lowQualScore : 22 11111 1 222222222222222222222 2222222222222 11 111 11 1 222 11 11111 44444444444 222222222 11111 222 1 1 11111 1
lowQualScore : 88 4 11111 0 6 999999999999999999999 2222222222222 11 7777 2 2 000 00 2 1 1 2 0 8 9 6 5 66 0 5 5 000 7 44 11 4 4 00000 0 4 55 5 0 22222222222 000000000 00000 1 4 4 8 1 666 222 7 666 4 3 0 5 3 0 55 00000 1 8888 55 2 8 4 6
lowQualScore : .. . ..... . . ..................... ............. .. .... . . ... .. . . . . . . . . . .. . . . ... . .. .. . . ..... . . .. . . ........... ......... ..... . . . . . ... ... . ... . . . . . . .. ..... . .... .. . . . .
lowQualScore : 99 4 11111 3 8 111111111111111111111 0000000000000 55 7777 1 9 444 22 6 1 1 8 3 2 9 0 0 99 0 0 0 444 0 99 99 0 3 00000 5 4 55 0 2 55555555555 000000000 00000 8 0 0 7 9 444 333 5 444 4 6 6 5 6 5 55 00000 2 5555 55 6 2 4 0
consensus : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAAGGTCGT----TCAGTGTCGTGCGTAGAGTGCGG-A-TTATCTAAGGTCNACCATGAGATCTGAATGCCGTTCCGGACTAGCCGTGCTACATAGTTACAGACGTGAGCA-GAT--TGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAA-AATN--CCGGTAAGAAAGCCCGGA-AATGNGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGTCTTA-----CTGTTCTAACGCCGATGATG--GTAACATGAATGTTT-CTTTTTGCACTGAA--G-----GTAA---------TGC-----CGGTCATTAAATAAAA-CG-TCATCAAACTTAA---AAAAN-GTTTAA---CTTATT-TTTGTNATTATTACTATTTTG-TTTTAAAA--CGAGAT-----TACCCAACACCCTTACAA----C--TAGACTATGGCGCTCAACGTGATGGATCGATCACACAACATTGT-TTAAGT
Reference ( gi|149028 ) : ATATCCTGACCTGT-CTGGT-----TGAACTTTTAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAATGGTCGT----TCAGTGTCGTGCGTAGAGTGCGG-A-TTATCTAAGATCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCTGGACTAGTCATGCTGCATAGTTACAAACGTGAACA-GAT--TGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAA-AATC--CCGGTAAAAAAGCCCGGA-AATGTGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCACTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGTCTTA-----CTGTTCTAACGCCGATGACG--GTAACATAAATGTTT-CTTTTTGCACT-----G-----GTAA---------TGC-----CGGTCATTAAATAAAA-CG-TCACCAAACTTAA---AAAAA-ATTGAA---CTTATT-TTTGTAATTATTACTATTTTG-TTTTAAAA--CGAGAT-----TACCCAACACCCTTACAA----C--TAGACTATGGCACTCAATGTGATTGATCGATCACATAACATTGT-TCAAGT
gi|149029 : ATATCCTTCCCTGT-CTGAT-----TGAACCTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAATGGTCGT----TCAGTGTTGTGCGTAGAGTTCGG-A-TTATCTAAGGTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCTGGACTAGTCGTGCTACATAGTTACAGACATGAGCA-GAT--TGACATTGAAAATGTAA-TTT-AAA-AATC--CCGGTAAGAAAGCCCGGA-AATGTGACTTTATCTAGAACT-AGTGGCGCTCAGTTGAATACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGTCTTA-----CTGTTCTAATGTCGATGATG--GTAACATAAATGTTT-CTTTTTACACT-----G-----GTAA---------TGC-----CGACCATTAAATAAAA-CGTTTATCAAACTTAA---AAAAATGTTTAA---CTTATT-TTTGTAATTATTACTATTTTG-TTTTAAAA--CGAGAT-----TACCCAACACCCTTACAA----C--TAGACTATGGCACTCAATGTGATTGATCGATCACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149030 : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAATGGTCGT----TCAATGTCGTACGTAGAGTGCGG-G-TTATCTAG--TCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCTGGACTAGTCATGCTACATAGTTACAGACACGAGCA-GAT--TGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAA-AATC--CCGGTAAGAAAGCCCAGA-AATGTGACTTTATCTCGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGTCTTA-----CTGTTCTAACGTCGATGATG--GTAACATAATTGTTTATTTTTTGCACT-----G-----GTAA---------TGC-----CGGTCATTAAATAAAA-CG-TCATCAAACTTAA---AAAAATGTTTAA---CTTA-T-TTTGTAATTATTACTATTTTG-TTTTAAAA--CGAGAT-----TACCCAACAACCTTACAA----C--TAGACTATGGCACTCAGTGTGATGGATCGACAACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149031 : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TAAACATATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCAGGAAGGTTTT----TCAGTGTCATGCGTAGAGTAAGG-A-TTATCTAACACCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCAGGACTAATCATGCTACATGGTTACAGACGTGAGCA-GAT--TGACATTCGAAATGTAA-TTA-AAATGTTT--TCGATAAGAAAGCCAGGA-AATGAGAC--TATCTAGAATC-AGGAACGCTTAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGTCTTA-----CTGTTCTAACGCCGATGATG--GTAACATAAATGTTT-CTTTTTGTACTGAAACG-----GCAA---------TGC-----CGGTTAT----TAAAA-CG-TCGTCAAACTTCC---AAAAT-GTTTAAAGCCTCATT-
gi|149032 : ATATCCTTACATGC-CTGGT-----TGTACATATAACCAC-------------G-------CCAGT------------------ATCCACAG----CCAGTGTCGTGCGTAGAGTGTAACA-TTATCTGAGGTCTACCATAACATCTGAATGCATTTTCGGACTAGCCGTGCTGCATAGTTACATACATGAGCA-TAT--TGACATTGATAATGTAA-TTACAAA-AATTG-CCGCTAGGAAAGTCCAG---ATTAGATTTTATCTAGAATCGGGGGGCGCTCAGTTGAGAACAAATTGTGACTGAGTGAAAACAGTTTTA-----CTGTCCTAACGCCGATGATG--GTAACATGAATATT
gi|149033 : ATATCCTTTTCTGTACTTATGTACATGTACTTATAACCAT-------------G-------ACAGTATCCACAGCCCTTGCGGAAATGTCGT----TCGGTGTCATGCGTAGAGTGAGG-AATTTTCTAAGGTCTACCATGACATCTGAATGCCTTTCTGGATTAGCCACG
gi|149036 : TATCCTTTCATAT-CTAGT-----TGTACATATAACCACACCAGTATCCACAG-------CCAGT-------------GCAGAAAGGTTGT----TAAACGTCATGCGTAGAGTGAAACA-TTATCTGAGGTCTACCATGACATCTGAACGCCTTTCAAGACTAGCCATGCTACATAGTTACATACATGAGCATGATATTGACATATAGAATGTAA-TTA-CAA-AATGTGCCGGTAGGAAAGCCTGGA---TTAGATTTTATCTAGAATC-GGGGACACTCAGTTGGGTACAAATTGAGATTCTGTTTAAACAGTCTTAGCTTACTGTTTTA--GTT--TAACGTCGTAA----AATGACT-AGTTTTGCA-T-----G-----ACAA-----------------CGGT----------AA-CG-----CAAACTTAAAATAAAAA-ATTG-T---CGTATT-CGTGAGATTGGTATTGTTGTGATTTTA
gi|149035 : TATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTGTAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGA----------------------------AATGCGG-A-TTATCTAACCTCAACAATGAGAGATGAATGCCG--------------CGCT------------ACGGGAGCA-GAT--TGACATTGAAAATATAATTTA-AAA-AATG--CCGGTAcctgattttgtt
gi|149034 : TATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAATGTCAT----TCAtgaa
gi|149037 : TCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------T-------CCAGT-------------GCGGAAATGTCAT----TCAGTGTCATGTGTAGTGTGCAG-A-TTATCTAACGTCAACTATGAGAGCTGAATGCTGCTCTGGACTAGTCATGCTACACAGTTACAGACGTGAGCA-GAT--TGACATTGAAAATGGAATTTA-AAA-AA
gi|149038 : TTATAACCAT-------------ATCAGAATCCAGT-------------GCGGAAAGGTTGTTCAGTCAGTGTCATGCGTAGAGTG
gi|149039 : GT----TCAGTGTCATGCGTAGAGTGAAG-AATTATCTGAGGTCTACCATGACATCTTAACACCTTTTCAGACTAGCTGTGCTACATAGTTACAGGCATGAGCA-GAC--TGACATTGAGAATGTAA-ATA-CAA-AATTTGCCAGTAAGAAAGTCCAGACAATA-GACTTTATCTAGAATC-AGGGATGCTCAGTTAAGTACAAA-TGTGACTGTGTAAAGACAGTCTTA-----CTGTTTCAACGGCGATGATG--GTAACATGAATATTT-GTTTTTGCATT-----------GCAA---------CGC-----TG
gi|149040 : ATG--CCGGTAAGAAAGCT-GGA-AATG--ACTTTTTCTAGAACC-AGGGGTGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTTAAGACAGTCTTA-----CTGTTCTAACGCCAATGATG--GTAACATAAATGTTT-CATTTTGCACTGAAC-G-----GTAA---------TGC-----CGGTCATTAAATAAAA-CA-TCATCAAACTTAA---AAAAT-GTTTAA---CTTA-T-TTTGTAAATATTACTATTTTG-TTTTAAAA--CGAAAT-----TACCCAGCACCCTTACAA----C--TAGACTATGGCACTCAATGTGATGGATCAATCACACAATATTGT-TTAAGTcagcggtaatgtcttgcttcaaaaaacgaattttctgtcttattcatgagattggtattgttgtgatttttacctgactttgttcaggcggtcattaaataagacatcaacaaacttcaaaaatgtttaaaaacaagattactcaacactctgacaactaaactaatgcatcaacaaaatggatcaatcacacaacattgtttaagt
gi|149041 : --CCGGAAGCACAGCCCGGA-AATGTGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAATACAGTCTAA-----CTGTTCTAACGCCGATGATG--GTAACATAAATGTTT-CGTTTTGCACTGAAC-G-----GTAA---------TGC-----CGGTCATTAAATAAAA-CA-TCATAAAACTTAG---AAAAT-GTT-AA---CTTA-T-TTTGTAATTATTACTATTTTG-TTTTAAAA--C----------TA----------TT-----------TAAACTATGGCACTCAATGTGATGGATCAATCACACAACATCGT-TTAAGT
gi|149042 : --CCGGTAAGAAAGTCCAGA-TATATGACTTTATCTAGAACT-AGGGG
gi|149043 : GTCCGGA-AATTAGACTTTATCTAGAATC-GGGGACGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGATTGTGTGATGACAGT-------------------GTCGATGATG--GTAACATGAATATTT-CTTTTTGAACG-----GCCACAGTAAAACGTACTTTGTTCAGGCGGTTATGAAAAAAAAACG-TGAACAAACTTCA---AAAAT-GTTTAA---CTTATTATTTGTTATTATTACTTTTTTG-TTAAAAAAAACGAGAT-----AACCTAAAACCCTAACTA----C--TAGAC-------------GTGATGGATCGATCACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149044 : TTGTGAAGATTGTTTCA-----CTCTTCTAACGTTGGTGTTG--GTAACATGAATG
gi|149039 : -----CGGTCATTAAATAAGA-CA-TCAACAAACTTCA---AAAA
gi|149045 : gttcagtgtcatgcgtagagtgaagaattatctgaggtctaccatgacatcttaacaccttttcagactagctgtgctacatagttacaggcatgagcagactgacattgagaatgtaaatacaaaatttgccagtaagaaagtccagacaatagactttatctagaatcagggatgctcagttaagtacaaatgtgactgtgtaaagacagtcttactgtttcaacggcgatgatggtaacatgaatatttgtttttgcattgcaacgctgcagcggtaatgtcttgcttcaaaaaacgaattttctgtcttattcatgagattggtattgttgtgatttttacctgactttgttcagg-----CGGTCGTTAAAGAAAA-CG-TCATCAAACTTCA---AATAT-GTTTAA---CTTATT-TT-GTTATTATTACTCTTTTG-TTTAAAAA--CGAGAA-----TGCTCAACACCCTAACAA----C--TACACTATGGTGCTAAACGTGATGGATCGATCCCTAAAAATTGT-TTAAGTtgtttaaaaacaagattactcaacactctgacaactaaactaatgcatcaacaaaatggatcaatcacacaacattgtttaagt
gi|149046 : ttttacctgactcaggAAATAAAA-CG-TCATCAAACTTCA---AAATATATT-AA---CTTATT-TT-GTTATTATTACTATTTTG-TTTAAAAA--CGAGATAAGCCTACTTAACACCCTAACAA----C--TAGACTATGGCGCTCAACGTGATGGATCGATCACTAAACATTGTGTTAAGT
gi|149047 : AAGTTTAA---TAAGC-CTTTAA---CTTATT-TT-ATTATTATTACTATTTTG-TTTTAAGA--CGAGAT-----TGCCCAACACCCTTACAAATAGCTATAGACAATGGCTCTCAATGTGATGGATCGATCACACAA
gi|149048 : AA---CTTATT-TT-GTTATTATTACTATTTTG-TTTTAAAA--CAAAAT-----TACCCAGCACGTTTACAA----C--TAGACTATGGCACTCAATGTGATGGATCAATCACACAACATCGT-TTAAGT
gi|149039 : tTG-TTTAAAAA--CAAGAT-----TACTCAACACTCTGACAA----C--TAAACTAATGCA-TCAACAAAATGGATCAATCACACAACATTGT-TTAAGT
Alignments
lowQualScore : 11111 222222222222222222222 2222222222222 11 111111 444444444 1111111 11
lowQualScore : 4 00000 555555555555555555555 0000000000000 1 7777 1 1 888 1 2 5 0 4 66 8 4 4 55 1 3 3 77 3 99999 99999 4 66 222222 222222222 4444444 55 2 3 3 00 3 8888888 555 2 3 7 1 44 44 55 99999 0 7777 55 4 2 4
lowQualScore : . ..... ..................... ............. . .... . . ... . . . . . .. . . . .. . . . .. . ..... ..... . .. ...... ......... ....... .. . . . .. . ....... ... . . . . .. .. .. ..... . .... .. . . .
lowQualScore : 0 00000 555555555555555555555 0000000000000 4 1111 0 6 555 0 5 5 1 4 11 9 4 4 00 0 6 6 44 6 11111 11111 4 11 888888 444444444 4444444 00 2 3 3 66 1 0000000 000 3 1 3 0 66 22 00 11111 3 7777 00 7 5 0
consensus : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAAGGTCGT----TCAGTGTCGTGCGTAGAGTGCGG-A-TTATCTAAGGTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCCGGACTAGCCGTGCTACATAGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAA-AA--TGCCGGTAAGAA-AGCCCGGA-AATGNGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATGAATGTTT-CT--TTTTG------CACTG---A-A--GGTAAT-------GC--CGGTCATTAAATAAAA-CG-TCATCAAACTT-AAAAA-ATG-----TTTAA---CTTATT-TTTGTNATTATTACT--ATTTTG--TTTTAAAA--CGAGAT-----TACCCAACACCCTTACAA----C--TAGACTATGGCACTCAACGTGATGGATCGATCACACAACATTGT-TTAAGT
Reference ( family-789 ) : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAAGGTCGT----TCAGTGTCGTGCGTAGAGTGCGG-A-TTATCTAAGGTCNACCATGAGATCTGAATGCCGTTCCGGACTAGCCGTGCTACATAGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAA-AA--TNCCGGTAAGAA-AGCCCGGA-AATGNGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATGAATGTTT-CT--TTTTG------CACTG---A-A--GGTAAT-------GC--CGGTCATTAAATAAAA-CG-TCATCAAACTT-AAAAA-ANG-----TTTAA---CTTATT-TTTGTNATTATTACT--ATTTTG--TTTTAAAA--CGAGAT-----TACCCAACACCCTTACAA----C--TAGACTATGGCGCTCAACGTGATGGATCGATCACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149028 : ATATCCTGACCTGT-CTGGT-----TGAACTTTTAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAATGGTCGT----TCAGTGTCGTGCGTAGAGTGCGG-A-TTATCTAAGATCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCTGGACTAGTCATGCTGCATAGTTACAAACGTGAACA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAA-AA--TCCCGGTAAAAA-AGCCCGGA-AATGTGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCACTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGACGGTAACATAAATGTTT-CT--TTTTG------CACT---------GGTAAT-------GC--CGGTCATTAAATAAAA-CG-TCACCAAACTT-AAAAA-AAA-----TTGAA---CTTATT-TTTGTAATTATTACT--ATTTTG--TTTTAAAA--CGAGAT-----TACCCAACACCCTTACAA----C--TAGACTATGGCACTCAATGTGATTGATCGATCACATAACATTGT-TCAAGT
gi|149029 : ATATCCTTCCCTGT-CTGAT-----TGAACCTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAATGGTCGT----TCAGTGTTGTGCGTAGAGTTCGG-A-TTATCTAAGGTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCTGGACTAGTCGTGCTACATAGTTACAGACATGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTT-AAA-AA--TCCCGGTAAGAA-AGCCCGGA-AATGTGACTTTATCTAGAACT-AGTGGCGCTCAGTTGAATACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAATGTCGATGATGGTAACATAAATGTTT-CT--TTTTA------CACT---------GGTAAT-------GC--CGACCATTAAATAAAA-CGTTTATCAAACTTAAAAAA-ATG-----TTTAA---CTTATT-TTTGTAATTATTACT--ATTTTG--TTTTAAAA--CGAGAT-----TACCCAACACCCTTACAA----C--TAGACTATGGCACTCAATGTGATTGATCGATCACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149030 : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAATGGTCGT----TCAATGTCGTACGTAGAGTGCGG-G-TTATCTA--GTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCTGGACTAGTCATGCTACATAGTTACAGACACGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAA-AA--TCCCGGTAAGAA-AGCCCAGA-AATGTGACTTTATCTCGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGTCGATGATGGTAACATAATTGTTTATT--TTTTG------CACT---------GGTAAT-------GC--CGGTCATTAAATAAAA-CG-TCATCAAACTTAAAAAA-ATG-----TTTAA---CTTA-T-TTTGTAATTATTACT--ATTTTG--TTTTAAAA--CGAGAT-----TACCCAACAACCTTACAA----C--TAGACTATGGCACTCAGTGTGATGGATCGACAACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149031 : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TAAACATATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCAGGAAGGTTTT----TCAGTGTCATGCGTAGAGTAAGG-A-TTATCTAACACCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCAGGACTAATCATGCTACATGGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTCGAAATGTAA-TTA-AAATGT--TTTCGATAAGAA-AGCCAGGA-AATGAGAC--TATCTAGAATC-AGGAACGCTTAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATAAATGTTT-CT--TTTTG------TACTG---A-AACGGCAAT-------GC--CGGTTAT----TAAAA-CG-TCGTCAAACTT-CCAAA-ATG-----TTTAAAGCCTCATT-
gi|149032 : ATATCCTTACATGC-CTGGT-----TGTACATATAACCAC-------------G-------CCAGT-------------ATCCACAG---------CCAGTGTCGTGCGTAGAGTGTAACA-TTATCTGAGGTCTACCATAACATCTGAATGCATTTTCGGACTAGCCGTGCTGCATAGTTACATACATGAGCA-T--ATTGACATTGATAATGTAA-TTACAAA-AAT-TGCCGCTAGGAA-AGTCCAG---ATTAGATTTTATCTAGAATCGGGGGGCGCTCAGTTGAGAACAAATTGTGACTGAGTGAAAACAGT-----TTTACTGT-----CCTAACGCCGATGATGGTAACATGAATATT
gi|149033 : ATATCCTTTTCTGTACTTATGTACATGTACTTATAACCAT-------------G-------ACAGTATCCACAGCCCTTGCGGAAATGTCGT----TCGGTGTCATGCGTAGAGTGAGG-AATTTTCTAAGGTCTACCATGACATCTGAATGCCTTTCTGGATTAGCC
gi|149034 : TATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAATGTCAT----TCAacg
gi|149035 : TATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTGTAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAA----------------------------TGCGG-A-TTATCTAACCTCAACAATGAGAGATGAAT--------------GCCGCGCT------------ACGGGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATATAATTTA-AAA-AA--TGCCGGTATGAA-
gi|149036 : TATCCTTTCATAT-CTAGT-----TGTACATATAACCACACCAGTATCCACAG-------CCAGT-------------GCAGAAAGGTTGT----TAAACGTCATGCGTAGAGTGAAACA-TTATCTGAGGTCTACCATGACATCTGAACGCCTTTCAAGACTAGCCATGCTACATAGTTACATACATGAGCATGATATTGACATATAGAATGTAA-TTA-CAA-AATGTGCCGGTAGGAA-AGCCTGG---ATTAGATTTTATCTAGAATC-GGGGACACTCAGTTGGGTACAAATTGAGATTCTGTTTAAACAGTCTTAGCTTACTGTTTTAGTTTAACGTC-------GTAAAATGA-------CTAGTTTTG------CA-TG---ACAACGGTAAC-------GC--AAA-CTTAAAATAAAA-AA-TTGTCGTATTC-GTGAG-A--------TTGG-----TATT-GTTGTGATT-TTACCTGATTTTG--TT
gi|149037 : TCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------T-------CCAGT-------------GCGGAAATGTCAT----TCAGTGTCATGTGTAGTGTGCAG-A-TTATCTAACGTCAACTATGAGAGCTGAATGCTGCTCTGGACTAGTCATGCTACACAGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGGAATTTA-AAA-AA--
gi|149038 : TTATAACCAT-------------ATCAGAATCCAGT-------------GCGGAAAGGTTGTTCAGTCAGTGTCATGCGTAGAGTG
gi|149039 : GT----TCAGTGTCATGCGTAGAGTGAAG-AATTATCTGAGGTCTACCATGACATCTTAACACCTTTTCAGACTAGCTGTGCTACATAGTTACAGGCATGAGCA-G--ACTGACATTGAGAATGTAA-ATA-CAA-AATTTGCCAGTAAGAA-AGTCCAGACAAT-AGACTTTATCTAGAATC-AGGGATGCTCAGTTAAGTACAAA-TGTGACTGTGTAAAGACAGT-----CTTACTGT-----TTCAACGGCGATGATGGTAACATGAATATTT-GT--TTTTG------CATTGC--A-A--CGC--T-------GCAGCGGT----------AA-TG-TCTT---GCTTCAAAAA-ACGAATTTTCTGT---CTTATT-CATGAGATTGGTATT--GTTGTGATTTTTA
gi|149039 : --CGGTCATTAAATAAGA-CA-TCAACAAACTT-CAAAA-ATG-----TTTAA---cctgactttgttcaggcggtcattaaataagacatcaacaaacttcaaaaatgtttaaaaacaagattactcaacactctgacaactaaactaatgcatcaacaaaatggatcaatcacacaacattgtttaagt
gi|149039 : gttcagtgtcatgcgtagagtgaagaattatctgaggtctaccatgacatcttaacaccttttcagactagctgtgctacatagttacaggcatgagcagactgacattgagaatgtaaatacaaaatttgccagtaagaaagtccagacaatagactttatctagaatcagggatgctcagttaagtacaaatgtgactgtgtaaagacagtcttactgtttcaacggcgatgatggtaacatgaatatttgtttttgcattgcaacgctgcagcggtaatgtcttgcttcaaaaaacgaattttctgtcttattcatgagattggtattgttgtgatttttacctgactttgttcaggTG--TTTAAAAA--CAAGAT-----TACTCAACACTCTGACAA----C--TAAACTAATGCA-TCAACAAAATGGATCAATCACACAACATTGT-TTAAGTaaacaagattactcaacactctgacaactaaactaatgcatcaacaaaatggatcaatcacacaacattgtttaagt
gi|149040 : gttcagtgtcatgcgtagagtgaagaattatctgaggtctaccatgacatcttaacaccttttcagactagctgtgctacatagttacaggcatgagcagactgacattgagaatgtaaatacaaaatttgccagtaagaaagtccagacaatagactttatctagaatcagggatgctcagttaagtacaaatgtgactgtgtaaagacagtcttactgtttcaacggcgatgatggtaacatgaatatttgtttttgcattgcaacgctgcagcggtaatgtcttgcttcaaaaaacgaattttctgtcttattcatgagattggtattgttgtgatttttacctgactttgttcaggcggtcattaaataagacatcaacaaacttcaaaaaA--TGCCGGTAAGAA-AGCT-GGA-AATG--ACTTTTTCTAGAACC-AGGGGTGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTTAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCAATGATGGTAACATAAATGTTT-CA--TTTTG------CACTG---A-AC-GGTAAT-------GC--CGGTCATTAAATAAAA-CA-TCATCAAACTT-AAAAA-ATG-----TTTAA---CTTA-T-TTTGTAAATATTACT--ATTTTG--TTTTAAAA--CGAAAT-----TACCCAGCACCCTTACAA----C--TAGACTATGGCACTCAATGTGATGGATCAATCACACAATATTGT-TTAAGT
gi|149041 : CCGG-AAGCACAGCCCGGA-AATGTGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAATACAGT-----CTAACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATAAATGTTT-CG--TTTTG------CACTG---A-AC-GGTAAT-------GC--CGGTCATTAAATAAAA-CA-TCATAAAACTT-AGAAA-ATG------TTAA---CTTA-T-TTTGTAATTATTACT--ATTTTG--TTTTAAAA--C----------TA----------TT-----------TAAACTATGGCACTCAATGTGATGGATCAATCACACAACATCGT-TTAAGT
gi|149042 : CCGGTAAGAA-AGTCCAGA-TATATGACTTTATCTAGAACT-AGGGG
gi|149043 : GTCCGGA-AATTAGACTTTATCTAGAATC-GGGGACGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGATTGTGTGATGACAGT------------------------GTCGATGATGGTAACATGAATATTT-CT--TTTTGAACGGCCACAGTAAA-A--CGTACTTTGTTCAGG--CGGTTATGAAAAAAAAACG-TGAACAAACTT-CAAAA-ATG-----TTTAA---CTTATTATTTGTTATTATTACT--TTTTTG--TTAAAAAAAACGAGAT-----AACCTAAAACCCTAACTA----C--TAGAC-------------GTGATGGATCGATCACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149044 : TTGTGAAGATTGT-----TTCACTCT-----TCTAACGTTGGTGTTGGTAACATGAATG
gi|149045 : --CGGTCGTTAAAGAAAA-CG-TCATCAAACTT-CAAAT-ATG-----TTTAA---CTTATT-TT-GTTATTATTACT--CTTTTG--TTTAAAAA--CGAGAA-----TGCTCAACACCCTAACAA----C--TACACTATGGTGCTAAACGTGATGGATCGATCCCTAAAAATTGT-TTAAGT
gi|149046 : ttttacctgactcaggAAATAAAA-CG-TCATCAAACTT-CAAAATATA-----TT-AA---CTTATT-TT-GTTATTATTACT--ATTTTG--TTTAAAAA--CGAGATAAGCCTACTTAACACCCTAACAA----C--TAGACTATGGCGCTCAACGTGATGGATCGATCACTAAACATTGTGTTAAGT
gi|149047 : AAGTTT-AATAA-GCC-----TTTAA---CTTATT-TT-ATTATTATTACT--ATTTTG--TTTTAAGA--CGAGAT-----TGCCCAACACCCTTACAAATAGCTATAGACAATGGCTCTCAATGTGATGGATCGATCACACAA
gi|149048 : TAA---CTTATT-TT-GTTATTATTACT--ATTTTG--TTTTAAAA--CAAAAT-----TACCCAGCACGTTTACAA----C--TAGACTATGGCACTCAATGTGATGGATCAATCACACAACATCGT-TTAAGT
Alignments
lowQualScore : 11111 222222222222222222222 2222222222222 11 111111 6666666666666666 1111111 1111111111 1111111 1111111111 111111111
lowQualScore : 4 00000 555555555555555555555 0000000000000 1 7777 1 1 888 1 2 5 0 4 66 8 4 55 666 3 3 77 3 99999 99999 4 66 222222 0000000000000000 4444444 2 3 88 777 3 0 6666 555 44 2 3 7 1 99 4444444444 3 55 99999 1111111 3 7777 55 5555555555 3 2 444444444 7777 4
lowQualScore : . ..... ..................... ............. . .... . . ... . . . . . .. . . .. ... . . .. . ..... ..... . .. ...... ................ ....... . . .. ... . . .... ... .. . . . . .. .......... . .. ..... ....... . .... .. .......... . . ......... .... .
lowQualScore : 0 00000 555555555555555555555 0000000000000 4 1111 0 6 555 4 5 5 1 4 11 9 4 00 444 6 6 44 6 11111 11111 4 11 888888 2222222222222222 4444444 4 6 66 444 3 5 5555 444 22 3 1 3 0 22 6666666666 6 00 11111 8888888 6 7777 00 9999999999 6 5 555555555 7777 0
consensus : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAAGGTCGT----TCAGTGTCGTGCGTAGAGTGCGG-A-TTATCTAAGGTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCCGGACTAGCCGTGCTACATAGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAAAA--TG---CCGGTAAGAA-AGCCCGGA-AATGNGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATGAATGTTT-CT--TTTTG------CACTG---A-A---------GGTAAT-------GCCGGTCATTAAATAAAA-CG--TCATCAAACTT-AAAAA-ATGTTTA----A---CT--TATT-TTTGTNATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAGAT-----TACCCAAC-------ACCCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAACGTGATGGATC---------GATC----ACACAACATTGT-TTAAGT
Reference ( family-789 ) : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAAGGTCGT----TCAGTGTCGTGCGTAGAGTGCGG-A-TTATCTAAGGTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCCGGACTAGCCGTGCTACATAGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAAAA--TG---CCGGTAAGAA-AGCCCGGA-AATGNGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATGAATGTTT-CT--TTTTG------CACTG---A-A---------GGTAAT-------GCCGGTCATTAAATAAAA-CG--TCATCAAACTT-AAAAA-ATGTTTA----A---CT--TATT-TTTGTNATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAGAT-----TACCCAAC-------ACCCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAACGTGATGGATC---------GATC----ACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149028 : ATATCCTGACCTGT-CTGGT-----TGAACTTTTAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAATGGTCGT----TCAGTGTCGTGCGTAGAGTGCGG-A-TTATCTAAGATCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCTGGACTAGTCATGCTGCATAGTTACAAACGTGAACA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAAAA--TC---CCGGTAAAAA-AGCCCGGA-AATGTGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCACTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGACGGTAACATAAATGTTT-CT--TTTTG------CACT----------------GGTAAT-------GCCGGTCATTAAATAAAA-CG--TCACCAAACTT-AAAAA-AAATTGA----A---CT--TATT-TTTGTAATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAGAT-----TACCCAAC-------ACCCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAATGTGATTGATC---------GATC----ACATAACATTGT-TCAAGT
gi|149029 : ATATCCTTCCCTGT-CTGAT-----TGAACCTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAATGGTCGT----TCAGTGTTGTGCGTAGAGTTCGG-A-TTATCTAAGGTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCTGGACTAGTCGTGCTACATAGTTACAGACATGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTT-AAAAA--TC---CCGGTAAGAA-AGCCCGGA-AATGTGACTTTATCTAGAACT-AGTGGCGCTCAGTTGAATACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAATGTCGATGATGGTAACATAAATGTTT-CT--TTTTA------CACT----------------GGTAAT-------GCCGACCATTAAATAAAA-CGT-TTATCAAACTTAAAAAA-ATGTTTA----A---CT--TATT-TTTGTAATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAGAT-----TACCCAAC-------ACCCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAATGTGATTGATC---------GATC----ACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149030 : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAATGGTCGT----TCAATGTCGTACGTAGAGTGCGG-G-TTATCTA--GTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCTGGACTAGTCATGCTACATAGTTACAGACACGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAAAA--TC---CCGGTAAGAA-AGCCCAGA-AATGTGACTTTATCTCGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGTCGATGATGGTAACATAATTGTTTATT--TTTTG------CACT----------------GGTAAT-------GCCGGTCATTAAATAAAA-CG--TCATCAAACTTAAAAAA-ATGTTTA----A---CT--TA-T-TTTGTAATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAGAT-----TACCCAAC-------AACCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAGTGTGATGGATC---------GACA----ACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149031 : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TAAACATATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCAGGAAGGTTTT----TCAGTGTCATGCGTAGAGTAAGG-A-TTATCTAACACCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCAGGACTAATCATGCTACATGGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTCGAAATGTAA-TT---AAAA--TGTTTTCGATAAGAA-AGCCAGGA-AATGAGAC--TATCTAGAATC-AGGAACGCTTAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATAAATGTTT-CT--TTTTG------TACTG---A-AAC-------GGCAAT-------GCCGGTTAT----TAAAA-CG--TCGTCAAACTT-CCAAA-ATGTTTA----AAGCCT--CATT-
gi|149032 : ATATCCTTACATGC-CTGGT-----TGTACATATAACCAC-------------G-------CCAGT-------------ATCCACAG---------CCAGTGTCGTGCGTAGAGTGTAACA-TTATCTGAGGTCTACCATAACATCTGAATGCATTTTCGGACTAGCCGTGCTGCATAGTTACATACATGAGCA-T--ATTGACATTGATAATGTAA-TTACAAAAAT-TG---CCGCTAGGAA-AGTCCAG---ATTAGATTTTATCTAGAATCGGGGGGCGCTCAGTTGAGAACAAATTGTGACTGAGTGAAAACAGT-----TTTACTGT-----CCTAACGCCGATGATGGTAACATGAATATT
gi|149033 : ATATCCTTTTCTGTACTTATGTACATGTACTTATAACCAT-------------G-------ACAGTATCCACAGCCCTTGCGGAAATGTCGT----TCGGTGTCATGCGTAGAGTGAGG-AATTTTCTAAGGTCTACCATGACATCTGAATGCCTTTCTGGATTAGCC
gi|149034 : TATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAATGTCAT----TCAacg
gi|149035 : TATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTGTAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAA----------------------------TGCGG-A-TTATCTAACCTCAACAATGAGAGATGAAT--------------GCCGCGCT------------ACGGGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATATAATTTA-AAAAA--TG---CCGGTATGAA-
gi|149036 : TATCCTTTCATAT-CTAGT-----TGTACATATAACCACACCAGTATCCACAG-------CCAGT-------------GCAGAAAGGTTGT----TAAACGTCATGCGTAGAGTGAAACA-TTATCTGAGGTCTACCATGACATCTGAACGCCTTTCAAGACTAGCCATGCTACATAGTTACATACATGAGCATGATATTGACATATAGAATGTAA-TTA-CAAAATGTG---CCGGTAGGAA-AGCCTGG---ATTAGATTTTATCTAGAATC-GGGGACACTCAGTTGGGTACAAATTGAGATTCTGTTTAAACAGTCTTAGCTTACTGTTTTAGTTTAACGTC-------GTAAAATGA-------CTAGTTTTG------CA-TG---ACAAC-------GGTAAC-------GCAAA-CTTAAAATAAAA-AA--TTGTCGTATTC-GTGAG-A---TTG----G-------TATT-GTTGTGATT-TTACCTGATTTTGTT----------
gi|149037 : TCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------T-------CCAGT-------------GCGGAAATGTCAT----TCAGTGTCATGTGTAGTGTGCAG-A-TTATCTAACGTCAACTATGAGAGCTGAATGCTGCTCTGGACTAGTCATGCTACACAGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGGAATTTA-AAAAA--
gi|149038 : TTATAACCAT-------------ATCAGAATCCAGT-------------GCGGAAAGGTTGTTCAGTCAGTGTCATGCGTAGAGTG
gi|149039 : GT----TCAGTGTCATGCGTAGAGTGAAG-AATTATCTGAGGTCTACCATGACATCTTAACACCTTTTCAGACTAGCTGTGCTACATAGTTACAGGCATGAGCA-G--ACTGACATTGAGAATGTAA-ATA-CAAAATTTG---CCAGTAAGAA-AGTCCAGACAAT-AGACTTTATCTAGAATC-AGGGATGCTCAGTTAAGTACAAA-TGTGACTGTGTAAAGACAGT-----CTTACTGT-----TTCAACGGCGATGATGGTAACATGAATATTT-GT--TTTTG------CATTGC--A-ACGCTGCAGCGGTAAT-------GTCTTGCTTCAA--AAAA-CGAATTTTCTGTCTT-A--------TTCATGAGA---TTGGTATT-GTTGTGATTTTTACCTGACTTTGTTCAGGCGGTCATTAAATA--AGACAT-----CAACAAACTTCAAAAATGTTTAAAAA----C--AAGATTACTCAACACTCTGACAACTAAAC-TAATGCATCAACAAAATGGATCAATCACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149040 : A--TG---CCGGTAAGAA-AGCT-GGA-AATG--ACTTTTTCTAGAACC-AGGGGTGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTTAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCAATGATGGTAACATAAATGTTT-CA--TTTTG------CACTG---A-AC--------GGTAAT-------GCCGGTCATTAAATAAAA-CA--TCATCAAACTT-AAAAA-ATGTTTA----A---CT--TA-T-TTTGTAAATATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAAAT-----TACCCAGC-------ACCCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAATGTGATGGATC---------AATC----ACACAATATTGT-TTAAGT
gi|149041 : ---CCGG-AAGCACAGCCCGGA-AATGTGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAATACAGT-----CTAACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATAAATGTTT-CG--TTTTG------CACTG---A-AC--------GGTAAT-------GCCGGTCATTAAATAAAA-CA--TCATAAAACTT-AGAAA-ATG-TTA----A---CT--TA-T-TTTGTAATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--C----------TA-----------------TT------------TAAACTA----------TGGC-ACTCAATGTGATGGATC---------AATC----ACACAACATCGT-TTAAGT
gi|149042 : ---CCGGTAAGAA-AGTCCAGA-TATATGACTTTATCTAGAACT-AGGGG
gi|149043 : GTCCGGA-AATTAGACTTTATCTAGAATC-GGGGACGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGATTGTGTGATGACAGT------------------------GTCGATGATGGTAACATGAATATTT-CT--TTTTGAACGGCCACAGTAAA-A---------CGTACTTTGTTCAGGCGGTTATGAAAAAAAAACG--TGAACAAACTT-CAAAA-ATGTTTA----A---CT--TATTATTTGTTATTATTACT--TTTTTGTT----------AAAAA-AAACGAGAT-----AACCTAAA-------ACCCTA-ACTA----C--TAGAC------------------------GTGATGGATC---------GATC----ACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149044 : TTGTGAAGATTGT-----TTCACTCT-----TCTAACGTTGGTGTTGGTAACATGAATG
gi|149045 : CGGTCGTTAAAGAAAA-CG--TCATCAAACTT-CAAAT-ATGTTTA----A---CT--TATT-TT-GTTATTATTACT--CTTTTGTT----------TAAAA-A--CGAGAA-----TGCTCAAC-------ACCCTA-ACAA----C--TACACTA----------TGGT-GCTAAACGTGATGGATC---------GATC----CCTAAAAATTGT-TTAAGT
gi|149046 : ttttacctgactcaggAAATAAAA-CG--TCATCAAACTT-CAAAATATATT-A----A---CT--TATT-TT-GTTATTATTACT--ATTTTGTT----------TAAAA-A--CGAGATAAGCCTACTTAAC-------ACCCTA-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-GCTCAACGTGATGGATC---------GATC----ACTAAACATTGTGTTAAGT
gi|149047 : AAGTTT-AATAA-GCCTTTA----A---CT--TATT-TT-ATTATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAG-A--CGAGAT-----TGCCCAAC-------ACCCTT-ACAAATAGCTATAGACAA----------TGGC-TCTCAATGTGATGGATC---------GATC----ACACAA
gi|149048 : TA----A---CT--TATT-TT-GTTATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CAAAAT-----TACCCAGC-------ACGTTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAATGTGATGGATC---------AATC----ACACAACATCGT-TTAAGT
Alignments
lowQualScore : 11111 222222222222222222222 2222222222222 11 111111 6666666666666666 1111111 1111111111 1111111 1111111111 111111111
lowQualScore : 4 00000 555555555555555555555 0000000000000 1 7777 1 1 888 1 2 5 0 4 66 8 4 55 666 3 3 77 3 99999 99999 4 66 222222 0000000000000000 4444444 2 3 88 777 3 0 6666 555 44 2 3 7 1 99 4444444444 3 55 99999 1111111 3 7777 55 5555555555 3 2 444444444 7777 4
lowQualScore : . ..... ..................... ............. . .... . . ... . . . . . .. . . .. ... . . .. . ..... ..... . .. ...... ................ ....... . . .. ... . . .... ... .. . . . . .. .......... . .. ..... ....... . .... .. .......... . . ......... .... .
lowQualScore : 0 00000 555555555555555555555 0000000000000 4 1111 0 6 555 4 5 5 1 4 11 9 4 00 444 6 6 44 6 11111 11111 4 11 888888 2222222222222222 4444444 4 6 66 444 3 5 5555 444 22 3 1 3 0 22 6666666666 6 00 11111 8888888 6 7777 00 9999999999 6 5 555555555 7777 0
consensus : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAAGGTCGT----TCAGTGTCGTGCGTAGAGTGCGG-A-TTATCTAAGGTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCCGGACTAGCCGTGCTACATAGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAAAA--TG---CCGGTAAGAA-AGCCCGGA-AATGNGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATGAATGTTT-CT--TTTTG------CACTG---A-A---------GGTAAT-------GCCGGTCATTAAATAAAA-CG--TCATCAAACTT-AAAAA-ATGTTTA----A---CT--TATT-TTTGTNATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAGAT-----TACCCAAC-------ACCCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAACGTGATGGATC---------GATC----ACACAACATTGT-TTAAGT
Reference ( family-789 ) : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAAGGTCGT----TCAGTGTCGTGCGTAGAGTGCGG-A-TTATCTAAGGTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCCGGACTAGCCGTGCTACATAGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAAAA--TG---CCGGTAAGAA-AGCCCGGA-AATGNGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATGAATGTTT-CT--TTTTG------CACTG---A-A---------GGTAAT-------GCCGGTCATTAAATAAAA-CG--TCATCAAACTT-AAAAA-ATGTTTA----A---CT--TATT-TTTGTNATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAGAT-----TACCCAAC-------ACCCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAACGTGATGGATC---------GATC----ACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149028 : ATATCCTGACCTGT-CTGGT-----TGAACTTTTAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAATGGTCGT----TCAGTGTCGTGCGTAGAGTGCGG-A-TTATCTAAGATCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCTGGACTAGTCATGCTGCATAGTTACAAACGTGAACA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAAAA--TC---CCGGTAAAAA-AGCCCGGA-AATGTGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCACTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGACGGTAACATAAATGTTT-CT--TTTTG------CACT----------------GGTAAT-------GCCGGTCATTAAATAAAA-CG--TCACCAAACTT-AAAAA-AAATTGA----A---CT--TATT-TTTGTAATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAGAT-----TACCCAAC-------ACCCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAATGTGATTGATC---------GATC----ACATAACATTGT-TCAAGT
gi|149029 : ATATCCTTCCCTGT-CTGAT-----TGAACCTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAATGGTCGT----TCAGTGTTGTGCGTAGAGTTCGG-A-TTATCTAAGGTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCTGGACTAGTCGTGCTACATAGTTACAGACATGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTT-AAAAA--TC---CCGGTAAGAA-AGCCCGGA-AATGTGACTTTATCTAGAACT-AGTGGCGCTCAGTTGAATACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAATGTCGATGATGGTAACATAAATGTTT-CT--TTTTA------CACT----------------GGTAAT-------GCCGACCATTAAATAAAA-CGT-TTATCAAACTTAAAAAA-ATGTTTA----A---CT--TATT-TTTGTAATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAGAT-----TACCCAAC-------ACCCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAATGTGATTGATC---------GATC----ACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149030 : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAATGGTCGT----TCAATGTCGTACGTAGAGTGCGG-G-TTATCTA--GTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCTGGACTAGTCATGCTACATAGTTACAGACACGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAAAA--TC---CCGGTAAGAA-AGCCCAGA-AATGTGACTTTATCTCGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGTCGATGATGGTAACATAATTGTTTATT--TTTTG------CACT----------------GGTAAT-------GCCGGTCATTAAATAAAA-CG--TCATCAAACTTAAAAAA-ATGTTTA----A---CT--TA-T-TTTGTAATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAGAT-----TACCCAAC-------AACCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAGTGTGATGGATC---------GACA----ACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149031 : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TAAACATATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCAGGAAGGTTTT----TCAGTGTCATGCGTAGAGTAAGG-A-TTATCTAACACCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCAGGACTAATCATGCTACATGGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTCGAAATGTAA-TT---AAAA--TGTTTTCGATAAGAA-AGCCAGGA-AATGAGAC--TATCTAGAATC-AGGAACGCTTAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATAAATGTTT-CT--TTTTG------TACTG---A-AAC-------GGCAAT-------GCCGGTTAT----TAAAA-CG--TCGTCAAACTT-CCAAA-ATGTTTA----AAGCCT--CATT-
gi|149032 : ATATCCTTACATGC-CTGGT-----TGTACATATAACCAC-------------G-------CCAGT-------------ATCCACAG---------CCAGTGTCGTGCGTAGAGTGTAACA-TTATCTGAGGTCTACCATAACATCTGAATGCATTTTCGGACTAGCCGTGCTGCATAGTTACATACATGAGCA-T--ATTGACATTGATAATGTAA-TTACAAAAAT-TG---CCGCTAGGAA-AGTCCAG---ATTAGATTTTATCTAGAATCGGGGGGCGCTCAGTTGAGAACAAATTGTGACTGAGTGAAAACAGT-----TTTACTGT-----CCTAACGCCGATGATGGTAACATGAATATT
gi|149033 : ATATCCTTTTCTGTACTTATGTACATGTACTTATAACCAT-------------G-------ACAGTATCCACAGCCCTTGCGGAAATGTCGT----TCGGTGTCATGCGTAGAGTGAGG-AATTTTCTAAGGTCTACCATGACATCTGAATGCCTTTCTGGATTAGCC
gi|149034 : TATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAATGTCAT----TCAacg
gi|149035 : TATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTGTAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAA----------------------------TGCGG-A-TTATCTAACCTCAACAATGAGAGATGAAT--------------GCCGCGCT------------ACGGGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATATAATTTA-AAAAA--TG---CCGGTATGAA-
gi|149036 : TATCCTTTCATAT-CTAGT-----TGTACATATAACCACACCAGTATCCACAG-------CCAGT-------------GCAGAAAGGTTGT----TAAACGTCATGCGTAGAGTGAAACA-TTATCTGAGGTCTACCATGACATCTGAACGCCTTTCAAGACTAGCCATGCTACATAGTTACATACATGAGCATGATATTGACATATAGAATGTAA-TTA-CAAAATGTG---CCGGTAGGAA-AGCCTGG---ATTAGATTTTATCTAGAATC-GGGGACACTCAGTTGGGTACAAATTGAGATTCTGTTTAAACAGTCTTAGCTTACTGTTTTAGTTTAACGTC-------GTAAAATGA-------CTAGTTTTG------CA-TG---ACAAC-------GGTAAC-------GCAAA-CTTAAAATAAAA-AA--TTGTCGTATTC-GTGAG-A---TTG----G-------TATT-GTTGTGATT-TTACCTGATTTTGTT----------
gi|149037 : TCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------T-------CCAGT-------------GCGGAAATGTCAT----TCAGTGTCATGTGTAGTGTGCAG-A-TTATCTAACGTCAACTATGAGAGCTGAATGCTGCTCTGGACTAGTCATGCTACACAGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGGAATTTA-AAAAA--
gi|149038 : TTATAACCAT-------------ATCAGAATCCAGT-------------GCGGAAAGGTTGTTCAGTCAGTGTCATGCGTAGAGTG
gi|149039 : GT----TCAGTGTCATGCGTAGAGTGAAG-AATTATCTGAGGTCTACCATGACATCTTAACACCTTTTCAGACTAGCTGTGCTACATAGTTACAGGCATGAGCA-G--ACTGACATTGAGAATGTAA-ATA-CAAAATTTG---CCAGTAAGAA-AGTCCAGACAAT-AGACTTTATCTAGAATC-AGGGATGCTCAGTTAAGTACAAA-TGTGACTGTGTAAAGACAGT-----CTTACTGT-----TTCAACGGCGATGATGGTAACATGAATATTT-GT--TTTTG------CATTGC--A-ACGCTGCAGCGGTAAT-------GTCTTGCTTCAA--AAAA-CGAATTTTCTGTCTT-A--------TTCATGAGA---TTGGTATT-GTTGTGATTTTTACCTGACTTTGTTCAGGCGGTCATTAAATA--AGACAT-----CAACAAACTTCAAAAATGTTTAAAAA----C--AAGATTACTCAACACTCTGACAACTAAAC-TAATGCATCAACAAAATGGATCAATCACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149040 : A--TG---CCGGTAAGAA-AGCT-GGA-AATG--ACTTTTTCTAGAACC-AGGGGTGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTTAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCAATGATGGTAACATAAATGTTT-CA--TTTTG------CACTG---A-AC--------GGTAAT-------GCCGGTCATTAAATAAAA-CA--TCATCAAACTT-AAAAA-ATGTTTA----A---CT--TA-T-TTTGTAAATATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAAAT-----TACCCAGC-------ACCCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAATGTGATGGATC---------AATC----ACACAATATTGT-TTAAGT
gi|149041 : ---CCGG-AAGCACAGCCCGGA-AATGTGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAATACAGT-----CTAACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATAAATGTTT-CG--TTTTG------CACTG---A-AC--------GGTAAT-------GCCGGTCATTAAATAAAA-CA--TCATAAAACTT-AGAAA-ATG-TTA----A---CT--TA-T-TTTGTAATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--C----------TA-----------------TT------------TAAACTA----------TGGC-ACTCAATGTGATGGATC---------AATC----ACACAACATCGT-TTAAGT
gi|149042 : ---CCGGTAAGAA-AGTCCAGA-TATATGACTTTATCTAGAACT-AGGGG
gi|149043 : GTCCGGA-AATTAGACTTTATCTAGAATC-GGGGACGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGATTGTGTGATGACAGT------------------------GTCGATGATGGTAACATGAATATTT-CT--TTTTGAACGGCCACAGTAAA-A---------CGTACTTTGTTCAGGCGGTTATGAAAAAAAAACG--TGAACAAACTT-CAAAA-ATGTTTA----A---CT--TATTATTTGTTATTATTACT--TTTTTGTT----------AAAAA-AAACGAGAT-----AACCTAAA-------ACCCTA-ACTA----C--TAGAC------------------------GTGATGGATC---------GATC----ACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149044 : TTGTGAAGATTGT-----TTCACTCT-----TCTAACGTTGGTGTTGGTAACATGAATG
gi|149045 : CGGTCGTTAAAGAAAA-CG--TCATCAAACTT-CAAAT-ATGTTTA----A---CT--TATT-TT-GTTATTATTACT--CTTTTGTT----------TAAAA-A--CGAGAA-----TGCTCAAC-------ACCCTA-ACAA----C--TACACTA----------TGGT-GCTAAACGTGATGGATC---------GATC----CCTAAAAATTGT-TTAAGT
gi|149046 : ttttacctgactcaggAAATAAAA-CG--TCATCAAACTT-CAAAATATATT-A----A---CT--TATT-TT-GTTATTATTACT--ATTTTGTT----------TAAAA-A--CGAGATAAGCCTACTTAAC-------ACCCTA-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-GCTCAACGTGATGGATC---------GATC----ACTAAACATTGTGTTAAGT
gi|149047 : AAGTTT-AATAA-GCCTTTA----A---CT--TATT-TT-ATTATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAG-A--CGAGAT-----TGCCCAAC-------ACCCTT-ACAAATAGCTATAGACAA----------TGGC-TCTCAATGTGATGGATC---------GATC----ACACAA
gi|149048 : TA----A---CT--TATT-TT-GTTATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CAAAAT-----TACCCAGC-------ACGTTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAATGTGATGGATC---------AATC----ACACAACATCGT-TTAAGT
blockSeqs : A GTACA ACCAGTATCCACAG ATCCACAGCCCTT G TCAG G C CA A G T T AT T C TG TTT C C GT G CTTAG TTTAG A AG AACGGC GCAACGCTGCAGC TTGTTCA T A AA AAA T TGAG AGC GG T A T A TG CAGGCGGTCA T AA AAGCC TTCAAAA A ATAG TA CTCAACACTC A T AACAAAATG AATC G
blockSeqs : . . ATCAGAAT . G . G C AA A G T . . T . TT . . . GT . . . . . . GACAAC . T . T AAA . . . . T . T A TG . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . G . G . A A CA A G A . . . . T . . . GA . . . . . . GTAAAA . A . . CC . . . . T . T G . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . G . G . G T AA T T C . . . . . . . . TA . . . . . . GAAAC . C . . GT . . . . T . T G . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . G . T . A A A T T T . . . . . . . . TA . . . . . . GAAC . T . . AA . . . . T . T A . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . G . T . A C G A T A . . . . . . . . GT . . . . . . GAAC . T . . AG . . . . T . T A . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . G . G . A A A T G T . . . . . . . . AT . . . . . . . . G . . CA . . . . T . T T . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . G . T . A C A A T C . . . . . . . . TA . . . . . . . . T . . CA . . . . T . . T . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . G . G . A A A T . . . . . . A . . . . . . CA . . . . T . . T . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : T . . . . . . . G . . . . . AA . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : GAAC************
originalCons : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAAGGTCGT----TCAGTGTCGTGCGTAGAGTGCGG-A-TTATCTAAGGTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCCGGACTAGCCGTGCTACATAGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAAAA--TG---CCGGTAAGAA-AGCCCGGA-AATGNGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATGAATGTTT-CT--TTTTG------CACTG---A-A---------GGTAAT-------GCCGGTCATTAAATAAAA-CG--TCATCAAACTT-AAAAA-ATGTTTA----A---CT--TATT-TTTGTNATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAGAT-----TACCCAAC-------ACCCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAACGTGATGGATC---------GATC----ACACAACATTGT-TTAAGT
finalCons : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAAGGTCGT----TCAGTGTCGTGCGTAGAGTGCGG-A-TTATCTAAGGTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCCGGACTAGCCGTGCTACATAGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAAAA--TG---CCGGTAAGAA-AGCCCGGA-AATGNGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATGAATGTTT-CT--TTTTG------CACTGAAC------------GGTAAT-------GCCGGTCATTAAATAAAA-CG--TCATCAAACTT-AAAAA-ATGTTTA----A---CT--TATT-TTTGTNATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAGAT-----TACCCAAC-------ACCCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAACGTGATGGATC---------GATC----ACACAACATTGT-TTAAGT
Alignments
lowQualScore : 11111 222222222222222222222 2222222222222 11 4444444444444 111111111 11111 1111111111 1111111 1111111111 111111111
lowQualScore : 4 00000 555555555555555555555 0000000000000 1 7777 1 1 888 1 2 5 0 4 66 8 4 55 666 3 3 77 3 99999 99999 4 66 1111111111111 777777777 00000 2 3 88 777 3 0 6666 555 44 2 3 7 1 99 4444444444 3 55 99999 1111111 3 7777 55 5555555555 3 2 444444444 7777 4
lowQualScore : . ..... ..................... ............. . .... . . ... . . . . . .. . . .. ... . . .. . ..... ..... . .. ............. ......... ..... . . .. ... . . .... ... .. . . . . .. .......... . .. ..... ....... . .... .. .......... . . ......... .... .
lowQualScore : 0 00000 555555555555555555555 0000000000000 4 1111 0 6 555 4 5 5 1 4 11 9 4 00 444 6 6 44 6 11111 11111 4 11 8888888888888 888888888 00000 4 6 66 444 3 5 5555 444 22 3 1 3 0 22 6666666666 6 00 11111 8888888 6 7777 00 9999999999 6 5 555555555 7777 0
consensus : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAAGGTCGT----TCAGTGTCGTGCGTAGAGTGCGG-A-TTATCTAAGGTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCCGGACTAGCCGTGCTACATAGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAAAA--TG---CCGGTAAGAA-AGCCCGGA-AATGNGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATGAATGTTT-CT--TTTTGCACTG---------A-ACGGTAA---------TGC-----CGGTCATTAAATAAAA-CG--TCATCAAACTT-AAAAA-ATGTTTA----A---CT--TATT-TTTGTNATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAGAT-----TACCCAAC-------ACCCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAACGTGATGGATC---------GAT----CACACAACATTGT-TTAAGT
Reference ( family-789 ) : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAAGGTCGT----TCAGTGTCGTGCGTAGAGTGCGG-A-TTATCTAAGGTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCCGGACTAGCCGTGCTACATAGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAAAA--TG---CCGGTAAGAA-AGCCCGGA-AATGNGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATGAATGTTT-CT--TTTTGCACTG---------A-ACGGTAA---------TGC-----CGGTCATTAAATAAAA-CG--TCATCAAACTT-AAAAA-ATGTTTA----A---CT--TATT-TTTGTNATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAGAT-----TACCCAAC-------ACCCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAACGTGATGGATC---------GAT----CACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149028 : ATATCCTGACCTGT-CTGGT-----TGAACTTTTAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAATGGTCGT----TCAGTGTCGTGCGTAGAGTGCGG-A-TTATCTAAGATCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCTGGACTAGTCATGCTGCATAGTTACAAACGTGAACA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAAAA--TC---CCGGTAAAAA-AGCCCGGA-AATGTGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCACTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGACGGTAACATAAATGTTT-CT--TTTTGCACT--------------GGTAA---------TGC-----CGGTCATTAAATAAAA-CG--TCACCAAACTT-AAAAA-AAATTGA----A---CT--TATT-TTTGTAATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAGAT-----TACCCAAC-------ACCCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAATGTGATTGATC---------GAT----CACATAACATTGT-TCAAGT
gi|149029 : ATATCCTTCCCTGT-CTGAT-----TGAACCTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAATGGTCGT----TCAGTGTTGTGCGTAGAGTTCGG-A-TTATCTAAGGTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCTGGACTAGTCGTGCTACATAGTTACAGACATGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTT-AAAAA--TC---CCGGTAAGAA-AGCCCGGA-AATGTGACTTTATCTAGAACT-AGTGGCGCTCAGTTGAATACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAATGTCGATGATGGTAACATAAATGTTT-CT--TTTTACACT--------------GGTAA---------TGC-----CGACCATTAAATAAAA-CGT-TTATCAAACTTAAAAAA-ATGTTTA----A---CT--TATT-TTTGTAATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAGAT-----TACCCAAC-------ACCCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAATGTGATTGATC---------GAT----CACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149030 : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAATGGTCGT----TCAATGTCGTACGTAGAGTGCGG-G-TTATCTA--GTCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCTGGACTAGTCATGCTACATAGTTACAGACACGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGTAA-TTA-AAAAA--TC---CCGGTAAGAA-AGCCCAGA-AATGTGACTTTATCTCGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGTCGATGATGGTAACATAATTGTTTATT--TTTTGCACT--------------GGTAA---------TGC-----CGGTCATTAAATAAAA-CG--TCATCAAACTTAAAAAA-ATGTTTA----A---CT--TA-T-TTTGTAATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAGAT-----TACCCAAC-------AACCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAGTGTGATGGATC---------GAC----AACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149031 : ATATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TAAACATATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCAGGAAGGTTTT----TCAGTGTCATGCGTAGAGTAAGG-A-TTATCTAACACCAACCATGAGATCTGAATGCCGTTCAGGACTAATCATGCTACATGGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTCGAAATGTAA-TT---AAAA--TGTTTTCGATAAGAA-AGCCAGGA-AATGAGAC--TATCTAGAATC-AGGAACGCTTAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATAAATGTTT-CT--TTTTGTACTGA--------A-ACGGCAA---------TGC-----CGGTTAT----TAAAA-CG--TCGTCAAACTT-CCAAA-ATGTTTA----AAGCCT--CATT-
gi|149032 : ATATCCTTACATGC-CTGGT-----TGTACATATAACCAC-------------G-------CCAGT-------------ATCCACAG---------CCAGTGTCGTGCGTAGAGTGTAACA-TTATCTGAGGTCTACCATAACATCTGAATGCATTTTCGGACTAGCCGTGCTGCATAGTTACATACATGAGCA-T--ATTGACATTGATAATGTAA-TTACAAAAAT-TG---CCGCTAGGAA-AGTCCAG---ATTAGATTTTATCTAGAATCGGGGGGCGCTCAGTTGAGAACAAATTGTGACTGAGTGAAAACAGT-----TTTACTGT-----CCTAACGCCGATGATGGTAACATGAATATT
gi|149033 : ATATCCTTTTCTGTACTTATGTACATGTACTTATAACCAT-------------G-------ACAGTATCCACAGCCCTTGCGGAAATGTCGT----TCGGTGTCATGCGTAGAGTGAGG-AATTTTCTAAGGTCTACCATGACATCTGAATGCCTTTCTGGATTAGCC
gi|149034 : TATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAATGTCAT----TCAacg
gi|149035 : TATCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTGTAACCAT-------------G-------CCAGT-------------GCGGAAA----------------------------TGCGG-A-TTATCTAACCTCAACAATGAGAGATGAAT--------------GCCGCGCT------------ACGGGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATATAATTTA-AAAAA--TG---CCGGTATGAA-
gi|149036 : TATCCTTTCATAT-CTAGT-----TGTACATATAACCACACCAGTATCCACAG-------CCAGT-------------GCAGAAAGGTTGT----TAAACGTCATGCGTAGAGTGAAACA-TTATCTGAGGTCTACCATGACATCTGAACGCCTTTCAAGACTAGCCATGCTACATAGTTACATACATGAGCATGATATTGACATATAGAATGTAA-TTA-CAAAATGTG---CCGGTAGGAA-AGCCTGG---ATTAGATTTTATCTAGAATC-GGGGACACTCAGTTGGGTACAAATTGAGATTCTGTTTAAACAGTCTTAGCTTACTGTTTTAGTTTAACGTC-------GTAAAATGA-------CTAGTTTTGCA-TGAC-------A-ACGGTAA---------CGC-----AAA-CTTAAAATAAAA-AA--TTGTCGTATTC-GTGAG-A---TTG----G-------TATT-GTTGTGATT-TTACCTGATTTTGTT----------
gi|149037 : TCCTTTCCTGT-CTGGT-----TGAACTTATAACCAT-------------T-------CCAGT-------------GCGGAAATGTCAT----TCAGTGTCATGTGTAGTGTGCAG-A-TTATCTAACGTCAACTATGAGAGCTGAATGCTGCTCTGGACTAGTCATGCTACACAGTTACAGACGTGAGCA-G--ATTGACATTGAAAATGGAATTTA-AAAAA--
gi|149038 : TTATAACCAT-------------ATCAGAATCCAGT-------------GCGGAAAGGTTGTTCAGTCAGTGTCATGCGTAGAGTG
gi|149039 : GT----TCAGTGTCATGCGTAGAGTGAAG-AATTATCTGAGGTCTACCATGACATCTTAACACCTTTTCAGACTAGCTGTGCTACATAGTTACAGGCATGAGCA-G--ACTGACATTGAGAATGTAA-ATA-CAAAATTTG---CCAGTAAGAA-AGTCCAGACAAT-AGACTTTATCTAGAATC-AGGGATGCTCAGTTAAGTACAAA-TGTGACTGTGTAAAGACAGT-----CTTACTGT-----TTCAACGGCGATGATGGTAACATGAATATTT-GT--TTTTGCATTGCAACGCTGCA-GCGGTAA---------TGT-----CTTGCTTCAA--AAAA-CGAATTTTCTGTCTT-A--------TTCATGAGA---TTGGTATT-GTTGTGATTTTTACCTGACTTTGTTCAGGCGGTCATTAAATA--AGACAT-----CAACAAACTTCAAAAATGTTTAAAAA----C--AAGATTACTCAACACTCTGACAACTAAAC-TAATGCATCAACAAAATGGATCAATCACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149040 : A--TG---CCGGTAAGAA-AGCT-GGA-AATG--ACTTTTTCTAGAACC-AGGGGTGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTTAAGACAGT-----CTTACTGT-----TCTAACGCCAATGATGGTAACATAAATGTTT-CA--TTTTGCACTG---------A-ACGGTAA---------TGC-----CGGTCATTAAATAAAA-CA--TCATCAAACTT-AAAAA-ATGTTTA----A---CT--TA-T-TTTGTAAATATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CGAAAT-----TACCCAGC-------ACCCTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAATGTGATGGATC---------AAT----CACACAATATTGT-TTAAGT
gi|149041 : ---CCGG-AAGCACAGCCCGGA-AATGTGACTTTATCTAGAACC-AGGGGCGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGACTTTGTGAATACAGT-----CTAACTGT-----TCTAACGCCGATGATGGTAACATAAATGTTT-CG--TTTTGCACTG---------A-ACGGTAA---------TGC-----CGGTCATTAAATAAAA-CA--TCATAAAACTT-AGAAA-ATG-TTA----A---CT--TA-T-TTTGTAATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--C----------TA-----------------TT------------TAAACTA----------TGGC-ACTCAATGTGATGGATC---------AAT----CACACAACATCGT-TTAAGT
gi|149042 : ---CCGGTAAGAA-AGTCCAGA-TATATGACTTTATCTAGAACT-AGGGG
gi|149043 : GTCCGGA-AATTAGACTTTATCTAGAATC-GGGGACGCTCAGTTGAGTACAAATTGTGATTGTGTGATGACAGT------------------------GTCGATGATGGTAACATGAATATTT-CT--TTTTGAACGG---------CCACAGTAAAACGTACTTTGTTCAGGCGGTTATGAAAAAAAAACG--TGAACAAACTT-CAAAA-ATGTTTA----A---CT--TATTATTTGTTATTATTACT--TTTTTGTT----------AAAAA-AAACGAGAT-----AACCTAAA-------ACCCTA-ACTA----C--TAGAC------------------------GTGATGGATC---------GAT----CACACAACATTGT-TTAAGT
gi|149044 : TTGTGAAGATTGT-----TTCACTCT-----TCTAACGTTGGTGTTGGTAACATGAATG
gi|149045 : -----CGGTCGTTAAAGAAAA-CG--TCATCAAACTT-CAAAT-ATGTTTA----A---CT--TATT-TT-GTTATTATTACT--CTTTTGTT----------TAAAA-A--CGAGAA-----TGCTCAAC-------ACCCTA-ACAA----C--TACACTA----------TGGT-GCTAAACGTGATGGATC---------GAT----CCCTAAAAATTGT-TTAAGT
gi|149046 : ttttacctgactcaggAAATAAAA-CG--TCATCAAACTT-CAAAATATATT-A----A---CT--TATT-TT-GTTATTATTACT--ATTTTGTT----------TAAAA-A--CGAGATAAGCCTACTTAAC-------ACCCTA-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-GCTCAACGTGATGGATC---------GAT----CACTAAACATTGTGTTAAGT
gi|149047 : AAGTTT-AATAA-GCCTTTA----A---CT--TATT-TT-ATTATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAG-A--CGAGAT-----TGCCCAAC-------ACCCTT-ACAAATAGCTATAGACAA----------TGGC-TCTCAATGTGATGGATC---------GAT----CACACAA
gi|149048 : TA----A---CT--TATT-TT-GTTATTATTACT--ATTTTGTT----------TTAAA-A--CAAAAT-----TACCCAGC-------ACGTTT-ACAA----C--TAGACTA----------TGGC-ACTCAATGTGATGGATC---------AAT----CACACAACATCGT-TTAAGT