lowQualScore : 3333333333333333 11111111 1111111111111111111 22222222 22222222222222222222222 222 11 1111 111 11111
lowQualScore : 0 3 3 8 5 3 4 5555555555555555 6666 3 444 444 8888 2 444 33 2 3 444 22222222 6666 0 6666 3333333333333333333 0 9 3 999 33 0 1 1 2 22222222 777 333 5555 5555 5555 3 66 66666666666666666666666 222 4 999 22 4 4444 55 444 00000 55
lowQualScore : . . . . . . . ................ .... . ... ... .... . ... .. . . ... ........ .... . .... ................... . . . ... .. . . . . ........ ... ... .... .... .... . .. ....................... ... . ... .. . .... .. ... ..... ..
lowQualScore : 2 3 3 8 0 4 0 6666666666666666 5555 7 777 777 3333 3 444 44 5 4 111 55555555 8888 9 5555 2222222222222222222 6 6 6 000 77 4 4 4 0 33333333 333 777 7777 7777 7777 3 33 99999999999999999999999 111 0 222 22 4 7777 22 666 77777 00
consensus : TGGATCCCCCATTT-G-TTGACNGACGANCAAAAG----C--GTGTACGNNTTG----AAACCGCCAGAA---A---A----CTGCTTAA---AA--T-GTTTCCGGAAT---AT--CAAAN-AAAGCAGTTTTC---TGACA----T-TG---TC-----ACTGGTGACGAAAC--NTGG--GTACACTTTTTCGAGCC--NA-CCAGAAAG---GTTGGCA----ACAAA----ATATG----GGCTACCAA--AAACNGTC------GNCGCCCCGCG-ATTG--CC-AAA-A-GA--TCG-A--TCAGTGCNAAGAAGGCGATGT-T---TGT-CATTTTCTTT
Reference ( gi|23226 ) : TGGATCCCTCATTT-G-TTGTCAGACAAGCAAAAG----C--GTGTCCGACTTG----AAACCGCCAGAA---A---A----CTGCTTAA---AA--T-GTTTCCAAAAT---AT--CAAAG-AAAGCAGTTTTC---TGACA----T-TA---TT-----ACTGGAGATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTTCGAGCC--TA-CCAGAAAA---ATTAACA----ACAAA----ATATG----GGCTACCAA--AAACTGTC------GCCGCCCCACA-ATTG--AC-AAA-A-GA--TTG-A--TCAGTGCTAAGAAAGCAATGT-T---TGT-TATTTTCTTT
gi|23227 : TGGATCCCTCATTT-G-TTGTCAGACAAGCAAAAG----C--GTGTCCCACTTG----AAACCGCCAGAA---A---A----CTGCTTAA---AA--T-GTTTCCAAAAT---AT--CAAAG-AAAGCAGTTTTC---TGACA----T-TA---TT-----ACTGGAGATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTTTGAGCC--TA-CCAGAAAA---ATTAACA----ACAAA----ATATG----GGCTACCAA--AAACTGTT------GCCGCCCCACA-ATTG--CC-AAA-A-GA--TTG-A--TCAGTGCTAAGAAAGCAATGT-T---TGT-TATTTTCTTT
gi|23228 : TGGATCCCTCATTT-G-TTGTCAAACAAGCAAAAG----C--GTGTCCGACTTG----AAACCGCCAGAA---A---A----CTGCTTAA---AA--T-GTTTCCAAAAT---AT--CAAAG-AAAGCAGTTTTC---TGACA----T-TA---TT-----ACTGGAGATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTTCGACCC--TA-CCAGAAAA---ATTAACA----AGAAA----ATATG----GGCTACCAA--AAACTGTC------GCCACCCCACA-ATTG--CCAAAA-A-GA--TTG-A--TCAGTGCTAAGAAAGCAATGT-T---TGT-TATTTTCTTT
gi|23229 : TGGATCCCTCATTT-G-CTGTCTGATGAACAGAA---------TG--CAAATAG----AAAAAGC--------A---A----CTGCTGAA---GA--A-GTTTCCAGAAT---AT--CAGAA-AAAGT-GTTT------GACAATT-T-CG---TA-----ACAGGTGATGAAAC--ATGG--GTCCATTTCTATGAGCC--CA-AGCGAAAA---GTTGATA----ACAGG----ATATG----GGCT--CAC--AAAC-ATCAAAAAAG--GCCCTGTA-A-TG--CC-AAA-T-GA--ACG-A--TGACGGCGAAGAAGG---TGT-TATACGC-CATATTCTTT
gi|23230 : TGGGTTCCCCATTT---TTGACTGACGACCAATAG----A--ATGT------TG----AAACTGCCAAAA---T---A----TTGCTTAA---AA--T-GTTCCCTGAAT---AT---AATC-AAA------TTCAATTGGCAAGTTT-TA---TC-----ACTGGTGACGAATCCGGTGACTGTTCACTATTTCGAACC--AA-TCCGAACA---GTTGGAA----ATAAA----ATATG----GGCCACCAA--A
gi|23231 : TGGATACCCCATTT-G-TTGACAAAAGAGAAGGAA----C--AAGTACGTGTTA----AAAAGGCCAGAA---A---A----TTATTGAA---GT--T-GTACCCGAAAT---GTGACAATA-ATAGTTTTTTTC---TGACA----T-AA---TA-----ACTGGTGATGACAG--TTGG--GTACACTTTTTTTAGCC--GA-AACGAAAGT--GTT---------CGAATCGTGTATA----GGCTACGAA--ACATGGTA------AGGGGCTAATT-ATTG--CC-AAACA-AA--CTGCA--ACGGTG--AAGAAAGTGTTGTAC---TGT-ATTTTTCTTcattacaaaaggccagtcattgcgatagggaacttgagtgtaaagaaggttatttatgcaattttctt
gi|23232 : TGGATTCCCCATTT-GCTTG-CAGATGAGCAGAAG----A--G-----GACATGTATAGAAGTGTCAAAA---A---A----TTACT-AA---AA--TCATTTCCAAAA----AT--C--AGTAAAATAACT------TGACA----TATGGCTTT-----ACAGGCGATGAAAT--CTGG--GTGTATTTCTATGACCC--AG-TTTGAAAC---AATGACA----ATAAG----ATATG----AGCCACAAA--ACACAATA------GACGAC---CA-ATTGTTGC-AAA-ACGAAGTCG-A----AGTGTGAAGACGG----GT-T---TGTATATTTTTT
gi|23233 : TGGGTGCCCCATTTTG-TTAACTGACGGTCAAAAGAAGTC--ATGT--G--TTG----AAACTGCCAAAATAAA---A----CTGATTAA---AA--T-GTTCCCTGAAT---AT--CACCA-AAGGCAATTTGC---AACCT----T-TG---TC-----ATTTGTGACGAAAG--CTGT--GTATACTATTTCGAACA--AA-TGTGAAAG---GTTGGGA----ACAAA----CTACA----GG-TACCGGT-AAACAATC------G
gi|23234 : GATCCCCCACTT-G-CTGACACATGACCGAAAGGC--CAAGTGTTTAGATTG--------TGCTAAAA---A---A----CTTCTGAA---AAATT-GT------AAT----C--CTAAG-AAAA----TTTC---TGAC-----T-TAC--TC-----ACTAGGGATGAAAC--TTTG--GTTTATTATTCTGGGC------CCAAACGGTTCATTAATA----ACAAA----CAATGACTTGG-TAATAATCAGACTA-A------GCCGGTC-----ATAG---C-AAAGA-GG--TCA-A--GAAGCGCCAAGAAGGTTTTAT-A---TGC-CACTTTCTTT
gi|23235 : CCCCACTT-G-TTGACTGACGACCTAAAG----A--AGGCACGTGTTG----AAACTGCCAAAA---A---AT---CTGCTTAA---AA--T-ATGCCCTGAATATAAT--CAAAG----GCAATTTGCA--TG-TT----T-TG---TC-----ACTGGTGACGAAAC--CTGG--GTACACTATTTCGAAC-------------A---AGTGCGA----ACAAA----ATACA----GGC--CCGA--AA
gi|23236 : CCCCATTT-G-TTGACTGACTACTAAAAG----A--AGGCACATGTTG----AAACTGCCAAAA---G---A----CTGCTT-A---AA--T-ATTCCTTGAAT---AT---AACC-AAGACAATTTGC---AAATT----T-TG---TC-----ACAGGTGACGAAACT-ATGcatggcagaaggccagtcattgccaaacggaccttgagtgtaaagaa
gi|23237 : CTCACTT-G-TTGACTGACGACCAAAAG----A--AGGCACGTGTTG----AAACTGCCAAAA---A---AAAAACTGCTTAA---AA--T-GTTCCCTGAAT---AT--AACAA-AAGGCGATTTGC---AAATT----T-TG---CC-----GCTGGTGACGAAAC--CTGG--ATACACTATTTGTAACCAGTA-C--GAAAG---GTTGGGA----ACAAA----ATATG----GGCCACCAA--ACA-TGTCA-----GACGGCCAGTC-ATTG--CC-AAA-
gi|23238 : CTCATTT-G-CTGTCTGATGAACAGAAA----C--GCACAAGAATGC----AAATC---AGAA---AGCAA----CCACTGAA---GA--A-GTTTCCAGAAT---AT--CAGAA-AAA--AGTGTT----TGACA-------A---TTTCGCAACAGGTGATGAAAC--ATGG--GTCCATTTCTATGTGCCC-TA-GCA-AAAA---GTTGACA----ACTGG----ATATG----GGCT--CAC--AAAC
gi|23239 : GTCAGACAAGCAAAAG----C--GTGTCCGACTTG----AAACTGCCAGAA---A---A----CTGCTTAA---AA--T-GTTTCAAAAAT---AT--CAAAA-AAAGCAGTTTTC---TGACA----T-TA---TT-----ACTGGATATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTTCGAGCC--TA-CCAGAAAA---ATTAACA----ACAAA----ATATG----GGCTACCAA--AAACTGTT------GCTGCCCTACA-ATTG--CC-AAA-A-GA--TTG-A--TCAGTGCTAAGAAAGCAATGT-T---TGT-TATTTTCTTTatcataaaaggcccagtattgctaaaggaacgat
gi|23239 : GTCAGAA---A---A----CTGCTTTTTTTGA--T-ATTTTTGAAAC---AT--T---T-TAAGCAGTTTTC---TGGCA----
gi|23241 : gtcagacaagcaaaagcgtgtccgacttgaaac---A---A----CTGCTGAG---AA--T-GTATCCGAAA---------------AACTCGCTTTG---AGA-A----T-TAAA-TA-----ACGGTTGACGAAAC--ATGG--G-ACATTTGTT--A--T--TAGCCAAAAAG---AAGAGCATCTTACAGA----ATCTG----GGCCACGTA--AAATGAGA------GACGCCC-ATGTATTT--CC-AAA-T-GA--TTG-AGATC--TGATAAGAAAGTGATGT-A---TG--CATTTTCTTTattattactggatatgagacatgggtacactttttcgagcctaccagaaaaattaacaacaaaatatgggctaccaaaaactgttgctgccctacaattgccaaaagattgatcagtgctaagaaagcaatgtttgttattttcttt
gi|23242 : AA---CA--T-GTTT--AAAAC---AT--TAAAT-AA-------CTG---TGATT----T-GG---TT-----ACAGGAGATGAAAC--GCGG--GTTCACCATTTCGAGCC--CC-TTAGAAAG---ATTGGCA----AACAA----ATATG----GACAACCAA--ATA--GAG------AATACCTTGT--ATCG--CC-AAA-A-TAACTTA-A----ATTGTGAAGAAGGTGATGT-T---TGT-CATTTTCTTT
gi|23243 : AAAT---TT--GATAA-AAGGAAGTTTTC---AAACA----T-TG---TC-----ACTAGCTACGAAAC--GTGG--ATACACTTTTACGAACCA-CA-TC-GGAAA---GTTATCA----ACCGT----GTATG----GGC-AACAA--AA
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|23240 ): AGAAATTCGGACAGCTTAAAATTTTCCCTGAACATAACCAACGTCCATTTGCAAATTGTGTCACTGGTGGCGAAACCTGGGTACACTATTTCGAACCAGTGCGAAAGGTTAGAAACAAAATATGGACCACCAGACAAGTGGAAGGCCAGTCATTGTCAAACGGACATTGAGTGTAAAGAACATTGTTTATGCAATTTTCTT
Alignments
lowQualScore : 1111111 11111 111111111 2222222 11111111111111 22222 111111111111111111 111
lowQualScore : 3 2 1 1 5555555 77 44 22 444 00000 7777 33 2 88 8 2 1 333333333 888888 99999 2 999 666666 1 444 33 1 0 0000000 33 7777777 22 5555 2 4 33 55555555555555 00000 2 44 888888888888888888 44 2 666 44 000
lowQualScore : . . . . ....... .. .. .. ... ..... .... .. . .. . . . ......... ...... ..... . ... ...... . ... .. . . ....... .. ....... .. .... . . .. .............. ..... . .. .................. .. . ... .. ...
lowQualScore : 1 2 0 0 0000000 11 00 88 444 66666 8888 22 4 88 1 4 0 444444444 444444 66666 2 222 444444 2 222 22 7 1 0000000 22 9999999 66 0000 7 7 44 11111111111111 44444 7 77 333333333333333333 00 2 777 22 888
consensus : TGGATCCCCCATTT-GTTGNCNGACGANCAAAAG--C--GNGT-ACGNGTTGAAACCGCCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTCCCNGAATATCA-AANAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TG---T--C---ACTGGTGACGAAACN--TGG--GTACACTTTTTCGAGCC--NACCNG--AAAG-G----TTGGCA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACNGTC----GANGNCCCGTN-ATTGCC-AAA-NGA--TC--G-A---TC---AGTGCNAAGAAGGCGATGT-TTGT-C-ATTTTCTTT
Reference ( family-831 ) : TGGATCCCCCATTT-GTTGACNGACGANCAAAAG--C--GTGT-ACGNNTTGAAACCGCCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCCGGAATATCA-AANAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TG---T--C---ACTGGTGACGAAACN--TGG--GTACACTTTTTCGAGCC--NACCAG--AAAG-G----TTGGCA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACNGTC----GNCGCCCCGCG-ATTGCC-AAA-AGA--TC--G-A---TC---AGTGCNAAGAAGGCGATGT-TTGT-C-ATTTTCTTT
gi|23226 : TGGATCCCTCATTT-GTTGTCAGACAAGCAAAAG--C--GTGT-CCGACTTGAAACCGCCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCCAAAATATCA-AAGAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGAGATGAGACA--TGG--GTACACTTTTTCGAGCC--TACCAG--AAAA-A----TTAACA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTC----GCCGCCCCACA-ATTGAC-AAA-AGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23227 : TGGATCCCTCATTT-GTTGTCAGACAAGCAAAAG--C--GTGT-CCCACTTGAAACCGCCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCCAAAATATCA-AAGAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGAGATGAGACA--TGG--GTACACTTTTTTGAGCC--TACCAG--AAAA-A----TTAACA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTT----GCCGCCCCACA-ATTGCC-AAA-AGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23228 : TGGATCCCTCATTT-GTTGTCAAACAAGCAAAAG--C--GTGT-CCGACTTGAAACCGCCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCCAAAATATCA-AAGAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGAGATGAGACA--TGG--GTACACTTTTTCGACCC--TACCAG--AAAA-A----TTAACA----AGAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTC----GCCACCCCACA-ATTGCCAAAA-AGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23229 : TGGATCCCTCATTT-GCTGTCTGATGAACAGAA---------T-GCAAATAGAAAAAGC--------A-----A----CTGCTGAAGA--A-GTTTCCAGAATATCA-GAAAA-A-G--T-GTTT------GACAATT-T-CG---T--A---ACAGGTGATGAAACA--TGG--GTCCATTTCTATGAGCC--CAAGCG--AAAA-G----TTGATA----ACAGGATATGGGCT--CAC-AA-ACA-TCAAAAAAGGCCCTGTA-A-TGCC-AAA-TGA--AC--G-A---TG---ACGGCGAAGAAGGTGTTAT-ACGC-C-ATATTCTTT
gi|23230 : TGGGTTCCCCATTT--TTGACTGACGACCAATAG--A--ATGT-------TGAAACTGCCAAAA---T-----A----TTGCTTAAAA--T-GTTCCCTGAATAT-A-ATCAA-A---------TTCAATTGGCAAGTTT-TA---T--C---ACTGGTGACGAATCCGGTGACTGTTCACTATTTCGAACC--AATCCG--AACA-G----TTGGAA----ATAAAATATGGGCCACCAA-AC-ATTACA----AAAGGCCAGTC-ATTGCG-ATA-GG-------G-AACTTG---AGTGTAAAGAAGGTTATTT-ATGC-A-ATTTTCTT
gi|23231 : TGGATACCCCATTT-GTTGACAAAAGAGAAGGAA--C--AAGT-ACGTGTTAAAAAGGCCAGAA---A-----A----TTATTGAAGT--T-GTACCCGAAATGTGACAATAATA-G--TTTTTTTC---TGACA----T-AA---T--A---ACTGGTGATGACAGT--TGG--GTACACTTTTTTTAGCC--GAAACG--AAAGTG----TTCG-A----ATCGTGTATAGGCTACGAA-AC-ATGGTA----AGGGGCTAATT-ATTGCC-AAACAAA--CT--GCA---AC---GGTG--AAGAAAGTGTTGTACTGT-A-TTTTTCTT
gi|23232 : TGGATTCCCCATTT-GCTTGCAGATGAGCAGAAG--A--GGAC-ATGTATAGAAG-TGTCAAAA---A-----A----TTAC-TAAAA--TCATTTCCAAAA-ATC--AGTAA-A-A--TAACT------TGACA----TATGGCTT--T---ACAGGCGATGAAATC--TGG--GTGTATTTCTATGACCC--AGTTTG--AAAC-A----ATGACA----ATAAGATATGAGCCACAAA-AC-ACAATA----GACGACCAATT-GTTGCA-AAA-CGAAGTC--G-A--------AGTGTGAAGACGG----GT-TTGTAT-ATTTTTT
gi|23233 : TGGGTGCCCCATTTTGTTAACTGACGGTCAAAAG--A--A-GTCATGTGTTGAAACTGCCAAAATAAA-----A----CTGATTAAAA--T-GTTCCCTGAATATCA-CCAAA-G-G--CAATTTGC---AACCT----T-TG---T--C---ATTTGTGACGAAAGC--TGT--GTATACTATTTCGAACA--AATGTG--AAAG-G----TTGGGA----ACAAACTACAGG-TACCGGTAA-ACAATC----G
gi|23234 : GATCCCCCACTT-GCTGACACATGACCGAAAGGCCAAGTGT-TTAGATTG----TGCTAAAA---A-----A----CTTCTGAAAAATT-GT------AATCCTA-AGAAA-A--------TTTC---TGAC-----T-TAC--T--C---ACTAGGGATGAAACT--TTG--GTTTATTATTCTGGGCC--CA------AACG-GTTCATTAATA----ACAAACAATGACTTGGTAATAA-TCAGAC----TAAG-CCGGTC-ATAGCA-AAG-AGG--TC--A-A---GA---AGCGCCAAGAAGGTTTTAT-ATGC-C-ACTTTCTTT
gi|23235 : CCCCACTT-GTTGACTGACGACCTAAAG--A--AGGC-ACGTGTTGAAACTGCCAAAA---A-----AT---CTGCTTAAAA--T-ATGCCCTGAATAT-A-ATCAA-AGG--CAATTTGCA--TG-TT----T-TG---T--C---ACTGGTGACGAAACC--TGG--GTACACTATTTCGAAC------------AAG-------TGCGA----ACAAAATACAGGC--CCGA-AACATGGCA----GAAGGCCAGTC-ATTGCC-AAA-CG-------G-A---CCTTGAGTGTAAAGAA
gi|23236 : CCCCATTT-GTTGACTGACTACTAAAAG--A--AGGC-ACATGTTGAAACTGCCAAAA---G-----A----CTGCTT-AAA--T-ATTCCTTGAATAT-A-ACCAA-G-A--CAATTTGC---AAATT----T-TG---T--C---ACAGGTGACGAAAC
gi|23237 : CTCACTT-GTTGACTGACGACCAAAAG--A--AGGC-ACGTGTTGAAACTGCCAAAA---A-----AAAAACTGCTTAAAA--T-GTTCCCTGAATATAA-CAAAA-G-G--CGATTTGC---AAATT----T-TG---C--C---GCTGGTGACGAAACC--TGG--ATACACTATTTGTAACCAGTAC--G--AAAG-G----TTGGGA----ACAAAATATGGGCCACCAA-AC-A-TGTCA---GACGGCCAGTC-ATTGCC-AAA-tatg
gi|23238 : CTCATTT-GCTGTCTGATGAACAGAAA--C--GCAC-AAGAATGCAAATC---AGAA---AGCA--A----CCACTGAAGA--A-GTTTCCAGAATATCA-GAAAA-A-----AGTGTT----TGACA----A-TT---T--CGCAACAGGTGATGAAACA--TGG--GTCCATTTCTATGTGCC----CTAGCAAAAA-G----TTGACA----ACTGGATATGGGCTCACAA-AC-ATCATA----AAAGGCCCAGT-ATTGCT-AAA-GGA--AC--G-A---T
gi|23239 : CAGACAAGCAAAAG--C--GTGT-CCGACTTGAAACTGCCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCAAAAATATCA-AAAAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGATATGAGACA--TGG--GTACACTTTTTCGAGCC--TACCAG--AAAA-A----TTAACA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTT----GCTGCCCTACA-ATTGCC-AAA-AGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23240 : gtAGAA---ATTCGGA----CAGCTTAAAA--T-TTTCCCTGAACAT-A-ACCAA-C-GTCCA-TTTGC-----AAA----T-TG---TGTC---ACTGGTGGCGAAACC--TGG--GTACACTATTTCGAACC--AGTGCG--AAAG-G----TTAGAA----ACAAAATATGGACCACCAG-AC-A-AGTG----GAAGGCCAGTC-ATTGTC-AAA-CGG--AC--A-T---TG---AGTGTAAAGAA--CATTGT-TTATGCAATTTTCTT
gi|23241 : ---A-----A----CTGCTGAGAA--T-GTATCCG----------AAAA-A-C--TCGCTTTG---AGA-A----T-TAAA-T--A---ACGGTTGACGAAACA--TGG--G-ACATTTGTT---ATT--AGCCAA--AAAG-A----AGAGCATCTTACAGAATCTGGGCCACGTA-AA-ATGAGA----GACG-CCCATGTATTTCC-AAA-TGA--TTGAG-A---TC-----TGATAAGAAAGTGATGT-ATG--C-ATTTTCTTT
gi|23242 : AACA--T-GTTT--AAAACATTA-AATAA-----------CTG---TGATT----T-GG---T--T---ACAGGAGATGAAACG--CGG--GTTCACCATTTCGAGCC--CCTTAG--AAAG-A----TTGGCA----AACAAATATGGACAACCAA-AT-AGAG------AATACCTTGT--ATCGCC-AAA-ATAACTT--A-A--------ATTGTGAAGAAGGTGATGT-TTGT-C-ATTTTCTTT
gi|23243 : AAAA-G-G--AAGTTTTC---AAACA----T-TG---T--C---ACTAGCTACGAAACG--TGG--ATACACTTTTACGAACCA-CATCGG--AAA--G----TTATCA----ACCGTGTATGGGC-AACAA-AA-
Alignments
lowQualScore : 11111111 11111 111111111 111111 111111111 222222222222222222 111
lowQualScore : 3 1 1 1 2 00000000 33 2 33 444 00000 7777 33 2 0 2 6 2 1 333333333 888888 99999 2 999 666666 1 444 33 1 2 999999 33 7777777 22 5555 2 4 33 333333333 1 6 4 66 2 1 000000000000000000 44 2 666 44 000
lowQualScore : . . . . . ........ .. . .. ... ..... .... .. . . . . . . ......... ...... ..... . ... ...... . ... .. . . ...... .. ....... .. .... . . .. ......... . . . .. . . .................. .. . ... .. ...
lowQualScore : 1 0 0 0 9 11111111 22 7 99 444 66666 8888 22 4 5 6 6 4 0 444444444 444444 66666 2 222 444444 2 111 22 7 4 333333 22 9999999 66 0000 7 7 44 333333333 0 2 9 33 7 0 888888888888888888 00 2 777 22 888
consensus : TGGATCCCCCATTT-GTTGNCNGACGANCAAAA-GCGNGC-ACGTGTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTCCCNGAATATCA-AANAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TG---T--C---ACTGGTGACGAAAC--NTGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-NACCNG--AAAG-G----TTGGCA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACNGTC----GANGNCCCGT-NATTGCC-AAANGA--TC--G-A---TC---AGTGCNAAGAAGGCGATGT-TTGT-C-ATTTTCTTT
Reference ( family-831 ) : TGGATCCCCCATTT-GTTGNCNGACGANCAAAA-GCGNGT-ACGNGTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTCCCNGAATATCA-AANAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TG---T--C---ACTGGTGACGAAAC--NTGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-NACCNG--AAAG-G----TTGGCA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACNGTC----GANGNCCCGT-NATTGCC-AAANGA--TC--G-A---TC---AGTGCNAAGAAGGCGATGT-TTGT-C-ATTTTCTTT
gi|23226 : TGGATCCCTCATTT-GTTGTCAGACAAGCAAAA-GCGTGT-CCGACTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCCAAAATATCA-AAGAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGAGATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-TACCAG--AAAA-A----TTAACA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTC----GCCGCCCCAC-AATTGAC-AAAAGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23227 : TGGATCCCTCATTT-GTTGTCAGACAAGCAAAA-GCGTGT-CCCACTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCCAAAATATCA-AAGAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGAGATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTT-TGAGCC-TACCAG--AAAA-A----TTAACA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTT----GCCGCCCCAC-AATTGCC-AAAAGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23228 : TGGATCCCTCATTT-GTTGTCAAACAAGCAAAA-GCGTGT-CCGACTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCCAAAATATCA-AAGAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGAGATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTT-CGACCC-TACCAG--AAAA-A----TTAACA----AGAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTC----GCCACCCCAC-AATTGCCAAAAAGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23229 : TGGATCCCTCATTT-GCTGTCTGATGAACAGAATGCAAAT-A------GAAAAAG--C--------A-----A----CTGCTGAAGA--A-GTTTCCAGAATATCA-GAAAA-A-G--T-GTTT------GACAATT-T-CG---T--A---ACAGGTGATGAAAC--ATGG--GTCCATTTCTA-TGAGCC-CAAGCG--AAAA-G----TTGATA----ACAGGATATGGGCT--CAC-AA-ACA-TCAAAAAAGGCCCTGT-AA-TGCC-AAATGA--AC--G-A---TG---ACGGCGAAGAAGGTGTTAT-ACGC-C-ATATTCTTT
gi|23230 : TGGGTTCCCCATTT--TTGACTGACGACCAATA-G------A-ATGTTGAAACTG--CCAAAA---T-----A----TTGCTTAAAA--T-GTTCCCTGAATAT-A-ATCAA-A---------TTCAATTGGCAAGTTT-TA---T--C---ACTGGTGACGAATCCGGTGACTGTTCACTATTT-CGAACC-AATCCG--AACA-G----TTGGAA----ATAAAATATGGGCCACCAA-AC-ATTACA----AAAGGCCAGT-CATTGCG-ATAGG-------G-AACTTG---AGTGTAAAGAAGGTTATTT-ATGC-A-ATTTTCTT
gi|23231 : TGGATACCCCATTT-GTTGACAAAAGAGAAGGA-ACAAGT-ACGTGTTAAAAAGG--CCAGAA---A-----A----TTATTGAAGT--T-GTACCCGAAATGTGACAATAATA-G--TTTTTTTC---TGACA----T-AA---T--A---ACTGGTGATGACAG--TTGG--GTACACTTTTT-TTAGCC-GAAACG--AAAGTG----TTCG-A----ATCGTGTATAGGCTACGAA-AC-ATGGTA----AGGGGCTAAT-TATTGCC-AAACAA--ACT-GCA---AC---GGTG--AAGAAAGTGTTGTACTGT-A-TTTTTCTT
gi|23232 : TGGATTCCCCATTT-GCTTGCAGATGAGCAGAA-GAGGAC-ATGTATAGAAG-TG--TCAAAA---A-----A----TTAC-TAAAA--TCATTTCCAAAA-ATC--AGTAA-A-A--TAACT------TGACA----TATGGCTT--T---ACAGGCGATGAAAT--CTGG--GTGTATTTCTA-TGACCC-AGTTTG--AAAC-A----ATGACA----ATAAGATATGAGCCACAAA-AC-ACAATA----GACGACCAAT-TGTTGCA-AAACGAAGTC--G-A--------AGTGTGAAGACGG----GT-TTGTAT-ATTTTTT
gi|23233 : TGGGTGCCCCATTTTGTTAACTGACGGTCAAAA-G-AAGTCATGTGTTGAAACTG--CCAAAATAAA-----A----CTGATTAAAA--T-GTTCCCTGAATATCA-CCAAA-G-G--CAATTTGC---AACCT----T-TG---T--C---ATTTGTGACGAAAG--CTGT--GTATACTATTT-CGAACA-AATGTG--AAAG-G----TTGGGA----ACAAACTACAGG-TACCGGTAA-ACAATC----G
gi|23234 : GATCCCCCACTT-GCTGACACATGACCGAAA-G-GC-C-AAGTGTTTAGATTGTGCTAAAA---A-----A----CTTCTGAAAAATT-GT------AATCCTA-AGAAA-A--------TTTC---TGAC-----T-TAC--T--C---ACTAGGGATGAAAC--TTTG--GTTTATTATTC-TGGGCC-CA------AACG-GTTCATTAATA----ACAAACAATGACTTGGTAATAA-TCAGAC----TAAG-CCGGT-CATAGCA-AAGAGG--TC--A-A---GA---AGCGCCAAGAAGGTTTTAT-ATGC-C-ACTTTCTTT
gi|23235 : CCCCACTT-GTTGACTGACGACCTAAA-GAAGGC-ACGTGTTGAAACTG--CCAAAA---A-----AT---CTGCTTAAAA--T-ATGCCCTGAATAT-A-ATCAA-AGG--CAATTTGCA--TG-TT----T-TG---T--C---ACTGGTGACGAAAC--CTGG--GTACACTATTT-CGAAC-----------AAG-------TGCGA----ACAAAATACAGGC--CCGA-AACATGGCA----GAAGGCCAGT-CATTGCC-AAACG-------G-A---CCTTGAGTGTAAAGAA
gi|23236 : CCCCATTT-GTTGACTGACTACTAAAA-GAAGGC-ACATGTTGAAACTG--CCAAAA---G-----A----CTGCTT-AAA--T-ATTCCTTGAATAT-A-ACCAA-G-A--CAATTTGC---AAATT----T-TG---T--C---ACAGGTGACGAAAC--
gi|23237 : CTCACTT-GTTGACTGACGACCAAAA-GAAGGC-ACGTGTTGAAACTG--CCAAAA---A-----AAAAACTGCTTAAAA--T-GTTCCCTGAATATAA-CAAAA-G-G--CGATTTGC---AAATT----T-TG---C--C---GCTGGTGACGAAAC--CTGG--ATACACTATTT-GTAACC-AGTACG--AAAG-G----TTGGGA----ACAAAATATGGGCCACCAA-AC-A-TGTCA---GACGGCCAGT-CATTGCC-AAAtatg
gi|23238 : CTCATTT-GCTGTCTGATGAACAGAA-ACGCAC-AAGAATGCAAATC-----AGAA---AGCA--A----CCACTGAAGA--A-GTTTCCAGAATATCA-GAAAA-A-----AGTGTT----TGACA----A-TT---T--CGCAACAGGTGATGAAAC--ATGG--GTCCATTTCTA-TGTGCC---CTAGCAAAAA-G----TTGACA----ACTGGATATGGGCTCACAA-AC-ATCATA----AAAGGCCCAG-TATTGCT-AAAGGA--AC--G-A---T
gi|23239 : GTCAGACAAGCAAAA-GCGTGT-CCGACTTGAAACTG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCAAAAATATCA-AAAAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGATATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-TACCAG--AAAA-A----TTAACA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTT----GCTGCCCTAC-AATTGCC-AAAAGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23240 : AGAA---ATTCGGA----CAGCTTAAAA--T-TTTCCCTGAACAT-A-ACCAA-C-GTCCA-TTTGC-----AAA----T-TG---TGTC---ACTGGTGGCGAAAC--CTGG--GTACACTATTT-CGAACC-AGTGCG--AAAG-G----TTAGAA----ACAAAATATGGACCACCAG-AC-A-AGTG----GAAGGCCAGT-CATTGTC-AAACGG--AC--A-T---TG---AGTGTAAAGAA--CATTGT-TTATGCAATTTTCTT
gi|23241 : ---A-----A----CTGCTGAGAA--T-GT---------ATCC-GAAAA-A-C--TCGCTTTG---AGA-A----T-TAAA-T--A---ACGGTTGACGAAAC--ATGG--G-ACATTTGTTATTAGCC-AA------AAAG-A----AGAGCATCTTACAGAATCTGGGCCACGTA-AA-ATGAGA----GACG-CCCATGTATTTCC-AAATGA--TTGAG-A---TC-----TGATAAGAAAGTGATGT-ATG--C-ATTTTCTTT
gi|23242 : AACA--T-GTTT--AAAACATTA-AATAA-----------CTG---TGATT----T-GG---T--T---ACAGGAGATGAAAC--GCGG--GTTCACCATTT-CGAGCC-CCTTAG--AAAG-A----TTGGCA----AACAAATATGGACAACCAA-AT-AGAG------AATACCTTGT--ATCGCC-AAAATAACTT--A-A--------ATTGTGAAGAAGGTGATGT-TTGT-C-ATTTTCTTT
gi|23243 : AAAA-G-G--AAGTTTTC---AAACA----T-TG---T--C---ACTAGCTACGAAAC--GTGG--ATACACTTTTA-CGAACCACATCGG--AAA--G----TTATCA----ACCGTGTATGGGC-AACAA-AA-
Alignments
lowQualScore : 1111111 11111 111111111 111111 111111111 222222222222222222 111
lowQualScore : 3 1 1 1 3333333 1 00 2 33 444 00000 7777 33 2 0 2 6 2 1 333333333 888888 99999 2 999 666666 1 444 33 1 2 999999 33 7777777 22 5555 2 4 33 333333333 1 6 4 66 2 1 000000000000000000 44 2 666 44 000
lowQualScore : . . . . ....... . .. . .. ... ..... .... .. . . . . . . ......... ...... ..... . ... ...... . ... .. . . ...... .. ....... .. .... . . .. ......... . . . .. . . .................. .. . ... .. ...
lowQualScore : 1 0 0 0 6666666 2 77 7 99 444 66666 8888 22 4 5 6 6 4 0 444444444 444444 66666 2 222 444444 2 111 22 7 4 333333 22 9999999 66 0000 7 7 44 333333333 0 2 9 33 7 0 888888888888888888 00 2 777 22 888
consensus : TGGATCCCCCATTT-GTTGNCNGACGANCAAAAGCGNG---CACGTGTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTCCCNGAATATCA-AANAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TG---T--C---ACTGGTGACGAAAC--NTGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-NACCNG--AAAG-G----TTGGCA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACNGTC----GANGNCCCGT-NATTGCC-AAANGA--TC--G-A---TC---AGTGCNAAGAAGGCGATGT-TTGT-C-ATTTTCTTT
Reference ( family-831 ) : TGGATCCCCCATTT-GTTGNCNGACGANCAAAAGCGNG---CACGTGTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTCCCNGAATATCA-AANAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TG---T--C---ACTGGTGACGAAAC--NTGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-NACCNG--AAAG-G----TTGGCA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACNGTC----GANGNCCCGT-NATTGCC-AAANGA--TC--G-A---TC---AGTGCNAAGAAGGCGATGT-TTGT-C-ATTTTCTTT
gi|23226 : TGGATCCCTCATTT-GTTGTCAGACAAGCAAAAGCGTG---TCCGACTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCCAAAATATCA-AAGAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGAGATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-TACCAG--AAAA-A----TTAACA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTC----GCCGCCCCAC-AATTGAC-AAAAGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23227 : TGGATCCCTCATTT-GTTGTCAGACAAGCAAAAGCGTGTCCCAC---TTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCCAAAATATCA-AAGAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGAGATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTT-TGAGCC-TACCAG--AAAA-A----TTAACA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTT----GCCGCCCCAC-AATTGCC-AAAAGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23228 : TGGATCCCTCATTT-GTTGTCAAACAAGCAAAAGCGTG---TCCGACTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCCAAAATATCA-AAGAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGAGATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTT-CGACCC-TACCAG--AAAA-A----TTAACA----AGAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTC----GCCACCCCAC-AATTGCCAAAAAGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23229 : TGGATCCCTCATTT-GCTGTCTGATGAACAGAA---TG---CAAATA--GAAAAAG--C--------A-----A----CTGCTGAAGA--A-GTTTCCAGAATATCA-GAAAA-A-G--T-GTTT------GACAATT-T-CG---T--A---ACAGGTGATGAAAC--ATGG--GTCCATTTCTA-TGAGCC-CAAGCG--AAAA-G----TTGATA----ACAGGATATGGGCT--CAC-AA-ACA-TCAAAAAAGGCCCTGT-AA-TGCC-AAATGA--AC--G-A---TG---ACGGCGAAGAAGGTGTTAT-ACGC-C-ATATTCTTT
gi|23230 : TGGGTTCCCCATTT--TTGACTGACGACCAATAG--------A-ATGTTGAAACTG--CCAAAA---T-----A----TTGCTTAAAA--T-GTTCCCTGAATAT-A-ATCAA-A---------TTCAATTGGCAAGTTT-TA---T--C---ACTGGTGACGAATCCGGTGACTGTTCACTATTT-CGAACC-AATCCG--AACA-G----TTGGAA----ATAAAATATGGGCCACCAA-AC-ATTACA----AAAGGCCAGT-CATTGCG-ATAGG-------G-AACTTG---AGTGTAAAGAAGGTTATTT-ATGC-A-ATTTTCTT
gi|23231 : TGGATACCCCATTT-GTTGACAAAAGAGAAGGAACAAG---TACGTGTTAAAAAGG--CCAGAA---A-----A----TTATTGAAGT--T-GTACCCGAAATGTGACAATAATA-G--TTTTTTTC---TGACA----T-AA---T--A---ACTGGTGATGACAG--TTGG--GTACACTTTTT-TTAGCC-GAAACG--AAAGTG----TTCG-A----ATCGTGTATAGGCTACGAA-AC-ATGGTA----AGGGGCTAAT-TATTGCC-AAACAA--ACT-GCA---AC---GGTG--AAGAAAGTGTTGTACTGT-A-TTTTTCTT
gi|23232 : TGGATTCCCCATTT-GCTTGCAGATGAGCAGAAGAGGA---CATGTATAGAAG-TG--TCAAAA---A-----A----TTAC-TAAAA--TCATTTCCAAAA-ATC--AGTAA-A-A--TAACT------TGACA----TATGGCTT--T---ACAGGCGATGAAAT--CTGG--GTGTATTTCTA-TGACCC-AGTTTG--AAAC-A----ATGACA----ATAAGATATGAGCCACAAA-AC-ACAATA----GACGACCAAT-TGTTGCA-AAACGAAGTC--G-A--------AGTGTGAAGACGG----GT-TTGTAT-ATTTTTT
gi|23233 : TGGGTGCCCCATTTTGTTAACTGACGGTCAAAAGAAGT---CATGTGTTGAAACTG--CCAAAATAAA-----A----CTGATTAAAA--T-GTTCCCTGAATATCA-CCAAA-G-G--CAATTTGC---AACCT----T-TG---T--C---ATTTGTGACGAAAG--CTGT--GTATACTATTT-CGAACA-AATGTG--AAAG-G----TTGGGA----ACAAACTACAGG-TACCGGTAA-ACAATC----G
gi|23234 : GATCCCCCACTT-GCTGACACATGACCGAAAG-GC----CAAGTGTTTAGATTGTGCTAAAA---A-----A----CTTCTGAAAAATT-GT------AATCCTA-AGAAA-A--------TTTC---TGAC-----T-TAC--T--C---ACTAGGGATGAAAC--TTTG--GTTTATTATTC-TGGGCC-CA------AACG-GTTCATTAATA----ACAAACAATGACTTGGTAATAA-TCAGAC----TAAG-CCGGT-CATAGCA-AAGAGG--TC--A-A---GA---AGCGCCAAGAAGGTTTTAT-ATGC-C-ACTTTCTTT
gi|23235 : CCCCACTT-GTTGACTGACGACCTAAAGAAGG---CACGTGTTGAAACTG--CCAAAA---A-----AT---CTGCTTAAAA--T-ATGCCCTGAATAT-A-ATCAA-AGG--CAATTTGCA--TG-TT----T-TG---T--C---ACTGGTGACGAAAC--CTGG--GTACACTATTT-CGAAC-----------AAG-------TGCGA----ACAAAATACAGGC--CCGA-AACATGGCA----GAAGGCCAGT-CATTGCC-AAACG-------G-A---CCTTGAGTGTAAAGAA
gi|23236 : CCCCATTT-GTTGACTGACTACTAAAAGAAGG---CACATGTTGAAACTG--CCAAAA---G-----A----CTGCTT-AAA--T-ATTCCTTGAATAT-A-ACCAA-G-A--CAATTTGC---AAATT----T-TG---T--C---ACAGGTGACGAAAC--
gi|23237 : CTCACTT-GTTGACTGACGACCAAAAGAAGG---CACGTGTTGAAACTG--CCAAAA---A-----AAAAACTGCTTAAAA--T-GTTCCCTGAATATAA-CAAAA-G-G--CGATTTGC---AAATT----T-TG---C--C---GCTGGTGACGAAAC--CTGG--ATACACTATTT-GTAACC-AGTACG--AAAG-G----TTGGGA----ACAAAATATGGGCCACCAA-AC-A-TGTCA---GACGGCCAGT-CATTGCC-AAAtatg
gi|23238 : CTCATTT-GCTGTCTGATGAACAGAAACGCA---CAAGAATGCAAATC-----AGAA---AGCA--A----CCACTGAAGA--A-GTTTCCAGAATATCA-GAAAA-A-----AGTGTT----TGACA----A-TT---T--CGCAACAGGTGATGAAAC--ATGG--GTCCATTTCTA-TGTGCC---CTAGCAAAAA-G----TTGACA----ACTGGATATGGGCTCACAA-AC-ATCATA----AAAGGCCCAG-TATTGCT-AAAGGA--AC--G-A---T
gi|23239 : GTCAGACAAGCAAAAGCGTG---TCCGACTTGAAACTG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCAAAAATATCA-AAAAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGATATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-TACCAG--AAAA-A----TTAACA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTT----GCTGCCCTAC-AATTGCC-AAAAGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23240 : AGAA---ATTCGGA----CAGCTTAAAA--T-TTTCCCTGAACAT-A-ACCAA-C-GTCCA-TTTGC-----AAA----T-TG---TGTC---ACTGGTGGCGAAAC--CTGG--GTACACTATTT-CGAACC-AGTGCG--AAAG-G----TTAGAA----ACAAAATATGGACCACCAG-AC-A-AGTG----GAAGGCCAGT-CATTGTC-AAACGG--AC--A-T---TG---AGTGTAAAGAA--CATTGT-TTATGCAATTTTCTT
gi|23241 : ---A-----A----CTGCTGAGAA--T-GT---------ATCC-GAAAA-A-C--TCGCTTTG---AGA-A----T-TAAA-T--A---ACGGTTGACGAAAC--ATGG--G-ACATTTGTTATTAGCC-AA------AAAG-A----AGAGCATCTTACAGAATCTGGGCCACGTA-AA-ATGAGA----GACG-CCCATGTATTTCC-AAATGA--TTGAG-A---TC-----TGATAAGAAAGTGATGT-ATG--C-ATTTTCTTT
gi|23242 : AACA--T-GTTT--AAAACATTA-AATAA-----------CTG---TGATT----T-GG---T--T---ACAGGAGATGAAAC--GCGG--GTTCACCATTT-CGAGCC-CCTTAG--AAAG-A----TTGGCA----AACAAATATGGACAACCAA-AT-AGAG------AATACCTTGT--ATCGCC-AAAATAACTT--A-A--------ATTGTGAAGAAGGTGATGT-TTGT-C-ATTTTCTTT
gi|23243 : AAAA-G-G--AAGTTTTC---AAACA----T-TG---T--C---ACTAGCTACGAAAC--GTGG--ATACACTTTTA-CGAACCACATCGG--AAA--G----TTATCA----ACCGTGTATGGGC-AACAA-AA-
Alignments
lowQualScore : 1111111 11111 111111111 111111 111111111 222222222222222222 111
lowQualScore : 3 1 1 1 3333333 1 00 2 33 444 00000 7777 33 2 0 2 6 2 1 333333333 888888 99999 2 999 666666 1 444 33 1 2 999999 33 7777777 22 5555 2 4 33 333333333 1 6 4 66 2 1 000000000000000000 44 2 666 44 000
lowQualScore : . . . . ....... . .. . .. ... ..... .... .. . . . . . . ......... ...... ..... . ... ...... . ... .. . . ...... .. ....... .. .... . . .. ......... . . . .. . . .................. .. . ... .. ...
lowQualScore : 1 0 0 0 6666666 2 77 7 99 444 66666 8888 22 4 5 6 6 4 0 444444444 444444 66666 2 222 444444 2 111 22 7 4 333333 22 9999999 66 0000 7 7 44 333333333 0 2 9 33 7 0 888888888888888888 00 2 777 22 888
consensus : TGGATCCCCCATTT-GTTGNCNGACGANCAAAAGCGNG---CACGTGTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTCCCNGAATATCA-AANAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TG---T--C---ACTGGTGACGAAAC--NTGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-NACCNG--AAAG-G----TTGGCA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACNGTC----GANGNCCCGT-NATTGCC-AAANGA--TC--G-A---TC---AGTGCNAAGAAGGCGATGT-TTGT-C-ATTTTCTTT
Reference ( family-831 ) : TGGATCCCCCATTT-GTTGNCNGACGANCAAAAGCGNG---CACGTGTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTCCCNGAATATCA-AANAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TG---T--C---ACTGGTGACGAAAC--NTGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-NACCNG--AAAG-G----TTGGCA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACNGTC----GANGNCCCGT-NATTGCC-AAANGA--TC--G-A---TC---AGTGCNAAGAAGGCGATGT-TTGT-C-ATTTTCTTT
gi|23226 : TGGATCCCTCATTT-GTTGTCAGACAAGCAAAAGCGTG---TCCGACTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCCAAAATATCA-AAGAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGAGATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-TACCAG--AAAA-A----TTAACA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTC----GCCGCCCCAC-AATTGAC-AAAAGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23227 : TGGATCCCTCATTT-GTTGTCAGACAAGCAAAAGCGTGTCCCAC---TTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCCAAAATATCA-AAGAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGAGATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTT-TGAGCC-TACCAG--AAAA-A----TTAACA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTT----GCCGCCCCAC-AATTGCC-AAAAGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23228 : TGGATCCCTCATTT-GTTGTCAAACAAGCAAAAGCGTG---TCCGACTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCCAAAATATCA-AAGAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGAGATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTT-CGACCC-TACCAG--AAAA-A----TTAACA----AGAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTC----GCCACCCCAC-AATTGCCAAAAAGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23229 : TGGATCCCTCATTT-GCTGTCTGATGAACAGAA---TG---CAAATA--GAAAAAG--C--------A-----A----CTGCTGAAGA--A-GTTTCCAGAATATCA-GAAAA-A-G--T-GTTT------GACAATT-T-CG---T--A---ACAGGTGATGAAAC--ATGG--GTCCATTTCTA-TGAGCC-CAAGCG--AAAA-G----TTGATA----ACAGGATATGGGCT--CAC-AA-ACA-TCAAAAAAGGCCCTGT-AA-TGCC-AAATGA--AC--G-A---TG---ACGGCGAAGAAGGTGTTAT-ACGC-C-ATATTCTTT
gi|23230 : TGGGTTCCCCATTT--TTGACTGACGACCAATAG--------A-ATGTTGAAACTG--CCAAAA---T-----A----TTGCTTAAAA--T-GTTCCCTGAATAT-A-ATCAA-A---------TTCAATTGGCAAGTTT-TA---T--C---ACTGGTGACGAATCCGGTGACTGTTCACTATTT-CGAACC-AATCCG--AACA-G----TTGGAA----ATAAAATATGGGCCACCAA-AC-ATTACA----AAAGGCCAGT-CATTGCG-ATAGG-------G-AACTTG---AGTGTAAAGAAGGTTATTT-ATGC-A-ATTTTCTT
gi|23231 : TGGATACCCCATTT-GTTGACAAAAGAGAAGGAACAAG---TACGTGTTAAAAAGG--CCAGAA---A-----A----TTATTGAAGT--T-GTACCCGAAATGTGACAATAATA-G--TTTTTTTC---TGACA----T-AA---T--A---ACTGGTGATGACAG--TTGG--GTACACTTTTT-TTAGCC-GAAACG--AAAGTG----TTCG-A----ATCGTGTATAGGCTACGAA-AC-ATGGTA----AGGGGCTAAT-TATTGCC-AAACAA--ACT-GCA---AC---GGTG--AAGAAAGTGTTGTACTGT-A-TTTTTCTT
gi|23232 : TGGATTCCCCATTT-GCTTGCAGATGAGCAGAAGAGGA---CATGTATAGAAG-TG--TCAAAA---A-----A----TTAC-TAAAA--TCATTTCCAAAA-ATC--AGTAA-A-A--TAACT------TGACA----TATGGCTT--T---ACAGGCGATGAAAT--CTGG--GTGTATTTCTA-TGACCC-AGTTTG--AAAC-A----ATGACA----ATAAGATATGAGCCACAAA-AC-ACAATA----GACGACCAAT-TGTTGCA-AAACGAAGTC--G-A--------AGTGTGAAGACGG----GT-TTGTAT-ATTTTTT
gi|23233 : TGGGTGCCCCATTTTGTTAACTGACGGTCAAAAGAAGT---CATGTGTTGAAACTG--CCAAAATAAA-----A----CTGATTAAAA--T-GTTCCCTGAATATCA-CCAAA-G-G--CAATTTGC---AACCT----T-TG---T--C---ATTTGTGACGAAAG--CTGT--GTATACTATTT-CGAACA-AATGTG--AAAG-G----TTGGGA----ACAAACTACAGG-TACCGGTAA-ACAATC----G
gi|23234 : GATCCCCCACTT-GCTGACACATGACCGAAAG-GC----CAAGTGTTTAGATTGTGCTAAAA---A-----A----CTTCTGAAAAATT-GT------AATCCTA-AGAAA-A--------TTTC---TGAC-----T-TAC--T--C---ACTAGGGATGAAAC--TTTG--GTTTATTATTC-TGGGCC-CA------AACG-GTTCATTAATA----ACAAACAATGACTTGGTAATAA-TCAGAC----TAAG-CCGGT-CATAGCA-AAGAGG--TC--A-A---GA---AGCGCCAAGAAGGTTTTAT-ATGC-C-ACTTTCTTT
gi|23235 : CCCCACTT-GTTGACTGACGACCTAAAGAAGG---CACGTGTTGAAACTG--CCAAAA---A-----AT---CTGCTTAAAA--T-ATGCCCTGAATAT-A-ATCAA-AGG--CAATTTGCA--TG-TT----T-TG---T--C---ACTGGTGACGAAAC--CTGG--GTACACTATTT-CGAAC-----------AAG-------TGCGA----ACAAAATACAGGC--CCGA-AACATGGCA----GAAGGCCAGT-CATTGCC-AAACG-------G-A---CCTTGAGTGTAAAGAA
gi|23236 : CCCCATTT-GTTGACTGACTACTAAAAGAAGG---CACATGTTGAAACTG--CCAAAA---G-----A----CTGCTT-AAA--T-ATTCCTTGAATAT-A-ACCAA-G-A--CAATTTGC---AAATT----T-TG---T--C---ACAGGTGACGAAAC--
gi|23237 : CTCACTT-GTTGACTGACGACCAAAAGAAGG---CACGTGTTGAAACTG--CCAAAA---A-----AAAAACTGCTTAAAA--T-GTTCCCTGAATATAA-CAAAA-G-G--CGATTTGC---AAATT----T-TG---C--C---GCTGGTGACGAAAC--CTGG--ATACACTATTT-GTAACC-AGTACG--AAAG-G----TTGGGA----ACAAAATATGGGCCACCAA-AC-A-TGTCA---GACGGCCAGT-CATTGCC-AAAtatg
gi|23238 : CTCATTT-GCTGTCTGATGAACAGAAACGCA---CAAGAATGCAAATC-----AGAA---AGCA--A----CCACTGAAGA--A-GTTTCCAGAATATCA-GAAAA-A-----AGTGTT----TGACA----A-TT---T--CGCAACAGGTGATGAAAC--ATGG--GTCCATTTCTA-TGTGCC---CTAGCAAAAA-G----TTGACA----ACTGGATATGGGCTCACAA-AC-ATCATA----AAAGGCCCAG-TATTGCT-AAAGGA--AC--G-A---T
gi|23239 : GTCAGACAAGCAAAAGCGTG---TCCGACTTGAAACTG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCAAAAATATCA-AAAAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGATATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-TACCAG--AAAA-A----TTAACA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTT----GCTGCCCTAC-AATTGCC-AAAAGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23240 : AGAA---ATTCGGA----CAGCTTAAAA--T-TTTCCCTGAACAT-A-ACCAA-C-GTCCA-TTTGC-----AAA----T-TG---TGTC---ACTGGTGGCGAAAC--CTGG--GTACACTATTT-CGAACC-AGTGCG--AAAG-G----TTAGAA----ACAAAATATGGACCACCAG-AC-A-AGTG----GAAGGCCAGT-CATTGTC-AAACGG--AC--A-T---TG---AGTGTAAAGAA--CATTGT-TTATGCAATTTTCTT
gi|23241 : ---A-----A----CTGCTGAGAA--T-GT---------ATCC-GAAAA-A-C--TCGCTTTG---AGA-A----T-TAAA-T--A---ACGGTTGACGAAAC--ATGG--G-ACATTTGTTATTAGCC-AA------AAAG-A----AGAGCATCTTACAGAATCTGGGCCACGTA-AA-ATGAGA----GACG-CCCATGTATTTCC-AAATGA--TTGAG-A---TC-----TGATAAGAAAGTGATGT-ATG--C-ATTTTCTTT
gi|23242 : AACA--T-GTTT--AAAACATTA-AATAA-----------CTG---TGATT----T-GG---T--T---ACAGGAGATGAAAC--GCGG--GTTCACCATTT-CGAGCC-CCTTAG--AAAG-A----TTGGCA----AACAAATATGGACAACCAA-AT-AGAG------AATACCTTGT--ATCGCC-AAAATAACTT--A-A--------ATTGTGAAGAAGGTGATGT-TTGT-C-ATTTTCTTT
gi|23243 : AAAA-G-G--AAGTTTTC---AAACA----T-TG---T--C---ACTAGCTACGAAAC--GTGG--ATACACTTTTA-CGAACCACATCGG--AAA--G----TTATCA----ACCGTGTATGGGC-AACAA-AA-
blockSeqs : T T A G CGTGTCC C C TG TAA TTCGG AAAA AT C A C C G TAGTTT TCAATT AAGTT A GCT CGCA A CGG CT T A ACATCG CA GGTTCA AC TCTT T T AC CATCAAAA C C C GT A A AACTGCAAC CT A CAA AC GCA
blockSeqs : . T A G CGTG C C . . GCA T . . A C . G AGGCAA GCAT AATT . AA GTC A A . T . TACCA . GTG AC . T T A CTGTT C C C A . A ATTGAGATC CT A CAA T AT
blockSeqs : . T T A CAAG A A . . . . . . A C . A CGTCCA TCT A . C T T A . T . TACCA . AA AT . T . A CTGTC G C T A . T ATTGATC CG G TGT T T
blockSeqs : . A T C AGGA C T . . . . . . T G . C AGCAG TCT A . . T T A . A . CAAGC . AA GA . C . A TTACA A G A A . G ATTGATC TA G TTA A T
blockSeqs : . A A G AAGT T G . . . . . . G C . T AGCAG TCT A . . A T T . T . AATCC . AG AC . T . C TGGTA G G A C . C AACGATG TG A TGT A C
blockSeqs : . G A G AAGG T T . . . . . . A C . T AATAA GCA A . . C C C . T . GAAAC . AG GG . C . C CAATA C A A T . C GAACTTG CC G TTT T A
blockSeqs : . A T T AAGG A T . . . . . . T T . A GGCAA TCT T . . A T C . A . AGTTT . CA AT . T . C CAATC A G G T . A AAGTCGA TA G CAA A A
blockSeqs : . A A C AAGG C T . . . . . . T A . A GACAA GCA T . . T G T . A . AATGT . GG CG . T . A CAGAC A G A C . C GTCAAGA CT A CAT T C
blockSeqs : . A T C CGCA C T . . . . . . T C . C GGCGA GCA T . . C T C . A . AGTAC . GG GG . C . A TGGCA C G A C . G GACCTTG TA A TGA T T
blockSeqs : . A T C CGTG C T . . . . . . T C . C AGCAG TCT T . . C T C . A . TACCA . AG AC . T . C TGTCA A C C C . A ATTGATC AT G TGA A C
blockSeqs : . A T C TG A T . . . . . . A C . A ACTCG TGA A . . C T A . T . AGTGC . AA AC . T . C TCATA T G T T . C GACATTG TG . . T C
blockSeqs : . T T A GC C C . . . . . . A T . A GGAAG TGT A . . C T A . T . CCTTA . GG GA . C . A CTGTT A C A A . T AACTTAA .
blockSeqs : T A G . . T . . . . . . T . . A AGTG TCA A . . C A C . A . CTA . GA GC . C . C TGAGA C . C C . A
blockSeqs : . . . . . A . . C AAG TT A . . T T A . T . CA . GA GC . A . A AGTG T . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . A A GC T . . A T G . A . AA . G TC . . . T GAG
blockSeqs : . . . . . T A T A . . T A G . T . . . G G . . . A
blockSeqs : A . . . . . C C
blockSeqCons :
originalCons : TGGATCCCCCATTT-GTTGNCNGACGANCAAAAGCGNG---CACGTGTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTCCCNGAATATCA-AANAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TG---T--C---ACTGGTGACGAAAC--NTGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-NACCNG--AAAG-G----TTGGCA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACNGTC----GANGNCCCGT-NATTGCC-AAANGA--TC--G-A---TC---AGTGCNAAGAAGGCGATGT-TTGT-C-ATTTTCTTT
finalCons : TGGATCCCCCATTT-GTTGNCNGACGANCAAAAGCGNG---CACGTGTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTCCCNGAATATCA-AANAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TG---T--C---ACTGGTGACGAAAC--NTGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-NACCNG--AAAG-G----TTGGCA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACNGTC----GANGNCCCGT-NATTGCC-AAANGA--TC--G-A---TC---AGTGCNAAGAAGGCGATGT-TTGT-C-ATTTTCTTT
Alignments
lowQualScore : 1111111 11111 111111111 111111 111111111 222222222222222222 111
lowQualScore : 3 1 1 1 3333333 1 00 2 33 444 00000 7777 33 2 0 2 6 2 1 333333333 888888 99999 2 999 666666 1 444 33 1 2 999999 33 7777777 22 5555 2 4 33 333333333 1 6 4 66 2 1 000000000000000000 44 2 666 44 000
lowQualScore : . . . . ....... . .. . .. ... ..... .... .. . . . . . . ......... ...... ..... . ... ...... . ... .. . . ...... .. ....... .. .... . . .. ......... . . . .. . . .................. .. . ... .. ...
lowQualScore : 1 0 0 0 6666666 2 77 7 99 444 66666 8888 22 4 5 6 6 4 0 444444444 444444 66666 2 222 444444 2 111 22 7 4 333333 22 9999999 66 0000 7 7 44 333333333 0 2 9 33 7 0 888888888888888888 00 2 777 22 888
consensus : TGGATCCCCCATTT-GTTGNCNGACGANCAAAAGCGNG---CACGTGTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTCCCNGAATATCA-AANAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TG---T--C---ACTGGTGACGAAAC--NTGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-NACCNG--AAAG-G----TTGGCA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACNGTC----GANGNCCCGT-NATTGCC-AAANGA--TC--G-A---TC---AGTGCNAAGAAGGCGATGT-TTGT-C-ATTTTCTTT
Reference ( family-831 ) : TGGATCCCCCATTT-GTTGNCNGACGANCAAAAGCGNG---CACGTGTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTCCCNGAATATCA-AANAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TG---T--C---ACTGGTGACGAAAC--NTGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-NACCNG--AAAG-G----TTGGCA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACNGTC----GANGNCCCGT-NATTGCC-AAANGA--TC--G-A---TC---AGTGCNAAGAAGGCGATGT-TTGT-C-ATTTTCTTT
gi|23226 : TGGATCCCTCATTT-GTTGTCAGACAAGCAAAAGCGTG---TCCGACTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCCAAAATATCA-AAGAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGAGATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-TACCAG--AAAA-A----TTAACA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTC----GCCGCCCCAC-AATTGAC-AAAAGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23227 : TGGATCCCTCATTT-GTTGTCAGACAAGCAAAAGCGTGTCCCAC---TTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCCAAAATATCA-AAGAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGAGATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTT-TGAGCC-TACCAG--AAAA-A----TTAACA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTT----GCCGCCCCAC-AATTGCC-AAAAGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23228 : TGGATCCCTCATTT-GTTGTCAAACAAGCAAAAGCGTG---TCCGACTTGAAACCG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCCAAAATATCA-AAGAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGAGATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTT-CGACCC-TACCAG--AAAA-A----TTAACA----AGAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTC----GCCACCCCAC-AATTGCCAAAAAGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23229 : TGGATCCCTCATTT-GCTGTCTGATGAACAGAA---TG---CAAATA--GAAAAAG--C--------A-----A----CTGCTGAAGA--A-GTTTCCAGAATATCA-GAAAA-A-G--T-GTTT------GACAATT-T-CG---T--A---ACAGGTGATGAAAC--ATGG--GTCCATTTCTA-TGAGCC-CAAGCG--AAAA-G----TTGATA----ACAGGATATGGGCT--CAC-AA-ACA-TCAAAAAAGGCCCTGT-AA-TGCC-AAATGA--AC--G-A---TG---ACGGCGAAGAAGGTGTTAT-ACGC-C-ATATTCTTT
gi|23230 : TGGGTTCCCCATTT--TTGACTGACGACCAATAG--------A-ATGTTGAAACTG--CCAAAA---T-----A----TTGCTTAAAA--T-GTTCCCTGAATAT-A-ATCAA-A---------TTCAATTGGCAAGTTT-TA---T--C---ACTGGTGACGAATCCGGTGACTGTTCACTATTT-CGAACC-AATCCG--AACA-G----TTGGAA----ATAAAATATGGGCCACCAA-AC-ATTACA----AAAGGCCAGT-CATTGCG-ATAGG-------G-AACTTG---AGTGTAAAGAAGGTTATTT-ATGC-A-ATTTTCTT
gi|23231 : TGGATACCCCATTT-GTTGACAAAAGAGAAGGAACAAG---TACGTGTTAAAAAGG--CCAGAA---A-----A----TTATTGAAGT--T-GTACCCGAAATGTGACAATAATA-G--TTTTTTTC---TGACA----T-AA---T--A---ACTGGTGATGACAG--TTGG--GTACACTTTTT-TTAGCC-GAAACG--AAAGTG----TTCG-A----ATCGTGTATAGGCTACGAA-AC-ATGGTA----AGGGGCTAAT-TATTGCC-AAACAA--ACT-GCA---AC---GGTG--AAGAAAGTGTTGTACTGT-A-TTTTTCTT
gi|23232 : TGGATTCCCCATTT-GCTTGCAGATGAGCAGAAGAGGA---CATGTATAGAAG-TG--TCAAAA---A-----A----TTAC-TAAAA--TCATTTCCAAAA-ATC--AGTAA-A-A--TAACT------TGACA----TATGGCTT--T---ACAGGCGATGAAAT--CTGG--GTGTATTTCTA-TGACCC-AGTTTG--AAAC-A----ATGACA----ATAAGATATGAGCCACAAA-AC-ACAATA----GACGACCAAT-TGTTGCA-AAACGAAGTC--G-A--------AGTGTGAAGACGG----GT-TTGTAT-ATTTTTT
gi|23233 : TGGGTGCCCCATTTTGTTAACTGACGGTCAAAAGAAGT---CATGTGTTGAAACTG--CCAAAATAAA-----A----CTGATTAAAA--T-GTTCCCTGAATATCA-CCAAA-G-G--CAATTTGC---AACCT----T-TG---T--C---ATTTGTGACGAAAG--CTGT--GTATACTATTT-CGAACA-AATGTG--AAAG-G----TTGGGA----ACAAACTACAGG-TACCGGTAA-ACAATC----G
gi|23234 : GATCCCCCACTT-GCTGACACATGACCGAAAG-GC----CAAGTGTTTAGATTGTGCTAAAA---A-----A----CTTCTGAAAAATT-GT------AATCCTA-AGAAA-A--------TTTC---TGAC-----T-TAC--T--C---ACTAGGGATGAAAC--TTTG--GTTTATTATTC-TGGGCC-CA------AACG-GTTCATTAATA----ACAAACAATGACTTGGTAATAA-TCAGAC----TAAG-CCGGT-CATAGCA-AAGAGG--TC--A-A---GA---AGCGCCAAGAAGGTTTTAT-ATGC-C-ACTTTCTTT
gi|23235 : CCCCACTT-GTTGACTGACGACCTAAAGAAGG---CACGTGTTGAAACTG--CCAAAA---A-----AT---CTGCTTAAAA--T-ATGCCCTGAATAT-A-ATCAA-AGG--CAATTTGCA--TG-TT----T-TG---T--C---ACTGGTGACGAAAC--CTGG--GTACACTATTT-CGAAC-----------AAG-------TGCGA----ACAAAATACAGGC--CCGA-AACATGGCA----GAAGGCCAGT-CATTGCC-AAACG-------G-A---CCTTGAGTGTAAAGAA
gi|23236 : CCCCATTT-GTTGACTGACTACTAAAAGAAGG---CACATGTTGAAACTG--CCAAAA---G-----A----CTGCTT-AAA--T-ATTCCTTGAATAT-A-ACCAA-G-A--CAATTTGC---AAATT----T-TG---T--C---ACAGGTGACGAAAC--
gi|23237 : CTCACTT-GTTGACTGACGACCAAAAGAAGG---CACGTGTTGAAACTG--CCAAAA---A-----AAAAACTGCTTAAAA--T-GTTCCCTGAATATAA-CAAAA-G-G--CGATTTGC---AAATT----T-TG---C--C---GCTGGTGACGAAAC--CTGG--ATACACTATTT-GTAACC-AGTACG--AAAG-G----TTGGGA----ACAAAATATGGGCCACCAA-AC-A-TGTCA---GACGGCCAGT-CATTGCC-AAAtatg
gi|23238 : CTCATTT-GCTGTCTGATGAACAGAAACGCA---CAAGAATGCAAATC-----AGAA---AGCA--A----CCACTGAAGA--A-GTTTCCAGAATATCA-GAAAA-A-----AGTGTT----TGACA----A-TT---T--CGCAACAGGTGATGAAAC--ATGG--GTCCATTTCTA-TGTGCC---CTAGCAAAAA-G----TTGACA----ACTGGATATGGGCTCACAA-AC-ATCATA----AAAGGCCCAG-TATTGCT-AAAGGA--AC--G-A---T
gi|23239 : GTCAGACAAGCAAAAGCGTG---TCCGACTTGAAACTG--CCAGAA---A-----A----CTGCTTAAAA--T-GTTTCAAAAATATCA-AAAAA-A-G--CAGTTTTC---TGACA----T-TA---T--T---ACTGGATATGAGAC--ATGG--GTACACTTTTT-CGAGCC-TACCAG--AAAA-A----TTAACA----ACAAAATATGGGCTACCAA-AA-ACTGTT----GCTGCCCTAC-AATTGCC-AAAAGA--TT--G-A---TC---AGTGCTAAGAAAGCAATGT-TTGT-T-ATTTTCTTT
gi|23240 : AGAA---ATTCGGA----CAGCTTAAAA--T-TTTCCCTGAACAT-A-ACCAA-C-GTCCA-TTTGC-----AAA----T-TG---TGTC---ACTGGTGGCGAAAC--CTGG--GTACACTATTT-CGAACC-AGTGCG--AAAG-G----TTAGAA----ACAAAATATGGACCACCAG-AC-A-AGTG----GAAGGCCAGT-CATTGTC-AAACGG--AC--A-T---TG---AGTGTAAAGAA--CATTGT-TTATGCAATTTTCTT
gi|23241 : ---A-----A----CTGCTGAGAA--T-GT---------ATCC-GAAAA-A-C--TCGCTTTG---AGA-A----T-TAAA-T--A---ACGGTTGACGAAAC--ATGG--G-ACATTTGTTATTAGCC-AA------AAAG-A----AGAGCATCTTACAGAATCTGGGCCACGTA-AA-ATGAGA----GACG-CCCATGTATTTCC-AAATGA--TTGAG-A---TC-----TGATAAGAAAGTGATGT-ATG--C-ATTTTCTTT
gi|23242 : AACA--T-GTTT--AAAACATTA-AATAA-----------CTG---TGATT----T-GG---T--T---ACAGGAGATGAAAC--GCGG--GTTCACCATTT-CGAGCC-CCTTAG--AAAG-A----TTGGCA----AACAAATATGGACAACCAA-AT-AGAG------AATACCTTGT--ATCGCC-AAAATAACTT--A-A--------ATTGTGAAGAAGGTGATGT-TTGT-C-ATTTTCTTT
gi|23243 : AAAA-G-G--AAGTTTTC---AAACA----T-TG---T--C---ACTAGCTACGAAAC--GTGG--ATACACTTTTA-CGAACCACATCGG--AAA--G----TTATCA----ACCGTGTATGGGC-AACAA-AA-