lowQualScore : 1 1111111111 222222222222 1111 1111111111 1111 11111111111 1111111 1111111111 11111 2222222222222 22222222222222222222222222222 4444444444444444444444444444 111111 11111 1 1111111 1111111111 111111111111 444444444444444444 11111 111111111111 1 111
lowQualScore : 5 1 888 66 2 0 1 1 5555 2222222222 2 66666 33 55 5 5555555 444 444 2 3 7777 33 333333333333 33 66 0 55555 0000 55 3333333333 0 1 4 7 1 1111 88888888 2 44444444444 33 33 1 2222222 5555 2 3333333333 2 2 00000 33 2 666 2 4 2 2 7777777777777 33 55555555555555555555555555555 8888888888888888888888888888 444444 4 33 444 6 44444 555 6 7 2 555 0 0000000 4 6666666666 3 3 4 555 1 666666666666 000000000000000000 22222 7777 555 7777 0 777777777777 0 4 0 8 999 111 0 8 8 1 5
lowQualScore : . . ... .. . . . . .... .......... . ..... .. .. . ....... ... ... . . .... .. ............ .. .. . ..... .... .. .......... . . . . . .... ........ . ........... .. .. . ....... .... . .......... . . ..... .. . ... . . . . ............. .. ............................. ............................ ...... . .. ... . ..... ... . . . ... . ....... . .......... . . . ... . ............ .................. ..... .... ... .... . ............ . . . . ... ... . . . . .
lowQualScore : 7 1 888 99 3 6 1 5 0000 4444444444 4 22222 44 55 4 4444444 444 444 4 8 1111 22 333333333333 11 11 7 66666 3333 33 9999999999 8 2 4 1 2 0000 77777777 4 55555555555 22 22 4 0000000 0000 4 2222222222 4 1 55555 44 5 999 5 0 9 9 6666666666666 11 66666666666666666666666666666 8888888888888888888888888888 444444 7 77 777 9 77777 555 2 7 2 888 0 8888888 2 7777777777 3 3 9 666 8 666666666666 333333333333333333 99999 1111 888 1111 8 888888888888 8 6 8 6 444 666 8 0 0 2 0
consensus : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATCAGAATTAATCACAGAATTCT----ACCAAC---------AAAAA-AATATCTACATA-----AA--ATT-AAGA-TAA---TTG---AC---A-GTCC--CTT--ATG--C-C-AT--NAT--T--GCCAACA-----AGAA---GAAA--CT-CTAATA--CACATGTTT-TGGACATGTCCAGCAACGCAA-CNATTTCTT--C-----A-AGAT----A-----TT--A--AGC--AN---T----G-GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAATA---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAANTA-TTT-ATATTTAATA------T-----AGG-AAA--C--A--TNTAT-T--CA--A----AC-GCAGA-----NC---TGT-N---A----GTN--AT-CN---TNGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACNAAACGACAT--AATGCTACATT-ATCTGTAGTT---GCATTTAA-AAAC-------AGANT--C-ANAA--AT-A-CATTC--TTATCA----CT---A--AAATGCA---T-----TGC-CCAAA-----AA----A---ATAA----TGATAT-NCA-TTA----TTTTAAAACACAATGGNATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTCAAACATACAGAAA
Reference ( gi|155958 ) : AAA-ACAAATATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAAA-AATATCTACATA-----AA--ATT-AAGA-TAA---TTA---AC---A-GCCC--CTT--ATG--C-C-AT--GAT--T--GCCAACA-----AGAG---GAAA--CT-CTAATA--CACATGCTT-TGGACATGTACAGCAACGCAA-CAATTTCTT--C-----A-AGAT----A-----TT--A--AGC--AG---T----G-GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAATA---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTA-TTT-ATATTTAATA------T-----TGG-GAA--C--A--TCTAT-T--CA--A----AT-GCAGA-----CC---TGT-T---A----GTA--AT-CA---TAGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACGAAACGACAT--AATGCTACATT-ATCTGTAGCT---GCATTTAA-AAAC-------AGAAT--C-ACAA--AT-A-CATTC--TTATCA----CT---A--AAATCTA---T-----TGC-CCAAA-----AA----A---ATAA----TGATAT-TCA-TTA----TTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTTAAACATACAGAAA
gi|155959 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATGAGAATTAACCATAGAAATTT----ACCAAC---------AAAAA-AATATCTACATA-----AA--ATT-AAGA-TAA---TTA---AC---A-GTCC--CTT--ATG--C-C-AT--GAT--T--GTCAACA-----AGAG---GAAA--AT-CTAATA--CATATGCTT-TGGACATGTACAGCAACGCAA-CAATTTCTT--C-----A-AGAT----A-----TT--A--AGC--AG---T----G-GCT-TCAA-ATG-AAA-AATATCAATA---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTA-TTT-ATATTTAATA------T-----TGG-GAA--C--A--TCTAT-T--CA--A----AT-GCAGA-----CC---TGT-T---A----GTA--AT-CA---TAGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACGAAACGACAT--AATGCTACATT-ATCTGTAGCT---GCATTTAA-AAAC-------AGAAT--C-ACAA--AT-A-CATTC--TTATCA----CT---A--AAATGCA---T-----TGC-CCAAA-----AA----A---ATAA----TGATAT-TCA-TTA----TTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AACACTTTTCAAACATACAGAAA
gi|155960 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATCTT----ACCGAC---------AAAAA-AACATCTACATA-----AA--ATT-AAGA-TAA---TTA---AC---A-GTCC--CTT--ATG--C-C-AT--AAT--T--GTCAATACGGTAAGAG---GAAA--CT-CTAATA--CATATGCTT-TGGACATGTACAGCAACGCAA-CAATTTCTT--C-----A-AGAT----A-----TT--A--GGC--AG---T----G-GCT-TCAA-ACA-AAA-AATATCAACA---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTA-TTT-ATATTTAATA------T-----TTG-GAA--C--A--TCTAT-T--CA--A----AG-GCAGA-----CC---TTT-C---A----GTT--AT-CA---TAGAAATTAAATAT--TATATCTT---TTCTACAAAACGACAT--AATGCTACATT-ATCTGTAGTT---GCATTTAA-AAAC-------AGAAT--C-ACAA--AT-A-CATTC--TTATCA----CT---A--AAATGCA---T-----TGC-CCAGA-----AA----A---ATAA----TGATAT-TCA-TTA----TTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTGTTAAAACATACAGAAA
gi|155961 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAG------------AATT---------AAC-----------------------CATA-----GA--ATT------------TTA---CC---A-GCCC--CGT--ATG--C-C-AT--GAT--A--GCCAACA-----AGAG---GAAG--CT-CTAATA--CATACGCTT-TGGACATGTACAGCAACGCAA-CTATTTCTT--C-----A-AGAT----A-----TT--A--AGC--AG---T----G-GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAATA---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTA-TTT-ATATTTAATA------T-----TGG-GAA--C--A--TTTAT-T--CA--A----AT-GCAGA-----CC---TGT-A---A----GTA--AT-CA---TAGAAATTAAACAT--TATATATT---TTCTACGAAACGTCAT--AATGCTTCATT-ATCTGTTGCT---GCATTTAA-AAAC-------AGAAT--C-ACAA--AT-A-CATTC--TTATCA----CT---A--AAATGCA---T-----TGC-CCCAA-----AA----A---ATAA----TGATAT-TCA-TTA----TTTTGAAACACAATGGAATAAATAC----------TCCTCCAATC--AATATTG-T-AATACTATTTAAACATACAGAAA
gi|155962 : AAT-ACAAGTATAGTTCAATTT---T--AAGCTGGCTTCAAACCAAAATTAACCATAGAATCTT----ACCACC-----------AAA-AACATCTACATA-----AA--CTC-AAGA-TTA---GTA---AC---A-GACC--CCT--ATG--T-C-AT--GAT--T--GCCGACA-----AGAA---GAAA--CT-TTAG-A---AAATGATT-TGGACATGTACAGCAACAAAA-CATTTTCTT--C-------AGCT----A-----TT--A--AGC--AG---T----G-ACT-TCAA-AC-------ATATCAACA---TAA-CAT-TGAT--T-AGAAGAACTA-TTA-ATGTTTAATA------C-----AGG-GAA--C--A--ATCAT-T--CA--AAGACAT-TCAAAAAAATCCTTATGT-T---------TA--TC-CA----AGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACAAAGCGACTT--ATTGCTATATT-ATCTGTAGTT---GCATTTAA-AAAC-------AGAAT--A-GCAA--AT-A-CATTG--TTAATG----CA---A--AAATGCA---T-----TGC-CCAAA-----AA----A---ATAA----TGCTAT-TCA-TCA----TTTTGAAACA-ACTTATATAAATACAACAACGTATTCCTCCAACC--AATATTA-T-AATACTATTCAAACATACAGAGA
gi|155963 : AAA-ACAACTATAATTCAATTT---T--AAGTAAGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAAA-AA-ATCTACATA-----AA--ATT-AAGA-TAA---TTA---AC---A-GCCC--CTT--ATG--C-G-AT--GAT--T--GCCAACA-----AGAG---GAAA--CT-CTAATA--CATATGCTT-TGGGCATGTACAGCAACATAA-CAATTTCTT--C-----A-AGAT----A-----TT--A--AGC--AG---T----G-GCT-TCAA-ATG-AAA-ACTA
gi|155964 : AAATATAACTATAGCTCAATTT---T--ACAATGGTTTCAAGTCAGGATCAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAGA-AATAT
gi|155965 : -ACAATTATAG---AACTTACTT--CAGT-GGTTTTAAATTACACTGAACCAGAGATTGTT----ACCAAC---------AAGAA-AATATATATTTA-----AC--AT--AAAA--AG---CTGCAGAT---A-GTCT--ATT--GTG--C-TTAT--T-T--T--GCAATCA-----AATT---GAGA--CT-ATTTCG--CAAATACTT-TGGTCATGCCCAGAAACGCAA-ATATTAATT--C-----AGAAAT----G-----TC--G--A----AT---T----G-GAT-TAAA-TCT-AAG-AATA--AAGA---T-----T-TCAAACT-AAAAGATGTC-TTC-ATTTTTACTA------T-----TGG-AGA--A--A--TGTAT-T--CC--C----AT-GCTGA------------T-T---AACATGTG--AT-AT---TGGAAATTAAATAT--TGTATTTTTAATTCTACAAtagaggaaagcattatttatttattctggacatgtccttcaacaagatcatttcttcaaaaaaatacaaacatggtttataaggaacagtataactttaccatttatagaagaattatttatatttaatataggagaacaatatataatggctgatatgcagatcatgttagagattaaatactatatattctcagccaaaaaattgacttctccattatctataactgcacttcacaacagacttaaacattcctttagggcaaacaaatatatagcagttaaaataataccataaaaacttttgaaaaaaaatggaatacattcaaaactttacttcaagattaatttgataaatact
gi|155966 : CAAATATAGTTCTACTC---TCCAA--TGGTTTCAAACCAGAATTAATCATAGAATATT----ACCCAC---------TAAAA-AATACTAATATA-----CA--ATA-AAAG-CTA---TTC---CT---A-GTCC--CTT--ATGT-C-C-GT---AC--T--GTGATCA-----GGAA---GAAA--C----AATAACCACTTATTC-TGGACATGTCAAACAACCCAG-TCCTTTTTA--C-----A-AAAG----A-----T-------AC--AGTCCT----G-GC--TAAG-AAG-AAATAATGTCATAA---TAC-CCT-TTA---T-AAAAAAAATA-TTT-ATTTTCAATA------T-----AGG-AGA--T--A----AAT-TCACA--G----AT-GAAGA-----AT---TAT-T---C----ATT--AT-CT---TAGATATTTAATTT--TATATATT---CTC
gi|155967 : TGGTTTTAAACCAGAATAAATCAGAGGATTCT----ACCA-T---------GAAAA-AATATCTACATA-----CA--TTA-AAAA-TAA---TAG---GC---A-GTCC--TCT--ATG--T-A-CT--TCC--T--GCAACCA-----GGAA---GAGA--CC-ACCATC--CATATGTTT-TAGACATGT-CAGCAACACAA-ACCTTTCTT--------A-ATAA----A-----CTCAA--AACTTAG---TTCTCT-GCT-TTAA-ATG-TAA-AATGCCCATT---TAA------TA---T-AAAA----TGTTTT-TTATTTAATACCAGTGT-----AGA-AAA--C--A--ACATT-T--CA--C----AA-GCAGA-----------AT-TCAAA----ATT--AT-TC---TTGAACTAAAATAT--TACATATT---TTCTACAAGACGACCG--AATGGAACACT-ATCAACAGTT---GCTTTTAA-AAAC-------AGACT--T-AAGT--TT-A-CACTT--TTATCA----CT---C--AAAGAAA---T-----AGCAATAAA-----AA----ACGGAAAA----AAATAT-AC---------TTTTAAAGCACAGTGGCATAAA
gi|155968 : TGGTTCCAAATACGAATTAATCACAGGATTCT----CCCAAC---------AAGAA-AATTTTTATATA-----TG--ATA-AATA-TTG---TTG---AT---A-GTCC--TAT--TTG--T-A-AA--TAT--T--GTCAAAT-----GGAA---GAAA--CC-TTGACA--CACATGTTG-TGGTCATGTCCTGCTACACAATCA--CTATT--A-----A-AGGA----AC----TT--A--AAC--TT---T----G-GCTATCCA-TC--AAA-CATTTCAAAT---TAA-CAC-TGA---T-AGAAGAATCA-TTT-ATATTCAATA------C-----AGG-AAA--T--A--AATTG-T--CC--A----AC-ACAGA-----AC---T-T-C---AT---ATA--AT-AC---TTGAAACTAAATAT--TACATATT---CTATACTAAACGGAATC-AAAGTT-CATTAAGCT-TAGAC---ACACTCAAGAAAC-------GT--T--T-GGAA--AT-A----TC--ATATGAGATCCT---T--AAATGCATATT-----TGT----AA-----AA----A---ATAA----TAACAT-AAACTTA----TTTGAAAATA-AATGG
gi|155972 : TGGTGTCAAACCAGAATAAATTACAGGATTCT----ACCA-T---------GTAAA-AATATCTACATACTCGTAC--ATT-AAAAATAA---CTG---AC---A-GTCC--TCT--ATG--TAC-AT--C-C--T--GCAACCA-----GGAA---AAGA--CC-CACGTC--AACATGTTT-TGGACATGTCCAGCCACACAA-ACATTTCTT--
gi|155969 : TGGTTCCAACACAGAATTA-TCATAGAATTGG----AACAAC---------AAAGA-AATGTTTAAAAA-----AA--ACT-ATTA-AAA---CTG---GCCCAA-GCTC--ATT--GTG--T-T-CT--TAT--T--GTAATCA-----AAAC---GAAAG-C----AGTATTCATTTACTC-TGGACATGTCCTTCAACAAGG-TCGTTTCTT--CAAAAAA-AAAT----A------C--A--AGC--A----T----G-GTT-T----ATA-AAG-AACATAATTACTTTAC-CAT-TTA---T-AGTAGAATTA-TTC-ATATGTTATA------C-----AGG-AAAAGA--A--TATAT--------A----ATGGCA-A-----CA---TGT----------GTATTAT-CGTATTAGAAATGAAATAC--TATACATA---ATCAGCTAAA--A-----AAT-CTACATT-ATCTATaataaactcagaacctggttctctgccataaatgtaaattgaaaaggttgaaaggttttatatccaataccaatatagaaaataacatgtcccaaaccgaattccaaaattttcttgaaataaaacacaacatattttctgcaagacgactgaatggaacactatcatcagttgcttttaagaagagactgaaatatacacttctagtatctcgccgagaaatagcaataaaaacggaaatatgatacttttaaagcacagtggcacaa
gi|155971 : TAGTTCCAAATACGAATTGATCACAGGATTTT----CCTAAC---------AAGAATTTTTTTTATATA-----TG--ATA-AACA-TTG---TTG---AT---A-GTCC--GAT--TTG--T-A-AA--TAT--T--GTCAAAT-----GGAA---AAAA--CA-TTGACA--TACATGTTG-TGGTCATGTCCTGCTACACAA-TAG-CTGTT--A-----A-AGGA----AC----TT--A--AAC--TT---T----G-GCTATCCA---T-AAA-CATTTCAAAT---TAA-CAC-TGA---T-TGAAGAATAA-TTT-ATATTCAATA------T-----AGG-AAA--TAAA--T-TAT-C--C---A----AC-ACAGA-----AC---TCCAT---A-----TG--ATCCA---T-GAAACTGAATACAGCATATATT---CTATACTAAACGGAAT--AAAAGTTCATT-A-----AGCTTAGACACTCAATAAACGACTGGAAAAAT--C-AT----ATGA-GATCC--TT----------------AAATGCATATT-----TGT-AAAAA-----AA----A---ATAA----C-ATA--ACT-TTA----TTTGAAAATA-AATGG
gi|155970 : TGGTTCCAATTTAGAATTAATCACAGAATTCTTGGAACAAACTCATTGCTTAAAAA-AATG-------A-----AG--ATT-AA-A-GAA---TCA---GA---T-G-------T--ATGTTC-C-TT----T--T--GTCAAAA-----AGAAACCGAAA--CTATTAA-A--CATATATTTATTGAC-TGCATAGTAACGCAA-CAATTTTTT--C-----A-AAGT----T-----TT--A--AAA--AT---T----A-TCT---GA-ATG-AAA-AGTG-CAATA---CAA-TAA-ATA---C-AGA
gi|155973 : TGGTTTCAAAACAGAATAAATCACAGGATTCT----ACCATG---------TAAAA-AATATCTACATA-----CATTATTAAAAA-TAA---CTG---AC---A-GTCC--ACT--ATG--TAC-ATCCGAG--TAGGCCAAC
gi|155974 : TTCCAATTTAGAATTAATCACAGAATTCT----TGGAAC---------AAACT-CATTGCTTAAAA-----AA--ATG-AAGA-T-----TTA---AG---A-ATCCGATGT--ATGTTC-C-TT----T--T--GTCAAAG-----AGAAACCGAAA--CTATTAA-A--CATATATTTATTGAC-TGCATAGTAACGCAA-CAATTTTTT--C-----A-AAGT----T-----TT--A--AAA--AT---T----A-TCT---GA-ATG-AAA-AGTG-CAATA---CAG-TAA-ATA---C-AGA
gi|155975 : AATTCT----ACTAA-------------AA-ATTACCATCA-A-----AA--GTT-AAAA-TAAGGGTCA---AT---TTGCTT--TTTGGATGGCC-T-AT--TATCCT--GCAACCA-----AGAA---GAGA--CC-CTCGTC--CACATGTTT-TGGACATATCCAGCAACACAA-ATATTTCTT--------A-ATAA----AC----TT--A--AAA--CC---T----G-GTT-TCTCTGCC-ATA-AATGTAAAT----TGCTCATGTTA---TGAGAAAGATT---TT-ATATTCAATA------CCAATATAG-AAA--GTAA--TATGT-CA-CA--A----A---CAGA-----AT---TCC-A---A----CTT--AT-TA---TCGAAATAAAACAC--TACATAGT---TTCTATAAGACGACTG--AATGGAACACT-ATCCACAGTT---TCTTTTAA-AAAT-------AGACTGAA-ATAATTAT-A-CACT---TTATCA----CTCACG--AGATATA----------G---CAAT-----AA----A---AAAG----GAAAAT-TTA-TAC----TTTTAAAGGACAGTGGCACAAA
gi|155976 : -GCCT--CTT--ATT--T-A-AA--TAT--T--GTCAAAT-----AGAA---GAAA--CC-TTGACA--CGCATGTTG-TGATGATGTCCTGCTACACAA------TCGC--C-----A-TGAA----AGGAACTT--A--GAC--TT---T----G-GCTATCCA--CA-AAA-CATTTCAAAT---TAA-CAC-TGA---T-AGAAAAATCA-TTT-ATAATCAATA------C-----AGG-AAA--T--AAAT-TAT-C--CA--A-----C-ACAGA-----AC---T-T-C---AT---ATA--AT-AC---TTGAAACTAAATAT--TACATATT---CTATACTAAACGGAATC-AAAGTT-CATTAAGCT-TAGAC---ACACTCAAGAAAC----------GT--CTGGAA--AT-ATCA-TA--TTATGAGATCCT---T--AAATGCATATT-----TGT----AA-----AA----A---ATAA----TAACATAACT-TTA----TTTGAAAATA-AATG
gi|155977 : -C-AC--GAT--TATGTAACCA-----GGAA---GAGAGCCT-C-AAC---CACACGTTT-TGGACATGTCCAGCAACACAA-ACATTTCTTAAT-----A-AGCTCAGAA-----TT--T--GGT--AC---T----CTGTT-ATAA-ATGCAAA-AAAACTCAT----------T-TTA---T--GAAAAAATA-TTTTATATTTAATACCAATGT-----AGA-AAA--C--A--AC-ATGT--CACGA----A---CAGA-----AT---TCC-A---A----ATG--AT-TT---TTTAAATAAAATAT--TACATATT---TTCTACAAGACGACCG--AATGGAACACT-ATCCACAGTT---GCTTTTAA-AAAT-------AGACT--A-AAAT--AT-A-CACTT--TTATCA----CT---C--AAAGAAA---TAGCAATGA-TTAAAAACGGAA----A---AAAA----TGATAC------------TTTTAAAACAAAGTGGCACAAA
gi|155964 : -----AGAG---GAAA--GC-ATTATT--TATTTATTC-TGGACATGTCCTTCAACAAGA-TCATTTCTT--C-----A-AAAA----A-----AT--ACAAAC--A----T----G-GTT-TATA-AGG-AAC-AGTATAACTT---TAC-CAT-TTA---T-AGAAGAATTA-TTT-ATATTTAATA------T-----AGGAGAA--CA-A--TATAT--------A----ATGGCTGA-----TA---TG--C---A----G----AT-CATGTTAGAGATTAAATAC--TATATATT---CTCAGCCAAA--AAATTGACTTCTCCATT-ATCTATAACT---GCACTTCA-CAAC-------AGACT--T-A-A------A-CATTCCTTTAGGG----CA---AACAAATATA---T-----AGC----AGTT---AA----A---ATAA----TA-----CCA-TAAAAACTTTTGAAAAAAAATGGAATACATTCAA-AACT--TTACTTCAAGATTAAT-TTGATAAATACT
gi|155972 : aaatataactatagctcaattttacaatggtttcaagtcaggatcaaccatagaattttaccaacaaagaaatattGAAATAAAACAC--AACATATT---TTCTGCAAGACGACTG--AATGGAACACT-ATCATCAGTT---GCTTTTAA-GAAG-------AGACT--G-AAAT--AT-A-CA--C--TT--------CT---A--GTATC-----T-----CGC-CGAGA-----AATAGCA---ATAAAAACGGAAATATGA-TAC----TTTTAAAGCACAGTGGCACAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1111111111 1111111111111111 1111111111 1111111 222222 1111111 11111 1111 2222222 1111111 1111 11111 11111111
lowQualScore : 5 0 777 66 1 1 2 4444 1111111111 2 55555 33 44 4 222 44444 444 333 55 55555 3333333333 33 55555 777 55 777 4444 22 4 0 0 66 444 2 7777777777777777 22 22 77777 6666 1111111111 2 0 1111111 33 2 888 2 1 0 2 777777 111111 666 7777 888 2 8888 5555 99999999 1 6666666 1 55555 1 33 444 1 11111 1 3 5 2 8 3 9 2 1 999 1 77777 3 3 3 666 44 3333 5555555 6 1111111 8888 11111 555 555 55555555 9 1 5 44 99 6 6 1
lowQualScore : . . ... .. . . . .... .......... . ..... .. .. . ... ..... ... ... .. ..... .......... .. ..... ... .. ... .... .. . . . .. ... . ................ .. .. ..... .... .......... . . ....... .. . ... . . . . ...... ...... ... .... ... . .... .... ........ . ....... . ..... . .. ... . ..... . . . . . . . . . ... . ..... . . . ... .. .... ....... . ....... .... ..... ... ... ........ . . . .. .. . . .
lowQualScore : 0 1 888 11 0 9 2 7777 2222222222 4 99999 22 66 5 999 55555 111 999 33 66666 2222222222 22 66666 888 33 444 9999 99 2 5 6 99 333 1 7777777777777777 99 99 77777 6666 3333333333 1 8 6666666 44 2 333 2 0 2 5 222222 666666 999 1111 111 5 4444 9999 11111111 0 4444444 0 66666 0 44 444 0 66666 2 4 7 9 2 4 2 3 0 555 0 33333 1 1 1 333 22 1111 0000000 2 2222222 9999 99999 444 444 00000000 2 0 7 22 22 7 7 4
consensus : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATCAGAATTAACCACAGAATTCT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-G---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATTAT--TGCCAACA-----AGAA---GAAA--CT-CTAATA--CACATGT--TT-TGGACATGTCCAGCAACGCAACNATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-NTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAANTATTT-ATAT------TTAATA------TAGGA---AA--C-A-TNT-AT-T--CAAACG--C--------AGANCTNTAA-A-TNATC---NTNGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACNAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGANT-N-ANA-A---ATA-CA-T-TC--T--TATCA----CT----N--AAAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-NCA-TTATTTTGAAACACAATGGNATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTCAAACATACAGAAA
Reference ( family-802 ) : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATCAGAATTAATCACAGAATTCT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-G---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATNAT--TGCCAACA-----AGAA---GAAA--CT-CTAATA--CACATGT--TT-TGGACATGTCCAGCAACGCAACNATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-NTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAANTATTT-ATAT------TTAATA------TAGGA---AA--C-A-TNT-AT-T--CAAACG--C--------AGANCTGTNA-G-TNATC---NTNGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACNAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGANT-C-ANA-A---ATA-CA-T-TC--T--TATCA----CT----A--AAAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-NCA-TTATTTTAAAACACAATGGNATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTCAAACATACAGAAA
gi|155958 : AAA-ACAAATATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GCCC--CTT-----ATG--C-C-ATGAT--TGCCAACA-----AGAG---GAAA--CT-CTAATA--CACATGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTGGG---AA--C-A-TCT-AT-T--CAAATG--C--------AGACCTGTTA-G-TAATC---ATAGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACGAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGCTGCATTTAA-AAACAGAAT-C-ACA-A---ATA-CA-T-TC--T--TATCA----CT----A--AAAT-CTA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTTAAACATACAGAAA
gi|155959 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATGAGAATTAACCATAGAAATTT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATGAT--TGTCAACA-----AGAG---GAAA--AT-CTAATA--CATATGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ATG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTGGG---AA--C-A-TCT-AT-T--CAAATG--C--------AGACCTGTTA-G-TAATC---ATAGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACGAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGCTGCATTTAA-AAACAGAAT-C-ACA-A---ATA-CA-T-TC--T--TATCA----CT----A--AAAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AACACTTTTCAAACATACAGAAA
gi|155960 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATCTT----ACCGAC---------AAAAAAACATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATAAT--TGTCAATACGGTAAGAG---GAAA--CT-CTAATA--CATATGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--GGC--A-GTG----GCT-TCAA-ACA-AAA-AATATCAAC--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTTGG---AA--C-A-TCT-AT-T--CAAAGG--C--------AGACCTTTCA-G-TTATC---ATAGAAATTAAATAT--TATATCTT---TTCTACAAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGAAT-C-ACA-A---ATA-CA-T-TC--T--TATCA----CT----A--AAAT-GCA---T---TGC-CCAGA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTGTTAAAACATACAGAAA
gi|155961 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAG------------AATT---------AAC-----------------------CATA-----GA--ATT---------TT-A---CC---A---GCCC--CGT-----ATG--C-C-ATGAT--AGCCAACA-----AGAG---GAAG--CT-CTAATA--CATACGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACTATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTGGG---AA--C-A-TTT-AT-T--CAAATG--C--------AGACCTGTAA-G-TAATC---ATAGAAATTAAACAT--TATATATT---TTCTACGAAACGTCAT--AATGCTTCATT-A-TCTGTTGCTGCATTTAA-AAACAGAAT-C-ACA-A---ATA-CA-T-TC--T--TATCA----CT----A--AAAT-GCA---T---TGC-CCCAA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATAC----------TCCTCCAATC--AATATTG-T-AATACTATTTAAACATACAGAAA
gi|155962 : AAT-ACAAGTATAGTTCAATTT---T--AAGCTGGCTTCAAACCAAAATTAACCATAGAATCTT----ACCACC-----------AAAAACATCT-ACATA-----AA--CTC-AAGA-TTAGT-A---AC---A---GACC--CCT-----ATG--T-C-ATGAT--TGCCGACA-----AGAA---GAAA--CT-TTAG-A---AAATGA--TT-TGGACATGTACAGCAACAAAACATTTTCTT--C--AGC-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----ACT-TCAA-AC-------ATATCAAC--A---TAA-CAT-TGAT--T-AGAAGAACTATTA-ATGT------TTAATA------CAGGG---AA--C-A-ATC-AT-T--CAAAGA--CATTCAAAAAAATCCTTAT-GTTTATC---CAAGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACAAAGCGACTT--ATTGCTATATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGAAT-A-GCA-A---ATA-CA-T-TG--T--TAATG----CA----A--AAAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGCTAT-TCA-TCATTTTGAAACA-ACTTATATAAATACAACAACGTATTCCTCCAACC--AATATTA-T-AATACTATTCAAACATACAGAGA
gi|155963 : AAA-ACAACTATAATTCAATTT---T--AAGTAAGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAAAAA-ATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GCCC--CTT-----ATG--C-G-ATGAT--TGCCAACA-----AGAG---GAAA--CT-CTAATA--CATATGC--TT-TGGGCATGTACAGCAACATAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ATG-AAA-ACTA
gi|155964 : AAATATAACTATAGCTCAATTT---T--ACAATGGTTTCAAGTCAGGATCAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAGAAATAT
gi|155964 : TAT--TC-TGGACATGTCCTTCAACAAGATCATTTCTT--CA-AAA-----A----A-----AT--ACAAAC--A--TG----GTT-TATA-AGG-AAC-AGTATAACT--T---TAC-CAT-TTA---T-AGAAGAATTATTT-ATAT------TTAATA------TAGGAG--AA--CAA-TAT-AT-----AATGG--C--------TGATATGCAG-A-TCATG---TTAGAGATTAAATAC--TATATATT---CTCAGCCAAA--AAATTGACTTCTCCATT-A-TCTATAACTGCACTTCA-CAACAGACT-T-AA--------A-CA-T-TCCTT--TAGGG----CA----AACAAAT-ATA---T---AGC----AGTT---A---AA---ATAATACCAT-AAA-AACTTTTGAAAAAAAATGGAATACATTCAA-AACT--TTACTTCAAGATTAAT-TTGATAAATACTtagaggaaagcattatttatttattctggacatgtccttcaacaagatcatttcttcaaaaaaatacaaacatggtttataaggaacagtataactttaccatttatagaagaattatttatatttaatataggagaacaatatataatggctgatatgcagatcatgttagagattaaatactatatattctcagccaaaaaattgacttctccattatctataactgcacttcacaacagacttaaacattcctttagggcaaacaaatatatagcagttaaaataataccataaaaacttttgaaaaaaaatggaatacattcaaaactttacttcaagattaatttgataaatact
gi|155965 : aaatataactatagctcaattttacaatggtttcaagtcaggatcaaccatagaattttaccaacaaagaaatattagaggaaagcattatttatt-ACAATTATAG---AACTTACTT--CAGT-GGTTTTAAATTACACTGAACCAGAGATTGTT----ACCAAC---------AAGAAAATATAT-ATTTA-----AC--AT--AAAA--AGCT-GCAGAT---A---GTCT--ATT-----GTG--C-TTATT-T--TGCAATCA-----AATT---GAGA--CT-ATTTCG--CAAATAC--TT-TGGTCATGCCCAGAAACGCAAATATTAATT--CAGAAA-----T----G-----TC--G--A----A-TTG----GAT-TAAA-TCT-AAG-AATA--AAG--A---T-----T-TCAAACT-AAAAGATGTCTTC-ATTT------TTACTA------TTGGA---GA--A-A-TGT-AT-T--CCCATG--C--------TGATTAACAT-G-TGATA---TTGGAAATTAAATAT--TGTATTTTTAATTCTACAA
gi|155966 : CAAATATAGTTCTACTC---TCCAA--TGGTTTCAAACCAGAATTAATCATAGAATATT----ACCCAC---------TAAAAAATACTA-ATATA-----CA--ATA-AAAG-CTATT-C---CT---A---GTCC--CTT-----ATG--T-C-CGTAC--TGTGATCA-----GGAA---GAAA--C----AATAACCACTTAT--TC-TGGACATGTCAAACAACCCAGTCCTTTTTA--CA-AAA-----G----A-----TA--C--AGT--C-CTG----GC--TAAG-AAG-AAATAATGTCATA--A---TAC-CCT-TTA---T-AAAAAAAATATTT-ATTT------TCAATA------TAGGA---G-----A-TAA-AT-TCACAGATG--A--------AGAATTATTC-A-TTATC---TTAGATATTTAATTT--TATATATT---CTC
gi|155967 : TGGTTTTAAACCAGAATAAATCAGAGGATTCT----ACCA-T---------GAAAAAATATCT-ACATA-----CA--TTA-AAAA-TAATA-G---GC---A---GTCC--TCT-----ATG--T-A-CTTCC--TGCAACCA-----GGAA---GAGA--CC-ACCATC--CATATGT--TT-TAGACATGTC-AGCAACACAAACCTTTCTT---A-ATA-----A----A-----CTCAA--AACTTA-GTTCTCTGCT-TTAA-ATG-TAA-AATGCC-------------CAT-TTAA--T-ATAAAATGTTTTT--TAT------TTAATACCAGTGTAGAA---AA--C-AACAT--T-T--CACAAG--C--------AGAATTCAAA-A-TTATT---CTTGAACTAAAATAT--TACATATT---TTCTACAAGACGACCG--AATGGAACACT-A-TCAACAGTTGCTTTTAA-AAACAGACT-T-AAG-T---TTA-CA-C-TT--T--TATCA----CT----C--AAAG-AAA---T---AGCAATAAA-----A---AACGGAAAAAAATAT-AC-----TTTTAAAGCACAGTGGCATAAA
gi|155968 : TGGTTCCAAATACGAATTAATCACAGGATTCT----CCCAAC---------AAGAAAATTTTT-ATATA-----TG--ATA-AATA-TTGTT-G---AT---A---GTCC--TAT-----TTG--T-A-AATAT--TGTCAAAT-----GGAA---GAAA--CC-TTGACA--CACATGT--TG-TGGTCATGTCCTGCTACACAATCA-CTATT--AA-AGG-----A----AC----TT--A--AAC--T-TTG----GCTATCCA-TC--AAA-CATTTCAAA--T---TAA-CAC-TGA---T-AGAAGAATCATTT-ATAT------TCAATA------CAGGA---AA--T-A-AAT-TG-T--CCAACA--C--------AGAACT-TCATA-TAATA---CTTGAAACTAAATAT--TACATATT---CTATACTAAACGGAATC-AAAGTT-CATTAA-GCT-TAGACACACTCAAGAAAC--GTT-T-GGA-A---ATA------TC--A--TATGAGATCCT----T--AAAT-GCATATT---TGT----AA-----A---AA---ATAATAACAT-AAACTTATTTGAAAATA-AATGG
gi|155969 : TGGTTCCAACACAGAATTA-TCATAGAATTGG----AACAAC---------AAAGAAATGTTT-AAAAA-----AA--ACT-ATTA-AAACT-G---GCCCAA---GCTC--ATT-----GTG--T-T-CTTAT--TGTAATCA-----AAAC---GAAAG-C----AGTA--TTCATTTACTC-TGGACATGTCCTTCAACAAGGTCGTTTCTT--CA-AAAAAAAAT----A-----C---A--AGC--A--TG----GTT-T----ATA-AAG-AACATAATT--ACTTTAC-CAT-TTA---T-AGTAGAATTATTC-ATAT------GTTATA------CAGGA---AAAGA-A-TAT-AT-----AATGG--C--------A-ACATGTGT-A-TTATCGTATTAGAAATGAAATAC--TATACATA---ATCAGCTAAA--A-----AAT-CTACATT-A-TCTAT
gi|155970 : TGGTTCCAATTTAGAATTAATCACAGAATTCTTGGAACAAACTCATTGCTTAAAAAAATG--------A-----AG--ATT-AA-A-GAATCAG---AT---GTATGTTC--CTT------------------T--TGTCAAAA-----AGAAACCGAAA--CTATTAA-A--CATATAT--TTATTGAC-TGCATAGTAACGCAACAATTTTTT--CA-AAG-----T----T-----TT--A--AAA--A-TTA----TCT---GA-ATG-AAA-AGTG-CAAT--A---CAA-TAA-ATA---C-AGA
gi|155971 : TAGTTCCAAATACGAATTGATCACAGGATTTT----CCTAAC---------AAGAATTTTTTTTATATA-----TG--ATA-AACA-TTGTT-G---AT---A---GTCC--GAT-----TTG--T-A-AATAT--TGTCAAAT-----GGAA---AAAA--CA-TTGACA--TACATGT--TG-TGGTCATGTCCTGCTACACAA-TAGCTGTT--AA-AGG-----A----AC----TT--A--AAC--T-TTG----GCTATCCA---T-AAA-CATTTCAAA--T---TAA-CAC-TGA---T-TGAAGAATAATTT-ATAT------TCAATA------TAGGA---AA--TAA-ATT-AT-C--C-AACA--C--------AGAACTCCAT-A-TGATC---CATGAAACTGAATACAGCATATATT---CTATACTAAACGGAAT--AAAAGTTCATTAA-GCT-TAG--ACACTCAATAAAC-GACTGG-AAA-A---AT--CA-TATG--A--GATC-----CT----T--AAAT-GCATATT---TGT-AAAAA-----A---AA---ATAAC-ATA--ACT-TTATTTGAAAATA-AATGG
gi|155972 : TGGTGTCAAACCAGAATAAATTACAGGATTCT----ACCA-T---------GTAAAAATATCT-ACATACTCGTAC--ATT-AAAAATAACT-G---AC---A---GTCC--TCT-----ATG--TAC-ATC-C--TGCAACCA-----GGAA---AAGA--CC-CACGTC--AACATGT--TT-TGGACATGTCCAGCCACACAAACATTTCTT---A-ATA-----A----A-----CT--C--AGA--ACCTG----GTT-CTCT-GCC-ATA-AATGTAAATTGA---AAA-GGT-T--------GAA-AGGT-TTT-ATATCCAATACCAATA------TAGAAAATAA--C-A-TGT--C-C--CAAAC---C---------GAATTCCAA-A-ATTTT---CTTGAAATAAAACAC--AACATATT---TTCTGCAAGACGACTG--AATGGAACACT-A-TCATCAGTTGCTTTTAA-GAAGAGACT-G-AAA-T---ATA-CACT-TC--TAGTATCT----CGCCGAG--AAATAGCA---A---TA----AAA-----ACGGAA---AT-ATGATAC--------TTTTAAAGCACAGTGGCACAA
gi|155973 : TGGTTTCAAAACAGAATAAATCACAGGATTCT----ACCATG---------TAAAAAATATCT-ACATA-----CATTATTAAAAA-TAACT-G---AC---A---GTCC--ACT-----ATG--
gi|155974 : TTCCAATTTAGAATTAATCACAGAATTCT----TGGAAC---------AAACTCATTGCT-TAAAA-----AA--ATG-AAGA-T--TT-A---AG---A---ATCCGATGT-----ATGTTC-C-TT--T--TGTCAAAG-----AGAAACCGAAA--CTATTAA-A--CATATAT--TTATTGAC-TGCATAGTAACGCAACAATTTTTT--CA-AAG-----T----T-----TT--A--AAA--A-TTA----TCT---GA-ATG-AAA-AGTG-CAAT--A---CAG-TAA-ATA---C-AGAtacatccgagtaggccaac
gi|155975 : AATTCT----ACTAA-------------AAATTACCA-TCA-A-----AA--GTT-AAAA-TAAGG-G---TC---A---ATTTG-CTTTTTGGATGGCC-T-ATTATCCTGCAACCA-----AGAA---GAGA--CC-CTCGTC--CACATGT--TT-TGGACATATCCAGCAACACAAATATTTCTT---A-ATA-----A----AC----TT--A--AAA--C-CTG----GTT-TCTCTGCC-ATA-AATGTAAAT------TGCTCATGTTA---TGAGAAAGATT--TT-ATAT------TCAATACCAATATAGAA---AG--T-A--AT-ATGT--CACAAA--C--------AGAATTCCAA-C-TTATT---ATCGAAATAAAACAC--TACATAGT---TTCTATAAGACGACTG--AATGGAACACT-A-TCCACAGTTTCTTTTAA-AAATAGACT-G-AAATAATTATA-CA-C-T---T--TATCA----CTCAC-G--AGAT---A---T---AG---CAAT-----A---AA---AAAGGAAAAT-TTA-TACTTTTAAAGGACAGTGGCACAAA
gi|155976 : ---GCCT--CTT-----ATT--T-A-AATAT--TGTCAAAT-----AGAA---GAAA--CC-TTGACA--CGCATGT--TG-TGATGATGTCCTGCTACACAA-----TCGC--CA-TGA-----A----AGGAACTT--A--GAC--T-TTG----GCTATCCA--CA-AAA-CATTTCAAA--T---TAA-CAC-TGA---T-AGAAAAATCATTT-ATAA------TCAATA------CAGGA---AA--T-A-AATTAT-C--CAA-CA--C--------AGAACT-TCATA-TAATA---CTTGAAACTAAATAT--TACATATT---CTATACTAAACGGAATC-AAAGTT-CATT-AAGCT-TAGACACACTCAAGAAAC---GT-CTGGA-A---ATATCA-T--A--T--TATGAGATCCT----T--AAAT-GCA---TATTTGT----AA-----A---AA---ATAATAACATAACT-TTATTTGAAAATA-AATG
gi|155977 : CA-----GGAA---GAGAGCCT-C-AAC---CACACGT--TT-TGGACATGTCCAGCAACACAAACATTTCTTAATA-AGC-----TCAGAA-----TT--T--GGT--A-CTCT---GTT-ATAA-ATGCAAA-AAAACTCAT------------T-TTA---T--GAAAAAATATTTTATAT------TTAATACCAATGTAGAA---AA--C-A--AC-ATGT--CA--CGAAC--------AGAATTCCAA-A-TGATT---TTTTAAATAAAATAT--TACATATT---TTCTACAAGACGACCG--AATGGAACACT-A-TCCACAGTTGCTTTTAA-AAATAGACT-A-AAA-T---ATA-CA-C-TT--T--TATCA----CTCAAAG--AAATAGCA---A---TGA-TTAAAAACGGA---AA---AAAATGATAC--------TTTTAAAACAAAGTGGCACAAA
Alignments
lowQualScore : 111111 1111111111111111 1111111111 1111111 222222 11111 11111111111 1111111 1111 11111 11111111
lowQualScore : 5 0 777 66 1 1 2 4444 888888888 2 55555 33 44 4 222 44444 444 333 55 55555 000000 11 33 0 55555 777 55 777 4444 0 22 4 0 0 66 444 2 7777777777777777 22 22 77777 6666 1111111111 2 0 1111111 33 2 666 4 1 0 2 777777 111111 666 7777 888 2 8888 5555 99999999 1 11 3 33 55555 1 33 444 1 11111 1 3 5 2 8 3 9 1 44 1 77777 3 3 3 2 44 6666 55555555555 3 6 1111111 8888 11111 555 555 55555555 9 1 5 44 99 6 6 1
lowQualScore : . . ... .. . . . .... ......... . ..... .. .. . ... ..... ... ... .. ..... ...... .. .. . ..... ... .. ... .... . .. . . . .. ... . ................ .. .. ..... .... .......... . . ....... .. . ... . . . . ...... ...... ... .... ... . .... .... ........ . .. . .. ..... . .. ... . ..... . . . . . . . . .. . ..... . . . . .. .... ........... . . ....... .... ..... ... ... ........ . . . .. .. . . .
lowQualScore : 0 1 888 11 0 9 2 7777 999999999 4 99999 22 66 5 999 55555 111 999 33 66666 222222 88 11 7 66666 888 33 444 9999 4 99 2 5 6 99 333 1 7777777777777777 99 99 77777 6666 3333333333 1 8 6666666 44 2 111 4 0 2 5 222222 666666 999 1111 111 5 4444 9999 11111111 0 11 2 55 66666 0 44 444 0 66666 2 4 7 9 2 4 2 0 11 0 33333 1 1 1 1 22 5555 99999999999 1 2 2222222 9999 99999 444 444 00000000 2 0 7 22 22 7 7 4
consensus : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATCAGAATTAACCACAGAATTCT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-G---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATTAT--TGCCAACA-----AGAA---GAAA--CT-CTAATA--CACATGT--TT-TGGACATGTCCAGCAACGCAACNATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-NTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAANTATTT-ATAT------TTAATA------TAGGA---AA--C-A-TNT-AT-T--CAAACG--CA--------GANCTNCANATN-ATC---NTNGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACNAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGACT-NANA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----NA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-NCA-TTATTTTGAAACACAATGGNATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTCAAACATACAGAAA
Reference ( family-802 ) : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATCAGAATTAACCACAGAATTCT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-G---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATTAT--TGCCAACA-----AGAA---GAAA--CT-CTAATA--CACATGT--TT-TGGACATGTCCAGCAACGCAACNATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-NTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAANTATTT-ATAT------TTAATA------TAGGA---AA--C-A-TNT-AT-T--CAAACG--CA--------GANCTNTAAATN-ATC---NTNGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACNAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGANT-NANA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----NA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-NCA-TTATTTTGAAACACAATGGNATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTCAAACATACAGAAA
gi|155958 : AAA-ACAAATATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GCCC--CTT-----ATG--C-C-ATGAT--TGCCAACA-----AGAG---GAAA--CT-CTAATA--CACATGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTGGG---AA--C-A-TCT-AT-T--CAAATG--CA--------GACCTGTTAGTA-ATC---ATAGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACGAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGCTGCATTTAA-AAACAGAAT-CACA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----AA-AAT-CTA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTTAAACATACAGAAA
gi|155959 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATGAGAATTAACCATAGAAATTT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATGAT--TGTCAACA-----AGAG---GAAA--AT-CTAATA--CATATGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ATG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTGGG---AA--C-A-TCT-AT-T--CAAATG--CA--------GACCTGTTAGTA-ATC---ATAGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACGAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGCTGCATTTAA-AAACAGAAT-CACA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----AA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AACACTTTTCAAACATACAGAAA
gi|155960 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATCTT----ACCGAC---------AAAAAAACATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATAAT--TGTCAATACGGTAAGAG---GAAA--CT-CTAATA--CATATGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--GGC--A-GTG----GCT-TCAA-ACA-AAA-AATATCAAC--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTTGG---AA--C-A-TCT-AT-T--CAAAGG--CA--------GACCTTTCAGTT-ATC---ATAGAAATTAAATAT--TATATCTT---TTCTACAAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGAAT-CACA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----AA-AAT-GCA---T---TGC-CCAGA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTGTTAAAACATACAGAAA
gi|155961 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAG------------AATT---------AAC-----------------------CATA-----GA--ATT---------TT-A---CC---A---GCCC--CGT-----ATG--C-C-ATGAT--AGCCAACA-----AGAG---GAAG--CT-CTAATA--CATACGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACTATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTGGG---AA--C-A-TTT-AT-T--CAAATG--CA--------GACCTGTAAGTA-ATC---ATAGAAATTAAACAT--TATATATT---TTCTACGAAACGTCAT--AATGCTTCATT-A-TCTGTTGCTGCATTTAA-AAACAGAAT-CACA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----AA-AAT-GCA---T---TGC-CCCAA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATAC----------TCCTCCAATC--AATATTG-T-AATACTATTTAAACATACAGAAA
gi|155962 : AAT-ACAAGTATAGTTCAATTT---T--AAGCTGGCTTCAAACCAAAATTAACCATAGAATCTT----ACCACC---------AAAAA--CATCT-ACATA-----AA--CTC-AAGA-TTAGT-A---AC---A---GACC--CCT-----ATG--T-C-ATGAT--TGCCGACA-----AGAA---GAAA--CT-TTAG-A--AA-ATGA--TT-TGGACATGTACAGCAACAAAACATTTTCTT--CA--GC-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----ACT-TCAA-AC-------ATATCAAC--A---TAA-CAT-TGA---TTAGAAGAACTATTA-ATGT------TTAATA------CAGGG---AA--C-A-ATC-AT-T--CAAAGA--CATTCAAAAAAATCCTTATGTTTATC---CAAGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACAAAGCGACTT--ATTGCTATATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGAAT-AGCA-A---ATA-CA-T-TGT--TAA----TG----CA----AA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGCTAT-TCA-TCATTTTGAAACA-ACTTATATAAATACAACAACGTATTCCTCCAACC--AATATTA-T-AATACTATTCAAACATACAGAGA
gi|155963 : AAA-ACAACTATAATTCAATTT---T--AAGTAAGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAAAAA-ATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GCCC--CTT-----ATG--C-G-ATGAT--TGCCAACA-----AGAG---GAAA--CT-CTAATA--CATATGC--TT-TGGGCATGTACAGCAACATAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ATG-AAA-ACTA
gi|155964 : AAATATAACTATAGCTCAATTT---T--ACAATGGTTTCAAGTCAGGATCAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAGAAATAT
gi|155964 : TAT--TC-TGGACATGTCCTTCAACAAGATCATTTCTT--CA-AAA-----A----A-----AT--ACAAAC--A--TG----GTT-TATA-AGG-AAC-AGTATAACT--T---TAC-CAT-TTA---T-AGAAGAATTATTT-ATAT------TTAATA------TAGGAG--AA--CAA-TAT-AT-----AATGG--CT--------GATATGCAGATC-ATG---TTAGAGATTAAATAC--TATATATT---CTCAGCCAAA--AAATTGACTTCTCCATT-A-TCTATAACTGCACTTCA-CAACAGACT-TAA--------A-CA-T-TCC--TTTAGGGCA----AA----CA-AAT-ATA---T---AGC----AGTT---A---AA---ATAATACCAT-AAA-AACTTTTGAAAAAAAATGGAATACATTCAA-AACT--TTACTTCAAGATTAAT-TTGATAAATACTtagaggaaagcattatttatttattctggacatgtccttcaacaagatcatttcttcaaaaaaatacaaacatggtttataaggaacagtataactttaccatttatagaagaattatttatatttaatataggagaacaatatataatggctgatatgcagatcatgttagagattaaatactatatattctcagccaaaaaattgacttctccattatctataactgcacttcacaacagacttaaacattcctttagggcaaacaaatatatagcagttaaaataataccataaaaacttttgaaaaaaaatggaatacattcaaaactttacttcaagattaatttgataaatact
gi|155965 : aaatataactatagctcaattttacaatggtttcaagtcaggatcaaccatagaattttaccaacaaagaaatattagaggaaagcattatttatt-ACAATTATAG---AACTTACTT--CAGT-GGTTTTAAATTACACTGAACCAGAGATTGTT----ACCAAC---------AAGAAAATATAT-ATTTA-----AC--AT--AAAA--AGCT-GCAGAT---A---GTCT--ATT-----GTG--C-TTATT-T--TGCAATCA-----AATT---GAGA--CT-ATTTCG--CAAATAC--TT-TGGTCATGCCCAGAAACGCAAATATTAATT--CAGAAA-----T----G-----TC--G--A----A-TTG----GAT-TAAA-TCT-AAG-AATA--AAG--A---T-----T-TCAAACT-AAAAGATGTCTTC-ATTT------TTACTA------TTGGA---GA--A-A-TGT-AT-T--CCCATG--CT--------GATTAACATGTG-ATA---TTGGAAATTAAATAT--TGTATTTTTAATTCTACAA
gi|155966 : CAAATATAGTTCTACTC---TCCAA--TGGTTTCAAACCAGAATTAATCATAGAATATT----ACCCAC---------TAAAAAATACTA-ATATA-----CA--ATA-AAAG-CTATT-C---CT---A---GTCC--CTT-----ATG--T-C-CGTAC--TGTGATCA-----GGAA---GAAA--C----AATAACCACTTAT--TC-TGGACATGTCAAACAACCCAGTCCTTTTTA--CA-AAA-----G----A-----TA--C--AGT--C-CTG----GC--TAAG-AAG-AAATAATGTCATA--A---TAC-CCT-TTA---T-AAAAAAAATATTT-ATTT------TCAATA------TAGGA---G-----A-TAA-AT-TCACAGATG--AA--------GAATTATTCATT-ATC---TTAGATATTTAATTT--TATATATT---CTC
gi|155967 : TGGTTTTAAACCAGAATAAATCAGAGGATTCT----ACCA-T---------GAAAAAATATCT-ACATA-----CA--TTA-AAAA-TAATA-G---GC---A---GTCC--TCT-----ATG--T-A-CTTCC--TGCAACCA-----GGAA---GAGA--CC-ACCATC--CATATGT--TT-TAGACATGTC-AGCAACACAAACCTTTCTT---A-ATA-----A----A-----CTCAA--AACTTA-GTTCTCTGCT-TTAA-ATG-TAA-AATGCC-------------CAT-TTAA--T-ATAAAATGTTTTT--TAT------TTAATACCAGTGTAGAA---AA--C-AACAT--T-T--CACAAG--CA--------GAATTCAAAATT-ATT---CTTGAACTAAAATAT--TACATATT---TTCTACAAGACGACCG--AATGGAACACT-A-TCAACAGTTGCTTTTAA-AAACAGACT-TAAG-T---TTA-CA-C-TTT--TAT----CA----CT----CA-AAG-AAA---T---AGCAATAAA-----A---AACGGAAAAAAATAT-AC-----TTTTAAAGCACAGTGGCATAAA
gi|155968 : TGGTTCCAAATACGAATTAATCACAGGATTCT----CCCAAC---------AAGAAAATTTTT-ATATA-----TG--ATA-AATA-TTGTT-G---AT---A---GTCC--TAT-----TTG--T-A-AATAT--TGTCAAAT-----GGAA---GAAA--CC-TTGACA--CACATGT--TG-TGGTCATGTCCTGCTACACAATCA-CTATT--AA-AGG-----A----AC----TT--A--AAC--T-TTG----GCTATCCA-TC--AAA-CATTTCAAA--T---TAA-CAC-TGA---T-AGAAGAATCATTT-ATAT------TCAATA------CAGGA---AA--T-A-AAT-TG-T--CCAACA--CA--------GAACTTCATATA-ATA---CTTGAAACTAAATAT--TACATATT---CTATACTAAACGGAATC-AAAGTT-CATTAA-GCT-TAGACACACTCAAGAAAC--GTT-TGGA-A---ATA------TCA--TAT----GAGATCCT----TA-AAT-GCATATT---TGT----AA-----A---AA---ATAATAACAT-AAACTTATTTGAAAATA-AATGG
gi|155969 : TGGTTCCAACACAGAATTA-TCATAGAATTGG----AACAAC---------AAAGAAATGTTT-AAAAA-----AA--ACT-ATTA-AAACT-G---GCCCAA---GCTC--ATT-----GTG--T-T-CTTAT--TGTAATCA-----AAAC---GAAAG-C----AGTA--TTCATTTACTC-TGGACATGTCCTTCAACAAGGTCGTTTCTT--CA-AAAAAAAAT----A-----C---A--AGC--A--TG----GTT-T----ATA-AAG-AACATAATT--ACTTTAC-CAT-TTA---T-AGTAGAATTATTC-ATAT------GTTATA------CAGGA---AAAGA-A-TAT-AT-----AATGG--CA---------ACATGTGTATT-ATCGTATTAGAAATGAAATAC--TATACATA---ATCAGCTAAA--A-----AAT-CTACATT-A-TCTAT
gi|155970 : TGGTTCCAATTTAGAATTAATCACAGAATTCTTGGAACAAACTCATTGCTTAAAAAAATG--------A-----AG--ATT-AA-A-GAATCAG---AT---GTATGTTC--CTT------------------T--TGTCAAAA-----AGAAACCGAAA--CTATTAA-A--CATATAT--TTATTGAC-TGCATAGTAACGCAACAATTTTTT--CA-AAG-----T----T-----TT--A--AAA--A-TTA----TCT---GA-ATG-AAA-AGTG-CAAT--A---CAA-TAA-ATA---C-AGA
gi|155971 : TAGTTCCAAATACGAATTGATCACAGGATTTT----CCTAAC---------AAGAATTTTTTTTATATA-----TG--ATA-AACA-TTGTT-G---AT---A---GTCC--GAT-----TTG--T-A-AATAT--TGTCAAAT-----GGAA---AAAA--CA-TTGACA--TACATGT--TG-TGGTCATGTCCTGCTACACAA-TAGCTGTT--AA-AGG-----A----AC----TT--A--AAC--T-TTG----GCTATCCA---T-AAA-CATTTCAAA--T---TAA-CAC-TGA---T-TGAAGAATAATTT-ATAT------TCAATA------TAGGA---AA--TAA-ATT-AT-C--C-AACA--CA--------GAACTCCATATG-ATC---CATGAAACTGAATACAGCATATATT---CTATACTAAACGGAAT--AAAAGTTCATTAA-GCT-TAG--ACACTCAATAAAC-GACTGGAAA-A---AT--CA-TATGA--GAT----C-----CT----TA-AAT-GCATATT---TGT-AAAAA-----A---AA---ATAAC-ATA--ACT-TTATTTGAAAATA-AATGG
gi|155972 : TGGTGTCAAACCAGAATAAATTACAGGATTCT----ACCA-T---------GTAAAAATATCT-ACATACTCGTAC--ATT-AAAAATAACT-G---AC---A---GTCC--TCT-----ATG--TAC-ATC-C--TGCAACCA-----GGAA---AAGA--CC-CACGTC--AACATGT--TT-TGGACATGTCCAGCCACACAAACATTTCTT---A-ATA-----A----A-----CT--C--AGA--ACCTG----GTT-CTCT-GCC-ATA-AATGTAAATTGA---AAA-GGT-T--------GAA-AGGT-TTT-ATATCCAATACCAATA------TAGAAAATAA--C-A-TGT--C-C--CAAAC---C---------GAATTCCAAAAT-TTT---CTTGAAATAAAACAC--AACATATT---TTCTGCAAGACGACTG--AATGGAACACT-A-TCATCAGTTGCTTTTAA-GAAGAGACT-GAAA-T---ATA-CACT-TCTAGTAT----CT----CGCCGAGA-AATAGCA---A---TA----AAA-----ACGGAA---AT-ATGATAC--------TTTTAAAGCACAGTGGCACAA
gi|155973 : TGGTTTCAAAACAGAATAAATCACAGGATTCT----ACCATG---------TAAAAAATATCT-ACATA-----CATTATTAAAAA-TAACT-G---AC---A---GTCC--ACT-----ATG--
gi|155974 : TTCCAATTTAGAATTAATCACAGAATTCT----TGGAAC---------AAACTCATTGCT-TAAAA-----AA--ATG-AAGA-T--TT-A---AG---A---ATCCGATGT-----ATG--T-T-CCTTT--TGTCAAAG-----AGAAACCGAAA--CTATTAA-A--CATATAT--TTATTGAC-TGCATAGTAACGCAACAATTTTTT--CA-AAG-----T----T-----TT--A--AAA--A-TTA----TCT---GA-ATG-AAA-AGTG-CAAT--A---CAG-TAA-ATA---C-AGAtacatccgagtaggccaac
gi|155975 : AATTCT----ACTAA-------------AAATTACCA-TCA-A-----AA--GTT-AAAA-TAAGG-G---TC---A---ATTTG-CTTTTTGGATGGCC-T-ATTATCCTGCAACCA-----AGAA---GAGA--CC-CTCGTC--CACATGT--TT-TGGACATATCCAGCAACACAAATATTTCTT---A-ATA-----A----AC----TT--A--AAA--C-CTG----GTT-TCTCTGCC-ATA-AATGTAAAT------TGCTCATGTTA---TGAGAAAGATT--TT-ATAT------TCAATACCAATATAGAA---AG--T-A--AT-ATGT--CACAAA--CA--------GAATTCCAACTT-ATT---ATCGAAATAAAACAC--TACATAGT---TTCTATAAGACGACTG--AATGGAACACT-A-TCCACAGTTTCTTTTAA-AAATAGACT-GAAATAATTATA-CA-C-T-T--TAT----CA----CT----CACGAG-ATA---T---AG---CAAT-----A---AA---AAAGGAAAAT-TTA-TACTTTTAAAGGACAGTGGCACAAA
gi|155976 : ---GCCT--CTT-----ATT--T-A-AATAT--TGTCAAAT-----AGAA---GAAA--CC-TTGACA--CGCATGT--TG-TGATGATGTCCTGCTACACAA-----TCGC--CA-TGA-----A----AGGAACTT--A--GAC--T-TTG----GCTATCCA--CA-AAA-CATTTCAAA--T---TAA-CAC-TGA---T-AGAAAAATCATTT-ATAA------TCAATA------CAGGA---AA--T-A-AATTAT-C--CAA-CA--CA--------GAACTTCATATA-ATA---CTTGAAACTAAATAT--TACATATT---CTATACTAAACGGAATC-AAAGTT-CATT-AAGCT-TAGACACACTCAAGAAACG--TC-TGGA-A---ATATCA-T--AT--TAT----GAGATCCT----TA-AAT-GCA---TATTTGT----AA-----A---AA---ATAATAACATAACT-TTATTTGAAAATA-AATG
gi|155977 : -ATTAT---GTAACCA-----GGAA---GAGAGCCT-C-AAC---CACACGT--TT-TGGACATGTCCAGCAACACAAACATTTCTTAATA-AGC-----TCAGAA-----TT--T--GGT--A-CTCT---GTT-ATAA-ATGCAAA-AAAACTCAT------------T-TTA---T--GAAAAAATATTTTATAT------TTAATACCAATGTAGAA---AA--C-A--AC-ATGT--CA--CGAACA--------GAATTCCAAATG-ATT---TTTTAAATAAAATAT--TACATATT---TTCTACAAGACGACCG--AATGGAACACT-A-TCCACAGTTGCTTTTAA-AAATAGACT-AAAA-T---ATA-CA-C-TTT--TAT----CA----CTCAAAGA-AATAGCA---A---TGA-TTAAAAACGGA---AA---AAAATGATAC--------TTTTAAAACAAAGTGGCACAAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 111111 1111111111111111 1111111111 1111111 222222 11111 11111111111 1111111 1111 11111 11111111
lowQualScore : 5 0 777 66 1 1 2 4444 1111111111 2 55555 33 44 4 222 44444 444 333 55 55555 000000 11 33 0 55555 777 55 777 4444 22 4 0 0 66 444 2 7777777777777777 22 22 77777 6666 1111111111 2 0 1111111 33 2 888 2 1 0 2 777777 111111 666 7777 888 2 8888 5555 99999999 1 1 1 2 1 55555 1 33 444 1 11111 1 3 5 2 8 3 9 2 0 44 1 77777 3 3 3 2 44 6666 55555555555 3 6 1111111 8888 11111 555 555 55555555 9 1 5 44 99 6 6 1
lowQualScore : . . ... .. . . . .... .......... . ..... .. .. . ... ..... ... ... .. ..... ...... .. .. . ..... ... .. ... .... .. . . . .. ... . ................ .. .. ..... .... .......... . . ....... .. . ... . . . . ...... ...... ... .... ... . .... .... ........ . . . . . ..... . .. ... . ..... . . . . . . . . . .. . ..... . . . . .. .... ........... . . ....... .... ..... ... ... ........ . . . .. .. . . .
lowQualScore : 0 1 888 11 0 9 2 7777 2222222222 4 99999 22 66 5 999 55555 111 999 33 66666 222222 88 11 7 66666 888 33 444 9999 99 2 5 6 99 333 1 7777777777777777 99 99 77777 6666 3333333333 1 8 6666666 44 2 333 2 0 2 5 222222 666666 999 1111 111 5 4444 9999 11111111 0 0 0 5 0 66666 0 44 444 0 66666 2 4 7 9 2 4 2 3 8 11 0 33333 1 1 1 1 22 5555 99999999999 1 2 2222222 9999 99999 444 444 00000000 2 0 7 22 22 7 7 4
consensus : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATCAGAATTAACCACAGAATTCT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-G---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATTAT--TGCCAACA-----AGAA---GAAA--CT-CTAATA--CACATGT--TT-TGGACATGTCCAGCAACGCAACNATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-NTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAANTATTT-ATAT------TTAATA------TAGGA---AA--C-A-TNT-AT-T--CAAACG--C--------AGANCTNCANA-TNATC---NTNGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACNAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGACT-NANA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----NA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-NCA-TTATTTTGAAACACAATGGNATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTCAAACATACAGAAA
Reference ( family-802 ) : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATCAGAATTAACCACAGAATTCT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-G---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATTAT--TGCCAACA-----AGAA---GAAA--CT-CTAATA--CACATGT--TT-TGGACATGTCCAGCAACGCAACNATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-NTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAANTATTT-ATAT------TTAATA------TAGGA---AA--C-A-TNT-AT-T--CAAACG--C--------AGANCTNCANA-TNATC---NTNGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACNAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGACT-NANA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----NA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-NCA-TTATTTTGAAACACAATGGNATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTCAAACATACAGAAA
gi|155958 : AAA-ACAAATATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GCCC--CTT-----ATG--C-C-ATGAT--TGCCAACA-----AGAG---GAAA--CT-CTAATA--CACATGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTGGG---AA--C-A-TCT-AT-T--CAAATG--C--------AGACCTGTTAG-TAATC---ATAGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACGAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGCTGCATTTAA-AAACAGAAT-CACA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----AA-AAT-CTA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTTAAACATACAGAAA
gi|155959 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATGAGAATTAACCATAGAAATTT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATGAT--TGTCAACA-----AGAG---GAAA--AT-CTAATA--CATATGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ATG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTGGG---AA--C-A-TCT-AT-T--CAAATG--C--------AGACCTGTTAG-TAATC---ATAGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACGAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGCTGCATTTAA-AAACAGAAT-CACA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----AA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AACACTTTTCAAACATACAGAAA
gi|155960 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATCTT----ACCGAC---------AAAAAAACATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATAAT--TGTCAATACGGTAAGAG---GAAA--CT-CTAATA--CATATGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--GGC--A-GTG----GCT-TCAA-ACA-AAA-AATATCAAC--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTTGG---AA--C-A-TCT-AT-T--CAAAGG--C--------AGACCTTTCAG-TTATC---ATAGAAATTAAATAT--TATATCTT---TTCTACAAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGAAT-CACA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----AA-AAT-GCA---T---TGC-CCAGA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTGTTAAAACATACAGAAA
gi|155961 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAG------------AATT---------AAC-----------------------CATA-----GA--ATT---------TT-A---CC---A---GCCC--CGT-----ATG--C-C-ATGAT--AGCCAACA-----AGAG---GAAG--CT-CTAATA--CATACGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACTATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTGGG---AA--C-A-TTT-AT-T--CAAATG--C--------AGACCTGTAAG-TAATC---ATAGAAATTAAACAT--TATATATT---TTCTACGAAACGTCAT--AATGCTTCATT-A-TCTGTTGCTGCATTTAA-AAACAGAAT-CACA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----AA-AAT-GCA---T---TGC-CCCAA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATAC----------TCCTCCAATC--AATATTG-T-AATACTATTTAAACATACAGAAA
gi|155962 : AAT-ACAAGTATAGTTCAATTT---T--AAGCTGGCTTCAAACCAAAATTAACCATAGAATCTT----ACCACC-----------AAAAACATCT-ACATA-----AA--CTC-AAGA-TTAGT-A---AC---A---GACC--CCT-----ATG--T-C-ATGAT--TGCCGACA-----AGAA---GAAA--CT-TTAG-A---AAATGA--TT-TGGACATGTACAGCAACAAAACATTTTCTT--C--AGC-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----ACT-TCAA-AC-------ATATCAAC--A---TAA-CAT-TGAT--T-AGAAGAACTATTA-ATGT------TTAATA------CAGGG---AA--C-A-ATC-AT-T--CAAAGA--CATTCAAAAAAATCCTTATGTTTATC---CAAGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACAAAGCGACTT--ATTGCTATATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGAAT-AGCA-A---ATA-CA-T-TGT--TAA----TG----CA----AA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGCTAT-TCA-TCATTTTGAAACA-ACTTATATAAATACAACAACGTATTCCTCCAACC--AATATTA-T-AATACTATTCAAACATACAGAGA
gi|155963 : AAA-ACAACTATAATTCAATTT---T--AAGTAAGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAAAAA-ATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GCCC--CTT-----ATG--C-G-ATGAT--TGCCAACA-----AGAG---GAAA--CT-CTAATA--CATATGC--TT-TGGGCATGTACAGCAACATAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ATG-AAA-ACTA
gi|155964 : AAATATAACTATAGCTCAATTT---T--ACAATGGTTTCAAGTCAGGATCAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAGAAATAT
gi|155964 : TAT--TC-TGGACATGTCCTTCAACAAGATCATTTCTT--CA-AAA-----A----A-----AT--ACAAAC--A--TG----GTT-TATA-AGG-AAC-AGTATAACT--T---TAC-CAT-TTA---T-AGAAGAATTATTT-ATAT------TTAATA------TAGGAG--AA--CAA-TAT-AT-----AATGG--C--------TGATATGCAGA-TCATG---TTAGAGATTAAATAC--TATATATT---CTCAGCCAAA--AAATTGACTTCTCCATT-A-TCTATAACTGCACTTCA-CAACAGACT-TAA--------A-CA-T-TCC--TTTAGGGCA----AA----CA-AAT-ATA---T---AGC----AGTT---A---AA---ATAATACCAT-AAA-AACTTTTGAAAAAAAATGGAATACATTCAA-AACT--TTACTTCAAGATTAAT-TTGATAAATACTtagaggaaagcattatttatttattctggacatgtccttcaacaagatcatttcttcaaaaaaatacaaacatggtttataaggaacagtataactttaccatttatagaagaattatttatatttaatataggagaacaatatataatggctgatatgcagatcatgttagagattaaatactatatattctcagccaaaaaattgacttctccattatctataactgcacttcacaacagacttaaacattcctttagggcaaacaaatatatagcagttaaaataataccataaaaacttttgaaaaaaaatggaatacattcaaaactttacttcaagattaatttgataaatact
gi|155965 : aaatataactatagctcaattttacaatggtttcaagtcaggatcaaccatagaattttaccaacaaagaaatattagaggaaagcattatttatt-ACAATTATAG---AACTTACTT--CAGT-GGTTTTAAATTACACTGAACCAGAGATTGTT----ACCAAC---------AAGAAAATATAT-ATTTA-----AC--AT--AAAA--AGCT-GCAGAT---A---GTCT--ATT-----GTG--C-TTATT-T--TGCAATCA-----AATT---GAGA--CT-ATTTCG--CAAATAC--TT-TGGTCATGCCCAGAAACGCAAATATTAATT--CAGAAA-----T----G-----TC--G--A----A-TTG----GAT-TAAA-TCT-AAG-AATA--AAG--A---T-----T-TCAAACT-AAAAGATGTCTTC-ATTT------TTACTA------TTGGA---GA--A-A-TGT-AT-T--CCCATG--C--------TGATTAACATG-TGATA---TTGGAAATTAAATAT--TGTATTTTTAATTCTACAA
gi|155966 : CAAATATAGTTCTACTC---TCCAA--TGGTTTCAAACCAGAATTAATCATAGAATATT----ACCCAC---------TAAAAAATACTA-ATATA-----CA--ATA-AAAG-CTATT-C---CT---A---GTCC--CTT-----ATG--T-C-CGTAC--TGTGATCA-----GGAA---GAAA--C----AATAACCACTTAT--TC-TGGACATGTCAAACAACCCAGTCCTTTTTA--CA-AAA-----G----A-----TA--C--AGT--C-CTG----GC--TAAG-AAG-AAATAATGTCATA--A---TAC-CCT-TTA---T-AAAAAAAATATTT-ATTT------TCAATA------TAGGA---G-----A-TAA-AT-TCACAGATG--A--------AGAATTATTCA-TTATC---TTAGATATTTAATTT--TATATATT---CTC
gi|155967 : TGGTTTTAAACCAGAATAAATCAGAGGATTCT----ACCA-T---------GAAAAAATATCT-ACATA-----CA--TTA-AAAA-TAATA-G---GC---A---GTCC--TCT-----ATG--T-A-CTTCC--TGCAACCA-----GGAA---GAGA--CC-ACCATC--CATATGT--TT-TAGACATGTC-AGCAACACAAACCTTTCTT---A-ATA-----A----A-----CTCAA--AACTTA-GTTCTCTGCT-TTAA-ATG-TAA-AATGCC-------------CAT-TTAA--T-ATAAAATGTTTTT--TAT------TTAATACCAGTGTAGAA---AA--C-AACAT--T-T--CACAAG--C--------AGAATTCAAAA-TTATT---CTTGAACTAAAATAT--TACATATT---TTCTACAAGACGACCG--AATGGAACACT-A-TCAACAGTTGCTTTTAA-AAACAGACT-TAAG-T---TTA-CA-C-TTT--TAT----CA----CT----CA-AAG-AAA---T---AGCAATAAA-----A---AACGGAAAAAAATAT-AC-----TTTTAAAGCACAGTGGCATAAA
gi|155968 : TGGTTCCAAATACGAATTAATCACAGGATTCT----CCCAAC---------AAGAAAATTTTT-ATATA-----TG--ATA-AATA-TTGTT-G---AT---A---GTCC--TAT-----TTG--T-A-AATAT--TGTCAAAT-----GGAA---GAAA--CC-TTGACA--CACATGT--TG-TGGTCATGTCCTGCTACACAATCA-CTATT--AA-AGG-----A----AC----TT--A--AAC--T-TTG----GCTATCCA-TC--AAA-CATTTCAAA--T---TAA-CAC-TGA---T-AGAAGAATCATTT-ATAT------TCAATA------CAGGA---AA--T-A-AAT-TG-T--CCAACA--C--------AGAACTTCATA-TAATA---CTTGAAACTAAATAT--TACATATT---CTATACTAAACGGAATC-AAAGTT-CATTAA-GCT-TAGACACACTCAAGAAAC--GTT-TGGA-A---ATA------TCA--TAT----GAGATCCT----TA-AAT-GCATATT---TGT----AA-----A---AA---ATAATAACAT-AAACTTATTTGAAAATA-AATGG
gi|155969 : TGGTTCCAACACAGAATTA-TCATAGAATTGG----AACAAC---------AAAGAAATGTTT-AAAAA-----AA--ACT-ATTA-AAACT-G---GCCCAA---GCTC--ATT-----GTG--T-T-CTTAT--TGTAATCA-----AAAC---GAAAG-C----AGTA--TTCATTTACTC-TGGACATGTCCTTCAACAAGGTCGTTTCTT--CA-AAAAAAAAT----A-----C---A--AGC--A--TG----GTT-T----ATA-AAG-AACATAATT--ACTTTAC-CAT-TTA---T-AGTAGAATTATTC-ATAT------GTTATA------CAGGA---AAAGA-A-TAT-AT-----AATGG--C--------A-ACATGTGTA-TTATCGTATTAGAAATGAAATAC--TATACATA---ATCAGCTAAA--A-----AAT-CTACATT-A-TCTAT
gi|155970 : TGGTTCCAATTTAGAATTAATCACAGAATTCTTGGAACAAACTCATTGCTTAAAAAAATG--------A-----AG--ATT-AA-A-GAATCAG---AT---GTATGTTC--CTT------------------T--TGTCAAAA-----AGAAACCGAAA--CTATTAA-A--CATATAT--TTATTGAC-TGCATAGTAACGCAACAATTTTTT--CA-AAG-----T----T-----TT--A--AAA--A-TTA----TCT---GA-ATG-AAA-AGTG-CAAT--A---CAA-TAA-ATA---C-AGA
gi|155971 : TAGTTCCAAATACGAATTGATCACAGGATTTT----CCTAAC---------AAGAATTTTTTTTATATA-----TG--ATA-AACA-TTGTT-G---AT---A---GTCC--GAT-----TTG--T-A-AATAT--TGTCAAAT-----GGAA---AAAA--CA-TTGACA--TACATGT--TG-TGGTCATGTCCTGCTACACAA-TAGCTGTT--AA-AGG-----A----AC----TT--A--AAC--T-TTG----GCTATCCA---T-AAA-CATTTCAAA--T---TAA-CAC-TGA---T-TGAAGAATAATTT-ATAT------TCAATA------TAGGA---AA--TAA-ATT-AT-C--C-AACA--C--------AGAACTCCATA-TGATC---CATGAAACTGAATACAGCATATATT---CTATACTAAACGGAAT--AAAAGTTCATTAA-GCT-TAG--ACACTCAATAAAC-GACTGGAAA-A---AT--CA-TATGA--GAT----C-----CT----TA-AAT-GCATATT---TGT-AAAAA-----A---AA---ATAAC-ATA--ACT-TTATTTGAAAATA-AATGG
gi|155972 : TGGTGTCAAACCAGAATAAATTACAGGATTCT----ACCA-T---------GTAAAAATATCT-ACATACTCGTAC--ATT-AAAAATAACT-G---AC---A---GTCC--TCT-----ATG--TAC-ATC-C--TGCAACCA-----GGAA---AAGA--CC-CACGTC--AACATGT--TT-TGGACATGTCCAGCCACACAAACATTTCTT---A-ATA-----A----A-----CT--C--AGA--ACCTG----GTT-CTCT-GCC-ATA-AATGTAAATTGA---AAA-GGT-T--------GAA-AGGT-TTT-ATATCCAATACCAATA------TAGAAAATAA--C-A-TGT--C-C--CAAAC---C---------GAATTCCAAA-ATTTT---CTTGAAATAAAACAC--AACATATT---TTCTGCAAGACGACTG--AATGGAACACT-A-TCATCAGTTGCTTTTAA-GAAGAGACT-GAAA-T---ATA-CACT-TCTAGTAT----CT----CGCCGAGA-AATAGCA---A---TA----AAA-----ACGGAA---AT-ATGATAC--------TTTTAAAGCACAGTGGCACAA
gi|155973 : TGGTTTCAAAACAGAATAAATCACAGGATTCT----ACCATG---------TAAAAAATATCT-ACATA-----CATTATTAAAAA-TAACT-G---AC---A---GTCC--ACT-----ATG--
gi|155974 : TTCCAATTTAGAATTAATCACAGAATTCT----TGGAAC---------AAACTCATTGCT-TAAAA-----AA--ATG-AAGA-T--TT-A---AG---A---ATCCGATGT-----ATG--T-T-CCTTT--TGTCAAAG-----AGAAACCGAAA--CTATTAA-A--CATATAT--TTATTGAC-TGCATAGTAACGCAACAATTTTTT--CA-AAG-----T----T-----TT--A--AAA--A-TTA----TCT---GA-ATG-AAA-AGTG-CAAT--A---CAG-TAA-ATA---C-AGAtacatccgagtaggccaac
gi|155975 : AATTCT----ACTAA-------------AAATTACCA-TCA-A-----AA--GTT-AAAA-TAAGG-G---TC---A---ATTTG-CTTTTTGGATGGCC-T-ATTATCCTGCAACCA-----AGAA---GAGA--CC-CTCGTC--CACATGT--TT-TGGACATATCCAGCAACACAAATATTTCTT---A-ATA-----A----AC----TT--A--AAA--C-CTG----GTT-TCTCTGCC-ATA-AATGTAAAT------TGCTCATGTTA---TGAGAAAGATT--TT-ATAT------TCAATACCAATATAGAA---AG--T-A--AT-ATGT--CACAAA--C--------AGAATTCCAAC-TTATT---ATCGAAATAAAACAC--TACATAGT---TTCTATAAGACGACTG--AATGGAACACT-A-TCCACAGTTTCTTTTAA-AAATAGACT-GAAATAATTATA-CA-C-T-T--TAT----CA----CT----CACGAG-ATA---T---AG---CAAT-----A---AA---AAAGGAAAAT-TTA-TACTTTTAAAGGACAGTGGCACAAA
gi|155976 : ---GCCT--CTT-----ATT--T-A-AATAT--TGTCAAAT-----AGAA---GAAA--CC-TTGACA--CGCATGT--TG-TGATGATGTCCTGCTACACAA-----TCGC--CA-TGA-----A----AGGAACTT--A--GAC--T-TTG----GCTATCCA--CA-AAA-CATTTCAAA--T---TAA-CAC-TGA---T-AGAAAAATCATTT-ATAA------TCAATA------CAGGA---AA--T-A-AATTAT-C--CAA-CA--C--------AGAACTTCATA-TAATA---CTTGAAACTAAATAT--TACATATT---CTATACTAAACGGAATC-AAAGTT-CATT-AAGCT-TAGACACACTCAAGAAAC-GTCT-G-GA-A---ATATCA-T--AT--TAT----GAGATCCT----TA-AAT-GCA---TATTTGT----AA-----A---AA---ATAATAACATAACT-TTATTTGAAAATA-AATG
gi|155977 : -ATTAT---GTAACCA-----GGAA---GAGAGCCT-C-AAC---CACACGT--TT-TGGACATGTCCAGCAACACAAACATTTCTTAATA-AGC-----TCAGAA-----TT--T--GGT--A-CTCT---GTT-ATAA-ATGCAAA-AAAACTCAT------------T-TTA---T--GAAAAAATATTTTATAT------TTAATACCAATGTAGAA---AA--C-A--AC-ATGT--CA--CGAAC--------AGAATTCCAAA-TGATT---TTTTAAATAAAATAT--TACATATT---TTCTACAAGACGACCG--AATGGAACACT-A-TCCACAGTTGCTTTTAA-AAATAGACT-AAAA-T---ATA-CA-C-TTT--TAT----CA----CTCAAAGA-AATAGCA---A---TGA-TTAAAAACGGA---AA---AAAATGATAC--------TTTTAAAACAAAGTGGCACAAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 111111 1111111111111111 1111111111 1111111 222222 11111 11111111111 1111111 1111 11111 11111111
lowQualScore : 5 0 777 66 1 1 2 4444 1111111111 2 55555 33 44 4 222 44444 444 333 55 55555 000000 11 33 0 55555 777 55 777 4444 22 4 0 0 66 444 2 7777777777777777 22 22 77777 6666 1111111111 2 0 1111111 33 2 888 2 1 0 2 777777 111111 666 7777 888 2 8888 5555 99999999 1 1 1 2 1 55555 1 33 444 1 11111 1 3 5 2 8 3 9 2 0 44 1 77777 3 3 3 2 44 6666 55555555555 3 6 1111111 8888 11111 555 555 55555555 9 1 5 44 99 6 6 1
lowQualScore : . . ... .. . . . .... .......... . ..... .. .. . ... ..... ... ... .. ..... ...... .. .. . ..... ... .. ... .... .. . . . .. ... . ................ .. .. ..... .... .......... . . ....... .. . ... . . . . ...... ...... ... .... ... . .... .... ........ . . . . . ..... . .. ... . ..... . . . . . . . . . .. . ..... . . . . .. .... ........... . . ....... .... ..... ... ... ........ . . . .. .. . . .
lowQualScore : 0 1 888 11 0 9 2 7777 2222222222 4 99999 22 66 5 999 55555 111 999 33 66666 222222 88 11 7 66666 888 33 444 9999 99 2 5 6 99 333 1 7777777777777777 99 99 77777 6666 3333333333 1 8 6666666 44 2 333 2 0 2 5 222222 666666 999 1111 111 5 4444 9999 11111111 0 0 0 5 0 66666 0 44 444 0 66666 2 4 7 9 2 4 2 3 8 11 0 33333 1 1 1 1 22 5555 99999999999 1 2 2222222 9999 99999 444 444 00000000 2 0 7 22 22 7 7 4
consensus : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATCAGAATTAACCACAGAATTCT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-G---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATTAT--TGCCAACA-----AGAA---GAAA--CT-CTAATA--CACATGT--TT-TGGACATGTCCAGCAACGCAACNATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-NTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAANTATTT-ATAT------TTAATA------TAGGA---AA--C-A-TNT-AT-T--CAAACG--C--------AGANCTNCANA-TNATC---NTNGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACNAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGACT-NANA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----NA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-NCA-TTATTTTGAAACACAATGGNATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTCAAACATACAGAAA
Reference ( family-802 ) : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATCAGAATTAACCACAGAATTCT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-G---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATTAT--TGCCAACA-----AGAA---GAAA--CT-CTAATA--CACATGT--TT-TGGACATGTCCAGCAACGCAACNATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-NTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAANTATTT-ATAT------TTAATA------TAGGA---AA--C-A-TNT-AT-T--CAAACG--C--------AGANCTNCANA-TNATC---NTNGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACNAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGACT-NANA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----NA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-NCA-TTATTTTGAAACACAATGGNATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTCAAACATACAGAAA
gi|155958 : AAA-ACAAATATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GCCC--CTT-----ATG--C-C-ATGAT--TGCCAACA-----AGAG---GAAA--CT-CTAATA--CACATGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTGGG---AA--C-A-TCT-AT-T--CAAATG--C--------AGACCTGTTAG-TAATC---ATAGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACGAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGCTGCATTTAA-AAACAGAAT-CACA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----AA-AAT-CTA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTTAAACATACAGAAA
gi|155959 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATGAGAATTAACCATAGAAATTT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATGAT--TGTCAACA-----AGAG---GAAA--AT-CTAATA--CATATGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ATG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTGGG---AA--C-A-TCT-AT-T--CAAATG--C--------AGACCTGTTAG-TAATC---ATAGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACGAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGCTGCATTTAA-AAACAGAAT-CACA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----AA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AACACTTTTCAAACATACAGAAA
gi|155960 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATCTT----ACCGAC---------AAAAAAACATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATAAT--TGTCAATACGGTAAGAG---GAAA--CT-CTAATA--CATATGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--GGC--A-GTG----GCT-TCAA-ACA-AAA-AATATCAAC--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTTGG---AA--C-A-TCT-AT-T--CAAAGG--C--------AGACCTTTCAG-TTATC---ATAGAAATTAAATAT--TATATCTT---TTCTACAAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGAAT-CACA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----AA-AAT-GCA---T---TGC-CCAGA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTGTTAAAACATACAGAAA
gi|155961 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAG------------AATT---------AAC-----------------------CATA-----GA--ATT---------TT-A---CC---A---GCCC--CGT-----ATG--C-C-ATGAT--AGCCAACA-----AGAG---GAAG--CT-CTAATA--CATACGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACTATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTGGG---AA--C-A-TTT-AT-T--CAAATG--C--------AGACCTGTAAG-TAATC---ATAGAAATTAAACAT--TATATATT---TTCTACGAAACGTCAT--AATGCTTCATT-A-TCTGTTGCTGCATTTAA-AAACAGAAT-CACA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----AA-AAT-GCA---T---TGC-CCCAA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATAC----------TCCTCCAATC--AATATTG-T-AATACTATTTAAACATACAGAAA
gi|155962 : AAT-ACAAGTATAGTTCAATTT---T--AAGCTGGCTTCAAACCAAAATTAACCATAGAATCTT----ACCACC-----------AAAAACATCT-ACATA-----AA--CTC-AAGA-TTAGT-A---AC---A---GACC--CCT-----ATG--T-C-ATGAT--TGCCGACA-----AGAA---GAAA--CT-TTAG-A---AAATGA--TT-TGGACATGTACAGCAACAAAACATTTTCTT--C--AGC-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----ACT-TCAA-AC-------ATATCAAC--A---TAA-CAT-TGAT--T-AGAAGAACTATTA-ATGT------TTAATA------CAGGG---AA--C-A-ATC-AT-T--CAAAGA--CATTCAAAAAAATCCTTATGTTTATC---CAAGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACAAAGCGACTT--ATTGCTATATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGAAT-AGCA-A---ATA-CA-T-TGT--TAA----TG----CA----AA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGCTAT-TCA-TCATTTTGAAACA-ACTTATATAAATACAACAACGTATTCCTCCAACC--AATATTA-T-AATACTATTCAAACATACAGAGA
gi|155963 : AAA-ACAACTATAATTCAATTT---T--AAGTAAGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAAAAA-ATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GCCC--CTT-----ATG--C-G-ATGAT--TGCCAACA-----AGAG---GAAA--CT-CTAATA--CATATGC--TT-TGGGCATGTACAGCAACATAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ATG-AAA-ACTA
gi|155964 : AAATATAACTATAGCTCAATTT---T--ACAATGGTTTCAAGTCAGGATCAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAGAAATAT
gi|155964 : TAT--TC-TGGACATGTCCTTCAACAAGATCATTTCTT--CA-AAA-----A----A-----AT--ACAAAC--A--TG----GTT-TATA-AGG-AAC-AGTATAACT--T---TAC-CAT-TTA---T-AGAAGAATTATTT-ATAT------TTAATA------TAGGAG--AA--CAA-TAT-AT-----AATGG--C--------TGATATGCAGA-TCATG---TTAGAGATTAAATAC--TATATATT---CTCAGCCAAA--AAATTGACTTCTCCATT-A-TCTATAACTGCACTTCA-CAACAGACT-TAA--------A-CA-T-TCC--TTTAGGGCA----AA----CA-AAT-ATA---T---AGC----AGTT---A---AA---ATAATACCAT-AAA-AACTTTTGAAAAAAAATGGAATACATTCAA-AACT--TTACTTCAAGATTAAT-TTGATAAATACTtagaggaaagcattatttatttattctggacatgtccttcaacaagatcatttcttcaaaaaaatacaaacatggtttataaggaacagtataactttaccatttatagaagaattatttatatttaatataggagaacaatatataatggctgatatgcagatcatgttagagattaaatactatatattctcagccaaaaaattgacttctccattatctataactgcacttcacaacagacttaaacattcctttagggcaaacaaatatatagcagttaaaataataccataaaaacttttgaaaaaaaatggaatacattcaaaactttacttcaagattaatttgataaatact
gi|155965 : aaatataactatagctcaattttacaatggtttcaagtcaggatcaaccatagaattttaccaacaaagaaatattagaggaaagcattatttatt-ACAATTATAG---AACTTACTT--CAGT-GGTTTTAAATTACACTGAACCAGAGATTGTT----ACCAAC---------AAGAAAATATAT-ATTTA-----AC--AT--AAAA--AGCT-GCAGAT---A---GTCT--ATT-----GTG--C-TTATT-T--TGCAATCA-----AATT---GAGA--CT-ATTTCG--CAAATAC--TT-TGGTCATGCCCAGAAACGCAAATATTAATT--CAGAAA-----T----G-----TC--G--A----A-TTG----GAT-TAAA-TCT-AAG-AATA--AAG--A---T-----T-TCAAACT-AAAAGATGTCTTC-ATTT------TTACTA------TTGGA---GA--A-A-TGT-AT-T--CCCATG--C--------TGATTAACATG-TGATA---TTGGAAATTAAATAT--TGTATTTTTAATTCTACAA
gi|155966 : CAAATATAGTTCTACTC---TCCAA--TGGTTTCAAACCAGAATTAATCATAGAATATT----ACCCAC---------TAAAAAATACTA-ATATA-----CA--ATA-AAAG-CTATT-C---CT---A---GTCC--CTT-----ATG--T-C-CGTAC--TGTGATCA-----GGAA---GAAA--C----AATAACCACTTAT--TC-TGGACATGTCAAACAACCCAGTCCTTTTTA--CA-AAA-----G----A-----TA--C--AGT--C-CTG----GC--TAAG-AAG-AAATAATGTCATA--A---TAC-CCT-TTA---T-AAAAAAAATATTT-ATTT------TCAATA------TAGGA---G-----A-TAA-AT-TCACAGATG--A--------AGAATTATTCA-TTATC---TTAGATATTTAATTT--TATATATT---CTC
gi|155967 : TGGTTTTAAACCAGAATAAATCAGAGGATTCT----ACCA-T---------GAAAAAATATCT-ACATA-----CA--TTA-AAAA-TAATA-G---GC---A---GTCC--TCT-----ATG--T-A-CTTCC--TGCAACCA-----GGAA---GAGA--CC-ACCATC--CATATGT--TT-TAGACATGTC-AGCAACACAAACCTTTCTT---A-ATA-----A----A-----CTCAA--AACTTA-GTTCTCTGCT-TTAA-ATG-TAA-AATGCC-------------CAT-TTAA--T-ATAAAATGTTTTT--TAT------TTAATACCAGTGTAGAA---AA--C-AACAT--T-T--CACAAG--C--------AGAATTCAAAA-TTATT---CTTGAACTAAAATAT--TACATATT---TTCTACAAGACGACCG--AATGGAACACT-A-TCAACAGTTGCTTTTAA-AAACAGACT-TAAG-T---TTA-CA-C-TTT--TAT----CA----CT----CA-AAG-AAA---T---AGCAATAAA-----A---AACGGAAAAAAATAT-AC-----TTTTAAAGCACAGTGGCATAAA
gi|155968 : TGGTTCCAAATACGAATTAATCACAGGATTCT----CCCAAC---------AAGAAAATTTTT-ATATA-----TG--ATA-AATA-TTGTT-G---AT---A---GTCC--TAT-----TTG--T-A-AATAT--TGTCAAAT-----GGAA---GAAA--CC-TTGACA--CACATGT--TG-TGGTCATGTCCTGCTACACAATCA-CTATT--AA-AGG-----A----AC----TT--A--AAC--T-TTG----GCTATCCA-TC--AAA-CATTTCAAA--T---TAA-CAC-TGA---T-AGAAGAATCATTT-ATAT------TCAATA------CAGGA---AA--T-A-AAT-TG-T--CCAACA--C--------AGAACTTCATA-TAATA---CTTGAAACTAAATAT--TACATATT---CTATACTAAACGGAATC-AAAGTT-CATTAA-GCT-TAGACACACTCAAGAAAC--GTT-TGGA-A---ATA------TCA--TAT----GAGATCCT----TA-AAT-GCATATT---TGT----AA-----A---AA---ATAATAACAT-AAACTTATTTGAAAATA-AATGG
gi|155969 : TGGTTCCAACACAGAATTA-TCATAGAATTGG----AACAAC---------AAAGAAATGTTT-AAAAA-----AA--ACT-ATTA-AAACT-G---GCCCAA---GCTC--ATT-----GTG--T-T-CTTAT--TGTAATCA-----AAAC---GAAAG-C----AGTA--TTCATTTACTC-TGGACATGTCCTTCAACAAGGTCGTTTCTT--CA-AAAAAAAAT----A-----C---A--AGC--A--TG----GTT-T----ATA-AAG-AACATAATT--ACTTTAC-CAT-TTA---T-AGTAGAATTATTC-ATAT------GTTATA------CAGGA---AAAGA-A-TAT-AT-----AATGG--C--------A-ACATGTGTA-TTATCGTATTAGAAATGAAATAC--TATACATA---ATCAGCTAAA--A-----AAT-CTACATT-A-TCTAT
gi|155970 : TGGTTCCAATTTAGAATTAATCACAGAATTCTTGGAACAAACTCATTGCTTAAAAAAATG--------A-----AG--ATT-AA-A-GAATCAG---AT---GTATGTTC--CTT------------------T--TGTCAAAA-----AGAAACCGAAA--CTATTAA-A--CATATAT--TTATTGAC-TGCATAGTAACGCAACAATTTTTT--CA-AAG-----T----T-----TT--A--AAA--A-TTA----TCT---GA-ATG-AAA-AGTG-CAAT--A---CAA-TAA-ATA---C-AGA
gi|155971 : TAGTTCCAAATACGAATTGATCACAGGATTTT----CCTAAC---------AAGAATTTTTTTTATATA-----TG--ATA-AACA-TTGTT-G---AT---A---GTCC--GAT-----TTG--T-A-AATAT--TGTCAAAT-----GGAA---AAAA--CA-TTGACA--TACATGT--TG-TGGTCATGTCCTGCTACACAA-TAGCTGTT--AA-AGG-----A----AC----TT--A--AAC--T-TTG----GCTATCCA---T-AAA-CATTTCAAA--T---TAA-CAC-TGA---T-TGAAGAATAATTT-ATAT------TCAATA------TAGGA---AA--TAA-ATT-AT-C--C-AACA--C--------AGAACTCCATA-TGATC---CATGAAACTGAATACAGCATATATT---CTATACTAAACGGAAT--AAAAGTTCATTAA-GCT-TAG--ACACTCAATAAAC-GACTGGAAA-A---AT--CA-TATGA--GAT----C-----CT----TA-AAT-GCATATT---TGT-AAAAA-----A---AA---ATAAC-ATA--ACT-TTATTTGAAAATA-AATGG
gi|155972 : TGGTGTCAAACCAGAATAAATTACAGGATTCT----ACCA-T---------GTAAAAATATCT-ACATACTCGTAC--ATT-AAAAATAACT-G---AC---A---GTCC--TCT-----ATG--TAC-ATC-C--TGCAACCA-----GGAA---AAGA--CC-CACGTC--AACATGT--TT-TGGACATGTCCAGCCACACAAACATTTCTT---A-ATA-----A----A-----CT--C--AGA--ACCTG----GTT-CTCT-GCC-ATA-AATGTAAATTGA---AAA-GGT-T--------GAA-AGGT-TTT-ATATCCAATACCAATA------TAGAAAATAA--C-A-TGT--C-C--CAAAC---C---------GAATTCCAAA-ATTTT---CTTGAAATAAAACAC--AACATATT---TTCTGCAAGACGACTG--AATGGAACACT-A-TCATCAGTTGCTTTTAA-GAAGAGACT-GAAA-T---ATA-CACT-TCTAGTAT----CT----CGCCGAGA-AATAGCA---A---TA----AAA-----ACGGAA---AT-ATGATAC--------TTTTAAAGCACAGTGGCACAA
gi|155973 : TGGTTTCAAAACAGAATAAATCACAGGATTCT----ACCATG---------TAAAAAATATCT-ACATA-----CATTATTAAAAA-TAACT-G---AC---A---GTCC--ACT-----ATG--
gi|155974 : TTCCAATTTAGAATTAATCACAGAATTCT----TGGAAC---------AAACTCATTGCT-TAAAA-----AA--ATG-AAGA-T--TT-A---AG---A---ATCCGATGT-----ATG--T-T-CCTTT--TGTCAAAG-----AGAAACCGAAA--CTATTAA-A--CATATAT--TTATTGAC-TGCATAGTAACGCAACAATTTTTT--CA-AAG-----T----T-----TT--A--AAA--A-TTA----TCT---GA-ATG-AAA-AGTG-CAAT--A---CAG-TAA-ATA---C-AGAtacatccgagtaggccaac
gi|155975 : AATTCT----ACTAA-------------AAATTACCA-TCA-A-----AA--GTT-AAAA-TAAGG-G---TC---A---ATTTG-CTTTTTGGATGGCC-T-ATTATCCTGCAACCA-----AGAA---GAGA--CC-CTCGTC--CACATGT--TT-TGGACATATCCAGCAACACAAATATTTCTT---A-ATA-----A----AC----TT--A--AAA--C-CTG----GTT-TCTCTGCC-ATA-AATGTAAAT------TGCTCATGTTA---TGAGAAAGATT--TT-ATAT------TCAATACCAATATAGAA---AG--T-A--AT-ATGT--CACAAA--C--------AGAATTCCAAC-TTATT---ATCGAAATAAAACAC--TACATAGT---TTCTATAAGACGACTG--AATGGAACACT-A-TCCACAGTTTCTTTTAA-AAATAGACT-GAAATAATTATA-CA-C-T-T--TAT----CA----CT----CACGAG-ATA---T---AG---CAAT-----A---AA---AAAGGAAAAT-TTA-TACTTTTAAAGGACAGTGGCACAAA
gi|155976 : ---GCCT--CTT-----ATT--T-A-AATAT--TGTCAAAT-----AGAA---GAAA--CC-TTGACA--CGCATGT--TG-TGATGATGTCCTGCTACACAA-----TCGC--CA-TGA-----A----AGGAACTT--A--GAC--T-TTG----GCTATCCA--CA-AAA-CATTTCAAA--T---TAA-CAC-TGA---T-AGAAAAATCATTT-ATAA------TCAATA------CAGGA---AA--T-A-AATTAT-C--CAA-CA--C--------AGAACTTCATA-TAATA---CTTGAAACTAAATAT--TACATATT---CTATACTAAACGGAATC-AAAGTT-CATT-AAGCT-TAGACACACTCAAGAAAC-GTCT-G-GA-A---ATATCA-T--AT--TAT----GAGATCCT----TA-AAT-GCA---TATTTGT----AA-----A---AA---ATAATAACATAACT-TTATTTGAAAATA-AATG
gi|155977 : -ATTAT---GTAACCA-----GGAA---GAGAGCCT-C-AAC---CACACGT--TT-TGGACATGTCCAGCAACACAAACATTTCTTAATA-AGC-----TCAGAA-----TT--T--GGT--A-CTCT---GTT-ATAA-ATGCAAA-AAAACTCAT------------T-TTA---T--GAAAAAATATTTTATAT------TTAATACCAATGTAGAA---AA--C-A--AC-ATGT--CA--CGAAC--------AGAATTCCAAA-TGATT---TTTTAAATAAAATAT--TACATATT---TTCTACAAGACGACCG--AATGGAACACT-A-TCCACAGTTGCTTTTAA-AAATAGACT-AAAA-T---ATA-CA-C-TTT--TAT----CA----CTCAAAGA-AATAGCA---A---TGA-TTAAAAACGGA---AA---AAAATGATAC--------TTTTAAAACAAAGTGGCACAAA
blockSeqs : T ACT CC G T T TGGA TCATTGCTTA T CTCGT TT TA G ATA GCAG CCA TAT GA TTTGG GCCT GA CC CGGTA ACC GC TAT TAAC AC A CA AAT G AAAAATA CA CA TTAG CTCT TCTCTGCC T TACTT CT G AAC G C T CCAATA CCAGTG AAT AGA ACA T TCA CGAA ATTCAAAA C G A T A CGTAT A AG TAA G AATTG C A A A G C G A GG C TAATT T C A C AG AGGG GATCCTT C A TATT CAAT AACGG CGG CGG AAACTTA C A T CT TT A A C
blockSeqs : . . . T T T . A . . . T G TA AG . . G . CTT AA . . ACC G TAT TA . A CA C . AAGGAAC . . ACC T ATAAATGC . TTGA A . T . C . . CCAATA G CA TC . GT TG . C T A . T CA A . . A AATC C A A . G T T A C C A . . . C . . CGCCGAG . A TATT CCC TT . . AACTTTA C A T CT . . . A
blockSeqs : . . . T T T . A . . . T G TA A . . . . TAC GA . . . . TC TA . . CT C . TCAGAA . . AG . TCAAATG . TA A . A . C . . CCAATG . TA TC . GT GG . C G A . A CA A . . G AATC C T . . G C G A C C A . . . C . . GATCCTT . . TATT CCC . . . TCATTA C A C GT . . . T
blockSeqs : . . . C T T . A . . . T G TT A . . . . CC GA . . . . TC TA . . CA C . AAC . . AG . TCAAACA . CA A . . . C . . . . C TT . T TG . T T T . T CA A . . A CAT C A . . G T . A C C A . . . G . . CTCAAAG . . T CCC . . . TCATTA A T . T . . . C
blockSeqs : . . . T T T . A . . . C A TA A . . . . CC GA . . . . TC TA . . CA C . AAC . . AG . TCAAACG . TA A . . . T . . . . C AT . T GA . T G G . C CC A . . C CAT C C . . A C . A A A A . . . C . . CTA . . T CCC . . . TCATTA C A . . . . .
blockSeqs : . . . C G T . A . . . T A CT A . . . . CC TA . . . . TT CG . . TC C . AAC . . AG . TCAAATG . CA C . . . G . . . . C TA . T GG . T A T . G GT G . . A CAT G A . . A T . A T A T . . . T . . CTA . . T TAA . . . TCATCA C C
blockSeqs : . . . T T T . T . . . A A TA A . . . . TC TC . . . . TC TC . . AT C . TA . . AG . TATAAGG . TT C . . . A . . . . C TG . T TG . A A C . T AT A . . A CTT T A . . A A . A T G A . . . C . . CTA . . T ATT . . . AAAAAC C C
blockSeqs : . . C G C . G . . . A T TT C . . . . CG TA . . . . TA CA . . TC C . TA . . AT . TAAATCT . GA A . . . G . . . . A TA . T TG . A C A . T CT T . . T CCG C T . . T T . A T A A . . . G . . CAA . . T C . . . ACTTTA A C
blockSeqs : C C C . A . . . A T AA G . . . . TC TA . . . . CA TA . . AC C . TA . . CC . TAAGAAG . AA C . . . T . . . . C AA . T AG . A T T . A TC T . . T AAT G A . . A T . A G A T . . . C . . AAC . . T T . . . TTATAC . C
blockSeqs : A T G . A . . . T C GA G . . . . TA TA . . . . CT CA . . TC A . TA . . TT . TTAAATG . AT A . . . T . . . . T TA . T CA . C G T . T AC A . . T CTG G A . . A A . . G A A . . . A . . CTC . . A C . . . AC .
blockSeqs : C C C . A . . . T A TT G . . . . TA TT . . . . AT TC . . TC C . TA . . AT . ATCCATC . TA A . . . T . . . . C AT . C GG . A C T . G CC T . . A CTG G A . . . T . . G G T . . . T . . CTT . . T T . . . . .
blockSeqs : T C T . G . . . A A TA G . . . . TT TA . . . . CC TC . . CA C . AA . . TT . CTCTGCC . AT A . . . G . . . . T TG . C CA . A C A . T TC T . . A CCG T . . . . . . . A A . . . . . . . CTC . . A . . . . . .
blockSeqs : A C C . T . . . T G TA G . . . . TA TA . . . . CC CA . . AC A . TG . . AT . ATCCACA . TA G . . . T . . . . T AA . C AA . A C A . T TA C . . T . G . . . .
blockSeqs : C C C . A . . . G A A G . . . . TT TA . . . . CT A . . CA C . GA . . CC . TCAAAC . AT A . . . T . . . . C A . . CA . A T T . A AC T . . A
blockSeqs : C C C . . . . . T . T A . . . . TA T . . . . TC A . . AT C . AA . . TT . ATCCAT . T . . . . A . . . . . A . . C . A C A . G TT T . .
blockSeqs : T . C . . . . . . . . G . . . . . C . . . . . A . . AC . . TT . . AC . GAATG . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . T . . AA . . A . GAATG . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TT . . A . TATA .
blockSeqCons :
originalCons : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATCAGAATTAACCACAGAATTCT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-G---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATTAT--TGCCAACA-----AGAA---GAAA--CT-CTAATA--CACATGT--TT-TGGACATGTCCAGCAACGCAACNATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-NTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAANTATTT-ATAT------TTAATA------TAGGA---AA--C-A-TNT-AT-T--CAAACG--C--------AGANCTNCANA-TNATC---NTNGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACNAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGACT-NANA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----NA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-NCA-TTATTTTGAAACACAATGGNATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTCAAACATACAGAAA
finalCons : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATCAGAATTAACCACAGAATTCT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-G---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATTAT--TGCCAACA-----AGAA---GAAA--CT-CTAATA--CACATGT--TT-TGGACATGTCCAGCAACGCAACNATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-NTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAANTATTT-ATAT------TTAATA------TAGGA---AA--C-A-TNT-AT-T--CAAACG--C--------AGANCTNCANA-TNATC---NTNGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACNAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGACT-NANA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----NA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-NCA-TTATTTTGAAACACAATGGNATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTCAAACATACAGAAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 111111 1111111111111111 1111111111 1111111 222222 11111 11111111111 1111111 1111 11111 11111111
lowQualScore : 5 0 777 66 1 1 2 4444 1111111111 2 55555 33 44 4 222 44444 444 333 55 55555 000000 11 33 0 55555 777 55 777 4444 22 4 0 0 66 444 2 7777777777777777 22 22 77777 6666 1111111111 2 0 1111111 33 2 888 2 1 0 2 777777 111111 666 7777 888 2 8888 5555 99999999 1 1 1 2 1 55555 1 33 444 1 11111 1 3 5 2 8 3 9 2 0 44 1 77777 3 3 3 2 44 6666 55555555555 3 6 1111111 8888 11111 555 555 55555555 9 1 5 44 99 6 6 1
lowQualScore : . . ... .. . . . .... .......... . ..... .. .. . ... ..... ... ... .. ..... ...... .. .. . ..... ... .. ... .... .. . . . .. ... . ................ .. .. ..... .... .......... . . ....... .. . ... . . . . ...... ...... ... .... ... . .... .... ........ . . . . . ..... . .. ... . ..... . . . . . . . . . .. . ..... . . . . .. .... ........... . . ....... .... ..... ... ... ........ . . . .. .. . . .
lowQualScore : 0 1 888 11 0 9 2 7777 2222222222 4 99999 22 66 5 999 55555 111 999 33 66666 222222 88 11 7 66666 888 33 444 9999 99 2 5 6 99 333 1 7777777777777777 99 99 77777 6666 3333333333 1 8 6666666 44 2 333 2 0 2 5 222222 666666 999 1111 111 5 4444 9999 11111111 0 0 0 5 0 66666 0 44 444 0 66666 2 4 7 9 2 4 2 3 8 11 0 33333 1 1 1 1 22 5555 99999999999 1 2 2222222 9999 99999 444 444 00000000 2 0 7 22 22 7 7 4
consensus : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATCAGAATTAACCACAGAATTCT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-G---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATTAT--TGCCAACA-----AGAA---GAAA--CT-CTAATA--CACATGT--TT-TGGACATGTCCAGCAACGCAACNATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-NTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAANTATTT-ATAT------TTAATA------TAGGA---AA--C-A-TNT-AT-T--CAAACG--C--------AGANCTNCANA-TNATC---NTNGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACNAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGACT-NANA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----NA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-NCA-TTATTTTGAAACACAATGGNATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTCAAACATACAGAAA
Reference ( family-802 ) : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATCAGAATTAACCACAGAATTCT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-G---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATTAT--TGCCAACA-----AGAA---GAAA--CT-CTAATA--CACATGT--TT-TGGACATGTCCAGCAACGCAACNATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-NTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAANTATTT-ATAT------TTAATA------TAGGA---AA--C-A-TNT-AT-T--CAAACG--C--------AGANCTNCANA-TNATC---NTNGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACNAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGACT-NANA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----NA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-NCA-TTATTTTGAAACACAATGGNATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTCAAACATACAGAAA
gi|155958 : AAA-ACAAATATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GCCC--CTT-----ATG--C-C-ATGAT--TGCCAACA-----AGAG---GAAA--CT-CTAATA--CACATGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTGGG---AA--C-A-TCT-AT-T--CAAATG--C--------AGACCTGTTAG-TAATC---ATAGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACGAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGCTGCATTTAA-AAACAGAAT-CACA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----AA-AAT-CTA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTATTTAAACATACAGAAA
gi|155959 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATGAGAATTAACCATAGAAATTT----ACCAAC---------AAAAAAATATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATGAT--TGTCAACA-----AGAG---GAAA--AT-CTAATA--CATATGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ATG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTGGG---AA--C-A-TCT-AT-T--CAAATG--C--------AGACCTGTTAG-TAATC---ATAGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACGAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGCTGCATTTAA-AAACAGAAT-CACA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----AA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AACACTTTTCAAACATACAGAAA
gi|155960 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATCTT----ACCGAC---------AAAAAAACATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GTCC--CTT-----ATG--C-C-ATAAT--TGTCAATACGGTAAGAG---GAAA--CT-CTAATA--CATATGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--GGC--A-GTG----GCT-TCAA-ACA-AAA-AATATCAAC--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTTGG---AA--C-A-TCT-AT-T--CAAAGG--C--------AGACCTTTCAG-TTATC---ATAGAAATTAAATAT--TATATCTT---TTCTACAAAACGACAT--AATGCTACATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGAAT-CACA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----AA-AAT-GCA---T---TGC-CCAGA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATACAATAACCTATTCCTCCAATA--AATATTG-T-AATACTGTTAAAACATACAGAAA
gi|155961 : AAA-ACAACTATAGTTCAATTT---T--AAGTTGGTTCCAAATTAG------------AATT---------AAC-----------------------CATA-----GA--ATT---------TT-A---CC---A---GCCC--CGT-----ATG--C-C-ATGAT--AGCCAACA-----AGAG---GAAG--CT-CTAATA--CATACGC--TT-TGGACATGTACAGCAACGCAACTATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ACG-AAA-AATATCAAT--A---TAA-CAT-TTA---T-AGAAGAACTATTT-ATAT------TTAATA------TTGGG---AA--C-A-TTT-AT-T--CAAATG--C--------AGACCTGTAAG-TAATC---ATAGAAATTAAACAT--TATATATT---TTCTACGAAACGTCAT--AATGCTTCATT-A-TCTGTTGCTGCATTTAA-AAACAGAAT-CACA-A---ATA-CA-T-TCT--TAT----CA----CT----AA-AAT-GCA---T---TGC-CCCAA-----A---AA---ATAATGATAT-TCA-TTATTTTGAAACACAATGGAATAAATAC----------TCCTCCAATC--AATATTG-T-AATACTATTTAAACATACAGAAA
gi|155962 : AAT-ACAAGTATAGTTCAATTT---T--AAGCTGGCTTCAAACCAAAATTAACCATAGAATCTT----ACCACC-----------AAAAACATCT-ACATA-----AA--CTC-AAGA-TTAGT-A---AC---A---GACC--CCT-----ATG--T-C-ATGAT--TGCCGACA-----AGAA---GAAA--CT-TTAG-A---AAATGA--TT-TGGACATGTACAGCAACAAAACATTTTCTT--C--AGC-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----ACT-TCAA-AC-------ATATCAAC--A---TAA-CAT-TGAT--T-AGAAGAACTATTA-ATGT------TTAATA------CAGGG---AA--C-A-ATC-AT-T--CAAAGA--CATTCAAAAAAATCCTTATGTTTATC---CAAGAAATTAAATAT--TATATATT---TTCTACAAAGCGACTT--ATTGCTATATT-A-TCTGTAGTTGCATTTAA-AAACAGAAT-AGCA-A---ATA-CA-T-TGT--TAA----TG----CA----AA-AAT-GCA---T---TGC-CCAAA-----A---AA---ATAATGCTAT-TCA-TCATTTTGAAACA-ACTTATATAAATACAACAACGTATTCCTCCAACC--AATATTA-T-AATACTATTCAAACATACAGAGA
gi|155963 : AAA-ACAACTATAATTCAATTT---T--AAGTAAGTTCCAAATTAGAATTAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAAAAA-ATCT-ACATA-----AA--ATT-AAGA-TAATT-A---AC---A---GCCC--CTT-----ATG--C-G-ATGAT--TGCCAACA-----AGAG---GAAA--CT-CTAATA--CATATGC--TT-TGGGCATGTACAGCAACATAACAATTTCTT--CA-AGA-----T----A-----TT--A--AGC--A-GTG----GCT-TCAA-ATG-AAA-ACTA
gi|155964 : AAATATAACTATAGCTCAATTT---T--ACAATGGTTTCAAGTCAGGATCAACCATAGAATTTT----ACCAAC---------AAAGAAATAT
gi|155964 : TAT--TC-TGGACATGTCCTTCAACAAGATCATTTCTT--CA-AAA-----A----A-----AT--ACAAAC--A--TG----GTT-TATA-AGG-AAC-AGTATAACT--T---TAC-CAT-TTA---T-AGAAGAATTATTT-ATAT------TTAATA------TAGGAG--AA--CAA-TAT-AT-----AATGG--C--------TGATATGCAGA-TCATG---TTAGAGATTAAATAC--TATATATT---CTCAGCCAAA--AAATTGACTTCTCCATT-A-TCTATAACTGCACTTCA-CAACAGACT-TAA--------A-CA-T-TCC--TTTAGGGCA----AA----CA-AAT-ATA---T---AGC----AGTT---A---AA---ATAATACCAT-AAA-AACTTTTGAAAAAAAATGGAATACATTCAA-AACT--TTACTTCAAGATTAAT-TTGATAAATACTtagaggaaagcattatttatttattctggacatgtccttcaacaagatcatttcttcaaaaaaatacaaacatggtttataaggaacagtataactttaccatttatagaagaattatttatatttaatataggagaacaatatataatggctgatatgcagatcatgttagagattaaatactatatattctcagccaaaaaattgacttctccattatctataactgcacttcacaacagacttaaacattcctttagggcaaacaaatatatagcagttaaaataataccataaaaacttttgaaaaaaaatggaatacattcaaaactttacttcaagattaatttgataaatact
gi|155965 : aaatataactatagctcaattttacaatggtttcaagtcaggatcaaccatagaattttaccaacaaagaaatattagaggaaagcattatttatt-ACAATTATAG---AACTTACTT--CAGT-GGTTTTAAATTACACTGAACCAGAGATTGTT----ACCAAC---------AAGAAAATATAT-ATTTA-----AC--AT--AAAA--AGCT-GCAGAT---A---GTCT--ATT-----GTG--C-TTATT-T--TGCAATCA-----AATT---GAGA--CT-ATTTCG--CAAATAC--TT-TGGTCATGCCCAGAAACGCAAATATTAATT--CAGAAA-----T----G-----TC--G--A----A-TTG----GAT-TAAA-TCT-AAG-AATA--AAG--A---T-----T-TCAAACT-AAAAGATGTCTTC-ATTT------TTACTA------TTGGA---GA--A-A-TGT-AT-T--CCCATG--C--------TGATTAACATG-TGATA---TTGGAAATTAAATAT--TGTATTTTTAATTCTACAA
gi|155966 : CAAATATAGTTCTACTC---TCCAA--TGGTTTCAAACCAGAATTAATCATAGAATATT----ACCCAC---------TAAAAAATACTA-ATATA-----CA--ATA-AAAG-CTATT-C---CT---A---GTCC--CTT-----ATG--T-C-CGTAC--TGTGATCA-----GGAA---GAAA--C----AATAACCACTTAT--TC-TGGACATGTCAAACAACCCAGTCCTTTTTA--CA-AAA-----G----A-----TA--C--AGT--C-CTG----GC--TAAG-AAG-AAATAATGTCATA--A---TAC-CCT-TTA---T-AAAAAAAATATTT-ATTT------TCAATA------TAGGA---G-----A-TAA-AT-TCACAGATG--A--------AGAATTATTCA-TTATC---TTAGATATTTAATTT--TATATATT---CTC
gi|155967 : TGGTTTTAAACCAGAATAAATCAGAGGATTCT----ACCA-T---------GAAAAAATATCT-ACATA-----CA--TTA-AAAA-TAATA-G---GC---A---GTCC--TCT-----ATG--T-A-CTTCC--TGCAACCA-----GGAA---GAGA--CC-ACCATC--CATATGT--TT-TAGACATGTC-AGCAACACAAACCTTTCTT---A-ATA-----A----A-----CTCAA--AACTTA-GTTCTCTGCT-TTAA-ATG-TAA-AATGCC-------------CAT-TTAA--T-ATAAAATGTTTTT--TAT------TTAATACCAGTGTAGAA---AA--C-AACAT--T-T--CACAAG--C--------AGAATTCAAAA-TTATT---CTTGAACTAAAATAT--TACATATT---TTCTACAAGACGACCG--AATGGAACACT-A-TCAACAGTTGCTTTTAA-AAACAGACT-TAAG-T---TTA-CA-C-TTT--TAT----CA----CT----CA-AAG-AAA---T---AGCAATAAA-----A---AACGGAAAAAAATAT-AC-----TTTTAAAGCACAGTGGCATAAA
gi|155968 : TGGTTCCAAATACGAATTAATCACAGGATTCT----CCCAAC---------AAGAAAATTTTT-ATATA-----TG--ATA-AATA-TTGTT-G---AT---A---GTCC--TAT-----TTG--T-A-AATAT--TGTCAAAT-----GGAA---GAAA--CC-TTGACA--CACATGT--TG-TGGTCATGTCCTGCTACACAATCA-CTATT--AA-AGG-----A----AC----TT--A--AAC--T-TTG----GCTATCCA-TC--AAA-CATTTCAAA--T---TAA-CAC-TGA---T-AGAAGAATCATTT-ATAT------TCAATA------CAGGA---AA--T-A-AAT-TG-T--CCAACA--C--------AGAACTTCATA-TAATA---CTTGAAACTAAATAT--TACATATT---CTATACTAAACGGAATC-AAAGTT-CATTAA-GCT-TAGACACACTCAAGAAAC--GTT-TGGA-A---ATA------TCA--TAT----GAGATCCT----TA-AAT-GCATATT---TGT----AA-----A---AA---ATAATAACAT-AAACTTATTTGAAAATA-AATGG
gi|155969 : TGGTTCCAACACAGAATTA-TCATAGAATTGG----AACAAC---------AAAGAAATGTTT-AAAAA-----AA--ACT-ATTA-AAACT-G---GCCCAA---GCTC--ATT-----GTG--T-T-CTTAT--TGTAATCA-----AAAC---GAAAG-C----AGTA--TTCATTTACTC-TGGACATGTCCTTCAACAAGGTCGTTTCTT--CA-AAAAAAAAT----A-----C---A--AGC--A--TG----GTT-T----ATA-AAG-AACATAATT--ACTTTAC-CAT-TTA---T-AGTAGAATTATTC-ATAT------GTTATA------CAGGA---AAAGA-A-TAT-AT-----AATGG--C--------A-ACATGTGTA-TTATCGTATTAGAAATGAAATAC--TATACATA---ATCAGCTAAA--A-----AAT-CTACATT-A-TCTAT
gi|155970 : TGGTTCCAATTTAGAATTAATCACAGAATTCTTGGAACAAACTCATTGCTTAAAAAAATG--------A-----AG--ATT-AA-A-GAATCAG---AT---GTATGTTC--CTT------------------T--TGTCAAAA-----AGAAACCGAAA--CTATTAA-A--CATATAT--TTATTGAC-TGCATAGTAACGCAACAATTTTTT--CA-AAG-----T----T-----TT--A--AAA--A-TTA----TCT---GA-ATG-AAA-AGTG-CAAT--A---CAA-TAA-ATA---C-AGA
gi|155971 : TAGTTCCAAATACGAATTGATCACAGGATTTT----CCTAAC---------AAGAATTTTTTTTATATA-----TG--ATA-AACA-TTGTT-G---AT---A---GTCC--GAT-----TTG--T-A-AATAT--TGTCAAAT-----GGAA---AAAA--CA-TTGACA--TACATGT--TG-TGGTCATGTCCTGCTACACAA-TAGCTGTT--AA-AGG-----A----AC----TT--A--AAC--T-TTG----GCTATCCA---T-AAA-CATTTCAAA--T---TAA-CAC-TGA---T-TGAAGAATAATTT-ATAT------TCAATA------TAGGA---AA--TAA-ATT-AT-C--C-AACA--C--------AGAACTCCATA-TGATC---CATGAAACTGAATACAGCATATATT---CTATACTAAACGGAAT--AAAAGTTCATTAA-GCT-TAG--ACACTCAATAAAC-GACTGGAAA-A---AT--CA-TATGA--GAT----C-----CT----TA-AAT-GCATATT---TGT-AAAAA-----A---AA---ATAAC-ATA--ACT-TTATTTGAAAATA-AATGG
gi|155972 : TGGTGTCAAACCAGAATAAATTACAGGATTCT----ACCA-T---------GTAAAAATATCT-ACATACTCGTAC--ATT-AAAAATAACT-G---AC---A---GTCC--TCT-----ATG--TAC-ATC-C--TGCAACCA-----GGAA---AAGA--CC-CACGTC--AACATGT--TT-TGGACATGTCCAGCCACACAAACATTTCTT---A-ATA-----A----A-----CT--C--AGA--ACCTG----GTT-CTCT-GCC-ATA-AATGTAAATTGA---AAA-GGT-T--------GAA-AGGT-TTT-ATATCCAATACCAATA------TAGAAAATAA--C-A-TGT--C-C--CAAAC---C---------GAATTCCAAA-ATTTT---CTTGAAATAAAACAC--AACATATT---TTCTGCAAGACGACTG--AATGGAACACT-A-TCATCAGTTGCTTTTAA-GAAGAGACT-GAAA-T---ATA-CACT-TCTAGTAT----CT----CGCCGAGA-AATAGCA---A---TA----AAA-----ACGGAA---AT-ATGATAC--------TTTTAAAGCACAGTGGCACAA
gi|155973 : TGGTTTCAAAACAGAATAAATCACAGGATTCT----ACCATG---------TAAAAAATATCT-ACATA-----CATTATTAAAAA-TAACT-G---AC---A---GTCC--ACT-----ATG--
gi|155974 : TTCCAATTTAGAATTAATCACAGAATTCT----TGGAAC---------AAACTCATTGCT-TAAAA-----AA--ATG-AAGA-T--TT-A---AG---A---ATCCGATGT-----ATG--T-T-CCTTT--TGTCAAAG-----AGAAACCGAAA--CTATTAA-A--CATATAT--TTATTGAC-TGCATAGTAACGCAACAATTTTTT--CA-AAG-----T----T-----TT--A--AAA--A-TTA----TCT---GA-ATG-AAA-AGTG-CAAT--A---CAG-TAA-ATA---C-AGAtacatccgagtaggccaac
gi|155975 : AATTCT----ACTAA-------------AAATTACCA-TCA-A-----AA--GTT-AAAA-TAAGG-G---TC---A---ATTTG-CTTTTTGGATGGCC-T-ATTATCCTGCAACCA-----AGAA---GAGA--CC-CTCGTC--CACATGT--TT-TGGACATATCCAGCAACACAAATATTTCTT---A-ATA-----A----AC----TT--A--AAA--C-CTG----GTT-TCTCTGCC-ATA-AATGTAAAT------TGCTCATGTTA---TGAGAAAGATT--TT-ATAT------TCAATACCAATATAGAA---AG--T-A--AT-ATGT--CACAAA--C--------AGAATTCCAAC-TTATT---ATCGAAATAAAACAC--TACATAGT---TTCTATAAGACGACTG--AATGGAACACT-A-TCCACAGTTTCTTTTAA-AAATAGACT-GAAATAATTATA-CA-C-T-T--TAT----CA----CT----CACGAG-ATA---T---AG---CAAT-----A---AA---AAAGGAAAAT-TTA-TACTTTTAAAGGACAGTGGCACAAA
gi|155976 : ---GCCT--CTT-----ATT--T-A-AATAT--TGTCAAAT-----AGAA---GAAA--CC-TTGACA--CGCATGT--TG-TGATGATGTCCTGCTACACAA-----TCGC--CA-TGA-----A----AGGAACTT--A--GAC--T-TTG----GCTATCCA--CA-AAA-CATTTCAAA--T---TAA-CAC-TGA---T-AGAAAAATCATTT-ATAA------TCAATA------CAGGA---AA--T-A-AATTAT-C--CAA-CA--C--------AGAACTTCATA-TAATA---CTTGAAACTAAATAT--TACATATT---CTATACTAAACGGAATC-AAAGTT-CATT-AAGCT-TAGACACACTCAAGAAAC-GTCT-G-GA-A---ATATCA-T--AT--TAT----GAGATCCT----TA-AAT-GCA---TATTTGT----AA-----A---AA---ATAATAACATAACT-TTATTTGAAAATA-AATG
gi|155977 : -ATTAT---GTAACCA-----GGAA---GAGAGCCT-C-AAC---CACACGT--TT-TGGACATGTCCAGCAACACAAACATTTCTTAATA-AGC-----TCAGAA-----TT--T--GGT--A-CTCT---GTT-ATAA-ATGCAAA-AAAACTCAT------------T-TTA---T--GAAAAAATATTTTATAT------TTAATACCAATGTAGAA---AA--C-A--AC-ATGT--CA--CGAAC--------AGAATTCCAAA-TGATT---TTTTAAATAAAATAT--TACATATT---TTCTACAAGACGACCG--AATGGAACACT-A-TCCACAGTTGCTTTTAA-AAATAGACT-AAAA-T---ATA-CA-C-TTT--TAT----CA----CTCAAAGA-AATAGCA---A---TGA-TTAAAAACGGA---AA---AAAATGATAC--------TTTTAAAACAAAGTGGCACAAA