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gi|2                          :                                                                                                                                                        t-TTAAACGGTGTAGATCA-GGAAAAA-A-CACTA--A--AAATGTCTTAAAA--AA-ATAAATTAATCGTTAAAATGTATAAAAAATCTTC----TCATTATCATTTA-TAA---ATAAAATCCAAA-TAGTTTGG---TGTGTCAAATCCACTAAAACATGATAAA-AT-TGA-TATGTAGATTGGAGTGGT----------------ACAAAAT-CC-CAAA-T-CTGAAAATAGACAGCACTTAGATAC--TGCTTGATGACCTTCG-------------C------------A------------TCATCAGTCTGATGCTT-TT-TAAGATGAA--A---T--AATTT-TTT--AC-----TACGTATAAAACTGTAT-AA---CAGATCATCatt
gi|7                          : aaatgtcagttattgcataatattgaataatataattgaatttacgcttagaaaatctaaatcaaacagaacttagcaattttaaacttgattttatattttttattgatgattattttaacaaatttcctctcattatatgattactgataccTAAAGGGAGTATATCA-GGAAAAAT--TGCTATAA----ATGTCTTAATA--AAT-TA--TTA-TTTTTAAAATAGATAAAA-G-CATC----T-ATTATCATTTA-GAA---ATGGAATCCAAA-TGGTTTGG---TATGTCAAATCCACCAAAACGTGATATG-ATTCAA-TATTTAAATTGGA---------------------ACGAAAT-CC-C-CA-TTCTAAAAATAGATAGCAATAACATAC--TG-----------------------------------------------------TCAT---TGGGTTTCTT-TTCTAAGATGAA--AC--A--AG--T-TTC--AT-----TACGTGTAAACCTGTATaaacagttgctatatcaaaatgaaatcacaaaactcatttaagtagtaacaaaatatgttgcaattttaagcgggaaatctattttagtctaatataggcgcatagtccaagttaggaaatttcttttcattttattattttagcatgtttgaattgatatccttttggcaatacagggtcagcaagtgcatataggtatgacatattgaaaataaatgtttttagacaattttaaaagttttaaaaatcctgataaatatttatataatttgatttatataaatttcagttttttagagcaatatctcctgatgcacacttcacctttaatggt
gi|9                          :                                                                                                                                                           TAGAGGAAGTGTATCA-GAAA-AAT--TGTTGTAG----ATGT-TTAATA--AATGAAA-TTA-AGTTTAAAATGG----------ATC----TAATTATCATT-T-GAA---CTAATATATAAA-TGATTTGG---AATATCAAATATGTCAAAATGTGAaacagatcatattgaaatcaaaatgtaatcacgtgtctcaattcatatgtcataaaatatgtgcaattttaagtgggaaatctattttagtctaacctaggcatgtagctcaagttaggaaatgccttttcaatatattattttggcatgtttaaatagatatccttttagcaataaggggtcagtgagtatatataggcatgatgtatttgggaaaaaaagttttagccaattttaaacatttgtaaaaaaatcctgataaattccttt
gi|5                          :                                                                                                                                                            AAAGGGAGTTTATCA-GGAA-AACA-CA--ATA--TCAATGTCTTAAAA--AATAAAA-TGA-TTT--AAAATTGATGAAAAG-CATCAGTCTCATTATCATTAA-TAA---ATAAAATCGGAA-TGGTTTGG---TATATTGAATCCACCAAAACGTGACAAA-TT-TTG-TACTTAAATTAGAGTGGTA----AA--CTT-GAAACAAAAT-CC-C-AATT-CTAAAAATAGTTAACACTTAAATAC--TGCTTG---------ATGACCTTCACAT-C------------A------------TCAT---TAGAACTCTT-TC-AAAAATGAA--ACAGT------T-TTT--AC-----TACATGTAAACCTGCATTAtccacaaaaaatatagtttaatcatttctaaaaataactgtcatacattcaagcttcacattatcattcagaatgtaatttgactatatgtaaccattatgatgaataaaattgtatcagattgaagtccagggacttttttgatatgttgtgaaaagcattttaattttaaacaggaaaattattttagactttaacctggatacatagtatatgtagagtttacttcaaaagtcccttttcgatatatatcttcttttttttctgatgtgttttaatagatattcttac
gi|10                         :                                                                                                                                                            AAAGG---TATATCATGGAAAAACG-C-----AAT-AAATGTCTTAAAA--ATTAAAA-TTA-TTTTTTAAAT-GGTTAAAAG-TACC----TCATTATCATTAT-TAA---TTAACATCTGAATTGGTTTGG---TAAGTCAAATCGACCATAATGTGACAAA-AT-CAA-TATTTAAATTAGAGTGGT-----AAACCT--GAAATGAAATCTC-C-AT-T-CTTAAAATAAGCAGCTCTTGAATAC--TGCTTT---------G-------------CGACCTTCACGTAG------------TCAT---TCAGACTCTT-TTCTTAGATGAA--Attaccagtcacaaattgaaatcaaactgaaatcaagtaactcatttaatatgtgacaaaatatgttgcaattttggaagttgtaggaaatctattttagtctaacctaggtgtgtggcccaagttaggaaatcccttttcaatatatttttttggcatgtttagattgacatgatatccttttgacagtacggggtcagtaggcatgatatattgaaaaatgtttttagccaactttaatttttttttaaatcatgttataaatattttaaata
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                              TTAAAATGGATAAAG-G-CATC----TCACTATCATTAA-TAA---ATATAAACCAAA-TTGTTCAG---TATGTCAACTCCACCGAAACGTGA--TACAT-TG--TATGTAAATCGAAGTGGCCAGTAAA--CTT-GAAACAAAAT-TC-C-CA-TTCTAAAAAAAGACATTACTTAAATAC--TGTTTG---------A-------------C------------GATCTTTGCATTGTCAT---TCTGACTCTT-TC-TAAGATGAAACAC--T------T-TTT--AC-----TACGTGTAAACCTGCAT-AA---CGGATCattatattgaaataaaaatgttatcgtgtgactcatttaatacatcacaaaatatgttgcagtttttagtgggaaatcaattttagtctaacctaggcacaaagcccaagttaggaaatcccttttcaatataatattttgtcatgtttaaatagatattcttttggcaatgagggatcgttgagtatatatagggatgctatattggaaataaatgtttttagtcgatttaaacgttttgaaaaaaaatcctgatatattcctttt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAC--TGCTTG---------A-------------C------------A------------TCAT---TTAGACTTTTGTT-TAA-ATGAA--AC----------------A-------ACATGTAAACCTGTATCAATGGTGGATCTACTC-TT--AAAAAA-ACATAGTATGTGCCTTaaattgaaatcaaaatgaaatcacgctactcattcaatacgtcataaaatatgttgccattttaagtaggaaatctattttagtcttacctgggcgcgtaacccaagttaggaaatccctttcaatatattattatgacatgtttaaacagatacccttttggcaatacagggtcagtgattatatatgagcatggtatattgacaaaaaatgtaaacttttcctcagttatgtgataaaacgaatcttacattcgttctcat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -------------C------------A------------TCAT---TCTGACTCTT-TC-TAAGATAAA--AC--C--A---T-TTT--cttcc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                             ggacaggttgttgaactggccaaaatcactagaatcataaaaagtcactatttcaccatgcactttaaccagtaacctaattttacaaaaggtcactgatttaaaaggattatatcagtataacactataaatgtcttaaaaaataaaatgattatcgaaatggataaaaagcatcggattatcattaatggatatatagaatgaataatttagtatgtcaaatacacagaaacgtgacaaatttattatgtaaattttacgaccttgtcatTAAATCTGTATCAATGGCAGATCTTCTC-TT--AAAAAG-A---t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCAATGGCCGATCTACTCTTT--AAAAAA-AC--GGCGCACAACTCTACCCA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AATAACAGATCTACTCTTT--AAAAAA-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gtagtgGATCTACTCTTTTAAAAAAACA---GGCCC-CGCCACTCCCCACCCCTACCTCCACAAATTCCCATATTTCATTCAAATATACTATATTT-TAGTGAAAAACA------TGcataaactcacatatttcactaaaattcactatgtttcttctgaaaaacatgtgtgcccattcagatttggtgttgtgccccctaagcacacccttctaaatcaaaatcctggatccacccctg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTACTCTTT--AAAAAA-CCT-GGCGTATGCCG----CTGTTG-----ACC-TAAACTGCCATATGTTATTAAAATGCATTATATTTCTACTAAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACA-TAAACTCACATATTTCACTAAAATTCACTATGTTTCTTCTGAAAAACA------TGTGTGCCCATTCAGATTTGGTGTTGTGCCCCCTAAGCACACCCTTCTAAATCAAAATCCTGGATCCACCCCTGctgaaatcctggatcgatccctgtgtataatggatcaaattgatatcaaaataattagcaatcccttta
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtagtgaataacagatctactctttaaaaaAACTCCCATTTTTTATTAAAATTCACTATATTTCTACGGAAAAACATATAACTGTGTACCC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tTCTACTAAACTGAAATCCTGGATCGATCCCTGTGTATAATGGATCA------AATTG--ATATCAAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ctactctttaaaaaacctggcgtatgccgctgttgacctaaactgccatatgttattaaaatgcattatattTGTATAACAGATCA------TATTG--AAATCAAAATGTAATCACGTGTCTCAATT-CA-TATGTCATAAAATA--TGT-GCAATTTT--AAGT---GGGAAATCTATTTTAG--TCTAACCTAGGCATGTAGCTCAAGTTAGGA----------AATGCCTTTTCAA-TATA-----TTATTT-----TGGCATGTTTAAATAGAT-----A--------TCC-TT---------TT------------------AGCAATAAGGGGTCAG----TG-AGTA-----------------TATA------TA-------G-----------GCATGATGTATTTGGGAAAA-AAAGT--TTTAGCC-AATTTTAAACATTTGTAAA----AAA-A-TCCTGAT--AAATTCCT--TTataattagcaatcccttta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taaagggagtatatcaggaaaaattgctataaatgtcttaataaattattatttttaaaatagataaaagcatctattatcatttagaaatggaatccaaatggtttggtatgtcaaatccaccaaaacgtgatatgattcaatatttaaattggaacgaaatccccattctaaaaatagatagcaataacatactgtcattgggtttcttttctaagatgaaacaagtttcattacgtgtaaaccTGTATAACGGATTA------TATTG--AAATAAAAATGTTATCGTGTGACTCATTT-AA-TACATCACAAAATA--TGTTGCAGTTTT--TAGT---GGGAAATCAATTTTAG--TCTAACCTAGGCACAAAGCCCAAGTTAGGA----------AATCCCTTTTCAA-TATA-----ATATTT-----TGTCATGTTTAAATAGAT-----A--------TTC-TT---------TT------------------GGCAATGAGGGATCGT----TG-AGTA-----------------TATATAGGGATGCTATATTG-----------G---------------AAAT-AAATGTTTTTAGTCGA--TTTA---AACGTTTTGAAAAAAA-A-TCCTGAT--ATATTCCT--TTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aagggattatattaagaaaaacatcgctttaaatgtctcaaaaaataaaatcaaaacagcatctcattatcattaataaataaaatgcaaatggtttggtttgtcaaattctcaaaaacgtgacataatcgatatttaaattggagtgcaaaacatgaaatgaaatccccactctaaaaacagacagcactaaattacctttatatcgtcattcggacactttctaagatgaaataaattgtattacatgtaaaccTGTATAACAGATCATCAAACAGTTGCTATATCAAAATGAAATCACAAAACTCATTT-AAGTA-GTAACAAAATA--TGTTGCAATTTT--AAGC---GGGAAATCTATTTTAG--TCTAATATAGGCGCATAGTCCAAGTTAGGA----------AATTTCTTTTCAT-TTTA-----TTATTT-----TAGCATGTTTGAATTGAT-----A--------TCC-TT---------TT------------------GGCAATACAGGGTCAGCAAGTG-CATA-----------------T---------AG-------GTATGACATATTG---------------AAAATAAATGTTTTTAGAC-AATTTTA---AAAGTTTTA----AAA-A-TCCTGATAAATATT-----TATAT--AAT-TTG--ATT--TAT-ATAA----A
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaatgtcagttattgcataatattgaataatataattgaatttacgcttagaaaatctaaatcaaacagaacttagcaattttaaacttgattttatattttttattgatgattattttaacaaatttcctctcattatatgattactgataccttaaacggtgtagatcaggaaaaaacactaaaaatgtcttaaaaaaataaattaatcgttaaaatgtataaaaaatcttctcattatcatttataaataaaatccaaatagtttggtgtgtcaaatccactaaaacatgataaaattgatatgtagattggagtggtacaaaatcccaaatctgaaaatagacagcacttagatactgcttgatgaccttcgcatcatcagtctgatgctttttaagatgaaataattttttactacgtataaaacTGCATAACGGATCA------AATTG--AAATCAAAATGAAATCACGCTACTCATTC-AA-TACGTCATAAAATA--TGTTGCCATTTT--AAGT---AGGAAATCTATTTTAG--TCTTACCTGGGCGCGTAACCCAAGTTAGGA----------AATCCC-TTTCAA-TATA-----TTATTA-----TGACATGTTTAAACAGAT-----A--------CCC-TT---------TT------------------GGCA----------------tttcagttttttagagcaatatctcctgatgcacacttcacctttaatggt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttaaaatggataaaggcatctcactatcattaataaatataaaccaaattgttcagtatgtcaactccaccgaaacgtgatacattgtatgtaaatcgaagtggccagtaaacttgaaacaaaattcccattctaaaaaaagacattacttaaatactgtttgacgatctttgcattgtcattctgactctttctaagatgaaacactttttactacgtgtaaaccTGAATAACGGATCA------AATTA--AAATCAAAT--AAATGACGTGAATCATAT-AA-TACTTCTCGAAATAAATATTATG-TTTC--AA--------------ATTTAAG--TCTAACCTAGGTTTGTAGCCCAACTTAGGA----------AATCCCTTTTTCAGTATA-----TTATTT-----TGGAATGTTTAAATAGAT-----A--------ACCGTT---------CT------------------Gatacagggtcagtgattatatatgagcatggtatattgacaaaaaatgtaaacttttcctcagttatgtgataaaacgaatcttacattcgttctcat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gaacaattgttgaaagtgatgttaaacaccatgctaaaacaatagaacattttatatgcgaatttctaatgaaataattttaaaatttccgcttgagtgcatctttaaagggagtgtatcggaaaaacagcaatatgaatgtctgaaaagaataagataatttttaagattgataaaatcatcttattactattattaaataaaatctgaatgttttagtctgtcaaatccacaaaaatatcacaaaaagtattggtaaacgtgaaacataatcctcaattttgaaaaaaacagcacttaaatactgtttgatgacctatacgtcatcattcgagctctttctaagatgaaataatttttaataccagtacgtgtaaacaTATGACAGATCA------AATCA--GAATCAAAATGAAATCATGTCACTCATTT-GA-TAAGTCATAAAATA--TGTTGCAATTTT--taatcggggtcagtgagtataacattataggtatgatatattgggaaaaatattttaaagtt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atgatacaaagtacacagtgtgttaaccacTATGATGAATAA------AATTG--TA-TCAGATTGAAGTCCAGGGACTTTTTT-GA-TATGTTGTGAAAAG--CATTTTAATTTT--AAAC---AGGAAAATTATTTTAGACTTTAACCTGGATACATAGTATATGTAGAGTTTACTTCAAAAGTCCCTTTTCGA-TATATATCTTCTTTTTTTTCTGATGTGTTTTAATAGAT-----A--------TTC-TT---------caatatattattttggcatgtttacatcgaaaattgggggtcagtgagtatatataggcatgatatattgcaaaatatgttttagccaattaaattttttaaaaattcttgatatactttctaataatacaattttgtacaaataggaattgttaatattggtacatatttatttcatttttaaaggtaatctttctttta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tagaggaagtgtatcagaaaaattgttgtagatgtttaataaatgaaattaagtttaaaatggatctaattatcatttgaactaatatataaatgatttggaatatcaaatatgtcaaaatgtgatccacaaaaaatatagtttaatcatttctaaaaataactgtcatacattcaagcttcacattatcattcagaatgtaatttgactatatgtaaccatCA------AATTG--AAATCAAACTGAAATCAAGTAACTCATTT-AA-TATGTGACAAAATA--TGTTGCAATTTTGGAAGTTGTAGGAAATCTATTTTAG--TCTAACCTAGGTGTGTGGCCCAAGTTAGGA----------AATCCCTTTTCAA-TATA-----TTTTTT-----TGGCATGTTTAGATTGACATGATA--------TCC-TT---------TTGACAGTACGGGGTCAGTAGGCA----------------TGATATA-----------------T---------T--------------------G---------------AAAA-A--TGTTTTTAGCCAACTTTAA---TTTTTTTTT-----AA-A-TCATGTT--ATAac
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaagggagtttatcaggaaaacacaatatcaatgtcttaaaaaataaaatgatttaaaattgatgaaaagcatcagtctcattatcattaataaataaaatcggaatggtttggtatattgaatccaccaaaacgtgacaaattttgtacttaaattagagtggtaaacttgaaacaaaatcccaattctaaaaatagttaacacttaaatactgcttgatgaccttcacatcatcattagaactctttcaaaaatgaaacagtttttactacatgtaaacctgcattattaccagtcaCA------ATTTA--AAATCAAAATGAAATCA-----CTCATTT-AA-TATATCATAAAATA--TGTTGTAATTTT--AAGC---GGGAAATCTATTTTAaatattttaaata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaaggtatatcatggaaaaacgcaataaatgtcttaaaaattaaaattattttttaaatggttaaaagtacctcattatcattattaattaacatctgaattggtttggtaagtcaaatcgaccataatgtgacaaaatcaatatttaaattagagtggtaaacctgaaatgaaatctccattcttaaaataagcagctcttgaatactgctttgcgaccttcacgtagtcattcagactcttttcttagatgaaaaagcagaacagttA------AATTG--AAGCCGAAATGAAATCACATGACTCATTTTAA-TATATGACAAAAAA-------TAATTTC--AAGC---AGGAAATCTATTTAAG--TTTAA-------ACGTAGCCCAAGTTAGGA----------AATCCCTTTTCAA-AATA-----TTATTT-----TAGCATGTTTAAATAGAT-----A--------TTT-TT---------TT------------------TGCAATATGGGTCAG-----TG-AGTATATAGAGGCACAATTTAT---------TG-------G-----------G---------------AAAA-AA-TTATTTTAGCC-------------TGTTTTA----AAATA-TCCTG-----CATTCAC--TGAAAACAGCTTCA--AAT--CAC--TAA----TTAACGGTTT---AGT-TACT-TCAACA-A
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tctccattttcacatattgtctcatttaaatttatagctgaaagtttttaatgtacatgttaaagggagtatatcaggaaaaaacactataaatgtcttaaaataaaaaaaaataattttaaattggttaaaatacatctcattatcattaacaaataaaatccaaatcgctttaaagtacgtaaaatccaccaaatgtggtaaaattgtaatttaaataggattggtaaacttgaaatgaaatcccccaatagacggcacttaaatactgttagaagaccttcacatcattatttggactctttccaagatgaaacaatgtttatcatgtgttgacttatataacgtttTTTTCAA-TATA-----TTATTT-----TGGCATGTTTACATCGAA-----AATTGGGGGTCA-GTGAGTATATATA------------------GGCA----------------TGATATA-----------------T---------TG-------C-----------------------------AA-AATATGTTTTAGCC-AA--TTA---AATTTTTTA----AAA-ATTCTTGAT--ATA--CTT--TCTAAT-AATAC----AAT--TTTG-T-A----CAAATAG--G---AAT----TGTTAATATTGGTACATAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atgatacaaagtacacagtgtgttaaccactatgacagatcaaatcagaatcaaaatgaaatcatgtcactcatttgataagtcataaaatatgttgcaa------------------GGCA----------------TGATATA-----------------T---------TG-------A-----------A---------------GAAA-AAATGTTTTTATCC-ACTTTTAA--TTTTTTTTA----AAA-A-TCCTGAT--ATATTCCCTATTTAA------TCA--TAT--TATATTAA----AGAGTGA--T---AATCCACCCTCAtatttcatttttaaaggtaatctttctttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ataaacctatgtacacattcgtggagaatcgcattattatcacggacaccaggcagatagtctcttgaactattttccaaatgctgaatgtcaagcatggaatcctgttagcaccatttaagtcttgcatacagtgtcggtgagtatatataATTTTTTTAAGAC-ATTTTTA---GTGTTTTT-----------TCCTGAT--CTACACCG--TTTAA--GGTATCAGTAATCATATAATGAGAGGAAATTTG--TTAAAAT-AATCATCAATA-AAAAATATAtt
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): AACCCTTTACTCCATCAATACGTGTTTTCCCAAACCAATCACAGAATGCCTTTGAAAACAGTGCAGGAAGAGTTCAGATTGCTCGTAATGAGCAATCTGAACACTTCCTGCACAGTTTTCCACTCTGTCAGTTAATATAAACATAATTCACCCAATAATTTAAAAGCTTTCTATATTAGAGGTGTCCAAAGGCGTCTATATTAGAGGTGTCCAAAGGCGTCTATATTAGAGGTGTCCAAAGGCATCTATATGAAGTAAAGGGTTAA
Unaligned ( gi|19 ): ATATAAACATAATTCACCCATTGCTGATACGTGGTGAATTAATGCTTTCAATATTAGAGGTGTCCAAAGGCGTCTATATGACGTAAAGGGT
Unaligned ( gi|24 ): ATGAAATTGAAAAACCTGACACAGAACAAGATT






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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atgatacaaagtacacagtgtgttaaccac-TTTTCAATATA----------TTATTTTGGCATGTTTACAT--C---GAAA----ATTGGGGGTCAGTGAGTATATAT--A--GG--------------------C-----ATG-----A------TA----------TA-T---------TG-----------CAAAATATGTTTTA-GCCAA--TTAA-AT-TTTTT---AAAAATTCTTGAT--ATA--CTT--TCTAATAATAC----AAT--T-TTGT-A----CAAATAGG---AAT-T---GTTAATATTGGTACATATTcaatatattattttggcatgtttacatcgaaaattgggggtcagtgagtatatataggcatgatatattgcaaaatatgttttagccaattaaattttttaaaaattcttgatatactttctaataatacaattttgtacaaataggaattgttaatattggtacatatttatttcatttttaaaggtaatctttctttta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atgatacaaagtacacagtgtgttaaccactatgacagatcaaatcagaatcaaaatgaaatcatgtcactcatttgataagtcataaaatatgttgcaa----------AT--A--GG--------------------C-----ATG-----A------TA----------TA-T---------TG-------AAGAAAAAATGT-TTTTA-TCCACTTTTAATTT-TTTTT---AAAAA-TCCTGAT--ATATTCCCTATTTA-----ATCA--TAT--TATATTAA----AGAGTGAT---AATCCACCCTCAtatttcatttttaaaggtaatctttctttta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ataaacctatgtacacattcgtggagaatcgcattattatcacggacaccaggcagatagtctcttgaactattttccaaatgctgaatgtcaagcatggaatcctgttagcaccatttaagtcttgcatacagtgtcggtgagtatatACA-TAAACTCACATATTTCACTAAAATTCACTATGTTTCTTCTGAAAAACA------TGTGTGCCCATTCAGATTTGGTGTTGTGCCCCCTAAGCACACCCTTCTAAATCAAAATCCTGGATCCACCCCTGtt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtagtgaataacagatctactctttaaaaaCTACTCTTT-AAA-AAACCTGGCGTATGCCGCT-----GTTG-----ACC-TAAACTGCCATATGTTATTAAAATGCATTATATTTCTACTAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTACTAAACTGAAATCCTGGATCGATCCCTGTGTATAATGGATCA------AATTG--ATATCAAAATAActgaaatcctggatcgatccctgtgtataatggatcaaattgatatcaaaataattagcaatcccttta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ctactctttaaaaaacctggcgtatgccgctgttgacctaaactgccatatgttattaaaatgcattatatttTACTG---------CT-TG---------A------------C------------A------------TC---AT---TTAGACTT-TTGTTTAA-ATGAAAC-AA------------------CATGTAAACCTGTATCAATGGTGGATCTACTC-TT-AAA-AAAAC-ttagcaatcccttta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GATCTACTCTTTTAAA-AAAACAGGCCC-CGCCACT-CCCCACCCCTACCTCCACAAATTCCCATATTTCATTCAAATATACTATATTT-TAGTGAAAAACA------TGatagtatgtgccttcttcc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATTT-TTTTAAGACATTTTTAG-TG-TTTTT---------TCCTGAT--CTACACCG--TTTAA-GGTATCAGTAATCATATAATGAGAGGAAATTTGTTAAAAT-AATCATCAATA-AAAAATATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaatgtcagttattgcataatattgaataatataattgaatttacgcttagaaaatctaaatcaaacagaacttagcaattttaaacttgatttTTACTGATAC-C-TTAAACGGTGTAGATCA-GGAAAAA-A-CACTA--A--A--AATGTCTTAAAA---AAATAAATTAATCGTTAAAATGTATAAAAAATCTTC----TCATTATCATTT----ATAAA-TAAAATCCAAA-TAGTTT---GGTGTGTCAAATCCACTAAAACATGA--TAAAA-TTGATATGTAGATTGGAGTGG----T---------ACAAAAT-C-C-CAAA-TCTGAAAATAGACAGCACTTAGATACTG---------CT-TGATGACCTTCG------------C------------A------------TC---ATCAGTCTGATGC-TT-TTTAAGATGAAAT-AATTT-TT----TAC---TACGTATAAAACTGTATaaattaatcgttaaaatgtataaaaaatcttctcattatcatttataaataaaatccaaatagtttggtgtgtcaaatccactaaaacatgataaaattgatatgtagattggagtggtacaaaatcccaaatctgaaaatagacagcacttagatactgcttgatgaccttcgcatcatcagtctgatgctttttaagatgaaataattttttactacgtataaaactgtataacagatcatcaaacagttgctatatcaaaatgaaatcacaaaactcatttaagtagtaacaaaatatgttgcaattttaagcgggaaatctattttagtctaatataggcgcatagtccaagttaggaaatttcttttcattttattattttagcatgtttgaattgatatccttttggcaatacagggtcagcaagtgcatataggtatgacatattgaaaataaatgtttttagacaattttaaaagttttaaaaatcctgataaatatttatataatttgatttatataaatttcagttttttagagcaatatctcctgatgcacacttcacctttaatggt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaatgtcagttattgcataatattgaataatataattgaatttacgcttagaaaatctaaatcaaacagaacttagcaattttaaacttgattttatattttttattgatgattattttaacaaatttcctctcattatatgaTGTATAACAGATCATCAAACAGTTGCTATATCAAAATGAAATCACAAAACTCATTT-AAGTA-GTAACAAAATATGTTGCAATTTT--AAGC---GGGAAATCTATTTTAG--TCTAATATAGGCGCATAGTCCA---AG---TTA----GGAAATTTC-TTTTCATTTTA----------TTATTTTAGCATGTTTGAAT--T---GATATCCTTTTGG----CA----------ATACA--GGG-T-----------------CAGCAAGTGCATATA------GG----------TA-TGACATA---TT-------GAAAATAAATGT-TTTTA-GACAATTTTAA-AA-GTTTT---AAAAA-TCCTGATAAATAT---T--TATAT-AAT-TTG--ATT--TAT-ATAA----Aaacagatcatcaaacagttgctatatcaaaatgaaatcacaaaactcatttaagtagtaacaaaatatgttgcaattttaagcgggaaatctattttagtctaatataggcgcatagtccaagttaggaaatttcttttcattttattattttagcatgtttgaattgatatccttttggcaatacagggtcagcaagtgcatataggtatgacatattgaaaataaatgtttttagacaattttaaaagttttaaaaatcctgataaatatttatataatttgatttatataaatttcagttttttagagcaatatctcctgatgcacacttcacctttaatggt
gi|20                         : aaatgtcagttattgcataatattgaataatataattgaatttacgcttagaaaatctaaatcaaacagaacttagcaattttaaacttgattttatattttttattgatgattattttaacaaatttcctctcattatatgattactgataccttaaacggtgtagatcaggaaaaaacactaaaaatgtcttaaaaaaataaattaatcgttaaaatgtataaaaaatcttctcattatcatttataaataaaatccaaatagtttggtgtgtcaaatccactaaaacatgataaaattgatatgtagattggagtggtacaaaatcccaaatctgaaaatagacagcacttagatactgcttgatgaccttcgcatcatcagtctgatgctttttaagatgaaataattttttactacgtataaaacT-TTAAAGGGAGT----CA-GGAAAAAC---GCTTTAA-----AATGTCTTGAAA---A--TATAATAATTGTTAAAACGGATAAAAAG-tttcagttttttagagcaatatctcctgatgcacacttcacctttaatggt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tAACTCCCATTTTTTATTAAAATTCACTATATTTCTACGGAAAAACATATAACTGTGTACCCatt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tTCAATGGCCGATCTACTCTTT-AAA-AAAAC-GGCGCACAACTCT-ACC-
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TAAATCTGTATCAATGGCAGATCTTCTC-TT-AAA-AAGAca
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tctccattttcacatattgtctcatttaaatttatagctgaaTATATAACGT-TTA------AATTG--AAGCCGAAATGAAATCACATGACTCATTTTAA-TATATGACAAAAAAT-----AATTTC--AAGC---AGGAAATCTATTTAAG--TTTAA-------ACGTAGCCCA---AG---TTA----GGAAATCCC-TTTTCAAAATA----------TTATTTTAGCATGTTTAAAT--A---GATATTTTTTTTG----CA----------AT--AT-GGG-T-----------------CA----GTG-----AGTATATAGAGGCACAATTTA-T---------TG-------GG-AAAAAATTA-TTTTA-GCCTGTTTTAA-aacgtttaaattgaagccgaaatgaaatcacatgactcattttaatatatgacaaaaaataatttcaagcaggaaatctatttaagtttaaacgtagcccaagttaggaaatcccttttcaaaatattattttagcatgtttaaatagatattttttttgcaatatgggtcagtgagtatatagaggcacaatttattgggaaaaaattattttagcctgttttaaaatatcctgcattcactgaaaacagcttcaaatcactaattaacggtttagttacttcaacaa
gi|4                          :                                                                                 tctccattttcacatattgtctcatttaaatttatagctgaaagtttttaatgtacatgttaaagggagtatatcaggaaaaaacactataaatgtcttaaaataaaaaaaaataattttaaattggttaaaatacatctcattatcattaacaaataaaatccaaatcgctttaaagtacgtaaaatccaccaaatgtggtaaaattgtaatttaaataggattggtaaacttgaaatgaaatcccccaatagacggcacttaaatactgttagaagaccttcacatcattatttggactctttccaagatgaaacaatgtttatcatgtgttgactTTGAGTG-CATCT-TTAAAGGGAGTGTATC--GGAAAAACA--GCAATA-T-G--AATGTCTGAAAAG--AA-TAAGATAATTTTTAAGATTGATAAAA-T-CATC----TTATTACTATTA----TTAAA-TAAAATCTGAA-TGTTTT---AGTCTGTCAAATCCACAAAAATATCA--CAAAA---AGTATT-----------GG----TAAACGTGAAACATAAT-C-CTC-AA-TTTTGAAAAAAACAGCACTTAAATACTG---------TT-TG---------A------------T------------GACCTATACGTCATC---AT---TCGAGCTC-TT-TCTAAGATGAAAT-AA--T-TTTTAATACCAGTACGTGTAAACATG----AATAACGGATCaatatcctgcattcactgaaaacagcttcaaatcactaattaacggtttagttacttcaacaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gaacaattgttgaaagtgatgttaaacaccatgctaaaacaatagaacattttatatgcgaatttctaatgaaataattttaaaatttccgcTGAATAACGGATCA------AATTA--AAATCAAA-T-AAATGACGTGAATCATAT-AA-TACTTCTCGAAATA------AATATT--ATGT---TTCAAATTTA----AG--TCTAACCTAGGTTTGTAGCCCA---AC---TTA----GGAAATCCCTTTTTCAGTATA----------TTATTTTGGAATGTTTAAAT--A---GATAACCGTTCTG----TA----------ATC-G--GGG-T-----------------CA----GTG-----A-------G----------TA-T---------aaattaaaatcaaataaatgacgtgaatcatataatacttctcgaaataaatattatgtttcaaatttaagtctaacctaggtttgtagcccaacttaggaaatccctttttcagtatattattttggaatgtttaaatagataaccgttctgtaatcggggtcagtgagtataacattataggtatgatatattgggaaaaatattttaaagtt
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-373 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTTTTAATG-TACAT-TTAAAGGGAGTATATCA-GGAAAAACA-CGCTATAAT-A--AATGTCTTAAAA---AA-TAAAATNATTTTTAAAATGGATAAAAAG-CATC----TCATTATCATTA----ATAAA-TAAAATCCGAA-TGGTTT---GGTATGTCAAATCCACCAAAACGTGA--CANAA-TCGATATTTAAATTGGAGTG----GTAAACTTGAAACGAAA-T-C-C-CAA-TCTNAAAATAGACAGCACTTAAATACTG---------CTT---GA------------C------------G------------TC---AT---TCGGACTC-TT-TCTAAGATGAAAC-AA--T-TT----TAC---TACGTGTAAACCTGTATCAATGGCGGATCTACTCTTT-AAA--AAAAC-GGCG-CACGCCNCT-CCCGCCGCACC---ACCT----AAACTCCCATATTTCATTAAAATTCACTATATTTCTACTGAAAAACA------TGTGTACCCATTCAGATTTGGNGTTGTGCCCCCTAAGCGCGCCCTTCTAAACCGAAATCCTGGATCCACCCCTGTGTATAACGGATCA------AATTG--AAATCAAAATGAAATCACGTGACTCATTT-AA-TACGTCACAAAATATGTTGCAATTTT--AAGC---GGGAAATCTATTTTAG--TCTAACCTAGGCGCGTAGCCCA---AG---TTA----GGAAATCCC-TTTTCAATATA----------TTATTTTGGCATGTTTAAAT--A---GATATCCTTTTGGCAAT--A--GGG-TC----AG----------------T---------G----------------A---TG---TA-TTGG---GAAA------A-AAATGT-TTTTAGCCAATTTT-AA-NNTTTTT---AAAAA-TCCTGAT--ATATTCCT--TTTAA-AGTATCGAATTATAATAAAAAATGGTAAT-CACCGTCAATA-AGGTATATACT
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atgatacaaagtacacagtgtgttaaccac-TTTTCAATATA----------TTATTTTGGCATGTTTACAT--C---GAAAA----TTGG---------GGG-TC----AG----------------T---------G----------------AGTATA---TA-TAGGCATGATATATTGCA-AAATATGTTTTAGCCAATT---AA-ATTTTTT---AAAAATTCTTGAT--ATA--CTT--TCTAATAATAC--AATT-TTGT-ACAAATAGGAAT----TGTTAATATTGGTACATATTcaatatattattttggcatgtttacatcgaaaattgggggtcagtgagtatatataggcatgatatattgcaaaatatgttttagccaattaaattttttaaaaattcttgatatactttctaataatacaattttgtacaaataggaattgttaatattggtacatatttatttcatttttaaaggtaatctttctttta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atgatacaaagtacacagtgtgttaaccactatgacagatcaaatcagaatcaaaatgaaatcatgtcactcatttgataagtcataaaatatgttgcaaAT--A--GG---C----A-----------------T---------G----------------A---TA---TA-TTGA---AGAA------A-AAATGT-TTTTATCCACTTTT-AATTTTTTTT---AAAAA-TCCTGAT--ATATTCCCTATTTA-----ATCATATTATATTAAAGAGTGATAATCCACCCTCAtatttcatttttaaaggtaatctttctttta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ataaacctatgtacacattcgtggagaatcgcattattatcacggacaccaggcagatagtctcttgaactattttccaaatgctgaatgtcaagcatggaatcctgttagcaccatttaagtcttgcatacagtgtcggtgagtatatAATAACAGATCTACTCTTT-AA----AAA-------------------------------ACAT----AAACTCACATATTTCACTAAAATTCACTATGTTTCTTCTGAAAAACA------TGTGTGCCCATTCAGATTTGGTGTTGTGCCCCCTAAGCACACCCTTCTAAATCAAAATCCTGGATCCACCCCTGtt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtagtgCTACTCTTT-AAA--AAACCTGGCG-TATGCCGCT----GTTG-------ACCT----AAACTGCCATATGTTATTAAAATGCATTATATTTCTACTAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTACTAAACTGAAATCCTGGATCGATCCCTGTGTATAATGGATCA------AATTG--ATATCAAAATAActgaaatcctggatcgatccctgtgtataatggatcaaattgatatcaaaataattagcaatcccttta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ctactctttaaaaaacctggcgtatgccgctgttgacctaaactgccatatgttattaaaatgcattatatttTACTG---------CTT---GA------------C------------A------------TC---AT---TTAGACTT-TTGTTTAA-ATGAAAC-AA------------------CATGTAAACCTGTATCAATGGTGGATCTACTC-TT-AAA--AAAAC-ttagcaatcccttta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GATCTACTCTTTTAAA--AAAACAGGCC-C-CGCCACT-CCC----CACCCCTACCTCCACAAATTCCCATATTTCATTCAAATATACTATATTT-TAGTGAAAAACA------TGatagtatgtgccttcttcc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTACTGATAC-C-TTAAACGGTGTAGATCA-GGAAAAA-A-CACTA--A--A--AATGTCTTAAAA---AAATAAATTAATCGTTAAAATGTATAAAAAATCTTC----TCATTATCATTT----ATAAA-TAAAATCCAAA-TAGTTT---GGTGTGTCAAATCCACTAAAACATGA--TAAAA-TTGATATGTAGATTGGAGTG----GTA---------CAAAA-T-C-C-CAAATCTGAAAATAGACAGCACTTAGATACTG---------CTT---GA------------T------------GACCTTCGCA---TC---ATCAGTCTGATGC-TT-TTTAAGATGAAAT-AATTT-TT----TAC---TACGTATAAAACTGTAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaatgtcagttattgcataatattgaataatataattgaatttacgcttagaaaatctaaatcaaacagaacttagcaattttaaacttgattttatattttttattgatgattattttaacaaatttcctctcattatatgaTGTATAACAGATCATCAAACAGTTGCTATATCAAAATGAAATCACAAAACTCATTT-AAGTA-GTAACAAAATATGTTGCAATTTT--AAGC---GGGAAATCTATTTTAG--TCTAATATAGGCGCATAGTCCA---AG---TTA----GGAAATTTC-TTTTCATTTTA----------TTATTTTAGCATGTTTGAAT--T---GATATCCTTTTGGCAATACA--GGG-TC----AGCAAGTGCATATAGGTAT---------G----------------A---CA---TA-TT-----GAAA------ATAAATGT-TTTTAGACAATTTT-AA-AAGTTTT---AAAAA-TCCTGATAAATAT---T--TATAT-AAT-TTGATTTAT-ATAAAaacagatcatcaaacagttgctatatcaaaatgaaatcacaaaactcatttaagtagtaacaaaatatgttgcaattttaagcgggaaatctattttagtctaatataggcgcatagtccaagttaggaaatttcttttcattttattattttagcatgtttgaattgatatccttttggcaatacagggtcagcaagtgcatataggtatgacatattgaaaataaatgtttttagacaattttaaaagttttaaaaatcctgataaatatttatataatttgatttatataaatttcagttttttagagcaatatctcctgatgcacacttcacctttaatggt
gi|20                         : aaatgtcagttattgcataatattgaataatataattgaatttacgcttagaaaatctaaatcaaacagaacttagcaattttaaacttgattttatattttttattgatgattattttaacaaatttcctctcattatatgattactgataccttaaacggtgtagatcaggaaaaaacactaaaaatgtcttaaaaaaataaattaatcgttaaaatgtataaaaaatcttctcattatcatttataaataaaatccaaatagtttggtgtgtcaaatccactaaaacatgataaaattgatatgtagattggagtggtacaaaatcccaaatctgaaaatagacagcacttagatactgcttgatgaccttcgcatcatcagtctgatgctttttaagatgaaataattttttactacgtataaaacT-TTAAAGGGAGT----CA-GGAAAAAC---GCTTTAA-----AATGTCTTGAAA---A--TATAATAATTGTTAAAACGGATAAAAAG-tttcagttttttagagcaatatctcctgatgcacacttcacctttaatggt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tAACTCCCATTTTTTATTAAAATTCACTATATTTCTACGGAAAAACATATAACTGTGTACCCatt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tTCAATGGCCGATCTACTCTTT-AAA--AAAAC-GGCG-CACAACTCT-ACC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAAATCTGTATCAATGGCAGATCTTCTC-TT-AAA--AAGAca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AGTTTTTAATG-TACATGTTAAAGGGAGTATATCA-GGAAAAA-A-CACTATAA------ATGTCTTAAAATAAAA-AAAAATAATTTT-AAATTGGTTAAAATA-CATC----TCATTATCATTA----ACAAA-TAAAATCCAAA-TCGCTTTAAAGTACGTAAAATCCACC-AAATGTGG--TAAAA-TTGTAATTTAAATAGGATTG----GTAAACTTGAAATGAAA-T-C-C-C---CC----AATAGACGGCACTTAAATACTGTTAGAAGACCTT---CA------------C------------A------------TCATTAT---TTGGACTC-TT-TCCAAGATGAAAC-AA--TGTT----TAT---CATGTGTTGACTTATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tctccattttcacatattgtctcatttaaatttatagctgaaTATATAACGT-TTA------AATTG--AAGCCGAAATGAAATCACATGACTCATTTTAA-TATATGACAAAAAAT-----AATTTC--AAGC---AGGAAATCTATTTAAG--TTTAA-------ACGTAGCCCA---AG---TTA----GGAAATCCC-TTTTCAAAATA----------TTATTTTAGCATGTTTAAAT--A---GATATTTTTTTTGCAAT--AT-GGG-TC----AG----------------T---------GAGTATATAGAGGCACAA---TT---TA-TTGG---GAAA------A-AATTA--TTTTAGCCTGTTTT-AA-AATaacgtttaaattgaagccgaaatgaaatcacatgactcattttaatatatgacaaaaaataatttcaagcaggaaatctatttaagtttaaacgtagcccaagttaggaaatcccttttcaaaatattattttagcatgtttaaatagatattttttttgcaatatgggtcagtgagtatatagaggcacaatttattgggaaaaaattattttagcctgttttaaaatatcctgcattcactgaaaacagcttcaaatcactaattaacggtttagttacttcaacaa
gi|4                          :                                                                                 tctccattttcacatattgtctcatttaaatttatagctgaaagtttttaatgtacatgttaaagggagtatatcaggaaaaaacactataaatgtcttaaaataaaaaaaaataattttaaattggttaaaatacatctcattatcattaacaaataaaatccaaatcgctttaaagtacgtaaaatccaccaaatgtggtaaaattgtaatttaaataggattggtaaacttgaaatgaaatcccccaatagacggcacttaaatactgttagaagaccttcacatcattatttggactctttccaagatgaaacaatgtttatcatgtgttgactTTGAGTG-CATCT-TTAAAGGGAGTGTATC--GGAAAAACA--GCAATA-T-G--AATGTCTGAAAAG--AA-TAAGATAATTTTTAAGATTGATAAAA-T-CATC----TTATTACTATTA----TTAAA-TAAAATCTGAA-TGTTTT---AGTCTGTCAAATCCACAAAAATATCA--CAAAA---AGTATT-----------G----GTAAACGTGAAACATAA-T-C-CTCAA-TTTTGAAAAAAACAGCACTTAAATACTG---------TTT---GA------------T------------GACCTATACGTCATC---AT---TCGAGCTC-TT-TCTAAGATGAAAT-AA--T-TTTTAATACCAGTACGTGTAAACATG----AATAACGGATCatcctgcattcactgaaaacagcttcaaatcactaattaacggtttagttacttcaacaa
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atgatacaaagtacacagtgtgttaaccac-TTTTCAATATA----------TTATTTTGGCATGTTTACAT--C---GAAAA----TTGG---------GGG-TC----AG----------------T---------G----------------AGTATA---TA-TAGGCATGATATATTGCA-AAATATGTTTTAGCCAATT---AA-ATTTTTT---AAAAATTCTTGAT--ATA--C-TT--TCTAATAATA---C--AATT-TTGTACAAA-TAG--GAAT----TGTTAATATTGGTACATATTcaatatattattttggcatgtttacatcgaaaattgggggtcagtgagtatatataggcatgatatattgcaaaatatgttttagccaattaaattttttaaaaattcttgatatactttctaataatacaattttgtacaaataggaattgttaatattggtacatatttatttcatttttaaaggtaatctttctttta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atgatacaaagtacacagtgtgttaaccactatgacagatcaaatcagaatcaaaatgaaatcatgtcactcatttgataagtcataaaatatgttgcaaAT--A--GG---C----A-----------------T---------G----------------A---TA---TA-TTGA---AGAA------A-AAATGT-TTTTATCCACTTTT-AATTTTTTTT---AAAAATCCT-GAT--ATATTC-CCTATTTA-----A---TCATATTATATTAAAGAGTGA--TAATCCACCCTCAtatttcatttttaaaggtaatctttctttta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ataaacctatgtacacattcgtggagaatcgcattattatcacggacaccaggcagatagtctcttgaactattttccaaatgctgaatgtcaagcatggaatcctgttagcaccatttaagtcttgcatacagtgtcggtgagtatatAATAACAGATCTACTCTTT-AA----AAA-------------------------------ACAT----AAACTCACATATTTCACTAAAATTCACTATGTTTCTTCTGAAAAACA------TGTGTGCCCATTCAGATTTGGTGTTGTGCCCCCTAAGCACACCCTTCTAAATCAAAATCCTGGATCCACCCCTGtt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtagtgCTACTCTTT-AAA--AAACCTGGCG-TATGCCGCT----GTTG-------ACCT----AAACTGCCATATGTTATTAAAATGCATTATATTTCTACTAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTACTAAACTGAAATCCTGGATCGATCCCTGTGTATAATGGATCA------AATTG--ATATCAAAATAActgaaatcctggatcgatccctgtgtataatggatcaaattgatatcaaaataattagcaatcccttta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ctactctttaaaaaacctggcgtatgccgctgttgacctaaactgccatatgttattaaaatgcattatatttTACTG---------CTT---GA------------C------------A------------TC---AT---TTAGACTT-TTGTTTAA-ATGAAAC-AA------------------CATGTAAACCTGTATCAATGGTGGATCTACTC-TT-AAA--AAAAC-ttagcaatcccttta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GATCTACTCTTTTAAA--AAAACAGGCC-C-CGCCACT-CCC----CACCCCTACCTCCACAAATTCCCATATTTCATTCAAATATACTATATTT-TAGTGAAAAACA------TGatagtatgtgccttcttcc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTACTGATAC-C-TTAAACGGTGTAGATCA-GGAAAAA-A-CACTA--A--A--AATGTCTTAAAA---AAATAAATTAATCGTTAAAATGTATAAAAAATCTTC----TCATTATCATTT----ATAAA-TAAAATCCAAA-TAGTTT---GGTGTGTCAAATCCACTAAAACATGA--TAAAA-TTGATATGTAGATTGGAGTG----GTA---------CAAAA-T-C-C-CAAATCTGAAAATAGACAGCACTTAGATACTG---------CTT---GA------------T------------GACCTTCGCA---TC---ATCAGTCTGATGC-TT-TTTAAGATGAAAT-AATTT-TT----TAC---TACGTATAAAACTGTAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaatgtcagttattgcataatattgaataatataattgaatttacgcttagaaaatctaaatcaaacagaacttagcaattttaaacttgattttatattttttattgatgattattttaacaaatttcctctcattatatgaTGTATAACAGATCATCAAACAGTTGCTATATCAAAATGAAATCACAAAACTCATTT-AAGTA-GTAACAAAATATGTTGCAATTTT--AAGC---GGGAAATCTATTTTAG--TCTAATATAGGCGCATAGTCCA---AG---TTA----GGAAATTTC-TTTTCATTTTA----------TTATTTTAGCATGTTTGAAT--T---GATATCCTTTTGGCAATACA--GGG-TC----AGCAAGTGCATATAGGTAT---------G----------------A---CA---TA-TT-----GAAA------ATAAATGT-TTTTAGACAATTTT-AA-AAGTTTT---AAAAATCCT-GATAAATAT----T--TATAT-AAT----TTGATTTAT-ATAAAaacagatcatcaaacagttgctatatcaaaatgaaatcacaaaactcatttaagtagtaacaaaatatgttgcaattttaagcgggaaatctattttagtctaatataggcgcatagtccaagttaggaaatttcttttcattttattattttagcatgtttgaattgatatccttttggcaatacagggtcagcaagtgcatataggtatgacatattgaaaataaatgtttttagacaattttaaaagttttaaaaatcctgataaatatttatataatttgatttatataaatttcagttttttagagcaatatctcctgatgcacacttcacctttaatggt
gi|20                         : aaatgtcagttattgcataatattgaataatataattgaatttacgcttagaaaatctaaatcaaacagaacttagcaattttaaacttgattttatattttttattgatgattattttaacaaatttcctctcattatatgattactgataccttaaacggtgtagatcaggaaaaaacactaaaaatgtcttaaaaaaataaattaatcgttaaaatgtataaaaaatcttctcattatcatttataaataaaatccaaatagtttggtgtgtcaaatccactaaaacatgataaaattgatatgtagattggagtggtacaaaatcccaaatctgaaaatagacagcacttagatactgcttgatgaccttcgcatcatcagtctgatgctttttaagatgaaataattttttactacgtataaaacT-TTAAAGGGAGT----CA-GGAAAAAC---GCTTTAA-----AATGTCTTGAAA---A--TATAATAATTGTTAAAACGGATAAAAAG-tttcagttttttagagcaatatctcctgatgcacacttcacctttaatggt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tAACTCCCATTTTTTATTAAAATTCACTATATTTCTACGGAAAAACATATAACTGTGTACCCatt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tTCAATGGCCGATCTACTCTTT-AAA--AAAAC-GGCG-CACAACTCT-ACC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAAATCTGTATCAATGGCAGATCTTCTC-TT-AAA--AAGAca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AGTTTTTAATG-TACATGTTAAAGGGAGTATATCA-GGAAAAA-A-CACTATAA------ATGTCTTAAAATAAAA-AAAAATAATTTT-AAATTGGTTAAAATA-CATC----TCATTATCATTA----ACAAA-TAAAATCCAAA-TCGCTTTAAAGTACGTAAAATCCACC-AAATGTGG--TAAAA-TTGTAATTTAAATAGGATTG----GTAAACTTGAAATGAAA-T-C-C-C---CC----AATAGACGGCACTTAAATACTGTTAGAAGACCTT---CA------------C------------A------------TCATTAT---TTGGACTC-TT-TCCAAGATGAAAC-AA--TGTT----TAT---CATGTGTTGACTTATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tctccattttcacatattgtctcatttaaatttatagctgaaTATATAACGT-TTA------AATTG--AAGCCGAAATGAAATCACATGACTCATTTTAA-TATATGACAAAAAAT-----AATTTC--AAGC---AGGAAATCTATTTAAG--TTTAA-------ACGTAGCCCA---AG---TTA----GGAAATCCC-TTTTCAAAATA----------TTATTTTAGCATGTTTAAAT--A---GATATTTTTTTTGCAAT--AT-GGG-TC----AG----------------T---------GAGTATATAGAGGCACAA---TT---TA-TTGG---GAAA------A-AATTA--TTTTAGCCTGTTTT-AA-AAT-----------ATCCT-G-----CATTCAC----TGAA-AACAGCTTCAAATCAC--TAATTAACGGTTTAGT-TACT-TCAACAaacgtttaaattgaagccgaaatgaaatcacatgactcattttaatatatgacaaaaaataatttcaagcaggaaatctatttaagtttaaacgtagcccaagttaggaaatcccttttcaaaatattattttagcatgtttaaatagatattttttttgcaatatgggtcagtgagtatatagaggcacaatttattgggaaaaaattattttagcctgttttaaaatatcctgcattcactgaaaacagcttcaaatcactaattaacggtttagttacttcaacaa
gi|4                          :                                                                                 tctccattttcacatattgtctcatttaaatttatagctgaaagtttttaatgtacatgttaaagggagtatatcaggaaaaaacactataaatgtcttaaaataaaaaaaaataattttaaattggttaaaatacatctcattatcattaacaaataaaatccaaatcgctttaaagtacgtaaaatccaccaaatgtggtaaaattgtaatttaaataggattggtaaacttgaaatgaaatcccccaatagacggcacttaaatactgttagaagaccttcacatcattatttggactctttccaagatgaaacaatgtttatcatgtgttgactTTGAGTG-CATCT-TTAAAGGGAGTGTATC--GGAAAAACA--GCAATA-T-G--AATGTCTGAAAAG--AA-TAAGATAATTTTTAAGATTGATAAAA-T-CATC----TTATTACTATTA----TTAAA-TAAAATCTGAA-TGTTTT---AGTCTGTCAAATCCACAAAAATATCA--CAAAA---AGTATT-----------G----GTAAACGTGAAACATAA-T-C-CTCAA-TTTTGAAAAAAACAGCACTTAAATACTG---------TTT---GA------------T------------GACCTATACGTCATC---AT---TCGAGCTC-TT-TCTAAGATGAAAT-AA--T-TTTTAATACCAGTACGTGTAAACATG----AATAACGGATCa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gaacaattgttgaaagtgatgttaaacaccatgctaaaacaatagaacattttatatgcgaatttctaatgaaataattttaaaatttccgcTGAATAACGGATCA------AATTA--AAATCAAA-T-AAATGACGTGAATCATAT-AA-TACTTCTCGAAATA------AATATT--ATGT---TTCAAATTTA----AG--TCTAACCTAGGTTTGTAGCCCA---AC---TTA----GGAAATCCCTTTTTCAGTATA----------TTATTTTGGAATGTTTAAAT--A---GATAACCGTTCTGTAATC-G--GGG-TC----AG----------------T---------G----------------A----G---TA-Taaattaaaatcaaataaatgacgtgaatcatataatacttctcgaaataaatattatgtttcaaatttaagtctaacctaggtttgtagcccaacttaggaaatccctttttcagtatattattttggaatgtttaaatagataaccgttctgtaatcggggtcagtgagtataacattataggtatgatatattgggaaaaatattttaaagtt
gi|5                          :                                                       gaacaattgttgaaagtgatgttaaacaccatgctaaaacaatagaacattttatatgcgaatttctaatgaaataattttaaaatttccgcttgagtgcatctttaaagggagtgtatcggaaaaacagcaatatgaatgtctgaaaagaataagataatttttaagattgataaaatcatcttattactattattaaataaaatctgaatgttttagtctgtcaaatccacaaaaatatcacaaaaagtattggtaaacgtgaaacataatcctcaattttgaaaaaaacagcacttaaatactgtttgatgacctatacgtcatcattcgagctctttctaagatgaaataatttttaataccagtacgtgtaaacaAAAGGGAGTTTATCA-GGAAAA-CA-C-----AAT-ATCAATGTCTTAAAA---AA-TAAAATGATTT--AAAATTGATGAAAAG-CATCAGTCTCATTATCATTA----ATAAA-TAAAATCGGAA-TGGTTT---GGTATATTGAATCCACCAAAACGTGA--CAAAT-TTTGTACTTAAATTAGAGTG----GTAAACTTGAAACAAAA-T-C-C-CAATTCTAAAAATAGTTAACACTTAAATACTG---------CTT---GATGACCTTCACATC------------A------------TC---AT---TAGAACTC-TT-TCAAAAATGAAAC-AGT-T-TT----TAC---TACATGTAAACCTGCATTAaacattataggtatgatatattgggaaaaatattttaaagtt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CA------AATTG--AAATCAAACTGAAATCAAGTAACTCATTT-AA-TATGTGACAAAATATGTTGCAATTTTGGAAGTTGTAGGAAATCTATTTTAG--TCTAACCTAGGTGTGTGGCCCA---AG---TTA----GGAAATCCC-TTTTCAATATA----------TTTTTTTGGCATGTTTAGATTGACATGATATCCTTTTGACAGT--ACGGGG-TC----AGTAGGCA----------T---------G----------------A---TA---TA-TTG-------A------A-AAATGT-TTTTAGCCAACTTT-AA-TTTTTTT---TTAAATCAT-GTT--ATAAAT-AT--TTTAA-Attaccagtcacaaattgaaatcaaactgaaatcaagtaactcatttaatatgtgacaaaatatgttgcaattttggaagttgtaggaaatctattttagtctaacctaggtgtgtggcccaagttaggaaatcccttttcaatatatttttttggcatgtttagattgacatgatatccttttgacagtacggggtcagtaggcatgatatattgaaaaatgtttttagccaactttaatttttttttaaatcatgttataaatattttaaata
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                ttaaaatggataaaggcatctcactatcattaataaatataaaccaaattgttcagtatgtcaactccaccgaaacgtgatacattgtatgtaaatcgaagtggccagtaaacttgaaacaaaattcccattctaaaaaaagacattacttaaatactgtttgacgatctttgcattgtcattctgactctttctaagatgaaacactttttactacgtgtaaaccTAGAGGAAGTGTATCA-GAAAAA------TTGTTGT-A--GATGT-TTAATA---AA-TGAAATTAAGTTTAAAATGG----------ATC----TAATTATCATT------TGAACTAATATATAAA-TGATTT---GGAATATCAAATATGTCAAAATGTGATCCACAA-atatgagcatggtatattgacaaaaaatgtaaacttttcctcagttatgtgataaaacgaatcttacattcgttctcat
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): AACCCTTTACTCCATCAATACGTGTTTTCCCAAACCAATCACAGAATGCCTTTGAAAACAGTGCAGGAAGAGTTCAGATTGCTCGTAATGAGCAATCTGAACACTTCCTGCACAGTTTTCCACTCTGTCAGTTAATATAAACATAATTCACCCAATAATTTAAAAGCTTTCTATATTAGAGGTGTCCAAAGGCGTCTATATTAGAGGTGTCCAAAGGCGTCTATATTAGAGGTGTCCAAAGGCATCTATATGAAGTAAAGGGTTAA
Unaligned ( gi|19 ): ATATAAACATAATTCACCCATTGCTGATACGTGGTGAATTAATGCTTTCAATATTAGAGGTGTCCAAAGGCGTCTATATGACGTAAAGGGT
Unaligned ( gi|24 ): ATGAAATTGAAAAACCTGACACAGAACAAGATT






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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atgatacaaagtacacagtgtgttaaccac-TTTTCAATATA----------TTATTTTGGCATGTTTACAT--C---GAAAA----TTGG---------GGG-TC----AG----------------T---------G----------------AGTATA---TA-TAGGCATGATATATTGCA-AAATATGTTTTAGCCAATT---AA-ATTTTTT---AAAAATTCTTGAT--ATA--C-TT--TCTAATAATA---C--AATTTT-G-TACAAA-TAG--GAAT----TGTTAATATTGGTACATATTcaatatattattttggcatgtttacatcgaaaattgggggtcagtgagtatatataggcatgatatattgcaaaatatgttttagccaattaaattttttaaaaattcttgatatactttctaataatacaattttgtacaaataggaattgttaatattggtacatatttatttcatttttaaaggtaatctttctttta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atgatacaaagtacacagtgtgttaaccactatgacagatcaaatcagaatcaaaatgaaatcatgtcactcatttgataagtcataaaatatgttgcaaAT--A--GG---C----A-----------------T---------G----------------A---TA---TA-TTGA---AGAA------A-AAATGT-TTTTATCCACTTTT-AATTTTTTTT---AAAAATCCT-GAT--ATATTC-CCTATTTA-----A---TCATATTAT-ATTAAAGAGTGA--TAATCCACCCTCAtatttcatttttaaaggtaatctttctttta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ataaacctatgtacacattcgtggagaatcgcattattatcacggacaccaggcagatagtctcttgaactattttccaaatgctgaatgtcaagcatggaatcctgttagcaccatttaagtcttgcatacagtgtcggtgagtatatAATAACAGATCTACTCTTT-AA----AAA-------------------------------ACAT----AAACTCACATATTTCACTAAAATTCACTATGTTTCTTCTGAAAAACA------TGTGTGCCCATTCAGATTTGGTGTTGTGCCCCCTAAGCACACCCTTCTAAATCAAAATCCTGGATCCACCCCTGtt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtagtgCTACTCTTT-AAA--AAACCTGGCG-TATGCCGCT----GTTG-------ACCT----AAACTGCCATATGTTATTAAAATGCATTATATTTCTACTAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTACTAAACTGAAATCCTGGATCGATCCCTGTGTATAATGGATCA------AATTG--ATATCAAAATAActgaaatcctggatcgatccctgtgtataatggatcaaattgatatcaaaataattagcaatcccttta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ctactctttaaaaaacctggcgtatgccgctgttgacctaaactgccatatgttattaaaatgcattatatttTACTG---------CTT---GA------------C------------A------------TC---AT---TTAGACTT-TTGTTTAA-ATGAAAC-AA------------------CATGTAAACCTGTATCAATGGTGGATCTACTC-TT-AAA--AAAAC-ttagcaatcccttta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GATCTACTCTTTTAAA--AAAACAGGCC-C-CGCCACT-CCC----CACCCCTACCTCCACAAATTCCCATATTTCATTCAAATATACTATATTT-TAGTGAAAAACA------TGatagtatgtgccttcttcc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTACTGATAC-C-TTAAACGGTGTAGATCA-GGAAAAA-A-CACTA--A--A--AATGTCTTAAAA---AAATAAATTAATCGTTAAAATGTATAAAAAATCTTC----TCATTATCATTT----ATAAA-TAAAATCCAAA-TAGTTT---GGTGTGTCAAATCCACTAAAACATGA--TAAAA-TTGATATGTAGATTGGAGTG----GTA---------CAAAA-T-C-C-CAAATCTGAAAATAGACAGCACTTAGATACTG---------CTT---GA------------T------------GACCTTCGCA---TC---ATCAGTCTGATGC-TT-TTTAAGATGAAAT-AATTT-TT----TAC---TACGTATAAAACTGTAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaatgtcagttattgcataatattgaataatataattgaatttacgcttagaaaatctaaatcaaacagaacttagcaattttaaacttgattttatattttttattgatgattattttaacaaatttcctctcattatatgaTGTATAACAGATCATCAAACAGTTGCTATATCAAAATGAAATCACAAAACTCATTT-AAGTA-GTAACAAAATATGTTGCAATTTT--AAGC---GGGAAATCTATTTTAG--TCTAATATAGGCGCATAGTCCA---AG---TTA----GGAAATTTC-TTTTCATTTTA----------TTATTTTAGCATGTTTGAAT--T---GATATCCTTTTGGCAATACA--GGG-TC----AGCAAGTGCATATAGGTAT---------G----------------A---CA---TA-TT-----GAAA------ATAAATGT-TTTTAGACAATTTT-AA-AAGTTTT---AAAAATCCT-GATAAATAT----T--TATAT-AAT----TTGATTTAT-A-TAAAaacagatcatcaaacagttgctatatcaaaatgaaatcacaaaactcatttaagtagtaacaaaatatgttgcaattttaagcgggaaatctattttagtctaatataggcgcatagtccaagttaggaaatttcttttcattttattattttagcatgtttgaattgatatccttttggcaatacagggtcagcaagtgcatataggtatgacatattgaaaataaatgtttttagacaattttaaaagttttaaaaatcctgataaatatttatataatttgatttatataaatttcagttttttagagcaatatctcctgatgcacacttcacctttaatggt
gi|20                         : aaatgtcagttattgcataatattgaataatataattgaatttacgcttagaaaatctaaatcaaacagaacttagcaattttaaacttgattttatattttttattgatgattattttaacaaatttcctctcattatatgattactgataccttaaacggtgtagatcaggaaaaaacactaaaaatgtcttaaaaaaataaattaatcgttaaaatgtataaaaaatcttctcattatcatttataaataaaatccaaatagtttggtgtgtcaaatccactaaaacatgataaaattgatatgtagattggagtggtacaaaatcccaaatctgaaaatagacagcacttagatactgcttgatgaccttcgcatcatcagtctgatgctttttaagatgaaataattttttactacgtataaaacT-TTAAAGGGAGT----CA-GGAAAAAC---GCTTTAA-----AATGTCTTGAAA---A--TATAATAATTGTTAAAACGGATAAAAAG-tttcagttttttagagcaatatctcctgatgcacacttcacctttaatggt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tAACTCCCATTTTTTATTAAAATTCACTATATTTCTACGGAAAAACATATAACTGTGTACCCatt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tTCAATGGCCGATCTACTCTTT-AAA--AAAAC-GGCG-CACAACTCT-ACC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAAATCTGTATCAATGGCAGATCTTCTC-TT-AAA--AAGAca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AGTTTTTAATG-TACATGTTAAAGGGAGTATATCA-GGAAAAA-A-CACTATAA------ATGTCTTAAAATAAAA-AAAAATAATTTT-AAATTGGTTAAAATA-CATC----TCATTATCATTA----ACAAA-TAAAATCCAAA-TCGCTTTAAAGTACGTAAAATCCACC-AAATGTGG--TAAAA-TTGTAATTTAAATAGGATTG----GTAAACTTGAAATGAAA-T-C-C-C---CC----AATAGACGGCACTTAAATACTGTTAGAAGACCTT---CA------------C------------A------------TCATTAT---TTGGACTC-TT-TCCAAGATGAAAC-AA--TGTT----TAT---CATGTGTTGACTTATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tctccattttcacatattgtctcatttaaatttatagctgaaTATATAACGT-TTA------AATTG--AAGCCGAAATGAAATCACATGACTCATTTTAA-TATATGACAAAAAAT-----AATTTC--AAGC---AGGAAATCTATTTAAG--TTTAA-------ACGTAGCCCA---AG---TTA----GGAAATCCC-TTTTCAAAATA----------TTATTTTAGCATGTTTAAAT--A---GATATTTTTTTTGCAAT--AT-GGG-TC----AG----------------T---------GAGTATATAGAGGCACAA---TT---TA-TTGG---GAAA------A-AATTA--TTTTAGCCTGTTTT-AA-AAT-----------ATCCT-G-----CATTCAC----TGAA-AACAGCTTCAAATCAC---TAATTAACGGTTTAGT-TACT-TCAACAaacgtttaaattgaagccgaaatgaaatcacatgactcattttaatatatgacaaaaaataatttcaagcaggaaatctatttaagtttaaacgtagcccaagttaggaaatcccttttcaaaatattattttagcatgtttaaatagatattttttttgcaatatgggtcagtgagtatatagaggcacaatttattgggaaaaaattattttagcctgttttaaaatatcctgcattcactgaaaacagcttcaaatcactaattaacggtttagttacttcaacaa
gi|4                          :                                                                                 tctccattttcacatattgtctcatttaaatttatagctgaaagtttttaatgtacatgttaaagggagtatatcaggaaaaaacactataaatgtcttaaaataaaaaaaaataattttaaattggttaaaatacatctcattatcattaacaaataaaatccaaatcgctttaaagtacgtaaaatccaccaaatgtggtaaaattgtaatttaaataggattggtaaacttgaaatgaaatcccccaatagacggcacttaaatactgttagaagaccttcacatcattatttggactctttccaagatgaaacaatgtttatcatgtgttgactTTGAGTG-CATCT-TTAAAGGGAGTGTATC--GGAAAAACA--GCAATA-T-G--AATGTCTGAAAAG--AA-TAAGATAATTTTTAAGATTGATAAAA-T-CATC----TTATTACTATTA----TTAAA-TAAAATCTGAA-TGTTTT---AGTCTGTCAAATCCACAAAAATATCA--CAAAA---AGTATT-----------G----GTAAACGTGAAACATAA-T-C-CTCAA-TTTTGAAAAAAACAGCACTTAAATACTG---------TTT---GA------------T------------GACCTATACGTCATC---AT---TCGAGCTC-TT-TCTAAGATGAAAT-AA--T-TTTTAATACCAGTACGTGTAAACATG----AATAACGGATCa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gaacaattgttgaaagtgatgttaaacaccatgctaaaacaatagaacattttatatgcgaatttctaatgaaataattttaaaatttccgcTGAATAACGGATCA------AATTA--AAATCAAA-T-AAATGACGTGAATCATAT-AA-TACTTCTCGAAATA------AATATT--ATGT---TTCAAATTTA----AG--TCTAACCTAGGTTTGTAGCCCA---AC---TTA----GGAAATCCCTTTTTCAGTATA----------TTATTTTGGAATGTTTAAAT--A---GATAACCGTTCTGTAATC-G--GGG-TC----AG----------------T---------G----------------A----G---TA-Taaattaaaatcaaataaatgacgtgaatcatataatacttctcgaaataaatattatgtttcaaatttaagtctaacctaggtttgtagcccaacttaggaaatccctttttcagtatattattttggaatgtttaaatagataaccgttctgtaatcggggtcagtgagtataacattataggtatgatatattgggaaaaatattttaaagtt
gi|5                          :                                                       gaacaattgttgaaagtgatgttaaacaccatgctaaaacaatagaacattttatatgcgaatttctaatgaaataattttaaaatttccgcttgagtgcatctttaaagggagtgtatcggaaaaacagcaatatgaatgtctgaaaagaataagataatttttaagattgataaaatcatcttattactattattaaataaaatctgaatgttttagtctgtcaaatccacaaaaatatcacaaaaagtattggtaaacgtgaaacataatcctcaattttgaaaaaaacagcacttaaatactgtttgatgacctatacgtcatcattcgagctctttctaagatgaaataatttttaataccagtacgtgtaaacaAAAGGGAGTTTATCA-GGAAAA-CA-C-----AAT-ATCAATGTCTTAAAA---AA-TAAAATGATTT--AAAATTGATGAAAAG-CATCAGTCTCATTATCATTA----ATAAA-TAAAATCGGAA-TGGTTT---GGTATATTGAATCCACCAAAACGTGA--CAAAT-TTTGTACTTAAATTAGAGTG----GTAAACTTGAAACAAAA-T-C-C-CAATTCTAAAAATAGTTAACACTTAAATACTG---------CTT---GATGACCTTCACATC------------A------------TC---AT---TAGAACTC-TT-TCAAAAATGAAAC-AGT-T-TT----TAC---TACATGTAAACCTGCATTAaacattataggtatgatatattgggaaaaatattttaaagtt
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                ttaaaatggataaaggcatctcactatcattaataaatataaaccaaattgttcagtatgtcaactccaccgaaacgtgatacattgtatgtaaatcgaagtggccagtaaacttgaaacaaaattcccattctaaaaaaagacattacttaaatactgtttgacgatctttgcattgtcattctgactctttctaagatgaaacactttttactacgtgtaaaccTAGAGGAAGTGTATCA-GAAAAA------TTGTTGT-A--GATGT-TTAATA---AA-TGAAATTAAGTTTAAAATGG----------ATC----TAATTATCATT------TGAACTAATATATAAA-TGATTT---GGAATATCAAATATGTCAAAATGTGATCCACAA-atatgagcatggtatattgacaaaaaatgtaaacttttcctcagttatgtgataaaacgaatcttacattcgttctcat
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): AACCCTTTACTCCATCAATACGTGTTTTCCCAAACCAATCACAGAATGCCTTTGAAAACAGTGCAGGAAGAGTTCAGATTGCTCGTAATGAGCAATCTGAACACTTCCTGCACAGTTTTCCACTCTGTCAGTTAATATAAACATAATTCACCCAATAATTTAAAAGCTTTCTATATTAGAGGTGTCCAAAGGCGTCTATATTAGAGGTGTCCAAAGGCGTCTATATTAGAGGTGTCCAAAGGCATCTATATGAAGTAAAGGGTTAA
Unaligned ( gi|19 ): ATATAAACATAATTCACCCATTGCTGATACGTGGTGAATTAATGCTTTCAATATTAGAGGTGTCCAAAGGCGTCTATATGACGTAAAGGGT
Unaligned ( gi|24 ): ATGAAATTGAAAAACCTGACACAGAACAAGATT






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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atgatacaaagtacacagtgtgttaaccac-TTTTCAATATA----------TTATTTTGGCATGTTTACAT--C---GAAAA----TTGG---------GGG-TC----AG----------------T---------G----------------AGTATA---TA-TAGGCATGATATATTGCA-AAATATGTTTTAGCCAATT---AA-ATTTTTT---AAAAATTCTTGAT--ATA--C-TT--TCTAATAATA---C--AATTTT-G-TACAAA-TAG--GAAT----TGTTAATATTGGTACATATTcaatatattattttggcatgtttacatcgaaaattgggggtcagtgagtatatataggcatgatatattgcaaaatatgttttagccaattaaattttttaaaaattcttgatatactttctaataatacaattttgtacaaataggaattgttaatattggtacatatttatttcatttttaaaggtaatctttctttta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atgatacaaagtacacagtgtgttaaccactatgacagatcaaatcagaatcaaaatgaaatcatgtcactcatttgataagtcataaaatatgttgcaaAT--A--GG---C----A-----------------T---------G----------------A---TA---TA-TTGA---AGAA------A-AAATGT-TTTTATCCACTTTT-AATTTTTTTT---AAAAATCCT-GAT--ATATTC-CCTATTTA-----A---TCATATTAT-ATTAAAGAGTGA--TAATCCACCCTCAtatttcatttttaaaggtaatctttctttta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ataaacctatgtacacattcgtggagaatcgcattattatcacggacaccaggcagatagtctcttgaactattttccaaatgctgaatgtcaagcatggaatcctgttagcaccatttaagtcttgcatacagtgtcggtgagtatatAATAACAGATCTACTCTTT-AA----AAA-------------------------------ACAT----AAACTCACATATTTCACTAAAATTCACTATGTTTCTTCTGAAAAACA------TGTGTGCCCATTCAGATTTGGTGTTGTGCCCCCTAAGCACACCCTTCTAAATCAAAATCCTGGATCCACCCCTGtt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtagtgCTACTCTTT-AAA--AAACCTGGCG-TATGCCGCT----GTTG-------ACCT----AAACTGCCATATGTTATTAAAATGCATTATATTTCTACTAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTACTAAACTGAAATCCTGGATCGATCCCTGTGTATAATGGATCA------AATTG--ATATCAAAATAActgaaatcctggatcgatccctgtgtataatggatcaaattgatatcaaaataattagcaatcccttta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ctactctttaaaaaacctggcgtatgccgctgttgacctaaactgccatatgttattaaaatgcattatatttTACTG---------CTT---GA------------C------------A------------TC---AT---TTAGACTT-TTGTTTAA-ATGAAAC-AA------------------CATGTAAACCTGTATCAATGGTGGATCTACTC-TT-AAA--AAAAC-ttagcaatcccttta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GATCTACTCTTTTAAA--AAAACAGGCC-C-CGCCACT-CCC----CACCCCTACCTCCACAAATTCCCATATTTCATTCAAATATACTATATTT-TAGTGAAAAACA------TGatagtatgtgccttcttcc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTACTGATAC-C-TTAAACGGTGTAGATCA-GGAAAAA-A-CACTA--A--A--AATGTCTTAAAA---AAATAAATTAATCGTTAAAATGTATAAAAAATCTTC----TCATTATCATTT----ATAAA-TAAAATCCAAA-TAGTTT---GGTGTGTCAAATCCACTAAAACATGA--TAAAA-TTGATATGTAGATTGGAGTG----GTA---------CAAAA-T-C-C-CAAATCTGAAAATAGACAGCACTTAGATACTG---------CTT---GA------------T------------GACCTTCGCA---TC---ATCAGTCTGATGC-TT-TTTAAGATGAAAT-AATTT-TT----TAC---TACGTATAAAACTGTAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaatgtcagttattgcataatattgaataatataattgaatttacgcttagaaaatctaaatcaaacagaacttagcaattttaaacttgattttatattttttattgatgattattttaacaaatttcctctcattatatgaTGTATAACAGATCATCAAACAGTTGCTATATCAAAATGAAATCACAAAACTCATTT-AAGTA-GTAACAAAATATGTTGCAATTTT--AAGC---GGGAAATCTATTTTAG--TCTAATATAGGCGCATAGTCCA---AG---TTA----GGAAATTTC-TTTTCATTTTA----------TTATTTTAGCATGTTTGAAT--T---GATATCCTTTTGGCAATACA--GGG-TC----AGCAAGTGCATATAGGTAT---------G----------------A---CA---TA-TT-----GAAA------ATAAATGT-TTTTAGACAATTTT-AA-AAGTTTT---AAAAATCCT-GATAAATAT----T--TATAT-AAT----TTGATTTAT-A-TAAAaacagatcatcaaacagttgctatatcaaaatgaaatcacaaaactcatttaagtagtaacaaaatatgttgcaattttaagcgggaaatctattttagtctaatataggcgcatagtccaagttaggaaatttcttttcattttattattttagcatgtttgaattgatatccttttggcaatacagggtcagcaagtgcatataggtatgacatattgaaaataaatgtttttagacaattttaaaagttttaaaaatcctgataaatatttatataatttgatttatataaatttcagttttttagagcaatatctcctgatgcacacttcacctttaatggt
gi|20                         : aaatgtcagttattgcataatattgaataatataattgaatttacgcttagaaaatctaaatcaaacagaacttagcaattttaaacttgattttatattttttattgatgattattttaacaaatttcctctcattatatgattactgataccttaaacggtgtagatcaggaaaaaacactaaaaatgtcttaaaaaaataaattaatcgttaaaatgtataaaaaatcttctcattatcatttataaataaaatccaaatagtttggtgtgtcaaatccactaaaacatgataaaattgatatgtagattggagtggtacaaaatcccaaatctgaaaatagacagcacttagatactgcttgatgaccttcgcatcatcagtctgatgctttttaagatgaaataattttttactacgtataaaacT-TTAAAGGGAGT----CA-GGAAAAAC---GCTTTAA-----AATGTCTTGAAA---A--TATAATAATTGTTAAAACGGATAAAAAG-tttcagttttttagagcaatatctcctgatgcacacttcacctttaatggt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tAACTCCCATTTTTTATTAAAATTCACTATATTTCTACGGAAAAACATATAACTGTGTACCCatt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tTCAATGGCCGATCTACTCTTT-AAA--AAAAC-GGCG-CACAACTCT-ACC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAAATCTGTATCAATGGCAGATCTTCTC-TT-AAA--AAGAca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AGTTTTTAATG-TACATGTTAAAGGGAGTATATCA-GGAAAAA-A-CACTATAA------ATGTCTTAAAATAAAA-AAAAATAATTTT-AAATTGGTTAAAATA-CATC----TCATTATCATTA----ACAAA-TAAAATCCAAA-TCGCTTTAAAGTACGTAAAATCCACC-AAATGTGG--TAAAA-TTGTAATTTAAATAGGATTG----GTAAACTTGAAATGAAA-T-C-C-C---CC----AATAGACGGCACTTAAATACTGTTAGAAGACCTT---CA------------C------------A------------TCATTAT---TTGGACTC-TT-TCCAAGATGAAAC-AA--TGTT----TAT---CATGTGTTGACTTATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tctccattttcacatattgtctcatttaaatttatagctgaaTATATAACGT-TTA------AATTG--AAGCCGAAATGAAATCACATGACTCATTTTAA-TATATGACAAAAAAT-----AATTTC--AAGC---AGGAAATCTATTTAAG--TTTAA-------ACGTAGCCCA---AG---TTA----GGAAATCCC-TTTTCAAAATA----------TTATTTTAGCATGTTTAAAT--A---GATATTTTTTTTGCAAT--AT-GGG-TC----AG----------------T---------GAGTATATAGAGGCACAA---TT---TA-TTGG---GAAA------A-AATTA--TTTTAGCCTGTTTT-AA-AAT-----------ATCCT-G-----CATTCAC----TGAA-AACAGCTTCAAATCAC---TAATTAACGGTTTAGT-TACT-TCAACAaacgtttaaattgaagccgaaatgaaatcacatgactcattttaatatatgacaaaaaataatttcaagcaggaaatctatttaagtttaaacgtagcccaagttaggaaatcccttttcaaaatattattttagcatgtttaaatagatattttttttgcaatatgggtcagtgagtatatagaggcacaatttattgggaaaaaattattttagcctgttttaaaatatcctgcattcactgaaaacagcttcaaatcactaattaacggtttagttacttcaacaa
gi|4                          :                                                                                 tctccattttcacatattgtctcatttaaatttatagctgaaagtttttaatgtacatgttaaagggagtatatcaggaaaaaacactataaatgtcttaaaataaaaaaaaataattttaaattggttaaaatacatctcattatcattaacaaataaaatccaaatcgctttaaagtacgtaaaatccaccaaatgtggtaaaattgtaatttaaataggattggtaaacttgaaatgaaatcccccaatagacggcacttaaatactgttagaagaccttcacatcattatttggactctttccaagatgaaacaatgtttatcatgtgttgactTTGAGTG-CATCT-TTAAAGGGAGTGTATC--GGAAAAACA--GCAATA-T-G--AATGTCTGAAAAG--AA-TAAGATAATTTTTAAGATTGATAAAA-T-CATC----TTATTACTATTA----TTAAA-TAAAATCTGAA-TGTTTT---AGTCTGTCAAATCCACAAAAATATCA--CAAAA---AGTATT-----------G----GTAAACGTGAAACATAA-T-C-CTCAA-TTTTGAAAAAAACAGCACTTAAATACTG---------TTT---GA------------T------------GACCTATACGTCATC---AT---TCGAGCTC-TT-TCTAAGATGAAAT-AA--T-TTTTAATACCAGTACGTGTAAACATG----AATAACGGATCa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gaacaattgttgaaagtgatgttaaacaccatgctaaaacaatagaacattttatatgcgaatttctaatgaaataattttaaaatttccgcTGAATAACGGATCA------AATTA--AAATCAAA-T-AAATGACGTGAATCATAT-AA-TACTTCTCGAAATA------AATATT--ATGT---TTCAAATTTA----AG--TCTAACCTAGGTTTGTAGCCCA---AC---TTA----GGAAATCCCTTTTTCAGTATA----------TTATTTTGGAATGTTTAAAT--A---GATAACCGTTCTGTAATC-G--GGG-TC----AG----------------T---------G----------------A----G---TA-Taaattaaaatcaaataaatgacgtgaatcatataatacttctcgaaataaatattatgtttcaaatttaagtctaacctaggtttgtagcccaacttaggaaatccctttttcagtatattattttggaatgtttaaatagataaccgttctgtaatcggggtcagtgagtataacattataggtatgatatattgggaaaaatattttaaagtt
gi|5                          :                                                       gaacaattgttgaaagtgatgttaaacaccatgctaaaacaatagaacattttatatgcgaatttctaatgaaataattttaaaatttccgcttgagtgcatctttaaagggagtgtatcggaaaaacagcaatatgaatgtctgaaaagaataagataatttttaagattgataaaatcatcttattactattattaaataaaatctgaatgttttagtctgtcaaatccacaaaaatatcacaaaaagtattggtaaacgtgaaacataatcctcaattttgaaaaaaacagcacttaaatactgtttgatgacctatacgtcatcattcgagctctttctaagatgaaataatttttaataccagtacgtgtaaacaAAAGGGAGTTTATCA-GGAAAA-CA-C-----AAT-ATCAATGTCTTAAAA---AA-TAAAATGATTT--AAAATTGATGAAAAG-CATCAGTCTCATTATCATTA----ATAAA-TAAAATCGGAA-TGGTTT---GGTATATTGAATCCACCAAAACGTGA--CAAAT-TTTGTACTTAAATTAGAGTG----GTAAACTTGAAACAAAA-T-C-C-CAATTCTAAAAATAGTTAACACTTAAATACTG---------CTT---GATGACCTTCACATC------------A------------TC---AT---TAGAACTC-TT-TCAAAAATGAAAC-AGT-T-TT----TAC---TACATGTAAACCTGCATTAaacattataggtatgatatattgggaaaaatattttaaagtt
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atgatacaaagtacacagtgtgttaaccac-TTTTCAATATA----------TTATTTTGGCATGTTTACAT--C---GAAAA----TTGG---------GGG-TC----AG----------------T---------G----------------AGTATA---TA-TAGGCATGATATATTGCA-AAATATGTTTTAGCCAATT---AA-ATTTTTT---AAAAATTCTTGATATA--CTT--TCTAAT-AA---TACAATTTTG-TACAAA-TAG--GAAT----TGTTAATATTGGTACATATTcaatatattattttggcatgtttacatcgaaaattgggggtcagtgagtatatataggcatgatatattgcaaaatatgttttagccaattaaattttttaaaaattcttgatatactttctaataatacaattttgtacaaataggaattgttaatattggtacatatttatttcatttttaaaggtaatctttctttta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atgatacaaagtacacagtgtgttaaccactatgacagatcaaatcagaatcaaaatgaaatcatgtcactcatttgataagtcataaaatatgttgcaaAT--A--GG---C----A-----------------T---------G----------------A---TA---TA-TTGA---AGAA------A-AAATGT-TTTTATCCACTTTT-AATTTTTTTT---AAAAATCCT-GATATATTCCCTATTTAAT-CA---T---ATTATATTAAAGAGTGA--TAATCCACCCTCAtatttcatttttaaaggtaatctttctttta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ataaacctatgtacacattcgtggagaatcgcattattatcacggacaccaggcagatagtctcttgaactattttccaaatgctgaatgtcaagcatggaatcctgttagcaccatttaagtcttgcatacagtgtcggtgagtatatAATAACAGATCTACTCTTT-AA----AAA-------------------------------ACAT----AAACTCACATATTTCACTAAAATTCACTATGTTTCTTCTGAAAAACA------TGTGTGCCCATTCAGATTTGGTGTTGTGCCCCCTAAGCACACCCTTCTAAATCAAAATCCTGGATCCACCCCTGtt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtagtgCTACTCTTT-AAA--AAACCTGGCG-TATGCCGCT----GTTG-------ACCT----AAACTGCCATATGTTATTAAAATGCATTATATTTCTACTAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTACTAAACTGAAATCCTGGATCGATCCCTGTGTATAATGGATCA------AATTG--ATATCAAAATAActgaaatcctggatcgatccctgtgtataatggatcaaattgatatcaaaataattagcaatcccttta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctactctttaaaaaacctggcgtatgccgctgttgacctaaactgccatatgttattaaaatgcattatatttTACTG---------CTT---GA------------C------------A------------TC---AT---TTAGACTT-TTGTTTAA-ATGAAAC-AA------------------CATGTAAACCTGTATCAATGGTGGATCTACTC-TT-AAA--AAAAC-ttagcaatcccttta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATCTACTCTTTTAAA--AAAACAGGCC-C-CGCCACT-CCC----CACCCCTACCTCCACAAATTCCCATATTTCATTCAAATATACTATATTT-TAGTGAAAAACA------TGatagtatgtgccttcttcc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTACTGATAC-C-TTAAACGGTGTAGATCA-GGAAAA-AAC---ACTA-A-A---AATGTCTTAAAA---AAATAAATTAATCGTTAAAATGTATAAAAAATCTTC----TCATTATCATTT----ATAAA-TAAAATCCAAA-TAGTTT---GGTGTGTCAAATCCACTAAAACATGA--TAAAA-TTGATATGTAGATTGGAGTG----GTA---------CAAAA-T-C-C-CAAATCTGAAAATAGACAGCACTTAGATACTG---------CTT---GA------------T------------GACCTTCGCA---TC---ATCAGTCTGATGC-TT-TTTAAGATGAAAT-AATTT-TT----TAC---TACGTATAAAACTGTAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaatgtcagttattgcataatattgaataatataattgaatttacgcttagaaaatctaaatcaaacagaacttagcaattttaaacttgattttatattttttattgatgattattttaacaaatttcctctcattatatgaTGTATAACAGATCATCAAACAGTTGCTATATCAAAATGAAATCACAAAACTCATTT-AAGTA-GTAACAAAATATGTTGCAATTTT--AAGC---GGGAAATCTATTTTAG--TCTAATATAGGCGCATAGTCCA---AG---TTA----GGAAATTTC-TTTTCATTTTA----------TTATTTTAGCATGTTTGAAT--T---GATATCCTTTTGGCAATACA--GGG-TC----AGCAAGTGCATATAGGTAT---------G----------------A---CA---TA-TT-----GAAA------ATAAATGT-TTTTAGACAATTTT-AA-AAGTTTT---AAAAATCCT-GATAAAT---A--TTTATA-TAAT-TTGATTTATA-TAAAaacagatcatcaaacagttgctatatcaaaatgaaatcacaaaactcatttaagtagtaacaaaatatgttgcaattttaagcgggaaatctattttagtctaatataggcgcatagtccaagttaggaaatttcttttcattttattattttagcatgtttgaattgatatccttttggcaatacagggtcagcaagtgcatataggtatgacatattgaaaataaatgtttttagacaattttaaaagttttaaaaatcctgataaatatttatataatttgatttatataaatttcagttttttagagcaatatctcctgatgcacacttcacctttaatggt
gi|20                         : aaatgtcagttattgcataatattgaataatataattgaatttacgcttagaaaatctaaatcaaacagaacttagcaattttaaacttgattttatattttttattgatgattattttaacaaatttcctctcattatatgattactgataccttaaacggtgtagatcaggaaaaaacactaaaaatgtcttaaaaaaataaattaatcgttaaaatgtataaaaaatcttctcattatcatttataaataaaatccaaatagtttggtgtgtcaaatccactaaaacatgataaaattgatatgtagattggagtggtacaaaatcccaaatctgaaaatagacagcacttagatactgcttgatgaccttcgcatcatcagtctgatgctttttaagatgaaataattttttactacgtataaaacT-TTAAAGGGAGT----CA-GGAAAA-A-C---GCTTTA-A---AATGTCTT-GAA---AA-TATAATAATTGTTAAAACGGATAAAAAG-tttcagttttttagagcaatatctcctgatgcacacttcacctttaatggt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tAACTCCCATTTTTTATTAAAATTCACTATATTTCTACGGAAAAACATATAACTGTGTACCCatt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tTCAATGGCCGATCTACTCTTT-AAA--AAAAC-GGCG-CACAACTCT-ACC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAAATCTGTATCAATGGCAGATCTTCTC-TT-AAA--AAGAca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AGTTTTTAATG-TACATGTTAAAGGGAGTATATCA-GGAAAA-AAC---ACTATA-A---A-TGTCTTAAAATAAAA-AAAAATAATTTT-AAATTGGTTAAAATA-CATC----TCATTATCATTA----ACAAA-TAAAATCCAAA-TCGCTTTAAAGTACGTAAAATCCACC-AAATGTGG--TAAAA-TTGTAATTTAAATAGGATTG----GTAAACTTGAAATGAAA-T-C-C-C---CC----AATAGACGGCACTTAAATACTGTTAGAAGACCTT---CA------------C------------A------------TCATTAT---TTGGACTC-TT-TCCAAGATGAAAC-AA--TGTT----TAT---CATGTGTTGACTTATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tctccattttcacatattgtctcatttaaatttatagctgaaTATATAACGT-TTA------AATTG--AAGCCGAAATGAAATCACATGACTCATTTTAA-TATATGACAAAAAAT-----AATTTC--AAGC---AGGAAATCTATTTAAG--TTTAA-------ACGTAGCCCA---AG---TTA----GGAAATCCC-TTTTCAAAATA----------TTATTTTAGCATGTTTAAAT--A---GATATTTTTTTTGCAAT--AT-GGG-TC----AG----------------T---------GAGTATATAGAGGCACAA---TT---TA-TTGG---GAAA------A-AATTA--TTTTAGCCTGTTTT-AA-AAT-----------ATCCT-G---CATTCAC--TGAAAA-CAGCTTCAAATCAC--TAATTAACGGTTTAGT-TACT-TCAACAaacgtttaaattgaagccgaaatgaaatcacatgactcattttaatatatgacaaaaaataatttcaagcaggaaatctatttaagtttaaacgtagcccaagttaggaaatcccttttcaaaatattattttagcatgtttaaatagatattttttttgcaatatgggtcagtgagtatatagaggcacaatttattgggaaaaaattattttagcctgttttaaaatatcctgcattcactgaaaacagcttcaaatcactaattaacggtttagttacttcaacaa
gi|4                          :                                                                                 tctccattttcacatattgtctcatttaaatttatagctgaaagtttttaatgtacatgttaaagggagtatatcaggaaaaaacactataaatgtcttaaaataaaaaaaaataattttaaattggttaaaatacatctcattatcattaacaaataaaatccaaatcgctttaaagtacgtaaaatccaccaaatgtggtaaaattgtaatttaaataggattggtaaacttgaaatgaaatcccccaatagacggcacttaaatactgttagaagaccttcacatcattatttggactctttccaagatgaaacaatgtttatcatgtgttgactTTGAGTG-CATCT-TTAAAGGGAGTGTATC--GGAAAA-A-CA--GCAATATG---AATGTCTGAAAAG--AA-TAAGATAATTTTTAAGATTGATAAAA-T-CATC----TTATTACTATTA----TTAAA-TAAAATCTGAA-TGTTTT---AGTCTGTCAAATCCACAAAAATATCA--CAAAA---AGTATT-----------G----GTAAACGTGAAACATAA-T-C-CTCAA-TTTTGAAAAAAACAGCACTTAAATACTG---------TTT---GA------------T------------GACCTATACGTCATC---AT---TCGAGCTC-TT-TCTAAGATGAAAT-AA--T-TTTTAATACCAGTACGTGTAAACATG----AATAACGGATCa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gaacaattgttgaaagtgatgttaaacaccatgctaaaacaatagaacattttatatgcgaatttctaatgaaataattttaaaatttccgcTGAATAACGGATCA------AATTA--AAATCAAA-T-AAATGACGTGAATCATAT-AA-TACTTCTCGAAATA------AATATT--ATGT---TTCAAATTTA----AG--TCTAACCTAGGTTTGTAGCCCA---AC---TTA----GGAAATCCCTTTTTCAGTATA----------TTATTTTGGAATGTTTAAAT--A---GATAACCGTTCTGTAATC-G--GGG-TC----AG----------------T---------G----------------A----G---TA-Taaattaaaatcaaataaatgacgtgaatcatataatacttctcgaaataaatattatgtttcaaatttaagtctaacctaggtttgtagcccaacttaggaaatccctttttcagtatattattttggaatgtttaaatagataaccgttctgtaatcggggtcagtgagtataacattataggtatgatatattgggaaaaatattttaaagtt
gi|5                          :                                                       gaacaattgttgaaagtgatgttaaacaccatgctaaaacaatagaacattttatatgcgaatttctaatgaaataattttaaaatttccgcttgagtgcatctttaaagggagtgtatcggaaaaacagcaatatgaatgtctgaaaagaataagataatttttaagattgataaaatcatcttattactattattaaataaaatctgaatgttttagtctgtcaaatccacaaaaatatcacaaaaagtattggtaaacgtgaaacataatcctcaattttgaaaaaaacagcacttaaatactgtttgatgacctatacgtcatcattcgagctctttctaagatgaaataatttttaataccagtacgtgtaaacaAAAGGGAGTTTATCA-GGAAAACA-C---AATATC-A---A-TGTCTTAAAA---AA-TAAAATGATTT--AAAATTGATGAAAAG-CATCAGTCTCATTATCATTA----ATAAA-TAAAATCGGAA-TGGTTT---GGTATATTGAATCCACCAAAACGTGA--CAAAT-TTTGTACTTAAATTAGAGTG----GTAAACTTGAAACAAAA-T-C-C-CAATTCTAAAAATAGTTAACACTTAAATACTG---------CTT---GATGACCTTCACATC------------A------------TC---AT---TAGAACTC-TT-TCAAAAATGAAAC-AGT-T-TT----TAC---TACATGTAAACCTGCATTAaacattataggtatgatatattgggaaaaatattttaaagtt
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                ttaaaatggataaaggcatctcactatcattaataaatataaaccaaattgttcagtatgtcaactccaccgaaacgtgatacattgtatgtaaatcgaagtggccagtaaacttgaaacaaaattcccattctaaaaaaagacattacttaaatactgtttgacgatctttgcattgtcattctgactctttctaagatgaaacactttttactacgtgtaaaccTAGAGGAAGTGTATCA-GAAAAA-T-T---GTTGTA-G---A-TGT-TTAATA---AA-TGAAATTAAGTTTAAAATGG----------ATC----TAATTATCATT------TGAACTAATATATAAA-TGATTT---GGAATATCAAATATGTCAAAATGTGATCCACAA-atatgagcatggtatattgacaaaaaatgtaaacttttcctcagttatgtgataaaacgaatcttacattcgttctcat
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): AACCCTTTACTCCATCAATACGTGTTTTCCCAAACCAATCACAGAATGCCTTTGAAAACAGTGCAGGAAGAGTTCAGATTGCTCGTAATGAGCAATCTGAACACTTCCTGCACAGTTTTCCACTCTGTCAGTTAATATAAACATAATTCACCCAATAATTTAAAAGCTTTCTATATTAGAGGTGTCCAAAGGCGTCTATATTAGAGGTGTCCAAAGGCGTCTATATTAGAGGTGTCCAAAGGCATCTATATGAAGTAAAGGGTTAA
Unaligned ( gi|19 ): ATATAAACATAATTCACCCATTGCTGATACGTGGTGAATTAATGCTTTCAATATTAGAGGTGTCCAAAGGCGTCTATATGACGTAAAGGGT
Unaligned ( gi|24 ): ATGAAATTGAAAAACCTGACACAGAACAAGATT