATTAT-A---A--T-TATCCAAAACCGGTT--AGTG---A-TGT----A----T----CTAAGCAG----T------CAGATCAATCAGAGCT--AGT----GACGTCATCT-GGGGAACACA
gi|14 : A------T--G---TAT--C--T--TTAT-----T------------C-TTAATATTAATGTG---AAGTTTA--TT---AAC----T------TTT--A--TCTCA-AGAAT-TTGTG------AAATATGA----GACAATTTATCAATATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCT
gi|15 : atttgcatttaaaaataaaagaaggaaagaaaactgcAGG-A-GTACCGCAACGACGTGTTTCTCCTC---TG--AAA------CAACATCCAAACACTCAAGTTG---TT--------CTTATGTA---A-----C----------T-------GG------TTTGGTG---AATC--AAAGATAA------GTC---TC-TT---------------TCA----GAAA---ACACGTCATTGACAGCAA--TA-TTTCCAGTAC--AAAATGGTTCGGTGGCGA----------------A-GTCTAT-A-T---GTT----GGTT-----A-A-AATTAATGAACTA------TA----TAC---T---ATTTACAAA-----TA------T--A---TATATC--T--TTAT-----A------------C-AAAATAGT-AAGTG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-TGGAA-ATGTG------ACATCTGA----GACAATTTTTGAGCATTTT-T-T-----TA-TTACAA---A--T--------C----C-TATGTCTTCAAA----TCACCCCGTGC-TACAAT-A---A--C-TAgttagtaatgcctcaaatttcaattgtgatattgtactcttttaaaacaacacaatatctaagtttcatattaaggagaactcaaaagcaaaagtagagtgtttcccaatgttaagcagcgtatcgtatcgccctacctgtatcgcggtacatatcatatctgaagcgacctggcaatacacaactctaataag
gi|16 : caagtaGGAGTTTTT-TCCTC---AG--AAT------CAGCTTTTAAACATTCAATTTG---TT--------CG---------G-----A----------T-------GGAAGTTGTTTGGTG---AATCCAAGAGATGC--TGCCATT---TC-TT---------------GAG----TTAA---ATCTGCCATGATAAGCAA--CA-GTTCCAGTAC-AAAAATGATTCAG-GGCTA----------------A-GTT--T-A-T---GTA----TGTT-----A-A-A-TTCACGAACTA-------------AAATTT---ATTAAGAAA-----TA------A--A---TCT--C--T--T--T-----T--------T---T-ATAATATTTc
gi|16 : acttttcctgtaacaagttaTATGTATGTT---AAATTCA--CG---AACTAAAA------TTT--A--TT----AAGAA-AT---------AAAT----------CTCTTTTTTATAATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TG------AT----C--A-GTCTTCCTA----CCATCCCACAC-TATAA---------C-CAACCAAAAT---------TG---A-AGT----G----T----CTAGGCAC----A------CAGATCAATAGGAGCT--TAT----GACGTGATCT-GGGGAACACActattaaaatgatcagtcttcctaccatcccacactataaccaaccaaaattgaagtgtctaggcacacagatcaataggagcttatgacgtgatctggggaacaca
gi|17 : acttttcctgtaacaagttaggagttttttcctcagaatcagcttttaaacattcaatttgttcggatggaagttgtttggtgaatccaagagatgctgccatttcttgagttaaatctgccatgataagcaacagttccagtacaaaaatgattcagggctaagttCCTT---TG--AAA------CGACATTTAG-CGCCCATTTTG---TT--------CT---------G-----C----------TTGAAT--GG------TTTTTTT---A-TCCA---GAT----TGGAG------C-TT---------------G--------------CCTACCATG---AGCAT--TA-TTTCCGGTAT-AAAAGTGAATCAG-AGCAA----------------A-GTTT------------------TT-----A-ATA-TTCATAACCTA------TA----TAA---T---ATTAAGAAA-----TA------T--A---TAT--A--T--TTAT-----T--------C------AAATATTTATGTG---ATTTTTT--TTTAAAAT----A------TTT--A--TTTGA-GGGAA-ATG-------------AGA----GACAATTTATGAGTGTATTAA-C-----GA---A-AG---A--TA------GT----T-CAAGCCTTCTAA----CCACTCTGCAC-------------------------------T--GGTG---A-GGT----G----T----CTAAGCAC----A------TAGATCAATCGGAGCT--AGT----GATGTAATCTGGGGGAACACA
gi|18 : CCCCTAACGTTA-T-CAGG-A-ATATCACAATTAGGTCTTTCTCCTC---CCCCAAA------CAGCATTCAAACACCCAATTTA---CT--------CT---------G-----C----------TTAAAT--GG------CTTGAAG---ATTATATTAGATAC--TGTCATC---TC-TA---------------GCA----TGAT---ACCTGCCACGGTGAGCAT--TA-TTTACGGTAC-AGAAATGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTATAT-A-T---ATT----TGTT-----A-A-A----A-----TA------CA----TAA---T---ATTTGGAAA-----TA------T--A---TA------T--TCA------T--------C---C-AAATTACATACCTG---AAGTTTA--TA---AGT----A------T-------CTTAA-AAGAA-ATGTGAAAAAAAAAAAAGA----GACAATTTATGAGCAT
gi|19 : aacttccTGCCATGGTAAGCAC--TA-TTTCCGGTACGAAAA-TGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTTAATGA-T---GTTG---TATTTAAA-A-G-A-TTGATGAACTA------TG----TAA---T---ATTAAGAAA-----TA------T--A---TAT--A--T--TTAT-----T------------C-AAAATATTAACGTG---AAGTTTA--TA---AAC----A------TCA--A--TTTCA-AGAAA-ATATC------AAATAAGG----TACAATTGATGAGCATATT-T-C-----TT-TTA-AA---A---A------GT----A-CATGCCTT---------CG--TCGCAC-TAAAGT-A---A--C-TAACCAAAACCTGTT--AGTG---T-TGT----G----G----CTAAGCAC----A------C-GATTAATCATAGCT--AGT----GGCGTCATCTGGGGGAACGC
gi|2 : agcgCCGTTACAG-G-T-CAAG-A-ATACTTCCATGAAGTGTTTCTTCTC---TG--AAA------CAGCACTGAATCACTATGTTTG---TC--------CT---------G-----C----------TTTA----AG------TTTTGTGGAAAAT--AAAAGACACG-TTCTGTCAATTC-CT---------------TTA----TAAT---ACCGGACATGGTCAGCAC--TA-TTTCCTGT-CAAAAAATATTTGGG-GGGGGGGGGGTGGGGGGGTGCA-GTTTAT-------GTT----TGTT-----A-A-ACTTAATAAACTT------CA----TAA---C---ATTTAAAAC-----TA------T--AGTTTAC--C--T--ATAT-----T--------TGTTT-AAAATAAATACGTA---AAATGTA--GT---AAT----A------TTT--AATTTTAA-AGGAA-ATATG------ATATAAGACTGAGACATTTTATGGGGATATT-T-C-----TA-TTC-AA---A--TA------AA----A-TGTGCCTTCTAA----CTA-CCTGCGC-TGTAATAA---A--C-T-ACCAAAATCG------GTG---A-CAG----G----T----CT------------------AGA--GATCGGAGAT--ATT----GACGTCATTTATGGGAACGCATt
gi|20 : ttCCCGTAACAGTA-T-CAGG-A-ATATCGAAATGAAGTATTTC-CCGC---CG--GAA------CAGCATTCAAACTAACAATTTACTATT--------CTTAA------G----------------T-------GG------TATGATG---A-TCCATTACATAG--TGTCGTC---TC-TT---------------GCA-----AA--------------GTGAGCAT--TA-TTTCATGTACGAAAATTGGTACAG-GGCGA----------------AAGTTTAT-A-T---GTTGGTTTGTT-----A-A-AATTCTTAAACTA------TA----TAA---T---ATTTAGAAA-----TA------T--A---TA------T--TTA------T--------T---C-AAATTATATACTTG---AAGTTTA--TC---AAT----ATTAAATTTT--A--TTTTA-AGGAA-AGGTA------AAATAAGA----GACAATtg
gi|21 : ttttCCGTAACAT-G-T-CAGG-T-GTACCATATAAAAGCCCTTTTTTTTGGATG--AAA------CAGCATTAAGAT-CCCAATTTG---TT--------TTAATTAAGT-G-----T----------T---------------TTTTGTG---AATC--------AC--T------------TT----------------TA----GAAA---ATCTGCCATGGTCAGCAA--TA-TTT-----ACGAAAAA-GGTTCAG-AGTAA----------------A-GTTTAT-G-T---TTG----TGTT-----A-A-ACTTCATGAACTA------TA----TAC---T---GTTTAGAAA-----TA------G--A---TAT--A--T--TTAT-----T------------C-AAACCATTTACCTG---AAGTGTA--TT---AAC----A------TTT--A---TTCACAGGAgt
gi|22 : tattttAG-GACGA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTTTGTTAA-A-A-TTAATGAACTA------TAATTATAA---A---ATT-AGAAA-----TA------T--A---T-------T--TTAA-----T--------T---AGAAAAAATATATCTG---AAGTTTA--TC---AAT----A------TCA--A--TTTTA-AGGAA-AAATG------AAATAAGA----GACATTTTGTGAGCGTATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----T-TATGCCTTCTTA----CCGACCAACAC-TGCAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--CATG---A-Gtcagtctgagctttttaagtcaa
gi|23 : ---GTT----TATT-----A-A-AATTCA-AAAATA------TA----TAA---T---ATTTAGAAG-----TA------T--A---TAT--C--T--TTAT-----T------------C-AAAATATTTACCTT---AAGTTTA--TC---AAT----A------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GACAATTAATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCATTCTTT----CCATCCCACAC-TATAAC-A---A--C-TAACCAAAAT-GA----AGGG---A-GGT----T----T----CTAAGCAC----A------CAGAACAATCGGAGCT--AGT----GACATCATCTGGGGAAACACATcaattaaagtcctctgaggaaacacattgtc
gi|24 : CTA------TA----TAA---C---ATTAAGAAACA---TA------T--A---TAT--C--T--TTAT-----T------------C-AAAATACTTACATG---AAGTTTA--TG---AAC----T------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GATAATTTATTACCATATT-T-T-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CTG-CCCGCGC-TATACT-A---A--T-TAACCAAAATCGGTTAAAGTG---A-GGT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCAGTCGGAGC
gi|25 : TCCCTTC---CG--AAA------CAACAACTAAGTACTCAATTTG---AT--------CT---------G-----A----------TTTAAGT-GG------TTTGGTC---AATCCAACAGATAC--TGCAGTC---TC-TT---------------GTA----TAAA---ACCTGACATGGTCAGCAC--TA-TTTCTGGTACG-AAAATGGTACAG-GTTGA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-A-AT--TAAA-TA------TA----TAA---C---ATTT-GAAA-----AA------T--A---TG---C--T--TGA------T--------T---C-AAAATATTAAC
gi|26 : AAATGAGTGAG-AACAA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-A-TCTATAAACTACATGTATA----TAA---A---ATTTGGAAA-----AA------T--G---CAT--------TTATCTA--T--------T---A-AAAAGATTTGCGTG---AAATTTA--TA---AAT----G------TTGGAA--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----CACAAATTATTAGCATGTT-T-C-----TA-TTC-AA---A--TA------GT----C-CAT--CTTCTAA----CCG
gi|27 : ccaatatgtAA------CAGCACTTAAGCACTCGGTTTG---TT---------T---------G-----C----------TTTAGGT-GG------TTGAATG---AATCCAAGAGATAC--TGCCGTC---TC-TTAATATAATACTATTAATG----TAAT---ACCTTCAATGGTCAACTC--TA-TTTTTCATAC-AGAAATGATTGAG-GACAA----------------A-GTTGA--A-------------GTTG----A-A-G-TTTATAAGCTA------TG----TAA---C---TTTTAGTTA-----TA------T--A---TA
gi|28 : ttccatagCCCGTAACATTA-C-CAGG-A-ACATCTCAATAAAGTTTTGCTCCTC---CG--AAT------CAGCATTCAAACATCTAATTTA---CC--------CT---------G-----C----------T-------CA------TGTGATG-----T------GATGA--TGTCGTC---TC-TT---------------GCAACGCGAAT---ACCTGACATAGCGAGCAT--TA-TTTCCGGTACGAAAAATTGAT--------A----------------G-GTT------T---GTT----TGTT-------A-A-TT-------TA------TA----TAA---T---ATaa
gi|29 : ttttACCTG---ATGTTTC--TT---AAT----A------TTC--A--TTTTA-AGGAA-ATGT-------AAACAAGA----AACAAGTTATGAGCATATT-T-C-----TC-TTA-AA---A--TA------GC----A-CATGCCTTCTAA----ACCCCTCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--AGTG---A-TAT----A----T----CTAAGCAC----A------C--ATTAAACGGAGCT--AGT----GACGTTATCTAGGAAAACA
gi|3 : CCTGTAAAATTA-T-CAGG-A-ATACCACAATGAAGTCTTTTTCCTT---CG--AAA------CAGCATTCAAACATCCAATTTA---CT--------TT---------G-----C----------C-------GG------TTTGATG---AATCCGTTAGGTAC--TGTCCTC---TC-TT---------------GTA----TAAT---ACCTGCCATGGTGAACAT--TA-TTTCCAGTACGAAAAACAGTTAAG-GGCAA----------------A-GTTTGT-A-T---GTT----TGTT-----T-G---TTCATAAGTTA------TG----TTA---T---ATTTAAAAA-----TG------T--A---TAT--C--T--TTATGGAATT--------T---C-AAAATCGTTACCTG---AAATTTA--TC---AAT----T------CTT--A--TTTTA-ATGAA-ATGTG------AAATAATA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------AT----C-CATGCCTTCTTA----CTGCCCCGCAC-TATAAT-A---A--T-TAACCAAAATTGGTT--AGTG---A-GTT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCGTTCAGAGCT--AGT----GACAACATTTAGGGAAACACATtg
gi|30 : CTGTAGCAT-G-T-TAGG-T-GTACCGTTATAAAGCCCCTTTTCTA---TG--AAA------CAGCATTAAAGCACCCAATTTG---TT--------CTAATTAA---G----------------T-------GT------TTTGCTG---AATCCA----ATA---TGTCGTC---ACTTT---------------TTA----AAAA---ATCTGCCATTGTCAGCAA--TA-TT-----AACGAAAAA-GGTTAAG-TTTGA----------------A-GTCTATGA-T----TT----TGTT-----A-
gi|31 : ttCCCGTAATA--A-GGCAGG-A-GTACCGCAGTGAACTTTTTCCCCTC---TG--AAAACTTGGCAGCATTTAAACACTCAGTTTG---TT--------CTAATTTTTTTG----------------T-------GG------TTTGATA---ACTCCAAGAGATAG--TGCCGTC---TC-TT---------------GT------------------CATGGTCAGCAA--CA-T-------------AATGATTCGG-GACGA----------------A-GTTTAA-A-T---GTT----T
gi|32 : gtttcGTAACA-------AGGTA-GTACTGCAACAAAGTCAATC-CCTC-------AAC------CAG--TTC-------TAATTTA------------------------A-----G----------T-------GG------TTTGGTG---AATCAAAGATATAA--TGCAGTC---AC-TT---------------GTA----T-AT---ACGTGCCACAGTCAGCGC--TA-TCT
gi|33 : tttttctt----------T-------GG------TTTGATG---AATCCAAGAGATAC--TGTTTTC---TC-TT---------------GTA----AAAT---ACCTGCCATGGTCAGCAC--TA-TTTCC-TTAC-AAAAGTGATTGAGAAGTCA----------------A-GTTTAT-ATT---ATTATA-TATTTAA--A-A-A-ATCATAAAATA------TG----TAA---T---ATATATAAA------A------T--A-----------T--TAAT-----T--------T---T-AAAATAactacctctgaaagtgttcgtccgtgtaggatatagatagt
gi|34 : TTTAA-TT---AAC----A------TG---A--TCTCA-GAGAA-ATGTG--------------------CAATTTATGAGCATAAT-T-T-----TA-TTG-AA---A--TC------GT----C-CATGCCCTCTCA-----CACCACGAGC-TGT--T-A---A--C-AAACCAAAATCGATT--AGTG---G-TGT----G----T----CTTAG-----------------------CGGAGCT--AGTGACGGACGTAACCCGGAGGATCACATg
gi|35 : ttA------TA----TAA---T---ATTTAGA------------------------------T--TTA------T--------T---C-AAAATATTTACCTG---AAGTATA--TC---AAT----A------TCT--A--TTTGA-AGTAA-ATATG------AAATAAGA----GACAATTTATGAGCATA---------------TA-AA---A--TA------GT----t
gi|36 : TCTTTCTTCGC---CA--AAA------CATTATTTAAGCAGTTCGTTTG---TTATTTTTAAGT---------G-----T----------T---------------TTTAGTG---AATCCAAAATATAC--TGTCTGC---AT-TT---------------AAA----TAAT---ACCTACCATGttttgctcgtcaaaggcctctctcaaattatatacatgccagacattccattatc
gi|37 : tgaaattaatcagtcgatggtaatatatctaccatataAATTTATAGGCATTCT-T-T-----TA-TTA-AA---G--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCTTCTCACGC-TATGGT-A---A--C-TAACCAAAACCGGCT--AGTG---G-TGT----A----T----CTAAGTAC----A------CTGACCAATCGGGTCT--ATT----GACGTCATCAGGGGAAAtt
gi|38 : atgg--C--T--TTAT-----T------------C-AAAATCTTTA-GTG---AAATATA--TT---AAC----A------CTT--A--TTTCA-AGGAA-TTGTG------ATATCTGG----GACAATTTATGAGTATATT---C-----TG-TTA-AA---A--TA------CT----C-CATGCCTTCTAA----TCTCCCCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAA
gi|39 : TACAGCCATAAAGCTGTTCTTCTC---AA--AAT------CAGC----------TCGATTTG---TT--------TT---------A-----CCTTAATTAAAT-------GG------GTTGATG---AATCCAAGATATAC--TACCGTC---TC-TT---------------GTG----TAAT---ACCTGCCACGGGCAGCTC--AA-TTTc
gi|4 : gtctgaat-T-CAGG-A-GTACTGCAATTAAGTAATTCTGCTT---TG--AAA------TAGTATTCAAACACTCAATTTG---TT--------CTAATTTAA--G----------------T-------GG------TTTGTTG---AATACAAGAGTTGA--CGCCGTC---TC-TT---------------GTA----TACA---ACCTGCCATTGTCAACAC--TATTTTTTTGTAAG-AAAATGATTCTT-GTCAA----------------A-GTTTAT-A-T---ACT----TGTTA----A-A-A-TTCATTAACTA------TA----TCA---T---ATTTATACA-----TA------T--A---TAT--C--T--TTA------T--------G---C-AGAATATTTACGAG---AAGGTTATTTT---AAC----T------TTT--A--TTTC------A-ATTT--------------A----GACAATTTATAAGCATATC-TACCGGTATG-TTA-AA---A--TA------GC----C-CATGCTGTCTCA----CCACCCTGCG--TAAATT-A---A--C-TAACCGAAATCAGTA--AGTG---A-GGT----G----A----CCAAGGAC----G------AAGATTAAAC-CAGCT--AGT----GATGTTATCTGGGGAAACACATgtt
gi|40 : ttacagtagcaagAATTA------TA----TCA---T---ATTCAGAAA-----AA--------------------------AT-----T------------C-AAAATATTTCTGCA---AAGTTTA--TTGA-AAC----T------TTA--A--TTTAA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GAAAATTTATGAGTATATT-T-------------------A--TA------G-----C-TAAGCTTTCTTA----CCATCCt
gi|41 : tA------GT----C-CATGCCGTCTTA----CCATTTTGTGC-TATAAT-A---A--C-AAACCAAACTCAGTT--AGTG---A-AGT----G----T----CTAAGCAC----ACACTGTCAGGTCTATTGGAGCT--AGT----GGCAACATCTGGGGACACACGT
gi|42 : CCGTAACATTA-T-CAGG-A-ATACAGTAATt
gi|42 : ccttttTGCCGCAGTGAAGTATGTCTCCTA---CG--AAA------CAGCATTCAAACACCTCATTTA---CT--------CT---------G-----C----------T-------cgaggaattagatagttccttgccgcagtgaagtatgtctcctacgaaacagcattcaaacacctcatttactctgcttt
gi|43 : ccttttccgtaacattatcaggaatacagtaatcgaggaattagatagttcctTTTTAA----CTGCCCCATGC-TATA-T-ATTTA--C-CTGCCGAAATC---T--AGTGGCTA-GAT----A----TTCTTCCATGCAC----A------AAGACCAATCGGAGCTTAGGT----GACATTGTCTGGAGGAATAGATtt
gi|44 : tAACATTT-T-CAGG-A-ATACCGCAGTGAGGTGTTTCTCCTC---CG--AAA------CAGCATTC-AACGCCCAATTTA---CT--------CT---------G-----C----------T-------tg
gi|45 : aacctttggctaA------TA----TAA---A---AGTAAGACA-----GA------T--A---TAT--T--TATTTAC-----T--------T-----AAAATGTTTACGTA---AATTTTA--TT---AAC----A------TTTA-A--TTTCA-ATGAA-ATGTG------AAATAAatatactgttgg
gi|47 : GG-ACGTACCGCCAAGAAGTATTTATTGTC---TT--AAA------CAATATTGAAGCACGTGATGTGT--TT--------CT---------G-----T----------T-------G
gi|48 : acaagtcCATTCAAGCACACAATTTG---TC--------CT---------AAT---C----------TAAGC---GG------TTTGGTG---AATCCAAGAGATAC--TGCCGTC---ttgtatg
gi|5 : aagttttccaGCCATGAGCACTTTTT--TG---CG--AAA------CAGAGTTCAA-----CG-TTTT---TC--------CT---------G-----CATTAAGT---T-------GT------TTTGTTT---AATATGTGAGATGC--TGCCTTC---TC-TT---------------TTA----TAGT---ACCTG-----GCCAGCAC--TA-TTTTCGGTACGAAA--TAATTGAG-GGCGA---------------------------C---GTT----GGTT-----ACA-A-TTCATAAATTA------AA----TAA---C---GTTCAGAAA-----TA------T--A---CCT--TCAT--TTAT-----T--------T---T-AAA-TATCTACATG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--AATTTTAA-AGGAA-CTGTG------ATAAAAAA----GACCAATTATGAGCATATT-T-A-----TA-TTA-AATTAA--TA------GTACAGCACATGCTTTCTAC----CCGACCTGTGC-TGTAAT-A---AAAC-TAACCAAAATCGGGT--TTTG---A-G-T----G----T----TCAAGCAC----A------AAACTCAACCAGAACT--GGT----GACGTCATCCGGGGG-ACACA
gi|50 : aattgttccgtaaaaaCCCGTAACA--AGT-CAGG-A-GTACGGCCATGAAGTGTTTATCCTC---TA--CGA------CAGCATTCAAACACTC
gi|51 : tgtt-GTGCCGCCATGAAGTCTTTTTTCTC---CG--AAA------TATCAATTAAGAACTCAATTTG---T
gi|52 : caattcatatGCCATGGTGAGCAT--TA-TTTCTGGTATG-AAAATATTTCAG-GGCGA----------------A-GTTGAT-A-
gi|53 : AGTT--AGT----GACGTCATCT-GGGGAACACATa
gi|54 : tttaacatgcA-TTA-AA---A--CA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCA--CCGCGC-TATtggtgt
gi|6 : GGTG---AGCCCAGGAGATAC--TGGAATA---TA-TT---------------GTA----TAAT---ACCTGCCGTGGTTAGCTC--TA-TTTCCGGTATGAAAA----TTGAG-GA-GA----------------A-GTTTAT-A-G---TTT----TGCTAA---A-A-A-TT-ATAAACTATAAT--TA----TAA---CACAATTT-GAAA-----TATC----T--A---TAT--A--T--TTAT-----TTGAATTAGT---T-AAAATATCTACGTA---CAGTTCA--GT---AAT----A------TTCA-A--TTTCA-A--AATATATG------ACACAGGA----GGCATTTTATGAGCATGTT-T-C-----TATTTA-AA---A--TA------GT----T-CATGCCATCTAAACGTCCGCTCTACTCGTATGAC-A---A--CTTGCCCAAAGCCAGCT--AAC------GGT----GGACCTTA--CTATGCAC----G------GGGATCAGACGGAGCT--AGT----GACg
gi|7 : attgaaagactaaacttctatgttttaaggggtttaaggggtttggtgagcccaaCCGTTACA--AGT-CAGG-A-GCACCGCCA----GTCTTTTTTCTC---CG--AAA------TGACATTCAAGCACACAATTTG---TC--------CT---------A-----C----------TTTAATCAGT------TTTGTTA---AAAATAAGAGATAC--TGCCATT---TC-CT---------------TTA----TAAT---ACCTGCCATTG-CAGCTC--TA-TTTTCTATACGAAATATTG---AA-GGTGA----------------A-GT-----------GTT----TGTT-----A-A-AATTCATGAACTA------CA----TGA---C---ATTCAGAAA-----TG------T--G---T-------------------T--------T--------ATGTTTACGTG---AAGTTTA--TT---AAC----AAACAA-TTT------TTAA-AGAAA-ATGTG------ATATAAGA----GACAATTTAT-AGCATATT-T-C-----TA-TTC-AA---A--TACTAATTGT----C-CATGCCTTCTAA----CCGCCTCCCGC-CATAAT-A---A--C-TAA-----------T--AGGG---A-TGC----C----T----CTAAGCAT----A------CCGATTAATCGGATCT--ATT----GCCGTCATAT-GGGAAACAccaatcggga
gi|8 : tCCTGTAACAA-A-T-CACG-A-GTACCACAATGAAGTCTTTCTCTTC---TT--AAA------TGTCATTCAAATA----ATTTG---TT--------CTT--------G-----T----------TTAAGT--GG------TTTAGTG---AATCCAACAG--------------------------------------A----TAG------------TGGTCAACAA--TA-TTTCTGGTAC-AAAAATGATTCTT-GGCAA----------------A-GTTTGT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-AATTCAAGAACTA------TA----TAG---A---ACT-----A-----TA------T--A---TAT--A--T--TTAT-----T------------C-AAAATATTTA-GCT---ATGTTTA--TT---GAC----A------TTT--A--CTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATATGA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TT--GA---A--TA------GT----C---TGACTTCTAA----CCATCAGGCGT-TATAAT-T---A--C-TAATTGAAATCTGTT--AGTG---GTAGTGCTAG----T----TTGAGAACAAATA------AAAACAAAGCGCAGCT--AGT----GATGTCATCTGAGGAAA
gi|9 : ttcCTGTAACA--AGT-CAGG-A-GTACCGCAATGAAGTCTTTCTCCTC---TG--A-------------------CATTCAATTTG---TC--------CTTATTTAA--G----------------T-------GG------TTTAATG---AATCGAAGAGATAG--TGCCGTC---TC-TT---------------TCA----GAAA---ACTTGTCATGGTCAGCAAAATA-TTTCCGGTATGAAAA-TGGTTT-G-GGCGG----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-AATTCACAAACTA------TA----TAC---T---ATTTAGAAA-----TA------TCTA---TAT--T--T--TTAT-----T--------C---C-AAA-TATTTAGG-G---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-AAGAA-ATGTG------CAATAAGA----CACAATTTATGAGCATATT----------------------------------------------TTCTAA----CCACTCTGCGT-TATAGT-A---A--C-TAGCCAAAATTGGTT--AGTG---A-TGT----G----T----CTAATTAC----A------CAGATCAAAC--------AGT----GATGTCATCTGGGGAAATAC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|46 ): ATAGTATCGTATGTATCAGCCTACCCATATCGCAGTACCTATCGTATCGGAACGGACCTGGCAATACACAGCCCTAATAAT
Unaligned ( gi|49 ): CTATGATTATAGTAAAATGAGCACATGGATCTCGTGCGTTCATTCATAGATATTTTAAATGGAATGCCATTG
Alignments
lowQualScore : 2222 6666666666666666666666666666666666 11111111111111111111111 11111 1 11111111111 111111111111111111111
lowQualScore : 5555 2 2 2 1 3333 22 444444 2 1 333 55555555 8888888888888888888888888888888888 444444 0 222 11 333 222 1 00000000000000000000000 7777 444 1 3 55 3 1 2 9999999999999999 1 2 1 2222 6666 77777 1 1 3 3 666666 2222 3333333 1 55555 555555 11 11111111111 11 999999999999999999999 222 33 444 77777777777 44 33 1 1 333333 2222 1 1 33333 1 1 222 11 333333 2222 1 0 3333 55 1 1 222 22 1 1 44 333 44 3333 3333 6666 3333 555555 0 22 3333 5
lowQualScore : .... . . . . .... .. ...... . . ... ........ .................................. ...... . ... .. ... ... . ....................... .... ... . . .. . . . ................ . . . .... .... ..... . . . . ...... .... ....... . ..... ...... .. ........... .. ..................... ... .. ... ........... .. .. . . ...... .... . . ..... . . ... .. ...... .... . . .... .. . . ... .. . . .. ... .. .... .... .... .... ...... . .. .... .
lowQualScore : 7777 4 1 0 0 9999 11 111111 4 1 999 44444444 3333333333333333333333333333333333 444444 6 666 33 333 444 4 11111111111111111111111 3333 111 4 1 11 5 3 8 1111111111111111 4 8 4 7777 7777 55555 4 5 3 2 555555 7777 2222222 0 22222 555555 88 55555555555 88 444444444444444444444 333 11 000 00000000000 44 55 3 3 888888 9999 4 4 66666 4 4 444 99 888888 8888 4 1 0000 00 5 6 888 22 6 3 88 000 77 9999 9999 4444 9999 222222 6 55 9999 4
consensus : CCCGTAACATTA-T-CAGG-A-GTACCGCAATGAAGTCTTTCTCCTC---CG--AAA------CAGCATTCAAACACTCAATTTG---TT--------CT---------G-----C----------T-------GG------TTTGGTG---AATCCAAGAGATAC--TGCCGTC---TC-TT---------------GTA----TAAN---ACCTGCCATGGTCAGCAC--TA-TTTCCGGTACGAAAAATGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-A-TTCATAAACTA------TA----TAA---T---ATTTAGAAA-----TA------T--A---TAT--C--T--TTAT-----T--------T---C-AAAATATTTACGTG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCGCCCCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--AGTG---A-GGT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCAATCGGAGCT--AGT----GACGTCATCTGGGGGAACACAT
Reference ( family-1607 ) : CCCGTAACATTA-T-CAGG-A-GTACCGCAATGAAGTCTTTCTCCTC---CG--AAA------CAGCATTCAAACACTCAATTTG---TT--------CT---------G-----C----------T-------GG------TTTGGTG---AATCCAAGAGATAC--TGCCGTC---TC-TT---------------GTA----TAAN---ACCTGCCATGGTCAGCAC--TA-TTTCCGGTACGAAAAATGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-A-TTCATAAACTA------TA----TAA---T---ATTTAGAAA-----TA------T--A---TAT--C--T--TTAT-----T--------T---C-AAAATATTTACGTG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCGCCCCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--AGTG---A-GGT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCAATCGGAGCT--AGT----GACGTCATCTGGGGGAACACAT
gi|1 : ------CAACATTCAAGCACTCAATTTG---TT--------CT---------GATAATC----------T-------GG------TTTGGTG---AATTCAAGAGATAC--TGCAGTC---TC-TT---------------GCA----GAAA---ACTTGCCATGGTCAGCAA--TA-TATCCGGTATG-AAAATGATTCAG-GG------------------------TAT-A-T----TC----TGAT-------A-G-TT--GAAAC--------------------C---ATTTAGAAATACAGTA------T--A---TAT--C--T--TTA------G--------T---C-TAAATATTTATGTG---ATGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-ATGAT-TTGTG------AAATATGA----GACAATTTATGAACATATT-T-C-----TA-TCA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCT
gi|10 : tttttcctgtataaagtatgCATTA-T-CAGG-A-TTACTGCAATGACATCTTTCTCCTC---TG--AAA------CAGCAGTCAAACTCTCAATTTA---CT--------TA---------A-----A----------T-------GG------TTTGATA---AATCCATCAGTTAC--TGTCGTC---TC-TT---------------GTA----TAAC---ACCTTCCACGGTGAGTAT--TA-GTTCCAGTACAAA----GGTACAG-GGCAA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTTTGTTAA-A-A-TTCATCAAC--------TA----TAA---T---ATTAAGGAA--------------------------------TAT-----T--------T---C-----------CCTG-----GTTTA--CC---AAC----A------TCT--A--TTTTA-AGGAA-ATGAG------AAAT------------AT------GCACATT-T-T-----TA-TTA-AA---T--CA------GT----C-GTTGCCTTCTAA-----CGCAGCGTGT-TATAAT-A---A--C-TAA-CATAACTGGTT--GGTG---A--GT----G----T----CTATGAAT----A------CCAATCAATCGGAGCT--AGT----GACATCATCT-GGGGAACACATgtcagtgatgtctcaaattgcaatacagacatactgtaatctttcaaaccaacacatatcaaagtttcatatcaatgagaatccaaagaaaaagtaagattgttttctaatgttaagcagcgtatcatatcatgtatcgctctacacgtatcgtggtacatatcatattggaaatctcctggcaatacacagccca
gi|11 : ccAGGGATATCGTGCCTTC---AT-TC---------------ATA----TAAA---ATTTGAT-TGG--AGTGT--CA-TTGACAGTACGAAAA-TGGTTGAG-GGCGA----------------A-GTTTAT-A-TAATGTT----TCTT-----A-A-AATTCATAAACTA------TC----TAA---C---ATTTAAAAA-----TAATTATAT--A---CAT--C--T--TTAT-----T--------T-----GATATACTTACATACTTATGTTTA--TC---AAC----T------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTA------AAATAAGA----GATAATTTATTACCATATT-T-C-----AA-ATA-AA---AAGTA------GT----C-CATGCCTTCTAA-----CAACCCGCGC-TATACT-A---T--T-TAGACAAAATCGGCTAAAGTG---A-GGT----G----T----CTTAGCAC----A------CAGATCAGTCGGAGCT--GGT----GATGTTATTCCGGGGAACACAT
gi|12 : ctataattttagtaaaatgagctcAAGAGATAC--TACCGTC---TC-TA---------------GTA----TAAA---ATATGTCATGTTCATCAC--TA-TTTCATATACGAAAAATGATACAG-ATCCA----------------A-GTTTAT-G-T---------------------A-A-TTCATGAACTA------TT----TAA---T---ATTTAGAAA-----TA------C--A---TGT----------AT-----A--------T---C-AATATACTT------------------------------------TTT-----TTTCA-AGGAA-GTG-A------AAATAAGA----GACAAACTATGAGACTATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--T-------------C-AATGCCCTCTAA----CCACCC-ATGC-TATTAT-A---A--C-CAAACAAAATCGGTT--AATC---A-GGT----G----A----ATTAGTAT----A------CAGGTCGATCGGATCT--ATT----GACGTAATGTGGGGGAACACATtg
gi|13 : tttcccgttataagtcaggagaagaaccaaaatgaaatttctttgttttttatttaaatcgataatt----------T-------GC------TTTGGTA---AATGTAAGAGATAC--TACCGTC---TC-TT---------------TTAACAATAAATAAACCTTAAATAGTCTGCAA--TT-TTTCAGGTACGAAAT-TGGTTCAG-GGTGA----------------G-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-A-TTCGTAAACTA------TA----TGC---T---ATTTGGAAA-----TA------T--AAA-TAT--CA-T--TTAT-----T------------C-ATAATATATATGTG---GAGTTGA--TT---ATC----A------TTA--C--TTTCT-AGGAA-ATGTG------AAAATAGA----TACAATATATGCGCATATT-T-C-----TA-TTT-AA---A--TA------GT----C-CATGCTTTCTT-----TCACCCCGCGC-TATTAT-A---A--T-TATCCAAAACCGGTT--AGTG---A-TGT----A----T----CTAAGCAG----T------CAGATCAATCAGAGCT--AGT----GACGTCATCT-GGGGAACACA
gi|14 : A------T--G---TAT--C--T--TTAT-----T------------C-TTAATATTAATGTG---AAGTTTA--TT---AAC----T------TTT--A--TCTCA-AGAAT-TTGTG------AAATATGA----GACAATTTATCAATATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCT
gi|15 : atttgcatttaaaaataaaagaaggaaagaaaactgcAGG-A-GTACCGCAACGACGTGTTTCTCCTC---TG--AAA------CAACATCCAAACACTCAAGTTG---TT--------CTTATGTA---A-----C----------T-------GG------TTTGGTG---AATC--AAAGATAA------GTC---TC-TT---------------TCA----GAAA---ACACGTCATTGACAGCAA--TA-TTTCCAGTAC--AAAATGGTTCGGTGGCGA----------------A-GTCTAT-A-T---GTT----GGTT-----A-A-AATTAATGAACTA------TA----TAC---T---ATTTACAAA-----TA------T--A---TATATC--T--TTAT-----A------------C-AAAATAGT-AAGTG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-TGGAA-ATGTG------ACATCTGA----GACAATTTTTGAGCATTTT-T-T-----TA-TTACAA---A--T--------C----C-TATGTCTTCAAA----TCACCCCGTGC-TACAAT-A---A--C-TAgttagtaatgcctcaaatttcaattgtgatattgtactcttttaaaacaacacaatatctaagtttcatattaaggagaactcaaaagcaaaagtagagtgtttcccaatgttaagcagcgtatcgtatcgccctacctgtatcgcggtacatatcatatctgaagcgacctggcaatacacaactctaataag
gi|16 : caagtaGGAGTTTTT-TCCTC---AG--AAT------CAGCTTTTAAACATTCAATTTG---TT--------CG---------G-----A----------T-------GGAAGTTGTTTGGTG---AATCCAAGAGATGC--TGCCATT---TC-TT---------------GAG----TTAA---ATCTGCCATGATAAGCAA--CA-GTTCCAGTAC-AAAAATGATTCAG-GGCTA----------------A-GTT--T-A-T---GTA----TGTT-----A-A-A-TTCACGAACTA-------------AAATTT---ATTAAGAAA-----TA------A--A---TCT--C--T--T--T-----T--------T---T-ATAATATTTc
gi|16 : acttttcctgtaacaagttaTATGTATGTT---AAATTCA--CG---AACTAAAA------TTT--A--TT----AAGAA-AT---------AAAT----------CTCTTTTTTATAATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TG------AT----C--A-GTCTTCCTA----CCATCCCACAC-TATAA---------C-CAACCAAAAT---------TG---A-AGT----G----T----CTAGGCAC----A------CAGATCAATAGGAGCT--TAT----GACGTGATCT-GGGGAACACActattaaaatgatcagtcttcctaccatcccacactataaccaaccaaaattgaagtgtctaggcacacagatcaataggagcttatgacgtgatctggggaacaca
gi|17 : acttttcctgtaacaagttaggagttttttcctcagaatcagcttttaaacattcaatttgttcggatggaagttgtttggtgaatccaagagatgctgccatttcttgagttaaatctgccatgataagcaacagttccagtacaaaaatgattcagggctaagttCCTT---TG--AAA------CGACATTTAG-CGCCCATTTTG---TT--------CT---------G-----C----------TTGAAT--GG------TTTTTTT---A-TCCA---GAT----TGGAG------C-TT---------------G--------------CCTACCATG---AGCAT--TA-TTTCCGGTAT-AAAAGTGAATCAG-AGCAA----------------A-GTTT------------------TT-----A-ATA-TTCATAACCTA------TA----TAA---T---ATTAAGAAA-----TA------T--A---TAT--A--T--TTAT-----T--------C------AAATATTTATGTG---ATTTTTT--TTTAAAAT----A------TTT--A--TTTGA-GGGAA-ATG-------------AGA----GACAATTTATGAGTGTATTAA-C-----GA---A-AG---A--TA------GT----T-CAAGCCTTCTAA----CCACTCTGCAC-------------------------------T--GGTG---A-GGT----G----T----CTAAGCAC----A------TAGATCAATCGGAGCT--AGT----GATGTAATCTGGGGGAACACA
gi|18 : CCCCTAACGTTA-T-CAGG-A-ATATCACAATTAGGTCTTTCTCCTC---CCCCAAA------CAGCATTCAAACACCCAATTTA---CT--------CT---------G-----C----------TTAAAT--GG------CTTGAAG---ATTATATTAGATAC--TGTCATC---TC-TA---------------GCA----TGAT---ACCTGCCACGGTGAGCAT--TA-TTTACGGTAC-AGAAATGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTATAT-A-T---ATT----TGTT-----A-A-A----A-----TA------CA----TAA---T---ATTTGGAAA-----TA------T--A---TA------T--TCA------T--------C---C-AAATTACATACCTG---AAGTTTA--TA---AGT----A------T-------CTTAA-AAGAA-ATGTGAAAAAAAAAAAAGA----GACAATTTATGAGCAT
gi|19 : aacttccTGCCATGGTAAGCAC--TA-TTTCCGGTACGAAAA-TGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTTAATGA-T---GTTG---TATTTAAA-A-G-A-TTGATGAACTA------TG----TAA---T---ATTAAGAAA-----TA------T--A---TAT--A--T--TTAT-----T------------C-AAAATATTAACGTG---AAGTTTA--TA---AAC----A------TCA--A--TTTCA-AGAAA-ATATC------AAATAAGG----TACAATTGATGAGCATATT-T-C-----TT-TTA-AA---A---A------GT----A-CATGCCTT---------CG--TCGCAC-TAAAGT-A---A--C-TAACCAAAACCTGTT--AGTG---T-TGT----G----G----CTAAGCAC----A------C-GATTAATCATAGCT--AGT----GGCGTCATCTGGGGGAACGC
gi|2 : agcgCCGTTACAG-G-T-CAAG-A-ATACTTCCATGAAGTGTTTCTTCTC---TG--AAA------CAGCACTGAATCACTATGTTTG---TC--------CT---------G-----C----------TTTA----AG------TTTTGTGGAAAAT--AAAAGACACG-TTCTGTCAATTC-CT---------------TTA----TAAT---ACCGGACATGGTCAGCAC--TA-TTTCCTGT-CAAAAAATATTTGGG-GGGGGGGGGGTGGGGGGGTGCA-GTTTAT-------GTT----TGTT-----A-A-ACTTAATAAACTT------CA----TAA---C---ATTTAAAAC-----TA------T--AGTTTAC--C--T--ATAT-----T--------TGTTT-AAAATAAATACGTA---AAATGTA--GT---AAT----A------TTT--AATTTTAA-AGGAA-ATATG------ATATAAGACTGAGACATTTTATGGGGATATT-T-C-----TA-TTC-AA---A--TA------AA----A-TGTGCCTTCTAA----CTA-CCTGCGC-TGTAATAA---A--C-T-ACCAAAATCG------GTG---A-CAG----G----T----CT------------------AGA--GATCGGAGAT--ATT----GACGTCATTTATGGGAACGCATt
gi|20 : ttCCCGTAACAGTA-T-CAGG-A-ATATCGAAATGAAGTATTTC-CCGC---CG--GAA------CAGCATTCAAACTAACAATTTACTATT--------CTTAA------G----------------T-------GG------TATGATG---A-TCCATTACATAG--TGTCGTC---TC-TT---------------GCA-----AA--------------GTGAGCAT--TA-TTTCATGTACGAAAATTGGTACAG-GGCGA----------------AAGTTTAT-A-T---GTTGGTTTGTT-----A-A-AATTCTTAAACTA------TA----TAA---T---ATTTAGAAA-----TA------T--A---TA------T--TTA------T--------T---C-AAATTATATACTTG---AAGTTTA--TC---AAT----ATTAAATTTT--A--TTTTA-AGGAA-AGGTA------AAATAAGA----GACAATtg
gi|21 : ttttCCGTAACAT-G-T-CAGG-T-GTACCATATAAAAGCCCTTTTTTTTGGATG--AAA------CAGCATTAAGAT-CCCAATTTG---TT--------TTAATTAAGT-G-----T----------T---------------TTTTGTG---AATC--------AC--T------------TT----------------TA----GAAA---ATCTGCCATGGTCAGCAA--TA-TTT-----ACGAAAAA-GGTTCAG-AGTAA----------------A-GTTTAT-G-T---TTG----TGTT-----A-A-ACTTCATGAACTA------TA----TAC---T---GTTTAGAAA-----TA------G--A---TAT--A--T--TTAT-----T------------C-AAACCATTTACCTG---AAGTGTA--TT---AAC----A------TTT--A---TTCACAGGAgt
gi|22 : tattttAG-GACGA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTTTGTTAA-A-A-TTAATGAACTA------TAATTATAA---A---ATT-AGAAA-----TA------T--A---T-------T--TTAA-----T--------T---AGAAAAAATATATCTG---AAGTTTA--TC---AAT----A------TCA--A--TTTTA-AGGAA-AAATG------AAATAAGA----GACATTTTGTGAGCGTATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----T-TATGCCTTCTTA----CCGACCAACAC-TGCAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--CATG---A-Gtcagtctgagctttttaagtcaa
gi|23 : ---GTT----TATT-----A-A-AATTCA-AAAATA------TA----TAA---T---ATTTAGAAG-----TA------T--A---TAT--C--T--TTAT-----T------------C-AAAATATTTACCTT---AAGTTTA--TC---AAT----A------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GACAATTAATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCATTCTTT----CCATCCCACAC-TATAAC-A---A--C-TAACCAAAAT-GA----AGGG---A-GGT----T----T----CTAAGCAC----A------CAGAACAATCGGAGCT--AGT----GACATCATCTGGGGAAACACATcaattaaagtcctctgaggaaacacattgtc
gi|24 : CTA------TA----TAA---C---ATTAAGAAACA---TA------T--A---TAT--C--T--TTAT-----T------------C-AAAATACTTACATG---AAGTTTA--TG---AAC----T------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GATAATTTATTACCATATT-T-T-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CTG-CCCGCGC-TATACT-A---A--T-TAACCAAAATCGGTTAAAGTG---A-GGT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCAGTCGGAGC
gi|25 : TCCCTTC---CG--AAA------CAACAACTAAGTACTCAATTTG---AT--------CT---------G-----A----------TTTAAGT-GG------TTTGGTC---AATCCAACAGATAC--TGCAGTC---TC-TT---------------GTA----TAAA---ACCTGACATGGTCAGCAC--TA-TTTCTGGTACG-AAAATGGTACAG-GTTGA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-A-AT--TAAA-TA------TA----TAA---C---ATTT-GAAA-----AA------T--A---TG---C--T--TGA------T--------T---C-AAAATATTAAC
gi|26 : AAATGAGTGAG-AACAA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-A-TCTATAAACTACATGTATA----TAA---A---ATTTGGAAA-----AA------T--G---CAT--------TTATCTA--T--------T---A-AAAAGATTTGCGTG---AAATTTA--TA---AAT----G------TTGGAA--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----CACAAATTATTAGCATGTT-T-C-----TA-TTC-AA---A--TA------GT----C-CAT--CTTCTAA----CCG
gi|27 : ccaatatgtAA------CAGCACTTAAGCACTCGGTTTG---TT---------T---------G-----C----------TTTAGGT-GG------TTGAATG---AATCCAAGAGATAC--TGCCGTC---TC-TTAATATAATACTATTAATG----TAAT---ACCTTCAATGGTCAACTC--TA-TTTTTCATAC-AGAAATGATTGAG-GACAA----------------A-GTTGA--A-------------GTTG----A-A-G-TTTATAAGCTA------TG----TAA---C---TTTTAGTTA-----TA------T--A---TA
gi|28 : ttccatagCCCGTAACATTA-C-CAGG-A-ACATCTCAATAAAGTTTTGCTCCTC---CG--AAT------CAGCATTCAAACATCTAATTTA---CC--------CT---------G-----C----------T-------CA------TGTGATG-----T------GATGA--TGTCGTC---TC-TT---------------GCAACGCGAAT---ACCTGACATAGCGAGCAT--TA-TTTCCGGTACGAAAAATTGAT--------A----------------G-GTT------T---GTT----TGTT-------A-A-TT-------TA------TA----TAA---T---ATaa
gi|29 : ttttACCTG---ATGTTTC--TT---AAT----A------TTC--A--TTTTA-AGGAA-ATGT-------AAACAAGA----AACAAGTTATGAGCATATT-T-C-----TC-TTA-AA---A--TA------GC----A-CATGCCTTCTAA----ACCCCTCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--AGTG---A-TAT----A----T----CTAAGCAC----A------C--ATTAAACGGAGCT--AGT----GACGTTATCTAGGAAAACA
gi|3 : CCTGTAAAATTA-T-CAGG-A-ATACCACAATGAAGTCTTTTTCCTT---CG--AAA------CAGCATTCAAACATCCAATTTA---CT--------TT---------G-----C----------C-------GG------TTTGATG---AATCCGTTAGGTAC--TGTCCTC---TC-TT---------------GTA----TAAT---ACCTGCCATGGTGAACAT--TA-TTTCCAGTACGAAAAACAGTTAAG-GGCAA----------------A-GTTTGT-A-T---GTT----TGTT-----T-G---TTCATAAGTTA------TG----TTA---T---ATTTAAAAA-----TG------T--A---TAT--C--T--TTATGGAATT--------T---C-AAAATCGTTACCTG---AAATTTA--TC---AAT----T------CTT--A--TTTTA-ATGAA-ATGTG------AAATAATA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------AT----C-CATGCCTTCTTA----CTGCCCCGCAC-TATAAT-A---A--T-TAACCAAAATTGGTT--AGTG---A-GTT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCGTTCAGAGCT--AGT----GACAACATTTAGGGAAACACATtg
gi|30 : CTGTAGCAT-G-T-TAGG-T-GTACCGTTATAAAGCCCCTTTTCTA---TG--AAA------CAGCATTAAAGCACCCAATTTG---TT--------CTAATTAA---G----------------T-------GT------TTTGCTG---AATCCA----ATA---TGTCGTC---ACTTT---------------TTA----AAAA---ATCTGCCATTGTCAGCAA--TA-TT-----AACGAAAAA-GGTTAAG-TTTGA----------------A-GTCTATGA-T----TT----TGTT-----A-
gi|31 : ttCCCGTAATA--A-GGCAGG-A-GTACCGCAGTGAACTTTTTCCCCTC---TG--AAAACTTGGCAGCATTTAAACACTCAGTTTG---TT--------CTAATTTTTTTG----------------T-------GG------TTTGATA---ACTCCAAGAGATAG--TGCCGTC---TC-TT---------------GT------------------CATGGTCAGCAA--CA-T-------------AATGATTCGG-GACGA----------------A-GTTTAA-A-T---GTT----T
gi|32 : gtttcGTAACA-------AGGTA-GTACTGCAACAAAGTCAATC-CCTC-------AAC------CAG--TTC-------TAATTTA------------------------A-----G----------T-------GG------TTTGGTG---AATCAAAGATATAA--TGCAGTC---AC-TT---------------GTA----T-AT---ACGTGCCACAGTCAGCGC--TA-TCT
gi|33 : tttttctt----------T-------GG------TTTGATG---AATCCAAGAGATAC--TGTTTTC---TC-TT---------------GTA----AAAT---ACCTGCCATGGTCAGCAC--TA-TTTCC-TTAC-AAAAGTGATTGAGAAGTCA----------------A-GTTTAT-ATT---ATTATA-TATTTAA--A-A-A-ATCATAAAATA------TG----TAA---T---ATATATAAA------A------T--A-----------T--TAAT-----T--------T---T-AAAATAactacctctgaaagtgttcgtccgtgtaggatatagatagt
gi|34 : TTTAA-TT---AAC----A------TG---A--TCTCA-GAGAA-ATGTG--------------------CAATTTATGAGCATAAT-T-T-----TA-TTG-AA---A--TC------GT----C-CATGCCCTCTCA-----CACCACGAGC-TGT--T-A---A--C-AAACCAAAATCGATT--AGTG---G-TGT----G----T----CTTAG-----------------------CGGAGCT--AGTGACGGACGTAACCCGGAGGATCACATg
gi|35 : ttA------TA----TAA---T---ATTTAGA------------------------------T--TTA------T--------T---C-AAAATATTTACCTG---AAGTATA--TC---AAT----A------TCT--A--TTTGA-AGTAA-ATATG------AAATAAGA----GACAATTTATGAGCATA---------------TA-AA---A--TA------GT----t
gi|36 : TCTTTCTTCGC---CA--AAA------CATTATTTAAGCAGTTCGTTTG---TTATTTTTAAGT---------G-----T----------T---------------TTTAGTG---AATCCAAAATATAC--TGTCTGC---AT-TT---------------AAA----TAAT---ACCTACCATGttttgctcgtcaaaggcctctctcaaattatatacatgccagacattccattatc
gi|37 : tgaaattaatcagtcgatggtaatatatctaccatataAATTTATAGGCATTCT-T-T-----TA-TTA-AA---G--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCTTCTCACGC-TATGGT-A---A--C-TAACCAAAACCGGCT--AGTG---G-TGT----A----T----CTAAGTAC----A------CTGACCAATCGGGTCT--ATT----GACGTCATCAGGGGAAAtt
gi|38 : atgg--C--T--TTAT-----T------------C-AAAATCTTTA-GTG---AAATATA--TT---AAC----A------CTT--A--TTTCA-AGGAA-TTGTG------ATATCTGG----GACAATTTATGAGTATATT---C-----TG-TTA-AA---A--TA------CT----C-CATGCCTTCTAA----TCTCCCCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAA
gi|39 : TACAGCCATAAAGCTGTTCTTCTC---AA--AAT------CAGC----------TCGATTTG---TT--------TT---------A-----CCTTAATTAAAT-------GG------GTTGATG---AATCCAAGATATAC--TACCGTC---TC-TT---------------GTG----TAAT---ACCTGCCACGGGCAGCTC--AA-TTTc
gi|4 : gtctgaat-T-CAGG-A-GTACTGCAATTAAGTAATTCTGCTT---TG--AAA------TAGTATTCAAACACTCAATTTG---TT--------CTAATTTAA--G----------------T-------GG------TTTGTTG---AATACAAGAGTTGA--CGCCGTC---TC-TT---------------GTA----TACA---ACCTGCCATTGTCAACAC--TATTTTTTTGTAAG-AAAATGATTCTT-GTCAA----------------A-GTTTAT-A-T---ACT----TGTTA----A-A-A-TTCATTAACTA------TA----TCA---T---ATTTATACA-----TA------T--A---TAT--C--T--TTA------T--------G---C-AGAATATTTACGAG---AAGGTTATTTT---AAC----T------TTT--A--TTTC------A-ATTT--------------A----GACAATTTATAAGCATATC-TACCGGTATG-TTA-AA---A--TA------GC----C-CATGCTGTCTCA----CCACCCTGCG--TAAATT-A---A--C-TAACCGAAATCAGTA--AGTG---A-GGT----G----A----CCAAGGAC----G------AAGATTAAAC-CAGCT--AGT----GATGTTATCTGGGGAAACACATgtt
gi|40 : ttacagtagcaagAATTA------TA----TCA---T---ATTCAGAAA-----AA--------------------------AT-----T------------C-AAAATATTTCTGCA---AAGTTTA--TTGA-AAC----T------TTA--A--TTTAA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GAAAATTTATGAGTATATT-T-------------------A--TA------G-----C-TAAGCTTTCTTA----CCATCCt
gi|41 : tA------GT----C-CATGCCGTCTTA----CCATTTTGTGC-TATAAT-A---A--C-AAACCAAACTCAGTT--AGTG---A-AGT----G----T----CTAAGCAC----ACACTGTCAGGTCTATTGGAGCT--AGT----GGCAACATCTGGGGACACACGT
gi|42 : CCGTAACATTA-T-CAGG-A-ATACAGTAATt
gi|42 : ccttttTGCCGCAGTGAAGTATGTCTCCTA---CG--AAA------CAGCATTCAAACACCTCATTTA---CT--------CT---------G-----C----------T-------cgaggaattagatagttccttgccgcagtgaagtatgtctcctacgaaacagcattcaaacacctcatttactctgcttt
gi|43 : ccttttccgtaacattatcaggaatacagtaatcgaggaattagatagttcctTTTTAA----CTGCCCCATGC-TATA-T-ATTTA--C-CTGCCGAAATC---T--AGTGGCTA-GAT----A----TTCTTCCATGCAC----A------AAGACCAATCGGAGCTTAGGT----GACATTGTCTGGAGGAATAGATtt
gi|44 : tAACATTT-T-CAGG-A-ATACCGCAGTGAGGTGTTTCTCCTC---CG--AAA------CAGCATTC-AACGCCCAATTTA---CT--------CT---------G-----C----------T-------tg
gi|45 : aacctttggctaA------TA----TAA---A---AGTAAGACA-----GA------T--A---TAT--T--TATTTAC-----T--------T-----AAAATGTTTACGTA---AATTTTA--TT---AAC----A------TTTA-A--TTTCA-ATGAA-ATGTG------AAATAAatatactgttgg
gi|47 : GG-ACGTACCGCCAAGAAGTATTTATTGTC---TT--AAA------CAATATTGAAGCACGTGATGTGT--TT--------CT---------G-----T----------T-------G
gi|48 : acaagtcCATTCAAGCACACAATTTG---TC--------CT---------AAT---C----------TAAGC---GG------TTTGGTG---AATCCAAGAGATAC--TGCCGTC---ttgtatg
gi|5 : aagttttccaGCCATGAGCACTTTTT--TG---CG--AAA------CAGAGTTCAA-----CG-TTTT---TC--------CT---------G-----CATTAAGT---T-------GT------TTTGTTT---AATATGTGAGATGC--TGCCTTC---TC-TT---------------TTA----TAGT---ACCTG-----GCCAGCAC--TA-TTTTCGGTACGAAA--TAATTGAG-GGCGA---------------------------C---GTT----GGTT-----ACA-A-TTCATAAATTA------AA----TAA---C---GTTCAGAAA-----TA------T--A---CCT--TCAT--TTAT-----T--------T---T-AAA-TATCTACATG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--AATTTTAA-AGGAA-CTGTG------ATAAAAAA----GACCAATTATGAGCATATT-T-A-----TA-TTA-AATTAA--TA------GTACAGCACATGCTTTCTAC----CCGACCTGTGC-TGTAAT-A---AAAC-TAACCAAAATCGGGT--TTTG---A-G-T----G----T----TCAAGCAC----A------AAACTCAACCAGAACT--GGT----GACGTCATCCGGGGG-ACACA
gi|50 : aattgttccgtaaaaaCCCGTAACA--AGT-CAGG-A-GTACGGCCATGAAGTGTTTATCCTC---TA--CGA------CAGCATTCAAACACTC
gi|51 : tgtt-GTGCCGCCATGAAGTCTTTTTTCTC---CG--AAA------TATCAATTAAGAACTCAATTTG---T
gi|52 : caattcatatGCCATGGTGAGCAT--TA-TTTCTGGTATG-AAAATATTTCAG-GGCGA----------------A-GTTGAT-A-
gi|53 : AGTT--AGT----GACGTCATCT-GGGGAACACATa
gi|54 : tttaacatgcA-TTA-AA---A--CA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCA--CCGCGC-TATtggtgt
gi|6 : GGTG---AGCCCAGGAGATAC--TGGAATA---TA-TT---------------GTA----TAAT---ACCTGCCGTGGTTAGCTC--TA-TTTCCGGTATGAAAA----TTGAG-GA-GA----------------A-GTTTAT-A-G---TTT----TGCTAA---A-A-A-TT-ATAAACTATAAT--TA----TAA---CACAATTT-GAAA-----TATC----T--A---TAT--A--T--TTAT-----TTGAATTAGT---T-AAAATATCTACGTA---CAGTTCA--GT---AAT----A------TTCA-A--TTTCA-A--AATATATG------ACACAGGA----GGCATTTTATGAGCATGTT-T-C-----TATTTA-AA---A--TA------GT----T-CATGCCATCTAAACGTCCGCTCTACTCGTATGAC-A---A--CTTGCCCAAAGCCAGCT--AAC------GGT----GGACCTTA--CTATGCAC----G------GGGATCAGACGGAGCT--AGT----GACg
gi|7 : attgaaagactaaacttctatgttttaaggggtttaaggggtttggtgagcccaaCCGTTACA--AGT-CAGG-A-GCACCGCCA----GTCTTTTTTCTC---CG--AAA------TGACATTCAAGCACACAATTTG---TC--------CT---------A-----C----------TTTAATCAGT------TTTGTTA---AAAATAAGAGATAC--TGCCATT---TC-CT---------------TTA----TAAT---ACCTGCCATTG-CAGCTC--TA-TTTTCTATACGAAATATTG---AA-GGTGA----------------A-GT-----------GTT----TGTT-----A-A-AATTCATGAACTA------CA----TGA---C---ATTCAGAAA-----TG------T--G---T-------------------T--------T--------ATGTTTACGTG---AAGTTTA--TT---AAC----AAACAA-TTT------TTAA-AGAAA-ATGTG------ATATAAGA----GACAATTTAT-AGCATATT-T-C-----TA-TTC-AA---A--TACTAATTGT----C-CATGCCTTCTAA----CCGCCTCCCGC-CATAAT-A---A--C-TAA-----------T--AGGG---A-TGC----C----T----CTAAGCAT----A------CCGATTAATCGGATCT--ATT----GCCGTCATAT-GGGAAACAccaatcggga
gi|8 : tCCTGTAACAA-A-T-CACG-A-GTACCACAATGAAGTCTTTCTCTTC---TT--AAA------TGTCATTCAAATA----ATTTG---TT--------CTT--------G-----T----------TTAAGT--GG------TTTAGTG---AATCCAACAG--------------------------------------A----TAG------------TGGTCAACAA--TA-TTTCTGGTAC-AAAAATGATTCTT-GGCAA----------------A-GTTTGT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-AATTCAAGAACTA------TA----TAG---A---ACT-----A-----TA------T--A---TAT--A--T--TTAT-----T------------C-AAAATATTTA-GCT---ATGTTTA--TT---GAC----A------TTT--A--CTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATATGA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TT--GA---A--TA------GT----C---TGACTTCTAA----CCATCAGGCGT-TATAAT-T---A--C-TAATTGAAATCTGTT--AGTG---GTAGTGCTAG----T----TTGAGAACAAATA------AAAACAAAGCGCAGCT--AGT----GATGTCATCTGAGGAAA
gi|9 : ttcCTGTAACA--AGT-CAGG-A-GTACCGCAATGAAGTCTTTCTCCTC---TG--A-------------------CATTCAATTTG---TC--------CTTATTTAA--G----------------T-------GG------TTTAATG---AATCGAAGAGATAG--TGCCGTC---TC-TT---------------TCA----GAAA---ACTTGTCATGGTCAGCAAAATA-TTTCCGGTATGAAAA-TGGTTT-G-GGCGG----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-AATTCACAAACTA------TA----TAC---T---ATTTAGAAA-----TA------TCTA---TAT--T--T--TTAT-----T--------C---C-AAA-TATTTAGG-G---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-AAGAA-ATGTG------CAATAAGA----CACAATTTATGAGCATATT----------------------------------------------TTCTAA----CCACTCTGCGT-TATAGT-A---A--C-TAGCCAAAATTGGTT--AGTG---A-TGT----G----T----CTAATTAC----A------CAGATCAAAC--------AGT----GATGTCATCTGGGGAAATAC
blockSeqs : TTA G T C G GGAT CC ACTTGG A T CTA ATTTTTAA ACCTTAATTAAAT AAGTTG GAA TC TCG AAT T AATATAATACTATTAATGT ATAA AAA T A AA A C T GGGGGTGGGGGGGTGC A G T AATG GGTT TGTTA C T A C CATGTA ATTA ATTT CA ATTATA CT AATATCA AT TTTGAATTAGTT CTT TT TAA ATTAAAT GA AT C T AAAAAA CTGA A A CGGTA T C TTA AG CTAATT ACAG A ACGT AA G A TTT AA T C AA GCT TA GCTA GACC TCTT AAAT CACTGT TA GACG C
blockSeqs : GTA . . . T T . . A T T . AATTAAGTGTT . . AG CG . . TTAACAAT C T . A GA A G A . . G . G ATA TGTTA . . A C TAAT . CACA . TC . GTTTACC . TGGAATTTC . A GA AAACAA A AT . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . T AA . G . . TA . . . . G
blockSeqs : TTA . . . C A . . A T . . AATTTTTTTGT . . AG C . . GCAACGCG A T . T GA A C . . . . . G G TAAA . . C C . . T . . . TATATC . TTTGTTT . . . TAAAA A . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . T . . G . . . . . . . G
blockSeqs : TTA . . . G T . . A C . . GCATTAAGTT . . AG C . . GTAT A C . G GA G C . . . . . G . TAA . . A C . . C . . . CCTTCA . TCTATTA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . T . . T . . . . . . . G
blockSeqs : TTA . . . A C . . T C . . ACTTTAATCA . . AA C . . ATAT A A . A GA A C . . . . . G . AA . . C A . . T . . . CATC . ATTAG . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . T . . A . . . . . . . A
blockSeqs : TTT . . . C T . . A T . . TATGTAACT . . AG A . . GTAT A A . A AA A C . . . . . A . G . . A C . . T . . . TATC . TTTC . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . T . . G . . . . . . . G
blockSeqs : GG . . . T C . . A A . . GATTTAAGT . . TT C . . TCAG T A . G GA T C . . . . . G . A . . A C . . T . . . TCTC . TATC . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . T . . T . . . . . . . A
blockSeqs : TG . . . C C . . G C . . GCTTTAGGT . . AA C . . GAGT T T . G GA A C . . . . . G . . . . A G . . T . . . TATA . TTTT . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . T . . C . . . . . . . A
blockSeqs : TG . . . C C . . G T . . AATTTAAGT . . TT G . . GCAT A T . G GA A C . . . . . G . . . . A A . . T . . . TATA . TTTT . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . . . T . . G . . . . . . . G
blockSeqs : AG . . . T C . . A T . . AATCTAAGC . . AC C . . TTAT A C . T GA A G . . . . . T . . . . . C . . T . . . TATA . TTTT . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . C . . G . . . . . . . G
blockSeqs : AG . . . C T . . A C . . TGTTTAAGT . . AG C . . GTAT T C . T GA A C . . . . . G . . . . . C . . C . . . TATC . TTCC . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . T . . G . . . . . . . G
blockSeqs : AA . . . C T . . G C . . TATTTAAGT . . TT C . . GTAT T T . G GA A C . . . . . G . . . . . A . . T . . . TATC . TTT . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . T . . T . . . . . . . G
blockSeqs : AG . . . T C . . A C . . GCTTGAAT . . AG A . . TTAA T A . C GA A C . . . . . G . . . . . C . . T . . . TATC . TTC . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . TC . . . . . G . . G . . . . . . . G
blockSeqs : A . . . A A . . G T . . GCTTAAAT . . AG C . . GTAT A C . G GA A G . . . . . G . . . . . T . . A . . . TATC . TTC . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . C . . T . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . A T . . A T . . AATTAAGT . . AG G . . GTAA T C . A GA A G . . . . . G . . . . . T . . T . . . TATT . TAC . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . T . . T . . . . . . . G
blockSeqs : . . . G C . . A T . . GCTTTA . . AA A . . AAAT T T . T A G A . . . . . G . . . . . C . . C . . . TATA . TTC . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . T . . G . . . . . . . G
blockSeqs : . . A C . . A T . . TAAGT . . AG C . . GTGT T T . G A A A . . . . . G . . . . . C . . C . . . TATA . TCC . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . C T . . G C . . AAT . . AG C . . GTAT T A . G A A C . . . . . A . . . . . C . . A . . . TATT . TTC . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . G C . . G C . . GAT . . AG C . . TTAT A A . G G A G . . . . . A . . . . . C . . C . . . TGT . TTC . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : C T . . A G . . GCT . . TG A . . GTAT T C . T A A C . . . . . G . . . . . C . . T . . . TGC . TTC . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : C C . . G A . . GCC . . GG C . . TTAT T C . G A . G . . . . . T . . . . . C . . T . . . CAT . TTC . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : C C . . G T . . AGT . . AG C . . TCAG T C . G G . C . . . . . G . . . . . C . . T . . . TA . TTC . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . T
blockSeqs : C T . . A T . . GTT . . AC C . . GCA A C . . G . G . . . . . G . . . . . . . . T . . . TA . TTC . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : T . . . A . . GCT . . AG C . . TAG . C . . A . C . . . . . G . . . . . . . . T . . . T . TTC . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . GCT . . . G . . GT . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . T . TTC . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . . . . . GTT . . . . . AT . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . TGC . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . G . C . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . TTC . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . C . . . . . CTT . . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . TTC . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . TT . . . . . .
blockSeqCons : NG** GATTTAAGT************************* GA G*** ***** G*
originalCons : CCCGTAACATTA-T-CAGG-A-GTACCGCAATGAAGTCTTTCTCCTC---CG--AAA------CAGCATTCAAACACTCAATTTG---TT--------CT---------G-----C----------T-------GG------TTTGGTG---AATCCAAGAGATAC--TGCCGTC---TC-TT---------------GTA----TAAN---ACCTGCCATGGTCAGCAC--TA-TTTCCGGTACGAAAAATGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-A-TTCATAAACTA------TA----TAA---T---ATTTAGAAA-----TA------T--A---TAT--C--T--TTAT-----T--------T---C-AAAATATTTACGTG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCGCCCCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--AGTG---A-GGT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCAATCGGAGCT--AGT----GACGTCATCTGGGGGAACACAT
finalCons : CCCGTAACANG--T-CAGG-A-GTACCGCAATGAAGTCTTTCTCCTC---CG--AAA------CAGCATTCAAACACTCAATTTG---TT--------CTGATTTAAGT-------------------------GG------TTTGGTG---AATCCAAGAGATAC--TGCCGTC---TC-TT---------------GTA----TAAN---ACCTGCCATGGTCAGCAC--TA-TTTCCGGTACGAAAAATGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTTTAT-A-TG---TT----TGTT-----A-A-A-TTCATAAACTA------TA----TAA---T---ATTTAGAAA-----TA------T--A---TAT--C--T--TTAT-----T--------T---C-AAAATATTTACGTG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCGCCCCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--AGTG---AG-GT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCAATCGGAGCT--AGT----GACGTCATCTGGGGGAACACAT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|46 ): ATAGTATCGTATGTATCAGCCTACCCATATCGCAGTACCTATCGTATCGGAACGGACCTGGCAATACACAGCCCTAATAAT
Unaligned ( gi|49 ): CTATGATTATAGTAAAATGAGCACATGGATCTCGTGCGTTCATTCATAGATATTTTAAATGGAATGCCATTG
Alignments
lowQualScore : 111111111 11111111111111111111111 11111 1 111111111111111111111
lowQualScore : 99 0 3 222 22 444444 2 2222 1 2222 111111111 22 1 1 1 222 1 1 7777777777777 444 222 1 00000000000000000000000 7777 444 1 3 55 3 1 2 9999999999999999 1 2 1 2222 6666 88888 1 1 1 3 666666 2222 3333333 1 11 55555 555555 11 999999999 11 999999999999999999999 222 33 444 77777777777 44 33 1 1 333333 2222 1 1 33333 1 1 222 11 333333 2222 1 0 3333 55 1 1 222 22 1 1 44 333 44 3333 3333 6666 3333 555555 0 22 3333 5
lowQualScore : .. . . ... .. ...... . .... . .... ......... .. . . . ... . . ............. ... ... . ....................... .... ... . . .. . . . ................ . . . .... .... ..... . . . . ...... .... ....... . .. ..... ...... .. ......... .. ..................... ... .. ... ........... .. .. . . ...... .... . . ..... . . ... .. ...... .... . . .... .. . . ... .. . . .. ... .. .... .... .... .... ...... . .. .... .
lowQualScore : 99 9 0 888 22 333333 1 8888 3 9999 888888888 00 4 4 4 555 4 5 3333333333333 222 444 4 11111111111111111111111 3333 111 4 1 11 5 3 8 1111111111111111 4 8 4 7777 7777 99999 4 5 9 2 555555 7777 2222222 0 88 22222 555555 88 777777777 88 444444444444444444444 333 11 000 00000000000 44 55 3 3 888888 9999 4 4 66666 4 4 444 99 888888 8888 4 1 0000 00 5 6 888 22 6 3 88 000 77 9999 9999 4444 9999 222222 6 55 9999 4
consensus : CCCGTAACAA-GTCAGGAGTACCGCAATGAAGTCTTTCTCCTC---CG--AAA------CAGCATTCAAACACTCAATTT----G-TT----CT----G-A--TT--TAAG-TGGTTT-G-GT---G-AATCCAAG-----------AGATAC--TGCCGTC---TC-TT---------------GTA----TAAN---ACCTGCCATGGTCAGCAC--TA-TTTCCGGTACGAAAAATGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-A-TTCATAAACTA------TA----TAA---T---ATTTAGAA--A-----TA------T--A---TATC--T--TTAT-----T--------T---C-AAAATATTTACGTG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCGCCCCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--AGTG---A-GGT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCAATCGGAGCT--AGT----GACGTCATCTGGGGGAACACAT
Reference ( family-1607 ) : CCCGTAACAN-GTCAGGAGTACCGCAATGAAGTCTTTCTCCTC---CG--AAA------CAGCATTCAAACACTCAATTT----G-TT----CT----G-A--TT--TAAG-TGGTTT-G-GT---G-AATCCAAG-----------AGATAC--TGCCGTC---TC-TT---------------GTA----TAAN---ACCTGCCATGGTCAGCAC--TA-TTTCCGGTACGAAAAATGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-A-TTCATAAACTA------TA----TAA---T---ATTTAGAA--A-----TA------T--A---TATC--T--TTAT-----T--------T---C-AAAATATTTACGTG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCGCCCCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--AGTG---A-GGT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCAATCGGAGCT--AGT----GACGTCATCTGGGGGAACACAT
gi|1 : ------CAACATTCAAGCACTCAATTT----G-TT----CT----G-A--T----AATCTGGTTT-G-GT---G-AATTCAAG-----------AGATAC--TGCAGTC---TC-TT---------------GCA----GAAA---ACTTGCCATGGTCAGCAA--TA-TATCCGGTATG-AAAATGATTCAG-GG------------------------TAT-A-T----TC----TGAT-------A-G-TT--GAAAC--------------------C---ATTTAGAA--ATACAGTA------T--A---TATC--T--TTA------G--------T---C-TAAATATTTATGTG---ATGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-ATGAT-TTGTG------AAATATGA----GACAATTTATGAACATATT-T-C-----TA-TCA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCT
gi|10 : tttttcctgtataaagtatgTCAGGATTACTGCAATGACATCTTTCTCCTC---TG--AAA------CAGCAGTCAAACTCTCAATTT--------------------A--CT--TAAA-TGGTTT-G-AT---A-AATCCATC-----------AGTTAC--TGTCGTC---TC-TT---------------GTA----TAAC---ACCTTCCACGGTGAGTAT--TA-GTTCCAGTACAAA----GGTACAG-GGCAA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTTTGTTAA-A-A-TTCATCAAC--------TA----TAA---T---ATTAAGGA--A------------------------------TAT-----T--------T---C-----------CCTG-----GTTTA--CC---AAC----A------TCT--A--TTTTA-AGGAA-ATGAG------AAAT------------AT------GCACATT-T-T-----TA-TTA-AA---T--CA------GT----C-GTTGCCTTCTAA-----CGCAGCGTGT-TATAAT-A---A--C-TAA-CATAACTGGTT--GGTG---A--GT----G----T----CTATGAAT----A------CCAATCAATCGGAGCT--AGT----GACATCATCT-GGGGAACACATgtcagtgatgtctcaaattgcaatacagacatactgtaatctttcaaaccaacacatatcaaagtttcatatcaatgagaatccaaagaaaaagtaagattgttttctaatgttaagcagcgtatcatatcatgtatcgctctacacgtatcgtggtacatatcatattggaaatctcctggcaatacacagccca
gi|11 : cccattaAG-----------GGATATCGTGCCTTC---AT-TC---------------ATA----TAAA---ATTTGAT-TGG--AGTGT--CA-TTGACAGTACGAAAA-TGGTTGAG-GGCGA----------------A-GTTTAT-A-TAATGTT----TCTT-----A-A-AATTCATAAACTA------TC----TAA---C---ATTTAAAA--A-----TAATTATAT--A---CATC--T--TTAT-----T--------T-----GATATACTTACATACTTATGTTTA--TC---AAC----T------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTA------AAATAAGA----GATAATTTATTACCATATT-T-C-----AA-ATA-AA---AAGTA------GT----C-CATGCCTTCTAA-----CAACCCGCGC-TATACT-A---T--T-TAGACAAAATCGGCTAAAGTG---A-GGT----G----T----CTTAGCAC----A------CAGATCAGTCGGAGCT--GGT----GATGTTATTCCGGGGAACACAT
gi|12 : ctataattttagtaaaatgagctcTTT----G-TT----TT----TTA--TT--TAAA-TCGAT-----------AATT-AAG-----------AGATAC--TACCGTC---TC-TA---------------GTA----TAAA---ATATGTCATGTTCATCAC--TA-TTTCATATACGAAAAATGATACAG-ATCCA----------------A-GTTTAT-G-T---------------------A-A-TTCATGAACTA------TT----TAA---T---ATTTAGAA--A-----TA------C--A---TGT--------AT-----A--------T---C-AATATACTT------------------------------------TTT-----TTTCA-AGGAA-GTG-A------AAATAAGA----GACAAACTATGAGACTATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--T-------------C-AATGCCCTCTAA----CCACCC-ATGC-TATTAT-A---A--C-CAAACAAAATCGGTT--AATC---A-GGT----G----A----ATTAGTAT----A------CAGGTCGATCGGATCT--ATT----GACGTAATGTGGGGGAACACATtg
gi|13 : tttcccgttataagtcaggagaagaaccaaaatgaaatttc-TGCTTT-G-GT---A-AATGTAAG-----------AGATAC--TACCGTC---TC-TT---------------TTAACAATAAATAAACCTTAAATAGTCTGCAA--TT-TTTCAGGTACGAAAT-TGGTTCAG-GGTGA----------------G-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-A-TTCGTAAACTA------TA----TGC---T---ATTTGGAA--A-----TA------T--AAA-TATCA-T--TTAT-----T------------C-ATAATATATATGTG---GAGTTGA--TT---ATC----A------TTA--C--TTTCT-AGGAA-ATGTG------AAAATAGA----TACAATATATGCGCATATT-T-C-----TA-TTT-AA---A--TA------GT----C-CATGCTTTCTT-----TCACCCCGCGC-TATTAT-A---A--T-TATCCAAAACCGGTT--AGTG---A-TGT----A----T----CTAAGCAG----T------CAGATCAATCAGAGCT--AGT----GACGTCATCT-GGGGAACACA
gi|14 : A------T--G---TATC--T--TTAT-----T------------C-TTAATATTAATGTG---AAGTTTA--TT---AAC----T------TTT--A--TCTCA-AGAAT-TTGTG------AAATATGA----GACAATTTATCAATATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCT
gi|15 : atttgcatttaaaaataaaagaaggaaagaaaactgcCAA-GTAAGGAGTACCGCAACGACGTGTTTCTCCTC---TG--AAA------CAACATCCAAACACTCAAGTT----G-TT----CT----T-A--TG--TAAC-TGGTTT-G-GT---G-AATC--AA-----------AGATA------AGTC---TC-TT---------------TCA----GAAA---ACACGTCATTGACAGCAA--TA-TTTCCAGTAC--AAAATGGTTCGGTGGCGA----------------A-GTCTAT-A-T---GTT----GGTTA----A-A-A-TTAATGAACTA------TA----TAC---T---ATTTACAAATA-----TA------T--A---TATC--T--TTA------T--------A---C-AAAATA-GTAAGTG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-TGGAA-ATGTG------ACATCTGA----GACAATTTTTGAGCATTTT-T-T-----TA-TTACAA---A--T--------C----C-TATGTCTTCAAA----TCACCCCGTGC-TACAAT-A---A--C-TAgttagtaatgcctcaaatttcaattgtgatattgtactcttttaaaacaacacaatatctaagtttcatattaaggagaactcaaaagcaaaagtagagtgtttcccaatgttaagcagcgtatcgtatcgccctacctgtatcgcggtacatatcatatctgaagcgacctggcaatacacaactctaataag
gi|16 : CCTGTAACAA-GTTAGGAGT--------------TTTTTCCTC---AG--AAT------CAGCTTTTAAACATTCAATTT----G-TT----CG----G-A--TG--GAAG-TTGTTT-G-GT---G-AATCCAAG-----------AGATGC--TGCCATT---TC-TT---------------GAG----TTAA---ATCTGCCATGATAAGCAA--CA-GTTCCAGTAC-AAAAATGATTCAG-GGCTA----------------A-GTT--T-A-T---GTA----TGTT-----A-A-A-TTCACGAACTA-------------AAATTT---ATTAAGAA--A-----TA------A--A---TCTC--T--T--T-----T--------T---T-ATAATATTTc
gi|16 : acttttTATGTATGTT---AAATTCA--CG---AACTAAAA------TTT--A--TT----AAGAA-AT---------AAAT----------CTCTTTTTTATAATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TG------AT----C--A-GTCTTCCTA----CCATCCCACAC-TATAA---------C-CAACCAAAAT---------TG---A-AGT----G----T----CTAGGCAC----A------CAGATCAATAGGAGCT--TAT----GACGTGATCT-GGGGAACACActattaaaatgatcagtcttcctaccatcccacactataaccaaccaaaattgaagtgtctaggcacacagatcaataggagcttatgacgtgatctggggaacaca
gi|17 : acttttcctgtaacaagttaggagttttttcctcagaatcagcttttaaacattcaatttgttcggatggaagttgtttggtgaatccaagagatgctgccatttcttgagttaaatctgccatgataagcaacagttccagtacaaaaatgattcagggctaagttCCTT---TG--AAA------CGACATTTAG-CGCCCATTTT----G-TT----CT----G----CT--TGAA-TGGTTT-T-TT---T-A-TCCA--------------GAT----TGGAG------C-TT---------------G--------------CCTACCATG---AGCAT--TA-TTTCCGGTAT-AAAAGTGAATCAG-AGCAA----------------A-GTTT------------------TT-----A-ATA-TTCATAACCTA------TA----TAA---T---ATTAAGAA--A-----TA------T--A---TATA--T--TTAT-----T--------C------AAATATTTATGTG---ATTTTTT--TTTAAAAT----A------TTT--A--TTTGA-GGGAA-ATG-------------AGA----GACAATTTATGAGTGTATTAA-C-----GA---A-AG---A--TA------GT----T-CAAGCCTTCTAA----CCACTCTGCAC-------------------------------T--GGTG---A-GGT----G----T----CTAAGCAC----A------TAGATCAATCGGAGCT--AGT----GATGTAATCTGGGGGAACACA
gi|18 : CCCCTAACGTTATCAGGAATATCACAATTAGGTCTTTCTCCTC---CCCCAAA------CAGCATTCAAACACCCAATTT----A-CT----CT----G----CT--TAAA-TGGCTT-G-AA---G-ATTATATT-----------AGATAC--TGTCATC---TC-TA---------------GCA----TGAT---ACCTGCCACGGTGAGCAT--TA-TTTACGGTAC-AGAAATGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTATAT-A-T---ATT----TGTT-----A-A-A----A-----TA------CA----TAA---T---ATTTGGAA--A-----TA------T--A---TA----T--TCA------T--------C---C-AAATTACATACCTG---AAGTTTA--TA---AGT----A------T-------CTTAA-AAGAA-ATGTGAAAAAAAAAAAAGA----GACAATTTATGAGCAT
gi|19 : aacttccTGCCATGGTAAGCAC--TA-TTTCCGGTACGAAAA-TGGTTCAG-GGCGA----------------A-GTTAATGA-T---GTTG---TATTTAAA-A-G-A-TTGATGAACTA------TG----TAA---T---ATTAAGAA--A-----TA------T--A---TATA--T--TTAT-----T------------C-AAAATATTAACGTG---AAGTTTA--TA---AAC----A------TCA--A--TTTCA-AGAAA-ATATC------AAATAAGG----TACAATTGATGAGCATATT-T-C-----TT-TTA-AA---A---A------GT----A-CATGCCTT---------CG--TCGCAC-TAAAGT-A---A--C-TAACCAAAACCTGTT--AGTG---T-TGT----G----G----CTAAGCAC----A------C-GATTAATCATAGCT--AGT----GGCGTCATCTGGGGGAACGC
gi|2 : agcgCCGTTACAG-GTCAAGAATACTTCCATGAAGTGTTTCTTCTC---TG--AAA------CAGCACTGAATCACTATGTTT----G-TC----CT----G-C--TT--TAAG-TTTTGT-G-GA---A-AAT--AAA-----------AGACACG-TTCTGTCAATTC-CT---------------TTA----TAAT---ACCGGACATGGTCAGCAC--TA-TTTCCTGT-CAAAAAATATTTGGG-GGGGGGGGGGTGGGGGGGTGCA-GTTTAT-------GTT----TGTT-----A-A-ACTTAATAAACTT------CA----TAA---C---ATTTAAAA--C-----TA------T--AGTTTACC--T--ATAT-----T--------TGTTT-AAAATAAATACGTA---AAATGTA--GT---AAT----A------TTT--AATTTTAA-AGGAA-ATATG------ATATAAGACTGAGACATTTTATGGGGATATT-T-C-----TA-TTC-AA---A--TA------AA----A-TGTGCCTTCTAA----CTA-CCTGCGC-TGTAATAA---A--C-T-ACCAAAATCG------GTG---A-CAG----G----T----CT------------------AGA--GATCGGAGAT--ATT----GACGTCATTTATGGGAACGCATt
gi|20 : ttCCCGTAACAGTATCAGGAATATCGAAATGAAGTATTTC-CCGC---CG--GAA------CAGCATTCAAACTAACAATTT----A-CT------------A--TTCTTAAG-TGGTAT-G-AT---G-A-TCCATT-----------ACATAG--TGTCGTC---TC-TT---------------GCA-----AA--------------GTGAGCAT--TA-TTTCATGTACGAAAATTGGTACAG-GGCGA----------------AAGTTTAT-A-T---GTTGGTTTGTT-----A-A-AATTCTTAAACTA------TA----TAA---T---ATTTAGAA--A-----TA------T--A---TA----T--TTA------T--------T---C-AAATTATATACTTG---AAGTTTA--TC---AAT----ATTAAATTTT--A--TTTTA-AGGAA-AGGTA------AAATAAGA----GACAATtg
gi|21 : ttttCCGTAACAT-GTCAGGTGTACCATATAAAAGCCCTTTTTTTTGGATG--AAA------CAGCATTAAGAT-CCCAATTT----G-TT----TT----A-A--TT---AAG-TGTTTT-TTGT---G-AATC-------------------AC--T------------TT----------------TA----GAAA---ATCTGCCATGGTCAGCAA--TA-TTT-----ACGAAAAA-GGTTCAG-AGTAA----------------A-GTTTAT-G-T---TTG----TGTT-----A-A-ACTTCATGAACTA------TA----TAC---T---GTTTAGAA--A-----TA------G--A---TATA--T--TTAT-----T------------C-AAACCATTTACCTG---AAGTGTA--TT---AAC----A------TTT--A---TTCACAGGAgt
gi|22 : tattttAG-GACGA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTTTGTTAA-A-A-TTAATGAACTA------TAATTATAA---A---ATT-AGAA--A-----TA------T--A---T-----T--TTAA-----T--------T---AGAAAAAATATATCTG---AAGTTTA--TC---AAT----A------TCA--A--TTTTA-AGGAA-AAATG------AAATAAGA----GACATTTTGTGAGCGTATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----T-TATGCCTTCTTA----CCGACCAACAC-TGCAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--CATG---A-Gtcagtctgagctttttaagtcaa
gi|23 : ---GTT----TATT-----A-A-AATTCA-AAAATA------TA----TAA---T---ATTTAGAA--G-----TA------T--A---TATC--T--TTAT-----T------------C-AAAATATTTACCTT---AAGTTTA--TC---AAT----A------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GACAATTAATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCATTCTTT----CCATCCCACAC-TATAAC-A---A--C-TAACCAAAAT-GA----AGGG---A-GGT----T----T----CTAAGCAC----A------CAGAACAATCGGAGCT--AGT----GACATCATCTGGGGAAACACATcaattaaagtcctctgaggaaacacattgtc
gi|24 : CTA------TA----TAA---C---ATTAAGAA--ACA---TA------T--A---TATC--T--TTAT-----T------------C-AAAATACTTACATG---AAGTTTA--TG---AAC----T------TTT--A--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GATAATTTATTACCATATT-T-T-----TA-TTA-AA---A--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CTG-CCCGCGC-TATACT-A---A--T-TAACCAAAATCGGTTAAAGTG---A-GGT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCAGTCGGAGC
gi|25 : TCCCTTC---CG--AAA------CAACAACTAAGTACTCAATTT----G-AT----CT----G-A--TT--TAAG-TGGTTT-G-GT---C-AATCCAAC-----------AGATAC--TGCAGTC---TC-TT---------------GTA----TAAA---ACCTGACATGGTCAGCAC--TA-TTTCTGGTACG-AAAATGGTACAG-GTTGA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-A-AT--TAAA-TA------TA----TAA---C---ATTT-GAA--A-----AA------T--A---TG-C--T--TGA------T--------T---C-AAAATATTAAC
gi|26 : AAATGAGTGAG-AACAA----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-A-TCTATAAACTACATGTATA----TAA---A---ATTTGGAA--A-----AA------T--G---CAT------TTATCTA--T--------T---A-AAAAGATTTGCGTG---AAATTTA--TA---AAT----G------TTGGAA--TTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----CACAAATTATTAGCATGTT-T-C-----TA-TTC-AA---A--TA------GT----C-CAT--CTTCTAA----CCG
gi|27 : ccaatatgtAA------CAGCACTTAAGCACTCGGTTT----G-TT-----T----G-C--TT--TAGG-TGGTTG-A-AT---G-AATCCAAG-----------AGATAC--TGCCGTC---TC-TTAATATAATACTATTAATG----TAAT---ACCTTCAATGGTCAACTC--TA-TTTTTCATAC-AGAAATGATTGAG-GACAA----------------A-GTTGA--A-------------GTTG----A-A-G-TTTATAAGCTA------TG----TAA---C---TTTTAGTT--A-----TA------T--A---TA
gi|28 : ttccatagCCCGTAACATTACCAGGAACATCTCAATAAAGTTTTGCTCCTC---CG--AAT------CAGCATTCAAACATCTAATTT----A-CC----CT----G----CT--CATG-TGATGT-G-AT---G-A--------------------------TGTCGTC---TC-TT---------------GCAACGCGAAT---ACCTGACATAGCGAGCAT--TA-TTTCCGGTACGAAAAATTGAT--------A----------------G-GTT------T---GTT----TGTT-------A-A-TT-------TA------TA----TAA---T---ATaa
gi|29 : ttttACCTG---ATGTTTC--TT---AAT----A------TTC--A--TTTTA-AGGAA-ATGT-------AAACAAGA----AACAAGTTATGAGCATATT-T-C-----TC-TTA-AA---A--TA------GC----A-CATGCCTTCTAA----ACCCCTCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAAATCGGTT--AGTG---A-TAT----A----T----CTAAGCAC----A------C--ATTAAACGGAGCT--AGT----GACGTTATCTAGGAAAACA
gi|3 : CCTGTAAAATTATCAGGAATACCACAATGAAGTCTTTTTCCTT---CG--AAA------CAGCATTCAAACATCCAATTT----A-CT----TT----G-C--C---------GGTTT-G-AT---G-AATCCGTT-----------AGGTAC--TGTCCTC---TC-TT---------------GTA----TAAT---ACCTGCCATGGTGAACAT--TA-TTTCCAGTACGAAAAACAGTTAAG-GGCAA----------------A-GTTTGT-A-T---GTT----TGTT-----T-G---TTCATAAGTTA------TG----TTA---T---ATTTAAAA--A-----TG------T--A---TATC--T--TTATGGAATT--------T---C-AAAATCGTTACCTG---AAATTTA--TC---AAT----T------CTT--A--TTTTA-ATGAA-ATGTG------AAATAATA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TTA-AA---A--TA------AT----C-CATGCCTTCTTA----CTGCCCCGCAC-TATAAT-A---A--T-TAACCAAAATTGGTT--AGTG---A-GTT----G----T----CTAAGCAC----A------CAGATCGTTCAGAGCT--AGT----GACAACATTTAGGGAAACACATtg
gi|30 : CTGTAGCAT-GTTAGGTGTACCGTTATAAAGCCCCTTTTCTA---TG--AAA------CAGCATTAAAGCACCCAATTT----G-TT----CT----A-A---T--TAAG-TGTTTT-G-CT---G-AATCCA---------------ATA---TGTCGTC---ACTTT---------------TTA----AAAA---ATCTGCCATTGTCAGCAA--TA-TT-----AACGAAAAA-GGTTAAG-TTTGA----------------A-GTCTATGA-T----TT----TGTT-----A-
gi|31 : ttCCCGTAATAA-GGCAGGAGTACCGCAGTGAACTTTTTCCCCTC---TG--AAAACTTGGCAGCATTTAAACACTCAGTTT----G-TT----CT----A-ATTTT--TTTG-TGGTTT-G-AT---A-ACTCCAAG-----------AGATAG--TGCCGTC---TC-TT---------------GT------------------CATGGTCAGCAA--CA-T-------------AATGATTCGG-GACGA----------------A-GTTTAA-A-T---GTT----T
gi|32 : gtttcTCAATCCCTCAACCA----G-TT----CT----A-A--TT--TAAG-TGGTTT-G-GT---G-AATCAAAG-----------ATATAA--TGCAGTC---AC-TT---------------GTA----T-AT---ACGTGCCACAGTCAGCGC--TA-TCT
gi|33 : tttttcttgtaacaaggtagtactgcaacaaag-TGGTTT-G-AT---G-AATCCAAG-----------AGATAC--TGTTTTC---TC-TT---------------GTA----AAAT---ACCTGCCATGGTCAGCAC--TA-TTTCC-TTAC-AAAAGTGATTGAGAAGTCA----------------A-GTTTAT-ATT---ATTATA-TATTTAA--A-A-A-ATCATAAAATA------TG----TAA---T---ATATATAA--A------A------T--A---------T--TAAT-----T--------T---T-AAAATAactacctctgaaagtgttcgtccgtgtaggatatagatagt
gi|34 : TTTAA-TT---AAC----A------TG---A--TCTCA-GAGAA-ATGTG--------------------CAATTTATGAGCATAAT-T-T-----TA-TTG-AA---A--TC------GT----C-CATGCCCTCTCA-----CACCACGAGC-TGT--T-A---A--C-AAACCAAAATCGATT--AGTG---G-TGT----G----T----CTTAG-----------------------CGGAGCT--AGTGACGGACGTAACCCGGAGGATCACATg
gi|35 : ttA------TA----TAA---T---ATTTAGA------------------------------T--TTA------T--------T---C-AAAATATTTACCTG---AAGTATA--TC---AAT----A------TCT--A--TTTGA-AGTAA-ATATG------AAATAAGA----GACAATTTATGAGCATA---------------TA-AA---A--TA------GT----t
gi|36 : TCTTTCTTCGC---CA--AAA------CATTATTTAAGCAGTTCGTTT----G-TT----AT----T----TT--TAAG-TGTTTTTA-GT---G-AATCCAAA-----------ATATAC--TGTCTGC---AT-TT---------------AAA----TAAT---ACCTACCATGttttgctcgtcaaaggcctctctcaaattatatacatgccagacattccattatc
gi|37 : tgaaattaatcagtcgatggtaatatatctaccatataAATTTATAGGCATTCT-T-T-----TA-TTA-AA---G--TA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCTTCTCACGC-TATGGT-A---A--C-TAACCAAAACCGGCT--AGTG---G-TGT----A----T----CTAAGTAC----A------CTGACCAATCGGGTCT--ATT----GACGTCATCAGGGGAAAtt
gi|38 : atggC--T--TTAT-----T------------C-AAAATCTTTA-GTG---AAATATA--TT---AAC----A------CTT--A--TTTCA-AGGAA-TTGTG------ATATCTGG----GACAATTTATGAGTATATT---C-----TG-TTA-AA---A--TA------CT----C-CATGCCTTCTAA----TCTCCCCGCGC-TATAAT-A---A--C-TAACCAAA
gi|39 : -GTCTGAATTACAGCCATAAAGCTGTTCTTCTC---AA--AAT------CAGC----------TCGATTT----G-TTTTACCT----T-A--AT--TAAA-TGGGTT-G-AT---G-AATCCAAG-----------ATATAC--TACCGTC---TC-TT---------------GTG----TAAT---ACCTGCCACGGGCAGCTC--AA-TTTc
gi|4 : GTAGCAA-GTCAGGAGTACTGCAATTAAGTAATTCTGCTT---TG--AAA------TAGTATTCAAACACTCAATTT----G-TT----CT----A-A--TT--TAAG-TGGTTT-G-TT---G-AATACAAG-----------AGTTGA--CGCCGTC---TC-TT---------------GTA----TACA---ACCTGCCATTGTCAACAC--TATTTTTTTGTAAG-AAAATGATTCTT-GTCAA----------------A-GTTTAT-A-T---ACT----TGTTA----A-A-A-TTCATTAACTA------TA----TCA---T---ATTTATAC--A-----TA------T--A---TATC--T--TTA------T--------G---C-AGAATATTTACGAG---AAGGTTATTTT---AAC----T------TTT--A--TTTC------A-ATTT--------------A----GACAATTTATAAGCATATC-TACCGGTATG-TTA-AA---A--TA------GC----C-CATGCTGTCTCA----CCACCCTGCG--TAAATT-A---A--C-TAACCGAAATCAGTA--AGTG---A-GGT----G----A----CCAAGGAC----G------AAGATTAAAC-CAGCT--AGT----GATGTTATCTGGGGAAACACATgtt
gi|40 : ttacaAATTA------TA----TCA---T---ATTCAGAA--A-----AA------------------------AT-----T------------C-AAAATATTTCTGCA---AAGTTTA--TTGA-AAC----T------TTA--A--TTTAA-AGGAA-ATGTG------AAATAAGA----GAAAATTTATGAGTATATT-T-------------------A--TA------G-----C-TAAGCTTTCTTA----CCATCCt
gi|41 : tA------GT----C-CATGCCGTCTTA----CCATTTTGTGC-TATAAT-A---A--C-AAACCAAACTCAGTT--AGTG---A-AGT----G----T----CTAAGCAC----ACACTGTCAGGTCTATTGGAGCT--AGT----GGCAACATCTGGGGACACACGT
gi|42 : TGCCGCAGTGAAGTATGTCTCCTA---CG--AAA------CAGCATTCAAACACCTCATTT----A-CT----CT----G-C--TT--Tt
gi|43 : ccttttccgtaacattatcaggaatacagtaatcgaggaattagatagttcctTTTTAA----CTGCCCCATGC-TATA-T-ATTTA--C-CTGCCGAAATC---T--AGTGGCTA-GAT----A----TTCTTCCATGCAC----A------AAGACCAATCGGAGCTTAGGT----GACATTGTCTGGAGGAATAGAT
gi|44 : tTCAGGAATACCGCAGTGAGGTGTTTCTCCTC---CG--AAA------CAGCATTC-AACGCCCAATTT----A-CT----CT----G-tg
gi|45 : aacctttggctaaacatttA------TA----TAA---A---AGTAAGAC--A-----GA------T--A---TATT--TATTTAC-----T--------T-----AAAATGTTTACGTA---AATTTTA--TT---AAC----A------TTTA-A--TTTCA-ATGAA-ATGTG------AAATAActatatactgttgg
gi|47 : ACAA-GTCGGACGTACCGCCAAGAAGTATTTATTGTC---TT--AAA------CAATATTGAAGCACGTGATGT----GTTT----CT----G-
gi|48 : CATTCAAGCACACAATTT----G-TC----CT----A-A--TC--TAAG-CGGTTT-G-GT---G-AATCCAAG-----------AGATAC--TGCCGTC---ttgttgtatg
gi|5 : aagttttccaCCGTAAAAA-GCCATGAGCAC------------TTTTT--TG---CG--AAA------CAGAGTTCAA-----CG-TTT----T-TC----CT----G-C--AT--TAAG-TTGTTT-T-GT---TTAATATGTG-----------AGATGC--TGCCTTC---TC-TT---------------TTA----TAGT---ACCTG-----GCCAGCAC--TA-TTTTCGGTACGAAA--TAATTGAG-GGCGA---------------------------C---GTT----GGTT-----ACA-A-TTCATAAATTA------AA----TAA---C---GTTCAGAA--A-----TA------T--A---CCTTCAT--TTAT-----T--------T---T-AAA-TATCTACATG---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--AATTTTAA-AGGAA-CTGTG------ATAAAAAA----GACCAATTATGAGCATATT-T-A-----TA-TTA-AATTAA--TA------GTACAGCACATGCTTTCTAC----CCGACCTGTGC-TGTAAT-A---AAAC-TAACCAAAATCGGGT--TTTG---A-G-T----G----T----TCAAGCAC----A------AAACTCAACCAGAACT--GGT----GACGTCATCCGGGGG-ACACA
gi|50 : aattgttCCCGTAACAA-GTCAGGAGTACGGCCATGAAGTGTTTATCCTC---TA--CGA------CAGCATTCAAACACTC
gi|51 : tgttGTGCCGCCATGAAGTCTTTTTTCTC---CG--AAA------TATCAATTAAGAACTCAATTT----G-T
gi|52 : caattcatatGCCATGGTGAGCAT--TA-TTTCTGGTATG-AAAATATTTCAG-GGCGA----------------A-GTTGAT-A-
gi|53 : AGTT--AGT----GACGTCATCT-GGGGAACACATa
gi|54 : tttaacatgcA-TTA-AA---A--CA------GT----C-CATGCCTTCTAA----CCA--CCGCGC-TATtggtgt
gi|6 : ATTGAAAGACTAAACTTCTATG-TT----TTAAGGG-G--TT--TAAG-GGGTTT-G-GT---G-AGCCCAAGGTGAGCCCAGGAGATAC--TGGAATA---TA-TT---------------GTA----TAAT---ACCTGCCGTGGTTAGCTC--TA-TTTCCGGTATGAAAA----TTGAG-GA-GA----------------A-GTTTAT-A-G---TTT----TGCTAA---A-A-A-TT-ATAAACTATAAT--TA----TAA---CACAATTT-GAA--A-----TATC----T--A---TATA--T--TTAT-----TTGAATTAGT---T-AAAATATCTACGTA---CAGTTCA--GT---AAT----A------TTCA-A--TTTCA-A--AATATATG------ACACAGGA----GGCATTTTATGAGCATGTT-T-C-----TATTTA-AA---A--TA------GT----T-CATGCCATCTAAACGTCCGCTCTACTCGTATGAC-A---A--CTTGCCCAAAGCCAGCT--AAC------GGT----GGACCTTA--CTATGCAC----G------GGGATCAGACGGAGCT--AGT----GACg
gi|7 : CCGTTACAA-GTCAGGAGCACCGCCA----GTCTTTTTTCTC---CG--AAA------TGACATTCAAGCACACAATTT----G-TC----CT----A-C--TT--TAAT-CAGTTT-T-GTTAAA-AAT--AAG-----------AGATAC--TGCCATT---TC-CT---------------TTA----TAAT---ACCTGCCATTG-CAGCTC--TA-TTTTCTATACGAAATATTG---AA-GGTGA----------------A-GT-----------GTT----TGTT-----A-A-AATTCATGAACTA------CA----TGA---C---ATTCAGAA--A-----TG------T--G---T-----------------T--------T--------ATGTTTACGTG---AAGTTTA--TT---AAC----AAACAA-TTT------TTAA-AGAAA-ATGTG------ATATAAGA----GACAATTTAT-AGCATATT-T-C-----TA-TTC-AA---A--TACTAATTGT----C-CATGCCTTCTAA----CCGCCTCCCGC-CATAAT-A---A--C-TAA-----------T--AGGG---A-TGC----C----T----CTAAGCAT----A------CCGATTAATCGGATCT--ATT----GCCGTCATAT-GGGAAACAccaatcggga
gi|8 : tCCTGTAACAA-ATCACGAGTACCACAATGAAGTCTTTCTCTTC---TT--AAA------TGTCATTCAAATA----ATTT----G-TT----CT----T-G--TT--TAAG-TGGTTT-A-GT---G-AATCCAAC-----------AG--------------------------------------A----TAG------------TGGTCAACAA--TA-TTTCTGGTAC-AAAAATGATTCTT-GGCAA----------------A-GTTTGT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-AATTCAAGAACTA------TA----TAG---A---ACT-------A-----TA------T--A---TATA--T--TTAT-----T------------C-AAAATATTTA-GCT---ATGTTTA--TT---GAC----A------TTT--A--CTTCA-AGGAA-ATGTG------AAATATGA----GACAATTTATGAGCATATT-T-C-----TA-TT--GA---A--TA------GT----C---TGACTTCTAA----CCATCAGGCGT-TATAAT-T---A--C-TAATTGAAATCTGTT--AGTG---GTAGTGCTAG----T----TTGAGAACAAATA------AAAACAAAGCGCAGCT--AGT----GATGTCATCTGAGGAAA
gi|9 : ttcCTGTAACAA-GTCAGGAGTACCGCAATGAAGTCTTTCTCCTC---TG--A-------------------CATTCAATTT----G-TC----CT----T-A--TT--TAAG-TGGTTT-A-AT---G-AATCGAAG-----------AGATAG--TGCCGTC---TC-TT---------------TCA----GAAA---ACTTGTCATGGTCAGCAAAATA-TTTCCGGTATGAAAA-TGGTTT-G-GGCGG----------------A-GTTTAT-A-T---GTT----TGTT-----A-A-AATTCACAAACTA------TA----TAC---T---ATTTAGAA--A-----TA------TCTA---TATT--T--TTAT-----T--------C---C-AAA-TATTTAGG-G---AAGTTTA--TT---AAC----A------TTT--A--TTTCA-AAGAA-ATGTG------CAATAAGA----CACAATTTATGAGCATATT----------------------------------------------TTCTAA----CCACTCTGCGT-TATAGT-A---A--C-TAGCCAAAATTGGTT--AGTG---A-TGT----G----T----CTAATTAC----A------CAGATCAAAC--------AGT----GATGTCATCTGGGGAAATAC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|46 ): ATAGTATCGTATGTATCAGCCTACCCATATCGCAGTACCTATCGTATCGGAACGGACCTGGCAATACACAGCCCTAATAAT
Unaligned ( gi|49 ): CTATGATTATAGTAAAATGAGCACATGGATCTCGTGCGTTCATTCATAGATATTTTAAATGGAATGCCATTG