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Reference ( gi|149349 )       :  ATACGTGTTACTTTCTAGA--A----ATAAGTGT--TTA--AAAAG--GTCGTCTACAAACAGTTGT------ATTCGTGATTGAT-TTT
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Reference ( family-751 )      :        ACACGTGTTACTTTCTAGA--A----ATAAGTGT--TTA--AAAAG--GTCGTCTATAAACAATTGT------ATTCGTGATTGAT-TTT
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Reference ( family-751 )      :        ACACGTGTTACTTTCTAGA--A----ATAAGTGT--TTA--AAAAG--GTCGTCTATAAACAATTGT------ATTCGTGATTGAT-TTT
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blockSeqs                     :                           .  .           .    .      .                    .                . .
blockSeqs                     :                           .  .           .    .      .                    .                . .
blockSeqs                     :                           .  .           .    .      .                    .                .  
blockSeqs                     :                           .  .           .    .      .                    .                   
blockSeqs                     :                           .  .           .    .      .                                        
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blockSeqCons                  :        
originalCons                  :        ACACGTGTTACTTTCTAGA--A----ATAAGTGT--TTA--AAAAG--GTCGTCTATAAACAATTGT------ATTCGTGATTGAT-TTT
finalCons                     :        ACACGTGTTACTTTCTAGA--A----ATAAGTGT--TTA--AAAAG--GTCGTCTATAAACAATTGT------ATTCGTGATTGAT-TTT





Alignments
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lowQualScore                  :                           44 7777        44   44     55                   555555           6 1   
consensus                     :        ACACGTGTTACTTTCTAGA--A----ATAAGTGT--TTA--AAAAG--GTCGTCTATAAACAATTGT------ATTCGTGATTGAT-TTT
Reference ( family-751 )      :        ACACGTGTTACTTTCTAGA--A----ATAAGTGT--TTA--AAAAG--GTCGTCTATAAACAATTGT------ATTCGTGATTGAT-TTT
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