lowQualScore : 222222 11 222222 111 444444444444444 2222222 1111 33333333 1111 22 222 222222222222222222222 111111 22 2 1
lowQualScore : 8 6 33 2 7 8 5 77 66 777 0 444444 9999 3 333 2 77 444444 4 2 777 88 333333333333333 66 5 2 66 3333333 0 7777 4 11111111 5 5555 00 2 55 666 888 999999999999999999999 444444 9999 77 0 1 888 9 1 0 5 0
lowQualScore : . . .. . . . . .. .. ... . ...... .... . ... . .. ...... . . ... .. ............... .. . . .. ....... . .... . ........ . .... .. . .. ... ... ..................... ...... .... .. . . ... . . . . .
lowQualScore : 0 1 77 7 1 5 8 66 99 888 1 000000 8888 2 222 5 44 111111 8 6 555 66 111111111111111 99 0 9 88 5555555 8 0000 7 66666666 0 0000 66 5 11 222 888 999999999999999999999 444444 5555 55 0 2 888 4 9 8 0 8
consensus : CCCTATT-TCTCATG--G-GGTTCCNCAAGGTTCNATNCT-GGG--TC---CATTA--C---TTTTN---ATTTTAT-ATATTAATGAT-----CTNCCATTGTNTGTAAAN-AAC----GT---AA----AACTGACNTGTATGCAGATGACNCNACGTTCTA-----CGACTTCAGGACAAACTGTTGGAGA-AATTCAGCAGAGATTTTANAAGCTGACTTGCAAACT---TC---TA------TA--------AA------TAA---GTGGTGCATTCAAGATGGTATGATGT---ATATNAATACAGAA-AAAACTAAGT
Reference ( gi|24345 ) : CCCTATT-TCTCATG--G-AGTTCCCCAAGGTTCAATACT-GGG--TC---CATTA--C---TTTTC---ATTTTAT-ATATTAATGAC-----CTCCCATTACATGTAAAA-AAC---AGT---GA----AACTGATATGTATGCAGATGACTCCACATTCCA-----C-ACTTCAGGAAAAACTGTTGGAGA-AATTCAGCAGAGA--TTACAAGCCGACTT---AACT---TC---TA------TA--------AA------TAA---ATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGT---ATATTAATACAGAA-AAAACTAAGT
gi|24346 : CCCTATT-TCTCATG--G-AGTTCCCTAAGGTTCCATACT-GGG--TC---CATTA--C---TTTTC---ATTTTAT-ATATTAATGAT-----CTCCCATTACATGTAAAA-AAC---AGT---GA----AACTGATATGTATGCAGATGACTCCACATTCCA-----C-ACTTCAGGAAAAACTGTTTGAAA-AATTTAGCAGAGA--TTACAAGCCGACAT---AACT---TC---TA------TA--------AA------TAA---ATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGT---ATATTAATACAGAA-AAAAATAAGT
gi|24347 : CCCTATT-TCTCATG--GGAGTTCCCCAAGGTTCCATACT-GGG--TC---TATTA--C---TTTTC---ATTTTAT-ATATTAATGAT-----CTCCCATTACATGTAAAAAAAC---AGT---GA----AACTGATATGTATGCAGATGACTCCACATTCCA-----C-ACTTCAGGAAAATCTGTTGGAGA-AATTCAGCAGAGA--TTACAAGCTGACTT---AACT---TC---TA------TA--------AA------ACA---ATAGTG--TACAAGA-AATATGATGT---ATATTAATACAGAA-AAAACTAAAT
gi|24348 : CCCTATT-TCTCATG--G-AGTGCCCCAAGGTTCCATACT-AGG--TC---TATTA--C---TTTTA---ATTTTAT-ATACTAATGAT-----CTCCCATTACATGTAAAA-AAC---AGT---GC----AACTGATATGTATGCAGATGACTCCACATTCAA-----C-ACTTCCGGAAAAACTGTTGGAGA-AATTCAGCAGAGA--TTAAAAGCTGACTT---AACT---TC---TA------TA--------AA------TAA---ATGTTG--TTCAAGA-AATATGATGT---ATATTAATACAGAA-AATACTAAGT
gi|24349 : CCCTGTT-TCCTCTG--G-AGTTCCAAAAGGGTCTGTATT-CGT--TC---CTCTC--CTCTTTCTC---A-TTTAT-ATA--AACGAT-----CTTCCAGAGCATGT---C-AAC---TGT---AA----ATCTCGTCTCTTTGCAGATGACACTGCAATCTACCTATC-ACTCCAG
gi|24350 : CTACTGTCTCATGTGG-GGTCCCTCGAGGTTCTACACT-AGG--TCACCTACTA--T---TTTTG---ATTT----ATGTCAATGATATGT-CTGTCGTT----GTAAAA-A-------T----A----AACTT-TA-ATATGCTGATGATTC
gi|24351 : TCA-G--G-GGTTCCACAGGGTTCTATTTT-AGG--TC---CATTG--TTA-TTTTT---ACTTTTT-ATA--AATGAT-----TTACCATTGTTTATAAAT-AAC----GTTTCAAC---AACTGACTTATATGCAAATGACACAACGTTATA-----TGACAT----ACAAAC--------A-AAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGCAAACT---TC---CAT-----TAATCGTCTTAA------TAT---GTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GT---AT-TGAATACTGAC-AAAACAAA
gi|24352 : TCA-G--G-GGTTCCACAGGGTTCTATTTT-AGG--TC---CATTG--TTA-TTTTT---A-CTTATCATA--AATGAT-----TTACCATTGTTTATAAAT-AAC----GTTTCAAC---AACAAACTTATATGCAGATGA---CACA----A-----C-GTTATATGACATAC----AGACA-AAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGCAAACT---TC---AA------TA--------AATCGTCTTAATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GT---AT-TGAATACTGAC-AAAACAAA
gi|24353 : TCA-G--G-GGTTCCACAGGGTTCTATTTT-AGG--TC---CATTG--TTA-TTTTT---ACTTTTC-ATA--AATAAT-----TTACCATTGTTTATGAAT-AAC---ATTTC-AAC---AACTGACTTATATGCAGATGACACAACGTTATA-----TGACAT----ACAAACGAATACAGATATTTTA--AAAGG--TAACTTGCTAACTT---AAATTAATCG--TC------TT--------AA------TAT---GTGGTGCATTCAAAATGGTATGGTATTGAATACTA--ACAAAACAAAAGTAA
gi|24354 : TCA-G--G-GGTTCCACAGGGTTCTATTTTAGGG--TCAT-TGTTA--T---TTTTA---CTTTTAT-A----AATGAT-----TTACCATTGTTTACAAAT-AAC----GTTTCAAC---AACTGACTTATATGCAGATGACACAACGTTATA-----TGACAT----ACAAAC--------A-AAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGCAAACT---TCAATTAATCGTCTT--------AA------TAT---GTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GT---AT-TGAATACTGAC-AAAACAAA
gi|24355 : TG--G-AGTTCCTCAAGGTTCTGTACT-GGG--CC---CATTATTC---TTTTT---AATTTAT-AT--TAATGA
gi|24357 : TG--G-AGTTCCGCAAGGATCAACGCTCGGGCCTC---TTTTA--T---TTTTA---ATC---T-ACATTAATGACATTGTCTCCCA--------AATA-AAC---TGT---CA----AATTAAATTGTTTGCAGATGAt
gi|24356 : TG--G-AGTTCCGCAAGGATCAACGCTCGGGCCTC---TTTTA--T---TTTTA---ATC---T-ACATTAATGACATTGTCTCCCA--------AATA-AAC---TGT---CA----AATTAAATTGTTTGCAGATGA
gi|24358 : TG--G-GGTACCTCAAGGATCTGTCCT-TTG--GC---CATTG--T---TATTT---ATTATGT-TTGTAAATGAT-----TTGCCACTTTATGTCAAT-AAC---GCT---AA----CACTGATAAATTTGCAGATG
gi|24359 : G--G-AGTTCCCCAAGGTTTAATTCT-GGG--TC---CTTTATTC---TTTTT---AATTTAC-ATA--AATGA
gi|24360 : G--G-GGTTCCACAGGGTTCAAGTTT-AGG--TC---CATTG--TTA-TTTTA---ACTTTTC-ATA--AATGAT-----TTACCATTGTTTATAAAT-TAC----GT---TACAACAACTGACTTAAATGCAGATGACACAACGTTt
gi|24361 : GTTCCGCAAGGTTCAATTCT-AGG--TT---CTCTA--C---TTTTCTTGATT---T-ATGTTAGTGAT-----TTTCCAATAGTTGTTGAT-GATTCAAGT---G-------TTGACATGTACACTGACGATTC
gi|24362 : -AGTTCAGAAGAGA--TTACAAGCTCACTT---GACT---TC---TA------TA--------AA------TAA---ATGGTG--TTCAAGA-AAAATGATGT---ATATCAATACAGAA-AAAAATAAGT
Alignments
lowQualScore : 11111 11 3333333333333 1 2222 33333333 111 11 222 222222222222222222222222222222222222 11 1 11 1
lowQualScore : 6 5 33 2 1 1 1 7 66 444 33 44444 33 444 1 33 44 2 55 2 2 444 5 2 1 2222222222222 2 55 1 1 1 5 4 6666 2 99999999 777 1 44 1 1 666 777 888888888888888888888888888888888888 55 5 44 2 1 2 1 2
lowQualScore : . . .. . . . . . .. ... .. ..... .. ... . .. .. . .. . . ... . . . ............. . .. . . . . . .... . ........ ... . .. . . ... ... .................................... .. . .. . . . . .
lowQualScore : 7 0 44 4 0 0 0 1 55 111 22 66666 22 111 0 22 66 4 33 5 9 777 3 7 0 1111111111111 7 00 0 0 1 0 0 0000 5 66666666 333 1 44 0 1 111 888 666666666666666666666666666666666666 77 7 44 8 0 6 7 6
consensus : CCCTATT-TCTCATG--GG-GTTCCNCAAGGTTCNATNCT-GGG--T---C--CATTA--C--T--T---TTNAT--TTTAT-ATATTAATGATCTNCCATTGT--NT-GT-AAATAA--C-G-T---AA-A-ACTGACNTGTATGCAGATGACNCNACGTTCTACGACNTCAGGANAAACTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGATTTTAAAAGCTGACTTGC-AACTT---CTA------TA--------AA------T------AA---GTGGTGCATTCAAGATGGTATGATGTATATNAATACNGAAAAAACNAAGT
Reference ( family-847 ) : CCCTATT-TCTCATG--GG-GTTCCNCAAGGTTCNATNCT-GGG--T---C--CATTA--C--T--T---TTNAT--TTTAT-ATATTAATGATCTNCCATTGT--NT-GT-AAANAA--C-G-T---AA-A-ACTGACNTGTATGCAGATGACNCNACGTTCTACGACTTCAGGACAAACTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGATTTTANAAGCTGACTTGCAAACTT---CTA------TA--------AA------T------AA---GTGGTGCATTCAAGATGGTATGATGTATATNAATACAGAAAAAACTAAGT
gi|24345 : CCCTATT-TCTCATG--GA-GTTCCCCAAGGTTCAATACT-GGG--T---C--CATTA--C--T--T---TTCAT--TTTAT-ATATTAATGACCTCCCATTAC--AT-GT-AAAAAA--CAG-T---GA-A-ACTGATATGTATGCAGATGACTCCACATTCCAC-ACTTCAGGAAAAACTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGA--TTACAAGCCGACTT---AACTT---CTA------TA--------AA------T------AA---ATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAACTAAGT
gi|24346 : CCCTATT-TCTCATG--GA-GTTCCCTAAGGTTCCATACT-GGG--T---C--CATTA--C--T--T---TTCAT--TTTAT-ATATTAATGATCTCCCATTAC--AT-GT-AAAAAA--CAG-T---GA-A-ACTGATATGTATGCAGATGACTCCACATTCCAC-ACTTCAGGAAAAACTGTTTGAAAAATTTAGCAGAGA--TTACAAGCCGACAT---AACTT---CTA------TA--------AA------T------AA---ATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAAATAAGT
gi|24347 : CCCTATT-TCTCATG--GGAGTTCCCCAAGGTTCCATACT-GGG--T---C--TATTA--C--T--T---TTCAT--TTTAT-ATATTAATGATCTCCCATTAC--AT-GTAAAAAAA--CAG-T---GA-A-ACTGATATGTATGCAGATGACTCCACATTCCAC-ACTTCAGGAAAATCTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGA--TTACAAGCTGACTT---AACTT---CTA------TA--------AA------A------CA---ATAGTGTA--CAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAACTAAAT
gi|24348 : CCCTATT-TCTCATG--GA-GTGCCCCAAGGTTCCATACT-AGG--T---C--TATTA--C--T--T---TTAAT--TTTAT-ATACTAATGATCTCCCATTAC--AT-GT-AAAAAA--CAG-T---GC-A-ACTGATATGTATGCAGATGACTCCACATTCAAC-ACTTCCGGAAAAACTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGA--TTAAAAGCTGACTT---AACTT---CTA------TA--------AA------T------AA---ATGTTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAATACTAAGT
gi|24349 : CCCTGTT-TCCTCTG--GA-GTTCCAAAAGGGTCTGTATT-CGT--T---C--CTCTC--C--T--C---TTTCTCATTTAT-ATA--AACGATCTTCCAGAGC--AT-GT----CAA--CTG-T---AA-A-TCTCGTCTCTTTGCAGATGACACTGCAATCTAC
gi|24350 : CTACTGTCTCATGTGGG-GTCCCTCGAGGTTCTACACT-AGG--TCACC--TACTA--T--T--T---TTGAT--T---T-ATGTCAATGATATGTC--TGTCGTT-GT-AAAAA-------T---AA-A-CTTTA---ATATGCTGATGATTCctatcactccag
gi|24351 : TCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTATTTT-AGG--T---C--CATTG--TTAT--T---TTTAC--TTTTT-ATA--AATGATTTACCATTGT--TT-AT-AAATAA--C-G-TTTCAACA-ACTGACTTATATGCAAATGACACAACGTTATATGACAT----ACAAAC--------AAAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGCAAACTT---CCAT-----TAATCGTCTTAA------T------AT---GTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAA
gi|24352 : TCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTATTTT-AGG--T---C--CATTG--T--TATT---TTTAC--TT-ATCATA--AATGATTTACCATTGT--TT-AT-AAATAA--C-G-TTTCAACA-ACAAACTTATATGCAGATGACACAACGTTATATGACAT----ACAGAC--------AAAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGCAAACTT---CAA------TA--------AATCGTCTT------AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAA
gi|24353 : TCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTATTTT-AGG--T---C--CATTG--TTAT--T---TTTAC--TTTTC-ATA--AATAATTTACCATTGT--TT-AT-GAATAA--C-A-TTTCAACA-ACTGACTTATATGCAGATGACACAACGTTATATGACAT----ACAAAC--------GAAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGCTAACTTAAATTAATCGTCTT--------AA------T------AT---GTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTAACAAAACAAA
gi|24354 : TCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTATTTTAGGG--T---CATTGTTA--T--T--T---TTACT--TTTAT-A----AATGATTTACCATTGT--TT-AC-AAATAA--C-G-TTTCAACA-ACTGACTTATATGCAGATGACACAACGTTATATGACAT----ACAAAC--------AAAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGCAAACTT---CAA------TT--------AA------TCGTCTTAATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAagtaa
gi|24355 : TG--GA-GTTCCTCAAGGTTCTGTACT-GGG--C---C--CATTATTC--T--T---TTTAA--TTTAT-AT--TAATGAT
gi|24356 : TG--GA-GTTCCGCAAGGATCAACGCTCGGGCCT---C--TTTTA--T--T--T---TTAAT--CT----ACATTAATGA-----CATTGT--CTCCC-AAATAAACT-G-T---CA-A-ATTAAATTGTTTGCAGATGA
gi|24357 : TG--GA-GTTCCGCAAGGATCAACGCTCGGGCCT---C--TTTTA--T--T--T---TTAAT--CT----ACATTAATGA-----CATTGT--CTCCC-AAATAAACT-G-T---CA-A-ATTAAATTGTTTGCAGATGA
gi|24358 : TG--GG-GTACCTCAAGGATCTGTCCT-TTG--G---C--CATTG--T--T--A---TTTAT--TATGT-TTGTAAATGATTTGCCACTTT--AT-GT-CAATAA--C-GCT---AA-C-ACTGATAAATTTGCAGATG
gi|24359 : G--GA-GTTCCCCAAGGTTTAATTCT-GGG--T---C--CTTTATTC--T--T---TTTAA--TTTAC-ATA--AATGAT
gi|24360 : G--GG-GTTCCACAGGGTTCAAGTTT-AGG--T---C--CATTG--TTAT--T---TTAAC--TTTTC-ATA--AATGATTTACCATTGT--TT-AT-AAATTA--C-G-TTACAACA-ACTGACTTAAATGCAGATGACACAACGTT
gi|24361 : -GTTCCGCAAGGTTCAATTCT-AGG--T---T--CTCTA--C--T--TTTCTTGAT--T---T-ATGTTAGTGATTTTCCAATAG--TT-GT-TGATGA--T-T-C---AA-GTGTTGACATGTACACTGACGATTC
gi|24362 : AGTTCAGAAGAGATT--ACAAGCTCACTTG---ACTT---CTA------TA--------AA------T------AA---ATGGTG--TTCAAGAAAA-ATGATGTATATCAATACAGAAAAAAATAAGT
Alignments
lowQualScore : 11111 11 3333333333333 1 2222 33333333 111 11 222 2222222222222222 33333333333 11 1 11 1
lowQualScore : 6 5 33 2 1 1 1 7 66 444 33 11111 66 444 1 33 44 2 55 2 2 444 5 2 2 6666666666666 2 22 2 1 1 1 5 1 6666 1 99999999 777 1 44 1 1 777 8 777 1111111111111111 11111111111 55 5 44 2 1 1 1 1
lowQualScore : . . .. . . . . . .. ... .. ..... .. ... . .. .. . .. . . ... . . . ............. . .. . . . . . . .... . ........ ... . .. . . ... . ... ................ ........... .. . .. . . . . .
lowQualScore : 7 0 44 4 0 0 0 1 55 111 22 44444 55 111 0 22 66 4 33 5 9 777 3 7 2 3333333333333 7 44 7 0 0 1 0 0 0000 0 66666666 333 1 44 7 1 888 9 888 1111111111111111 66666666666 77 7 44 8 0 0 7 0
consensus : CCCTATT-TCTCATG--GG-GTTCCNCAAGGTTCNATNCT-GGG--T---C--CATTA--C--T--T---TTNAT--TTTAT-ATATTAATGATCTNCCATTGT--NT-GT-AAATAA--C-G-T---AA-A-ACTGACNT-GTATGCAGATGACNCNACGTTCTACGACNTCAGGANAAACTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGATTTTAAAAGCTGACTTGC-AA-CTT---CTA------TA--------AAT------AA---GTGGTGCATTCAAGATGGTATGATGTATATNAATACNGAAAAAACNAAGT
Reference ( family-847 ) : CCCTATT-TCTCATG--GG-GTTCCNCAAGGTTCNATNCT-GGG--T---C--CATTA--C--T--T---TTNAT--TTTAT-ATATTAATGATCTNCCATTGT--NT-GT-AAATAA--C-G-T---AA-A-ACTGACNT-GTATGCAGATGACNCNACGTTCTACGACNTCAGGANAAACTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGATTTTAAAAGCTGACTTGC-AA-CTT---CTA------TA--------AAT------AA---GTGGTGCATTCAAGATGGTATGATGTATATNAATACNGAAAAAACNAAGT
gi|24345 : CCCTATT-TCTCATG--GA-GTTCCCCAAGGTTCAATACT-GGG--T---C--CATTA--C--T--T---TTCAT--TTTAT-ATATTAATGACCTCCCATTAC--AT-GT-AAAAAA--CAG-T---GA-A-ACTGATAT-GTATGCAGATGACTCCACATTCCAC-ACTTCAGGAAAAACTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGA--TTACAAGCCGACTT---AA-CTT---CTA------TA--------AAT------AA---ATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAACTAAGT
gi|24346 : CCCTATT-TCTCATG--GA-GTTCCCTAAGGTTCCATACT-GGG--T---C--CATTA--C--T--T---TTCAT--TTTAT-ATATTAATGATCTCCCATTAC--AT-GT-AAAAAA--CAG-T---GA-A-ACTGATAT-GTATGCAGATGACTCCACATTCCAC-ACTTCAGGAAAAACTGTTTGAAAAATTTAGCAGAGA--TTACAAGCCGACAT---AA-CTT---CTA------TA--------AAT------AA---ATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAAATAAGT
gi|24347 : CCCTATT-TCTCATG--GGAGTTCCCCAAGGTTCCATACT-GGG--T---C--TATTA--C--T--T---TTCAT--TTTAT-ATATTAATGATCTCCCATTAC--AT-GTAAAAAAA--CAG-T---GA-A-ACTGATAT-GTATGCAGATGACTCCACATTCCAC-ACTTCAGGAAAATCTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGA--TTACAAGCTGACTT---AA-CTT---CTA------TA--------AAA------CA---ATAGTGTA--CAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAACTAAAT
gi|24348 : CCCTATT-TCTCATG--GA-GTGCCCCAAGGTTCCATACT-AGG--T---C--TATTA--C--T--T---TTAAT--TTTAT-ATACTAATGATCTCCCATTAC--AT-GT-AAAAAA--CAG-T---GC-A-ACTGATAT-GTATGCAGATGACTCCACATTCAAC-ACTTCCGGAAAAACTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGA--TTAAAAGCTGACTT---AA-CTT---CTA------TA--------AAT------AA---ATGTTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAATACTAAGT
gi|24349 : CCCTGTT-TCCTCTG--GA-GTTCCAAAAGGGTCTGTATT-CGT--T---C--CTCTC--C--T--C---TTTCTCATTTAT-ATA--AACGATCTTCCAGAGC--AT-GT----CAA--CTG-T---AA-A-TCTCGTCT-CTTTGCAGATGACACTGCAATCTAC
gi|24350 : CTACTGTCTCATGTGGG-GTCCCTCGAGGTTCTACACT-AGG--TCACC--TACTA--T--T--T---TTGAT--T---T-ATGTCAATGATATGTC--TGTCGTT-GT-AAA-AA--T--------A-A-ACT---TTAATATGCTGATGATTCctatcactccag
gi|24351 : TCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTATTTT-AGG--T---C--CATTG--T--TATT---TTTAC--TTTTT-ATA--AATGATTTACCATTGT--TT-AT-AAATAA--C-G-TTTCAACA-ACTGACTT-ATATGCAAATGACACAACGTTATATGACAT----ACAAAC--------AAAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGCAAA-CTT---CCAT-----TAATCGTCTTAAT------AT---GTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAA
gi|24352 : TCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTATTTT-AGG--T---C--CATTG--T--TATT---TTTAC--TT-ATCATA--AATGATTTACCATTGT--TT-AT-AAATAA--C-G-TTTCAACA-ACAAACTT-ATATGCAGATGACACAACGTTATATGACAT----ACAGAC--------AAAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGC-AAACTT---CAA------TA--------AATCGTCTTAATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAA
gi|24353 : TCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTATTTT-AGG--T---C--CATTG--TTAT--T---TTTAC--TTTTC-ATA--AATAATTTACCATTGT--TT-AT-GAATAA--C-A-TTTCAACA-ACTGACTT-ATATGCAGATGACACAACGTTATATGACAT----ACAAAC--------GAAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGCTAA-CTTAAATTAATCGTCTT--------AAT------AT---GTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTAACAAAACAAA
gi|24354 : TCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTATTTTAGGG--T---CATTGTTA--T--T--T---TTACT--TTTAT-A----AATGATTTACCATTGT--TT-AC-AAATAA--C-G-TTTCAACA-ACTGACTT-ATATGCAGATGACACAACGTTATATGACAT----ACAAAC--------AAAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGC-AAACTT---CAA------TT--------AATCGTCTTAATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAagtaa
gi|24355 : TG--GA-GTTCCTCAAGGTTCTGTACT-GGG--C---C--CATTATTC--T--T---TTTAA--TTTAT-AT--TAATGAT
gi|24356 : TG--GA-GTTCCGCAAGGATCAACGCTCGGGCCT---C--TTTTA--T--T--T---TTAAT--CT----ACATTAATGA-----CATTGT--CTCCC-AAATAAACT-G-T---CA-A-ATTAAATT-GTTTGCAGATGA
gi|24357 : TG--GA-GTTCCGCAAGGATCAACGCTCGGGCCT---C--TTTTA--T--T--T---TTAAT--CT----ACATTAATGA-----CATTGT--CTCCC-AAATAAACT-G-T---CA-A-ATTAAATT-GTTTGCAGATGA
gi|24358 : TG--GG-GTACCTCAAGGATCTGTCCT-TTG--G---C--CATTG--T--T--A---TTTAT--TATGT-TTGTAAATGATTTGCCACTTT--AT-GT-CAATAA--C-GCT---AA-C-ACTGATAA-ATTTGCAGATG
gi|24359 : G--GA-GTTCCCCAAGGTTTAATTCT-GGG--T---C--CTTTATTC--T--T---TTTAA--TTTAC-ATA--AATGAT
gi|24360 : G--GG-GTTCCACAGGGTTCAAGTTT-AGG--T---C--CATTG--TTAT--T---TTAAC--TTTTC-ATA--AATGATTTACCATTGT--TT-AT-AAATTA--C-G-TTACAACA-ACTGACTT-AAATGCAGATGACACAACGTT
gi|24361 : -GTTCCGCAAGGTTCAATTCT-AGG--T---T--CTCTA--C--T--TTTCTTGAT--T---T-ATGTTAGTGATTTTCCAATAG--TT-GT-TGATGA--T-T-C---AA-GTGTTGACAT-GTACACTGACGATTC
gi|24362 : AGTTCAGAAGAGATT--ACAAGCTCACTTG---A-CTT---CTA------TA--------AAT------AA---ATGGTG--TTCAAGAAAA-ATGATGTATATCAATACAGAAAAAAATAAGT
Alignments
lowQualScore : 11111 11 3333333333333 1 2222 33333333 111 11 222 2222222222222222 33333333333 11 1 11 1
lowQualScore : 6 5 33 2 1 1 1 7 66 444 33 11111 66 444 1 33 44 2 55 2 2 444 5 2 2 6666666666666 2 22 2 1 1 1 5 1 6666 1 99999999 777 1 44 1 1 777 8 777 1111111111111111 11111111111 55 5 44 2 1 1 1 1
lowQualScore : . . .. . . . . . .. ... .. ..... .. ... . .. .. . .. . . ... . . . ............. . .. . . . . . . .... . ........ ... . .. . . ... . ... ................ ........... .. . .. . . . . .
lowQualScore : 7 0 44 4 0 0 0 1 55 111 22 44444 55 111 0 22 66 4 33 5 9 777 3 7 2 3333333333333 7 44 7 0 0 1 0 0 0000 0 66666666 333 1 44 7 1 888 9 888 1111111111111111 66666666666 77 7 44 8 0 0 7 0
consensus : CCCTATT-TCTCATG--GG-GTTCCNCAAGGTTCNATNCT-GGG--T---C--CATTA--C--T--T---TTNAT--TTTAT-ATATTAATGATCTNCCATTGT--NT-GT-AAATAA--C-G-T---AA-A-ACTGACNT-GTATGCAGATGACNCNACGTTCTACGACNTCAGGANAAACTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGATTTTAAAAGCTGACTTGC-AA-CTT---CTA------TA--------AAT------AA---GTGGTGCATTCAAGATGGTATGATGTATATNAATACNGAAAAAACNAAGT
Reference ( family-847 ) : CCCTATT-TCTCATG--GG-GTTCCNCAAGGTTCNATNCT-GGG--T---C--CATTA--C--T--T---TTNAT--TTTAT-ATATTAATGATCTNCCATTGT--NT-GT-AAATAA--C-G-T---AA-A-ACTGACNT-GTATGCAGATGACNCNACGTTCTACGACNTCAGGANAAACTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGATTTTAAAAGCTGACTTGC-AA-CTT---CTA------TA--------AAT------AA---GTGGTGCATTCAAGATGGTATGATGTATATNAATACNGAAAAAACNAAGT
gi|24345 : CCCTATT-TCTCATG--GA-GTTCCCCAAGGTTCAATACT-GGG--T---C--CATTA--C--T--T---TTCAT--TTTAT-ATATTAATGACCTCCCATTAC--AT-GT-AAAAAA--CAG-T---GA-A-ACTGATAT-GTATGCAGATGACTCCACATTCCAC-ACTTCAGGAAAAACTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGA--TTACAAGCCGACTT---AA-CTT---CTA------TA--------AAT------AA---ATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAACTAAGT
gi|24346 : CCCTATT-TCTCATG--GA-GTTCCCTAAGGTTCCATACT-GGG--T---C--CATTA--C--T--T---TTCAT--TTTAT-ATATTAATGATCTCCCATTAC--AT-GT-AAAAAA--CAG-T---GA-A-ACTGATAT-GTATGCAGATGACTCCACATTCCAC-ACTTCAGGAAAAACTGTTTGAAAAATTTAGCAGAGA--TTACAAGCCGACAT---AA-CTT---CTA------TA--------AAT------AA---ATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAAATAAGT
gi|24347 : CCCTATT-TCTCATG--GGAGTTCCCCAAGGTTCCATACT-GGG--T---C--TATTA--C--T--T---TTCAT--TTTAT-ATATTAATGATCTCCCATTAC--AT-GTAAAAAAA--CAG-T---GA-A-ACTGATAT-GTATGCAGATGACTCCACATTCCAC-ACTTCAGGAAAATCTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGA--TTACAAGCTGACTT---AA-CTT---CTA------TA--------AAA------CA---ATAGTGTA--CAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAACTAAAT
gi|24348 : CCCTATT-TCTCATG--GA-GTGCCCCAAGGTTCCATACT-AGG--T---C--TATTA--C--T--T---TTAAT--TTTAT-ATACTAATGATCTCCCATTAC--AT-GT-AAAAAA--CAG-T---GC-A-ACTGATAT-GTATGCAGATGACTCCACATTCAAC-ACTTCCGGAAAAACTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGA--TTAAAAGCTGACTT---AA-CTT---CTA------TA--------AAT------AA---ATGTTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAATACTAAGT
gi|24349 : CCCTGTT-TCCTCTG--GA-GTTCCAAAAGGGTCTGTATT-CGT--T---C--CTCTC--C--T--C---TTTCTCATTTAT-ATA--AACGATCTTCCAGAGC--AT-GT----CAA--CTG-T---AA-A-TCTCGTCT-CTTTGCAGATGACACTGCAATCTAC
gi|24350 : CTACTGTCTCATGTGGG-GTCCCTCGAGGTTCTACACT-AGG--TCACC--TACTA--T--T--T---TTGAT--T---T-ATGTCAATGATATGTC--TGTCGTT-GT-AAA-AA--T--------A-A-ACT---TTAATATGCTGATGATTCctatcactccag
gi|24351 : TCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTATTTT-AGG--T---C--CATTG--T--TATT---TTTAC--TTTTT-ATA--AATGATTTACCATTGT--TT-AT-AAATAA--C-G-TTTCAACA-ACTGACTT-ATATGCAAATGACACAACGTTATATGACAT----ACAAAC--------AAAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGCAAA-CTT---CCAT-----TAATCGTCTTAAT------AT---GTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAA
gi|24352 : TCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTATTTT-AGG--T---C--CATTG--T--TATT---TTTAC--TT-ATCATA--AATGATTTACCATTGT--TT-AT-AAATAA--C-G-TTTCAACA-ACAAACTT-ATATGCAGATGACACAACGTTATATGACAT----ACAGAC--------AAAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGC-AAACTT---CAA------TA--------AATCGTCTTAATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAA
gi|24353 : TCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTATTTT-AGG--T---C--CATTG--TTAT--T---TTTAC--TTTTC-ATA--AATAATTTACCATTGT--TT-AT-GAATAA--C-A-TTTCAACA-ACTGACTT-ATATGCAGATGACACAACGTTATATGACAT----ACAAAC--------GAAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGCTAA-CTTAAATTAATCGTCTT--------AAT------AT---GTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTAACAAAACAAA
gi|24354 : TCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTATTTTAGGG--T---CATTGTTA--T--T--T---TTACT--TTTAT-A----AATGATTTACCATTGT--TT-AC-AAATAA--C-G-TTTCAACA-ACTGACTT-ATATGCAGATGACACAACGTTATATGACAT----ACAAAC--------AAAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGC-AAACTT---CAA------TT--------AATCGTCTTAATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAagtaa
gi|24355 : TG--GA-GTTCCTCAAGGTTCTGTACT-GGG--C---C--CATTATTC--T--T---TTTAA--TTTAT-AT--TAATGAT
gi|24356 : TG--GA-GTTCCGCAAGGATCAACGCTCGGGCCT---C--TTTTA--T--T--T---TTAAT--CT----ACATTAATGA-----CATTGT--CTCCC-AAATAAACT-G-T---CA-A-ATTAAATT-GTTTGCAGATGA
gi|24357 : TG--GA-GTTCCGCAAGGATCAACGCTCGGGCCT---C--TTTTA--T--T--T---TTAAT--CT----ACATTAATGA-----CATTGT--CTCCC-AAATAAACT-G-T---CA-A-ATTAAATT-GTTTGCAGATGA
gi|24358 : TG--GG-GTACCTCAAGGATCTGTCCT-TTG--G---C--CATTG--T--T--A---TTTAT--TATGT-TTGTAAATGATTTGCCACTTT--AT-GT-CAATAA--C-GCT---AA-C-ACTGATAA-ATTTGCAGATG
gi|24359 : G--GA-GTTCCCCAAGGTTTAATTCT-GGG--T---C--CTTTATTC--T--T---TTTAA--TTTAC-ATA--AATGAT
gi|24360 : G--GG-GTTCCACAGGGTTCAAGTTT-AGG--T---C--CATTG--TTAT--T---TTAAC--TTTTC-ATA--AATGATTTACCATTGT--TT-AT-AAATTA--C-G-TTACAACA-ACTGACTT-AAATGCAGATGACACAACGTT
gi|24361 : -GTTCCGCAAGGTTCAATTCT-AGG--T---T--CTCTA--C--T--TTTCTTGAT--T---T-ATGTTAGTGATTTTCCAATAG--TT-GT-TGATGA--T-T-C---AA-GTGTTGACAT-GTACACTGACGATTC
gi|24362 : AGTTCAGAAGAGATT--ACAAGCTCACTTG---A-CTT---CTA------TA--------AAT------AA---ATGGTG--TTCAAGAAAA-ATGATGTATATCAATACAGAAAAAAATAAGT
blockSeqs : G T TG A C C A A CC CAC AT TTA AT TTC C CA TA C TT C C CGT C A A CGTTTCAAC T TA A T C C G T CAGG A TGTTTGAA TTA G TT C C GCA A AAA TTAATCGTCTT CGTCTTAATAT TA T AT A T A A T
blockSeqs : . T . . C C A C CC . . TTC AT . C . TA . TT C C A C . A CGTTTCAAC . TA . T C C G T CAGG A TGTTGGAG TCA G TT C C GCT A . ATCGTCTT CGTCTTAATAT CA T AT A T A A T
blockSeqs : . T . . C C A C . . . TTC . . A . TA . CT C C A . . A CATTTCAAC . TA . T C C G T CCGG A TGTTGGAG TCA G TT A C GC . . TA AA CA T AT A T A A T
blockSeqs : . T . . A T A . . . . TTA . . T . TA . TC C T A . . C CGTTTCAAC . TC . A T C G A . C . TCA T TT A G GC . . TA CA CA T AT A G T C A
blockSeqs : . T . . T T A . . . . C . . G . TT . TT A G A . . T CGTTACAAC . CT . T A A . A . C . . T TT A G G . . TA AA CA A . . G T C A
blockSeqs : T . . A T T . . . . C . . T . TT . TT T A T . . T ACTGTCA . CT . A A A . A . C . . T . A G . . . TA AT . . . . G T C A
blockSeqs : T . . A T T . . . . C . . T . TA . TA T A T . . T ACTGTCA . CT . A A A . A . C . . T . A G . . . TT AT . . . . G T C A
blockSeqs : T . . A T T . . . . C . . T . TA . TT T A T . . T CAGTGA . CT . A A A . G . C C . . . TA AA . . . . C A A T
blockSeqs : T . . A T T . . . . T . . A . TG . T T A T . . T CAGTGA . AT . A A
blockSeqs : . . . T T A . . . . T . . T . TA . . T G C . . T CAGTGC . AT . A
blockSeqs : . . . G A G . . . . T . . A . TT . . T A C . . T CTGTAA . TA . T
blockSeqs : . . . G A G . . . . T . . A . A . . T T A . . T CGCTAA . CT .
blockSeqs : . . . T T C . . . . T . . T . . . . . . T . . T TTCAA . CA .
blockSeqs : . . C A T . . . . T . . T . . . . . . T . . . TA . T .
blockSeqs : . . A A T . . . . T . . A . . . .
blockSeqs : . G A T . . . . C . . G . . . .
blockSeqCons : **** ******** TT CA AT
originalCons : CCCTATT-TCTCATG--GG-GTTCCNCAAGGTTCNATNCT-GGG--T---C--CATTA--C--T--T---TTNAT--TTTAT-ATATTAATGATCTNCCATTGT--NT-GT-AAATAA--C-G-T---AA-A-ACTGACNT-GTATGCAGATGACNCNACGTTCTACGACNTCAGGANAAACTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGATTTTAAAAGCTGACTTGC-AA-CTT---CTA------TA--------AAT------AA---GTGGTGCATTCAAGATGGTATGATGTATATNAATACNGAAAAAACNAAGT
finalCons : CCCTATT-TCTCATG--GG-GTTCCNCAAGGTTCNATNCT-GGG--T---C--CATTA--C--T--T---TTNAT--TTTAT-ATATTAATGATCTNCCATTGT--NT-GT-AAATAA--C-G-T---AA-A-ACTGACNT-GTATGCAGATGACNCNACGTTCTACGACNT----ANAAAC--------AAATTCAGCAGAGATTTTAAAAGCTGACTTGC-AA-CTT---CTA------TA--------AAT------AA---GTGGTGCATTCAAGATGGTATGATGTATATNAATACNGAAAAAACNAAGT
Alignments
lowQualScore : 11111 11 3333333333333 1 77777777777777777777777777 111 333 3333333333333333 111111 11 1 11 1
lowQualScore : 6 5 33 2 1 1 1 7 66 777 11111 66 444 1 33 44 2 55 2 2 444 5 2 9999999999999 2 22 2 1 1 1 5 1 55555555555555555555555555 777 1 888 1 1 666 777 777 3333333333333333 222222 777 55 5 44 2 1 1 1 1
lowQualScore : . . .. . . . . . .. ... ..... .. ... . .. .. . .. . . ... . . ............. . .. . . . . . . .......................... ... . ... . . ... ... ... ................ ...... ... .. . .. . . . . .
lowQualScore : 7 0 44 4 0 0 0 1 55 444 44444 55 111 0 22 66 4 33 5 9 777 3 2 0000000000000 7 44 7 0 0 1 0 0 00000000000000000000000000 333 1 222 7 1 777 888 888 9999999999999999 888888 888 77 7 44 8 0 0 7 0
consensus : CCCTATT-TCTCATG--GG-GTTCCNCAAGGTTCNATNCT-GGG--TC---CATTA--C--T--T---TTNAT--TTTAT-ATATTAATGATCTNCCATTGT--NT-GTAAATAA--C-G-T---AA-A-ACTGACNT-GTATGCAGATGACNCNACGTTCTACGACNTCAGGANAA--------ACTGTT-GA-AAATTCAGCAGAGATTTTAAAAGCTGACTTGC-AACTT---C---TA------TA--------AA------TAA---GTGGTGCATTCAAGATGGTATGATGTATATNAATACNGAAAAAACNAAGT
Reference ( family-847 ) : CCCTATT-TCTCATG--GG-GTTCCNCAAGGTTCNATNCT-GGG--TC---CATTA--C--T--T---TTNAT--TTTAT-ATATTAATGATCTNCCATTGT--NT-GTAAATAA--C-G-T---AA-A-ACTGACNT-GTATGCAGATGACNCNACGTTCTACGACNT----ANAA--------AC--------AAATTCAGCAGAGATTTTAAAAGCTGACTTGC-AACTT---C---TA------TA--------AA------TAA---GTGGTGCATTCAAGATGGTATGATGTATATNAATACNGAAAAAACNAAGT
gi|24345 : CCCTATT-TCTCATG--GA-GTTCCCCAAGGTTCAATACT-GGG--TC---CATTA--C--T--T---TTCAT--TTTAT-ATATTAATGACCTCCCATTAC--AT-GTAAAAAA--CAG-T---GA-A-ACTGATAT-GTATGCAGATGACTCCACATTCCAC-ACTTCAGGAAAA--------ACTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGA--TTACAAGCCGACTT---AACTT---C---TA------TA--------AA------TAA---ATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAACTAAGT
gi|24346 : CCCTATT-TCTCATG--GA-GTTCCCTAAGGTTCCATACT-GGG--TC---CATTA--C--T--T---TTCAT--TTTAT-ATATTAATGATCTCCCATTAC--AT-GTAAAAAA--CAG-T---GA-A-ACTGATAT-GTATGCAGATGACTCCACATTCCAC-ACTTCAGGAAAA--------ACTGTTTGAAAAATTTAGCAGAGA--TTACAAGCCGACAT---AACTT---C---TA------TA--------AA------TAA---ATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAAATAAGT
gi|24347 : CCCTATT-TCTCATG--GGAGTTCCCCAAGGTTCCATACT-GGG--TC---TATTA--C--T--T---TTCAT--TTTAT-ATATTAATGATCTCCCATTAC--AT-GTAAAAAAA-CAG-T---GA-A-ACTGATAT-GTATGCAGATGACTCCACATTCCAC-ACTTCAGGAAAATCTGTTGGAG--------AAATTCAGCAGAGATT--ACAAGCTGACTT---AACTT---C---TA------TA--------AA------ACA---ATAGTGTA--CAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAACTAAAT
gi|24348 : CCCTATT-TCTCATG--GA-GTGCCCCAAGGTTCCATACT-AGG--TC---TATTA--C--T--T---TTAAT--TTTAT-ATACTAATGATCTCCCATTAC--AT-GTAAAAAA--CAG-T---GC-A-ACTGATAT-GTATGCAGATGACTCCACATTCAAC-ACTTCCGGAAAA--------ACTGTTGGAGAAATTCAGCAGAGA--TTAAAAGCTGACTT---AACTT---C---TA------TA--------AA------TAA---ATGTTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAATACTAAGT
gi|24349 : CCCTGTT-TCCTCTG--GA-GTTCCAAAAGGGTCTGTATT-CGT--TC---CTCTC--C--T--C---TTTCTCATTTAT-ATA--AACGATCTTCCAGAGC--AT-GT---CAA--CTG-T---AA-A-TCTCGTCT-CTTTGCAGATGACACTGCAATCTAC
gi|24350 : CTACTGTCTCATGTGGG-GTCCCTCGAGGTTCTACACT-AGG--TCACCTACTA--T--T--T---TTGAT--T---T-ATGTCAATGATATGTC--TGTCGTT-GTAAA-AA--T--------A-A-ACT---TTAATATGCTGATGATTCctatcactccag
gi|24351 : TCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTATTTT-AGG--TC---CATTG--T--TATT---TTTAC--TTTTT-ATA--AATGATTTACCATTGT--TT-ATAAATAA--C-G-TTTCAACA-ACTGACTT-ATATGCAAATGACACAACGTTATATGACAT----ACAA--------AC--------AAAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGCAAACTT---C---CAT-----TAATCGTCTTAA------TAT---GTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAA
gi|24352 : TCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTATTTT-AGG--TC---CATTG--T--TATT---TTTAC--TT-ATCATA--AATGATTTACCATTGT--TT-ATAAATAA--C-G-TTTCAACA-ACAAACTT-ATATGCAGATGACACAACGTTATATGACAT----ACAG--------AC--------AAAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGCAAACTT---C---AA------TA--------AATCGTCTTAATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAA
gi|24353 : TCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTATTTT-AGG--TC---CATTG--TTAT--T---TTTAC--TTTTC-ATA--AATAATTTACCATTGT--TT-ATGAATAA--C-A-TTTCAACA-ACTGACTT-ATATGCAGATGACACAACGTTATATGACAT----ACAA--------AC--------GAAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGCTAACTTAAAT---TAATCGTCTT--------AA------TAT---GTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTAACAAAACAAA
gi|24354 : TCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTATTTTAGGG--TCAT-TGTTA--T--T--T---TTACT--TTTAT-A----AATGATTTACCATTGT--TT-ACAAATAA--C-G-TTTCAACA-ACTGACTT-ATATGCAGATGACACAACGTTATATGACAT----ACAA--------AC--------AAAT---ACAGATATTTTAAAAGGTAACTTGCAAACTT---CAATTAATCGTCTT--------AA------TAT---GTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAagtaa
gi|24355 : TG--GA-GTTCCTCAAGGTTCTGTACT-GGG--CC---CATTATTC--T--T---TTTAA--TTTAT-AT--TAATGAT
gi|24356 : TG--GA-GTTCCGCAAGGATCAACGCTCGGGCCTC---TTTTA--T--T--T---TTAAT--CT----ACATTAATGA-----CATTGT--CTCCCAAATAAACT-G-T---CA-A-ATTAAATT-GTTTGCAGATGA
gi|24357 : TG--GA-GTTCCGCAAGGATCAACGCTCGGGCCTC---TTTTA--T--T--T---TTAAT--CT----ACATTAATGA-----CATTGT--CTCCCAAATAAACT-G-T---CA-A-ATTAAATT-GTTTGCAGATGA
gi|24358 : TG--GG-GTACCTCAAGGATCTGTCCT-TTG--GC---CATTG--T--T--A---TTTAT--TATGT-TTGTAAATGATTTGCCACTTT--AT-GTCAATAA--C-GCT---AA-C-ACTGATAA-ATTTGCAGATG
gi|24359 : G--GA-GTTCCCCAAGGTTTAATTCT-GGG--TC---CTTTATTC--T--T---TTTAA--TTTAC-ATA--AATGAT
gi|24360 : G--GG-GTTCCACAGGGTTCAAGTTT-AGG--TC---CATTG--TTAT--T---TTAAC--TTTTC-ATA--AATGATTTACCATTGT--TT-ATAAATTA--C-G-TTACAACA-ACTGACTT-AAATGCAGATGACACAACGTT
gi|24361 : -GTTCCGCAAGGTTCAATTCT-AGG--TT---CTCTA--C--T--TTTCTTGAT--T---T-ATGTTAGTGATTTTCCAATAG--TT-GTTGATGA--T-T-C---AA-GTGTTGACAT-GTACACTGACGATTC
gi|24362 : AGTTCAGAAGAGATT--ACAAGCTCACTTG---ACTT---C---TA------TA--------AA------TAA---ATGGTG--TTCAAGAAAA-ATGATGTATATCAATACAGAAAAAAATAAGT