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9 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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blockSeqs : . . . ACT . . . AC . . . CTTAA . . . . . . . . . TTAC . . . . . . . GAATAAT . . . A
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finalCons : CGTCTTT-------CG--ATA-------TTCAACN--TGAAA------C-T------A------A-----C------CCTAA-C------CT--TNTCAG-----------------C--CTCCAATATTG----AA--------G-A-----------GT-----T----A-C-----ACAC------------------T-T-GAATAT-------C-------GA------AAG----------A-----CGAATAT--------------------------CA---A--AC--TA---AACTTAA
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11 : aaagacgttaaaacagtatcagacacagaagttagtttgatattatctttttGTCTTTCG--ATA-------TTCAACT-CGAAA------C-T------A------C-----T------CC------TAA-A------C------T-T----------A-ACTA-----CCTCCAATATCG----AA--------G-A-----------GT-----T--A-CAT-T-A---C--------T-------T-G--AATAC-------CTA------A-------AG----------C-----C-------G-------TA----A-A-T---CA---A--ATAACA---AACT
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gi|14 : aaactacgtaattgttaaaggcagattaaagcaggtttgttattcgcgtttTTCG--ATA-------TTCATTC-AGAAA------C-T------ATCATTAA-----C------CG------TAA-C------A------T-T----------T-CCAG-----CCTCCAATATTG----AA--------G-A-----------GT-----T--A-CG--C-A---C--------T-------T-A--AGTAT-------GGA------A-------AG----------A-----CAACGATTG-------AA----T-A-C---GG---A--AC--T----AACTTctgc
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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