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Reference ( family-1223 ) : AGGGAGTATATTGGCATTTAACTCTCAATATGGTGTCATAAATAAACATTACNAATACAAAGATATACATATACATATAACTTACATATTTATGAATGCAAGG-------------TATA-A-CTT----------TGT-ATA-TTGCCGCTTTATTA------T-ATGCGTCGGTTTTCAGAAGCTA-A-ATCA------TTTGATTTGTTTACC-TTT-CC-A--T---TTTGAACGAACTGCCTTCGGTAT----AACGAC--CGGT--GTAAA-C----AC--ATA-----------G---CA--C--AGG-T-A--G--GT----CAAA-C-GTTTTTA-------A-AGAGT---TTATTTACTA----GTA-TATA--ATT-GCTGTATAAGGTTAA-GGTANCCAATGAATCN---CGG---A---------G-AA---------A---------A---------------------C---------TGA--A--G-GAAAC---AAGGTCAG----ATCA---CTAAC-ATAACGGTTCGA-ANNTTTTCAATTGTGTGCACAC---------ATT-----ACAT----------AAT-ACCATT-A------------------GTCC-TT--TCGT-TATGACGTA--TTTC----AC--------C-----------AT-------TTC--GATG---T---AAA-AAA------C----A-GCAAGAAATACTACCGTGTCAAAACCTA-GT-TCGTTCTTTGTTTCCATTCAATTATTGACATGGTA-TCCGACTTCCGTACG-GAACCTATACCTAATAAATAATATTACAAGTCCATTCT-TCAATTATTGTTTGCGAC-A-TA--GT--CTGTG---CA----TATG---TAGT-A-ANTTTTTATTTCAACCGCCAGGTGCGTGCACGGATATTTTCAGAAATGCGAAGCTATGTTCGGA-ATGTTTACGGAGATAAATGTAAATATTGCGCAATATTTTTTCG-CGTTCCGC-GATAAACTAT--TG-TCAATATTTTGATT--TATTT-ATGTTAATTTAATAACTCTTAGGTTA----AT-------T--C--GNAT--CGGTA--CAA--GCACTATTTTATGTGCATAAC-ATATT-----AGAGAAAGTCTCCATTTGCAGCTTTNACGTGNAATTCACNAATATAA
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gi|11 : acaattagctttataagataaagatacacaatgaatctcagacacaatgtaagcaactaaactgaaactttagtctgatcaatagcagcggtttgattattttcaattgtgtgtacactacataatgtcattagtccagtatttataacgtattctaccatatcagaagaatgcaagaattactatcgGGAGTATATTGACATTTAACTCACAATATGG-GTCATAAATAAGCATTGCAAATACAAAGA-----GT-TGCATAAAACCTACATATTTATGAATGCAAGG-------------TATA-AACTTAAATATTACATAT-ATA-TTACCGCTTTATTC------TTGTG-GTCCGTTTTCAGAAGCTA-T-ATCA------TTTGATTTGTTTACC-TTT-CC-AACTTAGTTTGAATGAACTATCTTCGGTATTCC-ATCAAC--CATC--GTAAA-C----
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Reference ( family-1223 ) : AGGGAGTATATTGGCATTTAACTCTCAATATGGTGTCATAAATAAACATTACNAATACAAAGATATACATATACATATAACTTACATATTTATGAATGCAAGG-------------TATA-A-CTT----------TGT-ATA-TTGCCGCTTTATTA------T-ATGCGTCGGTTTTCAGAAGCTA-A-ATCA------TTTGATTTGTTTACC-TTT-CC-A--T---TTTGAACGAACTGCCTTCGGTAT----AACGAC--CGGT--GTAAAC----AC-GTA-----------G-CA--C--A--GG-T-----A--G--GT----CAAAC-NTTTTTA-------A-AGAGT---TTATTT---ACTAG--TA-TATAATT-GCTGTATAAGGTTAA-GGTANCCAATGAATCN---CGG---A---------G-A-A---------A--------------------A----------C---------TGA--A--G-GAAAC---AAGGTCAG----ATCA---CTAAC-ATAACGGTTCGA-ANNTTTTCAATTGTGTGCACAC---------ATT-----ACAT----------AAT-ACCATT-A------------------GTCC-TT--TCGT-TATGACGTA--TTTC----AC--------C-----------AT-------TTC--GATG---T---AAA-AAA------C----A-GCAAGAAATACTACCGTGTCAAAACCTA-GT-TCGTTCTTTGTTTCCATTCAATTATTGACATGGTA-TCCGACTTCCGTACG-GAACCTATACCTAATAAATAATATTACAAGTCCATTCT-TCAATTATTGTTTGCGAC-A-TA--GT--CTGTG---CA----TATG---TAGT-A-ANTTTTTATTTCAACCGCCAGGTGCGTGCACGGATATTTTCAGAAATGCGAAGCTATGTTCGGA-ATGTTTACGGAGATAAATGTAAATATTGCGCAATATTTTTTCG-CGTTCCGC-GATAAACTAT--TG-TCAATATTTTGATT--TATTT-ATGTTAATTTAATAACTCTTAGGTTA----AT-------T--C--GNAT--CGGTA--CAA--GCACTATTTTATGTGCATAAC-ATATT-----AGAGAAAGTCTCCATTTGCAGCTTTNACGTGNAATTCACNAATATAA
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gi|14 : tatgctgttgtagttgtggttatttcaaatcaaccatgatcgtaaacctgagactgtcgattaatgtgttcacgtatatagtttAGGGAGTATACTGGCA-----------ATATGGTGTTATAAATAAACATTA-----------ATATACCT-TAAACATAA-----ATAATTATTATTTCAAGG-------------TATA-T-TCT----------TGT-GTG-TTGCTGCTCTATTA------T-ATGCGTTGGTTTTTAAAAGCTA-C-ATCATTTCATTTTGATTTGTTTACC-TTT-CT-A--T---TTTGAATCA---GCCAT---TATA---AACGACGGTGG---------------TGTA--AATTTTTGTGTACA--GA-T-----
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gi|20 : ttaatttaggccttacaattttgctattttgttatatagttagtattcagagaccacatcatttgctttgtttacctttcccaatttaagcgacttatcttcagtattctgaccagtcattagactgtgactgtatcagtaattgtgtataggcaagtgatgtacacattttcacacatgcaaaggtcaattgtttttaaagagtttataaaatggctttattatgttaagatactcatcgattcttggacacaatgttaatatcaatacatgttactgaacaggaagaaagtcatatatctaactaaactgattgaacatttccaattgtgtgcacaatacatagtacctttaaaagttgtaatggtaatgattctatccttctggtgtatttcatctttgctaggttataattcgatgtcagaaaaacaccggaaattgtatcatattaagatctacatttgttctttgtgtccataaacgatctaagtctcaacataataaatattcttaaaATGAATATAAGA-------------T--------T----------T----TA-TTGCTGCTTAATTACTAATAT-ATGCGTCGGATTTCAGAAGC-A-A---CG------TTTGATGTATTTACCATTA-TT-A--A---TTTGAACGCACTGTCTTCGGTAT----cccccctctaaacattgtatta
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gi|22 : acagtggtgtcaataattgtgtacaaatgcagttt-------T--T--GAAT--CGGTAAACCA--GCACTATTTTATGTGCATTAC-ATACTGTTATAGAGAAAGTCTCCATTTGCAGCTTTTAAGAATAATATACCAGTATAAc
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gi|3 : acT----GACGAC--CGA---------------TGTT--TACACTTACGCTCA--GG-A-----AATG--GT----CAAAC-TTAATTA-------T-AAAAT---TTactgtcccatcaaacatcgtacaccgcgatggtgtaaatagttgtgtacacattcatagttgacgaccgatgtttacacttacgctcaggaaatggtcaaacttaattataaaattttctcggagaaaccgtcaacaactgaatgaaacatgttcattcatatcactaacaacggttcagttgccattagatctttcgttgtaatgaaattttcctttgctatatcttgatgtaaacagcaggaaatactaccatgtcaaaacctagttagttctttgtttctatttaatcattgagatgatatccgacttcagcacgaaacctatacctaataagtaatataaaaaatcgtttttatcaattattggttgtgacaactgcctgtgcatatgtagtaaattctatttcaaccgccaggtgcttgcattgatagtttcgcaaat
gi|3 : acggagtatattggcattaaactcgcaatgtgatgtcataaataaacattgcgaatacaaagatatacataacctttacatatttatgaatgcatggaaatgcataaacatgtaactatgtatagttgctgatttcctatatgcttcggttgtcagaagctgaatcatttgatgtgtttacttttccattttgaacgaactgctttcgactgtcccatcaaacatcgtacaccgcgatggtgtaaatagttgtgtacacattcatagtTCT---CGG---A---------G-A-A---------ACCGTCAACA-----------A----------C---------TGA--A--T-GAAAC---ATGTTCATTCATATCA---CTAAC-A--ACGGT-----------TCAGTTG---------------------------------------------CCATT-A------------------GATC-TT--TCGT-TGTAATGAAATTTTCCTTTGC--------T-----------AT-------ATCTTGATG---T---AAA----------CA----GCAGGAAATACTACCATGTCAAAACCTA-GT-TAGTTCTTTGTTTCTATTTAATCATTGAGATGATA-TCCGACTTCAGCACG-AAACCTATACCTAATAAGTAATATAAAAAATCGTTTTTATCAATTATTGGTTGTGAC-A--ACTGC--CTGTG---CA----TATG---TAGT-A-AA-TTCTATTTCAACCGCCAGGTGCTTGCATTGATAGTTTCGCAAATtctcggagaaaccgtcaacaactgaatgaaacatgttcattcatatcactaacaacggttcagttgccattagatctttcgttgtaatgaaattttcctttgctatatcttgatgtaaacagcaggaaatactaccatgtcaaaacctagttagttctttgtttctatttaatcattgagatgatatccgacttcagcacgaaacctatacctaataagtaatataaaaaatcgtttttatcaattattggttgtgacaactgcctgtgcatatgtagtaaattctatttcaaccgccaggtgcttgcattgatagtttcgcaaat
gi|4 : acggagtatattggcattaaactcgcaatgtgatgtcataaataaacattgcgaatacaaagatatacataacctttacatatttatgaatgcatggaaatgcataaacatgtaactatgtatagttgctgatttcctatatgcttcggttgtcagaagctgaatcatttgatgtgtttacttttccattttgaacgaactgctttcgactgtcccatcaaacatcgtacaccgcgatggtgtaaatagttgtgtacacattcatagttgacgaccgatgtttacacttacgctcaggaaatggtcaaacttaattataaaatttCTCA--GG-TT----AT-G--GT----CTCAT-TTTTTTA-------A-AGAAT---TTGTTT---ACTAG--AA-TATAATT-GCTGTATAAGGTTAA-GGTAGCCACTAAATCA---CGT---A---------G-A-A---------A--------------------AATGTCAACAAC---------TGA--A--C-GAAAC---AAGGTCA------------CTAAC-ATAACGATTCCA-AAGTTTTCAATTGTATGCACAT---------ATT-----ACAG----------AAT-ACCGTT-A------------------GTCC-TT--TCGT-TATGACGTA--TTTC----AC--------CCTCGCTAC---AT-------TTT--AATG---T---AAA-AAA------C-----GCAAGAAAGACTACCGTTTCAAAACTTA-GT-TCGTCCTTTGTTTCCATTCAATTATTGACATGGTA-TCCGGCTTCCTTGTG-CAACCTATACATAATGAATAATATTTCAAGTTCTTTCT-TCAATTATTGTTTGCTGC-AATT--GC--TAGTG---CA----TATG---T--T-ATATTTTTTA----------CAG-TGCACGCATGGATATTTTCAGAAATGCGAAGCTATGTTCGGATATTTTT-CGTAGGTAAATGTAAATACTGCGCAAAATTTTTTCG-CGTTCCGC-GGTAAACTAT--TG-TCAAAATGTTGATTAGTGTT-----TTGATTTATGACCTCTTAGGTTA----
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gi|7 : gtaaataattgtgtacttatgcatagtttaagactgctgtaaacacttatgctcaggtaatggtcaaacttttttagaaatttatttactattattgttgtaaaagggtagccaatgaatcatggagaaaatgtcaacaactgaaagaaaggaggtcagatcactaacattatggttcgaaacctttgtgcacacattacataataccataagtccttgaattatgacatattttattcatgctacatttttatgtaaaaaaactactgtgtgttctttgcttccatACAAC--TGA---------------TGCA--AACATTTACACTTA--GG---TAA-T-GGT-CA---AAC----TTTA-------A-A-------CTAT-----ACTAT--TA-T-----T-GCTGTACAAGGGTAA-GGTAGCCAGTGAATCG---TGG---A---------G-A-A---------A--------------------A----------T---------T-A--A--C-AAAAC---AATGTCAG----ATCG---CAAAC-ATAACTATTTGA-ATATTTTCGATTGTGTGCACTC---------ATTACAT-AATA-CCATC-G------------------GCCCATTTGTTATGACGTA--TTTC-A-CCCA-T-GCTA---CAA--TT---TGATG---T--AAA-AAAAAAAAAC-----ACAACAAATTCTGCCATGTCAAAACCTA-GT-TC----TTTGTTTCCAGTCAATTATTGACATTGTA-TCCGACTTCCGTGCG-GAACCTTTAGCTAATAAATAATATTACAAGTCCGTTA--TCAATTATTGTTTATGACAATTGCCTG-------------TG---TAGT----CTTTTTTTTCCAACCGCCAGTTGCGTTAACGGATATTTTCAGAAATGCG-AGC---------A-ATGTATACAGAAATGAAT---AATAT---ACAATATTTTTT
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