lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                   33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                                                                                                                                                                                                                      11111                           5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555                   1111111                                                                                                                                                                                                                                                                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                 1111111                                     1              22222222                               66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666        11       5555555555555555555            2222  1       11                           33333333333                                               1           22       11           22   111        1              00000          1       4444     4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444                   0000000                 1             1     1  1   1    1                1     1                                1    1     1         222    4         1           1      222   999999     1  1   1      5555555    22   1         11      222                  11        4          
lowQualScore                  :                       7777777777               1  444444   1                    22 55555555      7777777 555  1   1 1      3333 1111111  8888 4 4444444 4444  4444     2    1    44     4  77777777      0 1              1 4 66  55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555        33       4444444444444444444     6      1111  0  33   33   2   7    7      6  44   22222222222       0  6             2         0 9   55   2 5  2      6 77       88       2   33   555  4     7              00000   6  6   7 6     0000     2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222          6    6   7777777      6          5             5     5  7   7    5  6             5     5     6          6           6   7  6 5     7   6 6   999    0         7           7      333   111111     5  5   5      9999999    33   5      6  22      999                  22        0          
lowQualScore                  :                       ..........               .  ......   .                    .. ........      ....... ...  .   . .      .... .......  .... . ....... ....  ....     .    .    ..     .  ........      . .              . . ..  ............................................................................................................................................................................................        ..       ...................     .      ....  .  ..   ..   .   .    .      .  ..   ...........       .  .             .         . .   ..   . .  .      . ..       ..       .   ..   ...  .     .              .....   .  .   . .     ....     ...................................................................          .    .   .......      .          .             .     .  .   .    .  .             .     .     .          .           .   .  . .     .   . .   ...    .         .           .      ...   ......     .  .   .      .......    ..   .      .  ..      ...                  ..        .          
lowQualScore                  :                       3333333333               4  333333   5                    00 33333333      1111111 000  7   7 7      7777 7777777  5555 0 2222222 5555  5555     2    6    77     8  88888888      5 4              8 7 11  66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666        88       8888888888888888888     0      8888  0  55   88   5   2    0      7  77   00000000000       7  7             0         7 0   55   5 5  5      0 55       00       5   00   555  0     0              00000   0  0   0 0     0000     0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000          0    0   0000000      0          0             0     0  0   0    0  0             0     0     0          0           0   0  0 0     0   0 0   000    0         0           0      000   000000     0  0   0      0000000    00   0      0  00      000                  00        0          
consensus                     :     TGAATGAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCGCGCAA--A-------GATTAAT-----GAA--CGT-GAT-G-ATGACA----A-----N-AA----T-A---T---A----TT----AAATA-AATATGGTT-AAAAATNTA---G----TAAAACTATTTACAAATAAATAAATGA--AA-AC-AN-TTACGA-A-----TA--AATAAA-TGAA-A--AT--AAA--CAATAN-----TAAATA--AGTG--AACAA----TCAATAA--TAT-A-AT-----A--ATT-ATACC--TAAAAATGA--T--AAAACTTTAACCTC----TTTAANNAA-----AACA-GAAATG---TATGTTA-ACATCAATTT--TGTCAAAAA----GTNCNTTC-----ATGCTATCGACTTTAAAG-TACTTTT--CTCGCATNGGAGCGAAGTCAACGTAGTC-A-TCA----GTATGTGTTTNACAGTAAGCGGTGTAAAACAGGGTATACANNCTGNAACGCGTTCACATCTTTTAAAAGATGTGAACGCGTTNCAGNNNGTNTGCCCTGTTCTACACCGAGC-----CAACTTTTTCACAACGAAAAATCCTAT--------TGC-----------------TTTAA--A-ATGCAATTTTTTATTTA-------------AGAGGACTGCTATGATCTATAAAATTAATATACTTATTAATATTAGATTTAAAATCTTTAAAATGCTGTTAAAAATTAGTAATATTCAAGCTGAAGGCGGCTTTCGCAGCCTTATTAGCTTTATCGTCTCCACGGAGTCCTGTATGACCAGGTGACCAG-AGAAAACAAAAGTATTATCTTAACATAGTAGATTTTAAACATTTAGTTCAAATTTGAAGCAAAAATGAGGGATATAATCTTTTATGTCATCTAAAACTTGAAGAGATGAAAGTGGATCAGAAAA-ATAATAAACT
Reference ( gi|1 )            :     TGAATGAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCGCGCAA--A-------GATTAAT-----GGA--CGT-GAT-G-ATGACA----A-----A-AA----T-A---T---A----TT----AAATA-AATACGGTT-AAAAATTTA---T----TAAAACTATTTACAAATAAATAAATGA--AA-ATTAT-TTACAA-A-----TA--AATAAA-TGAA-A--A---AAA--CAACAA-----CAAATA--AGTG--AACAAG--GTCAATAA--TAT-A-AT-----A--ATT-GTAC---TAAAAATGA--TTAAAAAGCTTAACCTC----TTTAAGGAA-----ACC---AAATA---TATGTGAAACATCAATTT--TATCAAATA----ATTCATTC-----ATACTGTCGACTCTGTAG-TATTTTT--CTCGCATTGGAGAAAAGTCCACACAGTCGA-TCA----GTATGTGCTTCACAGTAAGCGGTGCAAAACAGGGCACACACTCTGGAACAGGTTCACGT--TTTAAAAGATATGAATGTGT-ACAGCGCGTATGCCCAATTCTACACCGAGCTAATACAATTTCTTCTCGACGAATACACCTATTGCTAGGATGCCATTCGCCAAGTTTTGGTTTAATAACATGTAATTTGTTATTTATAGCAAGATCCCAAGAGGACTGCCATGACCTA---AA--AATATATTTATTAATATGAGATTTAAAATCTGTAAAAGGCAGTTTAAAAGTAATAATATTCAAGCTTAAGGCTGCTTTTGCAGCCTTATCAGCTTTATCGTTTCCTCGAATTCCTGAATGGCTAGGAAGCCAGCAGAAAACAATAGTATTATCTTTACATAGAACATTGT----ATTTATTTAAAAGTTGAAG-AACAA-GAGGATTATCATCTTTCATACCATCTATGGCTTGAAGAGATGAAAGTGAGTCAGAAAATATAATAAACT
gi|3                          :     TGAATGAATGGTGTTATA----------TGGCACGCTGACACA-CA------AAT-AGGTCATTTTGTATGTGCAA--A-------GTCTAAT-----GAA--TGT-GAT-G-GTGACA----A-----T-AA----T-A---T---ATATGTT----AAATA-A----GGTTAAAAAATATA---G----TTAAAC----TACAAATAAATAAATAAATAA-ATCGA-TGATAC-A-----TA--CATTAA-T-----------CAA--CAATAT-----TAGATAATAGTA--ATTTAA--ATTATTAACCTATCA-AT-----GCCCTC-CTCC---CAAAAATGA--T--AAAATTTGAACTTC----TTTAA--AA-----ACTAAAAAATG---TATGTT--ACATCAATTT--TGTCAAAAA----GTGCTTTC-----ATACTACCAACTTTAAAG-CACTTTT--CTTGCATGGAAGCAAAGACAACCCAGTCTT-TCA----ATATGTGTTTGACAGTAAGCGGTGCAAAACAAGGTATACA
gi|14                         :    aTGAATGAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCGCGCAA--A-------GATTAAT-----GGA--CGT-GAT-G-ATGACA----A-----A-AA----T-A---T---A----TT----AAATA-ataggatttatttta
gi|17                         : tgaaTGAATGAATGATGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCGCGCAA--A-------GATTAAT-----GGA--CGT-GAT-A-ATGACA----A-----A-AA----T-A---T---
gi|6                          :    aTGAATGGCTGGTATTTTA----------CGGATCGTCGACACA-CA------AAT-AGGTCATTTTATGCATTAAA--A-------GATTAAT-----AAA--TGC-GAT-G-ATGACATATTA-----ATAA----T-A---T---A----TC----AAATA-AACATGGTT-GAAAATATA---G----TAAAACTATTTACAAATCAATAAATGA--AA-Aggtt
gi|15                         :    aTGAATGAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-ATGTCATTTTGTGCGCGTAA--A-------GATTAAT-----GAA--TG----T-G-ATGACA----A-----A-AATAATT-A---T---A----TT----AAATA-Agaatggatgagatatacattataaaacgattatagacaaaagaaataaaaatta
gi|5                          :     TAAATGAATAATGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AGATTATTTTGTGCACGCCT--A-------GAATAAT-----GAA--TTT-GAT-T-ATGACA----A-----T-GC----T-G---T---T----TC----AAATA-AATATAGTT-AAAAATATA---G----TTCAATTATTTACAAGTAAATAAATGA--AA-A-AAG-TGACAA-C-----TA--AAC--A-TTAA-A--A---------TATAT-----TAGATA--A-TG--CATA------CTATTA--TTC-A-AC-----A--ATT-A-ACCCGTCAACA-GACTTTCAA---TTTAAACTG----TTTAAAGAGTTTATAAC---AAATG---TATTTT---CATTAATTT--TGTCAAAAT----GTTCTTTC-----ATGATATCAACTTTTGAG-TACATTT--ATCTGATCGGA
gi|9                          :   aaTAAATAAATGTTGTATTA----------CTGCAC-TCGACACA-TA------AAT-AAGTCATTTTGTGCATGCAA--A-------AATAAAT-----CAA--TGT-CAT-T-A----A----A-----A-TA----TCA---T---A----TT----AAATA-AATGTGGTT-AGAAATATA---G----TAAAATTAATTACATATAAATAAATAA--A---------TACAATA-----TA--AAT--A-TGAATA--ATTCAAA--CA
gi|27                         :  gaaTGAATGAATGGTGTTTTA----------TGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AAGTCATTTTGTGCGCGCAga
gi|12                         :   aaTGACTGAATTGTGTTTTA----------CAA-ATGTCACCACA-TA------AGT-AAGTCATTTTGTGCGCGCAA--A-------TGTTAAA-----AAA--TGTGGAT---ATGACA----A-----T-AA----T-A---G---A----TT----TAATG-AATATGGCT--AAAATACA---G----TAAAACCATT
gi|22                         :   aaTGAATGAATAGTGTTTTA----------CG--------ACACA-TG------AAT-AGGCCATTTTGTACGTGCAACCA-------GACGAAT-----------GT-AAT-G-ATGACA----A-----
gi|30                         :    aTGAATGAATGGTGTT------------------CATTGACACA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCATGTAA--A-------G
gi|4                          :  gaaTGAATGAACGTTGTTTTA----------CGGCATATCGACACA-TA------GTT-AGGTATTTTTGTGTAAGC-------------CTTAA--------A--TGT-AAT-GCATGTTG----A-----A-AT----G-A---T---A----AT----AGATG-AA-----CT-AA----TTA---TTG--TAAATATATTTA-AAATAAAT-----A--AA-GCTAT-TTAC------------------A-TGAA-A--AT--AAG--CGATTA-----AAAAGA--A-TG--AATA-----T--ATAA--TAT-ATATTTAGGA--ATTAATACT--TAAAAATG-------GAACCGTCACCTCGAGGTGTAATTAA-----AACATGAAATACTTTAT-TAAAAGAGTAATTTAATATCAAATATGTCAGACATTTACGAAATACTATTGACTA-ATAATTATTCGTGACTCTCATAGGAGCGAAGTCAATGTAGT--ATTTATATTGTATGTTTTTCGCAGTAGGCATTGTA
gi|7                          :   caTGAGTGAATAGTGTCTTAAATAGTTTCCTGGCATGTTGACACA-TG------AGA-AGGTCATTTTCTATGCATGA--A-------TAT-AATATGGGGGA--TAT-GAC-G-GTGAGA----A-----A-AG----C-A---T---A----TC--------A-AATA----------ATTT----T----T-------TTT-------------TGA--AA-ATTACATCACAA-A------A--AACAAT-TACA-A--AT--AAA--TTG-AA-----TAAAGA--AATG--AACA
gi|13                         :  taaTGACTGAATTGTGTTTTA----------CA---------------A------AA----GTTATTTTGTGCGGGCAA--A-------TGTTAAA-----GAA--TGT-GAA-T-ATTACA----A-----T-AA----T-A---G---A----TT----CAATG-AATATGGCT--AAAATACA---G----TAAAACTATT--CAAAgctaaaagt
gi|29                         :   aaTAAATGAACGGTGTTTTA----------TGATATGTAAACACA-TA------AAC-AGGTCGTTTCGT
gi|26                         :   aaaGAATGAATGGTGTTTTA----------CAGCACGTCGACACATTAAACATTAAT-AGGCCATTTTGTGCATGCGA--atg
gi|28                         :       AATGAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGATGCA-TA------AAT-ACGTCATTTTGTGCGCGCAA--A-------
gi|16                         :      aAATGAATAATGTTTTA----------CGGCAGATTGAAACA-TA------AGT------ATTTTATGCACGCAA--G-------GAT--AC-----GGAATC-T-GAT-G-ATGACA----A-----T-AA----T-ACATT---A----CT----AAATA-AA
gi|21                         :     aattTGCATGGTGTTAGA----------CGGCACGTCGACATA-CA------ACT-ACGTCATTTTGTGCATGTAc
gi|11                         :         acAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGACGGC-TT------ATT-AAGTTGTTTTGTGCGCGC-------------GTTAAT-----T----CCT-GCT-A-AAGAT-----A-----C-AA----T-----T---G----TC----GAATATAAAACAATT-GATTATTTATATT----TAAAACtctaaacacaaacacctgata
gi|23                         :    atgaatatgcaGTGTTTTA----------CGACACGTCGACATA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCGCGCAA--T-------AGTTAAaaaata
gi|20                         :                TGTTTTA----------CAGAAAGTCATAACA-TA------AAT-AGGTCATTATGTACGTACAA--AGATTAATGATTAAT-----GGG--TGT-GAT-G-ATAGCA----A-----aacaacaacaaata
gi|34                         :                TGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-T
gi|2                          :                      A----------CGGCACATCGACACA----------AT-AGGTCATTTTTTGCGCGCAA--A-------GATTAAT-----GAA--TGG-GAT-G-ATGACG----A-----T-AC----T-A---G---A----TT----AAATA-AATATGGTT-AAAAATTAA---G----TAAATCTAATCACCAATGAATAA-TGA--AGGA--AC-CTATGA-AGGGGATATTGATAAA-TGAT-ATCA---AAA--TAGCAC-----TAAA-----GT---AACGGGTTGTCAA----------------------------C---TAAAAATAA--T-----A---TAATCTT----TTT--GAAA-----A-----AAA------ATGTTA--TATCAACGT--TATTAAA------AT-CGTCC-----ATGCTATCGGCCCTGAAG-TACCTTT--CTCGCATTGAGCAAATGTCCACATAGTCGA-TCA----GTATGTGCTTAACAGTAAGCGGTGTAAAACAGGGTAAACACTCTGGAATAGGTTCACAT--TTTAAAAGATATGAATGCGT-ACAGCTGGTATGCCCTATTCTACACCGAGC-----CAACTTTTTCACAACGAAAAATCCTAT--------TGC-----------------TTTAA--A-ATGCAATTTTTTATTTA-------------AGAGGACTGCTATGATCTATAAAATTAATATACTTATTAATATTAGATTTAAAATCTTTAAAATGCTGTTAAAAATTAGTAATATTCAAGCTGAAGGCGGCTTTCGCAGCCTTATTAGCTTTATCGTCTCCACGGAGTCCTGTATGACCAGGTGACCAG-AGAAAACAAAAGTATTATCTTAACATAGTAGATTTTAAACATTTAGTTCAAATTTGAAGCAAAAATGAGGGATATAATCTTTTATGTCATCTAAAACTTGAAGAGATGAAAGTGGATCAGAAAA-ATAATAAACTtacacatta
gi|25                         :                              ttgaatgaCGTTGACACG-CA------GGG-AGGTCATTTTGTACTCGCAG--A-------TGTAAAT-----GTA--CGT-GAT-G-GTGACA----
gi|10                         :                                        TCGACACA-CA------AAT-AGGTAATTTTGTGCGCCCAA--A-------GATAAAT-----GAA--TGT-GATCA-AT--CA----ATTGTTT-AA----T-A---TCCGA----TTTCTGAGATA-CAT---GTT-ACAAATTTA---CAGTGTGAAACAA--AACAAATAA--AAAT-A--AA-AC--T-TTATGA-A-----TA--gtatta
gi|18                         :                                          ctCACA-TA------AATTAGGACATTTTATGTGTGAAA--A-------TATTAAT-----GAA--AGT-GGT-G-ATGACA----A-----T-AA----TGA---T---A----T------AAT----TA---TT-AAAAAT
gi|8                          :                                     gaaaattgtCA-TA------AAT-AGGTCATTTT-TGAGTGCTA--A-------GATCAAT-----GAA--TGC-GAT-G-ATGACA----A-----T-AA----T-A---A---A----TT----AAATA-AATATGGTT-AAAAATGTA---T----TAAAGCTATTTACAAATAAATAAAACA--AA-----------AA-A-----TC--AATAAAGTGAA-A--A---GAAATCAATAATATACTAAATT--GGTACTAACAA----TCAATAA--aaa
gi|32                         :                                                                     TTGTGCGCGCAA--A-------GATTAAT-----GGA--CGT-GAT-G-ATGACA----A-----A-AA----T-A---T---A----TT----acctgt
gi|31                         :                                                                      TGTGCGCGCAA--A-------GATTAAT-----GAA--TG----T-G-ATGACA----A-----A-AATAATT-A---T---A----TT----AAATA-AAT
gi|19                         :                                                                       GTGCGCATGA--A--------ATTAAC-----G-A--TGC-AGT-G-ATGACG----A-----T-AA----T-A---A---G----TT----GAATT-AATATGGTT-A----TTTA---TAAAGTAAAACTATTTGCAAATAGGTA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CGGTGTAGAATAGGGCATACCAGCTGTA-CGCATTCATATCTTTTAAAA--TGTGAACCTATTCCAGAGTGTTTACCCTGTTTTACACCG

Unaligned ( gi|24 ): TGTTACGAATGAAATTTGGAATTATTAACAAACAATTTACATGACCAAATCTATTTGTTATAAATAA
Unaligned ( gi|33 ): TAACTTAACTGTAAATACCATCATTGAAATTAACTATATT

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                    555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555        33333333333333       1111     88888888888888888888888888888888888       222                22222        22222         1111          22222                1            33   2222                                                 22       444                   333              11             55555                              11            6666666    2           8888888888888888888888     22             2            222     44444444444        888888888                                                                                               2                                    2222                   1     1                                                          2          
lowQualScore                  :                              7777777777               1  444444   1                  222  22 1       44444  5555555 2  1   1      44444  555555  3 1 5555555  666666666          0   4    2 1  88888        66 1              4    888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888      0 88888888888888       7777     22222222222222222222222222222222222       444                44444 1      00000         3333       8  00000       1 3   2  0   3  4     44   1111          1                         4   22   1   11       666          6    6   222   333  1     00             00000          4       4 77        88        3   5555555    0      2  2 7777777777777777777777     77 3       3   0     88     111     99999999999        000000000  4   4    3                2     2                                4    2     4         4      0         4           4      4 2   3 4444     2  2   3      5  3  5     4   3                 4                              0          
lowQualScore                  :                              ..........               .  ......   .                  ...  .. .       .....  ....... .  .   .      .....  ......  . . .......  .........          .   .    . .  .....        .. .              .    ........................................................................................................................      . ..............       ....     ...................................       ...                ..... .      .....         ....       .  .....       . .   .  .   .  .     ..   ....          .                         .   ..   .   ..       ...          .    .   ...   ...  .     ..             .....          .       . ..        ..        .   .......    .      .  . ......................     .. .       .   .     ..     ...     ...........        .........  .   .    .                .     .                                .    .     .         .      .         .           .      . .   . ....     .  .   .      .  .  .     .   .                 .                              .          
lowQualScore                  :                              0000000000               4  111111   4                  333  00 5       33333  7777777 9  7   7      33333  333333  8 9 2222222  222222222          1   3    9 0  11111        88 8              8    444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444      8 00000000000000       0000     00000000000000000000000000000000000       222                44444 0      00000         6666       0  00000       0 2   0  0   0  2     00   2222          0                         7   00   0   00       000          0    0   000   000  0     00             00000          0       0 00        55        0   0000000    0      5  5 5555555555555555555555     55 0       0   0     00     000     00000000000        000000000  0   0    0                5     5                                0    5     0         0      0         0           0      0 5   0 0000     5  5   0      0  0  5     0   0                 0                              0          
consensus                     :            TGAATGAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCGCGC---AA--A-GATTAAT-----GA-------ATGT-GAT-GATGAC-----AA-----TAA-T-A---T---AT----T----AAATAAATATGGTTAAAAA-TATA----GTAAAACTAT-TTACAAATAAATAAATGAAAA-NANT-TACGA---ATAA-A-T----AAA-TGA--A-AAT--AAA-CA-----ATANTAAATAA--G--TG--A---ATAA--TCAATAATNTA-AC-----AA-T----T-GT-ACC--TAAAAATGA---T--AAAA-CTTAACCTC----TTTAAAGAA-----AAC--A--AAAT--------------GTATGTT-AACATCAATTTTGTCAAAAAGTTCNTTCATG-----CTATCGACTCTGAAGTACTT-TT-----CTCGCATNGGAGCAAA-GTCNACGCAGTCGNTCA----GTATGTGCTTNACAGTAAGCGGTGCAAAACAGGGTANACACTCTGGAACAGGTTCACGT-TTTTAAAAGATATGAATGCGTTACAGCNNGTATGCCCNATTCTACACCGAGCTAATACAACTTCTTCNCGACGAANANNCCTATTGCTTTAGGATGCNATTCGCCAAGTTTTGGTTTAANAGNATGTAATCTGCTATTTATAGCAAGATCCCAANAGGACTGNCATGACCTANNAATATTAGATTTATTAATATGAGNTTTAAAATCTGTAAAAGGCNGTTNAAAANTAGTAATATTCAAGCTNAAGGCNGCTTTCGCAGCCTTATCAGCTTTATCGTCTCCNCGGANTCCTGNATGGCCAGGNGGCCAGCAGAAAACAANAGTATTATCTTNACATAGNANATTNTAAACATTTANTTNAAANTTGAAGCAANAATGAGGGNTATNATCTTTCATGCCATCTANGGCTTGAAGAGATGAAAGTGGGTCAGAAAATATAATAAACT
Reference ( family-864 )      :            TGAATGAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCGCGC---AA--A-GATTAAT-----GA-------ACGT-GAT-GATGAC-----AA-----NAA-T-A---T---AT----T----AAATAAATATGGTTAAAAA-TNTA----GTAAAACTAT-TTACAAATAAATAAATGAAAA-CANT-TACGA---ATAA-A-T----AAA-TGA--A-AAT--AAA-CA-----ATANTAAATAA--G--TG--A---ACAA--TCAATAATATA-AT-----AA-T----T-AT-ACC--TAAAAATGA---T--AAAACTTTAACCTC----TTTAANNAA-----AAC--A-GAAAT--------------GTATGTT-AACATCAATTTTGTCAAAAAGTNCNTTCATG-----CTATCGACTTTAAAGTACTT-TT-----CTCGCATNGGAGCGAA-GTCAACGTAGTC-ATCA----GTATGTGTTTNACAGTAAGCGGTGTAAAACAGGGTATACANNCTGNAACGCGTTCACATCTTTTAAAAGATGTGAACGCGTTNCAGNNNGTNTGCCCTGTTCTACACCGAGC-----CAACTTTTTCACAACGAAAAATCCTATTGCTTTAAAATGCAATT-------TTTT-ATTTAAGAGGA------CTGCTAT---------GATCT--ATAAAATTAATAT-ACTTATTAATATTAGATTTA--AA-AT---CTTTAAAAT---------GCTGTTAAAAATTAGTAATATTCAAGCTGAAGGCGGCTTTCGCAGCCTTATTAGCTTTATCGTCTCCACGGAGTCCTGTATGACCAGGTGACCAG-AGAAAACAAAAGTATTATCTTAACATAGTAGATTTTAAACATTTAGTTCAAATTTGAAGCAAAAATGAGGGATATAATCTTTTATGTCATCTAAAACTTGAAGAGATGAAAGTGGATCAGAAAA-ATAATAAACT
gi|1                          :            TGAATGAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCGCGC---AA--A-GATTAAT-----GG-------ACGT-GAT-GATGAC-----AA-----AAA-T-A---T---AT----T----AAATAAATACGGTTAAAAA-TTTA----TTAAAACTAT-TTACAAATAAATAAATGAAAATTATT-TACAA---ATAA-A-T----AAA-TGA--A-AA---AAA-CA-----ACAACAAATAA--G--TG--A---ACAAGGTCAATAATATA-AT-----AA-T----T-GT-A-C--TAAAAATGA---TTAAAAAGCTTAACCTC----TTTAAGGAA-----ACC-----AAAT--------------ATATGTGAAACATCAATTTTATCAAATAATTCATTCATA-----CTGTCGACTCTGTAGTATTT-TT-----CTCGCATTGGAGAAAA-GTCCACACAGTCGATCA----GTATGTGCTTCACAGTAAGCGGTGCAAAACAGGGCACACACTCTGGAACAGGTTCACG--TTTTAAAAGATATGAATGTG-TACAGCGCGTATGCCCAATTCTACACCGAGCTAATACAATTTCTTCTCGACGAATACACCTATTGC--TAGGATGCCATTCGCCAAGTTTTGGTTTAATAACATGTAATTTGTTATTTATAGCAAGATCCCAAGAGGACTGCCATGACCTAAAAATAT---ATTTATTAATATGAGATTTAAAATCTGTAAAAGGCAGTTTAAAAGTAATAATATTCAAGCTTAAGGCTGCTTTTGCAGCCTTATCAGCTTTATCGTTTCCTCGAATTCCTGAATGGCTAGGAAGCCAGCAGAAAACAATAGTATTATCTTTACATAGAACATTGT----ATTTATTTAAAAGTTGAAG-AACAA-GAGGATTATCATCTTTCATACCATCTATGGCTTGAAGAGATGAAAGTGAGTCAGAAAATATAATAAACT
gi|10                         :                                               TCGACACA-CA------AAT-AGGTAATTTTGTGCGCCC---AA--A-GATAAAT-----GA-------ATGT-GATCAAT--C-----AATTGTTTAA-T-A---TCCGAT----TTCTGAGATACAT---GTTACAAA-TTTACAGTGTGAAACAA---AACAAATAA--AAAT-AAAA-C-TT-TATGA---ATA
gi|11                         :                ctAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGACGGC-TT------ATT-AAGTTGTTTTGTGCGCGC---
gi|12                         : atgaatatgcaTGACTGAATTGTGTTTTA----------CAA-ATGTCACCACA-TA------AGT-AAGTCATTTTGTGCGCGC---AA--A-TGTTAAA-----AA-------ATGTGGAT--ATGAC-----AA-----TAA-T-A---G---AT----T----TAATGAATATGGCT-AAAA-TACA----GTAAAACCAT-Tgttaattcctgctaaagatacaattgtcgaatataaaacaattgattatttatatttaaaacaaaata
gi|13                         :          aaTGACTGAATTGTGTTTTA----------CA---------------A------AA----GTTATTTTGTGCGGGC---AA--A-TGTTAAA-----GA-------ATGT-GAA-TATTAC-----AA-----TAA-T-A---G---AT----T----CAATGAATATGGCT-AAAA-TACA----GTAAAACTAT-T--CAAA
gi|14                         :          aaTGAATGAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCGCGC---AA--A-GATTAAT-----GG-------ACGT-GAT-GATGAC-----AA-----AAA-T-A---T---AT----T----AAATA
gi|15                         :        tgaaTGAATGAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-ATGTCATTTTGTGCGCGT---AA--A-GATTAAT-----GA-------ATGT-GAT-GACAAA-----AA-----TAATT-A---T---AT----T----AAATAA
gi|16                         :              AATGAATAATGTTTTA----------CGGCAGATTGAAACA-TA------AGT------ATTTTATGCACGC---AA--G-GA-TACG-----GA-------ATCT-GAT-GATGAC-----AA-----TAA-T-ACATT---AC----T----AAATAAA
gi|17                         :        aattTGAATGAATGATGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCGCGC---AA--A-GATTAAT-----GG-------ACGT-GAT-AATGAC-----AA-----AAA-T-A---T---c
gi|18                         :                                                  aCACA-TA------AATTAGGACATTTTATGTGTGA---AA--A-TATTAAT-----GA-------AAGT-GGT-GATGAC-----AA-----TAA-TGA---T---AT----------AAT---TA---TTAAAAA-Tggtt
gi|19                         :                                                                     gaaaattgtGTGCGCAT---GA--A--ATTAAC-----GA--------TGC-AGT-GATGAC-----GA-----TAA-T-A---A---GT----T----GAATTAATATGGTTATTTA-TAAA----GTAAAACTAT-TTGCAAATAGGTAaaa
gi|2                          :                             A----------CGGCACATCGACACA----------AT-AGGTCATTTTTTGCGCGC---AA--A-GATTAAT-----GA-------ATGG-GAT-GATGAC-----GA-----TAC-T-A---G---AT----T----AAATAAATATGGTTAAAAA-TTAA----GTAAATCTAA-TCACCAATGAATAA-TGAAGG-AACC-TATGA---AGGGGA-T----AT--TGA------T--AAA-TG-----ATATCAAA----------------ATAG---CACTAAAGTA-AC-----GGGT----T-GTCAAC--TAAAAATAA---T--A------TAATCTT----TTTGAAAAA-----AA--------------------------ATGTT-A-TATCAACGTTATTAAAA---TCGTCCATG-----CTATCGGCCCTGAAGTACCT-TT-----CTCGCATTG-AGCAAATGTCCACATAGTCGATCA----GTATGTGCTTAACAGTAAGCGGTGTAAAACAGGGTAAACACTCTGGAATAGGTTCACAT--TTTAAAAGATATGAATGCGT-ACAGCTGGTATGCCCTATTCTACACCGAGC-----CAACTTTTTCACAACGAAAAATCCTATTGCTTTAAAATGCAATT-------TTTT-ATTTAAGAGGA------CTGCTAT---------GATCT--ATAAAATTAATAT-ACTTATTAATATTAGATTTA--AA-AT---CTTTAAAAT---------GCTGTTAAAAATTAGTAATATTCAAGCTGAAGGCGGCTTTCGCAGCCTTATTAGCTTTATCGTCTCCACGGAGTCCTGTATGACCAGGTGACCAG-AGAAAACAAAAGTATTATCTTAACATAGTAGATTTTAAACATTTAGTTCAAATTTGAAGCAAAAATGAGGGATATAATCTTTTATGTCATCTAAAACTTGAAGAGATGAAAGTGGATCAGAAAA-ATAATAAACT
gi|20                         :               ttgaatgaTGTTTTA----------CAGAAAGTCATAACA-TA------AAT-AGGTCATTATGTACGTAC---AA--A-GATTAAT-----GATTAATGGGTGT-GAT-GATAGC-----AA-----
gi|21                         :                TGCATGGTGTTAGA----------CGGCACGTCGACATA-CA------ACT-ACGTCATTTTGTGCATGT---A
gi|22                         :          acTGAATGAATAGTGTTTTA----------CG--------ACACA-TG------AAT-AGGCCATTTTGTACGTGC---AACCA-G----AC-----GA-------ATGT-AAT-GATGAC-----AA-----tctaaacacaaacacctgata
gi|23                         :                     aGTGTTTTA----------CGACACGTCGACATA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCGCGC---AA--T-AGTTAA
gi|25                         :                                             CGTTGACACG-CA------GGG-AGGTCATTTTGTACTCGC---AG--A-TGTAAAT-----GT-------ACGT-GAT-GGTGAC-----AG-----TAT-T-A---aacaacaacaaata
gi|26                         :             GAATGAATGGTGTTTTA----------CAGCACGTCGACACATTAAACATTAAT-AGGCCATTTTGTGCATGC---GA--
gi|27                         :            TGAATGAATGGTGTTTTA----------TGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AAGTCATTTTGTGCGCGC---A
gi|28                         :            aaAATGAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGATGCA-TA------AAT-ACGTCATTTTGTGCGCGC---AA--A-
gi|29                         :           aTAAATGAACGGTGTTTTA----------TGATATGTAAACACA-TA------AAC-AGGTCGTTTCGT
gi|3                          :         aaaTGAATGAATGGTGTTATA----------TGGCACGCTGACACA-CA------AAT-AGGTCATTTTGTATGTGC---AA--A-GTCTAAT-----GA-------ATGT-GAT-GGTGAC-----AA-----TAA-T-A---T---ATATGTT----AAATAA----GGTTAAAAAATATA----GTTAAACTA-----CAAATAAATAAATAAATA--AAT---CGATG-ATAC-A-T----ACA-TTA--A---T--CAA-CA-----ATATTAGATAATAG--TA--ATTTA-AA--TTATTAACCTA-TC-----AA-TGCCCT-CC-TCC--CAAAAATGA---T--AAAATTTGAACTTC----TTTAA---A-----AACTAA-AAAAT--------------GTATGTT-A-CATCAATTTTGTCAAAAAGTGCTTTCATA-----CTACCAACTTTAAAGCACTT-TT-----CTTGCATGGAAGCAAA-GACAACCCAGTCTTTCA----ATATGTGTTTGACAGTAAGCGGTGCAAAACAAGGTATACAatg
gi|30                         :           aTGAATGAATGGTGTT------------------CATTGACACA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCATGT---AA--A-Gataggatttatttta
gi|31                         :                                                                          gaaTGTGCGCGC---AA--A-GATTAAT-----GA-------ATGT-GAT-GACAAA-----AA-----TAATT-A---T---AT----T----AAATAAAT
gi|32                         :                                                                            TTGTGCGCGC---AA--A-GATTAAT-----GG-------ACGT-GAT-GATGAC-----AA-----AAA-T-A---T---AT----T----
gi|34                         :                       TGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-T
gi|4                          :            TGAATGAACGTTGTTTTA----------CGGCATATCGACACA-TA------GTT-AGGTATTTTTGTGTAAGCCTTAA--ATG--TAAT-----GC-------ATGT---T-GA-AAT-----GA-----TAA-T-A---G---AT----G----AACTAATTATTGT---AAA-TATA-------------T-TTA-----AAATAAATAAAGC-TATT-TAC-------------------A-TGA--A-AAT--AAG-CG-----AT--TAAA-AA--GAATG--A---AT-A--T--ATAATATATATTTAGGAA-T----TAAT-ACT--TAAAAATG--------GAACCGTCACCTCGAGGTGTAATTAA-----AAC--ATGAAATACTTTATTAAAAGAGTAATTT-AATATCAAATATGTCAGA-----CATTTACGAAATACTATTGACT----AATAATTATTCGTGACTCTCATAGGAGCGAA-GTCAATGTAGTA-TTTATATTGTATGTTTTTCGCAGTAGGCATTGTAtacacatta
gi|5                          :          caTAAATGAATAATGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AGATTATTTTGTGCACGC---CT--A-GAATAAT-----GA-------ATTT-GAT-TATGAC-----AA-----TGC-T-G---T---TT----C----AAATAAATATAGTTAAAAA-TATA----GTTCAATTAT-TTACAAGTAAATAAATGAAAA-AAGT-GACAA---CTAA-A-C------A-TTA--A-AAT-------------ATATTAGATAA-----TG--C---ATAC--T--ATTATTCA-AC-----AA-T----T-A--ACCCGTCAACA-GACTTT--CAA--TTTAAACTG----TTTAAAGAGTTTATAAC-----AAAT--------------GTATTTT---CATTAATTTTGTCAAAATGTTCTTTCATG-----ATATCAACTTTTGAGTACAT-TT-----ATCTGATCGGA
gi|6                          :          aaTGAATGGCTGGTATTTTA----------CGGATCGTCGACACA-CA------AAT-AGGTCATTTTATGCATTA---AA--A-GATTAAT-----AA-------ATGC-GAT-GATGACATATTAA-----TAA-T-A---T---AT----C----AAATAAACATGGTTGAAAA-TATA----GTAAAACTAT-TTACAAATCAATAAATGAAAA-GAATGGATGAGATATAC-A-TTATAAAA-CGA--T-TAT--AGA-CA-----A-AAGAAATAA--
gi|7                          :           aTGAGTGAATAGTGTCTTAAATAGTTTCCTGGCATGTTGACACA-TG------AGA-AGGTCATTTTCTATGCAT---GA--A-TA-TAATATGGGGG-------ATAT-GAC-GGTGAG-----AA-----AAG-C-A---T---AT----C----AAATAATTTT--TT------TTTG------AAAATTACATCACAA-----------AAAA-CAAT-TACAA---ATAA-ATT----GAA-TAAAGA-AAT--GAA-CA-----aaatta
gi|8                          :                                                  taaCA-TA------AAT-AGGTCATTTT-TGAGTGC---TA--A-GATCAAT-----GA-------ATGC-GAT-GATGAC-----AA-----TAA-T-A---A---AT----T----AAATAAATATGGTTAAAAA-TGTA----TTAAAGCTAT-TTACAAATAAATAAAACAAAA----------A---ATCA-A-T----AAAGTGA--A-AAG--AAATCAATAATATACTAAATTG--G--TACTA---ACAA--TCAATAAgctaaaagt
gi|9                          :            TAAATAAATGTTGTATTA----------CTGCAC-TCGACACA-TA------AAT-AAGTCATTTTGTGCATGC---AA--A-AATAAAT-----CA-------ATGT-CAT---TAA------AA-----TAT-C-A---T---AT----T----AAATAAATGTGGTTAGAAA-TATA----GTAAAATTAA-TTACATATAAATAAATAAATA-CAAT---------ATAA-A-T------A-TGA--ATAATTCAAA-CA-----acctgt

Unaligned ( gi|24 ): TGTTACGAATGAAATTTGGAATTATTAACAAACAATTTACATGACCAAATCTATTTGTTATAAATAA
Unaligned ( gi|33 ): TAACTTAACTGTAAATACCATCATTGAAATTAACTATATT

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444    111           33333333333333        2222222222222        1111         66666666666666666666666666666       222                111                                11                1                 2222                                                          4                    4                               22222                              11            3333333    1           333333       333333333     11        888888888888888888888                                                                                                                                1                                    2222                   1     1                                                          1          
lowQualScore                  :                              7777777777               1  444444   1                  222  22 1       44444  5555555   1 1   1       44444 55555555555  3 1 4444444  666666666              444    2    88888888888       4 0         3     3  0 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666    111  1      8 44444444444444      0 7777777777777 8      7777   3  1  33333333333333333333333333333       444                000   1               1 3          11       1 3      0   1  4    333   1111          1                         1                     0                    0      22        1              77777          1       1 22        88        1   1111111    5      1  1 000000       888888888     88 1      999999999999999999999            2  1          2     2  1   1    1                1     1                                1    1     1         1      5         1           1      1 1   1 4444     1  1   1      5  1  5     1   1                 1                              5          
lowQualScore                  :                              ..........               .  ......   .                  ...  .. .       .....  .......   . .   .       ..... ...........  . . .......  .........              ...    .    ...........       . .         .     .  . ...................................................................................    ...  .      . ..............      . ............. .      ....   .  .  .............................       ...                ...   .               . .          ..       . .      .   .  .    ...   ....          .                         .                     .                    .      ..        .              .....          .       . ..        ..        .   .......    .      .  . ......       .........     .. .      .....................            .  .          .     .  .   .    .                .     .                                .    .     .         .      .         .           .      . .   . ....     .  .   .      .  .  .     .   .                 .                              .          
lowQualScore                  :                              0000000000               4  111111   4                  333  00 5       22222  4444444   7 7   7       22222 66666666666  6 8 6666666  666666666              777    9    66666666666       5 5         6     9  7 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444    777  0      0 66666666666666      8 8888888888888 0      0000   8  4  88888888888888888888888888888       222                222   0               4 2          00       0 2      0   0  2    888   2222          0                         0                     0                    0      00        0              55555          0       0 00        55        0   0000000    0      0  0 000000       555555555     00 0      000000000000000000000            5  0          5     5  0   0    0                0     0                                0    0     0         0      0         0           0      0 0   0 0000     0  0   0      0  0  5     0   0                 0                              5          
consensus                     :            TGAATGAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCGCGC---AA--A-GATTAAT-----GA-------ATG-T-GAT-GATGACA-----A-----T-----AA-T-A---T---AT----T----AAATAAATATGGTT--AAAAA-TATA----GT-----AAAACTATTTACAAATAAA-TAAATGAAAA-NATT-TACGA---ATAA-AT----AAA-TGAA-AAT--AAA-CG-----ATANTAAATAA--G--TG--AAT---A-A--TCAATA---ATNTAACAA-T----T-GT-ACC--TAAAAATGA--T---AAAACTT-AACCTC----TTTAAAGAA-----AACA--AAAT--------------GTATGTT-AACATCAATTTTGTCAAAAAGTTCNTTCATACTATCGACTCTNAAGTACTTTT--CTCGCATNGGAGCAAA-GTCNACGCAGTCGNTCA----GTATGTGCTTNACAGTAAGCGGTGCAAAACAGGGTANACACTCTGGAACAGGTTCACG-TTTTAAAAGATATGAATGCG-TACAGCNNGTATGCCCNATTCTACACCGAGCTAATACAACTTCTTCNCGACGAANANNCCTATTGCTTTAGGATGCNATTCGCCAAGTTTTGGTTTAANAGNATGTAATCTGCTATTTATAGCAAGATCCCAANAGGACTGCCATGACCTAAAAATAT---ACTTATTAATATNAGATTTAAAATCTNTAAAANGCNGTTNAAAANTAGTAATATTCAAGCTNAAGGCNGCTTTCGCAGCCTTATCAGCTTTATCGTCTCCNCGGANTCCTGNATGGCCAGGNGGCCAGCAGAAAACAANAGTATTATCTTNACATAGNANATTNTAAACATTTANTTNAAANTTGAAGCAANAATGAGGGNTATNATCTTTCATGCCATCTANGGCTTGAAGAGATGAAAGTGGGTCAGAAAATATAATAAACT
Reference ( family-864 )      :            TGAATGAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCGCGC---AA--A-GATTAAT-----GA-------ATG-T-GAT-GATGACA-----A-----T-----AA-T-A---T---AT----T----AAATAAATATGGTT--AAAAA-TATA----GT-----AAAACTATTTACAAATAAA-TAAATGAAAA-NANT-TACGA---ATAA-AT----AAA-TGAA-AAT--AAA-CA-----ATANTAAATAA--G--TG--AAT---A-A--TCAATA---ATNTAACAA-T----T-GT-ACC--TAAAAATGA--T---AAAACTT-AACCTC----TTTAAAGAA-----AACA--AAAT--------------GTATGTT-AACATCAATTTTGTCAAAAAGTTCNTTCATGCTATCGACTCTGAAGTACTTTT--CTCGCATNGGAGCAAA-GTCNACGCAGTCGNTCA----GTATGTGCTTNACAGTAAGCGGTGCAAAACAGGGTANACACTCTGGAACAGGTTCACGTTTTTAAAAGATATGAATGCGTTACAGCNNGTATGCCCNATTCTACACCGAGCTAATACAACTTCTTCNCGACGAANANNCCTATTGCTTTAGGATGCNATTCGCCAAGTTTTGGTTTAANAGNATGTAATCTGCTATTTATAGCAAGATCCCAANAGGACTGNCATGACCTANNAATATTAGATTTATTAATATGAGNTTTAAAATCTGTAAAAGGCNGTTNAAAANTAGTAATATTCAAGCTNAAGGCNGCTTTCGCAGCCTTATCAGCTTTATCGTCTCCNCGGANTCCTGNATGGCCAGGNGGCCAGCAGAAAACAANAGTATTATCTTNACATAGNANATTNTAAACATTTANTTNAAANTTGAAGCAANAATGAGGGNTATNATCTTTCATGCCATCTANGGCTTGAAGAGATGAAAGTGGGTCAGAAAATATAATAAACT
gi|1                          :            TGAATGAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCGCGC---AA--A-GATTAAT-----GG-------ACG-T-GAT-GATGACA-----A-----A-----AA-T-A---T---AT----T----AAATAAATACGGTT--AAAAA-TTTA----TT-----AAAACTATTTACAAATAAA-TAAATGAAAATTATT-TACAA---ATAA-AT----AAA-TGAA-AA---AAA-CA-----ACAACAAATAA--G--TG--AAC---A-AGGTCAATA---ATATAATAA-T----T-GT-A-C--TAAAAATGA--TTAAAAAGCTT-AACCTC----TTT-AAGGA-----AACC--AAAT--------------ATATGTGAAACATCAATTTTATCAAATAATTCATTCATACTGTCGACTCTGTAGTATTTTT--CTCGCATTGGAGAAAA-GTCCACACAGTCGATCA----GTATGTGCTTCACAGTAAGCGGTGCAAAACAGGGCACACACTCTGGAACAGGTTCACG-TTTTAAAAGATATGAATGTG-TACAGCGCGTATGCCCAATTCTACACCGAGCTAATACAATTTCTTCTCGACGAATACACCTATTGC--TAGGATGCCATTCGCCAAGTTTTGGTTTAATAACATGTAATTTGTTATTTATAGCAAGATCCCAAGAGGACTGCCATGACCTAAAAATAT---ATTTATTAATATGAGATTTAAAATCTGTAAAAGGCAGTTTAAAAGTAATAATATTCAAGCTTAAGGCTGCTTTTGCAGCCTTATCAGCTTTATCGTTTCCTCGAATTCCTGAATGGCTAGGAAGCCAGCAGAAAACAATAGTATTATCTTTACATAGAACATTGT----ATTTATTTAAAAGTTGAAG-AACAA-GAGGATTATCATCTTTCATACCATCTATGGCTTGAAGAGATGAAAGTGAGTCAGAAAATATAATAAACT
gi|10                         :                                               TCGACACA-CA------AAT-AGGTAATTTTGTGCGCCC---AA--A-GATAAAT-----GA-------ATG-T-GATCAAT--CA-----ATTGTTT-----AA-T-A---TCCGAT----TTCTGAGATACAT---GTT--ACAAA-TTTACAGTGT-----GAAACAA--AACAAATAA---AAAT-AAAA-C-TT-TATGA---ATA
gi|11                         :                ctAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGACGGC-TT------ATT-AAGTTGTTTTGTGCGCGC----------GTTAAT-----TC-------CTGCT-AAA-GAT-ACA-----A-----TTGTCGAA-T-A---T---A----------AAACAA
gi|12                         : atgaatatgcaTGACTGAATTGTGTTTTA----------CAA-ATGTCACCACA-TA------AGT-AAGTCATTTTGTGCGCGC---AA--A-TGTTAAA-----AA-------ATG-TGGAT--ATGACA-----A-----T-----AA-T-A---G---AT----T----TAATGAATATGGCT---AAAA-TACA----GT-----AAAACCATTttgattatttatatttaaaacaaaata
gi|13                         :          aaTGACTGAATTGTGTTTTA----------CA---------------A------AA----GTTATTTTGTGCGGGC---AA--A-TGTTAAA-----GA-------ATG-T-GAA-TATTACA-----A-----T-----AA-T-A---G---AT----T----CAATGAATATGGCT---AAAA-TACA----GT-----AAAACTATT--CAAA
gi|14                         :          aaTGAATGAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCGCGC---AA--A-GATTAAT-----GG-------ACG-T-GAT-GATGACA-----A-----A-----AA-T-A---T---AT----T----AAATA
gi|15                         :        tgaaTGAATGAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-ATGTCATTTTGTGCGCGT---AA--A-GATTAAT-----GA-------ATG-T-GAT-GACAAAA-----A-----T-----AATT-A---T---AT----T----AAATAA
gi|16                         :              AATGAATAATGTTTTA----------CGGCAGATTGAAACA-TA------AGT------ATTTTATGCACGC---AA--G-GA-TACG-----GA-------ATC-T-GAT-GATGACA-----A-----T-----AA-T-ACATT---AC----T----AAATAAA
gi|17                         :        aattTGAATGAATGATGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCGCGC---AA--A-GATTAAT-----GG-------ACG-T-GAT-AATGACA-----A-----A-----AA-T-A---T---c
gi|18                         :                                                  aCACA-TA------AATTAGGACATTTTATGTGTGA---AA--A-TATTAAT-----GA-------AAG-T-GGT-GATGACA-----A-----T-----AA-TGA---T---AT----------AAT---TA---TT--AAAAA-TAggtt
gi|19                         :                                                                     gaaaattgtGTGCGCAT---GA--A--ATTAAC-----GA--------TG-C-AGT-GATGACG-----A-----T-----AA-T-A---A---GT----T----GAATTAATATGGTT--ATTTA-TAAA----GT-----AAAACTATTTGCAAATAGG-TAaa
gi|2                          :                             A----------CGGCACATCGACACA----------AT-AGGTCATTTTTTGCGCGC---AA--A-GATTAAT-----GA-------ATG-G-GAT-GATGACG-----A-----T-----AC-T-A---G---AT----T----AAATAAATATGGTT--AAAAA-TTAA----GT-----AAATCTAATCACCAATGAA-TAA-TGAAGG-AACC-TATGA---AGGGGAT----AT--TGA----T--AAA-TG-----ATATCAAA-------------AT---A-G---CACTA---AAGTAACGGGT----T-GTCAAC--TAAAAATAA--T---A-----T-AATCTT----TTTGAAAAA-----AA------------------------ATGTT-A-TATCAACGTTATTAAAA---TCGTCCATGCTATCGGCCCTGAAGTACCTTT--CTCGCATTG-AGCAAATGTCCACATAGTCGATCA----GTATGTGCTTAACAGTAAGCGGTGTAAAACAGGGTAAACACTCTGGAATAGGTTCACA-TTTTAAAAGATATGAATGCG-TACAGCTGGTATGCCCTATTCTACACCGAGC-----CAACTTTTTCACAACGAAAAATCCTATTGCTTTAAAATGCAATT-------TTTT-ATTTAAGAGGA------CTGCTAT---------GATCT--ATAAAATT-------------AATAT---ACTTATTAATATTAGATTTAAAATCTTTAAAATGCTGTTAAAAATTAGTAATATTCAAGCTGAAGGCGGCTTTCGCAGCCTTATTAGCTTTATCGTCTCCACGGAGTCCTGTATGACCAGGTGACCAG-AGAAAACAAAAGTATTATCTTAACATAGTAGATTTTAAACATTTAGTTCAAATTTGAAGCAAAAATGAGGGATATAATCTTTTATGTCATCTAAAACTTGAAGAGATGAAAGTGGATCAGAAAA-ATAATAAACT
gi|20                         :               ttgaatgaTGTTTTA----------CAGAAAGTCATAACA-TA------AAT-AGGTCATTATGTACGTAC---AA--A-GATTAAT-----GATTAATGGGTG-T-GAT-GATAGCA-----A-----
gi|21                         :                TGCATGGTGTTAGA----------CGGCACGTCGACATA-CA------ACT-ACGTCATTTTGTGCATGT---A
gi|22                         :          acTGAATGAATAGTGTTTTA----------CG--------ACACA-TG------AAT-AGGCCATTTTGTACGTGC---AACCA-G----AC-----GA-------ATG-T-AAT-GATGACA-----A-----tctaaacacaaacacctgata
gi|23                         :                     aGTGTTTTA----------CGACACGTCGACATA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCGCGC---AA--T-AGTTAA
gi|25                         :                                             CGTTGACACG-CA------GGG-AGGTCATTTTGTACTCGC---AG--A-TGTAAAT-----GT-------ACG-T-GAT-GGTGACA-----G-----T-----AT-T-A---aacaacaacaaata
gi|26                         :             GAATGAATGGTGTTTTA----------CAGCACGTCGACACATTAAACATTAAT-AGGCCATTTTGTGCATGC---GA--
gi|27                         :            TGAATGAATGGTGTTTTA----------TGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AAGTCATTTTGTGCGCGC---A
gi|28                         :            aaAATGAATGGTGTTTTA----------CGGCACGTCGATGCA-TA------AAT-ACGTCATTTTGTGCGCGC---AA--A-
gi|29                         :           aTAAATGAACGGTGTTTTA----------TGATATGTAAACACA-TA------AAC-AGGTCGTTTCGT
gi|3                          :         aaaTGAATGAATGGTGTTATA----------TGGCACGCTGACACA-CA------AAT-AGGTCATTTTGTATGTGC---AA--A-GTCTAAT-----GA-------ATG-T-GAT-GGTGACA-----A-----T-----AA-T-A---T---ATATGTT----AAATAA----GGTT--AAAAAATATA----GT-----TAAACTA----CAAATAAA-TAAATAAATA-AATC-GATGA----TAC-AT----ACA-TTAA---T--CAA-CA-----ATATTAGATAATAG--T---AATTTAA-A--TTATTA---ACCTATCAA-TGCCCT-CC-TCC--CAAAAATGA--T---AAAATTTGAACTTC----TTTAAAAAC-----TAAA--AAAT--------------GTATGTT--ACATCAATTTTGTCAAAAAGTGCTTTCATACTACCAACTTTAAAGCACTTTT--CTTGCATGGAAGCAAA-GACAACCCAGTCTTTCA----ATATGTGTTTGACAGTAAGCGGTGCAAAACAAGGTATACAatg
gi|30                         :           aTGAATGAATGGTGTT------------------CATTGACACA-TA------AAT-AGGTCATTTTGTGCATGT---AA--A-Gataggatttatttta
gi|31                         :                                                                          gaaTGTGCGCGC---AA--A-GATTAAT-----GA-------ATG-T-GAT-GACAAAA-----A-----T-----AATT-A---T---AT----T----AAATAAAT
gi|32                         :                                                                            TTGTGCGCGC---AA--A-GATTAAT-----GG-------ACG-T-GAT-GATGACA-----A-----A-----AA-T-A---T---AT----T----
gi|34                         :                       TGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-T
gi|4                          :            TGAATGAACGTTGTTTTA----------CGGCATATCGACACA-TA------GTT-AGGTATTTTTGTGTAAGCCTTAA--ATG--TAAT-----GC-------ATG-T---T-GA-AATG-----A-----T-----AA-T-A---G---AT----G----AACTAATTATTGT-----AAA-TATA------------------TTTA-----AAA-TAAATAAAGC-TATT-TAC------------------A-TGAA-AAT--AAG-CG-----AT--TAAA-AA--GAATG--AAT---ATA--T-AATATATATTTAGGAA-T----TAAT-ACT--TAAAAATG-------GAACCGT-CACCTCGAGGTGTAATTAA-----AACATGAAATACTTTATTAAAAGAGTAATTT-AATATCAAATATGTCAGACATTTACGAAATACTATTGACTAATAATTATTCGTGACTCTCATAGGAGCGAA-GTCAATGTAGT-ATTTATATTGTATGTTTTTCGCAGTAGGCATTGTAtacacatta
gi|5                          :          caTAAATGAATAATGTTTTA----------CGGCACGTCGACACA-TA------AAT-AGATTATTTTGTGCACGC---CT--A-GAATAAT-----GA-------ATT-T-GAT-TATGACA-----A-----T-----GC-T-G---T---TT----C----AAATAAATATAGTT--AAAAA-TATA----GT-----TCAATTATTTACAAGTAAA-TAAATGAAAA-AAGT-GACAA---CTAA-AC------A-TTAA-AAT-------------ATATTAGATAA-----TG--CAT---A-C--T--ATT---ATTCAACAA-T----T-A--ACCCGTCAACA-GACTT---TCAATTT-AAACTG----TTTAAAGAGTTTATAAC---AAAT--------------GTATTTT---CATTAATTTTGTCAAAATGTTCTTTCATGATATCAACTTTTGAGTACATTT--ATCTGATCGGA
gi|6                          :          aaTGAATGGCTGGTATTTTA----------CGGATCGTCGACACA-CA------AAT-AGGTCATTTTATGCATTA---AA--A-GATTAAT-----AA-------ATG-C-GAT-GATGACATATTAA-----T-----AA-T-A---T---AT----C----AAATAAACATGGTT--GAAAA-TATA----GT-----AAAACTATTTACAAATCAA-TAAATGAAAA-GAATGGATGAGATATAC-ATTATAAAA-CGAT-TAT--AGA-CA-----A-AAGAAATAA--
gi|7                          :           aTGAGTGAATAGTGTCTTAAATAGTTTCCTGGCATGTTGACACA-TG------AGA-AGGTCATTTTCTATGCAT---GA--A-TA-TAATATGGGGG-------ATA-T-GAC-GGTGAGA-----A-----A-----AG-C-A---T---AT----C----AAATAATTTTTTTTTGAAAAT-TACA-----TCACAAAAAAC-AATTACAAATAAATTGAATAAAGA-AAT-----GA---ACAG-CT----AAA-aaatta
gi|8                          :                                                  taaCA-TA------AAT-AGGTCATTTT-TGAGTGC---TA--A-GATCAAT-----GA-------ATG-C-GAT-GATGACA-----A-----T-----AA-T-A---A---AT----T----AAATAAATATGGTT--AAAAA-TGTA----TT-----AAAGCTATTTACAAATAAA-TAAAACAAAA----------A---ATCA-AT----AAAGTGAA-AAG--AAATCAATAATATACTAAATTG--G--TACTAAC---A-A--TCAATA---Aagt
gi|9                          :            TAAATAAATGTTGTATTA----------CTGCAC-TCGACACA-TA------AAT-AAGTCATTTTGTGCATGC---AA--A-AATAAAT-----CA-------ATG-T-CAT---TAA-A-----A-----T-----AT-C-A---T---AT----T----AAATAAATGTGGTT--AGAAA-TATA----GT-----AAAATTAATTACATATAAA-TAAATAAATA-CAAT---------ATAA-AT------A-TGAATAATTCAAA-CA-----acctgt