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Reference ( gi|18 )           :                                                                  ATTTCATTCCAAC-TAT--TTCA-TCAC---TTT--GA---A-ACACA---AA-T--TTAGCA-A---A---------T-TCAT--T----G---T-CG---T--------C---G----ACA-----T----A------TATGA---ACCGA-T-A-AAA---A-TAA-A------AGCATG--TCTGGG--AT-A--AA--G-A--------T-A-T-ATTCAAT--TGATATT----AAA--------A-A----C-----TTGTGT----TTTCAAAGGAGTT---AAGT
gi|6                          :                                                                  ATTTTATTCCAAA-TATATTCCA-TAAC---TTT--AA---A-ACACA---AA-T--TTAAAA-C---G---------T-TCAT--T----G---T-GG---T--------C---G----ACA-----T----A------TATGA---ACTGA-T-A-AAA---A-TGA-T------AGCAGA--TCTTGG--AT-AG-AA--A-A--------A-A-C-AT---------ATATTC---CAA--------A-A----C-----TTGCGA----TTTTAAAGGCACT---AAG
gi|3                          :                                                                  ATTTTATTCCACT-TAT--T-CA-TCAC---TTT--AA---A-ACACA---AA-T--TTAACA-A---A---------T-TTAT--T----GATTT-TG---T------------A----ACA-----T----C------TATGA---ACTGA-T-A-AAA---A-TGA-T------AGCAGA--TATGGG--AT-G--AA--A-T--------T-A-T-TTTCA------ATATTCA--AAA--------A-A----C-----CTGcattgacatttgacgtaaatgtaattgaattaaataacgttgtgactatgtgt
gi|15                         :                                                                  ATTATATTCTAGC-CAT--TTCA-TCAC---TA---AA---A-ACATA---AA-C--AGAACA-A---A---------T-TATT--T----A---T-GG---T--------C---G----ACA-----T----A------TATGA---ACCAA-C---AAA---T-TTA-T------AGCAGA--CTTGAA--AA-A--AA--A-ACTAGAATGT-A-T-ATTCA------ATATT----AAA--------A-A----CT----TTGCGT----TTTCAAAGGCGTT---cagcgctttatatagcatagttgacataagacaattttgaatatagaatgttgagataaaatgctgctgagataataaagaacatgt
gi|16                         :                                                                  ATTTTATTCCAAC-TAT--TTCA-TCAT---ATC--AA---A-ACACA---AT-T--TCGACA-C---A-----------TCAT--TTGCGA---T-CG---A--------C---A----ACA-----T----A------AATGA---A-CAA-T-G-TAA---A-TGA-T------AGCAGA--TCTGAC--A--A--AA--A-A--------C-A-T-ATTCA------ATAAT----AAA--------A-AGTGTT-----TTTCGT----TTTTAAAGGCGTT---cata
gi|29                         :                                                                 tATTTTATTCCACG-GAT--ATCA-TCAC---TTT--AA---A-ACATA---AAAT--TTAAC----------------T-TAAT--TAAAAG---C-AG---T--------C---A----ACA-----T----G------TATGA---ACCGA-T-A-AAA---A-TGA-T------AGCCTA--TCTGG------------------------------CTTTAA--------------AAA--------ATA----C-----CTGTGT----TTTTAAAGGCATT---AGGTgata
gi|13                         :                                                                  ATTTTATTGCAAC-AAT--ATCA-TCAC---TTT--CA---A-ACACA---TA-T--TTTACA-A---A---------T-TAAT--T----GATTT-TG---T------------A----ACA-----T----A------TATAA---AGCGA-T-A-TAT---A-TAA-T------AGCAGA--TATGGG--TT-AACAA--T-A--------T-A-C-ATTCTAT--Tata
gi|9                          :                                                                  ATTTTATTCCAAC-AAT--TTCA-TCAC---TTT--AA---A-GCACA---AT-T--CTAACA-A---T---------T-TAAT--T----G---T-GG---T--------C---A----ACA-----T----AAT----TATAATTGACCAA-G-A-AAT---A-TAttgagacgaaacttctcctattgatacaaatattatc
gi|2                          :                                                                caATTTTATTCCAAC-AGT--TTTA-TCACAGTTCT-------A-TCACATTGAC-T--TT--CA-A---A---------TGTAAC--T----G---C-GG---TAACAATTGC---GGATAATA-----T----G------TATGA---ACCGA-T-A-AAA---A-TGA-A------AGTAAA--TCTTGG--TT-A--AA--A-C--------T---T-ATTCAAT----ATTTA----AAA--------A-A----C-----T--TGT----TTTTAATGGCGTT---AAGTttcaatattcaaatactttcactttaatagcgttatgtacataatataaatatatatttgtgtttatatactgtgtgacatgtatgctgaataaaactgc
gi|43                         :                                                                  ATTGTATTCCAAC-AAT--TTCA-TCAC---TTT--AA---A-ACACA---AA-T--TTA--------------------T--T--T----G---G-GG---G--------A---G----ACA-----T----A------TGTGA---ACTGATT-A-GGATG-A-TGA-T------AGCAGA--TCTGGatagatagttaaagattcacaaatacattggatatttaatatttaattatttttttaactgga
gi|14                         :                                                                  ATTGTATTCCAAC-AAT--TCTA-TCAC---TTT--AATTTA-AAACA---AA-ACATTAACA-C---A---------T-TAAT--T----G---C-GG---T--------C---G----ATA-----T----ACAAGTATATGA---ACCGA-T-A-AAA---A-CA-------------------------AT-A--AA--A-A--------T-ACT-ATTCGTA--TGAAA------AAAACAAAAACA-A----C-----ATGCGT----TTT-ATAGGCGTT---AAGT
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gi|26                         : cattgtatacaatctagaaatgacattaatgataactcagaatcaatcattctaccatgtttttcaTTTTATTCAAAC-AAT--TTCA-TCAT---TTT--AA---A-ACACA---TA-T--TTAAAA-C---A---------T-TGAT--T----G---A-GG---T--------C---T----GCA-----T----A------TATGA---ACCGA-T-A-ACA---A-TAT-A------AGCGTA--TCTGGA--ATGA--AA--A-A--------T-A-T-ATTCCAT----ATTTT----AAA--------A-------------TGTGTTCAGTTTTAAAGGtaatactggtattttaataaaatacaaaattagagatcccacttgaatccagatcttcaagtgaccacagcatgcatatattgagtagatata
gi|5                          :                                                                   TTTC-TTTTAAC-AAT--TTCA-TCAC---TTT--AC---A-AGACA---AA-T--TTAACA-A---A---------T-TAAT--T----GCGAT-CGACAT--------A---G----ACA-----T----A------TATGA---ACTAA-T---AGA---A-TGA-T------AGCAGA--TCTGGG--TT-A--AA----A--------T-A-T-ATTCAATACTAATAAA----ACA--------A-A----C-----TTGTAT----TTTTAATGTCGTA---AAGT
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gi|23                         :                                                                   TTTTATTCAAAT-AAT--TTCA-TCAC---TTA--AA---A-ACACA---AA-T--TTAACA-A---A---------T-TGAT--T----GATTT-TG---T--------A---A----AAA----------A------TATTA---ACTGA-T-A-AAA---A-TGA-T------AGCA-GATTTTTGG--AT-A--AA--A-A--------A-A-T-AT---AT-------TT----AAA--------A-A----C---------GT----TTTTAAAGGTGTT---GAGTtcagtttataaaaa
gi|10                         :                                                                   TTCTATTCCTAC-AAT--TTCA-TCTC---TTA--AA---A-ATGCA---CT-T--TTAACA-A---A---------T-TAATAAT--------T-TG---T------------A----ACA-----T----A------CATGA---AAAGA-T-G-AAA---A-TGA-A------AGCAGA--TCTGAA--AC-A--AA--A-AC-------T-A-T-ATTCACT----AT-TC----AAA--------A-G----C-----TTGCGT----TTTTAAAGGCATT---AAATat
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gi|4                          :                                                                   TTTCAATGCAAC-CAT--TTCA-TCAG---TTT--TC---A-ACACT---AA-T--TTAACA-A---A---------T-TAAT--T----G---C-GA---T--------T---G----ACA-----T----A------CATGA---ATCGA-TGA-AAA---A-TAT-A------A-CAGA--TCAAGG--CT-A--AAC-A-A--------T-A-T-ATT---T--T--TTTC----AAA--------A-A----C---------GT----TTTTAAA-GCGTT---AAaatccagtttgtaattgttaagaatttt
gi|44                         :                                                                   TTTTATTCCAAC-AAT--TCCA-TCAC---TTT--AA---A-ACACA---AA-T--TAAACA-A---A---------T-T--G--T----G---T-CA---T--------C--------ATA----------A------TATGA---GCTGA-T-A-AAAC--A-TGA-T------AGCAGA--TCTGacataaagtatcaatactttataggacacttaaacaaaatgctgcaatcaataccaaacacacatgcc
gi|36                         :                                                                   TTTCAT-CCAAC-AAT-----A-TCAC---TTT---A---A-ACACA---AA-T--ATAACA-A---A---------T-TAAT--T----G---A-CT---T--------T---GTT--ACA-----T----A------TATGA---ACCGA-T-A-AA-------------------CA----TCT-GG--AT-A--CA----A--------T-A-T-----AAT--CTATAT-----------------------------TTGCGT----TTTTAAAGGCGTT---TAG
gi|38                         :                                                                   TTTCTTACCAAC-AAT--TTCA-TCAA---TTT--AA---A-ATGCAC--AG-T--TTAACA-A---A---------T-TAAT--T----GATTT-TG---TA-------T---A----ATAAAGTGT----A------TACAT---ACTGA-A-A-AAA---G-TGA-T------AGCAGA--TCTGGG--AT-A--A
gi|12                         :                                                                    TTTATTCAAACATA-----AA-TCAT---TTC--AA---A-ACAAA---AA-A--TTAACG-A---A---------T-TAAT--T----G---C-GA---T--------C---G----ACA-----T----A------TATAA---ACCGA-T-ACAAATG-A-TAA-A------AG---A--TCTGGG--AT-A--AA----A--------TAA-T-ATTAAATACTAACATT----CAA--------A-A----C-----ATACGT----TTTTAAAAGCGTT---ACGT
gi|34                         :                                                                    TTTATTCCAAC-AAT--TGCA-TTAC---TTT--AT---A-ACACA---CA-T--TTAGCA-A---A-------------GT--A----G---T-AG---T--------T---G----ATA-----T----A------TGTGT---ACCGA-T-A-AGA---A-TTA-T------AGCAGG--TATGGG--TT-G--AA--A-A--------T-A-T-ATTCACT----AT-TC----AAA--------A-A----C-----GTACAT----TTTTAAatattttataat
gi|11                         :                                                                     TTATTTCAAC-AAT--TACA-TTAC---TTT--AA---A-ACACT---AA-T--TTAATA-ATTAA---------T-TAAT--T----A---TTCA---T--------TTTTA----ACA-----G----A------TATGA---ACCGA-T-A-ATA---A-TGA-T------AGCAGA--TCTTGG--AT-A--AA--C-AC-------T-A-T-TTTCAA-----A-ATT----AAA--------A-A----A-----ATCCGT----TTTTAAAGGTGTT---ATGTt
gi|25                         :                                                                     TTATTCCAAC-AAT--TTCA-TCAC---TTT--AA---A-ACACA---AA-T--TTAACA-A---AATAACGGATT-TTAT--T---------------------------------ACA-----T----A------CATGA---AC--A-T-ATAAA---A-GAA-A------GAAATA--TCTGGG--AT-A--AA----A--------T-A-T-ATACAAT----ATTCT----AAA-------------------------GT----TTTTGAAGGatatattgag
gi|22                         :                                                                     TTATTCCAAC-AAT--TTCA-TAAT---TTT--AA---A-ACACAT--AG-T--TAAACA-A---A---------T-AAAT--T----G---C-GG---T--------C---G----ATA-----T----C------TCTGA---ACCGA-T-A-AAA---A-TGG-T------AGTA---------A--AT-A--TG--G-T--------T-T-T-ATCAAAT--T-ATTTTTA--AAA--------A-A----CCA---TTGCGT----TTTTACTGCCGTT---AAGcttgaaatata
gi|19                         :                                                                       ATTTCAAC-AAA--TCCA-TCAC---TTT--GA---A-GCACA---CA-T--TTAACA-A---A---------C-ATAT--T----G---T-GG---T--------C---G----CCA-----T----A------TATGA---ACTGA-T-A-TAA---A-TGA-A------TGCAGA--TGTGGG--AT-A--AA--ATA--------T-A-T-ATCCAAT----AT-TC----AAA--------A-A----C-----ATGCGT----TTTTAACGTCATT---AAG
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-148 )      :                                                                  ATTTTATT-CC-AA-CA-ATTTCATCAC---TTT--AA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAAC------A-A---AT-TAA----TT----GCGG---TC------G------ACA--------T----ATATGAACCGA-T-AAAA--A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTGG---GAT-A-AA--A-A--------TA-T--ATTC-----AAT----A-TA-T-T---AA----A---AA----C-----TT-----GC-GT----TTTTAAAGGCGTT---AAGT
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gi|14                         :                                                                  ATTGTATT-CC-AA-CA-ATTCTATCAC---TTT--AATTTA-AAA--------CA-AA-ACATTAAC------A-C---AT-TAA----TT----GCGG---TC------G------ATATACAAG--T----ATATGAACCGA-T-AAAA--A---------------CA-------------AT-A-AA--A-A--------TACT--ATTCGTATGAAA----A-AA-A-C---AA----AAACAA----C-----AT-----GC-G-----TTTTATAGGCGTT---AAGTctcctattgatacaaatattatc
gi|15                         :                                                                  ATTATATT-CT-AG-CC-ATTTCATCAC---TA---AA---A-ACA--------TA-AA-C--AGAAC------A-A---AT-TAT----TT----ATGG---TC------G------ACA--------T----ATATGAACCAA-C--AAA--T-TT-------AT-AGCAG-A-CTTGA---AAA-A-AA--A-ACTAGAATGTA-T--ATTC-----A------A-TA-T-T---AA----A---AA----CT----TT-----GC-GT----TTTCAAAGGCGTT---tt
gi|16                         :                                                                  ATTTTATT-CC-AA-CT-ATTTCATCAT---ATC--AA---A-ACA--------CA-AT-T--TCGAC------A-C---AT-CAT----TT----GCGA---TC------GACA---ACA--------T----AAATGAA-CAA-T-GTAA--A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTGA---CA--A-AA--A-A--------CA-T--ATTC-----AAT----A--A---T---AA----A---AAGTGTT-----TT-----TC-GT----TTTTAAAGGCGTT---cata
gi|17                         :                                                                                       tCATCG-----TT--AA---ACACA--------TA-AA-T--AGAAC------A-A---AT-TAA----TT----GATT---TT------GTA----ACA--------T----ATATGAATC--------------G-------GT-AGCAG-A-TTTAG---ATT----A--T-A--------TA-T--ATTC-----AAG----A-T--T-C---AG----A---AA----C-----TT-----GC-GT----TGT--AAGACGGT---AAGTgata
gi|18                         :                                                               caaATTTCATT-CC-AA-CT-ATTTCATCAC---TTT--GA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAGC------A-A---AT-TCA----TT----GTCG---TC------G------ACA--------T----ATATGAACCGA-T-AAAA--A-TA-------AA-AGCAT-G-TCTGG---GAT-A-AA--G-A--------TA-T--ATTC-----AATTG--A-TA-T-T---AA----A---AA----C-----TT-----GT-GT----TTTCAAAGGAGTT---AAGTatatattatataacatagtactgagcaaagaaa
gi|19                         :                                                                    TCTATT-TC-AA-CA-AATCCATCAC---TTT--GA---A-GCA--------CA-CA-T--TTAAC------A-A---AC-ATA----TT----GTGG---TC------G------CCA--------T----ATATGAACTGA-T-ATAA--A-TG-------AA-TGCAG-A-TGTGG---GAT-A-AA--ATA--------TA-T--ATCC-----AAT----A-T--T-C---AA----A---AA----C-----AT-----GC-GT----TTTTAACGTCATT---AAG
gi|2                          :                                                                  ATTTTATT-CC-AA-CA-GTTTTATCACAGTTCT--AT---C-ACATTGACTTTCA-AA-T--GTAACTGCGGTA-A------CAA----TT----GCGG---AT------A------ATA--------T----GTATGAACCGA-T-AAAA--A-TG-------AA-AGTAA-A-TCTTG---GTT-A-AA--A-C--------T--T--ATTC-----AAT----A-TT-T-A---AA----A---AA----C-----TT--------GT----TTTTAATGGCGTT---AAGTaatg
gi|20                         :                                                                    TTTACT-CCCAA-CA-TTTTAATCAC---TAT--AA---A-ACA--------CT-GA-T--TTAAC------A-A---AT-TAA----TT----GTGG---TC------A------ACA--------C----ATATGAACCAA-T-CAAA--A-TG-------AT-AGCAA-A-TCTGG---GTT-A-AA--A-----------A-T--ATTA-----AAA----A-TA-T-TC--AA----G---AA----C-----TT-----GT-GT----TTTTAATTGAGTT---AAGatagatagttaaagattcacaaatacattggatatttaatatttaattatttttttaactgga
gi|21                         :                                                                      TGTT-CA-AT-CA-ATTGCATCAC---TTT--TA---A-AC---------CA-AACT--TTAAC------G-A---AT-TAA----TT----GCGG---TC------G------ACA--------TATTAATATGAAACGA-T-AAAA--A-TT-------AT-AGTAG-A-T-------------AA--A-ACC------TA-T--ATAC-----AAT----A--A-T-A---AAAC--A---AA----C-----TT-----GC-G-----TTTTAAAGGTGTT---AAGTaat
gi|22                         :                                                                     TTATT-CC-AA-CA-ATTTCATAAT---TTT--AA---A-ACA--------CATAG-T--TAAAC------A-A---AT-AAA----TT----GCGG---TC------G------ATA--------T----CTCTGAACCGA-T-AAAA--A-TG-------GT-AGTAA-A-TATGGTTTTAT-C-AA--A-T--------TA-T--TTTT-----A-----------------AA----A---AA----CCA---TT-----GC-GT----TTTTACTGCCGTT---AAGat
gi|23                         :                                                                   TTTTATT-CA-AA-TA-ATTTCATCAC---TTA--AA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAAC------A-A---AT-TGA----TT----GATT---TT------GTA----AAA--------A----ATATTAACTGA-T-AAAA--A-TG-------AT-AGCAG-ATTTTTG---GAT-A-AA--A-A-----------------------AAT----A-TATT-T---AA----A---AA------------------C-GT----TTTTAAAGGTGTT---GAGT
gi|24                         :                                                                   TTTTATT-TC-AA-CA-ATTTTATCAC---TTT--AA---A--CA--------CA-AAAT--TTAAC------A-A---GT-TAG----TT----TATG---TC------A------ACT--------T----ATATGAACCCA-G-ATAA--T-TG-------AT-AGCAG-A-TCTGG---GTT-A-AC--A-A--------TA-T--ATTC-----AAT----A-at
gi|25                         :                                                                     TTATT-CC-AA-CA-ATTTCATCAC---TTT--AA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAAC------A-A---AA-TAA-----------CGGATTTT------ATT----ACA--------T----ACATGAACATA-T-AAAA-----G-------AA-AGAAATA-TCTGG---GAT---AA--A-A--------TA-T--ATAC-----AAT----A-TT-C-T---AA----A-------------------------GT----TTTTGAAGGCatccagtttgtaattgttaagaatttt
gi|26                         :                                                                   TTTTATT-CA-AA-CA-ATTTCATCAT---TTT--AA---A-ACA--------CA-TA-T--TTAAA------A-C---AT-TGA----TT----GAGG---TC------T------GCA--------T----ATATGAACCGA-T-AACA--A-T--------ATAAGCGT-A-TCTGG---AATGA-AA--A-A--------TA-T--ATTC-----CAT----A-TT-T-T---AA----A---A------------T-----GT-GTTCAGTTTTAAAGGttgaaatata
gi|27                         :                                                                       ATT-TA-AA-CA-ATAGCATCTC---TTT--AA---A-ACA--------CA-CA-T--TTAAC------A-C---AT-TAA----TT----GCAG---TA------G------ATT--------T----ATATGAATCGA-T-AAAA--A-TG-------AT-AACAG-A-TCTGG---ATT-G-AA--A-A--------TG-T--ATC-------AT----A-TA-T-T---CA----A---AA----CACA--TTTTAAAAC-GT----TTTTAAA
gi|28                         :                                                                   TTTTATT-CC-AA-CA-ATTAATTCAC---TTT--AA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAAC------A-A---AC-TAA----TT----GTTG---TA------C------ATA--------T----ATATCAACTGA-T-AAAA--A-TG-------AC-AGCAG-A-TCTTG---GAT-C-AA--ATA--------TA-T--ATTC-----AGT------T--T-T---AA----A---AA----A-----TT-----TCAGT----TTATAAA
gi|29                         :                                                                  ATTTTATT-CC-AC-GG-ATATCATCAC---TTT--AA---A-ACA--------TA-AAAT--TTAAC-------------T-TAA----TTAAAAGCAG---TC------A------ACA--------T----GTATGAACCGA-T-AAAA--A-TG-------AT-AGCCT-A-TCTGG---CTT-T-AA--A-A-----------------------AAT--------------------------A----C-----CT-----GT-GT----TTTTAAAGGCATT---AGGTaa
gi|3                          :                                                                  ATTTTATT-CC-AC-TT-ATT-CATCAC---TTT--AA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAAC------A-A---AT-TTA----TT----GATT---TT------GTA----ACA--------T----CTATGAACTGA-T-AAAA--A-TG-------AT-AGCAG-A-TATGG---GAT-G-AA--A-T--------TA-T--TTTC-----AAT----A-TT-C-A---AA----A---AA----C-----CT-----GC-ata
gi|30                         :                                                                               A-CC-ATTCCATCAC---TTT--AA---A-ACA-----------AA-T--TTAAT------A-A---AG-TAG----TT----TAGA---TC------G------ACA--------T----ATATTATCCTA-T-AAAA--C-TC-------AT-AGAAG-A-TATGG---G-T-T-AA--A-A--------TA-T--ATTC-----AAT----A-TA-C------A----A---AA----C-----TT-----GC-GC----TTTAAATGAGGTT---AAGagcgctttatatagcatagttgacataagacaattttgaatatagaatgttgagataaaatgctgctgagataataaagaacatgt
gi|31                         :                                                                             tatttt-ATTTCATCAC---TTT--AC---A-ACA--------TA-AA-T--TTAAG------A-A---TT-TAA----TT----GCGG---TT------G------ACG--------T----ATATGAACCG--T-TAAA--A-T--------AT-AAAAG-A-TCCAG---GAT-A-CA--A-A--------TA-T--ATGC-----AAT----A-T--T-TAAAAA----A---AA----C-----TT-----GC-GT----TTTTAAAGGC-TT---AA
gi|32                         :                                                                                atttgtTTCATCTC---TTT--AA---A-ACA--------CA-GA-T--TTAGC------A-A---AT-TAA----TT----TTGA---TC------A------ACA--------T----ATATGAACTTA-T-AAAA--A-TG-------CT-AACAG-A-TCTGG---ATT-ATAA--A-A--------C--T--ATTC-----AAT----A-T--T-C---AA----C---AA----C-----TT-----GC-AT----TTTTAAAGGTGT
gi|33                         :                                                                     agcag-CC-AA-CT-ATAATATCAT---TTT--AA---A-ACA--------CA-AA-T--GTAA-------A-A---ATATAA----TT----GCGC---TC------G------ACA--------T----ATATGGACCGA---AAAT--A-TG-------AT-AGCGG-A-TCTGG---TAT-ACAA--A-A--------CA-T--CTTC-----AAT----A-TA---C---AA----A---CA----C-----TT-----GC-GG----TTTTAAAGcga
gi|34                         :                                                                    TTTATT-CC-AA-CA-ATTGCATTAC---TTT--AT---A-ACA--------CA-CA-T--TTAGC------A-A---AG-TA-----------GTAG---TT------G------ATA--------T----ATGTGTACCGA-T-AAGA--A-TT-------AT-AGCAG-G-TATGG---GTT-G-AA--A-A--------TA-T--ATTC-----ACT----A-T--T-C---AA----A---AA----C-----GT-----AC-AT----TTTTAAtca
gi|35                         :                                                                                -CA-ATACCATCAC---TAT--AA---A-ACA--------CA-CA-T--TCAAC------A-A---AT-TAA----TT----GATT---TT------GTA----ACC--------T----ATATGAAGTGA-T-GTGA--A-TG-------AT-AGCAG-A-CCTCG---GAT---AA--A-A--------TA-T--ATTT-----AAT----A-Tt
gi|36                         :                                                                   TTTCAT--CC-AA-CA-AT---ATCAC---TTT--AA---A--CA--------CA-AA-T--ATAAC------A-A---AT-TAA----TT----GACT---TT------GTT----ACA--------T----ATATGAACCGA-T-AAA-------------------C---A-TCT-G---GAT---AC--A-A--------TA-T--AATC-------T----A-TA-T---------------------------TT-----GC-GT----TTTTAAAGGCGTT---TAGttctttaaatgctaaaatgcttaa
gi|37                         :                                                                                                                                    AC------A-A---AT-TAA----TT----GCGG---TC------A------ACA--------T----ATAGGATCTGA-T-AAAC--A-TG-------AT-AGCAG-C-GCTTG---GAT-A-AAACA-A--------TA-T--ATTT-----TAT----A--A-TCT---AA----A---AT----CTATTTTT-----CT-AT----TTTTAAAGGCGTT---AA
gi|38                         :                                                                    TTTCTTACC-AA-CA-ATTTCATCAA---TTT--AA---A-ATG--------CACAG-T--TTAAC------A-A---AT-TAA----TT----GATT---TT------GT-----ATAATAAAGTGT----ATACATACTGA-A-AAAA--G-TG-------AT-AGCAG-A-TCTGG---GAT-A-Atta
gi|39                         :                                                                                                                            A-T--TTAGC------A-T---AT-TAA----TT---------------------------CA--------T----ATATGAAAGGA-T-AAAA--AATG-------AT-GGCAG-A-TCTGG---GAT-A-AA--AGA--------TA-T--ATTC-----AAT-------------------------AA----C-----T-------C-GT----TTTT-AGGGCATT---
gi|4                          :                                                        attccatccctTTTCAAT-GC-AA-CC-ATTTCATCAG---TTT--TC---A-ACA--------CT-AA-T--TTAAC------A-A---AT-TAA----TT----GCGA---TT------G------ACA--------T----ACATGAATCGA-TGAAAA--A-T--------AT-AACAG-A-TCAAG---GCT-A-AAC-A-A--------TA-T--ATT--------T----T-TT-T-C---AA----A---AA------------------C-GT----TTTTAAA-GCGTT---AAga
gi|40                         :                                                                                         ATCTC---TTT--GA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAAC------A-C---AT-TGA----TT----GCGG---TA------G------ATA--------T----ATTTTAACCAA-T-AGAA--A-TG-------AC-AGCAG-A-TCTGacataaagtatcaatactttataggacacttaaacaaaatgctgcaatcaataccaaacacacatgcc
gi|41                         :                                                                   TTTTA------AA-CA-ATCTTATCAC---TTT--TA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAAC------ACA---AT-TAA----TT----GTGG---TC------G------ACA--------T----ATAT-----------AAA--A-CG-------AT-AGCAG-A-TCTTG---GAT-A-AA--A-A--------Tttaatctgatctgtattcagtgttg
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                           ttAG-A-CCAGG---GAT-A-AA--A-A--------TA-T--ATTC-----AAT----A-T--T-T---AC----A---AA----C-----TT-----GC-GT----TTTTAAACCCGCT---AAAT
gi|43                         :                                                                  ATTGTATT-CC-AA-CA-ATTTCATCAC---TTT--AA---A-ACA--------CA-AA-T--TT---------------AT--------TT----GGGG---GA------G------ACA--------T----ATGTGAACTGATT-AGGATGA-TG-------AT-AGCAG-A-TCTGG---atatgttagtttagtacattcttcgattgaaa
gi|44                         :                                                                   TTTTATT-CC-AA-CA-ATTCCATCAC---TTT--AA---A-ACA--------CA-AA-T--TAAAC------A---------AA----TT----GT-G---TC------A------TCA--------TA---ATATGAGCTGA-T-AAAAC-A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTG
gi|45                         :                                                                                                                                                                    GG---TC------G------ATT--------T----GTATGAATCAA-T-AAAA--------------T-----G-A-TCTGA---GTT-A-AA--T-A--------TA-T--AGTA-----AAT----A-T--T-C---AA----A---AA----C-----TT-----CC-GT----TCTCAAAGGCGT
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                        gcaTGAACTAA-C-AAAA--A-TA-------AA-GGCAG-A-CCTGG---GAT-A-AA--A-T--------CA-TG-GTTC-----A------A-CA-T-T---AA----A---AAT---C-----TC-----GC-TT----TTTCAAAGGAGTT---AAGTgag
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gi|5                          :                                                                    TTTCTT-TT-AA-CA-ATTTCATCAC---TTT--AC---A-AGA--------CA-AA-T--TTAAC------A-A---AT-TAA----TT----GCGA---TCGACATAG------ACA--------T----ATATGAACTAA-T--AGA--A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTGG---G-T-T-AA--A-A--------TA-T--ATTC-----AAT----ACTA-A-T---AAAAC-A---AA----C-----TT-----GT-AT----TTTTAATGTCGTA---AAGTtatattat
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gi|9                          :                                                                 tATTTTATT-CC-AA-CA-ATTTCATCAC---TTT--AA---A-GCA--------CA-AT-T--CTAAC------A-A---TT-TAA----TT----GTGG---TC------A------ACA--------T----A-AT--------T-ATAA--T-TG-------AC---CA----------------A-GA--A-A--------TA-T--ATTC-----AAT----A-T--T-C---AA----A---TA----C-----TT-----TC-A-----CTTTAATAGCGTT---ATGTacatttgtatatattaatttattatgaataaaatacatgaagctttcgaa
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Reference ( family-148 )      :                                                                  ATTTTATT-CC-AA-CA-ATTTCATCAC---TTT--AA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAAC------A-A---AT-TAA----TT----GCGG---TC------G------ACA--------T----ATATGAACCGA-T-AAAA--A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTGG---GAT-A-AA--A-A--------TA-T-ATTC-----AAT--A--T--A-TC-A---A--A---A---A------C--TT----GCGT----TTTTAAAGGCGTT---AAGT
gi|1                          :                                                                  ATTCTATT-CT-AT-TA-ATTTGACCAT---TTT--AA---A-ACA--------CA-AC-T--TTAAA------T-C---AT-TAA----CT----GGGG---TC------T------GCA--------T----ATCTGACCTGA-A-AAGA--A-TG-------A
gi|10                         : cattgtatacaatctagaaatgacattaatgataactcagaatcaatcattctaccatgtttttcaTTCTATT-CC-TA-CA-ATTTCATCTC---TTA--AA---A-ATG--------CA-CT-T--TTAAC------A-A---AT-TAATAATTT----G-------T------A------ACA--------T----ACATGAAAAGA-T-GAAA--A-TG-------AA-AGCAG-A-TCTGA---AAC-A-AA--A-AC-------TA-T-ATTC-----ACT--A--T----TC-A---A--A---A---G------C--TT----GCGT----TTTTAAAGGCATT---AAATataatactggtattttaataaaatacaaaattagagatcccacttgaatccagatcttcaagtgaccacagcatgcatatattgagtagatata
gi|11                         :                                                                     TTATT-TC-AA-CA-ATTACATTAC---TTT--AA---A-ACA--------CT-AA-T--TTAAT------A-ATTAAT-TAA----TT----AT-----TC------ATTTTTAACA--------G----ATATGAACCGA-T-AATA--A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTTG---GAT-A-AAC-A-C--------TA-T-TTTC-----AA---A-----A-TT-A---A--A---A---A------A--AT----CCGT----TTTTAAAGGTGTT---ATGTatattgtataatcattatttgttattgtacaaagacaggac
gi|12                         :                                                                    TTTATT-CA-AA-CA---TAAATCAT---TTC--AA---A-ACA--------AA-AA-A--TTAAC------G-A---AT-TAA----TT----GCGA---TC------G------ACA--------T----ATATAAACCGA-T-ACAA--A-TG-------AT-AAAAG-A-TCTGG---GAT-A-AA--A-T--------AA-T-ATTA-----AAT--AC-T--A-AC-ATTCA--A---A---A------C--AT----ACGT----TTTTAAAAGCGTT---ACGTatatattgag
gi|13                         :                                                                  ATTTTATT-GC-AA-CA-ATATCATCAC---TTT--CA---A-ACA--------CA-TA-T--TTTAC------A-A---AT-TAA----TT----GATT---TT------GTA----ACA--------T----ATATAAAGCGA-T-ATAT--A-TA-------AT-AGCAG-A-TATGG---GTT-A-AC--A-A--------TA-T-Aatattttataat
gi|14                         :                                                                  ATTGTATT-CC-AA-CA-ATTCTATCAC---TTT--AATTTA-AAA--------CA-AA-ACATTAAC------A-C---AT-TAA----TT----GCGG---TC------G------ATATACAAG--T----ATATGAACCGA-T-AAAA--A---------------CA-------------AT-A-AA--A-A--------TACT-ATTCGTATGAAA--A--A--A-AC-A---A--AAACA---A------C--AT----GCG-----TTTTATAGGCGTT---AAGTcattctattttgagacgaaacttctcctattgatacaaatattatc
gi|15                         :                                                                  ATTATATT-CT-AG-CC-ATTTCATCAC---TA---AA---A-ACA--------TA-AA-C--AGAAC------A-A---AT-TAT----TT----ATGG---TC------G------ACA--------T----ATATGAACCAA-C--AAA--T-TT-------AT-AGCAG-A-CTTGA---AAA-A-AA--A-ACTAGAATGTA-T-ATTC-----A----A--T--A-TT-A---A--A---A---A------CT-TT----GCGT----TTTCAAAGGCGTT---tt
gi|16                         :                                                                  ATTTTATT-CC-AA-CT-ATTTCATCAT---ATC--AA---A-ACA--------CA-AT-T--TCGAC------A-C---AT-CAT----TT----GCGA---TC------GACA---ACA--------T----AAATGAA-CAA-T-GTAA--A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTGA---CA--A-AA--A-A--------CA-T-ATTC-----AAT--A-----A-T--A---A--A---A---AGTGT--T--TT----TCGT----TTTTAAAGGCGTT---cata
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gi|18                         :                                                               caaATTTCATT-CC-AA-CT-ATTTCATCAC---TTT--GA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAGC------A-A---AT-TCA----TT----GTCG---TC------G------ACA--------T----ATATGAACCGA-T-AAAA--A-TA-------AA-AGCAT-G-TCTGG---GAT-A-AA--G-A--------TA-T-ATTC-----AATTGA--T--A-TT-A---A--A---A---A------C--TT----GTGT----TTTCAAAGGAGTT---AAGTatatattatataacatagtactgagcaaagaaa
gi|19                         :                                                                    TCTATT-TC-AA-CA-AATCCATCAC---TTT--GA---A-GCA--------CA-CA-T--TTAAC------A-A---AC-ATA----TT----GTGG---TC------G------CCA--------T----ATATGAACTGA-T-ATAA--A-TG-------AA-TGCAG-A-TGTGG---GAT-A-AA--ATA--------TA-T-ATCC-----AAT--A--T----TC-A---A--A---A---A------C--AT----GCGT----TTTTAACGTCATT---AAG
gi|2                          :                                                                  ATTTTATT-CC-AA-CA-GTTTTATCACAGTTCT--AT---C-ACATTGACTTTCA-AA-T--GTAACTGCGGTA-A------CAA----TT----GCGG---AT------A------ATA--------T----GTATGAACCGA-T-AAAA--A-TG-------AA-AGTAA-A-TCTTG---GTT-A-AA--A-C--------T--T-ATTC-----AAT--A--T--T-TA-A---A--A---A---A------C--TT------GT----TTTTAATGGCGTT---AAGTaatg
gi|20                         :                                                                    TTTACT-CCCAA-CA-TTTTAATCAC---TAT--AA---A-ACA--------CT-GA-T--TTAAC------A-A---AT-TAA----TT----GTGG---TC------A------ACA--------C----ATATGAACCAA-T-CAAA--A-TG-------AT-AGCAA-A-TCTGG---GTT-A-AA--A-----------A-T-ATTA-----AAA--A--T--ATTC-A---A--G---A---A------C--TT----GTGT----TTTTAATTGAGTT---AAGatagatagttaaagattcacaaatacattggatatttaatatttaattatttttttaactgga
gi|21                         :                                                                      TGTT-CA-AT-CA-ATTGCATCAC---TTT--TA---A-AC---------CA-AACT--TTAAC------G-A---AT-TAA----TT----GCGG---TC------G------ACA--------TATTAATATGAAACGA-T-AAAA--A-TT-------AT-AGTAG-A-T-------------AA--A-ACC------TA-T-ATAC-----AAT--A-----A-TA-A---AACA---A---A------C--TT----GCG-----TTTTAAAGGTGTT---AAGTaat
gi|22                         :                                                                     TTATT-CC-AA-CA-ATTTCATAAT---TTT--AA---A-ACA--------CATAG-T--TAAAC------A-A---AT-AAA----TT----GCGG---TC------G------ATA--------T----CTCTGAACCGA-T-AAAA--A-TG-------GT-AGTAA-A-TATGGTTTTAT-C-AA--A-T--------TA-T-TTTT-----A---------------A---A--A---A---A------CCATT----GCGT----TTTTACTGCCGTT---AAGat
gi|23                         :                                                                   TTTTATT-CA-AA-TA-ATTTCATCAC---TTA--AA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAAC------A-A---AT-TGA----TT----GATT---TT------GTA----AAA--------A----ATATTAACTGA-T-AAAA--A-TG-------AT-AGCAG-ATTTTTG---GAT-A-AA--A-A----------------------AAT--A--T--ATTT-A---A--A---A---A----------------CGT----TTTTAAAGGTGTT---GAGT
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Reference ( family-148 )      :                                                                  ATTTTATT-CC-AA-CA-ATTTCATCAC---TTT--AA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAAC------A-A---AT-TAA----TT----GCGG---TC------G------ACA--------T----ATATGAACCGA-T-AAAA--A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTGG---GAT-A-AA--A-A--------TA-T-ATTC-----AAT--A--T--A-TC-A---A--A---A---A------C--TT----GCGT----TTTTAAAGGCGTT---AAGT
gi|1                          :                                                                  ATTCTATT-CT-AT-TA-ATTTGACCAT---TTT--AA---A-ACA--------CA-AC-T--TTAAA------T-C---AT-TAA----CT----GGGG---TC------T------GCA--------T----ATCTGACCTGA-A-AAGA--A-TG-------A
gi|10                         : cattgtatacaatctagaaatgacattaatgataactcagaatcaatcattctaccatgtttttcaTTCTATT-CC-TA-CA-ATTTCATCTC---TTA--AA---A-ATG--------CA-CT-T--TTAAC------A-A---AT-TAATAATTT----G-------T------A------ACA--------T----ACATGAAAAGA-T-GAAA--A-TG-------AA-AGCAG-A-TCTGA---AAC-A-AA--A-AC-------TA-T-ATTC-----ACT--A--T----TC-A---A--A---A---G------C--TT----GCGT----TTTTAAAGGCATT---AAATataatactggtattttaataaaatacaaaattagagatcccacttgaatccagatcttcaagtgaccacagcatgcatatattgagtagatata
gi|11                         :                                                                     TTATT-TC-AA-CA-ATTACATTAC---TTT--AA---A-ACA--------CT-AA-T--TTAAT------A-ATTAAT-TAA----TT----AT-----TC------ATTTTTAACA--------G----ATATGAACCGA-T-AATA--A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTTG---GAT-A-AAC-A-C--------TA-T-TTTC-----AA---A-----A-TT-A---A--A---A---A------A--AT----CCGT----TTTTAAAGGTGTT---ATGTatattgtataatcattatttgttattgtacaaagacaggac
gi|12                         :                                                                    TTTATT-CA-AA-CA---TAAATCAT---TTC--AA---A-ACA--------AA-AA-A--TTAAC------G-A---AT-TAA----TT----GCGA---TC------G------ACA--------T----ATATAAACCGA-T-ACAA--A-TG-------AT-AAAAG-A-TCTGG---GAT-A-AA--A-T--------AA-T-ATTA-----AAT--AC-T--A-AC-ATTCA--A---A---A------C--AT----ACGT----TTTTAAAAGCGTT---ACGTatatattgag
gi|13                         :                                                                  ATTTTATT-GC-AA-CA-ATATCATCAC---TTT--CA---A-ACA--------CA-TA-T--TTTAC------A-A---AT-TAA----TT----GATT---TT------GTA----ACA--------T----ATATAAAGCGA-T-ATAT--A-TA-------AT-AGCAG-A-TATGG---GTT-A-AC--A-A--------TA-T-Aatattttataat
gi|14                         :                                                                  ATTGTATT-CC-AA-CA-ATTCTATCAC---TTT--AATTTA-AAA--------CA-AA-ACATTAAC------A-C---AT-TAA----TT----GCGG---TC------G------ATATACAAG--T----ATATGAACCGA-T-AAAA--A---------------CA-------------AT-A-AA--A-A--------TACT-ATTCGTATGAAA--A--A--A-AC-A---A--AAACA---A------C--AT----GCG-----TTTTATAGGCGTT---AAGTcattctattttgagacgaaacttctcctattgatacaaatattatc
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gi|16                         :                                                                  ATTTTATT-CC-AA-CT-ATTTCATCAT---ATC--AA---A-ACA--------CA-AT-T--TCGAC------A-C---AT-CAT----TT----GCGA---TC------GACA---ACA--------T----AAATGAA-CAA-T-GTAA--A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTGA---CA--A-AA--A-A--------CA-T-ATTC-----AAT--A-----A-T--A---A--A---A---AGTGT--T--TT----TCGT----TTTTAAAGGCGTT---cata
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gi|18                         :                                                               caaATTTCATT-CC-AA-CT-ATTTCATCAC---TTT--GA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAGC------A-A---AT-TCA----TT----GTCG---TC------G------ACA--------T----ATATGAACCGA-T-AAAA--A-TA-------AA-AGCAT-G-TCTGG---GAT-A-AA--G-A--------TA-T-ATTC-----AATTGA--T--A-TT-A---A--A---A---A------C--TT----GTGT----TTTCAAAGGAGTT---AAGTatatattatataacatagtactgagcaaagaaa
gi|19                         :                                                                    TCTATT-TC-AA-CA-AATCCATCAC---TTT--GA---A-GCA--------CA-CA-T--TTAAC------A-A---AC-ATA----TT----GTGG---TC------G------CCA--------T----ATATGAACTGA-T-ATAA--A-TG-------AA-TGCAG-A-TGTGG---GAT-A-AA--ATA--------TA-T-ATCC-----AAT--A--T----TC-A---A--A---A---A------C--AT----GCGT----TTTTAACGTCATT---AAG
gi|2                          :                                                                  ATTTTATT-CC-AA-CA-GTTTTATCACAGTTCT--AT---C-ACATTGACTTTCA-AA-T--GTAACTGCGGTA-A------CAA----TT----GCGG---AT------A------ATA--------T----GTATGAACCGA-T-AAAA--A-TG-------AA-AGTAA-A-TCTTG---GTT-A-AA--A-C--------T--T-ATTC-----AAT--A--T--T-TA-A---A--A---A---A------C--TT------GT----TTTTAATGGCGTT---AAGTaatg
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gi|21                         :                                                                      TGTT-CA-AT-CA-ATTGCATCAC---TTT--TA---A-AC---------CA-AACT--TTAAC------G-A---AT-TAA----TT----GCGG---TC------G------ACA--------TATTAATATGAAACGA-T-AAAA--A-TT-------AT-AGTAG-A-T-------------AA--A-ACC------TA-T-ATAC-----AAT--A-----A-TA-A---AACA---A---A------C--TT----GCG-----TTTTAAAGGTGTT---AAGTaat
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gi|26                         :                                                                   TTTTATT-CA-AA-CA-ATTTCATCAT---TTT--AA---A-ACA--------CA-TA-T--TTAAA------A-C---AT-TGA----TT----GAGG---TC------T------GCA--------T----ATATGAACCGA-T-AACA--A-T--------ATAAGCGT-A-TCTGG---AATGA-AA--A-A--------TA-T-ATTC-----CAT--A--T--T-TT-A---A--A---A--------------T----GTGTTCAGTTTTAAAGGttgaaatata
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gi|30                         :                                                                               A-CC-ATTCCATCAC---TTT--AA---A-ACA-----------AA-T--TTAAT------A-A---AG-TAG----TT----TAGA---TC------G------ACA--------T----ATATTATCCTA-T-AAAA--C-TC-------AT-AGAAG-A-TATGG---G-T-T-AA--A-A--------TA-T-ATTC-----AAT--A--T--A-C------A--A---A---A------C--TT----GCGC----TTTAAATGAGGTT---AAGagcgctttatatagcatagttgacataagacaattttgaatatagaatgttgagataaaatgctgctgagataataaagaacatgt
gi|31                         :                                                                             tatttt-ATTTCATCAC---TTT--AC---A-ACA--------TA-AA-T--TTAAG------A-A---TT-TAA----TT----GCGG---TT------G------ACG--------T----ATATGAACCG--T-TAAA--A-T--------AT-AAAAG-A-TCCAG---GAT-A-CA--A-A--------TA-T-ATGC-----AAT--ATTT--A-AA-A---A--A---A---A------C--TT----GCGT----TTTTAAAGGC-TT---AA
gi|32                         :                                                                                atttgtTTCATCTC---TTT--AA---A-ACA--------CA-GA-T--TTAGC------A-A---AT-TAA----TT----TTGA---TC------A------ACA--------T----ATATGAACTTA-T-AAAA--A-TG-------CT-AACAG-A-TCTGG---ATT-ATAA--A-A--------C--T-ATTC-----AAT--A--T----TC-A---A--C---A---A------C--TT----GCAT----TTTTAAAGGTGT
gi|33                         :                                                                     agcag-CC-AA-CT-ATAATATCAT---TTT--AA---A-ACA--------CA-AA-T--GTAA-------A-A---ATATAA----TT----GCGC---TC------G------ACA--------T----ATATGGACCGA---AAAT--A-TG-------AT-AGCGG-A-TCTGG---TAT-ACAA--A-A--------CA-T-CTTC-----AAT--A--T--A--C-A---A--A---C---A------C--TT----GCGG----TTTTAAAGcga
gi|34                         :                                                                    TTTATT-CC-AA-CA-ATTGCATTAC---TTT--AT---A-ACA--------CA-CA-T--TTAGC------A-A---AG-TA-----------GTAG---TT------G------ATA--------T----ATGTGTACCGA-T-AAGA--A-TT-------AT-AGCAG-G-TATGG---GTT-G-AA--A-A--------TA-T-ATTC-----ACT--A--T----TC-A---A--A---A---A------C--GT----ACAT----TTTTAAtca
gi|35                         :                                                                                -CA-ATACCATCAC---TAT--AA---A-ACA--------CA-CA-T--TCAAC------A-A---AT-TAA----TT----GATT---TT------GTA----ACC--------T----ATATGAAGTGA-T-GTGA--A-TG-------AT-AGCAG-A-CCTCG---GAT---AA--A-A--------TA-T-ATTT-----AAT--A--T--T-TC-t
gi|36                         :                                                                   TTTCAT--CC-AA-CA-AT---ATCAC---TTT--AA---A--CA--------CA-AA-T--ATAAC------A-A---AT-TAA----TT----GACT---TT------GTT----ACA--------T----ATATGAACCGA-T-AAA-------------------C---A-TCT-G---GAT---AC--A-A--------TA-T-AATC-------T--A--T--A-T---------------------------TT----GCGT----TTTTAAAGGCGTT---TAGtttaaatgctaaaatgcttaa
gi|37                         :                                                                                                                                    AC------A-A---AT-TAA----TT----GCGG---TC------A------ACA--------T----ATAGGATCTGA-T-AAAC--A-TG-------AT-AGCAG-C-GCTTG---GAT-A-AAACA-A--------TA-T-ATTT-----TAT--A-----A-TC-T---A--A---A---ATCTATTT--TT----CTAT----TTTTAAAGGCGTT---AA
gi|38                         :                                                                    TTTCTTACC-AA-CA-ATTTCATCAA---TTT--AA---A-ATG--------CACAG-T--TTAAC------A-A---AT-TAA----TT----GATT---TT------GT-----ATAATAAAGTGT----ATACATACTGA-A-AAAA--G-TG-------AT-AGCAG-A-TCTGG---GAT-A-Atta
gi|39                         :                                                                                                                            A-T--TTAGC------A-T---AT-TAA----TT---------------------------CA--------T----ATATGAAAGGA-T-AAAA--AATG-------AT-GGCAG-A-TCTGG---GAT-A-AA--AGA--------TA-T-ATTC-----AAT------------------------A---A------C--T------CGT----TTTT-AGGGCATT---
gi|4                          :                                                        attccatccctTTTCAAT-GC-AA-CC-ATTTCATCAG---TTT--TC---A-ACA--------CT-AA-T--TTAAC------A-A---AT-TAA----TT----GCGA---TT------G------ACA--------T----ACATGAATCGA-TGAAAA--A-T--------AT-AACAG-A-TCAAG---GCT-A-AAC-A-A--------TA-T-ATT--------T--T--T--T-TC-A---A--A---A---A----------------CGT----TTTTAAA-GCGTT---AAga
gi|40                         :                                                                                         ATCTC---TTT--GA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAAC------A-C---AT-TGA----TT----GCGG---TA------G------ATA--------T----ATTTTAACCAA-T-AGAA--A-TG-------AC-AGCAG-A-TCTGacataaagtatcaatactttataggacacttaaacaaaatgctgcaatcaataccaaacacacatgcc
gi|41                         :                                                                   TTTTA------AA-CA-ATCTTATCAC---TTT--TA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAAC------ACA---AT-TAA----TT----GTGG---TC------G------ACA--------T----ATAT-----------AAA--A-CG-------AT-AGCAG-A-TCTTG---GAT-A-AA--A-A--------Tttaatctgatctgtattcagtgttg
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                           ttAG-A-CCAGG---GAT-A-AA--A-A--------TA-T-ATTC-----AAT--A--T----TT-A---C--A---A---A------C--TT----GCGT----TTTTAAACCCGCT---AAAT
gi|43                         :                                                                  ATTGTATT-CC-AA-CA-ATTTCATCAC---TTT--AA---A-ACA--------CA-AA-T--TT---------------AT--------TT----GGGG---GA------G------ACA--------T----ATGTGAACTGATT-AGGATGA-TG-------AT-AGCAG-A-TCTGG---atatgttagtttagtacattcttcgattgaaa
gi|44                         :                                                                   TTTTATT-CC-AA-CA-ATTCCATCAC---TTT--AA---A-ACA--------CA-AA-T--TAAAC------A---------AA----TT----GT-G---TC------A------TCA--------TA---ATATGAGCTGA-T-AAAAC-A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTG
gi|45                         :                                                                                                                                                                    GG---TC------G------ATT--------T----GTATGAATCAA-T-AAAA--------------T-----G-A-TCTGA---GTT-A-AA--T-A--------TA-T-AGTA-----AAT--A--T----TC-A---A--A---A---A------C--TT----CCGT----TCTCAAAGGCGT
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                        gcaTGAACTAA-C-AAAA--A-TA-------AA-GGCAG-A-CCTGG---GAT-A-AA--A-T--------CA-TGGTTC-----AAC--A--T----TA-A---A--A---A---T------C--TC----GCTT----TTTCAAAGGAGTT---AAGTgag
gi|47                         :                                                                      TATT-CC-AA-CA-ATTTCATCAT---TTT--AA---A-ATA--------CA-AA-T--AAAAC------A-A---AT-TAA----TT----GCAA---CC------A------ACA--------A----ATATGAACCGA-T-ata
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                      tgT-AACAG-A-TCTGG---GAT-G-AA--A-A--------TA-T-ATTC-----AAT--A-----A-TC-A---A--A---A---A------T--TT----GCAT----TTTTAAAGGTG-T---AAGT
gi|5                          :                                                                    TTTCTT-TT-AA-CA-ATTTCATCAC---TTT--AC---A-AGA--------CA-AA-T--TTAAC------A-A---AT-TAA----TT----GCGA---TCGACATAG------ACA--------T----ATATGAACTAA-T--AGA--A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTGG---G-T-T-AA--A-A--------TA-T-ATTC-----AAT--A--CTAA-TA-A---AACA---A---A------C--TT----GTAT----TTTTAATGTCGTA---AAGTtatattat
gi|6                          :                                                                  ATTTTATT-CC-AAATATATTCCATAAC---TTT--AA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAAA------A-C---GT-TCA----TT----GTGG---TC------G------ACA--------T----ATATGAACTGA-T-AAAA--A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTTG---GAT-AGAA--A-A--------AA-C-AT--------AT--A--T----TC-C---A--A---A---A------C--TT----GCGA----TTTTAAAGGCACT---AAGattataatacactgtttaaatacttaataaaatatgtgtgacatgagtaa
gi|7                          :                                                                               A-CA-ATTTTATCAC---AT-----------CA--------CA-AA-T--TTAAC------A-A---AT-TAA----TT----GTAG---TT------G------ACA--------T----ATATGAACAGA-T-AAAA--A-TG-------TA-AGCAG-T-TCTGG---GAT-A-AA--G-A--------TA-T-ATTC-----GAT--A--T----TG-A---A--A---A---A------C---T----GTGT----TACT---GGCGTT---AAGTcattgacatttgacgtaaatgtaattgaattaaataacgttgtgactatgtgt
gi|8                          :                                                                        TT-CC-TA-CA-ATTCCATCAC---TTTTTAA---A-GCA--------CA-AT-T--TTGAC------A-A---AT-CAA----AT----GCGT---TC------G------AC----------------ATGA--TGA-T-AAGA--A-TGATATCTTAT-ATCAG-A-TCTTG---AAT-A-AA--A-A---------A---AATC-----ATT--A--T----TC-A---A--A---A---A------C--TT----ACAT----TTT--AAGGCGTTTGAAAGTttactaaattaaagatcattaattttattgctgatatgatcggttttgatgttttttaagtaaagaaa
gi|9                          :                                                                 tATTTTATT-CC-AA-CA-ATTTCATCAC---TTT--AA---A-GCA--------CA-AT-T--CTAAC------A-A---TT-TAA----TT----GTGG---TC------A------ACA--------T----A-AT--------T-ATAA--T-TG-------AC---CA----------------A-GA--A-A--------TA-T-ATTC-----AAT--A--T----TC-A---A--A---T---A------C--TT----TCA-----CTTTAATAGCGTT---ATGTacatttgtatatattaatttattatgaataaaatacatgaagctttcgaa


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blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    TCG     .      TA       .        .                     .     .                      .   A A    .  . .                .       .  TA      C  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    TGG     .      TT       .        .                     .     .                      .   A A    .  . .                .       .  TA      A  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    CGG     .      T        .        .                     .     .                      .   T A    .  . .                .       .  TT      C  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    TGG     .      .        .        .                     .     .                      .   T A    .  . .                .       .  TT      A  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    CGG     .      .        .        .                     .     .                      .   A A    .  . .                .       .  TT      T  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    CGG     .      .        .        .                     .     .                      .   A A    .  . .                .       .  TA      C  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    ATT     .      .        .        .                     .     .                      .   T A    .  . .                .       .  TA      C  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    ATG     .      .        .        .                     .     .                      .   A C    .  . .                .       .  TT      T  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    AGG     .      .        .        .                     .     .                      .   A A    .  . .                .       .  TA      C  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    CAG     .      .        .        .                     .     .                      .   T A    .  . .                .       .  TT      A  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    TTG     .      .        .        .                     .     .                      .   A G    .  . .                .       .  A       A  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    CAG     .      .        .        .                     .     .                      .   T C    .  . .                .       .  A       C  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    ATT     .      .        .        .                     .     .                      .   A T    .  . .                .       .  T       C  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    AGA     .      .        .        .                     .     .                      .   A G    .  . .                .       .  T       C  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    CGG     .      .        .        .                     .     .                      .   T T    .  . .                .       .  A       C  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    TGA     .      .        .        .                     .     .                      .   A A    .  . .                .       .  A       C  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    CGC     .      .        .        .                     .     .                      .   T G    .  . .                .       .  T       C  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    TAG     .      .        .        .                     .     .                      .   A A    .  . .                .       .  T       T  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    ATT     .      .        .        .                     .     .                      .   A A    .  . .                .       .  T       C  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    ACT     .      .        .        .                     .     .                      .   A A    .  . .                .       .  T       A  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    CGG     .      .        .        .                     .     .                      .   A A    .  . .                .       .  A       C  .   .  .   .   .      .   .       .                .  
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    ATT     .      .        .        .                     .     .                      .   A A    .  . .                .       .  T       A  .   .  .   .   .      .   .       .                   
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    CGA     .      .        .        .                     .     .                      .   C A    .  . .                .       .  T       C  .   .  .   .   .      .   .       .                   
blockSeqs                     :                                                                          .  .  .  .          .     .   .       .         .  . .      .        .        .     .    CGG     .      .        .        .                     .     .                      .   A A    .  . .                .       .  T       G  .   .  .   .   .      .   .       .                   
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-148 )      :                                                                  ATTTTATT-CC-AA-CA-ATTTCATCAC---TTT--AA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAAC------A-A---AT-TAA----TT----GCGG---TC------G------ACA--------T----ATATGAACCGA-T-AAAA--A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTGG---GAT-A-AA--A-A--------TA-T-ATTC-----AAT--A--T--A-TC-A---A--A---A---A------C--TT----GCGT----TTTTAAAGGCGTT---AAGT
gi|1                          :                                                                  ATTCTATT-CT-AT-TA-ATTTGACCAT---TTT--AA---A-ACA--------CA-AC-T--TTAAA------T-C---AT-TAA----CT----GGGG---TC------T------GCA--------T----ATCTGACCTGA-A-AAGA--A-TG-------A
gi|10                         : cattgtatacaatctagaaatgacattaatgataactcagaatcaatcattctaccatgtttttcaTTCTATT-CC-TA-CA-ATTTCATCTC---TTA--AA---A-ATG--------CA-CT-T--TTAAC------A-A---AT-TAATAATTT----G-------T------A------ACA--------T----ACATGAAAAGA-T-GAAA--A-TG-------AA-AGCAG-A-TCTGA---AAC-A-AA--A-AC-------TA-T-ATTC-----ACT--A--T----TC-A---A--A---A---G------C--TT----GCGT----TTTTAAAGGCATT---AAATataatactggtattttaataaaatacaaaattagagatcccacttgaatccagatcttcaagtgaccacagcatgcatatattgagtagatata
gi|11                         :                                                                     TTATT-TC-AA-CA-ATTACATTAC---TTT--AA---A-ACA--------CT-AA-T--TTAAT------A-ATTAAT-TAA----TT----AT-----TC------ATTTTTAACA--------G----ATATGAACCGA-T-AATA--A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTTG---GAT-A-AAC-A-C--------TA-T-TTTC-----AA---A-----A-TT-A---A--A---A---A------A--AT----CCGT----TTTTAAAGGTGTT---ATGTatattgtataatcattatttgttattgtacaaagacaggac
gi|12                         :                                                                    TTTATT-CA-AA-CA---TAAATCAT---TTC--AA---A-ACA--------AA-AA-A--TTAAC------G-A---AT-TAA----TT----GCGA---TC------G------ACA--------T----ATATAAACCGA-T-ACAA--A-TG-------AT-AAAAG-A-TCTGG---GAT-A-AA--A-T--------AA-T-ATTA-----AAT--AC-T--A-AC-ATTCA--A---A---A------C--AT----ACGT----TTTTAAAAGCGTT---ACGTatatattgag
gi|13                         :                                                                  ATTTTATT-GC-AA-CA-ATATCATCAC---TTT--CA---A-ACA--------CA-TA-T--TTTAC------A-A---AT-TAA----TT----GATT---TT------GTA----ACA--------T----ATATAAAGCGA-T-ATAT--A-TA-------AT-AGCAG-A-TATGG---GTT-A-AC--A-A--------TA-T-Aatattttataat
gi|14                         :                                                                  ATTGTATT-CC-AA-CA-ATTCTATCAC---TTT--AATTTA-AAA--------CA-AA-ACATTAAC------A-C---AT-TAA----TT----GCGG---TC------G------ATATACAAG--T----ATATGAACCGA-T-AAAA--A---------------CA-------------AT-A-AA--A-A--------TACT-ATTCGTATGAAA--A--A--A-AC-A---A--AAACA---A------C--AT----GCG-----TTTTATAGGCGTT---AAGTcattctattttgagacgaaacttctcctattgatacaaatattatc
gi|15                         :                                                                  ATTATATT-CT-AG-CC-ATTTCATCAC---TA---AA---A-ACA--------TA-AA-C--AGAAC------A-A---AT-TAT----TT----ATGG---TC------G------ACA--------T----ATATGAACCAA-C--AAA--T-TT-------AT-AGCAG-A-CTTGA---AAA-A-AA--A-ACTAGAATGTA-T-ATTC-----A----A--T--A-TT-A---A--A---A---A------CT-TT----GCGT----TTTCAAAGGCGTT---tt
gi|16                         :                                                                  ATTTTATT-CC-AA-CT-ATTTCATCAT---ATC--AA---A-ACA--------CA-AT-T--TCGAC------A-C---AT-CAT----TT----GCGA---TC------GACA---ACA--------T----AAATGAA-CAA-T-GTAA--A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTGA---CA--A-AA--A-A--------CA-T-ATTC-----AAT--A-----A-T--A---A--A---A---AGTGT--T--TT----TCGT----TTTTAAAGGCGTT---cata
gi|17                         :                                                                                       tCATCG-----TT--AA---ACACA--------TA-AA-T--AGAAC------A-A---AT-TAA----TT----GATT---TT------GTA----ACA--------T----ATATGAATC--------------G-------GT-AGCAG-A-TTTAG---ATT----A--T-A--------TA-T-ATTC-----AAG--A--T----TC-A---G--A---A---A------C--TT----GCGT----TGT--AAGACGGT---AAGTgata
gi|18                         :                                                               caaATTTCATT-CC-AA-CT-ATTTCATCAC---TTT--GA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAGC------A-A---AT-TCA----TT----GTCG---TC------G------ACA--------T----ATATGAACCGA-T-AAAA--A-TA-------AA-AGCAT-G-TCTGG---GAT-A-AA--G-A--------TA-T-ATTC-----AATTGA--T--A-TT-A---A--A---A---A------C--TT----GTGT----TTTCAAAGGAGTT---AAGTatatattatataacatagtactgagcaaagaaa
gi|19                         :                                                                    TCTATT-TC-AA-CA-AATCCATCAC---TTT--GA---A-GCA--------CA-CA-T--TTAAC------A-A---AC-ATA----TT----GTGG---TC------G------CCA--------T----ATATGAACTGA-T-ATAA--A-TG-------AA-TGCAG-A-TGTGG---GAT-A-AA--ATA--------TA-T-ATCC-----AAT--A--T----TC-A---A--A---A---A------C--AT----GCGT----TTTTAACGTCATT---AAG
gi|2                          :                                                                  ATTTTATT-CC-AA-CA-GTTTTATCACAGTTCT--AT---C-ACATTGACTTTCA-AA-T--GTAACTGCGGTA-A------CAA----TT----GCGG---AT------A------ATA--------T----GTATGAACCGA-T-AAAA--A-TG-------AA-AGTAA-A-TCTTG---GTT-A-AA--A-C--------T--T-ATTC-----AAT--A--T--T-TA-A---A--A---A---A------C--TT------GT----TTTTAATGGCGTT---AAGTaatg
gi|20                         :                                                                    TTTACT-CCCAA-CA-TTTTAATCAC---TAT--AA---A-ACA--------CT-GA-T--TTAAC------A-A---AT-TAA----TT----GTGG---TC------A------ACA--------C----ATATGAACCAA-T-CAAA--A-TG-------AT-AGCAA-A-TCTGG---GTT-A-AA--A-----------A-T-ATTA-----AAA--A--T--ATTC-A---A--G---A---A------C--TT----GTGT----TTTTAATTGAGTT---AAGatagatagttaaagattcacaaatacattggatatttaatatttaattatttttttaactgga
gi|21                         :                                                                      TGTT-CA-AT-CA-ATTGCATCAC---TTT--TA---A-AC---------CA-AACT--TTAAC------G-A---AT-TAA----TT----GCGG---TC------G------ACA--------TATTAATATGAAACGA-T-AAAA--A-TT-------AT-AGTAG-A-T-------------AA--A-ACC------TA-T-ATAC-----AAT--A-----A-TA-A---AACA---A---A------C--TT----GCG-----TTTTAAAGGTGTT---AAGTaat
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gi|30                         :                                                                               A-CC-ATTCCATCAC---TTT--AA---A-ACA-----------AA-T--TTAAT------A-A---AG-TAG----TT----TAGA---TC------G------ACA--------T----ATATTATCCTA-T-AAAA--C-TC-------AT-AGAAG-A-TATGG---G-T-T-AA--A-A--------TA-T-ATTC-----AAT--A--T--A-C------A--A---A---A------C--TT----GCGC----TTTAAATGAGGTT---AAGagcgctttatatagcatagttgacataagacaattttgaatatagaatgttgagataaaatgctgctgagataataaagaacatgt
gi|31                         :                                                                             tatttt-ATTTCATCAC---TTT--AC---A-ACA--------TA-AA-T--TTAAG------A-A---TT-TAA----TT----GCGG---TT------G------ACG--------T----ATATGAACCG--T-TAAA--A-T--------AT-AAAAG-A-TCCAG---GAT-A-CA--A-A--------TA-T-ATGC-----AAT--ATTT--A-AA-A---A--A---A---A------C--TT----GCGT----TTTTAAAGGC-TT---AA
gi|32                         :                                                                                atttgtTTCATCTC---TTT--AA---A-ACA--------CA-GA-T--TTAGC------A-A---AT-TAA----TT----TTGA---TC------A------ACA--------T----ATATGAACTTA-T-AAAA--A-TG-------CT-AACAG-A-TCTGG---ATT-ATAA--A-A--------C--T-ATTC-----AAT--A--T----TC-A---A--C---A---A------C--TT----GCAT----TTTTAAAGGTGT
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gi|36                         :                                                                   TTTCAT--CC-AA-CA-AT---ATCAC---TTT--AA---A--CA--------CA-AA-T--ATAAC------A-A---AT-TAA----TT----GACT---TT------GTT----ACA--------T----ATATGAACCGA-T-AAA-------------------C---A-TCT-G---GAT---AC--A-A--------TA-T-AATC-------T--A--T--A-T---------------------------TT----GCGT----TTTTAAAGGCGTT---TAGtttaaatgctaaaatgcttaa
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gi|39                         :                                                                                                                            A-T--TTAGC------A-T---AT-TAA----TT---------------------------CA--------T----ATATGAAAGGA-T-AAAA--AATG-------AT-GGCAG-A-TCTGG---GAT-A-AA--AGA--------TA-T-ATTC-----AAT------------------------A---A------C--T------CGT----TTTT-AGGGCATT---
gi|4                          :                                                        attccatccctTTTCAAT-GC-AA-CC-ATTTCATCAG---TTT--TC---A-ACA--------CT-AA-T--TTAAC------A-A---AT-TAA----TT----GCGA---TT------G------ACA--------T----ACATGAATCGA-TGAAAA--A-T--------AT-AACAG-A-TCAAG---GCT-A-AAC-A-A--------TA-T-ATT--------T--T--T--T-TC-A---A--A---A---A----------------CGT----TTTTAAA-GCGTT---AAga
gi|40                         :                                                                                         ATCTC---TTT--GA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAAC------A-C---AT-TGA----TT----GCGG---TA------G------ATA--------T----ATTTTAACCAA-T-AGAA--A-TG-------AC-AGCAG-A-TCTGacataaagtatcaatactttataggacacttaaacaaaatgctgcaatcaataccaaacacacatgcc
gi|41                         :                                                                   TTTTA------AA-CA-ATCTTATCAC---TTT--TA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAAC------ACA---AT-TAA----TT----GTGG---TC------G------ACA--------T----ATAT-----------AAA--A-CG-------AT-AGCAG-A-TCTTG---GAT-A-AA--A-A--------Tttaatctgatctgtattcagtgttg
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                           ttAG-A-CCAGG---GAT-A-AA--A-A--------TA-T-ATTC-----AAT--A--T----TT-A---C--A---A---A------C--TT----GCGT----TTTTAAACCCGCT---AAAT
gi|43                         :                                                                  ATTGTATT-CC-AA-CA-ATTTCATCAC---TTT--AA---A-ACA--------CA-AA-T--TT---------------AT--------TT----GGGG---GA------G------ACA--------T----ATGTGAACTGATT-AGGATGA-TG-------AT-AGCAG-A-TCTGG---atatgttagtttagtacattcttcgattgaaa
gi|44                         :                                                                   TTTTATT-CC-AA-CA-ATTCCATCAC---TTT--AA---A-ACA--------CA-AA-T--TAAAC------A---------AA----TT----GT-G---TC------A------TCA--------TA---ATATGAGCTGA-T-AAAAC-A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTG
gi|45                         :                                                                                                                                                                    GG---TC------G------ATT--------T----GTATGAATCAA-T-AAAA--------------T-----G-A-TCTGA---GTT-A-AA--T-A--------TA-T-AGTA-----AAT--A--T----TC-A---A--A---A---A------C--TT----CCGT----TCTCAAAGGCGT
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                        gcaTGAACTAA-C-AAAA--A-TA-------AA-GGCAG-A-CCTGG---GAT-A-AA--A-T--------CA-TGGTTC-----AAC--A--T----TA-A---A--A---A---T------C--TC----GCTT----TTTCAAAGGAGTT---AAGTgag
gi|47                         :                                                                      TATT-CC-AA-CA-ATTTCATCAT---TTT--AA---A-ATA--------CA-AA-T--AAAAC------A-A---AT-TAA----TT----GCAA---CC------A------ACA--------A----ATATGAACCGA-T-ata
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                      tgT-AACAG-A-TCTGG---GAT-G-AA--A-A--------TA-T-ATTC-----AAT--A-----A-TC-A---A--A---A---A------T--TT----GCAT----TTTTAAAGGTG-T---AAGT
gi|5                          :                                                                    TTTCTT-TT-AA-CA-ATTTCATCAC---TTT--AC---A-AGA--------CA-AA-T--TTAAC------A-A---AT-TAA----TT----GCGA---TCGACATAG------ACA--------T----ATATGAACTAA-T--AGA--A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTGG---G-T-T-AA--A-A--------TA-T-ATTC-----AAT--A--CTAA-TA-A---AACA---A---A------C--TT----GTAT----TTTTAATGTCGTA---AAGTtatattat
gi|6                          :                                                                  ATTTTATT-CC-AAATATATTCCATAAC---TTT--AA---A-ACA--------CA-AA-T--TTAAA------A-C---GT-TCA----TT----GTGG---TC------G------ACA--------T----ATATGAACTGA-T-AAAA--A-TG-------AT-AGCAG-A-TCTTG---GAT-AGAA--A-A--------AA-C-AT--------AT--A--T----TC-C---A--A---A---A------C--TT----GCGA----TTTTAAAGGCACT---AAGattataatacactgtttaaatacttaataaaatatgtgtgacatgagtaa
gi|7                          :                                                                               A-CA-ATTTTATCAC---AT-----------CA--------CA-AA-T--TTAAC------A-A---AT-TAA----TT----GTAG---TT------G------ACA--------T----ATATGAACAGA-T-AAAA--A-TG-------TA-AGCAG-T-TCTGG---GAT-A-AA--G-A--------TA-T-ATTC-----GAT--A--T----TG-A---A--A---A---A------C---T----GTGT----TACT---GGCGTT---AAGTcattgacatttgacgtaaatgtaattgaattaaataacgttgtgactatgtgt
gi|8                          :                                                                        TT-CC-TA-CA-ATTCCATCAC---TTTTTAA---A-GCA--------CA-AT-T--TTGAC------A-A---AT-CAA----AT----GCGT---TC------G------AC----------------ATGA--TGA-T-AAGA--A-TGATATCTTAT-ATCAG-A-TCTTG---AAT-A-AA--A-A---------A---AATC-----ATT--A--T----TC-A---A--A---A---A------C--TT----ACAT----TTT--AAGGCGTTTGAAAGTttactaaattaaagatcattaattttattgctgatatgatcggttttgatgttttttaagtaaagaaa
gi|9                          :                                                                 tATTTTATT-CC-AA-CA-ATTTCATCAC---TTT--AA---A-GCA--------CA-AT-T--CTAAC------A-A---TT-TAA----TT----GTGG---TC------A------ACA--------T----A-AT--------T-ATAA--T-TG-------AC---CA----------------A-GA--A-A--------TA-T-ATTC-----AAT--A--T----TC-A---A--A---T---A------C--TT----TCA-----CTTTAATAGCGTT---ATGTacatttgtatatattaatttattatgaataaaatacatgaagctttcgaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|49 ): TATCACATATATGGGAAAAATAAAAACAGAAATGAGTTTTCAAA
Unaligned ( gi|50 ): AGTAATTAAGATTATAACAGNNNNNNNNNNTGTTTCTG