lowQualScore                  :                                                             1                                                                           
lowQualScore                  :          3      555    2  77777777                 33       0  2                        0             6                  6      9       
lowQualScore                  :          .      ...    .  ........                 ..       .  .                        .             .                  .      .       
lowQualScore                  :          1      444    9  66666666                 99       1  5                        6             0                  0      5       
consensus                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGCGGT--CATATTAAAGGCCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGAATANGTTTATA
Reference ( gi|120407 )       : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGCGGT--CATATTACAGACCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTATTTGTCACCTAAATACCAAACACATCAAGCGTGTGAATATGTTTATA
gi|120408                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATAGCAGT--CATATTAAAGATCAAGTACTTTTAATTGCGAATGTATTTGTCACCTAAACACAAAACACATCAAGCGTATGGATACGTTTATA
gi|120409                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAG-TT----C---TTTGGAAAAATGGCAAT--GATATCACTGACCATGTGCTTTTAATTACAAATGTATTTGCCACCTAAACACCAAACGAATCAAGCGTATGAATATGTTTATA
gi|120411                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----G---TTTGGAAAAATGGCGGT--CGTATTATAGGCCATATCCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAACGTATTAGTAGTTTTATA
gi|120410                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-CT----C---TTTGGAAAAATGGCGGT--CATATTAAAGTCCATGTGCTTTTAAGTGTAATTGTGTTTATCACCTGAACACCAAACACGTAAAGCATATGAATAGTTTTATA
gi|120413                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAGC-TT----C---TTTGGAAAAATGGAGGT--TATATTTAAGGCCATATAC----------AAATGTATTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGAATATGTTTATA
gi|120412                     : ATATTCAAA-CAAATG---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGTAGT--CATATTAAAGGCCATGTGCCTTTAATTGTAAATGTGTTTTTGACCTAAACACCAAACACATTAAACGTAT
gi|120414                     : ATATTCAAA-CAAATA---CAAC-TTGTCACGAGTTTAGGAAAATGGTGGT--CATATTAAACGCCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGTATA-ACTTATA
gi|120416                     : ATATTCAAA-CAAATG---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGCGAT--CATATTATAGACCATGTGCTTTTAATTTCAAATGCATTTGTCACCT
gi|120415                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----G---TTTAGGAAAATGGTGGT--CATATTAAAAGCTATGTGCTTTTAGTTGCAAATGTGTTTGTCACAAAAACATCTAACACATCAAGCAT
gi|120417                     : ATAGTCAAA-CAAATA---AAAC-TT----C---TTTCGAAAAATCGCGTT--AATATTAAAGGCCATGTGCTTTTAA-TGTTAATGTGTGTGTCACCTAAACACCAa
gi|120418                     : ATATTTAAA-CAAATC---AAAC-TT----T---TTTGGAAAAAT-----TAACACATTAAAAGCTTTGTTCTTTAAATAGCCCATGTGTGTGTCACCTAAACACCAAACACATTAAACGTAT
gi|120419                     :   ATTCAAAACAAATTCCTAAAC-TT----G---TTTAGGAAAATGGTAGT--CATAACAAAGGCCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTTAACACCAAACACATCAA-CGTATGTATA-GCTTATA
gi|120420                     :     TCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATAGCGAT--CATATTACAGACCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTATTTGTCACCT
gi|120421                     :                     AACATT----C---TTTGGAAAAATGGCAGT--CATATTAAAGGCCATGTGCTTTTAATTG-AAATGTGTTTGTCACCTTAACACCAAACACATCAAGCATATGAATAGTTTTATA
gi|120422                     :                                                                                              TCACCTAAACACCAAACACACCAAGCGTATGAATATGTTTATA
gi|120423                     :                                                                                              TCATCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGAATATGTTTATA





Alignments
lowQualScore                  :          2      555    2  66666666                 33                                                                           55      
lowQualScore                  :          .      ...    .  ........                 ..                                                                           ..      
lowQualScore                  :          9      000    7  44444444                 77                                                                           99      
consensus                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGCGGT--CATATTAAAGGCCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGAATANGTTTATA
Reference ( family-881 )      : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGCGGT--CATATTAAAGGCCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGAATANGTTTATA
gi|120407                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGCGGT--CATATTACAGACCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTATTTGTCACCTAAATACCAAACACATCAAGCGTGTGAATATGTTTATA
gi|120408                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATAGCAGT--CATATTAAAGATCAAGTACTTTTAATTGCGAATGTATTTGTCACCTAAACACAAAACACATCAAGCGTATGGATACGTTTATA
gi|120409                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAG-TT----C---TTTGGAAAAATGGCAAT--GATATCACTGACCATGTGCTTTTAATTACAAATGTATTTGCCACCTAAACACCAAACGAATCAAGCGTATGAATATGTTTATA
gi|120410                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-CT----C---TTTGGAAAAATGGCGGT--CATATTAAAGTCCATGTGCTTTTAAGTGTAATTGTGTTTATCACCTGAACACCAAACACGTAAAGCATATGAATAGTTTTATA
gi|120411                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----G---TTTGGAAAAATGGCGGT--CGTATTATAGGCCATATCCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAACGTATTAGTAGTTTTATA
gi|120412                     : ATATTCAAA-CAAATG---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGTAGT--CATATTAAAGGCCATGTGCCTTTAATTGTAAATGTGTTTTTGACCTAAACACCAAACACATTAAACGTAT
gi|120413                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAGC-TT----C---TTTGGAAAAATGGAGGT--TATATTTAAGGCCATATAC----------AAATGTATTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGAATATGTTTATA
gi|120414                     : ATATTCAAA-CAAATA---CAAC-TTGTCACGAGTTTAGGAAAATGGTGGT--CATATTAAACGCCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGTATAA-CTTATA
gi|120415                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----G---TTTAGGAAAATGGTGGT--CATATTAAAAGCTATGTGCTTTTAGTTGCAAATGTGTTTGTCACAAAAACATCTAACACATCAAGCATA
gi|120416                     : ATATTCAAA-CAAATG---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGCGAT--CATATTATAGACCATGTGCTTTTAATTTCAAATGCATTTGTCACCT
gi|120417                     : ATAGTCAAA-CAAATA---AAAC-TT----C---TTTCGAAAAATCGCGTT--AATATTAAAGGCCATGTGCTTTTAA-TGTTAATGTGTGTGTCACCTAAACACCA
gi|120418                     : ATATTTAAA-CAAATC---AAAC-TT----T---TTTGGAAAAAT-----TAACACATTAAAAGCTTTGTTCTTTAAATAGCCCATGTGTGTGTCACCTAAACACCAAACACATTAAACGTAT
gi|120419                     :   ATTCAAAACAAATTCCTAAAC-TT----G---TTTAGGAAAATGGTAGT--CATAACAAAGGCCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTTAACACCAAACACATCAA-CGTATGTATA-GCTTATA
gi|120420                     :     TCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATAGCGAT--CATATTACAGACCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTATTTGTCACCT
gi|120421                     :                     AACATT----C---TTTGGAAAAATGGCAGT--CATATTAAAGGCCATGTGCTTTTAATTG-AAATGTGTTTGTCACCTTAACACCAAACACATCAAGCATATGAATAGTTTTATA
gi|120422                     :                                                                                              TCACCTAAACACCAAACACACCAAGCGTATGAATATGTTTATA
gi|120423                     :                                                                                              TCATCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGAATATGTTTATA





Alignments
lowQualScore                  :          2      555    2  66666666                 33                                                                           55      
lowQualScore                  :          .      ...    .  ........                 ..                                                                           ..      
lowQualScore                  :          9      000    7  44444444                 77                                                                           99      
consensus                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGCGGT--CATATTAAAGGCCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGAATANGTTTATA
Reference ( family-881 )      : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGCGGT--CATATTAAAGGCCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGAATANGTTTATA
gi|120407                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGCGGT--CATATTACAGACCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTATTTGTCACCTAAATACCAAACACATCAAGCGTGTGAATATGTTTATA
gi|120408                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATAGCAGT--CATATTAAAGATCAAGTACTTTTAATTGCGAATGTATTTGTCACCTAAACACAAAACACATCAAGCGTATGGATACGTTTATA
gi|120409                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAG-TT----C---TTTGGAAAAATGGCAAT--GATATCACTGACCATGTGCTTTTAATTACAAATGTATTTGCCACCTAAACACCAAACGAATCAAGCGTATGAATATGTTTATA
gi|120410                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-CT----C---TTTGGAAAAATGGCGGT--CATATTAAAGTCCATGTGCTTTTAAGTGTAATTGTGTTTATCACCTGAACACCAAACACGTAAAGCATATGAATAGTTTTATA
gi|120411                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----G---TTTGGAAAAATGGCGGT--CGTATTATAGGCCATATCCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAACGTATTAGTAGTTTTATA
gi|120412                     : ATATTCAAA-CAAATG---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGTAGT--CATATTAAAGGCCATGTGCCTTTAATTGTAAATGTGTTTTTGACCTAAACACCAAACACATTAAACGTAT
gi|120413                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAGC-TT----C---TTTGGAAAAATGGAGGT--TATATTTAAGGCCATATAC----------AAATGTATTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGAATATGTTTATA
gi|120414                     : ATATTCAAA-CAAATA---CAAC-TTGTCACGAGTTTAGGAAAATGGTGGT--CATATTAAACGCCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGTATAA-CTTATA
gi|120415                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----G---TTTAGGAAAATGGTGGT--CATATTAAAAGCTATGTGCTTTTAGTTGCAAATGTGTTTGTCACAAAAACATCTAACACATCAAGCATA
gi|120416                     : ATATTCAAA-CAAATG---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGCGAT--CATATTATAGACCATGTGCTTTTAATTTCAAATGCATTTGTCACCT
gi|120417                     : ATAGTCAAA-CAAATA---AAAC-TT----C---TTTCGAAAAATCGCGTT--AATATTAAAGGCCATGTGCTTTTAA-TGTTAATGTGTGTGTCACCTAAACACCA
gi|120418                     : ATATTTAAA-CAAATC---AAAC-TT----T---TTTGGAAAAAT-----TAACACATTAAAAGCTTTGTTCTTTAAATAGCCCATGTGTGTGTCACCTAAACACCAAACACATTAAACGTAT
gi|120419                     :   ATTCAAAACAAATTCCTAAAC-TT----G---TTTAGGAAAATGGTAGT--CATAACAAAGGCCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTTAACACCAAACACATCAA-CGTATGTATA-GCTTATA
gi|120420                     :     TCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATAGCGAT--CATATTACAGACCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTATTTGTCACCT
gi|120421                     :                     AACATT----C---TTTGGAAAAATGGCAGT--CATATTAAAGGCCATGTGCTTTTAATTG-AAATGTGTTTGTCACCTTAACACCAAACACATCAAGCATATGAATAGTTTTATA
gi|120422                     :                                                                                              TCACCTAAACACCAAACACACCAAGCGTATGAATATGTTTATA
gi|120423                     :                                                                                              TCATCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGAATATGTTTATA


blockSeqs                     :          A      CCT    A  GTCACGAG                 AA                                                                           CG
blockSeqs                     :          .      .      .  C                        .                                                                            TG
blockSeqs                     :          .      .      .  C                        .                                                                            GT
blockSeqs                     :          .      .      .  C                        .                                                                            GT
blockSeqs                     :          .      .      .  G                        .                                                                            TG
blockSeqs                     :          .      .      .  C                        .                                                                            GT
blockSeqs                     :          .      .      .  C                        .                                                                            TG
blockSeqs                     :          .      .      .  G                        .                                                                            TG
blockSeqs                     :          .      .      .  C                        .                                                                            A 
blockSeqs                     :          .      .      .  C                        .                                                                            G 
blockSeqs                     :          .      .      .  T                        .                                                                              
blockSeqs                     :          .      .      .  G                        .                                                                              
blockSeqs                     :          .      .      .  C                        .                                                                              
blockSeqs                     :                        .  C                        .                                                                              


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGCGGT--CATATTAAAGGCCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGAATANGTTTATA
finalCons                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGCGGT--CATATTAAAGGCCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGAATANGTTTATA





Alignments
lowQualScore                  :          2      555    2  66666666                 33                                                                           55      
lowQualScore                  :          .      ...    .  ........                 ..                                                                           ..      
lowQualScore                  :          9      000    7  44444444                 77                                                                           99      
consensus                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGCGGT--CATATTAAAGGCCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGAATANGTTTATA
Reference ( family-881 )      : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGCGGT--CATATTAAAGGCCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGAATANGTTTATA
gi|120407                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGCGGT--CATATTACAGACCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTATTTGTCACCTAAATACCAAACACATCAAGCGTGTGAATATGTTTATA
gi|120408                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATAGCAGT--CATATTAAAGATCAAGTACTTTTAATTGCGAATGTATTTGTCACCTAAACACAAAACACATCAAGCGTATGGATACGTTTATA
gi|120409                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAG-TT----C---TTTGGAAAAATGGCAAT--GATATCACTGACCATGTGCTTTTAATTACAAATGTATTTGCCACCTAAACACCAAACGAATCAAGCGTATGAATATGTTTATA
gi|120410                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-CT----C---TTTGGAAAAATGGCGGT--CATATTAAAGTCCATGTGCTTTTAAGTGTAATTGTGTTTATCACCTGAACACCAAACACGTAAAGCATATGAATAGTTTTATA
gi|120411                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----G---TTTGGAAAAATGGCGGT--CGTATTATAGGCCATATCCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAACGTATTAGTAGTTTTATA
gi|120412                     : ATATTCAAA-CAAATG---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGTAGT--CATATTAAAGGCCATGTGCCTTTAATTGTAAATGTGTTTTTGACCTAAACACCAAACACATTAAACGTAT
gi|120413                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAGC-TT----C---TTTGGAAAAATGGAGGT--TATATTTAAGGCCATATAC----------AAATGTATTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGAATATGTTTATA
gi|120414                     : ATATTCAAA-CAAATA---CAAC-TTGTCACGAGTTTAGGAAAATGGTGGT--CATATTAAACGCCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGTATAA-CTTATA
gi|120415                     : ATATTCAAA-CAAATC---AAAC-TT----G---TTTAGGAAAATGGTGGT--CATATTAAAAGCTATGTGCTTTTAGTTGCAAATGTGTTTGTCACAAAAACATCTAACACATCAAGCATA
gi|120416                     : ATATTCAAA-CAAATG---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATGGCGAT--CATATTATAGACCATGTGCTTTTAATTTCAAATGCATTTGTCACCT
gi|120417                     : ATAGTCAAA-CAAATA---AAAC-TT----C---TTTCGAAAAATCGCGTT--AATATTAAAGGCCATGTGCTTTTAA-TGTTAATGTGTGTGTCACCTAAACACCA
gi|120418                     : ATATTTAAA-CAAATC---AAAC-TT----T---TTTGGAAAAAT-----TAACACATTAAAAGCTTTGTTCTTTAAATAGCCCATGTGTGTGTCACCTAAACACCAAACACATTAAACGTAT
gi|120419                     :   ATTCAAAACAAATTCCTAAAC-TT----G---TTTAGGAAAATGGTAGT--CATAACAAAGGCCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTGTTTGTCACCTTAACACCAAACACATCAA-CGTATGTATA-GCTTATA
gi|120420                     :     TCAAA-CAAATC---AAAC-TT----C---TTTGGAAAAATAGCGAT--CATATTACAGACCATGTGCTTTTAATTGCAAATGTATTTGTCACCT
gi|120421                     :                     AACATT----C---TTTGGAAAAATGGCAGT--CATATTAAAGGCCATGTGCTTTTAATTG-AAATGTGTTTGTCACCTTAACACCAAACACATCAAGCATATGAATAGTTTTATA
gi|120422                     :                                                                                              TCACCTAAACACCAAACACACCAAGCGTATGAATATGTTTATA
gi|120423                     :                                                                                              TCATCTAAACACCAAACACATCAAGCGTATGAATATGTTTATA