lowQualScore : 1111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111 1111111111111111111
lowQualScore : 333 222222222 111 11 333333333333 11 11 1 1 1 33333 2 2 2222222222 1 11 22 3333333333333333333333333333333 111 1 1 2 1 333 33 1 1 11 1111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 3333 2 2 333333333 1 1 4444444444444444 11 222222 5555 1 111 11 333333 1 111111111111111111111 11 1 111 1 1 55555 1 1 555555 222 111 11 2 1 1 22 1 2222 1 8888888888888888888 55555 1 222 222 1 1 1 22 333 1 1 1 1 11 222
lowQualScore : 555 444444444 4 2 1 999 000 888 11 33 222222222222 2 33 6 44 4 6 4 7 6 6 2 7 6 3 9 3 4 4 3 5 0 0 22222 0 4444 1 3333333333 0 33 33 8 5555555555555555555555555555555 2 777 5 3 3 66 4 4 4 5 6 6 0 6 7 6 6 555 00 6 2 7 5 2 88 6 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 6 6 5 8888 0 3 0 777777777 0 0 3 44 2 3 5 6666666666666666 333 33 6 888888 8 6666 7 6 9 5 6 6 999 11 6 888888 3 0 333333333333333333333 33 3 999 6 1 1 8 8 6 8 8 3 6 6 7 7 11111 6 5 5 6 4 777777 4 666 333 88 4 0 5 6 4 5 6 00 6 6 7 88 3333 5 6 2 8888888888888888888 00000 4 5 666 888 88 4 4 4 4 7 2 3 5 5 6 11 6 888 5 5 6 5 6 7 22 333
lowQualScore : ... ......... . . . ... ... ... .. .. ............ . .. . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . ..... . .... . .......... . .. .. . ............................... . ... . . . .. . . . . . . . . . . . ... .. . . . . . .. . .................................................... . . . . .... . . . ......... . . . .. . . . ................ ... .. . ...... . .... . . . . . . ... .. . ...... . . ..................... .. . ... . . . . . . . . . . . . . ..... . . . . . ...... . ... ... .. . . . . . . . .. . . . .. .... . . . ................... ..... . . ... ... .. . . . . . . . . . . .. . ... . . . . . . .. ...
lowQualScore : 888 999999999 0 1 7 444 000 777 44 22 000000000000 5 88 5 33 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 8 5 0 0 2 5 8 2 00000 0 0000 2 8888888888 0 88 88 8 2222222222222222222222222222222 5 555 0 5 5 00 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 000 55 0 5 0 5 5 33 0 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 5 0 0 5 0000 0 0 0 000000000 2 0 0 22 5 2 0 0000000000000000 888 88 0 888888 2 7777 0 0 0 0 7 0 000 33 7 333333 3 7 333333333333333333333 33 3 777 7 0 0 3 3 0 3 3 3 0 7 3 3 33333 0 0 0 0 0 555555 0 000 555 00 0 0 0 0 0 0 0 00 0 0 0 55 5555 0 0 5 0000000000000000000 00000 0 0 555 000 55 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 00 0 000 0 0 0 0 0 0 00 000
consensus : AGGGAATGCACTGGAGAGCGGT--ACGCATAAGCTCCGAGCTTNCTTCGCAATCAAGCTAA-AATAAA---TTAGT-G-TAAAATAAAT-GTA-----CGT----ATGCCAAAT--TAACANGACAGACC-GAAATAACACGTTAGACACAGGAAATAAAAACTAGCAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAANAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAANAGTAAATATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCATGTAAGCACGTAACAATTAAGCCACCATAAAAGCTGTGAAAGGNGCAACAAGTAAGAAATGACAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTNTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTNAATNAAGATTCATCCATCTGGCACNAATTACAATCAAAATGAAAATTACACA-CC-GGCAGGGTTCTTCCGTGGTCAATGGACCGATAAGTCACCAN-TT----A-AC-TAT--TT--ATTGACACGG-TCTCACTGGCATGTGACATA-CG-----GTTNT---CACCATGGGTGTCTGTNTTGNTGNNTGCCATGCAACTCTGCCTTCATNATAGTAATTNAATTGTTNTATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCACGTATCCAATATAAAAGCTGTCGACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTTCAAAAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACATTTTTACAAGGAATTATTTAGANACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATANGAAATCGCTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTAATACGCGTATGTCACACT--------T--------T----CATTCA--GA--ACTGG-------------CGTGGGGTTTTCGNTTCGTTAATTTAATGATATTAACATCATGGTGTTTACATACTAAAGTANCGTTCTGAAACCTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTNTTTGATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTCTTNCTT-TATCTTTT-CTTTTCAATCACATANTGCGGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACNAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----TC----------TTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACATA------ACGTAATTAACACCACGGGTGTCTGTGTTGCTGCGTGTCATATAAGTAGCGGTATAGCACAGCGGGTATA-TTTCAAACAAGTTTAATATAGTTCGTCATTTTAG-TAATGTATTAACATAAATCATACT------ATCAGT-AAAAAAATAAT---------------------TTGAGAAAC-CACTG-AAAAAA-GTTCATTTCAGGTACATATATATACATAATGATAACGAAAATATTTAT-AAATCTTATAATATCAGAATA-TCTTTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTAT----TATGTCAAATCCCATCGCGCGGATTATNATAAATTTTTCATCACCCGTGCAGTGCATAATTTTATTATNGATTATAAAGCTGATTTTTNGNTTGAACANTAACAAAAACCAGTGACANATCCACATGTTGTTAGGTCGCTGCTTACACTGATCAAATNAATGGATTACTGTTAANCCAAANATGTATAAGCGGTATNGAATTGTTAATNANA--CAATT-------ACAATATATCTAGTGATATCTATGTTGNTGATGTATCTGTAAATTTTGTGGACAACACTTGTTTTGCTTTNTTGTNACAAACGGCTNACGGTNTNTCAAAGAAGTCACTGACNCANACACATTTCTGTCTGGATAATACAAGTCGGCTGAACTTGGGGTATTCTTTGATCACACAGACCACTGATCACATATCAAAATATAGACTCTTCCATTAAACTTCCCTACTAT
Reference ( gi|1 ) : AGGGAATGCA-TGGAGAACGAT--ATGCATAAGCTCCGAGCTTACTTCACAATCAAGCTAA-ATTAAA---TTAAT-G-TAAAATAAAT-GTA-----TGT----ATGCCAAAT--TAACAGGACAGACT-GAAATAACACATTAGACACAGGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGTCTATAAAATAGTAAAAATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCACGTAAGCACATAACAATTAAGCCATTATAAAAGCTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATAAAAAATCTGCATATTTTAGTATTGACTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACA-AT-GGCAGGGTTCTT-CGTGATCAATGGACAGATAAATCACCAA-TT----A-AC-TAT--TT--ATTGATAC-----------ACATGTG-------------GTTCT---CACCATCGGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCAAGTATGCGCGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAGTCAATAAGTCTACATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATCT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACCTTTTTACAGGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTAATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATACGAAATCGCTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTAATACATGTATGTCACACT--------T--------T----CATTCA--GA--ACTAG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCATTAATTTAATGGTATTAACATCATGATATTTACATACTAAA---TCGTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATGA-TTTTTTT-ATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTCTTTTTTTTATCTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATAATACATA----TC----------TTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGTATGTGACATA------ACGTGATTAACACCACGGGTGT----GTTGCTGCGTGTCATATAATTAGCAGTATAGCACAGTGGGTGTAGTTTCAAACAAGTTTAATATAGTTTGTCACTTTAAATAATATATTAACATAAAGCATACT------ATCAGT-AAAAGAATAAT---------------------TTGAGAAACCCACTG-AAAAAA-GTTCATTGCAAGTATATTTATATACATAATGATAACGAAAATAATTATAAAAACTTAAAATATCAGAATA-TCTCTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTAT----CATGTCGAATTGTATCGCACGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCATGCAGTGCA------TATTATTGATTATAAAGCTTA-TTTTAGATTGAACATTAAC-AAAACCAGTCATATATCCACATGTTGTTAAGTCACTGCTTACACTGAGCAGATTTATGGATTATTATAAGGCCAACGAGGTATCAACAGTATGGAATTATTAATTAAATTTAATTATTAATAACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATATGTAAATTTTGTGGACAA-ACTT-TATTGCTTTCCTGTAACAAACGGCTTACGGTATATCAAAGAAGATACTGACGCAAACACATGTCGGTCTGGATAACAGGAGCCGGTATAACGTGTGATATTCTTTGATCACCCAGACCACTGATCACATATCAAAACATAGACACTTCTGTTAAACATGCCTACTATGGATACTACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGACCAAATTGGCCGCTTAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTCATCAATTTTCACCCAGATTAGCGAAGTATTTTTGTATATTGG
gi|2 : AGGGAATGCACTGGAGAA-------TGCATAAGCTCCGAGCTTACTTCACAATCAAGCTAA-ATTAAA---TTAAT-G-TTAAATAAAT-GAA-----TGTTTGTATGCCAAAT--TAACACGACAGACC-GAAATAACACATTAGACACAAGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAATAGTAAATATATTATTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCATGTAAGTACGTAACAATTAAGCCATCATAAAAGCTGTGAAAGGCGCAACAAGTAAGAAATGACAAC
gi|3 : ccatgtagtttatataaatgttttattgtaaaacgcatgataaaacttattttggtcaacactttatcaattataacataaatatcaatatttagctgatcaaacaaaacatagatatgcggaaaattatatgattatgattctgtttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttgaactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttgtgaacaaatctacgtaaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattttactcgtgtacatctcattaaaataatagtaataaattaattgtattctaaaatataaagtgggtcagtagtatagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctctacccgacctctcgaaacacaattcagtaccagacctaataAGGGAATGCACTGGAGAAAGAC--ATGCATAAGCTCCGAGCTTACTTGACAATCAAGCTAA-ATTAAA---TTAAT-G-TAAAATAAAT-GTA-----TGT----ATGCCAAAT--TAACAAGACAGACC-GAAATAACACATTAGACATAGGAAATAAAAACTAGCAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAATAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAAAAGTAAATATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCATGTAAGCACGTAACAATTAAGCCACTATAAAAGTTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAACaataataataaagaagataaaatactcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttataaaaaatctgcatatttaagtattgattgtgactatatatttcttatccaatcacatgccgcaggttaaataaagatttattcatcgggcacaaattataatcaaaatgaaaattacacaccggcagggttcttcgtgatcaatggaccgataaatcaccaattaactatttattgacacacatgtggttctcaccatgggtatctgttttgatgattgcaatgcaactctgccttcataatagtaattaaattgttttattaattgtgaacgactgaccagatgcacgtacgcacgtatccaatataaaagctgtgacaaatcaataagtcaatatgtatattataataatagctccaatgataataatatttaaaaaaataaaacaaataatgaaagtaaaaaataatacaaataaaatactacatttttacaaggaattatttagagacatgtctttaatttttattagttttaaaattgtaggattgttttattttgtaaattaacaattctgatctgttttttataagaaatcactatggcagctgtggtaaaatgacagccctgaatatacatcccttaatacgtgtatgtcacactttctaccagtcattcagaactggcgtggggttttcggttcgttaatttaatgatattaacatcatgatatttacatacttaagcgttctgaaacttcgaataaccaatatcttaaatgatttttttatttgttgttaattggctagcagtttttcttttttatcctttcttttcaatcacataatgttggctcaattaagattcatccatctggcacgaattacaatcaaaatgaaatcatacatatcttccgtggtcaatagaccgataagtcaccgctttagcatatataacttaattgacacggctctcactggcatgtgacataacgtaattaacaccacgggtgtgttgctgcatgtcatataattagcggtatagcacagtgggtttagtttcaaacaagtttattatagtttgtcattttaaataatgtattaacataaagcatactatcagtaaaagaataatttgagaaacccactgaaaaaaagttcattgcaagtatatttatatacataatgataacgaaaataattataaaacttaaaatatcagaatatcttttctaagtttagtgaagctacatttggacccaaatcgagaaaaacactacaagattattatttttcaaaaatcatttattata
gi|8 : atttgccgtgttatttcgatataaattagttatagaacatataaaacatgtactttatttcgatttaagcgtatactgctccaaatacaaaaatatcaaagcatgcgtgaatcaaacaaaacatagatatgtgtataattatatgattatgattctatttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttggactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttataaacaaatctacgtaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattatactcgtgcacatctcattaaaaaaataataataaattaattgtattctaaaatataaaatgggtcagtagtacagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctttacccgacctctcaaaacacaattcagtaccagatctaataAGCGGATGCA----AGAGTGGT--TCATATAAGCTCTGAGTTTTCATGACAATCCAGCTAA-AATAAA---TTAGTAG-TAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaattataaaaaatctgcatatttaagtattgattttgactatatatttcttatccaatcacatgccgcgggttaaataaagattcattcatcttgcacaaattataatcaaaatgaaaattacacaccggcagggttcgttgtgatcaatggaccgataaatcaccaataaactatttattgacacacatgtggttctcatcatgcgtatctgttttgatgattgccatgcaactctgctttcattatagtaatttaattgttatattaattgtgaacgactgaccagatgcacgtacgcacgtatccaatataaaagctgtcaacaaatcaataagtcaatatgtatattataataatagctccaatgataataatatttcaaaaaaaaataaaacaaataatgaaagtaaaaaataatacaaataaaatactacattttacaaggaattatttaaatacatgtctttaatttttattagttttaaaattgtaggattgttttattttgtaaattaacaattctgatctgtttttatacgaaatcgctatagcagctgtggtaaaatgacagccctgaatacacatccctttatacgtgtatgtcacactttctaccattcactcagagctggcgtggggttttcggttcgttaatttaatgatattaacatcatgatatttacatactaaagcgttctgatacttcgaataaccaatatcttaaataatttttttatttgttgttaattggctggcagtttttctttcttatttttttcttttcaatcacataatgttggctcaattaaaattcatccatctggcacgaattacaatcaaaatgaaatcatacatatcttccgtggtcaatagaccgataagtcaccgctttagcatataacctaattgacacggctctcactggcatgtgacataacgtaattaacacca
gi|7 : gttaaaactacattaactgtcgatgtaaggaattgatcattttaaaactgcagaaggagtgatagtgtactggatagagtgttggcctctaatgccagaggttgcaatccccagttcgacccgatatctctcataaaacaacactcagttctagttctaccagctggaAGGAAACGGACTTGAAAGCATT--ACAAATAACCTTTGTGCTTTCTTCACAACTGAGCTAAGAGT-AA---TTAGT-A-TAAACTAAATCTTA-----CTT----GT-CCAAATTATAAAAGAACAAGTTAAAAACAACATGCTAAActaaaactgagttg
gi|9 : ctttttaaaatcatggttgtcaactaactaaataaatctaatacaagtttgttcatttttaaagaaggcagagcgatagtgtagtggatagagtgctcgccagtcatgtcagaggttgcgggtttgattctcagcttgacctgatacttcttaaaaaaacaacactcagttatggttctacccGAGAGCGGTCAAT--ATAAGCTCTGAGCTGTCTTTGCAATCAAGCTAA-AATAAA---TTAGT-A-TACACTAAAata
gi|16 : tgatagagtgttggccactcacgccaggttgcaggttcaatccccagtttgaactgatgcctctaaaagaataacactcagtgatagttctatccaggaagctgacttGCAAAAGCTCAGAGCTTATTTTGTAATGATGCTAA-AATAAATTGTTAAT-GATAAAA-AAA--GTAACAGTCGT----ATGACACAT--TTACATAACAGacaacaactgtgaattaaacataccattgacaggtagcatattttattagacac
gi|17 : CATAAATTCAGAGTTTACTTCACAATCAA-TTAA-CATAAA---TTAtaacaaaacaaaaaaata
gi|2 : ctagttctaccaaggaagcagacccaatagagatttttTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTGTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCAGGTTAAATAAAGATTTATTCATCGGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACA-CC-GGCAGGGTTCTT-CGTGATCAATGGACCGATAAATCACCAA-TT----A-AC-TAT--TT--ATTGACAC-----------ACATGTG-------------GTTCT---CACCATGGGTATCTGTTTTGATGATTGCAATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTTTATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCACGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACATTTTTACAAGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATAAGAAATCACTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TATACATCCCTTAATACGTGTATGTCACACT--------TTCTACCAGT----CATTCA--GA--ACTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAATTTAATGATATTAACATCATGATATTTACATACTTAA---GCGTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATGA-TTTTTTT-ATTTGTTGTTAATTGGCTAGCAGTTTTTC--TTTTTTATCCTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----TC----------TTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGCATATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACATA------ACGTAATTAACACCACGGGTGT----GTTGCTGCATGTCATATAATTAGCGGTATAGCACAGTGGGTTTAGTTTCAAACAAGTTTATTATAGTTTGTCATTTTAAATAATGTATTAACATAAAGCATACT------ATCAGT-AAAAGAATAAT---------------------TTGAGAAACCCACTGAAAAAAA-GTTCATTGCAAGTATATTTATATACATAATGATAACGAAAATAATTAT-AAAACTTAAAATATCAGAATA-TCTTTTCTAAGTTTAGTGAAGCTACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTAT----gatacactaagaca
gi|3 : ccatgtagtttatataaatgttttattgtaaaacgcatgataaaacttattttggtcaacactttatcaattataacataaatatcaatatttagctgatcaaacaaaacatagatatgcggaaaattatatgattatgattctgtttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttgaactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttgtgaacaaatctacgtaaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattttactcgtgtacatctcattaaaataatagtaataaattaattgtattctaaaatataaagtgggtcagtagtatagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctctacccgacctctcgaaacacaattcagtaccagacctaataagggaatgcactggagaatgcataagctccgagcttacttcacaatcaagctaaattaaattaatgttaaataaatgaatgtttgtatgccaaattaacacgacagaccgaaataacacattagacacaagaaataaaaactagtaaacgtaaatttctaggtgacctttttgaggttgtgattttatattgactaaagaacagcttttgatcatgaggaaggtttaaataaacaaaaaagaacatgtattcactgcctataaaatagtaaatatattattttcccgctttcctacaaaatcgatacgcctgatcacgtgcatgtaagtacgtaacaattaagccatcataaaagctgtgaaaggcgcaacaagtaagaaatgacaacaataataataaagaagataaaatactcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTTGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACA-CC-GGCAGGGTTCGT-TGTGATCAATGGACCGATAAATCACCAA-TA----A-AC-TAT--TT--ATTGACAC-----------ACATGTG-------------GTTCT---CATCATGCGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCTTTCATTATAGTAATTTAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCACGTATCCAATATAAAAGCTGTCAACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTTCAAAAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACA-TTTTACAAGGAATTATTTAAATACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTG-TTTTTATACGAAATCGCTATAGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTTATACGTGTATGTCACACTTTCTACCAT--------T----CACTCA--GA--GCTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAATTTAATGATATTAACATCATGATATTTACATACTAAA---GCGTTCTGATACTTCGAATAACCAATATCTTAAATAA-TTTTTTT-ATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTCTTTCTTAT-TTTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAAATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----TC----------TTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACCTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACATA------ACGTAATTAACACCAa
gi|4 : atttgccgtgttatttcgatataaattagttatagaacatataaaacatgtactttatttcgatttaagcgtatactgctccaaatacaaaaatatcaaagcatgcgtgaatcaaacaaaacatagatatgtgtataattatatgattatgattctatttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttggactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttataaacaaatctacgtaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattatactcgtgcacatctcattaaaaaaataataataaattaattgtattctaaaatataaaatgggtcagtagtacagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctttacccgacctctcaaaacacaattcagtaccagatctaataagggaatgcactggagaaagacatgcataagctccgagcttacttgacaatcaagctaaattaaattaatgtaaaataaatgtatgtatgccaaattaacaagacagaccgaaataacacattagacataggaaataaaaactagcaaacgtaaatttctaggtgacctttttgaggttgtgattttatattgactaaagaacagcttttgatcatgaggaaggtttaaataaacaataaagaacatgtattcactgcctataaaaaagtaaatatattgttttcccgctttcctacaaaatcgatacgcctgatcacgtgcatgtaagcacgtaacaattaagccactataaaagttgtgaaaggggcaacaagtaagaaatgacaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaTACATATTTTCTTTTCAATCATATACTGCGGGTTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACTTATTACAATCAAA-TGAAA-TCATACATATCAGCAGGGTTCTTCCGTGGTC------C-GATAAGTCACCACTTT----A-GCATATAATTTAATTGACACGGCTCTTACTGGCATGTGACATACTAGTAACGTCATTAACACCATGGGTGTCTGTGTTGTTGCGTGTCATATAA
gi|5 : aaataaaaccactaaatcgtaagtttaatgcctatgcatgcacgtttatttattgttgttttaaattcatttagcttacatcaaaattcaacatccagaatgctagttgtggtaaatttacagccctgaaaatacacattccttaatatgcgtatgtcacactttctaccattcactcattactggttatattttatgacgtggggtttttgtttcgttaatgaacgaaacgaaaatcacaagtaataaaaaatatattatattaacatcatgggtttacatgcaaaagtattgttctgaaacctcgaataaccaatatcttaaatgaatttgtttgatttgttgttaattggttggcagtttttctTATCTTTTTCTT-TTCAATCATATACTGAGGTTTTAATTAAGATTCGTCCCTCTGGCACTAATTACAATCAAAATGAAA-----GCA-TC-CGCAGGGTTCTTCCGTGGGCAAAAGACCGGTAAGTCACCAC-TTTGGCATAT-AAT--TTA-ATTGAAACGGATCTCACTGGCATGTGACATAACGTA---ATTAA---CACCACGGGTGTCTGTATTGCTGCGTGTCATATAAgtagcggtatagcacagcgggtatattttcaaacaaatttaatatagttcgtcatttttaaattaacataaatcatactgcatgtatcagtaaaaaaataatgaagccacatttgcaaccaatttgagaagcacactgaaaagttcatttaaggtacatatatatacataatgataacaaaaatatttataaaatcttatagtatctgaataattttttttaagtttagtgaaaccacatttgaaccaaatcgagtaaaacactacaagattttttttcaaaaatcatttatcatatgtcaaattctatccgtggattataataaatttttcatcacccatacaatgcatattatagattataaagctgatttttgtttgaacattaacaaaaccagtgacatatccacatgttgttaagtcgctgcttacactaatcaaattaatggattactgttaagccaaacatgtataaatggtatggaattattaataacaaatacaatatatctagtgatatctatgttgttgatgtatctgtaaattttatggacaacatttttttgctttattgttacaaacggctaacggtttatcaaagaagtcactgacccacacacatttctgtctggataatacaagtcggctgaacttggggtattctttgatcacacagaccactgatcacatatcaaaatatagactcttccattaaacttccctactatctgtaatgatttattcaaaattgacaacctttcgtccagcgggtgacaaaatatgtagacaaacaatcggattatgaatccaattaccatgactaaatcctgtcactgcattttatttattgctccattggaacagcttaaattaaagaaaatgaattaatttaagagttgagatgttgcgattggttatgggccagaaaccgaattgagcggactgaaagttgagtcaacttgaacgaacaaagttaacgttgaga
gi|4 : tactttctaccattcactcagtaatggttatattttataacgtggggttttcgtttcgttaatttaatgatattgatatcatgggtttacatactaaagtattgttctgaaacctcgaataaccaatatcttaaatgaatttgtttgatttgttgttaattgactggcagtttttcttaATGCTAGTTGTGGTAAATTTACAGCCCTGAAAATACACATTCCTTAATATGCGTATGTCACACT--------T--------TCTACCATTCACTCATTACTGGTTATATTTTATGACGTGGGGTTTTTGTTTCGTTAATgtagcggtatagcacagtgggtatattttaaacaagtttaatatagtttgtattttagttaatatattaacatgaatcatactatcagtaaaaaaaataatttgagaaacactgaaaaaaggttaatttcaggtacatatatatacataatgataacgaacatatttattaaatcttataatatcaaactatcttttttaagtttagtgaagccacatttagacccaaagctagaaaaacactacaaaattattatttttcaaaaatcatttattattttatatgtcaaatcccattgcgcaaattattataaatttttcatcacccgtgcagtgcataattttattattgattataaagctgatttttaagttacaataacaaaaaccagtgacaaatccacatattgttaggtcactgcttatactgatcaaatgaatggattactgttaatccaaagatgtataagcggtattgaattgttaataacaattacaatatatttagtttatgttgatgatgtatctgtaaattttgtggacaacttgttttgctttcttgtaataaacggcttatggtatttcaaagaagttactgacgcaaacacat
gi|5 : aaataaaaccactaaatcgtaagtttaatgcctatgcatgcacgtttatttattgttgttttaaattcatttagcttacatcaaaattcaacatccagaTAA-------------CGTGGGGTTTTCGTTTCGTTAATTTAATGATATTGATATCATGG-GTTTACATACTAAAGTATTGTTCTGAAACCTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTGTTTGATTTGTTGTTAATTGACTGGCAGTTTTTCTTAT----ATCTTTTTCTTTTCAATCATATACTGAGGTTTTAATTAAGATTCGTCCCTCTGGCACTAATTACAATCAAAATGAAAGCATCCGCAGGGTTC----------TTCCGTGGGCAAAAGACCGGTAAGTCACCACTTTGGC--ATATAATTTAATTGAAACGGATCTCACTGGCATGTGACATA------ACGTAATTAACACCACGGGTGTCTGTATTGCTGCGTGTCATATAAGTAGCGGTATAGCACAGTGGGTATA-TTTTAAACAAGTTTAATATAGTTTGT-ATTTTAGTTAATATATTAACATGAATCATACT------ATCAGTAAAAAAAATAAT---------------------TTGAGAAA--CACTG-AAAAAAGGTTAATTTCAGGTACATATATATACATAATGATAACGAACATATTTATTAAATCTTATAATATCAAACTA-TCTTTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTAGACCCAAAGCTAGAAAAACACTACAAAATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATTTTATATGTCAAATCCCATTGCGCAAATTATTATAAATTTTTCATCACCCGTGCAGTGCATAATTTTATTATTGATTATAAAGCTGATTTTTAAGTT--ACAATAACAAAAACCAGTGACAAATCCACATATTGTTAGGTCACTGCTTATACTGATCAAATGAATGGATTACTGTTAATCCAAAGATGTATAAGCGGTATTGAATTGTTAA-TAA---CAATT-------ACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATCTGTAAATTTTGTGGAC-A-ACTTGTTTTGCTTTCTTGTAATAAACGGCTTATGGTATTTCAAAGAAGTTACTGACGCAAACACATgaacgaaacgaaaatcacaagtaataaaaaatatattatattaacatcatgggtttacatgcaaaagtattgttctgaaacctcgaataaccaatatcttaaatgaatttgtttgatttgttgttaattggttggcagtttttcttacatattttcttttcaatcatatactgcgggttcaattaagattcatccatctggcacttattacaatcaaatgaaatcatacatatcagcagggttcttccgtggtccgataagtcaccactttagcatataatttaattgacacggctcttactggcatgtgacatactagtaacgtcattaacaccatgggtgtctgtgttgttgcgtgtcatataagtagcggtatagcacagcgggtatattttcaaacaaatttaatatagttcgtcatttttaaattaacataaatcatactgcatgtatcagtaaaaaaataatgaagccacatttgcaaccaatttgagaagcacactgaaaagttcatttaaggtacatatatatacataatgataacaaaaatatttataaaatcttatagtatctgaataattttttttaagtttagtgaaaccacatttgaaccaaatcgagtaaaacactacaagattttttttcaaaaatcatttatcatatgtcaaattctatccgtggattataataaatttttcatcacccatacaatgcatattatagattataaagctgatttttgtttgaacattaacaaaaccagtgacatatccacatgttgttaagtcgctgcttacactaatcaaattaatggattactgttaagccaaacatgtataaatggtatggaattattaataacaaatacaatatatctagtgatatctatgttgttgatgtatctgtaaattttatggacaacatttttttgctttattgttacaaacggctaacggtttatcaaagaagtcactgacccacacacatttctgtctggataatacaagtcggctgaacttggggtattctttgatcacacagaccactgatcacatatcaaaatatagactcttccattaaacttccctactatctgtaatgatttattcaaaattgacaacctttcgtccagcgggtgacaaaatatgtagacaaacaatcggattatgaatccaattaccatgactaaatcctgtcactgcattttatttattgctccattggaacagcttaaattaaagaaaatgaattaatttaagagttgagatgttgcgattggttatgggccagaaaccgaattgagcggactgaaagttgagtcaacttgaacgaacaaagttaacgttgaga
gi|4 : tactttctaccattcactcagtaatggttatattttaTATTAACATCATGG-GTTTACATGCAAAAGTATTGTTCTGAAACCTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTGTTTGATTTGTTGTTAATTGGTTGGCAGTTTTTCTTAC----ATATTTT-CTTTTCAATCATATACTGCGGGTTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACTTATTACAATCAAA-TGAAATCATACATA----TCAGCAGGGTTCTTCCGTGGTC-------CGATAAGTCACCACTTTAGC--ATATAATTTAATTGACACGGCTCTTACTGGCATGTGACATACTAGTAACGTCATTAACACCATGGGTGTCTGTGTTGTTGCGTGTCATATAAGTAGCGGTATAGCACAGCGGGTATATTTTCAAACAAATTTAATATAGTTCGTCATTTT---TAA---ATTAACATAAATCATACTGCATGTATCAGT-AAAAAAATAATGAAGCCACATTTGCAACCAATTTGAGAAGCACACTG-AAAA---GTTCATTTAAGGTACATATATATACATAATGATAACAAAAATATTTATAAAATCTTATAGTATCTGAATAATTTTTTTTAAGTTTAGTGAAACCACATTTGAACC-AAATCGAGTAAAACACTACAAGATT--T-TTTTTCAAAAATCATTTATCAT-----ATGTCAAATTCTATC-CGTGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCATACAATGCA------TATTATAGATTATAAAGCTGA-TTTTTGTTTGAACATTAAC-AAAACCAGTGACATATCCACATGTTGTTAAGTCGCTGCTTACACTAATCAAATTAATGGATTACTGTTAAGCCAAACATGTATAAATGGTATGGAATTATTAATAACA---AAT--------ACAATATATCTAGTGATATCTATGTTGTTGATGTATCTGTAAATTTTATGGACAACATTT-TTTTGCTTTATTGTTACAAACGGCTAACGGTTTATCAAAGAAGTCACTGACCCACACACATTTCTGTCTGGATAATACAAGTCGGCTGAACTTGGGGTATTCTTTGATCACACAGACCACTGATCACATATCAAAATATAGACTCTTCCATTAAACTTCCCTACTAT
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): AACACATTCCCTATTATGAGTAATGGTTTATCCAAAATTTACAACCTTTCGCCAAGTGGGTGACACAATATGTAGACAAACAATCAGATTATGAATTCAATTACCTTGACTAAAATCCCATGAATACATTTTATTAATTGCTCCATTTTTAACAGCTTCAATTATAAAGTCAATATGGAATTATTTTAAGAGTTGAGAGGTTTGCGATTGCCATTGGTAACCAAACTGAGCAACTGAACAATGAGTGAATGCTGAAGGAACGAAGCGAACACTGAGAGGAGTATAAAATAAAGATAGTGAGCGAATACTTGCGTTTGTGAGTGTATTAGTTTAACCGCACGCAAACGGAGCGTAACTGGAGCGCAATTATGGGGAACTTGAGCAGTTTAGGTTCTGTAATGGTGTGTAAGTGAT
Unaligned ( gi|10 ): GTTTAAACTATTAAACTACAAAAAAAATCACTCAGTACTGGTTCAACTTCTACCCAGGAAGCAGACTCAAGAGTTGTTCATATATGCTTTGAGTATCCTTCGCAATCAAGATAAAATTAACCAATTAACCAGAACCAATTTAAATGTAGTTTGTTTT
Unaligned ( gi|11 ): AGTGAATTGTGTTAGCCGCTTACGTCAGAGGTCACATGTTTAATCCCACTGATATCCACTCCCCTTCATAAAAAAAAATGCTCGGTTCCACCCTGGAAACGACATGAGCAGTTCATTTAACCTTCACAAAGCTTTACCTTCAGGACTGCGTTCA
Unaligned ( gi|12 ): AAACAATGTACACCATTTTTAGACAATTTTAGAGTTATTTTATAGTAGTGCAGAGGATAGATTGTTTGTCATTCACGCAAGAGGTTGCAGGTTTGATCGCCAGCTCGACCTAATGTGTCTTTAAAAGCAACACTTATAACTGGTTCA
Unaligned ( gi|13 ): TCAATGTTGGCAGGTGGCACAGTGGATAGAGTGTTGGCTGATCACTCCAGATGTTTGCTCCCATGCTCCAGCGAATGACCTCTTAATAACAACACTTAGTATTCATTCTGCTCATGAAACAGACTCCAGAGCCATCTA
Unaligned ( gi|14 ): TTTGCCTTGCTATTTCGATATAAATTAGTTATAGAACATACAGAACATATATTTCAATTGGATTTAAGCGTATGCAGCTCTAAACACAAAAAATCAATGCATTTGTGAATCAAACAAAACATAGATA
Unaligned ( gi|15 ): TATTGTTTAAAACTTTTTATCAAAGGTCGAGAGTTGTTGATACATAGATAGTGCAATGGATAGAGTGTTGGTCACTCACATAAGATGTAACAGGTTCGATCCGACATTTAGT
Alignments
lowQualScore : 22222222222222222
lowQualScore : 111 111 1111 111111 111111111111 11 4 88888888888888888 11 2 333 11 7777777777777777777777 111111 4444444444444 666666666666666666666 222222 22222 1 222 1 2 22222 5555555555 11 222222 2222 3 3333 222222 1 888888888888888888888 333 11 1 222 1 22222 555555 1 2 555555555555555555 55555 22 2
lowQualScore : 7 77 222 4 4444 22 2 1 0 777 000 0000 666666 6 999999999999 11 1 8 8 2 0 1 1 11 1 1 1 1 6 1 6 0 6 6 1 00000000000000000 22 1 6 1 1 22 1 1 1 3 777 7 1 7 1 33 2 5555555555555555555555 444444 4444444444444 1 111111111111111111111 333333 00000 0 0 222 0 1 0 8 11111 8 1 99 1 0 2222222222 1 11 333333 3333 2 2 1 0 2 2 7777 77 3 888888 0 555555555555555555555 222 33 0 3 4 4 111 4 4 0 2 3 3 44444 0 0 6 1 0 888888 1 7 4 1 6 1 3 1 0 0 1 1 1 0 1 0 555555555555555555 0 11111 0 1 22 3 1 1 1 1 1 0 1 1 3 3 2 66 3 2 3 4 4 2
lowQualScore : . .. ... . .... .. . . . ... ... .... ...... . ............ .. . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . ................. .. . . . . .. . . . . ... . . . . .. . ...................... ...... ............. . ..................... ...... ..... . . ... . . . . ..... . . .. . . .......... . .. ...... .... . . . . . . .... .. . ...... . ..................... ... .. . . . . ... . . . . . . ..... . . . . . ...... . . . . . . . . . . . . . . . . .................. . ..... . . .. . . . . . . . . . . . . .. . . . . . .
lowQualScore : 1 99 111 3 6666 33 7 0 7 888 222 6666 444444 7 333333333333 00 0 0 0 0 7 0 0 33 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 00000000000000000 00 0 0 0 0 00 0 0 0 3 333 3 0 3 0 88 0 8888888888888888888888 888888 0000000000000 0 000000000000000000000 000000 00000 6 8 666 6 0 0 0 44444 0 0 66 0 8 0000000000 0 00 000000 5555 5 0 2 0 0 5 5555 55 0 888888 0 000000000000000000000 555 22 0 0 0 0 000 0 0 0 5 2 2 55555 7 7 7 0 7 777777 0 3 0 0 7 0 7 0 7 7 0 0 0 7 0 7 777777777777777777 7 33333 7 0 33 3 0 0 0 0 0 7 0 0 0 0 5 55 0 5 0 0 0 5
consensus : AGGGAATGC--A--CTNGAGAGCGGTACGCATAAGCTCCGAGCTTNCTTCGCAATCAAGCTAAAATAAA---TTAGT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----CGT----ATGCCAAAT--TAACANGACAG-ACC-GAAATAACACGTTAGACACAGGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAATAGTAAATATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCACGTAAGCACGTAACAATTAAGCCATTATAAAAGCTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCTTC-GTGATCAATGGACCGATAAATCACCAATTAACTATTTATTGACAC-----------------ACATGTGGTTCTCACCATGGGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCGCGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACATTTTTACAAGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATACGAAATCGCTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTAATACGTGTATGTCACACT--------T--------T----CATTCA--GA--ACTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTAAAGTATCGTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTTTTTGATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTC-TTTCTTTATCTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGGTGTCTGTGTTGCTGCGTGTCATATAANTAGCGGTATAGCACAGTGGGTATAGTTTCAAACAAGTTTAATATAGTTTGTCATTTTAAA-TAATATATTAACATAAANCATAC------TATCAGT-AAAAGAATAAT---------------------TTGAGAAACC-CACTG-AAAAAA-GTTCATTNCAGGTACATNTATATACATAATGATAACGAAAATANTTA-TAAAANCTTANAATATCAGAAT-ATCTTTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTAT----TATGTCGAATTCTATCGCGCGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCGTGCAGTGCA------TATTATTGATTATAAAGCTGATTTTTAGNTTGAACATTAAC-AAAACCAGTGACATATCCACATGTTGTTAAGTCGCTGCTTACACTGATCAAATTAATGGATTACTGTTAAGCCAAAGATGTATAAACGGTATGGAATTATTAAT--AA--CAATT-------ACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATCTGTAAATTTTGTGGACAA-ACTT-TTTTGCTTTCTTGTAACAAACGGCTTACGGTATATCAAAGAAGTTACTGACGCAAACACATNTCNGTCTGGATAACACGAGCCGGCNNAACNTGNGGTATTCTTTGATCACNCAGACCACTGATCACATATCAAAACATAGACNCTTCCGTTAAACNTNCCTACTAT
Reference ( family-1016 ) : AGGGAATGC--A--CTGGAGAGCGGTACGCATAAGCTCCGAGCTTNCTTCGCAATCAAGCTAAAATAAA---TTAGT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----CGT----ATGCCAAAT--TAACANGACAG-ACC-GAAATAACACGTTAGACACAGGAAATAAAAACTAGCAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAANAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAANAGTAAATATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCATGTAAGCACGTAACAATTAAGCCACCATAAAAGCTGTGAAAGGNGCAACAAGTAAGAAATGACAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTNTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTNAATNAAGATTCATCCATCTGGCACNAATTACAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCTTCCGTGGTCAATGGACCGATAAGTCACCANTTAACTATTTATTGACACGGTCTCACTGGCATGTGACATACGGTTNTCACCATGGGTGTCTGTNTTGNTGNNTGCCATGCAACTCTGCCTTCATNATAGTAATTNAATTGTTNTATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCACGTATCCAATATAAAAGCTGTCGACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTTCAAAAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACATTTTTACAAGGAATTATTTAGANACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATANGAAATCGCTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTAATACGCGTATGTCACACT--------T--------T----CATTCA--GA--ACTGG-------------CGTGGGGTTTTCGNTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGGTGTTTACATACTAAAGTANCGTTCTGAAACCTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTNTTTGATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTC-TTNCTTTATCTTTT-CTTTTCAATCACATANTGCGGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACNAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGGTGTCTGTGTTGCTGCGTGTCATATAAGTAGCGGTATAGCACAGCGGGTATA-TTTCAAACAAGTTTAATATAGTTCGTCATTTT-AG-TAATGTATTAACATAAATCATAC------TATCAGT-AAAAAAATAAT---------------------TTGAGAAA-C-CACTG-AAAAAA-GTTCATTTCAGGTACATATATATACATAATGATAACGAAAATATTTA-T-AAATCTTATAATATCAGAAT-ATCTTTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTAT----TATGTCAAATCCCATCGCGCGGATTATNATAAATTTTTCATCACCCGTGCAGTGCATAATTTTATTATNGATTATAAAGCTGATTTTTNGNTTGAACANTAACAAAAACCAGTGACANATCCACATGTTGTTAGGTCGCTGCTTACACTGATCAAATNAATGGATTACTGTTAANCCAAANATGTATAAGCGGTATNGAATTGTTAATNANA--CAATT-------ACAATATATCTAGTGATATCTATGTTGNTGATGTATCTGTAAATTTTGTGGACAACACTTGTTTTGCTTTNTTGTNACAAACGGCTNACGGTNTNTCAAAGAAGTCACTGACNCANACACATTTCTGTCTGGATAATACAAGTCGGCTGAACTTGGGGTATTCTTTGATCACACAGACCACTGATCACATATCAAAATATAGACTCTTCCATTAAACTTCCCTACTAT
gi|1 : AGGGAATGC--A---TGGAGAACGATATGCATAAGCTCCGAGCTTACTTCACAATCAAGCTAAATTAAA---TTAAT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----TGT----ATGCCAAAT--TAACAGGACAG-ACT-GAAATAACACATTAGACACAGGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGTCTATAAAATAGTAAAAATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCACGTAAGCACATAACAATTAAGCCATTATAAAAGCTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAAC
gi|1 : TTATAAAAAATCTGCATATTTTAGTATTGACTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACAATGGCAGGGTTCTTC-GTGATCAATGGACAGATAAATCACCAATTAACTATTTATTGATAC-----------------ACATGTGGTTCTCACCATCGGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCAAGTATGCGCGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAGTCAATAAGTCTACATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATCT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACCTTTTTACAGGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTAATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATACGAAATCGCTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTAATACATGTATGTCACACT--------T--------T----CATTCA--GA--ACTAG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCATTAAT--------------T------TAATGG------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTAA---ATCGTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATG-ATTTTTTT-ATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTCTTTTTTTTATCTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATAATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGTATGTGACA------TAACGTGATTAACACCACGGG----TGTGTTGCTGCGTGTCATATAATTAGCAGTATAGCACAGTGGGTGTAGTTTCAAACAAGTTTAATATAGTTTGTCACTTTAAA-TAATATATTAACATAAAGCATAC------TATCAGT-AAAAGAATAAT---------------------TTGAGAAACC-CACTG-AAAAAA-GTTCATTGCAAGTATATTTATATACATAATGATAACGAAAATAATTA-TAAAAACTTAAAATATCAGAAT-ATCTCTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTAT----CATGTCGAATTGTATCGCACGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCATGCAGTGCA------TATTATTGATTATAAAGCTTA-TTTTAGATTGAACATTAAC-AAAACCAGTCATATATCCACATGTTGTTAAGTCACTGCTTACACTGAGCAGATTTATGGATTATTATAAGGCCAACGAGGTATCAACAGTATGGAATTATTAATTAAATTTAATTATTAATAACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATATGTAAATTTTGTGGACAA-ACTT-TATTGCTTTCCTGTAACAAACGGCTTACGGTATATCAAAGAAGATACTGACGCAAACACATGTCGGTCTGGATAACAGGAGCCGGTATAACGTGTGATATTCTTTGATCACCCAGACCACTGATCACATATCAAAACATAGACACTTCTGTTAAACATGCCTACTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttataaaaaatctgcatattttagtattgactttgactatatatttcttatccaatcacatgccgcgggttaaataaagattcattcatctggcacaaattataatcaaaatgaaaattacacaatggcagggttcttcgtgatcaatggacagataaatcaccaattaactatttattgatacacatgtggttctcaccatcggtatctgttttgatgattgccatgcaactctgccttcataatagtaattaaattgttatattaattgtgaacgactgaccagatgcaagtatgcgcgtatccaatataaaagctgtgacaagtcaataagtctacatgtatattataataatagctccaatgataataatatctaaaaaaataaaacaaataatgaaagtaaaaaataatacaaataaaatactacctttttacagggaattatttagagacatgtctttaattttaattagttttaaaattgtaggattgttttattttgtaaattaacaattctgatctgttttttatacgaaatcgctatggcagctgtggtaaaatgacagccctgaatacacatcccttaatacatgtatgtcacactttcattcagaactagcgtggggttttcggttcattaatttaatggtattaacatcatgatatttacatactaaatcgttctgaaacttcgaataaccaatatcttaaatgatttttttatttgttgttaattggctggcagtttttcttttttttatcttttcttttcaatcacataatgttggctcaattaagattcatccatctggcacgaattacaatcaaaatgaaataatacatatcttccgtggtcaatagaccgataagtcaccgctttagcatataacttaattgacacggctctcactggtatgtgacataacgtgattaacaccacgggtgtgttgctgcgtgtcatataattagcagtatagcacagtgggtgtagtttcaaacaagtttaatatagtttgtcactttaaataatatattaacataaagcatactatcagtaaaagaataatttgagaaacccactgaaaaaagttcattgcaagtatatttatatacataatgataacgaaaataattataaaaacttaaaatatcagaatatctcttttaagtttagtgaagccacatttggacccaaatcgagaaaaacactacaagattattatttttcaaaaatcatttattatcatgtcgaattgtatcgcacggattataataaatttttcatcacccatgcagtgcatattattgattataaagcttattttagattgaacattaacaaaaccagtcatatatccacatgttgttaagtcactgcttacactgagcagatttatggattattataaggccaacgaggtatcaacagtatggaattattaattaaatttaattattaataacaatatatttagtttatgttgatgatgtatatgtaaattttgtggacaaactttattgctttcctgtaacaaacggcttacggtatatcaaagaagatactgacgcaaacacatgtcggtctggataacaggagccggtataacgtgtgatattctttgatcacccagaccactgatcacatatcaaaacatagacacttctgttaaacatgcctactatggatactacagtcaaacctgtcttaagcagccagccaagggaaaggaccaaattggccgcttaagacaggtggctgcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaagtatttttgtatattgg
gi|10 : agggaatgcatggagaacgatatgcataagctccgagcttacttcacaatcaagctaaattaaattaatgtaaaataaatgtatgtatgccaaattaacaggacagactgaaataacacattagacacaggaaataaaaactagtaaacgtaaatttctaggtgacctttttgaggttgtgattttatattgactaaagaacagcttttgatcatgaggaaggtttaaataaacaaaaaagaacatgtattcactgtctataaaatagtaaaaatattgttttcccgctttcctacaaaatcgatacgcctgatcacgtgcacgtaagcacataacaattaagccattataaaagctgtgaaaggggcaacaagtaagaaatgacaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGAA-GC--AGACTCAAGAGTTGTTCATATATGCTTTGAGTATCCTTCGCAATCAAGATAAAATTAA---CCAAT---TAACCAGAACCAATTTAAATGT-A-----ggatactacagtcaaacctgtcttaagcagccagccaagggaaaggaccaaattggccgcttaagacaggtggctgcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaagtatttttgtatattgg
gi|16 : gtttaaactattaaactacaaaaaaaatcactcagtactggttcaacttctacccaGCAAAAGCTCAGAGCTTATTTTGTAATGATGCTAAAATAAATTGTTAAT-GATAA----AA-------AAA-GT-AACAGTCGT----ATGACACAT--TTACATAACAGTAAC-AAAACAAgtttgtttt
gi|17 : CATAAATTCAGAGTTTACTTCACAATCAA-TTAACATAAA---TTAGaaaaata
gi|2 : ctagttctaccaaggaagcagacccaatagagatttttAGGGAATGC--A--CTGGAGA-----ATGCATAAGCTCCGAGCTTACTTCACAATCAAGCTAAATTAAA---TTAAT-G-TTA----AA------TAAATGA-A-----TGTTTGTATGCCAAAT--TAACACGACAG-ACC-GAAATAACACATTAGACACAAGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAATAGTAAATATATTATTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCATGTAAGTACGTAACAATTAAGCCATCATAAAAGCTGTGAAAGGCGCAACAAGTAAGAAATGACAACatacactaagaca
gi|2 : ccatgtagtttatataaatgttttattgtaaaacgcatgataaaacttattttggtcaacactttatcaattataacataaatatcaatatttagctgatcaaacaaaacatagatatgcggaaaattatatgattatgattctgtttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttgaactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttgtgaacaaatctacgtaaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattttactcgtgtacatctcattaaaataatagtaataaattaattgtattctaaaatataaagtgggtcagtagtatagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctctacccgacctctcgaaacacaattcagtaccagacctaataTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTGTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCAGGTTAAATAAAGATTTATTCATCGGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCTTC-GTGATCAATGGACCGATAAATCACCAATTAACTATTTATTGACAC-----------------ACATGTGGTTCTCACCATGGGTATCTGTTTTGATGATTGCAATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTTTATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCACGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACATTTTTACAAGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATAAGAAATCACTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TATACATCCCTTAATACGTGTATGTCACACT--------TTCTACCAGT----CATTCA--GA--ACTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTTAAG---CGTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATG-ATTTTTTT-ATTTGTTGTTAATTGGCTAGCAGTTTTTC-TTT-TTTATCCTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGCATATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGG----TGTGTTGCTGCATGTCATATAATTAGCGGTATAGCACAGTGGGTTTAGTTTCAAACAAGTTTATTATAGTTTGTCATTTTAAA-TAATGTATTAACATAAAGCATAC------TATCAGT-AAAAGAATAAT---------------------TTGAGAAACC-CACTGAAAAAAA-GTTCATTGCAAGTATATTTATATACATAATGATAACGAAAATAATTA-T-AAAACTTAAAATATCAGAAT-ATCTTTTCTAAGTTTAGTGAAGCTACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTAT----aataataataaagaagataaaatactcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttataaaaaatctgcatatttaagtattgattgtgactatatatttcttatccaatcacatgccgcaggttaaataaagatttattcatcgggcacaaattataatcaaaatgaaaattacacaccggcagggttcttcgtgatcaatggaccgataaatcaccaattaactatttattgacacacatgtggttctcaccatgggtatctgttttgatgattgcaatgcaactctgccttcataatagtaattaaattgttttattaattgtgaacgactgaccagatgcacgtacgcacgtatccaatataaaagctgtgacaaatcaataagtcaatatgtatattataataatagctccaatgataataatatttaaaaaaataaaacaaataatgaaagtaaaaaataatacaaataaaatactacatttttacaaggaattatttagagacatgtctttaatttttattagttttaaaattgtaggattgttttattttgtaaattaacaattctgatctgttttttataagaaatcactatggcagctgtggtaaaatgacagccctgaatatacatcccttaatacgtgtatgtcacactttctaccagtcattcagaactggcgtggggttttcggttcgttaatttaatgatattaacatcatgatatttacatacttaagcgttctgaaacttcgaataaccaatatcttaaatgatttttttatttgttgttaattggctagcagtttttcttttttatcctttcttttcaatcacataatgttggctcaattaagattcatccatctggcacgaattacaatcaaaatgaaatcatacatatcttccgtggtcaatagaccgataagtcaccgctttagcatatataacttaattgacacggctctcactggcatgtgacataacgtaattaacaccacgggtgtgttgctgcatgtcatataattagcggtatagcacagtgggtttagtttcaaacaagtttattatagtttgtcattttaaataatgtattaacataaagcatactatcagtaaaagaataatttgagaaacccactgaaaaaaagttcattgcaagtatatttatatacataatgataacgaaaataattataaaacttaaaatatcagaatatcttttctaagtttagtgaagctacatttggacccaaatcgagaaaaacactacaagattattatttttcaaaaatcatttattata
gi|3 : ccatgtagtttatataaatgttttattgtaaaacgcatgataaaacttattttggtcaacactttatcaattataacataaatatcaatatttagctgatcaaacaaaacatagatatgcggaaaattatatgattatgattctgtttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttgaactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttgtgaacaaatctacgtaaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattttactcgtgtacatctcattaaaataatagtaataaattaattgtattctaaaatataaagtgggtcagtagtatagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctctacccgacctctcgaaacacaattcagtaccagacctaataagggaatgcactggagaatgcataagctccgagcttacttcacaatcaagctaaattaaattaatgttaaataaatgaatgtttgtatgccaaattaacacgacagaccgaaataacacattagacacaagaaataaaaactagtaaacgtaaatttctaggtgacctttttgaggttgtgattttatattgactaaagaacagcttttgatcatgaggaaggtttaaataaacaaaaaagaacatgtattcactgcctataaaatagtaaatatattattttcccgctttcctacaaaatcgatacgcctgatcacgtgcatgtaagtacgtaacaattaagccatcataaaagctgtgaaaggcgcaacaagtaagaaatgacaacaataataataaagaagataaaatactcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGGAATGC--A--CTGGAGAAAGACATGCATAAGCTCCGAGCTTACTTGACAATCAAGCTAAATTAAA---TTAAT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----TGT----ATGCCAAAT--TAACAAGACAG-ACC-GAAATAACACATTAGACATAGGAAATAAAAACTAGCAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAATAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAAAAGTAAATATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCATGTAAGCACGTAACAATTAAGCCACTATAAAAGTTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAACa
gi|3 : atttgccgtgttatttcgatataaattagttatagaacatataaaacatgtactttatttcgatttaagcgtatactgctccaaatacaaaaatatcaaagcatgcgtgaatcaaacaaaacatagatatgtgtataattatatgattatgattctatttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttggactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttataaacaaatctacgtaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattatactcgtgcacatctcattaaaaaaataataataaattaattgtattctaaaatataaaatgggtcagtagtacagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctttacccgacctctcaaaacacaattcagtaccagatctaataTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTTGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCGTT-GTGATCAATGGACCGATAAATCACCAATAAACTATTTATTGACAC-----------------ACATGTGGTTCTCATCATGCGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCTTTCATTATAGTAATTTAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCACGTATCCAATATAAAAGCTGTCAACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTTCAAAAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACA-TTTTACAAGGAATTATTTAAATACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTG-TTTTTATACGAAATCGCTATAGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTTATACGTGTATGTCACACTTTCTACCAT--------T----CACTCA--GA--GCTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTAAAG---CGTTCTGATACTTCGAATAACCAATATCTTAAAT-AATTTTTTT-ATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTC-TTTCTTATTTTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAAATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACCTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaattataaaaaatctgcatatttaagtattgattttgactatatatttcttatccaatcacatgccgcgggttaaataaagattcattcatcttgcacaaattataatcaaaatgaaaattacacaccggcagggttcgttgtgatcaatggaccgataaatcaccaataaactatttattgacacacatgtggttctcatcatgcgtatctgttttgatgattgccatgcaactctgctttcattatagtaatttaattgttatattaattgtgaacgactgaccagatgcacgtacgcacgtatccaatataaaagctgtcaacaaatcaataagtcaatatgtatattataataatagctccaatgataataatatttcaaaaaaaaataaaacaaataatgaaagtaaaaaataatacaaataaaatactacattttacaaggaattatttaaatacatgtctttaatttttattagttttaaaattgtaggattgttttattttgtaaattaacaattctgatctgtttttatacgaaatcgctatagcagctgtggtaaaatgacagccctgaatacacatccctttatacgtgtatgtcacactttctaccattcactcagagctggcgtggggttttcggttcgttaatttaatgatattaacatcatgatatttacatactaaagcgttctgatacttcgaataaccaatatcttaaataatttttttatttgttgttaattggctggcagtttttctttcttatttttttcttttcaatcacataatgttggctcaattaaaattcatccatctggcacgaattacaatcaaaatgaaatcatacatatcttccgtggtcaatagaccgataagtcaccgctttagcatataacctaattgacacggctctcactggcatgtgacataacgtaattaacacca
gi|4 : atttgccgtgttatttcgatataaattagttatagaacatataaaacatgtactttatttcgatttaagcgtatactgctccaaatacaaaaatatcaaagcatgcgtgaatcaaacaaaacatagatatgtgtataattatatgattatgattctatttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttggactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttataaacaaatctacgtaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattatactcgtgcacatctcattaaaaaaataataataaattaattgtattctaaaatataaaatgggtcagtagtacagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctttacccgacctctcaaaacacaattcagtaccagatctaataagggaatgcactggagaaagacatgcataagctccgagcttacttgacaatcaagctaaattaaattaatgtaaaataaatgtatgtatgccaaattaacaagacagaccgaaataacacattagacataggaaataaaaactagcaaacgtaaatttctaggtgacctttttgaggttgtgattttatattgactaaagaacagcttttgatcatgaggaaggtttaaataaacaataaagaacatgtattcactgcctataaaaaagtaaatatattgttttcccgctttcctacaaaatcgatacgcctgatcacgtgcatgtaagcacgtaacaattaagccactataaaagttgtgaaaggggcaacaagtaagaaatgacaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaATGCTAGTTGTGGTAAATTTACAGCCCTGAAAATACACATTCCTTAATATGCGTATGTCACACT--------T--------TCTACCATTCACTCATTACTGGTTATATTTTATGACGTGGGGTTTTTGTTTCGTTAATGAACGAAACGAAAATCACAAGTAATAAAAAATATATTATATTAACATCATGG-GTTTACATGCAAAAGTATTGTTCTGAAACCTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTGTTTGATTTGTTGTTAATTGGTTGGCAGTTTTTC-TTAC---ATATTTT-CTTTTCAATCATATACTGCGGGTTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACTTATTACAATC-AAATGAAATCATACATATCAGCAGGGTTCTTCCGTGGT-------CCGATAAGTCACCACTTTAGC--ATATAATTTAATTGACACGGCTCTTACTGGCATGTGACATACTAGTAACGTCATTAACACCATGGGTGTCTGTGTTGTTGCGTGTCATATAAGTAGCGGTATAGCACAGCGGGTATATTTTCAAACAAATTTAATATAGTTCGTCATTTT----TAA---ATTAACATAAATCATACTGCATGTATCAGT-AAAAAAATAATGAAGCCACATTTGCAACCAATTTGAGAAG-CACACTG---AAAA-GTTCATTTAAGGTACATATATATACATAATGATAACAAAAATATTTA-TAAAATCTTATAGTATCTGAATAATTTTTTTTAAGTTTAGTGAAACCACATTTGAA-CCAAATCGAGTAAAACACTACAAGATT-T--TTTTTCAAAAATCATTTATCA-----TATGTCAAATTCTATC-CGTGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCATACAATGCA------TATTATAGATTATAAAGCTGATTTTT-GTTTGAACATTAAC-AAAACCAGTGACATATCCACATGTTGTTAAGTCGCTGCTTACACTAATCAAATTAATGGATTACTGTTAAGCCAAACATGTATAAATGGTATGGAATTATTAAT--AA--CAAAT-------ACAATATATCTAGTGATATCTATGTTGTTGATGTATCTGTAAATTTTATGGACAACATTT-TTTTGCTTTATTGTTACAAACGGCTAACGGTTTATCAAAGAAGTCACTGACCCACACACATTTCTGTCTGGATAATACAAGTCGGCTGAACTTGGGGTATTCTTTGATCACACAGACCACTGATCACATATCAAAATATAGACTCTTCCATTAAACTTCCCTACTAT
gi|5 : aaataaaaccactaaatcgtaagtttaatgcctatgcatgcacgtttatttattgttgttttaaattcatttagcttacatcaaaattcaacatccaga-------------CGTGGGGTTTTCGTTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTG-----ATATCATGG-GTTTACATACTAAAGTATTGTTCTGAAACCTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTGTTTGATTTGTTGTTAATTGACTGGCAGTTTTTC-TTA---TATCTTTTTCTTTTCAATCATATACTGAGGTTTTAATTAAGATTCGTCCCTCTGGCACTAATTACAATCAAAATGAAAGCATCCGCAGGGT------TCTTCCGTGGGCAAAAGACCGGTAAGTCACCACTTTGGC--ATATAATTTAATTGAAACGGATCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGGTGTCTGTATTGCTGCGTGTCATATAAGTAGCGGTATAGCACAGTGGGTATA-TTTTAAACAAGTTTAATATAGTTTGT-ATTTT-AGTTAATATATTAACATGAATCATAC------TATCAGTAAAAAAAATAAT---------------------TTGAGAAA---CACTG-AAAAAAGGTTAATTTCAGGTACATATATATACATAATGATAACGAACATATTTATT-AAATCTTATAATATCAAACT-ATCTTTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTAGACCCAAAGCTAGAAAAACACTACAAAATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATTTTATATGTCAAATCCCATTGCGCAAATTATTATAAATTTTTCATCACCCGTGCAGTGCATAATTTTATTATTGATTATAAAGCTGATTTTTAAGTT--ACAATAACAAAAACCAGTGACAAATCCACATATTGTTAGGTCACTGCTTATACTGATCAAATGAATGGATTACTGTTAATCCAAAGATGTATAAGCGGTATTGAATTGTTAAT--AA--CAATT-------ACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATCTGTAAATTTTGTGGACA--ACTTGTTTTGCTTTCTTGTAATAAACGGCTTATGGTATTTCAAAGAAGTTACTGACGCAAACACATctgtaatgatttattcaaaattgacaacctttcgtccagcgggtgacaaaatatgtagacaaacaatcggattatgaatccaattaccatgactaaatcctgtcactgcattttatttattgctccattggaacagcttaaattaaagaaaatgaattaatttaagagttgagatgttgcgattggttatgggccagaaaccgaattgagcggactgaaagttgagtcaacttgaacgaacaaagttaacgttgaga
gi|7 : tactttctaccattcactcagtaatggttatattttataaAGGAAACGG--A--CTTGAAAGCATTACAAATAACCTTTGTGCTTTCTTCACAACTGAGCTAAGAGTAA---TTAGT-A-TAA----AC------TAAATCTTA-----CTT----GT-CCAAATTATAAAAGAACAA-GTTAAAAACAACATGCTAAA
gi|8 : ctttttaaaatcatggttgtcaactaactaaataaatctaatacaagtttgttcatttttaaagaaggcagagcgatagtgtagtggatagagtgctcgccagtcatgtcagaggttgcgggtttgattctcagcttgacctgatacttcttaaaaaaacaacactcagttatggttctacccAGCGGATGC--A------AGAGTGGTTCATATAAGCTCTGAGTTTTCATGACAATCCAGCTAAAATAAA---TTAGTAG-TAA----ata
gi|9 : gttaaaactacattaactgtcgatgtaaggaattgatcattttaaaactgcagaaggagtgatagtgtactggatagagtgttggcctctaatgccagaggttgcaatccccagttcgacccgatatctctcataaaacaacactcagttctagttctaccagctggaGGAA-GCTGA--CTTGAGAGCGGTCAATATAAGCTCTGAGCTGTCTTTGCAATCAAGCTAAAATAAA---TTAGT-A-TAC----AC------TAAActaaaactgagttg
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): AACACATTCCCTATTATGAGTAATGGTTTATCCAAAATTTACAACCTTTCGCCAAGTGGGTGACACAATATGTAGACAAACAATCAGATTATGAATTCAATTACCTTGACTAAAATCCCATGAATACATTTTATTAATTGCTCCATTTTTAACAGCTTCAATTATAAAGTCAATATGGAATTATTTTAAGAGTTGAGAGGTTTGCGATTGCCATTGGTAACCAAACTGAGCAACTGAACAATGAGTGAATGCTGAAGGAACGAAGCGAACACTGAGAGGAGTATAAAATAAAGATAGTGAGCGAATACTTGCGTTTGTGAGTGTATTAGTTTAACCGCACGCAAACGGAGCGTAACTGGAGCGCAATTATGGGGAACTTGAGCAGTTTAGGTTCTGTAATGGTGTGTAAGTGAT
Unaligned ( gi|11 ): AGTGAATTGTGTTAGCCGCTTACGTCAGAGGTCACATGTTTAATCCCACTGATATCCACTCCCCTTCATAAAAAAAAATGCTCGGTTCCACCCTGGAAACGACATGAGCAGTTCATTTAACCTTCACAAAGCTTTACCTTCAGGACTGCGTTCA
Unaligned ( gi|12 ): AAACAATGTACACCATTTTTAGACAATTTTAGAGTTATTTTATAGTAGTGCAGAGGATAGATTGTTTGTCATTCACGCAAGAGGTTGCAGGTTTGATCGCCAGCTCGACCTAATGTGTCTTTAAAAGCAACACTTATAACTGGTTCA
Unaligned ( gi|13 ): TCAATGTTGGCAGGTGGCACAGTGGATAGAGTGTTGGCTGATCACTCCAGATGTTTGCTCCCATGCTCCAGCGAATGACCTCTTAATAACAACACTTAGTATTCATTCTGCTCATGAAACAGACTCCAGAGCCATCTA
Unaligned ( gi|14 ): TTTGCCTTGCTATTTCGATATAAATTAGTTATAGAACATACAGAACATATATTTCAATTGGATTTAAGCGTATGCAGCTCTAAACACAAAAAATCAATGCATTTGTGAATCAAACAAAACATAGATA
Unaligned ( gi|15 ): TATTGTTTAAAACTTTTTATCAAAGGTCGAGAGTTGTTGATACATAGATAGTGCAATGGATAGAGTGTTGGTCACTCACATAAGATGTAACAGGTTCGATCCGACATTTAGT
Alignments
lowQualScore : 111 111 1111 111111 111111111111 11 1 222 11 7777777777777777777777 111111 4444444444444 666666666666666666666 222222 22222 1 222 2 222222 5555555555 11 222222 222222 1 888888888888888888888 11 1 1 1 2222 333333 1 1 222 4444444 33333 1 1
lowQualScore : 7 77 222 3 4444 22 2 1 0 777 000 0000 666666 6 999999999999 11 1 8 8 2 0 0 3 333 7 7 33 5555555555555555555555 444444 4444444444444 111111111111111111111 333333 00000 0 111 11 0 0 999999 8 0 0 0 2222222222 1 11 333333 3 8 1 1 8 2 777 44 1 888888 0 555555555555555555555 8 33 0 1 1 1 0 1 0 2 3 3 3 8888 0 6 0 888888 7 7 1 6 3 0 3 333 3333333 33333 7 3 3 1 1 2 22 1 1 1 1 1 1
lowQualScore : . .. ... . .... .. . . . ... ... .... ...... . ............ .. . . . . . . . ... . . .. ...................... ...... ............. ..................... ...... ..... . ... .. . . ...... . . . . .......... . .. ...... . . . . . . ... .. . ...... . ..................... . .. . . . . . . . . . . . .... . . . ...... . . . . . . . ... ....... ..... . . . . . . .. . . . . . .
lowQualScore : 1 99 111 0 6666 33 7 0 7 888 222 6666 444444 7 333333333333 00 0 0 0 0 7 7 3 333 3 3 88 8888888888888888888888 888888 0000000000000 000000000000000000000 000000 00000 6 444 66 6 0 888888 0 6 6 8 0000000000 0 00 000000 2 8 0 2 8 5 555 00 0 888888 0 000000000000000000000 8 22 0 0 0 0 8 0 0 5 2 2 2 3333 7 7 7 333333 3 3 0 7 3 7 3 333 3333333 33333 3 3 3 0 0 5 00 0 0 0 0 0 0
consensus : AGGGAATGC--A--CTNGAGAGCGGTACGCATAAGCTCCGAGCTTNCTTCGCAATCAAGCTAAAATAAA---TTAGT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----CGT----ATGCCAAAT--TAACANGACAG-ACC-GAAATAACACGTTAGACACAGGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAATAGTAAATATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCACGTAAGCACGTAACAATTAAGCCATTATAAAAGCTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCTTCGTGATCAATGGACCGATAAATCACCAATTAACTATTTATTGACACACATGTGGTTCTCACCATGGGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCGCGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACATTTTTACAAGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATACGAAATCGCTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTAATACGTGTATGTCACACT--------T--------T----CATTCA--GA--ACTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTAAAGTATCGTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTTTTTGATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTCTTTCTTT-ATCTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGGTGTCTGTGTTGCTGCGTGTCATATAANTAGCGGTATAGCACAGTGGGTATAGTTTCAAACAAGTTTAATATAGTTTGTCATTTTAAATAATATATTAACATAAANCATAC------TATCAGTAAAAGAA-TA---------------------ATTTGAGAAACCCACTG-AAAAAAG-TTCATTNCAGGTACATNTATATACATAATGATAACGAAAATANTTATAAAATCTTANAATATCAGAAT-ATCTTTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATT----ATGTCGAATTCTATCGCGCGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCGTGCAGTGCATA------TTATTGATTATAAAGCTGATTTTTAGNTTGAACATTAACAAAA-CCAGTGACATATCCACATGTTGTTAAGTCGCTGCTTACACTGATCAAATTAATGGATTACTGTTAAGCCAAAGATGTATAAACGGTATGGAATTATTAA-TAA---CAATT-------ACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATCTGTAAATTTTGTGGACAA-ACTT-TTTTGCTTTCTTGTAACAAACGGCTTACGGTATATCAAAGAAGTTACTGACGCAAACACATNTCNGTCTGGATAACACGAGCCGGCNNAACNTGNGGTATTCTTTGATCACNCAGACCACTGATCACATATCAAAACATAGACNCTTCCGTTAAACNTNCCTACTAT
Reference ( family-1016 ) : AGGGAATGC--A--CTNGAGAGCGGTACGCATAAGCTCCGAGCTTNCTTCGCAATCAAGCTAAAATAAA---TTAGT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----CGT----ATGCCAAAT--TAACANGACAG-ACC-GAAATAACACGTTAGACACAGGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAATAGTAAATATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCACGTAAGCACGTAACAATTAAGCCATTATAAAAGCTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCTTCGTGATCAATGGACCGATAAATCACCAATTAACTATTTATTGACACACATGTGGTTCTCACCATGGGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCGCGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACATTTTTACAAGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATACGAAATCGCTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTAATACGTGTATGTCACACT--------T--------T----CATTCA--GA--ACTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTAAAGTATCGTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTTTTTGATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTCTTTCTTT-ATCTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGGTGTCTGTGTTGCTGCGTGTCATATAANTAGCGGTATAGCACAGTGGGTATAGTTTCAAACAAGTTTAATATAGTTTGTCATTTTAAATAATATATTAACATAAANCATAC------TATCAGTAAAAGAA-TA---------------------ATTTGAGAAACCCACTG-AAAAAAG-TTCATTNCAGGTACATNTATATACATAATGATAACGAAAATANTTATAAAANCTTANAATATCAGAAT-ATCTTTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATT----ATGTCGAATTCTATCGCGCGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCGTGCAGTGCATA------TTATTGATTATAAAGCTGATTTTTAGNTTGAACATTAACAAAA-CCAGTGACATATCCACATGTTGTTAAGTCGCTGCTTACACTGATCAAATTAATGGATTACTGTTAAGCCAAAGATGTATAAACGGTATGGAATTATTAA-TAA---CAATT-------ACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATCTGTAAATTTTGTGGACAA-ACTT-TTTTGCTTTCTTGTAACAAACGGCTTACGGTATATCAAAGAAGTTACTGACGCAAACACATNTCNGTCTGGATAACACGAGCCGGCNNAACNTGNGGTATTCTTTGATCACNCAGACCACTGATCACATATCAAAACATAGACNCTTCCGTTAAACNTNCCTACTAT
gi|1 : AGGGAATGC--A---TGGAGAACGATATGCATAAGCTCCGAGCTTACTTCACAATCAAGCTAAATTAAA---TTAAT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----TGT----ATGCCAAAT--TAACAGGACAG-ACT-GAAATAACACATTAGACACAGGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGTCTATAAAATAGTAAAAATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCACGTAAGCACATAACAATTAAGCCATTATAAAAGCTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAAC
gi|1 : TTATAAAAAATCTGCATATTTTAGTATTGACTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACAATGGCAGGGTTCTTCGTGATCAATGGACAGATAAATCACCAATTAACTATTTATTGATACACATGTGGTTCTCACCATCGGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCAAGTATGCGCGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAGTCAATAAGTCTACATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATCT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACCTTTTTACAGGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTAATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATACGAAATCGCTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTAATACATGTATGTCACACT--------T--------T----CATTCA--GA--ACTAG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCATTAAT--------------T------TAATGG------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTAAA---TCGTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATGA-TTTTTTT-ATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTCTTTTTTTTATCTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATAATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGTATGTGACA------TAACGTGATTAACACCACGGGTGT----GTTGCTGCGTGTCATATAATTAGCAGTATAGCACAGTGGGTGTAGTTTCAAACAAGTTTAATATAGTTTGTCACTTTAAATAATATATTAACATAAAGCATAC------TATCAGTAAAAGAA-TA---------------------ATTTGAGAAACCCACTG-AAAAAAG-TTCATTGCAAGTATATTTATATACATAATGATAACGAAAATAATTATAAAAACTTAAAATATCAGAAT-ATCTCTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATC----ATGTCGAATTGTATCGCACGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCATGCAGTGCATA------TTATTGATTATAAAGCTTA-TTTTAGATTGAACATTAACAAAA-CCAGTCATATATCCACATGTTGTTAAGTCACTGCTTACACTGAGCAGATTTATGGATTATTATAAGGCCAACGAGGTATCAACAGTATGGAATTATTAATTAAATTTAATTATTAATAACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATATGTAAATTTTGTGGACAA-ACTT-TATTGCTTTCCTGTAACAAACGGCTTACGGTATATCAAAGAAGATACTGACGCAAACACATGTCGGTCTGGATAACAGGAGCCGGTATAACGTGTGATATTCTTTGATCACCCAGACCACTGATCACATATCAAAACATAGACACTTCTGTTAAACATGCCTACTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttataaaaaatctgcatattttagtattgactttgactatatatttcttatccaatcacatgccgcgggttaaataaagattcattcatctggcacaaattataatcaaaatgaaaattacacaatggcagggttcttcgtgatcaatggacagataaatcaccaattaactatttattgatacacatgtggttctcaccatcggtatctgttttgatgattgccatgcaactctgccttcataatagtaattaaattgttatattaattgtgaacgactgaccagatgcaagtatgcgcgtatccaatataaaagctgtgacaagtcaataagtctacatgtatattataataatagctccaatgataataatatctaaaaaaataaaacaaataatgaaagtaaaaaataatacaaataaaatactacctttttacagggaattatttagagacatgtctttaattttaattagttttaaaattgtaggattgttttattttgtaaattaacaattctgatctgttttttatacgaaatcgctatggcagctgtggtaaaatgacagccctgaatacacatcccttaatacatgtatgtcacactttcattcagaactagcgtggggttttcggttcattaatttaatggtattaacatcatgatatttacatactaaatcgttctgaaacttcgaataaccaatatcttaaatgatttttttatttgttgttaattggctggcagtttttcttttttttatcttttcttttcaatcacataatgttggctcaattaagattcatccatctggcacgaattacaatcaaaatgaaataatacatatcttccgtggtcaatagaccgataagtcaccgctttagcatataacttaattgacacggctctcactggtatgtgacataacgtgattaacaccacgggtgtgttgctgcgtgtcatataattagcagtatagcacagtgggtgtagtttcaaacaagtttaatatagtttgtcactttaaataatatattaacataaagcatactatcagtaaaagaataatttgagaaacccactgaaaaaagttcattgcaagtatatttatatacataatgataacgaaaataattataaaaacttaaaatatcagaatatctcttttaagtttagtgaagccacatttggacccaaatcgagaaaaacactacaagattattatttttcaaaaatcatttattatcatgtcgaattgtatcgcacggattataataaatttttcatcacccatgcagtgcatattattgattataaagcttattttagattgaacattaacaaaaccagtcatatatccacatgttgttaagtcactgcttacactgagcagatttatggattattataaggccaacgaggtatcaacagtatggaattattaattaaatttaattattaataacaatatatttagtttatgttgatgatgtatatgtaaattttgtggacaaactttattgctttcctgtaacaaacggcttacggtatatcaaagaagatactgacgcaaacacatgtcggtctggataacaggagccggtataacgtgtgatattctttgatcacccagaccactgatcacatatcaaaacatagacacttctgttaaacatgcctactatggatactacagtcaaacctgtcttaagcagccagccaagggaaaggaccaaattggccgcttaagacaggtggctgcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaagtatttttgtatattgg
gi|10 : agggaatgcatggagaacgatatgcataagctccgagcttacttcacaatcaagctaaattaaattaatgtaaaataaatgtatgtatgccaaattaacaggacagactgaaataacacattagacacaggaaataaaaactagtaaacgtaaatttctaggtgacctttttgaggttgtgattttatattgactaaagaacagcttttgatcatgaggaaggtttaaataaacaaaaaagaacatgtattcactgtctataaaatagtaaaaatattgttttcccgctttcctacaaaatcgatacgcctgatcacgtgcacgtaagcacataacaattaagccattataaaagctgtgaaaggggcaacaagtaagaaatgacaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGAA-GC--AGACTCAAGAGTTGTTCATATATGCTTTGAGTATCCTTCGCAATCAAGATAAAATTAA---CCAAT---TAACCAGAACCAATTTAAATGT-A-----ggatactacagtcaaacctgtcttaagcagccagccaagggaaaggaccaaattggccgcttaagacaggtggctgcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaagtatttttgtatattgg
gi|16 : gtttaaactattaaactacaaaaaaaatcactcagtactggttcaacttctacccaGCAAAAGCTCAGAGCTTATTTTGTAATGATGCTAAAATAAATTGTTAAT-GATAA----AA-------AAA-GT-AACAGTCGT----ATGACACAT--TTACATAACAGTAAC-AAAACAAgtttgtttt
gi|17 : CATAAATTCAGAGTTTACTTCACAATCAA-TTAACATAAA---TTAGaaaaata
gi|2 : ctagttctaccaaggaagcagacccaatagagatttttAGGGAATGC--A--CTGGAGA-----ATGCATAAGCTCCGAGCTTACTTCACAATCAAGCTAAATTAAA---TTAAT-G-TTA----AA------TAAATGA-A-----TGTTTGTATGCCAAAT--TAACACGACAG-ACC-GAAATAACACATTAGACACAAGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAATAGTAAATATATTATTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCATGTAAGTACGTAACAATTAAGCCATCATAAAAGCTGTGAAAGGCGCAACAAGTAAGAAATGACAACatacactaagaca
gi|2 : ccatgtagtttatataaatgttttattgtaaaacgcatgataaaacttattttggtcaacactttatcaattataacataaatatcaatatttagctgatcaaacaaaacatagatatgcggaaaattatatgattatgattctgtttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttgaactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttgtgaacaaatctacgtaaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattttactcgtgtacatctcattaaaataatagtaataaattaattgtattctaaaatataaagtgggtcagtagtatagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctctacccgacctctcgaaacacaattcagtaccagacctaataTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTGTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCAGGTTAAATAAAGATTTATTCATCGGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCTTCGTGATCAATGGACCGATAAATCACCAATTAACTATTTATTGACACACATGTGGTTCTCACCATGGGTATCTGTTTTGATGATTGCAATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTTTATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCACGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACATTTTTACAAGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATAAGAAATCACTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TATACATCCCTTAATACGTGTATGTCACACT--------TTCTACCAGT----CATTCA--GA--ACTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTTAAG---CGTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATG-ATTTTTTT-ATTTGTTGTTAATTGGCTAGCAGTTTTTCTTT-TTT-ATCCTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGCATATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGG----TGTGTTGCTGCATGTCATATAATTAGCGGTATAGCACAGTGGGTTTAGTTTCAAACAAGTTTATTATAGTTTGTCATTTTAAATAATGTATTAACATAAAGCATAC------TATCAGTAAAAGAA-TA---------------------ATTTGAGAAACCCACTGAAAAAAAG-TTCATTGCAAGTATATTTATATACATAATGATAACGAAAATAATTATAAAA-CTTAAAATATCAGAAT-ATCTTTTCTAAGTTTAGTGAAGCTACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATaataataataaagaagataaaatactcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttataaaaaatctgcatatttaagtattgattgtgactatatatttcttatccaatcacatgccgcaggttaaataaagatttattcatcgggcacaaattataatcaaaatgaaaattacacaccggcagggttcttcgtgatcaatggaccgataaatcaccaattaactatttattgacacacatgtggttctcaccatgggtatctgttttgatgattgcaatgcaactctgccttcataatagtaattaaattgttttattaattgtgaacgactgaccagatgcacgtacgcacgtatccaatataaaagctgtgacaaatcaataagtcaatatgtatattataataatagctccaatgataataatatttaaaaaaataaaacaaataatgaaagtaaaaaataatacaaataaaatactacatttttacaaggaattatttagagacatgtctttaatttttattagttttaaaattgtaggattgttttattttgtaaattaacaattctgatctgttttttataagaaatcactatggcagctgtggtaaaatgacagccctgaatatacatcccttaatacgtgtatgtcacactttctaccagtcattcagaactggcgtggggttttcggttcgttaatttaatgatattaacatcatgatatttacatacttaagcgttctgaaacttcgaataaccaatatcttaaatgatttttttatttgttgttaattggctagcagtttttcttttttatcctttcttttcaatcacataatgttggctcaattaagattcatccatctggcacgaattacaatcaaaatgaaatcatacatatcttccgtggtcaatagaccgataagtcaccgctttagcatatataacttaattgacacggctctcactggcatgtgacataacgtaattaacaccacgggtgtgttgctgcatgtcatataattagcggtatagcacagtgggtttagtttcaaacaagtttattatagtttgtcattttaaataatgtattaacataaagcatactatcagtaaaagaataatttgagaaacccactgaaaaaaagttcattgcaagtatatttatatacataatgataacgaaaataattataaaacttaaaatatcagaatatcttttctaagtttagtgaagctacatttggacccaaatcgagaaaaacactacaagattattatttttcaaaaatcatttattata
gi|3 : ccatgtagtttatataaatgttttattgtaaaacgcatgataaaacttattttggtcaacactttatcaattataacataaatatcaatatttagctgatcaaacaaaacatagatatgcggaaaattatatgattatgattctgtttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttgaactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttgtgaacaaatctacgtaaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattttactcgtgtacatctcattaaaataatagtaataaattaattgtattctaaaatataaagtgggtcagtagtatagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctctacccgacctctcgaaacacaattcagtaccagacctaataagggaatgcactggagaatgcataagctccgagcttacttcacaatcaagctaaattaaattaatgttaaataaatgaatgtttgtatgccaaattaacacgacagaccgaaataacacattagacacaagaaataaaaactagtaaacgtaaatttctaggtgacctttttgaggttgtgattttatattgactaaagaacagcttttgatcatgaggaaggtttaaataaacaaaaaagaacatgtattcactgcctataaaatagtaaatatattattttcccgctttcctacaaaatcgatacgcctgatcacgtgcatgtaagtacgtaacaattaagccatcataaaagctgtgaaaggcgcaacaagtaagaaatgacaacaataataataaagaagataaaatactcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGGAATGC--A--CTGGAGAAAGACATGCATAAGCTCCGAGCTTACTTGACAATCAAGCTAAATTAAA---TTAAT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----TGT----ATGCCAAAT--TAACAAGACAG-ACC-GAAATAACACATTAGACATAGGAAATAAAAACTAGCAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAATAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAAAAGTAAATATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCATGTAAGCACGTAACAATTAAGCCACTATAAAAGTTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAACa
gi|3 : atttgccgtgttatttcgatataaattagttatagaacatataaaacatgtactttatttcgatttaagcgtatactgctccaaatacaaaaatatcaaagcatgcgtgaatcaaacaaaacatagatatgtgtataattatatgattatgattctatttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttggactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttataaacaaatctacgtaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattatactcgtgcacatctcattaaaaaaataataataaattaattgtattctaaaatataaaatgggtcagtagtacagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctttacccgacctctcaaaacacaattcagtaccagatctaataTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTTGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCGTTGTGATCAATGGACCGATAAATCACCAATAAACTATTTATTGACACACATGTGGTTCTCATCATGCGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCTTTCATTATAGTAATTTAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCACGTATCCAATATAAAAGCTGTCAACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTTCAAAAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACA-TTTTACAAGGAATTATTTAAATACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTG-TTTTTATACGAAATCGCTATAGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTTATACGTGTATGTCACACTTTCTACCAT--------T----CACTCA--GA--GCTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTAAAG---CGTTCTGATACTTCGAATAACCAATATCTTAAAT-AATTTTTTT-ATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTCTTTCTTA-TTTTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAAATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACCTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaattataaaaaatctgcatatttaagtattgattttgactatatatttcttatccaatcacatgccgcgggttaaataaagattcattcatcttgcacaaattataatcaaaatgaaaattacacaccggcagggttcgttgtgatcaatggaccgataaatcaccaataaactatttattgacacacatgtggttctcatcatgcgtatctgttttgatgattgccatgcaactctgctttcattatagtaatttaattgttatattaattgtgaacgactgaccagatgcacgtacgcacgtatccaatataaaagctgtcaacaaatcaataagtcaatatgtatattataataatagctccaatgataataatatttcaaaaaaaaataaaacaaataatgaaagtaaaaaataatacaaataaaatactacattttacaaggaattatttaaatacatgtctttaatttttattagttttaaaattgtaggattgttttattttgtaaattaacaattctgatctgtttttatacgaaatcgctatagcagctgtggtaaaatgacagccctgaatacacatccctttatacgtgtatgtcacactttctaccattcactcagagctggcgtggggttttcggttcgttaatttaatgatattaacatcatgatatttacatactaaagcgttctgatacttcgaataaccaatatcttaaataatttttttatttgttgttaattggctggcagtttttctttcttatttttttcttttcaatcacataatgttggctcaattaaaattcatccatctggcacgaattacaatcaaaatgaaatcatacatatcttccgtggtcaatagaccgataagtcaccgctttagcatataacctaattgacacggctctcactggcatgtgacataacgtaattaacacca
gi|4 : atttgccgtgttatttcgatataaattagttatagaacatataaaacatgtactttatttcgatttaagcgtatactgctccaaatacaaaaatatcaaagcatgcgtgaatcaaacaaaacatagatatgtgtataattatatgattatgattctatttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttggactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttataaacaaatctacgtaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattatactcgtgcacatctcattaaaaaaataataataaattaattgtattctaaaatataaaatgggtcagtagtacagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctttacccgacctctcaaaacacaattcagtaccagatctaataagggaatgcactggagaaagacatgcataagctccgagcttacttgacaatcaagctaaattaaattaatgtaaaataaatgtatgtatgccaaattaacaagacagaccgaaataacacattagacataggaaataaaaactagcaaacgtaaatttctaggtgacctttttgaggttgtgattttatattgactaaagaacagcttttgatcatgaggaaggtttaaataaacaataaagaacatgtattcactgcctataaaaaagtaaatatattgttttcccgctttcctacaaaatcgatacgcctgatcacgtgcatgtaagcacgtaacaattaagccactataaaagttgtgaaaggggcaacaagtaagaaatgacaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaATGCTAGTTGTGGTAAATTTACAGCCCTGAAAATACACATTCCTTAATATGCGTATGTCACACT--------T--------TCTACCATTCACTCATTACTGGTTATATTTTATGACGTGGGGTTTTTGTTTCGTTAATGAACGAAACGAAAATCACAAGTAATAAAAAATATATTATATTAACATCATGG-GTTTACATGCAAAAGTATTGTTCTGAAACCTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTGTTTGATTTGTTGTTAATTGGTTGGCAGTTTTTCTTAC----ATATTTT-CTTTTCAATCATATACTGCGGGTTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACTTATTACAATC-AAATGAAATCATACATATCAGCAGGGTTCTTCCGTGGT-------CCGATAAGTCACCACTTTAGC--ATATAATTTAATTGACACGGCTCTTACTGGCATGTGACATACTAGTAACGTCATTAACACCATGGGTGTCTGTGTTGTTGCGTGTCATATAAGTAGCGGTATAGCACAGCGGGTATATTTTCAAACAAATTTAATATAGTTCGTCATTTT---TAA---ATTAACATAAATCATACTGCATGTATCAGTAAAAAAA-TAATGAAGCCACATTTGCAACCAATTTGAGAAGCACACTG---AAAAG-TTCATTTAAGGTACATATATATACATAATGATAACAAAAATATTTATAAAATCTTATAGTATCTGAATAATTTTTTTTAAGTTTAGTGAAACCACATTTGAA-CCAAATCGAGTAAAACACTACAAGATT-T--TTTTTCAAAAATCATTTATCA-T----ATGTCAAATTCTATC-CGTGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCATACAATGCATA------TTATAGATTATAAAGCTGATTTTT-GTTTGAACATTAACAAAA-CCAGTGACATATCCACATGTTGTTAAGTCGCTGCTTACACTAATCAAATTAATGGATTACTGTTAAGCCAAACATGTATAAATGGTATGGAATTATTAA-TAA---CAAAT-------ACAATATATCTAGTGATATCTATGTTGTTGATGTATCTGTAAATTTTATGGACAACATTT-TTTTGCTTTATTGTTACAAACGGCTAACGGTTTATCAAAGAAGTCACTGACCCACACACATTTCTGTCTGGATAATACAAGTCGGCTGAACTTGGGGTATTCTTTGATCACACAGACCACTGATCACATATCAAAATATAGACTCTTCCATTAAACTTCCCTACTAT
gi|5 : aaataaaaccactaaatcgtaagtttaatgcctatgcatgcacgtttatttattgttgttttaaattcatttagcttacatcaaaattcaacatccaga-------------CGTGGGGTTTTCGTTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTG-----ATATCATGG-GTTTACATACTAAAGTATTGTTCTGAAACCTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTGTTTGATTTGTTGTTAATTGACTGGCAGTTTTTCTTA---T-ATCTTTTTCTTTTCAATCATATACTGAGGTTTTAATTAAGATTCGTCCCTCTGGCACTAATTACAATCAAAATGAAAGCATCCGCAGGGT------TCTTCCGTGGGCAAAAGACCGGTAAGTCACCACTTTGGC--ATATAATTTAATTGAAACGGATCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGGTGTCTGTATTGCTGCGTGTCATATAAGTAGCGGTATAGCACAGTGGGTATA-TTTTAAACAAGTTTAATATAGTTTGT-ATTTTAGTTAATATATTAACATGAATCATAC------TATCAGTAAAAAAAATA---------------------ATTTGAGAAAC--ACTG-AAAAAAGGTTAATTTCAGGTACATATATATACATAATGATAACGAACATATTTATTAAATCTTATAATATCAAACT-ATCTTTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTAGACCCAAAGCTAGAAAAACACTACAAAATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATTTTATATGTCAAATCCCATTGCGCAAATTATTATAAATTTTTCATCACCCGTGCAGTGCATAATTTTATTATTGATTATAAAGCTGATTTTTAAGTT--ACAATAACAAAAACCAGTGACAAATCCACATATTGTTAGGTCACTGCTTATACTGATCAAATGAATGGATTACTGTTAATCCAAAGATGTATAAGCGGTATTGAATTGTTAA-TAA---CAATT-------ACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATCTGTAAATTTTGTGGAC-A-ACTTGTTTTGCTTTCTTGTAATAAACGGCTTATGGTATTTCAAAGAAGTTACTGACGCAAACACATctgtaatgatttattcaaaattgacaacctttcgtccagcgggtgacaaaatatgtagacaaacaatcggattatgaatccaattaccatgactaaatcctgtcactgcattttatttattgctccattggaacagcttaaattaaagaaaatgaattaatttaagagttgagatgttgcgattggttatgggccagaaaccgaattgagcggactgaaagttgagtcaacttgaacgaacaaagttaacgttgaga
gi|7 : tactttctaccattcactcagtaatggttatattttataaAGGAAACGG--A--CTTGAAAGCATTACAAATAACCTTTGTGCTTTCTTCACAACTGAGCTAAGAGTAA---TTAGT-A-TAA----AC------TAAATCTTA-----CTT----GT-CCAAATTATAAAAGAACAA-GTTAAAAACAACATGCTAAA
gi|8 : ctttttaaaatcatggttgtcaactaactaaataaatctaatacaagtttgttcatttttaaagaaggcagagcgatagtgtagtggatagagtgctcgccagtcatgtcagaggttgcgggtttgattctcagcttgacctgatacttcttaaaaaaacaacactcagttatggttctacccAGCGGATGC--A------AGAGTGGTTCATATAAGCTCTGAGTTTTCATGACAATCCAGCTAAAATAAA---TTAGTAG-TAA----ata
gi|9 : gttaaaactacattaactgtcgatgtaaggaattgatcattttaaaactgcagaaggagtgatagtgtactggatagagtgttggcctctaatgccagaggttgcaatccccagttcgacccgatatctctcataaaacaacactcagttctagttctaccagctggaGGAA-GCTGA--CTTGAGAGCGGTCAATATAAGCTCTGAGCTGTCTTTGCAATCAAGCTAAAATAAA---TTAGT-A-TAC----AC------TAAActaaaactgagttg
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): AACACATTCCCTATTATGAGTAATGGTTTATCCAAAATTTACAACCTTTCGCCAAGTGGGTGACACAATATGTAGACAAACAATCAGATTATGAATTCAATTACCTTGACTAAAATCCCATGAATACATTTTATTAATTGCTCCATTTTTAACAGCTTCAATTATAAAGTCAATATGGAATTATTTTAAGAGTTGAGAGGTTTGCGATTGCCATTGGTAACCAAACTGAGCAACTGAACAATGAGTGAATGCTGAAGGAACGAAGCGAACACTGAGAGGAGTATAAAATAAAGATAGTGAGCGAATACTTGCGTTTGTGAGTGTATTAGTTTAACCGCACGCAAACGGAGCGTAACTGGAGCGCAATTATGGGGAACTTGAGCAGTTTAGGTTCTGTAATGGTGTGTAAGTGAT
Unaligned ( gi|11 ): AGTGAATTGTGTTAGCCGCTTACGTCAGAGGTCACATGTTTAATCCCACTGATATCCACTCCCCTTCATAAAAAAAAATGCTCGGTTCCACCCTGGAAACGACATGAGCAGTTCATTTAACCTTCACAAAGCTTTACCTTCAGGACTGCGTTCA
Unaligned ( gi|12 ): AAACAATGTACACCATTTTTAGACAATTTTAGAGTTATTTTATAGTAGTGCAGAGGATAGATTGTTTGTCATTCACGCAAGAGGTTGCAGGTTTGATCGCCAGCTCGACCTAATGTGTCTTTAAAAGCAACACTTATAACTGGTTCA
Unaligned ( gi|13 ): TCAATGTTGGCAGGTGGCACAGTGGATAGAGTGTTGGCTGATCACTCCAGATGTTTGCTCCCATGCTCCAGCGAATGACCTCTTAATAACAACACTTAGTATTCATTCTGCTCATGAAACAGACTCCAGAGCCATCTA
Unaligned ( gi|14 ): TTTGCCTTGCTATTTCGATATAAATTAGTTATAGAACATACAGAACATATATTTCAATTGGATTTAAGCGTATGCAGCTCTAAACACAAAAAATCAATGCATTTGTGAATCAAACAAAACATAGATA
Unaligned ( gi|15 ): TATTGTTTAAAACTTTTTATCAAAGGTCGAGAGTTGTTGATACATAGATAGTGCAATGGATAGAGTGTTGGTCACTCACATAAGATGTAACAGGTTCGATCCGACATTTAGT
Alignments
lowQualScore : 111 111 1111 111111 111111111111 11 1 222 11 7777777777777777777777 111111 4444444444444 666666666666666666666 222222 22222 1 222 2 222222 5555555555 11 222222 222222 1 888888888888888888888 11 1 1 2222 333333 1 1 222 4444444 33333 1 1
lowQualScore : 7 77 222 3 4444 22 2 1 0 777 000 0000 666666 6 999999999999 11 1 8 8 2 0 0 3 333 7 7 33 5555555555555555555555 444444 4444444444444 111111111111111111111 333333 00000 0 111 11 0 0 999999 8 0 0 0 2222222222 1 11 333333 3 8 1 1 8 2 777 44 1 888888 0 555555555555555555555 8 33 0 1 1 1 9 1 0 2 3 3 3 8888 0 6 0 888888 7 7 1 6 3 0 3 333 3333333 33333 7 3 3 1 1 2 22 1 1 1 1 1 1
lowQualScore : . .. ... . .... .. . . . ... ... .... ...... . ............ .. . . . . . . . ... . . .. ...................... ...... ............. ..................... ...... ..... . ... .. . . ...... . . . . .......... . .. ...... . . . . . . ... .. . ...... . ..................... . .. . . . . . . . . . . . .... . . . ...... . . . . . . . ... ....... ..... . . . . . . .. . . . . . .
lowQualScore : 1 99 111 0 6666 33 7 0 7 888 222 6666 444444 7 333333333333 00 0 0 0 0 7 7 3 333 3 3 88 8888888888888888888888 888888 0000000000000 000000000000000000000 000000 00000 6 444 66 6 0 888888 0 6 6 8 0000000000 0 00 000000 2 8 0 2 8 5 555 00 0 888888 0 000000000000000000000 8 22 0 0 0 0 8 0 0 5 2 2 2 3333 7 7 7 333333 3 3 0 7 3 7 3 333 3333333 33333 3 3 3 0 0 5 00 0 0 0 0 0 0
consensus : AGGGAATGC--A--CTNGAGAGCGGTACGCATAAGCTCCGAGCTTNCTTCGCAATCAAGCTAAAATAAA---TTAGT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----CGT----ATGCCAAAT--TAACANGACAG-ACC-GAAATAACACGTTAGACACAGGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAATAGTAAATATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCACGTAAGCACGTAACAATTAAGCCATTATAAAAGCTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCTTCGTGATCAATGGACCGATAAATCACCAATTAACTATTTATTGACACACATGTGGTTCTCACCATGGGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCGCGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACATTTTTACAAGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATACGAAATCGCTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTAATACGTGTATGTCACACT--------T--------T----CATTCA--GA--ACTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTAAAGTATCGTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTTTTTGATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTCTTTCTTT-ATCTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGGTGTCTGTGTTGCTGCGTGTCATATAANTAGCGGTATAGCACAGTGGGTATAGTTTCAAACAAGTTTAATATAGTTTGTCATTTTAAATAATATATTAACATAAANCATAC------TATCAGTAAAAGAA-TA---------------------ATTTGAGAAACCCACTG-AAAAAAG-TTCATTNCAGGTACATNTATATACATAATGATAACGAAAATANTTATAAAATCTTANAATATCAGAAT-ATCTTTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATT----ATGTCGAATTCTATCGCGCGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCGTGCAGTGCATA------TTATTGATTATAAAGCTGATTTTTAGNTTGAACATTAACAAAA-CCAGTGACATATCCACATGTTGTTAAGTCGCTGCTTACACTGATCAAATTAATGGATTACTGTTAAGCCAAAGATGTATAAACGGTATGGAATTATTAA-TAA---CAATT-------ACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATCTGTAAATTTTGTGGACAA-ACTT-TTTTGCTTTCTTGTAACAAACGGCTTACGGTATATCAAAGAAGTTACTGACGCAAACACATNTCNGTCTGGATAACACGAGCCGGCNNAACNTGNGGTATTCTTTGATCACNCAGACCACTGATCACATATCAAAACATAGACNCTTCCGTTAAACNTNCCTACTAT
Reference ( family-1016 ) : AGGGAATGC--A--CTNGAGAGCGGTACGCATAAGCTCCGAGCTTNCTTCGCAATCAAGCTAAAATAAA---TTAGT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----CGT----ATGCCAAAT--TAACANGACAG-ACC-GAAATAACACGTTAGACACAGGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAATAGTAAATATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCACGTAAGCACGTAACAATTAAGCCATTATAAAAGCTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCTTCGTGATCAATGGACCGATAAATCACCAATTAACTATTTATTGACACACATGTGGTTCTCACCATGGGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCGCGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACATTTTTACAAGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATACGAAATCGCTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTAATACGTGTATGTCACACT--------T--------T----CATTCA--GA--ACTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTAAAGTATCGTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTTTTTGATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTCTTTCTTT-ATCTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGGTGTCTGTGTTGCTGCGTGTCATATAANTAGCGGTATAGCACAGTGGGTATAGTTTCAAACAAGTTTAATATAGTTTGTCATTTTAAATAATATATTAACATAAANCATAC------TATCAGTAAAAGAA-TA---------------------ATTTGAGAAACCCACTG-AAAAAAG-TTCATTNCAGGTACATNTATATACATAATGATAACGAAAATANTTATAAAATCTTANAATATCAGAAT-ATCTTTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATT----ATGTCGAATTCTATCGCGCGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCGTGCAGTGCATA------TTATTGATTATAAAGCTGATTTTTAGNTTGAACATTAACAAAA-CCAGTGACATATCCACATGTTGTTAAGTCGCTGCTTACACTGATCAAATTAATGGATTACTGTTAAGCCAAAGATGTATAAACGGTATGGAATTATTAA-TAA---CAATT-------ACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATCTGTAAATTTTGTGGACAA-ACTT-TTTTGCTTTCTTGTAACAAACGGCTTACGGTATATCAAAGAAGTTACTGACGCAAACACATNTCNGTCTGGATAACACGAGCCGGCNNAACNTGNGGTATTCTTTGATCACNCAGACCACTGATCACATATCAAAACATAGACNCTTCCGTTAAACNTNCCTACTAT
gi|1 : AGGGAATGC--A---TGGAGAACGATATGCATAAGCTCCGAGCTTACTTCACAATCAAGCTAAATTAAA---TTAAT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----TGT----ATGCCAAAT--TAACAGGACAG-ACT-GAAATAACACATTAGACACAGGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGTCTATAAAATAGTAAAAATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCACGTAAGCACATAACAATTAAGCCATTATAAAAGCTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAAC
gi|1 : TTATAAAAAATCTGCATATTTTAGTATTGACTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACAATGGCAGGGTTCTTCGTGATCAATGGACAGATAAATCACCAATTAACTATTTATTGATACACATGTGGTTCTCACCATCGGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCAAGTATGCGCGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAGTCAATAAGTCTACATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATCT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACCTTTTTACAGGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTAATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATACGAAATCGCTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTAATACATGTATGTCACACT--------T--------T----CATTCA--GA--ACTAG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCATTAAT--------------T------TAATGG------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTAAA---TCGTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATGA-TTTTTTT-ATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTCTTTTTTTTATCTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATAATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGTATGTGACA------TAACGTGATTAACACCACGGGTGT----GTTGCTGCGTGTCATATAATTAGCAGTATAGCACAGTGGGTGTAGTTTCAAACAAGTTTAATATAGTTTGTCACTTTAAATAATATATTAACATAAAGCATAC------TATCAGTAAAAGAA-TA---------------------ATTTGAGAAACCCACTG-AAAAAAG-TTCATTGCAAGTATATTTATATACATAATGATAACGAAAATAATTATAAAAACTTAAAATATCAGAAT-ATCTCTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATC----ATGTCGAATTGTATCGCACGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCATGCAGTGCATA------TTATTGATTATAAAGCTTA-TTTTAGATTGAACATTAACAAAA-CCAGTCATATATCCACATGTTGTTAAGTCACTGCTTACACTGAGCAGATTTATGGATTATTATAAGGCCAACGAGGTATCAACAGTATGGAATTATTAATTAAATTTAATTATTAATAACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATATGTAAATTTTGTGGACAA-ACTT-TATTGCTTTCCTGTAACAAACGGCTTACGGTATATCAAAGAAGATACTGACGCAAACACATGTCGGTCTGGATAACAGGAGCCGGTATAACGTGTGATATTCTTTGATCACCCAGACCACTGATCACATATCAAAACATAGACACTTCTGTTAAACATGCCTACTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttataaaaaatctgcatattttagtattgactttgactatatatttcttatccaatcacatgccgcgggttaaataaagattcattcatctggcacaaattataatcaaaatgaaaattacacaatggcagggttcttcgtgatcaatggacagataaatcaccaattaactatttattgatacacatgtggttctcaccatcggtatctgttttgatgattgccatgcaactctgccttcataatagtaattaaattgttatattaattgtgaacgactgaccagatgcaagtatgcgcgtatccaatataaaagctgtgacaagtcaataagtctacatgtatattataataatagctccaatgataataatatctaaaaaaataaaacaaataatgaaagtaaaaaataatacaaataaaatactacctttttacagggaattatttagagacatgtctttaattttaattagttttaaaattgtaggattgttttattttgtaaattaacaattctgatctgttttttatacgaaatcgctatggcagctgtggtaaaatgacagccctgaatacacatcccttaatacatgtatgtcacactttcattcagaactagcgtggggttttcggttcattaatttaatggtattaacatcatgatatttacatactaaatcgttctgaaacttcgaataaccaatatcttaaatgatttttttatttgttgttaattggctggcagtttttcttttttttatcttttcttttcaatcacataatgttggctcaattaagattcatccatctggcacgaattacaatcaaaatgaaataatacatatcttccgtggtcaatagaccgataagtcaccgctttagcatataacttaattgacacggctctcactggtatgtgacataacgtgattaacaccacgggtgtgttgctgcgtgtcatataattagcagtatagcacagtgggtgtagtttcaaacaagtttaatatagtttgtcactttaaataatatattaacataaagcatactatcagtaaaagaataatttgagaaacccactgaaaaaagttcattgcaagtatatttatatacataatgataacgaaaataattataaaaacttaaaatatcagaatatctcttttaagtttagtgaagccacatttggacccaaatcgagaaaaacactacaagattattatttttcaaaaatcatttattatcatgtcgaattgtatcgcacggattataataaatttttcatcacccatgcagtgcatattattgattataaagcttattttagattgaacattaacaaaaccagtcatatatccacatgttgttaagtcactgcttacactgagcagatttatggattattataaggccaacgaggtatcaacagtatggaattattaattaaatttaattattaataacaatatatttagtttatgttgatgatgtatatgtaaattttgtggacaaactttattgctttcctgtaacaaacggcttacggtatatcaaagaagatactgacgcaaacacatgtcggtctggataacaggagccggtataacgtgtgatattctttgatcacccagaccactgatcacatatcaaaacatagacacttctgttaaacatgcctactatggatactacagtcaaacctgtcttaagcagccagccaagggaaaggaccaaattggccgcttaagacaggtggctgcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaagtatttttgtatattgg
gi|10 : agggaatgcatggagaacgatatgcataagctccgagcttacttcacaatcaagctaaattaaattaatgtaaaataaatgtatgtatgccaaattaacaggacagactgaaataacacattagacacaggaaataaaaactagtaaacgtaaatttctaggtgacctttttgaggttgtgattttatattgactaaagaacagcttttgatcatgaggaaggtttaaataaacaaaaaagaacatgtattcactgtctataaaatagtaaaaatattgttttcccgctttcctacaaaatcgatacgcctgatcacgtgcacgtaagcacataacaattaagccattataaaagctgtgaaaggggcaacaagtaagaaatgacaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGAA-GC--AGACTCAAGAGTTGTTCATATATGCTTTGAGTATCCTTCGCAATCAAGATAAAATTAA---CCAAT---TAACCAGAACCAATTTAAATGT-A-----ggatactacagtcaaacctgtcttaagcagccagccaagggaaaggaccaaattggccgcttaagacaggtggctgcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaagtatttttgtatattgg
gi|16 : gtttaaactattaaactacaaaaaaaatcactcagtactggttcaacttctacccaGCAAAAGCTCAGAGCTTATTTTGTAATGATGCTAAAATAAATTGTTAAT-GATAA----AA-------AAA-GT-AACAGTCGT----ATGACACAT--TTACATAACAGTAAC-AAAACAAgtttgtttt
gi|17 : CATAAATTCAGAGTTTACTTCACAATCAA-TTAACATAAA---TTAGaaaaata
gi|2 : ctagttctaccaaggaagcagacccaatagagatttttAGGGAATGC--A--CTGGAGA-----ATGCATAAGCTCCGAGCTTACTTCACAATCAAGCTAAATTAAA---TTAAT-G-TTA----AA------TAAATGA-A-----TGTTTGTATGCCAAAT--TAACACGACAG-ACC-GAAATAACACATTAGACACAAGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAATAGTAAATATATTATTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCATGTAAGTACGTAACAATTAAGCCATCATAAAAGCTGTGAAAGGCGCAACAAGTAAGAAATGACAACatacactaagaca
gi|2 : ccatgtagtttatataaatgttttattgtaaaacgcatgataaaacttattttggtcaacactttatcaattataacataaatatcaatatttagctgatcaaacaaaacatagatatgcggaaaattatatgattatgattctgtttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttgaactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttgtgaacaaatctacgtaaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattttactcgtgtacatctcattaaaataatagtaataaattaattgtattctaaaatataaagtgggtcagtagtatagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctctacccgacctctcgaaacacaattcagtaccagacctaataTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTGTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCAGGTTAAATAAAGATTTATTCATCGGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCTTCGTGATCAATGGACCGATAAATCACCAATTAACTATTTATTGACACACATGTGGTTCTCACCATGGGTATCTGTTTTGATGATTGCAATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTTTATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCACGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACATTTTTACAAGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATAAGAAATCACTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TATACATCCCTTAATACGTGTATGTCACACT--------TTCTACCAGT----CATTCA--GA--ACTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTTAAG---CGTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATG-ATTTTTTT-ATTTGTTGTTAATTGGCTAGCAGTTTTTCTTT-TTT-ATCCTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGCATATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGG----TGTGTTGCTGCATGTCATATAATTAGCGGTATAGCACAGTGGGTTTAGTTTCAAACAAGTTTATTATAGTTTGTCATTTTAAATAATGTATTAACATAAAGCATAC------TATCAGTAAAAGAA-TA---------------------ATTTGAGAAACCCACTGAAAAAAAG-TTCATTGCAAGTATATTTATATACATAATGATAACGAAAATAATTATAAAA-CTTAAAATATCAGAAT-ATCTTTTCTAAGTTTAGTGAAGCTACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATaataataataaagaagataaaatactcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttataaaaaatctgcatatttaagtattgattgtgactatatatttcttatccaatcacatgccgcaggttaaataaagatttattcatcgggcacaaattataatcaaaatgaaaattacacaccggcagggttcttcgtgatcaatggaccgataaatcaccaattaactatttattgacacacatgtggttctcaccatgggtatctgttttgatgattgcaatgcaactctgccttcataatagtaattaaattgttttattaattgtgaacgactgaccagatgcacgtacgcacgtatccaatataaaagctgtgacaaatcaataagtcaatatgtatattataataatagctccaatgataataatatttaaaaaaataaaacaaataatgaaagtaaaaaataatacaaataaaatactacatttttacaaggaattatttagagacatgtctttaatttttattagttttaaaattgtaggattgttttattttgtaaattaacaattctgatctgttttttataagaaatcactatggcagctgtggtaaaatgacagccctgaatatacatcccttaatacgtgtatgtcacactttctaccagtcattcagaactggcgtggggttttcggttcgttaatttaatgatattaacatcatgatatttacatacttaagcgttctgaaacttcgaataaccaatatcttaaatgatttttttatttgttgttaattggctagcagtttttcttttttatcctttcttttcaatcacataatgttggctcaattaagattcatccatctggcacgaattacaatcaaaatgaaatcatacatatcttccgtggtcaatagaccgataagtcaccgctttagcatatataacttaattgacacggctctcactggcatgtgacataacgtaattaacaccacgggtgtgttgctgcatgtcatataattagcggtatagcacagtgggtttagtttcaaacaagtttattatagtttgtcattttaaataatgtattaacataaagcatactatcagtaaaagaataatttgagaaacccactgaaaaaaagttcattgcaagtatatttatatacataatgataacgaaaataattataaaacttaaaatatcagaatatcttttctaagtttagtgaagctacatttggacccaaatcgagaaaaacactacaagattattatttttcaaaaatcatttattata
gi|3 : ccatgtagtttatataaatgttttattgtaaaacgcatgataaaacttattttggtcaacactttatcaattataacataaatatcaatatttagctgatcaaacaaaacatagatatgcggaaaattatatgattatgattctgtttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttgaactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttgtgaacaaatctacgtaaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattttactcgtgtacatctcattaaaataatagtaataaattaattgtattctaaaatataaagtgggtcagtagtatagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctctacccgacctctcgaaacacaattcagtaccagacctaataagggaatgcactggagaatgcataagctccgagcttacttcacaatcaagctaaattaaattaatgttaaataaatgaatgtttgtatgccaaattaacacgacagaccgaaataacacattagacacaagaaataaaaactagtaaacgtaaatttctaggtgacctttttgaggttgtgattttatattgactaaagaacagcttttgatcatgaggaaggtttaaataaacaaaaaagaacatgtattcactgcctataaaatagtaaatatattattttcccgctttcctacaaaatcgatacgcctgatcacgtgcatgtaagtacgtaacaattaagccatcataaaagctgtgaaaggcgcaacaagtaagaaatgacaacaataataataaagaagataaaatactcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGGAATGC--A--CTGGAGAAAGACATGCATAAGCTCCGAGCTTACTTGACAATCAAGCTAAATTAAA---TTAAT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----TGT----ATGCCAAAT--TAACAAGACAG-ACC-GAAATAACACATTAGACATAGGAAATAAAAACTAGCAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAATAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAAAAGTAAATATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCATGTAAGCACGTAACAATTAAGCCACTATAAAAGTTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAACa
gi|3 : atttgccgtgttatttcgatataaattagttatagaacatataaaacatgtactttatttcgatttaagcgtatactgctccaaatacaaaaatatcaaagcatgcgtgaatcaaacaaaacatagatatgtgtataattatatgattatgattctatttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttggactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttataaacaaatctacgtaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattatactcgtgcacatctcattaaaaaaataataataaattaattgtattctaaaatataaaatgggtcagtagtacagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctttacccgacctctcaaaacacaattcagtaccagatctaataTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTTGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCGTTGTGATCAATGGACCGATAAATCACCAATAAACTATTTATTGACACACATGTGGTTCTCATCATGCGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCTTTCATTATAGTAATTTAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCACGTATCCAATATAAAAGCTGTCAACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTTCAAAAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACA-TTTTACAAGGAATTATTTAAATACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTG-TTTTTATACGAAATCGCTATAGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTTATACGTGTATGTCACACTTTCTACCAT--------T----CACTCA--GA--GCTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTAAAG---CGTTCTGATACTTCGAATAACCAATATCTTAAAT-AATTTTTTT-ATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTCTTTCTTA-TTTTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAAATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACCTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaattataaaaaatctgcatatttaagtattgattttgactatatatttcttatccaatcacatgccgcgggttaaataaagattcattcatcttgcacaaattataatcaaaatgaaaattacacaccggcagggttcgttgtgatcaatggaccgataaatcaccaataaactatttattgacacacatgtggttctcatcatgcgtatctgttttgatgattgccatgcaactctgctttcattatagtaatttaattgttatattaattgtgaacgactgaccagatgcacgtacgcacgtatccaatataaaagctgtcaacaaatcaataagtcaatatgtatattataataatagctccaatgataataatatttcaaaaaaaaataaaacaaataatgaaagtaaaaaataatacaaataaaatactacattttacaaggaattatttaaatacatgtctttaatttttattagttttaaaattgtaggattgttttattttgtaaattaacaattctgatctgtttttatacgaaatcgctatagcagctgtggtaaaatgacagccctgaatacacatccctttatacgtgtatgtcacactttctaccattcactcagagctggcgtggggttttcggttcgttaatttaatgatattaacatcatgatatttacatactaaagcgttctgatacttcgaataaccaatatcttaaataatttttttatttgttgttaattggctggcagtttttctttcttatttttttcttttcaatcacataatgttggctcaattaaaattcatccatctggcacgaattacaatcaaaatgaaatcatacatatcttccgtggtcaatagaccgataagtcaccgctttagcatataacctaattgacacggctctcactggcatgtgacataacgtaattaacacca
gi|4 : atttgccgtgttatttcgatataaattagttatagaacatataaaacatgtactttatttcgatttaagcgtatactgctccaaatacaaaaatatcaaagcatgcgtgaatcaaacaaaacatagatatgtgtataattatatgattatgattctatttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttggactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttataaacaaatctacgtaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattatactcgtgcacatctcattaaaaaaataataataaattaattgtattctaaaatataaaatgggtcagtagtacagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctttacccgacctctcaaaacacaattcagtaccagatctaataagggaatgcactggagaaagacatgcataagctccgagcttacttgacaatcaagctaaattaaattaatgtaaaataaatgtatgtatgccaaattaacaagacagaccgaaataacacattagacataggaaataaaaactagcaaacgtaaatttctaggtgacctttttgaggttgtgattttatattgactaaagaacagcttttgatcatgaggaaggtttaaataaacaataaagaacatgtattcactgcctataaaaaagtaaatatattgttttcccgctttcctacaaaatcgatacgcctgatcacgtgcatgtaagcacgtaacaattaagccactataaaagttgtgaaaggggcaacaagtaagaaatgacaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaATGCTAGTTGTGGTAAATTTACAGCCCTGAAAATACACATTCCTTAATATGCGTATGTCACACT--------T--------TCTACCATTCACTCATTACTGGTTATATTTTATGACGTGGGGTTTTTGTTTCGTTAATGAACGAAACGAAAATCACAAGTAATAAAAAATATATTATATTAACATCATGG-GTTTACATGCAAAAGTATTGTTCTGAAACCTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTGTTTGATTTGTTGTTAATTGGTTGGCAGTTTTTCTTAC----ATATTTT-CTTTTCAATCATATACTGCGGGTTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACTTATTACAATC-AAATGAAATCATACATATCAGCAGGGTTCTTCCGTGGT-------CCGATAAGTCACCACTTTAGC--ATATAATTTAATTGACACGGCTCTTACTGGCATGTGACATACTAGTAACGTCATTAACACCATGGGTGTCTGTGTTGTTGCGTGTCATATAAGTAGCGGTATAGCACAGCGGGTATATTTTCAAACAAATTTAATATAGTTCGTCATTTT---TAA---ATTAACATAAATCATACTGCATGTATCAGTAAAAAAA-TAATGAAGCCACATTTGCAACCAATTTGAGAAGCACACTG---AAAAG-TTCATTTAAGGTACATATATATACATAATGATAACAAAAATATTTATAAAATCTTATAGTATCTGAATAATTTTTTTTAAGTTTAGTGAAACCACATTTGAA-CCAAATCGAGTAAAACACTACAAGATT-T--TTTTTCAAAAATCATTTATCA-T----ATGTCAAATTCTATC-CGTGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCATACAATGCATA------TTATAGATTATAAAGCTGATTTTT-GTTTGAACATTAACAAAA-CCAGTGACATATCCACATGTTGTTAAGTCGCTGCTTACACTAATCAAATTAATGGATTACTGTTAAGCCAAACATGTATAAATGGTATGGAATTATTAA-TAA---CAAAT-------ACAATATATCTAGTGATATCTATGTTGTTGATGTATCTGTAAATTTTATGGACAACATTT-TTTTGCTTTATTGTTACAAACGGCTAACGGTTTATCAAAGAAGTCACTGACCCACACACATTTCTGTCTGGATAATACAAGTCGGCTGAACTTGGGGTATTCTTTGATCACACAGACCACTGATCACATATCAAAATATAGACTCTTCCATTAAACTTCCCTACTAT
gi|5 : aaataaaaccactaaatcgtaagtttaatgcctatgcatgcacgtttatttattgttgttttaaattcatttagcttacatcaaaattcaacatccaga-------------CGTGGGGTTTTCGTTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTG-----ATATCATGG-GTTTACATACTAAAGTATTGTTCTGAAACCTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTGTTTGATTTGTTGTTAATTGACTGGCAGTTTTTCTTA---T-ATCTTTTTCTTTTCAATCATATACTGAGGTTTTAATTAAGATTCGTCCCTCTGGCACTAATTACAATCAAAATGAAAGCATCCGCAGGGT------TCTTCCGTGGGCAAAAGACCGGTAAGTCACCACTTTGGC--ATATAATTTAATTGAAACGGATCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGGTGTCTGTATTGCTGCGTGTCATATAAGTAGCGGTATAGCACAGTGGGTATA-TTTTAAACAAGTTTAATATAGTTTGT-ATTTTAGTTAATATATTAACATGAATCATAC------TATCAGTAAAAAAAATA---------------------ATTTGAGAAAC--ACTG-AAAAAAGGTTAATTTCAGGTACATATATATACATAATGATAACGAACATATTTATTAAATCTTATAATATCAAACT-ATCTTTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTAGACCCAAAGCTAGAAAAACACTACAAAATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATTTTATATGTCAAATCCCATTGCGCAAATTATTATAAATTTTTCATCACCCGTGCAGTGCATAATTTTATTATTGATTATAAAGCTGATTTTTAAGTT--ACAATAACAAAAACCAGTGACAAATCCACATATTGTTAGGTCACTGCTTATACTGATCAAATGAATGGATTACTGTTAATCCAAAGATGTATAAGCGGTATTGAATTGTTAA-TAA---CAATT-------ACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATCTGTAAATTTTGTGGAC-A-ACTTGTTTTGCTTTCTTGTAATAAACGGCTTATGGTATTTCAAAGAAGTTACTGACGCAAACACATctgtaatgatttattcaaaattgacaacctttcgtccagcgggtgacaaaatatgtagacaaacaatcggattatgaatccaattaccatgactaaatcctgtcactgcattttatttattgctccattggaacagcttaaattaaagaaaatgaattaatttaagagttgagatgttgcgattggttatgggccagaaaccgaattgagcggactgaaagttgagtcaacttgaacgaacaaagttaacgttgaga
gi|7 : tactttctaccattcactcagtaatggttatattttataaAGGAAACGG--A--CTTGAAAGCATTACAAATAACCTTTGTGCTTTCTTCACAACTGAGCTAAGAGTAA---TTAGT-A-TAA----AC------TAAATCTTA-----CTT----GT-CCAAATTATAAAAGAACAA-GTTAAAAACAACATGCTAAA
gi|8 : ctttttaaaatcatggttgtcaactaactaaataaatctaatacaagtttgttcatttttaaagaaggcagagcgatagtgtagtggatagagtgctcgccagtcatgtcagaggttgcgggtttgattctcagcttgacctgatacttcttaaaaaaacaacactcagttatggttctacccAGCGGATGC--A------AGAGTGGTTCATATAAGCTCTGAGTTTTCATGACAATCCAGCTAAAATAAA---TTAGTAG-TAA----ata
gi|9 : gttaaaactacattaactgtcgatgtaaggaattgatcattttaaaactgcagaaggagtgatagtgtactggatagagtgttggcctctaatgccagaggttgcaatccccagttcgacccgatatctctcataaaacaacactcagttctagttctaccagctggaGGAA-GCTGA--CTTGAGAGCGGTCAATATAAGCTCTGAGCTGTCTTTGCAATCAAGCTAAAATAAA---TTAGT-A-TAC----AC------TAAActaaaactgagttg
blockSeqs : T TG GAC C GTTG TC T C TTG GA CCAG CCAATT T ACAGTCGT TA T T A A C CAA T T AA TTCTACCAGT CTCATT TTATATTTTATGA GAACGAAACGAAAATCACAAG AAAATA TATTA T TAT AA G TCTTA T TCAGCAGGGT T AT TACTAG T C T T G C AAA TG G TGCATG A ATGAAGCCACATTTGCAACCA C AA G G T A T A A C A T T TTAT G ATTTTA T A T G A . . . TGATA A C G T T C TG T G A T T C
blockSeqs : T . C G AAGA AT A A . AG . . . TGTTTGT . C . . A . . . . . TTCTACCATT GA . T . . T TAT AA G TTTT . GGGT T . . T C G A T C AGT TA T . . . A A . T A T T T . C A T T . . . T . G . . . . . . . . .
blockSeqs : C . C G GCAT AT A A . G . . . TGT . A . . G . TTCTAC GA . T . . . . AA . AC . . A . . . . G A . . . . T . . . . . . T A T . T . . . . .
blockSeqs : T . C T GTGG AC C A . G . . . CTT . G . . . T . . . . A . AT . . . . .
blockSeqs : . . C T GCGG TC C A . A . . .
blockSeqs : . . . . . CA T T . A . .
blockSeqs : T T . . .
blockSeqs : T T .
blockSeqCons : C** *** AA AC****
originalCons : AGGGAATGC--A--CTNGAGAGCGGTACGCATAAGCTCCGAGCTTNCTTCGCAATCAAGCTAAAATAAA---TTAGT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----CGT----ATGCCAAAT--TAACANGACAG-ACC-GAAATAACACGTTAGACACAGGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAATAGTAAATATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCACGTAAGCACGTAACAATTAAGCCATTATAAAAGCTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCTTCGTGATCAATGGACCGATAAATCACCAATTAACTATTTATTGACACACATGTGGTTCTCACCATGGGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCGCGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACATTTTTACAAGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATACGAAATCGCTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTAATACGTGTATGTCACACT--------T--------T----CATTCA--GA--ACTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTAAAGTATCGTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTTTTTGATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTCTTTCTTT-ATCTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGGTGTCTGTGTTGCTGCGTGTCATATAANTAGCGGTATAGCACAGTGGGTATAGTTTCAAACAAGTTTAATATAGTTTGTCATTTTAAATAATATATTAACATAAANCATAC------TATCAGTAAAAGAA-TA---------------------ATTTGAGAAACCCACTG-AAAAAAG-TTCATTNCAGGTACATNTATATACATAATGATAACGAAAATANTTATAAAATCTTANAATATCAGAAT-ATCTTTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATT----ATGTCGAATTCTATCGCGCGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCGTGCAGTGCATA------TTATTGATTATAAAGCTGATTTTTAGNTTGAACATTAACAAAA-CCAGTGACATATCCACATGTTGTTAAGTCGCTGCTTACACTGATCAAATTAATGGATTACTGTTAAGCCAAAGATGTATAAACGGTATGGAATTATTAA-TAA---CAATT-------ACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATCTGTAAATTTTGTGGACAA-ACTT-TTTTGCTTTCTTGTAACAAACGGCTTACGGTATATCAAAGAAGTTACTGACGCAAACACATNTCNGTCTGGATAACACGAGCCGGCNNAACNTGNGGTATTCTTTGATCACNCAGACCACTGATCACATATCAAAACATAGACNCTTCCGTTAAACNTNCCTACTAT
finalCons : AGGGAATGC--AC--TNGAGAGCGGTACGCATAAGCTCCGAGCTTNCTTCGCAATCAAGCTAAAATAAA---TTAGT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----CGT----ATGCCAAAT--TAACANGACAG-ACC-GAAATAACACGTTAGACACAGGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAATAGTAAATATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCACGTAAGCACGTAACAATTAAGCCATTATAAAAGCTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCTTCGTGATCAATGGACCGATAAATCACCAATTAACTATTTATTGACACACATGTGGTTCTCACCATGGGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCGCGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACATTTTTACAAGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATACGAAATCGCTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTAATACGTGTATGTCACACT--------T--------T----CATTCA--GA--ACTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTAAAG---CGTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTTTTTGATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTCTTAC----ATCTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGGTGTCTGTGTTGCTGCGTGTCATATAANTAGCGGTATAGCACAGTGGGTATAGTTTCAAACAAGTTTAATATAGTTTGTCATTTTAAATAATATATTAACATAAANCATAC------TATCAGTAAAAGAA-TA---------------------ATTTGAGAAACCCACTG-AAAAAAG-TTCATTNCAGGTACATNTATATACATAATGATAACGAAAATANTTATAAAATCTTANAATATCAGAAT-ATCTTTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATT----ATGTCGAATTCTATCGCGCGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCGTGCAGTGCATA------TTATTGATTATAAAGCTGATTTTTAGNTTGAACATTAACAAAA-CCAGTGACATATCCACATGTTGTTAAGTCGCTGCTTACACTGATCAAATTAATGGATTACTGTTAAGCCAAAGATGTATAAACGGTATGGAATTATTAA-TAA---CAATT-------ACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATCTGTAAATTTTGTGGACAA-ACTT-TTTTGCTTTCTTGTAACAAACGGCTTACGGTATATCAAAGAAGTTACTGACGCAAACACATNTCNGTCTGGATAACACGAGCCGGCNNAACNTGNGGTATTCTTTGATCACNCAGACCACTGATCACATATCAAAACATAGACNCTTCCGTTAAACNTNCCTACTAT
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): AACACATTCCCTATTATGAGTAATGGTTTATCCAAAATTTACAACCTTTCGCCAAGTGGGTGACACAATATGTAGACAAACAATCAGATTATGAATTCAATTACCTTGACTAAAATCCCATGAATACATTTTATTAATTGCTCCATTTTTAACAGCTTCAATTATAAAGTCAATATGGAATTATTTTAAGAGTTGAGAGGTTTGCGATTGCCATTGGTAACCAAACTGAGCAACTGAACAATGAGTGAATGCTGAAGGAACGAAGCGAACACTGAGAGGAGTATAAAATAAAGATAGTGAGCGAATACTTGCGTTTGTGAGTGTATTAGTTTAACCGCACGCAAACGGAGCGTAACTGGAGCGCAATTATGGGGAACTTGAGCAGTTTAGGTTCTGTAATGGTGTGTAAGTGAT
Unaligned ( gi|11 ): AGTGAATTGTGTTAGCCGCTTACGTCAGAGGTCACATGTTTAATCCCACTGATATCCACTCCCCTTCATAAAAAAAAATGCTCGGTTCCACCCTGGAAACGACATGAGCAGTTCATTTAACCTTCACAAAGCTTTACCTTCAGGACTGCGTTCA
Unaligned ( gi|12 ): AAACAATGTACACCATTTTTAGACAATTTTAGAGTTATTTTATAGTAGTGCAGAGGATAGATTGTTTGTCATTCACGCAAGAGGTTGCAGGTTTGATCGCCAGCTCGACCTAATGTGTCTTTAAAAGCAACACTTATAACTGGTTCA
Unaligned ( gi|13 ): TCAATGTTGGCAGGTGGCACAGTGGATAGAGTGTTGGCTGATCACTCCAGATGTTTGCTCCCATGCTCCAGCGAATGACCTCTTAATAACAACACTTAGTATTCATTCTGCTCATGAAACAGACTCCAGAGCCATCTA
Unaligned ( gi|14 ): TTTGCCTTGCTATTTCGATATAAATTAGTTATAGAACATACAGAACATATATTTCAATTGGATTTAAGCGTATGCAGCTCTAAACACAAAAAATCAATGCATTTGTGAATCAAACAAAACATAGATA
Unaligned ( gi|15 ): TATTGTTTAAAACTTTTTATCAAAGGTCGAGAGTTGTTGATACATAGATAGTGCAATGGATAGAGTGTTGGTCACTCACATAAGATGTAACAGGTTCGATCCGACATTTAGT
Alignments
lowQualScore : 111 111 1111 111111 111111111111 11 1 222 11 7777777777777777777777 111111 4444444444444 666666666666666666666 222222 22222 1 2222222 2 11 333333 5555555555 11 222222 222222 1 888888888888888888888 11 1 1 2222 333333 1 1 222 4444444 33333 1 1
lowQualScore : 7 77 222 3 4444 22 2 1 0 777 000 0000 666666 6 999999999999 11 1 8 8 2 0 0 3 333 7 7 33 5555555555555555555555 444444 4444444444444 111111111111111111111 333333 00000 0 4444444 11 0 0 11 444444 8 8 0 0 0 2222222222 1 11 333333 3 8 1 1 8 2 777 44 1 888888 0 555555555555555555555 8 33 0 1 1 1 9 1 0 2 3 3 3 8888 0 6 0 888888 7 7 1 6 3 0 3 333 3333333 33333 7 3 3 1 1 2 22 1 1 1 1 1 1
lowQualScore : . .. ... . .... .. . . . ... ... .... ...... . ............ .. . . . . . . . ... . . .. ...................... ...... ............. ..................... ...... ..... . ....... .. . . .. ...... . . . . . .......... . .. ...... . . . . . . ... .. . ...... . ..................... . .. . . . . . . . . . . . .... . . . ...... . . . . . . . ... ....... ..... . . . . . . .. . . . . . .
lowQualScore : 1 99 111 0 6666 33 7 0 7 888 222 6666 444444 7 333333333333 00 0 0 0 0 7 7 3 333 3 3 88 8888888888888888888888 888888 0000000000000 000000000000000000000 000000 00000 6 4444444 66 6 0 00 222222 0 0 6 6 8 0000000000 0 00 000000 2 8 0 2 8 5 555 00 0 888888 0 000000000000000000000 8 22 0 0 0 0 8 0 0 5 2 2 2 3333 7 7 7 333333 3 3 0 7 3 7 3 333 3333333 33333 3 3 3 0 0 5 00 0 0 0 0 0 0
consensus : AGGGAATGC--A--CTNGAGAGCGGTACGCATAAGCTCCGAGCTTNCTTCGCAATCAAGCTAAAATAAA---TTAGT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----CGT----ATGCCAAAT--TAACANGACAG-ACC-GAAATAACACGTTAGACACAGGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAATAGTAAATATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCACGTAAGCACGTAACAATTAAGCCATTATAAAAGCTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCTTCGTGATCAATGGACCGATAAATCACCAATTAACTATTTATTGACACACATGTGGTTCTCACCATGGGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCGCGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACATTTTTACAAGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATACGAAATCGCTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTAATACGTGTATGTCACACT--------T--------T----CATTCA--GA--ACTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTAAAG---C---GTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTTTTTGATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTC--TTTTTT--A-TCTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGGTGTCTGTGTTGCTGCGTGTCATATAANTAGCGGTATAGCACAGTGGGTATAGTTTCAAACAAGTTTAATATAGTTTGTCATTTTAAATAATATATTAACATAAANCATAC------TATCAGTAAAAGAA-TA---------------------ATTTGAGAAACCCACTG-AAAAAAG-TTCATTNCAGGTACATNTATATACATAATGATAACGAAAATANTTATAAAATCTTANAATATCAGAAT-ATCTTTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATT----ATGTCGAATTCTATCGCGCGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCGTGCAGTGCATA------TTATTGATTATAAAGCTGATTTTTAGNTTGAACATTAACAAAA-CCAGTGACATATCCACATGTTGTTAAGTCGCTGCTTACACTGATCAAATTAATGGATTACTGTTAAGCCAAAGATGTATAAACGGTATGGAATTATTAA-TAA---CAATT-------ACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATCTGTAAATTTTGTGGACAA-ACTT-TTTTGCTTTCTTGTAACAAACGGCTTACGGTATATCAAAGAAGTTACTGACGCAAACACATNTCNGTCTGGATAACACGAGCCGGCNNAACNTGNGGTATTCTTTGATCACNCAGACCACTGATCACATATCAAAACATAGACNCTTCCGTTAAACNTNCCTACTAT
Reference ( family-1016 ) : AGGGAATGC--A--CTNGAGAGCGGTACGCATAAGCTCCGAGCTTNCTTCGCAATCAAGCTAAAATAAA---TTAGT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----CGT----ATGCCAAAT--TAACANGACAG-ACC-GAAATAACACGTTAGACACAGGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAATAGTAAATATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCACGTAAGCACGTAACAATTAAGCCATTATAAAAGCTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCTTCGTGATCAATGGACCGATAAATCACCAATTAACTATTTATTGACACACATGTGGTTCTCACCATGGGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCGCGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACATTTTTACAAGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATACGAAATCGCTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTAATACGTGTATGTCACACT--------T--------T----CATTCA--GA--ACTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTAAAG---C---GTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTTTTTGATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTC--TTAC----A-TCTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGGTGTCTGTGTTGCTGCGTGTCATATAANTAGCGGTATAGCACAGTGGGTATAGTTTCAAACAAGTTTAATATAGTTTGTCATTTTAAATAATATATTAACATAAANCATAC------TATCAGTAAAAGAA-TA---------------------ATTTGAGAAACCCACTG-AAAAAAG-TTCATTNCAGGTACATNTATATACATAATGATAACGAAAATANTTATAAAATCTTANAATATCAGAAT-ATCTTTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATT----ATGTCGAATTCTATCGCGCGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCGTGCAGTGCATA------TTATTGATTATAAAGCTGATTTTTAGNTTGAACATTAACAAAA-CCAGTGACATATCCACATGTTGTTAAGTCGCTGCTTACACTGATCAAATTAATGGATTACTGTTAAGCCAAAGATGTATAAACGGTATGGAATTATTAA-TAA---CAATT-------ACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATCTGTAAATTTTGTGGACAA-ACTT-TTTTGCTTTCTTGTAACAAACGGCTTACGGTATATCAAAGAAGTTACTGACGCAAACACATNTCNGTCTGGATAACACGAGCCGGCNNAACNTGNGGTATTCTTTGATCACNCAGACCACTGATCACATATCAAAACATAGACNCTTCCGTTAAACNTNCCTACTAT
gi|1 : AGGGAATGC--A---TGGAGAACGATATGCATAAGCTCCGAGCTTACTTCACAATCAAGCTAAATTAAA---TTAAT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----TGT----ATGCCAAAT--TAACAGGACAG-ACT-GAAATAACACATTAGACACAGGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGTCTATAAAATAGTAAAAATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCACGTAAGCACATAACAATTAAGCCATTATAAAAGCTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAAC
gi|1 : TTATAAAAAATCTGCATATTTTAGTATTGACTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACAATGGCAGGGTTCTTCGTGATCAATGGACAGATAAATCACCAATTAACTATTTATTGATACACATGTGGTTCTCACCATCGGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCAAGTATGCGCGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAGTCAATAAGTCTACATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATCT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACCTTTTTACAGGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTAATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATACGAAATCGCTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTAATACATGTATGTCACACT--------T--------T----CATTCA--GA--ACTAG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCATTAAT--------------T------TAATGG------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTAAAT---C---GTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATGA-TTTTTTT-ATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTC--TTTTTTTTA-TCTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATAATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGTATGTGACA------TAACGTGATTAACACCACGGGTGT----GTTGCTGCGTGTCATATAATTAGCAGTATAGCACAGTGGGTGTAGTTTCAAACAAGTTTAATATAGTTTGTCACTTTAAATAATATATTAACATAAAGCATAC------TATCAGTAAAAGAA-TA---------------------ATTTGAGAAACCCACTG-AAAAAAG-TTCATTGCAAGTATATTTATATACATAATGATAACGAAAATAATTATAAAAACTTAAAATATCAGAAT-ATCTCTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATC----ATGTCGAATTGTATCGCACGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCATGCAGTGCATA------TTATTGATTATAAAGCTTA-TTTTAGATTGAACATTAACAAAA-CCAGTCATATATCCACATGTTGTTAAGTCACTGCTTACACTGAGCAGATTTATGGATTATTATAAGGCCAACGAGGTATCAACAGTATGGAATTATTAATTAAATTTAATTATTAATAACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATATGTAAATTTTGTGGACAA-ACTT-TATTGCTTTCCTGTAACAAACGGCTTACGGTATATCAAAGAAGATACTGACGCAAACACATGTCGGTCTGGATAACAGGAGCCGGTATAACGTGTGATATTCTTTGATCACCCAGACCACTGATCACATATCAAAACATAGACACTTCTGTTAAACATGCCTACTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttataaaaaatctgcatattttagtattgactttgactatatatttcttatccaatcacatgccgcgggttaaataaagattcattcatctggcacaaattataatcaaaatgaaaattacacaatggcagggttcttcgtgatcaatggacagataaatcaccaattaactatttattgatacacatgtggttctcaccatcggtatctgttttgatgattgccatgcaactctgccttcataatagtaattaaattgttatattaattgtgaacgactgaccagatgcaagtatgcgcgtatccaatataaaagctgtgacaagtcaataagtctacatgtatattataataatagctccaatgataataatatctaaaaaaataaaacaaataatgaaagtaaaaaataatacaaataaaatactacctttttacagggaattatttagagacatgtctttaattttaattagttttaaaattgtaggattgttttattttgtaaattaacaattctgatctgttttttatacgaaatcgctatggcagctgtggtaaaatgacagccctgaatacacatcccttaatacatgtatgtcacactttcattcagaactagcgtggggttttcggttcattaatttaatggtattaacatcatgatatttacatactaaatcgttctgaaacttcgaataaccaatatcttaaatgatttttttatttgttgttaattggctggcagtttttcttttttttatcttttcttttcaatcacataatgttggctcaattaagattcatccatctggcacgaattacaatcaaaatgaaataatacatatcttccgtggtcaatagaccgataagtcaccgctttagcatataacttaattgacacggctctcactggtatgtgacataacgtgattaacaccacgggtgtgttgctgcgtgtcatataattagcagtatagcacagtgggtgtagtttcaaacaagtttaatatagtttgtcactttaaataatatattaacataaagcatactatcagtaaaagaataatttgagaaacccactgaaaaaagttcattgcaagtatatttatatacataatgataacgaaaataattataaaaacttaaaatatcagaatatctcttttaagtttagtgaagccacatttggacccaaatcgagaaaaacactacaagattattatttttcaaaaatcatttattatcatgtcgaattgtatcgcacggattataataaatttttcatcacccatgcagtgcatattattgattataaagcttattttagattgaacattaacaaaaccagtcatatatccacatgttgttaagtcactgcttacactgagcagatttatggattattataaggccaacgaggtatcaacagtatggaattattaattaaatttaattattaataacaatatatttagtttatgttgatgatgtatatgtaaattttgtggacaaactttattgctttcctgtaacaaacggcttacggtatatcaaagaagatactgacgcaaacacatgtcggtctggataacaggagccggtataacgtgtgatattctttgatcacccagaccactgatcacatatcaaaacatagacacttctgttaaacatgcctactatggatactacagtcaaacctgtcttaagcagccagccaagggaaaggaccaaattggccgcttaagacaggtggctgcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaagtatttttgtatattgg
gi|10 : agggaatgcatggagaacgatatgcataagctccgagcttacttcacaatcaagctaaattaaattaatgtaaaataaatgtatgtatgccaaattaacaggacagactgaaataacacattagacacaggaaataaaaactagtaaacgtaaatttctaggtgacctttttgaggttgtgattttatattgactaaagaacagcttttgatcatgaggaaggtttaaataaacaaaaaagaacatgtattcactgtctataaaatagtaaaaatattgttttcccgctttcctacaaaatcgatacgcctgatcacgtgcacgtaagcacataacaattaagccattataaaagctgtgaaaggggcaacaagtaagaaatgacaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGAA-GC--AGACTCAAGAGTTGTTCATATATGCTTTGAGTATCCTTCGCAATCAAGATAAAATTAA---CCAAT---TAACCAGAACCAATTTAAATGT-A-----ggatactacagtcaaacctgtcttaagcagccagccaagggaaaggaccaaattggccgcttaagacaggtggctgcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaagtatttttgtatattgg
gi|16 : gtttaaactattaaactacaaaaaaaatcactcagtactggttcaacttctacccaGCAAAAGCTCAGAGCTTATTTTGTAATGATGCTAAAATAAATTGTTAAT-GATAA----AA-------AAA-GT-AACAGTCGT----ATGACACAT--TTACATAACAGTAAC-AAAACAAgtttgtttt
gi|17 : CATAAATTCAGAGTTTACTTCACAATCAA-TTAACATAAA---TTAGaaaaata
gi|2 : ctagttctaccaaggaagcagacccaatagagatttttAGGGAATGC--A--CTGGAGA-----ATGCATAAGCTCCGAGCTTACTTCACAATCAAGCTAAATTAAA---TTAAT-G-TTA----AA------TAAATGA-A-----TGTTTGTATGCCAAAT--TAACACGACAG-ACC-GAAATAACACATTAGACACAAGAAATAAAAACTAGTAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAAAAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAATAGTAAATATATTATTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCATGTAAGTACGTAACAATTAAGCCATCATAAAAGCTGTGAAAGGCGCAACAAGTAAGAAATGACAACatacactaagaca
gi|2 : ccatgtagtttatataaatgttttattgtaaaacgcatgataaaacttattttggtcaacactttatcaattataacataaatatcaatatttagctgatcaaacaaaacatagatatgcggaaaattatatgattatgattctgtttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttgaactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttgtgaacaaatctacgtaaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattttactcgtgtacatctcattaaaataatagtaataaattaattgtattctaaaatataaagtgggtcagtagtatagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctctacccgacctctcgaaacacaattcagtaccagacctaataTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTGTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCAGGTTAAATAAAGATTTATTCATCGGGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCTTCGTGATCAATGGACCGATAAATCACCAATTAACTATTTATTGACACACATGTGGTTCTCACCATGGGTATCTGTTTTGATGATTGCAATGCAACTCTGCCTTCATAATAGTAATTAAATTGTTTTATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCACGTATCCAATATAAAAGCTGT-GACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTT---AAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACATTTTTACAAGGAATTATTTAGAGACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTGTTTTTTATAAGAAATCACTATGGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TATACATCCCTTAATACGTGTATGTCACACT--------TTCTACCAGT----CATTCA--GA--ACTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTTAAG---C---GTTCTGAAACTTCGAATAACCAATATCTTAAATG-ATTTTTTT-ATTTGTTGTTAATTGGCTAGCAGTTTTTCTTTTTT----A-TCCTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGCATATATAACTTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGG----TGTGTTGCTGCATGTCATATAATTAGCGGTATAGCACAGTGGGTTTAGTTTCAAACAAGTTTATTATAGTTTGTCATTTTAAATAATGTATTAACATAAAGCATAC------TATCAGTAAAAGAA-TA---------------------ATTTGAGAAACCCACTGAAAAAAAG-TTCATTGCAAGTATATTTATATACATAATGATAACGAAAATAATTATAAAA-CTTAAAATATCAGAAT-ATCTTTTCTAAGTTTAGTGAAGCTACATTTGGACCCAAATCGAGAAAAACACTACAAGATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATaataataataaagaagataaaatactcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttataaaaaatctgcatatttaagtattgattgtgactatatatttcttatccaatcacatgccgcaggttaaataaagatttattcatcgggcacaaattataatcaaaatgaaaattacacaccggcagggttcttcgtgatcaatggaccgataaatcaccaattaactatttattgacacacatgtggttctcaccatgggtatctgttttgatgattgcaatgcaactctgccttcataatagtaattaaattgttttattaattgtgaacgactgaccagatgcacgtacgcacgtatccaatataaaagctgtgacaaatcaataagtcaatatgtatattataataatagctccaatgataataatatttaaaaaaataaaacaaataatgaaagtaaaaaataatacaaataaaatactacatttttacaaggaattatttagagacatgtctttaatttttattagttttaaaattgtaggattgttttattttgtaaattaacaattctgatctgttttttataagaaatcactatggcagctgtggtaaaatgacagccctgaatatacatcccttaatacgtgtatgtcacactttctaccagtcattcagaactggcgtggggttttcggttcgttaatttaatgatattaacatcatgatatttacatacttaagcgttctgaaacttcgaataaccaatatcttaaatgatttttttatttgttgttaattggctagcagtttttcttttttatcctttcttttcaatcacataatgttggctcaattaagattcatccatctggcacgaattacaatcaaaatgaaatcatacatatcttccgtggtcaatagaccgataagtcaccgctttagcatatataacttaattgacacggctctcactggcatgtgacataacgtaattaacaccacgggtgtgttgctgcatgtcatataattagcggtatagcacagtgggtttagtttcaaacaagtttattatagtttgtcattttaaataatgtattaacataaagcatactatcagtaaaagaataatttgagaaacccactgaaaaaaagttcattgcaagtatatttatatacataatgataacgaaaataattataaaacttaaaatatcagaatatcttttctaagtttagtgaagctacatttggacccaaatcgagaaaaacactacaagattattatttttcaaaaatcatttattata
gi|3 : ccatgtagtttatataaatgttttattgtaaaacgcatgataaaacttattttggtcaacactttatcaattataacataaatatcaatatttagctgatcaaacaaaacatagatatgcggaaaattatatgattatgattctgtttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttgaactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttgtgaacaaatctacgtaaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattttactcgtgtacatctcattaaaataatagtaataaattaattgtattctaaaatataaagtgggtcagtagtatagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctctacccgacctctcgaaacacaattcagtaccagacctaataagggaatgcactggagaatgcataagctccgagcttacttcacaatcaagctaaattaaattaatgttaaataaatgaatgtttgtatgccaaattaacacgacagaccgaaataacacattagacacaagaaataaaaactagtaaacgtaaatttctaggtgacctttttgaggttgtgattttatattgactaaagaacagcttttgatcatgaggaaggtttaaataaacaaaaaagaacatgtattcactgcctataaaatagtaaatatattattttcccgctttcctacaaaatcgatacgcctgatcacgtgcatgtaagtacgtaacaattaagccatcataaaagctgtgaaaggcgcaacaagtaagaaatgacaacaataataataaagaagataaaatactcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGGAATGC--A--CTGGAGAAAGACATGCATAAGCTCCGAGCTTACTTGACAATCAAGCTAAATTAAA---TTAAT-G-TAA----AA------TAAATGT-A-----TGT----ATGCCAAAT--TAACAAGACAG-ACC-GAAATAACACATTAGACATAGGAAATAAAAACTAGCAAACGTAAATTTCTAGGTGACCTTTTTGAGGTTGTGATTTTATATTGACTAAAGAACAGCTTTTGATCATGAGGAAGGTTTAAATAAACAATAAAGAACATGTATTCACTGCCTATAAAAAAGTAAATATATTGTTTTCCCGCTTTCCTACAAAATCGATACGCCTGATCACGTGCATGTAAGCACGTAACAATTAAGCCACTATAAAAGTTGTGAAAGGGGCAACAAGTAAGAAATGACAACa
gi|3 : atttgccgtgttatttcgatataaattagttatagaacatataaaacatgtactttatttcgatttaagcgtatactgctccaaatacaaaaatatcaaagcatgcgtgaatcaaacaaaacatagatatgtgtataattatatgattatgattctatttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttggactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttataaacaaatctacgtaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattatactcgtgcacatctcattaaaaaaataataataaattaattgtattctaaaatataaaatgggtcagtagtacagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctttacccgacctctcaaaacacaattcagtaccagatctaataTTATAAAAAATCTGCATATTTAAGTATTGATTTTGACTATATATTTCTTATCCAATCACATGCCGCGGGTTAAATAAAGATTCATTCATCTTGCACAAATTATAATCAAAATGAAAATTACACACCGGCAGGGTTCGTTGTGATCAATGGACCGATAAATCACCAATAAACTATTTATTGACACACATGTGGTTCTCATCATGCGTATCTGTTTTGATGATTGCCATGCAACTCTGCTTTCATTATAGTAATTTAATTGTTATATTAATTGTGAACGACTGACCAGATGCACGTACGCACGTATCCAATATAAAAGCTGTCAACAAATCAATAAGTCAATATGTATATTATAATAATAGCTCCAATGATAATAATATTTCAAAAAAAAATAAAACAAATAATGAAAGTAAAAAATAATACAAATAAAATACTACA-TTTTACAAGGAATTATTTAAATACATGTCTTTAATTTTTATTAGTTTTAAAATTGTAGGATTGTTTTATTTTGTAAATTAACAATTCTGATCTG-TTTTTATACGAAATCGCTATAGCAGCTGTGGTAAAATGACAGCCCTGAA--TACACATCCCTTTATACGTGTATGTCACACTTTCTACCAT--------T----CACTCA--GA--GCTGG-------------CGTGGGGTTTTCGGTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTA-----ACATCATGATATTTACATACTAAAG---C---GTTCTGATACTTCGAATAACCAATATCTTAAAT-AATTTTTTT-ATTTGTTGTTAATTGGCTGGCAGTTTTTC--TTTCTT--ATTTTTTT-CTTTTCAATCACATAATGTTGGCTCAATTAAAATTCATCCATCTGGCACGAATTACAATCAAAATGAAATCATACATA----------TCTTCCGTGGTCAATAGACCGATAAGTCACCGCTTTAGC--ATATAACCTAATTGACACGGCTCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaattataaaaaatctgcatatttaagtattgattttgactatatatttcttatccaatcacatgccgcgggttaaataaagattcattcatcttgcacaaattataatcaaaatgaaaattacacaccggcagggttcgttgtgatcaatggaccgataaatcaccaataaactatttattgacacacatgtggttctcatcatgcgtatctgttttgatgattgccatgcaactctgctttcattatagtaatttaattgttatattaattgtgaacgactgaccagatgcacgtacgcacgtatccaatataaaagctgtcaacaaatcaataagtcaatatgtatattataataatagctccaatgataataatatttcaaaaaaaaataaaacaaataatgaaagtaaaaaataatacaaataaaatactacattttacaaggaattatttaaatacatgtctttaatttttattagttttaaaattgtaggattgttttattttgtaaattaacaattctgatctgtttttatacgaaatcgctatagcagctgtggtaaaatgacagccctgaatacacatccctttatacgtgtatgtcacactttctaccattcactcagagctggcgtggggttttcggttcgttaatttaatgatattaacatcatgatatttacatactaaagcgttctgatacttcgaataaccaatatcttaaataatttttttatttgttgttaattggctggcagtttttctttcttatttttttcttttcaatcacataatgttggctcaattaaaattcatccatctggcacgaattacaatcaaaatgaaatcatacatatcttccgtggtcaatagaccgataagtcaccgctttagcatataacctaattgacacggctctcactggcatgtgacataacgtaattaacacca
gi|4 : atttgccgtgttatttcgatataaattagttatagaacatataaaacatgtactttatttcgatttaagcgtatactgctccaaatacaaaaatatcaaagcatgcgtgaatcaaacaaaacatagatatgtgtataattatatgattatgattctatttgtttgggtatttcggcaaaataaaaattaccaattttcaatttaatttggactttagttttatattttccccaaacatagttacactgagtttgtgcttagttataaacaaatctacgtaaactgttatattgcaattaaagtggaaacattatactcgtgcacatctcattaaaaaaataataataaattaattgtattctaaaatataaaatgggtcagtagtacagcggatagggtgctggcttcagacggcagaggtcgcgagtttgacccaggctttacccgacctctcaaaacacaattcagtaccagatctaataagggaatgcactggagaaagacatgcataagctccgagcttacttgacaatcaagctaaattaaattaatgtaaaataaatgtatgtatgccaaattaacaagacagaccgaaataacacattagacataggaaataaaaactagcaaacgtaaatttctaggtgacctttttgaggttgtgattttatattgactaaagaacagcttttgatcatgaggaaggtttaaataaacaataaagaacatgtattcactgcctataaaaaagtaaatatattgttttcccgctttcctacaaaatcgatacgcctgatcacgtgcatgtaagcacgtaacaattaagccactataaaagttgtgaaaggggcaacaagtaagaaatgacaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaATGCTAGTTGTGGTAAATTTACAGCCCTGAAAATACACATTCCTTAATATGCGTATGTCACACT--------T--------TCTACCATTCACTCATTACTGGTTATATTTTATGACGTGGGGTTTTTGTTTCGTTAATGAACGAAACGAAAATCACAAGTAATAAAAAATATATTATATTAACATCATGG-GTTTACATGCAAAAGTATT---GTTCTGAAACCTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTGTTTGATTTGTTGTTAATTGGTTGGCAGTTTTTC--TTAC----A-TATTTT-CTTTTCAATCATATACTGCGGGTTCAATTAAGATTCATCCATCTGGCACTTATTACAATC-AAATGAAATCATACATATCAGCAGGGTTCTTCCGTGGT-------CCGATAAGTCACCACTTTAGC--ATATAATTTAATTGACACGGCTCTTACTGGCATGTGACATACTAGTAACGTCATTAACACCATGGGTGTCTGTGTTGTTGCGTGTCATATAAGTAGCGGTATAGCACAGCGGGTATATTTTCAAACAAATTTAATATAGTTCGTCATTTT---TAA---ATTAACATAAATCATACTGCATGTATCAGTAAAAAAA-TAATGAAGCCACATTTGCAACCAATTTGAGAAGCACACTG---AAAAG-TTCATTTAAGGTACATATATATACATAATGATAACAAAAATATTTATAAAATCTTATAGTATCTGAATAATTTTTTTTAAGTTTAGTGAAACCACATTTGAA-CCAAATCGAGTAAAACACTACAAGATT-T--TTTTTCAAAAATCATTTATCA-T----ATGTCAAATTCTATC-CGTGGATTATAATAAATTTTTCATCACCCATACAATGCATA------TTATAGATTATAAAGCTGATTTTT-GTTTGAACATTAACAAAA-CCAGTGACATATCCACATGTTGTTAAGTCGCTGCTTACACTAATCAAATTAATGGATTACTGTTAAGCCAAACATGTATAAATGGTATGGAATTATTAA-TAA---CAAAT-------ACAATATATCTAGTGATATCTATGTTGTTGATGTATCTGTAAATTTTATGGACAACATTT-TTTTGCTTTATTGTTACAAACGGCTAACGGTTTATCAAAGAAGTCACTGACCCACACACATTTCTGTCTGGATAATACAAGTCGGCTGAACTTGGGGTATTCTTTGATCACACAGACCACTGATCACATATCAAAATATAGACTCTTCCATTAAACTTCCCTACTAT
gi|5 : aaataaaaccactaaatcgtaagtttaatgcctatgcatgcacgtttatttattgttgttttaaattcatttagcttacatcaaaattcaacatccaga-------------CGTGGGGTTTTCGTTTCGTTAAT--------------T------TAATGA------TATTG-----ATATCATGG-GTTTACATACTAAAG---TATTGTTCTGAAACCTCGAATAACCAATATCTTAAATGAATTTGTTTGATTTGTTGTTAATTGACTGGCAGTTTTTC--TTAT----A-TCTTTTTCTTTTCAATCATATACTGAGGTTTTAATTAAGATTCGTCCCTCTGGCACTAATTACAATCAAAATGAAAGCATCCGCAGGGT------TCTTCCGTGGGCAAAAGACCGGTAAGTCACCACTTTGGC--ATATAATTTAATTGAAACGGATCTCACTGGCATGTGACA------TAACGTAATTAACACCACGGGTGTCTGTATTGCTGCGTGTCATATAAGTAGCGGTATAGCACAGTGGGTATA-TTTTAAACAAGTTTAATATAGTTTGT-ATTTTAGTTAATATATTAACATGAATCATAC------TATCAGTAAAAAAAATA---------------------ATTTGAGAAAC--ACTG-AAAAAAGGTTAATTTCAGGTACATATATATACATAATGATAACGAACATATTTATTAAATCTTATAATATCAAACT-ATCTTTTTTAAGTTTAGTGAAGCCACATTTAGACCCAAAGCTAGAAAAACACTACAAAATTATTATTTTTCAAAAATCATTTATTATTTTATATGTCAAATCCCATTGCGCAAATTATTATAAATTTTTCATCACCCGTGCAGTGCATAATTTTATTATTGATTATAAAGCTGATTTTTAAGTT--ACAATAACAAAAACCAGTGACAAATCCACATATTGTTAGGTCACTGCTTATACTGATCAAATGAATGGATTACTGTTAATCCAAAGATGTATAAGCGGTATTGAATTGTTAA-TAA---CAATT-------ACAATATATTTAG-----TTTATGTTGATGATGTATCTGTAAATTTTGTGGAC-A-ACTTGTTTTGCTTTCTTGTAATAAACGGCTTATGGTATTTCAAAGAAGTTACTGACGCAAACACATctgtaatgatttattcaaaattgacaacctttcgtccagcgggtgacaaaatatgtagacaaacaatcggattatgaatccaattaccatgactaaatcctgtcactgcattttatttattgctccattggaacagcttaaattaaagaaaatgaattaatttaagagttgagatgttgcgattggttatgggccagaaaccgaattgagcggactgaaagttgagtcaacttgaacgaacaaagttaacgttgaga
gi|7 : tactttctaccattcactcagtaatggttatattttataaAGGAAACGG--A--CTTGAAAGCATTACAAATAACCTTTGTGCTTTCTTCACAACTGAGCTAAGAGTAA---TTAGT-A-TAA----AC------TAAATCTTA-----CTT----GT-CCAAATTATAAAAGAACAA-GTTAAAAACAACATGCTAAA
gi|8 : ctttttaaaatcatggttgtcaactaactaaataaatctaatacaagtttgttcatttttaaagaaggcagagcgatagtgtagtggatagagtgctcgccagtcatgtcagaggttgcgggtttgattctcagcttgacctgatacttcttaaaaaaacaacactcagttatggttctacccAGCGGATGC--A------AGAGTGGTTCATATAAGCTCTGAGTTTTCATGACAATCCAGCTAAAATAAA---TTAGTAG-TAA----ata
gi|9 : gttaaaactacattaactgtcgatgtaaggaattgatcattttaaaactgcagaaggagtgatagtgtactggatagagtgttggcctctaatgccagaggttgcaatccccagttcgacccgatatctctcataaaacaacactcagttctagttctaccagctggaGGAA-GCTGA--CTTGAGAGCGGTCAATATAAGCTCTGAGCTGTCTTTGCAATCAAGCTAAAATAAA---TTAGT-A-TAC----AC------TAAActaaaactgagttg
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): AACACATTCCCTATTATGAGTAATGGTTTATCCAAAATTTACAACCTTTCGCCAAGTGGGTGACACAATATGTAGACAAACAATCAGATTATGAATTCAATTACCTTGACTAAAATCCCATGAATACATTTTATTAATTGCTCCATTTTTAACAGCTTCAATTATAAAGTCAATATGGAATTATTTTAAGAGTTGAGAGGTTTGCGATTGCCATTGGTAACCAAACTGAGCAACTGAACAATGAGTGAATGCTGAAGGAACGAAGCGAACACTGAGAGGAGTATAAAATAAAGATAGTGAGCGAATACTTGCGTTTGTGAGTGTATTAGTTTAACCGCACGCAAACGGAGCGTAACTGGAGCGCAATTATGGGGAACTTGAGCAGTTTAGGTTCTGTAATGGTGTGTAAGTGAT
Unaligned ( gi|11 ): AGTGAATTGTGTTAGCCGCTTACGTCAGAGGTCACATGTTTAATCCCACTGATATCCACTCCCCTTCATAAAAAAAAATGCTCGGTTCCACCCTGGAAACGACATGAGCAGTTCATTTAACCTTCACAAAGCTTTACCTTCAGGACTGCGTTCA
Unaligned ( gi|12 ): AAACAATGTACACCATTTTTAGACAATTTTAGAGTTATTTTATAGTAGTGCAGAGGATAGATTGTTTGTCATTCACGCAAGAGGTTGCAGGTTTGATCGCCAGCTCGACCTAATGTGTCTTTAAAAGCAACACTTATAACTGGTTCA
Unaligned ( gi|13 ): TCAATGTTGGCAGGTGGCACAGTGGATAGAGTGTTGGCTGATCACTCCAGATGTTTGCTCCCATGCTCCAGCGAATGACCTCTTAATAACAACACTTAGTATTCATTCTGCTCATGAAACAGACTCCAGAGCCATCTA
Unaligned ( gi|14 ): TTTGCCTTGCTATTTCGATATAAATTAGTTATAGAACATACAGAACATATATTTCAATTGGATTTAAGCGTATGCAGCTCTAAACACAAAAAATCAATGCATTTGTGAATCAAACAAAACATAGATA
Unaligned ( gi|15 ): TATTGTTTAAAACTTTTTATCAAAGGTCGAGAGTTGTTGATACATAGATAGTGCAATGGATAGAGTGTTGGTCACTCACATAAGATGTAACAGGTTCGATCCGACATTTAGT