lowQualScore                  :                   8                    6     7             
lowQualScore                  :                   .                    .     .             
lowQualScore                  :                   7                    0     1             
consensus                     : CAGTATTTTAAGTGCACCCATCCATTTCAATTGTCACACTGTCCCCAGGTAAGAAATTC
Reference ( gi|31328 )        : CAGTATTTTAAGTGCACCAATCCATTTCAATTGTCACACCGTCCCTAGGTAAGAAATTC
gi|31329                      : CAATATTCTAACTGCACCCATCCATTTCAATTGTTACACTGTCCCTAGGTAAGAAATTC
gi|31330                      : CAGTATTTAAAGTGCACTAATCCATTTCAGTTGTCACACTGTCCCCATGTAAGAAATTC
gi|31331                      : CAGTATTTTAAGTGCTCCCATTTATTTCAATTGTCACACTGTCCC-ATGTAAGAAATTC
gi|31336                      : CAGTATTTTAAGTCCACAAATCCATTTCAATTGTCACACTGTCTTCAGGTAAG
gi|31333                      : CAGTATTTTAAGTGCACTTATCAATTTCCAATGTCACACTGTCCCCAGGTAAGAAAGTC
gi|31332                      : CAGTATTTTTAATGTACCCATCCATTTCAATTGT--CACTGTCCCCAGGTAAAAAATTC
gi|31339                      : CAGTATTTTAAATGGACCAACTCCTTTCAATTGCCACACTGTCCTTATGTAAGGAATTC
gi|31334                      : CAGTACTTAAAGTGCACCCTTCCATTGCAATTGTCCCACTGTCCCCAGGTAAGAAAT
gi|31335                      : CAGCGTTTTAAGTACACTCCTCCATTTCAGCTGTCACACTGTCCCCAGGTAGGGAATTC
gi|31337                      : CAGCATTTTAATTGCACCCATCCATTTCAATCGAAACACTGCTCCCAGGTAATAAATTC
gi|31338                      : CAGTATTTTAAGTGCACCCATCTATTTCAATTGTTACACTGT
gi|31340                      : CAGTATTTTAAGTGTTCTCATCCATTTCAATTGTCAgacatgttcccatgttagacatt
gi|31341                      :   GTGTTTTAAGTGCACCAATCTATTTCAATTCTCATACTGTCCCCAGGTAAGAAATTC
gi|31342                      :      TTTTA--TGCACTCATCCATTTCAATTGTCACACTGTTCCCAGGTTAGAAATTC
gi|31343                      :           AGTGCACCCACTCATTTCAATTGTCACACTGTCCCAAGGTAAGAAAT
gi|31344                      :                        ATTTCAATTGTCACACTGTCCCCAGGTAAGAAATTC

lowQualScore                  :                                        8888888                    
lowQualScore                  :                                        .......                    
lowQualScore                  :                                        1111111                    
consensus                     : CAGTATTTTAAGTGCACCCATCCATTTCAATTGTCACAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAATTC
Reference ( family-879 )      : CAGTATTTTAAGTGCACCCATCCATTTCAATTGTCACAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAATTC
gi|31328                      : CAGTATTTTAAGTGCACCAATCCATTTCAATTGTCACAC-------CGTCCCTAGGTAAGAAATTC
gi|31329                      : CAATATTCTAACTGCACCCATCCATTTCAATTGTTACAC-------TGTCCCTAGGTAAGAAATTC
gi|31330                      : CAGTATTTAAAGTGCACTAATCCATTTCAGTTGTCACAC-------TGTCCCCATGTAAGAAATTC
gi|31331                      : CAGTATTTTAAGTGCTCCCATTTATTTCAATTGTCACAC-------TGT-CCCATGTAAGAAATTC
gi|31332                      : CAGTATTTTTAATGTACCCATCCATTTCAATTGT--CAC-------TGTCCCCAGGTAAAAAATTC
gi|31333                      : CAGTATTTTAAGTGCACTTATCAATTTCCAATGTCACAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAAGTC
gi|31334                      : CAGTACTTAAAGTGCACCCTTCCATTGCAATTGTCCCAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAAT
gi|31335                      : CAGCGTTTTAAGTACACTCCTCCATTTCAGCTGTCACAC-------TGTCCCCAGGTAGGGAATTC
gi|31336                      : CAGTATTTTAAGTCCACAAATCCATTTCAATTGTCACAC-------TGTCTTCAGGTAAG
gi|31337                      : CAGCATTTTAATTGCACCCATCCATTTCAATCGAAACAC-------TGCTCCCAGGTAATAAATTC
gi|31338                      : CAGTATTTTAAGTGCACCCATCTATTTCAATTGTTACACTGTGACATGTTCCCATGTTAGACATT
gi|31339                      : CAGTATTTTAAATGGACCAACTCCTTTCAATTGCCACAC-------TGTCCTTATGTAAGGAATTC
gi|31340                      : CAGTATTTTAAGTGTTCTCATCCATTTCAATTGTCA
gi|31341                      :   GTGTTTTAAGTGCACCAATCTATTTCAATTCTCATAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAATTC
gi|31342                      :      TTTTA--TGCACTCATCCATTTCAATTGTCACAC-------TGTTCCCAGGTTAGAAATTC
gi|31343                      :           AGTGCACCCACTCATTTCAATTGTCACAC-------TGTCCCAAGGTAAGAAAT
gi|31344                      :                        ATTTCAATTGTCACAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAATTC

lowQualScore                  :                                        8888888                    
lowQualScore                  :                                        .......                    
lowQualScore                  :                                        1111111                    
consensus                     : CAGTATTTTAAGTGCACCCATCCATTTCAATTGTCACAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAATTC
Reference ( family-879 )      : CAGTATTTTAAGTGCACCCATCCATTTCAATTGTCACAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAATTC
gi|31328                      : CAGTATTTTAAGTGCACCAATCCATTTCAATTGTCACAC-------CGTCCCTAGGTAAGAAATTC
gi|31329                      : CAATATTCTAACTGCACCCATCCATTTCAATTGTTACAC-------TGTCCCTAGGTAAGAAATTC
gi|31330                      : CAGTATTTAAAGTGCACTAATCCATTTCAGTTGTCACAC-------TGTCCCCATGTAAGAAATTC
gi|31331                      : CAGTATTTTAAGTGCTCCCATTTATTTCAATTGTCACAC-------TGT-CCCATGTAAGAAATTC
gi|31332                      : CAGTATTTTTAATGTACCCATCCATTTCAATTGT--CAC-------TGTCCCCAGGTAAAAAATTC
gi|31333                      : CAGTATTTTAAGTGCACTTATCAATTTCCAATGTCACAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAAGTC
gi|31334                      : CAGTACTTAAAGTGCACCCTTCCATTGCAATTGTCCCAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAAT
gi|31335                      : CAGCGTTTTAAGTACACTCCTCCATTTCAGCTGTCACAC-------TGTCCCCAGGTAGGGAATTC
gi|31336                      : CAGTATTTTAAGTCCACAAATCCATTTCAATTGTCACAC-------TGTCTTCAGGTAAG
gi|31337                      : CAGCATTTTAATTGCACCCATCCATTTCAATCGAAACAC-------TGCTCCCAGGTAATAAATTC
gi|31338                      : CAGTATTTTAAGTGCACCCATCTATTTCAATTGTTACACTGTGACATGTTCCCATGTTAGACATT
gi|31339                      : CAGTATTTTAAATGGACCAACTCCTTTCAATTGCCACAC-------TGTCCTTATGTAAGGAATTC
gi|31340                      : CAGTATTTTAAGTGTTCTCATCCATTTCAATTGTCA
gi|31341                      :   GTGTTTTAAGTGCACCAATCTATTTCAATTCTCATAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAATTC
gi|31342                      :      TTTTA--TGCACTCATCCATTTCAATTGTCACAC-------TGTTCCCAGGTTAGAAATTC
gi|31343                      :           AGTGCACCCACTCATTTCAATTGTCACAC-------TGTCCCAAGGTAAGAAAT
gi|31344                      :                        ATTTCAATTGTCACAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAATTC


blockSeqs                     :                                        TGTGACA
blockSeqs                     :                                        .      
blockSeqs                     :                                        .      
blockSeqs                     :                                        .      
blockSeqs                     :                                        .      
blockSeqs                     :                                        .      
blockSeqs                     :                                        .      
blockSeqs                     :                                        .      
blockSeqs                     :                                        .      
blockSeqs                     :                                        .      
blockSeqs                     :                                        .      
blockSeqs                     :                                        .      
blockSeqs                     :                                        .      
blockSeqs                     :                                        .      
blockSeqs                     :                                        .      


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : CAGTATTTTAAGTGCACCCATCCATTTCAATTGTCACAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAATTC
finalCons                     : CAGTATTTTAAGTGCACCCATCCATTTCAATTGTCACAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAATTC

lowQualScore                  :                                        8888888                    
lowQualScore                  :                                        .......                    
lowQualScore                  :                                        1111111                    
consensus                     : CAGTATTTTAAGTGCACCCATCCATTTCAATTGTCACAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAATTC
Reference ( family-879 )      : CAGTATTTTAAGTGCACCCATCCATTTCAATTGTCACAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAATTC
gi|31328                      : CAGTATTTTAAGTGCACCAATCCATTTCAATTGTCACAC-------CGTCCCTAGGTAAGAAATTC
gi|31329                      : CAATATTCTAACTGCACCCATCCATTTCAATTGTTACAC-------TGTCCCTAGGTAAGAAATTC
gi|31330                      : CAGTATTTAAAGTGCACTAATCCATTTCAGTTGTCACAC-------TGTCCCCATGTAAGAAATTC
gi|31331                      : CAGTATTTTAAGTGCTCCCATTTATTTCAATTGTCACAC-------TGT-CCCATGTAAGAAATTC
gi|31332                      : CAGTATTTTTAATGTACCCATCCATTTCAATTGT--CAC-------TGTCCCCAGGTAAAAAATTC
gi|31333                      : CAGTATTTTAAGTGCACTTATCAATTTCCAATGTCACAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAAGTC
gi|31334                      : CAGTACTTAAAGTGCACCCTTCCATTGCAATTGTCCCAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAAT
gi|31335                      : CAGCGTTTTAAGTACACTCCTCCATTTCAGCTGTCACAC-------TGTCCCCAGGTAGGGAATTC
gi|31336                      : CAGTATTTTAAGTCCACAAATCCATTTCAATTGTCACAC-------TGTCTTCAGGTAAG
gi|31337                      : CAGCATTTTAATTGCACCCATCCATTTCAATCGAAACAC-------TGCTCCCAGGTAATAAATTC
gi|31338                      : CAGTATTTTAAGTGCACCCATCTATTTCAATTGTTACACTGTGACATGTTCCCATGTTAGACATT
gi|31339                      : CAGTATTTTAAATGGACCAACTCCTTTCAATTGCCACAC-------TGTCCTTATGTAAGGAATTC
gi|31340                      : CAGTATTTTAAGTGTTCTCATCCATTTCAATTGTCA
gi|31341                      :   GTGTTTTAAGTGCACCAATCTATTTCAATTCTCATAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAATTC
gi|31342                      :      TTTTA--TGCACTCATCCATTTCAATTGTCACAC-------TGTTCCCAGGTTAGAAATTC
gi|31343                      :           AGTGCACCCACTCATTTCAATTGTCACAC-------TGTCCCAAGGTAAGAAAT
gi|31344                      :                        ATTTCAATTGTCACAC-------TGTCCCCAGGTAAGAAATTC