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Reference ( gi|139068 )       :    CAACCTTAATATGCCAATTCCAGC-TCAGAAAATAGTTTTAAAAGTAACAGA---AATGAC--G--CCAACTGATAGCATTCGTGTA------------------------GTTCCGTGAAAGACATTCACACGCTCA-TA-----AACGTGTTGCTACATATATCGGAGAAAATGCCATACCAGTTGAGATAAATAAATA------TATTGTTAGTAA-AA--GGGATAACATT-T---AAATCAC-A-CACGAGGAGGCAAA---T---ACTATCCTCGCACAAGTGATCATAGCAGCACATAAACTAAACAGAGACAT------AACA-ACAATTT---C--AAATGATACTGATGT
gi|139054                     :    CAACCTTAATATGCCAATTCCAGC-TCAGAAAATAGTTTTAAAAGTAACAGA---AATGAC--G--CCAACTGATAGCATTCATGCA------------------------GTTCCGTGAAATACATACACACGCTCA-TA-----ACCTTGTTGTTACATATATTACAGAAAATGACATACCAGTTGAGATAGATAAATA------TATTGTTATTAA-AA--GGGATGACATT-G---AAATCAC-A-CACGAGGAGGCAGA---C---ACTATCATCGCACAAGTGATCATAGCAGCACA-AA--TAAACAGAGGCAT------AACA-GTAATTT---C--AAATGATACTGATGT
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Alignments
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Reference ( family-870 )      :                                                                                                                                                                                                                                              CAACCTTAATATGCCAATTCCAGC-TCAGAAAATAGTTTTAACAGTAACAGA---AATGAC--G--CCAACTGATAGCAATCATGTA------------------------GTTCCGTGAAAGACA--TACACACGCTCATA-----AACTTGTTGTTACATGTATCGGAGAAAATGACATACCAGTTGAGATAAATAAATA------TATTGTTATTAAAA--GGGATGACA----TTAAAATCAC-A-CACGAGGAGGCAGA---TAATATCCTCGCACAAGTGATCATAGCAGCACATAAACTAAACAGAGGCAT------AACA-GCAATTT---C--AAATGATACTGATGT
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Reference ( family-870 )      :                                                                                                                                                                                                                                              CAACCTTAATATGCCAATTCCAGC-TCAGAAAATAGTTTTAACAGTAACAGA---AATGAC--G--CCAACTGATAGCANTCATGTA------------------------GTTCCGTGAAAGACA--TACACACGCTCATA-----AACTTGTTGTTACATGTATCGGAGAAAATGACATACCAGTTGAGATAAATAAATA------TATTGTTATTAAAA--GGGATGACA----TTAAAATCAC-A-CACGAGGAGGCAGA---TAATATCCTCGCACAAGTGATCATAGCAGCACATAAACTAAACAGAGGCAT------AACA-GCAATTT---C--AAATGATACTGATGT
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gi|139061                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       actAT------AACA-GCAATTT---C--AAATGATACTGATATatttcaaatgatactgatat
gi|139062                     : actcaaccttactatgcaaagtcaagctcagaaagtaattttaatagtaacagaaatgacgccaacggatagcaatcatgtagttccgtgaaagacatacacacgttcatgaacttgctgttacatgtatcggtgaaaatgacataccagttgagataaatgaatatattgttattaaaaggggtgacattaaaatcacatcatgaggagacagataatatcttcgcacaagtgagtCAACCTTAGAAGGCTAATTCCAGT-TCAGAAAATAGTTTTAACAGTACCAAA---AAGGAAAAG--CCAACTGAAAGCAATCATGTA------------------------GCTC------------------A-----ATA-----AACTTGTTGTTACATGTACCAGTGAAAATGACATACCAGTTGAAATGAATAA-TA------TATTGTTATAAGAA--AGGGTGACA----TTAAAATCAC-A-CATGAGGATGCAGA---TAATATCCTCGCACAA-TGATCATAGCAGCACATAAACCAAACAGAGGCAT------AACAGGAAATTT---C--AAATGATACTGATGT
gi|139063                     :                                                                                                                                                                                                                                           actCAACCTTAATATGCCAATTCCAGC-TCAGAAAATTTTTTTAACAGTAACTGA---AATGAC--T--CCAACTGATAGCAATCAAGTA------------------------AATCCATGAAAGACA--TACACACGTTCATA-----A---TCTTGTTACATGT--C--------TGTCACATCAATGGAGATAAATAAATA------TATTGTTATTGAAA--TGGATGACA----TTAAAATTAC-A-CACGAGGAAACAGATCTTAATATCCT-GCACAAGTGATCATAGCAGCAAATGAACTTAACAGAGGTAT------AACA-GTAATTT---T--AATTGATACTGATGT
gi|139064                     :                                                                                                                                                                                                                                           actCAACCTTAATATGCCAATTCCACCATAAAAAAATAGTTTAAACAGTTACAGATAGAA-AAA--G--CAAACTGATAGCAATAATGTA------------------------GTTCCGTGAAAGTCA--TACACACGCTCATA-----AAC--G-TATTACATATGCCGGA-AGGACGACATACCCGTTGAGATAAATAAATA------TATTGTTATTAAAA--GGGATGACATTATTTAAAATCAT-A-CACGATGAGACAGA---TAATATCCTCGTACAAGTGATCGTAGCAGCTCATAAACTAAACAGAG---------------GCAATTT---C--AAATGATACTGATGT
gi|139065                     :                                                                                                                                                                                                                                           actCAAATTTAATATGCTTATTCTAGC-TCAGAAAATAATTTTAACAGTAACAGA---AGGGAAAAG--CCAACTGACAGCAAACATGTATGGAGAGCTAACAAAAGATGAAGTGTTCCGTGAAAAACA--TACACACGCTCATA-----AAC--GT-GTTACATGTACCAGGGAAAATGATATACTAGTTGATATAAATTAATA------TGTTGTTATTAAAA--GTGTTGACA----TTTAAACCAC-A-CGCGAGGAGGCAGA---TACTGTCCTTGCACGAGTGATCATAGCAGCACATAAACTAATCAGAGGCAT------AACA-GTAATTT---C--AAATGATACTAACGT
gi|139066                     :                                                                                                                                                                                                                                           actCAACCTTAATATATCAATTCCAGC-ACAGAAAATAGTTTTAGCAGTTACAGA---AA-AAA--G--CCAATTTATAGCAATCACGTA------------------------G-------AAAAGCA--TACACACGCTCATG-----AACGTGTTGTTACATGTACCGGAGAAGATGACATACCTGTTGAGATGAATACATACATGTATATTGTTATTAAAA--GGGATGACA----TTAAAATCCC-A-CACGAATAGGCAGA---TAATATCCTAGAACAAATTATCGTAGCAACATATAAACTTAACAGGG---------------GCAATTT---C--AAATGATATTGATGT
gi|139067                     :                                                                                                                                                                                                                                           actCAACCTTAATATGCCAATTCCAGC-CCAGAAAATAGTTTAAAAAGTAACAGA---AATGAC--G--CCAACTGATAGCATCCGTGTA------------------------GCTCCGTGAAAGACA--TACACACGCTCATA-----AACTTGTTATTACATATATCAGAGAAAATGA-----CAGTTGAGATAAATAAATA------TATTGTTATTAAAA--GGGGTGACA----TAAAAATCAC-A-CATGAAGAGGCAGA---AACTATCCTCACACAAGTAATAATAGCAGCACATAAACTAAACAGAGGTAT------AACA-GCAATTT---C--TAATGATACTGATGT
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      .                 C         .    T   .  .              A       .                                      .               .       T                                                   .                   .          .             . .              .                                                     .         .       .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      .                 A         .    T   .  .              T       .                                      .               .       C                                                   .                   .          .             . .              .                                                     .         .       .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      .                 C         .    T   .  .              A       .                                      .               .       T                                                   .                   .          .             . .              .                                                     .         .       .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      .                 T         .    T   .  .              A       .                                      .               .       T                                                   .                   .          .             . .              .                                                     .         .       .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      .                 C         .    G   .  .              A       .                                      .               .       T                                                   .                   .          .             . .              .                                                     .         .       .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      .                 C         .    T   .  .              A       .                                      .               .       G                                                   .                   .          .             . .              .                                                     .         .       .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      .                 C         .    G   .  .              A       .                                      .               .       T                                                   .                   .          .             . .              .                                                     .         .       .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      .                 C         .    T   .  .              A       .                                      .               .       G                                                   .                   .          .             . .              .                                                     .         .       .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      .                 C         .    T   .  .              A       .                                      .               .       T                                                   .                   .          .             . .              .                                                     .         .       .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      .                 A         .    A   .  .              T       .                                      .               .       A                                                   .                   .          .             . .              .                                                     .         .       .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      .                 A         .    .   .  .              T       .                                      .               .       .                                                   .                   .          .             . .              .                                                     .         .       .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      .                 C         .    .   .  .              A       .                                      .               .       .                                                   .                   .          .             . .              .                                                     .         .       .   . 
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Reference ( family-870 )      :                                                                                                                                                                                                                                              CAACCTTAATATGCCAATTCCAGC-TCAGAAAATAGTTTTAACAGTAACAGA---AATGAC--G--CCAACTGATAGCANTCATGTA------------------------GTTCCGTGAAAGACA--TACACACGCTCATA-----AACTTGTTGTTACATGTATCGGAGAAAATGACATACCAGTTGAGATAAATAAATA------TATTGTTATTAAAA--GGGATGACA----TTAAAATCAC-A-CACGAGGAGGCAGA---TAATATCCTCGCACAAGTGATCATAGCAGCACATAAACTAAACAGAGGCAT------AACA-GCAATTT---C--AAATGATACTGATGT
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gi|139061                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       actAT------AACA-GCAATTT---C--AAATGATACTGATATatttcaaatgatactgatat
gi|139062                     : actcaaccttactatgcaaagtcaagctcagaaagtaattttaatagtaacagaaatgacgccaacggatagcaatcatgtagttccgtgaaagacatacacacgttcatgaacttgctgttacatgtatcggtgaaaatgacataccagttgagataaatgaatatattgttattaaaaggggtgacattaaaatcacatcatgaggagacagataatatcttcgcacaagtgagtCAACCTTAGAAGGCTAATTCCAGT-TCAGAAAATAGTTTTAACAGTACCAAA---AAGGAAAAG--CCAACTGAAAGCAATCATGTA------------------------GCTC------------------A-----ATA-----AACTTGTTGTTACATGTACCAGTGAAAATGACATACCAGTTGAAATGAATAA-TA------TATTGTTATAAGAA--AGGGTGACA----TTAAAATCAC-A-CATGAGGATGCAGA---TAATATCCTCGCACAA-TGATCATAGCAGCACATAAACCAAACAGAGGCAT------AACAGGAAATTT---C--AAATGATACTGATGT
gi|139063                     :                                                                                                                                                                                                                                           actCAACCTTAATATGCCAATTCCAGC-TCAGAAAATTTTTTTAACAGTAACTGA---AATGAC--T--CCAACTGATAGCAATCAAGTA------------------------AATCCATGAAAGACA--TACACACGTTCATA-----A---TCTTGTTACATGT--C--------TGTCACATCAATGGAGATAAATAAATA------TATTGTTATTGAAA--TGGATGACA----TTAAAATTAC-A-CACGAGGAAACAGATCTTAATATCCT-GCACAAGTGATCATAGCAGCAAATGAACTTAACAGAGGTAT------AACA-GTAATTT---T--AATTGATACTGATGT
gi|139064                     :                                                                                                                                                                                                                                           actCAACCTTAATATGCCAATTCCACCATAAAAAAATAGTTTAAACAGTTACAGATAGAA-AAA--G--CAAACTGATAGCAATAATGTA------------------------GTTCCGTGAAAGTCA--TACACACGCTCATA-----AAC--G-TATTACATATGCCGGA-AGGACGACATACCCGTTGAGATAAATAAATA------TATTGTTATTAAAA--GGGATGACATTATTTAAAATCAT-A-CACGATGAGACAGA---TAATATCCTCGTACAAGTGATCGTAGCAGCTCATAAACTAAACAGAG---------------GCAATTT---C--AAATGATACTGATGT
gi|139065                     :                                                                                                                                                                                                                                           actCAAATTTAATATGCTTATTCTAGC-TCAGAAAATAATTTTAACAGTAACAGA---AGGGAAAAG--CCAACTGACAGCAAACATGTATGGAGAGCTAACAAAAGATGAAGTGTTCCGTGAAAAACA--TACACACGCTCATA-----AAC--GT-GTTACATGTACCAGGGAAAATGATATACTAGTTGATATAAATTAATA------TGTTGTTATTAAAA--GTGTTGACA----TTTAAACCAC-A-CGCGAGGAGGCAGA---TACTGTCCTTGCACGAGTGATCATAGCAGCACATAAACTAATCAGAGGCAT------AACA-GTAATTT---C--AAATGATACTAACGT
gi|139066                     :                                                                                                                                                                                                                                           actCAACCTTAATATATCAATTCCAGC-ACAGAAAATAGTTTTAGCAGTTACAGA---AA-AAA--G--CCAATTTATAGCAATCACGTA------------------------G-------AAAAGCA--TACACACGCTCATG-----AACGTGTTGTTACATGTACCGGAGAAGATGACATACCTGTTGAGATGAATACATACATGTATATTGTTATTAAAA--GGGATGACA----TTAAAATCCC-A-CACGAATAGGCAGA---TAATATCCTAGAACAAATTATCGTAGCAACATATAAACTTAACAGGG---------------GCAATTT---C--AAATGATATTGATGT
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gi|139068                     :                                                                                                                                                                                                                                             tCAACCTTAATATGCCAATTCCAGC-TCAGAAAATAGTTTTAAAAGTAACAGA---AATGAC--G--CCAACTGATAGCATTCGTGTA------------------------GTTCCGTGAAAGACA--TTCACACGCTCATA-----AACGTGTTGCTACATATATCGGAGAAAATGCCATACCAGTTGAGATAAATAAATA------TATTGTTAGTAAAA--GGGATAACA----TTTAAATCAC-A-CACGAGGAGGCAAA---TACTATCCTCGCACAAGTGATCATAGCAGCACATAAACTAAACAGAGACAT------AACA-ACAATTT---C--AAATGATACTGATGT
gi|139069                     :                                                                                                                                                                                                                                                ACCTTAATATGCCAATATCAGC-TTAGAAATT-GTTTTAACAGTAATAGA---AAAGAA--GAGCCAACTGATAGCAATCATGTA------------------------GTTCCGCAAAAGACA--TACACACGCTCATATCATAAACTTGTTGTTACATGTACCGGAGAAAATGACATACCA-TTGAGATAAATATATA------TAT----AGTAAGACTGGTATG-TA----TCAAAATCAT-A-CACGAGGAGACAGA---TAATATCCTCGCACAAATAATCATAGCAGCACATTAACTAAACAGAGGCAG------AACA-GCAATTT---C--AAATGATACTGATGT
gi|139070                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTAACAGACAACTAAGTATATTCATA-----TACATGTTGTT-C-TGTA---------ATGGC-CAATAGATGAGCTAAATAAATA------TATTGTTATTAAAA--GGGGTGACA----TTAAAATCAC-A-CACGAGGAGACAGA---TAATATCCTCGCACAAGTGATCATACCAGCACATAAACTAAACAGAGGTAT------AACA-GCAATTT---C--AATTGTTACTGATGT