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blockSeqs                     :                     TTGTTTTACTACT CCTC CACG                                                 T     G                                       T             GTTTCG  T CTAGTA       A           G                 G                                            TC                          A  C                      T                    T         ACCATATTT
blockSeqs                     :                     TTGTTTTACTACT CGTC .                                                    .     A                                       .             .       . .            .           .                 G                                            .                           A  .                      .                    .         .        
blockSeqs                     :                     TTGTTTTACTACT .    .                                                    .     A                                       .             .       . .            .           .                 T                                            .                           T  .                      .                    .         .        
blockSeqs                     :                     ATGTTTTACTACC .    .                                                    .     A                                       .             .       . .            .           .                 T                                            .                           T  .                      .                    .         .        
blockSeqs                     :                     TTGTTTGAATACT .    .                                                    .     G                                       .             .       . .            .           .                 G                                            .                           A  .                      .                    .         .        
blockSeqs                     :                     TTGTTTTATTACT .    .                                                    .     G                                       .             .       . .            .           .                 T                                            .                           A  .                      .                    .         .        
blockSeqs                     :                     TTCTTTCACTACT .    .                                                    .     A                                       .             .       . .            .           .                 T                                            .                           A  .                      .                    .         .        
blockSeqs                     :                     TTGTTTTACTACT .    .                                                    .     A                                       .             .       . .            .           .                 G                                            .                           T  .                      .                    .         .        
blockSeqs                     :                     TTGTTTTACTGCT .    .                                                    .     T                                       .             .       . .            .           .                 T                                            .                           T  .                      .                    .         .        
blockSeqs                     :                     TTGTTTTACTGCA .    .                                                    .     A                                       .             .       . .            .           .                 G                                            .                           A  .                      .                    .         .        
blockSeqs                     :                     .             .    .                                                    .     A                                       .             .       . .            .           .                 G                                            .                           T  .                      .                    .         .        
blockSeqs                     :                     .             .    .                                                    .     A                                       .             .       . .            .           .                 T                                            .                           T  .                      .                    .         .        
blockSeqs                     :                     .             .    .                                                    .     A                                       .             .       . .            .           .                 A                                            .                           A  .                      .                    .         .        
blockSeqs                     :                     .             .    .                                                    .     A                                       .             .       . .            .           .                 G                                            .                           T  .                      .                    .         .        
blockSeqs                     :                     .             .    .                                                    .     .                                       .             .       . .            .           .                 A                                            .                           T  .                      .                                       
blockSeqs                     :                     .             .    .                                                    .     .                                       .             .       . .            .           .                 .                                            .                                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                         .       . .                                                                                                                                                                                     


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TGGTGCAGTCTATCTCTGTTTTGTTTTACTACTC----T----TGTCAAACTACATAATTTGTAATTAGTAATTAACTTTCACGTGGAATAG-AAAAAAGGTAAACGTAATGTTCATGTTAATGATAAGTAGACAGTT-GTCGTCATAATGA------AC-A------TGCTATT-ATTTGGTGGGG-TAGCGAACATGTTGGATNGAAAGAAGTTCCCTGAGAATGTCATATCATTATTTAAGCAGTGG--AGTTGTTTATGCGGAACATTTTAATANTA-AGAGTTGGAAACTGATCTAAAC-AATTTCGCTGAGAGAAGTAA-AACAACGAA---------GTAATGGGTAGATGATGT
finalCons                     : TGGTGCAGTCTATCTCTGTTTTGTTTTACTACTC----T----TGTCAAACTACATAATTTGTAATTAGTAATTAACTTTCACGTGGAATAG-AAAAAAGGTAAACGTAATGTTCATGTTAATGATAAGTAGACAGTT-GTCGTCATAATGA------AC-A------TGCTATT-ATTTGGTGGGG-TAGCGAACATGTTGGATNGAAAGAAGTTCCCTGAGAATGTCATATCATTATTTAAGCAGTGG--AGTTGTTTATGCGGAACATTTTAATANTA-AGAGTTGGAAACTGATCTAAAC-AATTTCGCTGAGAGAAGTAA-AACAACGAA---------GTAATGGGTAGATGATGT





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Reference ( family-837 )      : TGGTGCAGTCTATCTCTGTTTTGTTTTACTACTC----T----TGTCAAACTACATAATTTGTAATTAGTAATTAACTTTCACGTGGAATAG-AAAAAAGGTAAACGTAATGTTCATGTTAATGATAAGTAGACAGTT-GTCGTCATAATGA------AC-A------TGCTATT-ATTTGGTGGGG-TAGCGAACATGTTGGATNGAAAGAAGTTCCCTGAGAATGTCATATCATTATTTAAGCAGTGG--AGTTGTTTATGCGGAACATTTTAATANTA-AGAGTTGGAAACTGATCTAAAC-AATTTCGCTGAGAGAAGTAA-AACAACGAA---------GTAATGGGTAGATGATGT
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