lowQualScore : 11111111 2222222222222 11111 777777777777777777777777777777777777777777 11111 22222222 111111111 22222222222222222222 111111 2222222222222222222222 1
lowQualScore : 8888 99999999 4 6 4 0000000000000 2 77 0 1 99 1 0 0 3 88888 555 4 22222 5 33 0 6666 9999 222222222222222222222222222222222222222222 4 444 8 33333 44 22222222 33 33 2 5555 000000000 33 66666 33 2 6666 2 2 88888888888888888888 555 7 333333 2 555 1111111111111111111111 2 1 2 3 6 4 4 3 6666 3 777777 7777777 66 5 66 2 5
lowQualScore : .... ........ . . . ............. . .. . . .. . . . . ..... ... . ..... . .. . .... .... .......................................... . ... . ..... .. ........ .. .. . .... ......... .. ..... .. . .... . . .................... ... . ...... . ... ...................... . . . . . . . . .... . ...... ....... .. . .. . .
lowQualScore : 3333 33333333 9 2 4 9999999999999 0 99 8 1 22 1 5 7 5 66666 000 0 44444 6 99 8 1111 4444 111111111111111111111111111111111111111111 1 333 1 33333 22 33333333 77 77 7 6666 777777777 77 77777 99 8 1111 9 9 11111111111111111111 000 1 000000 9 000 5555555555555555555555 9 3 9 2 2 1 9 1 5555 1 222222 9999999 99 0 99 8 0
consensus : AAAGACAAAGGCCA-CAA-------GGACTCAANAG-ACAGAAGCA-------TGGACAAAAT-ACAAACAAT--TAAGAAATAAAGTTAATAATTTGAAAA----NA---CATGCNAAAGAAC-A-NTNTTTT--AATAATATTG----AANA--CACT----G-----TT--TT--AGATA-CGA-----AT-GTGTCAAATCCTAAATT-ATATTGGAAACTNCTTAAACAGTTT----AT-TAAA-----NC-TAA--CA--AA-AA---CTCAG---------A--AAT----AAT--TCCNCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AACGG---TGANGA-TNCANT-CTAT---TTT---A-AT----GATGCA--GANAAA-GCNAAC-TGCTTAAACGATTA-TTTCGTCTCNATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGGGTGTGTCT-TTAAAAC
Reference ( gi|48623 ) : AAAGACAAAGGCCG-TAA-------GGACTCAAAAG-ACAGAAGCA-------TGGACAAAAC-ACAAACAAT--TAAGGAATAAAGTTAGTAATTTGAAAA----CA---CATGCTAAAGAAC-A-CTATTTT--AATAATATTG----AAAA--CACT----G-----TT--TT--AGATA-CGA-----AT-GTGTCATATTCTAAATT-ATATTGGAAACTACTTAAACAGTTT----AT-TAAA-----TC-TAA--CA--AA-AA---CTCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AATGG---TGAGGA-TTCAGT-CTAT---TTT---A-AT----GATGCA--GGTAAA-GCTAAC-TGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCCATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48624 : AAAGACAAAGGCCA-TAA-------GGACTCAACAG-ACAGAAGCA-------TGGACAAAAT-ACAAACAAT--TAAGGAATAAAGTTAATAATTTGAAAA----CA---CGTGCTAAAGAAC-A-TTATTTT--AATAATATTG----AATA--CACT----G-----TT--TT--AGATG-CGA-----AT-GTGTCAAATTCTAAATT-ATATTGGAAACTACTTAAACAGTTT----AT-AACA-----TC-TAA--CA--AA-AA---CTCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCCAC----T-CAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AATGG---TGAGGA-TTCAGT-TTAT---CTT---A-AT----GATGCA--GATAAA-GCTAAC-TGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCCATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48625 : AAAGACAAAGGTCA-CAA-------GGACTCAACAG-ACAGAAGTA-------TGGACAAACT-ACAAACACT--TAAGGAATAAAG--AG-AATTTGAAAA----CA---CATGCTAAAGAAC-A-ATATTTT--AATAATATGG----AAAT--CACT----G-----TT--TT--AGATG-CGA-----AT-GTGTAAAATTCTAAATT-ATATCGGAAACTACTTAAACAGTTT----AT-TAAG-----GC-TAA--CA--AA-AA---CTCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCAAC----T-AAG-ATATACAT-----C-TGT-T-AATGC---TTAGGA-TTCAGT-CTAT---TTT---A-AT----GATGCA--GATAAA-GCTAAC-TGCTTAAACGACTA-TTTCCTCTCCATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48626 : AAGGACAAAAGCTA-TAC-------GGACGCAAAAA-ACAGAAGAT-------TGGACAAAAT-ACAGACATT--TTAGAAATAAGGTTAATAACTTAAAAA----AA---TATGCCAAGAAAC-A-ATATTTT--AGGAATATTG----AAGA--AATA----A-----TT--GT--AGACA-GTA-----GT-AAGACTAATCCTAAATT-GTATTGGAAATTGCTAAAACAATTA----AT-TAGA-----GT-AAA--TA--AA-AA---TTGTG---------A--AAC----TAT--TCCTCCAT----T-AAA-AACGACAT-------TATAT-AACGG---TGAAGA--AAAATACCA----TTT---G-AC----GACATC--GAAAAA-GCAAAT-AGTTTAAACAATTA-TTTTGTATCAATTTC-ATC----AAT-A---A--GT-----------CATGAGCAAAACAAT-ACTTT--ACTACCAACTTGT-TCTCTTAAAAC
gi|48627 : AAAGACGAAGACAG-CAA---------ACTCA------CA-----A-------CGAACGGAAT-A---ACAAT--TAAGGAATGAAGTGAGCAATTTGAAAA----CA---TATGCTAAGGAAG-A-CTACTTT--GATAATACGG----AAGA--CAAT----G-----TT--CT--AGGTA-CTA-----AT-AGGTCAAATCCTATATT-GTATAGGAAAATACTTAAAGGG-------AT-TATA-----T--TGG--CA--AGTAA---CACAA---------A--AAT----
gi|48628 : AGACAAAAGTCG-TAA-------GGACTCAACAG-ATAGAAGCA-------TGGACAAAAT-ACAAACAAT--TAAGAAATAAAGTAAATAATTTGAAAA----CA---CATGCTAAAGAAC-A-ATATTTT--AATA---TGG----AAAA--CACT----G-----TT--TT--AGATG-CAA-----AT-GTGTCAAATCCTAAATT-ATATTGGAAACTACTTAAACAGTAA----AT-TAAG-----AC-AAA--CA--AA-AA---CTGAG---------A--AAT----TAT--TCCCCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TAT-T-AACGG---TGAGGA-TTCATT-CTAA---TTT---A-AT----GATGCA--GATAAA-GCTAAC-TGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCAATCTC-AAC----AAT-G---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTGCCAAAGTGTGTCT-TTAAAAC
gi|48629 : AGACAAAGGACA-CAATCAATACGAACGCAAAGA-ACAGACGAC-------TGGACTAAAT-ACAAACAGT--TAAGAAACAAAGTTAATAATTTGAAAA----CG---CATGCTAAAGAAC-A-GTTCTTT--AATAATATAG----AA-----ACTTTA-G-----TT--TC--AGACAGCAG-----AA-ATGTAA-ATCCAAAACT-TTACTGGAAACTTCTTAAACAGATT----AT-TAAG-----GCATGATGCG--AA-AA---ATCAAATTTACTCTA--AATCGGAAAT--CTCTTAAC----C-AAATATATATAT-----C-
gi|48630 : AGACAAAAGAAAATAG-------CGAC-CAAAAGTACA-AACCAAAATGATTGGAAAAAAT-ACAAACGTT--TAAGGAACAAGGTTAACAACTTGAAAA----AA---CATGCAAAAAAAC-G-CTTTTTC--AGCAAC-TTGGAACAAAA--TATT----GCCACATC--TC--GG--A-CAA-----A------CA-A-TCCAAATCAATACTGGAAAAT-CTAAAGGAACTTG---GT-TAAA-----AA-TAA--TA--GT-AA---ATCCG---------A--AAC----AAT--CCGAATAC----TGAAA-ACA-ACAC-----T-TAC-C-GACAGCTCCGAAAA-TATA-T-GTTT---CTC---AGAC----AATG-A--G--AAA-GCAAAT-TGTTTAAATGAGTT-TTTTTGCTCTATCTCTAAC-----GT-A---G--ATGA
gi|48631 : AATAG-ACAATA--A-------TGGTTAAAAT-ATAAATAAAAATACGAAACAAAGTTAATAATTTAAAAAAGCTCA---CA----AAAGAAA-GTCTATTT---AGCAACATTG----AAAA--TACT-----------T--TT--AG-------------T-GAGTC-----CTAAATA-TTATTAGAAACTTCTTCGTCAGTAA----AT-AAAA------C-TAA--CA--AA-AA---CTCAG---------A--TGC----AAT--TCCGCCAC----T-GAA-ATCGACA---------GT-A-AACAG---TTATGA-AACATT-CTGT---TTT---G-AA----GAT-TA--TGAAAAGGCAAAT-TGTTTAAATAATTACTTTTGT-TTAGTTTC-AAG----TGT-A---A--ACGACA---ATGGTATAAA
gi|48632 : AG-ACAACA--A-------TGGTTAAAAT-ATAAAAAGT--TACGAAACAAAGTTAACAATTTAAAAA----AG---CATGCAAAAGAAA-G-TTTCTTT--AGCAACATTG----AAGG--TACG----A---------TT--AG-TG-GGGCCTTTAT--TGACA-ATCCTAAATA-TTATTGGAAACTTCTTCGTCAGTAA----AT-AAAA-----AC-TTA--CA--AA-AA---TTCAG---------A--TGC----AAT--TCTGCCAC----T-GAA-ATCAACA---------AT-A-AACGG---TGTTGA-AACATT-CTGT---TTTGTAG-AT----TATGAA-----AAA-GC-AAC-T
gi|48634 : -------TGGAATAAAT-ATAAA-AATGCTA-GAAATAAAGTTAACAATTTAAAAA----AA---CATGCAAAAGAAA-A-CTTATAT--AATAATCTGG----AAAT--GAAT----A-----T----------TA-CAA-----AT-CTG-CA-ATGGAAAATT-ATA-------------AGACATTTT----GT-TAA---------CAA--CA--GC-GGTTCCTC-G---------ACTAAT-----AT--TCCACCGCTTATT-GAA-AT-TAC-------CATGC----ATGG---TGATAA-ATCATT-CTATATATCT---A-AC----GA---A--GAGAAA-GCAAAC-TACTTAAATAAATA-CTTTGTTTCTACATC-CAC----GGT-AGATG--ATGAAA---A---T
gi|48635 : -------TGGA-ACAACTATAAGCGAA--TAAGAAA--AAGTAAATAACATGAAAA----AA---CATGCCCAAGAA--A--TATTTTTCAATAGTAATG----AATATTCATTACAAG-----AT--TT--AAATA-CTA------------CACAACCCTCACA-GTACTGGAAGCTGGTAAAAATGCTT----AT-AAAAGAAAATA-CAA--CA--AA-AT---GTGAT---------A--AA------AT--ACCACCAC----T-AAA-A--------------------AATG------AAAA---CAAT-C-AT---TTTTC-A-ATTTCTGATGAA--GAAATA-GCCAAT-ACCTTAAACAATTA-CTTCATTTCTATCTC-TAC----AAT-T---G--ATG--------------------ATACTGACTCTGAACTTTCAAATTTTGTTT-TGAAAAC
gi|48636 : -ATAAAAAGT--TAAGAAACAAAGTTAATAATATGAAAA----AA---CACGCGAAAGAACTA-TT-TTTT--AATAATATCG----AATT--CACT----------TTAATCGAAGAAA-AAA-----ATAGTA----ATCCCAGAAA-ATACTGGAAACT-TTTAAAGAATTTT---AT-CAAA-----AC-TAA--TA--AA-AT---TTCAG---------A--AAT----AAT--ACTTCCAT----T-GAA-A-ACAAAC-----T-TAC-CAAATGG---TGA-AA-TT--GT-ATAT---TCC---A-TTTCG-GATAAA--GACAAG-GCCAAT-CGTTTAAATAATTT-TTT
gi|48633 : tAAGAAATAAAGTAAATAACCTGAAAA----AA---AATGCTAAAGAAA-A-GTTTTTT--TTTAACATTG----AAAC--CAGT----A-----TT--TC--AGA------------------CAAACCCGAAAAT-ATATTGGAAATTACTTCAA-AGTTTTACAA---AAA-----CC-TAA--TAATAA-AA---CTGAC---------A--CTT----ACTGATCCTC---------AAG-AC---CATTTTGAC-TGA-C-AACAC---TGAACACTTTAA----AT---ATT---A-CT----G--GCAACGACAAA-GCTAAA-TGCTTAAACGATTC-TTTCACTTCAAGTTT-GACTTCTAAC-A------ATGAAA---A---TAT
gi|48637 : atggagtgaatttaaaaaagaAAAA----CAAAGCATTTAAAAGAAA-G-TTTTTTT--AGCAACATTG----AAGA--TACT----A-----TT------AG-TG-GGGCCTTTAT--TGACA-ATCTTAAATA-TTATTGGAAACTTCTTCGTCAGTTA----ATACAAA------C-TAA--CA--AA-AT---TTCAG---------A--TGC----GAT--TCCGCCAC----T-GAA-ATCAACA---------AT-T-AACGG---TGTTGA-AACATT-CTGT---TTTGTAG-AT----TATGAA-----AAA-GC-AACTTGTTTAAATAATTACTTTTGT
gi|48638 : aaatataaaaagttacAAATT-ATATAGGAAACTACTTAAACAGTTC----AT-TAAG-----AC-AAA--CA--AA-AA---ATCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCCAC----T-AAA-ATATACCT-----C-TGT-T-TATTA---TGATGA-TTCATT-CTAT---TTT---A-AT----GATGCA--GATAAA-GCAAAC-T------------------GTTTCCATCTC-AAC----AAT-A---A--ATGACA---G---TATTAAC--AATAAT-ATGTT--ACTTCCAGGCTGTGTCT-TTAAAAC
gi|48639 : ---TGGGGA-TGAAAT-CTAC---TTTTAAA-AT----GACGTA--GAAAAA-GGAAAT-TGTTTGAATGACTA-TTTCTTTTCTATTTC-AAC----AATCA---GTAATGAAACTGA---TATAA
gi|48641 : C-AAC----AAT-A---G--GTGAAA---A---TACAAAC--AATACT-ACTCT--ACTTCCAGGGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48640 : C-AAC----AAT-A---G--GTGAAA---A---TACAAAC--AATACT-ACTCT--ACTTCCAGGGTGTATCT-TTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 111111111 1111111111 44444444444444444444444444444444444444444 111111111 22222222222222 11111 11111
lowQualScore : 0 1 777777777 3 2 4 3 4444444444 0 0 1 0 77 2 1 1 3 1 1 2 1 8888 00000000000000000000000000000000000000000 22 33 3 2 55 99999 9999999 2 33 33 2 4444 000000000 33 5555 33 1 5555 2 2 77 22222222222222 444 3333 22 3 33 444 55555 22222 1 3 2 5 2 1 2 6666 2 555555 6666666 66 4 66 1 4 4
lowQualScore : . . ......... . . . . .......... . . . . .. . . . . . . . . .... ......................................... .. .. . . .. ..... ....... . .. .. . .... ......... .. .... .. . .... . . .. .............. ... .... .. . .. ... ..... ..... . . . . . . . .... . ...... ....... .. . .. . . .
lowQualScore : 2 1 555555555 1 6 0 2 6666666666 2 8 1 1 33 7 9 0 3 0 0 7 7 5555 55555555555555555555555555555555555555555 77 88 4 5 66 99999 1111111 5 44 44 5 6666 000000000 44 3333 77 0 7777 7 7 55 33333333333333 777 8888 33 6 77 777 99999 11111 0 6 9 7 9 0 9 1111 9 999999 6666666 11 4 11 7 4 4
consensus : AAAGACAAAGGCCGCAA-------G-GACTCAANAG-ACAGAAGCA-------TGGACAAAATACAAACAAT--TAAGAAACAAAGTTAATAATTTGAAAAAACATGCNAAAGAACANTNT-TTTAATAATATTGAANA--CACT----GTT--TT--AGAT-----A-CGA-----ATGTGTCA-AATCCT-AAATT-ATATTGGAAACTNCTTAAACAG-TTT-ATT----AAA------AC-TAA--CA--AA-AA---CTCAG---------A--AAT----AAT--TCCNCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AACGG---TGANG--ATNCATTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GANAAAGCNAACTGCTTAAACGA-CTA-TTTCGTCTCNATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
Reference ( family-829 ) : AAAGACAAAGGCCACAA-------G-GACTCAANAG-ACAGAAGCA-------TGGACAAAATACAAACAAT--TAAGAAATAAAGTTAATAATTTGAAAANACATGCNAAAGAACANTNT-TTTAATAATATTGAANA--CACT----GTT--TT--AGAT-----A-CGA-----ATGTGTCA-AATCCT-AAATT-ATATTGGAAACTNCTTAAACAG-TTT-ATT----AAA------NC-TAA--CA--AA-AA---CTCAG---------A--AAT----AAT--TCCNCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AACGG---TGANG--ATNCANTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GANAAAGCNAACTGCTTAAACGA-TTA-TTTCGTCTCNATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGGGTGTGTCT-TTAAAAC
gi|48623 : AAAGACAAAGGCCGTAA-------G-GACTCAAAAG-ACAGAAGCA-------TGGACAAAACACAAACAAT--TAAGGAATAAAGTTAGTAATTTGAAAACACATGCTAAAGAACACTAT-TTTAATAATATTGAAAA--CACT----GTT--TT--AGAT-----A-CGA-----ATGTGTCA-TATTCT-AAATT-ATATTGGAAACTACTTAAACAG-TTT-ATT----AAA------TC-TAA--CA--AA-AA---CTCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AATGG---TGAGG--ATTCAGTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GGTAAAGCTAACTGCTTAAACGA-CTA-TTTCGTCTCCATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48624 : AAAGACAAAGGCCATAA-------G-GACTCAACAG-ACAGAAGCA-------TGGACAAAATACAAACAAT--TAAGGAATAAAGTTAATAATTTGAAAACACGTGCTAAAGAACATTAT-TTTAATAATATTGAATA--CACT----GTT--TT--AGAT-----G-CGA-----ATGTGTCA-AATTCT-AAATT-ATATTGGAAACTACTTAAACAG-TTT-ATA----ACA------TC-TAA--CA--AA-AA---CTCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCCAC----T-CAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AATGG---TGAGG--ATTCAGTTT--AT---CTT---A-ATGATGCA--GATAAAGCTAACTGCTTAAACGA-CTA-TTTCGTCTCCATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48625 : AAAGACAAAGGTCACAA-------G-GACTCAACAG-ACAGAAGTA-------TGGACAAACTACAAACACT--TAAGGAATAAAG---AGAATTTGAAAACACATGCTAAAGAACAATAT-TTTAATAATATGGAAAT--CACT----GTT--TT--AGAT-----G-CGA-----ATGTGTAA-AATTCT-AAATT-ATATCGGAAACTACTTAAACAG-TTT-ATT----AAG------GC-TAA--CA--AA-AA---CTCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCAAC----T-AAG-ATATACAT-----C-TGT-T-AATGC---TTAGG--ATTCAGTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GATAAAGCTAACTGCTTAAACGA-CTA-TTTCCTCTCCATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48626 : AAGGACAAAAGCTATAC-------G-GACGCAAAAA-ACAGAAGAT-------TGGACAAAATACAGACATT--TTAGAAATAAGGTTAATAACTTAAAAAAATATGCCAAGAAACAATAT-TTTAGGAATATTGAAGA--AATA----ATT--GT--AGAC-----A-GTA-----GTAAGACT-AATCCT-AAATT-GTATTGGAAATTGCTAAAACAA-TTA-ATT----AGA------GT-AAA--TA--AA-AA---TTGTG---------A--AAC----TAT--TCCTCCAT----T-AAA-AACGACAT-------TATAT-AACGG---TGAAG--AAAAATACC--A----TTT---G-ACGACATC--GAAAAAGCAAATAGTTTAAACAA-TTA-TTTTGTATCAATTTC-ATC----AAT-A---A--GT-----------CATGAGCAAAACAAT-ACTTT--ACTACCAACTTGT-TCTCTTAAAAC
gi|48627 : AAAGACGAAGACAGCAA----------ACTCA------CA-----A-------CGAACGGAATA---ACAAT--TAAGGAATGAAGTGAGCAATTTGAAAACATATGCTAAGGAAGACTAC-TTTGATAATACGGAAGA--CAAT----GTT--CT--AGGT-----A-CTA-----ATAGGTCA-AATCCT-ATATT-GTATAGGAAAATACTTAAAGGG-ATT-AT--------------AT-TGG--CA--AGTAA---CACAA---------A--AAT----
gi|48628 : AGACAAAAGTCGTAA-------G-GACTCAACAG-ATAGAAGCA-------TGGACAAAATACAAACAAT--TAAGAAATAAAGTAAATAATTTGAAAACACATGCTAAAGAACAATAT-TTTAATA---TGGAAAA--CACT----GTT--TT--AGAT-----G-CAA-----ATGTGTCA-AATCCT-AAATT-ATATTGGAAACTACTTAAACAG-TAA-ATT----AAG------AC-AAA--CA--AA-AA---CTGAG---------A--AAT----TAT--TCCCCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TAT-T-AACGG---TGAGG--ATTCATTCT--AA---TTT---A-ATGATGCA--GATAAAGCTAACTGCTTAAACGA-CTA-TTTCGTCTCAATCTC-AAC----AAT-G---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTGCCAAAGTGTGTCT-TTAAAAC
gi|48629 : AGACAAAGGACACAATCAATACG-AACGCAAAGA-ACAGACGAC-------TGGACTAAATACAAACAGT--TAAGAAACAAAGTTAATAATTTGAAAACGCATGCTAAAGAACAGTTC-TTTAATAATATAGAA-----ACTTTA-GTT--TC--AGAC-----AGCAG-----AAATGT-A-AATCCA-AAACT-TTACTGGAAACTTCTTAAACAG-ATT-ATT----AAG------GCATGATGCG--AA-AA---ATCAAATTTACTCTA--AATCGGAAAT--CTCTTAAC----C-AAATATATATAT-----C-
gi|48630 : AGACAAAAGAAAATA-------GCGAC-CAAAAGTACA-AACCAAAATGATTGGAAAAAATACAAACGTT--TAAGGAACAAGGTTAACAACTTGAAAAAACATGCAAAAAAACGCTTT-TTCAGCAACTTGGAACA--AAAT----ATTG-CC--ACATCTCGGA-CAA-----AC-------AATCC--AAATCAATACTGGAAAAT-CTAAAGGAA-CTTGGTT----AAA------AA-TAA--TA--GT-AA---ATCCG---------A--AAC----AAT--CCGAATAC----TGAAA-ACA-ACAC-----T-TAC-C-GACAGCTCCGAAA--ATATATGTT---T---CTC---AGACAAT-----GAGAAAGCAAATTGTTTAAATGAGTTT-TTTTG-CTCTATCTCTAAC-----GT-A---G--ATGA
gi|48631 : AATAG-ACAATA--A-------TGGTTAAAATATAAATAAAAATACGAAACAAAGTTAATAATTTAAAAAAGCTCACAAAAGAA-AGTCTATTTAGCAACATTGAAAA--TACT------T--TT--AG--------------------TG----AGTCCT-AAATA-TTATTAGAAACTTCTTCGTCAG-TAA-AT-----AAA------AC-TAA--CA--AA-AA---CTCAG---------A--TGC----AAT--TCCGCCAC----T-GAA-ATCGACA---------GT-A-AACAG---TTATG--AAACATTCT--GT---TTT---G-AAGATTAT--GAAAAGGCAAATTGTTTAAATAA-TTACTTTTGT-TTAGTTTC-AAG----TGT-A---A--ACGACA---ATGGTATAAA
gi|48632 : AG-ACAACA--A-------TGGTTAAAATATAAAAAGT--TACGAAACAAAGTTAACAATTTAAAAAAGCATGCAAAAGAAAGTTTC-TTTAGCAACATTGAAGG--TACG----ATT------AG-T-----G-GGGCCTTTAT-TGACA-A-TCCT-AAATA-TTATTGGAAACTTCTTCGTCAG-TAA-ATA----AAA------AC-TTA--CA--AA-AA---TTCAG---------A--TGC----AAT--TCTGCCAC----T-GAA-ATCAACA---------AT-A-AACGG---TGTTG--AAACATTCT--GT---TTTGTAG-ATTAT-----GAAAAAGC-AACT
gi|48633 : A-------TGGAGTGAATTTAAAAAAG--AAAGAAATAAAGTAAATAACCTGAAAAAAAATGCTAAAGAAAAGTTT-TTTTTTAACATTGAAAC--CAGT----ATT--TC--AGA----------------------CA-AACCCG-AAAAT-ATATTGGAAATTACTTCAA-AG-TT---TTACAAAAA------CC-TAA--TAATAA-AA---CTGAC---------A--CTT----ACTGATCCTC---------AAG-AC---CATTTTGAC-TGA-C-AACAC---TGA------ACACTTTAAAT---ATT---A-CTG--GCAACGACAAAGCTAAATGCTTAAACGA-TTC-TTTCACTTCAAGTTT-GACTTCTAAC-A------ATGAAA---A---TAT
gi|48634 : -------TGGAATAAATATAAA-AATGCTA-GAAATAAAGTTAACAATTTAAAAAAACATGCAAAAGAAAACTTA-TATAATAAT------------CT----G---------GAA-----A-TGA-----ATATTACA-AATC-------T-GCAATGGAAAATTATAAGACAT-TTT-GTT----AA----------CAA--CA--GC-GGTTCCTC-G---------ACTAAT-----AT--TCCACCGCTTATT-GAA-AT-TAC-------CATGC----ATGG---TGATA--AATCATTCT--ATATATCT---A-ACGA---A--GAGAAAGCAAACTACTTAAATAA-ATA-CTTTGTTTCTACATC-CAC----GGT-AGATG--ATGAAA---A---T
gi|48635 : -------TGGAACAACTATAAGCGAA--TAAGAA--AAAGTAAATAACATGAAAAAACATGCCCAAGAAATATTT-TTCAATAGTAATGAATATTCATTACAAGAT--TT--AAAT-----A-CTA-----------CACAACCCTCACA---GTACTGGAAGCTGGTAAAAATG-CTT-ATA----AAAGAAAATAC--AA--CA--AA-AT---GTGAT---------A--A------AAT--ACCACCAC----T-AAA-AAATGAA--------------AACAA---TCATT--TTTCA------AT---TTC------TGATGAA--GAAATAGCCAATACCTTAAACAA-TTA-CTTCATTTCTATCTC-TAC----AAT-T---G--ATG--------------------ATACTGACTCTGAACTTTCAAATTTTGTTT-TGAAAAC
gi|48636 : TATAAAAAGT--TAAGAAACAAAGTTAATAATATGAAAAAACACGCGAAAGAACTATTT-TTTAATAATATCGAATT--CACT-----TTAATCGAAGAA-----A-AAA-----ATA-GT---AATCCC-AGAAA-ATACTGGAAACTT-TTAAAGAATTTT-ATC----AAA------AC-TAA--TA--AA-AT---TTCAG---------A--AAT----AAT--ACTTCCAT----T-GAA-A-ACAAAC-----T-TAC-CAAATGG---TGAAATTGTATATTCC--AT---TTC---G---GATAAA--GACAAGGCCAATCGTTTAAATAA-TTT-TTT
gi|48637 : AAATATAAAAAGT--TACAAAACAAAGC-----ATTTAAAA--------GAAAG----TTTT-TTTAGCAACATTGAAGA--TACT----ATT------AG-T-----G-GGGCCTTTAT-TGACA-A-TCTT-AAATA-TTATTGGAAACTTCTTCGTCAG-TTA-ATA----CAA------AC-TAA--CA--AA-AT---TTCAG---------A--TGC----GAT--TCCGCCAC----T-GAA-ATCAACA---------AT-T-AACGG---TGTTG--AAACATTCT--GT---TTTGTAG-ATTAT-----GAAAAAGCAACTTGTTTAAATAA-TTACTTTTGT
gi|48638 : -AAATT-ATATAGGAAACTACTTAAACAG-TTC-ATT----AAG------AC-AAA--CA--AA-AA---ATCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCCAC----T-AAA-ATATACCT-----C-TGT-T-TATTA---TGATG--ATTCATTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GATAAAGCAAACT-------------------GTTTCCATCTC-AAC----AAT-A---A--ATGACA---G---TATTAAC--AATAAT-ATGTT--ACTTCCAGGCTGTGTCT-TTAAAAC
gi|48639 : ---TGGGG--ATGAAATCT--AC---TTTTAAA-ATGACGTA--GAAAAAGGAAATTGTTTGAATGA-CTA-TTTCTTTTCTATTTC-AAC----AATCA---GTAATGAAACTGA---TATAA
gi|48640 : C-AAC----AAT-A---G--GTGAAA---A---TACAAAC--AATACT-ACTCT--ACTTCCAGGGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48641 : C-AAC----AAT-A---G--GTGAAA---A---TACAAAC--AATACT-ACTCT--ACTTCCAGGGTGTATCT-TTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 1111111 1111111111111 44444444444444444444444444 111111111 22222222222222 11111 11111
lowQualScore : 8888888 2 99 0 0 1 0 77 1 2 2 1 3 1 1 2 1 8888 1111111111111 33333333333333333333333333 0 2 33 3 5 22 3 2 777777 2 44 33 33 2 0 000000000 33 55555 33 1 5555 2 2 77 22222222222222 444 5555 22 33 444 55555 22222 1 3 2 5 2 1 2 6666 2 555555 6666666 66 4 66 1 4
lowQualScore : ....... . .. . . . . .. . . . . . . . . . .... ............. .......................... . . .. . . .. . . ...... . .. .. .. . . ......... .. ..... .. . .... . . .. .............. ... .... .. .. ... ..... ..... . . . . . . . .... . ...... ....... .. . .. . .
lowQualScore : 6666666 8 66 2 8 1 1 33 9 7 2 0 3 0 0 7 7 5555 8888888888888 44444444444444444444444444 2 5 88 4 0 66 1 5 222222 5 55 44 44 5 2 000000000 44 66666 77 0 7777 7 7 55 33333333333333 777 5555 33 77 777 99999 11111 0 6 2 7 9 0 9 1111 9 999999 6666666 11 4 11 4 4
consensus : AAAGACAAAGGCCGCAA-------GGACTCAANAGACAGAAGCATGGACAAAATACAAACAAT--TAAGAAACAAAGTTAATAATTTGAAAAAACATGCNAAAGAACANTNT-TTTAATAATATTGAANA--CACT----GTT--TT--AGAT-----A-CGA-----ATGTGTCA-AATCCTAA-ATT-ATATTGGAAACTNCTTAAACAG-TTT-ATTAA-A------A-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--AAT----AAT--TCCNCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AACGG---TGANG--ATNCATTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GANAAAGCNAACTGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCNATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
Reference ( family-829 ) : AAAGACAAAGGCCGCAA-------GGACTCAANAGACAGAAGCATGGACAAAATACAAACAAT--TAAGAAACAAAGTTAATAATTTGAAAAAACATGCNAAAGAACANTNT-TTTAATAATATTGAANA--CACT----GTT--TT--AGAT-----A-CGA-----ATGTGTCA-AATCCTAA-ATT-ATATTGGAAACTNCTTAAACAG-TTT-ATTAA-A------A-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--AAT----AAT--TCCNCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AACGG---TGANG--ATNCATTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GANAAAGCNAACTGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCNATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48623 : AAAGACAAAGGCCGTAA-------GGACTCAAAAGACAGAAGCATGGACAAAACACAAACAAT--TAAGGAATAAAGTTAGTAATTTGAAAACACATGCTAAAGAACACTAT-TTTAATAATATTGAAAA--CACT----GTT--TT--AGAT-----A-CGA-----ATGTGTCA-TATTCTAA-ATT-ATATTGGAAACTACTTAAACAG-TTT-ATTAA-A------T-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AATGG---TGAGG--ATTCAGTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GGTAAAGCTAACTGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCCATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48624 : AAAGACAAAGGCCATAA-------GGACTCAACAGACAGAAGCATGGACAAAATACAAACAAT--TAAGGAATAAAGTTAATAATTTGAAAACACGTGCTAAAGAACATTAT-TTTAATAATATTGAATA--CACT----GTT--TT--AGAT-----G-CGA-----ATGTGTCA-AATTCTAA-ATT-ATATTGGAAACTACTTAAACAG-TTT-ATAAC-A------T-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCCAC----T-CAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AATGG---TGAGG--ATTCAGTTT--AT---CTT---A-ATGATGCA--GATAAAGCTAACTGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCCATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48625 : AAAGACAAAGGTCACAA-------GGACTCAACAGACAGAAGTATGGACAAACTACAAACACT--TAAGGAATAAAG---AGAATTTGAAAACACATGCTAAAGAACAATAT-TTTAATAATATGGAAAT--CACT----GTT--TT--AGAT-----G-CGA-----ATGTGTAA-AATTCTAA-ATT-ATATCGGAAACTACTTAAACAG-TTT-ATTAA-G------G-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCAAC----T-AAG-ATATACAT-----C-TGT-T-AATGC---TTAGG--ATTCAGTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GATAAAGCTAACTGCTTAAACGACTA-TTTCCTCTCCATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48626 : AAGGACAAAAGCTATAC-------GGACGCAAAAAACAGAAGATTGGACAAAATACAGACATT--TTAGAAATAAGGTTAATAACTTAAAAAAATATGCCAAGAAACAATAT-TTTAGGAATATTGAAGA--AATA----ATT--GT--AGAC-----A-GTA-----GTAAGACT-AATCCTAA-ATT-GTATTGGAAATTGCTAAAACAA-TTA-ATTAG-A------G-T-AAA--TA--AA-AATTGTG---------A--AAC----TAT--TCCTCCAT----T-AAA-AACGACAT-------TATAT-AACGG---TGAAG--AAAAATACC--A----TTT---G-ACGACATC--GAAAAAGCAAATAGTTTAAACAATTA-TTTTGTATCAATTTC-ATC----AAT-A---A--GT-----------CATGAGCAAAACAAT-ACTTT--ACTACCAACTTGT-TCTCTTAAAAC
gi|48627 : AAAGACGAAGACAGCAA---------ACTCA-----CA-----ACGAACGGAATA---ACAAT--TAAGGAATGAAGTGAGCAATTTGAAAACATATGCTAAGGAAGACTAC-TTTGATAATACGGAAGA--CAAT----GTT--CT--AGGT-----A-CTA-----ATAGGTCA-AATCCTAT-ATT-GTATAGGAAAATACTTAAAGGG-ATT-AT-----------A-T-TGG--CA--AGTAACACAA---------A--AAT----
gi|48628 : AGACAAAAGTCGTAA-------GGACTCAACAGATAGAAGCATGGACAAAATACAAACAAT--TAAGAAATAAAGTAAATAATTTGAAAACACATGCTAAAGAACAATAT-TTTAATA---TGGAAAA--CACT----GTT--TT--AGAT-----G-CAA-----ATGTGTCA-AATCCTAA-ATT-ATATTGGAAACTACTTAAACAG-TAA-ATTAA-G------A-C-AAA--CA--AA-AACTGAG---------A--AAT----TAT--TCCCCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TAT-T-AACGG---TGAGG--ATTCATTCT--AA---TTT---A-ATGATGCA--GATAAAGCTAACTGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCAATCTC-AAC----AAT-G---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTGCCAAAGTGTGTCT-TTAAAAC
gi|48629 : AGACAAAGGACACAATCAATACGAACGCAAAGAACAGACGACTGGACTAAATACAAACAGT--TAAGAAACAAAGTTAATAATTTGAAAACGCATGCTAAAGAACAGTTC-TTTAATAATATAGAA-----ACTTTA-GTT--TC--AGAC-----AGCAG-----AAATGT-A-AATCCAAA-ACT-TTACTGGAAACTTCTTAAACAG-ATT-ATTAA-G------G-CATGATGCG--AA-AAATCAAATTTACTCTA--AATCGGAAAT--CTCTTAAC----C-AAATATATATAT-----C-
gi|48630 : TGGAAAAAATACAAACGTT--TAAGGAACAAGGTTAACAACTTGAAAAAACATGCAAAAAAACGCTTT-TTCAGCAACTTGGAACA--AAAT----ATTG-CC--ACATCTCGGA-CAA-----AC-------AATCC-AA-ATCAATACTGGAAAAT-CTAAAGGAA-CTTGGTTAA-A------A-A-TAA--TA--GT-AAATCCG---------A--AAC----AAT--CCGAATAC----TGAAA-ACA-ACAC-----T-TAC-C-GACAGCTCCGAAA--ATATATGTT---T---CTC---AGACAAT-----GAGAAAGCAAATTGTTTAAATGAGTT-TTTTTGCTCTATCTCTAAC-----GT-A---G--ATGA
gi|48631 : agacaaaagaaaatagcgaccaaaagtacaaaccaaaatgatAATAGACAATA--ATGGTTAAAATATAAATAAAAATACGAAACAAAGTTAATAATTTAAAAAAGCTCACAAAAGAA-AGTCTATTTAGCAACATTGAAAA--TAC------TT--TT--AG------------------TG------AGTCCTAA-ATA-TTATTAGAAACTTCTTCGTCAG--TA-AATAA-A------A-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--TGC----AAT--TCCGCCAC----T-GAA-ATCGACA---------GT-A-AACAG---TTATG--AAACATTCT--GT---TTT---G-AAGATTAT--GAAAAGGCAAATTGTTTAAATAATTACTTTTGT-TTAGTTTC-AAG----TGT-A---A--ACGACA---ATGGTATAAA
gi|48632 : AGACAACA--ATGGTTAAAATATAAAAAGT--TACGAAACAAAGTTAACAATTTAAAAAAGCATGCAAAAGAAAGTTTC-TTTAGCAACATTGAAGG--TACG----A----TT--AG-T-----G-GGGCCTTTAT-TGAC--AATCCTAA-ATA-TTATTGGAAACTTCTTCGTCAG-TAA-ATAAA-A------A-C-TTA--CA--AA-AATTCAG---------A--TGC----AAT--TCTGCCAC----T-GAA-ATCAACA---------AT-A-AACGG---TGTTG--AAACATTCT--GT---TTTGTAG-ATTAT-----GAAAAAGC-AACT
gi|48633 : ATGGAGTGAATTTAAAAAAG--AAAGAAATAAAGTAAATAACCTGAAAAAAAATGCTAAAGAAAAGTTT-TTTTTTAACATTGAAAC--CAGT----ATT--TC--AGA----------------------CA-AACCCGAA-AAT-ATATTGGAAATTACTTCAA-AGTTTT-ACAAA-A------ACC-TAA--TAATAA-AACTGAC---------A--CTT----ACTGATCCTC---------AAG-AC---CATTTTGAC-TGA-C-AACAC---TGA------ACACTTTAAAT---ATT---A-CTG--GCAACGACAAAGCTAAATGCTTAAACGATTC-TTTCACTTCAAGTTT-GACTTCTAAC-A------ATGAAA---A---TAT
gi|48634 : TGGAATAAATATAAA-AATGCTA-GAAATAAAGTTAACAATTTAAAAAAACATGCAAAAGAAAACTTA-TATAATAAT------------CT----G---------GAA-----A-TGA-----ATATTACA-AATC-------T-GCAATGGAAAATTATAAGACAT-TTT-GTTAACA------A-C--AG--CG--GT-TCCTC-G---------ACTAAT-----AT--TCCACCGCTTATT-GAA-AT-TAC-------CATGC----ATGG---TGATA--AATCATTCT--ATATATCT---A-ACGA---A--GAGAAAGCAAACTACTTAAATAAATA-CTTTGTTTCTACATC-CAC----GGT-AGATG--ATGAAA---A---T
gi|48635 : TGGAACAACTATAAGCGAA--TAAGAAA--AAGTAAATAACATGAAAAAACATGCCCAAGAAATATTT-TTCAATAGTAATGAATATTCATTACAAGAT--TT--AAAT-----A-CTA-----------CACAACCCTCACA---GTACTGGAAGCTGGTAAAAATG-CTT-ATAAA-AGAAAATA-C--AA--CA--AA-ATGTGAT---------A--AA------AT--ACCACCAC----T-AAA-AAATGAA--------------AACAA---TCAT----TT--TTCA--AT---TTC------TGATGAA--GAAATAGCCAATACCTTAAACAATTA-CTTCATTTCTATCTC-TAC----AAT-T---G--ATG--------------------ATACTGACTCTGAACTTTCAAATTTTGTTT-TGAAAAC
gi|48636 : TATAAAAAGT--TAAGAAACAAAGTTAATAATATGAAAAAACACGCGAAAGAACTATTT-TTTAATAATATCGAATT--CACT-----TTAATCGAAGAA-----A-AAA-----ATA-GT---AATCCCAG-AAA-ATACTGGAAACTT-TTAAAGAATTTT-ATCAA-A------A-C-TAA--TA--AA-ATTTCAG---------A--AAT----AAT--ACTTCCAT----T-GAA-A-ACAAAC-----T-TAC-CAAATGG---TGAAATTGTATATTCC--AT---TTC---G---GATAAA--GACAAGGCCAATCGTTTAAATAATTT-TTT
gi|48637 : AAATATAAAAAGT--TACAAAACAAAGC-----ATTTAAAA--------GAAAG----TTTT-TTTAGCAACATTGAAGA--TACT----ATT------AG-T-----G-GGGCCTTTAT-TGACA-A-TCTTAA-ATA-TTATTGGAAACTTCTTCGTCAG-TTA-ATACA-A------A-C-TAA--CA--AA-ATTTCAG---------A--TGC----GAT--TCCGCCAC----T-GAA-ATCAACA---------AT-T-AACGG---TGTTG--AAACATTCT--GT---TTTGTAG-ATTAT-----GAAAAAGCAACTTGTTTAAATAATTACTTTTGT
gi|48638 : AA-ATT-ATATAGGAAACTACTTAAACAG-TTC-ATTAA-G------A-C-AAA--CA--AA-AAATCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCCAC----T-AAA-ATATACCT-----C-TGT-T-TATTA---TGATG--ATTCATTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GATAAAGCAAACT------------------GTTTCCATCTC-AAC----AAT-A---A--ATGACA---G---TATTAAC--AATAAT-ATGTT--ACTTCCAGGCTGTGTCT-TTAAAAC
gi|48639 : ---TGGGG--ATGAAATCT--AC---TTTTAAA-ATGACGTA--GAAAAAGGAAATTGTTTGAATGACTA-TTTCTTTTCTATTTC-AAC----AATCA---GTAATGAAACTGA---TATAA
gi|48640 : C-AAC----AAT-A---G--GTGAAA---A---TACAAAC--AATACT-ACTCT--ACTTCCAGGGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48641 : C-AAC----AAT-A---G--GTGAAA---A---TACAAAC--AATACT-ACTCT--ACTTCCAGGGTGTATCT-TTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 1111111 1111111111111 44444444444444444444444444 111111111 22222222222222 11111 11111
lowQualScore : 8888888 2 99 0 0 1 0 77 1 2 2 1 3 1 1 2 1 8888 1111111111111 33333333333333333333333333 0 2 33 3 5 22 3 2 777777 2 44 33 33 2 0 000000000 33 55555 33 1 5555 2 2 77 22222222222222 444 5555 22 33 444 55555 22222 1 3 2 5 2 1 2 6666 2 555555 6666666 66 4 66 1 4
lowQualScore : ....... . .. . . . . .. . . . . . . . . . .... ............. .......................... . . .. . . .. . . ...... . .. .. .. . . ......... .. ..... .. . .... . . .. .............. ... .... .. .. ... ..... ..... . . . . . . . .... . ...... ....... .. . .. . .
lowQualScore : 6666666 8 66 2 8 1 1 33 9 7 2 0 3 0 0 7 7 5555 8888888888888 44444444444444444444444444 2 5 88 4 0 66 1 5 222222 5 55 44 44 5 2 000000000 44 66666 77 0 7777 7 7 55 33333333333333 777 5555 33 77 777 99999 11111 0 6 2 7 9 0 9 1111 9 999999 6666666 11 4 11 4 4
consensus : AAAGACAAAGGCCGCAA-------GGACTCAANAGACAGAAGCATGGACAAAATACAAACAAT--TAAGAAACAAAGTTAATAATTTGAAAAAACATGCNAAAGAACANTNT-TTTAATAATATTGAANA--CACT----GTT--TT--AGAT-----A-CGA-----ATGTGTCA-AATCCTAA-ATT-ATATTGGAAACTNCTTAAACAG-TTT-ATTAA-A------A-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--AAT----AAT--TCCNCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AACGG---TGANG--ATNCATTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GANAAAGCNAACTGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCNATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
Reference ( family-829 ) : AAAGACAAAGGCCGCAA-------GGACTCAANAGACAGAAGCATGGACAAAATACAAACAAT--TAAGAAACAAAGTTAATAATTTGAAAAAACATGCNAAAGAACANTNT-TTTAATAATATTGAANA--CACT----GTT--TT--AGAT-----A-CGA-----ATGTGTCA-AATCCTAA-ATT-ATATTGGAAACTNCTTAAACAG-TTT-ATTAA-A------A-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--AAT----AAT--TCCNCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AACGG---TGANG--ATNCATTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GANAAAGCNAACTGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCNATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48623 : AAAGACAAAGGCCGTAA-------GGACTCAAAAGACAGAAGCATGGACAAAACACAAACAAT--TAAGGAATAAAGTTAGTAATTTGAAAACACATGCTAAAGAACACTAT-TTTAATAATATTGAAAA--CACT----GTT--TT--AGAT-----A-CGA-----ATGTGTCA-TATTCTAA-ATT-ATATTGGAAACTACTTAAACAG-TTT-ATTAA-A------T-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AATGG---TGAGG--ATTCAGTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GGTAAAGCTAACTGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCCATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48624 : AAAGACAAAGGCCATAA-------GGACTCAACAGACAGAAGCATGGACAAAATACAAACAAT--TAAGGAATAAAGTTAATAATTTGAAAACACGTGCTAAAGAACATTAT-TTTAATAATATTGAATA--CACT----GTT--TT--AGAT-----G-CGA-----ATGTGTCA-AATTCTAA-ATT-ATATTGGAAACTACTTAAACAG-TTT-ATAAC-A------T-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCCAC----T-CAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AATGG---TGAGG--ATTCAGTTT--AT---CTT---A-ATGATGCA--GATAAAGCTAACTGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCCATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48625 : AAAGACAAAGGTCACAA-------GGACTCAACAGACAGAAGTATGGACAAACTACAAACACT--TAAGGAATAAAG---AGAATTTGAAAACACATGCTAAAGAACAATAT-TTTAATAATATGGAAAT--CACT----GTT--TT--AGAT-----G-CGA-----ATGTGTAA-AATTCTAA-ATT-ATATCGGAAACTACTTAAACAG-TTT-ATTAA-G------G-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCAAC----T-AAG-ATATACAT-----C-TGT-T-AATGC---TTAGG--ATTCAGTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GATAAAGCTAACTGCTTAAACGACTA-TTTCCTCTCCATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48626 : AAGGACAAAAGCTATAC-------GGACGCAAAAAACAGAAGATTGGACAAAATACAGACATT--TTAGAAATAAGGTTAATAACTTAAAAAAATATGCCAAGAAACAATAT-TTTAGGAATATTGAAGA--AATA----ATT--GT--AGAC-----A-GTA-----GTAAGACT-AATCCTAA-ATT-GTATTGGAAATTGCTAAAACAA-TTA-ATTAG-A------G-T-AAA--TA--AA-AATTGTG---------A--AAC----TAT--TCCTCCAT----T-AAA-AACGACAT-------TATAT-AACGG---TGAAG--AAAAATACC--A----TTT---G-ACGACATC--GAAAAAGCAAATAGTTTAAACAATTA-TTTTGTATCAATTTC-ATC----AAT-A---A--GT-----------CATGAGCAAAACAAT-ACTTT--ACTACCAACTTGT-TCTCTTAAAAC
gi|48627 : AAAGACGAAGACAGCAA---------ACTCA-----CA-----ACGAACGGAATA---ACAAT--TAAGGAATGAAGTGAGCAATTTGAAAACATATGCTAAGGAAGACTAC-TTTGATAATACGGAAGA--CAAT----GTT--CT--AGGT-----A-CTA-----ATAGGTCA-AATCCTAT-ATT-GTATAGGAAAATACTTAAAGGG-ATT-AT-----------A-T-TGG--CA--AGTAACACAA---------A--AAT----
gi|48628 : AGACAAAAGTCGTAA-------GGACTCAACAGATAGAAGCATGGACAAAATACAAACAAT--TAAGAAATAAAGTAAATAATTTGAAAACACATGCTAAAGAACAATAT-TTTAATA---TGGAAAA--CACT----GTT--TT--AGAT-----G-CAA-----ATGTGTCA-AATCCTAA-ATT-ATATTGGAAACTACTTAAACAG-TAA-ATTAA-G------A-C-AAA--CA--AA-AACTGAG---------A--AAT----TAT--TCCCCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TAT-T-AACGG---TGAGG--ATTCATTCT--AA---TTT---A-ATGATGCA--GATAAAGCTAACTGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCAATCTC-AAC----AAT-G---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTGCCAAAGTGTGTCT-TTAAAAC
gi|48629 : AGACAAAGGACACAATCAATACGAACGCAAAGAACAGACGACTGGACTAAATACAAACAGT--TAAGAAACAAAGTTAATAATTTGAAAACGCATGCTAAAGAACAGTTC-TTTAATAATATAGAA-----ACTTTA-GTT--TC--AGAC-----AGCAG-----AAATGT-A-AATCCAAA-ACT-TTACTGGAAACTTCTTAAACAG-ATT-ATTAA-G------G-CATGATGCG--AA-AAATCAAATTTACTCTA--AATCGGAAAT--CTCTTAAC----C-AAATATATATAT-----C-
gi|48630 : TGGAAAAAATACAAACGTT--TAAGGAACAAGGTTAACAACTTGAAAAAACATGCAAAAAAACGCTTT-TTCAGCAACTTGGAACA--AAAT----ATTG-CC--ACATCTCGGA-CAA-----AC-------AATCC-AA-ATCAATACTGGAAAAT-CTAAAGGAA-CTTGGTTAA-A------A-A-TAA--TA--GT-AAATCCG---------A--AAC----AAT--CCGAATAC----TGAAA-ACA-ACAC-----T-TAC-C-GACAGCTCCGAAA--ATATATGTT---T---CTC---AGACAAT-----GAGAAAGCAAATTGTTTAAATGAGTT-TTTTTGCTCTATCTCTAAC-----GT-A---G--ATGA
gi|48631 : agacaaaagaaaatagcgaccaaaagtacaaaccaaaatgatAATAGACAATA--ATGGTTAAAATATAAATAAAAATACGAAACAAAGTTAATAATTTAAAAAAGCTCACAAAAGAA-AGTCTATTTAGCAACATTGAAAA--TAC------TT--TT--AG------------------TG------AGTCCTAA-ATA-TTATTAGAAACTTCTTCGTCAG--TA-AATAA-A------A-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--TGC----AAT--TCCGCCAC----T-GAA-ATCGACA---------GT-A-AACAG---TTATG--AAACATTCT--GT---TTT---G-AAGATTAT--GAAAAGGCAAATTGTTTAAATAATTACTTTTGT-TTAGTTTC-AAG----TGT-A---A--ACGACA---ATGGTATAAA
gi|48632 : AGACAACA--ATGGTTAAAATATAAAAAGT--TACGAAACAAAGTTAACAATTTAAAAAAGCATGCAAAAGAAAGTTTC-TTTAGCAACATTGAAGG--TACG----A----TT--AG-T-----G-GGGCCTTTAT-TGAC--AATCCTAA-ATA-TTATTGGAAACTTCTTCGTCAG-TAA-ATAAA-A------A-C-TTA--CA--AA-AATTCAG---------A--TGC----AAT--TCTGCCAC----T-GAA-ATCAACA---------AT-A-AACGG---TGTTG--AAACATTCT--GT---TTTGTAG-ATTAT-----GAAAAAGC-AACT
gi|48633 : ATGGAGTGAATTTAAAAAAG--AAAGAAATAAAGTAAATAACCTGAAAAAAAATGCTAAAGAAAAGTTT-TTTTTTAACATTGAAAC--CAGT----ATT--TC--AGA----------------------CA-AACCCGAA-AAT-ATATTGGAAATTACTTCAA-AGTTTT-ACAAA-A------ACC-TAA--TAATAA-AACTGAC---------A--CTT----ACTGATCCTC---------AAG-AC---CATTTTGAC-TGA-C-AACAC---TGA------ACACTTTAAAT---ATT---A-CTG--GCAACGACAAAGCTAAATGCTTAAACGATTC-TTTCACTTCAAGTTT-GACTTCTAAC-A------ATGAAA---A---TAT
gi|48634 : TGGAATAAATATAAA-AATGCTA-GAAATAAAGTTAACAATTTAAAAAAACATGCAAAAGAAAACTTA-TATAATAAT------------CT----G---------GAA-----A-TGA-----ATATTACA-AATC-------T-GCAATGGAAAATTATAAGACAT-TTT-GTTAACA------A-C--AG--CG--GT-TCCTC-G---------ACTAAT-----AT--TCCACCGCTTATT-GAA-AT-TAC-------CATGC----ATGG---TGATA--AATCATTCT--ATATATCT---A-ACGA---A--GAGAAAGCAAACTACTTAAATAAATA-CTTTGTTTCTACATC-CAC----GGT-AGATG--ATGAAA---A---T
gi|48635 : TGGAACAACTATAAGCGAA--TAAGAAA--AAGTAAATAACATGAAAAAACATGCCCAAGAAATATTT-TTCAATAGTAATGAATATTCATTACAAGAT--TT--AAAT-----A-CTA-----------CACAACCCTCACA---GTACTGGAAGCTGGTAAAAATG-CTT-ATAAA-AGAAAATA-C--AA--CA--AA-ATGTGAT---------A--AA------AT--ACCACCAC----T-AAA-AAATGAA--------------AACAA---TCAT----TT--TTCA--AT---TTC------TGATGAA--GAAATAGCCAATACCTTAAACAATTA-CTTCATTTCTATCTC-TAC----AAT-T---G--ATG--------------------ATACTGACTCTGAACTTTCAAATTTTGTTT-TGAAAAC
gi|48636 : TATAAAAAGT--TAAGAAACAAAGTTAATAATATGAAAAAACACGCGAAAGAACTATTT-TTTAATAATATCGAATT--CACT-----TTAATCGAAGAA-----A-AAA-----ATA-GT---AATCCCAG-AAA-ATACTGGAAACTT-TTAAAGAATTTT-ATCAA-A------A-C-TAA--TA--AA-ATTTCAG---------A--AAT----AAT--ACTTCCAT----T-GAA-A-ACAAAC-----T-TAC-CAAATGG---TGAAATTGTATATTCC--AT---TTC---G---GATAAA--GACAAGGCCAATCGTTTAAATAATTT-TTT
gi|48637 : AAATATAAAAAGT--TACAAAACAAAGC-----ATTTAAAA--------GAAAG----TTTT-TTTAGCAACATTGAAGA--TACT----ATT------AG-T-----G-GGGCCTTTAT-TGACA-A-TCTTAA-ATA-TTATTGGAAACTTCTTCGTCAG-TTA-ATACA-A------A-C-TAA--CA--AA-ATTTCAG---------A--TGC----GAT--TCCGCCAC----T-GAA-ATCAACA---------AT-T-AACGG---TGTTG--AAACATTCT--GT---TTTGTAG-ATTAT-----GAAAAAGCAACTTGTTTAAATAATTACTTTTGT
gi|48638 : AA-ATT-ATATAGGAAACTACTTAAACAG-TTC-ATTAA-G------A-C-AAA--CA--AA-AAATCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCCAC----T-AAA-ATATACCT-----C-TGT-T-TATTA---TGATG--ATTCATTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GATAAAGCAAACT------------------GTTTCCATCTC-AAC----AAT-A---A--ATGACA---G---TATTAAC--AATAAT-ATGTT--ACTTCCAGGCTGTGTCT-TTAAAAC
gi|48639 : ---TGGGG--ATGAAATCT--AC---TTTTAAA-ATGACGTA--GAAAAAGGAAATTGTTTGAATGACTA-TTTCTTTTCTATTTC-AAC----AATCA---GTAATGAAACTGA---TATAA
gi|48640 : C-AAC----AAT-A---G--GTGAAA---A---TACAAAC--AATACT-ACTCT--ACTTCCAGGGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48641 : C-AAC----AAT-A---G--GTGAAA---A---TACAAAC--AATACT-ACTCT--ACTTCCAGGGTGTATCT-TTAAAAC
blockSeqs : TCAATAC C GC C AA T T C T C T A A T TATT ACAAGATTT TGGGGCCTTTATTGACA C AA A T TG A C GAAAAT C AT TG AT T ATTTACTCT CT CGGAA GA T TTAT G T AT TTTTGACTGAC CTC AATT TT AA ATA GTAG GCAAC T T C C C C T TTCT C GATG ATGG AA G GA A C
blockSeqs : . C GT C GC T T C T C A A . G TA TTAGTTTC TGGGGCCTTTATTGAC . A A T T T . . . T . . . . . A . T . . . AT CTTACCA . GG TT . . GTAG GCA T T C C C C . . . GTA CTGA . . . A .
blockSeqs : . A GA C . T G A C C A A . T AT TTAATCGA ATGCGAATGTGTCA . A G . T T . . . T . . . . . A . T . . . CG TCTGTT . GG AA . . TAAA GCA A A T . A A . . . G A . . . G .
blockSeqs : . C GC C . T A C T G C A . G GA ATTGCC ATGCGAATGTGTAA . G A . A T . . . A . . . . . T . C . . . AT TCTGTT . AG TT . . AG ATC T T C . C A . . . G A . . . G .
blockSeqs : . A GA C . T T C T C A A . G GA GTTTT ACAGTAGTAAGACT . G A . T T . . . T . . . . . T . T . . . AT TTATAT . GG TA . . A GCA G A G . C T . . . A A . . . G .
blockSeqs : . T . C . C T C T C G T . A AA GTTTT GTACTAATAGGTCA . A T . A T . . . A . . . . . A . A . . . CG TCTATT . AA AA . . A TAT A A T . T A . . . G A . . . A .
blockSeqs : . . C . C T A A C C T . G CA ATTGT ATGCAAATGTGTCA . T T . T T . . . T . . . . . A . G . . . CA CTTACC . TG AA . . G GAA A T T . T A . . . G A . . . A .
blockSeqs : . T . C T A A A G C . T AA GTTCT ACAGCAGAAATGTA . T T . A A . . . T . . . . . A . G . . . AT TCTGTT . TG AT . . A AAA C A A . T T . . . A G . . . . .
blockSeqs : A . C A A A A T T . T GG GTTTT AAATGAATATTACA . T A . A A . . . T . . . . . A . T . . . AC CATGC . TA TT . . G GCA G C T . T T . . . G A
blockSeqs : A . T T A T A G T . T AC ATTTC ATCTCGGACAAAC . A T . T T . . . T . . . . . A . A . . . CA GTA . TG TA . . A GTA A C T . T C . . . A A
blockSeqs : C . T A A A A C T . T TT TTTT AAAAAAATAGT . G G . T A . . . T . . . . . G . A . . . AT ATA . TG AA . . A A C A T . . T . . . G .
blockSeqs : A . C T A C C A T . C GA ATT ATACTACAC . G T . T C . . . T . . . . . A . T . . . A ATT . GG TT . . G . A A C . . . . G .
blockSeqs : A . C . A G . A T . T . ATT ACA . A T . T A . . . A . . . . . . . G . . . T . . T TG . . A . T A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . T T . . . G TG . T A . A T . . . . . . . . . . . T . . . . . . A . . . . A .
blockSeqs : . A . . C . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : AAAGACAAAGGCCGCAA-------GGACTCAANAGACAGAAGCATGGACAAAATACAAACAAT--TAAGAAACAAAGTTAATAATTTGAAAAAACATGCNAAAGAACANTNT-TTTAATAATATTGAANA--CACT----GTT--TT--AGAT-----A-CGA-----ATGTGTCA-AATCCTAA-ATT-ATATTGGAAACTNCTTAAACAG-TTT-ATTAA-A------A-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--AAT----AAT--TCCNCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AACGG---TGANG--ATNCATTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GANAAAGCNAACTGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCNATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
finalCons : AAAGACAAAGGCCGCAA-------GGACTCAANAGACAGAAGCATGGACAAAATACAAACAAT--TAAGAAACAAAGTTAATAATTTGAAAAAACATGCNAAAGAACANTNT-TTTAATAATATTGAANA--CACT----GTT--TT--AGAT-----A-CGA-----ATGTGTCA-AATCCTAA-ATT-ATATTGGAAACTNCTTAAACAG-TTT-ATTAA-A------A-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--AAT----AAT--TCCNCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AACGG---TGANG--ATNCATTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GANAAAGCNAACTGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCNATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 1111111 1111111111111 44444444444444444444444444 111111111 22222222222222 11111 11111
lowQualScore : 8888888 2 99 0 0 1 0 77 1 2 2 1 3 1 1 2 1 8888 1111111111111 33333333333333333333333333 0 2 33 3 5 22 3 2 777777 2 44 33 33 2 0 000000000 33 55555 33 1 5555 2 2 77 22222222222222 444 5555 22 33 444 55555 22222 1 3 2 5 2 1 2 6666 2 555555 6666666 66 4 66 1 4
lowQualScore : ....... . .. . . . . .. . . . . . . . . . .... ............. .......................... . . .. . . .. . . ...... . .. .. .. . . ......... .. ..... .. . .... . . .. .............. ... .... .. .. ... ..... ..... . . . . . . . .... . ...... ....... .. . .. . .
lowQualScore : 6666666 8 66 2 8 1 1 33 9 7 2 0 3 0 0 7 7 5555 8888888888888 44444444444444444444444444 2 5 88 4 0 66 1 5 222222 5 55 44 44 5 2 000000000 44 66666 77 0 7777 7 7 55 33333333333333 777 5555 33 77 777 99999 11111 0 6 2 7 9 0 9 1111 9 999999 6666666 11 4 11 4 4
consensus : AAAGACAAAGGCCGCAA-------GGACTCAANAGACAGAAGCATGGACAAAATACAAACAAT--TAAGAAACAAAGTTAATAATTTGAAAAAACATGCNAAAGAACANTNT-TTTAATAATATTGAANA--CACT----GTT--TT--AGAT-----A-CGA-----ATGTGTCA-AATCCTAA-ATT-ATATTGGAAACTNCTTAAACAG-TTT-ATTAA-A------A-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--AAT----AAT--TCCNCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AACGG---TGANG--ATNCATTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GANAAAGCNAACTGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCNATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
Reference ( family-829 ) : AAAGACAAAGGCCGCAA-------GGACTCAANAGACAGAAGCATGGACAAAATACAAACAAT--TAAGAAACAAAGTTAATAATTTGAAAAAACATGCNAAAGAACANTNT-TTTAATAATATTGAANA--CACT----GTT--TT--AGAT-----A-CGA-----ATGTGTCA-AATCCTAA-ATT-ATATTGGAAACTNCTTAAACAG-TTT-ATTAA-A------A-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--AAT----AAT--TCCNCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AACGG---TGANG--ATNCATTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GANAAAGCNAACTGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCNATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48623 : AAAGACAAAGGCCGTAA-------GGACTCAAAAGACAGAAGCATGGACAAAACACAAACAAT--TAAGGAATAAAGTTAGTAATTTGAAAACACATGCTAAAGAACACTAT-TTTAATAATATTGAAAA--CACT----GTT--TT--AGAT-----A-CGA-----ATGTGTCA-TATTCTAA-ATT-ATATTGGAAACTACTTAAACAG-TTT-ATTAA-A------T-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AATGG---TGAGG--ATTCAGTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GGTAAAGCTAACTGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCCATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48624 : AAAGACAAAGGCCATAA-------GGACTCAACAGACAGAAGCATGGACAAAATACAAACAAT--TAAGGAATAAAGTTAATAATTTGAAAACACGTGCTAAAGAACATTAT-TTTAATAATATTGAATA--CACT----GTT--TT--AGAT-----G-CGA-----ATGTGTCA-AATTCTAA-ATT-ATATTGGAAACTACTTAAACAG-TTT-ATAAC-A------T-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCCAC----T-CAA-ATATACAT-----C-TGT-T-AATGG---TGAGG--ATTCAGTTT--AT---CTT---A-ATGATGCA--GATAAAGCTAACTGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCCATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48625 : AAAGACAAAGGTCACAA-------GGACTCAACAGACAGAAGTATGGACAAACTACAAACACT--TAAGGAATAAAG---AGAATTTGAAAACACATGCTAAAGAACAATAT-TTTAATAATATGGAAAT--CACT----GTT--TT--AGAT-----G-CGA-----ATGTGTAA-AATTCTAA-ATT-ATATCGGAAACTACTTAAACAG-TTT-ATTAA-G------G-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCAAC----T-AAG-ATATACAT-----C-TGT-T-AATGC---TTAGG--ATTCAGTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GATAAAGCTAACTGCTTAAACGACTA-TTTCCTCTCCATCTC-AAC----AAT-A---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTTCCAGAGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48626 : AAGGACAAAAGCTATAC-------GGACGCAAAAAACAGAAGATTGGACAAAATACAGACATT--TTAGAAATAAGGTTAATAACTTAAAAAAATATGCCAAGAAACAATAT-TTTAGGAATATTGAAGA--AATA----ATT--GT--AGAC-----A-GTA-----GTAAGACT-AATCCTAA-ATT-GTATTGGAAATTGCTAAAACAA-TTA-ATTAG-A------G-T-AAA--TA--AA-AATTGTG---------A--AAC----TAT--TCCTCCAT----T-AAA-AACGACAT-------TATAT-AACGG---TGAAG--AAAAATACC--A----TTT---G-ACGACATC--GAAAAAGCAAATAGTTTAAACAATTA-TTTTGTATCAATTTC-ATC----AAT-A---A--GT-----------CATGAGCAAAACAAT-ACTTT--ACTACCAACTTGT-TCTCTTAAAAC
gi|48627 : AAAGACGAAGACAGCAA---------ACTCA-----CA-----ACGAACGGAATA---ACAAT--TAAGGAATGAAGTGAGCAATTTGAAAACATATGCTAAGGAAGACTAC-TTTGATAATACGGAAGA--CAAT----GTT--CT--AGGT-----A-CTA-----ATAGGTCA-AATCCTAT-ATT-GTATAGGAAAATACTTAAAGGG-ATT-AT-----------A-T-TGG--CA--AGTAACACAA---------A--AAT----
gi|48628 : AGACAAAAGTCGTAA-------GGACTCAACAGATAGAAGCATGGACAAAATACAAACAAT--TAAGAAATAAAGTAAATAATTTGAAAACACATGCTAAAGAACAATAT-TTTAATA---TGGAAAA--CACT----GTT--TT--AGAT-----G-CAA-----ATGTGTCA-AATCCTAA-ATT-ATATTGGAAACTACTTAAACAG-TAA-ATTAA-G------A-C-AAA--CA--AA-AACTGAG---------A--AAT----TAT--TCCCCCAC----T-AAA-ATATACAT-----C-TAT-T-AACGG---TGAGG--ATTCATTCT--AA---TTT---A-ATGATGCA--GATAAAGCTAACTGCTTAAACGACTA-TTTCGTCTCAATCTC-AAC----AAT-G---G--ATGAAA---A---TATAAAC--AATAAT-ACTCT--ACTGCCAAAGTGTGTCT-TTAAAAC
gi|48629 : AGACAAAGGACACAATCAATACGAACGCAAAGAACAGACGACTGGACTAAATACAAACAGT--TAAGAAACAAAGTTAATAATTTGAAAACGCATGCTAAAGAACAGTTC-TTTAATAATATAGAA-----ACTTTA-GTT--TC--AGAC-----AGCAG-----AAATGT-A-AATCCAAA-ACT-TTACTGGAAACTTCTTAAACAG-ATT-ATTAA-G------G-CATGATGCG--AA-AAATCAAATTTACTCTA--AATCGGAAAT--CTCTTAAC----C-AAATATATATAT-----C-
gi|48630 : TGGAAAAAATACAAACGTT--TAAGGAACAAGGTTAACAACTTGAAAAAACATGCAAAAAAACGCTTT-TTCAGCAACTTGGAACA--AAAT----ATTG-CC--ACATCTCGGA-CAA-----AC-------AATCC-AA-ATCAATACTGGAAAAT-CTAAAGGAA-CTTGGTTAA-A------A-A-TAA--TA--GT-AAATCCG---------A--AAC----AAT--CCGAATAC----TGAAA-ACA-ACAC-----T-TAC-C-GACAGCTCCGAAA--ATATATGTT---T---CTC---AGACAAT-----GAGAAAGCAAATTGTTTAAATGAGTT-TTTTTGCTCTATCTCTAAC-----GT-A---G--ATGA
gi|48631 : agacaaaagaaaatagcgaccaaaagtacaaaccaaaatgatAATAGACAATA--ATGGTTAAAATATAAATAAAAATACGAAACAAAGTTAATAATTTAAAAAAGCTCACAAAAGAA-AGTCTATTTAGCAACATTGAAAA--TAC------TT--TT--AG------------------TG------AGTCCTAA-ATA-TTATTAGAAACTTCTTCGTCAG--TA-AATAA-A------A-C-TAA--CA--AA-AACTCAG---------A--TGC----AAT--TCCGCCAC----T-GAA-ATCGACA---------GT-A-AACAG---TTATG--AAACATTCT--GT---TTT---G-AAGATTAT--GAAAAGGCAAATTGTTTAAATAATTACTTTTGT-TTAGTTTC-AAG----TGT-A---A--ACGACA---ATGGTATAAA
gi|48632 : AGACAACA--ATGGTTAAAATATAAAAAGT--TACGAAACAAAGTTAACAATTTAAAAAAGCATGCAAAAGAAAGTTTC-TTTAGCAACATTGAAGG--TACG----A----TT--AG-T-----G-GGGCCTTTAT-TGAC--AATCCTAA-ATA-TTATTGGAAACTTCTTCGTCAG-TAA-ATAAA-A------A-C-TTA--CA--AA-AATTCAG---------A--TGC----AAT--TCTGCCAC----T-GAA-ATCAACA---------AT-A-AACGG---TGTTG--AAACATTCT--GT---TTTGTAG-ATTAT-----GAAAAAGC-AACT
gi|48633 : ATGGAGTGAATTTAAAAAAG--AAAGAAATAAAGTAAATAACCTGAAAAAAAATGCTAAAGAAAAGTTT-TTTTTTAACATTGAAAC--CAGT----ATT--TC--AGA----------------------CA-AACCCGAA-AAT-ATATTGGAAATTACTTCAA-AGTTTT-ACAAA-A------ACC-TAA--TAATAA-AACTGAC---------A--CTT----ACTGATCCTC---------AAG-AC---CATTTTGAC-TGA-C-AACAC---TGA------ACACTTTAAAT---ATT---A-CTG--GCAACGACAAAGCTAAATGCTTAAACGATTC-TTTCACTTCAAGTTT-GACTTCTAAC-A------ATGAAA---A---TAT
gi|48634 : TGGAATAAATATAAA-AATGCTA-GAAATAAAGTTAACAATTTAAAAAAACATGCAAAAGAAAACTTA-TATAATAAT------------CT----G---------GAA-----A-TGA-----ATATTACA-AATC-------T-GCAATGGAAAATTATAAGACAT-TTT-GTTAACA------A-C--AG--CG--GT-TCCTC-G---------ACTAAT-----AT--TCCACCGCTTATT-GAA-AT-TAC-------CATGC----ATGG---TGATA--AATCATTCT--ATATATCT---A-ACGA---A--GAGAAAGCAAACTACTTAAATAAATA-CTTTGTTTCTACATC-CAC----GGT-AGATG--ATGAAA---A---T
gi|48635 : TGGAACAACTATAAGCGAA--TAAGAAA--AAGTAAATAACATGAAAAAACATGCCCAAGAAATATTT-TTCAATAGTAATGAATATTCATTACAAGAT--TT--AAAT-----A-CTA-----------CACAACCCTCACA---GTACTGGAAGCTGGTAAAAATG-CTT-ATAAA-AGAAAATA-C--AA--CA--AA-ATGTGAT---------A--AA------AT--ACCACCAC----T-AAA-AAATGAA--------------AACAA---TCAT----TT--TTCA--AT---TTC------TGATGAA--GAAATAGCCAATACCTTAAACAATTA-CTTCATTTCTATCTC-TAC----AAT-T---G--ATG--------------------ATACTGACTCTGAACTTTCAAATTTTGTTT-TGAAAAC
gi|48636 : TATAAAAAGT--TAAGAAACAAAGTTAATAATATGAAAAAACACGCGAAAGAACTATTT-TTTAATAATATCGAATT--CACT-----TTAATCGAAGAA-----A-AAA-----ATA-GT---AATCCCAG-AAA-ATACTGGAAACTT-TTAAAGAATTTT-ATCAA-A------A-C-TAA--TA--AA-ATTTCAG---------A--AAT----AAT--ACTTCCAT----T-GAA-A-ACAAAC-----T-TAC-CAAATGG---TGAAATTGTATATTCC--AT---TTC---G---GATAAA--GACAAGGCCAATCGTTTAAATAATTT-TTT
gi|48637 : AAATATAAAAAGT--TACAAAACAAAGC-----ATTTAAAA--------GAAAG----TTTT-TTTAGCAACATTGAAGA--TACT----ATT------AG-T-----G-GGGCCTTTAT-TGACA-A-TCTTAA-ATA-TTATTGGAAACTTCTTCGTCAG-TTA-ATACA-A------A-C-TAA--CA--AA-ATTTCAG---------A--TGC----GAT--TCCGCCAC----T-GAA-ATCAACA---------AT-T-AACGG---TGTTG--AAACATTCT--GT---TTTGTAG-ATTAT-----GAAAAAGCAACTTGTTTAAATAATTACTTTTGT
gi|48638 : AA-ATT-ATATAGGAAACTACTTAAACAG-TTC-ATTAA-G------A-C-AAA--CA--AA-AAATCAG---------A--AAT----AAT--TCCTCCAC----T-AAA-ATATACCT-----C-TGT-T-TATTA---TGATG--ATTCATTCT--AT---TTT---A-ATGATGCA--GATAAAGCAAACT------------------GTTTCCATCTC-AAC----AAT-A---A--ATGACA---G---TATTAAC--AATAAT-ATGTT--ACTTCCAGGCTGTGTCT-TTAAAAC
gi|48639 : ---TGGGG--ATGAAATCT--AC---TTTTAAA-ATGACGTA--GAAAAAGGAAATTGTTTGAATGACTA-TTTCTTTTCTATTTC-AAC----AATCA---GTAATGAAACTGA---TATAA
gi|48640 : C-AAC----AAT-A---G--GTGAAA---A---TACAAAC--AATACT-ACTCT--ACTTCCAGGGTGTATCT-TTAAAAC
gi|48641 : C-AAC----AAT-A---G--GTGAAA---A---TACAAAC--AATACT-ACTCT--ACTTCCAGGGTGTATCT-TTAAAAC