lowQualScore : 0 0 0 0 0 00 00 00 0000 5 0
lowQualScore : . . . . . .. .. .. .... . .
lowQualScore : 4 4 4 4 4 66 66 66 9999 5 7
consensus : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATT
Reference ( gi|51993 ) : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGATTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACT
gi|51983 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ATCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52035 : ATTCCCCATGT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--CAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTATACTt
gi|52004 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCGT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAa
gi|52050 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAACAATTTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----TTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAATACAGGTTTAACTGTAt
gi|52020 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAATTTG--CCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCAATTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAtatggtatgttcaatttcttc
gi|52083 : ATTTCCCATTT-CT-C-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--GAAACCTGTCTT--AAAAAGCCACCTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTCTACTatttat
gi|52088 : ATTTCCCATTT-CT-A-AGCTTTT-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CCCCTTCCCTTGACTGGCCACTTAAGATAGGTTTGACTGTAttg
gi|52091 : ATTTCCGATTT-AT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGCATTAA--ACA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTATGACAGGTTTGACTGTATT
gi|52024 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-AACTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACGGGTTTGACAGTATTtgcaagtggttatttattccaggatgggtatcaaacccgaattgtgcatgctccatcagaactataaaaccactgctatttt
gi|52056 : ATTTCCCAATT-CT-A-TGCTTTC-AGAATAAATTA-CCCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAAGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGAATGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAtatttattct
gi|52046 : ATTTCCTATTT-CT-A-TGCTTTA-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCTCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGGCTGTA
gi|52040 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGTATCAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCATTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTGCTGTAtagtttctagaacattataggatataggatatatga
gi|51999 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTCA--TCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTCACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTtatg
gi|52087 : ATTTCCCGTAT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACCATTG----CTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52077 : ACTTCCCATTT-CT-A-TACTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACATCCTGTCTC--AAAAGGCCACTATTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAAACAGGTTTGACTGTA
gi|52007 : ATATCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCGGTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCATCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAtatg
gi|52026 : ATTTCCCAATT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATAA-ACCTTTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--GAAGGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCCTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|51987 : ATTTTCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAGTTA-ACCTCTATTAG--GCA--ACAACCAGTCTT--AATAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTt
gi|52098 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GTA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTT----CTCCCTTACTTGATTGGCTTCTTAAGACAGGTTTGACTGTAagattttgttcagtccaa
gi|51994 : ATTTCCAATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACTTGGATTAA--GTA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAtgaatctctttattttatc
gi|52013 : ATTTCCCAATT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTCATTCCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTACTGTAt
gi|52016 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTTTACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTATCTT--AAAAGGCCATTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCAGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAt
gi|52033 : ATTTTCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ATCTGTATTAA--TCA--ACAACCTGTCTT--ATAAGGCCACCTTTG----CTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAt
gi|52039 : ATTTCCCATTT-TG-A-TGCTTCT-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCT--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGT
gi|51984 : ATTTCCTATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTCA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGACAAATTTTG----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACTgtataataatgttt
gi|52054 : ATTTCCCATGT-CT-A-TGCTATC-AAAGTAAATTA-ACCTGTGTTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CACCTTCCCTTGAGTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52084 : ATTTCCCATTT-CT-C-TGCGTTC-AGAGCAAATTG-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTTCCTCCCTTGACTGGCTGCTTCAGACAGGTTTGACTGTAtatacttccacttttat
gi|51995 : ATTTCCTATGT-CTTA-TGCTTTC-AGGGTAAATTA-ACCTGCTTTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACTgtgtttt
gi|52094 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACATCCCGTCTT--AAGATGCTACGTTTG----CTCCTTTCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52031 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-ATAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----TTCCTCTCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGTCTGTATTgttaagttt
gi|52022 : ATTCCCTATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACCACCTGTTTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCCCTTGACTTGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52023 : ATTTTCTATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTGAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTTTTTAAGACAGGTTTGAATGTAt
gi|52066 : ATTTCCCATTT-CT-A-AACTTTC-AGAGTAAATTT-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACCTTTG----CCTTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAt
gi|52063 : ATTTCCCATTT-GT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTGTTAA--GCA--ACAACATGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCCCTTGACTGGCTGTTTAAGACAGGTTTTACTGTA
gi|52061 : ATCTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTT-ACCTGTATTAA--GCA--ACATCCTATCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCTTTTGATTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGAATGTACtattgtttccct
gi|52085 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGTCTTAA--GCA--ACAACATGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCGTT-CCTTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACTatgt
gi|52048 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTTTAGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--GCCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTGCTCCCTCCCTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAat
gi|52080 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGACCAAATTA-ACTCATATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCAATTTGG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTCACTGTACtatgt
gi|52041 : ATTTCCCATTT-TT-A-TGCTTTT-ATAGCAAATTC-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTCCTTTCCTGGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAaatgt
gi|52043 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTTA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTGG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTATTTAGGACAGATTTAACAGTAt
gi|51997 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGTATAAA--ACA--ATAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCCCTCAGCTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAtatatttttcttttaaatggggta
gi|52092 : ATTTCACATTT-CT-A-TGCGTTC-ATAGTAAATTA-ACCTGTACTAA--GCA--ACACCTTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCTTTCCCTTGATTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAtattgttttttattctgt
gi|52059 : ATTTCCCATTT-AT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATAA-ATCTGCATTAA--ACA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCACTTGACTGCCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAt
gi|52042 : ATTTCCCATTT-CT-A-TCCTTTC-AGAGGAAATTA-ACTAGTATTAA--GCA--ATAACCTGTCTT--AAAAGGCCATTTTTG----CTCATTCCCTTGACTAGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTt
gi|52029 : ATTTCCTATTT-AT-A-TGATTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--GAAAGGTCATTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGA-TGTAgttttttt
gi|52075 : ATTTCCCATTT-CT-A-AGCCTTC-AGGGAAAATTA-ACCTGTATTTA--GCA--ACAACCTGTTTT--AAAGGGTCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTAGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAattattttaaggtttttttat
gi|52037 : ATTTCCCATTT-CT----GTTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTTTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTACCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTt
gi|52095 : ATTTCCCATTT-AT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTG-ATCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCATGACTGACTACTTAAGCCAGGTGTGACTGTgtgtttttatatatatatatatatatatata
gi|51996 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGTATAAA--ACA--ATAATCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----TTCATTCCCTCGGCTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52090 : ATTTTCTATTT-TT-AATGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGAATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTTACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTATTtattgttttt
gi|52036 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTATAATAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACCTGTG----CTTTTTTCCATGATTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGT
gi|52006 : ATATCCCATTT-CT-A-AGCTTTC-ATAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAATAGCCACTTTT-----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTtcatgtatt
gi|52017 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGGAAATTA-ACCTGTATTAA--A------AACCTGTCTT--AAAAGGCAACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGATTGGACTGTATT
gi|52005 : ATTTCCCATTT-CT-A-TAGTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTCTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--GAAAGGCCACTTTTG----TTCCTTCCATTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTACTGTA
gi|52065 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ATCACCTTGCTT--AAAAAGCCACTTTTG----CTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGattatgt
gi|51981 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGAAAATTA-ACCTGTATTAA--ACA--TCACTCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTTCCTTGACTGGCTGATTAAGACGGGCTTAACTGTA
gi|52012 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTT-AGAGCAAATTC-ATCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT---TAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCTGTCACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTtgtgttt
gi|52000 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTGTC-AGACTAAATTA-ACCTGTATGAA--GCA--GCAACCTATCTT--AAAAGGTCACATTTG----CTCCTTCCATTGACTGGCTGCTTAATACAGGTTTGACTGTACa
gi|52053 : ATTTCCCATGT-AT-A-TGGTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGCATTAA-------ACAATCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTTCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAatgt
gi|52038 : ATTTCTCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA-------ACAACCTATCTT--AAAGGGCCACTTTTG----CTCAATCCCATGACTGGCTGTTTAAGACAGGTTTGACTGTAatcttatgttatctggttttttttaaatatt
gi|52010 : ATTTCCCATTA-AT-A-CGCTTTC-AGAATAAATCA-ACCTGTATTAA--CCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCAATTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAAACAGGTTCGACTGTAtgaatatgatt
gi|51980 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAACAAATTA-ACCTGCATTAA--GCA--AT--TCTGTCTT--AAAAGGTCACATTTG----CTCTTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAtgtgttt
gi|52086 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATAA-ACCTGTATTAA--TTA--ACAACCTGTCTT--AAAAAGTCACTTT---------CTTCCCATGATTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTt
gi|52051 : ATTTCCCCTTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAATGGCA--ACAGCCTTTCTT--TAAAGGCCACTTTTG----CACATTCCATTGACTAGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52100 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCCTTC-AGATCAAATTA-ACCTGCATCAA--ACA--TCAACTTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----TGCCTTCCCATGACTTGCTGTTTAAGACAGGTTTGACTGTAt
gi|52072 : ATTTTCCATTT-AT-A-TGCTTTG-AGAGCAAATTA-ACCTGCATTTA--ACA--ACAATATGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTACTTCCCATGATTGGCTGCTTGGGACAGGTTTGACTGTATTt
gi|52021 : ATTTGCTATTTTCA-A-TGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTTTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAGAGGTCATTTTTG----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGGTTGACTGTAa
gi|52093 : ATTTCCCATTT-AT-A-TGCTTAC-AGAGTAAACTA-ACCTGTATTAA--TCA--CCAGCCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCATTAACTGGCTGCTTAAGTAAGGTTTGACTGCA
gi|52025 : ATTTCCCGTTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACTTGTCTTA----CATCACTACCTGTCTT--TAAAGGCCACTTGTG----CTTCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTAACTGTAtatta
gi|52003 : ATTTTCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA--------------GCA--ACAACCTGTCTT--ATAAGGCCACCTTTG----CTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTt
gi|51991 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAGCATATTA-ACCTG---------CA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTTATGCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGGCTGTAttaaaagtgtattttatcc
gi|51992 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTCTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTA--------------ACCTGCCTT--AAAATACCACTTTTG----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGAAAGGTTTTACTGTATT
gi|52047 : ATTTCCCATTG-CT-A-TGCTTTC-GGAGTAAATTA-ACCTGTATAAA--GCA--ACAAATTACC---------ACCACTTTTG----CTCCTTCCAATGACTGGCTGCTTAAGAGAGGCTTGACTGTA
gi|51977 : ATTTCCTATTT-CT-A-CGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACC---------------------TGTCTT--AAAAGGTCGCTTTTA----CTCCTTCCAATGACTGGCTGCTTAAAACAGGTTTGACTGTATT
gi|52069 : ATATCCCATTT-CT-A-TCCTTTC-ACAGCAAATTA-ATCT---------------------GTATT--AAAAGGTCACTTTTG----CTTCTTCTCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTCACTGTACTaagtttttcttctatccaatattgggtatataactataaaagctatgtttagtagttaataagttagacgctaatgtcgaacaatcacgactgaccgttaattactttatttcactctgaatatt
gi|51975 : ATTTCCTGTTT-CT-A-CGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACC---------------------TGTCTT--GAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCAATGACTGGCTGTTTAAGACAGGTTTGATTGTATTtaacttccttc
gi|51976 : ATTTCCTATTT-CA-A-CGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACC---------------------TGTCTT--AAAAG-TCACTTTTG----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTCAGACAGGTTTGATTGTATTatgtttttcttctatccaatattgggtaggtaactataaaagctatttttagtagttaataagttagatgttaaggtcgaacaatcacaattgactgtttaaattactttatttcactctggacatt
gi|51978 : ATTTGCTTTTT-CT-A-CACTTTC-AAAGTCAATTA-ACCTGCAT---------------------T--GAAAGGTTGCTTTTA----TTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGGCAGGTTTGACAGTATTatgtttttcttctatccaatattgggtgtttaactataaaagctatttttagtagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacaactgaccgttaaagttactttatttcactctggacatt
gi|52329 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCATGTTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTCCTTCCCTCGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTAATTGTAatgtttttcttctatccaatattgggtaaataactataaatttaaagctatttttagtagttaataagttaagacattaatgtcgaaaaatcacgactgactgattaaattactttatttcactcttgacatt
gi|52317 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-ACAGCAAATTA-ACCTGTTTTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCAATTTTG----TCCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAt
gi|52318 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-ATAGTAAATTA-ACGTGTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACgtatgt
gi|52322 : TTTCCCATTT-AT-A-TGCTTTT-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ATCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTACTTCCCCTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAC
gi|52333 : TTTCCCATTT-CT-A-TACTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTTAATTTTG----CTCCTTCTCTTGACTGGCTGCTGAAGACAGGTTTGACTGTATTatgt
gi|52327 : TTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACTTGTCTTAAAAAAGGCCACTTTTA----CTTCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTactatctgatagtttatatttaaggattatttacagtttttcataa
gi|52320 : TTTCCGATTT-CT-A-TGCTTTT-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTGCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACACGTTTGACTGTATTttat
gi|52326 : TTCCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGCATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT---AAATTCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAgt
gi|52324 : TTTTCCATTT-CT-T-TGTTTTC-AGAGTAAATGT-CCCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCCT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAAACAGGTTTGACTGTATTtatgcctgcatgcagatatacatgtgaatataact
gi|52332 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTA-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--------CAGCCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCATTCCCTTGATTGGCTGCTTAGGATAGATTTGACTATATTctg
gi|52331 : TTTCTCATTC-CT-A-TGCTTTC-TGAGCAAATAA-GCCTGTG--AA--GCA--CTAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACATGTTTGACTGTAa
gi|52313 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-ACAGTGAACTA-ACCTGTATTAA--CCA------CCTGTCTT--AAAATGCCACTTTTG----CTTCTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAtatgtctt
gi|52325 : TTTCACATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGAAAATTA-ACCTG---------CA--ACAACCTGTCTT--AAAAAGCCACTTTTA----CTCCTTTCCTTGA-CGGCTGCTTAAGACAGGTTTGATTGTAtatgt
gi|52330 : TTTCCTAATT-TT-A-TGCTTTC-AGAATAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAATCTGAATT--GAA-GGTCACTTTTG----CTCCTTCTCTTGACTGATTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAt
gi|52312 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTT-AAAGTAAATTA-ACC---------------------TGTCTT--AAAAGGCCAATTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGGTTGACTGTatatg
gi|52310 : TTTTCTATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAGCAAATTA-A---------------------CCTGTCTT--AAAAGGTCACCTTTT----CTCCTTCCCACGACTGGCTGCTTAAGACAGATTTAACTGCATT
gi|52376 : TTCCTATTT-CT-A-TGCTTTC-ATAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGACCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACTatgcttttcatttatccaatattgggtatataactatagaagctatttttcagtagagaataagttagacgttaaggtcgaacaatctaggctgaccgttgaaattactttatttcaatctggacatt
gi|52385 : TTCCCATTG-CT-A-TGCTTTT-GGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--A-AACCTGTCTT--AAAGGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAttgt
gi|52374 : TTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCAATTTTG----CCCCTTCCCTTGACAGGCTGCTTAAGACAGGTTTCACTGTA
gi|52425 : T-CT-A-TGCTTTT-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAATATGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CCCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAt
gi|52023 : AACCTGTCTT--AAAAAGCCA
gi|52048 : attttctatttctatgctttcagagtgaattaacctgtattaagcaacaacctgtcttaaaaggtcacttttgctccttcccttgacTGGCTGCTTAATACAGGTTtgaatgtat
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|52523 ): TTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAAGTCGAACAATCACGACTGACCGATTAAATTACTTTATTTCACTCTGGACATT
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 0 0 00 00 00 0000
lowQualScore : . . . . . .. .. .. ....
lowQualScore : 4 4 4 4 4 66 66 66 9999
consensus : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATT
Reference ( family-82 ) : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATT
gi|51975 : ATTTCCTGTTT-CT-A-CGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGT---------------------CTT--GAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCAATGACTGGCTGTTTAAGACAGGTTTGATTGTATT
gi|51976 : ATTTCCTATTT-CA-A-CGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGT---------------------CTT--AAAAG-TCACTTTTG----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTCAGACAGGTTTGATTGTATTatgtttttcttctatccaatattgggtaggtaactataaaagctatttttagtagttaataagttagatgttaaggtcgaacaatcacaattgactgtttaaattactttatttcactctggacatt
gi|51977 : ATTTCCTATTT-CT-A-CGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACC---------------------TGTCTT--AAAAGGTCGCTTTTA----CTCCTTCCAATGACTGGCTGCTTAAAACAGGTTTGACTGTATTatgtttttcttctatccaatattgggtgtttaactataaaagctatttttagtagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacaactgaccgttaaagttactttatttcactctggacatt
gi|51978 : ATTTGCTTTTT-CT-A-CACTTTC-AAAGTCAATTA-ACCTGCATTGA-----------------------AAGGTTGCTTTTA----TTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGGCAGGTTTGACAGTATTaagtttttcttctatccaatattgggtatataactataaaagctatgtttagtagttaataagttagacgctaatgtcgaacaatcacgactgaccgttaattactttatttcactctgaatatt
gi|51980 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAACAAATTA-ACCTGCATTAA--GCA--AT--TCTGTCTT--AAAAGGTCACATTTG----CTCTTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATatgtttttcttctatccaatattgggtaaataactataaatttaaagctatttttagtagttaataagttaagacattaatgtcgaaaaatcacgactgactgattaaattactttatttcactcttgacatt
gi|51981 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGAAAATTA-ACCTGTATTAA--ACA--TCACTCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTTCCTTGACTGGCTGATTAAGACGGGCTTAACTGTAT
gi|51983 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ATCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATgtgttt
gi|51984 : ATTTCCTATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTCA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGACAAATTTTG----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACT
gi|51987 : ATTTTCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAGTTA-ACCTCTATTAG--GCA--ACAACCAGTCTT--AATAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATT
gi|51991 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAGCATATTA-ACCTG---------CA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTTATGCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGGCTGTAagattttgttcagtccaa
gi|51992 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTCTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTA--------------ACCTGCCTT--AAAATACCACTTTTG----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGAAAGGTTTTACTGTATT
gi|51993 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGATTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACT
gi|51994 : ATTTCCAATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACTTGGATTAA--GTA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|51995 : ATTTCCTATGT-CTTA-TGCTTTC-AGGGTAAATTA-ACCTGCTTTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACT
gi|51996 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGTATAAA--ACA--ATAATCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----TTCATTCCCTCGGCTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|51997 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGTATAAA--ACA--ATAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCCCTCAGCTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATattgttttt
gi|51999 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTCA--TCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTCACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTattgttttttattctgt
gi|52000 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTGTC-AGACTAAATTA-ACCTGTATGAA--GCA--GCAACCTATCTT--AAAAGGTCACATTTG----CTCCTTCCATTGACTGGCTGCTTAATACAGGTTTGACTGTA
gi|52003 : ATTTTCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA--------------GCA--ACAACCTGTCTT--ATAAGGCCACCTTTG----CTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTcatgt
gi|52004 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCGT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATttaaaagtgtattttatcc
gi|52005 : ATTTCCCATTT-CT-A-TAGTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTCTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--GAAAGGCCACTTTTG----TTCCTTCCATTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTACTGTA
gi|52006 : ATATCCCATTT-CT-A-AGCTTTC-ATAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAATAGCCACTTTT-----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTattatgt
gi|52007 : ATATCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCGGTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCATCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52010 : ATTTCCCATTA-AT-A-CGCTTTC-AGAATAAATCA-ACCTGTATTAA--CCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCAATTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAAACAGGTTCGACTGTAT
gi|52012 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTT-AGAGCAAATTC-ATCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT---TAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCTGTCACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTgtgttt
gi|52013 : ATTTCCCAATT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTCATTCCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTACTGTATa
gi|52016 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTTTACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTATCTT--AAAAGGCCATTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCAGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52017 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGGAAATTA-ACCTGTATTAA--A------AACCTGTCTT--AAAAGGCAACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGATTGGACTGTATT
gi|52020 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAATTTG--CCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCAATTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52021 : ATTTGCTATTTTCA-A-TGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTTTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAGAGGTCATTTTTG----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGGTTGACTGTAatttat
gi|52022 : ATTCCCTATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACCACCTGTTTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCCCTTGACTTGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52023 : ATTTTCTATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTGAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTTTTTAAGACAGGTTTGAATGTAT
gi|52024 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-AACTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACGGGTTTGACAGTATT
gi|52025 : ATTTCCCGTTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACTTGTCTTA----CATCACTACCTGTCTT--TAAAGGCCACTTGTG----CTTCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTAACTGTATtatttattct
gi|52026 : ATTTCCCAATT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATAA-ACCTTTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--GAAGGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCCTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52029 : ATTTCCTATTT-AT-A-TGATTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--GAAAGGTCATTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGA-TGTA
gi|52031 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-ATAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----TTCCTCTCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGTCTGTATTattattttaaggtttttttat
gi|52033 : ATTTTCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ATCTGTATTAA--TCA--ACAACCTGTCTT--ATAAGGCCACCTTTG----CTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52035 : ATTCCCCATGT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--CAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTATACT
gi|52036 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTATAATAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACCTGTG----CTTTTTTCCATGATTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTa
gi|52037 : ATTTCCCATTT-CT----GTTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTTTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTACCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTGTtcatgtatt
gi|52038 : ATTTCTCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA-------ACAACCTATCTT--AAAGGGCCACTTTTG----CTCAATCCCATGACTGGCTGTTTAAGACAGGTTTGACTGTATgtttttatatatatatatatatatatata
gi|52039 : ATTTCCCATTT-TG-A-TGCTTCT-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCT--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTGTgaatatgatt
gi|52040 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGTATCAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCATTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTGCTGTATataataatgttt
gi|52041 : ATTTCCCATTT-TT-A-TGCTTTT-ATAGCAAATTC-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTCCTTTCCTGGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATatg
gi|52042 : ATTTCCCATTT-CT-A-TCCTTTC-AGAGGAAATTA-ACTAGTATTAA--GCA--ATAACCTGTCTT--AAAAGGCCATTTTTG----CTCATTCCCTTGACTAGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATT
gi|52043 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTTA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTGG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTATTTAGGACAGATTTAACAGTATgttttttt
gi|52046 : ATTTCCTATTT-CT-A-TGCTTTA-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCTCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGGCTGTATatatttttcttttaaatggggta
gi|52047 : ATTTCCCATTG-CT-A-TGCTTTC-GGAGTAAATTA-ACCTGTATAAA--GCA--ACAAATTACC---------ACCACTTTTG----CTCCTTCCAATGACTGGCTGCTTAAGAGAGGCTTGACTGTAagtttctagaacattataggatataggatatatga
gi|52048 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTTTAGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--GCCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTGCTCCCTCCCTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52050 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAACAATTTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----TTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAATACAGGTTTAACTGTATatgt
gi|52051 : ATTTCCCCTTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAATGGCA--ACAGCCTTTCTT--TAAAGGCCACTTTTG----CACATTCCATTGACTAGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATatggtatgttcaatttcttc
gi|52053 : ATTTCCCATGT-AT-A-TGGTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGCATTAA-------ACAATCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTTCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52054 : ATTTCCCATGT-CT-A-TGCTATC-AAAGTAAATTA-ACCTGTGTTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CACCTTCCCTTGAGTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATatcttatgttatctggttttttttaaatatt
gi|52056 : ATTTCCCAATT-CT-A-TGCTTTC-AGAATAAATTA-CCCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAAGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGAATGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAatacttccacttttat
gi|52059 : ATTTCCCATTT-AT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATAA-ATCTGCATTAA--ACA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCACTTGACTGCCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52061 : ATCTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTT-ACCTGTATTAA--GCA--ACATCCTATCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCTTTTGATTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGAATGTA
gi|52063 : ATTTCCCATTT-GT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTGTTAA--GCA--ACAACATGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCCCTTGACTGGCTGTTTAAGACAGGTTTTACTGTATcatgt
gi|52065 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ATCACCTTGCTT--AAAAAGCCACTTTTG----CTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGattgtttccct
gi|52066 : ATTTCCCATTT-CT-A-AACTTTC-AGAGTAAATTT-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACCTTTG----CCTTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52069 : ATATCCCATTT-CT-A-TCCTTTC-ACAGCAAATTA-ATCTGTATTAA-----------------------AAGGTCACTTTTG----CTTCTTCTCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTCACTGTACT
gi|52072 : ATTTTCCATTT-AT-A-TGCTTTG-AGAGCAAATTA-ACCTGCATTTA--ACA--ACAATATGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTACTTCCCATGATTGGCTGCTTGGGACAGGTTTGACTGTATTtaacttccttc
gi|52075 : ATTTCCCATTT-CT-A-AGCCTTC-AGGGAAAATTA-ACCTGTATTTA--GCA--ACAACCTGTTTT--AAAGGGTCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTAGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATa
gi|52077 : ACTTCCCATTT-CT-A-TACTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACATCCTGTCTC--AAAAGGCCACTATTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAAACAGGTTTGACTGTAT
gi|52080 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGACCAAATTA-ACTCATATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCAATTTGG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTCACTGTAatg
gi|52083 : ATTTCCCATTT-CT-C-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--GAAACCTGTCTT--AAAAAGCCACCTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTCTACTcaatgt
gi|52084 : ATTTCCCATTT-CT-C-TGCGTTC-AGAGCAAATTG-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTTCCTCCCTTGACTGGCTGCTTCAGACAGGTTTGACTGTAttg
gi|52085 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGTCTTAA--GCA--ACAACATGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCGTT-CCTTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACTgtgtttt
gi|52086 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATAA-ACCTGTATTAA--TTA--ACAACCTGTCTT--AAAAAGTCACTTT---------CTTCCCATGATTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTat
gi|52087 : ATTTCCCGTAT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACCATTG----CTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52088 : ATTTCCCATTT-CT-A-AGCTTTT-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CCCCTTCCCTTGACTGGCCACTTAAGATAGGTTTGACTGTA
gi|52090 : ATTTTCTATTT-TT-AATGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGAATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTTACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTATT
gi|52091 : ATTTCCGATTT-AT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGCATTAA--ACA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTATGACAGGTTTGACTGTATT
gi|52092 : ATTTCACATTT-CT-A-TGCGTTC-ATAGTAAATTA-ACCTGTACTAA--GCA--ACACCTTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCTTTCCCTTGATTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATtgcaagtggttatttattccaggatgggtatcaaacccgaattgtgcatgctccatcagaactataaaaccactgctatttt
gi|52093 : ATTTCCCATTT-AT-A-TGCTTAC-AGAGTAAACTA-ACCTGTATTAA--TCA--CCAGCCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCATTAACTGGCTGCTTAAGTAAGGTTTGACTGCAT
gi|52094 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACATCCCGTCTT--AAGATGCTACGTTTG----CTCCTTTCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAatta
gi|52095 : ATTTCCCATTT-AT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTG-ATCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCATGACTGACTACTTAAGCCAGGTGTGACTGTgttaagttt
gi|52098 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GTA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTT----CTCCCTTACTTGATTGGCTTCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52100 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCCTTC-AGATCAAATTA-ACCTGCATCAA--ACA--TCAACTTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----TGCCTTCCCATGACTTGCTGTTTAAGACAGGTTTGACTGTATgaatctctttattttatc
gi|52310 : TTTTCTATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAGCAAATTA-ACC---------------------TGTCTT--AAAAGGTCACCTTTT----CTCCTTCCCACGACTGGCTGCTTAAGACAGATTTAACTGCATT
gi|52312 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTT-AAAGTAAATTA-ACC---------------------TGTCTT--AAAAGGCCAATTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGGTTGACTGTatgcttttcatttatccaatattgggtatataactatagaagctatttttcagtagagaataagttagacgttaaggtcgaacaatctaggctgaccgttgaaattactttatttcaatctggacatt
gi|52313 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-ACAGTGAACTA-ACCTGTATTAA--CCA------CCTGTCTT--AAAATGCCACTTTTG----CTTCTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52317 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-ACAGCAAATTA-ACCTGTTTTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCAATTTTG----TCCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAatgt
gi|52318 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-ATAGTAAATTA-ACGTGTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACgtatgt
gi|52320 : TTTCCGATTT-CT-A-TGCTTTT-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTGCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACACGTTTGACTGTATT
gi|52322 : TTTCCCATTT-AT-A-TGCTTTT-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ATCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTACTTCCCCTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAgt
gi|52324 : TTTTCCATTT-CT-T-TGTTTTC-AGAGTAAATGT-CCCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCCT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAAACAGGTTTGACTGTATTcatgt
gi|52325 : TTTCACATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGAAAATTA-ACCTG---------CA--ACAACCTGTCTT--AAAAAGCCACTTTTA----CTCCTTTCCTTGAC-GGCTGCTTAAGACAGGTTTGATTGTATctg
gi|52326 : TTCCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGCATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT---AAATTCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52327 : TTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACTTGTCTTAAAAAAGGCCACTTTTA----CTTCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTatgcctgcatgcagatatacatgtgaatataact
gi|52329 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCATGTTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTCCTTCCCTCGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTAATTGTATttat
gi|52330 : TTTCCTAATT-TT-A-TGCTTTC-AGAATAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAATCTGAATT--GAA-GGTCACTTTTG----CTCCTTCTCTTGACTGATTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52331 : TTTCTCATTC-CT-A-TGCTTTC-TGAGCAAATAA-GCCTGTG--AA--GCA--CTAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACATGTTTGACTGTATatatg
gi|52332 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTA-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--------CAGCCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCATTCCCTTGATTGGCTGCTTAGGATAGATTTGACTATATTatgtctt
gi|52333 : TTTCCCATTT-CT-A-TACTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTTAATTTTG----CTCCTTCTCTTGACTGGCTGCTGAAGACAGGTTTGACTGTATTa
gi|52374 : TTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCAATTTTG----CCCCTTCCCTTGACAGGCTGCTTAAGACAGGTTTCACTGTATactatctgatagtttatatttaaggattatttacagtttttcataa
gi|52376 : TTCCTATTT-CT-A-TGCTTTC-ATAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGACCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACT
gi|52385 : TTCCCATTG-CT-A-TGCTTTT-GGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--A-AACCTGTCTT--AAAGGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAttgt
gi|52425 : T-CT-A-TGCTTTT-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAATATGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CCCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|52523 ): TTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAAGTCGAACAATCACGACTGACCGATTAAATTACTTTATTTCACTCTGGACATT
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 0 0 00 00 00 0000
lowQualScore : . . . . . .. .. .. ....
lowQualScore : 4 4 4 4 4 66 66 66 9999
consensus : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATT
Reference ( family-82 ) : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATT
gi|51975 : ATTTCCTGTTT-CT-A-CGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGT---------------------CTT--GAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCAATGACTGGCTGTTTAAGACAGGTTTGATTGTATT
gi|51976 : ATTTCCTATTT-CA-A-CGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGT---------------------CTT--AAAAG-TCACTTTTG----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTCAGACAGGTTTGATTGTATTatgtttttcttctatccaatattgggtaggtaactataaaagctatttttagtagttaataagttagatgttaaggtcgaacaatcacaattgactgtttaaattactttatttcactctggacatt
gi|51977 : ATTTCCTATTT-CT-A-CGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACC---------------------TGTCTT--AAAAGGTCGCTTTTA----CTCCTTCCAATGACTGGCTGCTTAAAACAGGTTTGACTGTATTatgtttttcttctatccaatattgggtgtttaactataaaagctatttttagtagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacaactgaccgttaaagttactttatttcactctggacatt
gi|51978 : ATTTGCTTTTT-CT-A-CACTTTC-AAAGTCAATTA-ACCTGCATTGA-----------------------AAGGTTGCTTTTA----TTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGGCAGGTTTGACAGTATTaagtttttcttctatccaatattgggtatataactataaaagctatgtttagtagttaataagttagacgctaatgtcgaacaatcacgactgaccgttaattactttatttcactctgaatatt
gi|51980 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAACAAATTA-ACCTGCATTAA--GCA--AT--TCTGTCTT--AAAAGGTCACATTTG----CTCTTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATatgtttttcttctatccaatattgggtaaataactataaatttaaagctatttttagtagttaataagttaagacattaatgtcgaaaaatcacgactgactgattaaattactttatttcactcttgacatt
gi|51981 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGAAAATTA-ACCTGTATTAA--ACA--TCACTCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTTCCTTGACTGGCTGATTAAGACGGGCTTAACTGTAT
gi|51983 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ATCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATgtgttt
gi|51984 : ATTTCCTATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTCA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGACAAATTTTG----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACT
gi|51987 : ATTTTCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAGTTA-ACCTCTATTAG--GCA--ACAACCAGTCTT--AATAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATT
gi|51991 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAGCATATTA-ACCTG---------CA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTTATGCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGGCTGTAagattttgttcagtccaa
gi|51992 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTCTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTA--------------ACCTGCCTT--AAAATACCACTTTTG----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGAAAGGTTTTACTGTATT
gi|51993 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGATTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACT
gi|51994 : ATTTCCAATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACTTGGATTAA--GTA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|51995 : ATTTCCTATGT-CTTA-TGCTTTC-AGGGTAAATTA-ACCTGCTTTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACT
gi|51996 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGTATAAA--ACA--ATAATCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----TTCATTCCCTCGGCTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|51997 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGTATAAA--ACA--ATAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCCCTCAGCTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATattgttttt
gi|51999 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTCA--TCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTCACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTattgttttttattctgt
gi|52000 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTGTC-AGACTAAATTA-ACCTGTATGAA--GCA--GCAACCTATCTT--AAAAGGTCACATTTG----CTCCTTCCATTGACTGGCTGCTTAATACAGGTTTGACTGTA
gi|52003 : ATTTTCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA--------------GCA--ACAACCTGTCTT--ATAAGGCCACCTTTG----CTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTcatgt
gi|52004 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCGT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATttaaaagtgtattttatcc
gi|52005 : ATTTCCCATTT-CT-A-TAGTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTCTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--GAAAGGCCACTTTTG----TTCCTTCCATTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTACTGTA
gi|52006 : ATATCCCATTT-CT-A-AGCTTTC-ATAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAATAGCCACTTTT-----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTattatgt
gi|52007 : ATATCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCGGTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCATCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52010 : ATTTCCCATTA-AT-A-CGCTTTC-AGAATAAATCA-ACCTGTATTAA--CCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCAATTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAAACAGGTTCGACTGTAT
gi|52012 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTT-AGAGCAAATTC-ATCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT---TAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCTGTCACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTgtgttt
gi|52013 : ATTTCCCAATT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTCATTCCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTACTGTATa
gi|52016 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTTTACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTATCTT--AAAAGGCCATTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCAGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52017 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGGAAATTA-ACCTGTATTAA--A------AACCTGTCTT--AAAAGGCAACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGATTGGACTGTATT
gi|52020 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAATTTG--CCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCAATTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52021 : ATTTGCTATTTTCA-A-TGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTTTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAGAGGTCATTTTTG----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGGTTGACTGTAatttat
gi|52022 : ATTCCCTATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACCACCTGTTTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCCCTTGACTTGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52023 : ATTTTCTATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTGAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTTTTTAAGACAGGTTTGAATGTAT
gi|52024 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-AACTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACGGGTTTGACAGTATT
gi|52025 : ATTTCCCGTTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACTTGTCTTA----CATCACTACCTGTCTT--TAAAGGCCACTTGTG----CTTCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTAACTGTATtatttattct
gi|52026 : ATTTCCCAATT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATAA-ACCTTTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--GAAGGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCCTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52029 : ATTTCCTATTT-AT-A-TGATTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--GAAAGGTCATTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGA-TGTA
gi|52031 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-ATAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----TTCCTCTCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGTCTGTATTattattttaaggtttttttat
gi|52033 : ATTTTCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ATCTGTATTAA--TCA--ACAACCTGTCTT--ATAAGGCCACCTTTG----CTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52035 : ATTCCCCATGT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--CAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTATACT
gi|52036 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTATAATAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACCTGTG----CTTTTTTCCATGATTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTa
gi|52037 : ATTTCCCATTT-CT----GTTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTTTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTACCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTGTtcatgtatt
gi|52038 : ATTTCTCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA-------ACAACCTATCTT--AAAGGGCCACTTTTG----CTCAATCCCATGACTGGCTGTTTAAGACAGGTTTGACTGTATgtttttatatatatatatatatatatata
gi|52039 : ATTTCCCATTT-TG-A-TGCTTCT-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCT--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTGTgaatatgatt
gi|52040 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGTATCAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCATTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTGCTGTATataataatgttt
gi|52041 : ATTTCCCATTT-TT-A-TGCTTTT-ATAGCAAATTC-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTCCTTTCCTGGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATatg
gi|52042 : ATTTCCCATTT-CT-A-TCCTTTC-AGAGGAAATTA-ACTAGTATTAA--GCA--ATAACCTGTCTT--AAAAGGCCATTTTTG----CTCATTCCCTTGACTAGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATT
gi|52043 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTTA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTGG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTATTTAGGACAGATTTAACAGTATgttttttt
gi|52046 : ATTTCCTATTT-CT-A-TGCTTTA-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCTCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGGCTGTATatatttttcttttaaatggggta
gi|52047 : ATTTCCCATTG-CT-A-TGCTTTC-GGAGTAAATTA-ACCTGTATAAA--GCA--ACAAATTACC---------ACCACTTTTG----CTCCTTCCAATGACTGGCTGCTTAAGAGAGGCTTGACTGTAagtttctagaacattataggatataggatatatga
gi|52048 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTTTAGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--GCCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTGCTCCCTCCCTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52050 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAACAATTTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----TTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAATACAGGTTTAACTGTATatgt
gi|52051 : ATTTCCCCTTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAATGGCA--ACAGCCTTTCTT--TAAAGGCCACTTTTG----CACATTCCATTGACTAGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATatggtatgttcaatttcttc
gi|52053 : ATTTCCCATGT-AT-A-TGGTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGCATTAA-------ACAATCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTTCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52054 : ATTTCCCATGT-CT-A-TGCTATC-AAAGTAAATTA-ACCTGTGTTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CACCTTCCCTTGAGTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATatcttatgttatctggttttttttaaatatt
gi|52056 : ATTTCCCAATT-CT-A-TGCTTTC-AGAATAAATTA-CCCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAAGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGAATGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAatacttccacttttat
gi|52059 : ATTTCCCATTT-AT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATAA-ATCTGCATTAA--ACA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCACTTGACTGCCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52061 : ATCTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTT-ACCTGTATTAA--GCA--ACATCCTATCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCTTTTGATTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGAATGTA
gi|52063 : ATTTCCCATTT-GT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTGTTAA--GCA--ACAACATGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCCCTTGACTGGCTGTTTAAGACAGGTTTTACTGTATcatgt
gi|52065 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ATCACCTTGCTT--AAAAAGCCACTTTTG----CTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGattgtttccct
gi|52066 : ATTTCCCATTT-CT-A-AACTTTC-AGAGTAAATTT-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACCTTTG----CCTTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52069 : ATATCCCATTT-CT-A-TCCTTTC-ACAGCAAATTA-ATCTGTATTAA-----------------------AAGGTCACTTTTG----CTTCTTCTCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTCACTGTACT
gi|52072 : ATTTTCCATTT-AT-A-TGCTTTG-AGAGCAAATTA-ACCTGCATTTA--ACA--ACAATATGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTACTTCCCATGATTGGCTGCTTGGGACAGGTTTGACTGTATTtaacttccttc
gi|52075 : ATTTCCCATTT-CT-A-AGCCTTC-AGGGAAAATTA-ACCTGTATTTA--GCA--ACAACCTGTTTT--AAAGGGTCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTAGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATa
gi|52077 : ACTTCCCATTT-CT-A-TACTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACATCCTGTCTC--AAAAGGCCACTATTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAAACAGGTTTGACTGTAT
gi|52080 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGACCAAATTA-ACTCATATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCAATTTGG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTCACTGTAatg
gi|52083 : ATTTCCCATTT-CT-C-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--GAAACCTGTCTT--AAAAAGCCACCTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTCTACTcaatgt
gi|52084 : ATTTCCCATTT-CT-C-TGCGTTC-AGAGCAAATTG-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTTCCTCCCTTGACTGGCTGCTTCAGACAGGTTTGACTGTAttg
gi|52085 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGTCTTAA--GCA--ACAACATGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCGTT-CCTTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACTgtgtttt
gi|52086 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATAA-ACCTGTATTAA--TTA--ACAACCTGTCTT--AAAAAGTCACTTT---------CTTCCCATGATTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTat
gi|52087 : ATTTCCCGTAT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACCATTG----CTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52088 : ATTTCCCATTT-CT-A-AGCTTTT-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CCCCTTCCCTTGACTGGCCACTTAAGATAGGTTTGACTGTA
gi|52090 : ATTTTCTATTT-TT-AATGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGAATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTTACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTATT
gi|52091 : ATTTCCGATTT-AT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGCATTAA--ACA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTATGACAGGTTTGACTGTATT
gi|52092 : ATTTCACATTT-CT-A-TGCGTTC-ATAGTAAATTA-ACCTGTACTAA--GCA--ACACCTTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCTTTCCCTTGATTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATtgcaagtggttatttattccaggatgggtatcaaacccgaattgtgcatgctccatcagaactataaaaccactgctatttt
gi|52093 : ATTTCCCATTT-AT-A-TGCTTAC-AGAGTAAACTA-ACCTGTATTAA--TCA--CCAGCCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCATTAACTGGCTGCTTAAGTAAGGTTTGACTGCAT
gi|52094 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACATCCCGTCTT--AAGATGCTACGTTTG----CTCCTTTCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAatta
gi|52095 : ATTTCCCATTT-AT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTG-ATCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCATGACTGACTACTTAAGCCAGGTGTGACTGTgttaagttt
gi|52098 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GTA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTT----CTCCCTTACTTGATTGGCTTCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52100 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCCTTC-AGATCAAATTA-ACCTGCATCAA--ACA--TCAACTTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----TGCCTTCCCATGACTTGCTGTTTAAGACAGGTTTGACTGTATgaatctctttattttatc
gi|52310 : TTTTCTATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAGCAAATTA-ACC---------------------TGTCTT--AAAAGGTCACCTTTT----CTCCTTCCCACGACTGGCTGCTTAAGACAGATTTAACTGCATT
gi|52312 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTT-AAAGTAAATTA-ACC---------------------TGTCTT--AAAAGGCCAATTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGGTTGACTGTatgcttttcatttatccaatattgggtatataactatagaagctatttttcagtagagaataagttagacgttaaggtcgaacaatctaggctgaccgttgaaattactttatttcaatctggacatt
gi|52313 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-ACAGTGAACTA-ACCTGTATTAA--CCA------CCTGTCTT--AAAATGCCACTTTTG----CTTCTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52317 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-ACAGCAAATTA-ACCTGTTTTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCAATTTTG----TCCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAatgt
gi|52318 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-ATAGTAAATTA-ACGTGTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACgtatgt
gi|52320 : TTTCCGATTT-CT-A-TGCTTTT-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTGCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACACGTTTGACTGTATT
gi|52322 : TTTCCCATTT-AT-A-TGCTTTT-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ATCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTACTTCCCCTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAgt
gi|52324 : TTTTCCATTT-CT-T-TGTTTTC-AGAGTAAATGT-CCCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCCT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAAACAGGTTTGACTGTATTcatgt
gi|52325 : TTTCACATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGAAAATTA-ACCTG---------CA--ACAACCTGTCTT--AAAAAGCCACTTTTA----CTCCTTTCCTTGAC-GGCTGCTTAAGACAGGTTTGATTGTATctg
gi|52326 : TTCCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGCATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT---AAATTCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52327 : TTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACTTGTCTTAAAAAAGGCCACTTTTA----CTTCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTatgcctgcatgcagatatacatgtgaatataact
gi|52329 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCATGTTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTCCTTCCCTCGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTAATTGTATttat
gi|52330 : TTTCCTAATT-TT-A-TGCTTTC-AGAATAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAATCTGAATT--GAA-GGTCACTTTTG----CTCCTTCTCTTGACTGATTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52331 : TTTCTCATTC-CT-A-TGCTTTC-TGAGCAAATAA-GCCTGTG--AA--GCA--CTAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACATGTTTGACTGTATatatg
gi|52332 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTA-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--------CAGCCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCATTCCCTTGATTGGCTGCTTAGGATAGATTTGACTATATTatgtctt
gi|52333 : TTTCCCATTT-CT-A-TACTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTTAATTTTG----CTCCTTCTCTTGACTGGCTGCTGAAGACAGGTTTGACTGTATTa
gi|52374 : TTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCAATTTTG----CCCCTTCCCTTGACAGGCTGCTTAAGACAGGTTTCACTGTATactatctgatagtttatatttaaggattatttacagtttttcataa
gi|52376 : TTCCTATTT-CT-A-TGCTTTC-ATAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGACCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACT
gi|52385 : TTCCCATTG-CT-A-TGCTTTT-GGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--A-AACCTGTCTT--AAAGGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAttgt
gi|52425 : T-CT-A-TGCTTTT-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAATATGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CCCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
blockSeqCons :
originalCons : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATT
finalCons : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|52523 ): TTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAAGTCGAACAATCACGACTGACCGATTAAATTACTTTATTTCACTCTGGACATT
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 0 0 00 00 00 0000
lowQualScore : . . . . . .. .. .. ....
lowQualScore : 4 4 4 4 4 66 66 66 9999
consensus : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATT
Reference ( family-82 ) : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATT
gi|51975 : ATTTCCTGTTT-CT-A-CGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGT---------------------CTT--GAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCAATGACTGGCTGTTTAAGACAGGTTTGATTGTATT
gi|51976 : ATTTCCTATTT-CA-A-CGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGT---------------------CTT--AAAAG-TCACTTTTG----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTCAGACAGGTTTGATTGTATTatgtttttcttctatccaatattgggtaggtaactataaaagctatttttagtagttaataagttagatgttaaggtcgaacaatcacaattgactgtttaaattactttatttcactctggacatt
gi|51977 : ATTTCCTATTT-CT-A-CGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACC---------------------TGTCTT--AAAAGGTCGCTTTTA----CTCCTTCCAATGACTGGCTGCTTAAAACAGGTTTGACTGTATTatgtttttcttctatccaatattgggtgtttaactataaaagctatttttagtagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacaactgaccgttaaagttactttatttcactctggacatt
gi|51978 : ATTTGCTTTTT-CT-A-CACTTTC-AAAGTCAATTA-ACCTGCATTGA-----------------------AAGGTTGCTTTTA----TTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGGCAGGTTTGACAGTATTaagtttttcttctatccaatattgggtatataactataaaagctatgtttagtagttaataagttagacgctaatgtcgaacaatcacgactgaccgttaattactttatttcactctgaatatt
gi|51980 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAACAAATTA-ACCTGCATTAA--GCA--AT--TCTGTCTT--AAAAGGTCACATTTG----CTCTTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATatgtttttcttctatccaatattgggtaaataactataaatttaaagctatttttagtagttaataagttaagacattaatgtcgaaaaatcacgactgactgattaaattactttatttcactcttgacatt
gi|51981 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGAAAATTA-ACCTGTATTAA--ACA--TCACTCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTTCCTTGACTGGCTGATTAAGACGGGCTTAACTGTAT
gi|51983 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ATCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATgtgttt
gi|51984 : ATTTCCTATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTCA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGACAAATTTTG----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACT
gi|51987 : ATTTTCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAGTTA-ACCTCTATTAG--GCA--ACAACCAGTCTT--AATAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATT
gi|51991 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAGCATATTA-ACCTG---------CA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTTATGCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGGCTGTAagattttgttcagtccaa
gi|51992 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTCTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTA--------------ACCTGCCTT--AAAATACCACTTTTG----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGAAAGGTTTTACTGTATT
gi|51993 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGATTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACT
gi|51994 : ATTTCCAATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACTTGGATTAA--GTA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|51995 : ATTTCCTATGT-CTTA-TGCTTTC-AGGGTAAATTA-ACCTGCTTTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACT
gi|51996 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGTATAAA--ACA--ATAATCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----TTCATTCCCTCGGCTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|51997 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGTATAAA--ACA--ATAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCCCTCAGCTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATattgttttt
gi|51999 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTCA--TCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTCACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTattgttttttattctgt
gi|52000 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTGTC-AGACTAAATTA-ACCTGTATGAA--GCA--GCAACCTATCTT--AAAAGGTCACATTTG----CTCCTTCCATTGACTGGCTGCTTAATACAGGTTTGACTGTA
gi|52003 : ATTTTCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA--------------GCA--ACAACCTGTCTT--ATAAGGCCACCTTTG----CTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTcatgt
gi|52004 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCGT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATttaaaagtgtattttatcc
gi|52005 : ATTTCCCATTT-CT-A-TAGTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTCTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--GAAAGGCCACTTTTG----TTCCTTCCATTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTACTGTA
gi|52006 : ATATCCCATTT-CT-A-AGCTTTC-ATAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAATAGCCACTTTT-----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTattatgt
gi|52007 : ATATCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCGGTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCATCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52010 : ATTTCCCATTA-AT-A-CGCTTTC-AGAATAAATCA-ACCTGTATTAA--CCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCAATTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAAACAGGTTCGACTGTAT
gi|52012 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTT-AGAGCAAATTC-ATCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT---TAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCTGTCACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTgtgttt
gi|52013 : ATTTCCCAATT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTCATTCCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTACTGTATa
gi|52016 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTTTACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTATCTT--AAAAGGCCATTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCAGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52017 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGGAAATTA-ACCTGTATTAA--A------AACCTGTCTT--AAAAGGCAACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGATTGGACTGTATT
gi|52020 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAATTTG--CCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCAATTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52021 : ATTTGCTATTTTCA-A-TGCTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTTTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAGAGGTCATTTTTG----CTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGGTTGACTGTAatttat
gi|52022 : ATTCCCTATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACCACCTGTTTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCCCTTGACTTGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52023 : ATTTTCTATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTGAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTTTTTAAGACAGGTTTGAATGTAT
gi|52024 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-AACTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACGGGTTTGACAGTATT
gi|52025 : ATTTCCCGTTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACTTGTCTTA----CATCACTACCTGTCTT--TAAAGGCCACTTGTG----CTTCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTAACTGTATtatttattct
gi|52026 : ATTTCCCAATT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATAA-ACCTTTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--GAAGGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCCTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52029 : ATTTCCTATTT-AT-A-TGATTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--GAAAGGTCATTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGA-TGTA
gi|52031 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-ATAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----TTCCTCTCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGTCTGTATTattattttaaggtttttttat
gi|52033 : ATTTTCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ATCTGTATTAA--TCA--ACAACCTGTCTT--ATAAGGCCACCTTTG----CTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52035 : ATTCCCCATGT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--CAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTATACT
gi|52036 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTATAATAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACCTGTG----CTTTTTTCCATGATTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTa
gi|52037 : ATTTCCCATTT-CT----GTTTTC-AAAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTTTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTACCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTGTtcatgtatt
gi|52038 : ATTTCTCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA-------ACAACCTATCTT--AAAGGGCCACTTTTG----CTCAATCCCATGACTGGCTGTTTAAGACAGGTTTGACTGTATgtttttatatatatatatatatatatata
gi|52039 : ATTTCCCATTT-TG-A-TGCTTCT-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCT--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTGTgaatatgatt
gi|52040 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGTATCAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCATTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTGCTGTATataataatgttt
gi|52041 : ATTTCCCATTT-TT-A-TGCTTTT-ATAGCAAATTC-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTCCTTTCCTGGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATatg
gi|52042 : ATTTCCCATTT-CT-A-TCCTTTC-AGAGGAAATTA-ACTAGTATTAA--GCA--ATAACCTGTCTT--AAAAGGCCATTTTTG----CTCATTCCCTTGACTAGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATT
gi|52043 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTTA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTGG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTATTTAGGACAGATTTAACAGTATgttttttt
gi|52046 : ATTTCCTATTT-CT-A-TGCTTTA-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCTCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGGCTGTATatatttttcttttaaatggggta
gi|52047 : ATTTCCCATTG-CT-A-TGCTTTC-GGAGTAAATTA-ACCTGTATAAA--GCA--ACAAATTACC---------ACCACTTTTG----CTCCTTCCAATGACTGGCTGCTTAAGAGAGGCTTGACTGTAagtttctagaacattataggatataggatatatga
gi|52048 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTTTAGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--GCCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTGCTCCCTCCCTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52050 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAACAATTTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----TTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAATACAGGTTTAACTGTATatgt
gi|52051 : ATTTCCCCTTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAATGGCA--ACAGCCTTTCTT--TAAAGGCCACTTTTG----CACATTCCATTGACTAGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATatggtatgttcaatttcttc
gi|52053 : ATTTCCCATGT-AT-A-TGGTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGCATTAA-------ACAATCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTTCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52054 : ATTTCCCATGT-CT-A-TGCTATC-AAAGTAAATTA-ACCTGTGTTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CACCTTCCCTTGAGTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATatcttatgttatctggttttttttaaatatt
gi|52056 : ATTTCCCAATT-CT-A-TGCTTTC-AGAATAAATTA-CCCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAAGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGAATGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAatacttccacttttat
gi|52059 : ATTTCCCATTT-AT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATAA-ATCTGCATTAA--ACA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCACTTGACTGCCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52061 : ATCTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTT-ACCTGTATTAA--GCA--ACATCCTATCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCTTTTGATTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGAATGTA
gi|52063 : ATTTCCCATTT-GT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTGTTAA--GCA--ACAACATGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCATTCCCTTGACTGGCTGTTTAAGACAGGTTTTACTGTATcatgt
gi|52065 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ATCACCTTGCTT--AAAAAGCCACTTTTG----CTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGattgtttccct
gi|52066 : ATTTCCCATTT-CT-A-AACTTTC-AGAGTAAATTT-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACCTTTG----CCTTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52069 : ATATCCCATTT-CT-A-TCCTTTC-ACAGCAAATTA-ATCTGTATTAA-----------------------AAGGTCACTTTTG----CTTCTTCTCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTCACTGTACT
gi|52072 : ATTTTCCATTT-AT-A-TGCTTTG-AGAGCAAATTA-ACCTGCATTTA--ACA--ACAATATGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTACTTCCCATGATTGGCTGCTTGGGACAGGTTTGACTGTATTtaacttccttc
gi|52075 : ATTTCCCATTT-CT-A-AGCCTTC-AGGGAAAATTA-ACCTGTATTTA--GCA--ACAACCTGTTTT--AAAGGGTCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTAGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATa
gi|52077 : ACTTCCCATTT-CT-A-TACTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACATCCTGTCTC--AAAAGGCCACTATTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAAACAGGTTTGACTGTAT
gi|52080 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGACCAAATTA-ACTCATATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCAATTTGG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTCACTGTAatg
gi|52083 : ATTTCCCATTT-CT-C-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--GAAACCTGTCTT--AAAAAGCCACCTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTCTACTcaatgt
gi|52084 : ATTTCCCATTT-CT-C-TGCGTTC-AGAGCAAATTG-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTTCCTCCCTTGACTGGCTGCTTCAGACAGGTTTGACTGTAttg
gi|52085 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGTCTTAA--GCA--ACAACATGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCGTT-CCTTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACTgtgtttt
gi|52086 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATAA-ACCTGTATTAA--TTA--ACAACCTGTCTT--AAAAAGTCACTTT---------CTTCCCATGATTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATTat
gi|52087 : ATTTCCCGTAT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACCATTG----CTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52088 : ATTTCCCATTT-CT-A-AGCTTTT-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CCCCTTCCCTTGACTGGCCACTTAAGATAGGTTTGACTGTA
gi|52090 : ATTTTCTATTT-TT-AATGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGAATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTTACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTATT
gi|52091 : ATTTCCGATTT-AT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGCATTAA--ACA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTATGACAGGTTTGACTGTATT
gi|52092 : ATTTCACATTT-CT-A-TGCGTTC-ATAGTAAATTA-ACCTGTACTAA--GCA--ACACCTTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCTTTCCCTTGATTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTATtgcaagtggttatttattccaggatgggtatcaaacccgaattgtgcatgctccatcagaactataaaaccactgctatttt
gi|52093 : ATTTCCCATTT-AT-A-TGCTTAC-AGAGTAAACTA-ACCTGTATTAA--TCA--CCAGCCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCATTAACTGGCTGCTTAAGTAAGGTTTGACTGCAT
gi|52094 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACATCCCGTCTT--AAGATGCTACGTTTG----CTCCTTTCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAatta
gi|52095 : ATTTCCCATTT-AT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTG-ATCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCATGACTGACTACTTAAGCCAGGTGTGACTGTgttaagttt
gi|52098 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GTA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTT----CTCCCTTACTTGATTGGCTTCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52100 : ATTTCCCATTT-CT-A-TGCCTTC-AGATCAAATTA-ACCTGCATCAA--ACA--TCAACTTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----TGCCTTCCCATGACTTGCTGTTTAAGACAGGTTTGACTGTATgaatctctttattttatc
gi|52310 : TTTTCTATTT-CT-A-TGCTTTC-AAAGCAAATTA-ACC---------------------TGTCTT--AAAAGGTCACCTTTT----CTCCTTCCCACGACTGGCTGCTTAAGACAGATTTAACTGCATT
gi|52312 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTT-AAAGTAAATTA-ACC---------------------TGTCTT--AAAAGGCCAATTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGGTTGACTGTatgcttttcatttatccaatattgggtatataactatagaagctatttttcagtagagaataagttagacgttaaggtcgaacaatctaggctgaccgttgaaattactttatttcaatctggacatt
gi|52313 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-ACAGTGAACTA-ACCTGTATTAA--CCA------CCTGTCTT--AAAATGCCACTTTTG----CTTCTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52317 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-ACAGCAAATTA-ACCTGTTTTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCAATTTTG----TCCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAatgt
gi|52318 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-ATAGTAAATTA-ACGTGTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACgtatgt
gi|52320 : TTTCCGATTT-CT-A-TGCTTTT-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTGCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACACGTTTGACTGTATT
gi|52322 : TTTCCCATTT-AT-A-TGCTTTT-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ATCACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTACTTCCCCTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAgt
gi|52324 : TTTTCCATTT-CT-T-TGTTTTC-AGAGTAAATGT-CCCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCCT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAAACAGGTTTGACTGTATTcatgt
gi|52325 : TTTCACATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGAAAATTA-ACCTG---------CA--ACAACCTGTCTT--AAAAAGCCACTTTTA----CTCCTTTCCTTGAC-GGCTGCTTAAGACAGGTTTGATTGTATctg
gi|52326 : TTCCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGCATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT---AAATTCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|52327 : TTTCCCATTT-CT-A-TGTTTTC-AGAGCAAATTT-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACTTGTCTTAAAAAAGGCCACTTTTA----CTTCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTatgcctgcatgcagatatacatgtgaatataact
gi|52329 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGCATGTTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTA----CTCCTTCCCTCGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTAATTGTATttat
gi|52330 : TTTCCTAATT-TT-A-TGCTTTC-AGAATAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAATCTGAATT--GAA-GGTCACTTTTG----CTCCTTCTCTTGACTGATTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|52331 : TTTCTCATTC-CT-A-TGCTTTC-TGAGCAAATAA-GCCTGTG--AA--GCA--CTAACCTGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACATGTTTGACTGTATatatg
gi|52332 : TTTCCCATTT-CT-A-TGCTTTA-AGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--------CAGCCTGTCTT--AAAAGGTCACTTTTG----CTCATTCCCTTGATTGGCTGCTTAGGATAGATTTGACTATATTatgtctt
gi|52333 : TTTCCCATTT-CT-A-TACTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTTAATTTTG----CTCCTTCTCTTGACTGGCTGCTGAAGACAGGTTTGACTGTATTa
gi|52374 : TTCCCATTT-CT-A-TGCTTTC-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGGTCAATTTTG----CCCCTTCCCTTGACAGGCTGCTTAAGACAGGTTTCACTGTATactatctgatagtttatatttaaggattatttacagtttttcataa
gi|52376 : TTCCTATTT-CT-A-TGCTTTC-ATAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAACCTGTCTT--AAAAGACCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTACT
gi|52385 : TTCCCATTG-CT-A-TGCTTTT-GGAGCAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--A-AACCTGTCTT--AAAGGGCCACTTTTG----CTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAttgt
gi|52425 : T-CT-A-TGCTTTT-AGAGTAAATTA-ACCTGTATTAA--GCA--ACAATATGTCTT--AAAAGGCCACTTTTG----CCCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|52523 ): TTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAAGTCGAACAATCACGACTGACCGATTAAATTACTTTATTTCACTCTGGACATT