lowQualScore : 11 1 1 11 333333333333333333333333 1 1
lowQualScore : 44 2 33 888888 6 5 8 2 5 444 6 444 3 11 444444444444444444444444 3 555 55 4 7 8 7
lowQualScore : .. . .. ...... . . . . . ... . ... . .. ........................ . ... .. . . . .
lowQualScore : 22 9 99 222222 0 4 9 7 8 777 3 777 7 77 777777777777777777777777 3 888 11 6 0 2 0
consensus : TGTATTT-ATCGACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAATGCATTTTCCAACACAGAAGTATGCNTGTTCA-GTACTGTGTTTG---CTTTAACATACAATCAGT---GCTGAANNGGAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-ATT---T-GCTGGAAATCATCCATCCTGTAAAACCGCACCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
Reference ( gi|138107 ) : TGTATTA-ATCAACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAAT-CATTTTCAAACACAGAAGTATGCATGTTCA-GTACTGTGCTTG---CTTAAACATACAATCAGT---GCTGAAGAGGAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-ATT---T-ACTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACCGTACCAGTGGTCAAGGGGTAGAG
gi|138106 : TGTATTT-ATCAACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAAT-CATTTTCAAATACAGAAGTATGCATGTTCA-GTACTGTGCTTG---CTTTAACATACAATCAGT---GCTGAAGAGGAGTTAGT-----------TA--A--G-----T-ATT---T-ATTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACCGCATCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
gi|138108 : TGTATTT-ATCAAGTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAAT-CATTTTCAAACACAGAAGTATGCATGTTCA-GTACTGTGCTTG---GTTTAACATACAATCAGT---GCTGAAGAGGAGCTAGT-----------TT--A--G-----T-ATT---T-ACTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACAGCACCAGTGGTCTAGGGGCAGAG
gi|138109 : TGTATTT-ATCAAGTGTAT-TACA--ATACAGCAAGTA------ACAATCTAAAAT-CATTTTCAAACACAGAAGTATGCATGTTCA-GTACTGTGCTTA---ATTTAAAATACAATCAGT---GCTGAAGAAGAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-ATT---T-ACTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACCGCAC
gi|138110 : TGTCTTT-ATTGGCTATTT-TGCA--ATATAGCAAGTACATGTAACCAACTAAAATGCAGTTTCCAACACAGAAATATGC-TGTTCA-GTATTGTGTTTG---CTTTAATATATAATCAGT---GCTGTACTAGAGCCAGTGAAGGGTATCATA--A--G-----TCATT---TTGTTGAAAATCATCCATCCTG-AAAACTGggtgtagag
gi|138111 : TGCATGC-ATCACCTGTAT-TGCA--ATATAGCAGGTA------ACCAACTTAAATGCATTTACCAACACAGAAGAAAGCCTATCCA-GTACTGCA-TTG---ATTTAACATA-AATCAGTACAGCT--AGTGGAG--AGT---------------A--T-----T-ATT---T-GCTAACAAACATCCATCCCGc
gi|138112 : GTATTATATAGTCTGTAT-TGTA--TTACAGCAAGTT------TCCAACTAAAATGCATCTTCAAACACAGAAGGTTGT-TTTTTATGTACTATGTTTG---CTTGAACATACAATCAGT---GCTGTATTGGAGCTACT-----------AA--AGGG-----T-A-T---T-GCTGAAAATCATCAATCCTG-AAAACTG
gi|138113 : TTA-ATCAACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGCA------ACCAACTAAA-T-CATTTTCAAACACAGAAGTATGCATGTTCA-GTACTGTGCTTG---GTTTAATATACAATCAGT---GCTGAAGAGAAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-ATT---T-ACTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACCGCACCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
gi|138114 : TTT-ATCAACTGTAT-TACA--ATACGGTAAGTA------ACCGACTAAAAT-CATTTTCAAACACAAAAGTATGCATGTTCA-GTACTGTGCTTG---CTTTAATATACAATCAGT---GCTGATGAAGAGCTAGT-----------TA--G--G-----T-ATT---T-CCTGGAAATCCTATATCCTGAAAAACCAAACCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
gi|138116 : -ATCAGCCGTAT-TGTA--ATACAACAAGTT------ATAAACTAAA-------------CACAGAAGTATGTTTGCTCA-GTACTGT--TTG---CTTTAACATACAATCAGT---GCTGTACCAGAGGTAGT-----------AAACA--GTAT--T-ATT---T-GCTGAAAATCACCCTTCCTGCAAA
gi|138117 : t-ATCGACTGTAT-TGCA--ATA---------------A--AACTAAATG-TATTTTCCAACACATCAGTACGCATTTTCA-TTACTGTGTTTG---CTTTAATATACAATCAGC---GCTGTACTAGAGCTGGT-----------AA--A--GGGTATT-ATT---T-GCTTAAAATCATCTATCCTG-AAAACTG
gi|138115 : tCAA-TGCAT-TGCA--ATACAACAAGTA------ACCAACTAAAATGCATTTTCCAACACAGAAGTATGCCTGTTCA-GTACTGTGTTGG---CGTTAACATACAATCAGT---GCT------GTGTTAGT-----------GA--ATGG-----T-ATTATGT-GCTGAAAATCATCCATCCCG-AAAACTG
gi|138119 : ttaCTGTAT-TGCA--ATACAGCACATA------ACCAATTAAAATGCATTTT---ACACTGAAGTATGCCTGTTCA-GTACCGTGTTTG---CTTTA----ACAATCAGT---GCTG
gi|138120 : CTTTATCTGCAGTATACAGAACATA------ACCAACTAAAATACAATTTCCAACACAGAAGTATGCCTGTATA-GTACTGTGTTGG---CTTTAACATACACTCAGT---GCTAAACTAGAGCTAG
gi|138118 : CTGTAT-GACA--ATATAGCAACAA------ACCAACTTAAAT-GCTTTTCCAATACAGAACTA------TTCA-TTGGTGTGTTTG---TATTAACATATAATCAGT---GCTGTACTGTAGCTAGT-----------AA--A--G-----
gi|138121 : tattgg-CATTTTCCTACACAGAAGTATGCCTGTCCA-GTACTGTG-TTGCCTCTTTAACATACAAGCA
gi|138122 : AACATACACTCAAT---GCTGAACTAGAGCTAGTG----------TA--G--GGTAT-T-ATT---T-GCTGGAAATCATCCATCCTG-AAAAC
Alignments
lowQualScore : 1 222222222222222222222222 1
lowQualScore : 3 0 2 33 777777 0 2 4 4 4 444 444 2 33 555555555555555555555555 3 3 3 555 2 4
lowQualScore : . . . .. ...... . . . . . ... ... . .. ........................ . . . ... . .
lowQualScore : 3 7 7 77 777777 8 7 1 3 2 444 444 9 99 666666666666666666666666 1 1 1 444 1 8
consensus : TGTATT-TATCGACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAATGCATTTTCNAACACAGAAGTATGCNTGTTCAGTACTGTGCTTG---CTTTAACATACAATCAGT---GCTGAANNGGAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TGCTGGAAATCNTCCATCCTGTAAAACCGCACCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
Reference ( family-858 ) : TGTATT-TATCGACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAATGCATTTTCCAACACAGAAGTATGCNTGTTCAGTACTGTGTTTG---CTTTAACATACAATCAGT---GCTGAANNGGAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TGCTGGAAATCATCCATCCTGTAAAACCGCACCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
gi|138106 : TGTATT-TATCAACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAAT-CATTTTCAAATACAGAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTG---CTTTAACATACAATCAGT---GCTGAAGAGGAGTTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TATTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACCGCATCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
gi|138107 : TGTATT-AATCAACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAAT-CATTTTCAAACACAGAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTG---CTTAAACATACAATCAGT---GCTGAAGAGGAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TACTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACCGTACCAGTGGTCAAGGGGTAGAG
gi|138108 : TGTATT-TATCAAGTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAAT-CATTTTCAAACACAGAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTG---GTTTAACATACAATCAGT---GCTGAAGAGGAGCTAGT-----------TT--A--G-----T-A-T-T---TACTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACAGCACCAGTGGTCTAGGGGCAGAG
gi|138109 : TGTATT-TATCAAGTGTAT-TACA--ATACAGCAAGTA------ACAATCTAAAAT-CATTTTCAAACACAGAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTA---ATTTAAAATACAATCAGT---GCTGAAGAAGAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TACTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACCGCAC----GGTGTAGAG
gi|138110 : TGTCTT-TATTGGCTATTT-TGCA--ATATAGCAAGTACATGTAACCAACTAAAATGCAGTTTCCAACACAGAAATATGC-TGTTCAGTATTGTGTTTG---CTTTAATATATAATCAGT---GCTGTACTAGAGCCAGTGAAGGGTATCATA--A--G-----TCATT-T---TGTTGAAAATCATCCATCCTG-AAAACTGC
gi|138111 : TGCATG-CATCACCTGTAT-TGCA--ATATAGCAGGTA------ACCAACTTAAATGCATTTACCAACACAGAAGAAAGCCTATCCAGTACTGCA-TTG---ATTTAACATA-AATCAGTACAGCT--AGTGGAG--AGT---------------A--T-----T-A-T-T---TGCTAACAAACATCCATCCCG
gi|138112 : GTATTATATAGTCTGTAT-TGTA--TTACAGCAAGTT------TCCAACTAAAATGCATCTTCAAACACAGAAGGTTGTTTTTTATGTACTATGTTTG---CTTGAACATACAATCAGT---GCTGTATTGGAGCTACT-----------AA--A--G-----G-G-TAT---TGCTGAAAATCATCAATCCTG-AAAACTG
gi|138113 : TT-AATCAACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGCA------ACCAACTAAA-T-CATTTTCAAACACAGAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTG---GTTTAATATACAATCAGT---GCTGAAGAGAAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TACTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACCGCACCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
gi|138114 : TT-TATCAACTGTAT-TACA--ATACGGTAAGTA------ACCGACTAAAAT-CATTTTCAAACACAAAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTG---CTTTAATATACAATCAGT---GCTGATGAAGAGCTAGT-----------TA--G--G-----T-A-T-T---TCCTGGAAATCCTATATCCTGAAAAACCAAACCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
gi|138115 : TGCAT-TGCA--ATACAACAAGTA------ACCAACTAAAATGCATTTTCCAACACAGAAGTATGCCTGTTCAGTACTGTGTTGG---CGTTAACATACAATCAGT---GCT------GTGTTAGT-----------GA--ATGG-----T-A-T-TATGTGCTGAAAATCATCCATCCCG-AAAACTG
gi|138116 : ttacaa-TATCAGCCGTAT-TGTA--ATACAACAAGTT------ATAAACTAAA-------------CACAGAAGTATGTTTGCTCAGTACTGT--TTG---CTTTAACATACAATCAGT---GCTGTACCAGAGGTAGT-----------AAACA--GTAT--T-A-T-T---TGCTGAAAATCACCCTTCCTGCAAA
gi|138117 : -TATCGACTGTAT-TGCA--ATA---------------A--AACTAAA-TGTATTTTCCAACACATCAGTACGCATTTTCATTACTGTGTTTG---CTTTAATATACAATCAGC---GCTGTACTAGAGCTGGT-----------AA--A--GGGTATT-A-T-T---TGCTTAAAATCATCTATCCTG-AAAACTG
gi|138118 : -TATTGGCTGTAT-GACA--ATATAGCAACAA------ACCAACTTAAATGC-TTTTCCAATACAGAACTAT------TCATTGGTGTGTTTG---TATTAACATATAATCAGT---GCTGTACTGTAGCTAGT-----------AA--A--G-----
gi|138119 : CTGTAT-TGCA--ATACAGCACATA------ACCAATTAAAATGCATTTT---ACACTGAAGTATGCCTGTTCAGTACCGTGTTTG---CTTTA----ACAATCAGT---GCTG
gi|138120 : CTTTATCTGCAGTATACAGAACATA------ACCAACTAAAATACAATTTCCAACACAGAAGTATGCCTGTATAGTACTGTGTTGG---CTTTAACATACACTCAGT---GCTAAACTAGAGCTAG
gi|138121 : CATTTTCCTACACAGAAGTATGCCTGTCCAGTACTGTG-TTGCCTCTTTAACATACAAGCA
gi|138122 : TAACATACACTCAAT---GCTGAACTAGAGCTAGTG----------TA--G--GGTAT-T-A-T-T---TGCTGGAAATCATCCATCCTG-AAAAC
Alignments
lowQualScore : 1 222222222222222222222222 1
lowQualScore : 3 0 2 33 777777 0 2 2 4 4 444 444 2 33 555555555555555555555555 3 3 3 555 1 4
lowQualScore : . . . .. ...... . . . . . ... ... . .. ........................ . . . ... . .
lowQualScore : 3 7 7 77 777777 8 7 8 3 8 444 444 9 99 666666666666666666666666 1 1 1 444 0 8
consensus : TGTATT-TATCGACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAATGCATTTTCNAACACAGAAGTATGCNTGTTCAGTACTGTGCTTG---CTTTAACATACAATCAGT---GCTGAANNGGAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TGCTGGAAATCNTCCATCCTGTAAAACCGCACCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
Reference ( family-858 ) : TGTATT-TATCGACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAATGCATTTTCNAACACAGAAGTATGCNTGTTCAGTACTGTGCTTG---CTTTAACATACAATCAGT---GCTGAANNGGAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TGCTGGAAATCNTCCATCCTGTAAAACCGCACCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
gi|138106 : TGTATT-TATCAACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAAT-CATTTTCAAATACAGAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTG---CTTTAACATACAATCAGT---GCTGAAGAGGAGTTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TATTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACCGCATCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
gi|138107 : TGTATT-AATCAACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAAT-CATTTTCAAACACAGAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTG---CTTAAACATACAATCAGT---GCTGAAGAGGAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TACTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACCGTACCAGTGGTCAAGGGGTAGAG
gi|138108 : TGTATT-TATCAAGTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAAT-CATTTTCAAACACAGAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTG---GTTTAACATACAATCAGT---GCTGAAGAGGAGCTAGT-----------TT--A--G-----T-A-T-T---TACTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACAGCACCAGTGGTCTAGGGGCAGAG
gi|138109 : TGTATT-TATCAAGTGTAT-TACA--ATACAGCAAGTA------ACAATCTAAAAT-CATTTTCAAACACAGAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTA---ATTTAAAATACAATCAGT---GCTGAAGAAGAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TACTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACCGCAC----GGTGTAGAG
gi|138110 : TGTCTT-TATTGGCTATTT-TGCA--ATATAGCAAGTACATGTAACCAACTAAAATGCAGTTTCCAACACAGAAATATGC-TGTTCAGTATTGTGTTTG---CTTTAATATATAATCAGT---GCTGTACTAGAGCCAGTGAAGGGTATCATA--A--G-----TCATT-T---TGTTGAAAATCATCCATCCTG-AAAACTGC
gi|138111 : TGCATG-CATCACCTGTAT-TGCA--ATATAGCAGGTA------ACCAACTTAAATGCATTTACCAACACAGAAGAAAGCCTATCCAGTACTGCA-TTG---ATTTAACATA-AATCAGTACAGCT--AGTGGAG--AGT---------------A--T-----T-A-T-T---TGCTAACAAACATCCATCCCG
gi|138112 : GTATTATATAGTCTGTAT-TGTA--TTACAGCAAGTT------TCCAACTAAAATGCATCTTCAAACACAGAAGGTTGTTTTTTATGTACTATGTTTG---CTTGAACATACAATCAGT---GCTGTATTGGAGCTACT-----------AA--A--G-----G-G-TAT---TGCTGAAAATCATCAATCCTG-AAAACTG
gi|138113 : TT-AATCAACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGCA------ACCAACTAAA-T-CATTTTCAAACACAGAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTG---GTTTAATATACAATCAGT---GCTGAAGAGAAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TACTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACCGCACCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
gi|138114 : TT-TATCAACTGTAT-TACA--ATACGGTAAGTA------ACCGACTAAAAT-CATTTTCAAACACAAAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTG---CTTTAATATACAATCAGT---GCTGATGAAGAGCTAGT-----------TA--G--G-----T-A-T-T---TCCTGGAAATCCTATATCCTGAAAAACCAAACCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
gi|138115 : TGCAT-TGCA--ATACAACAAGTA------ACCAACTAAAATGCATTTTCCAACACAGAAGTATGCCTGTTCAGTACTGTGTTGG---CGTTAACATACAATCAGT---GCT------GTGTTAGT-----------GA--ATGG-----T-A-T-TATGTGCTGAAAATCATCCATCCCG-AAAACTG
gi|138116 : ttacaa-TATCAGCCGTAT-TGTA--ATACAACAAGTT------ATAAACTAAA-------------CACAGAAGTATGTTTGCTCAGTACTGT--TTG---CTTTAACATACAATCAGT---GCTGTACCAGAGGTAGT-----------AAACA--GTAT--T-A-T-T---TGCTGAAAATCACCCTTCCTGCAAA
gi|138117 : -TATCGACTGTAT-TGCA--ATA---------------A--AACTAAA-TGTATTTTCCAACACATCAGTACGCATTTTCATTACTGTGTTTG---CTTTAATATACAATCAGC---GCTGTACTAGAGCTGGT-----------AA--A--GGGTATT-A-T-T---TGCTTAAAATCATCTATCCTG-AAAACTG
gi|138118 : -TATTGGCTGTAT-GACA--ATATAGCAACAA------ACCAACTTAAATGC-TTTTCCAATACAGAACTAT------TCATTGGTGTGTTTG---TATTAACATATAATCAGT---GCTGTACTGTAGCTAGT-----------AA--A--G-----
gi|138119 : CTGTAT-TGCA--ATACAGCACATA------ACCAATTAAAATGCATTTT---ACACTGAAGTATGCCTGTTCAGTACCGTGTTTG---CTTTA----ACAATCAGT---GCTG
gi|138120 : CTTTATCTGCAGTATACAGAACATA------ACCAACTAAAATACAATTTCCAACACAGAAGTATGCCTGTATAGTACTGTGTTGG---CTTTAACATACACTCAGT---GCTAAACTAGAGCTAG
gi|138121 : CATTTTCCTACACAGAAGTATGCCTGTCCAGTACTGTG-TTGCCTCTTTAACATACAAGCA
gi|138122 : TAACATACACTCAAT---GCTGAACTAGAGCTAGTG----------TA--G--GGTAT-T-A-T-T---TGCTGGAAATCATCCATCCTG-AAAAC
blockSeqs : A C GT CATGTA G A A C CCT ACA A GA GAAGGGTATCATAAG C T A ATG C T
blockSeqs : . . . . G A A C . . A GA AAACAGTAT . . . . C T
blockSeqs : . . . . G A A C . . A GA AAAGGGTAT . . . . C T
blockSeqs : . . . . G C C T . . T CT GTAGGGTAT . . . . A T
blockSeqs : . . . . G C T T . . T GT GAATGG . . . . A A
blockSeqs : . . . . G A A C . . A TT TAAG . . . . A C
blockSeqs : . . . . G A A C . . A GA TTAG . . . . C .
blockSeqs : . . . . A A C T . . T GA TAAG . . . . C .
blockSeqs : . . . . . C T T . . T CC AAAG . . . . A .
blockSeqs : . . . . . C A T . . T CT TAAG . . . . A .
blockSeqs : . . . . . C C T . . A CT TAGG . . . . A .
blockSeqs : . . . . C C T . . A CT AAAG . . . . A
blockSeqs : . . . . C C . . . . CT AT
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TGTATT-TATCGACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAATGCATTTTCNAACACAGAAGTATGCNTGTTCAGTACTGTGCTTG---CTTTAACATACAATCAGT---GCTGAANNGGAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TGCTGGAAATCNTCCATCCTGTAAAACCGCACCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
finalCons : TGTATT-TATCGACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAATGCATTTTCNAACACAGAAGTATGCNTGTTCAGTACTGTGCTTG---CTTTAACATACAATCAGT---GCTGAANNGGAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TGCTGGAAATCNTCCATCCTGTAAAACCGCACCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
Alignments
lowQualScore : 1 222222222222222222222222 1
lowQualScore : 3 0 2 33 777777 0 2 2 4 4 444 444 2 33 555555555555555555555555 3 3 3 555 1 4
lowQualScore : . . . .. ...... . . . . . ... ... . .. ........................ . . . ... . .
lowQualScore : 3 7 7 77 777777 8 7 8 3 8 444 444 9 99 666666666666666666666666 1 1 1 444 0 8
consensus : TGTATT-TATCGACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAATGCATTTTCNAACACAGAAGTATGCNTGTTCAGTACTGTGCTTG---CTTTAACATACAATCAGT---GCTGAANNGGAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TGCTGGAAATCNTCCATCCTGTAAAACCGCACCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
Reference ( family-858 ) : TGTATT-TATCGACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAATGCATTTTCNAACACAGAAGTATGCNTGTTCAGTACTGTGCTTG---CTTTAACATACAATCAGT---GCTGAANNGGAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TGCTGGAAATCNTCCATCCTGTAAAACCGCACCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
gi|138106 : TGTATT-TATCAACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAAT-CATTTTCAAATACAGAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTG---CTTTAACATACAATCAGT---GCTGAAGAGGAGTTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TATTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACCGCATCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
gi|138107 : TGTATT-AATCAACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAAT-CATTTTCAAACACAGAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTG---CTTAAACATACAATCAGT---GCTGAAGAGGAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TACTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACCGTACCAGTGGTCAAGGGGTAGAG
gi|138108 : TGTATT-TATCAAGTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGTA------ACCAACTAAAAT-CATTTTCAAACACAGAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTG---GTTTAACATACAATCAGT---GCTGAAGAGGAGCTAGT-----------TT--A--G-----T-A-T-T---TACTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACAGCACCAGTGGTCTAGGGGCAGAG
gi|138109 : TGTATT-TATCAAGTGTAT-TACA--ATACAGCAAGTA------ACAATCTAAAAT-CATTTTCAAACACAGAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTA---ATTTAAAATACAATCAGT---GCTGAAGAAGAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TACTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACCGCAC----GGTGTAGAG
gi|138110 : TGTCTT-TATTGGCTATTT-TGCA--ATATAGCAAGTACATGTAACCAACTAAAATGCAGTTTCCAACACAGAAATATGC-TGTTCAGTATTGTGTTTG---CTTTAATATATAATCAGT---GCTGTACTAGAGCCAGTGAAGGGTATCATA--A--G-----TCATT-T---TGTTGAAAATCATCCATCCTG-AAAACTGC
gi|138111 : TGCATG-CATCACCTGTAT-TGCA--ATATAGCAGGTA------ACCAACTTAAATGCATTTACCAACACAGAAGAAAGCCTATCCAGTACTGCA-TTG---ATTTAACATA-AATCAGTACAGCT--AGTGGAG--AGT---------------A--T-----T-A-T-T---TGCTAACAAACATCCATCCCG
gi|138112 : GTATTATATAGTCTGTAT-TGTA--TTACAGCAAGTT------TCCAACTAAAATGCATCTTCAAACACAGAAGGTTGTTTTTTATGTACTATGTTTG---CTTGAACATACAATCAGT---GCTGTATTGGAGCTACT-----------AA--A--G-----G-G-TAT---TGCTGAAAATCATCAATCCTG-AAAACTG
gi|138113 : TT-AATCAACTGTAT-TGCA--ATACAGCAAGCA------ACCAACTAAA-T-CATTTTCAAACACAGAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTG---GTTTAATATACAATCAGT---GCTGAAGAGAAGCTAGT-----------TA--A--G-----T-A-T-T---TACTGGAAATCCTCCATCCTGTAAAACCGCACCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
gi|138114 : TT-TATCAACTGTAT-TACA--ATACGGTAAGTA------ACCGACTAAAAT-CATTTTCAAACACAAAAGTATGCATGTTCAGTACTGTGCTTG---CTTTAATATACAATCAGT---GCTGATGAAGAGCTAGT-----------TA--G--G-----T-A-T-T---TCCTGGAAATCCTATATCCTGAAAAACCAAACCAGTGGTCTAGGGGTAGAG
gi|138115 : TGCAT-TGCA--ATACAACAAGTA------ACCAACTAAAATGCATTTTCCAACACAGAAGTATGCCTGTTCAGTACTGTGTTGG---CGTTAACATACAATCAGT---GCT------GTGTTAGT-----------GA--ATGG-----T-A-T-TATGTGCTGAAAATCATCCATCCCG-AAAACTG
gi|138116 : ttacaa-TATCAGCCGTAT-TGTA--ATACAACAAGTT------ATAAACTAAA-------------CACAGAAGTATGTTTGCTCAGTACTGT--TTG---CTTTAACATACAATCAGT---GCTGTACCAGAGGTAGT-----------AAACA--GTAT--T-A-T-T---TGCTGAAAATCACCCTTCCTGCAAA
gi|138117 : -TATCGACTGTAT-TGCA--ATA---------------A--AACTAAA-TGTATTTTCCAACACATCAGTACGCATTTTCATTACTGTGTTTG---CTTTAATATACAATCAGC---GCTGTACTAGAGCTGGT-----------AA--A--GGGTATT-A-T-T---TGCTTAAAATCATCTATCCTG-AAAACTG
gi|138118 : -TATTGGCTGTAT-GACA--ATATAGCAACAA------ACCAACTTAAATGC-TTTTCCAATACAGAACTAT------TCATTGGTGTGTTTG---TATTAACATATAATCAGT---GCTGTACTGTAGCTAGT-----------AA--A--G-----
gi|138119 : CTGTAT-TGCA--ATACAGCACATA------ACCAATTAAAATGCATTTT---ACACTGAAGTATGCCTGTTCAGTACCGTGTTTG---CTTTA----ACAATCAGT---GCTG
gi|138120 : CTTTATCTGCAGTATACAGAACATA------ACCAACTAAAATACAATTTCCAACACAGAAGTATGCCTGTATAGTACTGTGTTGG---CTTTAACATACACTCAGT---GCTAAACTAGAGCTAG
gi|138121 : CATTTTCCTACACAGAAGTATGCCTGTCCAGTACTGTG-TTGCCTCTTTAACATACAAGCA
gi|138122 : TAACATACACTCAAT---GCTGAACTAGAGCTAGTG----------TA--G--GGTAT-T-A-T-T---TGCTGGAAATCATCCATCCTG-AAAAC