lowQualScore                  :                                     11111                 44444444444444444444444444444444                   1111                          
lowQualScore                  :          1                   33 2   99999                 33333333333333333333333333333333  33  33 5     88  3333     2 4                  
lowQualScore                  :          .                   .. .   .....                 ................................  ..  .. .     ..  ....     . .                  
lowQualScore                  :          2                   22 4   22222                 77777777777777777777777777777777  22  44 0     00  6666     0 9                  
consensus                     :  AAAAAACGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GCC---G-GGTGTTCAAGTAAGAAT--------AG---C-N----------------GG--GG--G-AAAAC-CCC-G--GCCCCCGGCTTCTAATGACAGCCCTG
Reference ( gi|144587 )       :  AAAAAATGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GCC---T-GGTGTTCAAGTAAGAAT--------TG---C-A----------------GG--GG--G-AAAAC-TCC-A--GCCCCTGACTTCTAATGACAGCCCTG
gi|144586                     :  AAAAAATGGGAGAAACTCGGCTGAAAAT--A-GCC---G-GGTGTTCAAGTAAGAAC--------AGC--C-A----------------GG--GT--G-AAAAC-TCC-G--GCACCCGGCGTCTAGTGACAGCCCTG
gi|144585                     :  AAACAACAGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GAC---A-GGTGTTCAAGTAAGAAT--------AG---C-C----------------AT--GG--G-AAAAC-CCC-G--GCTCCTGGCTTCAAATGACAGCCCTG
gi|144588                     :  AAAAAAGGGTAGGAACGCAGCTGAAAAT--A-GCC---G-GGTGTTCAAGTAAGAAT--------AG---C-T----------------GG--GA--G-AAAAC-CCC-G--GTCCCCGGCTTTTAATGACAACCCTG
gi|144592                     :  AAAAAATG-AAGAAACTCAGCTAAAAAT--A-GCC---A-GGAGTTCAAGTAAGAAT--------AG---C-T----------------GT--GGCAA-AAAAC-GCC-A--ACTCCTGGCTTCTAATGACAGCCTTG
gi|144584                     : aAAGAAACGGAAGAAACTCCACTGAAAAT--A-GCC---G-GGTGTTCAAGTAAGAAT--------AG---C-C----------------AG--GG--G-AAAAC-CCT-G--GCCCACGGCTTCTTATTACAGCTCTG
gi|144590                     :  AAAAAATGTAAGAAACTCATCTGAAAAC--A-GCC---G-GATGTTCAAGTAAGATT--------AA---C-T----------------GG--GG--ACAAACC-CCC-G--GCCCCTGGCTTCTAATGACAGCC
gi|144589                     :  AAAAAACTGAAGAAACTCGACTGAAAAA--AAGCC---A-GATTTTCAAGTAAGAAT--------AG---C------------------CG--GG--G-AAAAC-CCC-G--ACCCC-GGCTTCTAATGACAGCCTTG
gi|144591                     :  AAAAGGCAGAATAAACTCAGCTGAAAAT--A-AA----T-GATGTTCAAGTAAGAAT--------AG---C-T----------------GG--GG--G-GGAAC-CCC-G--GCCACCAGCATCTAATGACAGCCCTG
gi|144593                     :  AAACAGTGGAAGAAACT--GCTGGAAAT--A-GCC---A-TATGTTCA-GTAGGAAT--------AG---CCA----------------GG--GG--G-GAAAC-CCA-G--GCCTCTGGCTTCTAATGCCAGCCCTG
gi|144594                     :  AAAAAATGTAAGAAACTCAGCTGGAAAT--A-GGT---G-GGTGTTCAAGTAAGAAT--------AG---C-C----------------GG--AG--G-AAAACATCC----GCCCCCAGCGTCAGATTACAGC
gi|144595                     :  AAAAAACGGAAGGAACTCAGCTGAAATT--A-GTT---A-AGTGTTCAAGTAAGAAT--------GGC--C-A----------------GG--GG--GAAAAAC-CCT-G--GCCCC
gi|144596                     :  AAAAAACATAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GCTAAGTGGGTGTTCAAGTAAGAAT--------AGCCCC-A------------------------G-AAAAC-CCC-GATGCCCCTCA--TCTATTGACATCCCTGcagtagataaagccctg
gi|144598                     :  AAAAAATAGAAGAAACTCAGCTG-----------------GGTGTTCAGATAGGAATAGTCGGTGTG---T-ATGTGTGTGTGTGGGGGGG--GG--G-GGAAC-CCT-G--GCCCCCAGTTTCTAATGACAGCCCTG
gi|144597                     :  AGAAAACGAAAGAAATTCAGCTAAAAAT--A-GGC---G-GGTGTTCAAGTAAGAAT--------AGC--C-A----------------GG--G
gi|144599                     :  AAAAAATG-AGGAAACTCAGCTGAAAGCTAA-GCT---G-GGTGTTCAAATAAGAAT--------AG---C-C----------------GGGTGG--G-AAAA
gi|144600                     :   AAAAATGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GCC---G-AGTGTTCAAGAAGGAAT--------AG---C-
gi|144601                     :    AAAACAGAAGAAACACAGCTGAAAAT--A-GCC---G-GGTGTTTAAGTAAGAAT--------AGA--C-G----------------GG--GA--A-AAAAC-ACC-G--GTCCTTGGCTTCAAATGACAGCCTTGc
gi|144602                     :                                                                    G---T-A----------------GA--AG--G-AAAAC-CCCCG--GCCCCCAGCGTCTAATTACAGCCCTG





Alignments
lowQualScore                  :                                                              22222222222222222222222222222                                                
lowQualScore                  :                             33 2  4444                     2 33333333333333333333333333333 33  55 2        2 33     0   0    2            
lowQualScore                  :                             .. .  ....                     . ............................. ..  .. .        . ..     .   .    .            
lowQualScore                  :                             11 2  7777                     1 88888888888888888888888888888 11  33 4        5 44     1   2    5            
consensus                     : AAAAAACGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAG-C--C-G------------------------G--GG--G-AAAACCCC-G--GCCCCCGGCTTCTA-ATGACAGCCCTG
Reference ( family-822 )      : AAAAAACGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAG-C--N-G------------------------G--GG--G-AAAACCCC-G--GCCCCCGGCTTCTA-ATGACAGCCCTG
gi|144584                     : AAGAAACGGAAGAAACTCCACTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAG-C--C-A------------------------G--GG--G-AAAACCCT-G--GCCCACGGCTTCTT-ATTACAGCTCTG
gi|144585                     : AAACAACAGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GA----CAGGTGTTCAAGTAAGAATAG-C--C-A------------------------T--GG--G-AAAACCCC-G--GCTCCTGGCTTCAA-ATGACAGCCCTG
gi|144586                     : AAAAAATGGGAGAAACTCGGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAACAG-C--C-A------------------------G--GGT-G-AAAACTCC-G--GCACCCGGCGTCTA-GTGACAGCCCTG
gi|144587                     : AAAAAATGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CTGGTGTTCAAGTAAGAATTG-C--A-G------------------------G--GG--G-AAAACTCC-A--GCCCCTGACTTCTA-ATGACAGCCCTG
gi|144588                     : AAAAAAGGGTAGGAACGCAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAG-C--T-G------------------------G--GA--G-AAAACCCC-G--GTCCCCGGCTTTTA-ATGACAACCCTG
gi|144589                     : AAAAAACTGAAGAAACTCGACTGAAAAA--AAGC----CAGATTTTCAAGTAAGAATAG-C--C-G------------------------G--GG----AAAACCCC-G--ACCCC-GGCTTCTA-ATGACAGCCTTG
gi|144590                     : AAAAAATGTAAGAAACTCATCTGAAAAC--A-GC----CGGATGTTCAAGTAAGATTAA-C--T-G------------------------G--GG--ACAAACCCCC-G--GCCCCTGGCTTCTA-ATGACAGCC
gi|144591                     : AAAAGGCAGAATAAACTCAGCTGAAAAT--A-AA----TGA-TGTTCAAGTAAGAATAG-C--T-G------------------------G--GG--G-GGAACCCC-G--GCCACCAGCATCTA-ATGACAGCCCTG
gi|144592                     : AAAAAAATGAAGAAACTCAGCTAAAAAT--A-GC----CAGGAGTTCAAGTAAGAATAG-C--T-G------------------------T--GGCAA-AAAACGCC-A--ACTCCTGGCTTCTA-ATGACAGCCTTG
gi|144593                     : AAACAGTGGAAGAAACT--GCTGGAAAT--A-GC----CATATGTTCA-GTAGGAATAG-C--CAG------------------------G--GG--G-GAAACCCA-G--GCCTCTGGCTTCTA-ATGCCAGCCCTG
gi|144594                     : AAAAAATGTAAGAAACTCAGCTGGAAAT--A-GG----TGGGTGTTCAAGTAAGAATAG-C--C-G------------------------G--AG--G-AAAACATC-C--GCCCCCAGCGTCAG-ATTACAGC
gi|144595                     : AAAAAACGGAAGGAACTCAGCTGAAATT--A-GT----TAAGTGTTCAAGTAAGAATGG-CCAG-G------------------------G--GG--A-AAAACCCT-G--GCCCCCAG----TAGATAA-AGCCCTG
gi|144596                     : AAAAAACATAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GCTAAGTGGGTGTTCAAGTAAGAATAG-C--C--------------------------C--CA--G-AAAACCCC-GATGCCCCT--CATCTA-TTGACATCCCTG
gi|144597                     : AGAAAACGAAAGAAATTCAGCTAAAAAT--A-GG----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAG-C--C-A------------------------G--GG--
gi|144598                     : AAAAAATAGAAGAAACTCAGCTG-----------------GGTGTTCAGATAGGAATAG-T--C-GGTGTGTATGTGTGTGTGTGGGGGGG--GG--G-GGAACCCT-G--GCCCCCAGTTTCTA-ATGACAGCCCTG
gi|144599                     : AAAAAATG-AGGAAACTCAGCTGAAAGCTAA-GC----TGGGTGTTCAAATAAGAATAG-C--C-G------------------------GGTGG--G-AAAA
gi|144600                     :  AAAAATGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CGAGTGTTCAAGAAGGAATAG-C--
gi|144601                     :   AAAACAGAAGAAACACAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTTAAGTAAGAATAGAC--G-G------------------------G--GA--A-AAAACACC-G--GTCCTTGGCTTCAA-ATGACAGCCTTGc
gi|144602                     :                                                           G-T--A-G------------------------A--AG--G-AAAACCCCCG--GCCCCCAGCGTCTA-ATTACAGCCCTG





Alignments
lowQualScore                  :                                                              222222222222222222222222222                                                
lowQualScore                  :                             33 2  4444                       777777777777777777777777777 33  77 2        2 33         0    2            
lowQualScore                  :                             .. .  ....                       ........................... ..  .. .        . ..         .    .            
lowQualScore                  :                             11 2  7777                       666666666666666666666666666 22  55 4        5 44         2    5            
consensus                     : AAAAAACGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--G------------------------G--GG--G-AAAACCCC-G--GCCCCCGGCTTCTA-ATGACAGCCCTG
Reference ( family-822 )      : AAAAAACGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--G------------------------G--GG--G-AAAACCCC-G--GCCCCCGGCTTCTA-ATGACAGCCCTG
gi|144584                     : AAGAAACGGAAGAAACTCCACTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--A------------------------G--GG--G-AAAACCCT-G--GCCCACGGCTTCTT-ATTACAGCTCTG
gi|144585                     : AAACAACAGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GA----CAGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--A------------------------T--GG--G-AAAACCCC-G--GCTCCTGGCTTCAA-ATGACAGCCCTG
gi|144586                     : AAAAAATGGGAGAAACTCGGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAACAGCC--A------------------------G--GGT-G-AAAACTCC-G--GCACCCGGCGTCTA-GTGACAGCCCTG
gi|144587                     : AAAAAATGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CTGGTGTTCAAGTAAGAATTGCA--G------------------------G--GG--G-AAAACTCC-A--GCCCCTGACTTCTA-ATGACAGCCCTG
gi|144588                     : AAAAAAGGGTAGGAACGCAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCT--G------------------------G--GA--G-AAAACCCC-G--GTCCCCGGCTTTTA-ATGACAACCCTG
gi|144589                     : AAAAAACTGAAGAAACTCGACTGAAAAA--AAGC----CAGATTTTCAAGTAAGAATAGCC---------------------------G--GG--G-AAAACCCC-G--A-CCCCGGCTTCTA-ATGACAGCCTTG
gi|144590                     : AAAAAATGTAAGAAACTCATCTGAAAAC--A-GC----CGGATGTTCAAGTAAGATTAACT--G------------------------G--GG--ACAAACCCCC-G--GCCCCTGGCTTCTA-ATGACAGCC
gi|144591                     : AAAAGGCAGAATAAACTCAGCTGAAAAT--A-AA----TGA-TGTTCAAGTAAGAATAGCT--G------------------------G--GG--G-GGAACCCC-G--GCCACCAGCATCTA-ATGACAGCCCTG
gi|144592                     : AAAAAAATGAAGAAACTCAGCTAAAAAT--A-GC----CAGGAGTTCAAGTAAGAATAGCT--G------------------------T--GGCAA-AAAACGCC-A--ACTCCTGGCTTCTA-ATGACAGCCTTG
gi|144593                     : AAACAGTGGAAGAAACT--GCTGGAAAT--A-GC----CATATGTTCA-GTAGGAATAGCCA-G------------------------G--GG--G-GAAACCCA-G--GCCTCTGGCTTCTA-ATGCCAGCCCTG
gi|144594                     : AAAAAATGTAAGAAACTCAGCTGGAAAT--A-GG----TGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--G------------------------G--AG--G-AAAACATC-C--GCCCCCAGCGTCAG-ATTACAGC
gi|144595                     : AAAAAACGGAAGGAACTCAGCTGAAATT--A-GT----TAAGTGTTCAAGTAAGAATGGCCAGG------------------------G--GG--A-AAAACCCT-G--GCCCCCAG----TAGATAA-AGCCCTG
gi|144596                     : AAAAAACATAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GCTAAGTGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC---------------------------C--CA--G-AAAACCCC-GATGCCCCT--CATCTA-TTGACATCCCTG
gi|144597                     : AGAAAACGAAAGAAATTCAGCTAAAAAT--A-GG----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--A------------------------G--GG--
gi|144598                     : AAAAAATAGAAGAAACTCAGCTG-----------------GGTGTTCAGATAGGAATAGTC--GGTGTGTATGTGTGTGTGTGGGGGGG--GG--G-GGAACCCT-G--GCCCCCAGTTTCTA-ATGACAGCCCTG
gi|144599                     : AAAAAATG-AGGAAACTCAGCTGAAAGCTAA-GC----TGGGTGTTCAAATAAGAATAGCC--G------------------------GGTGG--G-AAAA
gi|144600                     :  AAAAATGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CGAGTGTTCAAGAAGGAATAGCC--
gi|144601                     :   AAAACAGAAGAAACACAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTTAAGTAAGAATAGAC--G------------------------G--GGA-A-AAAACACC-G--GTCCTTGGCTTCAA-ATGACAGCCTTG
gi|144602                     :                                                                                             G--G-AAAACCCCCG--GCCCCCAGCGTCTA-ATTACAGCCCTG





Alignments
lowQualScore                  :                                                              222222222222222222222222222                                                
lowQualScore                  :                             33 2  4444                       777777777777777777777777777 33  77 2        2 33         0    2            
lowQualScore                  :                             .. .  ....                       ........................... ..  .. .        . ..         .    .            
lowQualScore                  :                             11 2  7777                       666666666666666666666666666 22  55 4        5 44         2    5            
consensus                     : AAAAAACGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--G------------------------G--GG--G-AAAACCCC-G--GCCCCCGGCTTCTA-ATGACAGCCCTG
Reference ( family-822 )      : AAAAAACGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--G------------------------G--GG--G-AAAACCCC-G--GCCCCCGGCTTCTA-ATGACAGCCCTG
gi|144584                     : AAGAAACGGAAGAAACTCCACTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--A------------------------G--GG--G-AAAACCCT-G--GCCCACGGCTTCTT-ATTACAGCTCTG
gi|144585                     : AAACAACAGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GA----CAGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--A------------------------T--GG--G-AAAACCCC-G--GCTCCTGGCTTCAA-ATGACAGCCCTG
gi|144586                     : AAAAAATGGGAGAAACTCGGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAACAGCC--A------------------------G--GGT-G-AAAACTCC-G--GCACCCGGCGTCTA-GTGACAGCCCTG
gi|144587                     : AAAAAATGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CTGGTGTTCAAGTAAGAATTGCA--G------------------------G--GG--G-AAAACTCC-A--GCCCCTGACTTCTA-ATGACAGCCCTG
gi|144588                     : AAAAAAGGGTAGGAACGCAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCT--G------------------------G--GA--G-AAAACCCC-G--GTCCCCGGCTTTTA-ATGACAACCCTG
gi|144589                     : AAAAAACTGAAGAAACTCGACTGAAAAA--AAGC----CAGATTTTCAAGTAAGAATAGCC---------------------------G--GG--G-AAAACCCC-G--A-CCCCGGCTTCTA-ATGACAGCCTTG
gi|144590                     : AAAAAATGTAAGAAACTCATCTGAAAAC--A-GC----CGGATGTTCAAGTAAGATTAACT--G------------------------G--GG--ACAAACCCCC-G--GCCCCTGGCTTCTA-ATGACAGCC
gi|144591                     : AAAAGGCAGAATAAACTCAGCTGAAAAT--A-AA----TGA-TGTTCAAGTAAGAATAGCT--G------------------------G--GG--G-GGAACCCC-G--GCCACCAGCATCTA-ATGACAGCCCTG
gi|144592                     : AAAAAAATGAAGAAACTCAGCTAAAAAT--A-GC----CAGGAGTTCAAGTAAGAATAGCT--G------------------------T--GGCAA-AAAACGCC-A--ACTCCTGGCTTCTA-ATGACAGCCTTG
gi|144593                     : AAACAGTGGAAGAAACT--GCTGGAAAT--A-GC----CATATGTTCA-GTAGGAATAGCCA-G------------------------G--GG--G-GAAACCCA-G--GCCTCTGGCTTCTA-ATGCCAGCCCTG
gi|144594                     : AAAAAATGTAAGAAACTCAGCTGGAAAT--A-GG----TGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--G------------------------G--AG--G-AAAACATC-C--GCCCCCAGCGTCAG-ATTACAGC
gi|144595                     : AAAAAACGGAAGGAACTCAGCTGAAATT--A-GT----TAAGTGTTCAAGTAAGAATGGCCAGG------------------------G--GG--A-AAAACCCT-G--GCCCCCAG----TAGATAA-AGCCCTG
gi|144596                     : AAAAAACATAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GCTAAGTGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC---------------------------C--CA--G-AAAACCCC-GATGCCCCT--CATCTA-TTGACATCCCTG
gi|144597                     : AGAAAACGAAAGAAATTCAGCTAAAAAT--A-GG----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--A------------------------G--GG--
gi|144598                     : AAAAAATAGAAGAAACTCAGCTG-----------------GGTGTTCAGATAGGAATAGTC--GGTGTGTATGTGTGTGTGTGGGGGGG--GG--G-GGAACCCT-G--GCCCCCAGTTTCTA-ATGACAGCCCTG
gi|144599                     : AAAAAATG-AGGAAACTCAGCTGAAAGCTAA-GC----TGGGTGTTCAAATAAGAATAGCC--G------------------------GGTGG--G-AAAA
gi|144600                     :  AAAAATGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CGAGTGTTCAAGAAGGAATAGCC--
gi|144601                     :   AAAACAGAAGAAACACAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTTAAGTAAGAATAGAC--G------------------------G--GGA-A-AAAACACC-G--GTCCTTGGCTTCAA-ATGACAGCCTTG
gi|144602                     :                                                                                             G--G-AAAACCCCCG--GCCCCCAGCGTCTA-ATTACAGCCCTG


blockSeqs                     :                             TA A  TAAG                       GGTGTGTATGTGTGTGTGTGGGGGG   GT  CA C        C AT              G
blockSeqs                     :                             .  .  .                          AGG                         .   T  .        . .               .
blockSeqs                     :                             .  .  .                          AG                          .   A  .        . .               .
blockSeqs                     :                             .  .  .                          A                           .   .  .        . .               .
blockSeqs                     :                             .  .  .                          A                           .   .  .        . .               .
blockSeqs                     :                             .  .  .                          G                           .   .  .        . .               .
blockSeqs                     :                             .  .  .                          G                           .   .  .        . .               .
blockSeqs                     :                             .  .  .                          G                           .   .  .        . .               .
blockSeqs                     :                             .  .  .                          G                           .   .  .        . .               .
blockSeqs                     :                             .  .  .                          G                           .   .  .        . .               .
blockSeqs                     :                             .  .  .                          G                           .   .  .        . .               .
blockSeqs                     :                             .  .  .                          A                           .   .  .        . .               .
blockSeqs                     :                             .  .  .                          G                           .   .  .        . .               .
blockSeqs                     :                             .  .  .                          G                           .   .  .        . .               .
blockSeqs                     :                             .  .  .                          .                           .   .  .        . .               .
blockSeqs                     :                             .  .  .                          .                           .   .  .                           
blockSeqs                     :                             .  .  .                                                          .                              


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : AAAAAACGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--G------------------------G--GG--G-AAAACCCC-G--GCCCCCGGCTTCTA-ATGACAGCCCTG
finalCons                     : AAAAAACGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--G------------------------G--GG--G-AAAACCCC-G--GCCCCCGGCTTCTA-ATGACAGCCCTG





Alignments
lowQualScore                  :                                                              222222222222222222222222222                                                
lowQualScore                  :                             33 2  4444                       777777777777777777777777777 33  77 2        2 33         0    2            
lowQualScore                  :                             .. .  ....                       ........................... ..  .. .        . ..         .    .            
lowQualScore                  :                             11 2  7777                       666666666666666666666666666 22  55 4        5 44         2    5            
consensus                     : AAAAAACGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--G------------------------G--GG--G-AAAACCCC-G--GCCCCCGGCTTCTA-ATGACAGCCCTG
Reference ( family-822 )      : AAAAAACGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--G------------------------G--GG--G-AAAACCCC-G--GCCCCCGGCTTCTA-ATGACAGCCCTG
gi|144584                     : AAGAAACGGAAGAAACTCCACTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--A------------------------G--GG--G-AAAACCCT-G--GCCCACGGCTTCTT-ATTACAGCTCTG
gi|144585                     : AAACAACAGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GA----CAGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--A------------------------T--GG--G-AAAACCCC-G--GCTCCTGGCTTCAA-ATGACAGCCCTG
gi|144586                     : AAAAAATGGGAGAAACTCGGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAACAGCC--A------------------------G--GGT-G-AAAACTCC-G--GCACCCGGCGTCTA-GTGACAGCCCTG
gi|144587                     : AAAAAATGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CTGGTGTTCAAGTAAGAATTGCA--G------------------------G--GG--G-AAAACTCC-A--GCCCCTGACTTCTA-ATGACAGCCCTG
gi|144588                     : AAAAAAGGGTAGGAACGCAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCT--G------------------------G--GA--G-AAAACCCC-G--GTCCCCGGCTTTTA-ATGACAACCCTG
gi|144589                     : AAAAAACTGAAGAAACTCGACTGAAAAA--AAGC----CAGATTTTCAAGTAAGAATAGCC---------------------------G--GG--G-AAAACCCC-G--A-CCCCGGCTTCTA-ATGACAGCCTTG
gi|144590                     : AAAAAATGTAAGAAACTCATCTGAAAAC--A-GC----CGGATGTTCAAGTAAGATTAACT--G------------------------G--GG--ACAAACCCCC-G--GCCCCTGGCTTCTA-ATGACAGCC
gi|144591                     : AAAAGGCAGAATAAACTCAGCTGAAAAT--A-AA----TGA-TGTTCAAGTAAGAATAGCT--G------------------------G--GG--G-GGAACCCC-G--GCCACCAGCATCTA-ATGACAGCCCTG
gi|144592                     : AAAAAAATGAAGAAACTCAGCTAAAAAT--A-GC----CAGGAGTTCAAGTAAGAATAGCT--G------------------------T--GGCAA-AAAACGCC-A--ACTCCTGGCTTCTA-ATGACAGCCTTG
gi|144593                     : AAACAGTGGAAGAAACT--GCTGGAAAT--A-GC----CATATGTTCA-GTAGGAATAGCCA-G------------------------G--GG--G-GAAACCCA-G--GCCTCTGGCTTCTA-ATGCCAGCCCTG
gi|144594                     : AAAAAATGTAAGAAACTCAGCTGGAAAT--A-GG----TGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--G------------------------G--AG--G-AAAACATC-C--GCCCCCAGCGTCAG-ATTACAGC
gi|144595                     : AAAAAACGGAAGGAACTCAGCTGAAATT--A-GT----TAAGTGTTCAAGTAAGAATGGCCAGG------------------------G--GG--A-AAAACCCT-G--GCCCCCAG----TAGATAA-AGCCCTG
gi|144596                     : AAAAAACATAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GCTAAGTGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC---------------------------C--CA--G-AAAACCCC-GATGCCCCT--CATCTA-TTGACATCCCTG
gi|144597                     : AGAAAACGAAAGAAATTCAGCTAAAAAT--A-GG----CGGGTGTTCAAGTAAGAATAGCC--A------------------------G--GG--
gi|144598                     : AAAAAATAGAAGAAACTCAGCTG-----------------GGTGTTCAGATAGGAATAGTC--GGTGTGTATGTGTGTGTGTGGGGGGG--GG--G-GGAACCCT-G--GCCCCCAGTTTCTA-ATGACAGCCCTG
gi|144599                     : AAAAAATG-AGGAAACTCAGCTGAAAGCTAA-GC----TGGGTGTTCAAATAAGAATAGCC--G------------------------GGTGG--G-AAAA
gi|144600                     :  AAAAATGGAAGAAACTCAGCTGAAAAT--A-GC----CGAGTGTTCAAGAAGGAATAGCC--
gi|144601                     :   AAAACAGAAGAAACACAGCTGAAAAT--A-GC----CGGGTGTTTAAGTAAGAATAGAC--G------------------------G--GGA-A-AAAACACC-G--GTCCTTGGCTTCAA-ATGACAGCCTTG
gi|144602                     :                                                                                             G--G-AAAACCCCCG--GCCCCCAGCGTCTA-ATTACAGCCCTG