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Reference ( gi|160885 ) : AATGTTTTACAGCATTGTCACTACTAAGTAAACTGCAATCGTTTACAGCTGTACAGCTATGTAACAAATGTAATACGCTTGTAGATAATTAAGTACTACATATTGTTCATTTTTGTTTTGCTAACACTGTCGAAGGAA-TAAGCTTTGGGACGCAGTTATAACGACTTGTGGTCTTCAGGCCTTTAATTCATTGTTTAAAAAG-ACGCTTAAAGATCAGATTTATGCACTGCTTTCCGGGATTAATGAATATTTATCCGACATTGAACA-GATTGAAGATATATTAT---TGTTCAATAT--TG-----GGATAATTCACAGAATGTTCAAGTAACTTTTATCGATACTGCTAAT-GTTTACTGTTTGTTACTCAGTGTATTATCAATTTCTTACATTTCGTTTCGGTAAGATATAAA-AG----GTTCATCGTTGTCATGAGTCTATCACTG-G-ATCTTGCATTTTATTTCGGTAA-TATTCATTATAGATGGACAATGTTATTATTTCACTTATATTTGTGTAAGTTATA-------CTATATGACAGTTTAAAAGCTATACTG--ATTTTTATAAA--ATCATA-ATT----TATTT----AGTCATTTT-AACAAATCCATCATGTTATGAA--TACTCTTACAATATGACATCATATTAGGCGTATCGTATGT-TCATTCTTC--ACTTG--TAAC--TCA-TTGTATAT--TGTTCATTGATATGTA---AT-AA----TTTACTGCAATTT--GTTTATATGTTATTATATGCTCTCCAATTATGGAGGAAATAAAGATTCTAT
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Reference ( family-885 ) : AATGTTTTACAGCAGTGTCACTACTAAGTAAACTGCAATCGTTTACAGCTGTACAGCTATGTAACAAATGTAATACGCTTGTAGATAAT-T-A-GTACTACATATTGTTCATTTTTGTNTTGCAAACACTGTCGAAAGAA-TAAGCTTTGGGACGCAGTTATAACGACTTGTGGTCTTCAGGCCTTTAATTCATTTATTAAAAAG-ACGCCTAAAGATCAGATTTATGCACTGCTTTCCGGGCTTAATGAATATTTATCTGACACTGAACA-GATTGAAGATATATTAT---TGTTCAATAT--TG-----GGNTAATTCACAGTATGTT-AA-G-TAACTTTTATCGATACTGCTAAT-GTTTACTGTTTGTTACTCAGTGTATGATCAATTTCTTACATTTCGTTTCGGTAAGATACAAA-AG----GTTCACCGTTGTCATGAGTCTATCANTGGG-TCTTGCATTTTATTTCGGTAA-GATTCATTATAGATGGACAATGTTATTATTTCACTTATATTNGTNTAAGNTATA-------CTATATGACAGTTAAAAAGCTATACTG--ATTTTTATAAA--ATCATA-ATT----TATTT----AGTTATTTT-AACAAATCCATCATGT-TATGAA--TACTCTTACAATATGACA-----TCATA------TTAGGCGT---------ATCGT-ATGT-TCATTC-----TTC--ACTTG--TAACTCA-T-TGTA----TANTATTCATTTAT-ATGT---A---A-----TN-A--TTTAC-TGCAATTTGTATATATGTTATTATATGCTCTCCAANTATGGAGGAAATAAAGATTCTAT
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gi|160888 : ACAATAAGGG-AA-A-TAACTCCT-CCGATACTGCTAATAGTTGACTATTTGTTAAATAGT-TATGgatggccattgctctgttgtttaacactgtttccaattaattacgctgaatattcaaacaaacattcaaaacattgttgaactacaactcagtttacgacatgtttaaatattcagtgtaatttgttggaaaatgtgtttatttacgaatcttaactagatcaatggtcatttttatgtacaataagggaaataactcctccgatactgctaatagttgactatttgttaaatagttatg
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Reference ( family-885 ) : AATGTTTTACAGCAGTGTCACTACTAAGTAAACTGCAATCGTTTACAGCTGTACAGCTATGTAACAAATGTAATACGCTTGTAGATAAT-T-A-GTACTACATATTGTTCATTTTTGTNTTGCAAACACTGTCGAAAGAA-TAAGCTTTGGGACGCAGTTATAACGACTTGTGGTCTTCAGGCCTTTAATTCATTTATTAAAAAG-ACGCCTAAAGATCAGATTTATGCACTGCTTTCCGGGCTTAATGAATATTTATCCGACACTGAACA-GATTGAAGATATATTAT---TGTTCAATAT--TG-----GGNTAATTCACAGTATGTT-AA-G-TAACTTTTATCGATACTGCTAAT-GTTTACTGTTTGTTACTCAGTGTATGATCAATTTCTTACATTTCGTTTCGGTAAGATACAAA-AG----GTTCACCGTTGTCATGAGTCTATCACTGGG-TCTTGCATTTTATTTCGGTAA-NATTCATTATAGATGGACAATGTTATTATTTCACTTATATTTGTGTAAGNTATA-------CTATATGACAGTTAAAAAGCTATACTG--ATTTTTATAAA--ATCATA-ATT----TATTT----AGTTATTTT-AACAAATCCATCATGT-TATGAA--TACTCTTACAATATGACA-----TCATA------TTAGGCGT---------ATCGT-ATGT-TCATTC-----TTC--ACTTG--TAACTCA-T-TGTA----TANTATTCATTTATATGT---A---A-----TT-ATTTACTGCAATTTGTATAT--ATGTTATTATATGCTCTCCAANTATGGAGGAAATAAAGATTCTAT
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Reference ( family-885 ) : AATGTTTTACAGCAGTGTCACTACTAAGTAAACTGCAATCGTTTACAGCTGTACAGCTATGTAACAAATGTAATACGCTTGTAGATAAT-T-A-GTACTACATATTGTTCATTTTTGTNTTGCAAACACTGTCGAAAGAA-TAAGCTTTGGGACGCAGTTATAACGACTTGTGGTCTTCAGGCCTTTAATTCATTTATTAAAAAG-ACGCCTAAAGATCAGATTTATGCACTGCTTTCCGGGCTTAATGAATATTTATCCGACACTGAACA-GATTGAAGATATATTAT---TGTTCAATAT--TG-----GGNTAATTCACAGTATGTT-AA-G-TAACTTTTATCGATACTGCTAAT-GTTTACTGTTTGTTACTCAGTGTATGATCAATTTCTTACATTTCGTTTCGGTAAGATACAAA-AG----GTTCACCGTTGTCATGAGTCTATCACTGGG-TCTTGCATTTTATTTCGGTAA-NATTCATTATAGATGGACAATGTTATTATTTCACTTATATTTGTGTAAGNTATA-------CTATATGACAGTTAAAAAGCTATACTG--ATTTTTATAAA--ATCATA-ATT----TATTT----AGTTATTTT-AACAAATCCATCATGT-TATGAA--TACTCTTACAATATGACA-----TCATA------TTAGGCGT---------ATCGT-ATGT-TCATTC-----TTC--ACTTG--TAACTCA-T-TGTA----TANTATTCATTTATATGT---A---A-----TT-ATTTACTGCAATTTGTATAT--ATGTTATTATATGCTCTCCAANTATGGAGGAAATAAAGATTCTAT
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Reference ( family-885 ) : AATGTTTTACAGCAGTGTCACTACTAAGTAAACTGCAATCGTTTACAGCTGTACAGCTATGTAACAAATGTAATACGCTTGTAGATAAT-T-A-GTACTACATATTGTTCATTTTTGTNTTGCAAACACTGTCGAAAGAA-TAAGCTTTGGGACGCAGTTATAACGACTTGTGGTCTTCAGGCCTTTAATTCATTTATTAAAAAG-ACGCCTAAAGATCAGATTTATGCACTGCTTTCCGGGCTTAATGAATATTTATCCGACACTGAACA-GATTGAAGATATATTAT---TGTTCAATAT--TG-----GGNTAATTCACAGTATGTT-AA-G-TAACTTTTATCGATACTGCTAAT-GTTTACTGTTTGTTACTCAGTGTATGATCAATTTCTTACATTTCGTTTCGGTAAGATACAAA-AG----GTTCACCGTTGTCATGAGTCTATCACTGGG-TCTTGCATTTTATTTCGGTAA-NATTCATTATAGATGGACAATGTTATTATTTCACTTATATTTGTGTAAGNTATA-------CTATATGACAGTTAAAAAGCTATACTG--ATTTTTATAAA--ATCATA-ATT----TATTT----AGTTATTTT-AACAAATCCATCATGT-TATGAA--TACTCTTACAATATGACA-----TCATA------TTAGGCGT---------ATCGT-ATGT-TCATTC-----TTC--ACTTG--TAACTCA-T-TGTA----TANTATTCATTTATATGT---A---A-----TT-ATTTACTGCAATTTGTATAT--ATGTTATTATATGCTCTCCAANTATGGAGGAAATAAAGATTCTAT
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gi|160887 : AATGTTTTACAGCAGTGTCACTA-TAAGTAAACTGCAATCGTTTACAGCTGTACAGCTATGTAACAAATGTAATAAGCTTGTAGATG------------------TGTTCATTTTTGTTTTGCAAACACTGTCAAAAAAA-
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gi|160888 : aatgttttacagcagtgtcactataagtaaactgcaatcgtttacagctgtacagctatgtaacaaatgtaataagcttgtagatgtgttcatttttgttttgcaaacactgtcaaaaaaagatggccattgctctgttgtttaacactgtttccaattaattacgctgaatattcaaacaaacattcaaaacattgttgaactacaactcagtttacgacatgtttaaatattcagtgtaatttgttggaaaatgtgtttatttacgaatcttaactagatcaatggtcatttttatgtAATGTTTTACAGCAGTGTCACTA-TAAGTAAACTGCAATCGTTTACAGCTGTACAGCTATGTAACAAATGTAATAAGCTTGTAGATG------------------TGTTCATTTTTGTTTTGCAAACACTGTCAAAAAAA-
gi|160888 : ACAATAAGGG-AA-A-TAACTCCT-CCGATACTGCTAATAGTTGACTATTTGTTAAATAGT-TATGgatggccattgctctgttgtttaacactgtttccaattaattacgctgaatattcaaacaaacattcaaaacattgttgaactacaactcagtttacgacatgtttaaatattcagtgtaatttgttggaaaatgtgtttatttacgaatcttaactagatcaatggtcatttttatgtacaataagggaaataactcctccgatactgctaatagttgactatttgttaaatagttatg
gi|160889 : aatgttttacagcagtgtcactataagtaaactgcaatcgtttacagctgtacagctatgtaacaaatgtaataagcttgtagatgtgttcatttttgttttgcaaacactgtcaaaaaaagatggccattgctctgttgtttaacactgtttccaattaattacgctgaatattcaaacaaacattcaaaacattgttgaactacaactcagtttacgacatgtttaaatattcagtgtaatttgttggaaaatgtgtttatttacgaatcttaactagatcaatggtcatttttatgtAATGTTTTACAGCAGTGTCACTACTAAGTAAACTGCAATCGTTTACAGCTGTACAGCTATGTAACAAATGTAATACGCTTGTAGATAAT-TGA-GTACTACATATTGTTCATTTTTGTATTGCAAACATTGTCGAAAGAAATAAGCTTTGGGACGCAGTTATAACGACTTGTGGTCTTCAGGTCTTTAATTCATTTATTAAAAAG-ACGCCTAAAGATCAGATTTATGCACTACTTTCCAGGCTTAATGAATATTTATCTGACATTGAACA-GATTGAAGATATATTAT---TGTTCAATAT--TG-----GGATACTTCACAGTATGTT-AAAG-TAACTTTTATCGATACTGCTAAT-GTTTACTGTTTGTTACTCAGTGTATGATTAATTTCTTACATTTCGTTTCGGTAAGATACAAA-AG----GTTCATCGTTGTCATTAGTCTATCACTGGG-TCTTGCATTTTATTTCGGTAA-GATTCATTATAGATGGACAATGTTATTATTTCACTTATATTAGAGTAAGGTACA-------CTATATGACAGTTAAAAAGCTATACTG--ATTTTTAT-AA--ATCATA-ATT----TATTT----AGTTATTTT-AACAAATCCATCATGT-TATGAA--TACTCTTACAATATGACA-----TCATA------TTAGGCGT---------ATCGT-ATGT-TCATTC-----TTC--ACTTG--TAACTCA-T-TGTA----TATTATTCATTTATATGT---A---A-----TT-ATTTACTGCAATTTTTATAT--ATGTTATTATATGCTCTCCAATTATGGAGGAAATAAAGATTCTAT
gi|160890 : AATGTTTTACAGCAGTGTCACTACTAAGTAAACTGCAATCGTTTACAGCTGTACAGCTATGTAACAAATGTAATACGCTTGTAGATAAT-TTA-GTACTACATATTGTTCATTTTTGTATTGCAAACACTGTCGAAAGAAATAAGCTTTGGGACGCAGTTATAACGACCTGTGGTCTTCAGGTCTTTAATTTATTTATTAAAAAG-ACGCCTAAAGATCAGATTTATGCACTGCTTTCCGGGCTTAATGAATATTTATCTGACATTGAACA-GATTGAAGATGTATTAT---TGTTCAATAT--TG-----GGATACTTCACAGTATGTT-AAAG-TAACTTTTATCGATACTGCTAAT-GTTTACTGTTTGTTACTCAGTGTATGATTAATTTCTTACATTTCGTTTCGGTAAGATACAAA-AG----GTTCATCGTTGTCATTAGTCTATCACTGGG-TCTTGCATTTTATTTCGGTAA-GATTCATTATAGATGGACAATGTTATTATTTCACTTATATTATTTTAAGGTACA-------CTATATGACAGTTAAAAAGCTATACTA--ATTTTTATAAA--ATCATA-ATT----TATTT----AGTTATTTT-AACAAATCCATCATGT-TATGAA--TACTCTTACAATATGACA-----TCATA------TTAGGCGT---------ATCGT-ATGT-TCATTC-----TTC--ACTTG--TAACTCA-T-TGTA----TGTTGTTCATTTATATGT---A---A-----TT-ATTTACTGCAATTTTTATAT--ATGTTATTATATGCTCTCCAATTATGGAGGAAATAAAGATTCTAT
gi|160891 : TGTTTTACAGCAGTGAAACTGTTAAGTAGATTGCCATCGTTTACAGCTGTA----------ACAAATGTCATACGCATGTAGAAAATCT-A-GCATTACATATTATTCATTTTTGTATTGCAAATAAT-----AAGAA-TAAGCTTTGTGATTGAATTATAACGACGTGCGGTCTTCAGTCATTTAATTCATTTATTAAAAAGAACG-GTAAAGATCAAATATATGCATTGGTTTCTGATCTTACTAGATATTTATCTGGCACGGATTT-GATTGAAAATATACTAT---GATTAAATAT--TT-----GTTTAATTCACAGTATG-------------TTTAT--ATA--ACTA-----TTACTGTTTGCTACTCATCGTATAATCCATTTCTTACATTTCGTTTTGGTAAGATACTAA-AG----GTTTACTGCTGTAACAAGTCTATCAATGAGTTTTTGAATTTT-TTTCGGCAATTTTTTTTTGTAAATTGACAATGTCATTTTTTCAGTTATACTT-TTT--GATATT-------CTACATGCCAGTTAAACACCTA-ACTG--ATATTTAC-AA--ATCATAGATTAATATATGT----A-TGATTTT-AACCTGTTCACTAT-------AATCTACTTGTACACTATGATAACTTTTCATGAATGCTTTATATGTTAGAATGACATTATAATGT-CCACTCTGTCGTTC--AC-TG--TAAAACA-TATGTAATGTTAAGATTTACTTAT-CGT-------------TT-GTTCACTTTCACTTGTATTTTGATG-TATGATAT
gi|160891 : T---------ATCGT-TTGT-TCACT------TTC--ACTTG--TATTTTG-A-TGTA----TGATATTAATTTGTAT---------A-----TT-AT--------------ATAT--GTGTTATAATATTCTCTCCAAACACAG-GGAAGTCAAGA--CTATtaatttgtatattatatatgtgttataatattctctccaaacacagggaagtcaagactat
gi|160892 : tgttttacagcagtgaaactgttaagtagattgccatcgtttacagctgtaacaaatgtcatacgcatgtagaaaatctagcattacatattattcatttttgtattgcaaataataagaataagctttgtgattgaattataacgacgtgcggtcttcagtcatttaattcatttattaaaaagaacggtaaagatcaaatatatgcattggtttctgatcttactagatatttatctggcacggatttgattgaaaatatactatgattaaatatttgtttaattcacagtatgtttatataactattactgtttgctactcatcgtataatccatttcttacatttcgttttggtaagatactaaaggtttactgctgtaacaagtctatcaatgagtttttgaatttttttcggcaatttttttttgtaaattgacaatgtcattttttcagttatactttttgatattctacatgccagttaaacacctaactgatatttacaaatcatagattaatatatgtatgattttaacctgttcactataatctacttgtacactatgataacttttcatgaatgctttatatgttagaatgacattataatgtccactctgtcgttcactgtaaaacatatgtaatgttaagatttactTATGCGTTGCTCTCTGGTCTTAGTGAATATTTATCTGACAC--AATAAGATTGAAAAAATATAAC---TGTTCAATACAATGTAATTGGTTAATTCACATTATGTT-TG-GATAACAATTTTCAGTATTGCTAAT-GTTTGCTATTTGATACTCATT---TGATCGTCTTTTTACATTTTGTTTCGGTAATATACAAACAGTTCAGTTCACCGGTAGCATGAATCTATCAATACG-TCTTGCATTTTATTTTGGTAA-GATTCATTATCAATAGACACTATCATTATTACACTTAAAT---TATAA-TTATAGTCAACTCTATATGGCTG-TAAAAAGC--TGCTGTAATTCTTAAAAAAGAGCATT-ATC----TATTTTAAAAGTTATTTTAAACAATTTCA--GTGTGTATAAA--TATT
gi|160893 : TTACTGAATATTTATCTGGTACGGATCA-GAT-AAAAATATACTATGTTTATTCAATAT--TG-----GTTTGATTCACAGTGTGTT-AA-G-TAACTATTATCGATACTGCTA------------TTGATACTCGGTGTATGATCAACTTCTTACATTTCGTTACAGAAAGATACAAA-CA----GTTCTCCACTGTCATGAGTCTATCAATGAC-ATGTGCATTGAATTTCCGTAA-
gi|160894 : CTCTTTAAATCTAATC-----TAATG------TTATGTTT---------ACCG--ATTTATC-TTT-----TTC--ACCTGCGTACGTCA-T-TATA----TAATAATTATATACAGGT---A---A-----TG-AATTACTGCAATT-GTATAT--ATGTAATTATATGATCTTCAA--ACGGAAGAAATAAGGATT
gi|160895 : ATA------TTATGCTT---------ATTGA-ATGT-TCATTT-----TTCCTGTTTT--TTA--CA-T-TGTA--------GTTCATTTATATGTCACA---AAGTCTTT-ATTTATTTTAA---GTATAT--ATGCTATTATAT-CTCTCAAAATATGAAGGAAATGAAAATT
gi|160896 : T---------ATCGT-TTGT-T-AGGC-----CTA--GTTTG--T---TCACT-TATA----AAATATTCATTTATTTGT---A---A-----TT-ATTTACTGCAA-TTATATGT--ATGTTACTATATGCT-TTAAAATGTGGAGGGAATA
gi|160897 : TGT-TCACTT-----TTC--ACTTG--TATTTCG-A-TGTA----TAATATTAATGTATATGT---A---A-----TT-ATTTATTGCAA-TTGTATAT--ATATCAGCCTATGCTCTCGGAATATGGAGGAAATAAAAATGCTGT
gi|160898 : TCA-T--ATA----TGCTATTAATTTATATGT---ATTTA-----TTCATTTACTGGAATT-GTATAT--ATATTATTATATGCTCTCCAAATATGGA-GAAGTAAAGAT
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gi|160900 : TATGCTCTCCAATTATGGAGGAAATAAAGATTCTAT