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gi|7                          :                                                                                                        cattctgtcagtaaCAGTAAGCTT-CATCGTTTCAATTCAT----TGAAAAA--A---ATGATAAAATTGTAAC-TTTAGCATAAGTTGTTGCTATCTGAGTCATATCAGGTGCAAAAAATACCCTTGCTTATTGTCAA--AA-CAGGC-ATTTAGA-CTCGC--TATTATCACCccattctagtttatattttgatacag
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): GAGGTGTAGGCTGTTATAAATACATCAAAGGGCCTTATAATTCACAAAATGTTAGT
Unaligned ( gi|18 ): TGTCCATCGTCACGCGTCGTCATTATTATCATCATCATCATCAAT






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gi|2                          :                                                                                           TCCTT---TAAAGCAGTATAA--------CCAGTAATTTC-TACCATTTTTGTTCAA----T-AAAAA--A---CTGGTATAATTGTAATATTTAGCATAAATTGCAGCTATCTGGATCATATCAGGTGC--TTAATTTCATTGTTTATCATCAA-AAA-CATGTTATCTAAA-CTCGC--TATT----------------------ACTTGGCTCATGGAATAACATAAATGATTTTGCAAACATA-----TAATCT-----------GTAAACATTTGGACATTTCCAGGCAATATTGATTAAACCTGAGTAATCGGTTAAGTTTAAACTTAGATTTATATGTCCAATA-------TTGTGATATTCCTACATTGCGCA--TG--TATTATCTATGGATTATGACCCA---------------GATGATACGGGTTCGAAT---AAGACAAGAGTTTTTGTTAATTTCCCTAGCAACATTATTTTTTTC-CTACAG-TAAACGGCTCCTCATATCCAATAAATCATGTTGAAACAAAATGGAAAAAATTTTTT--------TGT---CAGCCA--GCTACTT----GCATATAAGAATATAACTGATCAGTAAATTTAGATTTAAAACATCATTAATTTACATTT--AAG----AGAGGT-ATT--------TG---------TTATAAAA---GCATCAAAGTCCATGAG---A--GTTCAGGAAAATGTTTATC-TTC
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1086 )     :                                               TCTCTTCAACTGTGGCTTNACATNGTAAATNCGCTATATCGATATTCT--T---TAAAGCGGCATAA--------CCAGTANNTTC-TACCCTTTTAATTCAA----T-AAAAA--A---CTGGTATAATTGTAATATTTAGCATAAATTGTGGCTATCTGGATCATATCTGGTGC--AAAATACCGTTGTTTATCGTCAA-AAA-CATG-TATTTAAA-CTCGC--TATTATCGCCGAT-ATTTG-A-TNAGACCTGACCCATGGAGTAACATAAATGATTT----AATATAT-TG-TAATCT------TATNCGTAAACGTTTGGANATTTCCGGGCATCATCGATTAAACCCGAGTAANCGGTTAAGTTTAAANTTAGATTTATACGTCCGATGCCGAT-CTTGTTATATTNCTACATNGCGNAG-CG--TATTATCTATGGANTATGACNCGGGGGGGTGGGGTGCTGATNATNCGGGTTCGAATCCCGGGACANNNNCTTTTGTTNATTTCCCTAGCAANANTATTTTNNNCGNTGGAGTTGANCGAGT----ATATACGA---------TTGAATCA-----GAAA----TTTTTA-----GATGC---CAG-CG--GCAATTT----GCATATTAGAAT-T-ACTGATCTGTAAATTTAGATTTAAAACGCGATTTATTCACGTTT--AAG----AGAGGT-A-T--------CG---------T------A---GCATCGAAGGCCAT--G---A--ATTCANGAAAATGTTTGTCATTCATGAATAAGTTGTTTCTTTCTTTATAAAAGAAACATCTTCA-GATACCGGTTATGCC-GCTTTAAAG
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Reference ( family-1086 )     :                                               TCTCTTCAACTGTGGCTTNACATNGTAAATNCGCTATATCGATATTCT--T---TAAAGCGGCATAA--------CCAGTANNTTC-TACCCTTTTAATTCAA----T-AAAAA--A---CTGGTATAATTGTAATATTTAGCATAAATTGTGGCTATCTGGATCATATCTGGTGC--AAAATACCGTTGTTTATCGTCAA-AAA-CATG-TATTTAAA-CTCGC--TATTATCGCCGAT-ATTTG-A-TNAGACCTGACCCATGGAGTAACATAAATGATTT----AATATAT-TG-TAATCT------TATNCGTAAACGTTTGGANATTTCCGGGCATCATCGATTAAACCCGAGTAANCGGTTAAGTTTAAANTTAGATTTATACGTCCGATGCCGAT-CTTGTTATATTNCTACATNGCGNAG-CG--TATTATCTATGGANTATGACNCGGGGGGGTGGGGTGCTGATNATNCGGGTTCGAATCCCGGGACANNNNCTTTTGTTNATTTCCCTAGCAANANTATTTTNNNCGNTGGAGTTGANCGAGT----ATATACGA---------TTGAATCA-----GAAA----TTTTTA-----GATGC---CAG-CG--GCAATTT----GCATATTAGAAT-T-ACTGATCTGTAAATTTAGATTTAAAACGCGATTTATTCACGTTT--AAG----AGAGGT-A-T--------CG---------T------A---GCATCGAAGGCCAT--G---A--ATTCANGAAAATGTTTGTCATTCATGAATAAGTTGTTTCTTTCTTTATAAAAGAAACATCTTCA-GATACCGGTTATGCC-GCTTTAAAG
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gi|1                          :                                                                                        ATATTCC--TCCTTAAAGCGGCATTA--------CCAGTATCTaggaatataccttttaaattattttcgaaatcag
gi|10                         :                                                                                                                                      tctctttaactgtagctttacattgtttcgttatatcgacattatttaaagcggtataaccagtaatttctacccttttaattcactaaaaaactggtataattgtaatatttatcataaattatggcaatctggatcatgtttggttcacaatactgttgtttataaaaaacaacatgtatttaaaattgttatattatcgtcaatatttatataagatctgacccatggattaacataaatgattgagtatattataatctcagatgtatacgtaaatgtttagaaatttttgggcatcttcaaataaagcacagtaagcatttaagtttaaccttatatttatacaatggatcttattatatgactgcatggcatagtggttatatctatggaatatgacacgggggggtggggtgctgatcattcaggttcgaatcccggaacattttcttttgtttatttccctagcaaaagtattttggatgatggaattggttgagtaatatatgattgaatcagaaatttttagataatttgcatattagaattactgatctgtaaaatttaaaacctgatttgttcatgtttaagagaggtatcgtagcctctaagatcagaattcatgaaaatgtttttcattcatgaaagttgtttctttctttataaaagaaatattttcATGAAAAAAATTGTCATTCATGAATAAGTTGTTTATTTCTTTATAAGATACACATCTTAA-GTTACCCGTTGTTCCAATTTTAAAGaccttttaaattattttcgaaatcag
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTT----GCATATAACAAT-T-ACTGATCTATAACTTTAGAATTAAATTACGATTTGTTCACGTCT--AAG----AGCGGgcctgtatagt
gi|2                          :                                                                                           TCCT--T---TAAAGCAGTATAA--------CCAGTAATTTC-TACCATTTTTGTTCAA----T-AAAAA--A---CTGGTATAATTGTAATATTTAGCATAAATTGCAGCTATCTGGATCATATCAGGTGC--TTAATTTCATTGTTTATCATCAA-AAA-CATGTTATCTAAA-CTCGC--TATT----------------------ACTTGGCTCATGGAATAACATAAATGATTTTGCAAACATA-----TAATCT-----------GTAAACATTTGGACATTTCCAGGCAATATTGATTAAACCTGAGTAATCGGTTAAGTTTAAACTTAGATTTATATGTCCAATA-------TTGTGATATTCCTACATTGCGCA--TG--TATTATCTATGGATTATGACCCA---------------GATGATACGGGTTCGAAT---AAGACAAGAGTTTTTGTTAATTTCCCTAGCAACATTATTTTTTTC-CTACAG-TAAACGGCTCCTCATATCCAATAAATCATGTTGAAACAAAATGGAAAAAATTTTTT--------TGT---CAGCCA--GCTACTT----GCATATAAGAATATAACTGATCAGTAAATTTAGATTTAAAACATCATTAATTTACATTT--AAG----AGAGGT-ATT--------TG---------TTATAAAA---GCATCAAAGTCCATGAG---A--GTTCAGGAAAATGTTTATC-TTC
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gi|5                          :                                                                                                                                                 tagcaaccgttcttatactaaatggttgcAAATGTAATATTTACCATAAATGGTAAATATTTAGATTAAATCTGGTGC--AAAATAACGTTGTTTATCGTCAA-AAT-AATG-AATTTAAAACTCGT--TATTACCGCCGAT-ATTTA-A-TGAGACCTGACCCATGGAGTGACATAAATGATTT----AATATATATGCT--CCT------TATT-------------ACA--TCCGGGTATCATCGATTAA--------AATC----AAAT----AGTTAGATTT----GTTCG--GCC-ATACTTGTTATATTACTACCTTACGAAGTCG--TATTAT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tatatatacatatacataATTT----GTATATTAGAAT-T-CATAATCAGTAAATTTAGATTTAAAATGTGATTTATTCACTTTT--TTA----AGAGGT-A-T--------CGGCTGTTATAT------AT--GCATCGAAGGCCAT--G---ATAATTCAAGAAAATGTTTGTCATTCGTAAACAAGGTCTTTCTTTCTTTATAAAAGAAATATC-TCATGATACTGGTTATGTC-TCTTTAAA
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Reference ( family-1086 )     :                                               TCTCTTCAACTGTGGCTTNACATNGTAAATNCGCTATATCGATATTCT--T---TAAAGCGGCATAA--------CCAGTANNTTC-TACCCTTTTAATTCAA----T-AAAAA--A---CTGGTATAATTGTAATATTTAGCATAAATTGTGGCTATCTGGATCATATCTGGTGC--AAAATACCGTTGTTTATCGTCAA-AAA-CATG-TATTTAAA-CTCGC--TATTATCGCCGAT-ATTTG-A-TNAGACCTGACCCATGGAGTAACATAAATGATTT----AATATAT-TG-TAATCT------TATNCGTAAACGTTTGGANATTTCCGGGCATCATCGATTAAACCCGAGTAANCGGTTAAGTTTAAANTTAGATTTATACGTCCGATGCCGAT-CTTGTTATATTNCTACATNGCGNAG-CG--TATTATCTATGGANTATGACNCGGGGGGGTGGGGTGCTGATNATNCGGGTTCGAATCCCGGGACANNNNCTTTTGTTNATTTCCCTAGCAANANTATTTTNNNCGNTGGAGTTGANCGAGT----ATATACGA---------TTGAATCA-----GAAA----TTTTTA-----GATGC---CAG-CG--GCAATTT----GCATATTAGAAT-T-ACTGATCTGTAAATTTAGATTTAAAACGCGATTTATTCACGTTT--AAG----AGAGGT-A-T--------CG---------T------A---GCATCGAAGGCCAT--G---A--ATTCANGAAAATGTTTGTCATTCATGAATAAGTTGTTTCTTTCTTTATAAAAGAAACATCTTCA-GATACCGGTTATGCC-GCTTTAAAG
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gi|5                          :                                                                                                                                                 tagcaaccgttcttatactaaatggttgcAAATGTAATATTTACCATAAATGGTAAATATTTAGATTAAATCTGGTGC--AAAATAACGTTGTTTATCGTCAA-AAT-AATG-AATTTAAAACTCGT--TATTACCGCCGAT-ATTTA-A-TGAGACCTGACCCATGGAGTGACATAAATGATTT----AATATATATGCT--CCT------TATT-------------ACA--TCCGGGTATCATCGATTAA--------AATC----AAAT----AGTTAGATTT----GTTCG--GCC-ATACTTGTTATATTACTACCTTACGAAGTCG--TATTAT
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gi|7                          :                                                                                                     cattctgtcagtaaagcaagtcCAGTAAGCTT-CATCGTTTCAATTCAT----TGAAAAA--A---ATGATAAAATTGTAAC-TTTAGCATAAGTTGTTGCTATCTGAGTCATATCAGGTGCAAAAAATACCCTTGCTTATTGTC-A-AAA-CAGG-CATTTAGA-CTCGC--TATTATCACCccattctagtttatattttgatacag
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gi|9                          :                                                                                                      AAAGCCTCATAA--------TTAGTATGCCC-TATCGTTTAAATTCAT----T-ACAAA--A----------AATTGTAA-ATTCAGCATAAATTGTTGCTATCTAGGTCATATCTGTTGCA-AAAATAGCCTTGTTTATTGTC-A-AAA-CATG-AATTTTAA-CTCGC--TTTTATCACCTATGATT
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Unaligned ( gi|17 ): GAGGTGTAGGCTGTTATAAATACATCAAAGGGCCTTATAATTCACAAAATGTTAGT
Unaligned ( gi|18 ): TGTCCATCGTCACGCGTCGTCATTATTATCATCATCATCATCAAT