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lowQualScore                  :                                                   4     99    1    33333   222 2         3   2222  77       77  22222 2 2        4  1      2 3    1 4                                                                                                                             6                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :                                                   .     ..    .    .....   ... .         .   ....  ..       ..  ..... . .        .  .      . .    . .                                                                                                                             .                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :                                                   2     66    7    66666   888 7         1   8888  33       33  55555 2 4        5  2      4 2    3 8                                                                                                                             0                                                                                                                                                                                                        
consensus                     :                               AAAACCAAACCAGGTACCCCNTTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCNTTG----GT--ACCATAA--TAAN---ACCAGGTACCCCNTTGGTACCATA-ATAAAANCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATGGATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGATCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
Reference ( gi|22115 )        :                               AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GT--ACCATAA--TAAT---ATCGGGTACCCCCTTAGTACCA-A-ATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTAGCCCTTATCGCTTTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATGGATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGATCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
gi|22116                      :                               AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GT--ACCATAA--TAAT---ATCAGGTACCCCCTTAGTACCA-A-ATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACACCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACTCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCACATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATAGATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGATCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
gi|22118                      :                               AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GT--ACCATAA--TAAT---ATCGGGTACCCCCTTAGTACCA-A-ATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGGCACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCAAAAAAA--AAATTTGAACCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATGGAGTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGATCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
gi|22117                      :                               AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CA-------GGTAACCCATTG----GT--ACCATAA--TAAT---AT-GGGTACCCCCTAAGTACCA-A-ATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAGAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTGGCCCTTATTGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTTTGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATGGATTTGAAATATGCCAATACGTAAGTAATATTTCGTTA
gi|22120                      :                               AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATTATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GT--ACCATAA--TAAT---ATCGGGTACCCCCTTAGTACCA-A-ATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGT
gi|22119                      :                               AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATTATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GT--ACCATAA--TA------TCTGGTACCCCCTTAGTACCA-A-ATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGT
gi|22131                      :                               AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GT--ACCATAA--TAAT---ATCGGGTA
gi|22129                      : atgatagccacacacccctttggtgtactaAAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GT--ACCATAA--TAAT---ATCGGGTA
gi|22130                      : atgatagccacacacccctttggtgtactaAAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GT--ACCATAA--TAAT---ATCAGGTA
gi|22133                      : atgatagccacatacccctttggtgtactaAAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATTATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GT--ACCATAA--TAAT---ATCGGGTA
gi|22132                      : atgatagccacacacccctttggtgtgctaAAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATTATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GT--ACCATAA--TA
gi|22121                      :  atgatagccacacacccctttggtgtactaAAATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGAC--ACCATAATA-----CAA---CCAGGTGCCCCTTTG----AC--ACCATAA--TACA---ACCAGGTGCCCCTTTGACACCATA-ATACAACCAGTTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACAGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATAGGCATGCAAAAGAATGAATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGCTCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
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gi|22129                      :                                 atgatAGCCACACACCCCTTTGGTGTACTAAAA-AC----CAAAC-C-AGGTACCCCATTG----GT--ACCATGA--TAAC---AACAGGTACCCCATTGGTACCATA-ATAATATCGGGTa
gi|22130                      :                                 atgatAGCCACATACCCCTTTGGTGTACTAAAA-AC----CAAAC-C-AGGTACCCCATTG----GT--ACCATGA--TAAC---AACAGGTACCCCATTGGTACCATA-ATAATATCAGGTa
gi|22133                      :                                 atgatAGCCACACACCCCTTTGGT--G---TGCTAAAAACCAAAC-C-AGGTACCCCATTG----GT--ACCATTA--TAAC---AACAGGTACCCCATTGGTACCATA-ATAATATCGGGTa
gi|22132                      :                                 atgatAGCCACACACCCCTTTGGTGTACTAAAA-AC----CAAAC-C-AGGTACCCCATTG----GT--ACCATTA--TAAC---AACAGGTACCCCATTGGTACCATA-ATAa
gi|22123                      :                                 atgatAACCAGGTGCCCCTTTGAC--ACCATAAT-A----CAAC--C-AGGTGCCCCTTTG----AC--ACCATAC--TACA---ACCAGGTA
gi|22122                      :                                      AACCAGGTGCCCCTTTGAC--ACCATAATA-----CAA---CCAGTTGCCCCTTTG----AC--ACCATAA--TACA---ACCAGGTA
gi|22126                      :                                       ATCGGGTACCCCCTTAGT--ACCA-AATAA----AAG---C-AGGTGCCCCTTTG----AC--ACCATAA--TACA---ACCAGGTGCCCCTTTGACACCATA-ATACAACCAGGTGCCCCTTTGACACCATACTACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCTTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCAAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATAACACAGATGACTGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATAGGCATGCAAAAGAATGAATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGATCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
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gi|22127                      :                                         CAGGTACTCCATTGG---GTTGTG--AA----CAACTTC-AGGTACTCCATTGGGTTGT--A----AA--CAAC---TTCAGATATTCCTTTGGTTGTA-A-ACAACTTCAGGTACTCCTTTG
gi|22128                      :                                           GGTACCCCCTAAGT--ACCA-AATAA----AAG---C-AGGTGCCCCTTTG----AC--ACCATAA--TACA---ACCAGGTA
gi|22131                      :                                                              ATGATAG----CCA---C-A--CACCCCTTTG----GTGTACTAAAAACCAA----ACCAGGTACCCCATTGGTACCATG-ATAACAACAGGTACCCCATTGGTACCATAATAATATCGGGTA
gi|22129                      :                                                              ATGATAG----CCA---C-A--CACCCCTTTG----GTGTACTAAAAACCAA----ACCAGGTACCCCATTGGTACCATG-ATAACAACAGGTACCCCATTGGTACCATAATAATATCGGGTA
gi|22130                      :                                                              ATGATAG----CCA---C-A--TACCCCTTTG----GTGTACTAAAAACCAA----ACCAGGTACCCCATTGGTACCATG-ATAACAACAGGTACCCCATTGGTACCATAATAATATCAGGTA
gi|22133                      :                                                              ATGATAG----CCA---C-A--CACCCCTTTG----GT--GTGCTAA--AAACCAAACCAGGTACCCCATTGGTACCA-TTATAACAACAGGTACCCCATTGGTACCATAATAATATCGGGTA
gi|22132                      :                                                              ATGATAG----CCA---C-A--CACCCCTTTG----GTGTACTAAAAACCAA----ACCAGGTACCCCATTGGTACCA-TTATAACAACAGGTACCCCATTGGTACCATAATA
gi|22123                      :                                                                            ---C-AGGTGCCCCTTTG----AC--ACCATAA--TACA---ACCAGGTGCCCCTTTGACACCATA-CTACAACCAGGT
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gi|22125                      :                                                                                                                   ---ATCGGGTACCCCCTTAGTACCA-A-ATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGGCACCATAATACAACCAGGTA
gi|22123                      :                                                                                                                   ---ACCAGGTGCCCCTTTGACACCATA-ATACAACCAGGTGCCCCTTTGACACCATACTACAACCAGGTA
gi|22122                      :                                                                                                                  a---ACCAGGTGCCCCTTTGACACCATA-ATACAACCAGTTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTA
gi|22128                      :                                                                                                                         aGGTACCCCCTAAGTACCA-A-ATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTA





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lowQualScore                  :                                                  11                 111                                                      1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                            1     11     0 2  4444   888 2         1   4444            1 5          1         6       1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
lowQualScore                  :                                            .     ..     . .  ....   ... .         .   ....            . .          .         .       .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
lowQualScore                  :                                            0     66     3 6  5555   222 1         0   5555            8 1          0         8       0                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
consensus                     :                        AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCGGGTACCCCCTTGGTACCATAATAAAANCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATGGATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGATCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
Reference ( family-818 )      :                        AAAACCAAACCAGGTACCCCNTTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCNTTG----GTACCATAATAANACCAGGTACCCCNTTGGTACCATAATAAAANCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATGGATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGATCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
gi|22115                      :                        AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCGGGTACCCCCTTAGTACCA-AATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTAGCCCTTATCGCTTTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATGGATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGATCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
gi|22116                      :                        AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCAGGTACCCCCTTAGTACCA-AATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACACCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACTCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCACATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATAGATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGATCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
gi|22117                      :                        AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CA-------GGTAACCCATTG----GTACCATAATAATAT-GGGTACCCCCTAAGTACCA-AATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAGAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTGGCCCTTATTGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTTTGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATGGATTTGAAATATGCCAATACGTAAGTAATATTTCGTTA
gi|22118                      :                        AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCGGGTACCCCCTTAGTACCA-AATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGGCACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCAAAAAAA--AAATTTGAACCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATGGAGTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGATCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
gi|22119                      :                        AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATTATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAAT---ATCTGGTACCCCCTTAGTACCA-AATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGT
gi|22120                      :                        AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATTATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCGGGTACCCCCTTAGTACCA-AATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGT
gi|22121                      :                         AAATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGAC--ACCATAATA-----CAA---CCAGGTGCCCCTTTG----ACACCATAATACAACCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGTTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACAGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATAGGCATGCAAAAGAATGAATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGCTCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
gi|22122                      :                                                                                                        ACCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGTTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTA
gi|22123                      :                                                                                                       aACCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTGCCCCTTTGACACCATACTACAACCAGGTA
gi|22124                      :                                                                                                       aATCGGGTACCCCCTTAGTACCA-AATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTA
gi|22125                      :                                                                                                        ATCGGGTACCCCCTTAGTACCA-AATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGGCACCATAATACAACCAGGTA
gi|22126                      :                                ATCGGGTACCCCCTTAGT--ACCA-AATAA----AAG---C-AGGTGCCCCTTTG----ACACCATAATACAACCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTGCCCCTTTGACACCATACTACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCTTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCAAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATAACACAGATGACTGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATAGGCATGCAAAAGAATGAATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGATCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
gi|22127                      :                                  CAGGTACTCCATTGG---GTTGTG--AA----CAACTTC-AGGTACTCCATTGGGTTGTA----AACAACTTCAGATATTCCTTTGGTTGTA-AACAACTTCAGGTACTCCTTTG
gi|22128                      :                                                                                                            GGTACCCCCTAAGTACCA-AATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTA
gi|22129                      :                               AGCCACACACCCCTTTGGTGTACTAAAA-AC----CAAAC-C-AGGTACCCCATTG----GTACCATGATAACAACAGGTACCCCATTGGTACCATAATAATATCGGGT
gi|22129                      :                   atgatAAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCGGGTAa
gi|22130                      : atgatagccacacacccctttggtgtactaAGCCACATACCCCTTTGGTGTACTAAAA-AC----CAAAC-C-AGGTACCCCATTG----GTACCATGATAACAACAGGTACCCCATTGGTACCATAATAATATCAGGT
gi|22130                      :                   atgatAAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCAGGTAa
gi|22131                      : atgatagccacatacccctttggtgtactaAGCCACACACCCCTTTGGTGTACTAAAA-AC----CAAAC-C-AGGTACCCCATTG----GTACCATGATAACAACAGGTACCCCATTGGTACCATAATAATATCGGGT
gi|22131                      :                   atgatAAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCGGGTAa
gi|22132                      : atgatagccacacacccctttggtgtactaAGCCACACACCCCTTTGGTGTACTAAAA-AC----CAAAC-C-AGGTACCCCATTG----GTACCATTATAACAACAGGTACCCCATTGGTACCATAATA
gi|22132                      :                   atgatAAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATTATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATA
gi|22133                      : atgatagccacacacccctttggtgtactaAGCCACACACCCCTTTGGT--G---TGCTAAAAACCAAAC-C-AGGTACCCCATTG----GTACCATTATAACAACAGGTACCCCATTGGTACCATAATAATATCGGGT
gi|22133                      :                   atgatAAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATTATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCGGGTAa





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lowQualScore                  :                                                  11                 111                                                      1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                            0     11     0 2  4444   888 2             4444                         0         6       1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
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consensus                     :                        AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCGGGTACCCCCTTGGTACCATAATAAAANCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATGGATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGATCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
Reference ( family-818 )      :                        AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCGGGTACCCCCTTGGTACCATAATAAAANCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATGGATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGATCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
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gi|22116                      :                        AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCAGGTACCCCCTTAGTACCA-AATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACACCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACTCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCACATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATAGATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGATCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
gi|22117                      :                        AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CA-------GGTAACCCATTG----GTACCATAATAATAT-GGGTACCCCCTAAGTACCA-AATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAGAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTGGCCCTTATTGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTTTGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATGGATTTGAAATATGCCAATACGTAAGTAATATTTCGTTA
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gi|22121                      :                         AAATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGAC--ACCATAATA-----CAA---CCAGGTGCCCCTTTG----ACACCATAATACAACCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGTTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACAGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATAGGCATGCAAAAGAATGAATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGCTCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
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gi|22123                      :                                                                                                       aACCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTGCCCCTTTGACACCATACTACAACCAGGTA
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gi|22127                      :                                  CAGGTACTCCATTGG---GTTGTG--AA----CAACTTC-AGGTACTCCATTGGGTTGTA----AACAACTTCAGATATTCCTTTGGTTGTA-AACAACTTCAGGTACTCCTTTG
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gi|22129                      :                   atgatAAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCGGGTAa
gi|22130                      : atgatagccacacacccctttggtgtactaAGCCACATACCCCTTTGGTGTACTAAAA-AC----CAAAC-C-AGGTACCCCATTG----GTACCATGATAACAACAGGTACCCCATTGGTACCATAATAATATCAGGT
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gi|22131                      : atgatagccacatacccctttggtgtactaAGCCACACACCCCTTTGGTGTACTAAAA-AC----CAAAC-C-AGGTACCCCATTG----GTACCATGATAACAACAGGTACCCCATTGGTACCATAATAATATCGGGT
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gi|22132                      : atgatagccacacacccctttggtgtactaAGCCACACACCCCTTTGGTGTACTAAAA-AC----CAAAC-C-AGGTACCCCATTG----GTACCATTATAACAACAGGTACCCCATTGGTACCATAATA
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Alignments
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lowQualScore                  :                                            0     11     0 2  4444   888 2             4444                         0         6       1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
lowQualScore                  :                                            .     ..     . .  ....   ... .             ....                         .         .       .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
lowQualScore                  :                                            5     66     3 6  5555   222 1             5555                         8         8       0                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
consensus                     :                        AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCGGGTACCCCCTTGGTACCATAATAAAANCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATGGATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGATCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
Reference ( family-818 )      :                        AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCGGGTACCCCCTTGGTACCATAATAAAANCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATGGATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGATCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
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gi|22117                      :                        AAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CA-------GGTAACCCATTG----GTACCATAATAATAT-GGGTACCCCCTAAGTACCA-AATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCCTGTTTCAATATAGAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTGGCCCTTATTGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCCAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATATCACAGATGACTGCTATGGTTTGTTGAAAGACCCATGGGCATGCAAAAGAATGGATTTGAAATATGCCAATACGTAAGTAATATTTCGTTA
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gi|22122                      :                                                                                                        ACCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGTTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTA
gi|22123                      :                                                                                                       aACCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTGCCCCTTTGACACCATACTACAACCAGGTA
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gi|22125                      :                                                                                                        ATCGGGTACCCCCTTAGTACCA-AATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGGCACCATAATACAACCAGGTA
gi|22126                      :                                ATCGGGTACCCCCTTAGT--ACCA-AATAA----AAG---C-AGGTGCCCCTTTG----ACACCATAATACAACCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTGCCCCTTTGACACCATACTACAACCAGGTAACAGCGCAACTTCGCCTACTTCTTGTTTCAATATAAAGTAGTCTTACATAAACGGGTGAGACAATGTAAGAACGCCTAGCCCTTATCGCTCTCTGGCCAGTTCTTACATGCTCCAAAAACCACTCCAAAAAAACTAATTTTTAGCCGCATGAGTCTCCTCCATAACACAGATGACTGCTATGGTATGTTGAAAGACCCATAGGCATGCAAAAGAATGAATTTGAAATATGCCAATACATAAGTAATATTTCGTTATGCCCCCGATCGCATCCAAACGTAAGAATTTTCCGC
gi|22127                      :                                  CAGGTACTCCATTGG---GTTGTG--AA----CAACTTC-AGGTACTCCATTGGGTTGTA----AACAACTTCAGATATTCCTTTGGTTGTA-AACAACTTCAGGTACTCCTTTG
gi|22128                      :                                                                                                            GGTACCCCCTAAGTACCA-AATAAAAGCAGGTGCCCCTTTGACACCATAATACAACCAGGTA
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gi|22129                      :                   atgatAAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCGGGTAa
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gi|22130                      :                   atgatAAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATGATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCAGGTAa
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gi|22132                      : atgatagccacacacccctttggtgtactaAGCCACACACCCCTTTGGTGTACTAAAA-AC----CAAAC-C-AGGTACCCCATTG----GTACCATTATAACAACAGGTACCCCATTGGTACCATAATA
gi|22132                      :                   atgatAAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATTATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATA
gi|22133                      : atgatagccacacacccctttggtgtactaAGCCACACACCCCTTTGGT--G---TGCTAAAAACCAAAC-C-AGGTACCCCATTG----GTACCATTATAACAACAGGTACCCCATTGGTACCATAATAATATCGGGT
gi|22133                      :                   atgatAAAACCAAACCAGGTACCCCATTGGT--ACCATTATAA----CAA---C-AGGTACCCCATTG----GTACCATAATAATATCGGGTAa