lowQualScore : 1
lowQualScore : 2 2 1 666666 4 1 1 333 2 8 1 1 666 0 5 55555 4 3 2 333 1 5 3333 1 666666 3333 1 222 22 3333 44444 1 1 222 22
lowQualScore : . . . ...... . . . ... . . . . ... . . ..... . . . ... . . .... . ...... .... . ... .. .... ..... . . ... ..
lowQualScore : 5 4 4 111111 4 8 8 333 2 4 8 8 444 4 0 00000 0 1 0 333 9 2 7777 4 888888 3333 5 888 22 4444 00000 7 7 999 33
consensus : GCG-T-GGTCTAGTGGTAGAGCG------TCCGCCTCGCATGCGGAAGGTCGTGGGTTCGATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTGAAA-AA-T---GGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGGCGCTCAGCA-----TTTAGAGGATAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGGCAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAA
Reference ( gi|2 ) : GCG-T-GGTCTAGTGGTAGAGCG------TCCGCCTCGCATGCGGAAGGTTGTGGGTTCGATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTTAAA-AA-T---GGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGACGCTCAGCA-----TTTAGAGGAGAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATATTCCAGT----GTGACAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAA
gi|7 : GCG-T-GGTCTAGTGGTAGAGCG------TCCGCCTCGCATGCGGAAGGTCGTGGGTTCAATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTTAAA-AA-T---GGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGACGCTCAGCA-----TTTAGAGGAGAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----TAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---------G--ACGCTAAACCCCAAACAA
gi|4 : cgGCGAT-GTTCTAGTAGTAGAGAG------TCTGTCTCCCATGGCGAAGGGTCCGAGTTCGATCTGT-GGTCGTG-GCATACCA---ATGACTTGTAA-AA-C---AATACTTTAAGCTTCCTCGTTTGGTGCTCAGCA-----TTTAGAGGATAGTTCTGGGTCTTGCCGGTCTGGTGTCAGCTTAATTTAACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGTGGCATGATACTCCAGT----GTAGCAATGCT-----CGGAA----TG-CTGTCTCAAATGGA---CACG--AA----TGTG-----ATATGGCTGAAAAAA-ATGTT---GAAAGCA--TCGCTAAACACc
gi|10 : caGCG-TTGGTCTAGGGTTGGAGCA------TCCGCCTGTCACGTGGAAGGTCATGGGTTCCATCCGT-GGTCGGGGTCATACCA---GACA----AAA-AA-T---GGTTCTAGAAGCTTCCTGAGTTAATGCTCAGCA-----TTTAGAGGTTAGTAAAAGGTCTGGTTGACCTTGTGTCGGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCGTACCA-----------CA-----------T----GTGGCAGCGCT-----TAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--AT----CGTG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTTAACACCATGCAAtt
gi|11 : caGCG-T-AGTCTGGTGGTAAAGCA------TCTGCCTCACTTGCAGAAG------------ATCCTC-AGCCAGG-TCA-ACCA---AAGACTTTAAA-AC-A---GGTACTTGACGCTTTCTCCCTTGGTGCTCAACA-----TT-AGAGTAATATTCTGGGTCTGGTCAGTCAGATATCAGTATAATATCACTGG--TGG---G-GTATTGTACCATGTGTCTGCGGAATGATATTTCTAT----GTGGAAGTGCA-----GAGAA----TA-C--TCTCAAGTAGA---CACC--AT----CG--------TAAGACTG---AAT-TTGTTTTGGAAAGTA--ACGCAAAACTCCATA
gi|18 : GCG-T-TGTCTAGTGGAAGAGTA------TCCACCTTGCATGCGGAAGGTCTTGGGTTCGATCCCC-GGCCGGT-TCATACCA---AGTACTTGTTA-AA-T---GGTACTAGTAGCTTCTTCGATTGGCGCTCAACA-----TTAAGAGGATTATCCCAGGTCTGGTCGATACGGTGT---TATAATGTGACTTG-GTGG---G-
gi|3 : caG-T-GATCTAGTGGTCGAGCT------TCTGCCTCAAGTGCGAAAGGTCGTAGGTTCGATCTCC-GACTGGG-TCATACCA---AAGACTTAAAA-AA-T---TGAACTAGAAGATTCCTTGCTCGGCGCCCTGCA-----TTTAGAGGATAATTCTAGGTCTGGTCGGCC-GGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGT---A-GTATCATGCGATTTGTCTGCGGTATAATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----CAGAA----TA-CTATCCCAAGTAGA---AACC--GT----CGCG-----GTATGACTG-AACAA-TCGTT---GAAAGTG--ACGCTTAACGCCATACAAt
gi|5 : gtgG-T-AGTCTAGGAGTAGAACG------TCCGCTTCACATGCGGAAAGTCGTAAATTCGATTTCC-GGCTGGA-TCATACCA---AAGA-TTGAAA-AA-TAATGGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGGCGCTCAGTG-----TTTAGAGGATAGTTCCAGACCTGGTCGGCCCGGTATCAATCTAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATATCGTATGTTGGCGACACGAAACTCAAAT----GTGGCAGCGCT-----TAGAA----TA-TTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CTCG-----ACATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCA--ACTCTAAACAC
gi|6 : cagcgG-T-GGTCTATAGGTAGAGCG------TCAGCCTCGCATGCGGCATGTCATTGGTTCGACCCCCCGGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTGAAT-AA-T---AGTTATA-AAGCGTCCTTGCTCAGTGCTAAGCA-----TTAAGTGGATAGTTCTGGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTTTAATGTGATTGG-GTGA---G-GTATCATACCA--TGTCTGCGGAATGATACTCCAGT----GTGGCAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACA--TT----TGCG-----ATAT--CCG--CAAA-TTGTT---GAAATTG--ACGCTAAACACCACACAt
gi|12 : gcagcaG-T-GGTCTAGGGGTAGAGCG------CCCGCCACGCATGCGGAAGGTCGTGGGTTCGATCCCC-TGCCAGA-TCACACCA---A------TAAA----T---GGTACTAGAAGTTTCCTCCCTTGGTGCTTAGCA-----CTTAGAGGATAGTTCTAAGTCTGATCGGCTCGGTGTCAGTATAATGTGTCTTG-GCGG---G-GTATCATACCAT-----------ATGGCACTCCAGT----GTGGCAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGTG-----ATATACCAG-AAAAA-ATGCT---GAAAGCA--ACGTT--ACACC
gi|1 : gG-T-GGTCAAGGGATAGAGCGAGAGCGTCCGCC------------GGTCGTGGGCTCGATCCCC-TGCCGGC-TCATACAA---AATACCTAAAA-AA-T---TGTGCTAGAAGCTTCCTCGCTTGGCGCTCGGCT-----TTAAGAGGATAGATTTAGGTTTGGTCGACTCGTTGTCAGTATAATGTTACTGGAATGGATTG-ATAGCATACCATGTGTCTACGGCATGATACTCTGGTGTGGGTGGCAGCGCT-----CAGTA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CATT--GT----CGCA-----ATGTGACTG-AAAAC-TTATT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAA
gi|8 : cagcgG-T-TGTCTAGTGGTACAACG------TCCGCCTTGCATGAGCAAGTTCATGGGCTCGATCCCT-GGCCCGG-TCATACCA---AAAACTCGAAA-AAGT---GGGACTAGAAGCTTTCTCACTTGGCACTCGGCA-----TTAAGTGGATAGTTCTAGGTCTGGTTGGCCCGGTGCCAGTATAATGAGAATGG-GTGG---A-GAATCATATCATGT------GGCAAGAGATTCCAGC----GAGGCAGTATTAAGTACAAAA----TA-CTGTCTCAAGTG-----------GT----TGCG-----ATATGACTG-AAAAC-TT-TT---AAAAGCA--GCACTAAACAca
gi|13 : gcagcaG-T-GGTCTAGTGGTAGAGTG------TCTGACTCATGTGCGGAAAGCCATCGGTTCGATCCTC-GGCAGGG-TCATACCA---AA----TT----------------------CTTCCTGAAATGGCGCTCATCA-----TTTAGAGGATAGTCCTACCTCTGGTCGGTCATGTGTTGGTAAAATTTGACTAG-ATGG---G-GTAG-ATA---TGTGTCTGCGGCATGATTCTCCAGT----CTGGCAGCACT-----CAAAAATACTA-TTGTTTC-------------C--AT----CACG-----ATATGACTG-AAAAG-TTGTT---GAAAGCG--ACACTAAACACCATAC
gi|16 : gcagcgG-T-GGTCCAGAGGTAGAATG------ACTGCCTCGCATGCAGATGGTCATGGGTTCATTCTCT-GGCTGGG-TTATACCA---TAGACTTGAAATAA-T---GTT-CAAGAAGGTTCCTTGCAAG-CACCCAGCA-----TTAAGAGGATAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCTTGTATCACTATAATGTGACTAG-GTGA---G-GTATCATACCATGTGTCTACAGCATGACACTCCA
gi|21 : gcagtgG-T-GGCCTTGTGGTAGAGCG------TCCCACTCGCATACGGAATCTCGTGGGTTCGATCCCC-GACAGGA--CATACAA---AATAATTGAAA-AA-T---AGTACTAGAAGCTTCCTCATTTTGCTCTCAGCA-----TTAAGAGGAtga
gi|25 : cagcgG-T-GGTCTAGGGGTAGAGCA------CCAGCCTCGCTTGTGGAAGATCGTATATTCGATCCCC-AGCTCGG-TCATt
gi|28 : caaaccaG-T-GGACTAGT--TAAAA--------TTTGTCTCGCATGCGAAATGTCATGGGTTCAAACCCA-GGCCATA-TTATAGCA---AAGACT---AA-AA-TAAGAGTAATAAAAGcaacatttctcaagcaatacatagtc
gi|32 : a-GGTCAAGTGATAGAGAG------TCTGCCTCGCATATGGAAGGTCATGGATTCGATCCCC-CGCCAAG-TCATATCA---AAGACTT
gi|22 : acagcagCTAGACGTAGAGCA------TCTGCCTCGCATACAGACAGTTGTGGGTTCAATCCCC-AGCCAGG-TCATACCA---AAGACTAGAAA-AT-T---GGTACTAAAAA----------TGTTGCTCAACAGAAAGTTCAGAGGAgacaaga
gi|33 : tgttgaTAGTGGTTGAGTG------TCCA-CTTGCATGCAGAAGTTTGTTGGTTCAATCTCC-AGCCAGA-TCAAGCCATCGAAAACTTGACA-AA-T---
gi|9 : taCACCTCGCATGCGGAATGTCGTGGGTTCAATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTTAAA-AA-T---GGTACTAAAAGCTTCCTCGCTTGACGCTCAGCA-----TTTAGAG-----TTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----TAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CAAC--AT----CACG-----ATATGACTG-AAGAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCAAACA
gi|14 : CGCATGCAGACGGTCGTGGGTTCGATCCCT-GACCGAG-TCGTATCA---AA--------A-TA-T---GGTACAAGTAACGTCATCACTTGGCGCTCAGCA-----TTTAGAGGATAGTTCTAGGTCTTGTCGACCCGGTG-------------ACTGG-GTGG---GAGTGTCATACAATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTTGCAGCGTT-----CAGAA----TA-CTGTCTAAAGTAGA---CACC--GT----CTCG-----ATATGAC------------TT---AAAAGCG--GCGCTAAACACCATACAAtaaacaac
gi|15 : CATGCG-ATGGTCATGGTTTTGATCCCC-AGCTGGG-TCATACCA---AAGAC-TTGAA-AA-T---GGTACTGGAAACTTCCTCGcaaca
gi|20 : aTTAAAA-AA-T---GGTACTATTAGCTTTCCCGCTTGAAGCACAGCA-----TTCAGAAGACAGTTCTGTGTCTGGTCTGCCCGATGTCAGTATAATTTGATCGG-GTGG---G-GCATCATACCATGTGTCTGCG-------------AT----GTGGTAGCGCT-----TAGAA----TA-ATGTCTGAAtaaggttggcccagtgtcagtataatgtgactgggtgggatgtcataccatgtgtctggcatgatacttcagcatggcagcactaagaatactgtcttaagtagacactgtcctaagataaatgaaaagttgttgaaagtgacaataaacacagtaca
gi|19 : A-AA-T---GGTATTAAAAGCTTCCTCG-------------A-----T---------AGTTCTAGGTCAGGTCAGCCCTTAGTCAGTTAAATGAGACTGG-ATGG---T-GTATCATACCATGTGTCTGTGACATGATACTCCATT----GTGGCAGTGTT----------------------------------CACC--AT----CGCG-----ATATAACTG-AACAA-TTGTT---GAAAGCA--ATGCTAAACACCATACA
gi|17 : CTAGAAGCTTCCTCGATTGACGCTCAGCA-----TTTAGAGGATAGTTCTAAGTCTGGTCGGCCCGTCGTCGGTATAATGTGACTGG-GTGA---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----AAGAA----TA-CTGTTTCAAGTAGA---CACC--GT----GGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAAgca
gi|15 : GGTTGGCCCAGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-ATGTCATACCATGTGTCTG--GCATGATACTTCAGC----ATGGCAGCACT-----AAGAA----TA-CTGTCTTAAGTAGA---CACT--GT----CCTA-----AGATAAATG-AAAAG-TTGTT---GAAAGTG--ACAATAAACACAGTACAcaaca
gi|27 : acatgcgatggtcatggttttgatccccagctgggtcataccaaagacttgaaaatggtactggaaacttcctcgtaaATTTGAGTGG-GTGG---G-GTACCATGTCACATGTCTGAG-------------AT----GTGGCA----T-----CACCG----TACCTATATCAAATAAATACCACC--GTGAAACGTT-----ATGTGACTG-AA
gi|34 : TGG---G-GTATCATGCTGTATGTCTGCATCATGATACTACAGT----GTGGAAACGTT--------AA-------------CAAGCAG-----ACC--TT----TGTG-----ATATCAC
gi|23 : aGGCATCCTACTCCAGT----GTGGCAGTGCT-----TAGA--------------CAAGTAGA---CACT--GT----TGCG-----ATATAACTG-AAAAAGTTGTT---GAAAGCA--ACACTTAAAACTAT
gi|29 : gtgatagagttgGCATGATATATAAGT----GTGACAGCGTT-----CAACA----TA-CTATTTGAAGCAGA---AACA--AT----CGTG-----ACATGA-TG-A---------T---GAAAATG--ACACTAAACACTATACAA
gi|24 : CATGATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----TAGAA----AA-CTGTATCAAGTAAA---CACC--GT----CGTG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAATCACCTTACAAc
gi|31 : ATACTCCAGT----ATGACAGCGCT-----TAGAA----TA-CT----CGAGTAGA---CACC--GT----CACA-----ATATAACTG-AAATA-TTGTT---GCAAGCG--ACGATTAACACCATACAA
gi|30 : GCT-----TAGAG----TA-CTGTATCTCGTCAT---CCCCCAGT----CACGCCATAATATAACTG-AAAAA--TGTT---TAAA-CGATACTCTTAACACTATACAA
gi|26 : acga-----CAAAT----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--AGGCTAAACACCATACAAcaa
gi|35 : agtgttaacA----TA-TTGTCTCAAGTAGA---CATC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AACAA-TTGTT---GAAAGAG--AAGCTATACAACAcaacaacaacaac
gi|36 : A-TTATT---GAAAACG--ACGCTTAACACCACACAAa
Alignments
lowQualScore : 2 2 0 555555 1 1 1 333 0 3 1 1 333 44444 3 1 1 333 1 3333 666666 3333 1 222 22 3333 33333 1 1 222 22
lowQualScore : . . . ...... . . . ... . . . . ... ..... . . . ... . .... ...... .... . ... .. .... ..... . . ... ..
lowQualScore : 4 2 9 888888 7 7 7 222 5 3 7 7 000 88888 3 9 9 222 8 5555 111111 1111 5 777 11 3333 88888 6 6 888 22
consensus : GCG-T-GGTCTAGTGGTAGAGCG------TCCGCCTCGCATG-CGGAAGGTCGTGGGTTCGATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTGAAA-AA-T---GGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGGCGCTCAGCA-----TTTAGAG-GATAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGGCAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAA
Reference ( family-118 ) : GCG-T-GGTCTAGTGGTAGAGCG------TCCGCCTCGCATG-CGGAAGGTCGTGGGTTCGATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTGAAA-AA-T---GGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGGCGCTCAGCA-----TTTAGAG-GATAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGGCAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAA
gi|1 : G-T-GGTCAAGGGATAGAGCGAGAGCGTCCGCC-------------GGTCGTGGGCTCGATCCCC-TGCCGGC-TCATACAA---AATACCTAAAA-AA-T---TGTGCTAGAAGCTTCCTCGCTTGGCGCTCGGCT-----TTAAGAG-GATAGATTTAGGTTTGGTCGACTCGTTGTCAGTATAATGTTACTGGAATGGATTG-ATAGCATACCATGTGTCTACGGCATGATACTCTGGTGTGGGTGGCAGCGCT-----CAGTA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CATT--GT----CGCA-----ATGTGACTG-AAAAC-TTATT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAA
gi|10 : cagcgGCG-TTGGTCTAGGGTTGGAGCA------TCCGCCTGTCACG-TGGAAGGTCATGGGTTCCATCCGT-GGTCGGGGTCATACCA-----GAC--AAAA-AA-T---GGTTCTAGAAGCTTCCTGAGTTAATGCTCAGCA-----TTTAGAG-GTTAGTAAAAGGTCTGGTTGACCTTGTGTCGGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCGTACCA-----------CA-----------T----GTGGCAGCGCT-----TAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--AT----CGTG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTTAACACCATGCAAca
gi|11 : caGCG-T-AGTCTGGTGGTAAAGCA------TCTGCCTCACTTG-CAGAAG------------ATCCTC-AGCCAGG-TCA-ACCA---AAGACTTTAAA-AC-A---GGTACTTGACGCTTTCTCCCTTGGTGCTCAACA-----TT-AGAGTAATA-TTCTGGGTCTGGTCAGTCAGATATCAGTATAATATCACTGG--TGG---G-GTATTGTACCATGTGTCTGCGGAATGATATTTCTAT----GTGGAAGTGCA-----GAGAA----TA-C--TCTCAAGTAGA---CACC--AT----CG--------TAAGACTG---AAT-TTGTTTTGGAAAGTA--ACGCAAAACTCCATA
gi|12 : G-T-GGTCTAGGGGTAGAGCG------CCCGCCACGCATG-CGGAAGGTCGTGGGTTCGATCCCC-TGCCAGA-TCACACCA---A-----T---A-AA-T---GGTACTAGAAGTTTCCTCCCTTGGTGCTTAGCA-----CTTAGAG-GATAGTTCTAAGTCTGATCGGCTCGGTGTCAGTATAATGTGTCTTG-GCGG---G-GTATCATACCAT-----------ATGGCACTCCAGT----GTGGCAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGTG-----ATATACCAG-AAAAA-ATGCT---GAAAGCA--ACGTT--ACACC
gi|13 : gG-T-GGTCTAGTGGTAGAGTG------TCTGACTCATGTG-CGGAAAGCCATCGGTTCGATCCTC-GGCAGGG-TCATACCA---AA---TT-----------------------CTTCCTGAAATGGCGCTCATCA-----TTTAGAG-GATAGTCCTACCTCTGGTCGGTCATGTGTTGGTAAAATTTGACTAG-ATGG---G-GTA-GAT---ATGTGTCTGCGGCATGATTCTCCAGT----CTGGCAGCACT-----CAAAAATACTA-TTGTTT-------------CC--AT----CACG-----ATATGACTG-AAAAG-TTGTT---GAAAGCG--ACACTAAACACCATAC
gi|14 : gcagcgCGCATG-CAGACGGTCGTGGGTTCGATCCCT-GACCGAG-TCGTATCA---AA--------A-TA-T---GGTACAAGTAACGTCATCACTTGGCGCTCAGCA-----TTTAGAG-GATAGTTCTAGGTCTTGTCGACCCGGTG-------------ACTGG-GTGG---GAGTGTCATACAATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTTGCAGCGTT-----CAGAA----TA-CTGTCTAAAGTAGA---CACC--GT----CTCG-----ATATGAC------------TT---AAAAGCG--GCGCTAAACACCATACAA
gi|15 : CATG-CG-ATGGTCATGGTTTTGATCCCC-AGCTGGG-TCATACCA---AAGACTTG-AA-AA-T---GGTACTGGAAACTTCCTCGcaaca
gi|15 : aGGTTGGCCCAGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-ATGTCATACCATGTGTCTG--GCATGATACTTCAGC----ATGGCAGCACT-----AAGAA----TA-CTGTCTTAAGTAGA---CACT--GT----CCTA-----AGATAAATG-AAAAG-TTGTT---GAAAGTG--ACAATAAACACAGTACAtaaggttggcccagtgtcagtataatgtgactgggtgggatgtcataccatgtgtctggcatgatacttcagcatggcagcactaagaatactgtcttaagtagacactgtcctaagataaatgaaaagttgttgaaagtgacaataaacacagtaca
gi|16 : acatgcgatggtcatggttttgatccccagctgggtcataccaaagacttgaaaatggtactggaaacttcctcgtaaG-T-GGTCCAGAGGTAGAATG------ACTGCCTCGCATG-CAGATGGTCATGGGTTCATTCTCT-GGCTGGG-TTATACCA---TAGACTTGAAATAA-T---GTT-CAAGAAGGTTCCTTGCA-AGCACCCAGCA-----TTAAGAG-GATAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCTTGTATCACTATAATGTGACTAG-GTGA---G-GTATCATACCATGTGTCTACAGCATGACACTCCA
gi|17 : gcagtgCTAGAAGCTTCCTCGATTGACGCTCAGCA-----TTTAGAG-GATAGTTCTAAGTCTGGTCGGCCCGTCGTCGGTATAATGTGACTGG-GTGA---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----AAGAA----TA-CTGTTTCAAGTAGA---CACC--GT----GGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAAtga
gi|18 : GCG-T-TGTCTAGTGGAAGAGTA------TCCACCTTGCATG-CGGAAGGTCTTGGGTTCGATCCCC-GGCCGGT-TCATACCA---AGTACTTGTTA-AA-T---GGTACTAGTAGCTTCTTCGATTGGCGCTCAACA-----TTAAGAG-GATTATCCCAGGTCTGGTCGATACGGTGT---TATAATGTGACTTG-GTGG---G-caaca
gi|19 : caA-AA-T---GGTATTAAAAGCTTCCTCG----------------------------ATAGTTCTAGGTCAGGTCAGCCCTTAGTCAGTTAAATGAGACTGG-ATGG---T-GTATCATACCATGTGTCTGTGACATGATACTCCATT----GTGGCAGTGTT----------------------------------CACC--AT----CGCG-----ATATAACTG-AACAA-TTGTT---GAAAGCA--ATGCTAAACACCATACAt
gi|2 : GCG-T-GGTCTAGTGGTAGAGCG------TCCGCCTCGCATG-CGGAAGGTTGTGGGTTCGATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTTAAA-AA-T---GGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGACGCTCAGCA-----TTTAGAG-GAGAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATATTCCAGT----GTGACAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAAgca
gi|20 : TTAAAA-AA-T---GGTACTATTAGCTTTCCCGCTTGAAGCACAGCA-----TTCAGAA-GACAGTTCTGTGTCTGGTCTGCCCGATGTCAGTATAATTTGATCGG-GTGG---G-GCATCATACCATGTGTCTGCG-------------AT----GTGGTAGCGCT-----TAGAA----TA-ATGTCTGAA
gi|21 : G-T-GGCCTTGTGGTAGAGCG------TCCCACTCGCATA-CGGAATCTCGTGGGTTCGATCCCC-GACAGGA--CATACAA---AATAATTGAAA-AA-T---AGTACTAGAAGCTTCCTCATTTTGCTCTCAGCA-----TTAAGAG-GAT
gi|22 : cagcgCTAGACGTAGAGCA------TCTGCCTCGCATA-CAGACAGTTGTGGGTTCAATCCCC-AGCCAGG-TCATACCA---AAGACTAGAAA-AT-T---GGTACTAAAAA----------TGTTGCTCAACAGAAAGTTCAGAG-GA
gi|23 : tgttgaGGCATCCTACTCCAGT----GTGGCAGTGCT-----TAGA--------------CAAGTAGA---CACT--GT----TGCG-----ATATAACTG-AAAAAGTTGTT---GAAAGCA--ACACTTAAAACTAT
gi|24 : gtgatagagttgCATGATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----TAGAA----AA-CTGTATCAAGTAAA---CACC--GT----CGTG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAATCACCTTACAA
gi|25 : G-T-GGTCTAGGGGTAGAGCA------CCAGCCTCGCTTG-TGGAAGATCGTATATTCGATCCCC-AGCTCGG-TCAT
gi|26 : caaacca-----CAAAT----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--AGGCTAAACACCATACAAcaacatttctcaagcaatacatagtc
gi|27 : agtgttaacATTTGAGTGG-GTGG---G-GTACCATGTCACATGTCTGAG-------------AT----GTGGCA----T-----CACCG----TACCTATATCAAATAAATACCACC--GTGAAACGTT-----ATGTGACTG-AAcaacaacaacaac
gi|28 : G-T-GGACTAGT--TAAAA--------TTTGTCTCGCATG-CGAAATGTCATGGGTTCAAACCCA-GGCCATA-TTATAGCA---AAGACTAAAAT-AA-G---AGTAATAAAAG
gi|29 : aGCATGATATATAAGT----GTGACAGCGTT-----CAACA----TA-CTATTTGAAGCAGA---AACA--AT----CGTG-----ACATGA-TG-A---------T---GAAAATG--ACACTAAACACTATACAA
gi|3 : G-T-GATCTAGTGGTCGAGCT------TCTGCCTCAAGTG-CGAAAGGTCGTAGGTTCGATCTCC-GACTGGG-TCATACCA---AAGACTTAAAA-AA-T---TGAACTAGAAGATTCCTTGCTCGGCGCCCTGCA-----TTTAGAG-GATAATTCTAGGTCTGGTCGGCC-GGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGT---A-GTATCATGCGATTTGTCTGCGGTATAATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----CAGAA----TA-CTATCCCAAGTAGA---AACC--GT----CGCG-----GTATGACTG-AACAA-TCGTT---GAAAGTG--ACGCTTAACGCCATACAAc
gi|30 : gtgGCT-----TAGAG----TA-CTGTATCTCGTCAT---CCCCCAGT----CACGCCATAATATAACTG-AAAAA--TGTT---TAAA-CGATACTCTTAACACTATACAA
gi|31 : acgaATACTCCAGT----ATGACAGCGCT-----TAGAA----TA-CT----CGAGTAGA---CACC--GT----CACA-----ATATAACTG-AAATA-TTGTT---GCAAGCG--ACGATTAACACCATACAAcaa
gi|32 : -GGTCAAGTGATAGAGAG------TCTGCCTCGCATA-TGGAAGGTCATGGATTCGATCCCC-CGCCAAG-TCATATCA---AAGACTTGACA-A
gi|33 : acagcagTAGTGGTTGAGTG------TCCA-CTTGCATG-CAGAAGTTTGTTGGTTCAATCTCC-AGCCAGA-TCAAGCCATCGAAAACTTGACA-AA-T---ga
gi|34 : taTGG---G-GTATCATGCTGTATGTCTGCATCATGATACTACAGT----GTGGAAACGTT--------AA-------------CAAGCAG-----ACC--TT----TGTG-----ATATCAC
gi|35 : aA----TA-TTGTCTCAAGTAGA---CATC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AACAA-TTGTT---GAAAGAG--AAGCTATACAACA
gi|36 : A-TTATT---GAAAACG--ACGCTTAACACCACACAAa
gi|4 : GCGAT-GTTCTAGTAGTAGAGAG------TCTGTCTCCCATGGCGAAGGGTC-CGAGTTCGATCTGT-GGTCGTG-GCATACCA---ATGACTTGTAA-AA-C---AATACTTTAAGCTTCCTCGTTTGGTGCTCAGCA-----TTTAGAG-GATAGTTCTGGGTCTTGCCGGTCTGGTGTCAGCTTAATTTAACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGTGGCATGATACTCCAGT----GTAGCAATGCT-----CGGAA----TG-CTGTCTCAAATGGA---CACG--AA----TGTG-----ATATGGCTGAAAAAA-ATGTT---GAAAGCA--TCGCTAAACACtaa
gi|5 : caG-T-AGTCTAGGAGTAGAACG------TCCGCTTCACATG-CGGAAAGTCGTAAATTCGATTTCC-GGCTGGA-TCATACCA---AAGA-TTGAAA-AA-TAATGGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGGCGCTCAGTG-----TTTAGAG-GATAGTTCCAGACCTGGTCGGCCCGGTATCAATCTAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATATCGTATGTTGGCGACACGAAACTCAAAT----GTGGCAGCGCT-----TAGAA----TA-TTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CTCG-----ACATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCA--ACTCTAAACACtt
gi|6 : cagcgG-T-GGTCTATAGGTAGAGCG------TCAGCCTCGCATG-CGGCATGTCATTGGTTCGACCCCCCGGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTGAAT-AA-T---AGTTATA-AAGCGTCCTTGCTCAGTGCTAAGCA-----TTAAGTG-GATAGTTCTGGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTTTAATGTGATTGG-GTGA---G-GTATCATACCA--TGTCTGCGGAATGATACTCCAGT----GTGGCAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACA--TT----TGCG-----ATAT--CCG--CAAA-TTGTT---GAAATTG--ACGCTAAACACCACACAt
gi|7 : gcagcaGCG-T-GGTCTAGTGGTAGAGCG------TCCGCCTCGCATG-CGGAAGGTCGTGGGTTCAATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTTAAA-AA-T---GGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGACGCTCAGCA-----TTTAGAG-GAGAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----TAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---------G--ACGCTAAACCCCAAACAA
gi|8 : cgG-T-TGTCTAGTGGTACAACG------TCCGCCTTGCATG-AGCAAGTTCATGGGCTCGATCCCT-GGCCCGG-TCATACCA---AAAACTCGAAA-AAGT---GGGACTAGAAGCTTTCTCACTTGGCACTCGGCA-----TTAAGTG-GATAGTTCTAGGTCTGGTTGGCCCGGTGCCAGTATAATGAGAATGG-GTGG---A-GAATCATATCATGT------GGCAAGAGATTCCAGC----GAGGCAGTATTAAGTACAAAA----TA-CTGTCTCAAGTG-----------GT----TGCG-----ATATGACTG-AAAAC-TT-TT---AAAAGCA--GCACTAAACAc
gi|9 : gcagcaCACCTCGCATG-CGGAATGTCGTGGGTTCAATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTTAAA-AA-T---GGTACTAAAAGCTTCCTCGCTTGACGCTCAGCA-----TTTAGAG------TTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----TAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CAAC--AT----CACG-----ATATGACTG-AAGAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCAAACA
Alignments
lowQualScore : 2 2 0 555555 1 1 1 333 0 3 1 1 333 44444 3 1 1 333 1 3333 666666 3333 1 222 22 3333 33333 1 1 222 22
lowQualScore : . . . ...... . . . ... . . . . ... ..... . . . ... . .... ...... .... . ... .. .... ..... . . ... ..
lowQualScore : 4 2 9 888888 7 7 7 222 5 3 7 7 000 88888 3 9 9 222 8 5555 111111 1111 5 777 11 3333 88888 6 6 888 22
consensus : GCG-T-GGTCTAGTGGTAGAGCG------TCCGCCTCGCATG-CGGAAGGTCGTGGGTTCGATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTGAAA-AA-T---GGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGGCGCTCAGCA-----TTTAGAG-GATAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGGCAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAA
Reference ( family-118 ) : GCG-T-GGTCTAGTGGTAGAGCG------TCCGCCTCGCATG-CGGAAGGTCGTGGGTTCGATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTGAAA-AA-T---GGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGGCGCTCAGCA-----TTTAGAG-GATAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGGCAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAA
gi|1 : G-T-GGTCAAGGGATAGAGCGAGAGCGTCCGCC-------------GGTCGTGGGCTCGATCCCC-TGCCGGC-TCATACAA---AATACCTAAAA-AA-T---TGTGCTAGAAGCTTCCTCGCTTGGCGCTCGGCT-----TTAAGAG-GATAGATTTAGGTTTGGTCGACTCGTTGTCAGTATAATGTTACTGGAATGGATTG-ATAGCATACCATGTGTCTACGGCATGATACTCTGGTGTGGGTGGCAGCGCT-----CAGTA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CATT--GT----CGCA-----ATGTGACTG-AAAAC-TTATT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAA
gi|10 : cagcgGCG-TTGGTCTAGGGTTGGAGCA------TCCGCCTGTCACG-TGGAAGGTCATGGGTTCCATCCGT-GGTCGGGGTCATACCA-----GAC--AAAA-AA-T---GGTTCTAGAAGCTTCCTGAGTTAATGCTCAGCA-----TTTAGAG-GTTAGTAAAAGGTCTGGTTGACCTTGTGTCGGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCGTACCA-----------CA-----------T----GTGGCAGCGCT-----TAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--AT----CGTG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTTAACACCATGCAAca
gi|11 : caGCG-T-AGTCTGGTGGTAAAGCA------TCTGCCTCACTTG-CAGAAG------------ATCCTC-AGCCAGG-TCA-ACCA---AAGACTTTAAA-AC-A---GGTACTTGACGCTTTCTCCCTTGGTGCTCAACA-----TT-AGAGTAATA-TTCTGGGTCTGGTCAGTCAGATATCAGTATAATATCACTGG--TGG---G-GTATTGTACCATGTGTCTGCGGAATGATATTTCTAT----GTGGAAGTGCA-----GAGAA----TA-C--TCTCAAGTAGA---CACC--AT----CG--------TAAGACTG---AAT-TTGTTTTGGAAAGTA--ACGCAAAACTCCATA
gi|12 : G-T-GGTCTAGGGGTAGAGCG------CCCGCCACGCATG-CGGAAGGTCGTGGGTTCGATCCCC-TGCCAGA-TCACACCA---A-----T---A-AA-T---GGTACTAGAAGTTTCCTCCCTTGGTGCTTAGCA-----CTTAGAG-GATAGTTCTAAGTCTGATCGGCTCGGTGTCAGTATAATGTGTCTTG-GCGG---G-GTATCATACCAT-----------ATGGCACTCCAGT----GTGGCAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGTG-----ATATACCAG-AAAAA-ATGCT---GAAAGCA--ACGTT--ACACC
gi|13 : gG-T-GGTCTAGTGGTAGAGTG------TCTGACTCATGTG-CGGAAAGCCATCGGTTCGATCCTC-GGCAGGG-TCATACCA---AA---TT-----------------------CTTCCTGAAATGGCGCTCATCA-----TTTAGAG-GATAGTCCTACCTCTGGTCGGTCATGTGTTGGTAAAATTTGACTAG-ATGG---G-GTA-GAT---ATGTGTCTGCGGCATGATTCTCCAGT----CTGGCAGCACT-----CAAAAATACTA-TTGTTT-------------CC--AT----CACG-----ATATGACTG-AAAAG-TTGTT---GAAAGCG--ACACTAAACACCATAC
gi|14 : gcagcgCGCATG-CAGACGGTCGTGGGTTCGATCCCT-GACCGAG-TCGTATCA---AA--------A-TA-T---GGTACAAGTAACGTCATCACTTGGCGCTCAGCA-----TTTAGAG-GATAGTTCTAGGTCTTGTCGACCCGGTG-------------ACTGG-GTGG---GAGTGTCATACAATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTTGCAGCGTT-----CAGAA----TA-CTGTCTAAAGTAGA---CACC--GT----CTCG-----ATATGAC------------TT---AAAAGCG--GCGCTAAACACCATACAA
gi|15 : CATG-CG-ATGGTCATGGTTTTGATCCCC-AGCTGGG-TCATACCA---AAGACTTG-AA-AA-T---GGTACTGGAAACTTCCTCGcaaca
gi|15 : aGGTTGGCCCAGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-ATGTCATACCATGTGTCTG--GCATGATACTTCAGC----ATGGCAGCACT-----AAGAA----TA-CTGTCTTAAGTAGA---CACT--GT----CCTA-----AGATAAATG-AAAAG-TTGTT---GAAAGTG--ACAATAAACACAGTACAtaaggttggcccagtgtcagtataatgtgactgggtgggatgtcataccatgtgtctggcatgatacttcagcatggcagcactaagaatactgtcttaagtagacactgtcctaagataaatgaaaagttgttgaaagtgacaataaacacagtaca
gi|16 : acatgcgatggtcatggttttgatccccagctgggtcataccaaagacttgaaaatggtactggaaacttcctcgtaaG-T-GGTCCAGAGGTAGAATG------ACTGCCTCGCATG-CAGATGGTCATGGGTTCATTCTCT-GGCTGGG-TTATACCA---TAGACTTGAAATAA-T---GTT-CAAGAAGGTTCCTTGCA-AGCACCCAGCA-----TTAAGAG-GATAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCTTGTATCACTATAATGTGACTAG-GTGA---G-GTATCATACCATGTGTCTACAGCATGACACTCCA
gi|17 : gcagtgCTAGAAGCTTCCTCGATTGACGCTCAGCA-----TTTAGAG-GATAGTTCTAAGTCTGGTCGGCCCGTCGTCGGTATAATGTGACTGG-GTGA---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----AAGAA----TA-CTGTTTCAAGTAGA---CACC--GT----GGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAAtga
gi|18 : GCG-T-TGTCTAGTGGAAGAGTA------TCCACCTTGCATG-CGGAAGGTCTTGGGTTCGATCCCC-GGCCGGT-TCATACCA---AGTACTTGTTA-AA-T---GGTACTAGTAGCTTCTTCGATTGGCGCTCAACA-----TTAAGAG-GATTATCCCAGGTCTGGTCGATACGGTGT---TATAATGTGACTTG-GTGG---G-caaca
gi|19 : caA-AA-T---GGTATTAAAAGCTTCCTCG----------------------------ATAGTTCTAGGTCAGGTCAGCCCTTAGTCAGTTAAATGAGACTGG-ATGG---T-GTATCATACCATGTGTCTGTGACATGATACTCCATT----GTGGCAGTGTT----------------------------------CACC--AT----CGCG-----ATATAACTG-AACAA-TTGTT---GAAAGCA--ATGCTAAACACCATACAt
gi|2 : GCG-T-GGTCTAGTGGTAGAGCG------TCCGCCTCGCATG-CGGAAGGTTGTGGGTTCGATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTTAAA-AA-T---GGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGACGCTCAGCA-----TTTAGAG-GAGAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATATTCCAGT----GTGACAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAAgca
gi|20 : TTAAAA-AA-T---GGTACTATTAGCTTTCCCGCTTGAAGCACAGCA-----TTCAGAA-GACAGTTCTGTGTCTGGTCTGCCCGATGTCAGTATAATTTGATCGG-GTGG---G-GCATCATACCATGTGTCTGCG-------------AT----GTGGTAGCGCT-----TAGAA----TA-ATGTCTGAA
gi|21 : G-T-GGCCTTGTGGTAGAGCG------TCCCACTCGCATA-CGGAATCTCGTGGGTTCGATCCCC-GACAGGA--CATACAA---AATAATTGAAA-AA-T---AGTACTAGAAGCTTCCTCATTTTGCTCTCAGCA-----TTAAGAG-GAT
gi|22 : cagcgCTAGACGTAGAGCA------TCTGCCTCGCATA-CAGACAGTTGTGGGTTCAATCCCC-AGCCAGG-TCATACCA---AAGACTAGAAA-AT-T---GGTACTAAAAA----------TGTTGCTCAACAGAAAGTTCAGAG-GA
gi|23 : tgttgaGGCATCCTACTCCAGT----GTGGCAGTGCT-----TAGA--------------CAAGTAGA---CACT--GT----TGCG-----ATATAACTG-AAAAAGTTGTT---GAAAGCA--ACACTTAAAACTAT
gi|24 : gtgatagagttgCATGATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----TAGAA----AA-CTGTATCAAGTAAA---CACC--GT----CGTG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAATCACCTTACAA
gi|25 : G-T-GGTCTAGGGGTAGAGCA------CCAGCCTCGCTTG-TGGAAGATCGTATATTCGATCCCC-AGCTCGG-TCAT
gi|26 : caaacca-----CAAAT----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--AGGCTAAACACCATACAAcaacatttctcaagcaatacatagtc
gi|27 : agtgttaacATTTGAGTGG-GTGG---G-GTACCATGTCACATGTCTGAG-------------AT----GTGGCA----T-----CACCG----TACCTATATCAAATAAATACCACC--GTGAAACGTT-----ATGTGACTG-AAcaacaacaacaac
gi|28 : G-T-GGACTAGT--TAAAA--------TTTGTCTCGCATG-CGAAATGTCATGGGTTCAAACCCA-GGCCATA-TTATAGCA---AAGACTAAAAT-AA-G---AGTAATAAAAG
gi|29 : aGCATGATATATAAGT----GTGACAGCGTT-----CAACA----TA-CTATTTGAAGCAGA---AACA--AT----CGTG-----ACATGA-TG-A---------T---GAAAATG--ACACTAAACACTATACAA
gi|3 : G-T-GATCTAGTGGTCGAGCT------TCTGCCTCAAGTG-CGAAAGGTCGTAGGTTCGATCTCC-GACTGGG-TCATACCA---AAGACTTAAAA-AA-T---TGAACTAGAAGATTCCTTGCTCGGCGCCCTGCA-----TTTAGAG-GATAATTCTAGGTCTGGTCGGCC-GGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGT---A-GTATCATGCGATTTGTCTGCGGTATAATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----CAGAA----TA-CTATCCCAAGTAGA---AACC--GT----CGCG-----GTATGACTG-AACAA-TCGTT---GAAAGTG--ACGCTTAACGCCATACAAc
gi|30 : gtgGCT-----TAGAG----TA-CTGTATCTCGTCAT---CCCCCAGT----CACGCCATAATATAACTG-AAAAA--TGTT---TAAA-CGATACTCTTAACACTATACAA
gi|31 : acgaATACTCCAGT----ATGACAGCGCT-----TAGAA----TA-CT----CGAGTAGA---CACC--GT----CACA-----ATATAACTG-AAATA-TTGTT---GCAAGCG--ACGATTAACACCATACAAcaa
gi|32 : -GGTCAAGTGATAGAGAG------TCTGCCTCGCATA-TGGAAGGTCATGGATTCGATCCCC-CGCCAAG-TCATATCA---AAGACTTGACA-A
gi|33 : acagcagTAGTGGTTGAGTG------TCCA-CTTGCATG-CAGAAGTTTGTTGGTTCAATCTCC-AGCCAGA-TCAAGCCATCGAAAACTTGACA-AA-T---ga
gi|34 : taTGG---G-GTATCATGCTGTATGTCTGCATCATGATACTACAGT----GTGGAAACGTT--------AA-------------CAAGCAG-----ACC--TT----TGTG-----ATATCAC
gi|35 : aA----TA-TTGTCTCAAGTAGA---CATC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AACAA-TTGTT---GAAAGAG--AAGCTATACAACA
gi|36 : A-TTATT---GAAAACG--ACGCTTAACACCACACAAa
gi|4 : GCGAT-GTTCTAGTAGTAGAGAG------TCTGTCTCCCATGGCGAAGGGTC-CGAGTTCGATCTGT-GGTCGTG-GCATACCA---ATGACTTGTAA-AA-C---AATACTTTAAGCTTCCTCGTTTGGTGCTCAGCA-----TTTAGAG-GATAGTTCTGGGTCTTGCCGGTCTGGTGTCAGCTTAATTTAACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGTGGCATGATACTCCAGT----GTAGCAATGCT-----CGGAA----TG-CTGTCTCAAATGGA---CACG--AA----TGTG-----ATATGGCTGAAAAAA-ATGTT---GAAAGCA--TCGCTAAACACtaa
gi|5 : caG-T-AGTCTAGGAGTAGAACG------TCCGCTTCACATG-CGGAAAGTCGTAAATTCGATTTCC-GGCTGGA-TCATACCA---AAGA-TTGAAA-AA-TAATGGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGGCGCTCAGTG-----TTTAGAG-GATAGTTCCAGACCTGGTCGGCCCGGTATCAATCTAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATATCGTATGTTGGCGACACGAAACTCAAAT----GTGGCAGCGCT-----TAGAA----TA-TTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CTCG-----ACATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCA--ACTCTAAACACtt
gi|6 : cagcgG-T-GGTCTATAGGTAGAGCG------TCAGCCTCGCATG-CGGCATGTCATTGGTTCGACCCCCCGGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTGAAT-AA-T---AGTTATA-AAGCGTCCTTGCTCAGTGCTAAGCA-----TTAAGTG-GATAGTTCTGGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTTTAATGTGATTGG-GTGA---G-GTATCATACCA--TGTCTGCGGAATGATACTCCAGT----GTGGCAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACA--TT----TGCG-----ATAT--CCG--CAAA-TTGTT---GAAATTG--ACGCTAAACACCACACAt
gi|7 : gcagcaGCG-T-GGTCTAGTGGTAGAGCG------TCCGCCTCGCATG-CGGAAGGTCGTGGGTTCAATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTTAAA-AA-T---GGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGACGCTCAGCA-----TTTAGAG-GAGAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----TAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---------G--ACGCTAAACCCCAAACAA
gi|8 : cgG-T-TGTCTAGTGGTACAACG------TCCGCCTTGCATG-AGCAAGTTCATGGGCTCGATCCCT-GGCCCGG-TCATACCA---AAAACTCGAAA-AAGT---GGGACTAGAAGCTTTCTCACTTGGCACTCGGCA-----TTAAGTG-GATAGTTCTAGGTCTGGTTGGCCCGGTGCCAGTATAATGAGAATGG-GTGG---A-GAATCATATCATGT------GGCAAGAGATTCCAGC----GAGGCAGTATTAAGTACAAAA----TA-CTGTCTCAAGTG-----------GT----TGCG-----ATATGACTG-AAAAC-TT-TT---AAAAGCA--GCACTAAACAc
gi|9 : gcagcaCACCTCGCATG-CGGAATGTCGTGGGTTCAATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTTAAA-AA-T---GGTACTAAAAGCTTCCTCGCTTGACGCTCAGCA-----TTTAGAG------TTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----TAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CAAC--AT----CACG-----ATATGACTG-AAGAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCAAACA
blockSeqs : A T . G C G TCG A T G AAT GAAAG T T . . A . AAGTAC ATAC C TAC CA GAAA CCATA A G TTG AT
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . T . . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . T . . . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . A . . . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . T . . . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . A . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . C . . . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . T . . . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . T . . . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . A . . . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . T . . . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ****** *** ****
originalCons : GCG-T-GGTCTAGTGGTAGAGCG------TCCGCCTCGCATG-CGGAAGGTCGTGGGTTCGATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTGAAA-AA-T---GGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGGCGCTCAGCA-----TTTAGAG-GATAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGGCAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAA
finalCons : GCG-T-GGTCTAGTGGTAGAGCG------TCCGCCTCGCATG-CGGAAGGTCGTGGGTTCGATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTGAAA-AA-T---GGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGGCGCTCAGCA-----TTTAGAG-GATAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGGCAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAA
Alignments
lowQualScore : 2 2 0 555555 1 1 1 333 0 3 1 1 333 44444 3 1 1 333 1 3333 666666 3333 1 222 22 3333 33333 1 1 222 22
lowQualScore : . . . ...... . . . ... . . . . ... ..... . . . ... . .... ...... .... . ... .. .... ..... . . ... ..
lowQualScore : 4 2 9 888888 7 7 7 222 5 3 7 7 000 88888 3 9 9 222 8 5555 111111 1111 5 777 11 3333 88888 6 6 888 22
consensus : GCG-T-GGTCTAGTGGTAGAGCG------TCCGCCTCGCATG-CGGAAGGTCGTGGGTTCGATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTGAAA-AA-T---GGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGGCGCTCAGCA-----TTTAGAG-GATAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGGCAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAA
Reference ( family-118 ) : GCG-T-GGTCTAGTGGTAGAGCG------TCCGCCTCGCATG-CGGAAGGTCGTGGGTTCGATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTGAAA-AA-T---GGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGGCGCTCAGCA-----TTTAGAG-GATAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGGCAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAA
gi|1 : G-T-GGTCAAGGGATAGAGCGAGAGCGTCCGCC-------------GGTCGTGGGCTCGATCCCC-TGCCGGC-TCATACAA---AATACCTAAAA-AA-T---TGTGCTAGAAGCTTCCTCGCTTGGCGCTCGGCT-----TTAAGAG-GATAGATTTAGGTTTGGTCGACTCGTTGTCAGTATAATGTTACTGGAATGGATTG-ATAGCATACCATGTGTCTACGGCATGATACTCTGGTGTGGGTGGCAGCGCT-----CAGTA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CATT--GT----CGCA-----ATGTGACTG-AAAAC-TTATT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAA
gi|10 : cagcgGCG-TTGGTCTAGGGTTGGAGCA------TCCGCCTGTCACG-TGGAAGGTCATGGGTTCCATCCGT-GGTCGGGGTCATACCA-----GAC--AAAA-AA-T---GGTTCTAGAAGCTTCCTGAGTTAATGCTCAGCA-----TTTAGAG-GTTAGTAAAAGGTCTGGTTGACCTTGTGTCGGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCGTACCA-----------CA-----------T----GTGGCAGCGCT-----TAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--AT----CGTG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTTAACACCATGCAAca
gi|11 : caGCG-T-AGTCTGGTGGTAAAGCA------TCTGCCTCACTTG-CAGAAG------------ATCCTC-AGCCAGG-TCA-ACCA---AAGACTTTAAA-AC-A---GGTACTTGACGCTTTCTCCCTTGGTGCTCAACA-----TT-AGAGTAATA-TTCTGGGTCTGGTCAGTCAGATATCAGTATAATATCACTGG--TGG---G-GTATTGTACCATGTGTCTGCGGAATGATATTTCTAT----GTGGAAGTGCA-----GAGAA----TA-C--TCTCAAGTAGA---CACC--AT----CG--------TAAGACTG---AAT-TTGTTTTGGAAAGTA--ACGCAAAACTCCATA
gi|12 : G-T-GGTCTAGGGGTAGAGCG------CCCGCCACGCATG-CGGAAGGTCGTGGGTTCGATCCCC-TGCCAGA-TCACACCA---A-----T---A-AA-T---GGTACTAGAAGTTTCCTCCCTTGGTGCTTAGCA-----CTTAGAG-GATAGTTCTAAGTCTGATCGGCTCGGTGTCAGTATAATGTGTCTTG-GCGG---G-GTATCATACCAT-----------ATGGCACTCCAGT----GTGGCAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGTG-----ATATACCAG-AAAAA-ATGCT---GAAAGCA--ACGTT--ACACC
gi|13 : gG-T-GGTCTAGTGGTAGAGTG------TCTGACTCATGTG-CGGAAAGCCATCGGTTCGATCCTC-GGCAGGG-TCATACCA---AA---TT-----------------------CTTCCTGAAATGGCGCTCATCA-----TTTAGAG-GATAGTCCTACCTCTGGTCGGTCATGTGTTGGTAAAATTTGACTAG-ATGG---G-GTA-GAT---ATGTGTCTGCGGCATGATTCTCCAGT----CTGGCAGCACT-----CAAAAATACTA-TTGTTT-------------CC--AT----CACG-----ATATGACTG-AAAAG-TTGTT---GAAAGCG--ACACTAAACACCATAC
gi|14 : gcagcgCGCATG-CAGACGGTCGTGGGTTCGATCCCT-GACCGAG-TCGTATCA---AA--------A-TA-T---GGTACAAGTAACGTCATCACTTGGCGCTCAGCA-----TTTAGAG-GATAGTTCTAGGTCTTGTCGACCCGGTG-------------ACTGG-GTGG---GAGTGTCATACAATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTTGCAGCGTT-----CAGAA----TA-CTGTCTAAAGTAGA---CACC--GT----CTCG-----ATATGAC------------TT---AAAAGCG--GCGCTAAACACCATACAA
gi|15 : CATG-CG-ATGGTCATGGTTTTGATCCCC-AGCTGGG-TCATACCA---AAGACTTG-AA-AA-T---GGTACTGGAAACTTCCTCGcaaca
gi|15 : aGGTTGGCCCAGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-ATGTCATACCATGTGTCTG--GCATGATACTTCAGC----ATGGCAGCACT-----AAGAA----TA-CTGTCTTAAGTAGA---CACT--GT----CCTA-----AGATAAATG-AAAAG-TTGTT---GAAAGTG--ACAATAAACACAGTACAtaaggttggcccagtgtcagtataatgtgactgggtgggatgtcataccatgtgtctggcatgatacttcagcatggcagcactaagaatactgtcttaagtagacactgtcctaagataaatgaaaagttgttgaaagtgacaataaacacagtaca
gi|16 : acatgcgatggtcatggttttgatccccagctgggtcataccaaagacttgaaaatggtactggaaacttcctcgtaaG-T-GGTCCAGAGGTAGAATG------ACTGCCTCGCATG-CAGATGGTCATGGGTTCATTCTCT-GGCTGGG-TTATACCA---TAGACTTGAAATAA-T---GTT-CAAGAAGGTTCCTTGCA-AGCACCCAGCA-----TTAAGAG-GATAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCTTGTATCACTATAATGTGACTAG-GTGA---G-GTATCATACCATGTGTCTACAGCATGACACTCCA
gi|17 : gcagtgCTAGAAGCTTCCTCGATTGACGCTCAGCA-----TTTAGAG-GATAGTTCTAAGTCTGGTCGGCCCGTCGTCGGTATAATGTGACTGG-GTGA---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----AAGAA----TA-CTGTTTCAAGTAGA---CACC--GT----GGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAAtga
gi|18 : GCG-T-TGTCTAGTGGAAGAGTA------TCCACCTTGCATG-CGGAAGGTCTTGGGTTCGATCCCC-GGCCGGT-TCATACCA---AGTACTTGTTA-AA-T---GGTACTAGTAGCTTCTTCGATTGGCGCTCAACA-----TTAAGAG-GATTATCCCAGGTCTGGTCGATACGGTGT---TATAATGTGACTTG-GTGG---G-caaca
gi|19 : caA-AA-T---GGTATTAAAAGCTTCCTCG----------------------------ATAGTTCTAGGTCAGGTCAGCCCTTAGTCAGTTAAATGAGACTGG-ATGG---T-GTATCATACCATGTGTCTGTGACATGATACTCCATT----GTGGCAGTGTT----------------------------------CACC--AT----CGCG-----ATATAACTG-AACAA-TTGTT---GAAAGCA--ATGCTAAACACCATACAt
gi|2 : GCG-T-GGTCTAGTGGTAGAGCG------TCCGCCTCGCATG-CGGAAGGTTGTGGGTTCGATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTTAAA-AA-T---GGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGACGCTCAGCA-----TTTAGAG-GAGAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATATTCCAGT----GTGACAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCATACAAgca
gi|20 : TTAAAA-AA-T---GGTACTATTAGCTTTCCCGCTTGAAGCACAGCA-----TTCAGAA-GACAGTTCTGTGTCTGGTCTGCCCGATGTCAGTATAATTTGATCGG-GTGG---G-GCATCATACCATGTGTCTGCG-------------AT----GTGGTAGCGCT-----TAGAA----TA-ATGTCTGAA
gi|21 : G-T-GGCCTTGTGGTAGAGCG------TCCCACTCGCATA-CGGAATCTCGTGGGTTCGATCCCC-GACAGGA--CATACAA---AATAATTGAAA-AA-T---AGTACTAGAAGCTTCCTCATTTTGCTCTCAGCA-----TTAAGAG-GAT
gi|22 : cagcgCTAGACGTAGAGCA------TCTGCCTCGCATA-CAGACAGTTGTGGGTTCAATCCCC-AGCCAGG-TCATACCA---AAGACTAGAAA-AT-T---GGTACTAAAAA----------TGTTGCTCAACAGAAAGTTCAGAG-GA
gi|23 : tgttgaGGCATCCTACTCCAGT----GTGGCAGTGCT-----TAGA--------------CAAGTAGA---CACT--GT----TGCG-----ATATAACTG-AAAAAGTTGTT---GAAAGCA--ACACTTAAAACTAT
gi|24 : gtgatagagttgCATGATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----TAGAA----AA-CTGTATCAAGTAAA---CACC--GT----CGTG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAATCACCTTACAA
gi|25 : G-T-GGTCTAGGGGTAGAGCA------CCAGCCTCGCTTG-TGGAAGATCGTATATTCGATCCCC-AGCTCGG-TCAT
gi|26 : caaacca-----CAAAT----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCG--AGGCTAAACACCATACAAcaacatttctcaagcaatacatagtc
gi|27 : agtgttaacATTTGAGTGG-GTGG---G-GTACCATGTCACATGTCTGAG-------------AT----GTGGCA----T-----CACCG----TACCTATATCAAATAAATACCACC--GTGAAACGTT-----ATGTGACTG-AAcaacaacaacaac
gi|28 : G-T-GGACTAGT--TAAAA--------TTTGTCTCGCATG-CGAAATGTCATGGGTTCAAACCCA-GGCCATA-TTATAGCA---AAGACTAAAAT-AA-G---AGTAATAAAAG
gi|29 : aGCATGATATATAAGT----GTGACAGCGTT-----CAACA----TA-CTATTTGAAGCAGA---AACA--AT----CGTG-----ACATGA-TG-A---------T---GAAAATG--ACACTAAACACTATACAA
gi|3 : G-T-GATCTAGTGGTCGAGCT------TCTGCCTCAAGTG-CGAAAGGTCGTAGGTTCGATCTCC-GACTGGG-TCATACCA---AAGACTTAAAA-AA-T---TGAACTAGAAGATTCCTTGCTCGGCGCCCTGCA-----TTTAGAG-GATAATTCTAGGTCTGGTCGGCC-GGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGT---A-GTATCATGCGATTTGTCTGCGGTATAATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----CAGAA----TA-CTATCCCAAGTAGA---AACC--GT----CGCG-----GTATGACTG-AACAA-TCGTT---GAAAGTG--ACGCTTAACGCCATACAAc
gi|30 : gtgGCT-----TAGAG----TA-CTGTATCTCGTCAT---CCCCCAGT----CACGCCATAATATAACTG-AAAAA--TGTT---TAAA-CGATACTCTTAACACTATACAA
gi|31 : acgaATACTCCAGT----ATGACAGCGCT-----TAGAA----TA-CT----CGAGTAGA---CACC--GT----CACA-----ATATAACTG-AAATA-TTGTT---GCAAGCG--ACGATTAACACCATACAAcaa
gi|32 : -GGTCAAGTGATAGAGAG------TCTGCCTCGCATA-TGGAAGGTCATGGATTCGATCCCC-CGCCAAG-TCATATCA---AAGACTTGACA-A
gi|33 : acagcagTAGTGGTTGAGTG------TCCA-CTTGCATG-CAGAAGTTTGTTGGTTCAATCTCC-AGCCAGA-TCAAGCCATCGAAAACTTGACA-AA-T---ga
gi|34 : taTGG---G-GTATCATGCTGTATGTCTGCATCATGATACTACAGT----GTGGAAACGTT--------AA-------------CAAGCAG-----ACC--TT----TGTG-----ATATCAC
gi|35 : aA----TA-TTGTCTCAAGTAGA---CATC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AACAA-TTGTT---GAAAGAG--AAGCTATACAACA
gi|36 : A-TTATT---GAAAACG--ACGCTTAACACCACACAAa
gi|4 : GCGAT-GTTCTAGTAGTAGAGAG------TCTGTCTCCCATGGCGAAGGGTC-CGAGTTCGATCTGT-GGTCGTG-GCATACCA---ATGACTTGTAA-AA-C---AATACTTTAAGCTTCCTCGTTTGGTGCTCAGCA-----TTTAGAG-GATAGTTCTGGGTCTTGCCGGTCTGGTGTCAGCTTAATTTAACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGTGGCATGATACTCCAGT----GTAGCAATGCT-----CGGAA----TG-CTGTCTCAAATGGA---CACG--AA----TGTG-----ATATGGCTGAAAAAA-ATGTT---GAAAGCA--TCGCTAAACACtaa
gi|5 : caG-T-AGTCTAGGAGTAGAACG------TCCGCTTCACATG-CGGAAAGTCGTAAATTCGATTTCC-GGCTGGA-TCATACCA---AAGA-TTGAAA-AA-TAATGGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGGCGCTCAGTG-----TTTAGAG-GATAGTTCCAGACCTGGTCGGCCCGGTATCAATCTAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATATCGTATGTTGGCGACACGAAACTCAAAT----GTGGCAGCGCT-----TAGAA----TA-TTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CTCG-----ACATGACTG-AAAAA-TTGTT---GAAAGCA--ACTCTAAACACtt
gi|6 : cagcgG-T-GGTCTATAGGTAGAGCG------TCAGCCTCGCATG-CGGCATGTCATTGGTTCGACCCCCCGGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTGAAT-AA-T---AGTTATA-AAGCGTCCTTGCTCAGTGCTAAGCA-----TTAAGTG-GATAGTTCTGGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTTTAATGTGATTGG-GTGA---G-GTATCATACCA--TGTCTGCGGAATGATACTCCAGT----GTGGCAGCGCT-----CAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACA--TT----TGCG-----ATAT--CCG--CAAA-TTGTT---GAAATTG--ACGCTAAACACCACACAt
gi|7 : gcagcaGCG-T-GGTCTAGTGGTAGAGCG------TCCGCCTCGCATG-CGGAAGGTCGTGGGTTCAATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTTAAA-AA-T---GGTACTAGAAGCTTCCTCGCTTGACGCTCAGCA-----TTTAGAG-GAGAGTTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----TAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CACC--GT----CGCG-----ATATGACTG-AAAAA-TTGTT---------G--ACGCTAAACCCCAAACAA
gi|8 : cgG-T-TGTCTAGTGGTACAACG------TCCGCCTTGCATG-AGCAAGTTCATGGGCTCGATCCCT-GGCCCGG-TCATACCA---AAAACTCGAAA-AAGT---GGGACTAGAAGCTTTCTCACTTGGCACTCGGCA-----TTAAGTG-GATAGTTCTAGGTCTGGTTGGCCCGGTGCCAGTATAATGAGAATGG-GTGG---A-GAATCATATCATGT------GGCAAGAGATTCCAGC----GAGGCAGTATTAAGTACAAAA----TA-CTGTCTCAAGTG-----------GT----TGCG-----ATATGACTG-AAAAC-TT-TT---AAAAGCA--GCACTAAACAc
gi|9 : gcagcaCACCTCGCATG-CGGAATGTCGTGGGTTCAATCCCC-GGCCGGG-TCATACCA---AAGACTTTAAA-AA-T---GGTACTAAAAGCTTCCTCGCTTGACGCTCAGCA-----TTTAGAG------TTCTAGGTCTGGTCGGCCCGGTGTCAGTATAATGTGACTGG-GTGG---G-GTATCATACCATGTGTCTGCGGCATGATACTCCAGT----GTGACAGCGCT-----TAGAA----TA-CTGTCTCAAGTAGA---CAAC--AT----CACG-----ATATGACTG-AAGAA-TTGTT---GAAAGCG--ACGCTAAACACCAAACA