lowQualScore : 11111 1 11 1 1 1111111111111 1111111111 22 1111111 44444444444444444444444444444444444444444 111111111111111 1111111 11 11 1
lowQualScore : 1 66666 0 5 2 00 2 777 1 2 6666 0 0 4 999999 0 1 6 2 6666 8 7777777777777 6 5 3333333333 00 0000000 77777 99999999999999999999999999999999999999999 000000000000000 4444444 3 3 66 555 7777 6 44 555 3 3
lowQualScore : . ..... . . . .. . ... . . .... . . . ...... . . . . .... . ............. . . .......... .. ....... ..... ......................................... ............... ....... . . .. ... .... . .. ... . .
lowQualScore : 6 66666 1 3 9 99 5 111 0 9 1111 4 1 5 666666 1 8 8 6 5555 4 5555555555555 0 7 5555555555 11 0000000 77777 22222222222222222222222222222222222222222 333333333333333 3333333 1 3 66 888 1111 7 22 888 2 3
consensus : TCTGGTACATGATNTATACANA--NATATATGACAGACAGTGGTTT-AG-TAATGNTAT-NTAACAGTTAC-A----ATGTTAGTTTCATGNTA------TAAATCGTATCGAATATATT----TAAATTNAAGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAG-AAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----TA---ATAAT-A-----T-TCAAA-AG-TCATGT---C----AG-AAAA-CAA---ATATAATACAACATGA-TCTTACCTA
Reference ( gi|34674 ) : TCTGGTACATGATATATACACA--CATATATGACAGACAGTTGTTT-AA-TAATGATAT-TTAACAGTCAC-A----ATGTTAGTTTCATGGTA------TAAATCGTATCGGATAAATT----TAAATTTAAGCAA------------GGGTAAAAAT----------GGAG-TAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----TA---ATAAT-G-----T-TCAAA-AT-TCATGT---C----AG-AAAC-CAA---ATATAATGCAACATTA-TCTTACCTA
gi|34673 : TCTGGTACATGATGTATGCACA--GCTATATGAAAGACAGTGGTTT-AT-TAATATTAA-TAAACAGTTAC-A----ATGTTAGTTTCATTTTA------TAAATCATATCGAATAATAT----TAAATTTAAGCAA------------GGGTGAAAGT----------GGAA-AAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----AA---ATAAT-A-----T-TAAAA-AG-TCATGT---C----AG-AAAG-CAA---ATATAATGTAACATGA-TCTTACCTA
gi|34672 : TCTGCTACATGATGTATGCACA--AATATATGACAGAGAGTGGTTT-AT-TAATGATAA-TAAACAGT-AC-A----ATGTTATTTTCATGGTA------TAATTCATATAGAATACATT----TAAATTTA-GTAA------------GGGTGAAAGT----------GGAG-AAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----CA---AAAAT-A-----T-TCAAA-AG-TCATG----C----AG-AAAG-CAA---ATATAATGCAACATGA-TCTTACCTA
gi|34675 : TCTGATGCATGATGTATACACA--AATATATGACAGATAGTGGTTT-AT-TAATGATAA-TAAACAGTAAC-A----ATGTTATTTTCATGGTA------TAAATCATATAAAATAAATT----TAAATTTAAGCAA------------GTGTGAAATT----------GGAG-AAGCTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----TG---ATGAT-A-----T-TCAGA-AA-TCATGT---C----AG-AAAG-CAA---AACTAATGCAACATGA-TC
gi|34676 : TCTGGTAAATGATATATACAAA--AACATATGGCAG-TAGTAGTTT-AG-TAATGGTAT-GCAACAGTTAC-A----ATATTAGTTTCATATTA------TAAATAATATAGAATGTATT----AAAATTAAAGCAATGGTGAAAGTAAAGGTGAAAAT----------GGAG-AAGGCG-------G-----TACACTGTTTCT----GCGTTTGT------------A------ACATAGTTA----TA---ATATT-A-----T-TCAAA-AG-TCATGT---C----AGAAAAA-CAG---ATATAATACAACATGA-TCTAATCT
gi|34677 : TCTGGTACATGACATATACAAA---AGCT-TGACAGACAGTGGTTT-AG-GAATGATAT-ATAACAATCAC-A----ATATTTATGTCATGGTATACTAGTAAATCATATCGAAAATGTTTTGATAAAT----GCCA------------AGTTGAACGT----------GAGG-AAGGTGACCCGTTG-----TA---------TTGTCGT----ACTTCA--------A------ACA-----G----TC---AAAAG-A-----T-TCAAACAT-T-ATAT---C----AGTAAAA-CAA---ATATAATATAACCTGA-TACTATCTA
gi|34678 : TCTGGTACATGATATATACAGA--AACATGTGGTAGACAGTGGTTT-AG-TAATGCTTT-TTAACAGTTAC-T----GTGTTAGTT
gi|34679 : TTTGGTACATGATTTATACAAAAGCATTTAC--CAGACTGTGTTTT-GA-TAATGCTAT-ATGATAGTTAC-A----ATATTAGTTTCATGAT
gi|34680 : TCTGGTACACGATTTATAT-TA---ATATAT---AGATAG-TGTTTCAG-TAATGCTGT-ATAATAGTAAA-A----ATAT----------------------ACCGTATCAAATATACT----TAAACTGAGGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAG-AAAGTG-------T-----TA---------CA---GT----AT------------G------TCA-----G----CA---TCAAC-A-----T-T
gi|34681 : CTGGTACATGATGTATACACA--CATATATGGCAGACAGTGGTTC-AT-TAATGATAT-TAAACAGATGC-A----ATGTTATTTTCATTGGA------TAAGTCATATCGAATAAATT----TAAACTTAAGCAA------------GAGTGAAAGT----------TGGG-ACAGTA-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----TA---ATAAC-A-----T-TAAAA-AG-ACATGT---CATAAAA-AAAA-CAA---ATATAATGCAATATGA-TCTTACTTA
gi|34682 : CTGGTACATGATATATATAAA--AAGATATGAGAGACGGTGGTTA-AG-AAATTATAT-CTGACAGT-----------------TTCATGATA------TAAA----ATTGAATATATT----TGAATTAAAGCAA------------TGGTGAAAGT----------GGAG---ACTG-------G-----TA---------T----GA----AA------------A------ACA-----G----TT---ATAAT-A-----T-T-AAA-ATGTTATGT---C----AG-AAAG-CAA---ATAT-ATAC------A-TCTTACCTA
gi|34683 : CTGGTGCATGATTTATACAAA--TTTATATGACAGACAGATTCTT-AG-TAACGCAAT-GAAATAATTAC-A----ATGTTAGTTTTATGTTA------TAATTAGCAT----TA--------TATATTAAAGCAA------------AAGTGACAGC----------GGGG-AAGGTG-------G-----TA---------
gi|34684 : TAGTACATAATATACAGAAA--CA-A-ATGACAGACAGTGGTTT-AG-TAATGATAT-TTAACAGTTACTACGGTATATTAGTTTTACATTA------TACATCGTATCGAATATATT----TAGATTAAAGCAA------------AGGTGAAAGTAAAGGTGAAAGGAG-AAGGTG-------G-----TACACTGTTT-T----GC----ATTTGC--------A------ACA----------CATCTATAAT-A-----T-TCCAA-AG-TCATGT---T----AG-AAAA-AAATATATATAATACAACATGA-TCTTACCTA
gi|34685 : TGATGCTTG-TATATACA-G--TGTATATGACAGA--GT-GTTA-AG-TTATGATAT-ATAATAGTTAC-A----ATATTAGTTTCATGATA------TACATTGCATCAATTATATT----TTAATTACAGCAA------------AGGAGAATGT----------GGAGATA-GTG-------GGACACTATATT-----T----GC----GT------------ATGGTTTACA-----GTTTTTG---ATATTAG-----TCTCGAA-AG-TCATGT---A----AT-CAAA-CAA---ATAGAACACAATATTA-CCTT
gi|34686 : caTATATGGCAGACAGT-GTTT-AGGTAATGCTATATTATAGGTTA--------TTTCAGTTTCATGATA------TTAATTGTAACAAGTATATT----TGAATTGAGGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGA
gi|34687 : ATATATT----TAAATTGAAGCAA------------AAGAGAAAGT----------GGAG-AAGGTT-------G-----CA---------T----ACTT--ATTTTGCCCATGCAA------ACA-----G----TA-----AAT-GAGACTT-TCAAA-AG-TCTTGTTAGC----AG-AAAC---A---TTATAATATAACCTGATTCTTGCaaatgtg
gi|34688 : atatat-------G-----TA---------T----GC----AA------------C------ACT-----G----TT---ATACT-A-----C-TCAAA-AG-TTATGT---C----AG-AAAAACAA---ATATAATACAACGTAA-TCTTACCTA
gi|34689 : ---------T----GC----AT------------T------ATA-----G----TA---ATAAT-A-----T-TCAAA-A----GTGT---C----AG-AAAC-CAA---ATATAACGCAACATGA-TCTTACCTA
Alignments
lowQualScore : 111111111111 1111111111 44444444444444444444444444444444444444444 1111111111111111 11
lowQualScore : 3 1 1 1 2 1 11 2 2 5555 2 888888 0 1 2 1 444444444444 2222222222 8888888 77777 11111111111111111111111111111111111111111 0000000000000000 77 6666 00 3 555 3
lowQualScore : . . . . . . .. . . .... . ...... . . . . ............ .......... ....... ..... ......................................... ................ .. .... .. . ... .
lowQualScore : 8 0 0 7 7 0 77 7 7 7777 0 888888 8 1 9 0 666666666666 5555555555 7777777 11111 88888888888888888888888888888888888888888 4444444444444444 99 5555 44 1 444 1
consensus : TCTGGTACATGATNTATACANAAATATATGACAGACAGTGGTTTAG-TAATGATATNTAACAG-TTAC-A----ATGTTAGTTTCATGNTA------TAAATCGTATCGAATATAT-TTAAATTNAAGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAGAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAATA--TTCAAAAGTCATGTC----AG--AAAA-CAA---ATATAATGCAACATGA-TCTTACCTA
Reference ( family-839 ) : TCTGGTACATGATNTATACANANATATATGACAGACAGTGGTTTAG-TAATGNTATNTAACAG-TTAC-A----ATGTTAGTTTCATGNTA------TAAATCGTATCGAATATAT-TTAAATTNAAGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAGAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAATA--TTCAAAAGTCATGTC----AG--AAAA-CAA---ATATAATACAACATGA-TCTTACCTA
gi|34672 : TCTGCTACATGATGTATGCACAAATATATGACAGAGAGTGGTTTAT-TAATGATAATAAACAG-T-AC-A----ATGTTATTTTCATGGTA------TAATTCATATAGAATACAT-TTAAATTTA-GTAA------------GGGTGAAAGT----------GGAGAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----C-A---AAAATA--TTCAAAAGTCATG-C----AG--AAAG-CAA---ATATAATGCAACATGA-TCTTACCTA
gi|34673 : TCTGGTACATGATGTATGCACAGCTATATGAAAGACAGTGGTTTAT-TAATATTAATAAACAG-TTAC-A----ATGTTAGTTTCATTTTA------TAAATCATATCGAATA-ATATTAAATTTAAGCAA------------GGGTGAAAGT----------GGAAAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----A-A---ATAATA--TTAAAAAGTCATGTC----AG--AAAG-CAA---ATATAATGTAACATGA-TCTTACCTA
gi|34674 : TCTGGTACATGATATATACACACATATATGACAGACAGTTGTTTAA-TAATGATATTTAACAG-TCAC-A----ATGTTAGTTTCATGGTA------TAAATCGTATCGGATAAAT-TTAAATTTAAGCAA------------GGGTAAAAAT----------GGAGTAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAATG--TTCAAAATTCATGTC----AG--AAAC-CAA---ATATAATGCAACATTA-TCTTACCTA
gi|34675 : TCTGATGCATGATGTATACACAAATATATGACAGATAGTGGTTTAT-TAATGATAATAAACAG-TAAC-A----ATGTTATTTTCATGGTA------TAAATCATATAAAATAAAT-TTAAATTTAAGCAA------------GTGTGAAATT----------GGAGAAGCTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-G---ATGATA--TTCAGAAATCATGTC----AG--AAAG-CAA---AACTAATGCAACATGA-TC
gi|34676 : TCTGGTAAATGATATATACAAAAACATATGGCAG-TAGTAGTTTAG-TAATGGTATGCAACAG-TTAC-A----ATATTAGTTTCATATTA------TAAATAATATAGAATGTAT-TAAAATTAAAGCAATGGTGAAAGTAAAGGTGAAAAT----------GGAGAAGGCG-------G-----TACACTGTTTCT----GCGTTTGT------------A------ACATAGTTA----T-A---ATATTA--TTCAAAAGTCATGTC----AGA-AAAA-CAG---ATATAATACAACATGA-TCTAATCT
gi|34677 : TCTGGTACATGACATATACAAAAGC-T-TGACAGACAGTGGTTTAG-GAATGATATATAACAA-TCAC-A----ATATTTATGTCATGGTATACTAGTAAATCATATCGAAAATGT-TTTGATAAATGCCA------------AGTTGAACGT----------GAGGAAGGTGACCCGTTG-----TA---------TTGTCGT----ACTTCA--------A------ACA-----G----T-C---AAAAGA--TTCAAACATTATATC----AGT-AAAA-CAA---ATATAATATAACCTGA-TACTATCTA
gi|34678 : TCTGGTACATGATATATACAGAAACATGTGGTAGACAGTGGTTTAG-TAATGCTTTTTAACAG-TTAC-T----GTGTTAGTT
gi|34679 : TTTGGTACATGATTTATACAAAAGCATTTACCAGACTGTGTTTTGA-TAATGCTATATGATAG-TTAC-A----ATATTAGTTTCATGAT
gi|34680 : TCTGGTACACGATTTATATTAATATATA-----GATAGTGTTTCAG-TAATGCTGTATAATAG-TAAA-A----ATAT----------------------ACCGTATCAAATATAC-TTAAACTGAGGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAGAAAGTG-------T-----TA---------CA---GT----AT------------G------TCA-----G----C-A---TCAACA--TT
gi|34681 : CTGGTACATGATGTATACACACATATATGGCAGACAGTGGTTCAT-TAATGATATTAAACAG-ATGC-A----ATGTTATTTTCATTGGA------TAAGTCATATCGAATAAAT-TTAAACTTAAGCAA------------GAGTGAAAGT----------TGGGACAGTA-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAACA--TTAAAAAGACATGTCATAAAA--AAAA-CAA---ATATAATGCAATATGA-TCTTACTTA
gi|34682 : CTGGTACATGATATATATAAAAAGATATGAGAGACGGTGGTTAAG-AAATTATATCTGACAG-TT-----------------TCATGATA------TAAA----ATTGAATATAT-TTGAATTAAAGCAA------------TGGTGAAAGT----------GGAGAC--TG-------G-----TA---------T----GA----AA------------A------ACA-----G----T-T---ATAATA--TTAAAATGTTATGTC----AG--AAAG-CAA---ATAT-ATAC------A-TCTTACCTA
gi|34683 : CTGGTGCATGATTTATACAAATTTATATGACAGACAGATTCTTAG-TAACGCAATGAAATAA-TTAC-A----ATGTTAGTTTTATGTTA------TAATTAGCAT----TATAT-----ATTAAAGCAA------------AAGTGACAGC----------GGGGAAGGTG-------G-----TA---------
gi|34684 : TAGTACATAAT--ATACAGAAACAAATGACAGACAGTGGTTTAG-TAATGATATTTAACAG-TTACTACGGTATATTAGTTTTACATTA------TACATCGTATCGAATATAT-TTAGATTAAAGCAA------------AGGTGAAAGTAAAGGTGAAAGGAGAAGGTG-------G-----TACACTGTTT-T----GC----ATTTGC--------A------ACA----------C-ATCTATAATA--TTCCAAAGTCATGTT----AG--AAAA-AAATATATATAATACAACATGA-TCTTACCTA
gi|34685 : TGATGCTTG-TATATACAG-TGTATATGACAGA--GTG-TTAAG-TTATGATATATAATAG-TTAC-A----ATATTAGTTTCATGATA------TACATTGCATCAATTATAT-TTTAATTACAGCAA------------AGGAGAATGT----------GGAGATAGTG-------GGACACTATATT-----T----GC----GT------------ATGGTTTACA-----GTTTTT-G---ATATTAGTCTCGAAAGTCATGTA----AT--CAAA-CAA---ATAGAACACAATATTA-CCTT
gi|34686 : caTATATGGCAGACAGTG-TTTAGGTAATGCTATATTATAGGTTA--------TTTCAGTTTCATGATA------TTAATTGTAACAAGTATAT-TTGAATTGAGGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAAAATGTG-------
gi|34687 : ATATAT-TTAAATTGAAGCAA------------AAGAGAAAGT----------GGAGAAGGTT-------G-----CA---------T----ACTT--ATTTTGCCCATGCAA------ACA-----G----TAA---ATGAGACTTTCAAAAGTCTTGTT----AGCAGAAA-C-A---TTATAATATAACCTGATTCTTGC
gi|34688 : atatat-------G-----TA---------T----GC----AA------------C------ACT-----G----T-T---ATACTA--CTCAAAAGTTATGTC----AG--AAAAACAA---ATATAATACAACGTAA-TCTTACCTA
gi|34689 : ---------T----GC----AT------------T------ATA-----G----T-A---ATAATA--TTCAAAAGT---GTC----AG--AAAC-CAA---ATATAACGCAACATGA-TCTTACCTA
Alignments
lowQualScore : 111111111111 1111111111 44444444444444444444444444444444444444444 1111111111111111 11
lowQualScore : 99999 1 2 1 2 1 11 2 2 5555 2 888888 0 1 2 1 444444444444 2222222222 8888888 77777 11111111111111111111111111111111111111111 0000000000000000 77 6666 00 3 555 3
lowQualScore : ..... . . . . . .. . . .... . ...... . . . . ............ .......... ....... ..... ......................................... ................ .. .... .. . ... .
lowQualScore : 99999 0 9 7 7 7 77 7 7 7777 0 888888 8 1 9 0 666666666666 5555555555 7777777 11111 88888888888888888888888888888888888888888 4444444444444444 99 5555 44 1 444 1
consensus : TCTGGTACATGATG----TATACANAA-ATATATGACAGACAGTGGTTTAG-TAATGATATNTAACAG-TTAC-A----ATGTTAGTTTCATGNTA------TAAATCGTATCGAATATAT-TTAAATTNAAGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAGAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAATA--TTCAAAAGTCATGTC----AG--AAAA-CAA---ATATAATGCAACATGA-TCTTACCTA
Reference ( family-839 ) : TCTGGTACATGATN----TATACANAA-ATATATGACAGACAGTGGTTTAG-TAATGATATNTAACAG-TTAC-A----ATGTTAGTTTCATGNTA------TAAATCGTATCGAATATAT-TTAAATTNAAGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAGAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAATA--TTCAAAAGTCATGTC----AG--AAAA-CAA---ATATAATGCAACATGA-TCTTACCTA
gi|34672 : TCTGCTACATGATG----TATGCACAA-ATATATGACAGAGAGTGGTTTAT-TAATGATAATAAACAG-T-AC-A----ATGTTATTTTCATGGTA------TAATTCATATAGAATACAT-TTAAATTTA-GTAA------------GGGTGAAAGT----------GGAGAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----C-A---AAAATA--TTCAAAAGTCATG-C----AG--AAAG-CAA---ATATAATGCAACATGA-TCTTACCTA
gi|34673 : TCTGGTACATGATG----TATGCACAG-CTATATGAAAGACAGTGGTTTAT-TAATATTAATAAACAG-TTAC-A----ATGTTAGTTTCATTTTA------TAAATCATATCGAATA-ATATTAAATTTAAGCAA------------GGGTGAAAGT----------GGAAAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----A-A---ATAATA--TTAAAAAGTCATGTC----AG--AAAG-CAA---ATATAATGTAACATGA-TCTTACCTA
gi|34674 : TCTGGTACATGATA----TATACACAC-ATATATGACAGACAGTTGTTTAA-TAATGATATTTAACAG-TCAC-A----ATGTTAGTTTCATGGTA------TAAATCGTATCGGATAAAT-TTAAATTTAAGCAA------------GGGTAAAAAT----------GGAGTAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAATG--TTCAAAATTCATGTC----AG--AAAC-CAA---ATATAATGCAACATTA-TCTTACCTA
gi|34675 : TCTGATGCATGATG----TATACACAA-ATATATGACAGATAGTGGTTTAT-TAATGATAATAAACAG-TAAC-A----ATGTTATTTTCATGGTA------TAAATCATATAAAATAAAT-TTAAATTTAAGCAA------------GTGTGAAATT----------GGAGAAGCTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-G---ATGATA--TTCAGAAATCATGTC----AG--AAAG-CAA---AACTAATGCAACATGA-TC
gi|34676 : TCTGGTAAATGATA----TATACAAAA-ACATATGGCAG-TAGTAGTTTAG-TAATGGTATGCAACAG-TTAC-A----ATATTAGTTTCATATTA------TAAATAATATAGAATGTAT-TAAAATTAAAGCAATGGTGAAAGTAAAGGTGAAAAT----------GGAGAAGGCG-------G-----TACACTGTTTCT----GCGTTTGT------------A------ACATAGTTA----T-A---ATATTA--TTCAAAAGTCATGTC----AGA-AAAA-CAG---ATATAATACAACATGA-TCTAATCT
gi|34677 : TCTGGTACATGACA----TATACAAAA-GC-T-TGACAGACAGTGGTTTAG-GAATGATATATAACAA-TCAC-A----ATATTTATGTCATGGTATACTAGTAAATCATATCGAAAATGT-TTTGATAAATGCCA------------AGTTGAACGT----------GAGGAAGGTGACCCGTTG-----TA---------TTGTCGT----ACTTCA--------A------ACA-----G----T-C---AAAAGA--TTCAAACATTATATC----AGT-AAAA-CAA---ATATAATATAACCTGA-TACTATCTA
gi|34678 : TCTGGTACATGATA----TATACAGAA-ACATGTGGTAGACAGTGGTTTAG-TAATGCTTTTTAACAG-TTAC-T----GTGTTAGTT
gi|34679 : TTTGGTACATGATT----TATACAAAA-GCATTTACCAGACTGTGTTTTGA-TAATGCTATATGATAG-TTAC-A----ATATTAGTTTCATGAT
gi|34680 : TCTGGTACACGATT----TATA--TTA-ATATAT---AGATAGTGTTTCAG-TAATGCTGTATAATAG-TAAA-A----ATAT----------------------ACCGTATCAAATATAC-TTAAACTGAGGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAGAAAGTG-------T-----TA---------CA---GT----AT------------G------TCA-----G----C-A---TCAACA--TT
gi|34681 : CTGGTACATGATG----TATACACAC-ATATATGGCAGACAGTGGTTCAT-TAATGATATTAAACAG-ATGC-A----ATGTTATTTTCATTGGA------TAAGTCATATCGAATAAAT-TTAAACTTAAGCAA------------GAGTGAAAGT----------TGGGACAGTA-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAACA--TTAAAAAGACATGTCATAAAA--AAAA-CAA---ATATAATGCAATATGA-TCTTACTTA
gi|34682 : CTGGTACATGATA----TATATAAAA-AGATATGAGAGACGGTGGTTAAG-AAATTATATCTGACAG-TT-----------------TCATGATA------TAAA----ATTGAATATAT-TTGAATTAAAGCAA------------TGGTGAAAGT----------GGAGAC--TG-------G-----TA---------T----GA----AA------------A------ACA-----G----T-T---ATAATA--TTAAAATGTTATGTC----AG--AAAG-CAA---ATAT-ATAC------A-TCTTACCTA
gi|34683 : CTGGTGCATGATT----TATACAAAT-TTATATGACAGACAGATTCTTAG-TAACGCAATGAAATAA-TTAC-A----ATGTTAGTTTTATGTTA------TAATTAGCAT----TATAT-----ATTAAAGCAA------------AAGTGACAGC----------GGGGAAGGTG-------G-----TA---------
gi|34684 : TAGTACATAAT------ATACAGAA-ACAAATGACAGACAGTGGTTTAG-TAATGATATTTAACAG-TTACTACGGTATATTAGTTTTACATTA------TACATCGTATCGAATATAT-TTAGATTAAAGCAA------------AGGTGAAAGTAAAGGTGAAAGGAGAAGGTG-------G-----TACACTGTTT-T----GC----ATTTGC--------A------ACA----------C-ATCTATAATA--TTCCAAAGTCATGTT----AG--AAAA-AAATATATATAATACAACATGA-TCTTACCTA
gi|34685 : CATGATGCTTGTATATACAGTGTATATGACAGA--GTG-TTAAG-TTATGATATATAATAG-TTAC-A----ATATTAGTTTCATGATA------TACATTGCATCAATTATAT-TTTAATTACAGCAA------------AGGAGAATGT----------GGAGATAGTG-------GGACACTATATT-----T----GC----GT------------ATGGTTTACA-----GTTTTT-G---ATATTAGTCTCGAAAGTCATGTA----AT--CAAA-CAA---ATAGAACACAATATTA-CCTT
gi|34686 : TATATGGCAGACAGTG-TTTAGGTAATGCTATATTATAGGTTA--------TTTCAGTTTCATGATA------TTAATTGTAACAAGTATAT-TTGAATTGAGGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAAAATGTG-------
gi|34687 : ATATAT-TTAAATTGAAGCAA------------AAGAGAAAGT----------GGAGAAGGTT-------G-----CA---------T----ACTT--ATTTTGCCCATGCAA------ACA-----G----TAA---ATGAGACTTTCAAAAGTCTTGTT----AGCAGAAA-C-A---TTATAATATAACCTGATTCTTGC
gi|34688 : atatat-------G-----TA---------T----GC----AA------------C------ACT-----G----T-T---ATACTA--CTCAAAAGTTATGTC----AG--AAAAACAA---ATATAATACAACGTAA-TCTTACCTA
gi|34689 : ---------T----GC----AT------------T------ATA-----G----T-A---ATAATA--TTCAAAAGT---GTC----AG--AAAC-CAA---ATATAACGCAACATGA-TCTTACCTA
Alignments
lowQualScore : 11111 111111111111 1111111111 44444444444444444444444444444444444444444 1111111111111111 11
lowQualScore : 00000 1 2 1 2 1 11 2 2 5555 2 888888 0 1 2 1 444444444444 2222222222 8888888 77777 11111111111111111111111111111111111111111 0000000000000000 77 6666 00 3 555 3
lowQualScore : ..... . . . . . .. . . .... . ...... . . . . ............ .......... ....... ..... ......................................... ................ .. .... .. . ... .
lowQualScore : 77777 0 9 7 7 7 77 7 7 7777 0 888888 8 1 9 0 666666666666 5555555555 7777777 11111 88888888888888888888888888888888888888888 4444444444444444 99 5555 44 1 444 1
consensus : TCTGGTACATGATG----TATACANAA-ATATATGACAGACAGTGGTTTAG-TAATGATATNTAACAG-TTAC-A----ATGTTAGTTTCATGNTA------TAAATCGTATCGAATATAT-TTAAATTNAAGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAGAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAATA--TTCAAAAGTCATGTC----AG--AAAA-CAA---ATATAATGCAACATGA-TCTTACCTA
Reference ( family-839 ) : TCTGGTACATGATG----TATACANAA-ATATATGACAGACAGTGGTTTAG-TAATGATATNTAACAG-TTAC-A----ATGTTAGTTTCATGNTA------TAAATCGTATCGAATATAT-TTAAATTNAAGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAGAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAATA--TTCAAAAGTCATGTC----AG--AAAA-CAA---ATATAATGCAACATGA-TCTTACCTA
gi|34672 : TCTGCTACATGATG----TATGCACAA-ATATATGACAGAGAGTGGTTTAT-TAATGATAATAAACAG-T-AC-A----ATGTTATTTTCATGGTA------TAATTCATATAGAATACAT-TTAAATTTA-GTAA------------GGGTGAAAGT----------GGAGAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----C-A---AAAATA--TTCAAAAGTCATG-C----AG--AAAG-CAA---ATATAATGCAACATGA-TCTTACCTA
gi|34673 : TCTGGTACATGATG----TATGCACAG-CTATATGAAAGACAGTGGTTTAT-TAATATTAATAAACAG-TTAC-A----ATGTTAGTTTCATTTTA------TAAATCATATCGAATA-ATATTAAATTTAAGCAA------------GGGTGAAAGT----------GGAAAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----A-A---ATAATA--TTAAAAAGTCATGTC----AG--AAAG-CAA---ATATAATGTAACATGA-TCTTACCTA
gi|34674 : TCTGGTACATGATA----TATACACAC-ATATATGACAGACAGTTGTTTAA-TAATGATATTTAACAG-TCAC-A----ATGTTAGTTTCATGGTA------TAAATCGTATCGGATAAAT-TTAAATTTAAGCAA------------GGGTAAAAAT----------GGAGTAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAATG--TTCAAAATTCATGTC----AG--AAAC-CAA---ATATAATGCAACATTA-TCTTACCTA
gi|34675 : TCTGATGCATGATG----TATACACAA-ATATATGACAGATAGTGGTTTAT-TAATGATAATAAACAG-TAAC-A----ATGTTATTTTCATGGTA------TAAATCATATAAAATAAAT-TTAAATTTAAGCAA------------GTGTGAAATT----------GGAGAAGCTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-G---ATGATA--TTCAGAAATCATGTC----AG--AAAG-CAA---AACTAATGCAACATGA-TC
gi|34676 : TCTGGTAAATGATA----TATACAAAA-ACATATGGCAG-TAGTAGTTTAG-TAATGGTATGCAACAG-TTAC-A----ATATTAGTTTCATATTA------TAAATAATATAGAATGTAT-TAAAATTAAAGCAATGGTGAAAGTAAAGGTGAAAAT----------GGAGAAGGCG-------G-----TACACTGTTTCT----GCGTTTGT------------A------ACATAGTTA----T-A---ATATTA--TTCAAAAGTCATGTC----AGA-AAAA-CAG---ATATAATACAACATGA-TCTAATCT
gi|34677 : TCTGGTACATGACA----TATACAAAA-GC-T-TGACAGACAGTGGTTTAG-GAATGATATATAACAA-TCAC-A----ATATTTATGTCATGGTATACTAGTAAATCATATCGAAAATGT-TTTGATAAATGCCA------------AGTTGAACGT----------GAGGAAGGTGACCCGTTG-----TA---------TTGTCGT----ACTTCA--------A------ACA-----G----T-C---AAAAGA--TTCAAACATTATATC----AGT-AAAA-CAA---ATATAATATAACCTGA-TACTATCTA
gi|34678 : TCTGGTACATGATA----TATACAGAA-ACATGTGGTAGACAGTGGTTTAG-TAATGCTTTTTAACAG-TTAC-T----GTGTTAGTT
gi|34679 : TTTGGTACATGATT----TATACAAAA-GCATTTACCAGACTGTGTTTTGA-TAATGCTATATGATAG-TTAC-A----ATATTAGTTTCATGAT
gi|34680 : TCTGGTACACGATT----TATA--TTA-ATATAT---AGATAGTGTTTCAG-TAATGCTGTATAATAG-TAAA-A----ATAT----------------------ACCGTATCAAATATAC-TTAAACTGAGGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAGAAAGTG-------T-----TA---------CA---GT----AT------------G------TCA-----G----C-A---TCAACA--TT
gi|34681 : CTGGTACATGATG----TATACACAC-ATATATGGCAGACAGTGGTTCAT-TAATGATATTAAACAG-ATGC-A----ATGTTATTTTCATTGGA------TAAGTCATATCGAATAAAT-TTAAACTTAAGCAA------------GAGTGAAAGT----------TGGGACAGTA-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAACA--TTAAAAAGACATGTCATAAAA--AAAA-CAA---ATATAATGCAATATGA-TCTTACTTA
gi|34682 : CTGGTACATGATA----TATATAAAA-AGATATGAGAGACGGTGGTTAAG-AAATTATATCTGACAG-TT-----------------TCATGATA------TAAA----ATTGAATATAT-TTGAATTAAAGCAA------------TGGTGAAAGT----------GGAGAC--TG-------G-----TA---------T----GA----AA------------A------ACA-----G----T-T---ATAATA--TTAAAATGTTATGTC----AG--AAAG-CAA---ATAT-ATAC------A-TCTTACCTA
gi|34683 : CTGGTGCATGATT----TATACAAAT-TTATATGACAGACAGATTCTTAG-TAACGCAATGAAATAA-TTAC-A----ATGTTAGTTTTATGTTA------TAATTAGCAT----TATAT-----ATTAAAGCAA------------AAGTGACAGC----------GGGGAAGGTG-------G-----TA---------
gi|34684 : TAGTACATAAT------ATACAGAA-ACAAATGACAGACAGTGGTTTAG-TAATGATATTTAACAG-TTACTACGGTATATTAGTTTTACATTA------TACATCGTATCGAATATAT-TTAGATTAAAGCAA------------AGGTGAAAGTAAAGGTGAAAGGAGAAGGTG-------G-----TACACTGTTT-T----GC----ATTTGC--------A------ACA----------C-ATCTATAATA--TTCCAAAGTCATGTT----AG--AAAA-AAATATATATAATACAACATGA-TCTTACCTA
gi|34685 : CATGATGCTTGTATATACAGTGTATATGACAGA--GTG-TTAAG-TTATGATATATAATAG-TTAC-A----ATATTAGTTTCATGATA------TACATTGCATCAATTATAT-TTTAATTACAGCAA------------AGGAGAATGT----------GGAGATAGTG-------GGACACTATATT-----T----GC----GT------------ATGGTTTACA-----GTTTTT-G---ATATTAGTCTCGAAAGTCATGTA----AT--CAAA-CAA---ATAGAACACAATATTA-CCTT
gi|34686 : TATATGGCAGACAGTG-TTTAGGTAATGCTATATTATAGGTTA--------TTTCAGTTTCATGATA------TTAATTGTAACAAGTATAT-TTGAATTGAGGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAAAATGTG-------
gi|34687 : ATATAT-TTAAATTGAAGCAA------------AAGAGAAAGT----------GGAGAAGGTT-------G-----CA---------T----ACTT--ATTTTGCCCATGCAA------ACA-----G----TAA---ATGAGACTTTCAAAAGTCTTGTT----AGCAGAAA-C-A---TTATAATATAACCTGATTCTTGC
gi|34688 : atatat-------G-----TA---------T----GC----AA------------C------ACT-----G----T-T---ATACTA--CTCAAAAGTTATGTC----AG--AAAAACAA---ATATAATACAACGTAA-TCTTACCTA
gi|34689 : ---------T----GC----AT------------T------ATA-----G----T-A---ATAATA--TTCAAAAGT---GTC----AG--AAAC-CAA---ATATAACGCAACATGA-TCTTACCTA
blockSeqs : GCTTG C T G G T TA G T CGGT T TACTAG A A T TGGTGAAAGTAA AAAGGTGAAA ACCCGTT GACAC TACTTATTTTGCCCATGCAA TAGTTATA GT ATAA CA A TAT T
blockSeqs : G C . G . A TT . . . G . A . T . . . . CACTGTTTCTGCGTTTGTA GTTTTTG CT . A . . .
blockSeqs : A C . G . A TA . . . G . T . T . . . . CACTGTTTTGCATTTGCA CATCT . . T . . .
blockSeqs : G A . G . G GC . . . T . T . A . . . . TATTTGCGTATGGTTT GTAA . . . . . .
blockSeqs : A A . G . A AT . . . G . T . A . . . . TTGTCGTACTTCAA GAA . . . . . .
blockSeqs : A G . G . C TT . . . A . A . G . . . . CAGTATG GTA . . . . . .
blockSeqs : A A . T . C AT . . . G . T . T . . . . TGCATA GTG . . . . . .
blockSeqs : T T . T . C AT . . . A . T . A . . . . TGCATA GTC . . . . . .
blockSeqs : T C . G . A TA . . . T . T . A . . . . TGCATA GCA . . . . . .
blockSeqs : G A . G . A CT . . . T . T . A . . . . TGCATA GTA . . . . . .
blockSeqs : A A . T . C GA . . . A . T . A . . . . TGAAAA GTT . . . . . .
blockSeqs : T G . G . A TT . . . A . T . G . . . . TGCAAC GTT . . . . . .
blockSeqs : . C . . . A AT . . . . . . G . . . . TGCATT GTA .
blockSeqs : . . C AT . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TCTGGTACATGATG----TATACANAA-ATATATGACAGACAGTGGTTTAG-TAATGATATNTAACAG-TTAC-A----ATGTTAGTTTCATGNTA------TAAATCGTATCGAATATAT-TTAAATTNAAGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAGAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAATA--TTCAAAAGTCATGTC----AG--AAAA-CAA---ATATAATGCAACATGA-TCTTACCTA
finalCons : TCTGGTACATGATG----TATACANAA-ATATATGACAGACAGTGGTTTAG-TAATGATATNTAACAG-TTAC-A----ATGTTAGTTTCATGNTA------TAAATCGTATCGAATATAT-TTAAATTNAAGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAGAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAATA--TTCAAAAGTCATGTC----AG--AAAA-CAA---ATATAATGCAACATGA-TCTTACCTA
Alignments
lowQualScore : 11111 111111111111 1111111111 44444444444444444444444444444444444444444 1111111111111111 11
lowQualScore : 00000 1 2 1 2 1 11 2 2 5555 2 888888 0 1 2 1 444444444444 2222222222 8888888 77777 11111111111111111111111111111111111111111 0000000000000000 77 6666 00 3 555 3
lowQualScore : ..... . . . . . .. . . .... . ...... . . . . ............ .......... ....... ..... ......................................... ................ .. .... .. . ... .
lowQualScore : 77777 0 9 7 7 7 77 7 7 7777 0 888888 8 1 9 0 666666666666 5555555555 7777777 11111 88888888888888888888888888888888888888888 4444444444444444 99 5555 44 1 444 1
consensus : TCTGGTACATGATG----TATACANAA-ATATATGACAGACAGTGGTTTAG-TAATGATATNTAACAG-TTAC-A----ATGTTAGTTTCATGNTA------TAAATCGTATCGAATATAT-TTAAATTNAAGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAGAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAATA--TTCAAAAGTCATGTC----AG--AAAA-CAA---ATATAATGCAACATGA-TCTTACCTA
Reference ( family-839 ) : TCTGGTACATGATG----TATACANAA-ATATATGACAGACAGTGGTTTAG-TAATGATATNTAACAG-TTAC-A----ATGTTAGTTTCATGNTA------TAAATCGTATCGAATATAT-TTAAATTNAAGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAGAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAATA--TTCAAAAGTCATGTC----AG--AAAA-CAA---ATATAATGCAACATGA-TCTTACCTA
gi|34672 : TCTGCTACATGATG----TATGCACAA-ATATATGACAGAGAGTGGTTTAT-TAATGATAATAAACAG-T-AC-A----ATGTTATTTTCATGGTA------TAATTCATATAGAATACAT-TTAAATTTA-GTAA------------GGGTGAAAGT----------GGAGAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----C-A---AAAATA--TTCAAAAGTCATG-C----AG--AAAG-CAA---ATATAATGCAACATGA-TCTTACCTA
gi|34673 : TCTGGTACATGATG----TATGCACAG-CTATATGAAAGACAGTGGTTTAT-TAATATTAATAAACAG-TTAC-A----ATGTTAGTTTCATTTTA------TAAATCATATCGAATA-ATATTAAATTTAAGCAA------------GGGTGAAAGT----------GGAAAAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----A-A---ATAATA--TTAAAAAGTCATGTC----AG--AAAG-CAA---ATATAATGTAACATGA-TCTTACCTA
gi|34674 : TCTGGTACATGATA----TATACACAC-ATATATGACAGACAGTTGTTTAA-TAATGATATTTAACAG-TCAC-A----ATGTTAGTTTCATGGTA------TAAATCGTATCGGATAAAT-TTAAATTTAAGCAA------------GGGTAAAAAT----------GGAGTAGGTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAATG--TTCAAAATTCATGTC----AG--AAAC-CAA---ATATAATGCAACATTA-TCTTACCTA
gi|34675 : TCTGATGCATGATG----TATACACAA-ATATATGACAGATAGTGGTTTAT-TAATGATAATAAACAG-TAAC-A----ATGTTATTTTCATGGTA------TAAATCATATAAAATAAAT-TTAAATTTAAGCAA------------GTGTGAAATT----------GGAGAAGCTG-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-G---ATGATA--TTCAGAAATCATGTC----AG--AAAG-CAA---AACTAATGCAACATGA-TC
gi|34676 : TCTGGTAAATGATA----TATACAAAA-ACATATGGCAG-TAGTAGTTTAG-TAATGGTATGCAACAG-TTAC-A----ATATTAGTTTCATATTA------TAAATAATATAGAATGTAT-TAAAATTAAAGCAATGGTGAAAGTAAAGGTGAAAAT----------GGAGAAGGCG-------G-----TACACTGTTTCT----GCGTTTGT------------A------ACATAGTTA----T-A---ATATTA--TTCAAAAGTCATGTC----AGA-AAAA-CAG---ATATAATACAACATGA-TCTAATCT
gi|34677 : TCTGGTACATGACA----TATACAAAA-GC-T-TGACAGACAGTGGTTTAG-GAATGATATATAACAA-TCAC-A----ATATTTATGTCATGGTATACTAGTAAATCATATCGAAAATGT-TTTGATAAATGCCA------------AGTTGAACGT----------GAGGAAGGTGACCCGTTG-----TA---------TTGTCGT----ACTTCA--------A------ACA-----G----T-C---AAAAGA--TTCAAACATTATATC----AGT-AAAA-CAA---ATATAATATAACCTGA-TACTATCTA
gi|34678 : TCTGGTACATGATA----TATACAGAA-ACATGTGGTAGACAGTGGTTTAG-TAATGCTTTTTAACAG-TTAC-T----GTGTTAGTT
gi|34679 : TTTGGTACATGATT----TATACAAAA-GCATTTACCAGACTGTGTTTTGA-TAATGCTATATGATAG-TTAC-A----ATATTAGTTTCATGAT
gi|34680 : TCTGGTACACGATT----TATA--TTA-ATATAT---AGATAGTGTTTCAG-TAATGCTGTATAATAG-TAAA-A----ATAT----------------------ACCGTATCAAATATAC-TTAAACTGAGGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAGAAAGTG-------T-----TA---------CA---GT----AT------------G------TCA-----G----C-A---TCAACA--TT
gi|34681 : CTGGTACATGATG----TATACACAC-ATATATGGCAGACAGTGGTTCAT-TAATGATATTAAACAG-ATGC-A----ATGTTATTTTCATTGGA------TAAGTCATATCGAATAAAT-TTAAACTTAAGCAA------------GAGTGAAAGT----------TGGGACAGTA-------G-----TA---------T----GC----AT------------A------ACA-----G----T-A---ATAACA--TTAAAAAGACATGTCATAAAA--AAAA-CAA---ATATAATGCAATATGA-TCTTACTTA
gi|34682 : CTGGTACATGATA----TATATAAAA-AGATATGAGAGACGGTGGTTAAG-AAATTATATCTGACAG-TT-----------------TCATGATA------TAAA----ATTGAATATAT-TTGAATTAAAGCAA------------TGGTGAAAGT----------GGAGAC--TG-------G-----TA---------T----GA----AA------------A------ACA-----G----T-T---ATAATA--TTAAAATGTTATGTC----AG--AAAG-CAA---ATAT-ATAC------A-TCTTACCTA
gi|34683 : CTGGTGCATGATT----TATACAAAT-TTATATGACAGACAGATTCTTAG-TAACGCAATGAAATAA-TTAC-A----ATGTTAGTTTTATGTTA------TAATTAGCAT----TATAT-----ATTAAAGCAA------------AAGTGACAGC----------GGGGAAGGTG-------G-----TA---------
gi|34684 : TAGTACATAAT------ATACAGAA-ACAAATGACAGACAGTGGTTTAG-TAATGATATTTAACAG-TTACTACGGTATATTAGTTTTACATTA------TACATCGTATCGAATATAT-TTAGATTAAAGCAA------------AGGTGAAAGTAAAGGTGAAAGGAGAAGGTG-------G-----TACACTGTTT-T----GC----ATTTGC--------A------ACA----------C-ATCTATAATA--TTCCAAAGTCATGTT----AG--AAAA-AAATATATATAATACAACATGA-TCTTACCTA
gi|34685 : CATGATGCTTGTATATACAGTGTATATGACAGA--GTG-TTAAG-TTATGATATATAATAG-TTAC-A----ATATTAGTTTCATGATA------TACATTGCATCAATTATAT-TTTAATTACAGCAA------------AGGAGAATGT----------GGAGATAGTG-------GGACACTATATT-----T----GC----GT------------ATGGTTTACA-----GTTTTT-G---ATATTAGTCTCGAAAGTCATGTA----AT--CAAA-CAA---ATAGAACACAATATTA-CCTT
gi|34686 : TATATGGCAGACAGTG-TTTAGGTAATGCTATATTATAGGTTA--------TTTCAGTTTCATGATA------TTAATTGTAACAAGTATAT-TTGAATTGAGGCAA------------AGGTGAAAGT----------GGAAAATGTG-------
gi|34687 : ATATAT-TTAAATTGAAGCAA------------AAGAGAAAGT----------GGAGAAGGTT-------G-----CA---------T----ACTT--ATTTTGCCCATGCAA------ACA-----G----TAA---ATGAGACTTTCAAAAGTCTTGTT----AGCAGAAA-C-A---TTATAATATAACCTGATTCTTGC
gi|34688 : atatat-------G-----TA---------T----GC----AA------------C------ACT-----G----T-T---ATACTA--CTCAAAAGTTATGTC----AG--AAAAACAA---ATATAATACAACGTAA-TCTTACCTA
gi|34689 : ---------T----GC----AT------------T------ATA-----G----T-A---ATAATA--TTCAAAAGT---GTC----AG--AAAC-CAA---ATATAACGCAACATGA-TCTTACCTA