lowQualScore : 0 0 11111 00 0 0 0 1 0 11111 0 0 0000 0 000 1111111 0 00
lowQualScore : . . ..... .. . . . . . ..... . . .... . ... ....... . ..
lowQualScore : 4 4 44444 66 4 4 4 8 4 00000 4 4 9999 5 777 3333333 4 66
consensus : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGG-TG-A-GGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
Reference ( gi|165511 ) : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGG-TG-A-GAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165513 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGG-TG-A-GAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165508 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGG-TG-A-GAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AA-TGCA--CACA
gi|165548 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGG-TG-A-GAAG-CAAA-----TG-AA-AAA----TATGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165517 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGG-TG-A-GGAT-CAAA-----TG-GA-AAA----TGCGAGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165557 : TATTACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGG-TG-A-GAAT-CGAA-----TG-AA-AAA----TGCGGATGCT---AG-------AG-TGCA--CACa
gi|165509 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGG-TG-A-GAGT-CAAC-----TG-GA-AAA----TGCGGGTGCT---AA-------AG-TGCA--CACA
gi|165526 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGA-TG-A-GAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TTCGGGTGCT---AG-------AG-CGCA--CACA
gi|165524 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGA-TG-A-GGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TTCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165525 : TATAAATA-C-TGT-----G--TAAGTTTGG-TG-A-TATT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165540 : TATAACTA-C-TGA-----G--TAAGTTTTG-TG-A-GAAT-CAAA-----AG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165528 : TATAAATA-C-TGA-----G--CAAGTTTGG-TG-A-GAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCC---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165527 : TAAAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGG-TG-A-GAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCC---AG-------AG-TTCA--CACA
gi|165568 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGA-TG-A-GAAT-CGAA-----TG-AA-AAA----TGC-GGTGCT---AG-------AG-TGCA--CAa
gi|165551 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGG-TG-A-GGAT-CACT-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TACA--CACA
gi|165543 : TATAACTA-C-TGA-----A--TAAGTTTGG-TG-A-GAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TACAGGTGCT---AG-------AG-TACA--CACa
gi|165516 : TATAACTA-C-TTT-----G--TAAGTTTGA-TG-A-TAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TATGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165522 : TATAACTA-C-TGT-----G--CACATTTGG-TG-A-GGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTGGGTGCT---GG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165563 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGT-TG-A-GGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTGAATGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165519 : TATAATTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGG-TG-A-TGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTAGGTGCT---AG-------AG-TGCG--CACAa
gi|165520 : TATAATTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGG-TG-A-GGAT-CAAA-----TG--A-AAA----TGCGAGAGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165530 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAATTTTTG-TG-A-GAAT-TAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCC---AG-------AC-TGCA--CACAa
gi|165546 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGA-TG-A-GGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCTCGTGCT---AC-------AG-TGCA--CACAa
gi|165588 : TATAACAA-C-TGT-----G--TAAGTTTGA-TG-A-TAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTTGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165514 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAATTTGG-TG-A-GGAT-CAAT-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CA
gi|165574 : TATAACTA-C-TGT-----A--TAAGTTTGG-TA-A-GAAT-CAGA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AT-GGCA--CACA
gi|165531 : TATAAATA-C-TGT-----G--TAAGTTTGA-CG-A-GAAT-TAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGATGAT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165539 : TATAATTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGA-TG-A-AGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGAGGGTGCT---AG-------AG-TGGA--CACA
gi|165579 : TATAACAA-C-TGT-----G--TAAGGCTGG-TG-T-GAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCTGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165542 : TATAACTA-C-TAT-----A--TAAGTTTAG-TG-A-AGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGTGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165558 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGG-TG-A-GGAT-CAAA-----TGCAA-AAA----TGCGAGTGCT---AT-------TG-TGCA--CACAa
gi|165529 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAATTTGA-TG-A-GGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TTCGGGTACA---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165559 : TATAACAA-C-TGC-----G--TAACTTTGG-TG-A-GATT-CAAA-----TG-GA-AAA----TGCGGATGCT---AG-------AG-TGCA--CACa
gi|165612 : TATAACAA-C-TGT-----A--TAAGTTTGG-TG-A-GAAT-CAAA-----TG-AA-AAC----GGCTGGCGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165598 : TATAACTA-C-TGT-----A--TAAGTTTAG-TG-A-AAAT-CTAA-----TT-AA-AAA----TGCGAGTGCT---AA-------AG-TGCA--CACAa
gi|165538 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGATTGG-TG-A-GGTT-CAAA-----TG-AA-GAA----TGCAGGTGCT---GG-------AG-TGCA--CACa
gi|165580 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGT-TG-A-GGAT-CAAA-----TA-AA-TAA----TGCGTGTGCT---AG-------AG-TGTA--CACA
gi|165571 : TATAATTG-C-TGT-----G--TAAGTTTGA-TG-A-GGAT-CAAA-----TT-AA-AAA----TGCAGGTGCTTAAAG-------AG-TGCA--CACA
gi|165564 : TATAACTA-C-TGG-----G--TAAGTTTGG-TG-A-AAAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AA-AGCA--TACAa
gi|165552 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGG-GG-A-GGAT-CAAT-----TG-AA-AAT----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TACA--CACAa
gi|165537 : TATAACTA-C-TGT-----A--TAAGTTTAG-TG-A-AGAT-CGAA-----TG-GA-AAA----TGCAAGTGTT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165578 : TATAACTA-C-TAT-----A--TAAGTTTAG-TG-A-AGAT-CCAA-----TG-AA-AAT----TACGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165532 : TATAACAA-C-TAT-----G--CAAGTGTGG-TG-A-GGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TTCGGGAGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165586 : TATAACTA-C-TAT--------TAAGTTTCG-TG-A-AAAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-CGCA--CACA
gi|165555 : TATAACTA-C-TGT-----G--TCAGTTTGG-TG-A-AGAT-CAAA-----TG-AA-ATT----TGTCGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165590 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGG-TA-A-AAAT-CGAA-----TG-AA-AAT----TGCGAGTGCT---GG-------AG-TTCA--CAa
gi|165521 : TATAAATA-C-TGT-----G--TAAGTTTAG-TA-C-GGAT-CAAA-----TG-CA-AAA----TGCAGGTGCC---AG-------AG-TGCA--CACAaaa
gi|165628 : TATAACTA-C-TGT--------TAAGCTTGG-TA-A-GGAA-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTGGATACT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165518 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTAGG-TG-A-GAAT-CAAA-----C--AA-AAA----TTCATGTGCC---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165577 : TATAACTA-C-TAT-----G--TAAGTTAGG-TA-A-ACAC-CAAA-----TA-AA-AAA----TGCAGGTACT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165624 : TATTACTA-C-TCT-----G--TAAGTTTGG-TG-A-GGAA-CAAAATTAATG-AA-AAA----TGTGGATGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165544 : TATAACTA-C-TAT-----G--TAAGTTTGG-TG-G-ACAT-CAAG-----TG-AA-AGC----TGCGAGTACT---AG-------AA-TGCA--CACA
gi|165587 : TATAATTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGG-TG-A-GGAT-CAAA-----TG-AA-TAC----TGTGGTGGCT---AG-------AG-CGCA--CACAa
gi|165606 : TATAAC-A-C-TGT-----G--TAAATTTGG-TG-A-AGAT-CAAA-----TG-AA-GAAATTCTGAGAGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165643 : TACAACTA-C-TGT-----G--TGAGTTTGG-TG-A-GGAT-TAAA-----TA-AA-AAG----TATGGGTGCT---CA-------AG-TGCA--TACAa
gi|165625 : TATTACTA-C-TAT-----A--TAAGTTAAG-TG-A-AGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGAT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165630 : TATAATGA-C-TTT-----G--TAAGTTTGG-TG-A-GGAT-CATA-----TT-AA-AAA----TGTATGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165596 : TATAACCA-C-TATT----A--TAAGTTTAG-TG-A-AGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTACT---AG-------AG-TACA--CACAa
gi|165572 : TATAACTA-C-TAT-----G--TAAGTTTGG-TG-A-AGAC-CCAA-----TG-AA-AAA----AGCAGGTGCT---AC-------AG-TAAA--CACAa
gi|165617 : TACAACTA-G-TGT-----G--CAAGTTTGG-TG-G-AGAT-CAAA-----TG-AA-AAT----TACATGCGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165603 : TACAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGA-TG-A-AGAC-CCAA-----TA-AA-TAA----TGCAGGGGCT---AG-------AG-TGCA--CATA
gi|165576 : TATAACTA-C-TGT-----A--TCAGTTTAA-TG-A-GGAT-CAAA-----TA-AA-AAC----TGCACATGCT---AG-------AG-TGTA--CACAa
gi|165623 : TATAACTA-C-T----------TAAGTTTAG-TG-A-AGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGTTGGTGCT---AG-------AG-GGCA--CACAa
gi|165581 : TATAACAA-C-TAT-----G--TAAGTTTGG-TG-A-ACAC-CCAA-----TG-AA-AAA----TGAAGGTGCT---AT-------AG-CGCA--CACAa
gi|165658 : TAAAACTA-C-TAT-----A--TAAGTTTAG-TG-A-AGAT-TTAA-----TG-CA-AAA----TGTGGATGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165533 : TATAACTA-C-TAT-----A--TAAATTTAG-TG-A-AGAT-CAAA-----TG-AA-ATA----TTTGGGAACT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165582 : TATAATTA-C-TGG-----G--TAAGATAGG-TG-A-AGAT-CAAA-----TG-AT-AAC----TGCGAGTGCT---AG-------AG-TGCA--CATAa
gi|165575 : TATAACTA-C-TAT-----AAATAAGTTTAG-TG-A-AGAT-CCAA-----TG-AA-ATA----TGTAGGTGTT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165634 : TACAACAA-C-TGT-----G--CAAGTTTGG-TG-G-AGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGT--GTGAT---AG-------AG-CGCA--CACAa
gi|165622 : TATACCTA-C-TAT-----A--TAAGTTTAG-TG-A-AGAT-CCAA-----TG-AAAAAA----TTCAGATGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165611 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGG-TG-A-AGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGGGCa
gi|165646 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAATTTGG-TA-A-AGAT-CAGA-----TA-AA-ACA----T--GGGTGCT---AG-------AA-TGCA--GACA
gi|165592 : TATAATAA-A-TGT-----A--TAAATTTGG-TG-A-AGAT-CAAA-----TG-GA-AAA----TGCATATGCT---GG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165573 : TATAACTA-C-TGT-----G--TATGTTTAG-AG-A-AGAT-GAAA-----TG-AA-AAA----TATGGGTACT---GG-------AA-TGTA--CACAa
gi|165640 : TATAACCA-C-TGT-----G--TAAGTTTAG-TC-A-AAAT-CAAA-----CG-AA-AAA----TGCAGGTGTT---GG-------AG-a
gi|165661 : TATAACTA-C-TGT-----C--TGTGTTTGGTTG-A-G-CT-CAAA-----TG-AA-AAT----TGCAAGTACT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165637 : TATAACTA-C-CGT-----G--TAAGTTTAG-TG-A-AGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCAAATGCT---AC-------TGTTGCA--TACAa
gi|165649 : TATAACTA-CATGTACCTTG--TAAGTTTGG-TG-A-AGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGTAGGTGTT---AGAGATTAAAG-TGCA--CACAa
gi|165657 : TATAACAA-C-TCT-----G--TAAGTTTGG-TGAA-GACT-C-AA-----TG-GA-AAA----TGCAGGTGCT---AC-------AG-TGTA--GACAa
gi|165650 : TATAACTA-A-TGT-----G--TATGTTTGG-GG-A-AGAT-GAAA-----TG-AA-AAA----TTCATGTGTT---AG-------AG-TGCA--CATAa
gi|165626 : TATAACTT-A-TAT-----G--TAAGTTTTG-TG-A-AGAT-CTAA-----TG-AA-AAA----TGACGATGCT---GG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165620 : TATAGCTA-C-TAT-----A--TAAATTTGG-TG-A-AGAT-CCAA-----TG-CC-AAA----TGCAAGTGCT---GG-------AT-TGCA--CACAa
gi|165633 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGGTTGG-TG-G-CGAT-GCAA-----TA-AA-AAC----TGCAGATGAT---GG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165654 : TATAAGTA-C-AGT-----G--TAGGTTTGT-TC-A-AGAT-CAAA-----TA-AA-AAC----TGCTGGTGCT---GG-------AG-TGCA--CATAa
gi|165632 : TATAGCTA-C-TAT-----A--TAAATTTGG-TG-A-AGAT-TCAA-----TG-CC-AAA----TGCAAGTGCT---GG-------AG-TGCA--CAa
gi|165830 : ATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGG-TG-A-GAAT-CAAA-----TA-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAgaa
gi|165832 : ATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTAG-TG-A-TAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TACGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165843 : ATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGG-TC-A-GGAT-TCAA-----TG-AA-AAC----TGTGGTTGTT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165847 : ATGATTA-C-TGT-----G--TAAGATTGG-TG-A-GAAT-AAAA-----TT-AA-AAA----TACAGGTGCT---AG-------AG-AGCA--CACAa
gi|165837 : ATAAATAAC-TGT-----G--AAAATTTGA-TG-A-AGAT-CTAA-----TG-AA-AAC----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165846 : ATAACTA-C-TGT-----T--CAAGTTTGG-TG-A-AGAT-TCAA-----TA-AA-AAA----TGCTGGTGCA---AG-------AG-AGCA--CACAa
gi|165879 : TAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTAG-TG-A-GGAT-TAAA-----TT-AA-ACA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165877 : TAACTA-C-TAT-----A--TAAGTTTGG-TG-A-AGAT-CCAA-----TC-AA-AAA----TGCGAGTGCT---AG-------AG-GGCA--CACAa
gi|165896 : AACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGG-TG-A-GAATATAAA-----TG-AG-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCATGCACAa
gi|165895 : AACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGG-AG-ATGAA--CAAA-----TG-AA-AAA----TGCTGGTGCT---AG-------AG-TGCA--TACA
gi|165897 : AACAA-C-TGT-----G--CCAGTTTGA-TG-A-TAAT-CCAA-----TG-AA-AAC----TGCAGGTGCT---GG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165908 : ACTA-C-TGT-----A--TAAGTTTGG-TG-A-ATAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AC-------AG-CGCA--CATAa
gi|165909 : ACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTAG-TG-A-GGAT-TAAA-----TT-AA-ACA----TGCAGTTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165924 : TA-C-TGC-----G--TAAGTTTGG-TG-A-AGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTAAGTG-----AT-------AT-TGCA--CACAa
gi|165941 : -TGT-----G--TAAGTTTGG-TG-A-ATAT-CAAA-----TG-AA-AGA----TACGGATGCT---GG-------AG-TGCA--CACAa
Alignments
lowQualScore : 0 0 11111 00 0 11111 0 0 0000 0 000 1111111 0 00
lowQualScore : . . ..... .. . ..... . . .... . ... ....... . ..
lowQualScore : 4 4 44444 66 4 00000 4 4 8888 4 777 3333333 4 66
consensus : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
Reference ( family-99 ) : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165508 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AA-TGCA--CACA
gi|165509 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAGT-CAAC-----TG-GA-AAA----TGCGGGTGCT---AA-------AG-TGCA--CACAa
gi|165511 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165513 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165514 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAATTTGGTGAGGAT-CAAT-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CA
gi|165516 : TATAACTA-C-TTT-----G--TAAGTTTGATGATAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TATGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165517 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-GA-AAA----TGCGAGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165518 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTAGGTGAGAAT-CAAA-----C--AA-AAA----TTCATGTGCC---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165519 : TATAATTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGATGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTAGGTGCT---AG-------AG-TGCG--CACA
gi|165520 : TATAATTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG--A-AAA----TGCGAGAGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165521 : TATAAATA-C-TGT-----G--TAAGTTTAGTACGGAT-CAAA-----TG-CA-AAA----TGCAGGTGCC---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165522 : TATAACTA-C-TGT-----G--CACATTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTGGGTGCT---GG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165524 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGATGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TTCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165525 : TATAAATA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGATATT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165526 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGATGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TTCGGGTGCT---AG-------AG-CGCA--CACA
gi|165527 : TAAAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCC---AG-------AG-TTCA--CACAa
gi|165528 : TATAAATA-C-TGA-----G--CAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCC---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165529 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAATTTGATGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TTCGGGTACA---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165530 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAATTTTTGTGAGAAT-TAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCC---AG-------AC-TGCA--CACAa
gi|165531 : TATAAATA-C-TGT-----G--TAAGTTTGACGAGAAT-TAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGATGAT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165532 : TATAACAA-C-TAT-----G--CAAGTGTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TTCGGGAGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165533 : TATAACTA-C-TAT-----A--TAAATTTAGTGAAGAT-CAAA-----TG-AA-ATA----TTTGGGAACT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165537 : TATAACTA-C-TGT-----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-CGAA-----TG-GA-AAA----TGCAAGTGTT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165538 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGATTGGTGAGGTT-CAAA-----TG-AA-GAA----TGCAGGTGCT---GG-------AG-TGCA--CACa
gi|165539 : TATAATTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGAAGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGAGGGTGCT---AG-------AG-TGGA--CACA
gi|165540 : TATAACTA-C-TGA-----G--TAAGTTTTGTGAGAAT-CAAA-----AG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165542 : TATAACTA-C-TAT-----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGTGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165543 : TATAACTA-C-TGA-----A--TAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TACAGGTGCT---AG-------AG-TACA--CACa
gi|165544 : TATAACTA-C-TAT-----G--TAAGTTTGGTGGACAT-CAAG-----TG-AA-AGC----TGCGAGTACT---AG-------AA-TGCA--CACA
gi|165546 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCTCGTGCT---AC-------AG-TGCA--CACAa
gi|165548 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAAG-CAAA-----TG-AA-AAA----TATGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165551 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGGAT-CACT-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TACA--CACA
gi|165552 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGGGAGGAT-CAAT-----TG-AA-AAT----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TACA--CACAa
gi|165555 : TATAACTA-C-TGT-----G--TCAGTTTGGTGAAGAT-CAAA-----TG-AA-ATT----TGTCGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165557 : TATTACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAAT-CGAA-----TG-AA-AAA----TGCGGATGCT---AG-------AG-TGCA--CACa
gi|165558 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TGCAA-AAA----TGCGAGTGCT---AT-------TG-TGCA--CACA
gi|165559 : TATAACAA-C-TGC-----G--TAACTTTGGTGAGATT-CAAA-----TG-GA-AAA----TGCGGATGCT---AG-------AG-TGCA--CAC
gi|165563 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGTTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTGAATGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165564 : TATAACTA-C-TGG-----G--TAAGTTTGGTGAAAAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AA-AGCA--TACAa
gi|165568 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGAGAAT-CGAA-----TG-AA-AAA----TGC-GGTGCT---AG-------AG-TGCA--CAa
gi|165571 : TATAATTG-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGAGGAT-CAAA-----TT-AA-AAA----TGCAGGTGCTTAAAG-------AG-TGCA--CACA
gi|165572 : TATAACTA-C-TAT-----G--TAAGTTTGGTGAAGAC-CCAA-----TG-AA-AAA----AGCAGGTGCT---AC-------AG-TAAA--CACAa
gi|165573 : TATAACTA-C-TGT-----G--TATGTTTAGAGAAGAT-GAAA-----TG-AA-AAA----TATGGGTACT---GG-------AA-TGTA--CACAa
gi|165574 : TATAACTA-C-TGT-----A--TAAGTTTGGTAAGAAT-CAGA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AT-GGCA--CACAa
gi|165575 : TATAACTA-C-TAT-----AAATAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-ATA----TGTAGGTGTT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165576 : TATAACTA-C-TGT-----A--TCAGTTTAATGAGGAT-CAAA-----TA-AA-AAC----TGCACATGCT---AG-------AG-TGTA--CACAa
gi|165577 : TATAACTA-C-TAT-----G--TAAGTTAGGTAAACAC-CAAA-----TA-AA-AAA----TGCAGGTACT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165578 : TATAACTA-C-TAT-----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAT----TACGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165579 : TATAACAA-C-TGT-----G--TAAGGCTGGTGTGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCTGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165580 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGTTGAGGAT-CAAA-----TA-AA-TAA----TGCGTGTGCT---AG-------AG-TGTA--CACAa
gi|165581 : TATAACAA-C-TAT-----G--TAAGTTTGGTGAACAC-CCAA-----TG-AA-AAA----TGAAGGTGCT---AT-------AG-CGCA--CACA
gi|165582 : TATAATTA-C-TGG-----G--TAAGATAGGTGAAGAT-CAAA-----TG-AT-AAC----TGCGAGTGCT---AG-------AG-TGCA--CATAa
gi|165586 : TATAACTA-C-TAT--------TAAGTTTCGTGAAAAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-CGCA--CACAa
gi|165587 : TATAATTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-TAC----TGTGGTGGCT---AG-------AG-CGCA--CACAa
gi|165588 : TATAACAA-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGATAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTTGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165590 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTAAAAAT-CGAA-----TG-AA-AAT----TGCGAGTGCT---GG-------AG-TTCA--CA
gi|165592 : TATAATAA-A-TGT-----A--TAAATTTGGTGAAGAT-CAAA-----TG-GA-AAA----TGCATATGCT---GG-------AG-TGCA--CACAaaa
gi|165596 : TATAACCA-C-TATT----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTACT---AG-------AG-TACA--CACAa
gi|165598 : TATAACTA-C-TGT-----A--TAAGTTTAGTGAAAAT-CTAA-----TT-AA-AAA----TGCGAGTGCT---AA-------AG-TGCA--CACAa
gi|165603 : TACAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGAAGAC-CCAA-----TA-AA-TAA----TGCAGGGGCT---AG-------AG-TGCA--CATAa
gi|165606 : TATAAC-A-C-TGT-----G--TAAATTTGGTGAAGAT-CAAA-----TG-AA-GAAATTCTGAGAGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165611 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAAGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGGGCa
gi|165612 : TATAACAA-C-TGT-----A--TAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAC----GGCTGGCGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165617 : TACAACTA-G-TGT-----G--CAAGTTTGGTGGAGAT-CAAA-----TG-AA-AAT----TACATGCGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165620 : TATAGCTA-C-TAT-----A--TAAATTTGGTGAAGAT-CCAA-----TG-CC-AAA----TGCAAGTGCT---GG-------AT-TGCA--CACA
gi|165622 : TATACCTA-C-TAT-----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AAAAAA----TTCAGATGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165623 : TATAACTA-C-T----------TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGTTGGTGCT---AG-------AG-GGCA--CACAa
gi|165624 : TATTACTA-C-TCT-----G--TAAGTTTGGTGAGGAA-CAAAATTAATG-AA-AAA----TGTGGATGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165625 : TATTACTA-C-TAT-----A--TAAGTTAAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGAT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165626 : TATAACTT-A-TAT-----G--TAAGTTTTGTGAAGAT-CTAA-----TG-AA-AAA----TGACGATGCT---GG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165628 : TATAACTA-C-TGT--------TAAGCTTGGTAAGGAA-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTGGATACT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165630 : TATAATGA-C-TTT-----G--TAAGTTTGGTGAGGAT-CATA-----TT-AA-AAA----TGTATGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165632 : TATAGCTA-C-TAT-----A--TAAATTTGGTGAAGAT-TCAA-----TG-CC-AAA----TGCAAGTGCT---GG-------AG-TGCA--CAa
gi|165633 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGGTTGGTGGCGAT-GCAA-----TA-AA-AAC----TGCAGATGAT---GG-------AG-TGCA--CACAgaa
gi|165634 : TACAACAA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGGAGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGT--GTGAT---AG-------AG-CGCA--CACAa
gi|165637 : TATAACTA-C-CGT-----G--TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCAAATGCT---AC-------TGTTGCA--TACA
gi|165640 : TATAACCA-C-TGT-----G--TAAGTTTAGTCAAAAT-CAAA-----CG-AA-AAA----TGCAGGTGTT---GG-------AG-a
gi|165643 : TACAACTA-C-TGT-----G--TGAGTTTGGTGAGGAT-TAAA-----TA-AA-AAG----TATGGGTGCT---CA-------AG-TGCA--TACA
gi|165646 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAATTTGGTAAAGAT-CAGA-----TA-AA-ACA----T--GGGTGCT---AG-------AA-TGCA--GACAa
gi|165649 : TATAACTA-CATGTACCTTG--TAAGTTTGGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGTAGGTGTT---AGAGATTAAAG-TGCA--CACAa
gi|165650 : TATAACTA-A-TGT-----G--TATGTTTGGGGAAGAT-GAAA-----TG-AA-AAA----TTCATGTGTT---AG-------AG-TGCA--CATAa
gi|165654 : TATAAGTA-C-AGT-----G--TAGGTTTGTTCAAGAT-CAAA-----TA-AA-AAC----TGCTGGTGCT---GG-------AG-TGCA--CATAa
gi|165657 : TATAACAA-C-TCT-----G--TAAGTTTGGTGAAGAC-TCAA-----TG-GA-AAA----TGCAGGTGCT---AC-------AG-TGTA--GACAa
gi|165658 : TAAAACTA-C-TAT-----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-TTAA-----TG-CA-AAA----TGTGGATGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165661 : TATAACTA-C-TGT-----C--TGTGTTTGGTTGAGCT-CAAA-----TG-AA-AAT----TGCAAGTACT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165830 : ATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TA-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165832 : ATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTAGTGATAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TACGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165837 : ATAAATAAC-TGT-----G--AAAATTTGATGAAGAT-CTAA-----TG-AA-AAC----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165843 : ATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTCAGGAT-TCAA-----TG-AA-AAC----TGTGGTTGTT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165846 : ATAACTA-C-TGT-----T--CAAGTTTGGTGAAGAT-TCAA-----TA-AA-AAA----TGCTGGTGCA---AG-------AG-AGCA--CACAa
gi|165847 : ATGATTA-C-TGT-----G--TAAGATTGGTGAGAAT-AAAA-----TT-AA-AAA----TACAGGTGCT---AG-------AG-AGCA--CACAa
gi|165877 : TAACTA-C-TAT-----A--TAAGTTTGGTGAAGAT-CCAA-----TC-AA-AAA----TGCGAGTGCT---AG-------AG-GGCA--CACAa
gi|165879 : TAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTAGTGAGGAT-TAAA-----TT-AA-ACA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165895 : AACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGAGATGAA-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCTGGTGCT---AG-------AG-TGCA--TACAa
gi|165896 : AACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAATATAAA-----TG-AG-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCATGCACAa
gi|165897 : AACAA-C-TGT-----G--CCAGTTTGATGATAAT-CCAA-----TG-AA-AAC----TGCAGGTGCT---GG-------AG-TGCA--CACA
gi|165908 : ACTA-C-TGT-----A--TAAGTTTGGTGAATAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AC-------AG-CGCA--CATAa
gi|165909 : ACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTAGTGAGGAT-TAAA-----TT-AA-ACA----TGCAGTTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165924 : TA-C-TGC-----G--TAAGTTTGGTGAAGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTAAGTG-----AT-------AT-TGCA--CACAa
gi|165941 : -TGT-----G--TAAGTTTGGTGAATAT-CAAA-----TG-AA-AGA----TACGGATGCT---GG-------AG-TGCA--CACAa
Alignments
lowQualScore : 0 0 11111 00 0 11111 0 0 0000 0 000 1111111 0 00
lowQualScore : . . ..... .. . ..... . . .... . ... ....... . ..
lowQualScore : 4 4 44444 66 4 00000 4 4 8888 4 777 3333333 4 66
consensus : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
Reference ( family-99 ) : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165508 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AA-TGCA--CACA
gi|165509 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAGT-CAAC-----TG-GA-AAA----TGCGGGTGCT---AA-------AG-TGCA--CACAa
gi|165511 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165513 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165514 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAATTTGGTGAGGAT-CAAT-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CA
gi|165516 : TATAACTA-C-TTT-----G--TAAGTTTGATGATAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TATGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165517 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-GA-AAA----TGCGAGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165518 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTAGGTGAGAAT-CAAA-----C--AA-AAA----TTCATGTGCC---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165519 : TATAATTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGATGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTAGGTGCT---AG-------AG-TGCG--CACA
gi|165520 : TATAATTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG--A-AAA----TGCGAGAGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165521 : TATAAATA-C-TGT-----G--TAAGTTTAGTACGGAT-CAAA-----TG-CA-AAA----TGCAGGTGCC---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165522 : TATAACTA-C-TGT-----G--CACATTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTGGGTGCT---GG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165524 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGATGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TTCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165525 : TATAAATA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGATATT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165526 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGATGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TTCGGGTGCT---AG-------AG-CGCA--CACA
gi|165527 : TAAAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCC---AG-------AG-TTCA--CACAa
gi|165528 : TATAAATA-C-TGA-----G--CAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCC---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165529 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAATTTGATGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TTCGGGTACA---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165530 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAATTTTTGTGAGAAT-TAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCC---AG-------AC-TGCA--CACAa
gi|165531 : TATAAATA-C-TGT-----G--TAAGTTTGACGAGAAT-TAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGATGAT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165532 : TATAACAA-C-TAT-----G--CAAGTGTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TTCGGGAGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165533 : TATAACTA-C-TAT-----A--TAAATTTAGTGAAGAT-CAAA-----TG-AA-ATA----TTTGGGAACT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165537 : TATAACTA-C-TGT-----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-CGAA-----TG-GA-AAA----TGCAAGTGTT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165538 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGATTGGTGAGGTT-CAAA-----TG-AA-GAA----TGCAGGTGCT---GG-------AG-TGCA--CACa
gi|165539 : TATAATTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGAAGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGAGGGTGCT---AG-------AG-TGGA--CACA
gi|165540 : TATAACTA-C-TGA-----G--TAAGTTTTGTGAGAAT-CAAA-----AG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165542 : TATAACTA-C-TAT-----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGTGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165543 : TATAACTA-C-TGA-----A--TAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TACAGGTGCT---AG-------AG-TACA--CACa
gi|165544 : TATAACTA-C-TAT-----G--TAAGTTTGGTGGACAT-CAAG-----TG-AA-AGC----TGCGAGTACT---AG-------AA-TGCA--CACA
gi|165546 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCTCGTGCT---AC-------AG-TGCA--CACAa
gi|165548 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAAG-CAAA-----TG-AA-AAA----TATGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165551 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGGAT-CACT-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TACA--CACA
gi|165552 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGGGAGGAT-CAAT-----TG-AA-AAT----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TACA--CACAa
gi|165555 : TATAACTA-C-TGT-----G--TCAGTTTGGTGAAGAT-CAAA-----TG-AA-ATT----TGTCGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165557 : TATTACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAAT-CGAA-----TG-AA-AAA----TGCGGATGCT---AG-------AG-TGCA--CACa
gi|165558 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TGCAA-AAA----TGCGAGTGCT---AT-------TG-TGCA--CACA
gi|165559 : TATAACAA-C-TGC-----G--TAACTTTGGTGAGATT-CAAA-----TG-GA-AAA----TGCGGATGCT---AG-------AG-TGCA--CAC
gi|165563 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGTTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTGAATGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165564 : TATAACTA-C-TGG-----G--TAAGTTTGGTGAAAAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AA-AGCA--TACAa
gi|165568 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGAGAAT-CGAA-----TG-AA-AAA----TGC-GGTGCT---AG-------AG-TGCA--CAa
gi|165571 : TATAATTG-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGAGGAT-CAAA-----TT-AA-AAA----TGCAGGTGCTTAAAG-------AG-TGCA--CACA
gi|165572 : TATAACTA-C-TAT-----G--TAAGTTTGGTGAAGAC-CCAA-----TG-AA-AAA----AGCAGGTGCT---AC-------AG-TAAA--CACAa
gi|165573 : TATAACTA-C-TGT-----G--TATGTTTAGAGAAGAT-GAAA-----TG-AA-AAA----TATGGGTACT---GG-------AA-TGTA--CACAa
gi|165574 : TATAACTA-C-TGT-----A--TAAGTTTGGTAAGAAT-CAGA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AT-GGCA--CACAa
gi|165575 : TATAACTA-C-TAT-----AAATAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-ATA----TGTAGGTGTT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165576 : TATAACTA-C-TGT-----A--TCAGTTTAATGAGGAT-CAAA-----TA-AA-AAC----TGCACATGCT---AG-------AG-TGTA--CACAa
gi|165577 : TATAACTA-C-TAT-----G--TAAGTTAGGTAAACAC-CAAA-----TA-AA-AAA----TGCAGGTACT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165578 : TATAACTA-C-TAT-----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAT----TACGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165579 : TATAACAA-C-TGT-----G--TAAGGCTGGTGTGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCTGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165580 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGTTGAGGAT-CAAA-----TA-AA-TAA----TGCGTGTGCT---AG-------AG-TGTA--CACAa
gi|165581 : TATAACAA-C-TAT-----G--TAAGTTTGGTGAACAC-CCAA-----TG-AA-AAA----TGAAGGTGCT---AT-------AG-CGCA--CACA
gi|165582 : TATAATTA-C-TGG-----G--TAAGATAGGTGAAGAT-CAAA-----TG-AT-AAC----TGCGAGTGCT---AG-------AG-TGCA--CATAa
gi|165586 : TATAACTA-C-TAT--------TAAGTTTCGTGAAAAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-CGCA--CACAa
gi|165587 : TATAATTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-TAC----TGTGGTGGCT---AG-------AG-CGCA--CACAa
gi|165588 : TATAACAA-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGATAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTTGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165590 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTAAAAAT-CGAA-----TG-AA-AAT----TGCGAGTGCT---GG-------AG-TTCA--CA
gi|165592 : TATAATAA-A-TGT-----A--TAAATTTGGTGAAGAT-CAAA-----TG-GA-AAA----TGCATATGCT---GG-------AG-TGCA--CACAaaa
gi|165596 : TATAACCA-C-TATT----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTACT---AG-------AG-TACA--CACAa
gi|165598 : TATAACTA-C-TGT-----A--TAAGTTTAGTGAAAAT-CTAA-----TT-AA-AAA----TGCGAGTGCT---AA-------AG-TGCA--CACAa
gi|165603 : TACAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGAAGAC-CCAA-----TA-AA-TAA----TGCAGGGGCT---AG-------AG-TGCA--CATAa
gi|165606 : TATAAC-A-C-TGT-----G--TAAATTTGGTGAAGAT-CAAA-----TG-AA-GAAATTCTGAGAGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165611 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAAGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGGGCa
gi|165612 : TATAACAA-C-TGT-----A--TAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAC----GGCTGGCGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165617 : TACAACTA-G-TGT-----G--CAAGTTTGGTGGAGAT-CAAA-----TG-AA-AAT----TACATGCGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165620 : TATAGCTA-C-TAT-----A--TAAATTTGGTGAAGAT-CCAA-----TG-CC-AAA----TGCAAGTGCT---GG-------AT-TGCA--CACA
gi|165622 : TATACCTA-C-TAT-----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AAAAAA----TTCAGATGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165623 : TATAACTA-C-T----------TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGTTGGTGCT---AG-------AG-GGCA--CACAa
gi|165624 : TATTACTA-C-TCT-----G--TAAGTTTGGTGAGGAA-CAAAATTAATG-AA-AAA----TGTGGATGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165625 : TATTACTA-C-TAT-----A--TAAGTTAAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGAT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165626 : TATAACTT-A-TAT-----G--TAAGTTTTGTGAAGAT-CTAA-----TG-AA-AAA----TGACGATGCT---GG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165628 : TATAACTA-C-TGT--------TAAGCTTGGTAAGGAA-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTGGATACT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165630 : TATAATGA-C-TTT-----G--TAAGTTTGGTGAGGAT-CATA-----TT-AA-AAA----TGTATGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165632 : TATAGCTA-C-TAT-----A--TAAATTTGGTGAAGAT-TCAA-----TG-CC-AAA----TGCAAGTGCT---GG-------AG-TGCA--CAa
gi|165633 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGGTTGGTGGCGAT-GCAA-----TA-AA-AAC----TGCAGATGAT---GG-------AG-TGCA--CACAgaa
gi|165634 : TACAACAA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGGAGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGT--GTGAT---AG-------AG-CGCA--CACAa
gi|165637 : TATAACTA-C-CGT-----G--TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCAAATGCT---AC-------TGTTGCA--TACA
gi|165640 : TATAACCA-C-TGT-----G--TAAGTTTAGTCAAAAT-CAAA-----CG-AA-AAA----TGCAGGTGTT---GG-------AG-a
gi|165643 : TACAACTA-C-TGT-----G--TGAGTTTGGTGAGGAT-TAAA-----TA-AA-AAG----TATGGGTGCT---CA-------AG-TGCA--TACA
gi|165646 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAATTTGGTAAAGAT-CAGA-----TA-AA-ACA----T--GGGTGCT---AG-------AA-TGCA--GACAa
gi|165649 : TATAACTA-CATGTACCTTG--TAAGTTTGGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGTAGGTGTT---AGAGATTAAAG-TGCA--CACAa
gi|165650 : TATAACTA-A-TGT-----G--TATGTTTGGGGAAGAT-GAAA-----TG-AA-AAA----TTCATGTGTT---AG-------AG-TGCA--CATAa
gi|165654 : TATAAGTA-C-AGT-----G--TAGGTTTGTTCAAGAT-CAAA-----TA-AA-AAC----TGCTGGTGCT---GG-------AG-TGCA--CATAa
gi|165657 : TATAACAA-C-TCT-----G--TAAGTTTGGTGAAGAC-TCAA-----TG-GA-AAA----TGCAGGTGCT---AC-------AG-TGTA--GACAa
gi|165658 : TAAAACTA-C-TAT-----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-TTAA-----TG-CA-AAA----TGTGGATGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165661 : TATAACTA-C-TGT-----C--TGTGTTTGGTTGAGCT-CAAA-----TG-AA-AAT----TGCAAGTACT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165830 : ATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TA-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165832 : ATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTAGTGATAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TACGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165837 : ATAAATAAC-TGT-----G--AAAATTTGATGAAGAT-CTAA-----TG-AA-AAC----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165843 : ATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTCAGGAT-TCAA-----TG-AA-AAC----TGTGGTTGTT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165846 : ATAACTA-C-TGT-----T--CAAGTTTGGTGAAGAT-TCAA-----TA-AA-AAA----TGCTGGTGCA---AG-------AG-AGCA--CACAa
gi|165847 : ATGATTA-C-TGT-----G--TAAGATTGGTGAGAAT-AAAA-----TT-AA-AAA----TACAGGTGCT---AG-------AG-AGCA--CACAa
gi|165877 : TAACTA-C-TAT-----A--TAAGTTTGGTGAAGAT-CCAA-----TC-AA-AAA----TGCGAGTGCT---AG-------AG-GGCA--CACAa
gi|165879 : TAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTAGTGAGGAT-TAAA-----TT-AA-ACA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165895 : AACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGAGATGAA-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCTGGTGCT---AG-------AG-TGCA--TACAa
gi|165896 : AACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAATATAAA-----TG-AG-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCATGCACAa
gi|165897 : AACAA-C-TGT-----G--CCAGTTTGATGATAAT-CCAA-----TG-AA-AAC----TGCAGGTGCT---GG-------AG-TGCA--CACA
gi|165908 : ACTA-C-TGT-----A--TAAGTTTGGTGAATAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AC-------AG-CGCA--CATAa
gi|165909 : ACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTAGTGAGGAT-TAAA-----TT-AA-ACA----TGCAGTTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165924 : TA-C-TGC-----G--TAAGTTTGGTGAAGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTAAGTG-----AT-------AT-TGCA--CACAa
gi|165941 : -TGT-----G--TAAGTTTGGTGAATAT-CAAA-----TG-AA-AGA----TACGGATGCT---GG-------AG-TGCA--CACAa
blockSeqs : ACCTT ATTAA AGATTAA
blockSeqs : T . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
finalCons : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
Alignments
lowQualScore : 0 0 11111 00 0 11111 0 0 0000 0 000 1111111 0 00
lowQualScore : . . ..... .. . ..... . . .... . ... ....... . ..
lowQualScore : 4 4 44444 66 4 00000 4 4 8888 4 777 3333333 4 66
consensus : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
Reference ( family-99 ) : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165508 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AA-TGCA--CACA
gi|165509 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAGT-CAAC-----TG-GA-AAA----TGCGGGTGCT---AA-------AG-TGCA--CACAa
gi|165511 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165513 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165514 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAATTTGGTGAGGAT-CAAT-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CA
gi|165516 : TATAACTA-C-TTT-----G--TAAGTTTGATGATAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TATGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165517 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-GA-AAA----TGCGAGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165518 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTAGGTGAGAAT-CAAA-----C--AA-AAA----TTCATGTGCC---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165519 : TATAATTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGATGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTAGGTGCT---AG-------AG-TGCG--CACA
gi|165520 : TATAATTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG--A-AAA----TGCGAGAGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165521 : TATAAATA-C-TGT-----G--TAAGTTTAGTACGGAT-CAAA-----TG-CA-AAA----TGCAGGTGCC---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165522 : TATAACTA-C-TGT-----G--CACATTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTGGGTGCT---GG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165524 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGATGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TTCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165525 : TATAAATA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGATATT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165526 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGATGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TTCGGGTGCT---AG-------AG-CGCA--CACA
gi|165527 : TAAAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCC---AG-------AG-TTCA--CACAa
gi|165528 : TATAAATA-C-TGA-----G--CAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCC---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165529 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAATTTGATGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TTCGGGTACA---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165530 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAATTTTTGTGAGAAT-TAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCC---AG-------AC-TGCA--CACAa
gi|165531 : TATAAATA-C-TGT-----G--TAAGTTTGACGAGAAT-TAAA-----TG-AA-AAA----TGCGGATGAT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165532 : TATAACAA-C-TAT-----G--CAAGTGTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TTCGGGAGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165533 : TATAACTA-C-TAT-----A--TAAATTTAGTGAAGAT-CAAA-----TG-AA-ATA----TTTGGGAACT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165537 : TATAACTA-C-TGT-----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-CGAA-----TG-GA-AAA----TGCAAGTGTT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165538 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGATTGGTGAGGTT-CAAA-----TG-AA-GAA----TGCAGGTGCT---GG-------AG-TGCA--CACa
gi|165539 : TATAATTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGAAGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGAGGGTGCT---AG-------AG-TGGA--CACA
gi|165540 : TATAACTA-C-TGA-----G--TAAGTTTTGTGAGAAT-CAAA-----AG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165542 : TATAACTA-C-TAT-----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGTGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165543 : TATAACTA-C-TGA-----A--TAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TACAGGTGCT---AG-------AG-TACA--CACa
gi|165544 : TATAACTA-C-TAT-----G--TAAGTTTGGTGGACAT-CAAG-----TG-AA-AGC----TGCGAGTACT---AG-------AA-TGCA--CACA
gi|165546 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCTCGTGCT---AC-------AG-TGCA--CACAa
gi|165548 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAAG-CAAA-----TG-AA-AAA----TATGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165551 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGGAT-CACT-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TACA--CACA
gi|165552 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGGGAGGAT-CAAT-----TG-AA-AAT----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TACA--CACAa
gi|165555 : TATAACTA-C-TGT-----G--TCAGTTTGGTGAAGAT-CAAA-----TG-AA-ATT----TGTCGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165557 : TATTACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAAT-CGAA-----TG-AA-AAA----TGCGGATGCT---AG-------AG-TGCA--CACa
gi|165558 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TGCAA-AAA----TGCGAGTGCT---AT-------TG-TGCA--CACA
gi|165559 : TATAACAA-C-TGC-----G--TAACTTTGGTGAGATT-CAAA-----TG-GA-AAA----TGCGGATGCT---AG-------AG-TGCA--CAC
gi|165563 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGTTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTGAATGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165564 : TATAACTA-C-TGG-----G--TAAGTTTGGTGAAAAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AA-AGCA--TACAa
gi|165568 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGAGAAT-CGAA-----TG-AA-AAA----TGC-GGTGCT---AG-------AG-TGCA--CAa
gi|165571 : TATAATTG-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGAGGAT-CAAA-----TT-AA-AAA----TGCAGGTGCTTAAAG-------AG-TGCA--CACA
gi|165572 : TATAACTA-C-TAT-----G--TAAGTTTGGTGAAGAC-CCAA-----TG-AA-AAA----AGCAGGTGCT---AC-------AG-TAAA--CACAa
gi|165573 : TATAACTA-C-TGT-----G--TATGTTTAGAGAAGAT-GAAA-----TG-AA-AAA----TATGGGTACT---GG-------AA-TGTA--CACAa
gi|165574 : TATAACTA-C-TGT-----A--TAAGTTTGGTAAGAAT-CAGA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AT-GGCA--CACAa
gi|165575 : TATAACTA-C-TAT-----AAATAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-ATA----TGTAGGTGTT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165576 : TATAACTA-C-TGT-----A--TCAGTTTAATGAGGAT-CAAA-----TA-AA-AAC----TGCACATGCT---AG-------AG-TGTA--CACAa
gi|165577 : TATAACTA-C-TAT-----G--TAAGTTAGGTAAACAC-CAAA-----TA-AA-AAA----TGCAGGTACT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165578 : TATAACTA-C-TAT-----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAT----TACGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165579 : TATAACAA-C-TGT-----G--TAAGGCTGGTGTGAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCTGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165580 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGTTGAGGAT-CAAA-----TA-AA-TAA----TGCGTGTGCT---AG-------AG-TGTA--CACAa
gi|165581 : TATAACAA-C-TAT-----G--TAAGTTTGGTGAACAC-CCAA-----TG-AA-AAA----TGAAGGTGCT---AT-------AG-CGCA--CACA
gi|165582 : TATAATTA-C-TGG-----G--TAAGATAGGTGAAGAT-CAAA-----TG-AT-AAC----TGCGAGTGCT---AG-------AG-TGCA--CATAa
gi|165586 : TATAACTA-C-TAT--------TAAGTTTCGTGAAAAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-CGCA--CACAa
gi|165587 : TATAATTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAGGAT-CAAA-----TG-AA-TAC----TGTGGTGGCT---AG-------AG-CGCA--CACAa
gi|165588 : TATAACAA-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGATAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTTGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165590 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTAAAAAT-CGAA-----TG-AA-AAT----TGCGAGTGCT---GG-------AG-TTCA--CA
gi|165592 : TATAATAA-A-TGT-----A--TAAATTTGGTGAAGAT-CAAA-----TG-GA-AAA----TGCATATGCT---GG-------AG-TGCA--CACAaaa
gi|165596 : TATAACCA-C-TATT----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTACT---AG-------AG-TACA--CACAa
gi|165598 : TATAACTA-C-TGT-----A--TAAGTTTAGTGAAAAT-CTAA-----TT-AA-AAA----TGCGAGTGCT---AA-------AG-TGCA--CACAa
gi|165603 : TACAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGATGAAGAC-CCAA-----TA-AA-TAA----TGCAGGGGCT---AG-------AG-TGCA--CATAa
gi|165606 : TATAAC-A-C-TGT-----G--TAAATTTGGTGAAGAT-CAAA-----TG-AA-GAAATTCTGAGAGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165611 : TATAACTA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGAAGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGGGCa
gi|165612 : TATAACAA-C-TGT-----A--TAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TG-AA-AAC----GGCTGGCGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165617 : TACAACTA-G-TGT-----G--CAAGTTTGGTGGAGAT-CAAA-----TG-AA-AAT----TACATGCGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165620 : TATAGCTA-C-TAT-----A--TAAATTTGGTGAAGAT-CCAA-----TG-CC-AAA----TGCAAGTGCT---GG-------AT-TGCA--CACA
gi|165622 : TATACCTA-C-TAT-----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AAAAAA----TTCAGATGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165623 : TATAACTA-C-T----------TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGTTGGTGCT---AG-------AG-GGCA--CACAa
gi|165624 : TATTACTA-C-TCT-----G--TAAGTTTGGTGAGGAA-CAAAATTAATG-AA-AAA----TGTGGATGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165625 : TATTACTA-C-TAT-----A--TAAGTTAAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCGGGTGAT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165626 : TATAACTT-A-TAT-----G--TAAGTTTTGTGAAGAT-CTAA-----TG-AA-AAA----TGACGATGCT---GG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165628 : TATAACTA-C-TGT--------TAAGCTTGGTAAGGAA-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTGGATACT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165630 : TATAATGA-C-TTT-----G--TAAGTTTGGTGAGGAT-CATA-----TT-AA-AAA----TGTATGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165632 : TATAGCTA-C-TAT-----A--TAAATTTGGTGAAGAT-TCAA-----TG-CC-AAA----TGCAAGTGCT---GG-------AG-TGCA--CAa
gi|165633 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAGGTTGGTGGCGAT-GCAA-----TA-AA-AAC----TGCAGATGAT---GG-------AG-TGCA--CACAgaa
gi|165634 : TACAACAA-C-TGT-----G--CAAGTTTGGTGGAGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGT--GTGAT---AG-------AG-CGCA--CACAa
gi|165637 : TATAACTA-C-CGT-----G--TAAGTTTAGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGCAAATGCT---AC-------TGTTGCA--TACA
gi|165640 : TATAACCA-C-TGT-----G--TAAGTTTAGTCAAAAT-CAAA-----CG-AA-AAA----TGCAGGTGTT---GG-------AG-a
gi|165643 : TACAACTA-C-TGT-----G--TGAGTTTGGTGAGGAT-TAAA-----TA-AA-AAG----TATGGGTGCT---CA-------AG-TGCA--TACA
gi|165646 : TATAACTA-C-TGT-----G--TAAATTTGGTAAAGAT-CAGA-----TA-AA-ACA----T--GGGTGCT---AG-------AA-TGCA--GACAa
gi|165649 : TATAACTA-CATGTACCTTG--TAAGTTTGGTGAAGAT-CCAA-----TG-AA-AAA----TGTAGGTGTT---AGAGATTAAAG-TGCA--CACAa
gi|165650 : TATAACTA-A-TGT-----G--TATGTTTGGGGAAGAT-GAAA-----TG-AA-AAA----TTCATGTGTT---AG-------AG-TGCA--CATAa
gi|165654 : TATAAGTA-C-AGT-----G--TAGGTTTGTTCAAGAT-CAAA-----TA-AA-AAC----TGCTGGTGCT---GG-------AG-TGCA--CATAa
gi|165657 : TATAACAA-C-TCT-----G--TAAGTTTGGTGAAGAC-TCAA-----TG-GA-AAA----TGCAGGTGCT---AC-------AG-TGTA--GACAa
gi|165658 : TAAAACTA-C-TAT-----A--TAAGTTTAGTGAAGAT-TTAA-----TG-CA-AAA----TGTGGATGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165661 : TATAACTA-C-TGT-----C--TGTGTTTGGTTGAGCT-CAAA-----TG-AA-AAT----TGCAAGTACT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165830 : ATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAAT-CAAA-----TA-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165832 : ATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTAGTGATAAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TACGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165837 : ATAAATAAC-TGT-----G--AAAATTTGATGAAGAT-CTAA-----TG-AA-AAC----TGCGGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACA
gi|165843 : ATAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTCAGGAT-TCAA-----TG-AA-AAC----TGTGGTTGTT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165846 : ATAACTA-C-TGT-----T--CAAGTTTGGTGAAGAT-TCAA-----TA-AA-AAA----TGCTGGTGCA---AG-------AG-AGCA--CACAa
gi|165847 : ATGATTA-C-TGT-----G--TAAGATTGGTGAGAAT-AAAA-----TT-AA-AAA----TACAGGTGCT---AG-------AG-AGCA--CACAa
gi|165877 : TAACTA-C-TAT-----A--TAAGTTTGGTGAAGAT-CCAA-----TC-AA-AAA----TGCGAGTGCT---AG-------AG-GGCA--CACAa
gi|165879 : TAACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTAGTGAGGAT-TAAA-----TT-AA-ACA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165895 : AACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGAGATGAA-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCTGGTGCT---AG-------AG-TGCA--TACAa
gi|165896 : AACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTGGTGAGAATATAAA-----TG-AG-AAA----TGCAGGTGCT---AG-------AG-TGCATGCACAa
gi|165897 : AACAA-C-TGT-----G--CCAGTTTGATGATAAT-CCAA-----TG-AA-AAC----TGCAGGTGCT---GG-------AG-TGCA--CACA
gi|165908 : ACTA-C-TGT-----A--TAAGTTTGGTGAATAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGCAGGTGCT---AC-------AG-CGCA--CATAa
gi|165909 : ACTA-C-TGT-----G--TAAGTTTAGTGAGGAT-TAAA-----TT-AA-ACA----TGCAGTTGCT---AG-------AG-TGCA--CACAa
gi|165924 : TA-C-TGC-----G--TAAGTTTGGTGAAGAT-CAAA-----TG-AA-AAA----TGTAAGTG-----AT-------AT-TGCA--CACAa
gi|165941 : -TGT-----G--TAAGTTTGGTGAATAT-CAAA-----TG-AA-AGA----TACGGATGCT---GG-------AG-TGCA--CACAa