lowQualScore : 1 111 1 111 111 1111111111 111111111 333333333333333333333333 11 11111 1 1 1
lowQualScore : 6 666 555 2 33 2 8888888 8 2 2 4 555 555 444 333 33 5555 2 5555 555 6 2 1111111111 8888888 33 000000000 2 33 33 444 66 777 33 888888888888888888888888 5 6666 00 2 2 1 44444 6 9 5
lowQualScore : . ... ... . .. . ....... . . . . ... ... ... ... .. .... . .... ... . . .......... ....... .. ......... . .. .. ... .. ... .. ........................ . .... .. . . . ..... . . .
lowQualScore : 6 666 444 0 77 7 7777777 6 7 7 4 000 000 777 000 77 7777 7 7777 666 5 1 7777777777 7777777 77 777777777 7 77 77 777 88 999 99 777777777777777777777777 5 1111 00 9 1 8 11111 0 1 0
consensus : GTTATTAGAAAGTTA--TA---CTTTTATAAACAAATNCAATGCTTAAGCG--AAAAC-AAACATATTCTCTGAATAGTATACAATGTACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AACAGAA--GATAAACAGTAATT-------C--G-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGA--A---G----------------A---TATATACATGT----ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTGATTTAACATTAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGAAAGCGTCCACTCTCTTTAATAAACTTATGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
Reference ( gi|32003 ) : GTTTTTAGAAAGTTT--TA---CTTTTATAAACAAATACAATGCTTAAGCG--AAAAC-AAACATATTCTCTGAATAGTATACAATATACATGTA-------AACAAT-G-GCAAGAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AACAGAG--GATAAACAGTAATT-------T--G-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGA--A---A----------------A---TATATGCATGT----ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTAATTTAACATTAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGTAAGCGTCCACTCTCATTAATAAACTTATGAACGCATCTCATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32004 : GTTGTTAAAAAATTA--TA---ATTTTATAAACAAATACAATGCTTAAGCG--AAAAC-AAACATATTCTCTGA------------ATACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---A---TGC--GAAATG----CTAAGTACATTGATCA----AACAGAG--GATAAACAGTAATT-------T--G-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGA--A---G----------------A---TATATACATCT----TCATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTAATTCAACATCAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGAAAACGTCCACTCTCTTTAATAATTTTATGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32005 : GTTATTAGAAAGTTA--TA---CTTTTATAAACAAAAACAATGCTTAAGCG--AAAAC-----ATATTCTCTGAATAGTATACACTATTCATGTA-------AAAACT-G-GGAAAAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AACAGAG--GATAAACAGTAATT-------T--G-------AAAA--GAT---------A-A--T--GGTGGAA---AGGTAGA--AG---AGA--A---G----------------A---TATATGCATGT----ACATGTCAACAAAACATC--ATTGCTCTGTAATTTAACATTAATCATTAGGCGGTTTAT-----GTGGTCGAAAGTGTTCACTCTC-----TAGA---ATAAACGTATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32006 : GTTATTAGAAAGTTA--TA---CTTTTATAAACATATACAATGCTTAAGCG--AAAAC-AAACATATTCTCTGAATAGTATACAATATACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATTAGT---A---AA---T---TGC--GAAATG----CTTAGTTTATTGATCA----AACAGAG--GGTAAACAGTAATT-------T--G-------TAAATTTAT---------A-AATT--TGTG-------GATAGA--A----AGA--A---G----------------A---TACATACACGT----ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTAACTTAAAATTAATCATTAGGCGATATAT-----GTGGTCGAACGCGTCCACTTTCTTTAATAAACTTATGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTTTATT
gi|32007 : GTTATTAGGAAGTTA--TA---TTTTCATAAACAAGTACAATGCTTGAGTG--AAAAC-AAACATATTCTCCGAGCAGTATACAATATACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---AAA-TGC--GAAATG----CTTTGTAGATTGATCA----AACAGAA--GTTAAAAAGTATTT-------T--G-------AAAA--TAT---------A-A--T--AGCGAAA---AGATAGA--AG---AGA--A---G----------------AAGATATATACATAT----ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTTATTTAACATTCATCATTAGGTGATACAT-----ATGGTCGAAAACGTCCACTCTCTTGAATGAACTTACGAACGCATCTAATTAAGTGTTCATTATGTT
gi|32008 : GTTATTAAAAAGTTA--TA---ATTTTATAAAAAAATACATTGCTTAAGCG--AAAAC-AAACATATTCTCTGAATAGTATACAATATATATGTT-------AACAAT-G-GGAAGAATACGT---AAAGAA---G---TGC--GAAAGG----CTTAGTGCATTGATCA----AATAGAA--GATAAA----AA------------G-------AAAA--GATATTAGTGGAA-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGA--A---ATATATATATATAATATA---TATATATATGTGTGAACATGTCAACCAATCATC--ATTGCTATGTGATTTTA-ATTAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGAAAACGTCCACTCTCTTTAGTGAATTTGTGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32012 : GTTGTTAGAAAGTTA--TA---CTTTTATAAACAAATACAATGCTTAAACG--AAAAC-AAACATATTCTCTGAATAGCATACAATATACATGTA-------AACAAT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATGCTTACTTAGTACATTGATCA----AGCAGAG--GATAAACAGTAATT-------T--G-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGA--A---A----------------A---TATATACATG
gi|32011 : GTTATTAGAAAGTTTATTAGAACTTTTATAAACAAATTCAATACTTAAGCG--AAAAC-AAACATATTTTCTGAATAGTATACAA---AGA---A-------AACACA-G-GGAAGAATACAT---A---AA---GAAGTGG--GAAAGG----C-------ATTGATCA----AACAGAA--GATAAAATGTATTT-------C--G-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AAA-AGA--AG---AGA--A---G----------------AAGACATATACACGT----GCATGTCAAACAAAAATC--AATGCTGTGAGATTTACCATTAAGCATTAGGTGGTATAT-----GTGGTCGAAAGCTGCCACTCTCTTTGATAAACTTATGAACGCATCTATTTAAATA--CATT
gi|32010 : GTTATTAGAAAGTTA--TA---CTTTTACAAACAAACACAATGCTTAAGCG--AAAAC-AAACATATTCTCTGAATAGTATACAATATACATGTT-------AACACT-A-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TTC--GAAATG----TTTTGTACATTGATCT----AAGAGA---TATAAACAGTAATT-------T--G-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGATGAGA--AGA--A---G----------------A---TATATACAAGT----ACAT
gi|32014 : GTTATTAGAAAGTTA--TG---CCTTTATAAACATATTCAATGCTTAAGCG--AAACC-AAACACATTCTAAGAATAGTACACAATGCA-----G-------AAC--T-G-ATAAAAATAAGT---A---AATAAG---GGT--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AGCAGAA--AATAACTAG-GATTACAAGAGT--G-------GAAA--GGT---------ATA--T--A-TAAAACATAAATAGAG-AG---AAA--ATGAA----------------A---TATATACATGT----ACATGTtaagtggtatatatgtgatggaaagcgtccactcttttttatgaacttatgaacgcatctaatccaatgttcgttatgtt
gi|32015 : GTTATTAGAAAAT-----A---TTTTTGTAAACAAAAACAATGCTTAAGCG--AAAAC-AAACATATTCTCTGAATAGTATACTATATACATGTA-------TACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TGCATAAAATG-------AAAACATC-ATAA----AATAAAGTTAATAAA-AATCATT-------G--A-------AAAA--AAA---------A-A--TAAAATGAAA---AAACA
gi|32013 : TTAGAAAGTTG--TA---CTTTTAAAAACAAATTTATTGCTTTAGCG--AAAAC-AAACACATTCTCTGAATAGTATACATTGTACATGTA-------AACACCGG-GGAAGAATAAAT---AATGAA---G---TGT--GGACTG----CTAAGTACATTGATCA----AACAGAA--GATAAAAAATATTT-------C--G-------AAAA--GAT---------A-A--A--AGTGGAA---AAATAGA--AGAGAAGA--A---G----------------A---TATATACATGT----ACAAGT
gi|32018 : gctaAAAAAGTAT---G---CTTTTTTAAACAAAGTCAATACTTAATCA--AAAGC-AAACACATTCATTGAATAGTATACAATGTACAT
gi|32009 : --TG---CTTCTACAAACAAAGCCAATGCT-AAGCG--AAATA-AAACAAATTCTCTGAACAGTATACAATCTACATGTT-------AACACT-G-GGAAGAACGAGT---A---AA---GAAGTGC--GAAATG----CT----ACATTGATCATAGTAACAGAA--GATAAATAGCATTT-------A--G-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTAGAA---CGATAGA--AG---AGA--A---GGAT-------------A---TATATACATGC----ACATGTCAGCGAAACATC--ATTGCCCTGTGATTAAACATAAATCATAAGGTGGTGTGT-----GTAGCCGAAAGCGTCCACTCTCTTTTATAAACTTATGAACGCATCTGATTAAATGTTC
gi|32016 : gttattatatacgagaTTTTATATACAAATTCGATACTTAAGCGAAAAAACAAAACACATTCCCTGAACAGTTTACACTGTACAGGTA-------AATTAT-A-TGAAGAATGA
gi|32017 : gttatcagaaaagaatgATGCTTAAGCG--ATAAC-ACACATGTTATCTGAATAGTATACAATGTACATGTAATATGTTAACACT-GTGGAAAA--AAGT---AAAGAA---G---AGC--AAAATG----CTTAGCACATTGATCA----AACTGAA--AAAGAATATTGATT-------cttaaaa
gi|32019 : atcaaaaagatatttcattgccatataattataattCAATGTACTGGTA-------AACAAT-G-AGAAGGCCAAATGAAA---AA---A---TAG--GAAAGG----CTAAGAACATAGACCA----AACAAAA--GATAAAAAGTACTA-------C--GTCTTCCTAAAT--GTT---------A-A-----AGTGGAA---AGCTAGA--AG---AGACGA---A----------------A----------------------ATCG--CAAAAAGC--ATTGCACTGTGATTTAACATTACTTATTA
gi|32020 : A---G---TGT--GAAATG----CTTAGTACGTTGATCA----AGCAGAG--GATACAC-GTA
gi|32021 : GAA--GAAGAATAGT--TT-------TCCG-------AAAG--AAA---------A-A--T--AGTTGAA---AGATAGA--AG---AGA--A---GGTG-------------A---TATATACATGT----ACATGTCAGCCAAACACCCTATTGATTTGTGATTTAACGTT------------GTTTGT-----GTGGTCGAAAGTGTCCACTCTCTTTAATAAACTTATGGACACATCTGATTGAATGTCCATTCTGCT
gi|32022 : GAA--GA-AAATAGTATTT-------C--G-------AAAG--AAA---------A-A--T--AGTTGAA---AGATAGA--AG---AGA--A---GGTG-------------A---TATATACATGT----ACATGTCAGCCAAACACCCTATTGATTTGTGATTTAACGTT------------GTTTGT-----GTGGTTGAAAGTGTCCACTCTCTTAAATAAACTTATGGACAC
gi|32023 : ----------------A---TAAATACATGT----AGATGTCAACCAAACATT--ATTACTTTGTGATAAAACATTAACCATAAGGTGGTATACTAGTAATGGGCGCTAGCATCCATTATCTTCAATAAACTTATGAACGTTTCTAACTGAATATACATTATAT
gi|32010 : CATTAAGTGGTATATAT---GTGATGGAAAGCGTCCACTCTTTTTTATGAACTTATGAACGCATCTAATCCAATGTTCGTTATGTT
Alignments
lowQualScore : 111 111 11111111 111111111 3333333333333333 11111
lowQualScore : 444 2 5555 2 1 33 2 1 8888888 2 2 444 444 444 222 33 5555 1 5555 333 5 1 00000000 8888888 33 000000000 2 33 33 444 66 777 0000000000000000 444 99999999 99 1 0 22222
lowQualScore : ... . .... . . .. . . ....... . . ... ... ... ... .. .... . .... ... . . ........ ....... .. ......... . .. .. ... .. ... ................ ... ........ .. . . .....
lowQualScore : 777 7 7777 5 0 44 5 9 1111111 5 5 777 000 444 222 44 3333 9 3333 999 6 6 33333333 1111111 44 000000000 5 44 44 444 33 333 4444444444444444 444 77777777 22 2 8 99999
consensus : GTTATTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTATAAACA-AATNCAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATGTACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AACAGAAG---ATAAACAGTAATT-------CG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------G---A---TATATACATGT--------ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTGATTTAACATTAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGAAAGCGTCCACTCTCTTTAATAAACTTATGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
Reference ( family-788 ) : GTTATTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTATAAACA-AATNCAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATGTACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AACAGAAG---ATAAACAGTAATT-------CG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------G---A---TATATACATGT--------ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTGATTTAACATTAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGAAAGCGTCCACTCTCTTTAATAAACTTATGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32003 : GTTTTTAGA---AAGTT-TT----ACTTTTATAAACA-AATACAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATATACATGTA-------AACAAT-G-GCAAGAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AACAGAGG---ATAAACAGTAATT-------TG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------A---A---TATATGCATGT--------ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTAATTTAACATTAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGTAAGCGTCCACTCTCATTAATAAACTTATGAACGCATCTCATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32004 : GTTGTTAAA---AAATT-AT----AATTTTATAAACA-AATACAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAA------------TACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---A---TGC--GAAATG----CTAAGTACATTGATCA----AACAGAGG---ATAAACAGTAATT-------TG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------G---A---TATATACATCT--------TCATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTAATTCAACATCAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGAAAACGTCCACTCTCTTTAATAATTTTATGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32005 : GTTATTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTATAAACA-AAAACAATGCTTAAGCGAAAA--C-----ATATTCTCTGAATAGTATACACTATTCATGTA-------AAAACT-G-GGAAAAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AACAGAGG---ATAAACAGTAATT-------TG-------AAAA--GAT---------A-A--T--GGTGGAA---AGGTAGA--AG---AGAA------------G---A---TATATGCATGT--------ACATGTCAACAAAACATC--ATTGCTCTGTAATTTAACATTAATCATTAGGCGGTTTAT-----GTGGTCGAAAGTGTTCACTCTC-----TAGA---ATAAACGTATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32006 : GTTATTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTATAAACA-TATACAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATATACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATTAGT---A---AA---T---TGC--GAAATG----CTTAGTTTATTGATCA----AACAGAGG---GTAAACAGTAATT-------TG-------TAAATTTAT---------A-AATT--TGTG-------GATAGA--A----AGAA------------G---A---TACATACACGT--------ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTAACTTAAAATTAATCATTAGGCGATATAT-----GTGGTCGAACGCGTCCACTTTCTTTAATAAACTTATGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTTTATT
gi|32007 : GTTATTAGG---AAGTT-AT----ATTTTCATAAACA-AGTACAATGCTTGAGTGAAAA--CAAA-CATATTCTCCGAGCAGTATACAATATACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---AAA-TGC--GAAATG----CTTTGTAGATTGATCA----AACAGAAG---TTAAAAAGTATTT-------TG-------AAAA--TAT---------A-A--T--AGCGAAA---AGATAGA--AG---AGAAGAA---------G---A---TATATACATAT--------ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTTATTTAACATTCATCATTAGGTGATACAT-----ATGGTCGAAAACGTCCACTCTCTTGAATGAACTTACGAACGCATCTAATTAAGTGTTCATTATGTT
gi|32008 : GTTATTAAA---AAGTT-AT----AATTTTATAAAAA-AATACATTGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATATATATGTT-------AACAAT-G-GGAAGAATACGT---AAAGAA---G---TGC--GAAAGG----CTTAGTGCATTGATCA----AATAGAAG---ATAAA----AA----------G-------AAAA--GATATTAGTGGAA-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAAATATATATATATA---A---TATATATATATATGTGTGAACATGTCAACCAATCATC--ATTGCTATGTGATTTTA-ATTAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGAAAACGTCCACTCTCTTTAGTGAATTTGTGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32009 : GTTATTATATACGAG---AT----GCTTCTACAAACA-AAGCCAATGCT-AAGCGAAAT--AAAA-CAAATTCTCTGAACAGTATACAATCTACATGTT-------AACACT-G-GGAAGAACGAGT---A---AA---GAAGTGC--GAAATG----CT----ACATTGATCATAGTAACAGAAG---ATAAATAGCATTT-------AG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTAGAA---CGATAGA--AG---AGAA------------GGATA---TATATACATGC--------ACATGTCAGCGAAACATC--ATTGCCCTGTGATTAAACATAAATCATAAGGTGGTGTGT-----GTAGCCGAAAGCGTCCACTCTCTTTTATAAACTTATGAACGCATCTGATTAAATGTTC
gi|32010 : GTTATTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTACAAACA-AACACAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATATACATGTT-------AACACT-A-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TTC--GAAATG----TTTTGTACATTGATCT----AAGAG-AT---ATAAACAGTAATT-------TG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGATGAGA--AGAA------------G---A---TATATACAAGT--------ACAT
gi|32010 : CATTAAGTGGTATATAT---GTGATGGAAAGCGTCCACTCTTTTTTATGAACTTATGAACGCATCTAATCCAATGTTCGTTATGTTtaagtggtatatatgtgatggaaagcgtccactcttttttatgaacttatgaacgcatctaatccaatgttcgttatgtt
gi|32011 : gttattagaaagttatacttttacaaacaaacacaatgcttaagcgaaaacaaacatattctctgaatagtatacaatatacatgttaacactaggaagaataagtaaagttcgaaatgttttgtacattgatctaagagatataaacagtaatttgaaaagataatagtggaaagatagatgagaagaagatatatacaagtaGTTATTAGA---AAGTTTATTAGAACTTTTATAAACA-AATTCAATACTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTTTCTGAATAGTATACAA---AGA---A-------AACACA-G-GGAAGAATACAT---A---AA---GAAGTGG--GAAAGG----C-------ATTGATCA----AACAGAAG---ATAAAATGTATTT-------CG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AAA-AGA--AG---AGAA------------G---AAGACATATACACGT--------GCATGTCAAACAAAAATC--AATGCTGTGAGATTTACCATTAAGCATTAGGTGGTATAT-----GTGGTCGAAAGCTGCCACTCTCTTTGATAAACTTATGAACGCATCTATTTAAATA--CATT
gi|32012 : GTTGTTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTATAAACA-AATACAATGCTTAAACGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGCATACAATATACATGTA-------AACAAT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATGCTTACTTAGTACATTGATCA----AGCAGAGG---ATAAACAGTAATT-------TG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------A---A---TATATACATG
gi|32013 : GCTATTAGA---AAGTT-GT----ACTTTTAAAAACA-AATTTATTGCTTTAGCGAAAA--CAAA-CACATTCTCTGAATAGTATACATTGTACATGTA-------AACACCGG-GGAAGAATAAAT---AATGAA---G---TGT--GGACTG----CTAAGTACATTGATCA----AACAGAAG---ATAAAAAATATTT-------CG-------AAAA--GAT---------A-A--A--AGTGGAA---AAATAGA--AGAGAAGAA------------G---A---TATATACATGT--------ACAAGT
gi|32014 : GTTATTAGA---AAGTT-AT----GCCTTTATAAACA-TATTCAATGCTTAAGCGAAAC--CAAA-CACATTCTAAGAATAGTACACAATGCAGA--------------ACT-G-ATAAAAATAAGT---A---AATAAG---GGT--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AGCAGAAA---ATAACTAG-GATTACAAGAGTG-------GAAA--GGT---------ATA--T--A-TAAAACATAAATAGAG-AG---AAAATGA---------A---A---TATATACATGT--------ACATGT
gi|32015 : GTTATTAGA---AA----AT----ATTTTTGTAAACA-AAAACAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACTATATACATGTA-------TACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TGCATAAAATG-------AAAACATC-ATAA----AATA-AAGTTAATAAA-AATCATT-------GA-------AAAA--AAA---------A-A--TAAAATGAAA---AAACA
gi|32016 : GTTATCAGA---AAAGA-AT----G-TTTTATATACA-AATTCGATACTTAAGCGAAAAAACAAAACACATTCCCTGAACAGTTTACACTGTACAGGTA-------AATTAT-A-TGAAGAATGA
gi|32017 : TATAATTATAATT--ATGCTTAAGCGATAA--CACA-CATGTTATCTGAATAGTATACAATGTACATGTAATATGTTAACACT-GTGGAAAA--AAGT---AAAGAA---G---AGC--AAAATG----CTTAGCACATTGATCA----AACTGAAA---AAGAATATTGATT-------cttaaaa
gi|32018 : atcaaaaagatatttcattgccaAAA---AAGT--AT----GCTTTTTTAAACA-AAGTCAATACTTAATCAAAAG--CAAA-CACATTCATTGAATAGTATACAATGTACAT
gi|32019 : CAATGTACTGGTA-------AACAAT-G-AGAAGGCCAAATGAAA---AA---A---TAG--GAAAGG----CTAAGAACATAGACCA----AACAAAAG---ATAAAAAGTACTA-------CGTCTTCCTAAAT--GTT---------A-A-----AGTGGAA---AGCTAGA--AG---AGAC------------G---A------------------------AAATCG--CAAAAAGC--ATTGCACTGTGATTTAACATTACTTATTA
gi|32020 : A---G---TGT--GAAATG----CTTAGTACGTTGATCA----AGCAGAGG---ATACAC-GTA
gi|32021 : GAAG---AAGAATAGTTTTC-------CG-------AAAG--AAA---------A-A--T--AGTTGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------GGTGA---TATATACATGT--------ACATGTCAGCCAAACACCCTATTGATTTGTGATTTAACGTT------------GTTTGT-----GTGGTCGAAAGTGTCCACTCTCTTTAATAAACTTATGGACACATCTGATTGAATGTCCATTCTGCT
gi|32022 : GAAG---A-AAATAGTATTT-------CG-------AAAG--AAA---------A-A--T--AGTTGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------GGTGA---TATATACATGT--------ACATGTCAGCCAAACACCCTATTGATTTGTGATTTAACGTT------------GTTTGT-----GTGGTTGAAAGTGTCCACTCTCTTAAATAAACTTATGGACAC
gi|32023 : ---A---TAAATACATGT--------AGATGTCAACCAAACATT--ATTACTTTGTGATAAAACATTAACCATAAGGTGGTATACTAGTAATGGGCGCTAGCATCCATTATCTTCAATAAACTTATGAACGTTTCTAACTGAATATACATTATAT
Alignments
lowQualScore : 111 111 11111111 111111111 3333333333333333 11111
lowQualScore : 444 2 5555 2 1 33 2 1 8888888 2 2 444 444 444 222 33 5555 1 5555 333 5 1 00000000 8888888 33 000000000 2 33 33 444 66 777 0000000000000000 444 99999999 99 1 0 22222
lowQualScore : ... . .... . . .. . . ....... . . ... ... ... ... .. .... . .... ... . . ........ ....... .. ......... . .. .. ... .. ... ................ ... ........ .. . . .....
lowQualScore : 777 7 7777 5 0 44 5 9 1111111 5 5 777 000 444 222 44 3333 9 3333 999 6 6 33333333 1111111 44 000000000 5 44 44 444 33 333 4444444444444444 444 77777777 22 2 8 99999
consensus : GTTATTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTATAAACA-AATNCAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATGTACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AACAGAAG---ATAAACAGTAATT-------CG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------G---A---TATATACATGT--------ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTGATTTAACATTAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGAAAGCGTCCACTCTCTTTAATAAACTTATGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
Reference ( family-788 ) : GTTATTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTATAAACA-AATNCAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATGTACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AACAGAAG---ATAAACAGTAATT-------CG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------G---A---TATATACATGT--------ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTGATTTAACATTAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGAAAGCGTCCACTCTCTTTAATAAACTTATGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32003 : GTTTTTAGA---AAGTT-TT----ACTTTTATAAACA-AATACAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATATACATGTA-------AACAAT-G-GCAAGAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AACAGAGG---ATAAACAGTAATT-------TG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------A---A---TATATGCATGT--------ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTAATTTAACATTAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGTAAGCGTCCACTCTCATTAATAAACTTATGAACGCATCTCATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32004 : GTTGTTAAA---AAATT-AT----AATTTTATAAACA-AATACAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAA------------TACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---A---TGC--GAAATG----CTAAGTACATTGATCA----AACAGAGG---ATAAACAGTAATT-------TG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------G---A---TATATACATCT--------TCATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTAATTCAACATCAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGAAAACGTCCACTCTCTTTAATAATTTTATGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32005 : GTTATTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTATAAACA-AAAACAATGCTTAAGCGAAAA--C-----ATATTCTCTGAATAGTATACACTATTCATGTA-------AAAACT-G-GGAAAAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AACAGAGG---ATAAACAGTAATT-------TG-------AAAA--GAT---------A-A--T--GGTGGAA---AGGTAGA--AG---AGAA------------G---A---TATATGCATGT--------ACATGTCAACAAAACATC--ATTGCTCTGTAATTTAACATTAATCATTAGGCGGTTTAT-----GTGGTCGAAAGTGTTCACTCTC-----TAGA---ATAAACGTATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32006 : GTTATTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTATAAACA-TATACAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATATACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATTAGT---A---AA---T---TGC--GAAATG----CTTAGTTTATTGATCA----AACAGAGG---GTAAACAGTAATT-------TG-------TAAATTTAT---------A-AATT--TGTG-------GATAGA--A----AGAA------------G---A---TACATACACGT--------ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTAACTTAAAATTAATCATTAGGCGATATAT-----GTGGTCGAACGCGTCCACTTTCTTTAATAAACTTATGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTTTATT
gi|32007 : GTTATTAGG---AAGTT-AT----ATTTTCATAAACA-AGTACAATGCTTGAGTGAAAA--CAAA-CATATTCTCCGAGCAGTATACAATATACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---AAA-TGC--GAAATG----CTTTGTAGATTGATCA----AACAGAAG---TTAAAAAGTATTT-------TG-------AAAA--TAT---------A-A--T--AGCGAAA---AGATAGA--AG---AGAAGAA---------G---A---TATATACATAT--------ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTTATTTAACATTCATCATTAGGTGATACAT-----ATGGTCGAAAACGTCCACTCTCTTGAATGAACTTACGAACGCATCTAATTAAGTGTTCATTATGTT
gi|32008 : GTTATTAAA---AAGTT-AT----AATTTTATAAAAA-AATACATTGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATATATATGTT-------AACAAT-G-GGAAGAATACGT---AAAGAA---G---TGC--GAAAGG----CTTAGTGCATTGATCA----AATAGAAG---ATAAA----AA----------G-------AAAA--GATATTAGTGGAA-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAAATATATATATATA---A---TATATATATATATGTGTGAACATGTCAACCAATCATC--ATTGCTATGTGATTTTA-ATTAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGAAAACGTCCACTCTCTTTAGTGAATTTGTGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32009 : GTTATTATATACGAG---AT----GCTTCTACAAACA-AAGCCAATGCT-AAGCGAAAT--AAAA-CAAATTCTCTGAACAGTATACAATCTACATGTT-------AACACT-G-GGAAGAACGAGT---A---AA---GAAGTGC--GAAATG----CT----ACATTGATCATAGTAACAGAAG---ATAAATAGCATTT-------AG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTAGAA---CGATAGA--AG---AGAA------------GGATA---TATATACATGC--------ACATGTCAGCGAAACATC--ATTGCCCTGTGATTAAACATAAATCATAAGGTGGTGTGT-----GTAGCCGAAAGCGTCCACTCTCTTTTATAAACTTATGAACGCATCTGATTAAATGTTC
gi|32010 : GTTATTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTACAAACA-AACACAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATATACATGTT-------AACACT-A-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TTC--GAAATG----TTTTGTACATTGATCT----AAGAG-AT---ATAAACAGTAATT-------TG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGATGAGA--AGAA------------G---A---TATATACAAGT--------ACAT
gi|32010 : CATTAAGTGGTATATAT---GTGATGGAAAGCGTCCACTCTTTTTTATGAACTTATGAACGCATCTAATCCAATGTTCGTTATGTTtaagtggtatatatgtgatggaaagcgtccactcttttttatgaacttatgaacgcatctaatccaatgttcgttatgtt
gi|32011 : gttattagaaagttatacttttacaaacaaacacaatgcttaagcgaaaacaaacatattctctgaatagtatacaatatacatgttaacactaggaagaataagtaaagttcgaaatgttttgtacattgatctaagagatataaacagtaatttgaaaagataatagtggaaagatagatgagaagaagatatatacaagtaGTTATTAGA---AAGTTTATTAGAACTTTTATAAACA-AATTCAATACTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTTTCTGAATAGTATACAA---AGA---A-------AACACA-G-GGAAGAATACAT---A---AA---GAAGTGG--GAAAGG----C-------ATTGATCA----AACAGAAG---ATAAAATGTATTT-------CG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AAA-AGA--AG---AGAA------------G---AAGACATATACACGT--------GCATGTCAAACAAAAATC--AATGCTGTGAGATTTACCATTAAGCATTAGGTGGTATAT-----GTGGTCGAAAGCTGCCACTCTCTTTGATAAACTTATGAACGCATCTATTTAAATA--CATT
gi|32012 : GTTGTTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTATAAACA-AATACAATGCTTAAACGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGCATACAATATACATGTA-------AACAAT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATGCTTACTTAGTACATTGATCA----AGCAGAGG---ATAAACAGTAATT-------TG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------A---A---TATATACATG
gi|32013 : GCTATTAGA---AAGTT-GT----ACTTTTAAAAACA-AATTTATTGCTTTAGCGAAAA--CAAA-CACATTCTCTGAATAGTATACATTGTACATGTA-------AACACCGG-GGAAGAATAAAT---AATGAA---G---TGT--GGACTG----CTAAGTACATTGATCA----AACAGAAG---ATAAAAAATATTT-------CG-------AAAA--GAT---------A-A--A--AGTGGAA---AAATAGA--AGAGAAGAA------------G---A---TATATACATGT--------ACAAGT
gi|32014 : GTTATTAGA---AAGTT-AT----GCCTTTATAAACA-TATTCAATGCTTAAGCGAAAC--CAAA-CACATTCTAAGAATAGTACACAATGCAGA--------------ACT-G-ATAAAAATAAGT---A---AATAAG---GGT--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AGCAGAAA---ATAACTAG-GATTACAAGAGTG-------GAAA--GGT---------ATA--T--A-TAAAACATAAATAGAG-AG---AAAATGA---------A---A---TATATACATGT--------ACATGT
gi|32015 : GTTATTAGA---AA----AT----ATTTTTGTAAACA-AAAACAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACTATATACATGTA-------TACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TGCATAAAATG-------AAAACATC-ATAA----AATA-AAGTTAATAAA-AATCATT-------GA-------AAAA--AAA---------A-A--TAAAATGAAA---AAACA
gi|32016 : GTTATCAGA---AAAGA-AT----G-TTTTATATACA-AATTCGATACTTAAGCGAAAAAACAAAACACATTCCCTGAACAGTTTACACTGTACAGGTA-------AATTAT-A-TGAAGAATGA
gi|32017 : TATAATTATAATT--ATGCTTAAGCGATAA--CACA-CATGTTATCTGAATAGTATACAATGTACATGTAATATGTTAACACT-GTGGAAAA--AAGT---AAAGAA---G---AGC--AAAATG----CTTAGCACATTGATCA----AACTGAAA---AAGAATATTGATT-------cttaaaa
gi|32018 : atcaaaaagatatttcattgccaAAA---AAGT--AT----GCTTTTTTAAACA-AAGTCAATACTTAATCAAAAG--CAAA-CACATTCATTGAATAGTATACAATGTACAT
gi|32019 : CAATGTACTGGTA-------AACAAT-G-AGAAGGCCAAATGAAA---AA---A---TAG--GAAAGG----CTAAGAACATAGACCA----AACAAAAG---ATAAAAAGTACTA-------CGTCTTCCTAAAT--GTT---------A-A-----AGTGGAA---AGCTAGA--AG---AGAC------------G---A------------------------AAATCG--CAAAAAGC--ATTGCACTGTGATTTAACATTACTTATTA
gi|32020 : A---G---TGT--GAAATG----CTTAGTACGTTGATCA----AGCAGAGG---ATACAC-GTA
gi|32021 : GAAG---AAGAATAGTTTTC-------CG-------AAAG--AAA---------A-A--T--AGTTGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------GGTGA---TATATACATGT--------ACATGTCAGCCAAACACCCTATTGATTTGTGATTTAACGTT------------GTTTGT-----GTGGTCGAAAGTGTCCACTCTCTTTAATAAACTTATGGACACATCTGATTGAATGTCCATTCTGCT
gi|32022 : GAAG---A-AAATAGTATTT-------CG-------AAAG--AAA---------A-A--T--AGTTGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------GGTGA---TATATACATGT--------ACATGTCAGCCAAACACCCTATTGATTTGTGATTTAACGTT------------GTTTGT-----GTGGTTGAAAGTGTCCACTCTCTTAAATAAACTTATGGACAC
gi|32023 : ---A---TAAATACATGT--------AGATGTCAACCAAACATT--ATTACTTTGTGATAAAACATTAACCATAAGGTGGTATACTAGTAATGGGCGCTAGCATCCATTATCTTCAATAAACTTATGAACGTTTCTAACTGAATATACATTATAT
blockSeqs : TAC T TAGA T A AA A A ATATGTT G T GAA AAG TAA AAG AT CTTA A TAGT TTA C A ACAAGAGT TCTTCCT TT ATTAGTGGA T AT AA CAT TG AGA ATATATATATATA AGA ATGTGTGA CT A TAGTA
blockSeqs : . . . . A . . A . . . . ATG . AAG . . T . . C A T . . . . . . . G A GAAG . . CT A AT
blockSeqs : . . . . A . . A . . . . AAG . AA . . T . . C A T . . . . . . . . . GGAT . . . A .
blockSeqs : . . . . A . . A . . . . . . . . . T . . A T T . . . . . . . . . TGAA . . . C .
blockSeqs : . . . . A . . C . . . . . . . . . T . . T A T . . . . . . . . . GGTG . . . A .
blockSeqs : . . . . C . . A . . . . . . . . . T . . C T A . . . . . . . . . GGTG . . . A .
blockSeqs : . . . . A . . A . . . . . . . . . T . . A A T . . . . . . . . . G . . . A .
blockSeqs : . . . . T . . G . . . . . . . . . A . . C T C . . . . . . . . . G . . . A .
blockSeqs : . . . . A . . G . . . . . . . . . T . . A A T . . . . . . . . . G . . . A .
blockSeqs : . . . . T . . A . . . . . . . . . T . . T T C . . . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . G . . . . . . . . . A . . T A G . . . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . G . . . . . . . . . T . . A A C . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . C A C . . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . T C C . . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : GTTATTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTATAAACA-AATNCAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATGTACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AACAGAAG---ATAAACAGTAATT-------CG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------G---A---TATATACATGT--------ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTGATTTAACATTAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGAAAGCGTCCACTCTCTTTAATAAACTTATGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
finalCons : GTTATTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTATAAACA-AATNCAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATGTACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AACAGAAG---ATAAACAGTAATT-------CG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------G---A---TATATACATGT--------ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTGATTTAACATTAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGAAAGCGTCCACTCTCTTTAATAAACTTATGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
Alignments
lowQualScore : 111 111 11111111 111111111 3333333333333333 11111
lowQualScore : 444 2 5555 2 1 33 2 1 8888888 2 2 444 444 444 222 33 5555 1 5555 333 5 1 00000000 8888888 33 000000000 2 33 33 444 66 777 0000000000000000 444 99999999 99 1 0 22222
lowQualScore : ... . .... . . .. . . ....... . . ... ... ... ... .. .... . .... ... . . ........ ....... .. ......... . .. .. ... .. ... ................ ... ........ .. . . .....
lowQualScore : 777 7 7777 5 0 44 5 9 1111111 5 5 777 000 444 222 44 3333 9 3333 999 6 6 33333333 1111111 44 000000000 5 44 44 444 33 333 4444444444444444 444 77777777 22 2 8 99999
consensus : GTTATTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTATAAACA-AATNCAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATGTACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AACAGAAG---ATAAACAGTAATT-------CG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------G---A---TATATACATGT--------ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTGATTTAACATTAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGAAAGCGTCCACTCTCTTTAATAAACTTATGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
Reference ( family-788 ) : GTTATTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTATAAACA-AATNCAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATGTACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AACAGAAG---ATAAACAGTAATT-------CG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------G---A---TATATACATGT--------ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTGATTTAACATTAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGAAAGCGTCCACTCTCTTTAATAAACTTATGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32003 : GTTTTTAGA---AAGTT-TT----ACTTTTATAAACA-AATACAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATATACATGTA-------AACAAT-G-GCAAGAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AACAGAGG---ATAAACAGTAATT-------TG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------A---A---TATATGCATGT--------ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTAATTTAACATTAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGTAAGCGTCCACTCTCATTAATAAACTTATGAACGCATCTCATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32004 : GTTGTTAAA---AAATT-AT----AATTTTATAAACA-AATACAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAA------------TACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---A---TGC--GAAATG----CTAAGTACATTGATCA----AACAGAGG---ATAAACAGTAATT-------TG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------G---A---TATATACATCT--------TCATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTAATTCAACATCAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGAAAACGTCCACTCTCTTTAATAATTTTATGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32005 : GTTATTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTATAAACA-AAAACAATGCTTAAGCGAAAA--C-----ATATTCTCTGAATAGTATACACTATTCATGTA-------AAAACT-G-GGAAAAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AACAGAGG---ATAAACAGTAATT-------TG-------AAAA--GAT---------A-A--T--GGTGGAA---AGGTAGA--AG---AGAA------------G---A---TATATGCATGT--------ACATGTCAACAAAACATC--ATTGCTCTGTAATTTAACATTAATCATTAGGCGGTTTAT-----GTGGTCGAAAGTGTTCACTCTC-----TAGA---ATAAACGTATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32006 : GTTATTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTATAAACA-TATACAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATATACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATTAGT---A---AA---T---TGC--GAAATG----CTTAGTTTATTGATCA----AACAGAGG---GTAAACAGTAATT-------TG-------TAAATTTAT---------A-AATT--TGTG-------GATAGA--A----AGAA------------G---A---TACATACACGT--------ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTAACTTAAAATTAATCATTAGGCGATATAT-----GTGGTCGAACGCGTCCACTTTCTTTAATAAACTTATGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTTTATT
gi|32007 : GTTATTAGG---AAGTT-AT----ATTTTCATAAACA-AGTACAATGCTTGAGTGAAAA--CAAA-CATATTCTCCGAGCAGTATACAATATACATGTA-------AACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---AAA-TGC--GAAATG----CTTTGTAGATTGATCA----AACAGAAG---TTAAAAAGTATTT-------TG-------AAAA--TAT---------A-A--T--AGCGAAA---AGATAGA--AG---AGAAGAA---------G---A---TATATACATAT--------ACATGTCAACCAAACATC--ATTGCTCTGTTATTTAACATTCATCATTAGGTGATACAT-----ATGGTCGAAAACGTCCACTCTCTTGAATGAACTTACGAACGCATCTAATTAAGTGTTCATTATGTT
gi|32008 : GTTATTAAA---AAGTT-AT----AATTTTATAAAAA-AATACATTGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATATATATGTT-------AACAAT-G-GGAAGAATACGT---AAAGAA---G---TGC--GAAAGG----CTTAGTGCATTGATCA----AATAGAAG---ATAAA----AA----------G-------AAAA--GATATTAGTGGAA-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAAATATATATATATA---A---TATATATATATATGTGTGAACATGTCAACCAATCATC--ATTGCTATGTGATTTTA-ATTAATCATTAGGCGGTATAT-----GTGGTCGAAAACGTCCACTCTCTTTAGTGAATTTGTGAACGCATCTAATTAAATGTTCATTATGTT
gi|32009 : GTTATTATATACGAG---AT----GCTTCTACAAACA-AAGCCAATGCT-AAGCGAAAT--AAAA-CAAATTCTCTGAACAGTATACAATCTACATGTT-------AACACT-G-GGAAGAACGAGT---A---AA---GAAGTGC--GAAATG----CT----ACATTGATCATAGTAACAGAAG---ATAAATAGCATTT-------AG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTAGAA---CGATAGA--AG---AGAA------------GGATA---TATATACATGC--------ACATGTCAGCGAAACATC--ATTGCCCTGTGATTAAACATAAATCATAAGGTGGTGTGT-----GTAGCCGAAAGCGTCCACTCTCTTTTATAAACTTATGAACGCATCTGATTAAATGTTC
gi|32010 : GTTATTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTACAAACA-AACACAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACAATATACATGTT-------AACACT-A-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TTC--GAAATG----TTTTGTACATTGATCT----AAGAG-AT---ATAAACAGTAATT-------TG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGATGAGA--AGAA------------G---A---TATATACAAGT--------ACAT
gi|32010 : CATTAAGTGGTATATAT---GTGATGGAAAGCGTCCACTCTTTTTTATGAACTTATGAACGCATCTAATCCAATGTTCGTTATGTTtaagtggtatatatgtgatggaaagcgtccactcttttttatgaacttatgaacgcatctaatccaatgttcgttatgtt
gi|32011 : gttattagaaagttatacttttacaaacaaacacaatgcttaagcgaaaacaaacatattctctgaatagtatacaatatacatgttaacactaggaagaataagtaaagttcgaaatgttttgtacattgatctaagagatataaacagtaatttgaaaagataatagtggaaagatagatgagaagaagatatatacaagtaGTTATTAGA---AAGTTTATTAGAACTTTTATAAACA-AATTCAATACTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTTTCTGAATAGTATACAA---AGA---A-------AACACA-G-GGAAGAATACAT---A---AA---GAAGTGG--GAAAGG----C-------ATTGATCA----AACAGAAG---ATAAAATGTATTT-------CG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AAA-AGA--AG---AGAA------------G---AAGACATATACACGT--------GCATGTCAAACAAAAATC--AATGCTGTGAGATTTACCATTAAGCATTAGGTGGTATAT-----GTGGTCGAAAGCTGCCACTCTCTTTGATAAACTTATGAACGCATCTATTTAAATA--CATT
gi|32012 : GTTGTTAGA---AAGTT-AT----ACTTTTATAAACA-AATACAATGCTTAAACGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGCATACAATATACATGTA-------AACAAT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TGC--GAAATGCTTACTTAGTACATTGATCA----AGCAGAGG---ATAAACAGTAATT-------TG-------AAAA--GAT---------A-A--T--AGTGGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------A---A---TATATACATG
gi|32013 : GCTATTAGA---AAGTT-GT----ACTTTTAAAAACA-AATTTATTGCTTTAGCGAAAA--CAAA-CACATTCTCTGAATAGTATACATTGTACATGTA-------AACACCGG-GGAAGAATAAAT---AATGAA---G---TGT--GGACTG----CTAAGTACATTGATCA----AACAGAAG---ATAAAAAATATTT-------CG-------AAAA--GAT---------A-A--A--AGTGGAA---AAATAGA--AGAGAAGAA------------G---A---TATATACATGT--------ACAAGT
gi|32014 : GTTATTAGA---AAGTT-AT----GCCTTTATAAACA-TATTCAATGCTTAAGCGAAAC--CAAA-CACATTCTAAGAATAGTACACAATGCAGA--------------ACT-G-ATAAAAATAAGT---A---AATAAG---GGT--GAAATG----CTTAGTACATTGATCA----AGCAGAAA---ATAACTAG-GATTACAAGAGTG-------GAAA--GGT---------ATA--T--A-TAAAACATAAATAGAG-AG---AAAATGA---------A---A---TATATACATGT--------ACATGT
gi|32015 : GTTATTAGA---AA----AT----ATTTTTGTAAACA-AAAACAATGCTTAAGCGAAAA--CAAA-CATATTCTCTGAATAGTATACTATATACATGTA-------TACACT-G-GGAAGAATAAGT---A---AA---G---TGCATAAAATG-------AAAACATC-ATAA----AATA-AAGTTAATAAA-AATCATT-------GA-------AAAA--AAA---------A-A--TAAAATGAAA---AAACA
gi|32016 : GTTATCAGA---AAAGA-AT----G-TTTTATATACA-AATTCGATACTTAAGCGAAAAAACAAAACACATTCCCTGAACAGTTTACACTGTACAGGTA-------AATTAT-A-TGAAGAATGA
gi|32017 : TATAATTATAATT--ATGCTTAAGCGATAA--CACA-CATGTTATCTGAATAGTATACAATGTACATGTAATATGTTAACACT-GTGGAAAA--AAGT---AAAGAA---G---AGC--AAAATG----CTTAGCACATTGATCA----AACTGAAA---AAGAATATTGATT-------cttaaaa
gi|32018 : atcaaaaagatatttcattgccaAAA---AAGT--AT----GCTTTTTTAAACA-AAGTCAATACTTAATCAAAAG--CAAA-CACATTCATTGAATAGTATACAATGTACAT
gi|32019 : CAATGTACTGGTA-------AACAAT-G-AGAAGGCCAAATGAAA---AA---A---TAG--GAAAGG----CTAAGAACATAGACCA----AACAAAAG---ATAAAAAGTACTA-------CGTCTTCCTAAAT--GTT---------A-A-----AGTGGAA---AGCTAGA--AG---AGAC------------G---A------------------------AAATCG--CAAAAAGC--ATTGCACTGTGATTTAACATTACTTATTA
gi|32020 : A---G---TGT--GAAATG----CTTAGTACGTTGATCA----AGCAGAGG---ATACAC-GTA
gi|32021 : GAAG---AAGAATAGTTTTC-------CG-------AAAG--AAA---------A-A--T--AGTTGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------GGTGA---TATATACATGT--------ACATGTCAGCCAAACACCCTATTGATTTGTGATTTAACGTT------------GTTTGT-----GTGGTCGAAAGTGTCCACTCTCTTTAATAAACTTATGGACACATCTGATTGAATGTCCATTCTGCT
gi|32022 : GAAG---A-AAATAGTATTT-------CG-------AAAG--AAA---------A-A--T--AGTTGAA---AGATAGA--AG---AGAA------------GGTGA---TATATACATGT--------ACATGTCAGCCAAACACCCTATTGATTTGTGATTTAACGTT------------GTTTGT-----GTGGTTGAAAGTGTCCACTCTCTTAAATAAACTTATGGACAC
gi|32023 : ---A---TAAATACATGT--------AGATGTCAACCAAACATT--ATTACTTTGTGATAAAACATTAACCATAAGGTGGTATACTAGTAATGGGCGCTAGCATCCATTATCTTCAATAAACTTATGAACGTTTCTAACTGAATATACATTATAT