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gi|2                          :                                                               TTTATCATGTGATATCACTTTACCCACAATGCTAATTGAA-AACAAGAATATAAAAAT-TACCA--GT------GTTTT-TTTGT-GTTTTTT--TC---TT-TAC---TTTCTATT-TTGTTTCAAG-T----TTTTATATTTACGTGCATTATTTTACATTCT--TGTT--AAGTT-G---T---A------T---A-T-TATG-----GTT----------TTTTATGTTCTT--------TTATTCCAATTGTTTAA-TTTAA--T---T-TGTGTTC----AT-TAATTT----TATAT-GCT--TGT-------AAGTT--TT------TTATA--TTGATGTT-TTTAGTTTA-A-------CA-----A-TAAG-AATG-----TA------CAAC-AAA-AACATAA---ATATAAATTTGAAC--ACCATATATGTAGA-ATTTTA-CATC--ACA-AATGTT---A--------AGT-TTGAACAAG---AAAA-AAT----tattattc
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ta----TACAT-GTT---GTT--G-----GTT--TT------TAATA--TTTATATTCCTTAGTTCACATTTTTATTA-----ACTAAG-TATA-----TA------AACATAAA-AACAAAAATTATG--------AAC--ATGA-ACATGAA--------ATCAACAAACACAATGGA---A--------AG--TTGAACAA----TACG-AAT----AGaa
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             a-T--T----TATACAGTT--TTTTCTGTTAATTTA------ATATG--TTTTTATTTTTAGTTTAACAATATGA-ATG-----TATAGTGAACTACATGAA-TATA-AAATGT-AACATCATATATGTA-G-AATT-TAA-CAACACTACTGT-----------TA--Ata
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                      TTTG-TTC--TTCATTTTGTATTCGTGTTATTCATATTTCTT-TTGTATTAGATA-T----TTTTATATTTATGTTCATTATTTTACATTCTTGTTGTAAA--
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Reference ( family-1036 )     :                                                                             NNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGNGTCGTCGGTGATCANGACGAANCAGAAACCTCGTTACGAGTTTATCATGTGACGTCACTTT--CCACAATGCTAATTGAAGAACAAGAATATAAAAAAT---TACCGGT-AG---GTTTTTTTC--T--GTTTTCTATTCGTGTTGTTCATCTTTCTA-TTGTGTTTGATG-T----TTTTATATTTATGTTCATTATTTTACATTCTTGTTGTAAA--T-G-T-ATA-CTA----TGTT--GTTG-TT-T--TATTTTTATGTTC-TTAATTTT--TTATTCTTATTG--TTTA------ATTT---AATTTGTGTTCGTTAATTTTATAT-GTT--TGTT--GTAAGTTTT------TTATA--TTTATGTTCTTAGTTNAACAATAAGAATGTAAAACGAANAACATAAA-TAT-A-AAA-TTT-AACACCATATATGTA-C-ANTT-T-A-CAACACAAATGT-----------TA--AGT-TTGAACAAG--AA--------AAAGAGTTATACA--ATNTTGCAACGTTTGGCCTGCCA
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Reference ( family-1036 )     :                                                                             NNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGNGTCGTCGGTGATCANGACGAANCAGAAACCTCGTTACGAGTTTATCATGTGACGTCACTTT--CCACAATGCTAATTGAAGAACAAGAATATAAAAAAT---TACCGGT-AG---GTTTTNTTC--T--GTTTTCTATTCGTGTTGTTCATCTTTCTA-TTGTGTTTGATG-T----TTTTATATTTATGTTCATTATTTTACATTCTTGTTGTAAA--T-G-T-ATA-CTA----TGTT--GTTG-TT-T--TATTTTTATGTTC-TTAATTTT--TTATTCTTATTG--TTTA------A-TTTANTTTGTGTTCGTTAATTTTATAT-GTT--TGTT--GTAAGTTTT------TTATA--TTTATGTTCTTAGTTNAACAATAAGAATGTAAAACGAANAACATAAA-TAT-A-AAA-TTT-AACACCATATATGTA-C-ANTT-T-A-CAACACAAATGT-----------TA--AGT-TTGAACAAG--AA--------AAAGAGTTATACA--ATNTTGCAACGTTTGGCCTGCCA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                           gttaaattgtacacacATG-T----TTTTATTTTTGTGTTGATTATTTTACATTTATGTTATAAAA-T-GGT-ATATCTA----TATT--GTCT-TTGT--TGCTTTTATAGTC-TTAATTTT--T-ATTCTTATTG--GCTA------A-TTTAATTTGTATTCGTTTATTATATAT-GTT--CGTT--GTAAGTTTT------TTTTAAATCTATGTTCTTAGTTTAACAATAAGAATGTAAAAGGAATAACATAAA-TAT-A-AAA-TTT-AACACCATCAATGTA-T-AATT-A-A-CAACACAAATGT-----------TA--AGT-TTGGAAAAGAAAA--------AAAGAGTTATACA--ATGTTGCAACATTTGGCCTGCCtt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gttgaaattgtacatatATGTTC-TTAATTTT--TT-TTCTTATTGATTTTGTGTTCTA-TTCATTTTGTGTTCGTTAAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cTTTTATAT-TTT--TGTT--GTAAGTTTT------TT-TA--GTTATGTTCTTAGTTTAACAATAAGAATGTAAAATGAATACCATAAA-TAT-A-AAA-ATT-AAATCCATATATGTA-C-AATTAA-A-CAACACAAGTGT-----------TA--AGT-TTGAAAATG--AA--------AATGAGTaaataaaacaaaaatacaacaaacatataaaaagtttttatatttttgttgtaagtttttttagttatgttcttagtttaacaataagaatgtaaaatgaataccataaatataaaaattaaatccatatatgtacaattaaacaacacaagtgttaagtttgaaaatgaaaatgagtaacccgcataccata
gi|6                          : catgttcttaattttttttcttattgattttgtgttctattcattttgtgttcgttaataaataaaacaaaaatacaacaaacatataaaaagtAAGAGTTGTCGGTAAT-ATGATGAAACAGAAACCTTGTTACAAGTTTATCATGTGACGTCTCTTT--------------TTGATGAACAAGAATGCAAAAAATTACTACCGGT-AG--------------T--GTTTTCTATTTGTGTTGTTCGTC-TTCTATTTGTGTTTGATGCT----TTTTATATTTTTTTTCATTATTTTACATTCTTGTTGTAAAGTT-G-T-GTA-TTA----TGTTTAG-TG-TT-T--TATTTTAATaacccgcataccata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTGTGTTT-TTAGTTTT--CTATTCGTATTG--TTCA------ACTTTCCATTGTGTTTGTTGATTTCAT---GTTCATGTTC-ATAATTTTTGTTT--TTATG--TTTATATACTTAGTT----AATAAAAATGTGAACTAAGGAATATAAA-TATTA-AAA-ACC-AACAACATGTATGTA-T--TTT-T-A-CAATACACATGC-----------TA--TGTATTGAAGAAG--AA--------AAAGAATTATACA--ATTAAGCAACGGTTGGtattattc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                       aATATTTTTGTTCATTAGTTTACATTCTTGTTGTAAAGTT-T-T-AGATCTT----TATT---TTG-TC-TGTTGTTTTTATTTTCACTAATTGTAATTCTTATTATTA--TCTA------A-TTTAATTTGTGTTCGTTAATTGTGTAT-GTT--TGTT--ATAAGTTTTTTTTTATTATA--TTTATGT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTCTT--TA--TTTA------A-TTTATTTTGTGTTTGTG---TTTATTT-GTT--TGTT--GTAAGTTTT------TT-------TATGTTCTTAGTTAAACAACAAGAGTGTAAAACGAACTATATAAA-TAT-A-GAA-CTT-AACACCTTAAGTGTA-C-AC---------------ATGT-----------TA--AAT-GTGAACAAG--AA--------ACAGAGTTGTACA--ATATTGAAACGTTTGACCTTCCAaacaattagtgtttatttactaaaaaaaac


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Reference ( family-1036 )     :                                                                             NNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGNGTCGTCGGTGATCANGACGAANCAGAAACCTCGTTACGAGTTTATCATGTGACGTCACTTT--CCACAATGCTAATTGAAGAACAAGAATATAAAAAAT---TACCGGT-AG---GTTTTNTTC--T--GTTTTCTATTCGTGTTGTTCATCTTTCTA-TTGTGTTTGATG-T----TTTTATATTTATGTTCATTATTTTACATTCTTGTTGTAAAGTTGTATA-CTA----TGTT--GTTG-TT-T--TATTTTTATGTTC-TTAATTTT--TTATTCTTATTG--TTTA------A-TTTANTTTGTGTTCGTTAATTTTATAT-GTT--TGTT--GTAAGTTTT------TTATA--TTTATGTTCTTAGTTNAACAATAAGAATGTAAAACGAANAACATAAA-TAT-A-AAA-TTT-AACAC--CATA--TATGTACANTTTAACAACACAAATGT-----------TA--AGT-TTGAACAAG--AA--------AAAGAGTTATACA--ATNTTGCAACGTTTGGCCTGCCA
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --AGT-TTGAACAA---AA--------AAGGTGTTATACA--ATATTGTAAGGCTTCACCTGCCta
gi|2                          :                                                                                                                                           TTTATCATGTGATATCACTTTACCCACAATGCTAATTGAA-AACAAGAATATAAAAA-T---TACCAGT------GTTTTTTTG--T--GTTTTTT--TC------TTTA-CTTTCTA-TTTTGTTTCAAG-T----TTTTATATTTACGTGCATTATTTTACATTCTTGTT---AAGTTGTATA-TTA----TG-------G-TT-T--T----TTATGTTC-TT--------TTATTCCAATTG--TTTA------A-TTTAATTTGTGTTCATTAATTTTATAT-GCT--TGT-----AAGTTTT------TTATA--TTGATGTTTTTAGTTTAACAATAAGAATGTACAAC-AAAAACATAAA-TAT-A-AAT-TTG-AACAC--CATA--TATGTAGAATTTTACATCACAAATGT-----------TA--AGT-TTGAACAAG--AA--------AAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACAAGAACGTAATATAATGAACATAGA-TAT-A-AAA---G-AACACATCAAACGTGTGTACAATTTAACattagccaaatacag
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTTGATG-TGTTCTTTTATATCTATGTTCATTATATTACGTTCTTGTC---AAGTTTTATC-TTACGTTTGTT--TTTG-TT-T--TATTTTCATGTTC-TTAATTTC--T-ATTCTTATTA--TTTA------A-TTG----TGTGTTCGTTAATTTTAT-----T--AGTT--TTAAGTTTTTT----TTATA--TTAATTATCTTAGTTGAACAATAAGAATTTAAAAAGAATAACAAAAC-TAT-A-AAATTTT-AACAC--CATA--TATGTACAATTTAACAACACCAATGTTAAGTTACATGTA--AGT-TTGGACAAA--AG--------CAAGAGTTATGCA--ATTAAACAACGTTCAGCCTGCCcaagttttatcttacgtttgtttttgttttattttcatgttcttaatttctattcttattatttaattgtgtgttcgttaattttattagttttaagttttttttatattaattatcttagttgaacaataagaatttaaaaagaataacaaaactataaaattttaacaccatatatgtacaatttaacaacaccaatgttaagttacatgtaagtttggacaaaagcaagagttatgcaattaaacaacgttcagcctgcctt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                           gttaaattgtacacacATG-T----TTTTATTTTTGTGTTGATTATTTTACATTTATGTTATAAAATGGTATATCTA----TATT--GTCT-TTGT--TGCTTTTATAGTC-TTAATTTT--T-ATTCTTATTG--GCTA------A-TTTAATTTGTATTCGTTTATTATATAT-GTT--CGTT--GTAAGTTTT------TTTTAAATCTATGTTCTTAGTTTAACAATAAGAATGTAAAAGGAATAACATAAA-TAT-A-AAA-TTT-AACAC--CATC--AATGTATAA-TTAACAACACAAATGT-----------TA--AGT-TTGGAAAAGAAAA--------AAAGAGTTATACA--ATGTTGCAACATTTGGCCTGCCtt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gttgaaattgtacatatATGTTC-TTAATTTT--TT-TTCTTATTGATTTTGTGTTCTA-TTCATTTTGTGTTCGTTAAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cTTTTATAT-TTT--TGTT--GTAAGTTTT------TT-TA--GTTATGTTCTTAGTTTAACAATAAGAATGTAAAATGAATACCATAAA-TAT-A-AAA-ATT-AAATC--CATA--TATGTACAATTAAACAACACAAGTGT-----------TA--AGT-TTGAAAATG--AA--------AATGAGTaaataaaacaaaaatacaacaaacatataaaaagtttttatatttttgttgtaagtttttttagttatgttcttagtttaacaataagaatgtaaaatgaataccataaatataaaaattaaatccatatatgtacaattaaacaacacaagtgttaagtttgaaaatgaaaatgagtaacccgcataccata
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTGTGTTT-TTAGTTTT--CTATTCGTATTG--TTCA------ACTTTCCATTGTGTTTGTTGATTTCAT---GTTCATGTTC-ATAATTTTTGTTT--TTATG--TTTATATACTTAGTT----AATAAAAATGTGAACTAAGGAATATAAA-TATTA-AAA-ACC-AACAA--CATG--TATGTA--TTTTTACAATACACATGC-----------TA--TGTATTGAAGAAG--AA--------AAAGAATTATACA--ATTAAGCAACGGTTGGtattattc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                       aATATTTTTGTTCATTAGTTTACATTCTTGTTGTAAAGTTTTAGATCTT----TATT---TTG-TC-TGTTGTTTTTATTTTCACTAATTGTAATTCTTATTATTA--TCTA------A-TTTAATTTGTGTTCGTTAATTGTGTAT-GTT--TGTT--ATAAGTTTTTTTTTATTATA--TTTATGT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCTT--TA--TTTA------A-TTTATTTTGTGTTTGTG---TTTATTT-GTT--TGTT--GTAAGTTTT------TT-------TATGTTCTTAGTTAAACAACAAGAGTGTAAAACGAACTATATAAA-TAT-A-GAA-CTT-AACAC--CTTA--AGTGTACAC-------------ATGT-----------TA--AAT-GTGAACAAG--AA--------ACAGAGTTGTACA--ATATTGAAACGTTTGACCTTCCAaacaattagtgtttatttactaaaaaaaac