lowQualScore                  :                                        1         1                        55                                   
lowQualScore                  :                                        6         8  6               2   2 11                           4       
lowQualScore                  :                                        .         .  .               .   . ..                           .       
lowQualScore                  :                                        0         5  2               7   9 22                           5       
consensus                     : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTACGATTTTCTAACGAGAATTGCTTCATAAA-TGGTCAATACCAGTA-TTT-C-CCCCTGTGGCGAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT
Reference ( gi|37535 )        : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTACGATTTTCTAACAAGATTTGCTTCAT-AA-TGGTCAATACCAGTA-TTT-CAACCCTGTGGCGAGCGTATTACTATCAATTCTTGGTT
gi|37539                      : ATGTTTTTTAATTGAATTAGCTACAATTATCTAACAAGAATTGCTTCAT-AT-TGGTTAATATCGGTA-TTT-CCCCCCTGTGGCGAGCGTATTACTATAAATTCTTGGTT
gi|37538                      : ATGTTTTTCATTTGAATAAGCTACGATTTTCTAACAAGAATTGCTTCATAAA-TGGTCAATACCAGTACCTT-C--CCCTGTGGCGAGCGTATTGCTATCAGTCCTTAGT
gi|37536                      : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTAAGATTTTCTAATGAGAATTGCTTCATAAA-TGGTCAGTACCAGTA-TTT-CTG-TCTGTGGCGAGCGTATTGCTATCAATCCTTGGTT
gi|37534                      : ATGTTTTTTATTTAAATTAGCTATGATTTTCTTACGAGAATTGCTTCAT-AA-TGGTTTATACCAATA-TTT-C-CCCCTGTGGCAAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37537                      : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTACGATTTTCTAATGAGAATTGCTTCAT-AA-TGGTCAATACCAGTA-TTT-C-CCCCTGTGGCGAGCATACT
gi|37541                      : ATGTTTTTTATTTGAATAATTTACAATTTTCTAACAAGAATTGTTTCATAAA-TGGTCATTACCAGTA-TTT-C-CCCCTGTGACAAGTGTATTACTATCAATTTTTTGTT
gi|37540                      : ATGTTTTAAATTTGAATTA-CTATGATTTTCTAACAAAAATTGCTCCATGAA-TGGTCAATACGAGTA-TTT-C-CCCCTGTGGCAAGCTTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37542                      :   GTTTTTTATTTGAATTAGCTACAATTTTCCAACGAGAATTGTTTCAT-AT-TGGTCAATACCAGTA-TTT-C--CCCTGTGGCGAGCGTATTACTATCATTACTTGGTT
gi|37543                      :     TTTTTAATTGAACTAGCTACAATTTTCTATCAAGACTTGCTTCATAAA-TGGTTAATATGAATA-T
gi|37545                      :      TCTTGTTTGAATTAGCTATGATTTTCTAACAAGAATTGCGTCAT-AATTGTTCAATATGAGTA-TTT-C-TCCCTGTGACGATCGTATTACTATCAATCTATGGTT
gi|37546                      :      TCTTGTTTGAATAAGATACAATTTTCTAACTAGAATTGCTTCAT-GACTGGTCAATATGAGTA-TTTTC--CCCTGTGGCGAACGTATTACTATCAATCCACGGTT
gi|37544                      :      TTTGATTTGAATTAGCTACGATTTTCTTACAA----TAATTC-C-AA-TGGTCAATACCAGTG-TTT-C--CCCCG-GGTAAGTGTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37547                      :       TTTATTTGAATTAGGTACGATTTTCTAATAAGAATTGCTTCATAAA-TGGTAAATACCAGTA-TGT-C-CCCCTATTGCAAACGTATAACTATCAGTCATTGGTT
gi|37548                      :                                                         TCAATACCAGTA-TTT-CT-CCCTGTGGCGAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37549                      :                                                         TCAATACCAGTA-TTT-C--CCCTTTGGCGAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT

lowQualScore                  :                                    2             5 3                   2    2                                
lowQualScore                  :                                    .             . .                   .    .                                
lowQualScore                  :                                    1             4 4                   7    7                                
consensus                     : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTACGATTTTCTAACGAGAATTGCTTCATAAATGGTCAATACCAGTATTTC-CCCC-TGTGGCGAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT
Reference ( family-890 )      : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTACGATTTTCTAACGAGAATTGCTTCATAAATGGTCAATACCAGTATTTC-CCCC-TGTGGCGAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37534                      : ATGTTTTTTATTTAAATTAGCTATGATTTTCTTACGAGAATTGCTTCATAA-TGGTTTATACCAATATTTC-CCCC-TGTGGCAAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37535                      : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTACGATTTTCTAACAAGATTTGCTTCAT-AATGGTCAATACCAGTATTTCAACCC-TGTGGCGAGCGTATTACTATCAATTCTTGGTT
gi|37536                      : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTAAGATTTTCTAATGAGAATTGCTTCATAAATGGTCAGTACCAGTATTTC-TGTC-TGTGGCGAGCGTATTGCTATCAATCCTTGGTT
gi|37537                      : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTACGATTTTCTAATGAGAATTGCTTCAT-AATGGTCAATACCAGTATTTC-CCCC-TGTGGCGAGCATACT
gi|37538                      : ATGTTTTTCATTTGAATAAGCTACGATTTTCTAACAAGAATTGCTTCATAAATGGTCAATACCAGTACCTT-CCCC-TGTGGCGAGCGTATTGCTATCAGTCCTTAGT
gi|37539                      : ATGTTTTTTAATTGAATTAGCTACAATTATCTAACAAGAATTGCTTCATAT-TGGTTAATATCGGTATTTC-CCCCCTGTGGCGAGCGTATTACTATAAATTCTTGGTT
gi|37540                      : ATGTTTTAAATTTGAATTA-CTATGATTTTCTAACAAAAATTGCTCCATGAATGGTCAATACGAGTATTTC-CCCC-TGTGGCAAGCTTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37541                      : ATGTTTTTTATTTGAATAATTTACAATTTTCTAACAAGAATTGTTTCATAAATGGTCATTACCAGTATTTC-CCCC-TGTGACAAGTGTATTACTATCAATTTTTTGTT
gi|37542                      :   GTTTTTTATTTGAATTAGCTACAATTTTCCAACGAGAATTGTTTCAT-ATTGGTCAATACCAGTATTT--CCCC-TGTGGCGAGCGTATTACTATCATTACTTGGTT
gi|37543                      :     TTTTTAATTGAACTAGCTACAATTTTCTATCAAGACTTGCTTCATAAATGGTTAATATGAATAT
gi|37544                      :      TTTGATTTGAATTAGCTACGATTTTCTTACAATAATTCC------AATGGTCAATACCAGTGTTTC-CCCC--G-GGTAAGTGTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37545                      :      TCTTGTTTGAATTAGCTATGATTTTCTAACAAGAATTGCGTCATAATTGTTCAATATGAGTATTTC-TCCC-TGTGACGATCGTATTACTATCAATCTATGGTT
gi|37546                      :      TCTTGTTTGAATAAGATACAATTTTCTAACTAGAATTGCTTCATGACTGGTCAATATGAGTATTTT-CCCC-TGTGGCGAACGTATTACTATCAATCCACGGTT
gi|37547                      :       TTTATTTGAATTAGGTACGATTTTCTAATAAGAATTGCTTCATAAATGGTAAATACCAGTATGTC-CCCC-TATTGCAAACGTATAACTATCAGTCATTGGTT
gi|37548                      :                                                        TCAATACCAGTATTTC-TCCC-TGTGGCGAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37549                      :                                                        TCAATACCAGTATTTC-CCCT-T-TGGCGAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT

lowQualScore                  :                                    2             5 3                   2    2                                
lowQualScore                  :                                    .             . .                   .    .                                
lowQualScore                  :                                    1             4 4                   7    7                                
consensus                     : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTACGATTTTCTAACGAGAATTGCTTCATAAATGGTCAATACCAGTATTTC-CCCC-TGTGGCGAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT
Reference ( family-890 )      : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTACGATTTTCTAACGAGAATTGCTTCATAAATGGTCAATACCAGTATTTC-CCCC-TGTGGCGAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37534                      : ATGTTTTTTATTTAAATTAGCTATGATTTTCTTACGAGAATTGCTTCATAA-TGGTTTATACCAATATTTC-CCCC-TGTGGCAAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37535                      : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTACGATTTTCTAACAAGATTTGCTTCAT-AATGGTCAATACCAGTATTTCAACCC-TGTGGCGAGCGTATTACTATCAATTCTTGGTT
gi|37536                      : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTAAGATTTTCTAATGAGAATTGCTTCATAAATGGTCAGTACCAGTATTTC-TGTC-TGTGGCGAGCGTATTGCTATCAATCCTTGGTT
gi|37537                      : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTACGATTTTCTAATGAGAATTGCTTCAT-AATGGTCAATACCAGTATTTC-CCCC-TGTGGCGAGCATACT
gi|37538                      : ATGTTTTTCATTTGAATAAGCTACGATTTTCTAACAAGAATTGCTTCATAAATGGTCAATACCAGTACCTT-CCCC-TGTGGCGAGCGTATTGCTATCAGTCCTTAGT
gi|37539                      : ATGTTTTTTAATTGAATTAGCTACAATTATCTAACAAGAATTGCTTCATAT-TGGTTAATATCGGTATTTC-CCCCCTGTGGCGAGCGTATTACTATAAATTCTTGGTT
gi|37540                      : ATGTTTTAAATTTGAATTA-CTATGATTTTCTAACAAAAATTGCTCCATGAATGGTCAATACGAGTATTTC-CCCC-TGTGGCAAGCTTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37541                      : ATGTTTTTTATTTGAATAATTTACAATTTTCTAACAAGAATTGTTTCATAAATGGTCATTACCAGTATTTC-CCCC-TGTGACAAGTGTATTACTATCAATTTTTTGTT
gi|37542                      :   GTTTTTTATTTGAATTAGCTACAATTTTCCAACGAGAATTGTTTCAT-ATTGGTCAATACCAGTATTT--CCCC-TGTGGCGAGCGTATTACTATCATTACTTGGTT
gi|37543                      :     TTTTTAATTGAACTAGCTACAATTTTCTATCAAGACTTGCTTCATAAATGGTTAATATGAATAT
gi|37544                      :      TTTGATTTGAATTAGCTACGATTTTCTTACAATAATTCC------AATGGTCAATACCAGTGTTTC-CCCC--G-GGTAAGTGTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37545                      :      TCTTGTTTGAATTAGCTATGATTTTCTAACAAGAATTGCGTCATAATTGTTCAATATGAGTATTTC-TCCC-TGTGACGATCGTATTACTATCAATCTATGGTT
gi|37546                      :      TCTTGTTTGAATAAGATACAATTTTCTAACTAGAATTGCTTCATGACTGGTCAATATGAGTATTTT-CCCC-TGTGGCGAACGTATTACTATCAATCCACGGTT
gi|37547                      :       TTTATTTGAATTAGGTACGATTTTCTAATAAGAATTGCTTCATAAATGGTAAATACCAGTATGTC-CCCC-TATTGCAAACGTATAACTATCAGTCATTGGTT
gi|37548                      :                                                        TCAATACCAGTATTTC-TCCC-TGTGGCGAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37549                      :                                                        TCAATACCAGTATTTC-CCCT-T-TGGCGAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT


blockSeqs                     :                                    A             A A                   A    C
blockSeqs                     :                                    G             A A                   .    .
blockSeqs                     :                                    G             A A                   .    .
blockSeqs                     :                                    A             G A                   .    .
blockSeqs                     :                                    A             A A                   .    .
blockSeqs                     :                                    A             A A                   .    .
blockSeqs                     :                                    A             A T                   .    .
blockSeqs                     :                                    G             G A                   .    .
blockSeqs                     :                                    A             A A                   .    .
blockSeqs                     :                                    A             . T                   .    .
blockSeqs                     :                                    A             . C                   .    .
blockSeqs                     :                                    T             . A                   .    .
blockSeqs                     :                                    A             . .                   .    .
blockSeqs                     :                                                                        .    .


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTACGATTTTCTAACGAGAATTGCTTCATAAATGGTCAATACCAGTATTTC-CCCC-TGTGGCGAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT
finalCons                     : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTACGATTTTCTAACGAGAATTGCTTCATAAATGGTCAATACCAGTATTTC-CCCC-TGTGGCGAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT

lowQualScore                  :                                    2             5 3                   2    2                                
lowQualScore                  :                                    .             . .                   .    .                                
lowQualScore                  :                                    1             4 4                   7    7                                
consensus                     : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTACGATTTTCTAACGAGAATTGCTTCATAAATGGTCAATACCAGTATTTC-CCCC-TGTGGCGAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT
Reference ( family-890 )      : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTACGATTTTCTAACGAGAATTGCTTCATAAATGGTCAATACCAGTATTTC-CCCC-TGTGGCGAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37534                      : ATGTTTTTTATTTAAATTAGCTATGATTTTCTTACGAGAATTGCTTCATAA-TGGTTTATACCAATATTTC-CCCC-TGTGGCAAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37535                      : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTACGATTTTCTAACAAGATTTGCTTCAT-AATGGTCAATACCAGTATTTCAACCC-TGTGGCGAGCGTATTACTATCAATTCTTGGTT
gi|37536                      : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTAAGATTTTCTAATGAGAATTGCTTCATAAATGGTCAGTACCAGTATTTC-TGTC-TGTGGCGAGCGTATTGCTATCAATCCTTGGTT
gi|37537                      : ATGTTTTTTATTTGAATTAGCTACGATTTTCTAATGAGAATTGCTTCAT-AATGGTCAATACCAGTATTTC-CCCC-TGTGGCGAGCATACT
gi|37538                      : ATGTTTTTCATTTGAATAAGCTACGATTTTCTAACAAGAATTGCTTCATAAATGGTCAATACCAGTACCTT-CCCC-TGTGGCGAGCGTATTGCTATCAGTCCTTAGT
gi|37539                      : ATGTTTTTTAATTGAATTAGCTACAATTATCTAACAAGAATTGCTTCATAT-TGGTTAATATCGGTATTTC-CCCCCTGTGGCGAGCGTATTACTATAAATTCTTGGTT
gi|37540                      : ATGTTTTAAATTTGAATTA-CTATGATTTTCTAACAAAAATTGCTCCATGAATGGTCAATACGAGTATTTC-CCCC-TGTGGCAAGCTTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37541                      : ATGTTTTTTATTTGAATAATTTACAATTTTCTAACAAGAATTGTTTCATAAATGGTCATTACCAGTATTTC-CCCC-TGTGACAAGTGTATTACTATCAATTTTTTGTT
gi|37542                      :   GTTTTTTATTTGAATTAGCTACAATTTTCCAACGAGAATTGTTTCAT-ATTGGTCAATACCAGTATTT--CCCC-TGTGGCGAGCGTATTACTATCATTACTTGGTT
gi|37543                      :     TTTTTAATTGAACTAGCTACAATTTTCTATCAAGACTTGCTTCATAAATGGTTAATATGAATAT
gi|37544                      :      TTTGATTTGAATTAGCTACGATTTTCTTACAATAATTCC------AATGGTCAATACCAGTGTTTC-CCCC--G-GGTAAGTGTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37545                      :      TCTTGTTTGAATTAGCTATGATTTTCTAACAAGAATTGCGTCATAATTGTTCAATATGAGTATTTC-TCCC-TGTGACGATCGTATTACTATCAATCTATGGTT
gi|37546                      :      TCTTGTTTGAATAAGATACAATTTTCTAACTAGAATTGCTTCATGACTGGTCAATATGAGTATTTT-CCCC-TGTGGCGAACGTATTACTATCAATCCACGGTT
gi|37547                      :       TTTATTTGAATTAGGTACGATTTTCTAATAAGAATTGCTTCATAAATGGTAAATACCAGTATGTC-CCCC-TATTGCAAACGTATAACTATCAGTCATTGGTT
gi|37548                      :                                                        TCAATACCAGTATTTC-TCCC-TGTGGCGAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT
gi|37549                      :                                                        TCAATACCAGTATTTC-CCCT-T-TGGCGAGCGTATTACTATCAATCCTTGGTT