lowQualScore : 1 8888888888888888 1 222222222 33333 1111111 1 2222222222222 1 11 1 33333333333333 2222222222 1111111 1
lowQualScore : 3 1 2 2 5 555 7777 4 999999 999999 2 3333333333333333 3 0 77 666 4 2 0 66 0 000000000 3 77777 6666666 1 0 5 2 4 77 7 1 1 7 1111111111111 5 33 5 7 3 77777777777777 8888888888 0000000 5 1
lowQualScore : . . . . . ... .... . ...... ...... . ................ . . .. ... . . . .. . ......... . ..... ....... . . . . . .. . . . . ............. . .. . . . .............. .......... ....... . .
lowQualScore : 3 2 3 1 5 444 1111 2 666666 666666 5 5555555555555555 3 5 99 444 0 7 7 11 0 000000000 4 22222 2222222 9 1 7 3 3 11 3 4 3 3 0000000000000 0 99 7 0 1 88888888888888 2222222222 8888888 0 1
consensus : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-CATGTCGCATGCGACA---TCCCTTCAAAAGATTTGG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAANTG--------------GCCCGACATGCCT-TCCCACCCGT-TGCGACT---ACCGTTAGATAA-TCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------CGTGATCA----AT-------TGACCTATTTCACAGACTTGTCAATCACTCGCAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTACAGGTAAGCCAATCAGAACGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATAGAATGCGGTGTCCT------GT-----GAAATTTCTTGATCC-GAGA-TTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACCAAGGTGTCGGC---------ATT-------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCCCA
Reference ( gi|6459 ) : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-CATGTCGCATGTGGCA---TCCCTTCAAAAGATTTGG----TTGATTACCGACATC------CCT------TAAGTG-----CCA-----GACCCGACATGCCT-TCCCACCCGT-TGCGACT---ACCGTTAGATAA-TCCCATTATACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------CGTGATCT----AT-------TGACCTATTTCACACACTTGTCAATCACTCGCAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTACAGGTAAGCTAATCGGAACGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCTTCAATATAGAATGTGGTGTCCT------GT-----GAAATGTCTTGATCC-AAGA-TTGTTTATCACAAGA-TTTAAAATTGACTACTGACCAAGGTGTCGGC---------TTT-------ACCTTTCAATTGATTCAGTAACCTCCCA
gi|6460 : TCAGGGTTTCCCCAAGAGTCATAACA-CATGTATCATGCGTCA---TCCCTTCAAAAGATCTGG----TTGATTAGCGATA-C------CCT------TAAGTG--------------GCCCGACATGCCT-TCCAACCCAT-TGCGACT---GCCGTTAGATAA-TCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------C-TAATCA----AT-------TGACATATTTCACAGACTTGTCAATCACTGGCAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTAATGGTAAGCCAATCAGAACGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATGGAATGTGGTGTCCT-------T-----GAAATTTCTTGATCC-AAGA-TTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACCAAGGTGTCGGC---------ATT-------ACATTTCAGTTGATTCATTAACCTCCCA
gi|6461 : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-CATGTCGAATGCGACA---TCTCTTCAAAAGATTAGGTCTTTTGACTTTTGACTTCAAAAGATTTGGTTGATGAGTGACATCCCATATGCGGCCCGACATGCTT-TCCGAACCGT-TGCGACT---AACGTTAGATAA-TCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------TGTGATCA----AT-------TGACCTATTTCACAGACTTGTCAATCACTCGCAAGCG-GAACT-GGAGGTGTGAACAGGTAAGCCAATCAGAACGAGTCATCTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATAGAAAACGGTGTCCT------GT-----GAAACTTCTTGATCC-GAGA-TTGTTTTTCACAAGA-TATAAAATCGACTACTGACCAAGGTGTCTGC---------ATT-------ACCTTTTAATTGATTCATTTACCACCCA
gi|6462 : TCTGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACGTCATGTCGTATGCGACA---TCCCTTCAAAAGATTTGG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTG--------------GCCTGACATGCCA-TCCCAACCAT-TGCGACT---ACCATTAGATAA-TCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATCAA--ACAAGTGAC-CC---------CGTGATCA----AT-------TAACCTATTTCACAGACTTGTCAATCACTCACAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTACAGGTAAGCCAATCAGAATGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCGTCAATATCGAATGTGATGTCCC------GT-----GAAATTTCTTGATCC-GAGA-TTGTTTTTCACAAGA-TGTAAAATCGTTCAC-GACCA
gi|6463 : TCAGGGTCTCCCCCCGAGTTATAACG-CATGTGGCATGTGACA---TCCCTTCAAAATATTTGG----TTAATTAGTGACATC------CCT------TAAGT--------------GGCCCGACATGCCT-TCCCACCCGT-TATGACT---AACGTTAGATTA-TCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--A-AAATGAC-CT---------TGTGATCA----AT-------TGACCTATTTCACAGACT-------------------TGAACT-GGAGTTGTGTACAGGTAAACCAATCAGAACGAGTCATTTGGCGGTTACTCTGCCTCAATATAGAATGCAGTGTCCT------GT-----GAAATTTCTTGATCC-TAGA-TTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTTCTGACCAAGGTGTCGGC---------ATT-------AGTTTTCAATTGATTCATTAACCTCACA
gi|6464 : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-T-TAT-GCATGTTGT-------------AAGATTTGG----TTGATAAGGGACATC------CCT------TCATTA-----CC--------CCC--CCCCCCC-CCCCACCCG--TGCAACT---ACCGTTAAATAA-TCACATTATGTAAGCCCATCAGTAAGTAA--ACAAGTGGCACG---------CATCATTCAA--AT-------TGATCTATTTCAAAGAC--GTCAATCATTCGCAAGTGTGAACT-AGGGATGTGTACAGGTAAG-TCATCAG-ACAAGGCATTTGAAAGTTACTCCGCCTCAATATAGAATATGGTGTACTAACGCAGTTAAAGGAAATTTCTTGATCT---GATTTATTTTTCTCAAGA-TTTAAAATCAATTATTGACAAAGGGTTCAGCATTAATCTGTTTGCGCATAACCTCTCACTTGATTCATCAACTTC
gi|6465 : TTAGGGTTTCCCCCAGTGTCCTAACA-CATGTTGCATGTGACAACATCCCTTCAAAATATTTAG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTG--------------GCCCGACATGCCT-TCCCACCCAT-TGTGACA---ACCGTTAGACAA-TCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAG
gi|6466 : TCAGGGTTTCTCCCAGAGTCATAATG-C---TTGCA----ACA---TGCCTTGAAAAAAATTGG----TTGATTTGTGACATC------CCT------TAATTT-----T---------TCTGACATA------CCGCCCAG-AGTGATT---ACCATTATACA---CACATAACACA----CATT--TAACAAAACACAAGTAAA-CCTAGGACATGCATGATCTCTCAAT-------TGATAAATT-----CATCTTCCAATCAC
gi|6467 : CAAGGTTTCCCCCAGAGTTATAACG-CATGTCGCATGCAACA---TCCCTTCAATAGATTTGG----TTGATCAGCTACATC------CCT------TAATTG--------------GCCCGACAAGCCT-TACCACCCAG-TGCAACT---AC---TAAATAAATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAAGTAA--ACAAGTGAC-CC---------CTTGATCA----AT-------TGACCTATTTCATAGACTTGTCTATCCCTCGCAACGGTGAACT-GG-GGTGTGTACA-GTAAGCGAATCAGAACGAGGCATTTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATAGAATGCGGTGTCCT------GT-----GAAATTTCTTGATCCAAAGA-TTGTATTTCACAAGA-TTAAAAATCGATTATTGACCAAGGTGTCGGC---------ATA-------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCCCA
gi|6468 : CAGAGTTTCCCCTAGAGTCATAACG-CATGTTGCATGCGACA---TCCCTTCAAAAGATTTGG----TTAATTAGCGACATC------CCT------TAATTG-----C---------CCCGACATGCAT-TACC-TCCATGTGTGATT---TCCGTTAAATTA-TTCCATTATGCACGCCCATCAGTAAGTAA--ACAAGTGACACG---------CGTGATCTGCCAATGATAAAATGACCTATTTCACAGACTTGTCAATCACTTGCAAGTGTGAACTGGGGGGTGTGTACA------------------AGGCATTTGGAGGTTACTCCACCTCAATATCGAATGCGGTGTCCT------GC-----G
gi|6469 : CAGGGTTTCCCCCAGGCCTTTATCG-CATGTCGCATGCGACA---TGCCTTCAGA
gi|6470 : GATTTCCCCAAGAGTCATAACG-TATATCGCATGCGACA---TCCCTTCAAAGGATTTGG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGT--------------GGCCCGACATGCAT-TCCCACCCGT-TGC-ACCCCAATCGTTAgttgctggtcattttgtgaca
gi|6471 : TCCCCAAGAGTCATA--------TCACATGCAAAA---TGCTTTCAAAAGGCTTCA----TTGATTTGTGACATT------TTT------TAATT--------------GACCGAACATGCCTAACCTCCCCG--AGCGACA---ATCTTTAAATAA-
gi|6472 : CATGTGATA---TGCCCTCAAA-GTCGTAG----TTGCTTTGCGGCATC------CCT------TGATTG--------------ATTCGACATGCCT-TCCCTCCC
gi|6473 : AAATTTCTTGAATA-GAGA-TTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACCAAGGTATCGGC---------AAT-------AACTTTCAATTTATTCATTAACCTCCCA
gi|6474 : TGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACTAAGGTGTCAGT---------ATT-------ACCTTTAAATTGATTCA
gi|6475 : TGTTTTTCACAAGA-TTTAAAA--------------AGGTGTTGGC---------ATT-------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCCCCCAtt
gi|6476 : TGTTTTTCACAAGAATTTAAAA---------------GGTGTCAGC---------ATT-------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCACA
gi|6478 : TGTTTTTCACAAGA-TTTAAAA--------------AGGTGTCGGC---------ATT-------ACCTTTCAATTGATTCA
gi|6477 : TGTTTTTCGCAAGA-TTTAAAA--------------AGGTGTCGGC---------AAT-------AACTTTCAATTGATTCATTAACCTCACA
gi|6479 : TTTTTCGCAAGA-TTTAAAA--------------AGGTGTCGGC---------ATT-------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCACA
Alignments
lowQualScore : 11111111111 111111111 1111111 1111111111111 111111111 2222222222222222
lowQualScore : 3 0 1 555 33 6666 0 888888 888888 1 77777 44 44444444444 3 3 3 555 3 55 8 777777777 1 999999999 66 4444444 4 5 0 2 0 0 6666666666666 5 2 888888888 1 0000000000000000
lowQualScore : . . . ... .. .... . ...... ...... . ..... .. ........... . . . ... . .. . ......... . ......... .. ....... . . . . . . ............. . . ......... . ................
lowQualScore : 1 4 4 000 99 1111 3 888888 888888 0 22222 22 66666666666 1 1 3 888 6 55 9 888888888 9 999999999 11 4444444 4 0 9 5 1 1 0000000000000 0 9 888888888 9 4444444444444444
consensus : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-CATGTCGCATGCGACA---TCCCTTCAAAAGATT--TGG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------CT-TCCC-ACCCGT-TGCGACT---ACCGTTAGAT-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------CGTGA----T----C--AAT-------TGACCT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTCGCAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTACAGGTAAGCCAATCAGAACGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATAGAATGCGGTGTCCT------GT-----GAAATTTCTTGATCC-GAGATTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACCAAGGTGTCGGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCCCA
Reference ( family-774 ) : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-CATGTCGCATGCGACA---TCCCTTCAAAAGATT--TGG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAANTG----GC--CCGACATGC-----------CT-TCCC-ACCCGT-TGCGACT---ACCGTTAGAT-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------CGTGA----T----C--AAT-------TGACCT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTCGCAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTACAGGTAAGCCAATCAGAACGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATAGAATGCGGTGTCCT------GT-----GAAATTTCTTGATCC-GAGATTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACCAAGGTGTCGGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCCCA
gi|6459 : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-CATGTCGCATGTGGCA---TCCCTTCAAAAGATT--TGG----TTGATTACCGACATC------CCT------TAAGTGCCAGAC--CCGACATGC-----------CT-TCCC-ACCCGT-TGCGACT---ACCGTTAGAT-AATCCCATTATACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------CGTGA----T----C--TAT-------TGACCT-ATTTCACACACTTGTCAATCACTCGCAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTACAGGTAAGCTAATCGGAACGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCTTCAATATAGAATGTGGTGTCCT------GT-----GAAATGTCTTGATCC-AAGATTGTTTATCACAAGA-TTTAAAATTGACTACTGACCAAGGTGTCGGCTTT----------------ACCTTTCAATTGATTCAGTAACCTCCCA
gi|6460 : TCAGGGTTTCCCCAAGAGTCATAACA-CATGTATCATGCGTCA---TCCCTTCAAAAGATC--TGG----TTGATTAGCGATA-C------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------CT-TCCA-ACCCAT-TGCGACT---GCCGTTAGAT-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------C-TAA----T----C--AAT-------TGACAT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTGGCAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTAATGGTAAGCCAATCAGAACGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATGGAATGTGGTGTCCT-------T-----GAAATTTCTTGATCC-AAGATTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACCAAGGTGTCGGCATT----------------ACATTTCAGTTGATTCATTAACCTCCCA
gi|6461 : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-CATGTCGAATGCGACA---TCTCTTCAAAAGATT--AGGTCTTTTGACTTTTGACTTCAAAAGATTTGGTTGATGAGTG----ACATCCCATATGCGGCCCGACATGCT-TTCCGAACCGT-TGCGACT---AACGTTAGAT-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------TGTGA----T----C--AAT-------TGACCT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTCGCAAGCG-GAACT-GGAGGTGTGAACAGGTAAGCCAATCAGAACGAGTCATCTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATAGAAAACGGTGTCCT------GT-----GAAACTTCTTGATCC-GAGATTGTTTTTCACAAGA-TATAAAATCGACTACTGACCAAGGTGTCTGCATT----------------ACCTTTTAATTGATTCATTTACCACCCA
gi|6462 : TCTGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACGTCATGTCGTATGCGACA---TCCCTTCAAAAGATT--TGG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CTGACATGC-----------CA-TCCC-AACCAT-TGCGACT---ACCATTAGAT-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATCAA--ACAAGTGAC-CC---------CGTGA----T----C--AAT-------TAACCT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTCACAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTACAGGTAAGCCAATCAGAATGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCGTCAATATCGAATGTGATGTCCC------GT-----GAAATTTCTTGATCC-GAGATTGTTTTTCACAAGA-TGTAAAATCGTTCAC-GACCA
gi|6463 : TCAGGGTCTCCCCCCGAGTTATAACG-CATGTGGCATGTGACA---TCCCTTCAAAATATT--TGG----TTAATTAGTGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------CT-TCCC-ACCCGT-TATGACT---AACGTTAGAT-TATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--A-AAATGAC-CT---------TGTGA----T----C--AAT-------TGACCT-ATTTCACAGACT-------------------TGAACT-GGAGTTGTGTACAGGTAAACCAATCAGAACGAGTCATTTGGCGGTTACTCTGCCTCAATATAGAATGCAGTGTCCT------GT-----GAAATTTCTTGATCC-TAGATTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTTCTGACCAAGGTGTCGGCATT----------------AGTTTTCAATTGATTCATTAACCTCACA
gi|6464 : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-T-TAT-GCATG-------------TTGTAAGATT--TGG----TTGATAAGGGACATC------CCT------TCATTA----CC--CCCCCCC-C-----------CC-CCCC-ACCCGT--GCAACT---ACCGTTAAAT-AATCACATTATGTAAGCCCATCAGTAAGTAA--ACAAGTGGCACG---------CATCA----T----TCAAAT-------TGATCT-ATTTCAAAGAC--GTCAATCATTCGCAAGTGTGAACT-AGGGATGTGTACAGGTAAGTC-ATCAG-ACAAGGCATTTGAAAGTTACTCCGCCTCAATATAGAATATGGTGTACTAACGCAGTTAAAGGAAATTTCTTGATCT-GAT-TTATTTTTCTCAAGA-TTTAAAATCAATTATTGACAAAGGGTTCAGCATTAATCTGTTTGCGCATAACCTCTCACTTGATTCATCAACTTC
gi|6465 : TTAGGGTTTCCCCCAGTGTCCTAACA-CATGTTGCATGTGACAACATCCCTTCAAAATATT--TAG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------CT-TCCC-ACCCAT-TGTGACA---ACCGTTAGAC-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAG
gi|6466 : TCAGGGTTTCTCCCAGAGTCATAATG-C---TTGCA----ACA---TGCCTTGAAAAAAAT--TGG----TTGATTTGTGACATC------CCT------TAATTT----TT--CTGACATA-----------------CC-GCCCAG-AGTGATT---ACCATTATAC-A--CACATAACACA----CATT--TAACAAAACACAAGTAAA-CCTAGGACATGCATGATCTCT----C--AAT-------TGA--TAAATTCAT---CTT-CCAATCAC
gi|6467 : CAAGGTTTCCCCCAGAGTTATAACG-CATGTCGCATGCAACA---TCCCTTCAATAGATT--TGG----TTGATCAGCTACATC------CCT------TAATTG----GC--CCGACAAGC-----------CT-TACC-ACCCAG-TGCAACT---AC---TAAATAAATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAAGTAA--ACAAGTGAC-CC---------CTTGA----T----C--AAT-------TGACCT-ATTTCATAGACTTGTCTATCCCTCGCAACGGTGAACT-GG-GGTGTGTACA-GTAAGCGAATCAGAACGAGGCATTTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATAGAATGCGGTGTCCT------GT-----GAAATTTCTTGATCCAAAGATTGTATTTCACAAGA-TTAAAAATCGATTATTGACCAAGGTGTCGGCATA----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCCCA
gi|6468 : CAGAGTTTCCCCTAGAGTCATAACG-CATGTTGCATGCGACA---TCCCTTCAAAAGATT--TGG----TTAATTAGCGACATC------CCT------TAATTG----CC--CCGACATGC-----------AT-TACC--TCCATGTGTGATT---TCCGTTAAAT-TATTCCATTATGCACGCCCATCAGTAAGTAA--ACAAGTGACACG---------CGTGA----TCTGCC--AATGATAAAATGACCT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTTGCAAGTGTGAACTGGGGGGTGTGTACA------------------AGGCATTTGGAGGTTACTCCACCTCAATATCGAATGCGGTGTCCT------GC-----G
gi|6469 : CAGGGTTTCCCCCAGGCCTTTATCG-CATGTCGCATGCGACA---TGCCTTCAGA--GTTGCTGG----TCATTTTGTGACA
gi|6470 : GATTTCCCCAAGAGTCATAACG-TATATCGCATGCGACA---TCCCTTCAAAGGATT--TGG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------AT-TCCC-ACCCGT-TGC-ACCCCAATCGTTA
gi|6471 : TCCCCAAGAGTCATA--------TCACATGCAAAA---TGCTTTCAAAAGGCT--TCA----TTGATTTGTGACATT------TTT------TAATTG----AC--CGAACATGC-----------CTAACCT-CCCCG--AGCGACA---ATCTTTAAAT-AA
gi|6472 : CATGTGATA---TGCCCTCAAA-GTCG--TAG----TTGCTTTGCGGCATC------CCT------TGATTG----AT--TCGACATGC-----------CT-TCCC-TCCC
gi|6473 : AAATTTCTTGAATA-GAGATTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACCAAGGTATCGGCAAT----------------AACTTTCAATTTATTCATTAACCTCCCA
gi|6474 : TGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACTAAGGTGTCAGTATT----------------ACCTTTAAATTGATTCATT
gi|6475 : TGTTTTTCACAAGA-TTTAAAA--------------AGGTGTTGGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCCCCCA
gi|6476 : TGTTTTTCACAAGAATTTAAAA---------------GGTGTCAGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCACA
gi|6477 : TGTTTTTCGCAAGA-TTTAAAA--------------AGGTGTCGGCAAT----------------AACTTTCAATTGATTCATTAACCTCACA
gi|6478 : TGTTTTTCACAAGA-TTTAAAA--------------AGGTGTCGGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCA
gi|6479 : TTTTTCGCAAGA-TTTAAAA--------------AGGTGTCGGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCACA
Alignments
lowQualScore : 11111111111 111111111 1111111 1111111111111 111111111 2222222222222222
lowQualScore : 3 0 1 555 33 6666 0 888888 888888 1 77777 44 44444444444 3 3 3 555 3 55 8 777777777 1 999999999 66 4444444 4 5 0 2 0 0 6666666666666 5 2 888888888 1 0000000000000000
lowQualScore : . . . ... .. .... . ...... ...... . ..... .. ........... . . . ... . .. . ......... . ......... .. ....... . . . . . . ............. . . ......... . ................
lowQualScore : 1 4 4 000 99 1111 3 888888 888888 5 22222 22 66666666666 1 1 3 888 6 55 9 888888888 9 999999999 11 4444444 4 0 9 5 1 1 0000000000000 0 9 888888888 9 4444444444444444
consensus : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-CATGTCGCATGCGACA---TCCCTTCAAAAGATT--TGG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------CT-TCCC-ACCCGT-TGCGACT---ACCGTTAGAT-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------CGTGA----T----C--AAT-------TGACCT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTCGCAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTACAGGTAAGCCAATCAGAACGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATAGAATGCGGTGTCCT------GT-----GAAATTTCTTGATCC-GAGATTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACCAAGGTGTCGGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCCCA
Reference ( family-774 ) : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-CATGTCGCATGCGACA---TCCCTTCAAAAGATT--TGG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------CT-TCCC-ACCCGT-TGCGACT---ACCGTTAGAT-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------CGTGA----T----C--AAT-------TGACCT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTCGCAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTACAGGTAAGCCAATCAGAACGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATAGAATGCGGTGTCCT------GT-----GAAATTTCTTGATCC-GAGATTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACCAAGGTGTCGGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCCCA
gi|6459 : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-CATGTCGCATGTGGCA---TCCCTTCAAAAGATT--TGG----TTGATTACCGACATC------CCT------TAAGTGCCAGAC--CCGACATGC-----------CT-TCCC-ACCCGT-TGCGACT---ACCGTTAGAT-AATCCCATTATACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------CGTGA----T----C--TAT-------TGACCT-ATTTCACACACTTGTCAATCACTCGCAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTACAGGTAAGCTAATCGGAACGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCTTCAATATAGAATGTGGTGTCCT------GT-----GAAATGTCTTGATCC-AAGATTGTTTATCACAAGA-TTTAAAATTGACTACTGACCAAGGTGTCGGCTTT----------------ACCTTTCAATTGATTCAGTAACCTCCCA
gi|6460 : TCAGGGTTTCCCCAAGAGTCATAACA-CATGTATCATGCGTCA---TCCCTTCAAAAGATC--TGG----TTGATTAGCGATA-C------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------CT-TCCA-ACCCAT-TGCGACT---GCCGTTAGAT-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------C-TAA----T----C--AAT-------TGACAT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTGGCAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTAATGGTAAGCCAATCAGAACGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATGGAATGTGGTGTCCT-------T-----GAAATTTCTTGATCC-AAGATTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACCAAGGTGTCGGCATT----------------ACATTTCAGTTGATTCATTAACCTCCCA
gi|6461 : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-CATGTCGAATGCGACA---TCTCTTCAAAAGATT--AGGTCTTTTGACTTTTGACTTCAAAAGATTTGGTTGATGAGTG----ACATCCCATATGCGGCCCGACATGCT-TTCCGAACCGT-TGCGACT---AACGTTAGAT-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------TGTGA----T----C--AAT-------TGACCT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTCGCAAGCG-GAACT-GGAGGTGTGAACAGGTAAGCCAATCAGAACGAGTCATCTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATAGAAAACGGTGTCCT------GT-----GAAACTTCTTGATCC-GAGATTGTTTTTCACAAGA-TATAAAATCGACTACTGACCAAGGTGTCTGCATT----------------ACCTTTTAATTGATTCATTTACCACCCA
gi|6462 : TCTGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACGTCATGTCGTATGCGACA---TCCCTTCAAAAGATT--TGG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CTGACATGC-----------CA-TCCC-AACCAT-TGCGACT---ACCATTAGAT-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATCAA--ACAAGTGAC-CC---------CGTGA----T----C--AAT-------TAACCT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTCACAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTACAGGTAAGCCAATCAGAATGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCGTCAATATCGAATGTGATGTCCC------GT-----GAAATTTCTTGATCC-GAGATTGTTTTTCACAAGA-TGTAAAATCGTTCAC-GACCA
gi|6463 : TCAGGGTCTCCCCCCGAGTTATAACG-CATGTGGCATGTGACA---TCCCTTCAAAATATT--TGG----TTAATTAGTGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------CT-TCCC-ACCCGT-TATGACT---AACGTTAGAT-TATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--A-AAATGAC-CT---------TGTGA----T----C--AAT-------TGACCT-ATTTCACAGACT-------------------TGAACT-GGAGTTGTGTACAGGTAAACCAATCAGAACGAGTCATTTGGCGGTTACTCTGCCTCAATATAGAATGCAGTGTCCT------GT-----GAAATTTCTTGATCC-TAGATTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTTCTGACCAAGGTGTCGGCATT----------------AGTTTTCAATTGATTCATTAACCTCACA
gi|6464 : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-T-TAT-GCATG-------------TTGTAAGATT--TGG----TTGATAAGGGACATC------CCT------TCATTA----CC--CCCCCCC-C-----------CC-CCCC-ACCCGT--GCAACT---ACCGTTAAAT-AATCACATTATGTAAGCCCATCAGTAAGTAA--ACAAGTGGCACG---------CATCA----T----TCAAAT-------TGATCT-ATTTCAAAGAC--GTCAATCATTCGCAAGTGTGAACT-AGGGATGTGTACAGGTAAGTC-ATCAG-ACAAGGCATTTGAAAGTTACTCCGCCTCAATATAGAATATGGTGTACTAACGCAGTTAAAGGAAATTTCTTGATCT-GAT-TTATTTTTCTCAAGA-TTTAAAATCAATTATTGACAAAGGGTTCAGCATTAATCTGTTTGCGCATAACCTCTCACTTGATTCATCAACTTC
gi|6465 : TTAGGGTTTCCCCCAGTGTCCTAACA-CATGTTGCATGTGACAACATCCCTTCAAAATATT--TAG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------CT-TCCC-ACCCAT-TGTGACA---ACCGTTAGAC-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAG
gi|6466 : TCAGGGTTTCTCCCAGAGTCATAATG-C---TTGCA----ACA---TGCCTTGAAAAAAAT--TGG----TTGATTTGTGACATC------CCT------TAATTT----TT--CTGACATA-----------------CC-GCCCAG-AGTGATT---ACCATTATAC-A--CACATAACACA----CATT--TAACAAAACACAAGTAAA-CCTAGGACATGCATGATCTCT----C--AAT-------TGA--TAAATTCAT---CTT-CCAATCAC
gi|6467 : CAAGGTTTCCCCCAGAGTTATAACG-CATGTCGCATGCAACA---TCCCTTCAATAGATT--TGG----TTGATCAGCTACATC------CCT------TAATTG----GC--CCGACAAGC-----------CT-TACC-ACCCAG-TGCAACT---AC---TAAATAAATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAAGTAA--ACAAGTGAC-CC---------CTTGA----T----C--AAT-------TGACCT-ATTTCATAGACTTGTCTATCCCTCGCAACGGTGAACT-GG-GGTGTGTACA-GTAAGCGAATCAGAACGAGGCATTTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATAGAATGCGGTGTCCT------GT-----GAAATTTCTTGATCCAAAGATTGTATTTCACAAGA-TTAAAAATCGATTATTGACCAAGGTGTCGGCATA----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCCCA
gi|6468 : CAGAGTTTCCCCTAGAGTCATAACG-CATGTTGCATGCGACA---TCCCTTCAAAAGATT--TGG----TTAATTAGCGACATC------CCT------TAATTG----CC--CCGACATGC-----------AT-TACC--TCCATGTGTGATT---TCCGTTAAAT-TATTCCATTATGCACGCCCATCAGTAAGTAA--ACAAGTGACACG---------CGTGA----TCTGCC--AATGATAAAATGACCT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTTGCAAGTGTGAACTGGGGGGTGTGTACA------------------AGGCATTTGGAGGTTACTCCACCTCAATATCGAATGCGGTGTCCT------GC-----G
gi|6469 : CAGGGTTTCCCCCAGGCCTTTATCG-CATGTCGCATGCGACA---TGCCTTCAGA--GTTGCTGG----TCATTTTGTGACA
gi|6470 : GATTTCCCCAAGAGTCATAACG-TATATCGCATGCGACA---TCCCTTCAAAGGATT--TGG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------AT-TCCC-ACCCGT-TGC-ACCCCAATCGTTA
gi|6471 : TCCCCAAGAGTCATA--------TCACATGCAAAA---TGCTTTCAAAAGGCT--TCA----TTGATTTGTGACATT------TTT------TAATTG----AC--CGAACATGC-----------CTAACCT-CCCCG--AGCGACA---ATCTTTAAAT-AA
gi|6472 : CATGTGATA---TGCCCTCAAA-GTCG--TAG----TTGCTTTGCGGCATC------CCT------TGATTG----AT--TCGACATGC-----------CT-TCCC-TCCC
gi|6473 : AAATTTCTTGAATA-GAGATTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACCAAGGTATCGGCAAT----------------AACTTTCAATTTATTCATTAACCTCCCA
gi|6474 : TGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACTAAGGTGTCAGTATT----------------ACCTTTAAATTGATTCATT
gi|6475 : TGTTTTTCACAAGA-TTTAAAA--------------AGGTGTTGGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCCCCCA
gi|6476 : TGTTTTTCACAAGAATTTAAAA---------------GGTGTCAGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCACA
gi|6477 : TGTTTTTCGCAAGA-TTTAAAA--------------AGGTGTCGGCAAT----------------AACTTTCAATTGATTCATTAACCTCACA
gi|6478 : TGTTTTTCACAAGA-TTTAAAA--------------AGGTGTCGGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCA
gi|6479 : TTTTTCGCAAGA-TTTAAAA--------------AGGTGTCGGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCACA
blockSeqs : T A ACA GC TCTT AAAAGA GGTTGA G G AT GGCCCGACATG A G G CCA A AC A TAGGACATG G TCTCT CA GATAAAA A G G AACGCAGTTAAAG A A TCGACTACT C AATCTGTTTGCGCATA
blockSeqs : . C . . . . . G A . . . . . . . . A . G TCTGC . . . . G GT . . TCGACTACT C .
blockSeqs : . C . . . . . G G . . . . . . . . . . G T . . . . G GT . . TCGACTTCT C .
blockSeqs : . G . . . . . G G . . . . . . . . . . A T . . . . G GT . . TCAATTATT C .
blockSeqs : . T . . . . . T C . . . . . . . . . . A T . . . . G GT . . TCGATTATT A .
blockSeqs : . T . . . . . G G . . . . . . . . . . T T . . . . . GC . . TCGACTACT C .
blockSeqs : . C . . . . . T T . . . . . . . . . . G T . . . . . T . . TCGACTACT C .
blockSeqs : . T . . . . . T G . . . . . . . . . . . T . . . . TCGTTCAC T .
blockSeqs : . C . . . . . T C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . G G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . T A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : G****
originalCons : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-CATGTCGCATGCGACA---TCCCTTCAAAAGATT--TGG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------CT-TCCC-ACCCGT-TGCGACT---ACCGTTAGAT-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------CGTGA----T----C--AAT-------TGACCT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTCGCAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTACAGGTAAGCCAATCAGAACGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATAGAATGCGGTGTCCT------GT-----GAAATTTCTTGATCC-GAGATTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACCAAGGTGTCGGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCCCA
finalCons : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-CATGTCGCATGCGACA---TCCCTTCAAAAGATT--TGG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTGG----C--CCGACATGC-----------CT-TCCC-ACCCGT-TGCGACT---ACCGTTAGAT-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------CGTGA----T----C--AAT-------TGACCT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTCGCAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTACAGGTAAGCCAATCAGAACGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATAGAATGCGGTGTCCT------GT-----GAAATTTCTTGATCC-GAGATTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACCAAGGTGTCGGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCCCA
Alignments
lowQualScore : 11111111111 111111111 1111111 1111111111111 111111111 2222222222222222
lowQualScore : 3 0 1 555 33 6666 0 888888 888888 1 77777 44 44444444444 3 3 3 555 3 55 8 777777777 1 999999999 66 4444444 4 5 0 2 0 0 6666666666666 5 2 888888888 1 0000000000000000
lowQualScore : . . . ... .. .... . ...... ...... . ..... .. ........... . . . ... . .. . ......... . ......... .. ....... . . . . . . ............. . . ......... . ................
lowQualScore : 1 4 4 000 99 1111 3 888888 888888 5 22222 22 66666666666 1 1 3 888 6 55 9 888888888 9 999999999 11 4444444 4 0 9 5 1 1 0000000000000 0 9 888888888 9 4444444444444444
consensus : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-CATGTCGCATGCGACA---TCCCTTCAAAAGATT--TGG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------CT-TCCC-ACCCGT-TGCGACT---ACCGTTAGAT-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------CGTGA----T----C--AAT-------TGACCT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTCGCAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTACAGGTAAGCCAATCAGAACGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATAGAATGCGGTGTCCT------GT-----GAAATTTCTTGATCC-GAGATTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACCAAGGTGTCGGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCCCA
Reference ( family-774 ) : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-CATGTCGCATGCGACA---TCCCTTCAAAAGATT--TGG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------CT-TCCC-ACCCGT-TGCGACT---ACCGTTAGAT-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------CGTGA----T----C--AAT-------TGACCT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTCGCAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTACAGGTAAGCCAATCAGAACGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATAGAATGCGGTGTCCT------GT-----GAAATTTCTTGATCC-GAGATTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACCAAGGTGTCGGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCCCA
gi|6459 : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-CATGTCGCATGTGGCA---TCCCTTCAAAAGATT--TGG----TTGATTACCGACATC------CCT------TAAGTGCCAGAC--CCGACATGC-----------CT-TCCC-ACCCGT-TGCGACT---ACCGTTAGAT-AATCCCATTATACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------CGTGA----T----C--TAT-------TGACCT-ATTTCACACACTTGTCAATCACTCGCAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTACAGGTAAGCTAATCGGAACGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCTTCAATATAGAATGTGGTGTCCT------GT-----GAAATGTCTTGATCC-AAGATTGTTTATCACAAGA-TTTAAAATTGACTACTGACCAAGGTGTCGGCTTT----------------ACCTTTCAATTGATTCAGTAACCTCCCA
gi|6460 : TCAGGGTTTCCCCAAGAGTCATAACA-CATGTATCATGCGTCA---TCCCTTCAAAAGATC--TGG----TTGATTAGCGATA-C------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------CT-TCCA-ACCCAT-TGCGACT---GCCGTTAGAT-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------C-TAA----T----C--AAT-------TGACAT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTGGCAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTAATGGTAAGCCAATCAGAACGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATGGAATGTGGTGTCCT-------T-----GAAATTTCTTGATCC-AAGATTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACCAAGGTGTCGGCATT----------------ACATTTCAGTTGATTCATTAACCTCCCA
gi|6461 : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-CATGTCGAATGCGACA---TCTCTTCAAAAGATT--AGGTCTTTTGACTTTTGACTTCAAAAGATTTGGTTGATGAGTG----ACATCCCATATGCGGCCCGACATGCT-TTCCGAACCGT-TGCGACT---AACGTTAGAT-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAGTGAC-CC---------TGTGA----T----C--AAT-------TGACCT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTCGCAAGCG-GAACT-GGAGGTGTGAACAGGTAAGCCAATCAGAACGAGTCATCTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATAGAAAACGGTGTCCT------GT-----GAAACTTCTTGATCC-GAGATTGTTTTTCACAAGA-TATAAAATCGACTACTGACCAAGGTGTCTGCATT----------------ACCTTTTAATTGATTCATTTACCACCCA
gi|6462 : TCTGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACGTCATGTCGTATGCGACA---TCCCTTCAAAAGATT--TGG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CTGACATGC-----------CA-TCCC-AACCAT-TGCGACT---ACCATTAGAT-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATCAA--ACAAGTGAC-CC---------CGTGA----T----C--AAT-------TAACCT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTCACAAGTGTGAACT-GGAGGTGTGTACAGGTAAGCCAATCAGAATGAGTCATTTGAAGGTTACTCCGCGTCAATATCGAATGTGATGTCCC------GT-----GAAATTTCTTGATCC-GAGATTGTTTTTCACAAGA-TGTAAAATCGTTCAC-GACCA
gi|6463 : TCAGGGTCTCCCCCCGAGTTATAACG-CATGTGGCATGTGACA---TCCCTTCAAAATATT--TGG----TTAATTAGTGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------CT-TCCC-ACCCGT-TATGACT---AACGTTAGAT-TATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--A-AAATGAC-CT---------TGTGA----T----C--AAT-------TGACCT-ATTTCACAGACT-------------------TGAACT-GGAGTTGTGTACAGGTAAACCAATCAGAACGAGTCATTTGGCGGTTACTCTGCCTCAATATAGAATGCAGTGTCCT------GT-----GAAATTTCTTGATCC-TAGATTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTTCTGACCAAGGTGTCGGCATT----------------AGTTTTCAATTGATTCATTAACCTCACA
gi|6464 : TCAGGGTTTCCCCCAGAGTCATAACG-T-TAT-GCATG-------------TTGTAAGATT--TGG----TTGATAAGGGACATC------CCT------TCATTA----CC--CCCCCCC-C-----------CC-CCCC-ACCCGT--GCAACT---ACCGTTAAAT-AATCACATTATGTAAGCCCATCAGTAAGTAA--ACAAGTGGCACG---------CATCA----T----TCAAAT-------TGATCT-ATTTCAAAGAC--GTCAATCATTCGCAAGTGTGAACT-AGGGATGTGTACAGGTAAGTC-ATCAG-ACAAGGCATTTGAAAGTTACTCCGCCTCAATATAGAATATGGTGTACTAACGCAGTTAAAGGAAATTTCTTGATCT-GAT-TTATTTTTCTCAAGA-TTTAAAATCAATTATTGACAAAGGGTTCAGCATTAATCTGTTTGCGCATAACCTCTCACTTGATTCATCAACTTC
gi|6465 : TTAGGGTTTCCCCCAGTGTCCTAACA-CATGTTGCATGTGACAACATCCCTTCAAAATATT--TAG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------CT-TCCC-ACCCAT-TGTGACA---ACCGTTAGAC-AATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAATTAA--ACAAG
gi|6466 : TCAGGGTTTCTCCCAGAGTCATAATG-C---TTGCA----ACA---TGCCTTGAAAAAAAT--TGG----TTGATTTGTGACATC------CCT------TAATTT----TT--CTGACATA-----------------CC-GCCCAG-AGTGATT---ACCATTATAC-A--CACATAACACA----CATT--TAACAAAACACAAGTAAA-CCTAGGACATGCATGATCTCT----C--AAT-------TGA--TAAATTCAT---CTT-CCAATCAC
gi|6467 : CAAGGTTTCCCCCAGAGTTATAACG-CATGTCGCATGCAACA---TCCCTTCAATAGATT--TGG----TTGATCAGCTACATC------CCT------TAATTG----GC--CCGACAAGC-----------CT-TACC-ACCCAG-TGCAACT---AC---TAAATAAATCCCATTACACAAGCCCATCAGTAAGTAA--ACAAGTGAC-CC---------CTTGA----T----C--AAT-------TGACCT-ATTTCATAGACTTGTCTATCCCTCGCAACGGTGAACT-GG-GGTGTGTACA-GTAAGCGAATCAGAACGAGGCATTTGAAGGTTACTCCGCCTCAATATAGAATGCGGTGTCCT------GT-----GAAATTTCTTGATCCAAAGATTGTATTTCACAAGA-TTAAAAATCGATTATTGACCAAGGTGTCGGCATA----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCCCA
gi|6468 : CAGAGTTTCCCCTAGAGTCATAACG-CATGTTGCATGCGACA---TCCCTTCAAAAGATT--TGG----TTAATTAGCGACATC------CCT------TAATTG----CC--CCGACATGC-----------AT-TACC--TCCATGTGTGATT---TCCGTTAAAT-TATTCCATTATGCACGCCCATCAGTAAGTAA--ACAAGTGACACG---------CGTGA----TCTGCC--AATGATAAAATGACCT-ATTTCACAGACTTGTCAATCACTTGCAAGTGTGAACTGGGGGGTGTGTACA------------------AGGCATTTGGAGGTTACTCCACCTCAATATCGAATGCGGTGTCCT------GC-----G
gi|6469 : CAGGGTTTCCCCCAGGCCTTTATCG-CATGTCGCATGCGACA---TGCCTTCAGA--GTTGCTGG----TCATTTTGTGACA
gi|6470 : GATTTCCCCAAGAGTCATAACG-TATATCGCATGCGACA---TCCCTTCAAAGGATT--TGG----TTGATTAGCGACATC------CCT------TAAGTG----GC--CCGACATGC-----------AT-TCCC-ACCCGT-TGC-ACCCCAATCGTTA
gi|6471 : TCCCCAAGAGTCATA--------TCACATGCAAAA---TGCTTTCAAAAGGCT--TCA----TTGATTTGTGACATT------TTT------TAATTG----AC--CGAACATGC-----------CTAACCT-CCCCG--AGCGACA---ATCTTTAAAT-AA
gi|6472 : CATGTGATA---TGCCCTCAAA-GTCG--TAG----TTGCTTTGCGGCATC------CCT------TGATTG----AT--TCGACATGC-----------CT-TCCC-TCCC
gi|6473 : AAATTTCTTGAATA-GAGATTGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACCAAGGTATCGGCAAT----------------AACTTTCAATTTATTCATTAACCTCCCA
gi|6474 : TGTTTTTCACAAGA-TTTAAAATCGACTACTGACTAAGGTGTCAGTATT----------------ACCTTTAAATTGATTCATT
gi|6475 : TGTTTTTCACAAGA-TTTAAAA--------------AGGTGTTGGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCCCCCA
gi|6476 : TGTTTTTCACAAGAATTTAAAA---------------GGTGTCAGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCACA
gi|6477 : TGTTTTTCGCAAGA-TTTAAAA--------------AGGTGTCGGCAAT----------------AACTTTCAATTGATTCATTAACCTCACA
gi|6478 : TGTTTTTCACAAGA-TTTAAAA--------------AGGTGTCGGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCA
gi|6479 : TTTTTCGCAAGA-TTTAAAA--------------AGGTGTCGGCATT----------------ACCTTTCAATTGATTCATTAACCTCACA