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Reference ( gi|2 )            :                                                                                                                                                                                 AAC-CCTTTACTTTAT-ATAGACGCCTTT-----GGACAC--C--T--A--AT-ATAG-ACG-CCTTTGGACACCTTTA----ATATAGACGCCTTTGGACACCTCTAATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AT------TGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGA--GTG-----GAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTCATGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATT-G-------CTG--C-A--GG----A-----AAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                 AAC-CCTTTACTCCAT-AGATACGCATTTTCCCCG--CAC--C-----A--ATCACAGAAGG-CCTTTGAAAAC
gi|4                          :      tacttcatatagactcctttggacacctctaatatagacgcctttggagacatgatatagaaggcttttgaattattgggtgaattatgtttatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcgttacgagcaatctgaactcttcctgcactAAC-CCTTTACTCTAT-AGATACGCGTTTTCCC-G--CAC--C-----A--ATCACAG-AAGATCTTTGAAAAC
gi|5                          :   ctttacttcatatagacgcctttggacacctctaatatagatgcctttggacacctaatatagaaggcttttcaattattgggtgtattatatttatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcgttattagcaatctgaactcttcctgcactAAC-CCTTTACTCCAT-AGATACGCGTTTTCCC-G--CAC--C-----A--ATCACAGAAGG-CCTTTGAA
gi|1                          : cctttacttcatatagacaccttttgacacctaatatatatgtctttggacacctaatatagaaggcttttgaattattgggtgaattatgttcatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagactgttcgttaaaagcaatctgaactcttcctgcactattAACACCTCTA----AT-ATAGACGCCTTT-----GGACATTTC--T--T--AT-ATAG-ACG-CCTTGGGACACCTATA----ATATAGATGCCTTTGGACACCT--AATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AT------TGGGTGAATTATGTTAATATTAACTGACATT--CTG-----GAAAATA----AGGAAGT--GTTCAGATTACTCGTTACGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATT-G-------GTG--C-G--GG----A-----AAATGTGTGTCTATGGAGTGTAAGGT
gi|7                          :                                                                                                           gactaacacttgcaaccagtaactgtactgacagagatagttaaccctttacttcatacagatgcctttgAAC-CCTTTACTTCAT-ATAGACGCCTTT-----GGAtt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                 AAC-CCTTTACTCCAT-AGATACGCGTTT-----TCCCACA-C--C--A--ATCACAGAAGG-CCTTTGAAAACtacccaatacagacacctctaatatagaaggcttttgaattattggatgaattatgtttatattaactgacagagtggaaaacagtgcagaaagtgttcagattgctcgttacgcaatctgaactcttcctgcactgttttcaaaggccttctgtgattggtgtgggaaaacgcgtatctatggagtaaagggtt
gi|15                         :           aaccctttacttcatatagacgcctttggatacccaatacagacacctctaatatagaaggcttttgaattattggatgaattatgtttatattaactgacagagtggaaaacagtgcagaaagtgttcagattgctcgttacgcaatctgaactcttcctgcactAAC-CCTTTACTTCAT-AAAGACGCCTTT-----GGACAT--C--T--A--AT-ATAG-AAG-GCTTTTGA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                 AAC-CCTTTACTTCAT-ATAGACACCTTT-----GGACAC--C--T--ATGAT-ATTG-Aattattggatgaattatgtttatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcgttacaagcaatctgaactcttcctgcactgttttctgtgattggtgcgggaaaacacgtatctataaagtaaagggtt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                 AAC-CCTTTACTTCAT-ATAGACACCTTT-----GGACAC--C--T--T--AT-ATAG-AAG-GCTTTTGAaagcattaattcaccatgtatcagcaatgggtgaattatgtttatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcgttacgagcaatgaactcttcctgcactgttttcaatggccttctgtgattgttgcgggaaaatgcgtatctatggagtaaagggt
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                  AC-CCTTTACTTCAT-ATAGACGCCTTT-----attaatggttgaattatgtttttattaaatgacagagtggaaaacagtgcaggaagggttcagattgctcgttacgaac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                  AC-CCTTTACTTCAT-ATAGACGCCTTT-----GGACACCTC--T--A--AT-ATTG-Atgacacttctaatatagacacctttggacaccttataaagaaggtttttgaattattgggtgaattatgtttatattaactgacagagcgaaaacagtgcaggaagtgctctctgaactcttccagctctgttttcaaaggccttctgtgattggtgcaggaaaacgcgtatctatggagtaaaggct
gi|11                         :                                                                                                                                                                                  AC-CCTTTACTTCAT-AGATACGCGTTTTCCC-G--CAC--C-----A--ATGACAGAAGG-CCTTTGAAAACaagcattaattcaccacgtatcaacaatgggtgaattatgtttatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcgcaatctgaactcttcctgcactgttttcaaaggccttctgtcattggtgcgggaaaacgcgtatctatgaagtaaagggt
gi|14                         :                   accctttacttcatatagacgcctttggacacctctaatattgaaagcattaattcaccacgtatcaacaatgggtgaattatgtttatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcgcaatctgaactcttcctgcactAC-CCTTTACTTCAT-ATAAATGCCTTT-----GGACAC--C--TCCA--AT-ATTG-A
gi|8                          :                                                                                                                                                                                   C-TCTTTACTTCCT-ATTGACGCCTTT-----GGACACCTC--T--A--AT-ATTG-Aaagcattaattcaccacatatcagcaatgggtgaattatgtttatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcttcctgcactgttttcaaagaccttctgtgattggtgcgggaaaacgtgtatctatggagtaaagggt
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                  at-CCTCTA----AT-ATAGACGCCTTT-----GGAGAC--A--T--G--AT-ATAG-AAG-GCTTTTGActaatattgacgcctttggacacctctaatatagaaggctttcgaataatttggtaataatttttatattaactgacagtgaaaaacagtgcgctgttttcaaaggccttatgtgattggtatctatggagtaaagggtt
gi|4                          :                                                                                                                                                           tacttcatatagactcctttggaca-CCTCTA----AT-ATAGATGCCTTT-----GGACAC--C--T--A--AT-ATAG-AAG-GCTTTattattgggtgaattatgtttatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcgttacgagcaatctgaactcttcctgcactgttttcaaaggccttctgtgattggtgcggggaaaatgcgtatctatggagtaaagggtt
gi|5                          :                                                                                                                                                        ctttacttcatatagacgcctttggaca-CCTTTACTTCAT-ATAGACtcaattattgggtgtattatatttatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcgttattagcaatctgaactcttcctgcactgttttcaaagatcttctgtgattggtgcgggaaaacgcgtatctatagagtaaagggtt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                    -CCTCTA----AT-ATAGATGCCTTT-----TGACACCTC--T--A--AT-ATAG-AAG-GCTTTaccttttgacacctaatatatatgtctttggacacctaatatagaaggcttttgaattattgggtgaattatgttcatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagactgttcgttaaaagcaatctgaactcttcctgcactattttcaaaggccttctgtgattggtgcgggaaaacgcgtatctatggagtaaagggtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                     tatatacaccttttgacaTTTACTTCAT-ATAGACGCCTTT-----GAACAC--C--TCTA--AT-ATAG-ACA-CATTTGGACACCTCTA----ATATAGACGCCTTTGGACACCT--AATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AT------TGGATGAATTATGTTTATATTAACTGACAGA--GTG-----GAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTCACAAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATT-G-------GTG--C-G--GG----A-----AAACACGTATCTATGGAGTAAAGGGttaattatagggtaaattatgtatatataaactgacagagtggaaagcagtgcaggaagtgttcagattgcttgttacgagcaatctgaactcttcctgcactgttttcaaaggccttctgtgattggtatctattgagtaaagggt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                           CTCTATTATAGACACCTTT-----GGACAC--G--T--A--AT-ATAG-AAG-GCTTTTGAa
gi|10                         :                                                                                                                                                               gccctttacttcatatagatgccttttgacatAT-ATAGACGCCTTT-----GGACAC--C--T--A--AT-ATAG-AAG-GCTTTTGAattattaggtgaattatgtttatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtacgctcaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                      cctttacatcattttgatgcccttggacacctccaCCTTT---------AC--T--T--C--AT-ATAG-ACA-CCTTTTGACACCT--A----ATATATATGTCTTTGGACACCT--AATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AT------TGGGTGAATTATGTTCATATTAACTGACAGA--GTG-----GAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGACTGTTCGTTAAAAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTATTTTCAAAGGCCTTCTGTGATT-G-------GTG--C-G--GG----A-----AAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTattattgtgtgaattatgtttacattaactgacagtgcaggaagtgttcagattgctcgttacgagccatctgaactcttcctgcactgttttcgaacaccttctgtgattagtgtgggaaaacgcgtatctatggagtaaagggtt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                         CCTTT---------AC--T--T--C--AT-ATAG-ACG-CCTTTGGATACCC--A----ATACAGAC----------ACCTCTAATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AT------TGGATGAATTATGTTTATATTAACTGACAGA--GTG-----GAAAACAGTGCAGAAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTAC--GCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATT-G-------GTG--T-G--GG----A-----AAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                      aacCCTTT-------ACAT--C--------AT-TTTG-ATG-CCCTTGGACACCTCCA----ATATAGACGCCTTTGGACACCT--AATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AT------TGTGTGAATTATGTTTACATTAACTGACAG-------------------TGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACGAGCCATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCGAACACCTTCTGTGATT-A-------GTG--T-G--GG----A-----AAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                         CCTTT---------AC--T--T--C--AT-ATAG-ACG-CCTTTTGACACTTCTA----ATATAGACACCTTTGGACACCTT--ATAAAGAAGGTTTTTGAAT------T--------AT------TGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGA--GC------GAAAACAGTGCAGGAAGT--GCTC--------------------TCTGAACTCTTCCAGCTCTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATT-G-------GTG--C-A--GG----A-----AAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                       acCCTTT---------AC--T--T--C--AT-ATAG-ACG-CCTTTGGACACCTct
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                       acCCTTT---------AC--T--T--C--AT-ATAG-ACA-CCTTTGGACACCTctaatattgaaagcattaattcaccacgtatcaacaatgggtgaattatgtttatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcgcaatctgaactcttcctgcactgttttcaaaggccttctgtcattggtgcgggaaaacgcgtatctatgaagtaaagggt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                      aacCCTTT---------AC--T--T--C--AT-ATAA-ATG-CCTTTGGACACCTatgatattgaaagcattaattcaccatgtatcagcaatgggtgaattatgtttatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcgttacgagcaatgaactcttcctgcactgttttcaatggccttctgtgattgttgcgggaaaatgcgtatctatggagtaaagggt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                       acCCTTT---------AC--T--T--C--AT-ATAG-ATG-CCTTTTGACATCTCTA----TTATAGACACCTTTGGACACGT--AATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AT------TAGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGA--GTG-----GAAAACAGTGCAGGAAGTACGCTCAccaatattgaaagcattaattcaccacatatcagcaatgggtgaattatgtttatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcttcctgcactgttttcaaagaccttctgtgattggtgcgggaaaacgtgtatctatggagtaaagggt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                       gcCCTTT---------AC--T--T--C--AT-ATAG-ACG-CCTTTGGACACCTCTA----ATATTGACGCCTTTGGACACCTCTAATATAGAAGGCTTTCGAAT------A--------AT------TTGGT-AATAATTTTTATATTAACTGAC--A--GTG-----AAAAACAGTGCa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                    atcAC--T--T--C--AT-ATAG-ACT-CCTTTGGACACCTCTA----ATATAGACGCCTTTGGAGACAT--GATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AT------TGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGA--GTG-----GAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATT-G-------GTG--CGG--GG----A-----AAATGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTgctgttttcaaaggccttatgtgattggtatctatggagtaaagggtt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                      tAC--T--T--C--AT-ATAG-ACG-CCTTTGGACACCTCTA----ATATAGATGCCTTTGGACACCT--AATATAGAAGGCTTTTCAAT------T--------AT------TGGGTGTATTATATTTATATTAACTGACAGA--GTG-----GAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTATTAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGATCTTCTGTGATT-G-------GTG--C-G--GG----A-----AAACGCGTATCTATAGAGTAAAGGGTt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                 ctttT-ATAT-ACA-CCTTTTGACACCTCTA----ATATAGATGCCTTTTGACACCTCTAATATAGAAGGCTTTTTAAT------T--------AT------AGGGTAAATTATGTATATATAAACTGACAGA--GTG-----GAAAGCAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTTGTTACGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATT-G-----------------------------------GTATCTATTGAGTAAAGGGTt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                     T-ATTG-ACG-CCTTTGGACACCTCTA----ATAT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                              ctctttacttccCCTTTACTTCATAAAGACGCCTTTGGACA--TCTAATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AT------TGGATGAATTATGTTTATATTAACTGACAGA--GTG-----GAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACAAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTT----------TTCTGTGATT-G-------GTG--C-G--GG----A-----AAACACGTATCTATAAAGTAAAGGGTtgaaagcattaaaataccacgtatcagcaatgggtgaatgatgtttatattaactaacagagtgaaaaaaagtgcatgaagtgttcagattgctcgttacgagcaatctgaactcttcctgcactgttttcaatgaccttctgtgattggtgcgggaaaacgcgtatctatggagtaaagggt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                       aacCCTTTACTTCATATAGACGCCTTTGGACACCTCTAATATTGAAAGCATT--AAT------TCACCACGTATCAACAATGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGA--GTG-----GAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCG-------CAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTCATT-G-------GTG--C-G--GG----A-----AAACGCGTATCTATGAAGTAAAGGGTt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                        acCCTTTACTTCATATAGACACCTTTGGACACCTATGATATTGAAAGCATT--AAT------TCACCATGTATCAGCAATGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGA--GTG-----GAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACGAGCAA--TGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAATGGCCTTCTGTGATT-G-------TTG--C-G--GG----A-----AAATGCGTATCTATGGAGTAAAGGGT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                       aacCCTTTACTTCATATAGACACCTTTGGACACCTT--ATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AT------TTGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGA--GTG-----GAAAACATTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTTGTT-------------ACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTTTGATT-G-------GTG--T-G--GGAA--A-----AAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                      taacCCTTTACTTCATATAAATGCCTTTGGACACCTCCAATATTGAAAGCATT--AAT------TCACCACATATCAGCAATGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGA--GTG-----GAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGC--------------------TCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGACCTTCTGTGATT-G-------GTG--C-G--GG----A-----AAACGTGTATCTATGGAGTAAAGGGT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                        acCCTTTATTC-ATAAAGACACCTTTGGACACCTGTAATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AA------TGGTTGAATTATGTTTTTATTAAATGACAGA--GTG-----GAAAACAGTGCAGGAAGG--GTTCAGATTGCTCGTTACGAAC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                  aacTATTGACGCCTTTGGACACCTCTAATATTGAAAGCATTAAAATACCACGT--------ATCAGCAATGGGTGAATGATGTTTATATTAACTAACAGA--GTG-----AAAAAAAGTGCATGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAATGACCTTCTGTGATT-G-------GTG--C-G--GG----A-----AAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               ctctttacttccTAATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AT------TGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGA--GTG-----AAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTACCCGTTACGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCTTTCTGTGATT-G-------GTG--C-G--GG----A-----TAACGCATATCTATGGAGTAAAGGGT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATATAGAAAGGTTTTGAAT------C--------AT------TGGTTGGATTATGTTTATATTAACTGACAGA--GTG-----GAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTACTCGTTATGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATT-G-------GTG--C-G--GG----A-----AACAACATCTCTATGGAGTAAAGGGTta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tGGCTTTTGAAT------T--------AC------TAGCTGAATTATGTTTATATTAGCTGACAGA--GTG-----GAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACGAACAATCTGAACGCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATT-G-------GTG--A-G--GG----A-----AAATGCATATCTTTAGAGTAAAGGGta
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACACTAA-TCACAGAAGGTGTTC--GAAAACAGTGCAGGAAGA--GTTCAGATGGCTCGTAACGAGCAATCTGAACACTTCCTGCACTGTct
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                     cctttacatcattttgatgcccttggacacctccaatatagacgcctttggacacctaatatagaaggcttttgaattattgtgtgaattatgtttacattaactgTGACAGA--AGGCCTTTGAAAACAGTGCAGGAAGA--GTTCAGATTGC-------GAGCAATCTGAACACTTCCTGCACTGTTTTCgggaaaacgcgtatctatggagtaaagggtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                  accctttacttcatatagacgcctttggacacctctaatattgaaagcattaattcaccacgtatcaacaatgggtgaattatgtttatattaactgacagagtg-----GAAAACAGTGCAGGAAGA--GTTCAGATTGCTTGTGACGAGCAATCTGAACACTTCCTGCACTGTTTTCttggtgcgggaaaacgcgtatctatgaagtaaagggt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                  tttacttcatatagacgcctttgaacacctctaatatagacacatttggacacctctaatatagacgcctttggacacctaatatagaaggcttttgaattattggatgaattatgtttatattaactgacagagtg-----GAAAACAGTGCAGGAAGA--GTTCAGATTGCTCGTAACGAGCAATCTGAACACTTCCTGCACTGTTTTCaaaggccttctgtgattggtgcgggaaaacacgtatctatggagtaaaggga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                             tacttcatatagactcctttggacacctctaatatagacgcctttggagacatgatatagaaggcttttgaattattgggtgaattatgtttatattaactgacagagtg-----GAAAACAGTGCAGGAAGA--GTTCAGATTGCTAATAACGAGCAATCTGAACACTTCCTGCACTGTTTTCaaaggccttctgtgattggtgcggggaaaatgcgtatctatggagtaaagggtt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                          ctttacttcatatagacgcctttggacacctctaatatagatgcctttggacacctaatatagaaggcttttcaattattgggtgtattatatttatattaactgacagagtg-----GAAAATAGTGCAGGAAGA--GTTCAGATTGCTTTTAACGAACAGTCTGAACACTTCCTGCACTGTTTTCaaagatcttctgtgattggtgcgggaaaacgcgtatctatagagtaaagggtt
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                           cctttacttcatatagacaccttttgacacctaatatatatgtctttggacacctaatatagaaggcttttgaattattgggtgaattatgttcatattaactgacagagtg-----GAAAACAGTGCAGGAAGA--GTTCAGATTGCTCGTAACGAGTAATCTGAACACTTCCT----TATTTTCaaaggccttctgtgattggtgcgggaaaacgcgtatctatggagtaaagggtt
gi|7                          :                                                                                                                                                          gactaacacttgcaaccagtaactgtactgacagagatagttaaccctttacttcatacagatgcctttgaacacctctaatatagacgcctttggacatttcttatatagacgccttgggacacctataatatagatgcctttggacacctaatatagaaggcttttgaattattgggtgaattatgttaatattaactgacattctg-----GAAAACAGTGCAGGAAGA--GTTCAGATTGC--GTAACGAGCAATCTGAACACTTTCTGCACTGTTTTCaaaggccttctgtgattggtgcgggaaaatgtgtgtctatggagtgtaaggttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                aaccctttacttcatatagacgcctttggatacccaatacagacacctctaatatagaaggcttttgaattattggatgaattatgtttatattaactgacagagtg-----GAAAACAGTGCAGGAAGA--GTTCAGATTGCTCGTAACAAGCAATCTGAACACTTCCTGCACTGCTTTCaaaggccttctgtgattggtgtgggaaaacgcgtatctatggagtaaagggtt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  tatatacaccttttgacacctctaatatagatgccttttgacacctctaatatagaaggctttttaattatagggtaaattatgtatatataaactgacagagtg-----GAAAACAGTGCAGGAAGA--GTTCAGATTGCTTGTAACGAGCAATCTGAACACTTCCTGCACTGTTTTCaaaggccttctgtgattggtatctattgagtaaagggt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               aaccctttacttcataaagacgcctttggacatctaatatagaaggcttttgaattattggatgaattatgtttatattaactgacagagtg-----GAAAACAGAGCTGGAAGA--GTTCAGA-----------GAGCA---------CTTCCTGCACTGTTTTCtgtgattggtgcgggaaaacacgtatctataaagtaaagggtt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                        accctttacttcatatagacgccttttgacacttctaatatagacacctttggacaccttataaagaaggtttttgaattattgggtgaattatgtttatattaactgacagagc-----GAAAACAGTGCAGGAAGA--GTTCAGATTGCTCGTAACGGGTAATCTGAACACTTCCTGCACTGTTTTaaaggccttctgtgattggtgcaggaaaacgcgtatctatggagtaaaggct
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taatatagaaggcttttgaattattgggtgaattatgtttatattaactgacagagtga-----GAAAACAGTGCAGGAAGA--GTTCA--TTGCTCGTAACGAGCAATCTGAACACTTCCTGCACTGTTTTCaaaggctttctgtgattggtgcgggataacgcatatctatggagtaaagggtta
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                 aaccctttacttcatatagacacctttggacacctatgatattgaaagcattaattcaccatgtatcagcaatgggtgaattatgtttatattaactgacagagtg-----GAAAACAGTGCAGGAAGA--GTTCAGATTGCTCGTAACGAGCAATCTGAACACTTCATGCACTTTTTTaatggccttctgtgattgttgcgggaaaatgcgtatctatggagtaaagggt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  ctctttacttcctattgacgcctttggacacctctaatattgaaagcattaaaataccacgtatcagcaatgggtgaatgatgtttatattaactaacagagtga-----GAAAACAGTGCAGGAAG---------A------GTAACAAGCAATCTGAACACTTCCTGCAATGTTTTCaatgaccttctgtgattggtgcgggaaaacgcgtatctatggagtaaagggt
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatatagaaaggttttgaatcattggttggattatgtttatattaactgacagagtg-----GAAAACAGTGCAGGAAGC--GTTCAGATTGTTCGTAACGAGCAATCTGAACACTTCCTGCACTGTTTTCaaaggccttctgtgattggtgcgggaaacaacatctctatggagtaaagggtta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ggcttttgaattactagctgaattatgtttatattagctgacagagtg-----GAAAACAGTGCAGGAAG----------------------AGCAATCTGAACACTTCCTGCACTGTTTTCaaaggccttctgtgattggtgagggaaaatgcatatctttagagtaaagggct
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    accctttacttcatataaatgcctttggacacctccaatattgaaagcattaattcaccacatatcagcaatgggtgaattatgtttatattaactgacagagtgGTTCGTAACGAGCAATCTGAACCCTTCCTGCACTGTTTTC-----CACTCTGTCATT-aaagaccttctgtgattggtgcgggaaaacgtgtatctatggagtaaagggt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaccctttattcataaagacacctttggacacctgtaatatagaaggcttttgaattaatggttgaattatgtttttattaTGCGCTGTTTTCAAAGGCCTTATGTGATT-G-----------------------------------GTATCTATGGAGTAAAGGGT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atccctttacttcatatagacgcctttggacacctctaatattgacgcctttggacacctctaatatagaaggctttcgaataatttggtaataatttttatattaactgacagtgaaaaacagTTCAAAAGCCTTCTAT-ATT-AGAGGTGTCTG--T-ATTGG----GTATCCAAAGGCGTCTATATGAAGTAAAGGGTt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aTTCAAAAGCCTTCTAT-ATTAG-------ATGTCC-A---------------AAGGCGTCTTTATGAAGTAAAGGGTttattggatgaattatgtttatattaactgacagagtggaaaacagtgcagaaagtgttcagattgctcgttacgcaatctgaactcttcctgcactgttttcaaaggccttctgtgattggtgtgggaaaacgcgtatctatggagtaaagggtt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aTTCAAAAGCCTTCTAT-AT-----------TA--C-A--GGTGTCC-----AAAGGTGTCTTTAT-GAATAAAGGGTttattggatgaattatgtttatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcgttacaagcaatctgaactcttcctgcactgttttctgtgattggtgcgggaaaacacgtatctataaagtaaagggtt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aGCCTTCTGTGATT-G-------GTG--T-G--GG----A-----AAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTttaatggttgaattatgtttttattaaatgacagagtggaaaacagtgcaggaagggttcagattgctcgttacgaac
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): TCTAGGCTGCGTTTCACAAAAAAATTACGATAAAAATTGCCGAAGTCAATCTGACAATTACATGTTGTTTGTTTAAATTTTGATTGACATTTAAAATGATTGTATTGGGAAATACAATTATTTTCTACATGATTTTAGCAATTTTGGATTCATG
Unaligned ( gi|24 ): ACTGATTTGATTAACAATATATTGCATTACCATAATGTGCATATTTGAGTTGAGCTACAAGTACATTAATTATTTACAGTAGTTTCCATGAAAAACAAAGGTTGTTGGAGGACAAAATTGTT
Unaligned ( gi|25 ): GATAATACTTGCAGGTCCAGAAACCATACTAAATGACAGCTTTTTCAGTCAAAATTTTAAAGTTTACTATACAGTTAAACCTGTGTAAACAGTCATCTCTATTTAGAAACCACTTGTC
Unaligned ( gi|26 ): TATTTAACATTTTCGGTATTCATGTACATGTACAGTCAAAACTGTGTAAGTGGCCATCTCTGT
Unaligned ( gi|27 ): ATAATATATTATTCAATTAAATCATACATACACAAATATAGTGCAGCCAC
Unaligned ( gi|29 ): ACAATTACATATAATGCCTTGTACTTACATGTAAAATGAGTGAGCACC






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consensus                     :                                                                                                                             AACCCTTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTTG-ACAC--TTCATATAGACGCCTTTGGACACCTCTA---ATATAGACGCCTTTGGACACCTCTAATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AT------TGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAG--TGTTCAGATTGCTCGTTACGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGT
Reference ( family-2059 )     :                                                                                                                             AACCCTTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTTGGACAC--CTAATATAGACGCCTTTGGACACCTCTA---ATATAGACGCCTTTGGACACCTCTAATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AT------TGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAG--NGTTCAGATTGCTCGTNACGAGCAATCTGAACNCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGT
gi|1                          :                                                                                                                                                         CCTTT----AC--TTCATACAGATGCCTTTGAACACCTCTA---ATATAGACGCCTTTGGACATTTCTTATATAGACGCCTT
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atcTGCGCTGTTTTCAAAGGCCTTATGTGATTG-----------------GTATCTATGGAGTAAAGGGTgctgttttcaaaggccttatgtgattggtatctatggagtaaagggtt
gi|2                          : atccctttacttcatatagacgcctttggacacctctaatattgacgcctttggacacctctaatatagaaggctttcgaataatttggtaataatttttatattaactgacagtgaaaaacagAACCCTTT----ACTTT--ATATAGACGCCTTTGGACAC--CTAATATAGACGCCTTTGGACACCTTTA---ATATAGACGCCTTTGGACACCTCTAATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AT------TGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAG--TGTTCAGATTGCTCGTCATGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGCTGC-AGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTt
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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Alignments
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Reference ( family-2059 )     :                                                                                                                             AACCCTTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTTG-A-CACTTC--ATATAGACGCCTTTGGACACCTCTA---ATATAGACGCCTTTGGACACCTCTAATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AT------TGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGT
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atcTGCGCTGTTTTCAAAGGCCTTATGTGATTG-----------------GTATCTATGGAGTAAAGGGTgctgttttcaaaggccttatgtgattggtatctatggagtaaagggtt
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gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aacGCCTTCTGTGATTGGTGT-GGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGT
gi|3                          :                                                                                                                                  TTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTTG-AACACCTCTAATATAGACACATTTGGACACCTCTA---ATATAGACGCCTTTGGACACCT--AATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AT------TGGATGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTCACAAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACACGTATCTATGGAGTAAAGGGt
gi|4                          :                                                                                                                                                          CTTT-----ACTTC--ATATAGACGCCTTTGGACACCTCTA---ATATAGATGCCTTTGGACACCT--AATATAGAAGGCTTTTCAAT------T--------AT------TGGGTGTATTATATTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTATTAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGATCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACGCGTATCTATAGAGTAAAGGGTa
gi|5                          :                                                                                                                                                         CCTTT-----ACTTC--ATATAGACACCTTTTGACACCT--A---ATATATATGTCTTTGGACACCT--AATATAGAAGGCTTTTGAAT------T--------AT------TGGGTGAATTATGTTCATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGACTGTTCGTTAAAAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTATTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTt
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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-2059 )     :                                                                                                                             AACCCTTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTTGGACACCTCTA---ATATAG-AC-GCCTTTGGACACCTCTAATATAGAAGGCTTTTGAAT------TAT------TGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGT
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gi|1                          :                                                                                   gactaacacttgcaaccagtaactgtactgacagagatagttaacCCTTTGAACACCTCTAATATAGACGCCTTTGGACATTTCTTATATAGACGCCTTGGGACACCTATA---ATATAG-AT-GCCTTTGGACACCT--AATATAGAAGGCTTTTGAAT------TAT------TGGGTGAATTATGTTAATATTAACTGACATTCTGGAAAATA----AGGAAGT--GTTCAGATTACTCGTTACGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAATGTGTGTCTATGGAGTGTAAGGTgggacacctataatatagatgcctttggacacctaatatagaaggcttttgaattattgggtgaattatgttaatattaactgacattctggaaaataaggaagtgttcagattactcgttacgagcaatctgaactcttcctgcactgttttcaaaggccttctgtgattggtgcgggaaaatgtgtgtctatggagtgtaaggttt
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atcTGCGCTGTTTTCAAAGGCCTTATGTGATTG-----------------GTATCTATGGAGTAAAGGGTgctgttttcaaaggccttatgtgattggtatctatggagtaaagggtt
gi|2                          : atccctttacttcatatagacgcctttggacacctctaatattgacgcctttggacacctctaatatagaaggctttcgaataatttggtaataatttttatattaactgacagtgaaaaacagAACCCTTT----ACTTT--ATATAGACGCCTTTGGACACCTA--ATATAGACGCCTTTGGACACCTTTA---ATATAG-AC-GCCTTTGGACACCTCTAATATAGAAGGCTTTTGAAT------TAT------TGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTCATGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGCTGC-AGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTt
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gi|22                         :                                                                                                                                                         CCTTT----ACTTC--ATATAGATGCCTTTTGACATCTCTA---TTATAG-AC-ACCTTTGGACACGT--AATATAGAAGGCTTTTGAAT------TAT------TAGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGTACGCTCAct
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gi|3                          :                                                                                                                                  TTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTTGAACACCTCTAATATAGACACATTTGGACACCTCTA---ATATAG-AC-GCCTTTGGACACCT--AATATAGAAGGCTTTTGAAT------TAT------TGGATGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTCACAAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACACGTATCTATGGAGTAAAGGGt
gi|4                          :                                                                                                                                                          CTTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTTGGACACCTCTA---ATATAG-AT-GCCTTTGGACACCT--AATATAGAAGGCTTTTCAAT------TAT------TGGGTGTATTATATTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTATTAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGATCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACGCGTATCTATAGAGTAAAGGGTa
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Reference ( family-2059 )     :                                                                                                                             AACCCTTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTTGGACACCTCTA---ATATAG-AC-GCCTTTGGACACCTCTAATATAGAAGGCTTTTGAAT------TAT------TGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGT
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atcTGCGCTGTTTTCAAAGGCCTTATGTGATTG-----------------GTATCTATGGAGTAAAGGGTgctgttttcaaaggccttatgtgattggtatctatggagtaaagggtt
gi|2                          : atccctttacttcatatagacgcctttggacacctctaatattgacgcctttggacacctctaatatagaaggctttcgaataatttggtaataatttttatattaactgacagtgaaaaacagAACCCTTT----ACTTT--ATATAGACGCCTTTGGACACCTA--ATATAGACGCCTTTGGACACCTTTA---ATATAG-AC-GCCTTTGGACACCTCTAATATAGAAGGCTTTTGAAT------TAT------TGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTCATGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGCTGC-AGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTt
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                          gcCCTTTATTCATAAAG-AC-ACCTTTGGACACCTGTAATATAGAAGGCTTTTGAAT------TAA------TGGTTGAATTATGTTTTTATTAAATGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGG--GTTCAGATTGCTCGTTACGAACa
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gi|3                          :                                                                                                                                  TTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTTGAACACCTCTAATATAGACACATTTGGACACCTCTA---ATATAG-AC-GCCTTTGGACACCT--AATATAGAAGGCTTTTGAAT------TAT------TGGATGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTCACAAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACACGTATCTATGGAGTAAAGGGt
gi|4                          :                                                                                                                                                          CTTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTTGGACACCTCTA---ATATAG-AT-GCCTTTGGACACCT--AATATAGAAGGCTTTTCAAT------TAT------TGGGTGTATTATATTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTATTAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGATCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACGCGTATCTATAGAGTAAAGGGTa
gi|5                          :                                                                                                                                                         CCTTT----ACTTC--ATATAGACACCTTTTGACACCT--A---ATATAT-AT-GTCTTTGGACACCT--AATATAGAAGGCTTTTGAAT------TAT------TGGGTGAATTATGTTCATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGACTGTTCGTTAAAAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTATTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTt
gi|6                          :                                                                                                                                                             T----ACTTC--ATATAGACTCCTTTGGACACCTCTA---ATATAG-AC-GCCTTTGGAGACAT--GATATAGAAGGCTTTTGAAT------TAT------TGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGCGGGG--AAAATGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTt
gi|7                          :                                                                                                                                                         CCTTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTTGGATACCC--A---ATACAG-AC-----------ACCTCTAATATAGAAGGCTTTTGAAT------TAT------TGGATGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGAAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTAC--GCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGT-GGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTt
gi|8                          :                                                                                                                                                       aacCTTT----ACTTC--CTATTGACGCCTTTGGACACCTCTA---ATATt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                    ctTATTG-AC-GCCTTTGGACACCTCTAATATTGAAAGCATTAAAATACCACGTATCAGCAATGGGTGAATGATGTTTATATTAACTAACAGAGTGAAAAAAAGTGCATGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAATGACCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTtgaaagcattaaaataccacgtatcagcaatgggtgaatgatgtttatattaactaacagagtgaaaaaaagtgcatgaagtgttcagattgctcgttacgagcaatctgaactcttcctgcactgttttcaatgaccttctgtgattggtgcgggaaaacgcgtatctatggagtaaagggt
gi|9                          :                                                                                                                                             ctctttacttccCCTTT----ACTTC--ATATAGACACCTTTGGACACCTATG---ATATTG-AAAGCATTAATTCACC----ATGTATCAG-C-----AAT----------------GGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACGAGCAA--TGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAATGGCCTTCTGTGATTGTTGC-GGG--AAAATGCGTATCTATGGAGTAAAGGGT


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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-2059 )     :                                                                                                                             AACCCTTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTTGGACACCTCTA---ATATAGAC-GCCTTTGGACA--C--CT--AATATAGAAGGCTTTTGAATTATTGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGT
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gi|14                         :                                                                                                                                                         CCTTT----ACTTC--ATATAAATGCCTTTGGACACCTCCA---ATATTGAAAGCATTAATTCA--C--C----ACATATCAG-C-----AAT----GGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTC--------------------TTCCTGCACTGTTTTCAAAGACCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACGTGTATCTATGGAGTAAAGGGT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                acCCTTT----ACTTC-----ATAAAGAC-GCCTTTGGACA--T--CT--AATATAGAAGGCTTTTGAATTATTGGATGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACAAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTT----------TTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACACGTATCTATAAAGTAAAGGGT
gi|16                         :                                                                                                                                                                               aacCCTTT----ACTTC-----ATATAGAC-ACCTTTGGACA--C--CT--TATATAGAAGGCTTTTGAATTATTTGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACATTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTTGTT-------------ACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTTTGATTGGTGT-GGGAAAAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                           taacT--AATATAGAAGGCTTTTGAATTATTGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGAAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTACCCGTTACGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCTTTCTGTGATTGGTGC-GGG--ATAACGCATATCTATGGAGTAAAGGGT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                   ATATAGAAAGGTTTTGAATCATTGGTTGGATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTACTCGTTATGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAACAACATCTCTATGGAGTAAAGGGTta
gi|19                         :                                                                                                                                                        tCCTTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTTGGACACCTCTA---ATATTGAC-GCCTTTGGACA--CCTCT--AATATAGAAGGCTTTCGAATAATTTGGT-AATAATTTTTATATTAACTGAC--AGTGAAAAACAGTGCta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atcTGCGCTGTTTTCAAAGGCCTTATGTGATTG-----------------GTATCTATGGAGTAAAGGGTgctgttttcaaaggccttatgtgattggtatctatggagtaaagggtt
gi|2                          : atccctttacttcatatagacgcctttggacacctctaatattgacgcctttggacacctctaatatagaaggctttcgaataatttggtaataatttttatattaactgacagtgaaaaacagAACCCTTT----ACTTT--ATATAGACGCCTTTGGACACCTA--ATATAGACGCCTTTGGACACCTTTA---ATATAGAC-GCCTTTGGACA--C--CTCTAATATAGAAGGCTTTTGAATTATTGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTCATGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGCTGC-AGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                           GGCTTTTGAATTACTAGCTGAATTATGTTTATATTAGCTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACGAACAATCTGAACGCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGA-GGG--AAAATGCATATCTTTAGAGTAAAGGG
gi|22                         :                                                                                                                                                         CCTTT----ACTTC--ATATAGATGCCTTTTGACATCTCTA---TTATAGAC-ACCTTTGGACA--C--GT--AATATAGAAGGCTTTTGAATTATTAGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGTACGCTCAct
gi|23                         :                                                                                                                                                                                          gcCCTTTATTCATAAAGAC-ACCTTTGGACA--C--CTGTAATATAGAAGGCTTTTGAATTAATGGTTGAATTATGTTTTTATTAAATGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGG--GTTCAGATTGCTCGTTACGAACa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aacGCCTTCTGTGATTGGTGT-GGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGT
gi|3                          :                                                                                                                                  TTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTTGAACACCTCTAATATAGACACATTTGGACACCTCTA---ATATAGAC-GCCTTTGGACA--C--CT--AATATAGAAGGCTTTTGAATTATTGGATGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTCACAAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACACGTATCTATGGAGTAAAGGGt
gi|4                          :                                                                                                                                                          CTTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTTGGACACCTCTA---ATATAGAT-GCCTTTGGACA--C--CT--AATATAGAAGGCTTTTCAATTATTGGGTGTATTATATTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTATTAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGATCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACGCGTATCTATAGAGTAAAGGGTa
gi|5                          :                                                                                                                                                         CCTTT----ACTTC--ATATAGACACCTTTTGACACCT--A---ATATATAT-GTCTTTGGACA--C--CT--AATATAGAAGGCTTTTGAATTATTGGGTGAATTATGTTCATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGACTGTTCGTTAAAAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTATTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTt
gi|6                          :                                                                                                                                                             T----ACTTC--ATATAGACTCCTTTGGACACCTCTA---ATATAGAC-GCCTTTGGAGA--C--AT--GATATAGAAGGCTTTTGAATTATTGGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGCGGGG--AAAATGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTt
gi|7                          :                                                                                                                                                         CCTTT----ACTTC--ATATAGACGCCTTTGGATACCC--A---ATACAGAC-ACCT------------CT--AATATAGAAGGCTTTTGAATTATTGGATGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGAAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTAC--GCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAAAGGCCTTCTGTGATTGGTGT-GGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTt
gi|8                          :                                                                                                                                                       aacCTTT----ACTTC--CTATTGACGCCTTTGGACACCTCTA---ATATTGAAAGCATTAAAATA--C--C----ACGTATCAG-C-----AAT----GGGTGAATGATGTTTATATTAACTAACAGAGTGAAAAAAAGTGCATGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACGAGCAATCTGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAATGACCTTCTGTGATTGGTGC-GGG--AAAACGCGTATCTATGGAGTAAAGGGTt
gi|9                          :                                                                                                                                                       ctCCTTT----ACTTC--ATATAGACACCTTTGGACACCTATG---ATATTGAAAGCATTAATTCA--C--C----ATGTATCAG-C-----AAT----GGGTGAATTATGTTTATATTAACTGACAGAGTGGAAAACAGTGCAGGAAGT--GTTCAGATTGCTCGTTACGAGCAA--TGAACTCTTCCTGCACTGTTTTCAATGGCCTTCTGTGATTGTTGC-GGG--AAAATGCGTATCTATGGAGTAAAGGGT
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): TCTAGGCTGCGTTTCACAAAAAAATTACGATAAAAATTGCCGAAGTCAATCTGACAATTACATGTTGTTTGTTTAAATTTTGATTGACATTTAAAATGATTGTATTGGGAAATACAATTATTTTCTACATGATTTTAGCAATTTTGGATTCATG
Unaligned ( gi|24 ): ACTGATTTGATTAACAATATATTGCATTACCATAATGTGCATATTTGAGTTGAGCTACAAGTACATTAATTATTTACAGTAGTTTCCATGAAAAACAAAGGTTGTTGGAGGACAAAATTGTT
Unaligned ( gi|25 ): GATAATACTTGCAGGTCCAGAAACCATACTAAATGACAGCTTTTTCAGTCAAAATTTTAAAGTTTACTATACAGTTAAACCTGTGTAAACAGTCATCTCTATTTAGAAACCACTTGTC
Unaligned ( gi|26 ): TATTTAACATTTTCGGTATTCATGTACATGTACAGTCAAAACTGTGTAAGTGGCCATCTCTGT
Unaligned ( gi|27 ): ATAATATATTATTCAATTAAATCATACATACACAAATATAGTGCAGCCAC
Unaligned ( gi|29 ): ACAATTACATATAATGCCTTGTACTTACATGTAAAATGAGTGAGCACC