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gi|16 : attcaattattctatattaaaaagtggcccagctttatatttcatatgattgcattctacatcatgtaattaactgttttattagctagggcggtaacaatgacatggaccatattatacaatacaggagtttgcatagaggtaactagttctactagtgacttttgccgtttagccattggatatgtatgtcttggtgttactttactaaactttgatgtggaaaatatgtctcccatgaaaagagttattttaacaaatacagactttctggtactactgcagatgcattttcaataccaataattttatagctaccaagacagggtgtgactttaataaaattttctttcttcagtgctgtattacctgttgatagtaacacattgtgtttatcatcatttctcagagattgatttgacacacccatcttcaatttgatttgatactttatttgttagggttgaataaatgaaaagttatgtgataatgggagtggggtggtggggaggggggtaagtctaatttgggaacttgatttcaccatttaatttatgcttctggtatattgattaataatcatattttacaatatcaatacaaatgaaatcagactcaatgttaaatatgagagttctcattagatttgccaaacataatgaagcgttttatatcaaatatcgttttgctaccaacctgattatacaaatatatcaggaccaggacattcaatgtgctaggcagttagtggttaagattaactgttattgtgatacactgctgaaatgtcattggacagaccttatgtcacattaattgtcataatatctcagacatatgaagaagcagaacctctaaaacctcacatctattATGTTTTACTTGTGGTGACCTTTGACCTTATAAC
gi|11 : taagtctgtcgaactagatgtataccaggtatttccatcacataacaccagaaaatgttgtgttgaagtttttataatgacaatagacacatgttacacaaaacccttatgagtcgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaattaacagatatctcaaatatgaatagtattggtattatctcgtagagttaaAAAATATATAACAAATATATTAACAAA--TCTTAAAT---GTGAATATTGTTATTTCATTTATACATA-tcagtcaaaaggtcaaatataatttggcaaccgactgtttcgaatgtaggttatagttgcaaactcatttagcgcggttgccatccatgaacacgccgtatcgatttctagcaacatatataagaaatttcaccagact
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gi|8 : taacatacataggaatttattcattgtatttccgtagtaatgtagtataactattacagtttcaacctaaatatatattcaaatattcaaacatctatagattaccgtccatagtgtttcattgatatatactgctgcgctgaggaaggacaggaaacctaatatacctctgtctagaaatgctctagatataatgatgataaaaatatgactaacttaagatggaattgcttttaaaatgtaggttttggtctagattattaaatacctatatatctaaagttgccgaagctttcatgagtttaatgtttactagtgaaatagatgttcagtgctgaaagtttattctgccaatctaattattctataataaaaagttgcccagctctatatattatatgattgcattctgcatgtataggtcatatgtactatattatattataattaatacttatgatatattgattaatactgatattttacaatctcaaaacaaatcagacacaatattagatgtgagaataccacacatcttattgctaccaacctgattatacaaatatttcgaggaccaggactttgaatgtgcctggcatttagtggtgaaactatctgttattgtgatacactgatgtaatgccagtggaaaaaccttatgtcatatttattgtcttaatatcccctacatgtgtagaagcattacatctaaaatgtttgttaaattacatggagctgcattttgtacaaattacggatgaaaagcatgtaaggccaagttcgttcaaaccaataaataacaaaatatgtttgtatgatgacattgaacaaatatatcacattattttgattaatatcctatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttaagcatatttaaaaatatatttaaactgaatcagttctattggtA-AAATACAT-AGCAAACATCTTAAAT---ATGAACATTGTTATTTCATAGATAaacttaacatttttcaaatgcaaccttatggtgacctttggccttttcagtcgtcaaactacgtgtataccttgtttttgcatcataaccacagaaaatgttgtgtttaagtttgcataatgacattagatacatgttacacaaaaccatcatgtatcgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttaacaggtatcgtaaataaggatatttttggtattatctcgtccagttcaaatatttgcttgtggtgaccgattgtttagtggcaaactcatttagcacgcttgcagtccataaacacgccgtacctcatgcatcgatttctaaccacatagatgagaaatatcaccagact
gi|14 : tttgatgtttactggtgcagtagttgttacgtgcgaatagtatatctagttattctataactaaaattatccccagctctatattttatatgatagcattctgcatcaagtaatttagtattttgttaactggagaggccacaatgacatgaacaatattatattataatttctgcttatgatatattgataaataatcatattttacaatgtcaaaacaaatcagactcaatgttaaatattaaaaatgagagttctcattatatttgccaaacatcaggtagttttatatcacaaatcgtatcgctaccaacctgattatacaaatattttaaaaccagaatattcaatgtgctaggcttgtggcaacccttggtgtaacaaaatcccttagtgtaaaaattgttacactaaggatttttgttacatttaatggtgaaacttaactgttattgtgatacactgctgtaatgccattgggcaaaacttatgttatatttattgccttaatataccctacatgtgtagaagcaatacctgtaacaaattttgctccatactgcacatcttatacattacaaacggctgattttatacaaaatacggatgaaaggtaaataaggtcaatttcattccaactttgtatatatcaatatacccataaataacaaaaaatacagcaaatcgttgtttgtatgatgacattgagcaagcatttcacattattttgattactatcctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcagttggtAAACATCTTAAATATGATGAATATTGTTATT--ATATtatcagttccaactttacacgttgcac
12 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-155 ) : TACCAGAT-TTT-AGATCGGAGCAAGAAGAACAGAAAACNGTTCATG---------TTGTAAGAACTGTGGTAAATCAATATTTCTTCGAAA-TTCACTATGCTTTGCTTTAATACATGTACATGGTGTTCTTGACCAACTACCA-CACGCAT--ATACGC--TGCTTGTTTGGCGGAGTTTTGTTTCGATTGA-----TATAAANTTANCTTTCAAACTTTACGTTAACGTAAAGTTGTGTTTCCTACGACATTNTCATATTTGCCAAATANAATGATCTC--TCGGAACGTAT--CA-C-GTGCATGTA-TTGA-CACCAG-ACA-AT---AAA---TGA----GGGCATTCGATTTATTCTTTTTT-AAAACGATAA-------CAGCCGATNTTCTT--AAACATGCACTAGTAGTTGCTATAATAATTCCAACAATTCCTATTGACATTTGNATAGGACTTCAATAGTAAGTTCAGCTATCCTTATAC-------T---ACATTTGATATGATTTCGGTA------TCAGATCATATCAGCTGCATTTCTGTTCAAACTGAA------CTTTGGCT------TA----------AAAC-G-TCAGATTCGGCAAAC-----TA------A----------TC-------A--------------GTTAT-T-TTTC-ACATACATNGGAATTNT-AC-CATTGTATTT----CCTTAGT---CTTGCAGTACAACTGTTACAG-TTTTCAAC-TTAAA---ANAT----A--TAT--TCAAACATTTATAGATTACCGTCCATAGAGTNTCATTTATATGTACTGCTGCGCTGAGAAAGGACAGGAAGCCTAATATACATTTGTCTGGAAATGCTCTAGATA--TAATAATGATA--AANAATATAACTGCCTNATGATGGAATNGC-TTTTCAAATGT--AGGTTTTGGTCTAGATNATGAAATACCTATATATCTAAAGTTGCTGAAGATTTCGTGATTTTAA-TGTTTACTGGTGCAGTAGATGTTCAGTGCTGAA-AGTTTA-TTTT--CAA-TCTAATTATTCTATA-CTAA-----------AA--A--GTGGCCCAGCTCTATATTTCATATGATTGCATTCTGCATC-ATGTAATTTAGTGCTTTGTT-AGCTAGAGNGGTNACAATGACATGGACCATATTAATTTTA-----TAATTTATGCTTATGATATAT--TGATTAATAATCATATTTTACAATCTCAAAA------CAAA---AATCAGACTCAATGTTAAATAT-------GAGAGTTCTCATTAGATTTGCCAAACATCAGGTAG--T--TTTATACCACANATCGTATTGCTACCAACCTGATTATACAAAGANTNCGAGGACCA---GGACATTCAATGTGCTAGGCATTTAGTGGTGAAGCTTAACTGTTATTGTGATACACTGCTGTAATGCCATTGGACAAACCTTATGTCATATTTATTGTCTTAATATCCCCTACATGTGTAGAAGC-ANTACCTCTA--AAAT-TTTGCTACATACAGCACATCTATTAAATTACATGCGGCTGCATTTTGTACAAAATACCGAAGAAA--GGCATGTAAGGCCAAGTTCATTC-NAA-TA---TGTATATATTA--ATATACCC---ATNAATAACAAAATATACAGTAAATCTTTGTG--------TGTATGATGACATTGAGCAAACATTTCA-----CATTATTTTGATTAATATCCTATAATAAAGCTAAAA--CTAATAAAAGAATACGACATATTTTGAACAA-T-CCCTCTTCAATGTCTNACTCGN--TGACCTTTGACCNTGTGACNNTGATACACATCANNTTA-----------AG-CATATTTAA-A---------------------AATATAT---AAC--AAACA--TCT-T-----AAAT---A-------------TGAA---TAT------TG---TTATTTCATATATACNTATATATATATATATCAGTTCC
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12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|18 ): AGAAGTTACTGCAGTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAAAATAGTTACCCTTAATTGTAATAAACGATTTTATTCTATACATAATAATCATTGTAACGTTGATAAACCTGATTAACATGTACCCATATGTCAATAAACAAACAGTATAATTTTGTATTTTAACCCAACTCCATGACTGGAAGTATGTTATGATCTTAACAATGAAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCATCAAGACCGCAACAACATAATATATGATAAGTTGTTAAGGCCTTTGCAAGTACATCACATTATATCAACATGGCATTGTAAGAATATTAATACATGCCTTTTGGATATTTTCCTTTTCATAAATGAGATCATGTACATTTGATTTGTATTAAATTTACTAGCTTTGCCTTGTATTTGTTATCAACTGCCAGGAAATACACTTGACCAATCACGGAATTACGAAAATAAGATATTAATGTATCTGTTTCT
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Reference ( family-155 ) : TACCAGAT-TTT-AGANCGGAGCAAGAAGAACAGAAAACAGTTCATG---------TTGTAAGAACTGTGGTAAATCAATATTTCTTCGAAA-TTCACTATGCTTTGCTTTAATACATGTACATGATGTTTTTGACCAACTAC-ACACG-CATT-ATACGC--TGCTTGTTTGACGGAGTTTTATTTCGATTGA-----TATAAANTTACCTTTCAAACTCTACGTAAACATAAAGTTGTGTTTCCTACGACATTCTCATATTTGCTAAATACAATGATCTC--TCGGAACGTAT--CA-C-GTACATGTA-TTGA-CACCAG-ACA-AT---AAA---TGA----GGGCATTCGATTTATTCTTTTTT-AAAACGATAA-------CAGCCGATNTTCTT--AAACATGCACTAGTAGTTGCTATAATAATTCCAACAATTCCTATTGACATTTGNATAGGACTTCAATAGTAAGTTTAGCTATCCTTATAC-------T---ACATTTAATATGATTTCG------GTATCAGATCATATCAGCTGCATTTCTGTTCAAACTGAACTTTGGCTCAGACT-----TAAAA-C-G-TCAGATTCGGC-----AAACTA------A----------TC-------------GAGTTAT-T-TTTC-ACATACATAGGAATTNT-A-C-CATTG----TATTTCCTTAGT---CTTGCAGTACAACTGTTACAG-TTTTCAAC-TTAAA---ANAT----A--TAT--TTAAACATTTATAGATTACCGTCCATAGAGTGTCATTTATATGTACTGCTGCGCTGAGAAAGGACAGGAAGCCTAATATACATTTGTCTGGAAATGCTCTAGATA--TAATAATAATA--AACAATATAACTGCCTNATGATGGAATNGC-TTTTCAAATGT--AGGTTTTGGTCTAGATNATGAAATACCTATATATCTAAAGTTGCTGAAGATTTCGTGATTTTAA-TGTTTACTGGTGCAGTAGATGTTCAGTGCTGAA-AGTTTA-TTTT--CAA-TCTAATTATTCTATA-CTAA-----------AA--A--GTGGCCCAGCTCTATATTTCATATGATTGCATTCTGCATC-ATGTAATTTAGTGCTTTGTT-AGCTAGAGCGGTCACAATGACATGGACCATATTAATTTTA-----TAATTTATGCTTATGATATAT--TGATTAATAATCATATTTTACAATCTCAAAA------CAAA---AATCAGACTCAATGTTAAATAT-------GAGAGTTCTCATTAGATTTGCCAAACATCAGGTAG--T--TTTATACCACANATCGTATTGCTACCAACCTGATTATACA---AATATTTCGAGGACCA---GGACATTCAATGTGCTAGGCATTTAGTGGTGAAGCTTAACTGTTATTGTGATACACTGCTGTAATGCCATTGGACAAACCTTATGTCATATTTATTGTCTTAATATCCCCTACATGTGTAGAAGCATTACCTCTA--A-AAT-TTTGCTACATACAGCACATCTATTAAATTACATGCAGCTGCATTTTGTACAAAATACGGAAGAAA-GGCATGTAAGGCCAAGTTCATTC-CAA-TA---TGTATATATTA--ATATACCC---ATNAATAACAAAATATACAGNAAATCTTTGTG--------TGTATGATGACATTGAACAAACGTTTCA-----CATTATTTTGATTAATATCCTATAATAAAGCTAAAA--CTAATAAAATAATACGACATATTTTGAACAA-TCACTCTTCAATATTTCACTCGT--TGACCTT------TGAC-CNNATGACCTCGATACACA-TCA-TTTAAG-C-ATATTTAA---------------------AAATATAT---AAC--AAACA--TCT-T-----AAAT---A-------------TGAA---T-A---T------TG---TTATTTC------ATATAT-ACNTATATATATATATATCAGTTCC
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consensus : TACCAGAT-TTT-AGANCGGAGCAAGAAGAACAGAAAACAGTTCATG---------TTGTAAGAACTGTGGTAAATCAATATTTCTTCGAAA-TTCACTATGCTTTGCTTTAATACATGTACATGATGTTTTTGACCAACTAC-ACACG-CATT-ATACGC--TGCTTGTTTGACGGAGTTTTATTTCGATTGA-----TATAAANTTACCTTTCAAACTCTACGTAAACATAAAGTTGTGTTTCCTACGACATTCTCATATTTGCTAAATACAATGATCTC--TCGGAACGTAT--CA-C-GTACATGTA-TTGA-CACCAG-ACA-AT---AAA---TGA----GGGCATTCGATTTATTCTTTTTT-AAAACGATAA-------CAGCCGATNTTCTT--AAACATGCACTAGTAGTTGCTATAATAATTCCAACAATTCCTATTGACATTTGNATAGGACTTCAATAGTAAGTTTAGCTATCCTTATAC-------T---ACATTTAATATGATTTCG------GTATCAGATCATATCAGCTGCATTTCTGTTCAAACTGAACTTTGGCTCAGACT-----TAAAA-C-G-TCAGATTCGGC-----AAACTA------A----------TC-------------GAGTTAT-T-TTTC-ACATACATAGGAATTNT-A-C-CATTG----TATTTCCTTAGT---CTTGCAGTACAACTGTTACAG-TTTTCAAC-TTAAA---ANAT----A--TAT--TTAAACATTTATAGATTACCGTCCATAGAGTGTCATTTATATGTACTGCTGCGCTGAGAAAGGACAGGAAGCCTAATATACATTTGTCTGGAAATGCTCTAGATA--TAATAATAATA--AACAATATAACTGCCTNATGATGGAATNGC-TTTTCAAATGT--AGGTTTTGGTCTAGATNATGAAATACCTATATATCTAAAGTTGCTGAAGATTTCGTGATTTTAA-TGTTTACTGGTGCAGTAGATGTTCAGTGCTGAA-AGTTTA-TTTT--CAA-TCTAATTATTCTATA-CTAA-----------AA--A--GTGGCCCAGCTCTATATTTCATATGATTGCATTCTGCATC-ATGTAATTTAGTGCTTTGTT-AGCTAGAGCGGTCACAATGACATGGACCATATTAATTTTA-----TAATTTATGCTTATGATATAT--TGATTAATAATCATATTTTACAATCTCAAAA------CAAA---AATCAGACTCAATGTTAAATAT-------GAGAGTTCTCATTAGATTTGCCAAACATCAGGTAG--T--TTTATACCACANATCGTATTGCTACCAACCTGATTATACA---AATATTTCGAGGACCA---GGACATTCAATGTGCTAGGCATTTAGTGGTGAAGCTTAACTGTTATTGTGATACACTGCTGTAATGCCATTGGACAAACCTTATGTCATATTTATTGTCTTAATATCCCCTACATGTGTAGAAGCATTACCTCTA--A-AAT-TTTGCTACATACAGCACATCTATTAAATTACATGCAGCTGCATTTTGTACAAAATACGGAAGAAA-GGCATGTAAGGCCAAGTTCATTC-CAA-TA---TGTATATATTA--ATATACCC---ATNAATAACAAAATATACAGNAAATCTTTGTG--------TGTATGATGACATTGAACAAACGTTTCA-----CATTATTTTGATTAATATCCTATAATAAAGCTAAAA--CTAATAAAATAATACGACATATTTTGAACAA-TCACTCTTCAATATTTCACTCGT--TGACCTT------TGAC-CNNATGACCTCGATACACATCG-TTTAAG-C-ATATTTAA---------------------AAATATAT---AAC--AAACA--TCT-T-----AAATA-------------TGAA---T-A---T------TG---TTATTTC------ATATAT-ACGTATATACATATATATCAGTTCC
Reference ( family-155 ) : TACCAGAT-TTT-AGANCGGAGCAAGAAGAACAGAAAACAGTTCATG---------TTGTAAGAACTGTGGTAAATCAATATTTCTTCGAAA-TTCACTATGCTTTGCTTTAATACATGTACATGATGTTTTTGACCAACTAC-ACACG-CATT-ATACGC--TGCTTGTTTGACGGAGTTTTATTTCGATTGA-----TATAAANTTACCTTTCAAACTCTACGTAAACATAAAGTTGTGTTTCCTACGACATTCTCATATTTGCTAAATACAATGATCTC--TCGGAACGTAT--CA-C-GTACATGTA-TTGA-CACCAG-ACA-AT---AAA---TGA----GGGCATTCGATTTATTCTTTTTT-AAAACGATAA-------CAGCCGATNTTCTT--AAACATGCACTAGTAGTTGCTATAATAATTCCAACAATTCCTATTGACATTTGNATAGGACTTCAATAGTAAGTTTAGCTATCCTTATAC-------T---ACATTTAATATGATTTCG------GTATCAGATCATATCAGCTGCATTTCTGTTCAAACTGAACTTTGGCTCAGACT-----TAAAA-C-G-TCAGATTCGGC-----AAACTA------A----------TC-------------GAGTTAT-T-TTTC-ACATACATAGGAATTNT-A-C-CATTG----TATTTCCTTAGT---CTTGCAGTACAACTGTTACAG-TTTTCAAC-TTAAA---ANAT----A--TAT--TTAAACATTTATAGATTACCGTCCATAGAGTGTCATTTATATGTACTGCTGCGCTGAGAAAGGACAGGAAGCCTAATATACATTTGTCTGGAAATGCTCTAGATA--TAATAATAATA--AACAATATAACTGCCTNATGATGGAATNGC-TTTTCAAATGT--AGGTTTTGGTCTAGATNATGAAATACCTATATATCTAAAGTTGCTGAAGATTTCGTGATTTTAA-TGTTTACTGGTGCAGTAGATGTTCAGTGCTGAA-AGTTTA-TTTT--CAA-TCTAATTATTCTATA-CTAA-----------AA--A--GTGGCCCAGCTCTATATTTCATATGATTGCATTCTGCATC-ATGTAATTTAGTGCTTTGTT-AGCTAGAGCGGTCACAATGACATGGACCATATTAATTTTA-----TAATTTATGCTTATGATATAT--TGATTAATAATCATATTTTACAATCTCAAAA------CAAA---AATCAGACTCAATGTTAAATAT-------GAGAGTTCTCATTAGATTTGCCAAACATCAGGTAG--T--TTTATACCACANATCGTATTGCTACCAACCTGATTATACA---AATATTTCGAGGACCA---GGACATTCAATGTGCTAGGCATTTAGTGGTGAAGCTTAACTGTTATTGTGATACACTGCTGTAATGCCATTGGACAAACCTTATGTCATATTTATTGTCTTAATATCCCCTACATGTGTAGAAGCATTACCTCTA--A-AAT-TTTGCTACATACAGCACATCTATTAAATTACATGCAGCTGCATTTTGTACAAAATACGGAAGAAA-GGCATGTAAGGCCAAGTTCATTC-CAA-TA---TGTATATATTA--ATATACCC---ATNAATAACAAAATATACAGNAAATCTTTGTG--------TGTATGATGACATTGAACAAACGTTTCA-----CATTATTTTGATTAATATCCTATAATAAAGCTAAAA--CTAATAAAATAATACGACATATTTTGAACAA-TCACTCTTCAATATTTCACTCGT--TGACCTT------TGAC-CNNATGACCTCGATACACATCG-TTTAAG-C-ATATTTAA---------------------AAATATAT---AAC--AAACA--TCT-T-----AAATA-------------TGAA---T-A---T------TG---TTATTTC------ATATAT-ACGTATATATATATATATCAGTTCC
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Reference ( family-155 ) : TACCAGAT-TTT-AGANCGGAGCAAGAAGAACAGAAAACAGTTCATG---------TTGTAAGAACTGTGGTAAATCAATATTTCTTCGAAA-TTCACTATGCTTTGCTTTAATACATGTACATGATGTTTTTGACCAACTAC-ACACG-CATT-ATACGC--TGCTTGTTTGACGGAGTTTTATTTCGATTGA-----TATAAANTTACCTTTCAAACTCTACGTAAACATAAAGTTGTGTTTCCTACGACATTCTCATATTTGCTAAATACAATGATCTC--TCGGAACGTAT--CA-C-GTACATGTA-TTGA-CACCAG-ACA-AT---AAA---TGA----GGGCATTCGATTTATTCTTTTTT-AAAACGATAA-------CAGCCGATNTTCTT--AAACATGCACTAGTAGTTGCTATAATAATTCCAACAATTCCTATTGACATTTGNATAGGACTTCAATAGTAAGTTTAGCTATCCTTATAC-------T---ACATTTAATATGATTTCG------GTATCAGATCATATCAGCTGCATTTCTGTTCAAACTGAACTTTGGCTCAGACT-----TAAAA-C-G-TCAGATTCGGC-----AAACTA------A----------TC-------------GAGTTAT-T-TTTC-ACATACATAGGAATTNT-A-C-CATTG----TATTTCCTTAGT---CTTGCAGTACAACTGTTACAG-TTTTCAAC-TTAAA---ANAT----A--TAT--TTAAACATTTATAGATTACCGTCCATAGAGTGTCATTTATATGTACTGCTGCGCTGAGAAAGGACAGGAAGCCTAATATACATTTGTCTGGAAATGCTCTAGATA--TAATAATAATA--AACAATATAACTGCCTNATGATGGAATNGC-TTTTCAAATGT--AGGTTTTGGTCTAGATNATGAAATACCTATATATCTAAAGTTGCTGAAGATTTCGTGATTTTAA-TGTTTACTGGTGCAGTAGATGTTCAGTGCTGAA-AGTTTA-TTTT--CAA-TCTAATTATTCTATA-CTAA-----------AA--A--GTGGCCCAGCTCTATATTTCATATGATTGCATTCTGCATC-ATGTAATTTAGTGCTTTGTT-AGCTAGAGCGGTCACAATGACATGGACCATATTAATTTTA-----TAATTTATGCTTATGATATAT--TGATTAATAATCATATTTTACAATCTCAAAA------CAAA---AATCAGACTCAATGTTAAATAT-------GAGAGTTCTCATTAGATTTGCCAAACATCAGGTAG--T--TTTATACCACANATCGTATTGCTACCAACCTGATTATACA---AATATTTCGAGGACCA---GGACATTCAATGTGCTAGGCATTTAGTGGTGAAGCTTAACTGTTATTGTGATACACTGCTGTAATGCCATTGGACAAACCTTATGTCATATTTATTGTCTTAATATCCCCTACATGTGTAGAAGCATTACCTCTA--A-AAT-TTTGCTACATACAGCACATCTATTAAATTACATGCAGCTGCATTTTGTACAAAATACGGAAGAAA-GGCATGTAAGGCCAAGTTCATTC-CAA-TA---TGTATATATTA--ATATACCC---ATNAATAACAAAATATACAGNAAATCTTTGTG--------TGTATGATGACATTGAACAAACGTTTCA-----CATTATTTTGATTAATATCCTATAATAAAGCTAAAA--CTAATAAAATAATACGACATATTTTGAACAA-TCACTCTTCAATATTTCACTCGT--TGACCTT------TGAC-CNNATGACCTCGATACACATCG-TTTAAG-C-ATATTTAA---------------------AAATATAT---AAC--AAACA--TCT-T-----AAATA-------------TGAA---T-A---T------TG---TTAT-TTCATATATACGTATATACATATATATCAGTTCC
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12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-155 ) : TACCAGAT-TTT-AGANCGGAGCAAGAAGAACAGAAAACAGTTCATG---------TTGTAAGAACTGTGGTAAATCAATATTTCTTCGAAA-TTCACTATGCTTTGCTTTAATACATGTACATGATGTTTTTGACCAACTAC-ACACG-CA-TTATACGC--TGCTTGTTTGACGGAGTTTTATTTCGATTGA-----TATAAANTTACCTTTCAAACTCTACGTAAACATAAAGTTGTGTTTCCTACGACATTCTCATATTTGCTAAATACAATGATCTC--TCGGAACGTAT--CA-CGTACATGTA-TTGA-CACCAG-ACA-AT---AAA---TGA----GGGCATTCGATTTATTCTTTTTT-AAAACGATAA-------CAGCCGATNTTCTT--AAACATGCACTAGTAGTTGCTATAATAATTCCAACAATTCCTATTGACATTTGNATAGGACTTCAATAGTAAGTTTAGCTATCCTTATA-------NT---ACATTTAATATGATTTCGGTA------TCAGATCATATCAGCTGCATTTCTGTTCAAACTGAACTTTGGCTCAGACT-----TAAAA-C-G-TCAGATTCGGC-----AAACTA---A--------T--------TTT-CAAGAGTTAT-T-TTTC-ACATACATAGGAATTNTA-C-CATTG----TATTTCCTTAGT---CTTGCAGTACAACTGTTACAGTTTTC-AACTT-AAA---T--ATAT-AT--TTAAA--------CATTTATAGATTACCGTCCATAGAGTGTCATTTATATGTACTGCTGCGCTGAGAAAGGACAGGAAGCCTAATATACATTTGTCTGGAAATGCTCTAGATA--TAATAATAATA--AACAATATAACTGCCTNATGATGGAATNGC-TTTTCAAATGT--AGGTTTTGGTCTAGATNATGAAATACCTATATATCTAAAGTTGCTGAAGATTTCGTGATTTTAA-TGTTTACTGGTGCAGTAGATGTTCAGTGCTGAA-AGTTTA-TTTT--C-AATCTAATTATTCTATA-CTAA-----------AA--A--GTGGCCCAGCTCTATATTTCATATGATTGCATTCTGCATC-ATGTAATTTAGTGCTTTGTT-AGCTAGAGCGGTCACAATGACATGGACCAT-ATTATTTNAT--AATTTATGCTTATGATATAT--TGATTAATAATCATATTTTACAATCTCAA------AACAAA---AATCAGACTCAATGTTAAAT-------ATGAGAGTTCTCATTAGATTTGCCAAACATCAGGTAG--T--TTTATACCACANATCGTATTGCTACCAACCTGATTATACA---AATATTTCGAGGACCA---GGACATTCAATGTGCTAGGCATTTAGTGGTGAAGCTTAACTGTTATTGTGATACACTGCTGTAATGCCATTGGACAAACCTTATGTCATATTTATTGTCTTAATATCCCCTACATGTGTAGAAGCATTACCTCTAA--AAT-TTTGCTACATACAGCACATCTATTAAATTACATGCAGCTGCATTTTGTACAAAATACGGAAGAAA-GGCATGTAAGGCCAAGTTCATTCCAA-CTA--TGTATATAT-TA--ATATACCCATNAATAACAAAATATACAGNAAATCTTTGTG--------TGTATGATGACATTAAACAAACGTTTCA-----CATTATTTTGATTAATATCCTATAATAAAGCT-AAAA---CAATAAAATAATACGACATATTTTGAACAA-TCACTCTTCAATATTTCACTCGT--TGACCTT------TGAC-CNNATGACCTCGATACACATCG-TTTAAG-C-ATATTTAA---------------------AAATATAT---AAC--AAACA--TCT-T-----AAAT---A-------------TGAA---TA---T------TG---TTATTTCATA-A-A----CGT-AAGCATATATATCAGTTCC
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Unaligned ( gi|10 ): ATATAATAATGGTCTATCTGTGTTTTGATTGGTAAAATATTAAAGAAGTTATTTCAGTAAAACAAAACTTTATATAGAGAAGAATAGTTAACCTTCGTTAAAATAACCAAATCTTTTCTATACACAACACTCATTATAATGCTGATAAATCTGATGAACATGTACCCTGGTGATGATGATGTGTCCATAAACAAATCAAATACTTGTGTATTTCAACCAAACTTCATGCCTGGAAGTATGTTTTGGTATATCTTAACAATGCGCAGGTATATGTTATTTTGACAGCTATCATCAAGATCACAACAACATAACATGTTATAAGTTAAGTTATTGGCTTTGAACTTAGTACATCACATTACATTAACATGGCATTGTAAGAATATTAAGACACACCTTTTGAATAGTCTCCTTTTCATAAATTAGATCATGTACACTTGATCTGTATCACAATATACTAACTTTGCATATGTTATCCACTGCCAGAAAATACATTTGACCTATGGGTCTTTCTAAATAATTTGAACTTAGTGAACAGCATGATTCTTATGTATTGCTATGTTGATTTTTTAAAATAACTGAATCACTGTCGCAACACATGTTCACACTAATGTATCTGTTTCTCCGTGGTTAATGCTGTAAGAAAAATCACAGAGAACTTTCCAGTTATGAAATTTCTGCATTCATGTTCCAATTTAGTCATCAAGATATTAGACAAAATGTGTTTTACATATTTTAGTAAGATCAATGGACTGTTTCCAATTTGAAGGCAAAAGAACCATATTTTCTTGAAAAGCTGGCTATACTTTTTCGATTTTTGGTGCCGTGTTATTTATACAGTAAACATATCCTCAAAATTTCAACAGTTTTGTATTCCTTTTGGTTAACTTTTGCCTTGGATAAGTTCTTGGCTATCACTTGACTGTTAGT
Unaligned ( gi|15 ): AGCTTAACATTTTGCGCACGATACTATTTGGTGACTTTTGGTCTTTAATTCCGTCAAACTACATGCATACCTGGTATTTGCATCATAACAGCAGAAAATGTTGCGCTTAAGTTTGCATAATGCCATAAGACACGTGTTACACAAAACCTTATAAGTTGCCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTAATAGATATCTTCAATGTGAATATATTTGGTATTATCTCGTCCAGCTAAAATTTTGCTTGTTGTGACATTTGGCCTTATAACTCAGTCAAAAGGTCAAATATTTTTGGCAACTATCCATGAAAACACTGTACCTAATGCATCGACTTCTAGCCACATATATGAGATATTTCACCAGTCTA
Unaligned ( gi|17 ): TTATAAGATAGGTTTGGGGCTTTGCACATCACATTACAGTAAAATTGTATTGTAAGAAAGTTAAGACATGCCTTTATGGATAGTCTCCTTTTCATAAATTAGATCATGTTCACTTTATTTGTATTACCATTTACTTACTTTGTATTGTTATGTGACCCAAGTGATCAGCATGATTGTTATGTAATTGTTATGTTGATTTCTTTAAATAACTGTTTCTCCGTGGTTTGCTTTAAGAAAGATCACATCCCCTCCATCAAGATATTAGACAAAACGTGTTTTACATATTTTAGTAAGATCAATGATTTGTTTTCAGTTTGAGGGCAAAATAACCATATAGATGGAAAAAGCTATATTTAAATTTATGGTACCGTGTCATAATGACAGTAAGCATATTAGCAAACTTTCTATAGTTTTGGATCCATTTTGGTTTTCTTTTGTCAAGATTTTTTTACAAGTTCCTTGCCATCACTTGACTCTTAATTACTTC
Unaligned ( gi|18 ): AGAAGTTACTGCAGTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAAAATAGTTACCCTTAATTGTAATAAACGATTTTATTCTATACATAATAATCATTGTAACGTTGATAAACCTGATTAACATGTACCCATATGTCAATAAACAAACAGTATAATTTTGTATTTTAACCCAACTCCATGACTGGAAGTATGTTATGATCTTAACAATGAAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCATCAAGACCGCAACAACATAATATATGATAAGTTGTTAAGGCCTTTGCAAGTACATCACATTATATCAACATGGCATTGTAAGAATATTAATACATGCCTTTTGGATATTTTCCTTTTCATAAATGAGATCATGTACATTTGATTTGTATTAAATTTACTAGCTTTGCCTTGTATTTGTTATCAACTGCCAGGAAATACACTTGACCAATCACGGAATTACGAAAATAAGATATTAATGTATCTGTTTCT
Unaligned ( gi|20 ): AACAGAGTTATTTTAACAAATATAGACTTTCTAGTACTAGTGTAGATGCATTTTAATACCAATAATTTTATAGCTACCAAGTCCGTGTGTGACTTTAATATAATTTTCTTTTCTTCAGTGCTGTATAATCTGTTGCTAGTAGCATATTGTGTTTGTCATCATTTCTCAGAGACAGTTTTTTCAATGATTTATTTGACACACTTATCTTCAATTTGATTTGATATTTTATTTTATTAGGTATGTAGAAATGAAACGTTGTGTAATGGTGAGGGTTGGGTTAAAGTCTAATTTGGGAACTTTATTTCGCCATTTAATATATGCTTATGATATTTTGATTAAT
Unaligned ( gi|21 ): ATATTAGTCTATATATGTTTTGATTGGCAAAATATTAAAGAAGTTATAGAAGTAAAACAAAGCTTTATATAGCAAAGAAGAGCTAACATTGATTAAAATTACCAAATAGTTTATACATAATAGTCATTATAACGCTAATAATATAATTAACATATACCTATGTGTCCATAAACAAACCGTATAATTTTATATTTCAACCAAAAATTCGTGACTGGAAATCATTAAAATACGCATTTATATGTTGTTTTGATAGCTATCAACAATACTGCAACAACATAATATATAATAGTAAAGTTATGGACTTGGCAAGTACATCTCATTTCATTAA
Unaligned ( gi|25 ): ACAAATGTCTTAAATATGAATGCTTTTGGTATTATCTTGTCAAGTTAAAATTTTTGCTTGTGGTGACCTTTGACCTCATAACTCAGTCAAAAGGTCAAATATTTTTTGGCAATCTATTGTTTCTAATGTAGGATATAGTCATTTGGCCCGGTTGCCGTCCATGAACACGCAGTACCTCTAGCCACATATATGAGAAATTTCATCAGACT
Unaligned ( gi|26 ): ATTAACATATATCTTTGTTTTTGGTATTATTTCGTCCAGTTAAAACTTTTGCTTGTGGTGACCTTTGACCTTGACCTCAGTCAAAAGGTCAAATATTTTTTGGCAACCTATTGTTTCTAATGTAGGTCATAATGGTAAACTTATTTAGCCATGTTGCCGTCCATGAACACGCCGTTCCTCATGCAACGATTTCTAGCCACATA
Unaligned ( gi|28 ): TTATATTGGTATATCGTTGTTTTGATTGGCAAAATATTGAATATTAAATTATAGCAGTAAAGGAAAGCTTTATATAGCGAAGAAGAGTTAACCTGATATTTCGTATACAGTATACTCATTGTA
Unaligned ( gi|29 ): TGACTTTTGCCGTTTAGCCAATTGGATATATATGCATTGTTTAATATATTTTGGTATCATTTTTCTGACCTTTAATAAGGAAAATCCAACGTCTCCC
Unaligned ( gi|30 ): ACCTATGAATATGCCTACCTCAGGTATCGATTATTAGCCGCACATATGAGAAATTTCACCAGACTA