lowQualScore : 222
lowQualScore : 5 2 0 2 2 666 2 5 2 2 0
lowQualScore : . . . . . ... . . . . .
lowQualScore : 0 5 6 2 5 999 5 0 5 5 4
consensus : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCC-ATTANG-TC--C-C-T-TGGTAA-GTTGATACATGCATGATA
Reference ( gi|23728 ) : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCC-ATTATG-T---C-C-T-TGGTAA-GTTGATACATGCATGATA
gi|23723 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAA-CCA-ATTATG-TC--C-C-T-TGGTAA-GTTGATACATGCATGATA
gi|23729 : ACCTGTCTCCGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCC-ATTATG-TC--C-C-T-TGGCAA-GTTTATACATGCATTATA
gi|23733 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCATT-TTTAACCCC---TATG-TGTCC-C-T-TGGTAA-GTTGATACATGCATGATA
gi|23735 : ACCTGTCTCCGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCT-AATGTG-T---C-CTT-TGGTAA-GTTGATACATGCATAGTA
gi|23734 : ACCTGTCTCTGGTAGTAAACGCCAAT-TTTAACCAC-AATATG-T---C-C-CACGGTAA-GTTGATACATGCATGATA
gi|23730 : ACCTGTCTCTGGTCGTTAACGCAAAT-TTTGACTCC-ATTAAG-TC--C-C-T-TGGTAA-GTTGATACATGCATGGTA
gi|23736 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TCTAACCAC-ATTATG-TC--C-C-T-TGATAA-TATGACACATGCATGAT
gi|23732 : ACCTGTCTCCGGTAGTTAACGTCAAC-TTTAACCCC-ATTATG-T---CTC-T-TGATAA-TGTAACACATGCATGATA
gi|23724 : ACCTGTCT--GGTAAT-AACGCCACT-TTTAACCAC-AATATG-TC--C-C-T-TGGTAA-GTTGATACATGCATGATA
gi|23726 : ACCTGTTT--GATAGTTAACACCAAT-TTTGACCCC-ATTAAG-TC--C-C-T-TGGTAA-GTTGATACATTCATGGTA
gi|23725 : ACCTGTCTCTAGTAGTTTACGCCAAT-TTTTACCAC-ATTATA-TC--C-C-T-TGATAA-TGTGATACATGCATGCTA
gi|23737 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAA--TTTAACCCC-ATTAGGCC---C-C-T-TGATAA-TGTGATACATGAAT
gi|23727 : ACCTGTCTCTTGAAGTTAACGACACT-TATAACCCC-ATTAAG-T---C-C-A-TGGGGATGTTGATACATGCATGGTA
gi|23731 : ACCTGTCTTTGGTAGTTAACGCCAATATAAAATCCC-AATAAG-TC--C-C-T-TGGTAA-GATGATACA
gi|23739 : ACCTGTCTCTTGAAGTTAACGACACT-TATAACCCCAATTAAG-T---C-CAT-AGGGAT-GTTGATACATGCATGGT
gi|23738 : ACCCGTCTCTGGTAGTTAACACCAATATAAAACCCC-AATAAG-TC--C-C-T-TGATAA-GATTATACA
Alignments
lowQualScore : 2 2 22 1
lowQualScore : . . .. .
lowQualScore : 4 4 55 0
consensus : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAA-CCCCA-TTATGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
Reference ( family-853 ) : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAA-CCCCA-TTANGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23723 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAA--CCAA-TTATGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23724 : ACCTGTCT--GGTAAT-AACGCCACT-TTTAA-CCACA-ATATGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23725 : ACCTGTCTCTAGTAGTTTACGCCAAT-TTTTA-CCACA-TTATATCCCTTGATAATGTGATACATGCATGCTA
gi|23726 : ACCTGTTT--GATAGTTAACACCAAT-TTTGA-CCCCA-TTAAGTCCCTTGGTAAGTTGATACATTCATGGTA
gi|23727 : ACCTGTCTCTTGAAGTTAACGACACT-TATAA-CCCCA-TTAAGTCCATGGGGATGTTGATACATGCATGGTA
gi|23728 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAA-CCCCA-TTATGT-CCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23729 : ACCTGTCTCCGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAA-CCCCA-TTATGTCCCTTGGCAAGTTTATACATGCATTATA
gi|23730 : ACCTGTCTCTGGTCGTTAACGCAAAT-TTTGA-CTCCA-TTAAGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGGTA
gi|23731 : ACCTGTCTTTGGTAGTTAACGCCAAT-ATAAAATCCCA-ATAAGTCCCTTGGTAAGATGATACA
gi|23732 : ACCTGTCTCCGGTAGTTAACGTCAAC-TTTAA-CCCCA-TTATGTCTCTTGATAATGTAACACATGCATGATA
gi|23733 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCATT-TTTAA-CCCCT-ATGTGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23734 : ACCTGTCTCTGGTAGTAAACGCCAAT-TTTAA-CCACA-ATATGTCCCACGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23735 : ACCTGTCTCCGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAA-CCCTA-ATGTGTCCTTTGGTAAGTTGATACATGCATAGTA
gi|23736 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TCTAA-CCACA-TTATGTCCCTTGATAATATGACACATGCATGAT
gi|23737 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAA--TTTAA-CCCCA-TTAGGCCCCTTGATAATGTGATACATGAAT
gi|23738 : ACCCGTCTCTGGTAGTTAACACCAATATAAAA-CCCCA-ATAAGTCCCTTGATAAGATTATACA
gi|23739 : ACCTGTCTCTTGAAGTTAACGACACT-TATAA-CCCCAATTAAGTCCATAGGGATGTTGATACATGCATGGT
Alignments
lowQualScore : 4 2 0 1
lowQualScore : . . . .
lowQualScore : 7 4 2 6
consensus : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCC-ATTATGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
Reference ( family-853 ) : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCC-ATTATGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23723 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCA--ATTATGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23724 : ACCTGTCT--GGTAAT-AACGCCACT-TTTAACCAC-AATATGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23725 : ACCTGTCTCTAGTAGTTTACGCCAAT-TTTTACCAC-ATTATATCCCTTGATAATGTGATACATGCATGCTA
gi|23726 : ACCTGTTT--GATAGTTAACACCAAT-TTTGACCCC-ATTAAGTCCCTTGGTAAGTTGATACATTCATGGTA
gi|23727 : ACCTGTCTCTTGAAGTTAACGACACT-TATAACCCC-ATTAAGTCCATGGGGATGTTGATACATGCATGGTA
gi|23728 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCC-ATTATGT-CCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23729 : ACCTGTCTCCGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCC-ATTATGTCCCTTGGCAAGTTTATACATGCATTATA
gi|23730 : ACCTGTCTCTGGTCGTTAACGCAAAT-TTTGACTCC-ATTAAGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGGTA
gi|23731 : ACCTGTCTTTGGTAGTTAACGCCAATATAAAATCCC-AATAAGTCCCTTGGTAAGATGATACA
gi|23732 : ACCTGTCTCCGGTAGTTAACGTCAAC-TTTAACCCC-ATTATGTCTCTTGATAATGTAACACATGCATGATA
gi|23733 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCATT-TTTAACCCC-TATGTGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23734 : ACCTGTCTCTGGTAGTAAACGCCAAT-TTTAACCAC-AATATGTCCCACGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23735 : ACCTGTCTCCGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCT-AATGTGTCCTTTGGTAAGTTGATACATGCATAGTA
gi|23736 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TCTAACCAC-ATTATGTCCCTTGATAATATGACACATGCATGAT
gi|23737 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAA--TTTAACCCC-ATTAGGCCCCTTGATAATGTGATACATGAAT
gi|23738 : ACCCGTCTCTGGTAGTTAACACCAATATAAAACCCC-AATAAGTCCCTTGATAAGATTATACA
gi|23739 : ACCTGTCTCTTGAAGTTAACGACACT-TATAACCCCAATTAAGTCCATAGGGATGTTGATACATGCATGGT
Alignments
lowQualScore : 4 2 0 1
lowQualScore : . . . .
lowQualScore : 7 4 2 6
consensus : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCC-ATTATGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
Reference ( family-853 ) : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCC-ATTATGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23723 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCA--ATTATGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23724 : ACCTGTCT--GGTAAT-AACGCCACT-TTTAACCAC-AATATGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23725 : ACCTGTCTCTAGTAGTTTACGCCAAT-TTTTACCAC-ATTATATCCCTTGATAATGTGATACATGCATGCTA
gi|23726 : ACCTGTTT--GATAGTTAACACCAAT-TTTGACCCC-ATTAAGTCCCTTGGTAAGTTGATACATTCATGGTA
gi|23727 : ACCTGTCTCTTGAAGTTAACGACACT-TATAACCCC-ATTAAGTCCATGGGGATGTTGATACATGCATGGTA
gi|23728 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCC-ATTATGT-CCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23729 : ACCTGTCTCCGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCC-ATTATGTCCCTTGGCAAGTTTATACATGCATTATA
gi|23730 : ACCTGTCTCTGGTCGTTAACGCAAAT-TTTGACTCC-ATTAAGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGGTA
gi|23731 : ACCTGTCTTTGGTAGTTAACGCCAATATAAAATCCC-AATAAGTCCCTTGGTAAGATGATACA
gi|23732 : ACCTGTCTCCGGTAGTTAACGTCAAC-TTTAACCCC-ATTATGTCTCTTGATAATGTAACACATGCATGATA
gi|23733 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCATT-TTTAACCCC-TATGTGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23734 : ACCTGTCTCTGGTAGTAAACGCCAAT-TTTAACCAC-AATATGTCCCACGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23735 : ACCTGTCTCCGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCT-AATGTGTCCTTTGGTAAGTTGATACATGCATAGTA
gi|23736 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TCTAACCAC-ATTATGTCCCTTGATAATATGACACATGCATGAT
gi|23737 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAA--TTTAACCCC-ATTAGGCCCCTTGATAATGTGATACATGAAT
gi|23738 : ACCCGTCTCTGGTAGTTAACACCAATATAAAACCCC-AATAAGTCCCTTGATAAGATTATACA
gi|23739 : ACCTGTCTCTTGAAGTTAACGACACT-TATAACCCCAATTAAGTCCATAGGGATGTTGATACATGCATGGT
blockSeqs : A A T
blockSeqs : A . T
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . T
blockSeqs : . . T
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . T
blockSeqs : . . T
blockSeqs : . . T
blockSeqs : . . T
blockSeqs : . . T
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqCons :
originalCons : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCC-ATTATGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
finalCons : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCC-ATTATGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
Alignments
lowQualScore : 4 2 0 1
lowQualScore : . . . .
lowQualScore : 7 4 2 6
consensus : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCC-ATTATGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
Reference ( family-853 ) : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCC-ATTATGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23723 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCA--ATTATGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23724 : ACCTGTCT--GGTAAT-AACGCCACT-TTTAACCAC-AATATGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23725 : ACCTGTCTCTAGTAGTTTACGCCAAT-TTTTACCAC-ATTATATCCCTTGATAATGTGATACATGCATGCTA
gi|23726 : ACCTGTTT--GATAGTTAACACCAAT-TTTGACCCC-ATTAAGTCCCTTGGTAAGTTGATACATTCATGGTA
gi|23727 : ACCTGTCTCTTGAAGTTAACGACACT-TATAACCCC-ATTAAGTCCATGGGGATGTTGATACATGCATGGTA
gi|23728 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCC-ATTATGT-CCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23729 : ACCTGTCTCCGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCC-ATTATGTCCCTTGGCAAGTTTATACATGCATTATA
gi|23730 : ACCTGTCTCTGGTCGTTAACGCAAAT-TTTGACTCC-ATTAAGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGGTA
gi|23731 : ACCTGTCTTTGGTAGTTAACGCCAATATAAAATCCC-AATAAGTCCCTTGGTAAGATGATACA
gi|23732 : ACCTGTCTCCGGTAGTTAACGTCAAC-TTTAACCCC-ATTATGTCTCTTGATAATGTAACACATGCATGATA
gi|23733 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCATT-TTTAACCCC-TATGTGTCCCTTGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23734 : ACCTGTCTCTGGTAGTAAACGCCAAT-TTTAACCAC-AATATGTCCCACGGTAAGTTGATACATGCATGATA
gi|23735 : ACCTGTCTCCGGTAGTTAACGCCAAT-TTTAACCCT-AATGTGTCCTTTGGTAAGTTGATACATGCATAGTA
gi|23736 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAAT-TCTAACCAC-ATTATGTCCCTTGATAATATGACACATGCATGAT
gi|23737 : ACCTGTCTCTGGTAGTTAACGCCAA--TTTAACCCC-ATTAGGCCCCTTGATAATGTGATACATGAAT
gi|23738 : ACCCGTCTCTGGTAGTTAACACCAATATAAAACCCC-AATAAGTCCCTTGATAAGATTATACA
gi|23739 : ACCTGTCTCTTGAAGTTAACGACACT-TATAACCCCAATTAAGTCCATAGGGATGTTGATACATGCATGGT