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Reference ( gi|2 )            :                                                      TGAGATACATG--GC-A--CT-AGT--GCTC---AT-TGGGGT--TAAAAGGAATA-TATCAGG-GGAAAAA--ACGCTATAAATATC-TTAAAA---TAAAGTTACATGTATTTTTAAAACTA-ACAAAAAAGCATTGCATTATCACTAATACAT-TAAA-TCG-GA---G-----TG---T----TATGG-----CAAATCCACCAA-AACGTGACAAAATCCATGTTTAG-ATTTA-A-----GCAGTAAACTTGAAAC-AAATTA---C-C--AT-T-TCTAAAAATAAAC-G-C--ACA--GAAATACT-----GCTTGACGACC-TTAA---CATCGTCATTC-GGAGTCTTTC----TAAGATGGTGAAACAATTTTTACTA----C-ATGTAAACCTG--T-TT-----A--A----CGGATC--AAATTAAAATCAAAATGTGATCTCGTTACTCAT---TAAA-------TTCA--TCACAAAATACGTTGCAATTTTAAGTGGGAAATCTATTTTA-------GTCTAA-----CCTAGGCGCGTA-A-CCA----AAGTTAGGAAATCTCTTTTCAATATATTTTTTTTGCATATTTAAA-TACATTTCCTTTTGACAATAC-A----TGTTCAGTGTATATATAGCATATAT-A-G-CATGCTATA--TGGGGGTGGGGGGGGGGATGT-TTTAA-CC---TTTAAGAAA-A----GAAATA-AT-TAT---T--C---AAA-TGG--ATAAAAAGAAACA---CATTAT---CATTAATGAA-TA-AAATATGAATGATTTGG-TA--TGTCAAATCCACCAACAACGTGACA
gi|6                          :                                                      TAAGA-ATATG--GCTG--CT-GTT--GCCC---ATGCAGTGTCTTAAAGGGAGTT-TATCAGG---ATAAA--ACGCTATAAATGCC-TTAAAAAA-TAAAAT---A---ATCATCAAAATGA-ATAAAAA-GCATATTATTATCATTAATGCATATAAA-CCA-AATA-G-----TT---TAG--TATGT-----CAAATCCATCAA-AAGGTGACAAAATCGATTATTAA-ATAGG-G-----GTGATAAAATTGAAAC-G--TTATCCC-C--AT-T-T-TAAAAATAGAC-AAC--ACT--TAAATACC-----GTTTAACGA----TAATCGCATCGTAATTC-GGACCGTTTC----TAAAAT----AAACGATTTTTACTA----C-GTGTAAACTTG--T-TT-----T--A----CGAATC--AAACTGAAATTAAAATTAAATCATATGACTAAT---TTAA-------TACG--TCACAAAATATGCTGCCATTTTAAGTAGGAAATCTTTTTTA-------GTCTGA-----CCTAGGCGTGTA-G-CCC----AAGTTA
gi|5                          : tttttctttggttcagaggtgtcatatacattagtgagattgcgcagtgatggTGAAATACACA--AA-ATCCT-AGTCTGCT---------GGTT--TAAAGGTTGTA-TATCAGG----AAAA--ACGCTATAAATGTC-TTAAAAC--TAAA---AC---TATTTTAAGAATTG-A-AACAAAGCATCGTATGATCAAAAACAAAT-AAAA-TCC-GA---A-----TG---G----TTTGGTATATCAAATCCACCAA-AACGTGACAAAAACGATATTTTG-ATCGA-A-----GTGATTAACTTGAAACGAAATCC---G-C--AT-T--CTAAAAATAGAC-A-TTTACT-----ATACTTAAAAGTTTAACGACC-TTCA---AATCATCATTT-GGACTATTTC----TAAGATC---AAACAAATTCTAC-------------AA---------T-----A--A----C------------AAAACCAGAACG----------ACGGAT---CAAA-------T-CG--TCACAAAACACGTTATAATTTTAAGCGGGGATTCTA-TTTA-------ATCTTA-----CCTTGGCGCGTATG-CC-----AAGTAAGGGAA--------CA------CCTTTTGGCATGCTTAAA-TAGATATCCTTATGGCAAAACGA----TA-TCGGTG-------AGTACATATGG-G-CATGCTAAA--T
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gi|10                         :                                                                                 attttgtatttttatc--TAAAAGGGATA-T--CAGG-A-AAAAATTACGGTG-AAATGTC-TTAAAA------AATTATAT-TATTTTCAAA--TGGATAAAAAAACATCTCATTATCATTAATAAAA-TAAAATCT-GA---A-----TGGTTTAG--TACGT-----CAAATCCACCAA-AACGTGACAAATTCGATATTAAA-ATTGG-A-----AGGGTAAACTTTAAAC-AAA--AG--C-CAAAT-T-AAAAAAAATAGAT-ACC--ACT--TAAATACT-----TTTTGACAAtacgctttaaaagtcccggcgtacgcccttccccctcccccctctaccgttcataaactcccatattctatcaaattcactctatttctacttaaaaacatgtgtgcccttcagattttatgatgcgctccctctaaactgaaatactggatccgtccctgtgtacaacggattgaaaattgaaatcaaaatgaaatcacgtgactcatttgatacttgacaaaatatgttgcacttttaagcgagaaatctattttacaatgtagtttaacctaggcgctaacccatgttaggaaataccttttcaatatattattttggcatgtttaattatatatccttttggcaatacggggtcagagaatatatctatagtcatgatatgtttgagaaaaaaatatgtttaagccaatttgaaaaatcctgaaaaaccctttaaaggtcacaaaaagcagaataaaagattaggatacttgtctaacagcaaacgtgaca
gi|4                          :                                                           caattttgccaacagtaccatttactggtgagagcattaataAAAGGGATAATACCAGG---AAAAA--GTGCTATAAAAATC-ATAAAA-------ATTAAATG-ATTATTAAAAATG-GATTAAAAGGATCTCATTATCATTAATAGAT-AAAA-TCT-GA---A-----TGGTTTGG--TATGT-----CAAATCCATCGT-AACGTGACAAAATTGATATCT-T-ATTTGGA-----GTGGGAAACTTGAAAC-AAAATC---CAC--AT-T-T-TAAAAATAGACAG-C--ATT--TTAATACT-----GTTTGATGACC-TTTG---CATCTTCATTT-GGACTCTTTC----TAAGA---TGAAACAATTTTAACTATAATT-ATGTAAACCTG--TATTATATAA--A----CGGACC--AAATTGAAATCAATATGAAATCATGTGACTCATG--TGAAATCCCTTTTCA--ATATAATATA-GAGACAAGTTTAAATGG
gi|13                         :                                                           ttttttgtctcacttttaaacaaacttacagcaacatatttgttcacttTG-TATCAAG-A-AAAAA--ATGCTGTAGTTGAT-TTAAAAAA-TAAAACTACATGTATCTTTAAAA-TG-GGTAAAAAGTATCTCATTATCATTAATAAAT-AAAA-TC--CA---GTTGTTTG---T----TGTGT-----CAAATATACTGA-AACGTGAAAAAATCTCTTTTCAG--TTTatatccttttgccaatacagggtcgtgcagtgagtataatataggcatgatgtattgggaaaaaagtttttagccaaatttacaagtttgaaaaatcctgatatattgactttcaaactatttctgaaatatacataataatcaac
gi|12                         :                                                                                                                                      TAAATGTC-TTAAAA---ATAAGATA-----ATTACTAAAATGG-ATAAAAA-GTATGTCACTGTCATTAAT---C-TAAA-T-------------------------A---------AAATCCA---A-AACTTGACAAAATCTATATTTGA-ATTGG-A-----GTTGT-AACTTGAAACAAAATCC---C-C--A--T-TCTAAAAAAAGAC-A----ACAATGAAATACT-----TCTCGATGGC-----------TCATCATTT-GAACTCTTTT----TAA---GCTGAAACAAATTTTACAA----T-GTGTAAATCgtgttgaatgtttagatgacagtataaaaacaacatgacaacat
gi|7                          :                                                                                                                                                                         TTAAAATGG-ATAAAATA-CATCTCATTATCATTAATTAAT-AAAA-TCC-GAATGG-----CG---TAG--TATGT-----AAAATCTACCAA-AATGTGACAAAATCGCTATTAAGTATTTA-A-----A--------TTGGAGT-G--TTA---TAC--ATGTATCTAAAA-TAGACAG-C--ACT--TAACTACT-----A---GACGACT-ATCG---TGTCGTCATTTTGGATTCTTTC----TAAGATA---AAACAGCTTT-A--A----C-GTATGAACCTGCAT-GT-----A--A----CATATG--AAATGAAAATGAAA------TCACTTCACTCATATATAA----------CAGGTCACAAAACATGTTGTAGGTT-AAGCGGGAAATCTATTCTA-------GTCTAACGTAGCCTAGGTGTGTA-GTCCATTGCAAGTCATGAAATCCCTAATTGATTTATTATTTTGGCATG--TAAATTATATAACATTTTGGTTATAC-G----GGGTCAGTG-------AGTATA-AT-AGG-CATGATATAATTGGG---GGGAGTGAAGGT-T-TTTAG-CCAATTTTGAAAAA-
gi|11                         :                                                                                                                                                                                      AAAAAGAAACACATTATCATTAATGAAT-AAAA-TAT-GA---A-----TGA--TTTGGTATGT-----CAAATCCACCAACAACGTGACATAATTGAT-TTTAA-ATTGG-A-----GTGGTAAACTTGAAACGAAATCC---C-C--AT-T-CTTAtcctgataaattcccttta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttaagaaaagaaataattattcaaatggatTACA-----GCTTGATGACCGTCAA---C-TGGTCATTT-TGACTCTTTA----TAAG--GATGAAACAATTttacgtgtaaacctgtataacagatcaaattgaaatgaaaatgaaatcacgtgactcatttaacacgtcacaaaatat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TACA-----GTTTGATGACC-GTCT---CTTTGTTATTT-TGACTCTTTA----TAAG--GATGAAACAA--TTCAACA----CTATGTAAcaacactttgtaaccatg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TT-GGACCTTTTC----TCAGAT--T-AAACCATATTTTCTA----T-A-GTAAACATG--T-AC-----A--T----GGGATC--AAATTGAAATCAAAATGAAATCATGTAACCAGT---TTAA-------TACT--TCACAAAACATGTTAAAATTTTAAGCAGGAAATCGATTTTA-------GTCTAA-----CCT--------------------AGTTGGGAAA-CCCGTTTCAGTATATTATTTTTGCATGTTTAGA-TATATATCCTTTTGGCAATAT-A----GGGTCAGTGAGTATA----ATA-AA-G-G-CAGGATATA--Tctatg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATTCTTATTA----C-GTGTAAACCTG--T-AT-----A--A----CAGATC--AAATTGAAATGAAAATGAAATCACGTGACTCAT---TTAA-------CACG--TCACAAAATAttggaaaatatgtctttagctaattttataatattgacaaatcctgatatattccctttaa
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tttaagaaaagaaataattattcaaatggataaaaagaaacacattatcattaatgaataaaatatgaatgatttggtatgtcaaatccaccaacaacgtgacataattgattttaaattggagtggtaaacttgaaacgaaatccccCCTG--T-GT-----ACAA----CGGATTGAAAATTGAAATCAAAATGAAATCACGTGACTCAT---TTGA-------TACT--TGACAAAATATGTTGCACTTTTAAGCGAGAAATCTATTTTACAATGTAGTTTAA-----CCTAGGCGC-TA-A-CCC----ATGTTAGGAAATACCTTTTCAATATATTATTTTGGCATGTTTAAT-TATATATCCTTTTGGCAATAC-G----GGGTCAGAGAATATAT--C---TAT-A-GTCATGATATG--T-----TTGAGAAAAAAATATGTTTAAGCCAA-TTTGA-AAA-ATCCTGAAA-A-AC-CCT---T--T---AAA--GGTCACAAAAAG---CA-------------------GAA-TA-AAA-------GATTAGGATACTTGTCTAA--CAGCA--AACGTGACAt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                   attttgtatttttatcttaaagggaatatgtcaggaaaacacgctatccatatcaaataactattacaattgataaaaatcatctcattatcattaatagataaaaaccgaatggtttggtatttcaaatccaccaaaacgtgacaaaatcgatatatagattggagtagtaaacttgaatcgaaatcttcactctaaaaatagacaacacttaaatactgcttgacatcattcggactctttctaagatgaaacaattttactacgcgttaatctgtataaatagcagatctacgctttaaaagtcccggcgtacgcccttccccctcccccctctaccgttcataaactcccatattctatcaaattcactctatttctacttaaaaacatgtgtgcccttcagattttatgatgcgctccctctaaactgaaatactggatccgtcGAAATCCCTTTTCAATATAATATAGAGACAAGTTTAAA-TGGATATCCTTTTGCCAATAC-AGGGTCGTGCAGTGAGTATA----ATATA--G-G-CATGATGTA--TTGGG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttttttgtctcacttttaaacaaacttacagcaacatatttgttcacttaaagggataataccaggaaaaagtgctataaaaatcataaaaattaaatgattattaaaaatggattaaaaggatctcattatcattaatagataaaatctgaatggtttggtatgtcaaatccatcgtaacgtgacaaaattgatatcttatttggagtgggaaacttgaaacaaaatccacattttaaaaatagacagcattttaatactgtttgatgacctttgcatcttcatttggactctttctaagatgaaacaattttaactataattatgtaaacctgtattatataaacggaccaaattgaaatcaatatgaaatcatgtgactcatgtC---CTTAAAAAA-T----AAAATA-AT-CAT---C--A---AAA-TGA--ATAAAAAG---CA---TATTATTATCATTAATGCA-TATAAAC-CAAATAGTTTAG-TA--TGTCAAATCCATCAA-AAGGTGACAaaaaaagtttttagccaaatttacaagtttgaaaaatcctgatatattgactttcaaactatttctgaaatatacataataatcaac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tttttctttggttcagaggtgtcatatacattagtgagattgcgcagtgatggtaagaatatggctgctgttgcccatgcagtgtcttaaagggagtttatcaggataaaacgctataaatg---TTTAAGAAA-A----GAAATA-AT-TAT---T--C---AAA-TGG--ATAAAAAGAAACA---CATTAT---CATTAATGAA-TA-AAATATGAATGATTTGG-TA--TGTCAAATCCACCAACAACGTGACAaaatcgattattaaataggggtgataaaattgaaacgttatccccattttaaaaatagacaacacttaaataccgtttaacgataatcgcatcgtaattcggaccgtttctaaaataaacgatttttactacgtgtaaacttgttttacgaatcaaactgaaattaaaattaaatcatatgactaatttaatacgtcacaaaatatgctgccattttaagtaggaaatcttttttagtctgacctaggcgtgtagcccaagtta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ---TTTAAAAAATA----AAACTACATGTATCTTT--A---AAA-TGG--GTAAAAAGTATCT---CATTAT---CATTAATAAA-TA-AAAT-CCAGTTGTTTGT-TG--TGTCAAATATACTGA-AACGTGAtaattgattttaaattggagtggtaaacttgaaacgaaatccccattcttattacgtgtaaacctgtataacagatcaaattgaaatgaaaatgaaatcacgtgactcatttaacacgtcacaaaatat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgtatcaagaaaaaaatgctgtagttgaTTAAAAAT-AT---AAAATA-AT-TAT---T--A---ACA-TGG--ATAGAAAGCTTCT---TATTAT---CATTAATAAAATA-AAATGTGAATGGTTTGG-TA--TGTTAAATCCACCAAC-ACGTGTCAaaaaatctcttttcagtttgtgttgaatgtttagatgacagtataaaaacaacatgacaacat
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcttttttacctacagtatacatgtagcatttcgtgttctttattacttaaagggagtatatcaggtggaaaacggtaaatatggAA-A----AAATTATAT-TAT---TTTC---AAA-TGG--ATAAAAA--AACATCTCATTAT---CATTAATAAAATA-AAATCTGAATGGTTTAG-TA--CGTCAAATCCACCAA-AACGTGACAagatcgatatttagattaaattggagtggtagccttgaaacgaaattcccattctaaaaatagacagtacttaactactgcttgacaacctttgtatcgccattcggtacctttctgcttaagatattaaacattctttacgtgtaaaactgtataacagatcaaattgagatcaaaatgaaatcacgtgactcacataatacatcacaaaatatgtctatatgtaccctgggtgcgtagctcatattaggaaatcccttttcaatttattattttggcatgtttaaattggtaaccttttggcaatacagggtcattgagtatatataagcatggtatattggaaaaattgtttttagctggatctaaatctaaaatgtggaaacttctgataaattcccttt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               caattttgccaacagtaccatttactggtgagagcattaatataaaagggatatcaggaaaaaattacggtgaaatgtcttAAATG-AT-TAT---T--A---AAAATGG--ATTAAAAGGATCT---CATTAT---CATTAATAGA-TA-AAATCTGAATGGTTTGG-TA--TGTCAAATCCATC-GTAACGTGACAaattcgatattaaaattggaagggtaaactttaaacaaaagccaaattaaaaaaaatagataccacttaaatactttttgacaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttttttgtctcacttttaaacaaacttacagcaacatatttgttcacttaaagggataataccaggaaaaagtgctataaaaatcataaaaattA-AC-TAT---T--TTAAGAA-TTG--AAACAAAGCATCG---TATGAT---CAAAAACAAA-TA-AAATCCGAATGGTTTGG-TA--TATCAAATCCACCAA-AACGTGACAaaattgatatcttatttggagtgggaaacttgaaacaaaatccacattttaaaaatagacagcattttaatactgtttgatgacctttgcatcttcatttggactctttctaagatgaaacaattttaactataattatgtaaacctgtattatataaacggaccaaattgaaatcaatatgaaatcatgtgactcatgtgaaatcccttttcaatataatatagagacaagtttaaatggatatccttttgccaatacagggtcgtgcagtgagtataatataggcatgatgtattgggaaaaaagtttttagccaaatttacaagtttgaaaaatcctgatatattgactttcaaactatttctgaaatatacataataatcaac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gaaatgtcattttgattatctttattttgaaatacacaaaatcctagtctgctggtttaaaggttgtatatcaggaaaaacgctataaatgtcttaaaactaaT---T--A---AAA-TGG--ATAAAATACATCT---CATTAT---CATTAATTAA-TA-AAATCCGAATGGCGTAG-TA--TGTAAAATCTACCAA-AATGTGACAaaaacgatattttgatcgaagtgattaacttgaaacgaaatccgcattctaaaaatagacatttactatacttaaaagtttaacgaccttcaaatcatcatttggactatttctaagatcaaacaaattctacaataacaaaaccagaacgacggatcaaatcgtcacaaaacacgttataattttaagcggggattctatttaatcttaccttggcgcgtatgccaagtaagggaacaccttttggcatgcttaaatagatatccttatggcaaaacgatatcggtgagtacatatgggcatgctaaattcgaaaaacatatttctagcaaatttgaaaaaaatgaaaatcatcatatatttcctta
8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): AGACGCTATAAATGTCTAAAACATAACTTAAATATGAATATAAAAAATGAAATAATTACTTGACCTAGATACGAATGATTTGGGATTGGCTATCAAACACGATCAAAAACAAACAATCAATACTTTAACCGAAGTTTAAAATCGAAACAGAATTTCAATTTACAAAAATCATAATACATATTCTTCGCCTCCCATTCGGACTATTTCTTTCTAAGACAAACCAGTTTCGCTAAAGATGGCCAATATGGCGAATCAAATTGAAGTCATGGCATTACG
Unaligned ( gi|14 ): CTACTTTTTACCTGTTTTATATTTATTAAGTATTTCAATGCATTGATAACTTAAAATTGTAAGTATTTTTGTTGTTTTTCTTATACATGTAGTAATGAAAGGATAAAGAACACTATAGAACGTTTTGGCCATCAAAAAGAAAATTATTAACAATGAA
Unaligned ( gi|15 ): TATGTGTCCGTTCAGATTTTATGTCAACCCACCCCTTCTGTTGTGCGCCCCCTTAGTGCGCCCCCTTTAAACTGAAACCCTGGAACCGCCCCTG
Unaligned ( gi|16 ): GTCCGGAAGCAATAATAACATTTGAAACTGCCCAGTGATGCAGTGACAGCATGAATTGACTTCAAACCCGAGCTAAACAAAAAACT
Unaligned ( gi|17 ): AAACCAGTATTCAAAATAAAAAAAATCGAAATGACAATACGAACGGCTGACACACAGCATACAAGACTGCATTTACCACAAAT
Unaligned ( gi|18 ): ATTCATAAATAGTTGCTTTTATTTCGCAAATTTCAAAGACGAGTTATCGTATTTAGAGCGCCAGTATGACTGAGAAATGA
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Reference ( family-438 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGAGATACACGG---C-GC---TNGT--GCTC---AT-CAG--T----TAAAGGGAGTATATCAGGG-AAAAA--ACGCTGTAAATGTC-TTAAAAA-TAAAATTA-AT-TATTNTTAA-AATTGATAAAAA--AGCATCTCATTATCATTAA--T--AAA-TAAAATCCGAAT-G---------T---G-TATGTCAAATCC-ACCAA-AACGTGACAAA--ATCG-------ATATTTAGATT-----GGAGTGGTAAACTTGAAACGAAATCCCCATTTCTAAAAATAGACA------ACACTTAAATACTGCTTGACGACCTTCGCATCGTCATTC-GG-ACT----CTTTCT----AAGAT--TGAAACAA--------TTTTTAC--T-A----CGTGTAAACCTGTAT------AA----CGGATC--AAATTGAAATCAAAATGAAATCACGTGACTCAT-T-TAATACGTCACAAAATATGTTGCAATTTTAAGCGGGAAATCTATTTTA-------GTCTAA-----CCTAGGCGCGTAGCC-----CAAGTTAGGAAATCCCTTTTCAATATATTATTTTGGCATGTTTAAA-TANATATCCTTTTGGCAATACGGGGT----CAGTGAGTATA-AGTATATATGGCATGATAT-AT--TGGTNGGGGNGAAGGTATG--TTTAGGCCAATTTAAAAA---A----A---AAAATAATTATTNAAATGG--ATAAAAAGCATCNCATTATCATTAATAAATAAAATCCGAATGGTTTGGTATGTCAAATCCACCAA-AACGTGACA
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      attttgtatttTGTAC------AA----CGGATTGAAAATTGAAATCAAAATGAAATCACGTGACTCAT-T-TGATACTTGACAAAATATGTTGCACTTTTAAGCGAGAAATCTATTTTACAATGTAGTTTAA-----CCTAGGCGC-TAACC-----CATGTTAGGAAATACCTTTTCAATATATTATTTTGGCATGTTTAAT-TATATATCCTTTTGGCAATACGGGGT----CAGAGAATATA---TCTATA-GTCATGATAT-GT-----TTGAGAAAAAAATATG--TTTAAGCCAATTTGAAAA---ATCCTG---AAA--AACCCTTTAAA-GGTCACAAAAAGCAtacgctttaaaagtcccggcgtacgcccttccccctcccccctctaccgttcataaactcccatattctatcaaattcactctatttctacttaaaaacatgtgtgcccttcagattttatgatgcgctccctctaaactgaaatactggatccgtccctgtgtacaacggattgaaaattgaaatcaaaatgaaatcacgtgactcatttgatacttgacaaaatatgttgcacttttaagcgagaaatctattttacaatgtagtttaacctaggcgctaacccatgttaggaaataccttttcaatatattattttggcatgtttaattatatatccttttggcaatacggggtcagagaatatatctatagtcatgatatgtttgagaaaaaaatatgtttaagccaatttgaaaaatcctgaaaaaccctttaaaggtcacaaaaagcagaataaaagattaggatacttgtctaacagcaaacgtgaca
gi|10                         : attttgtatttttatcttaaagggaatatgtcaggaaaacacgctatccatatcaaataactattacaattgataaaaatcatctcattatcattaatagataaaaaccgaatggtttggtatttcaaatccaccaaaacgtgacaaaatcgatatatagattggagtagtaaacttgaatcgaaatcttcactctaaaaatagacaacacttaaatactgcttgacatcattcggactctttctaagatgaaacaattttactacgcgttaatctgtataaatagcagatctacgctttaaaagtcccggcgtacgcccttccccctcccccctctaccgttcataaactcccatattctatcaaattcactctatttctacttaaaaacatgtgtgcccttcagattttatgatgcgctccctctaaactgaaatactggatccgtccctgC---AT-TAA--TA---TAAAAGGG--ATATCAGGA-AAAAATTACGGTG-AAATGTC-TTAAAAA-----ATTATAT-TATT-TTCA-AATGGATAAAAA--AACATCTCATTATCATTAA--T--AAAATAAAATCTGAAT-GGTT------TA--G-TACGTCAAATCC-ACCAA-AACGTGACAAA--TTCG-------ATATTAAAATT-----GGAAGGGTAAACTTTAAACAAAAGCCAAATTAAAAAAAATAGATA------CCACTTAAATACTTTTTGACAAgaataaaagattaggatacttgtctaacagcaaacgtgaca
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              caattttgccaacagtaccatttactggtgagag-TTAAGAA-AAGAAATA-AT-TATTC---A-AATGGATAAAAAGAAACA---CATTATCATTAA--T--GAA-TAAAATATGAAT-GA--------TTTGG-TATGTCAAATCC-ACCAACAACGTGACATA--ATTG-------AT-TTTAAATT-----GGAGTGGTAAACTTGAAACGAAATCCCCATTCTTA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tT----AAACT--TGAAACGAAATCCCCATTCTTAT--T-A----CGTGTAAACCTGTAT------AA----CAGATC--AAATTGAAATGAAAATGAAATCACGTGACTCAT-T-TAACACGTCACAAAATATttacgtgtaaacctgtataacagatcaaattgaaatgaaaatgaaatcacgtgactcatttaacacgtcacaaaatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttaagaaaagaaataattattcaaatggataaaaagaaacacattatcattaatgaataaaatatgaatgatttggtatgtcaaatccaccaacaacgtgacataattgattttaaattggagtggTAAATGTC-TTAAAAA-TAAGAT-A-AT-TACT---AA-AATGGATAAAAA---GTATGTCACTGTCATTAA--TCTAAA-TAAAATCC-------------------------------------AA-AACTTGACAAA--ATCT-------ATATTTGAATT-----GGAGTTGT-AACTTGAAACAAAATCCCCA-TTCTAAAAAAAGACA------ACAATGAAATACTTCTCGATGGC-------TCATCATTT-GA-ACT----CTTTTT----AAG-C--TGAAACAA--------ATTTTAC--A-A----TGTGTAAATC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTATCAAGA-AAAAA--ATGCTGTAGTTGAT-TTAAAAAATAAAACTACATGTATCTTTAA-AATGGGTAAAAA---GTATCTCATTATCATTAA--T--AAA-TAAAATCCAGTT-GTT-------T---GTTGTGTCAAATAT-ACTGA-AACGTGAAAAA--ATCT-------CTTTTCAGTTT-----G
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TACAGTTTGATGACCGTCTCTTTGTTATTT-TG-ACT----CTTTAT----AAGGA--TGAAACAA--------TTtgttgaatgtttagatgacagtataaaaacaacatgacaacat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGAGATACATGG---C-AC---TAGT--GCTC---AT-TGGGGT----TAAAAGGAATATATCAGGGGAAAAA--ACGCTATAAATATC-TTAAAA--TAAAGTTACATGTATTTTTAA-AACTAACAAAAA--AGCATTGCATTATCACTAA--T--ACA-TTAAATCGGAGT-G---------T-----TATGGCAAATCC-ACCAA-AACGTGACAAA--ATCC-------ATGTTTAGATT-----TAAGCAGTAAACTTGAAAC-AAATTACCATTTCTAAAAATAAACG-------CACAGAAATACTGCTTGACGACCTTAACATCGTCATTC-GG-AGT----CTTTCT----AAGATGGTGAAACAA--------TTTTTAC--T-A----CATGTAAACCTGTTT------AA----CGGATC--AAATTAAAATCAAAATGTGATCTCGTTACTCAT-T-AAATTCATCACAAAATACGTTGCAATTTTAAGTGGGAAATCTATTTTA-------GTCTAA-----CCTAGGCGCGTAACC-----AAAGTTAGGAAATCTCTTTTCAATATATTTTTTTTGCATATTTAAA-TACATTTCCTTTTGACAATACATGTT----CAGTGTATATATAGCATATATAGCATGCTAT-ATGGGGGTGGGGGGG--GGGATG--TTTTAACC--TTTAAGAA---A----A---GAAATAATTATTCAAATGG--ATAAAAAGAAACACATTATCATTAATGAATAAAATATGAATGATTTGGTATGTCAAATCCACCAACAACGTGACAcaacactatgtaactatg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TACAGCTTGATGACCGTCAACTGGTCATTT-TG-ACT----CTTTAT----AAGGA--TGAAACAA--------TT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATACATGT---A-GCATTTCGT--GTTCTTTAT-TAC--T----TAAAGGGAGTATATCAGGT-GGAAA--ACG--GTAAATATGGTTAAAAA-TATAA--A-AT-AATTATTAA-CATGGATAGAAA---GCTTCTTATTATCATTAA--T--AAAATAAAATGTGAAT-GGTT------T---GGTATGTTAAATCC-ACCAA-CACGTGTCAAG--ATCG-------ATATTTAGATTAAATTGGAGTGGTAGCCTTGAAACGAAATTCCCATT-CTAAAAATAGACA------GTACTTAACTACTGCTTGACAACCTTTGTATCGCCATTC-GGTAC-----CTTTCTGCTTAAGATA-TTAAACA---------TTCTT----T-A----CGTGTAAAACTGTAT------AA----CAGATC--AAATTGAGATCAAAATGAAATCACGTGACTCAC-A-TAATACATCACAAAATATG--------------------TCTAT-----------ATGTAC-----CCTGGGTGCGTAGCT-----CATATTAGGAAATCCCTTTTCAATTTATTATTTTGGCATGTTTAAA-TTGGTAACCTTTTGGCAATACAGGGT----CATTGAGTATA---TATA---AGCATGGTAT-AT--TGGcaacactttgtaaccatg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcttttttacctacagtT-CAC--T----TAAAGGGATAATACCAGG--AAAAA--GTGCTATAAAAATC-ATAAAAA-TTAAAT-G-AT-TATTA--AA-AATGGATTAAAA--GG-ATCTCATTATCATTAA--T--AGA-TAAAATCTGAAT-GGTT------T---GGTATGTCAAATCC-ATCGT-AACGTGACAAA--ATTG-------ATATCTTATTT-----GGAGTGGGAAACTTGAAACAAAATCCACATTT-TAAAAATAGACA------GCATTTTAATACTGTTTGATGACCTTTGCATCTTCATTT-GG-ACT----CTTTCT----AAGA---TGAAACAA--------TTTTAAC--T-ATAATTATGTAAACCTGTATTATATAAA----CGGACC--AAATTGAAATCAATATGAAATCATGTGACTCAT-aaaaattgtttttagctggatctaaatctaaaatgtggaaacttctgataaattcccttt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttttttgtctcacttttaaacaaacttacagcaacatatttgtGAAATCCCTTTTCAATATAATATAGAGACAAGTTTAAA-TGGATATCCTTTTGCCAATACAGGGTCGTGCAGTGAGTATA-A-TATA---GGCATGATGT-AT--T----GGGAAAAAAGT-T---TTTAGCCAAATTTACAAGTTTG----A---AAAATgtgaaatcccttttcaatataatatagagacaagtttaaatggatatccttttgccaatacagggtcgtgcagtgagtataatataggcatgatgtattgggaaaaaagtttttagccaaatttacaagtttgaaaaatcctgatatattgactttcaaactatttctgaaatatacataataatcaac
gi|5                          :                                    ttttttgtctcacttttaaacaaacttacagcaacatatttgttcacttaaagggataataccaggaaaaagtgctataaaaatcataaaaattaaatgattattaaaaatggattaaaaggatctcattatcattaatagataaaatctgaatggtttggtatgtcaaatccatcgtaacgtgacaaaattgatatcttatttggagtgggaaacttgaaacaaaatccacattttaaaaatagacagcattttaatactgtttgatgacctttgcatcttcatttggactctttctaagatgaaacaattttaactataattatgtaaacctgtattatataaacggaccaaattgaaatcaatatgaaatcatgtgactcatgtTGAAATACACAAAATC--C---TAGTCTGCTG---GT------T----TAAAGGTTGTATATCAGG---AAAA--ACGCTATAAATGTC-TTAAAAC-TAAAACTA-------TTTTAAGAATTGA-AACAA--AGCATCGTATGATCAAAAA--C--AAA-TAAAATCCGAAT-GGTT------T---GGTATATCAAATCC-ACCAA-AACGTGACAAA--AACG-------ATATTTTGATC-----GAAGTGATTAACTTGAAACGAAATCCGCA-TTCTAAAAATAGACATTTACTATACTTAAA-A--GTTTAACGACCTTCAAATCATCATTT-GG-ACT----ATTTCT----AAGAT--C-AAACAA--------ATTCTACAATAA----CA---AAACCAGAAC------GA----CGGATC--AAATCG---TCACAA----------------------AACACGT-------TAT-----AATTTTAAGCGGGGATTCTA-TTTA-------ATCTTA-----CCTTGGCGCGTATGC-----CAAGTAAGGGAACACC--------------TTTTGGCATGCTTAAA-TAGATATCCTTATGGCAAAACGATAT----CGGTGAGTACA---TATG---GGCATGCTAA-AT--T-----CGAAAAACATATT--TCTA-GCAAATTTGAAAA---A----AATGAAAATCATCATcctgatatattgactttcaaactatttctgaaatatacataataatcaac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gaaatgtcattttgattatctttatttTAAGA-ATATGG---CTGC---TGTT--GCCC---ATGCAG--TGTCTTAAAGGGAGTTTATCAGG--ATAAA--ACGCTATAAATGCC-TTAAAAAATAAAAT-A-AT-CATC---AA-AATGAATAAAAA---GCATATTATTATCATTAA--T--GCA-TATAAACCAAATAG---------TTTAG-TATGTCAAATCC-ATCAA-AAGGTGACAAA--ATCG-------ATTATTAAATA-----GGGGTGATAAAATTGAAACGTTATCCCCATTT-TAAAAATAGACA------ACACTTAAATACCGTTTAACGATAATCGCATCGTAATTC-GG-ACC----GTTTCT----AAAAT----AAACGA--------TTTTTAC--T-A----CGTGTAAACTTGTTT------TA----CGAATC--AAACTGAAATTAAAATTAAATCATATGACTAAT-T-TAATACGTCACAAAATATGCTGCCATTTTAAGTAGGAAATCTTTTTTA-------GTCTGA-----CCTAGGCGTGTAGCC-----CAAGTTAatatttcctta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttttctttggttcagaggtgtcatatacattagtgagattgcgcagtgatggTTAA-AATGGATAAAAT--A-CATCTCATTATCATTAA--T--TAA-TAAAATCCGAAT-GGCG------TA--G-TATGTAAAATCT-ACCAA-AATGTGACAAA--ATCGCTATTAAGTATTTAAATT-----GGAGTGTTATACATGTA--------------TCTAAAA-TAGACA------GCACTTAACTACTA---GACGACTATCGTGTCGTCATTTTGG-ATT----CTTTCT----AAGAT---AAAACAG--------CTTT-A-----A----CGTATGAACCTGCAT-------------GTAAC--ATAT-GAAATGAAAATGAAATCACTTCACTCATATATAACAGGTCACAAAACATGTTGTAGGTT-AAGCGGGAAATCTATTCTA-------GTCTAACGTAGCCTAGGTGTGTAGTCCATTGCAAGTCATGAAATCCCTAATTGATTTATTATTTTGGCATG--TAAATTATATAACATTTTGGTTATACGGGGT----CAGTGAGTATA-A-TA-----GGCATGATATAAT--TGGGGGGAGTGAAGGT-T---TTTA-GCCAATTTTGAAA---A----A---
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TT-GG-ACC----TTTTCT----CAGAT--T-AAACCA--------TATTTTC--T-A----TA-GTAAACATGTAC------AT----GGGATC--AAATTGAAATCAAAATGAAATCATGTAACCAGT-T-TAATACTTCACAAAACATGTTAAAATTTTAAGCAGGAAATCGATTTTA-------GTCTAA-----CCT-------------------AGTTGGGAAA-CCCGTTTCAGTATATTATTTTTGCATGTTTAGA-TATATATCCTTTTGGCAATATAGGGT----CAGTGAGTATA-A-TA---AAGGCAGGATAT-AT--TTG-------GAAAATATGTCTTTA-GCTAATTTtcctgataaattcccttta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AG--ACGCTATAAATGTC-TAAAACA-TAAC-TTA-AA-TAT-----G-AAT--ATAAAAA--ATGAAATAATTAC--TTGACCT--AGA-TA-----CGAAT-GATTTGGGATT---G-GCTATCAAACACGATCAA-AA----ACAAACAATCA-------ATACTTTAACC-----GAAGTT-TAAAATCGAAACAGAATTTCAATTTACAAAAATC-ATA------ATAC----ATATT----------CTTCGCCTC-CCATTC-GG-ACTATTTCTTTCT----AAGAC----AAACCA--------GTTTCGC--T-A----AAGATGG-CCAATAT------GG----CGAATC--AAATTGAAGTC---ATGGCATTACGtataatattgacaaatcctgatatattccctttaa
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|15 ): TATGTGTCCGTTCAGATTTTATGTCAACCCACCCCTTCTGTTGTGCGCCCCCTTAGTGCGCCCCCTTTAAACTGAAACCCTGGAACCGCCCCTG
Unaligned ( gi|16 ): GTCCGGAAGCAATAATAACATTTGAAACTGCCCAGTGATGCAGTGACAGCATGAATTGACTTCAAACCCGAGCTAAACAAAAAACT
Unaligned ( gi|17 ): AAACCAGTATTCAAAATAAAAAAAATCGAAATGACAATACGAACGGCTGACACACAGCATACAAGACTGCATTTACCACAAAT
Unaligned ( gi|18 ): ATTCATAAATAGTTGCTTTTATTTCGCAAATTTCAAAGACGAGTTATCGTATTTAGAGCGCCAGTATGACTGAGAAATGA
Unaligned ( gi|21 ): ATAAATGGCATCCTGTGTTAATGAATGAGAAAAAATATTTTCTAT
Unaligned ( gi|22 ): TCTGTTAACAGTTTCTTAAATATCAAGCTTTC






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Reference ( family-438 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGAGATACACGG---C-GCTAGT--GCTC---AT-CAN--T----TAAAGGGAGTATATCAGG--AAAAAA---CGCTATAAATGTC-TTAAAAA-TA-AAATTA-AT-TAT-TTT-AA-AATGGATAAAAA--AGCATCTCATTATCATTAA--T--AAA-TAAAATCCGAATGGTTT-G----TA--TGTCAAAT-CCACCAA-AACGTGACAA--AATCG-------ATATTTA-----AATTGGAGTGGTAAACTTGAAACGAAATCCCCATTTCTAAAAATAGACA------ACACTTAAATACTGCTTGACGACCNTCGCATCGTCATTC-GG-AC----TCTTTCT----AAGAT--TGAAACAA--------TTTTTAC--T-A----CGTGTAAACCTGTAT------AA----CGGATC--AAATTGAAATCAAAATGAAATCACGTGACTCAT-T-TAATACGTCACAAAATATGTTGCAATTTTAAGCGGGAAATCTATTTTA-------GTCTAA-----CCTAGGCGCGTAGCC-----CAAGTTAGGAAATCCCTTTTCAATATATTATTTTGGCATGTTTAAA-TANATATCCTTTTGGCAATACGGGGT----CAGTGAGTATA----ATATA-AGGCATGATAT-ATTGGG--GGAA--GAAAGTATGT-TTAAGCCAA---------TTTGAAAAA----A---AAAATAATCATTCAAATGGTCACAAAAAGNAACACATTATCATTAATGAATAAAATATGAATGATTTGG-TA--TGTCAAATCCACCAACAACGTGACA
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     attttgtatttTGTAC------AA----CGGATTGAAAATTGAAATCAAAATGAAATCACGTGACTCAT-T-TGATACTTGACAAAATATGTTGCACTTTTAAGCGAGAAATCTATTTTACAATGTAGTTTAA-----CCTAGGCGC-TAACC-----CATGTTAGGAAATACCTTTTCAATATATTATTTTGGCATGTTTAAT-TATATATCCTTTTGGCAATACGGGGT----CAGAGAATAT-----ATCTATAGTCATGATAT-GTT-TG--AGAA--AAAAATATGT-TTAAGCCAA---------TTTGAAAAATCCTG---AAA--AACCCTTTAAA-GGTCACAAAAAGCA----------------GAATAAAA-------GATTAGGATACTTGTCTAA--CAGCA--AACGTGACAtacgctttaaaagtcccggcgtacgcccttccccctcccccctctaccgttcataaactcccatattctatcaaattcactctatttctacttaaaaacatgtgtgcccttcagattttatgatgcgctccctctaaactgaaatactggatccgtccctgtgtacaacggattgaaaattgaaatcaaaatgaaatcacgtgactcatttgatacttgacaaaatatgttgcacttttaagcgagaaatctattttacaatgtagtttaacctaggcgctaacccatgttaggaaataccttttcaatatattattttggcatgtttaattatatatccttttggcaatacggggtcagagaatatatctatagtcatgatatgtttgagaaaaaaatatgtttaagccaatttgaaaaatcctgaaaaaccctttaaaggtcacaaaaagcagaataaaagattaggatacttgtctaacagcaaacgtgaca
gi|10                         : attttgtatttttatcttaaagggaatatgtcaggaaaacacgctatccatatcaaataactattacaattgataaaaatcatctcattatcattaatagataaaaaccgaatggtttggtatttcaaatccaccaaaacgtgacaaaatcgatatatagattggagtagtaaacttgaatcgaaatcttcactctaaaaatagacaacacttaaatactgcttgacatcattcggactctttctaagatgaaacaattttactacgcgttaatctgtataaatagcagatctacgctttaaaagtcccggcgtacgcccttccccctcccccctctaccgttcataaactcccatattctatcaaattcactctatttctacttaaaaacatgtgtgcccttcagattttatgatgcgctccctctaaactgaaatactggatccgtccctgC---AT-TAA--TA---TAAAAGGG--ATATCAGG--AAAAAATTACGGTG-AAATGTC-TTAAAAA------ATTATAT-TAT-TTT-CA-AATGGATAAAAA--AACATCTCATTATCATTAA--T--AAAATAAAATCTGAATGGTTTAG----TA--CGTCAAAT-CCACCAA-AACGTGACAA--ATTCG-------ATATTAA-----AATTGGAAGGGTAAACTTTAAACAAAAGCCAAATTAAAAAAAATAGATA------CCACTTAAATACTTTTTGACAA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               caattttgccaacagtaccatttactggtgagag-TTAAGAA-AA-GAAATA-AT-TAT-TC---A-AATGGATAAAAAGAAACA---CATTATCATTAA--T--GAA-TAAAATATGAATGATTTGG----TA--TGTCAAAT-CCACCAACAACGTGACAT--AATTG-------AT-TTTA-----AATTGGAGTGGTAAACTTGAAACGAAATCCCCATTCTTA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tT----AAACT--TGAAACGAAATCCCCATTCTTAT--T-A----CGTGTAAACCTGTAT------AA----CAGATC--AAATTGAAATGAAAATGAAATCACGTGACTCAT-T-TAACACGTCACAAAATATttacgtgtaaacctgtataacagatcaaattgaaatgaaaatgaaatcacgtgactcatttaacacgtcacaaaatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttaagaaaagaaataattattcaaatggataaaaagaaacacattatcattaatgaataaaatatgaatgatttggtatgtcaaatccaccaacaacgtgacataattgattttaaattggagtggTAAATGTC-TTAAAAA-TA-AGAT-A-AT-TAC-T---AA-AATGGATAAAAA---GTATGTCACTGTCATTAA--TCTAAA-TAAAATCC---------------------------------AA-AACTTGACAA--AATCT-------ATATTTG-----AATTGGAGTTGT-AACTTGAAACAAAATCCCCA-TTCTAAAAAAAGACA------ACAATGAAATACTTCTCGATGGC-------TCATCATTT-GA-AC----TCTTTTT----AAG-C--TGAAACAA--------ATTTTAC--A-A----TGTGTAAATC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTATCAAG--AAAAAAA--TGCTGTAGTTGAT-TTAAAAAATA-AAACTACATGTATCTTT-AA-AATGGGTAAAAA---GTATCTCATTATCATTAA--T--AAA-TAAAATCC-AGTTGTTT-GT---TG--TGTCAAAT-ATACTGA-AACGTGAAAA--AATC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TACAGTTTGATGACCGTCTCTTTGTTATTT-TG-AC----TCTTTAT----AAGGA--TGAAACAA--------TTtcttttcagtttgtgttgaatgtttagatgacagtataaaaacaacatgacaacat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGAGATACATGG---C-ACTAGT--GCTC---AT-TGGGGT----TAAAAGGAATATATCAGGGGAAAAAA---CGCTATAAATATC-TTAAAA--TA-AAGTTACATGTAT-TTTTAA-AACTAACAAAAA--AGCATTGCATTATCACTAA--T--ACA-TTAAATCGGAGTG---T------TA--TGGCAAAT-CCACCAA-AACGTGACAA--AATCC-------ATGTTTA-----GATTTAAGCAGTAAACTTGAAAC-AAATTACCATTTCTAAAAATAAACG-------CACAGAAATACTGCTTGACGACCTTAACATCGTCATTC-GG-AG----TCTTTCT----AAGATGGTGAAACAA--------TTTTTAC--T-A----CATGTAAACCTGTTT------AA----CGGATC--AAATTAAAATCAAAATGTGATCTCGTTACTCAT-T-AAATTCATCACAAAATACGTTGCAATTTTAAGTGGGAAATCTATTTTA-------GTCTAA-----CCTAGGCGCGTAACC-----AAAGTTAGGAAATCTCTTTTCAATATATTTTTTTTGCATATTTAAA-TACATTTCCTTTTGACAATACATGTT----CAGTGTATATATAGCATATA-TAGCATGCTAT-ATGGGGGTGGGG--GGGGGGATGT-TTTAACC-----------TTTAAGAAA----A---GAAATAATTATTCAAATGG--ATAAAAAGAAACACATTATCATTAATGAATAAAATATGAATGATTTGG-TA--TGTCAAATCCACCAACAACGTGACAcaacactatgtaactatg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TACAGCTTGATGACCGTCAACTGGTCATTT-TG-AC----TCTTTAT----AAGGA--TGAAACAA--------TT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GT--GTTCTTTAT-TAC--T----TAAAGGGAGTATATCAGGT-GGAAAA---CG--GTAAATATGGTTAAAAA-TATAAAATA-AT-TAT-T---AA-CATGGATAGAAA---GCTTCTTATTATCATTAA--T--AAAATAAAATGTGAATGGTTT-GG---TA--TGTTAAAT-CCACCAA-CACGTGTCAA--GATCG-------ATATTTAGATTAAATTGGAGTGGTAGCCTTGAAACGAAATTCCCATT-CTAAAAATAGACA------GTACTTAACTACTGCTTGACAACCTTTGTATCGCCATTC-GGTAC-----CTTTCTGCTTAAGATA-TTAAACA---------TTCTT----T-A----CGTGTAAAACTGTAT------AA----CAGATC--AAATTGAGATCAAAATGAAATCACGTGACTCAC-A-TAATACATCACAAAATATG--------------------TCTAT-----------ATGTAC-----CCTGGGTGCGTAGCT-----CATATTAGGAAATCCCTTTTCAATTTATTATTTTGGCATGTTTAAA-TTGGTAACCTTTTGGCAATACAGGGT----CATTGAGTAT-----ATATA-A-GCATGGTAT-ATTGG------A--AAAATTGTTT-TTAcaacactttgtaaccatg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcttttttacctacagtatacatgtagcatttcT-CAC--T----TAAAGGGATAATACCAGG--AAAAAG---TGCTATAAAAATC-ATAAAAA-TT-AAAT-G-AT-TAT-TA--AA-AATGGATTAAAA--GG-ATCTCATTATCATTAA--T--AGA-TAAAATCTGAATGGTTT-GG---TA--TGTCAAAT-CCATCGT-AACGTGACAA--AATTG-------ATATCTT-----ATTTGGAGTGGGAAACTTGAAACAAAATCCACATTT-TAAAAATAGACA------GCATTTTAATACTGTTTGATGACCTTTGCATCTTCATTT-GG-AC----TCTTTCT----AAGA---TGAAACAA--------TTTTAAC--T-ATAATTATGTAAACCTGTATTATATAAA----CGGACC--AAATTGAAATCAATATGAAATCATGTGACTCAT-gctggatctaaatctaaaatgtggaaacttctgataaattcccttt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttttttgtctcacttttaaacaaacttacagcaacatatttgtGAAATCCCTTTTCAATATAATATAGAGACAAGTTTAAA-TGGATATCCTTTTGCCAATACAGGGTCGTGCAGTGAGTATA----ATAT--AGGCATGATGT-ATT--G--GGAA--AAAAGT---T-TTTAGCCAAATTTACAAGTTTGAAAAA----gtgaaatcccttttcaatataatatagagacaagtttaaatggatatccttttgccaatacagggtcgtgcagtgagtataatataggcatgatgtattgggaaaaaagtttttagccaaatttacaagtttgaaaaatcctgatatattgactttcaaactatttctgaaatatacataataatcaac
gi|5                          :                                       ttttttgtctcacttttaaacaaacttacagcaacatatttgttcacttaaagggataataccaggaaaaagtgctataaaaatcataaaaattaaatgattattaaaaatggattaaaaggatctcattatcattaatagataaaatctgaatggtttggtatgtcaaatccatcgtaacgtgacaaaattgatatcttatttggagtgggaaacttgaaacaaaatccacattttaaaaatagacagcattttaatactgtttgatgacctttgcatcttcatttggactctttctaagatgaaacaattttaactataattatgtaaacctgtattatataaacggaccaaattgaaatcaatatgaaatcatgtgactcatgtTGAAATACACAAAATC--CTAGTCTGCTG---GT------T----TAAAGGTTGTATATCAGG--AAAAA----CGCTATAAATGTC-TTAAAAC-TA-AAACTA------T-TTT-AAGAATTGA-AACAA--AGCATCGTATGATCAAAAA--C--AAA-TAAAATCCGAATGGTTT-GG---TA--TATCAAAT-CCACCAA-AACGTGACAA--AAACG-------ATATTTT-----GATCGAAGTGATTAACTTGAAACGAAATCCGCA-TTCTAAAAATAGACATTTACTATACTTAAA-A--GTTTAACGACCTTCAAATCATCATTT-GG-AC----TATTTCT----AAGAT--C-AAACAA--------ATTCTACAATAA----CA---AAACCAGAAC------GA----CGGATC--AAATCG---TCACAA----------------------AACACGT-------TAT-----AATTTTAAGCGGGGATTCTA-TTTA-------ATCTTA-----CCTTGGCGCGTATGC-----CAAGTAAGGGAACACC--------------TTTTGGCATGCTTAAA-TAGATATCCTTATGGCAAAACGATAT----CGGTGAGTAC-----ATAT--GGGCATGCTAA-ATT-----CGAA--AAACATATTT-CT-AGCAAA---------TTTGAAAAA----AATGAAAATCATCATtcctgatatattgactttcaaactatttctgaaatatacataataatcaac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gaaatgtcattttgattatctttatttTAAGA-ATATGG---CTGCTGTT--GCCC---ATGCAG--TGTCTTAAAGGGAGTTTATCAGG--ATAAAA---CGCTATAAATGCC-TTAAAAAATA-AAAT-A-AT-CAT-C---AA-AATGAATAAAAA---GCATATTATTATCATTAA--T--GCA-TATAAACCAAATAGTTTAG----TA--TGTCAAAT-CCATCAA-AAGGTGACAA--AATCG-------ATTATTA-----AATAGGGGTGATAAAATTGAAACGTTATCCCCATTT-TAAAAATAGACA------ACACTTAAATACCGTTTAACGATAATCGCATCGTAATTC-GG-AC----CGTTTCT----AAAAT----AAACGA--------TTTTTAC--T-A----CGTGTAAACTTGTTT------TA----CGAATC--AAACTGAAATTAAAATTAAATCATATGACTAAT-T-TAATACGTCACAAAATATGCTGCCATTTTAAGTAGGAAATCTTTTTTA-------GTCTGA-----CCTAGGCGTGTAGCC-----CAAGTTAatatttcctta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttttctttggttcagaggtgtcatatacattagtgagattgcgcagtgatggTT-AA-AATGGATAAAAT--A-CATCTCATTATCATTAA--T--TAA-TAAAATCCGAATGGCGTAG----TA--TGTAAAAT-CTACCAA-AATGTGACAA--AATCGCTATTAAGTATTTA-----AATTGGAGTGTTATACATGTA--------------TCTAAAA-TAGACA------GCACTTAACTACTA---GACGACTATCGTGTCGTCATTTTGG-AT----TCTTTCT----AAGAT---AAAACAG--------CTTT-A-----A----CGTATGAACCTGCAT-------------GTAAC--ATAT-GAAATGAAAATGAAATCACTTCACTCATATATAACAGGTCACAAAACATGTTGTAGGTT-AAGCGGGAAATCTATTCTA-------GTCTAACGTAGCCTAGGTGTGTAGTCCATTGCAAGTCATGAAATCCCTAATTGATTTATTATTTTGGCATG--TAAATTATATAACATTTTGGTTATACGGGGT----CAGTGAGTATA----AT----AGGCATGATATAATTGGG--GGGAGTGAAGGT---T-TTTAGCCAAT--------TTTGAAAAA----
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TT-GG-AC----CTTTTCT----CAGAT--T-AAACCA--------TATTTTC--T-A----TA-GTAAACATGTAC------AT----GGGATC--AAATTGAAATCAAAATGAAATCATGTAACCAGT-T-TAATACTTCACAAAACATGTTAAAATTTTAAGCAGGAAATCGATTTTA-------GTCTAA-----CCT-------------------AGTTGGGAAA-CCCGTTTCAGTATATTATTTTTGCATGTTTAGA-TATATATCCTTTTGGCAATATAGGGT----CAGTGAGTATA----ATA-A-AGGCAGGATAT-ATTTG---------GAAAATATGTCTTTAGCTAA---------TTTtcctgataaattcccttta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGA---CGCTATAAATGTC-TAAAACA-T--AACTTA-AA-TAT------G-AAT--ATAAAAA--ATGAAATAATTAC--TTGACCT--AGA-TA-----CGAATGATTT-GGGATTGGCTATCAAACACGATCAA-AA----ACAAACAATCA-------ATACTTT-----AACCGAAGT-TTAAAATCGAAACAGAATTTCAATTTACAAAAAT-CATA------ATAC----ATATT----------CTTCGCCTC-CCATTC-GG-ACTATTTCTTTCT----AAGAC----AAACCA--------GTTTCGC--T-A----AAGAT-GGCCAATAT------GG----CGAATC--AAATTGAAGTC---ATGGCATTACGtataatattgacaaatcctgatatattccctttaa
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|15 ): TATGTGTCCGTTCAGATTTTATGTCAACCCACCCCTTCTGTTGTGCGCCCCCTTAGTGCGCCCCCTTTAAACTGAAACCCTGGAACCGCCCCTG
Unaligned ( gi|16 ): GTCCGGAAGCAATAATAACATTTGAAACTGCCCAGTGATGCAGTGACAGCATGAATTGACTTCAAACCCGAGCTAAACAAAAAACT
Unaligned ( gi|17 ): AAACCAGTATTCAAAATAAAAAAAATCGAAATGACAATACGAACGGCTGACACACAGCATACAAGACTGCATTTACCACAAAT
Unaligned ( gi|18 ): ATTCATAAATAGTTGCTTTTATTTCGCAAATTTCAAAGACGAGTTATCGTATTTAGAGCGCCAGTATGACTGAGAAATGA
Unaligned ( gi|21 ): ATAAATGGCATCCTGTGTTAATGAATGAGAAAAAATATTTTCTAT
Unaligned ( gi|22 ): TCTGTTAACAGTTTCTTAAATATCAAGCTTTC






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Reference ( family-438 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGAGATACACGG---C-GCTAGT--GCTC---AT-CAN--T----TAAAGGGAGTATATCAGG--AAAAAA---CGCTATAAATGTC-TTAAAAA-TA-AAATTA-AT-TAT-TTT-AA-AATGGATAAAAA--AGCATCTCATTATCATTAA--T--AAA-TAAAATCCGAATGGTTTGGTA-----TGTCAAAT-CCACCAA-AACGTGACAA--AATCG-------ATATTTA-----AATTGGAGTGGTAAACTTGAAACGAAATCCCCATTTCTAAAAATAGACA------ACACTTAAATACTGCTTGACGACCNTCGCATCGTCATTC-GG-AC----TCTTTCT----AAGAT--TGAAACAA--------TTTTTAC--T-A----CGTGTAAACCTGTAT------AA----CGGATC--AAATTGAAATCAAAATGAAATCACGTGACTCAT-T-TAATACGTCACAAAATATGTTGCAATTTTAAGCGGGAAATCTATTTTA-------GTCTAA-----CCTAGGCGCGTAGCC-----CAAGTTAGGAAATCCCTTTTCAATATATTATTTTGGCATGTTTAAA-TANATATCCTTTTGGCAATACGGGGT----CAGTGAGTATA----ATATA-AGGCATGATAT-ATTGGG--GGAA--GAAAGTATGT-TTTAGCCAA---------TTTGAAAAA----A---AAAATAATCATTCAAATGGTCACAAAAAGNAACACATTATCATTAATGAATAAAATATGAATGATTNGGATACTTGTCNAATCCANCAACAACGTGACA
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attttgtatttTGTAC------AA----CGGATTGAAAATTGAAATCAAAATGAAATCACGTGACTCAT-T-TGATACTTGACAAAATATGTTGCACTTTTAAGCGAGAAATCTATTTTACAATGTAGTTTAA-----CCTAGGCGC-TAACC-----CATGTTAGGAAATACCTTTTCAATATATTATTTTGGCATGTTTAAT-TATATATCCTTTTGGCAATACGGGGT----CAGAGAATAT-----ATCTATAGTCATGATAT-GTT-TG--AGAA--AAAAATATGT-TTAAGCCAA---------TTTGAAAAATCCTG---AAA--AACCCTTTAAA-GGTCACAAAAAGCA----------------GAATAAAA-------GATTAGGATACTTGTCTAA--CAGCA--AACGTGACAtacgctttaaaagtcccggcgtacgcccttccccctcccccctctaccgttcataaactcccatattctatcaaattcactctatttctacttaaaaacatgtgtgcccttcagattttatgatgcgctccctctaaactgaaatactggatccgtccctgtgtacaacggattgaaaattgaaatcaaaatgaaatcacgtgactcatttgatacttgacaaaatatgttgcacttttaagcgagaaatctattttacaatgtagtttaacctaggcgctaacccatgttaggaaataccttttcaatatattattttggcatgtttaattatatatccttttggcaatacggggtcagagaatatatctatagtcatgatatgtttgagaaaaaaatatgtttaagccaatttgaaaaatcctgaaaaaccctttaaaggtcacaaaaagcagaataaaagattaggatacttgtctaacagcaaacgtgaca
gi|10                         : attttgtatttttatcttaaagggaatatgtcaggaaaacacgctatccatatcaaataactattacaattgataaaaatcatctcattatcattaatagataaaaaccgaatggtttggtatttcaaatccaccaaaacgtgacaaaatcgatatatagattggagtagtaaacttgaatcgaaatcttcactctaaaaatagacaacacttaaatactgcttgacatcattcggactctttctaagatgaaacaattttactacgcgttaatctgtataaatagcagatctacgctttaaaagtcccggcgtacgcccttccccctcccccctctaccgttcataaactcccatattctatcaaattcactctatttctacttaaaaacatgtgtgcccttcagattttatgatgcgctccctctaaactgaaatactggatccgtccctgC---AT-TAA--TA---TAAAAGGG--ATATCAGG--AAAAAATTACGGTG-AAATGTC-TTAAAAA------ATTATAT-TAT-TTT-CA-AATGGATAAAAA--AACATCTCATTATCATTAA--T--AAAATAAAATCTGAATGGTTTAGTA-----CGTCAAAT-CCACCAA-AACGTGACAA--ATTCG-------ATATTAA-----AATTGGAAGGGTAAACTTTAAACAAAAGCCAAATTAAAAAAAATAGATA------CCACTTAAATACTTTTTGACAA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               caattttgccaacagtaccatttactggtgagag-TTAAGAA-AA-GAAATA-AT-TAT-TC---A-AATGGATAAAAAGAAACA---CATTATCATTAA--T--GAA-TAAAATATGAATGATTTGGTA-----TGTCAAAT-CCACCAACAACGTGACAT--AATTG-------AT-TTTA-----AATTGGAGTGGTAAACTTGAAACGAAATCCCCATTCTTA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tT----AAACT--TGAAACGAAATCCCCATTCTTAT--T-A----CGTGTAAACCTGTAT------AA----CAGATC--AAATTGAAATGAAAATGAAATCACGTGACTCAT-T-TAACACGTCACAAAATATttacgtgtaaacctgtataacagatcaaattgaaatgaaaatgaaatcacgtgactcatttaacacgtcacaaaatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttaagaaaagaaataattattcaaatggataaaaagaaacacattatcattaatgaataaaatatgaatgatttggtatgtcaaatccaccaacaacgtgacataattgattttaaattggagtggTAAATGTC-TTAAAAA-TA-AGAT-A-AT-TAC-T---AA-AATGGATAAAAA---GTATGTCACTGTCATTAA--TCTAAA-TAAAATCC--------------------------------AA-AACTTGACAA--AATCT-------ATATTTG-----AATTGGAGTTGT-AACTTGAAACAAAATCCCCA-TTCTAAAAAAAGACA------ACAATGAAATACTTCTCGATGGC-------TCATCATTT-GA-AC----TCTTTTT----AAG-C--TGAAACAA--------ATTTTAC--A-A----TGTGTAAATC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTATCAAG--AAAAAAA--TGCTGTAGTTGAT-TTAAAAAATA-AAACTACATGTATCTTT-AA-AATGGGTAAAAA---GTATCTCATTATCATTAA--T--AAA-TAAAATCC-AGTTGTTTGTTG-----TGTCAAAT-ATACTGA-AACGTGAAAA--AATC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TACAGTTTGATGACCGTCTCTTTGTTATTT-TG-AC----TCTTTAT----AAGGA--TGAAACAA--------TTtcttttcagtttgtgttgaatgtttagatgacagtataaaaacaacatgacaacat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGAGATACATGG---C-ACTAGT--GCTC---AT-TGGGGT----TAAAAGGAATATATCAGGGGAAAAAA---CGCTATAAATATC-TTAAAA--TA-AAGTTACATGTAT-TTTTAA-AACTAACAAAAA--AGCATTGCATTATCACTAA--T--ACA-TTAAATCGGAGTG---T--TA-----TGGCAAAT-CCACCAA-AACGTGACAA--AATCC-------ATGTTTA-----GATTTAAGCAGTAAACTTGAAAC-AAATTACCATTTCTAAAAATAAACG-------CACAGAAATACTGCTTGACGACCTTAACATCGTCATTC-GG-AG----TCTTTCT----AAGATGGTGAAACAA--------TTTTTAC--T-A----CATGTAAACCTGTTT------AA----CGGATC--AAATTAAAATCAAAATGTGATCTCGTTACTCAT-T-AAATTCATCACAAAATACGTTGCAATTTTAAGTGGGAAATCTATTTTA-------GTCTAA-----CCTAGGCGCGTAACC-----AAAGTTAGGAAATCTCTTTTCAATATATTTTTTTTGCATATTTAAA-TACATTTCCTTTTGACAATACATGTT----CAGTGTATATATAGCATATA-TAGCATGCTAT-ATGGGGGTGGGG--GGGGGGATGT-TTTAACC-----------TTTAAGAAA----A---GAAATAATTATTCAAATGG--ATAAAAAGAAACACATTATCATTAATGAATAAAATATGAATGATTTGG-TA--TGTCAAATCCACCAACAACGTGACAcaacactatgtaactatg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TACAGCTTGATGACCGTCAACTGGTCATTT-TG-AC----TCTTTAT----AAGGA--TGAAACAA--------TT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GT--GTTCTTTAT-TAC--T----TAAAGGGAGTATATCAGGT-GGAAAA---CG--GTAAATATGGTTAAAAA-TATAAAATA-AT-TAT-T---AA-CATGGATAGAAA---GCTTCTTATTATCATTAA--T--AAAATAAAATGTGAATGGTTTGGTA-----TGTTAAAT-CCACCAA-CACGTGTCAA--GATCG-------ATATTTAGATTAAATTGGAGTGGTAGCCTTGAAACGAAATTCCCATT-CTAAAAATAGACA------GTACTTAACTACTGCTTGACAACCTTTGTATCGCCATTC-GGTAC-----CTTTCTGCTTAAGATA-TTAAACA---------TTCTT----T-A----CGTGTAAAACTGTAT------AA----CAGATC--AAATTGAGATCAAAATGAAATCACGTGACTCAC-A-TAATACATCACAAAATATG--------------------TCTAT-----------ATGTAC-----CCTGGGTGCGTAGCT-----CATATTAGGAAATCCCTTTTCAATTTATTATTTTGGCATGTTTAAA-TTGGTAACCTTTTGGCAATACAGGGT----CATTGAGTAT-----ATATA-A-GCATGGTAT-ATTGG------A--AAAATTGT-T-TTTAGCcaacactttgtaaccatg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcttttttacctacagtatacatgtagcatttcT-CAC--T----TAAAGGGATAATACCAGG--AAAAAG---TGCTATAAAAATC-ATAAAAA-TT-AAAT-G-AT-TAT-TA--AA-AATGGATTAAAA--GG-ATCTCATTATCATTAA--T--AGA-TAAAATCTGAATGGTTTGGTA-----TGTCAAAT-CCATCGT-AACGTGACAA--AATTG-------ATATCTT-----ATTTGGAGTGGGAAACTTGAAACAAAATCCACATTT-TAAAAATAGACA------GCATTTTAATACTGTTTGATGACCTTTGCATCTTCATTT-GG-AC----TCTTTCT----AAGA---TGAAACAA--------TTTTAAC--T-ATAATTATGTAAACCTGTATTATATAAA----CGGACC--AAATTGAAATCAATATGAAATCATGTGACTCAT-tggatctaaatctaaaatgtggaaacttctgataaattcccttt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttttttgtctcacttttaaacaaacttacagcaacatatttgtGAAATCCCTTTTCAATATAATATAGAGACAAGTTTAAA-TGGATATCCTTTTGCCAATACAGGGTCGTGCAGTGAGTATA----ATAT--AGGCATGATGT-ATT--G--GGAA--AAAAGT---T-TTTAGCCAAATTTACAAGTTTGAAAAA----gtgaaatcccttttcaatataatatagagacaagtttaaatggatatccttttgccaatacagggtcgtgcagtgagtataatataggcatgatgtattgggaaaaaagtttttagccaaatttacaagtttgaaaaatcctgatatattgactttcaaactatttctgaaatatacataataatcaac
gi|5                          :                                       ttttttgtctcacttttaaacaaacttacagcaacatatttgttcacttaaagggataataccaggaaaaagtgctataaaaatcataaaaattaaatgattattaaaaatggattaaaaggatctcattatcattaatagataaaatctgaatggtttggtatgtcaaatccatcgtaacgtgacaaaattgatatcttatttggagtgggaaacttgaaacaaaatccacattttaaaaatagacagcattttaatactgtttgatgacctttgcatcttcatttggactctttctaagatgaaacaattttaactataattatgtaaacctgtattatataaacggaccaaattgaaatcaatatgaaatcatgtgactcatgtTGAAATACACAAAATC--CTAGTCTGCTG---GT------T----TAAAGGTTGTATATCAGG--AAAAA----CGCTATAAATGTC-TTAAAAC-TA-AAACTA------T-TTT-AAGAATTGA-AACAA--AGCATCGTATGATCAAAAA--C--AAA-TAAAATCCGAATGGTTTGGTA-----TATCAAAT-CCACCAA-AACGTGACAA--AAACG-------ATATTTT-----GATCGAAGTGATTAACTTGAAACGAAATCCGCA-TTCTAAAAATAGACATTTACTATACTTAAA-A--GTTTAACGACCTTCAAATCATCATTT-GG-AC----TATTTCT----AAGAT--C-AAACAA--------ATTCTACAATAA----CA---AAACCAGAAC------GA----CGGATC--AAATCG---TCACAA----------------------AACACGT-------TAT-----AATTTTAAGCGGGGATTCTA-TTTA-------ATCTTA-----CCTTGGCGCGTATGC-----CAAGTAAGGGAACACC--------------TTTTGGCATGCTTAAA-TAGATATCCTTATGGCAAAACGATAT----CGGTGAGTAC-----ATAT--GGGCATGCTAA-ATT-----CGAA--AAACATAT-T-TCTAGCAAA---------TTTGAAAAA----AATGAAAATCATCATtcctgatatattgactttcaaactatttctgaaatatacataataatcaac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gaaatgtcattttgattatctttatttTAAGA-ATATGG---CTGCTGTT--GCCC---ATGCAG--TGTCTTAAAGGGAGTTTATCAGG--ATAAAA---CGCTATAAATGCC-TTAAAAAATA-AAAT-A-AT-CAT-C---AA-AATGAATAAAAA---GCATATTATTATCATTAA--T--GCA-TATAAACCAAATAGTTTAGTA-----TGTCAAAT-CCATCAA-AAGGTGACAA--AATCG-------ATTATTA-----AATAGGGGTGATAAAATTGAAACGTTATCCCCATTT-TAAAAATAGACA------ACACTTAAATACCGTTTAACGATAATCGCATCGTAATTC-GG-AC----CGTTTCT----AAAAT----AAACGA--------TTTTTAC--T-A----CGTGTAAACTTGTTT------TA----CGAATC--AAACTGAAATTAAAATTAAATCATATGACTAAT-T-TAATACGTCACAAAATATGCTGCCATTTTAAGTAGGAAATCTTTTTTA-------GTCTGA-----CCTAGGCGTGTAGCC-----CAAGTTAatatttcctta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttttctttggttcagaggtgtcatatacattagtgagattgcgcagtgatggTT-AA-AATGGATAAAAT--A-CATCTCATTATCATTAA--T--TAA-TAAAATCCGAATGGCGTAGTA-----TGTAAAAT-CTACCAA-AATGTGACAA--AATCGCTATTAAGTATTTA-----AATTGGAGTGTTATACATGTA--------------TCTAAAA-TAGACA------GCACTTAACTACTA---GACGACTATCGTGTCGTCATTTTGG-AT----TCTTTCT----AAGAT---AAAACAG--------CTTT-A-----A----CGTATGAACCTGCAT-------------GTAAC--ATAT-GAAATGAAAATGAAATCACTTCACTCATATATAACAGGTCACAAAACATGTTGTAGGTT-AAGCGGGAAATCTATTCTA-------GTCTAACGTAGCCTAGGTGTGTAGTCCATTGCAAGTCATGAAATCCCTAATTGATTTATTATTTTGGCATG--TAAATTATATAACATTTTGGTTATACGGGGT----CAGTGAGTATA----AT----AGGCATGATATAATTGGG--GGGAGTGAAGGT---T-TTTAGCCAAT--------TTTGAAAAA----
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TT-GG-AC----CTTTTCT----CAGAT--T-AAACCA--------TATTTTC--T-A----TA-GTAAACATGTAC------AT----GGGATC--AAATTGAAATCAAAATGAAATCATGTAACCAGT-T-TAATACTTCACAAAACATGTTAAAATTTTAAGCAGGAAATCGATTTTA-------GTCTAA-----CCT-------------------AGTTGGGAAA-CCCGTTTCAGTATATTATTTTTGCATGTTTAGA-TATATATCCTTTTGGCAATATAGGGT----CAGTGAGTATA----ATA-A-AGGCAGGATAT-ATTTG---------GAAAATATGTCTTTAGCTAA---------TTTtcctgataaattcccttta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGA---CGCTATAAATGTC-TAAAACA-T--AACTTA-AA-TAT------G-AAT--ATAAAAA--ATGAAATAATTAC--TTGACCT--AGA-TA-----CGAATGATTTGGGATTGGCTATCAAACACGATCAA-AA----ACAAACAATCA-------ATACTTT-----AACCGAAGT-TTAAAATCGAAACAGAATTTCAATTTACAAAAAT-CATA------ATAC----ATATT----------CTTCGCCTC-CCATTC-GG-ACTATTTCTTTCT----AAGAC----AAACCA--------GTTTCGC--T-A----AAGAT-GGCCAATAT------GG----CGAATC--AAATTGAAGTC---ATGGCATTACGtataatattgacaaatcctgatatattccctttaa
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): CTACTTTTTACCTGTTTTATATTTATTAAGTATTTCAATGCATTGATAACTTAAAATTGTAAGTATTTTTGTTGTTTTTCTTATACATGTAGTAATGAAAGGATAAAGAACACTATAGAACGTTTTGGCCATCAAAAAGAAAATTATTAACAATGAA
Unaligned ( gi|15 ): TATGTGTCCGTTCAGATTTTATGTCAACCCACCCCTTCTGTTGTGCGCCCCCTTAGTGCGCCCCCTTTAAACTGAAACCCTGGAACCGCCCCTG
Unaligned ( gi|16 ): GTCCGGAAGCAATAATAACATTTGAAACTGCCCAGTGATGCAGTGACAGCATGAATTGACTTCAAACCCGAGCTAAACAAAAAACT
Unaligned ( gi|17 ): AAACCAGTATTCAAAATAAAAAAAATCGAAATGACAATACGAACGGCTGACACACAGCATACAAGACTGCATTTACCACAAAT
Unaligned ( gi|18 ): ATTCATAAATAGTTGCTTTTATTTCGCAAATTTCAAAGACGAGTTATCGTATTTAGAGCGCCAGTATGACTGAGAAATGA
Unaligned ( gi|21 ): ATAAATGGCATCCTGTGTTAATGAATGAGAAAAAATATTTTCTAT
Unaligned ( gi|22 ): TCTGTTAACAGTTTCTTAAATATCAAGCTTTC






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Reference ( family-438 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGAGATACACGG---C-GCTAGT--GCTC---AT-CAN--T----TAAAGGGAGTATATCAGG--AAAAAA---CGCTATAAATGTC-TTAAAAA-TA-AAATTA-AT-TAT-TTT-AA-AATGGATAAAAA--AGCATCTCATTATCATTAA--T--AAA-TAAAATCCGAATGGTTTGGTA-----TGTCAAAT-CCACCAA-AACGTGACAA--AATCG-------ATATTTA-----AATTGGAGTGGTAAACTTGAAACGAAATCCCCATTTCTAAAAATAGACA------ACACTTAAATACTGCTTGACGACCNTCGCATCGTCATTC-GG-AC----TCTTTCT----AAGAT--TGAAACAA--------TTTTTAC--T-A----CGTGTAAACCTGTAT------AA----CGGATC--AAATTGAAATCAAAATGAAATCACGTGACTCAT-T-TAATACGTCACAAAATATGTTGCAATTTTAAGCGGGAAATCTATTTTA-------GTCTAA-----CCTAGGCGCGTAGCC-----CAAGTTAGGAAATCCCTTTTCAATATATTATTTTGGCATGTTTAAA-TANATATCCTTTTGGCAATACGGGGT----CAGTGAGTATA----ATATA-AGGCATGATAT-ATTGGG--GGAA--GAAAGTATGT-TTTAGCCAA---------TTTGAAAAA----A---AAAATAATCATTCAAATGGTCACAAAAAGNAACACATTATCATTAATGAATAAAATATGAATGATTNGGATACTTGTCNAATCCANCAACAACGTGACA
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attttgtatttTGTAC------AA----CGGATTGAAAATTGAAATCAAAATGAAATCACGTGACTCAT-T-TGATACTTGACAAAATATGTTGCACTTTTAAGCGAGAAATCTATTTTACAATGTAGTTTAA-----CCTAGGCGC-TAACC-----CATGTTAGGAAATACCTTTTCAATATATTATTTTGGCATGTTTAAT-TATATATCCTTTTGGCAATACGGGGT----CAGAGAATAT-----ATCTATAGTCATGATAT-GTT-TG--AGAA--AAAAATATGT-TTAAGCCAA---------TTTGAAAAATCCTG---AAA--AACCCTTTAAA-GGTCACAAAAAGCA----------------GAATAAAA-------GATTAGGATACTTGTCTAA--CAGCA--AACGTGACAtacgctttaaaagtcccggcgtacgcccttccccctcccccctctaccgttcataaactcccatattctatcaaattcactctatttctacttaaaaacatgtgtgcccttcagattttatgatgcgctccctctaaactgaaatactggatccgtccctgtgtacaacggattgaaaattgaaatcaaaatgaaatcacgtgactcatttgatacttgacaaaatatgttgcacttttaagcgagaaatctattttacaatgtagtttaacctaggcgctaacccatgttaggaaataccttttcaatatattattttggcatgtttaattatatatccttttggcaatacggggtcagagaatatatctatagtcatgatatgtttgagaaaaaaatatgtttaagccaatttgaaaaatcctgaaaaaccctttaaaggtcacaaaaagcagaataaaagattaggatacttgtctaacagcaaacgtgaca
gi|10                         : attttgtatttttatcttaaagggaatatgtcaggaaaacacgctatccatatcaaataactattacaattgataaaaatcatctcattatcattaatagataaaaaccgaatggtttggtatttcaaatccaccaaaacgtgacaaaatcgatatatagattggagtagtaaacttgaatcgaaatcttcactctaaaaatagacaacacttaaatactgcttgacatcattcggactctttctaagatgaaacaattttactacgcgttaatctgtataaatagcagatctacgctttaaaagtcccggcgtacgcccttccccctcccccctctaccgttcataaactcccatattctatcaaattcactctatttctacttaaaaacatgtgtgcccttcagattttatgatgcgctccctctaaactgaaatactggatccgtccctgC---AT-TAA--TA---TAAAAGGG--ATATCAGG--AAAAAATTACGGTG-AAATGTC-TTAAAAA------ATTATAT-TAT-TTT-CA-AATGGATAAAAA--AACATCTCATTATCATTAA--T--AAAATAAAATCTGAATGGTTTAGTA-----CGTCAAAT-CCACCAA-AACGTGACAA--ATTCG-------ATATTAA-----AATTGGAAGGGTAAACTTTAAACAAAAGCCAAATTAAAAAAAATAGATA------CCACTTAAATACTTTTTGACAA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               caattttgccaacagtaccatttactggtgagag-TTAAGAA-AA-GAAATA-AT-TAT-TC---A-AATGGATAAAAAGAAACA---CATTATCATTAA--T--GAA-TAAAATATGAATGATTTGGTA-----TGTCAAAT-CCACCAACAACGTGACAT--AATTG-------AT-TTTA-----AATTGGAGTGGTAAACTTGAAACGAAATCCCCATTCTTA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tT----AAACT--TGAAACGAAATCCCCATTCTTAT--T-A----CGTGTAAACCTGTAT------AA----CAGATC--AAATTGAAATGAAAATGAAATCACGTGACTCAT-T-TAACACGTCACAAAATATttacgtgtaaacctgtataacagatcaaattgaaatgaaaatgaaatcacgtgactcatttaacacgtcacaaaatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttaagaaaagaaataattattcaaatggataaaaagaaacacattatcattaatgaataaaatatgaatgatttggtatgtcaaatccaccaacaacgtgacataattgattttaaattggagtggTAAATGTC-TTAAAAA-TA-AGAT-A-AT-TAC-T---AA-AATGGATAAAAA---GTATGTCACTGTCATTAA--TCTAAA-TAAAATCC--------------------------------AA-AACTTGACAA--AATCT-------ATATTTG-----AATTGGAGTTGT-AACTTGAAACAAAATCCCCA-TTCTAAAAAAAGACA------ACAATGAAATACTTCTCGATGGC-------TCATCATTT-GA-AC----TCTTTTT----AAG-C--TGAAACAA--------ATTTTAC--A-A----TGTGTAAATC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTATCAAG--AAAAAAA--TGCTGTAGTTGAT-TTAAAAAATA-AAACTACATGTATCTTT-AA-AATGGGTAAAAA---GTATCTCATTATCATTAA--T--AAA-TAAAATCC-AGTTGTTTGTTG-----TGTCAAAT-ATACTGA-AACGTGAAAA--AATC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TACAGTTTGATGACCGTCTCTTTGTTATTT-TG-AC----TCTTTAT----AAGGA--TGAAACAA--------TTtcttttcagtttgtgttgaatgtttagatgacagtataaaaacaacatgacaacat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGAGATACATGG---C-ACTAGT--GCTC---AT-TGGGGT----TAAAAGGAATATATCAGGGGAAAAAA---CGCTATAAATATC-TTAAAA--TA-AAGTTACATGTAT-TTTTAA-AACTAACAAAAA--AGCATTGCATTATCACTAA--T--ACA-TTAAATCGGAGTG---T--TA-----TGGCAAAT-CCACCAA-AACGTGACAA--AATCC-------ATGTTTA-----GATTTAAGCAGTAAACTTGAAAC-AAATTACCATTTCTAAAAATAAACG-------CACAGAAATACTGCTTGACGACCTTAACATCGTCATTC-GG-AG----TCTTTCT----AAGATGGTGAAACAA--------TTTTTAC--T-A----CATGTAAACCTGTTT------AA----CGGATC--AAATTAAAATCAAAATGTGATCTCGTTACTCAT-T-AAATTCATCACAAAATACGTTGCAATTTTAAGTGGGAAATCTATTTTA-------GTCTAA-----CCTAGGCGCGTAACC-----AAAGTTAGGAAATCTCTTTTCAATATATTTTTTTTGCATATTTAAA-TACATTTCCTTTTGACAATACATGTT----CAGTGTATATATAGCATATA-TAGCATGCTAT-ATGGGGGTGGGG--GGGGGGATGT-TTTAACC-----------TTTAAGAAA----A---GAAATAATTATTCAAATGG--ATAAAAAGAAACACATTATCATTAATGAATAAAATATGAATGATTTGG-TA--TGTCAAATCCACCAACAACGTGACAcaacactatgtaactatg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TACAGCTTGATGACCGTCAACTGGTCATTT-TG-AC----TCTTTAT----AAGGA--TGAAACAA--------TT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GT--GTTCTTTAT-TAC--T----TAAAGGGAGTATATCAGGT-GGAAAA---CG--GTAAATATGGTTAAAAA-TATAAAATA-AT-TAT-T---AA-CATGGATAGAAA---GCTTCTTATTATCATTAA--T--AAAATAAAATGTGAATGGTTTGGTA-----TGTTAAAT-CCACCAA-CACGTGTCAA--GATCG-------ATATTTAGATTAAATTGGAGTGGTAGCCTTGAAACGAAATTCCCATT-CTAAAAATAGACA------GTACTTAACTACTGCTTGACAACCTTTGTATCGCCATTC-GGTAC-----CTTTCTGCTTAAGATA-TTAAACA---------TTCTT----T-A----CGTGTAAAACTGTAT------AA----CAGATC--AAATTGAGATCAAAATGAAATCACGTGACTCAC-A-TAATACATCACAAAATATG--------------------TCTAT-----------ATGTAC-----CCTGGGTGCGTAGCT-----CATATTAGGAAATCCCTTTTCAATTTATTATTTTGGCATGTTTAAA-TTGGTAACCTTTTGGCAATACAGGGT----CATTGAGTAT-----ATATA-A-GCATGGTAT-ATTGG------A--AAAATTGT-T-TTTAGCcaacactttgtaaccatg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcttttttacctacagtatacatgtagcatttcT-CAC--T----TAAAGGGATAATACCAGG--AAAAAG---TGCTATAAAAATC-ATAAAAA-TT-AAAT-G-AT-TAT-TA--AA-AATGGATTAAAA--GG-ATCTCATTATCATTAA--T--AGA-TAAAATCTGAATGGTTTGGTA-----TGTCAAAT-CCATCGT-AACGTGACAA--AATTG-------ATATCTT-----ATTTGGAGTGGGAAACTTGAAACAAAATCCACATTT-TAAAAATAGACA------GCATTTTAATACTGTTTGATGACCTTTGCATCTTCATTT-GG-AC----TCTTTCT----AAGA---TGAAACAA--------TTTTAAC--T-ATAATTATGTAAACCTGTATTATATAAA----CGGACC--AAATTGAAATCAATATGAAATCATGTGACTCAT-tggatctaaatctaaaatgtggaaacttctgataaattcccttt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttttttgtctcacttttaaacaaacttacagcaacatatttgtGAAATCCCTTTTCAATATAATATAGAGACAAGTTTAAA-TGGATATCCTTTTGCCAATACAGGGTCGTGCAGTGAGTATA----ATAT--AGGCATGATGT-ATT--G--GGAA--AAAAGT---T-TTTAGCCAAATTTACAAGTTTGAAAAA----gtgaaatcccttttcaatataatatagagacaagtttaaatggatatccttttgccaatacagggtcgtgcagtgagtataatataggcatgatgtattgggaaaaaagtttttagccaaatttacaagtttgaaaaatcctgatatattgactttcaaactatttctgaaatatacataataatcaac
gi|5                          :                                       ttttttgtctcacttttaaacaaacttacagcaacatatttgttcacttaaagggataataccaggaaaaagtgctataaaaatcataaaaattaaatgattattaaaaatggattaaaaggatctcattatcattaatagataaaatctgaatggtttggtatgtcaaatccatcgtaacgtgacaaaattgatatcttatttggagtgggaaacttgaaacaaaatccacattttaaaaatagacagcattttaatactgtttgatgacctttgcatcttcatttggactctttctaagatgaaacaattttaactataattatgtaaacctgtattatataaacggaccaaattgaaatcaatatgaaatcatgtgactcatgtTGAAATACACAAAATC--CTAGTCTGCTG---GT------T----TAAAGGTTGTATATCAGG--AAAAA----CGCTATAAATGTC-TTAAAAC-TA-AAACTA------T-TTT-AAGAATTGA-AACAA--AGCATCGTATGATCAAAAA--C--AAA-TAAAATCCGAATGGTTTGGTA-----TATCAAAT-CCACCAA-AACGTGACAA--AAACG-------ATATTTT-----GATCGAAGTGATTAACTTGAAACGAAATCCGCA-TTCTAAAAATAGACATTTACTATACTTAAA-A--GTTTAACGACCTTCAAATCATCATTT-GG-AC----TATTTCT----AAGAT--C-AAACAA--------ATTCTACAATAA----CA---AAACCAGAAC------GA----CGGATC--AAATCG---TCACAA----------------------AACACGT-------TAT-----AATTTTAAGCGGGGATTCTA-TTTA-------ATCTTA-----CCTTGGCGCGTATGC-----CAAGTAAGGGAACACC--------------TTTTGGCATGCTTAAA-TAGATATCCTTATGGCAAAACGATAT----CGGTGAGTAC-----ATAT--GGGCATGCTAA-ATT-----CGAA--AAACATAT-T-TCTAGCAAA---------TTTGAAAAA----AATGAAAATCATCATtcctgatatattgactttcaaactatttctgaaatatacataataatcaac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gaaatgtcattttgattatctttatttTAAGA-ATATGG---CTGCTGTT--GCCC---ATGCAG--TGTCTTAAAGGGAGTTTATCAGG--ATAAAA---CGCTATAAATGCC-TTAAAAAATA-AAAT-A-AT-CAT-C---AA-AATGAATAAAAA---GCATATTATTATCATTAA--T--GCA-TATAAACCAAATAGTTTAGTA-----TGTCAAAT-CCATCAA-AAGGTGACAA--AATCG-------ATTATTA-----AATAGGGGTGATAAAATTGAAACGTTATCCCCATTT-TAAAAATAGACA------ACACTTAAATACCGTTTAACGATAATCGCATCGTAATTC-GG-AC----CGTTTCT----AAAAT----AAACGA--------TTTTTAC--T-A----CGTGTAAACTTGTTT------TA----CGAATC--AAACTGAAATTAAAATTAAATCATATGACTAAT-T-TAATACGTCACAAAATATGCTGCCATTTTAAGTAGGAAATCTTTTTTA-------GTCTGA-----CCTAGGCGTGTAGCC-----CAAGTTAatatttcctta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttttctttggttcagaggtgtcatatacattagtgagattgcgcagtgatggTT-AA-AATGGATAAAAT--A-CATCTCATTATCATTAA--T--TAA-TAAAATCCGAATGGCGTAGTA-----TGTAAAAT-CTACCAA-AATGTGACAA--AATCGCTATTAAGTATTTA-----AATTGGAGTGTTATACATGTA--------------TCTAAAA-TAGACA------GCACTTAACTACTA---GACGACTATCGTGTCGTCATTTTGG-AT----TCTTTCT----AAGAT---AAAACAG--------CTTT-A-----A----CGTATGAACCTGCAT-------------GTAAC--ATAT-GAAATGAAAATGAAATCACTTCACTCATATATAACAGGTCACAAAACATGTTGTAGGTT-AAGCGGGAAATCTATTCTA-------GTCTAACGTAGCCTAGGTGTGTAGTCCATTGCAAGTCATGAAATCCCTAATTGATTTATTATTTTGGCATG--TAAATTATATAACATTTTGGTTATACGGGGT----CAGTGAGTATA----AT----AGGCATGATATAATTGGG--GGGAGTGAAGGT---T-TTTAGCCAAT--------TTTGAAAAA----
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TT-GG-AC----CTTTTCT----CAGAT--T-AAACCA--------TATTTTC--T-A----TA-GTAAACATGTAC------AT----GGGATC--AAATTGAAATCAAAATGAAATCATGTAACCAGT-T-TAATACTTCACAAAACATGTTAAAATTTTAAGCAGGAAATCGATTTTA-------GTCTAA-----CCT-------------------AGTTGGGAAA-CCCGTTTCAGTATATTATTTTTGCATGTTTAGA-TATATATCCTTTTGGCAATATAGGGT----CAGTGAGTATA----ATA-A-AGGCAGGATAT-ATTTG---------GAAAATATGTCTTTAGCTAA---------TTTtcctgataaattcccttta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGA---CGCTATAAATGTC-TAAAACA-T--AACTTA-AA-TAT------G-AAT--ATAAAAA--ATGAAATAATTAC--TTGACCT--AGA-TA-----CGAATGATTTGGGATTGGCTATCAAACACGATCAA-AA----ACAAACAATCA-------ATACTTT-----AACCGAAGT-TTAAAATCGAAACAGAATTTCAATTTACAAAAAT-CATA------ATAC----ATATT----------CTTCGCCTC-CCATTC-GG-ACTATTTCTTTCT----AAGAC----AAACCA--------GTTTCGC--T-A----AAGAT-GGCCAATAT------GG----CGAATC--AAATTGAAGTC---ATGGCATTACGtataatattgacaaatcctgatatattccctttaa


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7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-438 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGAGATACACGG---C-GCTAGTGCTC---AT----TGN--T-TAAAGGGAGTATATCAGG--AAAAAA---CGCTATAAATGTC-TTAAAAA-TA-AAATTA-AT-TAT-TTT-AA-AATGGATAAAAA--AGCATCTCATTATCATTAA--T--AAA-TAAAATCCGAATGGTTTGGTA-----TGTCAAAT-CCACCAA-AACGTGACAA--AATCG-------ATATTTA-----AATTGGAGTGGTAAACTTGAAACGAAATCCCCATTTCTAAAAATAGACA------ACACTTAAATACTGCTTGACGACCNTCGCATCGTCATTC-GG-AC----TCTTTCT----AAGAT--TGAAACAA--------TTTTTAC--T-A----CGTGTAAACCTGTAT------AA----CGGATC--AAATTGAAATCAAAATGAAATCACGTGACTCAT-T-TAATACGTCACAAAATATGTTGCAATTTTAAGCGGGAAATCTATTTTA-------GTCTAAC-----CTAGGCGCGTAGCCCA-----AGTTAGGAAATCCCTTTTCAATATATTATTTTGGCATGTTTAAAT-ANATATCCTTTTGGCAATACGGGGT----CAGTGAGTATA----ATATA-AGGCATGATAT-A-T-----TGGGGGGAAAGTATG-T-TT-TAGCCAA---------TTTGAAAAA----A---AAAATAATCATTCAAATGGTCACAAAAAGNAACACATTATCATTAATGAATAAAATATGAATGATTNGGATACTTGTCNAATCCANCAACAACGTGACA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tT----AAACT--TGAAACGAAATCCCCATTCTTAT--T-A----CGTGTAAACCTGTAT------AA----CAGATC--AAATTGAAATGAAAATGAAATCACGTGACTCAT-T-TAACACGTCACAAAATATttacgtgtaaacctgtataacagatcaaattgaaatgaaaatgaaatcacgtgactcatttaacacgtcacaaaatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttaagaaaagaaataattattcaaatggataaaaagaaacacattatcattaatgaataaaatatgaatgatttggtatgtcaaatccaccaacaacgtgacataattgattttaaattggagtggTAAATGTC-TTAAAAA-TA-AGAT-A-AT-TAC-T---AA-AATGGATAAAAA---GTATGTCACTGTCATTAA--TCTAAA-TAAAATCC--------------------------------AA-AACTTGACAA--AATCT-------ATATTTG-----AATTGGAGTTGT-AACTTGAAACAAAATCCCCA-TTCTAAAAAAAGACA------ACAATGAAATACTTCTCGATGGC-------TCATCATTT-GA-AC----TCTTTTT----AAG-C--TGAAACAA--------ATTTTAC--A-A----TGTGTAAATC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTATCAAG--AAAAAAA--TGCTGTAGTTGAT-TTAAAAAATA-AAACTACATGTATCTTT-AA-AATGGGTAAAAA---GTATCTCATTATCATTAA--T--AAA-TAAAATCC-AGTTGTTTGTTG-----TGTCAAAT-ATACTGA-AACGTGAAAA--AATC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TACAGTTTGATGACCGTCTCTTTGTTATTT-TG-AC----TCTTTAT----AAGGA--TGAAACAA--------TTtcttttcagtttgtgttgaatgtttagatgacagtataaaaacaacatgacaacat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGAGATACATGG---C-ACTAGTGCTC---AT----TGGGGT-TAAAAGGAATATATCAGGGGAAAAAA---CGCTATAAATATC-TTAAAA--TA-AAGTTACATGTAT-TTTTAA-AACTAACAAAAA--AGCATTGCATTATCACTAA--T--ACA-TTAAATCGGAGTG---T--TA-----TGGCAAAT-CCACCAA-AACGTGACAA--AATCC-------ATGTTTA-----GATTTAAGCAGTAAACTTGAAAC-AAATTACCATTTCTAAAAATAAACG-------CACAGAAATACTGCTTGACGACCTTAACATCGTCATTC-GG-AG----TCTTTCT----AAGATGGTGAAACAA--------TTTTTAC--T-A----CATGTAAACCTGTTT------AA----CGGATC--AAATTAAAATCAAAATGTGATCTCGTTACTCAT-T-AAATTCATCACAAAATACGTTGCAATTTTAAGTGGGAAATCTATTTTA-------GTCTAAC-----CTAGGCGCGTAACCAA-----AGTTAGGAAATCTCTTTTCAATATATTTTTTTTGCATATTTAAAT-ACATTTCCTTTTGACAATACATGTT----CAGTGTATATATAGCATATA-TAGCATGCTAT-A-TGGGGGTGGGGGGGGGG-ATG-T-TT-TAACC-----------TTTAAGAAA----A---GAAATAATTATTCAAATGG--ATAAAAAGAAACACATTATCATTAATGAATAAAATATGAATGATTTGG-TA--TGTCAAATCCACCAACAACGTGACAcaacactatgtaactatg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TACAGCTTGATGACCGTCAACTGGTCATTT-TG-AC----TCTTTAT----AAGGA--TGAAACAA--------TT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTGTTCTTTAT----TAC--T-TAAAGGGAGTATATCAGGT-GGAAAA---CG--GTAAATATGGTTAAAAA-TATAAAATA-AT-TAT-T---AA-CATGGATAGAAA---GCTTCTTATTATCATTAA--T--AAAATAAAATGTGAATGGTTTGGTA-----TGTTAAAT-CCACCAA-CACGTGTCAA--GATCG-------ATATTTAGATTAAATTGGAGTGGTAGCCTTGAAACGAAATTCCCATT-CTAAAAATAGACA------GTACTTAACTACTGCTTGACAACCTTTGTATCGCCATTC-GGTAC-----CTTTCTGCTTAAGATA-TTAAACA---------TTCTT----T-A----CGTGTAAAACTGTAT------AA----CAGATC--AAATTGAGATCAAAATGAAATCACGTGACTCAC-A-TAATACATCACAAAATATG--------------------TCTAT-----------ATGTACC-----CTGGGTGCGTAGCTCA-----TATTAGGAAATCCCTTTTCAATTTATTATTTTGGCATGTTTAAAT-TGGTAACCTTTTGGCAATACAGGGT----CATTGAGTAT-----ATATA-A-GCATGGTAT-A-T-----T---GGAAAAAT-TGTT-TT-TAGCcaacactttgtaaccatg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tcttttttacctacagtatacatgtagcatttcTGTTC---A-------C--T-TAAAGGGATAATACCAGG--AAAAAG---TGCTATAAAAATC-ATAAAAA-TT-AAAT-G-AT-TAT-TA--AA-AATGGATTAAAA--GG-ATCTCATTATCATTAA--T--AGA-TAAAATCTGAATGGTTTGGTA-----TGTCAAAT-CCATCGT-AACGTGACAA--AATTG-------ATATCTT-----ATTTGGAGTGGGAAACTTGAAACAAAATCCACATTT-TAAAAATAGACA------GCATTTTAATACTGTTTGATGACCTTTGCATCTTCATTT-GG-AC----TCTTTCT----AAGA---TGAAACAA--------TTTTAAC--T-ATAATTATGTAAACCTGTATTATATAAA----CGGACC--AAATTGAAATCAATATGAAATCATGTGACTCAT-tggatctaaatctaaaatgtggaaacttctgataaattcccttt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttttttgtctcacttttaaacaaacttacagcaacatattGAAATCCCTTTTCAATATAATATAGAGACAAGTTTAAAT-GGATATCCTTTTGCCAATACAGGGTCGTGCAGTGAGTATA----ATAT--AGGCATGATGT-A-T-----TGGGAAAAAAGT----T-TT-TAGCCAAATTTACAAGTTTGAAAAA----gtgaaatcccttttcaatataatatagagacaagtttaaatggatatccttttgccaatacagggtcgtgcagtgagtataatataggcatgatgtattgggaaaaaagtttttagccaaatttacaagtttgaaaaatcctgatatattgactttcaaactatttctgaaatatacataataatcaac
gi|5                          :                                         ttttttgtctcacttttaaacaaacttacagcaacatatttgttcacttaaagggataataccaggaaaaagtgctataaaaatcataaaaattaaatgattattaaaaatggattaaaaggatctcattatcattaatagataaaatctgaatggtttggtatgtcaaatccatcgtaacgtgacaaaattgatatcttatttggagtgggaaacttgaaacaaaatccacattttaaaaatagacagcattttaatactgtttgatgacctttgcatcttcatttggactctttctaagatgaaacaattttaactataattatgtaaacctgtattatataaacggaccaaattgaaatcaatatgaaatcatgtgactcatgtTGAAATACACAAAATC--CTAGT-CTG---CT----GGT--T-TAAAGGTTGTATATCAGG--AAAAA----CGCTATAAATGTC-TTAAAAC-TA-AAACTA------T-TTT-AAGAATTGA-AACAA--AGCATCGTATGATCAAAAA--C--AAA-TAAAATCCGAATGGTTTGGTA-----TATCAAAT-CCACCAA-AACGTGACAA--AAACG-------ATATTTT-----GATCGAAGTGATTAACTTGAAACGAAATCCGCA-TTCTAAAAATAGACATTTACTATACTTAAA-A--GTTTAACGACCTTCAAATCATCATTT-GG-AC----TATTTCT----AAGAT--C-AAACAA--------ATTCTACAATAA----CA---AAACCAGAAC------GA----CGGATC--AAATCG---TCACAA----------------------AACACGT-------TAT-----AATTTTAAGCGGGGATTCTA-TTTA-------ATCTTAC-----CTTGGCGCGTATGCCA-----AGTAAGGGAACACC--------------TTTTGGCATGCTTAAAT-AGATATCCTTATGGCAAAACGATAT----CGGTGAGTAC-----ATAT--GGGCATGCTAA-A-T-----T---CGAAAAACATA-T-TTCTAGCAAA---------TTTGAAAAA----AATGAAAATCATCATtcctgatatattgactttcaaactatttctgaaatatacataataatcaac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaaatgtcattttgattatctttatttTAAGA-ATATGG---CTGCTGTTGCCC---ATGCAGTGTC-T-TAAAGGGAGTTTATCAGG--ATAAAA---CGCTATAAATGCC-TTAAAAAATA-AAAT-A-AT-CAT-C---AA-AATGAATAAAAA---GCATATTATTATCATTAA--T--GCA-TATAAACCAAATAGTTTAGTA-----TGTCAAAT-CCATCAA-AAGGTGACAA--AATCG-------ATTATTA-----AATAGGGGTGATAAAATTGAAACGTTATCCCCATTT-TAAAAATAGACA------ACACTTAAATACCGTTTAACGATAATCGCATCGTAATTC-GG-AC----CGTTTCT----AAAAT----AAACGA--------TTTTTAC--T-A----CGTGTAAACTTGTTT------TA----CGAATC--AAACTGAAATTAAAATTAAATCATATGACTAAT-T-TAATACGTCACAAAATATGCTGCCATTTTAAGTAGGAAATCTTTTTTA-------GTCTGAC-----CTAGGCGTGTAGCCCA-----AGTTAatatttcctta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttttctttggttcagaggtgtcatatacattagtgagattgcgcagtgatggTT-AA-AATGGATAAAAT--A-CATCTCATTATCATTAA--T--TAA-TAAAATCCGAATGGCGTAGTA-----TGTAAAAT-CTACCAA-AATGTGACAA--AATCGCTATTAAGTATTTA-----AATTGGAGTGTTATACATGTA--------------TCTAAAA-TAGACA------GCACTTAACTACTA---GACGACTATCGTGTCGTCATTTTGG-AT----TCTTTCT----AAGAT---AAAACAG--------CTTT-A-----A----CGTATGAACCTGCAT-------------GTAAC--ATAT-GAAATGAAAATGAAATCACTTCACTCATATATAACAGGTCACAAAACATGTTGTAGGTT-AAGCGGGAAATCTATTCTA-------GTCTAACGTAGCCTAGGTGTGTAGTCCATTGCAAGTCATGAAATCCCTAATTGATTTATTATTTTGGCATGT--AAATTATATAACATTTTGGTTATACGGGGT----CAGTGAGTATA----AT----AGGCATGATATAA-T-----TGGGGGGAGTGAAGGTT-TT-TAGCCAAT--------TTTGAAAAA----
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TT-GG-AC----CTTTTCT----CAGAT--T-AAACCA--------TATTTTC--T-A----TA-GTAAACATGTAC------AT----GGGATC--AAATTGAAATCAAAATGAAATCATGTAACCAGT-T-TAATACTTCACAAAACATGTTAAAATTTTAAGCAGGAAATCGATTTTA-------GTCTAAC-----CT-------------------AGTTGGGAAA-CCCGTTTCAGTATATTATTTTTGCATGTTTAGAT-ATATATCCTTTTGGCAATATAGGGT----CAGTGAGTATA----ATA-A-AGGCAGGATAT-A-T-----T---TGGAAAATATG-TCTT-TAGCTAA---------TTTtcctgataaattcccttta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGA---CGCTATAAATGTC-TAAAACA-T--AACTTA-AA-TAT------G-AAT--ATAAAAA--ATGAAATAATTAC--TTGACCT--AGA-TA-----CGAATGATTTGGGATTGGCTATCAAACACGATCAA-AA----ACAAACAATCA-------ATACTTT-----AACCGAAGT-TTAAAATCGAAACAGAATTTCAATTTACAAAAAT-CATA------ATAC----ATATT----------CTTCGCCTC-CCATTC-GG-ACTATTTCTTTCT----AAGAC----AAACCA--------GTTTCGC--T-A----AAGAT-GGCCAATAT------GG----CGAATC--AAATTGAAGTC---ATGGCATTACGtataatattgacaaatcctgatatattccctttaa
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): CTACTTTTTACCTGTTTTATATTTATTAAGTATTTCAATGCATTGATAACTTAAAATTGTAAGTATTTTTGTTGTTTTTCTTATACATGTAGTAATGAAAGGATAAAGAACACTATAGAACGTTTTGGCCATCAAAAAGAAAATTATTAACAATGAA
Unaligned ( gi|15 ): TATGTGTCCGTTCAGATTTTATGTCAACCCACCCCTTCTGTTGTGCGCCCCCTTAGTGCGCCCCCTTTAAACTGAAACCCTGGAACCGCCCCTG
Unaligned ( gi|16 ): GTCCGGAAGCAATAATAACATTTGAAACTGCCCAGTGATGCAGTGACAGCATGAATTGACTTCAAACCCGAGCTAAACAAAAAACT
Unaligned ( gi|17 ): AAACCAGTATTCAAAATAAAAAAAATCGAAATGACAATACGAACGGCTGACACACAGCATACAAGACTGCATTTACCACAAAT
Unaligned ( gi|18 ): ATTCATAAATAGTTGCTTTTATTTCGCAAATTTCAAAGACGAGTTATCGTATTTAGAGCGCCAGTATGACTGAGAAATGA
Unaligned ( gi|21 ): ATAAATGGCATCCTGTGTTAATGAATGAGAAAAAATATTTTCTAT
Unaligned ( gi|22 ): TCTGTTAACAGTTTCTTAAATATCAAGCTTTC