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blockSeqs                     :            . .   . .           .            A                 .  .           .    TT     .             .                           .         .   .   A   
blockSeqs                     :            . .   . .           .            A                 .  .           .    G      .             .                           .         .   .   .   
blockSeqs                     :            . .   . .           .            A                 .  .           .    T      .             .                           .         .   .   .   
blockSeqs                     :            . .   . .           .            T                 .  .           .    G      .             .                           .         .   .   .   
blockSeqs                     :            . .   . .           .            T                 .  .           .    A      .             .                           .         .   .   .   
blockSeqs                     :            . .   . .           .            T                 .  .           .    T      .             .                           .         .   .   .   
blockSeqs                     :            . .   . .           .            A                 .  .           .    G      .             .                           .         .   .   .   
blockSeqs                     :            . .   . .           .            C                 .  .           .    G      .             .                           .         .   .   .   
blockSeqs                     :            . .   . .           .            G                 .  .           .    T      .             .                           .         .   .   .   
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blockSeqs                     :            . .   . .           .            T                 .  .           .    T      .             .                           .         .   .   .   
blockSeqs                     :            . .   . .           .            A                 .  .           .    G      .             .                           .         .   .   .   
blockSeqs                     :                                                               .  .           .    G      .             .                           .         .   .   .   
blockSeqs                     :                                                                              .    T      .             .                           .         .   .   .   
blockSeqs                     :                                                                              .    G      .             .                           .         .   .   .   


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TAATTATGTAC-A-AAA-T---CATTCAGTT----TTATTATAANTTGATAATTTATTGCCT--A-TTTGACGAGAA---AAG--ATGT--CCGATTCCGGCA---------------ATGTATGTATCAT-CCTAATAAC-TGT--GT----TTGTTT
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lowQualScore                  :            . .   . ...         ....         .       .         .. .           ...  ...    ..            ...............             .         .   ..  .... .    
lowQualScore                  :            9 9   9 000         1111         8       1         77 7           111  333    22            777777777777777             4         4   22  4444 8    
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Reference ( family-878 )      : TAATTATGTAC-A-AAA-T---CATTCAGTT----TTATTATAANTTGATAATTTATTGCCT--A-TTTGACGAGAA---AAG--ATGT--CCGATTCCGGCA---------------ATGTATGTATCAT-CCTAATAAC-TGT--GT----TTGTTT
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gi|27978                      : TAATTATATAT-A-CAA-T---CATTCAGTT----TTATAATAAATTGATAAATTATTGACC--A-TTTGACGAGAA---AAG--ATGT--CCGATTACGGCA---------------ACGTATGAATCAT-CATAATAAC-TGC--GT----TAGCTT
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gi|27993                      :                                                                            AA---AAG--ACGG----GATTCCCGCA---------------ATGTATGTATCAT-CCTAGTAAC-TGT--CT----TTGCTT