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lowQualScore                  :           3333        0  1111111  111     0 333      0  0 0   222222 0  333 0         000 5555555555555 0 000 111111 0 22222222 0000      0 111     111 0  00     
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lowQualScore                  :           5555        4  3333333  333     4 666      4  8 4   777777 4  000 4         777 7777777777777 8 777 222222 4 55555555 9999      4 111     777 4  66     
consensus                     :   ACTTTTTGNCC-TGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CC--GCATTT-TT-C-ATT-----TG-ATCC-T-CACCAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
Reference ( gi|127055 )       :   ACTTTTTGGCCATGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CT--GCATTT-TT-C-ATT-----TG-ATTC-T-CACCAAACT---T-----G-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126987                     :   ACTATTTGACCTTGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-TC--GCATTT-TC-C-ATT-----TG-ATCC-T-CACCAAACT---T-----G-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--CTATC
gi|127039                     :  aACTATTTGACC--GTGTGTA-CT-------CT---AGCAC-CT--GTATTT-TT-C-ATT-----TG-ATTC-T-CACCAAACT---T-----A-------T-T---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127049                     :   ACTATTTGACCTTGTGTGCA-CT-------CC---AGCAC-CC--ACATTT-TT-C-ATT-----TG-ATCC-T-CACCAAATG---T-----G-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-CA--ATATC
gi|127052                     :   ACTATTTGACCCTGTGCGCA-CT-------CT---AGCAC-CT--ACATTT-TT-C-ATT-----TG-ATCA-T-CACCAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----AATTAT-A---TAATC---A-TA--ATATC
gi|127051                     :   ACTATTTGACCTTGTGTGAA-CT-------CT---GGCAC-CC--GCATTT-TT-C-ATT-----TG-ATTC-T-CACCAAACT---T-----G-------C-A---C------A-G--------T----AGTTTT-A---TAACT---G-TA--GTATC
gi|126977                     :   ACTTTTTTGT--TGTGTGCA-CT-------CT---AGCAT-TC--ACATTT-TT-C-ATT-----TG-ATCC-T-CAACAAACT---T-----G-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATAT
gi|127050                     :  aACTGTTTGACCTTGTGTGCA-GT-------CT---GGCAC-CC--GCATTT-TT-C-ATT-----TA-ATTC-T-CACAAAAAT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATAT
gi|127054                     :   ACTATTTGACTGTGTGTGCA-CT-------CT---AGTAC-CC--GCATTT-TT-TTATT-----TG-ATTC-T-CATTAAATT---T-----G-------C-A---C------A-G--------T----ATTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126976                     :   ACTTTTTGT---TGTATGCT-TT-------CT---AGCAC-CT--GCATTT-TT-C-ATT-----GG-ATTT-T-CACCAAACT---T-----A-------C-C---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126970                     :  aACTTTTTTGT--TGTGTGCA-CT-------CT---AACAC-TT--GCATTT-TC-C-ATT-----CG-ATCT-T-CACTAAACT---T-----A-------T-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127044                     :  aACTATTTGAACTTGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CA--GCATTT-TT-C-ATT-----TG-ATTC-A-CACCAGCCT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----TGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATGTC
gi|127064                     :   ACTATTTGACCTTGTGTGCA-CT-------GT---AGCAC-GA--GCATTT-TT-C-ATT-----TG-ATCC-T-CATCAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACA---A-TA--TTATC
gi|127053                     :   ACTATTTGACCTTGTGTGCA-CT-------CT---GGCAC-CT--GCATTT-TG-C-ATT-----TG-ATCC-G-TACTAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----ATTTAT-A---TAACC---A-TG--AGATC
gi|127042                     :   ACTATTTGACCTTGTGTGCG-CT-------AT---AGCAC-CT--TCATTT-TT-C-ATT-----GG-GTGT-T-CACCAAACT---T-----A-------C-A---T------A-G--------T----TGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127048                     :   ACTATTTGACCTTGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-C----CA-------C-ATT-----TG-ATCC-T-CACCACACT---T-----G-------A-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAATC---A-TA--ATATC
gi|126964                     :   ACTTTTTGT---TGTGTGTA-CT-------CT---AGTAC-CT--GCATTT-TT-C-ATT-----GG-ATCT-T-CACTAAACT---T-----A-------TAA---T------A-G--------T----GGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126974                     :  aACTTTTTGT---TGTGTGCG-CT-------CT---AGCAC-CT--GCATTT-TT-C-ATT-----GG-ATTT-T-CACGAAACT---T-----A---------A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---AAACC---A-TA--ATTTC
gi|126963                     :  aACTTTTTGT---TGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CC--ACATTT-TT-C-ATT-----GG-ATCT-T-CACTAAACT---T-----A-------T-A---T------A-G--------T----AGTTAT-AG--TAACC---A-TA--TTATC
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gi|126969                     :  aACTTTTTGT---TGTGTGCA-CT-------CT---AACAC-CT--ACATAT-TT-C-ATT-----GG-ATCT-T-CACTAAACT---T-----ATT-----T-A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAAGC---A-TA--CTATC
gi|127057                     :  aACTTTTTGT---TGTGTGCA-AT-------CC---AGCAC-TT--GCATTT-GG-C-ATT-----GG-ATCT-T-CACCAAATT---T-----A-------T-A---T------A-G--------T----AGCTAT-A---TAACC---A-TT--ATATC
gi|126979                     :   ACTTTTTTGT--TGTGTGCA-CT-------CT---AGTTC-CC--AAATAT-TT-C-ATT-----TG-ATCT-T-CACTAAATT---T-----A-------T-A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TACCT---A-TA--ATATC
gi|126982                     :  aACTTTTTTGT--TGTGTGCA-CT-------CTTT-ATCAC-TC--GCATTT-TT-A-ATT-----GG-ATTT-T-CACTAAACT---C-----A-------T-A---T------A-G--------T----AGTTAT-G---TAACT---A-TA--ATGTC
gi|126971                     :  aACTTTTTGT---TGTGTGCA-CT-------CT---AGCAA-AC--ACATTT-TT-C-A-T-----TG-GTTCTT-CACTTAACT---T-----A-------T-A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACT---A-AA--ATATC
gi|126973                     :  aACTTTTTTGT--TGTGTGCA-CT-------CA---AGCAC-TC--ACATTT-TT-C-ATT-----GA-ATCT-T-CGCTAAACTTAAT-----A-------T-G---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ACATC
gi|127059                     :  aACTTTTTGTTC---TGTGCA-CT-------CC---AGCAC-TT--GCATTT-GG-C-ATT-----GA-ATCT-T-CACCAAATT---T-----A-------T-A---T------A-G--------T----AGCTAT-A---TAAAC---A-TT--ATATC
gi|126994                     :   ACTTTTTGT---TGTGTGCA-CT-------CT---AGCCC-CT--GGATTT-TT-C-ATT----------------AGC--ACT---T-----A-------T-A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126980                     :  aACTTTTTGT---TGTGTGCC-CT-------CT---AGCAC-TC--GCATTT-TT-G-ATT-----GG-ATCT-T-CACCAAACT---T-----A-------T-A---T------A-G--------T----AGTTA-------AATCGG-A-TA--ATA
gi|126998                     :  aACTTTTTGT---TGTGTGCA-CT-------CT---AGCAA-CT--ATATTT-TT-C-ATT-----GG-------------AACT---T-----A-------C-A---C------A-A--------T----AGTTAT-A---CAACC---A-TA--TTATC
gi|126984                     :  aACTTTTTTAT--TGTGTGCA-CT-------CT---AGCAT-CC--ACATTT-TG-C-ATT-----AA-ATCT-T-CACTAAACT---T-----A-------T-A---T------A-G--------T----AGTTTT-A---TAA
gi|127000                     :  aACTTTTTGT---TGTGTACA-TT-------CT---GGCTC-AA--GCATTT-TT-C--TT-----TGCATCT-T-CACCAAATT---T-----A-------C-A---T------A-G--------TATTAAATTAT-A---TAACC---C-TA--ATATC
gi|126993                     :  aACTTTTTTGT--TGTGTGCA-CT-------GT---GCCAT-CC--ACATTT-T--C-ATT-----GG-ACCT-T-CACTTAATT---T-----AGATATCAT-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126992                     :  aACTTTTTGT---TGAGTGCG-CT-------CT---GGTAT-CC--GCATTT-TT-T-ATT-----GG-ATCT-T-CACTAAACT---T-----A-------T-A---T------A-T--------T----TGTTAC-T---TAACC---A-TA--
gi|127142                     :    aTTTTTGACC--GTGTGCA-CT-------CC---AGCAC-CT--GCATTC-TT-C-ATT-----TG-AACC-T-CACCAATCT---T-----G-------C-A---C------A-G--------T----AGTTATAA---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126975                     :     TTTTTGT---TGTGTGCA-CT-------TT---AGCAC-TC--GCATTT-TT-A-ATT-----AG-ATTT-T-CACTAAACT---T-----A-------T-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACA---A-TA--ATATC
gi|127144                     : aacaTCTTTGGCATTGTGTGCA-CT-------CT---AGCACTCTCAGAATTTCTT-C-ATT-----TG-ATCT-T-CACCAAATT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T-----GTTAT-A---TAACC---A--A--ATATC
gi|127062                     :      TTTTAACT-TGTGTGCA-CTTTAATCTCT---AACAC-CT--ACATTT-TT-C-ATT-----GG-ATCT-T-CACCAAACT---TACAAGG-------T-A---C------ATG--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126997                     :    acTTTTGGT--TGTGTGCA-CT-------CC---AGCAT-CG--TCATTT-TT-C-ATT-----AG-ATCT-T-CACAAAACT---T-----A-------C-A---T------A-T--------A----AGTTAT-A----AACA---A-CA--ATATC
gi|127169                     :    aacTTTGGCCTTGTGTGCC-AT-------CT---AGCAC-CT--GCATTT-TT-C-ATC-----TG-ATTC-T-TACCAAACT---T-----A-------T-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127180                     :       TTTGACT-TGTGTGCA-TT-------CT---AGCAC-CT--GCATTT-TT-C-ATT-----TG-ATTC-T-CACCAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAAGC---A-TA--ACATC
gi|127179                     :       TTTGACCTTGTGTGCA-CT-------CTTTAAGCAC-CT--GCATTT-TT-A-ATT-----TG-ATCC-T-CATCAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------C----AATTAT-A---TAACC---A-TA--A
gi|127172                     :       TTTGACCTTGTGTCCA-CT-------CT---AGCAC-CC--TCATTT-TT-C-ATT-----TG-ATCT-T-CATCAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----AATTAT-A---TAACTAAAA-CA--ATATC
gi|127168                     :       TTTGACTTTGTGTGCA-TT-------CT---AGTAC-TC--GCAGCT-TT-C-ACT-----TG-ATGT-C-CACCAAACT---T-----A-------C-A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAATC---A-TA--ATATC
gi|127182                     :       TTTG---ATGTGTGCA-CA-------CT---AGCAC-GT--GCAGTT-TT-T-ATT-----GG-ATCT-T-CACCAAACT---T-----A-------T-ATACC------G-G--------T----AGTTAC-A---TAAAC---ATTA--ATATC
gi|127159                     :       TTTTGC--TGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CC--GTTTTT-TT-C-ATC-----GG-ATTT-T-CCTTTAAAT---T-----A-------T-A---T------A-G--------T----TGTTTT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127186                     :              ATGTGTGCA-CT-------GT---ACTAC-TC--GCAGTT-TT-C-ATT-----TA-ATCT-T-CACTAAGTT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--CTATC
gi|127383                     :           tttaTGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CT--GCATTT-TT-T-ATT-----TG-ATTC-T-CACCAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-G---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127310                     :               TGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CC--GAATTT-TT-C-ATT-----TG-ATCC-T-CATCAAACT---T-----G-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--CTATC
gi|127375                     :              tTGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CC--ATATTT-TT-C-ATT-----TG-CTTC-T-CACCAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAATC---A-TA--ATATC
gi|127390                     :               TGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CC--GCATTT-TT-C-ATT-----TG-ATTC-T-CACCAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---T-ACC---G-TA--ATTTC
gi|127379                     :               TGTGTGCA-CT-------CT---GGCAC-CC--GCATTT-TT-C-ATT-----TG-ATTC-T-CACCAAACT---T-----G-------C-T---C------A-G--------T----ATTTAT-A---TAACC---A-CA--ATACC
gi|127311                     :               TGTGTGCG-CT-------CT---AGCAC-CC--GAATTT-TT-C-ATT-----TG-ATTC-T-CATCAAACT---T-----G-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAGCC---A-TACTATATC
gi|127386                     :              tTGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CC--GTATTT-TT-C-ATT-----TG-ATTA-T-CACTAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-G---TAACC---A-TG--ATATC
gi|127389                     :               TGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CA--ACATTT-TT-C-ATT-----TG-ATTA-T-CATCAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----TGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127388                     :               TGTGTGCA-CT-------TT---AGCAC-CC--GCATTT-TC-C-AGT-----TG-ACTC-T-CACCAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--A
gi|127328                     :               TGTGTGTA-CT-------CT---AGCAC-CT--GCAATT-TT-C-AAT-----TG-ATCC-T-CCCCAAACT---T-----G-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--AAATC
gi|127387                     :              tTGTGTGCA-CA-------AT---AGCAC-TC--GCATTT-TTGC-ATT-----TG-ATCC-T-CACCAAACT---T-----G-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATA
gi|127372                     :               TGTGTACA-CT-------CT---AGCAC-AC--GCATTA-TT-T-ATT-----TG-ATCC-T-CAACAAACT---T-----G-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127377                     :               TGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CC--GCATTT-TT-C-ATT-----TG-AATA-T-CACCAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----ATTTAT-A---TAACC---A-CA--ATA
gi|127327                     :               TGTGTGTA-CT-------CT---AGCAC-CC--GCATTT-TT-C-AAG-----TG-ATCC-T-CACCAAACT---T-----G-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAATC---A-GA--AAATC
gi|127378                     :              tTGTGTGCA-CT-------CT---AGCTC-CC--GAATTT-TT-C-ATT-----TG-ATCC-T-CACCACACT---T-----G-------C-A---T------A-G--------T----TGTTAT-A---TAACT---A-TA--ATATC
gi|127231                     :               TGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CT--GCATGT-TT-A-ATT-----TA-ATCC-T-CACTAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAA-A---TAACA---A-TA--ATATC
gi|127158                     :            tgtTGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CC--ATATTT-TT-C-ATT-----TG-ATTA-T-CATCAAACT---T-----A-------C-A---A------A-G--------T----AGTTAT-A---TAATC---A-TA--TTATC
gi|127312                     :         ttttgtTGTGTGAT-CT-------CT---AGCAC-CC--GCATTT-TT-C-ATT-----TG-ATCC-C-CACCAAATT---T-----G-------A-A---C------A-G--------C----ATTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127373                     :              tTGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CC--GCATTT-TT-C-TTT-----TG-ATTC-T-CACAAAACT---T-----A-------C-T---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAGCCT--A-T---ATATC
gi|127314                     :               TGTGTGCA-CT-------CT---AGCTC-TC--GCATTT-T--C-ATT-----TG-ATCC-T-CACCAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----AATTAT-A---CTACC---A-TA--ATAT
gi|127332                     :              tTGTGTGCA-CT-------CT---AGCGC-CA--GCCGTT-TT-C-ATT-----TG-ATTC-T-CACCAAACT---T-----A-------T-A---C------A-G--------T----TGTTAT-A---TTACC---A-CA--ATATC
gi|127227                     :              tTGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CG--ACAAAT-TT-C-ATT-----TG-ATCT-T-CACCAAACT---G-----A-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TTACC---A-TA--ATATC
gi|127209                     :            tgtTGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CC--GTAATT-TT-C-ATT-----GG-ATCT-T-CACTAAACT---T-----A-------T-A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATA
gi|127374                     :          ttgtcTGTGTGCA-CT-------CT---AGCAT-CC--ACATTT-TT-C-ATTAATTTTG-TTCC-T-CACCAAACT---T-----A-------C-A---G------A-G--------T----AGTAAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127156                     :               TGTGTGCA-CT-------CT---AGCAT-CT--GAATTT-TTTC-ATT-----GG-ATCT-T-CACTAAACT---T-----A-------T-A---T------A-G--------T----AGGTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126983                     :         ttttgtTGTGCACA-CT-------TT---ATCAT-CT--GCATTT-TT-C-ATT-----GA-ATCT-T-CACCAAACT---T-----G-------T-G---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-CA--ATATC
gi|127326                     :     aacttattgtTATGTGCA-CT-------CT---AGCCC-CT--GCATTA-TT-T-ATT-----GG-GTCT-T-CATCAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----AGTTGT-A---TAACC---A-TA--TTATC
gi|126986                     :              tTGTGTTTA-CT-------GT---AGCAC-CT--GCTTTT-TT-C-ATT-----GG-GTCT-T-CACCAAACT---T-----A-------C-A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAATC---G-TA--ATATC
gi|127288                     :     aacgttttgtTATGTGCG-CT-------GT---AGCAC-CT--GCATTT-TT-C-ATT-----TG-ATAT-T-CACCAAACT---T-----A-------T-A---C------A-G--------T----AGTCCT-A---TGTCT---A-TA--ATATC
gi|127228                     :             gtTGTATGCAACA-------GT---AGCAT-TT--GCATTT-TT-C-ATT-----GG-ATCT-T-CACTAAACT---T-----A-------C-A---C------G-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126972                     :            tgtTGTGTGCC-CT-------CT---AGCAC-CA--ACATTT-TT-C-ATT-----GG-ATCT-T-CACTAAACT---T-----A--------------------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACT---A-TA--ATATC
gi|126965                     :    agctttattgtTGTGTTCA-CT-------CT---TGCAC-TC--ACATTT-TT-C-ATT-----GG-ATCT-T-CACTAAACT---T-----A-------TAA---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127043                     :    aactattttgtTGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CC--GCAGTT-TT-C-ATT-----AG-ATCT-T-CATCAAATT---T-----T-------C-A---C------A-GTTATT---T----ATTTAT-T---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127140                     :   atttttaaatgtTGTGTACA-CT-------CT---AGCAT-GT--GCAGTT-TT-T-ATT-----TG-ATCC-T-CATTAAACT---G-----A-------T-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---T-AA--ATATC
gi|127183                     :        ttgttgtTGTGTGCT-CT-------CT---TGCAC-CA--GCATTT-TT-T-ATT-----GA-ATCT-T-CACCAAACT---T-----G-------A-A---C------A-G--------T----AGTTAT-G---AAATC---A-TA--ATAT
gi|127376                     :          tttgtTGTGTGCA-CT-------AT---AGCAC-CC--ACATTT-TT-C-ATT------G-GTTC-TTCACTTAACT---T-----A-------T-A---T------G-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--AT
gi|127219                     :               TGAGTGCA-CT-------CT---AGCAC-TC--ACAGTT-TA-A-ATT-----TG-ATCT-T-CATTAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----TGTTAT-G---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127229                     :            tgtTGTGAACA-CT-------CT---AGCAC-CC--GCATTT-TT-C-ATT-----GG-ATCT-T-CACTAAACT---A-----A-------C-A---CTAAACTA-A--------A----AGTTAT-A---TAACT---A-TA--ATATC
gi|127324                     :            tgtTATGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CA--ACATTT-TT-C-ATT-----GC-ATCA-T-TGCCAAACT---G-----A-------T-A---C------T-G--------T----AGTTAT-A---AAACC---A-TA--ATATC
gi|127225                     :              tTGTGTGCT-CT-------CT---AGCAC-TC--ACAGTT-TA-T-ATT-----TA-ATCT-T-CATTAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----TGTTAT-T---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127391                     :            tgtTGTGTGCA-TT-------CT---GGTAC-TC--ATAGCT-TT-C-ATT-----TG-ATGT-C-CACTAAACT---T-----A-------C-A---T------A-G--------T----AGTTAT-ATATTAACC---A-TA--ATATC
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gi|127143                     :            tgtTGTGTGCA-CT-------CT---AGCAC-TC--GCTTTT-TG-C-ATT-----GT-ATGT-A-CACTGAACT---T-----A-------A-A---T------A-G--------T----AATGAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127330                     :        tttttttTGTATGCA-CT-------CT---AGTAC-AA--ACAGTT-TT-C-ATT-----GG-ATCT-T-CATGAGAAT---T-----A-------G-A---C------A-A--------T----AGTTAC-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127411                     :               tGTGTGCA-CT-------CT---AGCAT-CC--GCATTT-TT-C-ATT-----CG-ATTC-T-CACCAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----AGTAAT-A---TAATC---A-TA--
gi|127417                     :                 TGTGCA-CT-------CT---AGCAC-CT--GCATTT-TT-C-AAT-----TG-ATCC-T-CACCAAATT---T-----G-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---T-TA--ATATC
gi|127419                     :                 TGTGCA-CT-------CT---AGCAC-C---GCATTT-TT-C-ATT-----CG-ATTC-T-CATCAAACT---T-----A-------C-A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAGCT---A-TA--ATATC
gi|127439                     :                   TACA-CT-------TT---AGCAC-CC--AAATTT-TT-C-ATT-----GG-ATCT-T-GACCAAACT---T-----A-------T-A----------A-G--------C----AGTTGT-A---TAACC---A-TA--AGATC
gi|126981                     :                                          C-CC--ACATTT-T--C-ATT-----GG-GTCT-T-CATCAAACT---T-----A-------T-A---T------A-G--------T----AGTTAT-G---TAACC---A-CA--ATTTC





Alignments
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lowQualScore                  :                8  7   555555 8       4  3333333  222          9999     8 4   999999 4   3          777  8888888 88888 777 111111 4 44444444 8888      4 111     333 4  00     
consensus                     :             ACT-TT-TTGN-C-C-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
Reference ( family-80 )       :             ACT-TT-TTGN-C-C-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126963                     :             ACT-TT-TTGT-----T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCACA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTCACTAAACT---TA-------T-----A---T------A-G--------T----AGTTAT-AG--TAACC---A-TA--TTATC
gi|126964                     :            aACT-TT-TTGT-----T-GTGTGTA-CT-------CT---AGTACCTGCA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTCACTAAACT---TA-------TA----A---T------A-G--------T----GGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126965                     :            aACTATT-TTGT-----T-GTGTTCA-CT-------CT---TGCACTCACA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTCACTAAACT---TA-------TA----A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
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gi|126975                     :              aT-TT-TTGT-----T-GTGTGCA-CT-------TT---AGCACTCGCA----TTTTT-A-ATT-----AG-ATTTTCACTAAACT---TA-------T-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACA---A-TA--ATATC
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gi|127042                     :             ACT-AT-TTGA-C-C-TTGTGTGCG-CT-------AT---AGCACCTTCA----TTTTT-C-ATT-----GG-GTGTTCACCAAACT---TA-------C-----A---T------A-G--------T----TGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127043                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGCA----GTTTT-C-ATT-----AG-ATCTTCATCAAATT---TT-------C-----A---C------A-GTTATT---T----ATTTAT-T---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127044                     : atttttaaatgtACT-AT-TTGAAC-T-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCAGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTCACACCAGCCT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----TGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATGTC
gi|127048                     :             ACT-AT-TTGA-C-C-TTGTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCACA----TT--------------TG-ATCCTCACCACACT---TG-------A-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAATC---A-TA--ATATC
gi|127049                     :             ACT-AT-TTGA-C-C-TTGTGTGCA-CT-------CC---AGCACCCACA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCCTCACCAAATG---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-CA--ATATC
gi|127050                     :             ACT-GT-TTGA-C-C-TTGTGTGCA-GT-------CT---GGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TA-ATTCTCACAAAAAT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATAT
gi|127051                     :             ACT-AT-TTGA-C-C-TTGTGTGAA-CT-------CT---GGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTCTCACCAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTTT-A---TAACT---G-TA--GTATC
gi|127052                     :             ACT-AT-TTGA-C-CCT-GTGCGCA-CT-------CT---AGCACCTACA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCATCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AATTAT-A---TAATC---A-TA--ATATC
gi|127053                     :             ACT-AT-TTGA-C-C-TTGTGTGCA-CT-------CT---GGCACCTGCA----TTTTG-C-ATT-----TG-ATCCGTACTAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----ATTTAT-A---TAACC---A-TG--AGATC
gi|127054                     :             ACT-AT-TTGA-C-TGT-GTGTGCA-CT-------CT---AGTACCCGCA----TTTTT-TTATT-----TG-ATTCTCATTAAATT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----ATTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127055                     :             ACT-TT-TTGG-C-CAT-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCTGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTCTCACCAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127057                     :             ACT-TT-TTGT-----T-GTGTGCA-AT-------CC---AGCACTTGCA----TTTGG-C-ATT-----GG-ATCTTCACCAAATT---TA-------T-----A---T------A-G--------T----AGCTAT-A---TAACC---A-TT--ATATC
gi|127059                     :             ACT-TT-TTGT-T-C-T-GTG--CA-CT-------CC---AGCACTTGCA----TTTGG-C-ATT-----GA-ATCTTCACCAAATT---TA-------T-----A---T------A-G--------T----AGCTAT-A---TAAAC---A-TT--ATATC
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gi|127066                     :             ACT-AT-TTGA-C-C-TTGTATGCA-CT-------TG---AGCACCCATA----CTTTT-T-ATT-----TA-ATCCTCACCAAACT---CA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTGT-A---TAATC---A-TA--ATATC
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consensus                     :             ACT-TT-TTGN-C-C-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
Reference ( family-80 )       :             ACT-TT-TTGN-C-C-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
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gi|127219                     :                            -T-GAGTGCA-CT-------CT---AGCACTCACA----GTTTA-A-ATT-----TG-ATCTTCATTAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----TGTTAT-G---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127224                     :                         tgt-T-GTGTACA-TT-------CC---AGTACCCATA----TTTTT-C-ATT-----TC-ATCTTCTCTAAACA---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TATCT---A-TG--ATATC
gi|127225                     :                         tgt-T-GTGTGCT-CT-------CT---AGCACTCACA----GTTTA-T-ATT-----TA-ATCTTCATTAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----TGTTAT-T---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127227                     :                         tgt-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCGACA----AATTT-C-ATT-----TG-ATCTTCACCAAACT---GA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TTACC---A-TA--ATATC
gi|127228                     :                         tgt-T-GTATGCAACA-------GT---AGCATTTGCA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTCACTAAACT---TA-------C-----A---C------G-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127229                     :                         tgt-T-GTGAACA-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTCACTAAACT---AA-------C-----A---CTAAACTA-A--------A----AGTTAT-A---TAACT---A-TA--ATATC
gi|127231                     :                         tgt-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCTGCA----TGTTT-A-ATT-----TA-ATCCTCACTAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAA-A---TAACA---A-TA--ATATC
gi|127288                     :                         tgt-T-ATGTGCG-CT-------GT---AGCACCTGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATATTCACCAAACT---TA-------T-----A---C------A-G--------T----AGTCCT-A---TGTCT---A-TA--ATATC
gi|127310                     :                          gt-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGAA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCCTCATCAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--CTATC
gi|127311                     :                           t-T-GTGTGCG-CT-------CT---AGCACCCGAA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTCTCATCAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAGCC---A-TACTATATC
gi|127312                     :                           t-T-GTGTGAT-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCCCCACCAAATT---TG-------A-----A---C------A-G--------C----ATTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127314                     :                           t-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCTCTCGCA----TTTT--C-ATT-----TG-ATCCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AATTAT-A---CTACC---A-TA--ATAT
gi|127324                     :                           t-T-ATGTGCA-CT-------CT---AGCACCAACA----TTTTT-C-ATT-----GC-ATCATTGCCAAACT---GA-------T-----A---C------T-G--------T----AGTTAT-A---AAACC---A-TA--ATATC
gi|127326                     :                           t-T-ATGTGCA-CT-------CT---AGCCCCTGCA----TTATT-T-ATT-----GG-GTCTTCATCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTGT-A---TAACC---A-TA--TTATC
gi|127327                     :                           t-T-GTGTGTA-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-AAG-----TG-ATCCTCACCAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAATC---A-GA--AAATC
gi|127328                     :                           t-T-GTGTGTA-CT-------CT---AGCACCTGCA----ATTTT-C-AAT-----TG-ATCCTCCCCAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--AAATC
gi|127330                     :                           t-T-GTATGCA-CT-------CT---AGTACAAACA----GTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTCATGAGAAT---TA-------G-----A---C------A-A--------T----AGTTAC-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127332                     :                           t-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCGCCAGCC----GTTTT-C-ATT-----TG-ATTCTCACCAAACT---TA-------T-----A---C------A-G--------T----TGTTAT-A---TTACC---A-CA--ATATC
gi|127372                     :                           t-T-GTGTACA-CT-------CT---AGCACACGCA----TTATT-T-ATT-----TG-ATCCTCAACAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127373                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-TTT-----TG-ATTCTCACAAAACT---TA-------C-----T---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAGCC-----TAT-ATATC
gi|127374                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCATCCACA----TTTTT-C-ATTAATTTTG-TTCCTCACCAAACT---TA-------C-----A---G------A-G--------T----AGTAAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127375                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCATA----TTTTT-C-ATT-----TG-CTTCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAATC---A-TA--ATATC
gi|127376                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------AT---AGCACCCACA----TTTTT-C-ATT-----GG-TTCTTCACTTAACT---TA-------T-----A---T------G-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--AT
gi|127377                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-AATATCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----ATTTAT-A---TAACC---A-CA--ATA
gi|127378                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCTCCCGAA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCCTCACCACACT---TG-------C-----A---T------A-G--------T----TGTTAT-A---TAACT---A-TA--ATATC
gi|127379                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---GGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTCTCACCAAACT---TG-------C-----T---C------A-G--------T----ATTTAT-A---TAACC---A-CA--ATACC
gi|127383                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCTGCA----TTTTT-T-ATT-----TG-ATTCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-G---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127386                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGTA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTATCACTAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-G---TAACC---A-TG--ATATC
gi|127387                     :                            -T-GTGTGCA-CA-------AT---AGCACTCGCA----TTTTTGC-ATT-----TG-ATCCTCACCAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATA
gi|127388                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------TT---AGCACCCGCA----TTTTC-C-AGT-----TG-ACTCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--A
gi|127389                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCAACA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTATCATCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----TGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127390                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---T-ACC---G-TA--ATTTC
gi|127391                     :                            -T-GTGTGCA-TT-------CT---GGTACTCATA----GCTTT-C-ATT-----TG-ATGTCCACTAAACT---TA-------C-----A---T------A-G--------T----AGTTAT-ATATTAACC---A-TA--ATATC
gi|127411                     :                              -GTGTGCA-CT-------CT---AGCATCCGCA----TTTTT-C-ATT-----CG-ATTCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTAAT-A---TAATC---A-TA--
gi|127417                     :                                TGTGCA-CT-------CT---AGCACCTGCA----TTTTT-C-AAT-----TG-ATCCTCACCAAATT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---T-TA--ATATC
gi|127419                     :                                TGTGCA-CT-------CT---AGCACC-GCA----TTTTT-C-ATT-----CG-ATTCTCATCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAGCT---A-TA--ATATC
gi|127439                     :                                  TACA-CT-------TT---AGCACCCAAA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTGACCAAACT---TA-------T-----A----------A-G--------C----AGTTGT-A---TAACC---A-TA--AGATC


blockSeqs                     :                       AACT   T          TTAATCT  TTA                         AATTTT                     GATATCA AAGGT     TAAACT   TAGTTATA             TAT     AAA
blockSeqs                     :                       ACCC   T          .        TT                          G                          TT      A         .        TTATT                .       GG 
blockSeqs                     :                       ACTG   T          .        .                           G                          .       A         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       GCCA   T          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       GCAT   T          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       ACC    T          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       ACC    T          .        .                           C                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       ACC    T          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       ACC    T          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       ACC    T          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       ACC    T          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       ACC    T          .        .                           A                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       ACC    T          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       TTC    T          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       ACT    .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       ACC    .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       ACC    .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       ACC    .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       ACC    .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       ACT    .          .        .                           A                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       GCC    .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       ACC    .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       ACC    .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       ACT    .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       AT     .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       TC     .          .        .                           A                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           A                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       C      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       A      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       T      .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                       .      .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
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blockSeqs                     :                              .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
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blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
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blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
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blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           C                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                              .          .        .                           T                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                                         .        .                           C                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                                         .        .                           G                          .       .         .        .                    .       .  
blockSeqs                     :                                         .        .                           .                          .       .         .        .                    .          


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                         ***
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finalCons                     :             ACT-TT-TTGN-C-C-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC





Alignments
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lowQualScore                  :                8  7   555555 8       4  3333333  222          9999     8 4   999999 4   3          777  8888888 88888 777 111111 4 44444444 8888      4 111     333 4  00     
consensus                     :             ACT-TT-TTGN-C-C-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
Reference ( family-80 )       :             ACT-TT-TTGN-C-C-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126963                     :             ACT-TT-TTGT-----T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCACA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTCACTAAACT---TA-------T-----A---T------A-G--------T----AGTTAT-AG--TAACC---A-TA--TTATC
gi|126964                     :            aACT-TT-TTGT-----T-GTGTGTA-CT-------CT---AGTACCTGCA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTCACTAAACT---TA-------TA----A---T------A-G--------T----GGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126965                     :            aACTATT-TTGT-----T-GTGTTCA-CT-------CT---TGCACTCACA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTCACTAAACT---TA-------TA----A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126966                     :            aACT-TT-TTGT-----T-GTGTGGA-GT-------CT---AGCATCCGCA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTCAGTAAACT---TA-------T-----G---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126968                     :            aATT-TT-TTGT-----T-GTGTGCA-CT-------CT---ATCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTCACTTAACT---TA-------T-----A---T------A-G--------T----AGTAAT-A---TAACC---C-TA--ATATC
gi|126969                     :            aACT-TT-TTGT-----T-GTGTGCA-CT-------CT---AACACCTACA----TATTT-C-ATT-----GG-ATCTTCACTAAACT---TATT-----T-----A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAAGC---A-TA--CTATC
gi|126970                     :              aT-TT-TTGT-----T-GTGTGCA-CT-------CT---AACACTTGCA----TTTTC-C-ATT-----CG-ATCTTCACTAAACT---TA-------T-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126971                     :         aactACT-TT-TTGT-----T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCAAACACA----TTTTT-C-ATT-----GG-TTCTTCACTTAACT---TA-------T-----A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACT---A-AA--ATATC
gi|126972                     :             aCT-TTATTGT-----T-GTGTGCC-CT-------CT---AGCACCAACA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTCACTAAACT---TA------------------------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACT---A-TA--ATATC
gi|126973                     :             agT-TT-TTGT-----T-GTGTGCA-CT-------CA---AGCACTCACA----TTTTT-C-ATT-----GA-ATCTTCGCTAAACTTAATA-------T-----G---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ACATC
gi|126974                     :         aactACT-TT-TTGT-----T-GTGTGCG-CT-------CT---AGCACCTGCA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATTTTCACGAAACT---TA-------------A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---AAACC---A-TA--ATTTC
gi|126975                     :              aT-TT-TTGT-----T-GTGTGCA-CT-------TT---AGCACTCGCA----TTTTT-A-ATT-----AG-ATTTTCACTAAACT---TA-------T-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACA---A-TA--ATATC
gi|126976                     :         aacaACT-TT-TTGT-----T-GTATGCT-TT-------CT---AGCACCTGCA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATTTTCACCAAACT---TA-------C-----C---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126977                     :              aT-TT-TTGT-----T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCATTCACA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCCTCAACAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATAT
gi|126979                     :           aactT-TT-TTGT-----T-GTGTGCA-CT-------CT---AGTTCCCAAA----TATTT-C-ATT-----TG-ATCTTCACTAAATT---TA-------T-----A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TACCT---A-TA--ATATC
gi|126980                     :         aactACT-TT-TTGT-----T-GTGTGCC-CT-------CT---AGCACTCGCA----TTTTT-G-ATT-----GG-ATCTTCACCAAACT---TA-------T-----A---T------A-G--------T----AGTTA-------AATCGG-A-TA--ATA
gi|126981                     :            aACG-TT-TTGT-----T-GTATGC--------------------CCCACA----TTTT--C-ATT-----GG-GTCTTCATCAAACT---TA-------T-----A---T------A-G--------T----AGTTAT-G---TAACC---A-CA--ATTTC
gi|126982                     :              aT-TT-TTGT-----T-GTGTGCA-CT-------CTTT-ATCACTCGCA----TTTTT-A-ATT-----GG-ATTTTCACTAAACT---CA-------T-----A---T------A-G--------T----AGTTAT-G---TAACT---A-TA--ATGTC
gi|126983                     :         aactACT-TA-TTGT-----T-GTGCACA-CT-------TT---ATCATCTGCA----TTTTT-C-ATT-----GA-ATCTTCACCAAACT---TG-------T-----G---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-CA--ATATC
gi|126984                     :            aACT-TT-TTTA-T---T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCATCCACA----TTTTG-C-ATT-----AA-ATCTTCACTAAACT---TA-------T-----A---T------A-G--------T----AGTTTT-A---TAA
gi|126986                     :            aACG-TT-TTGT-----T-GTGTTTA-CT-------GT---AGCACCTGCT----TTTTT-C-ATT-----GG-GTCTTCACCAAACT---TA-------C-----A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAATC---G-TA--ATATC
gi|126987                     :            aACT-AT-TTGA-C-C-TTGTGTGCA-CT-------CT---AGCACTCGCA----TTTTC-C-ATT-----TG-ATCCTCACCAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--CTATC
gi|126988                     :            aACT-TT-TTGT-----T-GTCTACA-CT-------GT---AGCACCTGCA----TTTTC-C-ATT-----GA-GTCTTCACCAAACT---TA-------C-----A---G------A-G--------T----TGTTAT-A---TAACC---A-TA--CTATC
gi|126992                     :            aACT-TT-TTGT-----T-GAGTGCG-CT-------CT---GGTATCCGCA----TTTTT-T-ATT-----GG-ATCTTCACTAAACT---TA-------T-----A---T------A-T--------T----TGTTAC-T---TAACC---A-TA--
gi|126993                     :              aT-TT-TTGT-----T-GTGTGCA-CT-------GT---GCCATCCACA----TTTT--C-ATT-----GG-ACCTTCACTTAATT---TAGATATCAT-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126994                     :         aactACT-TT-TTGT-----T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCCCCTGGA----TTTTT-C-ATT--------------AGCA--CT---TA-------T-----A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|126997                     :            aACT-TT-TGGT-----T-GTGTGCA-CT-------CC---AGCATCGTCA----TTTTT-C-ATT-----AG-ATCTTCACAAAACT---TA-------C-----A---T------A-T--------A----AGTTAT-A----AACA---A-CA--ATATC
gi|126998                     :            aACT-TT-TTGT-----T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCAACTATA----TTTTT-C-ATT-----GG-A----------ACT---TA-------C-----A---C------A-A--------T----AGTTAT-A---CAACC---A-TA--TTATC
gi|127000                     :            aACT-TT-TTGT-----T-GTGTACA-TT-------CT---GGCTCAAGCA----TTTTT-C--TT-----TGCATCTTCACCAAATT---TA-------C-----A---T------A-G--------TATTAAATTAT-A---TAACC---C-TA--ATATC
gi|127039                     :            aACT-AT-TTGA-C-C---GTGTGTA-CT-------CT---AGCACCTGTA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTCTCACCAAACT---TA-------T-----T---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127042                     :             ACT-AT-TTGA-C-C-TTGTGTGCG-CT-------AT---AGCACCTTCA----TTTTT-C-ATT-----GG-GTGTTCACCAAACT---TA-------C-----A---T------A-G--------T----TGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127043                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGCA----GTTTT-C-ATT-----AG-ATCTTCATCAAATT---TT-------C-----A---C------A-GTTATT---T----ATTTAT-T---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127044                     : atttttaaatgtACT-AT-TTGAAC-T-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCAGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTCACACCAGCCT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----TGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATGTC
gi|127048                     :             ACT-AT-TTGA-C-C-TTGTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCACA----TT--------------TG-ATCCTCACCACACT---TG-------A-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAATC---A-TA--ATATC
gi|127049                     :             ACT-AT-TTGA-C-C-TTGTGTGCA-CT-------CC---AGCACCCACA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCCTCACCAAATG---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-CA--ATATC
gi|127050                     :             ACT-GT-TTGA-C-C-TTGTGTGCA-GT-------CT---GGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TA-ATTCTCACAAAAAT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATAT
gi|127051                     :             ACT-AT-TTGA-C-C-TTGTGTGAA-CT-------CT---GGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTCTCACCAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTTT-A---TAACT---G-TA--GTATC
gi|127052                     :             ACT-AT-TTGA-C-CCT-GTGCGCA-CT-------CT---AGCACCTACA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCATCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AATTAT-A---TAATC---A-TA--ATATC
gi|127053                     :             ACT-AT-TTGA-C-C-TTGTGTGCA-CT-------CT---GGCACCTGCA----TTTTG-C-ATT-----TG-ATCCGTACTAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----ATTTAT-A---TAACC---A-TG--AGATC
gi|127054                     :             ACT-AT-TTGA-C-TGT-GTGTGCA-CT-------CT---AGTACCCGCA----TTTTT-TTATT-----TG-ATTCTCATTAAATT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----ATTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127055                     :             ACT-TT-TTGG-C-CAT-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCTGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTCTCACCAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127057                     :             ACT-TT-TTGT-----T-GTGTGCA-AT-------CC---AGCACTTGCA----TTTGG-C-ATT-----GG-ATCTTCACCAAATT---TA-------T-----A---T------A-G--------T----AGCTAT-A---TAACC---A-TT--ATATC
gi|127059                     :             ACT-TT-TTGT-T-C-T-GTG--CA-CT-------CC---AGCACTTGCA----TTTGG-C-ATT-----GA-ATCTTCACCAAATT---TA-------T-----A---T------A-G--------T----AGCTAT-A---TAAAC---A-TT--ATATC
gi|127062                     :                -TT-TTAA-C-T-T-GTGTGCA-CTTTAATCTCT---AACACCTACA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTCACCAAACT---TA-------CAAGGTA---C------ATG--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127064                     :           acACT-AT-TTGA-C-C-TTGTGTGCA-CT-------GT---AGCACGAGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCCTCATCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACA---A-TA--TTATC
gi|127066                     :             ACT-AT-TTGA-C-C-TTGTATGCA-CT-------TG---AGCACCCATA----CTTTT-T-ATT-----TA-ATCCTCACCAAACT---CA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTGT-A---TAATC---A-TA--ATATC
gi|127073                     :             ACT-AT-TTGA-C-C-TTGTGTGCA-CT-------CT---AGTATCCACA----TTTTT-C-ATT-----TG-TTCCTTACCAAGCT---TA-------------A---C------A-GTAGTTATAT----AGTTAT-A---TAATC---A-TA--ATATC
gi|127140                     :                            -T-GTGTACA-CT-------CT---AGCATGTGCA----GTTTT-T-ATT-----TG-ATCCTCATTAAACT---GA-------T-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---T-AA--ATATC
gi|127142                     :        ttgttgtT-TT-TTGA-C-C---GTGTGCA-CT-------CC---AGCACCTGCA----TTCTT-C-ATT-----TG-AACCTCACCAATCT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTATAA---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127143                     :               T-TT-TT-------T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACTCGCT----TTTTG-C-ATT-----GT-ATGTACACTGAACT---TA-------A-----A---T------A-G--------T----AATGAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127144                     :             ttT-CT-TTGG-CAT-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACTCTCAGAATTTCTT-C-ATT-----TG-ATCTTCACCAAATT---TA-------C-----A---C------A-G--------T-----GTTAT-A---TAACC---A--A--ATATC
gi|127156                     :                -TT-TTGT-----T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCATCTGAA----TTTTTTC-ATT-----GG-ATCTTCACTAAACT---TA-------T-----A---T------A-G--------T----AGGTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127158                     :                -TT-TTGT-----T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCATA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTATCATCAAACT---TA-------C-----A---A------A-G--------T----AGTTAT-A---TAATC---A-TA--TTATC
gi|127159                     :                -TT-TTG----C-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGTT----TTTTT-C-ATC-----GG-ATTTTCCTTTAAAT---TA-------T-----A---T------A-G--------T----TGTTTT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127168                     :                  T-TTGA-C-T-TTGTGTGCA-TT-------CT---AGTACTCGCA----GCTTT-C-ACT-----TG-ATGTCCACCAAACT---TA-------C-----A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAATC---A-TA--ATATC
gi|127169                     :                  T-TTGG-C-C-TTGTGTGCC-AT-------CT---AGCACCTGCA----TTTTT-C-ATC-----TG-ATTCTTACCAAACT---TA-------T-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127172                     :                  T-TTGA-C-C-TTGTGTCCA-CT-------CT---AGCACCCTCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCTTCATCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AATTAT-A---TAACTAAAA-CA--ATATC
gi|127179                     :                  T-TTGA-C-C-TTGTGTGCA-CT-------CTTTAAGCACCTGCA----TTTTT-A-ATT-----TG-ATCCTCATCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------C----AATTAT-A---TAACC---A-TA--A
gi|127180                     :                  T-TTGA-C-T-T-GTGTGCA-TT-------CT---AGCACCTGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAAGC---A-TA--ACATC
gi|127182                     :                  T-TTGA-----T-GTGTGCA-CA-------CT---AGCACGTGCA----GTTTT-T-ATT-----GG-ATCTTCACCAAACT---TA-------T-----ATACC------G-G--------T----AGTTAC-A---TAAAC---ATTA--ATATC
gi|127183                     :                  T-TTGT-----T-GTGTGCT-CT-------CT---TGCACCAGCA----TTTTT-T-ATT-----GA-ATCTTCACCAAACT---TG-------A-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-G---AAATC---A-TA--ATAT
gi|127186                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------GT---ACTACTCGCA----GTTTT-C-ATT-----TA-ATCTTCACTAAGTT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--CTATC
gi|127209                     :              tttaa-TTGT-C---T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGTA----ATTTT-C-ATT-----GG-ATCTTCACTAAACT---TA-------T-----A---T------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATA
gi|127219                     :                            -T-GAGTGCA-CT-------CT---AGCACTCACA----GTTTA-A-ATT-----TG-ATCTTCATTAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----TGTTAT-G---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127224                     :                         tgt-T-GTGTACA-TT-------CC---AGTACCCATA----TTTTT-C-ATT-----TC-ATCTTCTCTAAACA---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TATCT---A-TG--ATATC
gi|127225                     :                         tgt-T-GTGTGCT-CT-------CT---AGCACTCACA----GTTTA-T-ATT-----TA-ATCTTCATTAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----TGTTAT-T---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127227                     :                         tgt-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCGACA----AATTT-C-ATT-----TG-ATCTTCACCAAACT---GA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TTACC---A-TA--ATATC
gi|127228                     :                         tgt-T-GTATGCAACA-------GT---AGCATTTGCA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTCACTAAACT---TA-------C-----A---C------G-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127229                     :                         tgt-T-GTGAACA-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTCACTAAACT---AA-------C-----A---CTAAACTA-A--------A----AGTTAT-A---TAACT---A-TA--ATATC
gi|127231                     :                         tgt-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCTGCA----TGTTT-A-ATT-----TA-ATCCTCACTAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAA-A---TAACA---A-TA--ATATC
gi|127288                     :                         tgt-T-ATGTGCG-CT-------GT---AGCACCTGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATATTCACCAAACT---TA-------T-----A---C------A-G--------T----AGTCCT-A---TGTCT---A-TA--ATATC
gi|127310                     :                          gt-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGAA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCCTCATCAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--CTATC
gi|127311                     :                           t-T-GTGTGCG-CT-------CT---AGCACCCGAA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTCTCATCAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAGCC---A-TACTATATC
gi|127312                     :                           t-T-GTGTGAT-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCCCCACCAAATT---TG-------A-----A---C------A-G--------C----ATTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127314                     :                           t-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCTCTCGCA----TTTT--C-ATT-----TG-ATCCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AATTAT-A---CTACC---A-TA--ATAT
gi|127324                     :                           t-T-ATGTGCA-CT-------CT---AGCACCAACA----TTTTT-C-ATT-----GC-ATCATTGCCAAACT---GA-------T-----A---C------T-G--------T----AGTTAT-A---AAACC---A-TA--ATATC
gi|127326                     :                           t-T-ATGTGCA-CT-------CT---AGCCCCTGCA----TTATT-T-ATT-----GG-GTCTTCATCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTGT-A---TAACC---A-TA--TTATC
gi|127327                     :                           t-T-GTGTGTA-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-AAG-----TG-ATCCTCACCAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAATC---A-GA--AAATC
gi|127328                     :                           t-T-GTGTGTA-CT-------CT---AGCACCTGCA----ATTTT-C-AAT-----TG-ATCCTCCCCAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--AAATC
gi|127330                     :                           t-T-GTATGCA-CT-------CT---AGTACAAACA----GTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTCATGAGAAT---TA-------G-----A---C------A-A--------T----AGTTAC-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127332                     :                           t-T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCGCCAGCC----GTTTT-C-ATT-----TG-ATTCTCACCAAACT---TA-------T-----A---C------A-G--------T----TGTTAT-A---TTACC---A-CA--ATATC
gi|127372                     :                           t-T-GTGTACA-CT-------CT---AGCACACGCA----TTATT-T-ATT-----TG-ATCCTCAACAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127373                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-TTT-----TG-ATTCTCACAAAACT---TA-------C-----T---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAGCC-----TAT-ATATC
gi|127374                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCATCCACA----TTTTT-C-ATTAATTTTG-TTCCTCACCAAACT---TA-------C-----A---G------A-G--------T----AGTAAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127375                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCATA----TTTTT-C-ATT-----TG-CTTCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAATC---A-TA--ATATC
gi|127376                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------AT---AGCACCCACA----TTTTT-C-ATT-----GG-TTCTTCACTTAACT---TA-------T-----A---T------G-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--AT
gi|127377                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-AATATCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----ATTTAT-A---TAACC---A-CA--ATA
gi|127378                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCTCCCGAA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATCCTCACCACACT---TG-------C-----A---T------A-G--------T----TGTTAT-A---TAACT---A-TA--ATATC
gi|127379                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---GGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTCTCACCAAACT---TG-------C-----T---C------A-G--------T----ATTTAT-A---TAACC---A-CA--ATACC
gi|127383                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCTGCA----TTTTT-T-ATT-----TG-ATTCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-G---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127386                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGTA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTATCACTAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-G---TAACC---A-TG--ATATC
gi|127387                     :                            -T-GTGTGCA-CA-------AT---AGCACTCGCA----TTTTTGC-ATT-----TG-ATCCTCACCAAACT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATA
gi|127388                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------TT---AGCACCCGCA----TTTTC-C-AGT-----TG-ACTCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---A-TA--A
gi|127389                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCAACA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTATCATCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----TGTTAT-A---TAACC---A-TA--ATATC
gi|127390                     :                            -T-GTGTGCA-CT-------CT---AGCACCCGCA----TTTTT-C-ATT-----TG-ATTCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---T-ACC---G-TA--ATTTC
gi|127391                     :                            -T-GTGTGCA-TT-------CT---GGTACTCATA----GCTTT-C-ATT-----TG-ATGTCCACTAAACT---TA-------C-----A---T------A-G--------T----AGTTAT-ATATTAACC---A-TA--ATATC
gi|127411                     :                              -GTGTGCA-CT-------CT---AGCATCCGCA----TTTTT-C-ATT-----CG-ATTCTCACCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTAAT-A---TAATC---A-TA--
gi|127417                     :                                TGTGCA-CT-------CT---AGCACCTGCA----TTTTT-C-AAT-----TG-ATCCTCACCAAATT---TG-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAACC---T-TA--ATATC
gi|127419                     :                                TGTGCA-CT-------CT---AGCACC-GCA----TTTTT-C-ATT-----CG-ATTCTCATCAAACT---TA-------C-----A---C------A-G--------T----AGTTAT-A---TAGCT---A-TA--ATATC
gi|127439                     :                                  TACA-CT-------TT---AGCACCCAAA----TTTTT-C-ATT-----GG-ATCTTGACCAAACT---TA-------T-----A----------A-G--------C----AGTTGT-A---TAACC---A-TA--AGATC