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Reference ( family-862 )      : TAATAATGTTGTTAAAATACCNNCCCCTGACAGTGCTGTACAA-TCCC--ATAGCCGGAC-GTTCCGGACAAGTAG-AAA-A-T-----TG-TACAAGTCACTGGCCAAGTAGAAANTT-----GT-----A--------CAAGTCACCNTTTACAAAANT------TTAGTC-----TC------------TTT-----AAT-AA----C-TTTAATTGGTGCGCATACACAT--GGGGATTAATTAGCAC-TGACC---AGTTAATCACTANTCTGGATCAATTATCATNCAATTATCTCCAGGCGGTATTCAATGGGACGTCC--AAAAATACATAG------CTGTTTTGATGGCAGCATAACCAGTATAAGCTGGTTAGCCCCAT-------TAGCTCAG
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gi|148793                     : TAATAATGTTGTTAAAATACCTTCCTCTGACAGTGCTGTACAA-TCCT--ATAGCCAGAT-GTTCTGAACAAGTAGAAA-A-T-----TG-TACAAGTCACTGGCCAAGTAAAAACTT-----GT-----A--------CAAGTCACCATTTACAAA-GT------TTAATC-----TC------------TTC-----AAT-TA----C-TTTAATTGGTGCAAATACACAT--GGGGATTAATTACCAC-TGACC---AGTTAATCACTACTCTGGATCAACTATTATTCAATTATCTCCAGGAGGTATTCGATAAGATGTCC--AAAAATACATAG------CTGTTTCGATGGCAGCATAACCAGTATAAACTGGTTAGCCCCAT-------TAGCTCAG
gi|148794                     : TAATAAGGTTGTTAATATACCTTCCCCTGACAGTGCTGTACAA-TCCT--ATAGCCGGAT-GTTCTGAACAAGAAGAAA-A-T-----TG-TACAAGTCACTGGCCAAGTAGAAATTG-----GT-----A--------CAAGTCACCATTTACAAAAGT------TTAGTC-----TC------------TTT-----GAT-AA----C-TTTAATTGGTGCACAAACACAT--GGGGATTAATTACTAC-TGACC---AGTTAATCACTACTCTGGATCAATTATCATTCAATTATCTCTAAGCGGTATTCAATAAGATGTCCCTAAAA----ATAG------CTGTTTTTATGGTAGCATAACCAGTATAAGCTGGTTTGCCCAAT-------TAGCTCAG
gi|148795                     : TAATAATGTTGTTAAAATACCTTCCCCTGACAGTGCTGTACAA-TCCG--ATAGCCAGAT-GTTCTGAACAAGTAGAAA-AAT-----TG-TACAAGTCACTGGCCAAGTCGAAATTT-----GT-----A--------CAAGTCACCATTTACAAAAGT------TTAGTC-----TC------------TTT-----AAT-AA----C-TTTAATTGGTGCACATACACAT--GGGGATTAATTACCAC-CCACC---AGTTAATCACTACTCTGGATCAATTATCATTCAATTATCTCCAGGCAGTATTCAATAAGATGTCC--AAAAATACATAG------CTGTTTTGATGGCAGCATAACCAGTATA
gi|148796                     : TGATAATGTTGTTAAAATACCTTCCCCTG---------TGCAA-TCCT--ATAGCCAGAT-GTTCTGAACAAATAAAAACA-T-----TG-TACAAGTCACTGGCCAAGTAGAAATTT-----GT-----A--------CAAGTCACCATTTACAAAAGT------TTAGTC-----TC------------TTT-----AAT-TA----C-TTTAATTGGTGCACATACACAT--GGGGATTAATTACCAT-TGACC---AGTTAGTCACTACTCTGGAT-----------CAATTATCTCCAGGCGTTATTCAATAAGATGTCC--AAAAATACATAGCTGTAACTGTTTTGATGGCAGCATAACCAGTATAAGCTGGTTAGCCCCAT-------AAGCTCAG
gi|148797                     : TAATAATGTGATTAAAATACCAATCTCTGACAGTGCTGTACAG-TCCC--AAAGCCGGAC-GTTCTGGACAAGTAGAAA-A-T-----TG-TACAAGTCACTGGACAAGTAGAAAATT-----GT-----A--------CAAGTCACCCTTTACAAAAAT------TAGGTC-----TC------------TTT-----AAT-AA----C-TTTAATTGGTGCACATACACAT--GGGGATTAATTAGCAC-TGACC---AGTTAATCACTAGTCTGGATCAATTATCATTCAATTATCTCCAGTGGGTATTCAATGGGACGTGC--CAATATACGTAG------CTGTATTGATAGCAGC---------ATAAGCCGGTCAGCCCTAT-------TAACT
gi|148798                     : TAATAATGTGGTTAAA-TACCAACCCATGAAAATGCTCTACAA-TCCT--ATAGCTGGAT-GTTTTGAAAAAGTAGAAA-A-T-----TA-TACAAGTAACTGACCAAGTAGAAAGTT-----GT-----A--------CAAGTCATCCTTTATAAAAGT------TTAGTC-----TC------------TCT-----AAT-AA----C-TTTAGTTGGTGCACATATACAT--GGGGATTAATTAGCAC-TGACC---AATTAATCACTACCCTGGATCAATTATCATGCAATTATCTACAGGCGGTTTTCAATAAGATGTCC--AAAAATACATAG------TTGTTTTGATAGCAGC---------ATAAGCTGGTTAGCCCCATTACAATGTAGCTCAG
gi|148799                     : TAGTATTATGGTTAAAATACCAACCCCTGAC-----TGT--------------GCTGTACTGTTCCA------TAGC-----C-----TG----ATGTC-CTGGACAAGTAGAAAATC-----GT-----A--------CAAGTCACACTTTACAAAAGT------TTAGTC-----TT------------TTT-----AAT-AA----C-TTTAATTGGTACACATACACAT--GGGGATTGATTAGCAT-TTACA---AGTTAATCACTAGTCTGGTTCAATTATCATGCACTTATAACCAGGTGGTATTCATTGGGACATGC--CAATATACATAG------CTCTATTGATAGCAGC---------ATAAGCTGGTCAGTCCCAT-------TAGCTGAG
gi|148800                     :    TAATGTGTTTAAAATACCAACCCGTGACAGTGCTGTACAA-TCCA--ATAACC----------GGAC--------------------------GTT-CCGGACAAGTAGTAAATT-----GT-----A--------CAAGTCACCCTTTACTAAAGT------TTTGTC-----TC------------TGT-----AAT-AC----C-TTTAATCGGTGCAGACCCACAT--AGGGATTAGTT-GCAC-TGACC---GTTTAATCACTAGTCTGGATCAACTATCATGCAATTATCTCCAGGCGGTACTCAATGGGACGTGC--CAAAATACA
gi|148801                     :                         CCCT--CAGGGCTGTACAAATACC--ATAGCCAAAC-ATCCCGGACAAGTGGAAA-A-T-----GGCTACGGATAAGTGACCCTTTAAAATTTT-----TT-----AGTCCCGGGCAAGTGACATTTTTCAAAAAT------CAAGT---------------------------------A----CGTTTAATTGATGCGC-CGCACAT--GTGAATCGATTAGCCG-TGACC---AGTTTGCAACTAACAAAGGCCGATTAT-ATTTGATTATCTGCAGGGGGCAT
gi|148802                     :                               CAGGACTGTAAAA-TACC--ATAGCCCGAC-GTCCCTGACAAGTGGAAA-A-T-----GGCTACAGACAAGTGGCCCTTTAAAAAATT-----TT-----AGTCCCGGGCAAGTGACATTTTTCAAAAAT------TTAGTC-----CCGGACAAATGCCATTTTCGGAAATCAAGTATG-TTTTATTGATGCGC-CGCACAT--GTGAATCGATTAGCCT-TGACC---AGTT
gi|148803                     :                               CAG-GTTGTAAAAATCTC--ACAGCCCAAC-ATTCCAGACAAGTAGAAA-A-T-----TA-TGCAGGACAAAAGTTAAGT-----CCC-----GG-----G--------CAGAT-GCCATTTTCAGAATTCAGAAGTTGGTCAAATATT------------TTT-----ATT-AC----C-TTTAGTTGGCATGCCCACACAT--GGGGATTAA-TAGTAC-AGACCTCTAATGGATCAC
gi|148804                     :                               CAGGGCTGAACAAATACC--ATAGCCCGAC-GTCCCGGACAAGTGGAAA-A-TGGCTACG-GACAAGTGAC---CC---TTTAAATTTTTTTAGTCCCGGG--------CAAGTGACATTTTTCAAAAAT------TTAGTC-----CCGGATAAGTGCCATTTTCAGAAATCAAGTATG-TTTAATTGATGCAC-CGCACAT--GTGAATCGATTAG-ACATGACC---AGTT
gi|148805                     :                                        ATAA-TCTCTGATAGT---AC-ATTCTGCACAAGTAGAAA-A-T-----TG-TACAAGTCACTGGACAAGTAGAAACTT-----GT-----A--------CAA-TCACGCTTTACAAAAGT------TTAGTC-----TC------------TTT-----AAT-AA----C-TTTAATTGGTGCGTATACACATATGGGGATTATTTAGCAC-TGACC---AGATAATCATTAGTCTCGATCAATTATTATGCAATTACCTCCAGGCGGTATTCAATGGGACGTGC--CAATATACATGG------CTATTTTGATAGCAGCATAAC---------CTGGTCAGCCCCAT-------TATCTCAG
gi|148806                     :                                                                                                              TAGACAATT-----GT-----A--------CAAGTCACCCTTTACAAAA-T------TTAGTC-----TC------------TTT-----AAT-AA----C-TTTAATTGGTGCACATACACAT--GGGGATTACTTATCAC-TGACC---ATTTAATCACTACTCTGTATCGATTATCATGCAATTATCTCCAGATGGTATTCAATAAGATGTCC--AAAAATACATAG------CTGTTTTGTTAGCAGCATA--------AGGC-GGTTACTCCCAT-------TAGCTCAG
gi|148807                     :                                                                                                                                                      TTTACAAAATT------TTAGTC-----TC------------TTA-----AAT-AA----C-TTTAATTGGTGCACATACACAT--GGGGATTGATTAGCAC-TGACC---AATTAATCACTAGTCTGGATCAATTATCATGCACTTATGTCCAGGCGGTATTCAAGGGGAAATGC--CACTATACATAG------CTCACTTGATAGCAGC---------ATAAGCTGGTCAGTCCCAT-------TAGCTGAG
gi|148808                     :                                                                                                                                                                                                                  a-TTTAATTGATGCGC-TACACAT--GTGAATCGATTAGCTG-TGACC---AGTTTGCAACTAACAAAGGCCAATAATC-TTTGATTATCTGCAGGGGGCATGCCATGGCATGT


blockSeqs                     :          T           TT          T         A   CTG      A   T      A           C A GGCTA  C                        C  TTTTA  CCCGG GTCCCGGG         A         G CAGAAG      AAATA  GGACAAATGCCA   TCGGA   C  GTAT G            A A       AT                A     TCT            C                 T                             T    CTA           CTGTAA                ATAACCAGT                   TACAATG
blockSeqs                     :          T           TT          T         A   T        G   .      A           . . .      C                        T  .      .     GTCCCGGG         A         G .           .      GGATAAGTGCCA   TCAGA   C  GTAT .            A A       .                 .     .              C                 T                             T    A             .                     ATAACCAGT                   .      
blockSeqs                     :          T           TT          T         A   T        A   .      A           . . .      .                        T  .      .     .                A         G .           .      .              .       .  .    .            A A       .                 .     .              C                 T                             T    A             .                     ATAACCAGT                   .      
blockSeqs                     :          T           TT          T         .   G        A   .      A           . . .      .                        T  .      .     .                A         G .           .      .              .       .  .    .            A A       .                 .     .              C                 T                             T    A             .                     ATAACCAGT                   .      
blockSeqs                     :          G           AA          T         .   T        G   .      G           . . .      .                        A  .      .     .                C         A .           .      .              .       .  .    .            A A       .                 .     .              G                 G                             C    C             .                     ATAAC                       .      
blockSeqs                     :          G           AA          T         .   C        G   .      A           . . .      .                        G  .      .     .                C         G .           .      .              .       .  .    .            A A       .                 .     .              C                 G                             T    A             .                     ATA                         .      
blockSeqs                     :          G           AA          G         .   T        G   .      G           . . .      .                        A  .      .     .                C         G .           .      .              .       .  .    .            A A       .                 .     .              G                 G                             C    C             .                     .                           .      
blockSeqs                     :          G           AA          G         .   A        A   .      G           . . .      .                        A  .      .     .                C         G .           .      .              .       .  .    .            A A       .                 .     .              G                 T                             C    C             .                     .                           .      
blockSeqs                     :                                  G         .   C        C   .      G           . . .      .                        T  .      .     .                T         A .           .      .              .       .  .    .            G C       .                 .     .              A                 G                             C    C             .                     .                           .      
blockSeqs                     :                                  .         .   C        C   .      G           . . .      .                        A  .      .     .                T         A .           .      .              .       .  .    .            G A       .                 .     .              G                 G                             T    A             .                     .                                  
blockSeqs                     :                                  .         .   C        C   .      G           . . .      .                        C  .      .     .                A         T .           .      .              .       .  .    .            G A       .                 .     .              C                 G                             A    C                                                                      
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Reference ( family-862 )      : TAATAATGTTGTTAAAATACCNNCCCCTGACAGTGCTGTACAA-TCCC--ATAGCCGGAC-GTTCCGGACAAGTAGAAA-A-T-----TG-TACAAGTCACTGGCCAAGTAGAAANTT-----GT-----A--------CAAGTCACCNTTTACAAAAGT------TTAGTC-----TC------------TTT-----AAT-AA----C-TTTAATTGGTGCGCATACACAT--GGGGATTAATTAGCAC-TGACC---AGTTAATCACTANTCTGGATCAATTATCATNCAATTATCTCCAGGCGGTATTCAATGGGACGTCC--AAAAATACATAG------CTGTTTTGATGGCAGCATAAC----ATAAGCTGGTTAGCCCCAT-------TAGCTCAG
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gi|148799                     : TAGTATTATGGTTAAAATACCAACCCCTGAC-----TGT--------------GCTGTACTGTTCCA------TAGC-----C-----TG----ATGTC-CTGGACAAGTAGAAAATC-----GT-----A--------CAAGTCACACTTTACAAAAGT------TTAGTC-----TT------------TTT-----AAT-AA----C-TTTAATTGGTACACATACACAT--GGGGATTGATTAGCAT-TTACA---AGTTAATCACTAGTCTGGTTCAATTATCATGCACTTATAACCAGGTGGTATTCATTGGGACATGC--CAATATACATAG------CTCTATTGATAGCAG-----C----ATAAGCTGGTCAGTCCCAT-------TAGCTGAG
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gi|148802                     :                               CAGGACTGTAAAA-TACC--ATAGCCCGAC-GTCCCTGACAAGTGGAAA-A-T-----GGCTACAGACAAGTGGCCCTTTAAAAAATT-----TT-----AGTCCCGGGCAAGTGACATTTTTCAAAAAT------TTAGTC-----CCGGACAAATGCCATTTTCGGAAATCAAGTATG-TTTTATTGATGCGC-CGCACAT--GTGAATCGATTAGCCT-TGACC---AGTT
gi|148803                     :                               CAG-GTTGTAAAAATCTC--ACAGCCCAAC-ATTCCAGACAAGTAGAAA-A-T-----TA-TGCAGGACAAAAGTTAAGT-----CCC-----GG-----G--------CAGAT-GCCATTTTCAGAATTCAGAAGTTGGTCAAATATT------------TTT-----ATT-AC----C-TTTAGTTGGCATGCCCACACAT--GGGGATTAA-TAGTAC-AGACCTCTAATGGATCAC
gi|148804                     :                               CAGGGCTGAACAAATACC--ATAGCCCGAC-GTCCCGGACAAGTGGAAA-A-TGGCTACG-GACAAGTGAC---CC---TTTAAATTTTTTTAGTCCCGGG--------CAAGTGACATTTTTCAAAAAT------TTAGTC-----CCGGATAAGTGCCATTTTCAGAAATCAAGTATG-TTTAATTGATGCAC-CGCACAT--GTGAATCGATTAG-ACATGACC---AGTT
gi|148805                     :                                        ATAA-TCTCTGATAGT---AC-ATTCTGCACAAGTAGAAA-A-T-----TG-TACAAGTCACTGGACAAGTAGAAACTT-----GT-----A--------CAA-TCACGCTTTACAAAAGT------TTAGTC-----TC------------TTT-----AAT-AA----C-TTTAATTGGTGCGTATACACATATGGGGATTATTTAGCAC-TGACC---AGATAATCATTAGTCTCGATCAATTATTATGCAATTACCTCCAGGCGGTATTCAATGGGACGTGC--CAATATACATGG------CTATTTTGATAGCAGCATAAC---------CTGGTCAGCCCCAT-------TATCTCAG
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